View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7863_low_19 (Length: 542)

Name: NF7863_low_19
Description: NF7863
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7863_low_19
NF7863_low_19
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (15-531)||(2576-3092)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (15-531)||(20340253-20340769)
chr1 (17-522)||(16207951-16208453)
chr1 (17-357)||(20461076-20461416)
chr1 (15-369)||(28151845-28152199)
chr1 (15-480)||(41793226-41793694)
chr1 (378-522)||(20460935-20461079)
chr1 (15-525)||(10962494-10963007)
chr1 (15-525)||(28584805-28585318)
chr1 (15-525)||(51638042-51638555)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (20-522)||(16626470-16626972)
chr3 (25-531)||(17993753-17994259)
chr3 (25-531)||(4625727-4626233)
chr3 (24-531)||(5652170-5652677)
chr3 (17-522)||(18530186-18530685)
chr3 (15-369)||(32292697-32293051)
chr3 (15-369)||(31034076-31034430)
chr3 (25-531)||(5713007-5713516)
chr3 (25-531)||(5723917-5724426)
chr3 (25-531)||(5757051-5757560)
chr3 (25-531)||(5767942-5768451)
chr3 (15-525)||(15892665-15893178)
chr3 (15-525)||(8301226-8301736)
chr3 (15-507)||(18051066-18051561)
chr3 (15-507)||(8295779-8296271)
chr3 (15-525)||(22387537-22388047)
chr3 (15-507)||(4796612-4797107)
chr3 (15-525)||(18330460-18330968)
chr3 (15-525)||(6192102-6192615)
chr3 (15-525)||(35880552-35881065)
chr3 (15-507)||(29148714-29149209)
chr3 (15-525)||(4721417-4721930)
chr3 (15-507)||(15741053-15741536)
chr3 (15-525)||(7072998-7073511)
chr3 (15-525)||(28115913-28116429)
chr3 (15-507)||(18277011-18277506)
chr3 (15-507)||(18292312-18292807)
chr3 (15-507)||(18307613-18308108)
chr3 (15-477)||(10395970-10396432)
chr3 (15-480)||(4416747-4417218)
chr3 (15-525)||(8211527-8212037)
chr3 (46-524)||(32438944-32439422)
chr3 (15-525)||(5466771-5467284)
chr3 (15-480)||(4346646-4347111)
chr3 (15-480)||(28021109-28021574)
chr3 (15-526)||(17984915-17985429)
chr3 (15-525)||(31964432-31964945)
chr3 (15-525)||(50134030-50134543)
chr3 (15-480)||(47023284-47023752)
chr3 (15-525)||(28339088-28339601)
chr3 (15-480)||(5609281-5609749)
chr3 (46-507)||(20065850-20066311)
chr3 (15-525)||(21674479-21674992)
chr3 (15-480)||(7996393-7996861)
chr3 (15-480)||(10642901-10643369)
chr3 (149-525)||(4892999-4893375)
chr3 (15-285)||(11110308-11110578)
chr3 (15-345)||(29664929-29665259)
chr3 (15-347)||(6542421-6542753)
chr3 (15-345)||(20576806-20577136)
chr3 (15-345)||(36997036-36997366)
chr3 (15-285)||(48465956-48466226)
chr3 (15-525)||(5596316-5596838)
chr3 (15-525)||(18224977-18225490)
chr3 (15-285)||(51782052-51782322)
chr3 (15-285)||(51797141-51797412)
chr3 (15-348)||(22870815-22871148)
chr3 (15-348)||(22885874-22886207)
chr3 (15-526)||(5013497-5014011)
chr3 (15-273)||(18242780-18243038)
chr3 (15-525)||(24327945-24328458)
chr3 (398-483)||(29665330-29665415)
chr3 (398-480)||(11110706-11110788)
chr3 (398-525)||(6542819-6542946)
chr3 (398-525)||(22871219-22871346)
chr3 (398-525)||(22886278-22886405)
chr3 (398-480)||(36997434-36997516)
chr3 (398-525)||(48465701-48465828)
chr3 (379-525)||(18242513-18242659)
chr3 (398-480)||(20577207-20577289)
chr3 (398-483)||(51781839-51781924)
chr3 (398-483)||(51796928-51797013)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (20-522)||(19456333-19456835)
chr2 (15-531)||(34303210-34303726)
chr2 (24-531)||(27118506-27119013)
chr2 (25-531)||(3784472-3784978)
chr2 (25-531)||(34156829-34157334)
chr2 (25-531)||(16163417-16163923)
chr2 (17-522)||(21703073-21703578)
chr2 (25-530)||(31891245-31891750)
chr2 (20-526)||(27392813-27393298)
chr2 (15-507)||(27434351-27434846)
chr2 (15-507)||(23128473-23128968)
chr2 (15-507)||(28882053-28882548)
chr2 (15-507)||(12655381-12655876)
chr2 (15-505)||(20837759-20838252)
chr2 (15-525)||(22925935-22926448)
chr2 (15-525)||(13936451-13936964)
chr2 (15-480)||(21677089-21677557)
chr2 (15-525)||(11635093-11635609)
chr2 (15-345)||(40233515-40233845)
chr2 (15-525)||(11641282-11641798)
chr2 (15-525)||(37925314-37925827)
chr2 (15-345)||(9349889-9350219)
chr2 (15-480)||(32049664-32050132)
chr2 (134-525)||(34279270-34279664)
chr2 (50-477)||(34286223-34286653)
chr2 (50-477)||(34291283-34291713)
chr2 (15-525)||(34861501-34862014)
chr2 (15-525)||(37685816-37686329)
chr2 (15-525)||(37701081-37701594)
chr2 (15-507)||(37375000-37375495)
chr2 (15-507)||(16829245-16829740)
chr2 (15-507)||(16891741-16892236)
chr2 (15-345)||(12586814-12587144)
chr2 (15-525)||(12716509-12717025)
chr2 (15-525)||(31876102-31876615)
chr2 (15-345)||(27777226-27777556)
chr2 (15-345)||(27816984-27817314)
chr2 (15-345)||(39051729-39052059)
chr2 (18-369)||(27803687-27804038)
chr2 (15-285)||(260660-260930)
chr2 (15-273)||(39890150-39890408)
chr2 (15-525)||(19416406-19416919)
chr2 (398-480)||(261058-261140)
chr2 (398-525)||(40233320-40233447)
chr2 (398-525)||(39889883-39890010)
chr2 (398-480)||(12586667-12586749)
chr2 (398-480)||(27803558-27803640)
chr2 (398-483)||(39052121-39052206)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (25-531)||(31088278-31088784)
chr7 (25-531)||(45733283-45733789)
chr7 (23-522)||(16449810-16450309)
chr7 (17-522)||(16041155-16041660)
chr7 (15-369)||(26484679-26485033)
chr7 (23-369)||(2108817-2109163)
chr7 (15-369)||(39210827-39211181)
chr7 (15-369)||(2775344-2775698)
chr7 (16-507)||(16518221-16518715)
chr7 (16-507)||(16503185-16503679)
chr7 (13-525)||(5127818-5128333)
chr7 (15-480)||(10916672-10917137)
chr7 (15-480)||(11424580-11425048)
chr7 (46-369)||(18540784-18541107)
chr7 (15-507)||(2154417-2154912)
chr7 (15-219)||(26682804-26683008)
chr7 (15-219)||(4200682-4200886)
chr7 (15-483)||(5147144-5147615)
chr7 (15-483)||(26435125-26435596)
chr7 (15-525)||(26274898-26275411)
chr7 (15-525)||(4144927-4145440)
chr7 (15-525)||(26319673-26320186)
chr7 (15-525)||(45387169-45387682)
chr7 (46-525)||(5159348-5159827)
chr7 (15-480)||(16736264-16736732)
chr7 (15-480)||(16751318-16751786)
chr7 (15-480)||(17523403-17523871)
chr7 (15-480)||(17529344-17529812)
chr7 (15-525)||(9618477-9618990)
chr7 (15-525)||(26669718-26670231)
chr7 (15-525)||(26537674-26538190)
chr7 (15-347)||(31564194-31564526)
chr7 (15-285)||(3445375-3445645)
chr7 (15-285)||(11441641-11441911)
chr7 (15-525)||(24592345-24592858)
chr7 (15-273)||(31125001-31125259)
chr7 (398-480)||(11441431-11441513)
chr7 (349-525)||(26485885-26486061)
chr7 (398-525)||(31124737-31124864)
chr7 (398-525)||(31564589-31564716)
chr7 (398-483)||(3445162-3445247)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (25-531)||(13184473-13184979)
chr5 (20-531)||(33877078-33877589)
chr5 (25-531)||(13440319-13440825)
chr5 (25-531)||(11325625-11326131)
chr5 (17-522)||(22888310-22888815)
chr5 (17-507)||(25198884-25199374)
chr5 (15-507)||(23892058-23892553)
chr5 (15-381)||(29888897-29889263)
chr5 (15-507)||(24969876-24970365)
chr5 (15-507)||(24687972-24688467)
chr5 (15-507)||(30934488-30934980)
chr5 (15-507)||(23752265-23752760)
chr5 (15-525)||(33777321-33777834)
chr5 (15-507)||(11549206-11549701)
chr5 (15-507)||(23717803-23718298)
chr5 (15-507)||(22998929-22999424)
chr5 (15-480)||(9548358-9548826)
chr5 (15-480)||(15658575-15659043)
chr5 (15-480)||(8665290-8665758)
chr5 (15-526)||(30168302-30168816)
chr5 (15-525)||(12131989-12132502)
chr5 (15-526)||(30151851-30152365)
chr5 (15-525)||(9317285-9317798)
chr5 (15-525)||(15758672-15759185)
chr5 (46-525)||(33292362-33292841)
chr5 (14-480)||(32599286-32599752)
chr5 (15-525)||(26480226-26480739)
chr5 (15-480)||(34616400-34616865)
chr5 (15-480)||(6874181-6874652)
chr5 (15-526)||(18375227-18375741)
chr5 (15-525)||(37671298-37671820)
chr5 (15-480)||(2510930-2511398)
chr5 (15-480)||(28649105-28649582)
chr5 (46-479)||(41674589-41675025)
chr5 (15-525)||(31431262-31431787)
chr5 (15-526)||(33516189-33516703)
chr5 (15-525)||(5637744-5638257)
chr5 (23-347)||(18500553-18500877)
chr5 (15-525)||(24681271-24681787)
chr5 (15-525)||(24723798-24724314)
chr5 (15-525)||(43078083-43078599)
chr5 (15-285)||(31826222-31826492)
chr5 (15-369)||(37358458-37358812)
chr5 (15-345)||(40473364-40473694)
chr5 (15-347)||(37770802-37771134)
chr5 (15-525)||(29966881-29967394)
chr5 (15-525)||(30029249-30029762)
chr5 (15-347)||(37754995-37755327)
chr5 (15-285)||(13324644-13324914)
chr5 (15-285)||(3789618-3789888)
chr5 (14-360)||(28959600-28959946)
chr5 (398-525)||(3789360-3789487)
chr5 (398-480)||(18500949-18501031)
chr5 (398-525)||(37358856-37358983)
chr5 (398-525)||(13325045-13325172)
chr5 (398-525)||(31826620-31826747)
chr5 (398-525)||(37771200-37771327)
chr5 (398-480)||(28959999-28960081)
chr5 (398-480)||(37754847-37754929)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (25-531)||(44562923-44563427)
chr8 (24-531)||(19658926-19659432)
chr8 (15-531)||(9354444-9354961)
chr8 (50-526)||(22080790-22081263)
chr8 (24-369)||(33244649-33244994)
chr8 (15-507)||(16283292-16283787)
chr8 (15-507)||(16277397-16277892)
chr8 (15-525)||(19687923-19688436)
chr8 (15-480)||(27608782-27609250)
chr8 (15-525)||(18710411-18710924)
chr8 (15-507)||(14557470-14557962)
chr8 (15-507)||(2137136-2137631)
chr8 (15-525)||(31489627-31490140)
chr8 (15-525)||(19674263-19674779)
chr8 (15-480)||(31354394-31354862)
chr8 (15-525)||(19208237-19208750)
chr8 (15-525)||(19286290-19286800)
chr8 (15-526)||(28361832-28362346)
chr8 (15-347)||(3329384-3329716)
chr8 (15-285)||(29829390-29829660)
chr8 (15-347)||(12092601-12092933)
chr8 (15-525)||(33258548-33259061)
chr8 (15-191)||(189256-189432)
chr8 (398-525)||(3329782-3329909)
chr8 (398-525)||(29829138-29829265)
chr8 (398-480)||(19518406-19518488)
chr8 (398-525)||(12092996-12093123)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (25-531)||(33374127-33374633)
chr6 (20-531)||(13521939-13522450)
chr6 (25-530)||(28162477-28162982)
chr6 (25-531)||(8892182-8892687)
chr6 (25-531)||(8903417-8903922)
chr6 (122-522)||(22477241-22477644)
chr6 (15-369)||(22456795-22457149)
chr6 (15-369)||(14143146-14143500)
chr6 (15-369)||(26787925-26788279)
chr6 (15-369)||(27196298-27196652)
chr6 (15-369)||(27252588-27252942)
chr6 (15-381)||(27290231-27290597)
chr6 (20-483)||(20160568-20161031)
chr6 (20-483)||(22171800-22172263)
chr6 (15-507)||(22934741-22935233)
chr6 (15-507)||(23857186-23857678)
chr6 (15-525)||(24304479-24304992)
chr6 (15-525)||(26918202-26918715)
chr6 (15-507)||(13298812-13299307)
chr6 (15-507)||(26988841-26989336)
chr6 (18-506)||(16749695-16750186)
chr6 (15-507)||(24863557-24864052)
chr6 (29-507)||(26999913-27000394)
chr6 (15-507)||(15424178-15424673)
chr6 (15-525)||(29549300-29549810)
chr6 (15-345)||(27272441-27272771)
chr6 (15-525)||(4525111-4525621)
chr6 (15-525)||(29572835-29573348)
chr6 (15-525)||(4757583-4758099)
chr6 (15-347)||(4773009-4773341)
chr6 (15-526)||(30557877-30558391)
chr6 (15-480)||(27044257-27044723)
chr6 (15-336)||(4545636-4545957)
chr6 (15-345)||(3696086-3696416)
chr6 (15-345)||(34463207-34463537)
chr6 (15-336)||(4723995-4724316)
chr6 (15-336)||(28207468-28207789)
chr6 (15-525)||(29501228-29501750)
chr6 (15-285)||(16674204-16674474)
chr6 (15-285)||(27007792-27008062)
chr6 (14-273)||(27359852-27360111)
chr6 (14-273)||(27450195-27450454)
chr6 (14-360)||(26777475-26777821)
chr6 (15-347)||(17025280-17025612)
chr6 (15-267)||(26116271-26116523)
chr6 (15-525)||(16943888-16944401)
chr6 (15-141)||(17092301-17092427)
chr6 (15-273)||(27485206-27485464)
chr6 (349-522)||(27629907-27630080)
chr6 (398-525)||(4546031-4546158)
chr6 (398-525)||(4724390-4724517)
chr6 (398-525)||(28207264-28207391)
chr6 (398-480)||(3695930-3696012)
chr6 (398-480)||(17025129-17025211)
chr6 (398-480)||(26777874-26777956)
chr6 (398-480)||(27007579-27007661)
chr6 (379-525)||(27484939-27485085)
chr6 (398-483)||(16673991-16674076)
chr6 (398-525)||(4772819-4772946)
chr6 (398-525)||(27360257-27360384)
chr6 (398-525)||(27450600-27450727)
chr6 (398-480)||(26116666-26116748)
chr6 (398-480)||(34463608-34463690)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (20-522)||(15284851-15285353)
chr4 (25-531)||(24460533-24461039)
chr4 (17-522)||(15227716-15228221)
chr4 (17-522)||(1900103-1900608)
chr4 (20-522)||(14235448-14235953)
chr4 (50-526)||(15391291-15391764)
chr4 (15-507)||(17013858-17014353)
chr4 (15-525)||(24592232-24592742)
chr4 (15-525)||(14664858-14665371)
chr4 (15-507)||(14763222-14763717)
chr4 (15-526)||(5005709-5006226)
chr4 (15-507)||(36344433-36344925)
chr4 (46-525)||(34188909-34189388)
chr4 (15-480)||(6569738-6570206)
chr4 (46-524)||(24112506-24112984)
chr4 (15-526)||(27163235-27163749)
chr4 (15-525)||(14098381-14098894)
chr4 (15-525)||(31126436-31126949)
chr4 (15-525)||(54833230-54833740)
chr4 (15-525)||(18800531-18801053)
chr4 (15-525)||(40105556-40106069)
chr4 (15-345)||(33673716-33674046)
chr4 (15-480)||(21969586-21970054)
chr4 (15-285)||(30753837-30754107)
chr4 (15-345)||(39850661-39850991)
chr4 (424-525)||(19373101-19373202)
chr4 (398-525)||(30753582-30753709)
chr4 (398-483)||(33674114-33674199)
chr4 (398-483)||(39850505-39850590)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-522)||(20240-20723)
scaffold0124 (15-507)||(30296-30790)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (50-526)||(21391-21864)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (70-381)||(1-312)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (17-283)||(1838-2103)
scaffold0415 (23-317)||(6047-6344)
scaffold0415 (404-480)||(5859-5936)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (15-507)||(39987-40482)
scaffold0089 (15-507)||(29606-30101)
scaffold0089 (15-480)||(46903-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (16-507)||(27135-27629)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-525)||(47-561)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (15-525)||(7157-7670)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (15-525)||(8984-9497)
scaffold0159 (15-525)||(19840-20353)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (15-207)||(536-728)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-526)||(14848-15362)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (15-360)||(9559-9904)
scaffold0336 (395-525)||(8057-8187)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (15-525)||(26119-26633)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (15-336)||(7966-8287)
scaffold0038 (398-525)||(7762-7889)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (59-267)||(46764-46981)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (398-480)||(37-119)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 531
Target Start/End: Original strand, 2576 - 3092
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 2875  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||| |||||    
T  2876 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacggg 2975  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2976 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctga 3075  T
Q  515 gcagcattgatgtccat 531  Q
    |||||||||||||||||    
T  3076 gcagcattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 531
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340769
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 20340552  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||| |||||    
T  20340553 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacggg 20340652  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20340653 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctga 20340752  T
Q  515 gcagcattgatgtccat 531  Q
    |||||||||||||||||    
T  20340753 gcagcattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208453
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||     
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatac 16208250  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
T  16208251 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgatgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggta 16208347  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    ||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||| ||    
T  16208348 cctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgggc 16208447  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  16208448 agcatt 16208453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461076
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 20461117  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctg 357  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461116 agcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctg 20461076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151845
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 28151900  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151899 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793694
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 41793525  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | ||  ||||||| ||||| ||    
T  41793526 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgac 41793625  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  41793626 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgaga 41793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 378 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460935
Alignment:
Q  378 gctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 477  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  478 agagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcatt 20460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962494
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || |||||||||||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcat 10962708  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  10962707 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 10962608  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  10962607 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 10962508  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  10962507 tgagctgcattgat 10962494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28584805
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28585019  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  28585018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 28584919  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||| |      
T  28584918 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatt 28584819  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  28584818 tgagctgcattgat 28584805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638042
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 51638256  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||||||||||  ||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   ||||||||   | || || ||||| ||||| ||    
T  51638255 acaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgac 51638156  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  51638155 gggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 51638056  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  51638055 tgagctgcattgat 51638042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 522
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626972
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||| |    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatc 16626769  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||     
T  16626770 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccg 16626869  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16626870 gaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagc 16626969  T
Q  520 att 522  Q
    |||    
