View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7863_low_6 (Length: 666)

Name: NF7863_low_6
Description: NF7863
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7863_low_6
NF7863_low_6
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (11-288)||(15775710-15775987)
chr8 (470-656)||(15775288-15775474)
chr8 (532-656)||(33265554-33265678)
chr8 (539-656)||(28355223-28355340)
chr8 (476-656)||(31361363-31361542)
chr8 (539-656)||(31483142-31483259)
chr8 (476-656)||(12085937-12086116)
chr8 (537-656)||(9361437-9361556)
chr8 (537-656)||(18716290-18716409)
chr8 (537-656)||(29836157-29836276)
chr8 (539-656)||(19201654-19201771)
chr8 (537-656)||(44567815-44567934)
chr8 (537-656)||(19681290-19681409)
chr8 (475-661)||(22074135-22074321)
chr8 (476-656)||(21341394-21341574)
chr8 (476-656)||(18797517-18797697)
chr8 (476-659)||(15774379-15774562)
chr8 (476-656)||(14569963-14570143)
chr8 (134-283)||(15775884-15776032)
chr8 (470-580)||(19695001-19695110)
chr8 (476-656)||(33249171-33249351)
chr8 (537-656)||(22139722-22139842)
chr8 (476-656)||(16260746-16260926)
chr8 (537-656)||(2130552-2130672)
chr8 (537-656)||(19654610-19654730)
chr8 (476-580)||(27602137-27602240)
chr8 (537-580)||(19910451-19910494)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (11-288)||(24813123-24813400)
chr4 (470-656)||(24813636-24813822)
chr4 (476-656)||(40098879-40099058)
chr4 (537-656)||(18793949-18794068)
chr4 (539-656)||(20331743-20331860)
chr4 (476-656)||(31119756-31119935)
chr4 (476-656)||(54840231-54840410)
chr4 (537-656)||(6576677-6576796)
chr4 (537-656)||(24119482-24119601)
chr4 (476-656)||(5701369-5701548)
chr4 (476-656)||(21976544-21976723)
chr4 (476-656)||(24814547-24814726)
chr4 (537-656)||(14105384-14105503)
chr4 (537-656)||(27156632-27156751)
chr4 (537-656)||(39857455-39857574)
chr4 (476-656)||(14752762-14752941)
chr4 (537-656)||(34182263-34182382)
chr4 (537-656)||(36323643-36323762)
chr4 (537-656)||(36337852-36337971)
chr4 (475-661)||(15379482-15379668)
chr4 (537-656)||(30760604-30760723)
chr4 (537-656)||(33667107-33667226)
chr4 (537-656)||(5012721-5012841)
chr4 (470-661)||(15275865-15276056)
chr4 (538-656)||(1907108-1907227)
chr4 (476-656)||(24585616-24585796)
chr4 (477-656)||(15234659-15234838)
chr4 (134-283)||(24813078-24813226)
chr4 (537-656)||(17019869-17019989)
chr4 (537-577)||(14671910-14671950)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (11-288)||(13178078-13178355)
chr5 (470-656)||(13178638-13178824)
chr5 (470-656)||(33881942-33882127)
chr5 (476-656)||(15752004-15752183)
chr5 (537-656)||(2517881-2518000)
chr5 (537-656)||(9543934-9544053)
chr5 (537-656)||(15651967-15652086)
chr5 (539-656)||(40466757-40466874)
chr5 (476-656)||(30158856-30159035)
chr5 (476-656)||(33523220-33523399)
chr5 (476-656)||(43085083-43085262)
chr5 (537-656)||(5644636-5644755)
chr5 (537-656)||(6881129-6881248)
chr5 (537-656)||(18368736-18368855)
chr5 (537-656)||(28656081-28656200)
chr5 (537-656)||(28953001-28953120)
