View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7861_low_36 (Length: 306)

Name: NF7861_low_36
Description: NF7861
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7861_low_36
NF7861_low_36
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (10-306)||(9548419-9548715)
chr5 (10-306)||(15658636-15658932)
chr5 (10-306)||(9317441-9317737)
chr5 (10-306)||(12132145-12132441)
chr5 (10-302)||(8665355-8665647)
chr5 (10-306)||(30152008-30152304)
chr5 (10-302)||(2511041-2511333)
chr5 (10-306)||(11549344-11549640)
chr5 (10-302)||(15758737-15759029)
chr5 (10-306)||(22998990-22999286)
chr5 (10-306)||(23752326-23752622)
chr5 (10-306)||(5637900-5638196)
chr5 (10-306)||(23717864-23718160)
chr5 (10-306)||(26480382-26480678)
chr5 (4-302)||(6874289-6874587)
chr5 (10-302)||(30168459-30168751)
chr5 (13-306)||(30934626-30934919)
chr5 (10-306)||(33777477-33777773)
chr5 (10-302)||(41674699-41674991)
chr5 (10-302)||(18375292-18375584)
chr5 (10-306)||(24688033-24688329)
chr5 (35-306)||(18500606-18500877)
chr5 (16-306)||(24970014-24970304)
chr5 (10-306)||(33516346-33516642)
chr5 (34-302)||(34616532-34616800)
chr5 (35-306)||(28649250-28649521)
chr5 (10-302)||(29966946-29967238)
chr5 (10-302)||(30029405-30029697)
chr5 (37-306)||(43078269-43078538)
chr5 (43-306)||(31431463-31431726)
chr5 (35-306)||(37671359-37671630)
chr5 (35-302)||(37754995-37755262)
chr5 (35-302)||(37770867-37771134)
chr5 (34-302)||(28959666-28959934)
chr5 (35-302)||(3789556-3789823)
chr5 (37-302)||(31826287-31826552)
chr5 (34-302)||(32599352-32599620)
chr5 (10-306)||(37358519-37358815)
chr5 (37-305)||(40473426-40473694)
chr5 (37-302)||(24681457-24681722)
chr5 (37-302)||(24723984-24724249)
chr5 (35-306)||(13324705-13324976)
chr5 (10-306)||(23892196-23892492)
chr5 (31-306)||(29888958-29889233)
chr5 (13-306)||(22888463-22888756)
chr5 (13-306)||(25199022-25199315)
chr5 (34-306)||(11325808-11326080)
chr5 (34-306)||(33877261-33877533)
chr5 (34-302)||(33292539-33292807)
chr5 (34-306)||(13184524-13184796)
chr5 (34-306)||(13440370-13440642)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (10-306)||(34286331-34286627)
chr2 (10-306)||(34291391-34291687)
chr2 (10-281)||(34279426-34279697)
chr2 (10-302)||(21677154-21677446)
chr2 (10-306)||(34861657-34861953)
chr2 (10-303)||(37685880-37686173)
chr2 (10-303)||(37701145-37701438)
chr2 (10-306)||(12655519-12655815)
chr2 (10-302)||(22926000-22926292)
chr2 (10-306)||(23128534-23128830)
chr2 (10-306)||(28882191-28882487)
chr2 (10-306)||(32049775-32050071)
chr2 (4-306)||(11635154-11635456)
chr2 (4-306)||(11641343-11641645)
chr2 (10-305)||(37925470-37925765)
chr2 (10-306)||(20837895-20838191)
chr2 (10-306)||(27434412-27434708)
chr2 (10-306)||(16829306-16829602)
chr2 (10-306)||(16891879-16892175)
chr2 (10-302)||(19416471-19416763)
chr2 (10-302)||(31876258-31876550)
chr2 (35-305)||(37375163-37375433)
chr2 (10-306)||(13936512-13936808)
chr2 (34-306)||(39890075-39890347)
chr2 (43-306)||(260721-260984)
chr2 (37-305)||(40233515-40233783)
chr2 (10-302)||(12716574-12716869)
chr2 (37-306)||(27777226-27777495)
chr2 (37-306)||(27816984-27817253)
chr2 (37-306)||(27803711-27803980)
chr2 (37-306)||(39051790-39052059)
chr2 (37-306)||(12586814-12587083)
chr2 (37-306)||(9349950-9350219)
chr2 (13-306)||(21703132-21703425)
chr2 (31-306)||(31891296-31891571)
chr2 (13-306)||(19456389-19456682)
chr2 (31-306)||(27118686-27118961)
chr2 (31-306)||(34303271-34303546)
chr2 (34-306)||(3784655-3784927)
chr2 (34-306)||(16163600-16163872)
chr2 (34-306)||(34157012-34157283)
chr2 (37-306)||(27392973-27393242)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (4-306)||(28115974-28116276)
chr3 (10-306)||(29148775-29149071)
chr3 (10-302)||(18277076-18277368)
chr3 (10-302)||(18292377-18292669)
chr3 (10-302)||(18307678-18307970)
chr3 (10-306)||(7073154-7073450)
chr3 (10-302)||(47023395-47023687)
chr3 (4-306)||(4416855-4417157)
chr3 (10-306)||(5713169-5713465)
chr3 (10-306)||(5724079-5724375)
chr3 (10-306)||(5757102-5757398)
chr3 (10-306)||(5767993-5768289)
chr3 (10-306)||(6192258-6192554)
chr3 (10-302)||(7996504-7996796)
chr3 (10-302)||(10643012-10643304)
chr3 (10-302)||(31964497-31964789)
chr3 (10-302)||(50134095-50134387)
chr3 (10-306)||(4796673-4796969)
chr3 (10-302)||(5609346-5609638)
chr3 (10-306)||(10396075-10396371)
chr3 (10-306)||(18330611-18330907)
chr3 (10-302)||(28339244-28339536)
chr3 (10-306)||(35880708-35881004)
chr3 (10-306)||(15741114-15741410)
chr3 (13-306)||(8295917-8296210)
chr3 (13-306)||(8301287-8301580)
chr3 (10-305)||(21674635-21674930)
chr3 (10-306)||(4721573-4721869)
chr3 (10-306)||(18051204-18051500)
chr3 (10-306)||(15892726-15893022)
chr3 (10-302)||(5013654-5013946)
chr3 (10-302)||(18225133-18225425)
chr3 (10-302)||(24328101-24328393)
chr3 (10-306)||(17984976-17985272)
chr3 (34-306)||(22387598-22387870)
chr3 (34-306)||(22870876-22871148)
chr3 (34-306)||(22885935-22886207)
chr3 (37-305)||(48465896-48466164)
chr3 (43-306)||(8211713-8211976)
chr3 (34-306)||(4346707-4346979)
chr3 (37-305)||(11110370-11110638)
chr3 (10-302)||(18242681-18242973)
chr3 (35-302)||(5596381-5596648)
chr3 (35-302)||(6542486-6542753)
chr3 (36-306)||(5466953-5467223)
chr3 (34-306)||(28021241-28021513)
chr3 (43-306)||(51781998-51782261)
chr3 (37-302)||(36997101-36997366)
chr3 (43-306)||(51797087-51797351)
chr3 (37-306)||(20576867-20577136)
chr3 (37-306)||(29664990-29665259)
chr3 (34-306)||(31034137-31034409)
chr3 (31-306)||(32292715-32292990)
chr3 (31-306)||(18530351-18530626)
chr3 (13-306)||(16626526-16626819)
chr3 (34-302)||(32439120-32439388)
chr3 (34-306)||(5652353-5652625)
chr3 (34-306)||(17993804-17994076)
chr3 (34-306)||(4625910-4626182)
chr3 (35-302)||(20066010-20066277)
chr3 (34-245)||(4893176-4893387)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (10-302)||(14763287-14763579)
chr4 (10-306)||(27163296-27163592)
chr4 (4-306)||(5005863-5006165)
chr4 (13-306)||(24592293-24592586)
chr4 (10-306)||(40105617-40105913)
chr4 (10-306)||(14665014-14665310)
chr4 (10-306)||(17013996-17014292)
chr4 (10-305)||(6569849-6570144)
chr4 (10-302)||(14098537-14098829)
chr4 (10-306)||(31126497-31126793)
chr4 (35-306)||(18800592-18800863)
chr4 (35-302)||(54833408-54833675)
chr4 (37-302)||(30753777-30754042)
chr4 (35-306)||(36344494-36344765)
chr4 (37-306)||(33673777-33674046)
chr4 (10-306)||(21969697-21969993)
chr4 (37-299)||(39850661-39850923)
chr4 (13-306)||(15227869-15228162)
chr4 (13-306)||(15284907-15285200)
chr4 (13-306)||(1900256-1900549)
chr4 (34-302)||(34188943-34189211)
chr4 (34-302)||(24112682-24112950)
chr4 (34-306)||(24460584-24460856)
chr4 (31-306)||(14235504-14235779)
chr4 (37-306)||(15391317-15391586)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (10-306)||(5147205-5147501)
chr7 (10-306)||(4144988-4145284)
chr7 (10-302)||(16736329-16736621)
chr7 (10-302)||(16751383-16751675)
chr7 (10-302)||(17523514-17523806)
chr7 (10-302)||(17529409-17529701)
chr7 (10-306)||(26319734-26320030)
chr7 (10-306)||(26274959-26275255)
chr7 (10-306)||(45387325-45387621)
chr7 (10-306)||(9618633-9618929)
chr7 (10-306)||(11424641-11424937)
chr7 (10-306)||(26669779-26670075)
chr7 (10-305)||(5127974-5128269)
chr7 (10-306)||(2154555-2154851)
chr7 (13-306)||(10916733-10917026)
chr7 (10-306)||(16503245-16503541)
chr7 (10-306)||(26435239-26435535)
chr7 (10-306)||(16518281-16518577)
chr7 (10-306)||(24592406-24592702)
chr7 (35-306)||(31564255-31564526)
chr7 (37-302)||(26537739-26538004)
chr7 (37-302)||(3445315-3445580)
chr7 (10-302)||(31124902-31125194)
chr7 (43-302)||(11441587-11441846)
chr7 (13-306)||(16041308-16041601)
chr7 (31-306)||(2108870-2109145)
chr7 (31-306)||(26484697-26484972)
chr7 (31-306)||(16449863-16450138)
chr7 (31-306)||(39210888-39211163)
chr7 (34-306)||(2775365-2775637)
chr7 (31-302)||(18540802-18541073)
chr7 (34-302)||(5159525-5159793)
chr7 (34-306)||(31088329-31088601)
chr7 (34-306)||(45733466-45733738)
chr7 (166-306)||(4200685-4200825)
chr7 (37-138)||(26485756-26485857)
chr7 (166-306)||(26682865-26683005)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (10-306)||(16749832-16750128)
chr6 (10-306)||(24304540-24304836)
chr6 (10-306)||(24863695-24863991)
chr6 (10-306)||(27000051-27000347)
chr6 (10-306)||(13298873-13299169)
chr6 (10-306)||(26988979-26989275)
chr6 (10-306)||(26918358-26918654)
chr6 (11-306)||(15424239-15424534)
chr6 (13-306)||(22934802-22935095)
chr6 (13-306)||(23857247-23857540)
chr6 (10-306)||(29572991-29573287)
chr6 (1-306)||(27272502-27272807)
chr6 (34-306)||(29549477-29549749)
chr6 (10-306)||(30557938-30558234)
chr6 (35-306)||(4757767-4758038)
chr6 (37-302)||(34463272-34463537)
chr6 (10-302)||(16943953-16944245)
chr6 (10-306)||(27359914-27360210)
chr6 (10-306)||(27450257-27450553)
chr6 (37-306)||(3696086-3696355)
chr6 (35-306)||(4773009-4773280)
chr6 (35-302)||(27044390-27044658)
chr6 (43-302)||(4545701-4545960)
chr6 (35-306)||(27007730-27008001)
chr6 (34-302)||(26777541-26777809)
chr6 (35-302)||(26116336-26116603)
chr6 (35-302)||(29501418-29501685)
chr6 (37-305)||(16674144-16674412)
chr6 (10-302)||(27485107-27485399)
chr6 (35-302)||(4525289-4525556)
chr6 (43-302)||(4724060-4724319)
chr6 (43-306)||(28207465-28207728)
chr6 (35-306)||(17025280-17025551)
chr6 (13-306)||(20160682-20160975)
chr6 (13-306)||(22171856-22172149)
chr6 (31-306)||(14143207-14143482)
chr6 (31-306)||(26787943-26788218)
chr6 (31-306)||(27196316-27196591)
chr6 (31-306)||(27252649-27252924)
chr6 (32-306)||(27290292-27290566)
chr6 (10-306)||(22456856-22457152)
chr6 (34-306)||(13521995-13522267)
chr6 (10-260)||(22477241-22477491)
chr6 (34-306)||(8892233-8892504)
chr6 (34-306)||(8903468-8903739)
chr6 (34-306)||(33374178-33374450)
chr6 (31-306)||(28162656-28162931)
chr6 (34-275)||(27629653-27629894)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (10-306)||(7218-7514)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (10-306)||(28361893-28362189)
chr8 (10-306)||(31489688-31489984)
chr8 (10-306)||(16277535-16277831)
chr8 (10-306)||(19208298-19208594)
chr8 (4-302)||(19674416-19674714)
chr8 (10-306)||(27608843-27609139)
chr8 (10-302)||(31354505-31354797)
chr8 (10-306)||(19688079-19688375)
chr8 (13-306)||(14557608-14557901)
chr8 (10-306)||(2137197-2137493)
chr8 (34-306)||(18710591-18710863)
chr8 (10-302)||(33258704-33258996)
chr8 (10-306)||(16283430-16283726)
chr8 (10-306)||(12092662-12092958)
chr8 (35-302)||(19286468-19286735)
chr8 (35-306)||(3329445-3329716)
chr8 (35-306)||(29829328-29829599)
chr8 (196-306)||(189261-189371)
chr8 (34-306)||(9354627-9354900)
chr8 (34-306)||(33244670-33244942)
chr8 (34-306)||(19658978-19659249)
chr8 (31-306)||(44563103-44563377)
chr8 (99-306)||(22080816-22081023)
chr8 (37-101)||(19518280-19518344)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (10-306)||(10962650-10962946)
chr1 (10-302)||(41793291-41793583)
chr1 (10-302)||(28584961-28585253)
chr1 (10-306)||(51638198-51638494)
chr1 (16-306)||(16208010-16208300)
chr1 (13-306)||(20340314-20340607)
chr1 (31-306)||(20461082-20461357)
chr1 (31-306)||(28151863-28152138)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (10-306)||(27273-27569)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (10-305)||(9046-9341)
scaffold0159 (10-305)||(19996-20291)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (10-306)||(46964-47260)
scaffold0089 (10-306)||(40048-40344)
scaffold0089 (10-306)||(29744-30040)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (10-306)||(14909-15205)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (10-306)||(26180-26477)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-306)||(108-405)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (10-306)||(30434-30729)
scaffold0124 (31-306)||(20390-20664)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (34-306)||(9571-9843)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (35-306)||(6015-6291)
scaffold0415 (99-306)||(1897-2103)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (43-306)||(7963-8226)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (31-306)||(46781-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (13-306)||(2637-2930)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (31-306)||(7-282)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (34-275)||(94-335)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (37-306)||(21569-21838)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (175-306)||(597-728)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9548715 - 9548419
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548715 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 9548616  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548615 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9548516  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9548515 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 9548419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15658932 - 15658636
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658932 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 15658833  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658832 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 15658733  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15658732 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 15658636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 9317441 - 9317737
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9317441 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9317540  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317541 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9317640  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9317641 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 9317737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 12132145 - 12132441
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12132145 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 12132244  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132245 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 12132344  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12132345 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 12132441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8665647 - 8665355
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8665647 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 8665548  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665547 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 8665448  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665447 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 8665355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 30152008 - 30152304
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30152008 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 30152107  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152108 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 30152207  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30152208 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 30152304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 2511041 - 2511333
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2511041 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 2511140  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511141 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 2511240  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2511241 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 2511333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 11549344 - 11549640
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11549344 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 11549443  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11549444 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 11549543  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11549544 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 11549640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15759029 - 15758737