T  16626970 att 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17994259
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 17994052  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  17994053 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 17994152  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994153 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 17994252  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  17994253 tgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4625727
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 4625934  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | | ||||||||||||||||||||    
T  4625933 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggt 4625834  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625833 tgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 4625734  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  4625733 tgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652170
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 5652378  T
Q  324 gtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgagg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  5652377 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgagg 5652278  T
Q  424 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 523  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652277 ttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattg 5652178  T
Q  524 atgtccat 531  Q
    ||||||||    
T  5652177 atgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530186
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatac 18530386  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |    
T  18530385 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggca 18530292  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  18530291 cttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactgggc 18530192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292697
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 32292752  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292751 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034430
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 31034375  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31034376 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713007
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5713217  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctga 421  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || |||    
T  5713216 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttga 5713117  T
Q  422 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcat 521  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5713116 ggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcat 5713017  T
Q  522 tgatgtccat 531  Q
    ||||||||||    
T  5713016 tgatgtccat 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5723917
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5724127  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctga 421  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || |||    
T  5724126 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttga 5724027  T
Q  422 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcat 521  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5724026 ggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcat 5723927  T
Q  522 tgatgtccat 531  Q
    ||||||||||    
T  5723926 tgatgtccat 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757560
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5757350  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctga 421  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || |||    
T  5757351 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttga 5757450  T
Q  422 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcat 521  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5757451 ggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcat 5757550  T
Q  522 tgatgtccat 531  Q
    ||||||||||    
T  5757551 tgatgtccat 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768451
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5768241  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctga 421  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || |||    
T  5768242 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttga 5768341  T
Q  422 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcat 521  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5768342 ggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcat 5768441  T
Q  522 tgatgtccat 531  Q
    ||||||||||    
T  5768442 tgatgtccat 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15893178
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15892964  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||| |||| || |||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  15892965 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 15893064  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |      
T  15893065 gggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatt 15893164  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    || |||||||||||    
T  15893165 tgggcagcattgat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301736
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8301525  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||    
T  8301526 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacggg 8301625  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  ||     
T  8301626 tacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgg 8301725  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    |||||||||||    
T  8301726 gcagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051066
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 18051262  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  18051261 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 18051162  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  18051161 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8295779
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8295972  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| ||||||||  |||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||    
T  8295971 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacagg 8295872  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  8295871 tacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22388047
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||| ||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcat 22387836  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || ||    
T  22387837 acaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagg 22387936  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || | ||||    
T  22387937 gacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactga 22388036  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    |||||||||||    
T  22388037 gcagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4797107
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4796911  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  4796912 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 4797011  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  4797012 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 4797107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330460
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcat 18330669  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  18330668 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 18330569  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  18330568 gggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 18330474  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  18330473 tgagctgcattgat 18330460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192102
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 6192316  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  6192315 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 6192216  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  6192215 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 6192116  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  6192115 tgagctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880552
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 35880766  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  35880765 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 35880666  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  35880665 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 35880566  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  35880565 tgagctgcattgat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29149209
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 29149013  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  29149014 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 29149113  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  29149114 gggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 29149209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721417
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4721631  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   ||||||||   | || |||||||| ||||| ||    
T  4721630 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgac 4721531  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  4721530 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 4721431  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  4721430 tgagctgcattgat 4721417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741536
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 15741352  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   ||||            ||||| || ||||||||    
T  15741353 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgt------------tgagcgattgcattaac 15741440  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  15741441 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 15741536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7072998
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 7073212  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  7073211 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 7073112  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  7073111 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 7073012  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  7073011 tgagctgcattgat 7072998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcat 28116212  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  28116213 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 28116312  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  28116313 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 28116412  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  28116413 atttgagctgcattgat 28116429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277506
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18277310  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| ||    
T  18277311 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgac 18277410  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18277411 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18277506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292807
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18292611  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| ||    
T  18292612 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgac 18292711  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18292712 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18308108
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18307912  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| ||    
T  18307913 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgac 18308012  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18308013 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18308108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10395970
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 10396133  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||  |   || ||||| |||||||| ||    
T  10396132 acaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacc---tgttgagcgatggcattgac 10396036  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 477  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10396035 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 10395970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416747
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4416919  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  4416918 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 4416819  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4416818 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4416747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211527
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 8211738  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||  ||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || ||    
T  8211737 acaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagg 8211638  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||    
T  8211637 aacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttga 8211538  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  8211537 gctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32438944
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  32439122 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 32439023  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  32439022 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5466771
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcat 5466985  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| ||||| |||||||| || |||||| |   ||| ||||||||  | |||||| |||| || ||  ||||    || ||||| |||||||| ||    
T  5466984 acaacataggtataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcgatggcattgac 5466885  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
     || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  5466884 aggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 5466785  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  5466784 tgagctgcattgat 5466771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4347111
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 4346945  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || ||    
T  4346946 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagg 4347045  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4347046 aacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4347111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021109
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcat 28021275  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || ||    
T  28021274 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagg 28021175  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28021174 aacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 17985214  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  17985215 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 17985314  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  17985315 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 17985414  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  17985415 tgagctgcattgatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964945
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31964731  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  31964732 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 31964831  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  31964832 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 31964931  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  31964932 tgagctgcattgat 31964945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134543
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 50134329  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  50134330 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 50134429  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  50134430 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 50134529  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  50134530 tgagctgcattgat 50134543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023284
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 47023453  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  47023452 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 47023353  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  47023352 gggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 47023284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339088
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28339302  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  28339301 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 28339202  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  28339201 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 28339102  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  28339101 tgagctgcattgat 28339088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609749
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5609580  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  5609581 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 5609680  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5609681 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5609749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20065850
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 20066012  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  20066011 agtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 20065912  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  20065911 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 20065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674479
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcat 21674693  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| || || |     
T  21674692 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgat 21674593  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  21674592 gggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 21674493  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  21674492 tgagctgcattgat 21674479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996393
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7996562  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  7996561 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 7996462  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  7996461 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 7996393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10642901
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 10643070  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  10643069 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 10642970  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  10642969 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 10642901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 149 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4892999
