View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7861_high_19 (Length: 301)

Name: NF7861_high_19
Description: NF7861
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7861_high_19
NF7861_high_19
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (7-286)||(21969079-21969358)
chr8 (8-286)||(27007794-27008072)
chr8 (8-286)||(27014937-27015215)
chr8 (8-286)||(28498240-28498518)
chr8 (7-286)||(12561869-12562148)
chr8 (7-286)||(22130886-22131165)
chr8 (8-286)||(45534550-45534828)
chr8 (8-286)||(26240231-26240509)
chr8 (8-286)||(27880764-27881043)
chr8 (8-286)||(28020945-28021224)
chr8 (5-286)||(25610938-25611220)
chr8 (8-286)||(8371530-8371808)
chr8 (8-286)||(22659771-22660049)
chr8 (8-282)||(2963217-2963489)
chr8 (109-286)||(21916524-21916701)
chr8 (7-239)||(36970022-36970253)
chr8 (8-271)||(6430692-6430952)
chr8 (26-285)||(18835119-18835374)
chr8 (8-286)||(20539674-20539953)
chr8 (8-92)||(21914310-21914394)
chr8 (8-88)||(21862147-21862227)
chr8 (8-186)||(8782188-8782365)
chr8 (8-75)||(12642210-12642277)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (7-286)||(30174123-30174402)
chr2 (8-286)||(24250309-24250587)
chr2 (6-286)||(24229492-24229772)
chr2 (11-286)||(19616186-19616460)
chr2 (14-286)||(24763834-24764105)
chr2 (17-286)||(15342280-15342548)
chr2 (8-225)||(21626429-21626647)
chr2 (8-149)||(29800175-29800317)
chr2 (54-186)||(28719170-28719304)
chr2 (8-176)||(18852167-18852337)
chr2 (244-291)||(28719053-28719100)
chr2 (243-286)||(29800449-29800492)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (8-286)||(3952-4230)
scaffold0264 (8-242)||(10851-11085)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-286)||(130501-130779)
scaffold0001 (45-227)||(138471-138653)
scaffold0001 (7-43)||(141112-141148)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (8-286)||(18399851-18400129)
chr7 (8-286)||(18406835-18407113)
chr7 (8-286)||(48808773-48809051)
chr7 (8-286)||(15729498-15729776)
chr7 (8-286)||(19858869-19859147)
chr7 (8-286)||(30253885-30254163)
chr7 (8-286)||(2204298-2204577)
chr7 (8-286)||(8464746-8465024)
chr7 (8-286)||(18139615-18139895)
chr7 (8-286)||(19230634-19230913)
chr7 (8-286)||(10669179-10669456)
chr7 (8-286)||(47167136-47167413)
chr7 (8-285)||(18259402-18259678)
chr7 (8-286)||(34128322-34128598)
chr7 (34-286)||(41681250-41681502)
chr7 (8-286)||(28130309-28130586)
chr7 (23-282)||(19393705-19393963)
chr7 (13-286)||(14585913-14586191)
chr7 (69-286)||(15999791-16000007)
chr7 (73-286)||(2935846-2936056)
chr7 (8-278)||(42150363-42150626)
chr7 (8-128)||(22994055-22994176)
chr7 (8-286)||(3587657-3587934)
chr7 (8-286)||(22968697-22968975)
chr7 (115-286)||(24443604-24443772)
chr7 (11-285)||(15170307-15170581)
chr7 (8-84)||(48813749-48813825)
chr7 (8-149)||(24443932-24444074)
chr7 (8-284)||(31190722-31191000)
chr7 (243-301)||(25845736-25845796)
chr7 (243-301)||(25846155-25846215)
chr7 (23-87)||(25846379-25846443)
chr7 (10-74)||(5983259-5983324)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (8-286)||(16788818-16789096)
chr6 (7-286)||(22860165-22860444)
chr6 (8-286)||(1586385-1586663)
chr6 (8-286)||(13995220-13995498)
chr6 (8-286)||(18020118-18020396)
chr6 (8-286)||(27508624-27508903)
chr6 (8-286)||(27528210-27528489)
chr6 (7-286)||(14074226-14074505)
chr6 (8-286)||(8612664-8612940)
chr6 (8-210)||(13947501-13947704)
chr6 (8-286)||(5758758-5759034)
chr6 (8-271)||(17120741-17121002)
chr6 (8-286)||(20736605-20736882)
chr6 (5-286)||(19218176-19218454)
chr6 (8-156)||(14996859-14997007)
chr6 (8-286)||(22560461-22560740)
chr6 (8-280)||(4073320-4073595)
chr6 (78-286)||(21994406-21994613)
chr6 (9-186)||(10359410-10359588)
chr6 (8-84)||(21993711-21993786)
chr6 (7-46)||(11248530-11248569)
chr6 (10-82)||(23846851-23846923)
chr6 (244-286)||(10359326-10359368)
chr6 (193-282)||(23846668-23846755)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (8-286)||(2676760-2677038)
chr4 (8-286)||(15461244-15461522)
chr4 (8-286)||(15814768-15815046)
chr4 (8-286)||(18111320-18111598)
chr4 (8-286)||(20243684-20243962)
chr4 (8-286)||(26531360-26531638)
chr4 (8-286)||(3369300-3369578)
chr4 (8-286)||(18162909-18163187)
chr4 (7-286)||(17300236-17300515)
chr4 (8-286)||(4676260-4676538)
chr4 (8-286)||(5870159-5870443)
chr4 (8-286)||(34975298-34975576)
chr4 (6-242)||(38816458-38816694)
chr4 (8-286)||(1941472-1941749)
chr4 (8-215)||(11484265-11484472)
chr4 (10-285)||(9487301-9487575)
chr4 (12-286)||(11420768-11421041)
chr4 (7-286)||(30040751-30041029)
chr4 (127-285)||(4545948-4546104)
chr4 (129-286)||(19365389-19365544)
chr4 (8-98)||(4545860-4545950)
chr4 (3-224)||(9537705-9537926)
chr4 (73-286)||(19362229-19362435)
chr4 (28-280)||(5528762-5529013)
chr4 (8-276)||(39422426-39422694)
chr4 (242-286)||(32636465-32636509)
chr4 (8-185)||(23056437-23056615)
chr4 (8-72)||(19361597-19361661)
chr4 (12-280)||(56515990-56516255)
chr4 (53-186)||(21797922-21798054)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (8-286)||(21033985-21034263)
chr3 (8-286)||(12299658-12299936)
chr3 (8-286)||(15846813-15847091)
chr3 (8-286)||(14890138-14890416)
chr3 (8-286)||(55426768-55427046)
chr3 (8-286)||(20147831-20148110)
chr3 (8-282)||(21398539-21398813)
chr3 (8-285)||(25979006-25979282)
chr3 (10-254)||(28087967-28088211)
chr3 (55-285)||(11787382-11787611)
chr3 (8-286)||(14146769-14147046)
chr3 (8-285)||(15526503-15526777)
chr3 (8-142)||(14225954-14226090)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (8-286)||(9455863-9456141)
chr1 (8-286)||(42817266-42817544)
chr1 (7-286)||(47667751-47668030)
chr1 (7-286)||(20391516-20391795)
chr1 (8-286)||(22670534-22670812)
chr1 (7-286)||(20779922-20780201)
chr1 (8-286)||(19706716-19706994)
chr1 (8-286)||(28135000-28135278)
chr1 (7-286)||(43802642-43802921)
chr1 (8-286)||(22612234-22612517)
chr1 (8-286)||(35930329-35930607)
chr1 (8-210)||(22234827-22235029)
chr1 (8-286)||(8727412-8727692)
chr1 (139-286)||(633814-633959)
chr1 (8-236)||(26923675-26923900)
chr1 (8-286)||(21881653-21881931)
chr1 (115-277)||(29096580-29096739)
chr1 (8-46)||(14482299-14482337)
chr1 (245-285)||(16435837-16435877)
chr1 (60-138)||(16435649-16435728)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (8-286)||(119477-119755)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (8-286)||(24933583-24933861)
chr5 (8-286)||(31646-31924)
chr5 (8-286)||(23545669-23545947)
chr5 (7-286)||(12789940-12790219)
chr5 (7-286)||(25805662-25805941)
chr5 (8-286)||(22940997-22941275)
chr5 (8-286)||(31096563-31096841)
chr5 (8-286)||(20940774-20941052)
chr5 (11-286)||(12765271-12765544)
chr5 (8-286)||(7865711-7865987)
chr5 (11-286)||(12704155-12704428)
chr5 (11-286)||(9812014-9812287)
chr5 (8-286)||(26244850-26245127)
chr5 (22-286)||(5097414-5097676)
chr5 (8-286)||(39535211-39535489)
chr5 (10-286)||(20100520-20100793)
chr5 (8-282)||(26129974-26130249)
chr5 (11-141)||(31652208-31652338)
chr5 (243-286)||(31267939-31267982)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (8-286)||(8052-8330)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (10-286)||(15100-15376)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (8-276)||(1-273)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (8-242)||(40015-40249)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (6-237)||(19160-19391)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (8-286)||(67651-67928)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (8-286)||(8847-9135)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (8-285)||(45226-45502)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (8-286)||(11807-12083)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (8-191)||(18786-18969)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (79-286)||(1-208)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (8-216)||(961-1169)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (8-197)||(76307-76496)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (8-286)||(40265-40542)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (23-286)||(13226-13489)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (8-164)||(9516-9672)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (8-286)||(53521-53790)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (8-141)||(33927-34060)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (67-220)||(26413-26567)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (8-128)||(13740-13861)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (8-286)||(8479-8756)
[»] scaffold0783 (1 HSPs)
scaffold0783 (3-65)||(6222-6284)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (7-57)||(1825-1875)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (153-286)||(83292-83423)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 21969079 - 21969358
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969079 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 21969178  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969179 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 21969278  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969279 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21969358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27008072 - 27007794
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008072 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27007973  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007972 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27007873  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007872 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27007794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27015215 - 27014937
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015215 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27015116  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015115 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27015016  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015015 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 28498240 - 28498518
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498240 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28498339  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498340 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 28498439  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498440 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28498518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 12561869 - 12562148
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12561869 ctgttggcgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 12561968  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561969 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 12562068  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562069 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12562148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22131165 - 22130886
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131165 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 22131066  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131065 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22130966  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130965 aaatttatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22130886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45534828 - 45534550
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534828 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 45534729  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45534728 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctta 45534629  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534628 aatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 45534550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 26240231 - 26240509
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240231 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26240330  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26240331 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 26240430  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26240431 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatg 26240509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27881043 - 27880764
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881043 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 27880944  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880943 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27880844  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880843 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28021224 - 28020945
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021224 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 28021125  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021124 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 28021025  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021024 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28020945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 25610938 - 25611220
Alignment:
Q  5 atctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25610938 atctgtttgtgtaagccctaggggcaaatagtttatgataaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatat 25611037  T
Q  105 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25611038 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttagagaacgctattc 25611137  T
Q  205 tt-aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611138 ttaaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25611220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8371808 - 8371530