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15759029 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 15758930  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758929 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 15758830  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15758829 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 15758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22999286 - 22998990
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22999286 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgta 22999187  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999186 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 22999087  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22999086 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 22998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23752622 - 23752326
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23752622 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23752523  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752522 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 23752423  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23752422 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 23752326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 5637900 - 5638196
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5637900 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 5637999  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5638000 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 5638099  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5638100 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 5638196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23718160 - 23717864
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23718160 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23718061  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23718060 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 23717961  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23717960 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 23717864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 26480382 - 26480678
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26480382 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26480481  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26480482 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 26480581  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26480582 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26480678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 6874289 - 6874587
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6874289 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggc 6874388  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6874389 attgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatga 6874488  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874489 cgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 6874587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 30168459 - 30168751
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30168459 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 30168558  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30168559 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30168658  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30168659 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatcc 30168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 30934626 - 30934919
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30934626 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 30934725  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30934726 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 30934825  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30934826 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 30934919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 33777477 - 33777773
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33777477 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 33777576  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33777577 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 33777676  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33777677 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 33777773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 41674699 - 41674991
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674699 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 41674798  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41674799 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttga 41674898  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41674899 ggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatcc 41674991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18375584 - 18375292
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18375584 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgta 18375485  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18375484 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 18375385  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375384 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 18375292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24688329 - 24688033
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24688329 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 24688230  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  24688229 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcga 24688130  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24688129 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 24688033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500606
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 18500606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 24970014 - 24970304
Alignment:
Q  16 caacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaacta 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24970014 caacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaacca 24970113  T
Q  116 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970114 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtg 24970213  T
Q  216 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24970214 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 24970304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 33516346 - 33516642
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  33516346 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 33516445  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33516446 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 33516545  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33516546 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 33516642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616800
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 34616800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649521
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 28649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29967238 - 29966946
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29967238 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 29967139  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29967138 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 29967039  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29967038 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 29966946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 30029405 - 30029697
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30029405 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 30029504  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  30029505 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 30029604  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30029605 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 30029697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078538
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 43078468  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43078469 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 43078538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431726
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31431663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 31431726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671359
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctctt 37671359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755262
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 37755262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770867
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 37770867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959666
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 28959666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789823
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 3789823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826287
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 31826287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599352
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcc 32599352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37358815 - 37358519
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37358815 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 37358716  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37358715 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 37358616  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37358615 ggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctctt 37358519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473426
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40473495  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473494 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 40473426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681722
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24681656  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681657 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 24681722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724249
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24724183  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24724184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 24724249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324705
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
     || || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 13324705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 23892196 - 23892492
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||| || |    
T  23892196 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgca 23892295  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23892296 caaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 23892395  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
      | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23892396 aagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 23892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29888958
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||  | || |||||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 29888958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 22888463 - 22888756
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| || | |  |||||||| || ||||    
T  22888463 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaa 22888562  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  22888563 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 22888662  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22888663 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 22888756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 25199022 - 25199315
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  25199022 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 25199121  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  25199122 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 25199221  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25199222 atgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 25199315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326080
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 11326080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877533
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 33877533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292807
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 33292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184524
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 13184524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440370
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 13440370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 34286331 - 34286627
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286331 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34286430  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34286431 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcga 34286530  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286531 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 34286627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 34291391 - 34291687
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291391 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34291490  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34291491 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcga 34291590  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291591 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 34291687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 281
Target Start/End: Original strand, 34279426 - 34279697
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279426 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34279525  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279526 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 34279625  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34279626 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 34279697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21677446 - 21677154
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21677446 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 21677347  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677346 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 21677247  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677246 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 21677154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 34861657 - 34861953
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34861657 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 34861756  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861757 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 34861856  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34861857 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 34861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37686173 - 37685880
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37686173 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37686074  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686073 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37685974  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37685973 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcct 37685880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37701438 - 37701145