Alignment:
Q  149 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 248  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  249 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 348  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T
Q  349 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 448  Q
     | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  4893175 atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactga 4893076  T
Q  449 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  4893075 tgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110578
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 11110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665259
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29665228  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  29665229 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542753
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 6542720  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  6542721 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577136
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20577105  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  20577106 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997366
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 36997335  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  36997336 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465956
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 48465956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596838
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 5596615  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaat 402  Q
    | | |||||||||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||| ||||||||  ||| || || ||||| |  |||||||| ||    
T  5596616 acaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgat 5596715  T
Q  403 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgac 502  Q
    |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||    
T  5596716 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgac 5596815  T
Q  503 ggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  5596816 ggaggcatttgagctgcattgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18224977
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 18225191  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  18225190 acaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 18225091  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  18225090 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 18224991  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  18224990 tgagctgcattgat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782052
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797141
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  215 aggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871148
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22871114  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 348  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22871115 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886207
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22886173  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 348  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22886174 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013497
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 5013712  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| || || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  5013711 acaacattggtataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 5013612  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  5013611 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 5013512  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  5013511 tgagctgcattgatg 5013497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242780
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 18242780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24327945
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 24328159  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  24328158 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 24328059  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  24328058 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 24327959  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  24327958 tgagctgcattgat 24327945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Original strand, 29665330 - 29665415
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665330 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 11110706 - 11110788
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11110706 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11110788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 6542819 - 6542946
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  6542819 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 6542918  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  6542919 atgacggaggcatttgagctgcattgat 6542946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 22871219 - 22871346
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  22871219 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 22871318  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||    
T  22871319 atgacggaggcatctgagctgcattgat 22871346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 22886278 - 22886405
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  22886278 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 22886377  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||    
T  22886378 atgacggaggcatctgagctgcattgat 22886405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 36997434 - 36997516
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  36997434 gcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 36997516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 48465828 - 48465701
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||   || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||    
T  48465828 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 48465729  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  48465728 atgacggaggcatttgagctgcattgat 48465701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18242659 - 18242513
Alignment:
Q  379 ctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 478  Q
    |||||||| | | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  18242659 ctgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctga 18242560  T
Q  479 gagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    || ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18242559 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18242513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 20577207 - 20577289
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  20577207 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 20577289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 51781924 - 51781839
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51781924 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 51781839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 51797013 - 51796928
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51797013 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 51796928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 522
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456835
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 19456632  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  19456633 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacct 19456732  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  19456733 gaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagc 19456832  T
Q  520 att 522  Q
    |||    
T  19456833 att 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 531
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303726
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcat 34303509  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | | ||||||||||    
T  34303510 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacggg 34303609  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34303610 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctga 34303709  T
Q  515 gcagcattgatgtccat 531  Q
    |||||||||||||||||    
T  34303710 gcagcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118506
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcg 27118714  T
Q  324 gtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgagg 423  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  27118713 gtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgagg 27118614  T
Q  424 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118613 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 27118514  T
Q  524 atgtccat 531  Q
    ||||||||    
T  27118513 atgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784472
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 3784679  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  3784678 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 3784579  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784578 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 3784479  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  3784478 tgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34156829
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 34157036  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  34157035 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 34156936  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156935 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 34156836  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  34156835 tgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163417
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 16163624  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  16163623 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 16163524  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163523 tgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 16163424  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  16163423 tgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703578
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 21703372  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||    
T  21703373 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggta 21703472  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  21703473 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggc 21703572  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  21703573 agcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 530
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891750
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||      
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31891544  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  31891545 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggt 31891644  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891645 tgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 31891744  T
Q  525 tgtcca 530  Q
    ||||||    
T  31891745 tgtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27392813
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatc 27392999  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||                     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27392998 attggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgct---------------------gttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacct 27392920  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    ||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  27392919 gaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagc 27392820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434846
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| |||||||||||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcat 27434650  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  27434651 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 27434750  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27434751 gggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128968
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23128772  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  23128773 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 23128872  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23128873 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882053
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 28882249  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  28882248 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 28882149  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  28882148 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 28882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655381
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 12655577  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  12655576 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 12655477  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  12655476 gggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20837759
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 20837953  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  20837952 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 20837853  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 505  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  20837852 gggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacgga 20837759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926448
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 22926234  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  22926235 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 22926334  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  22926335 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 22926434  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  22926435 tgagctgcattgat 22926448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936964
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 13936750  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||    |||||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  13936751 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 13936850  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  13936851 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 13936950  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  13936951 tgagctgcattgat 13936964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677557
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 21677388  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  21677389 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 21677488  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21677489 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 21677557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635609
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11635392  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  11635393 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 11635492  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  11635493 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 11635592  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  11635593 atttgagctgcattgat 11635609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233515
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||||||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcat 40233546  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233545 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641798
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11641581  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  11641582 ataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 11641681  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  11641682 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 11641781  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  11641782 atttgagctgcattgat 11641798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925314
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37925528  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  37925527 ataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 37925428  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  37925427 gggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 37925328  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  37925327 tgagctgcattgat 37925314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350219
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9350188  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9350189 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049664
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 32049833  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  32049832 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 32049733  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32049732 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 32049664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279270
Alignment:
Q  134 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 233  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  234 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagagg 333  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  334 aaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgaccc 430  Q
     || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgaccc 34279365  T
Q  431 gatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  34279364 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 34279270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286223
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 349  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34286354  T
Q  350 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 446  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  34286353 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtact 34286254  T
Q  447 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 477  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34286253 gatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34286223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291283
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 349  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34291414  T
Q  350 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 446  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  34291413 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtact 34291314  T
Q  447 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 477  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34291313 gatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861501
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34861715  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  34861714 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 34861615  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  34861614 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 34861515  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  34861514 tgagctgcattgat 34861501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686329
