View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7863_low_56 (Length: 374)

Name: NF7863_low_56
Description: NF7863
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7863_low_56
NF7863_low_56
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-374)||(9340-9704)
scaffold0162 (23-116)||(17788-17884)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (11-374)||(12365-12729)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (11-374)||(2030385-2030759)
chr5 (12-374)||(25003433-25003795)
chr5 (24-331)||(23985670-23985992)
chr5 (23-280)||(7527684-7527955)
chr5 (23-255)||(17908244-17908489)
chr5 (165-374)||(34938160-34938369)
chr5 (75-239)||(34937981-34938146)
chr5 (23-279)||(32949674-32949926)
chr5 (147-229)||(14343351-14343430)
chr5 (23-321)||(23235809-23236106)
chr5 (165-229)||(16836869-16836934)
chr5 (174-229)||(11764913-11764969)
chr5 (186-229)||(18225565-18225608)
chr5 (174-229)||(14343258-14343313)
chr5 (174-321)||(16836681-16836829)
chr5 (181-225)||(19872557-19872601)
chr5 (316-374)||(29191430-29191487)
chr5 (316-374)||(23112314-23112371)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (11-326)||(51962520-51962834)
chr3 (12-374)||(18738342-18738720)
chr3 (25-281)||(12903201-12903471)
chr3 (165-374)||(54039830-54040039)
chr3 (75-239)||(54040053-54040218)
chr3 (75-239)||(54049340-54049505)
chr3 (165-324)||(54049166-54049326)
chr3 (23-281)||(11987510-11987763)
chr3 (23-141)||(9304221-9304342)
chr3 (23-281)||(11480423-11480677)
chr3 (142-281)||(17936911-17937051)
chr3 (182-251)||(9304100-9304169)
chr3 (23-281)||(38166614-38166867)
chr3 (23-116)||(14283873-14283969)
chr3 (165-251)||(31413690-31413777)
chr3 (175-229)||(31413802-31413856)
chr3 (23-116)||(23887688-23887784)
chr3 (165-229)||(11637120-11637184)
chr3 (186-281)||(14284019-14284115)
chr3 (23-111)||(17936810-17936901)
chr3 (165-229)||(8603306-8603370)
chr3 (181-225)||(10903073-10903117)
chr3 (176-232)||(11516929-11516984)
chr3 (316-374)||(18892814-18892871)
chr3 (328-374)||(9303682-9303729)
chr3 (316-374)||(18889587-18889644)
chr3 (316-374)||(23174534-23174591)
chr3 (23-67)||(11636980-11637024)
chr3 (343-371)||(17937078-17937106)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-374)||(167479-167841)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (11-374)||(7277-7638)
scaffold0686 (11-165)||(4-158)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (11-374)||(27739568-27739930)
chr6 (23-366)||(14151045-14151387)
chr6 (165-374)||(35010560-35010769)
chr6 (75-239)||(19627860-19628025)
chr6 (23-255)||(16301460-16301701)
chr6 (95-243)||(35010779-35010928)
chr6 (23-255)||(29664782-29665009)
chr6 (165-281)||(19628039-19628156)
chr6 (23-255)||(32277989-32278215)
chr6 (174-229)||(940649-940704)
chr6 (174-229)||(17084665-17084720)
chr6 (174-229)||(17084843-17084898)
chr6 (165-321)||(19671184-19671341)
chr6 (176-229)||(22594984-22595037)
chr6 (177-229)||(19671107-19671159)
chr6 (165-229)||(22594895-22594959)
chr6 (174-251)||(31468921-31468999)
chr6 (316-374)||(221983-222040)
chr6 (165-251)||(940537-940624)
chr6 (328-374)||(1554886-1554933)
chr6 (174-229)||(31469033-31469088)
chr6 (316-374)||(14627296-14627353)
chr6 (175-226)||(17084757-17084808)
chr6 (26-67)||(26523749-26523790)
chr6 (23-67)||(19670955-19670999)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (23-374)||(47482185-47482550)
chr7 (165-374)||(14252582-14252795)
chr7 (165-369)||(7285717-7285922)
chr7 (75-239)||(14252809-14252974)
chr7 (15-239)||(7285936-7286168)
chr7 (23-263)||(48623739-48623992)
chr7 (11-126)||(25122783-25122898)
chr7 (23-281)||(3048295-3048548)
chr7 (23-281)||(13319863-13320117)
chr7 (174-229)||(39293233-39293288)
chr7 (174-229)||(44306674-44306729)
chr7 (174-229)||(44306763-44306818)
chr7 (23-321)||(9641518-9641816)
chr7 (23-229)||(28388911-28389115)
chr7 (174-229)||(14276482-14276538)
chr7 (165-229)||(39293144-39293208)
chr7 (165-251)||(18081088-18081175)
chr7 (174-220)||(12246616-12246662)
chr7 (165-321)||(14276300-14276457)
chr7 (174-229)||(3136112-3136167)
chr7 (328-374)||(15761442-15761489)
chr7 (174-229)||(44306585-44306640)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (22-281)||(28032441-28032703)
chr2 (11-337)||(32464441-32464773)
chr2 (23-281)||(17203112-17203384)
chr2 (165-374)||(42179646-42179863)
chr2 (25-239)||(22254870-22255099)
chr2 (75-239)||(42179877-42180040)
chr2 (90-239)||(7513522-7513672)
chr2 (174-281)||(7513391-7513499)
chr2 (165-280)||(22255113-22255230)
chr2 (25-251)||(23779298-23779519)
chr2 (182-255)||(25266602-25266675)
chr2 (23-229)||(16294238-16294442)
chr2 (176-229)||(22331293-22331346)
chr2 (174-229)||(22331469-22331524)
chr2 (165-229)||(22331371-22331435)
chr2 (181-225)||(25593791-25593835)
chr2 (23-68)||(25254868-25254913)
chr2 (165-229)||(16294149-16294213)
chr2 (187-239)||(28773364-28773413)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (23-374)||(1719-2086)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (11-239)||(41508567-41508796)
chr8 (23-239)||(18617531-18617749)
chr8 (75-239)||(18610790-18610955)
chr8 (165-322)||(41508395-41508553)
chr8 (23-281)||(21495652-21495905)
chr8 (165-281)||(18610969-18611086)
chr8 (165-281)||(18617763-18617880)
chr8 (149-281)||(16040978-16041111)
chr8 (149-281)||(16042654-16042787)
chr8 (23-281)||(22885027-22885282)
chr8 (23-321)||(20708264-20708561)
chr8 (174-229)||(17500643-17500698)
chr8 (174-229)||(20177435-20177490)
chr8 (174-229)||(20177524-20177579)
chr8 (174-229)||(20222162-20222217)
chr8 (174-229)||(20222251-20222306)
chr8 (23-229)||(16000632-16000837)
chr8 (174-229)||(18262908-18262963)
chr8 (165-228)||(45468760-45468823)
chr8 (328-374)||(18618189-18618236)
chr8 (328-374)||(41508305-41508352)
chr8 (165-229)||(17500723-17500787)
chr8 (174-229)||(20177346-20177401)
chr8 (174-229)||(20222073-20222128)
chr8 (165-251)||(45468649-45468736)
chr8 (343-371)||(16040865-16040893)
chr8 (343-371)||(16042541-16042569)
chr8 (23-67)||(45476044-45476088)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (26-281)||(165794-166063)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (75-281)||(20252728-20252935)
chr1 (174-229)||(18164796-18164851)
chr1 (181-232)||(20192827-20192878)
chr1 (181-225)||(25093479-25093523)
chr1 (316-374)||(32650474-32650531)
chr1 (174-251)||(18164885-18164963)
chr1 (321-374)||(20253288-20253342)
chr1 (180-224)||(18623365-18623407)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (165-374)||(23577-23786)
scaffold0158 (75-239)||(23398-23563)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (23-243)||(9516-9739)
scaffold0335 (165-229)||(9442-9506)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (15-239)||(55378242-55378474)
chr4 (75-239)||(19699079-19699244)
chr4 (75-239)||(19709664-19709829)
chr4 (150-284)||(22737260-22737393)
chr4 (165-337)||(55378056-55378228)
chr4 (153-281)||(23271500-23271628)
chr4 (23-109)||(22737065-22737152)
chr4 (23-255)||(32461904-32462130)
chr4 (165-281)||(19698948-19699065)
chr4 (165-281)||(19709533-19709650)
chr4 (23-239)||(9793891-9794102)
chr4 (298-374)||(8043928-8044005)
chr4 (142-255)||(14502967-14503080)
chr4 (23-242)||(8043584-8043803)
chr4 (23-116)||(23271677-23271773)
chr4 (165-229)||(14570026-14570090)
chr4 (165-229)||(7966094-7966158)
chr4 (165-229)||(40902210-40902274)
chr4 (174-229)||(41918276-41918331)
chr4 (23-321)||(13595429-13595727)
chr4 (23-229)||(13448534-13448738)
chr4 (165-229)||(41918187-41918251)
chr4 (174-225)||(12336020-12336071)
chr4 (180-225)||(12346693-12346738)
chr4 (72-227)||(7848885-7849036)
chr4 (174-229)||(19623520-19623574)
chr4 (174-321)||(40902028-40902176)
chr4 (165-321)||(13448352-13448509)
chr4 (174-229)||(19082441-19082497)
chr4 (31-116)||(14503085-14503174)
chr4 (321-374)||(19019432-19019486)
chr4 (342-374)||(23271442-23271474)
chr4 (321-374)||(8373473-8373527)
chr4 (328-372)||(55377982-55378027)
chr4 (343-371)||(9794186-9794214)
chr4 (343-371)||(14502885-14502913)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (75-239)||(27851-28016)
scaffold0138 (75-239)||(39847-40012)
scaffold0138 (203-374)||(28072-28245)
scaffold0138 (203-374)||(40068-40241)
scaffold0138 (75-209)||(26836-26970)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (23-248)||(42325-42563)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (25-277)||(7421-7687)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (78-262)||(2426-2610)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (23-281)||(52827-53080)
scaffold0066 (23-281)||(44631-44884)
scaffold0066 (328-373)||(53330-53376)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-321)||(98386-98686)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (23-281)||(57872-58126)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (23-255)||(2042-2267)
[»] scaffold1486 (2 HSPs)
scaffold1486 (143-255)||(1616-1728)
scaffold1486 (23-92)||(1502-1573)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (150-281)||(35177-35309)
scaffold0012 (316-374)||(223337-223394)
scaffold0012 (35-104)||(35336-35408)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (23-255)||(16514-16728)
scaffold0207 (343-371)||(16782-16810)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (23-141)||(30040-30161)
scaffold0125 (298-374)||(34241-34318)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (147-280)||(35591-35725)
scaffold0118 (70-116)||(35748-35795)
[»] scaffold0244 (4 HSPs)
scaffold0244 (298-374)||(24232-24309)
scaffold0244 (182-251)||(24434-24503)
scaffold0244 (316-373)||(17814-17872)
scaffold0244 (343-371)||(24302-24330)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (23-239)||(14832-15043)
scaffold0032 (343-371)||(14720-14748)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (23-321)||(4166-4464)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (75-251)||(140-326)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (165-229)||(247286-247350)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (174-229)||(20742-20797)
scaffold0165 (174-229)||(28726-28781)
scaffold0165 (165-321)||(28806-28963)
scaffold0165 (174-251)||(20831-20909)
scaffold0165 (13-67)||(28567-28621)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (174-229)||(2632-2687)
scaffold0409 (174-229)||(10887-10942)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (174-229)||(36518-36573)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (31-229)||(104429-104624)
[»] scaffold1666 (2 HSPs)
scaffold1666 (142-251)||(945-1054)
scaffold1666 (23-89)||(1100-1168)
[»] scaffold0173 (2 HSPs)
scaffold0173 (153-281)||(4149-4278)
scaffold0173 (22-104)||(4009-4094)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (165-229)||(1200-1264)
[»] scaffold1068 (2 HSPs)
scaffold1068 (174-229)||(1869-1924)
scaffold1068 (165-229)||(1949-2013)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (181-229)||(3203-3251)
scaffold0133 (174-251)||(3091-3169)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (174-229)||(10230-10285)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (23-219)||(67085-67278)
[»] scaffold0329 (1 HSPs)
scaffold0329 (186-226)||(1809-1849)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (174-229)||(36283-36339)
scaffold0090 (174-229)||(36190-36245)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (26-67)||(8740-8781)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (316-368)||(1382-1433)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (341-371)||(2618-2648)


Alignment Details
Target: scaffold0162 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9704 - 9340
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9704 acatcaactacattcacaactaggactcatgccataacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccg 9605  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9604 tcgcccctgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatctatcatgtatgcatgaacatacgactcaacaac 9505  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9504 aatgcatatgttcacacaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcataaatggagtcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 9405  T
Q  311 caacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404 caacaattcacaacatcatatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 9340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Original strand, 17788 - 17884
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  17788 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc 17884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 12365 - 12729
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  12365 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttagaaag 12464  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465 tcgcccatgatgccgaaaaaacatcataatctcaccatttagatatataaaaataaacatctacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 12564  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12565 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 12664  T
Q  311 caacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12665 caacaattcacaacatcatatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 12729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 2030385 - 2030759
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2030385 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccatgtatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccg 2030484  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030485 tcgcccctgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatttgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 2030584  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2030585 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactaac 2030684  T
Q  311 caacaattcacaacatc----------atatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||| |||          |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030685 caacaattcacaatatcatatatatatatatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 2030759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 25003433 - 25003795
Alignment:
Q  12 catcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |    
T  25003433 catcaactacattcacaactaagactcattccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgtggtaccggtctcaccaatatttaggttg 25003532  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25003533 tcgcctgtgatgccaacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatatgtctccatcattcgtgtatgcatgaacatatgactcaacaac 25003632  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25003633 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcatatatgcattcacaccaatttatcatttctcgacatatatgcactcac 25003732  T
Q  311 caacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25003733 caacaattcacaacaacata--tatattcacccaccatatcataacaaacaatgtatatggattc 25003795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23985992 - 23985670