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8371808 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatattta 8371709  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  8371708 gataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaataacactattctta 8371609  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371608 aatgtgtctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 8371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22660049 - 22659771
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22660049 tgttggtgtaagtccaaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22659950  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22659949 tataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctta 22659850  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22659849 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 22659771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2963489 - 2963217
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2963489 tgttggtgtaagccctagatgccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatattta 2963390  T
Q  108 ga-taatgtt-aataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  2963389 tagtaatgtttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 2963290  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 282  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2963289 taaatgtattcgt-gtcaaa-ctttaatataatt--aggataataataaagcgtagagactattatgtatgtagact 2963217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 109 - 286
Target Start/End: Original strand, 21916524 - 21916701
Alignment:
Q  109 ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916524 ataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 21916623  T
Q  209 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916624 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21916701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 36970022 - 36970253
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36970022 ctgttggtgtaagcccta-aggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattt 36970120  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||    
T  36970121 atagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaataatatattatgtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttgttct 36970220  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36970221 taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat 36970253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 271
Target Start/End: Original strand, 6430692 - 6430952
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6430692 tgttggtgtaagctctagagaccaatagtttacgttaaatttatcttatgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatattt 6430791  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  6430792 atagtaatgttaataaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactta---atgagattacattatcataaataacactattct 6430888  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 271  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430889 taaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 6430952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Original strand, 18835119 - 18835374
Alignment:
Q  26 aggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  18835119 aggcgaatagtttatgttaaacttattttatttatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgttataatgttaataaagt 18835218  T
Q  125 ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaa 224  Q
     ||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||| ||||||      
T  18835219 tcttagaatagatagtt---gcagtagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatctgtagtc-c 18835314  T
Q  225 agctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18835315 agctttaatatggattga-aataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgat 18835374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20539953 - 20539674
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 106  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||     
T  20539953 tgttggtgtaagccattgagaccaatagtttatgttaaacttgtgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattataattg 20539854  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||    
T  20539853 ttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattaacataaagaacgttattctt 20539755  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||  ||  ||||| ||||||||||| | |||    |  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  20539754 aaatacatttgtagt-aaagctttaatgtaaattgggataataataataaagcgcatagacgattatgtatgtagactgatg 20539674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 21914310 - 21914394
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21914310 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 21914394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 21862147 - 21862227
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21862147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8782365 - 8782188
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||     
T  8782365 tgttggtgtaagccctataggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcattac-tttatt-tttaataaaatatgtcattctttattataattg 8782268  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 186  Q
       |||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8782267 ttgtaagattaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaaatgtgacttaatcatgggattacatta 8782188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Original strand, 12642210 - 12642277
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattat 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  12642210 tgttggtgtaagccctagaagcctatagtttatgttaaacttacgttgtgtatcatgacttttattat 12642277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 30174123 - 30174402
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174123 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 30174222  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174223 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 30174322  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174323 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30174402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24250587 - 24250309
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24250587 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatattta 24250488  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250487 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24250388  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250387 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24250309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24229772 - 24229492
Alignment:
Q  6 tctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24229772 tctgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 24229673  T
Q  106 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  24229672 taaataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacattattct 24229573  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229572 taaatgtgtccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24229492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 19616186 - 19616460
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga 109  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||       
T  19616186 tggtgtaagttctagcggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactcttttataatatttgtt 19616285  T
Q  110 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 208  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  19616286 gtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcataagattacattaacataaagaacactattcttaa 19616385  T
Q  209 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19616386 atgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataat-aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19616460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24764105 - 24763834
Alignment:
Q  14 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||   ||||    
T  24764105 tgtaagccctggaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatatttgttataa 24764006  T
Q  113 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 212  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | || | |||| ||||||||||||     
T  24764005 tgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaatagtatattaagcgtgacttaatcatgagattatattaacataaaaaacgatattcttaaatgc 24763906  T
Q  213 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24763905 atctgtactc-aagctttaatatgaattga-gataataataaagcatcgagactattatttatgtagactgatg 24763834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15342548 - 15342280
Alignment:
Q  17 aagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatg-t 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||     ||| |    
T  15342548 aagccttagaggccaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattataattcttgtatgat 15342449  T
Q  116 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 215  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||     
T  15342448 taataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaccataaagaacactattctttaatgtata 15342349  T
Q  216 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
     |||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15342348 tgtagtc-aagatttaatataaat-tgggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagattgatg 15342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 21626429 - 21626647
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 106  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  21626429 tgttggtgtaagtcctagatgtcaatagtttatgttaaacttatgatatgcatcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatatttg 21626528  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
      ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||   | |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||    
T  21626529 ttataagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacattaagtaagacttaatcatgacattacattaacataaagaacaatattctt 21626628  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaa 225  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21626629 aaaagtatccgaagtcaaa 21626647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 29800175 - 29800317
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  29800175 tgttggtgtaagccctagaggacaatattttatgttaaacttatactacgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattataatta 29800274  T
Q  108 -gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 149  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29800275 ttgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 29800317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28719304 - 28719170
Alignment:
Q  54 tatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| | || ||||| |||||| |||   |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||      
T  28719304 tatgtatcatgacttttattattaaacaaaataagacattcttttattatacttattgtaaaattaataaagtccttagaatatatagttcatgtgatgg 28719205  T
Q  152 tatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 186  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28719204 aacattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 28719170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18852337 - 18852167
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||| | ||||||| ||| || | ||||||||||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18852337 tgttggtgtaagccataaaaaccaataattttaagttaaacttatgttttctatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattatattt 18852238  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 176  Q
        |||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  18852237 tttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgttaagtgtgacttaatcatga 18852167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28719100 - 28719053
Alignment:
Q  244 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtccat 291  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28719100 gataataataaaacgtagagactattatgtatgtagactgatgaccat 28719053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 286
Target Start/End: Original strand, 29800449 - 29800492
Alignment:
Q  243 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29800449 ggataataataaagcggaaagactattatgtatgtagactgatg 29800492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4230 - 3952
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4230 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 4131  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4130 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4031  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11085 - 10851
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11085 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 10986  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 10886  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10885 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 130779 - 130501
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130779 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 130680  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130679 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 130580  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130579 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 130501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 138653 - 138471
Alignment:
Q  45 aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  138653 aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgt 138554  T
Q  145 gtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  138553 gtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 138471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 141148 - 141112
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtt 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141148 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtt 141112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 18399851 - 18400129
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399851 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18399950  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18400050  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400051 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 18406835 - 18407113
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406835 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18406934  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406935 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18407034  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407035 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48809051 - 48808773
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809051 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 48808952  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 48808852  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808851 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 48808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 15729498 - 15729776
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729498 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15729597  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15729598 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 15729697  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729698 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15729776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 19858869 - 19859147
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858869 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 19858968  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858969 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtttaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 19859068  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859069 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19859147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 30253885 - 30254163
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30253885 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatattta 30253984  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30253985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagatcgctattctta 30254084  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254085 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30254163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 2204298 - 2204577
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2204298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatattta 2204397  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204398 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2204497  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204498 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2204577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8464746 - 8465024
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464746 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgaatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8464845  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8464846 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 8464945  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8464946 aatgtatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgacgagactattatgtatgtagactgatg 8465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18139895 - 18139615
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18139895 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatattta 18139796  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18139795 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgttattctta 18139696  T
Q  208 a--atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139695 aatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18139615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 19230634 - 19230913
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19230634 tgttggtgtacgccctagaggccaatagttaatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 19230733  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19230734 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 19230833  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230834 aaatgtatccgtagtcaaaacattaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19230913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10669456 - 10669179
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10669456 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 10669357  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  10669356 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatataataagtgtgacttaatcatcagattacattatcataaagaacgttattctt 10669257  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669256 aaatgtatccgtagtc-aatcttt-atattaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 10669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47167413 - 47167136
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47167413 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatattta 47167314  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  47167313 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactttatcatgagattacattatcataaagaacgttattctt 47167214  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47167213 aaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18259678 - 18259402
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259678 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18259579  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  18259578 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattctt 18259479  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18259478 aaatgtatccatagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaatcgtcgagagtattatgtatgttgactgat 18259402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 34128322 - 34128598
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34128322 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 34128421  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  34128422 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattttt 34128521  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34128522 aaatgtatccgtagt-taagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagattattatgtatgtagactgatg 34128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41681502 - 41681250
Alignment:
Q  34 agtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaat 133  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41681502 agtttatattaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatataacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttggaat 41681403  T
Q  134 agatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaat 233  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41681402 agatagtttatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcttatagaatgttattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaat 41681303  T
Q  234 atgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41681302 atgaataaaggataataataaagctttgagactattatgtatgtagactgatg 41681250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 28130309 - 28130586
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  28130309 tgttggtgtaagccctatatgccaatagtttatgttgaacttatcttatgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatattta 28130408  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  28130409 taataatgttaatgaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaaaacgctattctt 28130508  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28130509 aaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatg 28130586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19393963 - 19393705
Alignment:
Q  23 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  19393963 tagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattatatctgtagtaatgttaataa 19393864  T
Q  122 agtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagt 221  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19393863 agtctctataatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaatgctattcttaaatgtatctgtagt 19393764  T
Q  222 caaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 282  Q
    | |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19393763 c-aagctttaatatgagt-tgggataattataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 19393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 14585913 - 14586191
Alignment:
Q  13 gtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatta------ttgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||      || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14585913 gtgtaagccgtaaatgccaatagtttaagttaaatttatgttatgtatcatgacttttattactattattaaataatatatgtcactctttattatattt 14586012  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
        ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  14586013 gttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaatgaacgctattat 14586112  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14586113 taaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-tggaataataataaagcgtcgagacttttatgtatgcagactgatg 14586191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 286
Target Start/End: Original strand, 15999791 - 16000007
Alignment:
Q  69 ttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgact 167  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15999791 ttattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaattaagtacctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgact 15999890  T
Q  168 taatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacta 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15999891 taatcatgagattacattaccttaaagaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactt 15999988  T
Q  268 ttatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15999989 ttatgtatgcagactgatg 16000007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 2935846 - 2936056
Alignment:
Q  73 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 171  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2935846 tattaaataatatatgtcactcttcattatatttgttgtaatgttaataaagtccctagaataaatagttcatgtaattatatattaagtg--acttaat 2935943  T
Q  172 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 271  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2935944 catgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgcgataataataaagcatcgagactgttat 2936041  T
Q  272 gtatgtagactgatg 286  Q
     ||||||||||||||    
T  2936042 ttatgtagactgatg 2936056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42150626 - 42150363
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatctt-atgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42150626 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatctttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatattt 42150527  T
Q  107 aga-----taatgttaataaagtcc--ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgc 199  Q
      |     |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||     
T  42150526 gtaggtagtaatgttaataaagcccctatagaatagatagttc-tgt-------------gtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgt 42150441  T
Q  200 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagact--attatgtatgta 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42150440 tattc-taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcgagactaaattatgtatgta 42150363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 22994055 - 22994176
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22994055 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22994154  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtcctt 128  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  22994155 tagtaatgttaataaagtcctt 22994176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 3587657 - 3587934
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||     
T  3587657 tgttggtgtaagccctaaatgtcaatagtttatgtgaaacttatgctatgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattataattg 3587756  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
       |||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||    
T  3587757 ttgtaagattaataaagtccatagaataggtagtttatgtgatgaaatattaactgtgacttaatcatgagattactttaacataaaaaacgttattctt 3587856  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3587857 aaatgaatctatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgtagagactattatgtatatagaccgatg 3587934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 22968697 - 22968975
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 105  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  22968697 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 22968795  T
Q  106 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 204  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  22968796 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 22968895  T