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37686115  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  37686116 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 37686215  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  37686216 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 37686315  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  37686316 tgagctgcattgat 37686329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701594
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37701380  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  37701381 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 37701480  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  37701481 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 37701580  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  37701581 tgagctgcattgat 37701594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375000
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 37375196  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag---cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  ||||||| || |||||||    ||| ||||||||  | |||||| | || || || |||||    || ||||| ||| |||| ||    
T  37375195 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgacattgac 37375096  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  37375095 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 37375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829740
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16829544  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  16829545 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 16829644  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16829645 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16829740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891741
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16891937  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  16891936 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 16891837  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16891836 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16891741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586814
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||| |||||||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcat 12586845  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  12586844 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12717025
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12716808  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |  | |||||||      ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| || ||    
T  12716809 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgtt 12716908  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  12716909 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 12717008  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  12717009 atttgagctgcattgat 12717025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876102
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 31876316  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  31876315 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 31876216  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  31876215 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 31876116  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  31876115 tgagctgcattgat 31876102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777226
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27777257  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27777256 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27816984
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27817015  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27817014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39052059
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39052028  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39052029 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803687
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatata 317  Q
    |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatata 27803739  T
Q  318 gcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
     ||| |||||  ||||||| || ||||| |  | |||||||||  |||||||    
T  27803738 acatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260930
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 260930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890150
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416919
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 19416705  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  |||| || || || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  19416706 acaacatcggtataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 19416805  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  19416806 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 19416905  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  19416906 tgagccgcattgat 19416919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 261058 - 261140
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  261058 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 261140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40233447 - 40233320
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||    
T  40233447 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 40233348  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  40233347 atgacggaggcatttgagctgcattgat 40233320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39890010 - 39889883
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  39890010 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 39889911  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  39889910 atgacggaggcatttgagctgcattgat 39889883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12586749 - 12586667
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12586749 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 12586667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27803640 - 27803558
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27803640 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 27803558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Original strand, 39052121 - 39052206
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39052121 gcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 39052206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088784
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31088577  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  31088578 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 31088677  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088678 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 31088777  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  31088778 tgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733283
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| || |||||||||| ||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattgg 45733490  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  45733489 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 45733390  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733389 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 45733290  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  45733289 tgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450309
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcatt 322  Q
    | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 16450109  T
Q  323 ggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  16450110 ggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgag 16450209  T
Q  423 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16450210 gttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041155
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 16041361  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||    
T  16041360 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggta 16041261  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  16041260 cctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggc 16041161  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  16041160 agcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484679
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26484734  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484733 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109163
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcatt 322  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcatt 2109116  T
Q  323 ggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109117 ggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211181
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 39211126  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39211127 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775344
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcat 2775399  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2775398 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 507
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518715
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16518520  T
Q  316 tagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacg 412  Q
     | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||    
T  16518521 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 16518620  T
Q  413 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16518621 ggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 507
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503679
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16503484  T
Q  316 tagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacg 412  Q
     | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||    
T  16503485 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 16503584  T
Q  413 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16503585 ggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5127818
Alignment:
Q  13 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  113 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 212  Q
    || || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  213 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagc 312  Q
    |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagc 5128034  T
Q  313 atatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatta 409  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||    
T  5128033 atacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatta 5127934  T
Q  410 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |    
T  5127933 acgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 5127834  T
Q  510 gctgagcagcattgat 525  Q
      ||||| ||||||||    
T  5127833 tttgagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10917137
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 10916971  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||    
T  10916972 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacagg 10917071  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917072 tacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11425048
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 11424879  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  11424880 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 11424979  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424980 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 11425048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540784
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18540807 agcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154417
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 2154613  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || ||| |||||||||| ||    || ||| |||||||| |  |   ||||||||   | || |||||||| ||||||||    
T  2154612 acaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaac 2154513  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  2154512 ggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 2154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 483
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147615
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 5147443  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  5147444 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 5147543  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5147544 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435125
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 26435297  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  26435296 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 26435197  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435196 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275411
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26275197  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  26275198 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 26275297  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  26275298 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 26275397  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  26275398 tgagctgcattgat 26275411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145440
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4145226  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || |||||    || ||||| |||||||| ||    
T  4145227 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgac 4145326  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  4145327 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 4145426  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  4145427 tgagctgcattgat 4145440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26320186
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26319972  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  26319973 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 26320072  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  26320073 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 26320172  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  26320173 tgagctgcattgat 26320186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387169
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 45387383  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  45387382 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 45387283  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  45387282 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 45387183  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  45387182 tgagctgcattgat 45387169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159348
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  5159527 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 5159428  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  5159427 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736732
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16736563  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  16736564 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 16736663  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16736664 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16736732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751786
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16751617  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  16751618 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 16751717  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16751718 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16751786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523403
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17523572  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  17523571 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 17523472  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17523471 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17523403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529812
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17529643  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  17529644 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 17529743  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529744 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17529812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618477
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9618691  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  9618690 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 9618591  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  9618590 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 9618491  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  9618490 tgagctgcattgat 9618477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26670231
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26670017  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  26670018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 26670117  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  26670118 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 26670217  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  26670218 tgagctgcattgat 26670231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26538190
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26537973  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |  | |||||||      ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  26537974 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 26538073  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  26538074 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggc 26538173  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  26538174 atttgagctgcattgat 26538190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564526
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31564493  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  31564494 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445375
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 3445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441641
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592858
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 24592644  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  24592645 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 24592744  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  24592745 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 24592844  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  24592845 tgagctgcattgat 24592858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125001
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11441513 - 11441431
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11441513 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 525
Target Start/End: Original strand, 26485885 - 26486061