Alignment:
Q  24 tcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  23985992 tcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgtcgtccatgatg 23985893  T
Q  123 ccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 209  Q
    || || ||||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23985892 ccaattgaacaccataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 23985793  T
Q  210 caatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaac-tc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  23985792 caatgcatatgttcacacaacaactcaccaaattctcaccattattatttgcataaatgcactcacaccaattcatcatttctctacacatatgcacatc 23985693  T
Q  309 accaacaattcacaacatcatat 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  23985692 accaacaattcacaacaacatat 23985670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Original strand, 7527684 - 7527955
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7527684 ttcacaacaaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccgtcgcccatgat 7527783  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7527784 gccgacagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaata 7527883  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaa 280  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  7527884 ataatgcatatatccacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgcatttatgcaatcacaccaa 7527955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Original strand, 17908244 - 17908489
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17908244 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccgtcgcccatgat 17908343  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17908344 gccgacagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaa-tatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 17908442  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17908443 acaatgcatatgttcacacaacaactcacaaaattctcaccaatatt 17908489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Original strand, 34938160 - 34938369
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34938160 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 34938259  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaat 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34938260 aaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatatatgcactcaccaacaattcacaacaacata--tatattcacccaccatatcataataaacaat 34938357  T
Q  363 gtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||    
T  34938358 gtatatggattc 34938369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 34937981 - 34938146
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34937981 atgcatgcggtaccagtctcaccaatatttaggtcgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 34938080  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34938081 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 34938146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Original strand, 32949674 - 32949926
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |     
T  32949674 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccatcgcccatc 32949773  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtc-atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
    ||          || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32949774 at----------caccaaaatcatcaccaattgaatatataaaaatatccgtcatcaccaaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 32949863  T
Q  218 atgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacacca 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  32949864 atgtccacacaacaactcaccatatcttcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacacca 32949926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14343430 - 14343351
Alignment:
Q  147 atttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14343430 atttggatatataaaa---tccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaatgtatatgttcacacaa 14343351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23236106 - 23235809
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| | |  ||| ||||||||||||||| | | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  23236106 ttcacaattagaactcatgccacaacatggtaagttcctagacataacacctaaatgcatgcggtaccgttgtcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 23236007  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |  || ||||||||| ||     ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  23236006 atgccaacagaacaccataatcacctcaattggatataaaa-----tccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacagatgactcaataacaaatgcata 23235912  T
Q  219 tgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaa 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| | |  | ||||| | ||||||| || ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  23235911 tgttcacacaaacaattcaccacaatctcatcaacact--tagcatatacgcattcaccaacaattcaccattacttgacatatatacactcaccaacaa 23235814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16836934 - 16836869
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16836934 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaactaatgcatatgttcacacaa 16836869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11764969 - 11764913
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactc-aacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11764969 catcagtcatgaatgcatgaacatatgtctctaacaacaatgcatatgttcacacaa 11764913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18225608 - 18225565
Alignment:
Q  186 atgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225608 atgcatgaacatatggctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 18225565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14343313 - 14343258
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14343313 catcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaaatacaatgcatatgttcgcacaa 14343258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16836829 - 16836681
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcat 271  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||  |  |||| ||||| ||||||    
T  16836829 catcagtcatgtatgtatacacatatgtcacaacaacaatgtatatgttcacacaaccaattcaccgcaatctcacca--aacacttagcatatatgcat 16836732  T
Q  272 tca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    ||| ||  |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16836731 tcaccaataattcaccgttacttgacatatatgcactcaccaacaattcac 16836681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 19872557 - 19872601
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19872557 catgtatgcatgaaaatatgactctacaataatgcatatgttcac 19872601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29191487 - 29191430
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29191487 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatatatatggattc 29191430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23112371 - 23112314
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23112371 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtagatgtattc 23112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51962834 - 51962520
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  51962834 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttagcccg 51962735  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51962734 tcgcccttgatgccgacagaacatcataatctcaccatttagatatataaaaatatccatctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 51962635  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51962634 aatgcatatgttcacacaacaactcgccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactc-c 51962536  T
Q  311 caacaattcacaacat 326  Q
    |||||||||| |||||    
T  51962535 caacaattcataacat 51962520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 18738342 - 18738720
Alignment:
Q  12 catcaactacattcacaactaggactcatgccacaa-catgatatgatcctagacac-accctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggc 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  18738342 catcaaccacattcacaactaggactcatgccacaatcatgttatgatcctagacacgacactatatgcatgcggtactgatcatcaccaatatttaggc 18738441  T
Q  109 cgttgcccttgatgccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaac 195  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18738442 cgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaac 18738541  T
Q  196 atatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcga 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18738542 atatgactcaataacaatgcatatgttcatacaacaactcaccatatcatcaccactattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcga 18738641  T
Q  296 catatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18738642 catatatgcactcaccaacaactcacaacatcatatatatattcacccaccatattataat-aacaaagtatatggattc 18738720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12903471 - 12903201
Alignment:
Q  25 cacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatg 122  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  12903471 cacaactaggtctcatgccacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccatcgcccatgatg 12903372  T
Q  123 ccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 209  Q
    |||| ||||||||||||||             |||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903371 ccgacagaacatcataatcatcaccaaagtcatcaccacttggatatataaaa-tatctgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 12903273  T
Q  210 caatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  12903272 caatgcatatgttcacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgcattcatgcaatcacaccaat 12903201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54040039 - 54039830
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54040039 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 54039940  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattcac-caccatatcataataaacaat 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54039939 aaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatatatgcactcaccaacaattcacaacgacata--tatattcacacaccctatcataataaacaat 54039842  T
Q  363 gtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||    
T  54039841 gtatatggattc 54039830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54040218 - 54040053
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  54040218 atgcatgtggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatctgtctcc 54040119  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54040118 atcagtcatgtatgtatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 54040053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54049505 - 54049340
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  54049505 atgcatgtggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatctgtctcc 54049406  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54049405 atcagtcatgtatgtatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 54049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54049326 - 54049166
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54049326 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 54049227  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaac 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54049226 aaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatatatgcactcaccaacaattcacaac 54049166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11987763 - 11987510
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    |||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  11987763 ttcacaactaggactcaattcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 11987664  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11987663 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaaaatattcgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 11987574  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  11987573 tgtccacacaacaactcaccatatcatcaccattatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 11987510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9304342 - 9304221
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| ||    
T  9304342 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccgttcatcaccaatatttaggccgtcgcccatg 9304243  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  9304242 atgccgacagaacatcataatc 9304221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11480677 - 11480423
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgccctt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  11480677 ttcacaactaggactcatgtcaccttatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattttaggccgtcgcccat 11480578  T
Q  119 gatgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
     ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  || ||   ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11480577 cat----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatctgtcatcaccaaatatgcatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 11480488  T
Q  218 atgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  11480487 atgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 11480423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 281
Target Start/End: Original strand, 17936911 - 17937051
Alignment:
Q  142 tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccata 241  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17936911 tcaccaattggatatataaacatatccgccatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccata 17937010  T
Q  242 ttctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  17937011 tcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 17937051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9304169 - 9304100
Alignment:
Q  182 atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9304169 atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaa 9304100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 38166614 - 38166867
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  38166614 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacagcacctatatgcatgcggcaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 38166713  T
Q  120 atgccgatagaacatcataa-tctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          ||||| || | |||||| |||||| |||||| |||||||||  |  ||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  38166714 at----------catcaaaattatcaccaattggatgtataaacatatccgtcatcgccaaatatgtatgtatgaacatataactcaataataatacata 38166803  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  38166804 tgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 38166867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Original strand, 14283873 - 14283969
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  14283873 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc 14283969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31413777 - 31413690