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37701438 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37701339  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701338 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37701239  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37701238 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcct 37701145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 12655519 - 12655815
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12655519 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 12655618  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12655619 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 12655718  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12655719 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 12655815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22926292 - 22926000
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22926292 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 22926193  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22926192 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 22926093  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926092 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 22926000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23128830 - 23128534
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23128830 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23128731  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128730 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 23128631  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23128630 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 23128534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 28882191 - 28882487
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28882191 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 28882290  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28882291 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 28882390  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28882391 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 28882487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 32049775 - 32050071
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32049775 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 32049874  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049875 caactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 32049974  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32049975 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 32050071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11635456 - 11635154
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11635456 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 11635357  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11635356 attgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 11635257  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11635256 tgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcct 11635157  T
Q  304 ctt 306  Q
    |||    
T  11635156 ctt 11635154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11641645 - 11641343
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11641645 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 11641546  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11641545 attgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 11641446  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11641445 tgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcct 11641346  T
Q  304 ctt 306  Q
    |||    
T  11641345 ctt 11641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 37925470 - 37925765
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37925470 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37925569  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925570 caactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37925669  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37925670 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 37925765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 20837895 - 20838191
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20837895 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 20837994  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20837995 caactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 20838094  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20838095 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 20838191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27434708 - 27434412
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27434708 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgta 27434609  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27434608 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27434509  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27434508 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 27434412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16829602 - 16829306
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16829602 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 16829503  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16829502 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 16829403  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16829402 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 16829306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 16891879 - 16892175
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16891879 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 16891978  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16891979 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 16892078  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16892079 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 16892175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19416763 - 19416471
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  19416763 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 19416664  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416663 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 19416564  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19416563 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 19416471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 31876258 - 31876550
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31876258 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 31876357  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  31876358 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 31876457  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31876458 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 31876550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375433
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctct 37375433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13936808 - 13936512
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  13936808 caacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 13936709  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13936708 cgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 13936609  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13936608 ggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 13936512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890347
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 39890347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260721
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  260784 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctctt 260721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233783
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 40233783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12716869 - 12716574
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaa---gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcatt 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12716869 caacaacaacaacaacagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 12716770  T
Q  107 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgt 206  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12716769 gcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgt 12716670  T
Q  207 cgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12716669 cgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 12716574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777495
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27777425  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27777426 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 27777495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817253
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27817083  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27817084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27817183  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27817184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 27817253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27803980
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27803810  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803811 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27803910  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27803911 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 27803980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051790
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39051960  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051959 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39051860  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39051859 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 39051790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12587083
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12586913  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12586914 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 12587013  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12587014 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 12587083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9349950
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9350020  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  9350019 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 9349950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21703425 - 21703132
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  21703425 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 21703326  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  21703325 ccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaagg 21703226  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21703225 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 21703132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891296
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggta 31891372  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || || ||||| || ||||||||  |||||||| ||||||| || || || ||| ||||||||||||||    
T  31891371 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctctt 31891296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19456682 - 19456389
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  | |||||| || ||||    
T  19456682 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaa 19456583  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |     
T  19456582 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaga 19456483  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19456482 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 19456389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27118961
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 27118885  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27118886 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 27118961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303271
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 34303347  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  34303346 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 34303271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3784927
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 3784927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16163872
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||| || || || || |||| ||| ||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 16163872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157283
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  34157212 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 34157283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 27392973 - 27393242
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || ||||| || |  | |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  27392973 agacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 27393072  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27393073 acccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 27393172  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  27393173 aaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 27393242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28116276 - 28115974
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28116276 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggc 28116177  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28116176 attgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatga 28116077  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28116076 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcct 28115977  T
Q  304 ctt 306  Q
    |||    
T  28115976 ctt 28115974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29149071 - 29148775
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29149071 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 29148972  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148971 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 29148872  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29148871 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 29148775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18277368 - 18277076
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277368 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18277269  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18277268 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18277169  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277168 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 18277076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18292669 - 18292377
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292669 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18292570  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292569 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18292470  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292469 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 18292377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18307970 - 18307678
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307970 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18307871  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18307870 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18307771  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307770 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 18307678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 7073154 - 7073450