Alignment:
Q  349 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 448  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  26485885 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactga 26485984  T
Q  449 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  26485985 tggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 26486061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31124864 - 31124737
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  31124864 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 31124765  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31124764 atgacggaggcatttgagctgcattgat 31124737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 31564589 - 31564716
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||    
T  31564589 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggt 31564688  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31564689 atgacggaggcatttgagctgcattgat 31564716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 3445247 - 3445162
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3445247 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 3445162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184979
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 13184772  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  13184773 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 13184872  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184873 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 13184972  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  13184973 tgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877078
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 33877290  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||    
T  33877289 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacct 33877190  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33877189 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagc 33877090  T
Q  520 attgatgtccat 531  Q
    ||||||||||||    
T  33877089 attgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440825
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattgg 13440618  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  13440619 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 13440718  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440719 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 13440818  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  13440819 tgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325625
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 11325832  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  11325831 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggt 11325732  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325731 tgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 11325632  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  11325631 tgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888310
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatac 22888516  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||    
T  22888515 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggtta 22888416  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  22888415 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggc 22888316  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  22888315 agcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25198884
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 25199075  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||| |||||| |||    
T  25199074 aacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagta 25198975  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25198974 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892058
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcat 23892254  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||   | | || |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  23892253 acatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgac 23892154  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23892153 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889263
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcat 29889196  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 381  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889197 acaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24969876
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24970066  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||||   || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||    
T  24970065 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgt---tgatgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacggg 24969969  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24969968 tacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688467
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24688271  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | |  || |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| | ||||||    
T  24688272 acaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaac 24688371  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24688372 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934488
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 30934681  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||    
T  30934680 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacggg 30934581  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  30934580 tacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 30934488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752760
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23752564  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  23752565 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 23752664  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  23752665 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 23752760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777321
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 33777535  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  33777534 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 33777435  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  33777434 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 33777335  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  33777334 tgagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549206
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 11549402  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  11549401 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 11549302  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  11549301 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggagg 11549206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718298
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23718102  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  23718103 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 23718202  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  23718203 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 23718298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999424
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 22999228  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  22999229 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 22999328  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  22999329 gggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 22999424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548826
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcat 9548657  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  9548658 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 9548757  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9548758 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 9548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15659043
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 15658874  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  15658875 ataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 15658974  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  15658975 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgaga 15659043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665758
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 8665589  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  8665590 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 8665689  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8665690 gggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 8665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168302
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30168517  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  30168516 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 30168417  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  30168416 gggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 30168317  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  30168316 tgagctgcattgatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12131989
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12132203  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  12132202 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 12132103  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  12132102 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 12132003  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  12132002 tgagctgcattgat 12131989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30151851
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30152066  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  30152065 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 30151966  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  30151965 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 30151866  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  30151865 tgagctgcattgatg 30151851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317285
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9317499  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  9317498 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 9317399  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  9317398 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 9317299  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  9317298 tgagctgcattgat 9317285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15759185
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 15758971  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  15758972 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 15759071  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  15759072 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 15759171  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  15759172 tgagctgcattgat 15759185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292362
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  33292541 agcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 33292442  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  33292441 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599752
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgca 32599585  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgg 413  Q
    || | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    |||||||| |||||||| || |    
T  32599586 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacag 32599685  T
Q  414 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    | ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  32599686 gaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 32599752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480226
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26480440  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  26480439 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 26480340  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  26480339 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 26480240  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  26480239 tgagctgcattgat 26480226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616400
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 34616566  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || ||    
T  34616565 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagg 34616466  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34616465 aacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874181
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||| ||||||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcat 6874353  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  6874352 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 6874253  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6874252 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375741
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 18375526  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  18375527 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 18375626  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  18375627 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 18375726  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  18375727 tgagctgcattgatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671820
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37671597  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----------ct--tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaat 402  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||          ||  ||||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |||||    
T  37671598 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaat 37671697  T
Q  403 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgac 502  Q
     ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||    
T  37671698 tgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgac 37671797  T
Q  503 ggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  37671798 ggaggcatttgagctgcattgat 37671820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2510930
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 2511099  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  2511098 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 2510999  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||  || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  2510998 ggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 2510930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649105
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28649283  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgc------tgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaat 402  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    ||  || ||||||      ||| |||||||| | |||  |||||||| | | || || |||||    
T  28649282 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgttgttgttgttgaaccggaaactgttgtttcatctgttgggcaat 28649183  T
Q  403 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28649182 tgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674589
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 41674726  T
Q  346 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 442  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||     
T  41674725 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagaggg 41674626  T
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgag 479  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  41674625 tactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431262
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 31431488  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag---------------cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagc 399  Q
    | | |||||||||  ||||||| || || ||||                |||||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||    
T  31431487 acaacattggtataggaggaaaagttggcctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggc 31431388  T
Q  400 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 499  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||     
T  31431387 aattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtat 31431288  T
Q  500 gacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31431287 gacggaggcatttgagctgcattgat 31431262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516189
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 33516404  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  33516403 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 33516304  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  33516303 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 33516204  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  33516203 tgagccgcattgatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5637744
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5637958  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  5637957 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 5637858  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  5637857 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 5637758  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  5637757 tgagctgcattgat 5637744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500877
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcatt 322  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||     
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatc 18500852  T
Q  323 ggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    |||||  ||||||| || |||||||    
T  18500853 ggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681271
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24681488  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag------cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |        || ||||||||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| || ||    
T  24681487 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgctgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgtt 24681388  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  24681387 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 24681288  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  24681287 atttgagctgcattgat 24681271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24723798
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24724015  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag------cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |        || ||||||||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| || ||    
T  24724014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgctgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgtt 24723915  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  24723914 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 24723815  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  24723814 atttgagctgcattgat 24723798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078083