Q  205 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22968896 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 22968975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24443772 - 24443604
Alignment:
Q  115 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 214  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  24443772 ttaataaagtccctataatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcacgagattacattaacataaagaacgatattcttaaatgtat 24443673  T
Q  215 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24443672 ccgtag-ccaagctttaatataaat--gggatgataacaaagtgtaaagactattatgtatgtagactgatg 24443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15170581 - 15170307
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 109  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||        
T  15170581 tggtgtaagccttgaaggctaatagtttatgttaaatttattctatgtatcgtgagttttaatattaaataatatacgacattctttattataattgttg 15170482  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||    
T  15170481 taaaattaataaagtccataaaatagat-gttcatgtaatggaatattaagtgggacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaa 15170383  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa---ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15170382 tatatttgtagtc-aagctttaatat--ataaattgggataataataaagcgtagagactattatatatgtagactgat 15170307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 48813749 - 48813825
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813749 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 48813825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24444074 - 24443932
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 106  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  24444074 tgttggtgtaagtcttagaggtcaatagcttatgttaaacttatgttatctatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatatttg 24443975  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 149  Q
      ||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24443974 ttataagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaat 24443932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31191000 - 31190722
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg----tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||    | |||| || |    | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  31191000 tgttggtgtaagccttagaggccaataatttatgttaaacttatgctatgacattttcataacatactatgttaaataatatatggcactttttattata 31190901  T
Q  104 tttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 202  Q
    |||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| | || | |||  |||    
T  31190900 tttgttgtaatgttaataaagtccccaga-tagatagttcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcgtttgcttacattaacataaataacattat 31190802  T
Q  203 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactga 284  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31190801 tattaaatatatccttagtc-aagctttagtataaat-tgggataataataaagcaccgagactattacgtatgtaggctga 31190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25845796 - 25845736
Alignment:
Q  243 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 301  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25845796 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25845736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25846215 - 25846155
Alignment:
Q  243 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 301  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25846215 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25846155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25846443 - 25846379
Alignment:
Q  23 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat 87  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25846443 tagaggtcaatattttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataaaatat 25846379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5983324 - 5983259
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatta 74  Q
    |||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  5983324 ttggtgtaagccctggatgccattaattttatgttaaacttatgatatgtatcatgacttttatta 5983259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 16788818 - 16789096
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788818 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 16788917  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788918 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 16789017  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789018 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 16789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22860444 - 22860165
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860444 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 22860345  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860344 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22860245  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860244 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1586663 - 1586385
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586663 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1586564  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1586563 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 1586464  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586463 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 1586385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13995498 - 13995220
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13995498 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13995399  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13995398 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctta 13995299  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995298 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 13995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18020396 - 18020118
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18020396 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattca 18020297  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18020296 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattattttaaagaacgctattctta 18020197  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020196 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27508903 - 27508624
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27508903 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27508804  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27508803 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattctt 27508704  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508703 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgtataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27508624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27528489 - 27528210
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27528489 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27528390  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27528389 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaaattacattatattatagaacgctattctt 27528290  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27528289 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27528210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 14074226 - 14074505
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074226 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaaaatatcttatgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatattt 14074325  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14074326 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactagtctt 14074425  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074426 aaatgtatatgtagtcaaagctttaatatgaataaagtataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 14074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8612664 - 8612940
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8612664 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattca 8612763  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8612764 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 8612863  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612864 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 13947501 - 13947704
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947501 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatattt 13947600  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947601 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 13947700  T
Q  207 aaat 210  Q
    ||||    
T  13947701 aaat 13947704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5759034 - 5758758
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5759034 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattta 5758935  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  5758934 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacaatattatt 5758835  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5758834 aaatgtatccgtagt-aaagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagaatattatgtatgtagactgatg 5758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17121002 - 17120741
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccc-tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17121002 tgttggtgtaagcccctagaggtcaatagtttatgttaaactcatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg--actctttattatattt 17120905  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  17120904 ataataatgttaataaaatccctagaatagatagttcgtataataatatattaagtgtgacttagtcatgagattatattatcataaagaacgttattct 17120805  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 271  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17120804 taaatgtatccattgtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 17120741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20736882 - 20736605
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20736882 tgttggtgtatgccctagaggccaataggttatgttaatcttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatatttg 20736783  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||    
T  20736782 ttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaacataaagaacattattctt 20736683  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20736682 aaatgtatctgtagtc-aagctttaataagaa-ctgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 19218176 - 19218454
Alignment:
Q  5 atctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 104  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19218176 atctgttggtgtaacccctatagtccaatagtttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattatat 19218275  T
Q  105 tt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctatt 203  Q
    ||    |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||    
T  19218276 ttgttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcataaagaatgctatt 19218375  T
Q  204 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19218376 cttaaa-gcatcagtagtc-aagctttaatat--aaaggggataataataaagtgtagagactattatgtatgtagactgatg 19218454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 14996859 - 14997007
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14996859 tgttggtgtaagatctagaggccaatattttatgttaaacttatcttatgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttattatattta 14996958  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 156  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996959 tataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 14997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22560740 - 22560461
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22560740 tgttggtgtaagccctagaagccgatagtttatgttaaaattatgcagtgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttattatattta 22560641  T
Q  108 -gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacg--ctattc 204  Q
        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  |||| |   ||| |    
T  22560640 ttgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggatattaagtgtgactcaatcatgagatgacattaacattaagaatgttttatcc 22560541  T
Q  205 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22560540 ttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatg 22560461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 4073320 - 4073595
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  4073320 tgttggtgtaagtcttagatgccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgatttttatcattaaataaaatatggcattctttattacatttg 4073419  T
Q  108 gataatgt-----taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 202  Q
      |  |||     ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||  |||    
T  4073420 tttgttgtaagattaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatggaaagaacattat 4073519  T
Q  203 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4073520 tcttaaaagtatccgtagtcaaa-ctttaatataaat-caggataataataaaacgtagagactattatgtttgtaga 4073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 286
Target Start/End: Original strand, 21994406 - 21994613
Alignment:
Q  78 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 176  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21994406 aataatatatgatactctttattatacttgttgtaatattaataaagtcccaataatagatagttcgtgtaatggtatattaattgtgacttaatcatga 21994505  T
Q  177 gattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 276  Q
    ||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  21994506 gattacattaatataaagaacactattcttaaatgtatccatagtc-gagctttaatataaat-tggaataataataaagcgcaaagactattatatatg 21994603  T
Q  277 tagactgatg 286  Q
    ||||||||||    