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073154 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 7073253  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073254 cgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7073353  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7073354 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 7073450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 47023395 - 47023687
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47023395 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 47023494  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023495 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 47023594  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023595 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 47023687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 4416855 - 4417157
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4416855 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 4416954  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4416955 attgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 4417054  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4417055 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcct 4417154  T
Q  304 ctt 306  Q
    |||    
T  4417155 ctt 4417157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 5713169 - 5713465
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713169 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5713268  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5713269 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5713368  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||| ||||||||||||||    
T  5713369 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 5713465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 5724079 - 5724375
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724079 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5724178  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5724179 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5724278  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||| ||||||||||||||    
T  5724279 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 5724375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5757398 - 5757102
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757398 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5757299  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757298 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5757199  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||| ||||||||||||||    
T  5757198 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 5757102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5768289 - 5767993
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768289 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5768190  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5768189 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5768090  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||| ||||||||||||||    
T  5768089 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 5767993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 6192258 - 6192554
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6192258 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 6192357  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192358 caaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 6192457  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6192458 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 6192554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 7996504 - 7996796
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7996504 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 7996603  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996604 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7996703  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7996704 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 7996796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 10643012 - 10643304
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10643012 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 10643111  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643112 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 10643211  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10643212 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 10643304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31964789 - 31964497
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31964789 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31964690  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31964689 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 31964590  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964589 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 31964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50134387 - 50134095
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50134387 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 50134288  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50134287 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 50134188  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134187 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 50134095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4796969 - 4796673
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4796969 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 4796870  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4796869 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 4796770  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4796769 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 4796673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5609638 - 5609346
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5609638 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 5609539  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5609538 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 5609439  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5609438 agggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 5609346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 10396075 - 10396371
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  10396075 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgca 10396174  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396175 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 10396274  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10396275 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 10396371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 18330611 - 18330907
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18330611 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgta 18330710  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18330711 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 18330810  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18330811 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 18330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 28339244 - 28339536
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28339244 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28339343  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28339344 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcga 28339443  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339444 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 28339536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 35880708 - 35881004
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35880708 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 35880807  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35880808 caaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcga 35880907  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35880908 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 35881004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15741410 - 15741114
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15741410 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 15741311  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15741310 caaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcga 15741211  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15741210 gggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 15741114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 8295917 - 8296210
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8295917 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaa 8296016  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8296017 ccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggg 8296116  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8296117 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 8296210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8301580 - 8301287
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8301580 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 8301481  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8301480 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggg 8301381  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8301380 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 8301287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 21674635 - 21674930
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21674635 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgta 21674734  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21674735 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 21674834  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21674835 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctct 21674930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 4721573 - 4721869
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4721573 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 4721672  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4721673 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 4721772  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4721773 ggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 4721869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 18051204 - 18051500
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18051204 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 18051303  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18051304 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 18051403  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18051404 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 18051500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15893022 - 15892726
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15893022 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 15892923  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15892922 caaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 15892823  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15892822 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 15892726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 5013654 - 5013946
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5013654 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 5013753  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013754 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 5013853  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5013854 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 5013946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 18225133 - 18225425
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18225133 caacaacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 18225232  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18225233 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 18225332  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18225333 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 18225425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 24328101 - 24328393
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  24328101 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 24328200  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328201 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 24328300  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24328301 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 24328393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17985272 - 17984976
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17985272 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 17985173  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17985172 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 17985073  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17985072 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 17984976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387598
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 22387598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870876
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 22870876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885935
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 22885935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466164
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 48466095  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48466096 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 48466164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8211976
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8211913 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 8211976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346707
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctctt 4346707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110370
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11110439  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11110438 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctct 11110370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 18242681 - 18242973
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18242681 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 18242780  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18242781 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 18242880  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242881 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 18242973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5596648 - 5596381
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5596648 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 5596549  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596548 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 5596449  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596448 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 5596381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542486
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 6542486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Original strand, 5466953 - 5467223
Alignment:
Q  36 tagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacct 135  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5466953 tagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 5467052  T
Q  136 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467053 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcg 5467152  T