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 43078300  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||| |  | |||||||      ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  43078299 acaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 43078200  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||||||||||||     
T  43078199 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggc 43078100  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  43078099 atttgagctgcattgat 43078083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826492
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358812
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 37358757  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||  |  ||||||||| |||||||    
T  37358758 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473694
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 40473663  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  40473664 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37771101  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37771102 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967394
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 29967180  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  29967181 acaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 29967280  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  29967281 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 29967380  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  29967381 tgagctgcattgat 29967394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029249
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 30029463  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  30029462 acaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 30029363  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  30029362 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 30029263  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  30029262 tgagctgcattgat 30029249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37754995
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37755028  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37755027 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324914
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 13324914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789618
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 3789618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959946
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgca 28959899  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 360  Q
    || | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  28959900 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctg 28959946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3789487 - 3789360
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||    
T  3789487 gcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 3789388  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  3789387 atgacggaggcatttgagctgcattgat 3789360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 18500949 - 18501031
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18500949 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 18501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 37358856 - 37358983
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  37358856 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 37358955  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  37358956 atgacggaggcatttgagctgcattgat 37358983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 13325045 - 13325172
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||    
T  13325045 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggt 13325144  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  13325145 atgacggaggcatttgagctgcattgat 13325172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 31826620 - 31826747
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  31826620 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 31826719  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31826720 atgacggaggcatttgagctgcattgat 31826747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 37771200 - 37771327
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || |    
T  37771200 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggat 37771299  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  37771300 acgacggaggcatttgagctgcattgat 37771327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 28959999 - 28960081
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28959999 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28960081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37754929 - 37754847
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37754929 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37754847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44562923
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 44563130  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  44563129 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggt 44563030  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563029 tgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 44562930  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  44562929 tgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 531
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659432
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 19659224  T
Q  324 gtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgagg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  19659225 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgagg 19659324  T
Q  424 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659325 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 19659424  T
Q  524 atgtccat 531  Q
    ||||||||    
T  19659425 atgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagca 9354662  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgg 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||    
T  9354661 tataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgg 9354562  T
Q  414 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9354561 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 9354462  T
Q  514 agcagcattgatgtccat 531  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9354461 agcagcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 50 - 526
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081263
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 349  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 22081089  T
Q  350 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatact 446  Q
    ||||||||||   | ||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||    
T  22081090 tgttgctgct---gctgttgagccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatact 22081183  T
Q  447 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 526  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22081184 ggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244649
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattg 323  Q
     ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattg 33244695  T
Q  324 gtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33244694 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283292
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcat 16283488  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||     
T  16283487 acaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaat 16283388  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16283387 gggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277397
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 16277593  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  16277592 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 16277493  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16277492 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19687923
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 19688137  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | |    |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  19688136 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 19688037  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||||| |      
T  19688036 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatt 19687937  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    || |||||||||||    
T  19687936 tgggcagcattgat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609250
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 27609081  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  27609082 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 27609181  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609182 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 27609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710411
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18710625  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| ||||||||  |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||    
T  18710624 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgac 18710525  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  18710524 gggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatt 18710425  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  18710424 tgagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557470
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14557663  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||    
T  14557662 ataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacagg 14557563  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  14557562 tacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 14557470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137631
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 2137435  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  2137436 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 2137535  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  2137536 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31490140
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31489926  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   ||| |||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  31489927 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 31490026  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  31490027 gggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 31490126  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  31490127 tgagctgcattgat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674263
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19674480  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  19674479 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 19674380  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  19674379 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 19674280  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  19674279 atttgagctgcattgat 19674263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354394
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||| ||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcat 31354563  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || |||||    || ||||| |||||||| ||    
T  31354562 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgac 31354463  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31354462 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31354394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208750
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19208536  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  19208537 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 19208636  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  19208637 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 19208736  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  19208737 tgagctgcattgat 19208750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286290
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 19286501  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || |||||||||||||| || ||    
T  19286500 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacagg 19286401  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  |||    
T  19286400 aacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttga 19286301  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  19286300 gctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362346
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28362131  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  28362132 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 28362231  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  28362232 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 28362331  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  28362332 tgagctgcattgatg 28362346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329716
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3329683  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  3329684 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829390
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092933
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 12092900  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  12092901 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258548
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 33258762  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  33258761 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 33258662  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  33258661 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 33258562  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  33258561 tgagctgcattgat 33258548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 191  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 3329782 - 3329909
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  3329782 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggt 3329881  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  3329882 atgacggaggcatttgagctgcattgat 3329909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29829265 - 29829138
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  29829265 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 29829166  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29829165 atgacggaggcatttgagctgcattgat 29829138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 19518406 - 19518488
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19518406 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 19518488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 12092996 - 12093123
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  12092996 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 12093095  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  12093096 atgacggaggcacttgagctgcattgat 12093123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374633
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 33374426  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  33374427 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 33374526  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374527 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 33374626  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  33374627 tgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522450
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 13522238  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||    
T  13522239 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacct 13522338  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13522339 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagc 13522438  T
Q  520 attgatgtccat 531  Q
    ||||||||||||    
T  13522439 attgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162477
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 28162683  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  28162682 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggt 28162583  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28162582 tgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcattga 28162483  T
Q  525 tgtcca 530  Q
    ||||||    
T  28162482 tgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892687
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8892480  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  8892481 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggt 8892580  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892581 tgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 8892680  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  8892681 tgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903922
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8903715  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  8903716 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggt 8903815  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903816 tgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 8903915  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  8903916 tgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477644
Alignment:
Q  122 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 221  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  222 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcat 321  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  322 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | | || | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacc 22477540  T
Q  419 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  22477541 tgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcag 22477640  T
Q  519 catt 522  Q
    ||||    
T  22477641 catt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457149
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 22457094  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22457095 acatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143500
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 14143445  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143446 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26787925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26787980  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26787979 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196298
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27196353  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196352 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252942
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27252887  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252888 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290597
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27290530  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 381  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27290531 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160568