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  31413777 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 31413690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31413856 - 31413802
Alignment:
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31413856 atcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 31413802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23887784 - 23887688
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  23887784 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcatagacacaacacctatatgtatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc 23887688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 11637120 - 11637184
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11637120 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatccatatgttcacacaa 11637184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 281
Target Start/End: Original strand, 14284019 - 14284115
Alignment:
Q  186 atgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  14284019 atgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtcgacacaagaactcaccatatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 14284115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 17936810 - 17936901
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  17936810 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggttccgttcatcaccaatatttaggccgt 17936901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 8603306 - 8603370
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8603306 atccgtcaccatcagtcatgaatgcataaacatatgtctcaacaataatgcatatgttcacacaa 8603370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 10903073 - 10903117
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10903073 catgtatgcatgaacatatgactcgacaataatgcatatgttcac 10903117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11516984 - 11516929
Alignment:
Q  176 tcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  11516984 tcagttatgtatgcatgaacatatgactcggc-acaatgcatatgttcacacaacaa 11516929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 18892814 - 18892871
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892814 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 18892871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9303729 - 9303682
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303729 atatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 9303682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 18889587 - 18889644
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18889587 attcacaacaacatat--atattcacccaccgtatcataataaacaatgtatatggattc 18889644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 23174534 - 23174591
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23174534 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaaagtatatggattc 23174591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 11636980 - 11637024
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11636980 ttcacaattaggactcatgccacaatatgatatgcccctagacac 11637024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Original strand, 17937078 - 17937106
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937078 accatatcataataaacaatgtatatgga 17937106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 167841 - 167479
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  167841 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttagttcg 167742  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167741 tctcccttgatgccgacagaacatcataatctcaccatttagatatttaaaaatatccatcttcatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 167642  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  167641 aatgcatatgttcacacaacaactcaccattttctcaccaatattgtttgcataaatgcattcatatcaattcatcatttctcgacatatatgaactc-c 167543  T
Q  311 caacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  167542 caacaattcataacat-atgtatatattcacccaccttatcataataaacaatgtatatggattc 167479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7638 - 7277
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7638 acatcaactacattcacaactaggactcatgccattacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggtcg 7539  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7538 tcgcccttgatgccgacagaacatcataatctcaccatttagatatttaaaaatacccatctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 7439  T
Q  211 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7438 aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattgtttgcataaatgcattcacatcaattcatcatttctcgacatacatgaactc-c 7340  T
Q  311 caacaattcacaacatcatatttatattcaccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7339 caacaattcataacat-atgtatatattcacccacttatcataataaacaatgtatatggattc 7277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 4
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  158 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccatgtatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggtcg 59  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaata 165  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  58 tcgcccttgatgccgacagaacatcataatctcaccatttagatatttaaaaata 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 27739568 - 27739930
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaa-catgatatgatcctagacac-accctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttagg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  27739568 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaatcatgatatgatcctagacacgacactataggcatgcgatatcggtcatcaccaatatttagg 27739667  T
Q  108 ccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaa--atatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactca 205  Q
    |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739668 ccgtcgcccatgatgccaacagaacatcataatctcaccatttagatatataaaaaaatatccgtctccaccagtcatgtatgcatgaacatatgactca 27739767  T
Q  206 acaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaa 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27739768 ataacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatatcctcaccaatattacttgcatatatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgca 27739867  T
Q  306 ctcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
         ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27739868 -----caacaattcacaacatcata--tatattcacccaccatattataataaacaatgtatatggattc 27739930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Original strand, 14151045 - 14151387
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||    
T  14151045 ttcacaactagcactcatgccacaacatgatatgatcctagacacgacacctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggtcgtcgcccatga 14151144  T
Q  121 tgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatg 220  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14151145 tgccgacaaaacatcaaaatcccaccatttggatataaaaa----tccgtctccactagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatg 14151240  T
Q  221 ttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatca-tttctcgacatatatgaactcaccaacaatt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  14151241 ttcacacaaacaactcaccatattctcaccaaaattacttgtgtatatgcattcacaccaattcattattttctcgacatgtatgcacccaccaacaatt 14151340  T
Q  319 cacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtat 366  Q
    | ||||| ||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14151341 ctcaacaacata--tatattcaccaatcatatcatcataaacaatgtat 14151387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35010769 - 35010560
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35010769 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 35010670  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattcac-caccatatcataataaacaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35010669 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgtactcaccaacaattcacaaca--agatatatattcactcaccatatcataataaacaat 35010572  T
Q  363 gtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||    
T  35010571 gtatatggattc 35010560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 19627860 - 19628025
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19627860 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 19627959  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19627960 atcagtcatatatgcatgaacatatgacttaacaacaatacatatgttcacacaaacaactcacca 19628025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16301701 - 16301460
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-accctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16301701 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggta-ctatctcaccaatatttaggccgtcgcccatgat 16301603  T
Q  122 gccgatagaacatcataat------------ctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 209  Q
    ||||| |||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16301602 gccgacagaacatcataatatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatcagtcatatatgcatgaatatatgactcaacaa 16301503  T
Q  210 caatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16301502 c---gcatatgttcacataacaactcaccaaattctcacaaatatt 16301460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35010928 - 35010779
Alignment:
Q  95 accaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaa 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35010928 accaatatttaggccgtcgcccatgatgtcgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatctgtctccatcagtcatgtatgcatgaa 35010829  T
Q  195 catatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatatt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35010828 catatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcaccatatt 35010779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Original strand, 29664782 - 29665009
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  29664782 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacgacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 29664881  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatt-tggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
    ||          || || |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29664882 at----------caccaaaatcatcaccaatatggatacataaaaatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 29664971  T
Q  218 atgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  29664972 atgtccacacaacaactctccatatcatcaccaatatt 29665009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 19628039 - 19628156
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628039 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 19628138  T
Q  264 aaatgcattcacaccaat 281  Q
      ||||| ||||||||||    
T  19628139 ttatgcaatcacaccaat 19628156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32278215 - 32277989
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  32278215 ttcacaactaggactcatgtcacctcaaaatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 32278116  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    ||  | |    | |||||     ||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32278115 atcacca----atatcat-----caccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatat 32278025  T
Q  220 gttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    || |||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  32278024 gtccacacaaccactcaccaaatcatcaccaatatt 32277989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 940704 - 940649
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  940704 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 940649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17084720 - 17084665
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17084720 catcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 17084665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17084898 - 17084843
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17084898 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 17084843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Original strand, 19671184 - 19671341
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gca 262  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| |||    
T  19671184 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagca 19671281  T
Q  263 taaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    || ||||||||| || |||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  19671282 tatatgcattcaccaacaattcatcatcacatgtcatatatgcactcaccaacaattcac 19671341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22595037 - 22594984
Alignment:
Q  176 tcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22595037 tcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgtttacacaa 22594984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 19671107 - 19671159
Alignment:
Q  177 cagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19671107 cagtcatgaatgcatgaacatataactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 19671159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22594959 - 22594895
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22594959 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatttgtctcaacaacattgcatatgttcacacaa 22594895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31468999 - 31468921
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  31468999 catcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 31468921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 221983 - 222040
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221983 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 940624 - 940537
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  940624 atccgtcatcatcagtcatgtatgtataaacatatatctcatcaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 940537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Original strand, 1554886 - 1554933
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554886 atatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 1554933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31469088 - 31469033
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  31469088 catcaatcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgtctatgttcacacaa 31469033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14627353 - 14627296
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14627353 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatatatatggattc 14627296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17084808 - 17084757
Alignment:
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcaca 226  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  17084808 atcattcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcaca 17084757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26523790 - 26523749