Q  236 tgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5467153 tgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 5467223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021513
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctctt 28021513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 51781998 - 51782261
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51781998 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51782097  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 51782197  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51782198 gctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 51782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997101
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatcc 36997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 51797087 - 51797351
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51797087 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51797186  T
Q  143 tgcctc-caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaaga 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797187 tgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaaga 51797286  T
Q  242 agctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51797287 agctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 51797351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20576867
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 20577037  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20577036 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 20576937  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20576936 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 20576867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29664990
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29665060  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29665059 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 29664990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034137
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 31034137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32292990
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 32292990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530626
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |  ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctctt 18530626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16626819 - 16626526
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16626819 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaa 16626720  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  16626719 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 16626620  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16626619 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctctt 16626526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439388
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 32439388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652625
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| |||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 5652625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993804
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 17993804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626182
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 4626182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066277
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
     |  || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    || |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatcc 20066277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || ||||||||||||   |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  234 cgtgaagaagct 245  Q
    ||| ||||||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14763579 - 14763287
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763579 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 14763480  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763479 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 14763380  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763379 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 14763287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27163592 - 27163296
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27163592 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 27163493  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163492 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 27163393  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27163392 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 27163296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 5005863 - 5006165
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5005863 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 5005962  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5005963 attgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatga 5006062  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5006063 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcct 5006162  T
Q  304 ctt 306  Q
    |||    
T  5006163 ctt 5006165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24592586 - 24592293
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24592586 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 24592487  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24592486 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 24592387  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24592386 gtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 24592293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40105913 - 40105617
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40105913 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgta 40105814  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105813 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 40105714  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40105713 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 40105617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 14665014 - 14665310
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14665014 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgta 14665113  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14665114 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 14665213  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  14665214 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctctt 14665310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 17013996 - 17014292
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17013996 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgta 17014095  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17014096 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 17014195  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17014196 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 17014292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 6569849 - 6570144
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6569849 caacagcaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 6569948  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6569949 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcga 6570048  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6570049 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 6570144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 14098537 - 14098829
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14098537 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 14098636  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14098637 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 14098736  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098737 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 14098829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31126793 - 31126497
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31126793 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 31126694  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31126693 caactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 31126594  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31126593 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 31126497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800592
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 18800592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833675
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 54833675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30754042
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 30754042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344494
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 36344494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673777
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33673847  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33673846 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 33673777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 21969697 - 21969993
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21969697 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 21969796  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21969797 cgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 21969896  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21969897 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 21969993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850923
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39850860  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaa 299  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39850861 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaa 39850923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 15227869 - 15228162
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  15227869 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaa 15227968  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  15227969 ccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaagg 15228068  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  15228069 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctctt 15228162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15285200 - 15284907
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15285200 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 15285101  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  15285100 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 15285001  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15285000 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 15284907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 1900256 - 1900549
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  1900256 caacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 1900355  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  1900356 ccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 1900455  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  1900456 atgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctctt 1900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188943
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 34188943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112950
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 24112950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460584
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 24460584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235504
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||| | || |  | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||| | || |||||||| ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || || |||||  | || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctctt 14235504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15391586 - 15391317
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | || || || ||||| || ||||| || |  | |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  15391586 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccaccta 15391487  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  15391486 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 15391387  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||  | |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15391386 aaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 15391317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5147501 - 5147205
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147501 caacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5147402  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5147401 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5147302  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5147301 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 5147205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4145284 - 4144988
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4145284 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 4145185  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145184 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 4145085  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4145084 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 4144988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16736621 - 16736329
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736621 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 16736522  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16736521 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 16736422  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736421 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 16736329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16751675 - 16751383
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751675 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 16751576  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16751575 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 16751476  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751475 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 16751383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 17523514 - 17523806
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523514 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 17523613  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17523614 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 17523713  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523714 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 17523806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17529701 - 17529409
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529701 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 17529602  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17529601 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 17529502  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529501 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 17529409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26320030 - 26319734
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26320030 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26319931  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319930 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26319831  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26319830 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26319734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26275255 - 26274959