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 20160732  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160731 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacct 20160632  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20160631 gaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 20160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 483
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172263
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 22172099  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172100 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacct 22172199  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22172200 gaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 22172263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22935233
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 22935040  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||    
T  22935041 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacggg 22935140  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  22935141 tacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857678
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23857485  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||    
T  23857486 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacggg 23857585  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23857586 tacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304992
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24304778  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| |||||  |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  24304779 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 24304878  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  24304879 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 24304978  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    || |||||||||||    
T  24304979 tgggcagcattgat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918202
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26918416  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| ||| || |||||||| ||||| ||    
T  26918415 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgac 26918316  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |      
T  26918315 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 26918216  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  26918215 tgagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299307
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 13299111  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  13299112 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 13299211  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13299212 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26988841
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26989037  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||  |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  26989036 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 26988937  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26988936 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26988841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749695
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatata 317  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatata 16749887  T
Q  318 gcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
     ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||    
T  16749886 acatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacggg 16749787  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 506  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||    
T  16749786 tacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863557
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24863753  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  24863752 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 24863653  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| || ||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24863652 gggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 26999913
Alignment:
Q  29 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 128  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  129 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  229 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 328  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  329 agaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 425  Q
     |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggtt 26999995  T
Q  426 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26999994 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26999913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424673
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15424477  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||| | ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  15424478 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 15424577  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  15424578 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549300
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 29549511  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || ||    
T  29549510 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagg 29549411  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  |||    
T  29549410 aacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttga 29549311  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  29549310 gctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272771
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcat 27272740  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  27272741 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525111
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
     | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4525322  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||  |  ||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || ||    
T  4525321 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagg 4525222  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  |||    
T  4525221 aacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttga 4525122  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  4525121 gctgcattgat 4525111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29572835
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29573049  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  29573048 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 29572949  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  29572948 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 29572849  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  29572848 tgagctgcattgat 29572835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757583
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4757800  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    ||  || ||||| ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  4757799 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 4757700  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  4757699 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 4757600  T
Q  509 agctgagcagcattgat 525  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  4757599 atttgagctgcattgat 4757583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773009
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4773042  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  4773041 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558391
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30558176  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  30558177 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 30558276  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  30558277 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 30558376  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  30558377 tgagctgcattgatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044257
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc-atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || | | || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| |||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgca 27044424  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgg 413  Q
    || | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || |    
T  27044423 tacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacag 27044324  T
Q  414 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27044323 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 27044257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 336
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545957
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4545935  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaa 336  Q
    | | |||||||||  |||||||    
T  4545936 acaacattggtataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696086
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3696117  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  3696116 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463537
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34463506  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34463507 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 336
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724316
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4724294  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaa 336  Q
    | | |||||||||  |||||||    
T  4724295 acaacattggtataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207468
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 28207490  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaa 336  Q
    | | |||||||||  |||||||    
T  28207489 acaacattggtataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501228
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 29501451  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaat 402  Q
    | | |||||||||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||| ||||||||  ||| || || ||||| |  |||||||| ||    
T  29501450 acaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgat 29501351  T
Q  403 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgac 502  Q
    |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||    
T  29501350 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgac 29501251  T
Q  503 ggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  29501250 ggaggcatttgagctgcattgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674204
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 16674204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007792
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 27007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360111
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27360111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450454
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27450454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777821
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggca 26777774  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 360  Q
    || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  26777775 tacaacatcggtataggagggaaggttggtctagcatattgctgctg 26777821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025280
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 17025313  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 347  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  17025312 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116523
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 267  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944401
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 16944187  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||    || ||| | |||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  16944188 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 16944287  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  16944288 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 16944387  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  16944388 tgagctgcattgat 16944401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctt 141  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485206
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 27485206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 522
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630080
Alignment:
Q  349 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 448  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||| || | || ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  449 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 522  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacatt 27630080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 4546031 - 4546158
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  4546031 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 4546130  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4546131 atgacggaggcatttgagctgcattgat 4546158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 4724390 - 4724517
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  4724390 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 4724489  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4724490 atgacggaggcatttgagctgcattgat 4724517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28207391 - 28207264
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  28207391 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 28207292  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  28207291 atgacggaggcatttgagctgcattgat 28207264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3696012 - 3695930
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3696012 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 3695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17025211 - 17025129
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17025211 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17025129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 26777874 - 26777956
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26777874 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 26777956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27007661 - 27007579
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27007661 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27485085 - 27484939
Alignment:
Q  379 ctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 478  Q
    |||||||| | | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  27485085 ctgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctga 27484986  T
Q  479 gagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    || ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  27484985 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 27484939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16674076 - 16673991
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16674076 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 16673991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4772946 - 4772819
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||    
T  4772946 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggt 4772847  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4772846 atgacggaggcatttgagctgcattgat 4772819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 27360257 - 27360384
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||    
T  27360257 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggt 27360356  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  27360357 atgacggaggcatttgagctgcattgat 27360384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Original strand, 27450600 - 27450727
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||    
T  27450600 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggt 27450699  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  27450700 atgacggaggcatttgagctgcattgat 27450727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 26116666 - 26116748
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||    
T  26116666 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgaga 26116748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 34463608 - 34463690
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34463608 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 34463690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 522
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285353
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagc 15285150  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  15285151 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacct 15285250  T
Q  420 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagc 519  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||    
T  15285251 gaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagc 15285350  T
Q  520 att 522  Q
    |||    
T  15285351 att 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24461039
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 24460832  T
Q  325 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  24460833 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggt 24460932  T
Q  425 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460933 tgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattga 24461032  T
Q  525 tgtccat 531  Q
    |||||||    
T  24461033 tgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227716
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 15227922  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||    
T  15227921 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggta 15227822  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15227821 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggc 15227722  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  15227721 agcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900103
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| |    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  1900408 gtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 1900309  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  1900308 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 1900209  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  1900208 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggc 1900109  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  1900108 agcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 522
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235953
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagc 319  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaac 14235747  T
Q  320 attggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14235748 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggta 14235847  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  14235848 cctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagc 14235947  T
Q  517 agcatt 522  Q
    ||||||    
T  14235948 agcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 50 - 526
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391764
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 349  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 15391590  T