Alignment:
Q  26 acaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26523790 acaactaggactcatgccacaacatactatgttcctagacac 26523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 19670955 - 19670999
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  19670955 ttcacaattaggactcatgccacaatatgatatgtccctagacac 19670999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47482550 - 47482185
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||| ||||    
T  47482550 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatacatgcggtaccgatctcaccaatatttaggttgtcgcccatgat 47482451  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||||||||||||||||||             |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47482450 gccgatagaacatcataatcatcaccaaaatcatcacaatttggatatataaaa-tatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaata 47482352  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactc 308  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||    
T  47482351 ataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgcatttatgcaatcacaccaataattcatttcgcgacttatatgcactc 47482252  T
Q  309 accaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47482251 accaacaattcacaacaacatatatatattcacccaccatatcataataaacaatatatatggattc 47482185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14252795 - 14252582
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  ||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14252795 atccgtcaccatcagttatgtataaataaacatatatctcaacaacgatacatatgttcatacaaacaactcaccatattctcatcaatattacttgcat 14252696  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatc--atatttatattca-ccaccatatcataataaaca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14252695 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatatatatattcacccaccatatcataataaaca 14252596  T
Q  361 atgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||    
T  14252595 atgtatatggattc 14252582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7285922 - 7285717
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcata 264  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| || |   || | ||||||||||||||||||||||    
T  7285922 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaaaaattcacacaatctcaccaatattacttgcata 7285823  T
Q  265 aatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatg 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7285822 aatgcatccacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatatatattcacccaccatatcataataaacaatg 7285723  T
Q  364 tatatg 369  Q
    ||||||    
T  7285722 tatatg 7285717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14252974 - 14252809
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14252974 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggtcgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 14252875  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14252874 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 14252809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7286168 - 7285936
Alignment:
Q  15 caactacattcacaactaggactcatgccacaa-catgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgtt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||     
T  7286168 caaccacattcacaactaggactcatgccacaatcatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtatcggtcacaccaatatt-aggccgtc 7286070  T
Q  113 gcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccat--------ttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactc 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7286069 gccct-gatgccgatagaacatcataatcacaccatcacaccatttggatatataaaaatatctgtcgccatcagtcatgtatgcatgaacatatgaatc 7285971  T
Q  205 aacaacaatgcatatgttcacacaacaactcacca 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285970 aacaataatgcatatgttcacacaacaactcacca 7285936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48623992 - 48623739
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca-ccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||| |||| ||||    
T  48623992 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacatatctctatatgcatgcggtaccattctcactaataattaggccgtcgcccatgat 48623893  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||||||||||||||||||             ||||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48623892 gccgatagaacatcataatcatcaccaaaatcatcaccatttagatatgt-aaaatatccatctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaata 48623794  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48623793 ataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgcat 48623739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 25122783 - 25122898
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25122783 acatcaactacattcacaactacgactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccg 25122882  T
Q  111 ttgcccttgatgccga 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  25122883 tcgcccttgatgccga 25122898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 3048295 - 3048548
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  3048295 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtacatgtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 3048394  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3048395 at----------caccaaaatcatcatcaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgtatgaacatatgactcaataataatgcata 3048484  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  3048485 tgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 3048548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 13319863 - 13320117
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatat--gcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||  ||| |     
T  13319863 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacatatatatgcatgtggtaccgatcatcaccaatatttaggctgtcacccatc 13319962  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtc-atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
    ||          || || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13319963 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaaaatatccgtcatcaccaaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 13320052  T
Q  218 atgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  13320053 atgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 13320117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39293288 - 39293233
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39293288 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 39293233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44306729 - 44306674
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44306729 catcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 44306674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44306818 - 44306763
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44306818 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 44306763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Original strand, 9641518 - 9641816
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||   | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  9641518 ttcacaattaggactcatgccacaacatggtatgtccctagacacgacacctaaatgcatgcggtaccgtcatcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 9641617  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    | ||| | | |||||||||||| |  || ||||||||| ||     | ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9641618 aggccaacataacatcataatcacctcaattggatataaaa-----ttcgtcatcatcagtcatgaatgcttgaacatatgactcaacaacaaatgcata 9641712  T
Q  219 tgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcattcac-accaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaaca 315  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||||||||  |  ||||  |||| |||||||||| | ||||||| | || || |||||||||| |||||||||||    
T  9641713 tgtttacacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttaacatatatgcattcacaaacaattcaccgttacttgacatatatgcactcaccaaca 9641810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 28388911 - 28389115
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-accc-tatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| || | || |||||||||||||||   | |||||  | |||||||| ||||  ||    
T  28388911 ttcacaattaggactcatgccataatatgatatgcccatagacacgacacataaatgcatgcggtaccgtcgtcaccaacgtctaggccgtcgccccatg 28389010  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |  || ||||||||| ||     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28389011 atgccaacagaacaccataatcacctcaattggatataaaa-----tccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatccatat 28389105  T
Q  220 gttcacacaa 229  Q
    ||||||||||    
T  28389106 gttcacacaa 28389115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14276538 - 14276482
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14276538 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaaatgcatatgttcacacaa 14276482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39293208 - 39293144
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39293208 atccgtcatcatcagtcgtgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 39293144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18081175 - 18081088
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||||    
T  18081175 atccgtcaccatcagtcatgaatccatgaacatatgactcaacaacaaatgcatatgttcacacaaacattcaccacaatctcaccaa 18081088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Original strand, 12246616 - 12246662
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12246616 catcattcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatg 12246662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14276457 - 14276300
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttca-cacaacaactcaccatattctcaccaatattactt-gca 262  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| |||    
T  14276457 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatccaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagca 14276360  T
Q  263 taaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    || ||||||||| || ||||||| |  | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14276359 tatatgcattcaccaacaattcaccgctacttgacatatatgaattcaccaacaattcac 14276300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 3136112 - 3136167
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3136112 catcagtcatgattgtatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttgacacaa 3136167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15761489 - 15761442
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761489 atatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 15761442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44306640 - 44306585
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44306640 catcagtcatgtatgcacaaacttatgtctcagcaacaacgcatatgttcacacaa 44306585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28032703 - 28032441
Alignment:
Q  22 attcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  28032703 attcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccgtcgcccatga 28032604  T
Q  121 tgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032603 tgccgacaaaacatcataatcatcaccatttggatatataaaaatatccgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 28032504  T
Q  220 gttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  28032503 gttcacacaacaactcaccatatcatcaccaatatttatttgcatttatgcattcacaccaat 28032441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Original strand, 32464441 - 32464773
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggcc 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||      
T  32464441 acatcaaatacattcacaactaggactcatgtcacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgtggtaccagtcacaccaatatt-aggtt 32464539  T
Q  110 gttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccat--------ttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatga 201  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32464540 gtcgccct-gatgccgacagaacatcataatcacaccatcacaccatttggatatataaaa-tatctgtcaccatcagtcatgtatgcatgaacatatga 32464637  T
Q  202 ctcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatata 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32464638 ctcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccaaattcacaccaatattacttgcataaatgcatgcacaccaattcgtcatttctcgacatata 32464737  T
Q  302 tgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatat 337  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  32464738 tgatcttaccgacaattcacaacatcacatatatat 32464773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 17203112 - 17203384
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  17203112 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctaaacacaactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatattcaggtcgtcgcccatgat 17203211  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||| ||||||||||||||             ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17203212 gccgacagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttagatatataaaaatatccgtctccatcactcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 17203311  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  17203312 acaatgcatatgttcacacaacaattcaccaaattctcaccaatattatttgcatttatgcaatcacaccaat 17203384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42179863 - 42179646
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42179863 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatccaaacaactcaccatattctcactaatattacttgcat 42179764  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatc------atatttatattca-ccaccatatcataata 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42179763 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatatatatatatattcacccaccatatcataata 42179664  T
Q  357 aacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42179663 aacaatgtatatggattc 42179646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 22254870 - 22255099
Alignment:
Q  25 cacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22254870 cacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgc 22254969  T
Q  124 cgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    ||| ||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22254970 cgacagaacatcataatcatcactaatatcatcaccatttggatatataaaaatatttgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 22255069  T
Q  211 aatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22255070 aattcatatgttcacacaaacaactcacca 22255099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42180040 - 42179877
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |    