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26275255 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26275156  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275155 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26275056  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26275055 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26274959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 45387325 - 45387621
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45387325 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 45387424  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387425 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 45387524  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45387525 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 45387621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 9618633 - 9618929
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9618633 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9618732  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9618733 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 9618832  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9618833 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 9618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11424937 - 11424641
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11424937 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgca 11424838  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11424837 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 11424738  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11424737 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 11424641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26670075 - 26669779
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26670075 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26669976  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669975 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26669876  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26669875 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26669779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 5127974 - 5128269
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5127974 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 5128073  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128074 caaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 5128173  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5128174 gggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctct 5128269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 2154555 - 2154851
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154555 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 2154654  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154655 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcga 2154754  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154755 gggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 2154851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10917026 - 10916733
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10917026 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 10916927  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10916926 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 10916827  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10916826 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 10916733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16503541 - 16503245
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16503541 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 16503442  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16503441 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16503342  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16503341 ggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 16503245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 26435239 - 26435535
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26435239 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 26435338  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26435339 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 26435438  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26435439 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26435535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16518577 - 16518281
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16518577 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 16518478  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16518477 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16518378  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16518377 ggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 16518281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24592702 - 24592406
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  24592702 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 24592603  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24592602 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 24592503  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24592502 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 24592406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564255
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 31564255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537739
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26537805  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26537804 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 26537739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445580
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 3445580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 31124902 - 31125194
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31124902 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 31125001  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31125002 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 31125101  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31125102 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 31125194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 302
Target Start/End: Original strand, 11441587 - 11441846
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11441587 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 11441686  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441687 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11441786  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441787 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 11441846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 16041308 - 16041601
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16041308 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 16041407  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  16041408 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaagg 16041507  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16041508 atgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 16041601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108870
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 2108870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26484972
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 26484972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449863
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 16449863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210888
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 39210888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775637
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| | ||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 2775637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 302
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541073
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    |||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 18541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159793
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 5159793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088329
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 31088329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 45733466 - 45733738
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||   |||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  45733466 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 45733565  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  45733566 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 45733665  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  45733666 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 45733738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 306
Target Start/End: Original strand, 4200685 - 4200825
Alignment:
Q  166 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctga 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  4200685 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttga 4200784  T
Q  266 cctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  4200785 cttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctctt 4200825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26485857 - 26485756
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26485857 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 26485758  T
Q  137 at 138  Q
    ||    
T  26485757 at 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26683005 - 26682865
Alignment:
Q  166 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctga 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||  | || || ||||| || ||||||||  |||    
T  26683005 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 26682906  T
Q  266 cctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||    
T  26682905 cctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctctt 26682865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 16749832 - 16750128
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16749832 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 16749931  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16749932 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16750031  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16750032 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 16750128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24304836 - 24304540
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24304836 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 24304737  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24304736 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 24304637  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24304636 ggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 24304540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 24863695 - 24863991
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24863695 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 24863794  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24863795 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 24863894  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24863895 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 24863991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 27000051 - 27000347
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27000051 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 27000150  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27000151 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27000250  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27000251 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 27000347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13299169 - 13298873
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13299169 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 13299070  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13299069 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcga 13298970  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13298969 gggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 13298873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 26988979 - 26989275
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26988979 caacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 26989078  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26989079 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 26989178  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26989179 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 26989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 26918358 - 26918654
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26918358 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 26918457  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26918458 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 26918557  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26918558 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26918654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15424534 - 15424239
Alignment:
Q  11 aacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424534 aacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtac 15424435  T
Q  111 aactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15424434 aactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgag 15424335  T
Q  211 gggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15424334 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctctt 15424239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22935095 - 22934802
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22935095 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 22934996  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22934995 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 22934896  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22934895 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 22934802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23857540 - 23857247
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23857540 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 23857441  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23857440 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 23857341  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23857340 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 23857247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 29572991 - 29573287
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  29572991 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 29573090  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573091 cgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 29573190  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29573191 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 29573287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27272807 - 27272502
Alignment:
Q  1 ccagttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  27272807 ccagttcagcaacaacaacaacagaatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagag 27272708  T
Q  101 ggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||    
T  27272707 ggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtca 27272608  T
Q  201 tgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27272607 tgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataat 27272508  T
Q  301 cctctt 306  Q
    ||||||    
T  27272507 cctctt 27272502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549749