T  21994604 tagactgatg 21994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10359588 - 10359410
Alignment:
Q  9 gttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attta 107  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||| || | ||||| || |||      
T  10359588 gttggtgtaagttttagaggtcaatagtttatgttaaacttatcgtatgtattatgatttttaatattaaataaaatatgacattatttatcataattgt 10359489  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 186  Q
     ||||  |||||||||||  || |||| ||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359488 tataagattaataaagtctctataatatatagttgatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 10359410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 21993711 - 21993786
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 84  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21993711 tgttggtgtaagccctatag-ccaataatttatgttaaacctatgatatgtatcatgacttttattattaaataata 21993786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 11248530 - 11248569
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11248530 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 11248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23846923 - 23846851
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataa 82  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23846923 ttggtataagctatagaggtcaatagtttatattaaacttgtcatatgtatcatgacttttaatattaaataa 23846851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10359368 - 10359326
Alignment:
Q  244 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10359368 gataataataaagcgtagagactattatatatgtagagtgatg 10359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23846755 - 23846668
Alignment:
Q  193 agaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  23846755 agaacactattcttaaaagtatctgtagtcaaa-ctttaatataaattg-ggataataatatagtacagagactattatgtatgtagact 23846668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 2676760 - 2677038
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676760 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 2676859  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676860 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2676959  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676960 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 15461244 - 15461522
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461244 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15461343  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461344 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 15461443  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461444 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 15814768 - 15815046
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814768 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15814867  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814868 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 15814967  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814968 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15815046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18111598 - 18111320
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111598 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttgaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18111499  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111498 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18111399  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111398 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18111320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 20243684 - 20243962
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243684 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20243783  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243784 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 20243883  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243884 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 26531360 - 26531638
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531360 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatattaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26531459  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531460 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 26531559  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531560 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26531638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3369578 - 3369300
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369578 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 3369479  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369478 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 3369379  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369378 aatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 18162909 - 18163187
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18162909 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattacattta 18163008  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163009 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18163108  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163109 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17300515 - 17300236
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300515 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 17300416  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300415 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgaaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 17300316  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300315 aaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 17300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4676538 - 4676260
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4676538 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatattta 4676439  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676438 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4676339  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676338 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 4676260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 5870159 - 5870443
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta------tta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||      |||    
T  5870159 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatttttatta 5870258  T
Q  102 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870259 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 5870358  T
Q  202 ttcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5870359 ttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 5870443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 34975298 - 34975576
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34975298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatattta 34975397  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34975398 gataatgttaataaagtccttagaatagatggttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 34975497  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975498 aatgtatttgtagtcaaagttttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 34975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 38816458 - 38816694
Alignment:
Q  6 tctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38816458 tctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatt 38816557  T
Q  106 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816558 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 38816657  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816658 taaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 38816694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 1941472 - 1941749
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1941472 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 1941571  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  1941572 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 1941671  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941672 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 1941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11484472 - 11484265
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484472 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 11484373  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484372 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 11484273  T
Q  208 aatgtatc 215  Q
    ||||||||    
T  11484272 aatgtatc 11484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Original strand, 9487301 - 9487575
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9487301 ttggtgtaagccctaggggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttata 9487400  T
Q  110 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 208  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  9487401 gtaatgttaataaagcccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacgttattcttaa 9487500  T
Q  209 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9487501 atgtatccgtagtc-aagatttaatatgaat-taggataataataaagcgttgagactattatgtatgttgactgat 9487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 286
Target Start/End: Original strand, 11420768 - 11421041
Alignment:
Q  12 ggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-t 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  11420768 ggtggaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattttttgt 11420867  T
Q  111 aatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaat 210  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  11420868 aatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtgcaatgatatattaagtgtgatttaatcattagattacattaacataaagaacgctattcttaaat 11420967  T
Q  211 gtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420968 gtatccgtagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcttcgagactattatgtatgtagactgatg 11421041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30041029 - 30040751
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  30041029 ctgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatattt 30040930  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
        ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  30040929 gttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattct 30040830  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30040829 taaatgtatctatagtc-aagcgttaatatgaat-tgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatg 30040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 285
Target Start/End: Original strand, 4545948 - 4546104
Alignment:
Q  127 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4545948 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttagtcatgagaatactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagt-taag 4546046  T
Q  227 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4546047 ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 4546104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Original strand, 19365389 - 19365544
Alignment:
Q  129 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 228  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19365389 agaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagct 19365487  T
Q  229 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||| |||   || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  19365488 ttaatataaat-tggggtaataataaagtgttgagactattatatacgtagactgatg 19365544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Original strand, 4545860 - 4545950
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4545860 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 9537705 - 9537926
Alignment:
Q  3 caatctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat 102  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  9537705 caatttgttggtgtaagccccagaggccaatagtttatgttaaatttatgttatgtatcatgac-tttattattaaataatatatgtca-tttttattat 9537802  T
Q  103 -atttagataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 200  Q
     |||    |||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||  || | ||| |||||||| | || ||||||||    
T  9537803 aattgttgtaagattaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaatatcaagtgtgactctataaagagtttacattaacataaagaacgct 9537902  T
Q  201 attcttaaatgtatccgtagtcaa 224  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  9537903 attcttaaatgtatatgtagtcaa 9537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 19362229 - 19362435
Alignment:
Q  73 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 171  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    |||  | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||    
T  19362229 tattaaataatatatgacattctttattatatttgttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaagtgtgagttaat 19362328  T
Q  172 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 271  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |       ||||||||| || | ||||||||||||    
T  19362329 catgagattacattaacgtaaggaacgcttttcttaaatgtatcagtagtc-aagctttaatataa-------ataataatacagtgccgagactattat 19362420  T
Q  272 gtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||    
T  19362421 gtatgtagattgatg 19362435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5529013 - 5528762
Alignment:
Q  28 gccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-atttagataatgttaataaagtcc 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| || | |||||||| |||    |||  |||||||| |||    