T  42180040 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggtcgtcacccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatata--aaaatatctgtctcc 42179943  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42179942 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 42179877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7513672 - 7513522
Alignment:
Q  90 gtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgc 189  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  7513672 gtctcaccaatatttaggctgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatttgtctccatcagtcatgtatgc 7513573  T
Q  190 atgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7513572 atgaacatatgactcaacaacaatacatatgttcacacaaacaactcacca 7513522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7513499 - 7513391
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcatt 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  7513499 catcagtcatgtatgcataaacatatttctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaatttaccatattctcaccaatattacttgcatttatgcaat 7513400  T
Q  273 cacaccaat 281  Q
    |||||||||    
T  7513399 cacaccaat 7513391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 280
Target Start/End: Original strand, 22255113 - 22255230
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa-tattacttgca 262  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22255113 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaattattacttgca 22255212  T
Q  263 taaatgcattcacaccaa 280  Q
    |  ||||| |||||||||    
T  22255213 tttatgcaatcacaccaa 22255230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23779519 - 23779298
Alignment:
Q  25 cacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||| | |    
T  23779519 cacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacaactatatgcatgcggtaccgttcatcaccaatattttaggccgtcgcccatca 23779420  T
Q  121 tgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    |          || || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23779419 t----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaatattaatgcatat 23779330  T
Q  220 gttcacacaacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    || ||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  23779329 gtccacacaaaaactcatcatatcatcaccaa 23779298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25266675 - 25266602
Alignment:
Q  182 atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25266675 atgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaatatt 25266602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16294442 - 16294238
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-accc-tatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||||   | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  16294442 ttcacaattaggactcatgccacaatatgatatgcccctagacacgacacataaatgcatgcggtaccgtcgtcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 16294343  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |  || |||||||||     | ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16294342 atgccaacagaacaccataatcacctcaattggatata-----acatctgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatat 16294248  T
Q  220 gttcacacaa 229  Q
    ||||||||||    
T  16294247 gttcacacaa 16294238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 229
Target Start/End: Original strand, 22331293 - 22331346
Alignment:
Q  176 tcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22331293 tcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 22331346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 22331469 - 22331524
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22331469 catcagtcatgtatgcataaacatatggctcaacaacaatgcatatgtttacacaa 22331524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 22331371 - 22331435
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22331371 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatgtatatgttcacacaa 22331435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 25593791 - 25593835
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25593791 catgtatgcatgaacatatgactcgacaataatgcatatgttcac 25593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25254913 - 25254868
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  25254913 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacaca 25254868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16294213 - 16294149
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16294213 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaataatacatatgttcacacaa 16294149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 239
Target Start/End: Original strand, 28773364 - 28773413
Alignment:
Q  187 tgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28773364 tgcatgaacatatgac---acaacaatgcatatgttcatacaacaaatcacca 28773413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 374
Target Start/End: Original strand, 1719 - 2086
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| ||||    
T  1719 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacataactctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggctttcgcccatgat 1818  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    ||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1819 gccgatagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaa-tattcgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaata 1917  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactc 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| |||     
T  1918 ataatgcatatgttcacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgcatttatgcaatcacaccaataattcatttctcgacttatatgcactg 2017  T
Q  309 accaacaattcacaacatc--atatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2018 accaacaattcacaacaacatatatatatattcacccaccatatcataataaacaatatatatggattc 2086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41508796 - 41508567
Alignment:
Q  11 acatcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  41508796 acatcaactacattcacaactaggactcatgccaaaacatgatatgatcctagacacaccctatatgcatgcgttgccggtctcaccaatatttaggccg 41508697  T
Q  111 ttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 210  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41508696 tcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatctgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac 41508597  T
Q  211 aatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41508596 aatgcatatgttcacacaaacaactcacca 41508567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 18617531 - 18617749
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  18617531 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctaaatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggtcgtcgcccatgat 18617630  T
Q  122 gccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgt 221  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18617631 gccggcagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatattcgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatatatatgt 18617730  T
Q  222 tcacac-aacaactcacca 239  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  18617731 tcacacaaacaactcacca 18617749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 18610790 - 18610955
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18610790 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacataacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 18610889  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18610890 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatacatatgttcacacaaacaactcacca 18610955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 165 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41508553 - 41508395
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41508553 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacctgcat 41508454  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcaca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41508453 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcaca 41508395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21495905 - 21495652
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  21495905 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtactggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 21495806  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21495805 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 21495716  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  21495715 tgtctacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 21495652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 18610969 - 18611086
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18610969 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 18611068  T
Q  264 aaatgcattcacaccaat 281  Q
      ||||| ||||||||||    
T  18611069 ttatgcaatcacaccaat 18611086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 18617763 - 18617880
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18617763 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 18617862  T
Q  264 aaatgcattcacaccaat 281  Q
      ||||| ||||||||||    
T  18617863 ttatgcaatcacaccaat 18617880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16041111 - 16040978
Alignment:
Q  149 ttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcac 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  16041111 ttggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcac 16041012  T
Q  249 caata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  16041011 caatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 16040978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16042787 - 16042654
Alignment:
Q  149 ttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcac 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  16042787 ttggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcac 16042688  T
Q  249 caata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  16042687 caatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 16042654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 22885027 - 22885282
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt--aggccgttgccct 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||     
T  22885027 ttcacaactaggactcatgtcaccttatgatatgatcctagacacaacatctatatgcatgtggtaccggtcatcaccaatatttttaggccgtcgccca 22885126  T
Q  118 tgatgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgca 216  Q
    | ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||  || ||   ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22885127 tcat----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatttgtcatcaccaaatatgcatgcatgaacatatgactcaataataatgca 22885216  T
Q  217 tatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  22885217 tatgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 22885282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Original strand, 20708264 - 20708561
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacac--cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||| |   | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  20708264 ttcacaattagaactcatgccacaacatgatatgttcctagacacgatacctaaatgcatgcggtactgtcgtcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 20708363  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |  || |||||||||   |||| |  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20708364 atgccaacagaacaccataatcacctcaattggatata---aaattt--gtcaccatcagtcatgaatgcatgaacacatgactcaacaacaaatgcata 20708458  T
Q  219 tgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaa 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | |  | ||||| | ||||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  20708459 tgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaacact--tagcatataggcattcaccaacaattcaccattacttgccatatatgcactcagcaacaa 20708556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 17500643 - 17500698
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17500643 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 17500698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20177490 - 20177435
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20177490 catcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 20177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20177579 - 20177524
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20177579 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 20177524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20222217 - 20222162
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20222217 catcagtcatgtatgcataaacatatgtctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 20222162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20222306 - 20222251
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20222306 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 20222251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 16000632 - 16000837
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||   | | |||| | ||||||||  |||  ||    
T  16000632 ttcacaattaggactcatgccacaacgtggtatgttcctagacacgacacctaaatgcatgccgtaccgacatcaacaatgtctaggccgtcaccccatg 16000731  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    ||||| |  |||||||| |||| |  || ||||||||| ||     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16000732 atgccaactgaacatcacaatcacctcaattggatataaaa-----tccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaaatgcata 16000826  T
Q  219 tgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||    
T  16000827 tgttcacacaa 16000837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18262963 - 18262908
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18262963 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatacatatgttcacacaa 18262908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45468823 - 45468760
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacaca 228  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45468823 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgtttacaca 45468760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Original strand, 18618189 - 18618236
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618189 atatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 18618236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41508352 - 41508305
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41508352 atatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 41508305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 17500723 - 17500787
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17500723 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaa 17500787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20177401 - 20177346