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 29549749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30558234 - 30557938
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30558234 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 30558135  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30558134 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30558035  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30558034 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 30557938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758038
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 4758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463272
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||||||||    
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 34463272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16944245 - 16943953
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16944245 caacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 16944146  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  16944145 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 16944046  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16944045 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 16943953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27360210 - 27359914
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27360210 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27360111  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27360110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 27360011  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27360010 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 27359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27450553 - 27450257
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27450553 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27450454  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27450453 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 27450354  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27450353 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 27450257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696355
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 3696355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773280
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 4773280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044658
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggt-gttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 27044658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545701
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4545760 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 4545701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008001
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 27008001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777541
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26777610  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26777609 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 26777541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116336
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 26116336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 29501418 - 29501685
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29501418 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 29501517  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501518 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29501617  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501618 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 29501685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674412
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 16674412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 27485107 - 27485399
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27485107 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 27485206  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27485207 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 27485306  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27485307 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 27485399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525556
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 4525556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724060
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4724119 actcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatcc 4724060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207728
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28207665 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 28207728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025551
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
     || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 17025551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 20160682 - 20160975
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20160682 caacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaa 20160781  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  20160782 ccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagg 20160881  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  20160882 gtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctctt 20160975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22172149 - 22171856
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22172149 caacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaa 22172050  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  22172049 ccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagg 22171950  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  22171949 gtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctctt 22171856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14143207
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 14143207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788218
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 26788218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196591
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 27196591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252649
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 27252649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290292
Alignment:
Q  32 aagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 131  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  132 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtat 231  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||     
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  232 atcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttctt 27290292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22457152 - 22456856
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  | | |||| || |    
T  22457152 caacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgca 22457053  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22457052 caaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 22456953  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  22456952 aggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctctt 22456856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521995
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 13521995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22477491 - 22477241
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  | | |||| || |    
T  22477491 caacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgca 22477392  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22477391 caaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 22477292  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 260  Q
     || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  22477291 aggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892233
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  8892304 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 8892233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903468
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  8903539 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 8903468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374178
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 33374178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 28162656 - 28162931
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  28162656 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 28162755  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||| |||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||  || || || || |||| |||    
T  28162756 cacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggta 28162855  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  28162856 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 28162931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27629894 - 27629653
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  27629894 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgc 27629795  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27629794 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 27629695  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaa 275  Q
     ||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27629694 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaa 27629653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7514 - 7218
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7514 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 7415  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7414 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7315  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7314 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28362189 - 28361893
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28362189 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28362090  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28362089 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 28361990  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28361989 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 28361893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31489984 - 31489688
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31489984 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31489885  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31489884 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 31489785  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31489784 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 31489688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 16277535 - 16277831
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16277535 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 16277634  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16277635 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16277734  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16277735 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 16277831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19208594 - 19208298
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19208594 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 19208495  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19208494 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 19208395  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19208394 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 19208298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 19674416 - 19674714
Alignment:
Q  4 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19674416 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 19674515  T
Q  104 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19674516 attgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 19674615  T
Q  204 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674616 tgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 19674714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27609139 - 27608843
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27609139 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 27609040  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27609039 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27608940  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27608939 gggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 27608843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 31354505 - 31354797
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31354505 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31354604  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31354605 caactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 31354704  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354705 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 31354797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 19688079 - 19688375
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19688079 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 19688178  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688179 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 19688278  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19688279 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 19688375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 14557608 - 14557901
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14557608 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 14557707  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14557708 ccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 14557807  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  14557808 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctctt 14557901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2137493 - 2137197
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2137493 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 2137394  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  2137393 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcga 2137294  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  2137293 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctctt 2137197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710863
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctctt 18710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 33258704 - 33258996
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  33258704 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 33258803  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  33258804 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 33258903  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33258904 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 33258996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 16283430 - 16283726
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  16283430 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgta 16283529  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  16283530 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcga 16283629  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16283630 agggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 16283726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12092958 - 12092662