T  5529013 gccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacatttattattaaatataatatgacattttttattataattgttgtaagattaataaaatcc 5528914  T
Q  127 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 226  Q
     ||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |  | |||||  |||||||||| || | | ||||| |||    
T  5528913 ctagaatagatagtgcatgtgatggaatattcagtgcgacttaatcacgagattacattaacacaaagaactatattcttaaaagtgttcatagtc-aag 5528815  T
Q  227 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 280  Q
    |||||| || ||   | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5528814 ctttaa-attaaatcatgataataataaagcgtatagactattatgtttgtaga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39422694 - 39422426
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||    
T  39422694 tgttggtgtaagtcgtagaggtcaatagttttatgttaaacttatgttacatatcatgattgttattattaaataaaatgacgcactatttattatattt 39422595  T
Q  107 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
        |||  ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||   | |||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  39422594 gttgtaagattaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaaacgagacttaatcgtgagattacattaacatataagacattattct 39422495  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 276  Q
    |||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39422494 taaaagtatttgtagacaaa-ctttaatatgaattaagg-tagtaataaagcgtatagactattatttatg 39422426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 286
Target Start/End: Original strand, 32636465 - 32636509
Alignment:
Q  242 aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32636465 aggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagactgatg 32636509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23056615 - 23056437
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  23056615 tgttggtgtaagcgctataggtgaatagttttatgttaaactgatgat-tgtatcatgacttttattgttaattaaaataaggcattctttgttatattt 23056517  T
Q  107 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatt 185  Q
       ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| | | |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23056516 tctataaaattaataaagtccctagaatatatagttcaagtaatgagacattaagtgagacttaatcgtaagattacatt 23056437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 19361597 - 19361661
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttat 72  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  19361597 tgttggtttaagccctataggccaattgtttatgttaaacttatgctatgtatcatgaattttat 19361661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Original strand, 56515990 - 56516255
Alignment:
Q  12 ggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagat 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    | |  ||||||||||||||   |    
T  56515990 ggtgtcagccctagaggtcaatagttttaagttaaagttatattttgtatcattacttttattattaaataatga--gactttctttattatatttgttt 56516087  T
Q  111 aatg-ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||||||||||  ||||| | ||||| | ||||||||  ||||||| ||    
T  56516088 taagattaataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaacatatagaacattattcttgaa 56516187  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 280  Q
     |||||  ||||| |||||||| | ||||| || |||| || |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  56516188 -gtatctatagtc-aagctttattgtgaat-aacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtaga 56516255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Original strand, 21797922 - 21798054
Alignment:
Q  53 ttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataat 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||   |||||||||| |||  ||||  |||||||||| | || |||| |||| ||| |||||||     
T  21797922 ttatgtatcataacttttattattaaataatatgaggtgttctttattat-tttctataagattaataaagttcctaaaatatatagatcgagtaataaa 21798020  T
Q  153 atattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 186  Q
    | |||||| | ||||||||| | |||||| ||||    
T  21798021 acattaagggagacttaatcgtaagattatatta 21798054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 21033985 - 21034263
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033985 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 21034084  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034085 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 21034184  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034185 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21034263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 12299658 - 12299936
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12299658 tgttgatgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatattta 12299757  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299758 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 12299857  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299858 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15847091 - 15846813
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847091 tgttggtgtaagcgctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15846992  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15846991 gataatgttaataaattccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattttcttaaagaacgctattctta 15846892  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846891 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15846813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 14890138 - 14890416
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14890138 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 14890237  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890238 tataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 14890337  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14890338 aatgtatccgtattcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgttgagactattatgtatgtagactgatg 14890416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 55426768 - 55427046
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55426768 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaatctatcttatgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 55426867  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426868 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtatgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 55426967  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426968 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 55427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20148110 - 20147831
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148110 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 20148011  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20148010 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 20147911  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147910 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 21398539 - 21398813
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21398539 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 21398638  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21398639 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaattatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 21398738  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398739 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgtcgagactattatgtatgtagact 21398813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25979282 - 25979006
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25979282 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 25979183  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25979182 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 25979083  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25979082 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 25979006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Original strand, 28087967 - 28088211
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28087967 ttggtgtaatccctaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttaga 28088066  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  28088067 taatattaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 28088166  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 254  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28088167 tagatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataa 28088211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Original strand, 11787382 - 11787611
Alignment:
Q  55 atgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11787382 atgtatcatgacttttcttattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 11787481  T
Q  154 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11787482 tattaaatgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataata 11787579  T
Q  254 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11787580 aagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 11787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 14146769 - 14147046
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14146769 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatttg 14146868  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
      ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |  | || ||||||  |    
T  14146869 ttataagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgaaactacattaacattaacaaagctatttct 14146968  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14146969 aaatgtatctgtagtc-aagctttaacataaat-tgggataataataaagcacagagactattatatatgtagactgatg 14147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 15526503 - 15526777
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  15526503 tgttggtgtaagccctataggccattaatttatgttaaacttaagctacgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattatatttg 15526602  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
      ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  15526603 ttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaatattaagggtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattctt 15526701  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15526702 aaatgcatatgtagtc-aagctttaatataaatga--gataataataaagcgtagagactattatgtttgtagactgat 15526777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 14225954 - 14226090
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  | |||||||||||     
T  14225954 tgttggtgtaagctctagagaccaatatttttatgttaaatttatgttatgtatcatgacttttattattaaataagataacgcgttttttattatatta 14226053  T
Q  107 a-gataatgttaataaagtccttagaatagatagttc 142  Q
    |   |||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  14226054 actgtaagattaataaagtccctaaaatagatagttc 14226090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 9455863 - 9456141
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455863 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 9455962  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455963 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 9456062  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456063 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 9456141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42817544 - 42817266
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817544 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 42817445  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817444 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 42817345  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817344 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 42817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47668030 - 47667751
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47668030 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 47667931  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667930 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 47667831  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667830 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20391795 - 20391516
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391795 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgagaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 20391696  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391695 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 20391596  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391595 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22670812 - 22670534
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670812 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 22670713  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670712 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22670613  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670612 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20780201 - 20779922
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780201 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttatatttatcttatgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatattt 20780102  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780101 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 20780002  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780001 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20779922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19706994 - 19706716