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20177401 catcagtcatgtatgcacaaacttatgtctcagcaacaacgcatatgttcacacaa 20177346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20222128 - 20222073
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20222128 catcagtcatgtatgcacaaacttatgtctcagcaacaacgcatatgttcacacaa 20222073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45468736 - 45468649
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||   ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  45468736 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatttcagcaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 45468649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16040893 - 16040865
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040893 accatatcataataaacaatgtatatgga 16040865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16042569 - 16042541
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042569 accatatcataataaacaatgtatatgga 16042541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45476088 - 45476044
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45476088 ttcacaattaggactcatgccacaatatgatatgcccctagacac 45476044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 166063 - 165794
Alignment:
Q  26 acaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca-ccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgcc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  166063 acaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaaccctatatgcatgcggtaccgatctcacca-tatttaggccgtagcccatgatgcc 165965  T
Q  125 gatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaaca 211  Q
    || ||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165964 gacagaacatcataatcatcaccaatatcatcaccatttggatatataaaaatatttgtctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaaca 165865  T
Q  212 atgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  165864 atgcatatgttcacacaacaactcaccaaattctcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 165794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 281
Target Start/End: Original strand, 20252728 - 20252935
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20252728 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcacccatgatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 20252827  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20252828 atcagtcatgtatgcatgaacatatatcttaacaacaatacatatgttcatacaaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcatttatgcaatc 20252927  T
Q  274 acaccaat 281  Q
    ||||||||    
T  20252928 acaccaat 20252935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 18164796 - 18164851
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18164796 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 18164851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 20192827 - 20192878
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20192827 catgtatgcatgaacatatgactcgacaataatgcatatgttcacccaacaa 20192878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 25093479 - 25093523
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25093479 catgtatgcatgaacatatgactcgacaataatgcatatgttcac 25093523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 32650474 - 32650531
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650474 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 32650531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Original strand, 18164885 - 18164963
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  18164885 catcaatcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 18164963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 20253288 - 20253342
Alignment:
Q  321 caacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20253288 caacatcatatatatattcacccaccatatcataataaggaatgtatatggattc 20253342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18623407 - 18623365
Alignment:
Q  180 tcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttca 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18623407 tcatgaatgcatgaacatatgactca--aacaatgcatatgttca 18623365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Original strand, 23577 - 23786
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23577 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 23676  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaat 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23677 aaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatatatgcactcaccaataattcacaacaacata--tatattcacccaccatatcataataaacaat 23774  T
Q  363 gtatatggattc 374  Q
    ||||||||||||    
T  23775 gtatatggattc 23786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 23398 - 23563
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |    
T  23398 atgcatgcggtaccggtctcacaaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatctcaatatttggatatataaaaatatccgtctcc 23497  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23498 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 23563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9739 - 9516
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| || |||| ||||    
T  9739 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggttccgatctcaccaataattaggctgtcgcccatgat 9640  T
Q  122 gccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatg 220  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9639 gctgacagaacatcataatcatcaccatttggatatataaaaatatacatctccatcagtcatgtatgcatgaacgtatgactcaacgacaatgcatatg 9540  T
Q  221 ttcacac-aacaactcaccatatt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  9539 ttcacacaaacaactcaccatatt 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9506 - 9442
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9506 atccgtcaccatcagtcatctatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaa 9442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55378474 - 55378242
Alignment:
Q  15 caactacattcacaactaggactcatgccacaa-catgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgtt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||     
T  55378474 caaccacattcacaactaggactcatgccacaatcatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccggtcacaccaatatt-aggccgtc 55378376  T
Q  113 gcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccat--------ttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactc 204  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55378375 gccct-gatgccgacagaacatcataatcacaccatcgcaccatttggatatataaaaatatccgtcaccatcagtcatgtatgcatgaacgtatgactc 55378277  T
Q  205 aacaacaatgcatatgttcacacaacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55378276 aacaacaatgcatatgttcacacaataactcacca 55378242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19699244 - 19699079
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19699244 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacataacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 19699145  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19699144 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatacatatgttcacacaaacaactcacca 19699079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19709829 - 19709664
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19709829 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacataacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 19709730  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19709729 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatacatatgttcacacaaacaactcacca 19709664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 284
Target Start/End: Original strand, 22737260 - 22737393
Alignment:
Q  150 tggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcacc 249  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22737260 tggatatataaaa-tatccgccaccatcaggcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcccacaacaactcaccatattcacacc 22737358  T
Q  250 aatattacttgcataaatgcattcacaccaattca 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22737359 aatattacttgcataattgcattcacaccaattca 22737393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 165 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55378228 - 55378056
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||| ||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  55378228 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatacctcaacaataataaatatgttcatacaaacaattcac-acaatctcaccaatattacttgcat 55378130  T
Q  264 aaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatat 337  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55378129 aaatgcatccacaccaatttatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatatatat 55378056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23271628 - 23271500
Alignment:
Q  153 atatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaat 252  Q
    |||||||||||||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23271628 atatataaaaatatccgtcatcaccaaaaatgtatgcatgaacatatgactcaataacaatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaat 23271529  T
Q  253 attacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||| ||||||  ||||| | ||||||||    
T  23271528 attatttgcatttatgcaattacaccaat 23271500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 22737065 - 22737152
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagaca-caccctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggcc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22737065 ttcacaactaggactcatgccacatcatgatatgatcctagacaccactctatatgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggcc 22737152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32462130 - 32461904
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  32462130 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctggacacaacacctatatgcatgcagtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 32462031  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  32462030 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatggacatatgactcaataataatgcata 32461941  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32461940 tgtccacacaacaactcatcatatcatcaccaatatt 32461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19699065 - 19698948
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19699065 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 19698966  T
Q  264 aaatgcattcacaccaat 281  Q
      ||||| ||||||||||    
T  19698965 ttatgcaatcacaccaat 19698948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19709650 - 19709533
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcat 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709650 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccatattctcaccaatattacttgcat 19709551  T
Q  264 aaatgcattcacaccaat 281  Q
      ||||| ||||||||||    
T  19709550 ttatgcaatcacaccaat 19709533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 9793891 - 9794102
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgccctt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  9793891 ttcacaactaggactcatgtcaccttatgatatgatcctagacacaacacctacatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattttaggccgtcgcccat 9793990  T
Q  119 gatgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
     ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9793991 cat----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 9794080  T
Q  218 atgttcacacaacaactcacca 239  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  9794081 atgtccacacaacaactcacca 9794102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Original strand, 8043928 - 8044005
Alignment:
Q  298 tatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8043928 tatatggactcaccaacaattcacaacatcatatatatattcacccaccacatcataataaacaatgtatatggattc 8044005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14503080 - 14502967
Alignment:
Q  142 tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccata 241  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14503080 tcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaa 14502981  T
Q  242 ttctcaccaatatt 255  Q
    |  |||||||||||    
T  14502980 tcatcaccaatatt 14502967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 8043584 - 8043803
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |     
T  8043584 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacataacacctatatgcatgcggtaccgttcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 8043683  T
Q  120 atg-ccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||  || || | | || |||| |  |    ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  8043684 atcaccaattggatat-ataaacataa---ttggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaatattaatgcata 8043779  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8043780 tgtccacacaacaactcaccatat 8043803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23271773 - 23271677
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  23271773 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc 23271677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 14570026 - 14570090
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14570026 atccgtcaccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgtccacacaa 14570090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7966158 - 7966094
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7966158 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 7966094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40902274 - 40902210
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40902274 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 40902210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41918331 - 41918276
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41918331 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 41918276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13595727 - 13595429
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||   | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  13595727 ttcacaattaggactcatgccacaacatggtatgtccctagacacgacacctaaatgcatgcggtaccgtcatcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 13595628  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    | ||| | | |||||||||||| |  || ||||||||| ||     | ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13595627 aggccaacataacatcataatcacctcaattggatataaaa-----ttcgtcatcatcagtcatgaatgcttgaacatatgactcaacaacaaatgcata 13595533  T
Q  219 tgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcattcac-accaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaaca 315  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||||||||  |  ||||  |||| |||||||||| | ||||||| | || || |||||||||| |||||||||||    