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  12092958 caacaacaacagcaacagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 12092859  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12092858 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcga 12092759  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12092758 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 12092662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286735
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 19286735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329445
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctctt 3329445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829599
Alignment:
Q  35 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  135 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 234  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29829527  T
Q  235 gtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29829528 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 29829599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 306
Target Start/End: Original strand, 189261 - 189371
Alignment:
Q  196 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcg 295  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  189261 ggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 189360  T
Q  296 acaatcctctt 306  Q
    |||||||||||    
T  189361 acaatcctctt 189371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9354900
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || || || |||| ||| ||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  234 cgt-gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||  || || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 9354900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33244942
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||| |  | |||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 33244942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658978
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19659049 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 19658978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563377
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    |||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 44563302  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  44563303 cattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctctt 44563377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22081023 - 22080816
Alignment:
Q  99 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 198  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  22081023 agggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 22080924  T
Q  199 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 298  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  22080923 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 22080824  T
Q  299 atcctctt 306  Q
    ||||||||    
T  22080823 atcctctt 22080816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19518344 - 19518280
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagg 101  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19518344 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 10962650 - 10962946
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962650 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgta 10962749  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10962750 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 10962849  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10962850 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 10962946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41793583 - 41793291
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41793583 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 41793484  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41793483 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 41793384  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793383 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 41793291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 28584961 - 28585253
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28584961 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28585060  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  28585061 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 28585160  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28585161 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcc 28585253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 51638198 - 51638494
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51638198 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 51638297  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51638298 cgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 51638397  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51638398 ggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 51638494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16208300 - 16208010
Alignment:
Q  16 caacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaacta 115  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |    
T  16208300 caacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 16208201  T
Q  116 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  16208200 gacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 16208101  T
Q  216 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16208100 ctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 16208010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20340607 - 20340314
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  | || |||||| |||| |  |||||||| |  ||||    
T  20340607 caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaa 20340508  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  20340507 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 20340408  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  20340407 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctctt 20340314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461357
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || || |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctctt 20461357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152138
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctctt 28152138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 27273 - 27569
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27273 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 27372  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27373 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27472  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27473 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 27569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9046
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9341 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9242  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9142  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9141 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 9046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 19996 - 20291
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19996 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 20095  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20096 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 20195  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20196 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctct 20291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47260 - 46964
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  47260 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 47161  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47160 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 47061  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47060 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 46964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40344 - 40048
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40344 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 40245  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40244 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 40145  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40144 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 40048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 29744 - 30040
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29744 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 29843  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29844 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcga 29943  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29944 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 30040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15205 - 14909
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15205 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgta 15106  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15105 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 15006  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15005 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26477 - 26180
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26477 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 26378  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaa-ggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 26278  T
Q  209 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26277 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 26180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 405 - 108
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaa-ttgcttccaactttactccaaagagggcattgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  405 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgt 306  T
Q  109 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 208  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  305 acaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcg 206  T
Q  209 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  205 aggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctt 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 30434 - 30729
Alignment:
Q  10 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30434 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 30532  T
Q  110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30533 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30632  T
Q  210 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30633 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 30729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20664
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  20390 caagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20489  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20490 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20589  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20590 cattgtgaagaagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 20664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9843
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 9843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6291
Alignment:
Q  35 ctagaccta-ctttccctccgataccgatgtt-atatgctgaattgcttccaacttt-actccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 131  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  6015 ctagacctaacttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccacc 6114  T
Q  132 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga-ttttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgc-tttgaagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagt 6214  T
Q  230 atatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6215 atatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctt 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1897
Alignment:
Q  99 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 198  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  199 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 298  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  299 atcctctt 306  Q
    ||||||||    
T  1904 atcctctt 1897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8226
Alignment:
Q  43 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 142  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  143 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  243 gctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8163 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctctt 8226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46781
Alignment:
Q  31 caagctagacctacttt-ccctccgatacc-gatgttatatgctgaattgcttccaac---tttactccaaagaggg-cattgtacaac-tagacagggt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  124 aa--gcccccacctgatccgttgcctccaaggttca-ggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtc--atg-atgtcgaggggtgt- 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||      
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  217 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg-aaatctgac-ctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctctt 46781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2637
Alignment:
Q  13 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  | || |||||| |||| |  |||||||| |  ||||    
T  2930 caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaa 2831  T
Q  113 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2830 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 2731  T
Q  213 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  2730 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctctt 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 7
Alignment:
Q  31 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 130  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  131 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 230  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  231 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctctt 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 94 - 335
Alignment:
Q  34 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 133  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  94 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 193  T
Q  134 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 233  Q
    | ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  194 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 293  T
Q  234 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaa 275  Q
     ||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  294 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaa 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 21569 - 21838
Alignment:
Q  37 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 136  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| || ||||| || |  | ||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  21569 agacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 21668  T
Q  137 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 236  Q
    | | ||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  21669 acctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgt 21768  T
Q  237 gaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
     |||||||||||||| || |||||  | || ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  21769 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 21838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 597
Alignment:
Q  175 gattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaatctgacctttgaga 274  Q
    ||||| ||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  275 ataatgttccacatgtcctcgacaatcctctt 306  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctctt 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University