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19706994 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattta 19706895  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19706894 aacaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 19706795  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706794 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19706716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28135278 - 28135000
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135278 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28135179  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28135178 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctttaagaacgctattatta 28135079  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28135078 aatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatg 28135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43802921 - 43802642
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43802921 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacatatcttatgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatattt 43802822  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43802821 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaattatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 43802722  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802721 aaatgtattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 43802642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 22612234 - 22612517
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaa-taatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22612234 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatattt 22612333  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612334 agataatgttaataaagtccttagaatagaaagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22612433  T
Q  207 aaatgtatc----cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612434 aaatatatatattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 35930329 - 35930607
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35930329 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 35930428  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35930429 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 35930528  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35930529 aatgtatccgtagtcaaaactttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 35930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22235029 - 22234827
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 22234930  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234929 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22234830  T
Q  208 aat 210  Q
    |||    
T  22234829 aat 22234827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8727412 - 8727692
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtta-aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8727412 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttataacttatattacatatcataacatttactattaaataatatatggcactctttatcatactt 8727511  T
Q  107 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
       |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||    
T  8727512 gttataatgttaataaagtccctagaataaatt-ttcgtgtaattttatattaagtgtgactaaatcataagattactttaacataaagaacgttattct 8727610  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8727611 gaaatctatctgtagtcaaa-ctttaatatgaattgagataataataataaagcgtcgagactattatctatgtagactgatg 8727692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 633814 - 633959
Alignment:
Q  139 gttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  633814 gttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattaaattatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaa 633912  T
Q  239 taaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  633913 t-aaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 633959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26923900 - 26923675
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||| || | || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26923900 tgttggtgtaagtcccaaagtccattaggttatgttaaacttatcttatgtatca---cttttattattaaataatatatgacactctttattatatttg 26923804  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || | || | |||||||    
T  26923803 tagtgatgttaataaagtttctagaatagatagttcgtgtaattgtatattgagtgtgacttaatcattagattacattaacataaataatgttattctt 26923704  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatg 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26923703 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatg 26923675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21881931 - 21881653
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 105  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  21881931 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 21881833  T
Q  106 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 204  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  21881832 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 21881733  T
Q  205 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  21881732 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 21881653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 277
Target Start/End: Original strand, 29096580 - 29096739
Alignment:
Q  115 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  | |||||  |||||||||| ||||    
T  29096580 ttaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcgtaagattacattaacaaaaagaactttattcttaaaagtat 29096679  T
Q  215 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgt 277  Q
      |||||| ||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29096680 atgtagtc-aagcttt-atatatatcga-gataataataaagcgtagagactattatgtatgt 29096739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Original strand, 14482299 - 14482337
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 46  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482299 tgttagtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 14482337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Original strand, 16435837 - 16435877
Alignment:
Q  245 ataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16435837 ataataataaagcgtagagactaatatgtatgtagactgat 16435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Original strand, 16435649 - 16435728
Alignment:
Q  60 tcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata-tttagataatgttaataaagtccttagaatagata 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16435649 tcatgacttttattattaaataaaatgagacattctttattatattttatataagattaataaagttcttagaatagata 16435728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 119477 - 119755
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119477 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 119576  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119577 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 119676  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119677 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatg 119755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24933861 - 24933583
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933861 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 24933762  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933761 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24933662  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933661 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24933583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 31646 - 31924
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31646 tgttggtgtaagccttagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31745  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31746 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 31845  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 23545669 - 23545947
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545669 tgttggtgtgagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatattta 23545768  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545769 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 23545868  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545869 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 23545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12790219 - 12789940
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790219 ctgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 12790120  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790119 agataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 12790020  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790019 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25805941 - 25805662
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805941 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 25805842  T
Q  107 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25805841 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 25805742  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805741 aaatatatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 22940997 - 22941275
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22940997 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22941096  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22941097 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaatgttattctta 22941196  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941197 aatgtatccgtagtcaaagctttaatttgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 31096563 - 31096841
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096563 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31096662  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31096663 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgggattacattatcttaaagaacgttattctta 31096762  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096763 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31096841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 20940774 - 20941052
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940774 tgtttgtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20940873  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20940874 gataatgttaataatgtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaactgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattctta 20940973  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940974 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12765544 - 12765271
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  12765544 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 12765445  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12765444 taatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 12765345  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765344 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12765271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7865987 - 7865711
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7865987 tgttggtttaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattca 7865888  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  7865887 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 7865788  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865787 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 7865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12704428 - 12704155
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  12704428 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 12704329  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12704328 taatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 12704229  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12704228 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 12704155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9812287 - 9812014
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  9812287 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 9812188  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  9812187 taatgctaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattattaaa 9812088  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9812087 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 9812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 26244850 - 26245127
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  26244850 tgttggtgtaagctctggaggccaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttatattta 26244949  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  26244950 tagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaatgttattctt 26245049  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26245050 aaatgtatctgtaatc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26245127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 5097414 - 5097676
Alignment:
Q  22 ctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaata 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  5097414 ctagaggctaata-tttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattatatttatagtaatgttaata 5097512  T
Q  121 aagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 220  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||  ||||    
T  5097513 aagtccctggaatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatttgtag 5097612  T
Q  221 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097613 tc-aagttttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 5097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 39535211 - 39535489
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39535211 tgttggtgtatgccctagaggtcaatagtttatgttaaatttacgttatgtatcatgaattttttttattaaataatatatgacactctttattatattt 39535310  T