Q  350 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatact 446  Q
    ||||||||||||   ||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   |||||||    
T  15391591 tgttgctgctgt---tgttgagccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatact 15391684  T
Q  447 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 526  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15391685 ggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17013858
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcat 17014054  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  17014053 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaac 17013954  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||    
T  17013953 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggagg 17013858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592742
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24592531  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||    
T  24592532 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacggg 24592631  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  |||    
T  24592632 tacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttga 24592731  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  24592732 gctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14664858
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14665072  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  14665071 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 14664972  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |      
T  14664971 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatt 14664872  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    || |||||||||||    
T  14664871 tgggcagcattgat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763717
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 14763521  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| ||    
T  14763522 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgac 14763621  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  14763622 aggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 14763717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005709
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5005927  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 408  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| |||||    
T  5005926 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 5005827  T
Q  409 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 508  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||     
T  5005826 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 5005727  T
Q  509 agctgagcagcattgatg 526  Q
    |  ||||| |||||||||    
T  5005726 atttgagctgcattgatg 5005709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 36344732  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || ||    
T  36344733 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagg 36344832  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  36344833 aacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 36344925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 525
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189388
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  34189209 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 34189308  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  34189309 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569738
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 6569907  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| | |||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| ||||||||    
T  6569906 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaac 6569807  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6569806 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 6569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112506
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  346 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 445  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  24112684 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 24112585  T
Q  446 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 524  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  24112584 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163749
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27163534  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  27163535 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 27163634  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  27163635 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 27163734  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  27163735 tgagctgcattgatg 27163749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098381
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 14098595  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  14098594 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 14098495  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  14098494 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 14098395  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  14098394 tgagctgcattgat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126949
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 31126735  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  31126736 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 31126835  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  31126836 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 31126935  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  31126936 tgagctgcattgat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833230
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 54833441  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacggg 414  Q
    | | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || |||||||||||||| || ||    
T  54833440 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacagg 54833341  T
Q  415 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctga 514  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  |||    
T  54833340 aacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttga 54833241  T
Q  515 gcagcattgat 525  Q
    || ||||||||    
T  54833240 gctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18801053
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 18800830  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----------ct--tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaat 402  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||||          ||  || ||||| ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |||||    
T  18800831 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaat 18800930  T
Q  403 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgac 502  Q
     ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||    
T  18800931 tgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgac 18801030  T
Q  503 ggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  18801031 ggaggcatttgagctgcattgat 18801053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40106069
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  |||||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcat 40105855  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   ||| |||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  40105856 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgac 40105955  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  40105956 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 40106055  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  40106056 tgagctgcattgat 40106069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33674046
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 33674015  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    | | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  33674016 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969586
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 21969755  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  21969754 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgac 21969655  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21969654 gggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgaga 21969586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753837
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 30753837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850661
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39850692  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39850691 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  424 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 523  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  524 at 525  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30753709 - 30753582
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  30753709 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 30753610  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  30753609 atgacggaggcatttgagctgcattgat 30753582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Original strand, 33674114 - 33674199
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33674114 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagta 33674199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 39850590 - 39850505
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 483  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39850590 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 39850505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20240
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 20425  T
Q  317 agcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggta 416  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  20424 aacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgct---------------------gttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 20346  T
Q  417 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  20345 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggc 20246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30296
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30491  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  30490 acaacattggtataggaggaaa-gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 30392  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  30391 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 50 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21391
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 21565  T
Q  350 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 449  Q
    ||||| ||||   | |||| |||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |    
T  21564 tgttgttgct---gctgttaagccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggt 21468  T
Q  450 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 526  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21467 gatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 70 - 381
Target Start/End: Original strand, 1 - 312
Alignment:
Q  70 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  170 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  270 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 300  T
Q  370 agctggaggctg 381  Q
    |||||| |||||    
T  301 agctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2103
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6047
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 220  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  221 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagt-agagtcgggagcaactcagcatata 317  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaagcaactcagcatata 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 5936 - 5859
Alignment:
Q  404 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgat-agaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5936 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 5859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40482
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 40286  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||    
T  40287 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttac 40386  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  40387 gggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggagg 40482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29606
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 29802  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  29801 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaac 29702  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  29701 gggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggagg 29606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47371
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 47202  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||    
T  47203 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaac 47302  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47303 gggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27135
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 27330  T
Q  316 tagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacg 412  Q
    || ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||    
T  27329 taacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 27230  T
Q  413 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 507  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27229 ggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 47 - 561
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact-cagca 313  Q
    || || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||  ||||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagca 346  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaa 410  Q
    |||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||    
T  347 tataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaa 446  T
Q  411 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtag 510  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |     
T  447 cgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcat 546  T
Q  511 ctgagcagcattgat 525  Q
     ||||| ||||||||    
T  547 ttgagctgcattgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7670
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7456  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  7457 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 7556  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  7557 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 7656  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  7657 tgagctgcattgat 7670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9497
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9283  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  9284 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 9383  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  9384 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 9483  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  9484 tgagctgcattgat 9497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 19840
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20054  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  20053 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 19954  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  19953 gggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 19854  T
Q  512 tgagcagcattgat 525  Q
    ||||| ||||||||    
T  19853 tgagctgcattgat 19840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 207  Q
     ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15362
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 15147  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaac 411  Q
    | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||    
T  15148 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgac 15247  T
Q  412 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagc 511  Q
    ||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |      
T  15248 gggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatt 15347  T
Q  512 tgagcagcattgatg 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  15348 tgagctgcattgatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 9605  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 360  Q
    | | ||| |||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  9604 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctg 9559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 8057
Alignment:
Q  395 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 494  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |    
T  8187 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 8088  T
Q  495 ggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    |||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8087 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 525
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26633
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  215 aggtcagaatggaacctg-ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagca 313  Q
    || |||||   ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgca 26418  T
Q  314 tatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaa 410  Q
    || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |    
T  26419 tacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattga 26518  T
Q  411 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtag 510  Q
    |||| || ||||| || ||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |     
T  26519 cgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 26618  T
Q  511 ctgagcagcattgat 525  Q
     ||||| ||||||||    
T  26619 ttgagctgcattgat 26633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 7966
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 7988  T
Q  315 atagcattggtatcagaggaaa 336  Q
    | | |||||||||  |||||||    
T  7987 acaacattggtataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7889 - 7762
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 497  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||    
T  7889 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 7790  T
Q  498 acgacggaggtagctgagcagcattgat 525  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  7789 atgacggaggcatttgagctgcattgat 7762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 267
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46981
Alignment:
Q  59 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtactt 156  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || |||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatactt 46863  T
Q  157 caaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtg 251  Q
    |||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  46864 caaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtg 46963  T
Q  252 gaggc--ttgccctgtct 267  Q
    | |||  |||||||||||    
T  46964 ggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 37 - 119
Alignment:
Q  398 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 480  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University