T  13595532 tgtttacacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttaacatatatgcattcacaaacaattcaccgttacttgacatatatgcactcaccaaca 13595435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13448738 - 13448534
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagaca-cac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgt-tgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  || | || |||||||||||||||   | |||||  | ||||||||   ||| ||    
T  13448738 ttcacaactaggactcatgccacaatatgatatgtccctagacatgacgcataaatgcatgcggtaccgtcgtcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 13448639  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
    ||||| | |||||||||||||| |  || ||| ||||     || ||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13448638 atgccaacagaacatcataatcacctcaattgaatat-----aaaatctgtcaccgtcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatat 13448544  T
Q  220 gttcacacaa 229  Q
    ||||||||||    
T  13448543 gttcacacaa 13448534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41918251 - 41918187
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41918251 atccgtcaccatcagtcatgtatgcataaacatatatctcaacaacaatgcatatgttcacacaa 41918187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12336071 - 12336020
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12336071 catcagtcatgaatgcatgaacatatgaatcaacaacaatgcatatgttcac 12336020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12346738 - 12346693
Alignment:
Q  180 tcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12346738 tcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcac 12346693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Original strand, 7848885 - 7849036
Alignment:
Q  72 tatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtc 171  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||  |||| |     
T  7848885 tatatgcatgtggtaccagtctcaccaataattaggttgtcgcctttgatgccgacagaacatcatagtctcacc-gttggatatat--aaccatccct- 7848980  T
Q  172 cacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac 227  Q
    | || || ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7848981 ctcaccaatcatacatgcatgagcatatgactctacaacaatgtatatgttcacac 7849036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19623574 - 19623520
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19623574 catcagtcatgtatgcatcaacatatgactcgac-acaatgcatatgttcacacaa 19623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40902176 - 40902028
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcat 271  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| ||||| ||||||    
T  40902176 catcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcatacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagcatatatgcat 40902079  T
Q  272 tca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    ||| || |||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40902078 tcaccaacaattcacagttacttgacatatatgcactcaccaacaattcac 40902028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13448509 - 13448352
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gca 262  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| |||    
T  13448509 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcatcaacaatacatatgtttacacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagca 13448412  T
Q  263 taaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    || ||||||||| || ||||||| |||| |  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  13448411 tatatgcattcaccaacaattcaccattacatgtcatatatgcactcaccaacaattcac 13448352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19082497 - 19082441
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactc-aacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19082497 catcagttatgtatgcatgaacatatgcctcaaacaacaaagcatatgttcacacaa 19082441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14503174 - 14503085
Alignment:
Q  31 taggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaat-atttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||    
T  14503174 taggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccgatcatcaccaataatttaggccgtcgccc 14503085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 19019432 - 19019486
Alignment:
Q  321 caacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19019432 caacatcatatatatattcacccaccatatcataataaggaatgtatatggattc 19019486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23271474 - 23271442
Alignment:
Q  342 caccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23271474 caccatatcataataaacaatgtatatggattc 23271442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 8373473 - 8373527
Alignment:
Q  321 caacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8373473 caacataatatatatattcacccaccatatcataataaggaatgtatatggattc 8373527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 55378027 - 55377982
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggat 372  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55378027 atatatatattcacccaccatatcataataaataatgtatatggat 55377982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Original strand, 9794186 - 9794214
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9794186 accatatcataataaacaatgtatatgga 9794214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14502913 - 14502885
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14502913 accatatcataataaacaatgtatatgga 14502885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 27851 - 28016
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27851 atgcatgcggtaccggtctcatcaatatttaggccgtcgcccataatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 27950  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27951 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 28016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 39847 - 40012
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39847 atgcatgcggtaccggtctcatcaatatttaggccgtcgcccataatgccgacagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtctcc 39946  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39947 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaaacaactcacca 40012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 374
Target Start/End: Original strand, 28072 - 28245
Alignment:
Q  203 tcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatata 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28072 tcaacaacaatacatatgttcatgcaaacaattaaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatata 28171  T
Q  302 tgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28172 tgcactcaccaacaattcacaacaacatatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 28245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 374
Target Start/End: Original strand, 40068 - 40241
Alignment:
Q  203 tcaacaacaatgcatatgttcacacaa-caactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcatcatttctcgacatata 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40068 tcaacaacaatacatatgttcatgcaaacaattaaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacaccaattcgtcatttctcgacatata 40167  T
Q  302 tgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40168 tgcactcaccaacaattcacaacaacatatatatattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 40241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 26836 - 26970
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccac 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26836 atgcatgcggtaccggtctcaccaatatttaggccgtcgcccatgatgccgacagaacatcataatcacaccatttggatatataaaaatatccgtcctc 26935  T
Q  175 atcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26936 atcagtcatgtatgcacgaacatatgactcaacaa 26970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Original strand, 42325 - 42563
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc-ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  42325 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacaactctatatgcatgcggtaccaatctgaccaataattaggccgtcgcccatgat 42424  T
Q  122 gccgatagaacatcataat-------------ctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaaca 208  Q
    |||||||||||||||||||              ||||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42425 gccgatagaacatcataattatcaccaaaatcatcaccatttagatatgt-aaaatatccatctccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaata 42523  T
Q  209 acaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcac 248  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42524 ataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaattctcac 42563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7687 - 7421
Alignment:
Q  25 cacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatg 122  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  7687 cacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctatacacaacacctatatgcatgcggtaccgatctcaccaatatttaggccgccgcccatgatg 7588  T
Q  123 ccgatagaacatcataatc-------------tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaa 209  Q
    |||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7587 ccgatagaacatcataatcatcaccaaaatcatcaccatttggatatataaaa-tatccatctcgatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaataa 7489  T
Q  210 caatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgcataaatgcattcacac 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  7488 taatgcatatgtccacacaacaactcaccaaattctcaccaatatcatttgcatttatgcaatcacac 7421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 262
Target Start/End: Original strand, 2426 - 2610
Alignment:
Q  78 catgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacat 176  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||    
T  2426 catgcggtaccaatctcaccaataattaggccgtcgcccatgatgccgatagaacatcataatcatcaccatttagatatgtaaaa-tatccatctccat 2524  T
Q  177 cagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatattacttgca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2525 cagtcatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaattctcaccaatattatttgca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 52827 - 53080
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  52827 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacgacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 52926  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52927 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatctgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 53016  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  53017 tgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 53080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 44631 - 44884
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |     
T  44631 ttcacaactagaactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacgacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgcccatc 44730  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44731 at----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacataactgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 44820  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  44821 tgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaat 44884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 53330 - 53376
Alignment:
Q  328 atatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggatt 373  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53330 atatatatattcacccaccatatcataataaagaatgtatatggatt 53376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 98686 - 98386
Alignment:
Q  20 acattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||| ||||||| |||||||   | |||||  | ||||||||  |||     
T  98686 acattcacaattaggagtcatgccacaacatggtatgttcttagacacgacacctaaatgcatgtggtaccgacatcaccaacgtctaggccgtcaccca 98587  T
Q  118 tgatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgca 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |  || ||||||||| ||     ||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  98586 tgatgccaacagaacatcataatcacctcaattggatataaaa-----tccatcaccatcagtcatgaatgcgtgaacatatgactcaacaacaaatgca 98492  T
Q  217 tatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaa 313  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |  ||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  98491 tatgttcacacaaacaattcaccacattctcacca--aacacttaacatatatgcattcaccaacaattcaccattacttgacatatatgaactcaccaa 98394  T
Q  314 caattcac 321  Q
    ||||||||    
T  98393 caattcac 98386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 58126 - 57872
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgccctt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  58126 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacgacacctacatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattttaggccgtcgcccat 58027  T
Q  119 gatgccgatagaacatcataatct-caccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
     ||          || || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58026 cat----------cacca-aatcagcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcattaacatatgactcaacaacaatgcat 57938  T
Q  218 atgttcacacaacaactcaccatattctcaccaata--ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  57937 atgttcacacaacaactcaccatatcatcaccaatattttatttgcatttatgcaatcacaccaat 57872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2042
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| |     
T  2267 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttagaccgtcgcccatc 2168  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
    ||          || || |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2167 at----------cacca-aatcatcacaaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 2079  T
Q  219 tgttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2078 tgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaatatt 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 1616 - 1728
Alignment:
Q  143 caccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatat 242  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1616 caccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcattaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatat 1715  T
Q  243 tctcaccaatatt 255  Q
      |||||||||||    
T  1716 catcaccaatatt 1728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 92
Target Start/End: Original strand, 1502 - 1573
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtc 92  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  1502 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcatagacacgacacctaaatgcatgcggtaccggtc 1573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35309 - 35177
Alignment:
Q  150 tggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcacc 249  Q
    |||||||||||| |||||||||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  35309 tggatatataaacatatccgtcatcaccaattatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcactatatcatcacc 35210  T