Q  107 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
       |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  39535311 gttataatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaccttaaagaacgatattct 39535410  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39535411 taaatgtatccgtactcaaa-ctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 39535489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20100793 - 20100520
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||       
T  20100793 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtcagacttatgttatgtatcatgacttttattattcaataatat--gacattctttattatatttgtt 20100696  T
Q  110 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 208  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||    
T  20100695 gtaagattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaataacgttattcttaa 20100596  T
Q  209 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20100595 atgtattcgtagttaaa-ctttaatataaat-tgggataataataaagcgtcacgactattatgtatgtagactgatg 20100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26130249 - 26129974
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatt--atatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  26130249 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgataaacttatgttatgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaatact 26130150  T
Q  106 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 204  Q
    |    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| | | ||||| ||| | |  |||||||| |||    
T  26130149 tgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatggaatatttagtgtgacttaatcctaatattactttaacattaagaacgctcttc 26130050  T
Q  205 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26130049 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagaatattatgtatgtagact 26129974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31652338 - 31652208
Alignment:
Q  11 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-aga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||        
T  31652338 tggtgtaagccttaaaggccaata-tttatgttaaacttacgctttgtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatttgttg 31652240  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagtt 141  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31652239 taagattaataaagtccctagaatagatagtt 31652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31267982 - 31267939
Alignment:
Q  243 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31267982 ggataacaataaagcgtggagactattatgtatgtagacggatg 31267939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8052 - 8330
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8151  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8152 tataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 8251  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8252 aatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15376 - 15100
Alignment:
Q  10 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 15277  T
Q  110 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15276 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaa 15177  T
Q  210 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15176 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 1
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  273 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttttgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatattta 174  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 74  T
Q  208 a----atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 276  Q
    |    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 aatatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40249 - 40015
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40249 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 40150  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40149 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattctta 40050  T
Q  208 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40049 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 40015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19391 - 19160
Alignment:
Q  6 tctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19391 tctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttataaaaaaaatatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 19292  T
Q  106 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19291 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 19192  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19191 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 19160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 67928 - 67651
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67928 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 67829  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  67828 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 67729  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67728 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 67651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8847 - 9135
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatg-acttttattatt-gaataatatatggcactctttattatatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8847 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatatt 8946  T
Q  106 tagataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatag-aacgctatt 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8947 tagataatgttaataaagtaccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagtaacgctatt 9046  T
Q  204 ctt-aaatgtatccgtagtc-aaagc-tttaatatgaat-aaaggataat-aataaagcgt-cgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9047 cttaaaatgtatccgtagtcaaaagcttttaatatgaataaaaggataataaataaagcgtacgagactattatgtatgtagactgatg 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45502 - 45226
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45502 tgttggtgtaagcccaaaaggccaatagtttctgttaaacttatcttatgcatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 45403  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45402 tagtaatgttaataaagtccttacaatagatagttcttgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 45303  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45302 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatattaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 45226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12083 - 11807
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12083 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtattta 11984  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11983 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 11884  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11883 aaatgtatctgtagtc-aatctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgaaactattatgtatgtagattgatg 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18969 - 18786
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18870  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctta 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18869 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctta 18786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 286
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  79 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaataatgaga 100  T
Q  179 ttacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgta 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 ttacattatcttatagaacgctgttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataatggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtc 200  T
Q  279 gactgatg 286  Q
    ||||||||    
T  201 gactgatg 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 961
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1070  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1069 gataatgttaataaagtccttataatagatagtttttttaataatatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcttaaagaacgttattctta 970  T
Q  208 aatgtatcc 216  Q
    |||||||||    
T  969 aatgtatcc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 76307 - 76496
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  76307 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatattta 76406  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  76407 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaac 76496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40542 - 40265
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  40542 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgctatgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttt 40443  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
       |||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  40442 ttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcatgagaatacattaacgtaaagaacgctattctt 40343  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40342 aaatgtatccatagtc-aagctttaatataaattga-gataataataaagcgccgagactattatgtatgtagactgatg 40265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13489 - 13226
Alignment:
Q  23 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||    
T  13489 tagaggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatatttgtagtaatgctaataa 13390  T
Q  122 agtccttagaatagatagttcgtgt-aataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13389 agtccctagaatagatagttcatgtaaatgatatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaacataaaaaacagtattcttaaatgtatccatag 13290  T
Q  221 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13289 tc-aagctttaatattaat-tgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatg 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9672
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9516 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatattta 9615  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9616 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 53521 - 53790
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  53521 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattcgattca 53620  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 206  Q
     | ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  53621 tagtaatgttaataaagtccctagagtaaatagttcatgtaatgatatattaagtgtg--------atgagattacattaacataaagaacactattctt 53712  T
Q  207 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53713 aaatgtatccgtattc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagtgtcaagactattatgtatgtagattgatg 53790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34060 - 33927
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34060 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatattta 33961  T
Q  108 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33960 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 33927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 220
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26567
Alignment:
Q  67 ttttattattgaataatatatggcactctttattatatt--tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattatattcgttg-taatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatcgtatattaagtgtg 26511  T
Q  165 acttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26512 acttaatcatgagattacattataataaagaacgttattcttaaatgtatcagtag 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13740 - 13861
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13740 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13839  T
Q  108 ga-taatgttaataaagtcctt 128  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  13840 tagtaatgttaataaagtcctt 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8756
Alignment:
Q  8 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 106  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | ||||    
T  8479 tgttggtgtaaatcctagaggttaatagttttatgttaaaattattttatgtatcgtgatttttattattaaataaaatgaggtattctttatgaaattt 8578  T
Q  107 -agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 205  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  8579 gatataatattaataaagtccttagaatatatagttcaagtaatgg-acattatgtgagacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattct 8677  T
Q  206 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||||  |||||| ||| |||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8678 taaaagtatttgtagtc-aagttttaatataaattga-gatagtaataaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatg 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0783 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:

Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Original strand, 6222 - 6284
Alignment:
Q  3 caatctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6222 caatgtgttggtgtaagccctagaagccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 1825 - 1875
Alignment:
Q  7 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1825 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg 1875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 83423 - 83292
Alignment:
Q  153 atattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataat 252  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| |||  |  | ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||  || ||||||||    
T  83423 atattaagtgagacttaattgtgagattaaattcacacaaagaatactattcttaaaagtatccgtagtcgaaa-tttaatataaattgag-ataataat 83326  T
Q  253 aaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 286  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  83325 aaagtgtatagactattatgtatgtagactgatg 83292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University