Q  250 aat-attacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    ||| |||| ||||||  ||||| || |||||||    
T  35209 aataattatttgcatttatgcaatcgcaccaat 35177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 223394 - 223337
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  223394 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 223337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35408 - 35336
Alignment:
Q  35 actcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt 104  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35408 actcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattt 35336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Original strand, 16514 - 16728
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||       
T  16514 ttcacaactaggactcgtgtcacctcatgatatgatcctagacacaacatctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc--- 16610  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatat 219  Q
                 |||||     ||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16611 -------------atcat-----caccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatat 16692  T
Q  220 gttcacacaacaactcaccatattctcaccaatatt 255  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16693 gtccacacaacaactcaccatatcatcaccaatatt 16728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Original strand, 16782 - 16810
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16782 accatatcataataaacaatgtatatgga 16810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 30040 - 30161
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30040 ttcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccgttcatcaccaatatttaggccgtcgcccatg 30139  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatc 141  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  30140 atgccgacaaaacatcataatc 30161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Original strand, 34241 - 34318
Alignment:
Q  298 tatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34241 tatatggactcaccaacaattcacaacatcatatatatattcacccaccacatcataataaccaatgtatatggattc 34318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35725 - 35591
Alignment:
Q  147 atttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctc 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || ||   |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  35725 atttggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgacttaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatc 35626  T
Q  247 accaata-ttacttgcataaatgcattcacaccaa 280  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  35625 accaatatttatttgcatttatgcaatcacaccaa 35591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35795 - 35748
Alignment:
Q  70 cctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgccc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  35795 cctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatatttaggccgtcgccc 35748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24309 - 24232
Alignment:
Q  298 tatatgaactcaccaacaattcacaacatcatatttatattca-ccaccatatcataataaacaatgtatatggattc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24309 tatatggactcaccaacaattcacaacatcatatatatattcacccaccacatcataataaacaatgtatatggattc 24232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24503 - 24434
Alignment:
Q  182 atgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24503 atgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaa 24434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17872 - 17814
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatatggatt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17872 attcacaacatcatatatatattcacccaccacatcgtaataaacaatgtatatggatt 17814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24330 - 24302
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24330 accatatcataataaacaatgtatatgga 24302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15043 - 14832
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgccctt 118  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  15043 ttcacaattaggactcatgtcaccttatgatatgatcctagacacaacacctacatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattttaggccgtcgcccat 14944  T
Q  119 gatgccgatagaacatcataatc-tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcat 217  Q
     ||          || || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14943 cat----------caccaaaatcatcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcat 14854  T
Q  218 atgttcacacaacaactcacca 239  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  14853 atgtccacacaacaactcacca 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14748 - 14720
Alignment:
Q  343 accatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748 accatatcataataaacaatgtatatgga 14720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4464 - 4166
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-ac-cctatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgccct-tg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||||  | ||||||||  |||  ||    
T  4464 ttcacaattaggactcatgccacaacatggtatgtccctagacaccacacctaaatgcatgcggtaccgttgtcaccaacgtctaggccgtcaccccatg 4365  T
Q  120 atgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcata 218  Q
    ||| | | |||||||||||||| |  || ||||||||| ||     | || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4364 atgtcaacagaacatcataatcacctcaattggatataaaa-----ttcgccaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaaatgcata 4270  T
Q  219 tgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gcataaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaaca 315  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| ||||| ||||||||| || ||||||| | || || |||||||||| |||||| ||||    
T  4269 tgtttacactaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagcatatatgcattcaccaacaattcaccgttacttgacatatatgcactcacaaaca 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 140
Alignment:
Q  75 atgcatgcggtaccggtc-tgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgatagaacatcataatc------------tcaccatttggatatataaa 161  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||||    
T  326 atgcatgcggtaccgttcatcaccaatatttaggtcgtcgcccatgatgccgatagaacatcataatcatcaccaaattatcaccaattggatatataaa 227  T
Q  162 aatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
     |||||||||  || ||   ||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  226 catatccgtcatcaccaaatatgtatgc---aacatatgactcaataataatgcatatgtccacacaacaactcaccatatcatcaccaa 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 247350 - 247286
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  247350 atccgtcaccatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgtccacacaa 247286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 20742 - 20797
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20742 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 20797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 28726 - 28781
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28726 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 28781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28963
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaatattactt-gca 262  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |  |||| |||    
T  28806 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcacca--aacacttagca 28903  T
Q  263 taaatgcattca-caccaattcatcatttctcgacatatatgaactcaccaacaattcac 321  Q
    || ||||||||| || ||||||| |||  |  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  28904 tatatgcattcaccaacaattcaccatcacatgtcatatatgcactcaccaacaattcac 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Original strand, 20831 - 20909
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  20831 catcagtcatgtatgaataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 28567 - 28621
Alignment:
Q  13 atcaactacattcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  28567 atcaactattttcacaattaggactcatgccacaatatgatatggccctagacac 28621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2687 - 2632
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2687 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 2632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10942 - 10887
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10942 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 10887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 36518 - 36573
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36518 catcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaacaatgcatatgttcacacaa 36573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 104429 - 104624
Alignment:
Q  31 taggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac-accc-tatatgcatgcggtaccggtctgaccaatatttaggccgttgcccttgatgccgata 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||||   | |||||  | |||| |||  ||| ||||||| | |    
T  104429 taggactcatgccacaatatgatatgtccctagacacgacacataaatgcatgcggtaccgtcgtcaccaacgtctaggtcgtcacccatgatgccaaca 104528  T
Q  129 gaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacaca 228  Q
    ||||| ||||||| |  || |||||||||   ||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  104529 gaacaccataatcacttcaattggatata---aaatat--gtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgactcgacaagaatgcatatgttcacaca 104623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 945
Alignment:
Q  142 tcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccata 241  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1054 tcaccaattggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaagatatgaatcaataataatgcatatgtccacacaaaaactcaccata 955  T
Q  242 ttctcaccaa 251  Q
    |  |||||||    
T  954 tcatcaccaa 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 1100
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccg 89  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1168 ttcacaactagaactcatgtcacctcatgatatgatcatagacacaacacctatatgcatgcggtaccg 1100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 281
Target Start/End: Original strand, 4149 - 4278
Alignment:
Q  153 atatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaacaactcaccatattctcaccaat 252  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||   ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  4149 atatataaacatatccgtcatcaccaaatatgcatgcatgaacatatgactcgataataatgcatatgtccacacaacaactcaccaaatcatcaccaat 4248  T
Q  253 a-ttacttgcataaatgcattcacaccaat 281  Q
    | ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  4249 atttatttgcatttatgcaatcacaccaat 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 4009 - 4094
Alignment:
Q  22 attcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacaca--ccctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4009 attcacaactaggactcatgtcacctcatgatatgatcatagacacaacacctatatacatgcggtatcggtcatcaccaatattt 4094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 1200 - 1264
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1200 atccgtcaccatcagtcatgaatgcatgaacatatgagtcgacaacaatgcatatgttcacacaa 1264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 1869 - 1924
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1869 catcagtcatgaatgcatgaacatatgacttgacaacaatgcatatgttcacacaa 1924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 1949 - 2013
Alignment:
Q  165 atccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  1949 atccgtcaccatcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacagtacatatgttcatacaa 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3251 - 3203
Alignment:
Q  181 catgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3251 catgaatgcatgaacatatgactctacaacaatgcatatgttcacacaa 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3169 - 3091
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacac-aacaactcaccatattctcaccaa 251  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  3169 catcagtcatgtatgtataaacatatatctcaacaacaatacatatgttcacacaaacaattcaccacaatctcaccaa 3091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 10230 - 10285
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10230 catcagtcatgaatgcatggacatatgactcgacaacaatgcatatgttcatacaa 10285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 67278 - 67085
Alignment:
Q  23 ttcacaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacacacc--ctatatgcatgcggtaccggtc-tgaccaatattt-aggccgttgccctt 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |    
T  67278 ttcacaactgggactcatgtcaccttatgatatgatcctagacacaacacctatatgcatgcggtaccggtcatcaccaatattttaggtcgtcgcccat 67179  T
Q  119 gatgccgatagaacatcataatctcaccatttggatatataaaaatatccgtccacatcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcata 218  Q
     ||  | | |  | |||||     ||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  67178 catcaccaaa--atatcat-----caccagttggatatataaacatatccgtcatcaccaaatatgtatgcatgaacatatgactcaataataatgcata 67086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0329 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0329
Description:

Target: scaffold0329; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 1809 - 1849
Alignment:
Q  186 atgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1809 atgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatattcaca 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36339 - 36283
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaac-aatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36339 catcagtcatgaatgcatgaacatatgattcaataacaaatgcatatgttcacacaa 36283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36190
Alignment:
Q  174 catcagtcatgtatgcatgaacatatgactcaacaacaatgcatatgttcacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36245 catcagtcatgaatgtataaacaaatgtctcaacaacattgcatatgttcacacaa 36190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 67
Target Start/End: Original strand, 8740 - 8781
Alignment:
Q  26 acaactaggactcatgccacaacatgatatgatcctagacac 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8740 acaactaggactcatgccacaacatgttatgttcctagacac 8781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Original strand, 1382 - 1433
Alignment:
Q  316 attcacaacatcatatttatattcacc-accatatcataataaacaatgtatat 368  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1382 attcacaacaacatat--atattcacccaccatatcataataaacaatgtatat 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 371
Target Start/End: Original strand, 2618 - 2648
Alignment:
Q  341 ccaccatatcataataaacaatgtatatgga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618 ccaccatatcataataaacaatgtatatgga 2648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University