chr5 (537-656)||(37664710-37664829)
chr5 (539-656)||(11330470-11330587)
chr5 (535-656)||(12138998-12139119)
chr5 (476-656)||(18493914-18494093)
chr5 (476-656)||(30036262-30036441)
chr5 (476-656)||(37351810-37351989)
chr5 (537-656)||(3796369-3796488)
chr5 (537-656)||(9324300-9324419)
chr5 (537-656)||(13435875-13435994)
chr5 (537-656)||(26487210-26487329)
chr5 (537-656)||(31438273-31438392)
chr5 (537-656)||(32589481-32589600)
chr5 (537-656)||(34623335-34623454)
chr5 (537-656)||(37745555-37745674)
chr5 (470-656)||(13317966-13318151)
chr5 (470-648)||(24730793-24730970)
chr5 (470-656)||(30175304-30175489)
chr5 (537-661)||(18121639-18121764)
chr5 (476-656)||(8658639-8658818)
chr5 (477-659)||(25207122-25207304)
chr5 (477-659)||(25271278-25271460)
chr5 (537-650)||(31819627-31819740)
chr5 (537-656)||(37761810-37761929)
chr5 (477-656)||(22895243-22895422)
chr5 (537-656)||(41681523-41681638)
chr5 (476-656)||(11556170-11556350)
chr5 (476-656)||(23727053-23727233)
chr5 (476-656)||(33784298-33784478)
chr5 (537-656)||(33299352-33299472)
chr5 (476-656)||(13179962-13180142)
chr5 (134-283)||(13178033-13178181)
chr5 (476-656)||(22992286-22992466)
chr5 (476-656)||(23898712-23898892)
chr5 (537-601)||(23632842-23632906)
chr5 (476-580)||(24976737-24976840)
chr5 (537-656)||(30941446-30941566)
chr5 (537-577)||(24609141-24609181)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-288)||(3790872-3791149)
chr2 (470-656)||(3790473-3790659)
chr2 (476-656)||(37679132-37679311)
chr2 (476-656)||(37694397-37694576)
chr2 (476-656)||(19409718-19409897)
chr2 (537-656)||(34161670-34161789)
chr2 (470-656)||(22921372-22921557)
chr2 (539-656)||(253948-254065)
chr2 (539-656)||(27783052-27783169)
chr2 (539-656)||(39045178-39045295)
chr2 (476-656)||(13929845-13930024)
chr2 (476-656)||(16822572-16822751)
chr2 (476-656)||(16898729-16898908)
chr2 (476-656)||(32056581-32056760)
chr2 (537-656)||(12593643-12593762)
chr2 (541-656)||(34297978-34298093)
chr2 (537-656)||(37384484-37384603)
chr2 (470-656)||(31883100-31883285)
chr2 (539-656)||(9343283-9343400)
chr2 (539-656)||(16168307-16168424)
chr2 (539-656)||(21670469-21670586)
chr2 (476-656)||(37932206-37932385)
chr2 (537-656)||(3789272-3789391)
chr2 (537-656)||(27123329-27123448)
chr2 (537-656)||(40240352-40240471)
chr2 (470-648)||(12709852-12710029)
chr2 (539-656)||(27810532-27810649)
chr2 (539-656)||(37945161-37945278)
chr2 (537-656)||(34868463-34868582)
chr2 (470-661)||(27397159-27397350)
chr2 (537-656)||(11628479-11628598)
chr2 (476-656)||(39896898-39897077)
chr2 (477-651)||(21696423-21696597)
chr2 (470-661)||(19449639-19449830)
chr2 (537-656)||(34268216-34268336)
chr2 (537-656)||(31868102-31868222)
chr2 (134-198)||(3791130-3791194)
chr2 (537-656)||(23117603-23117723)
chr2 (532-656)||(27427761-27427886)
chr2 (481-656)||(28889061-28889236)
chr2 (537-580)||(12662375-12662418)
chr2 (470-577)||(20844802-20844908)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (470-666)||(27622913-27623109)
chr6 (470-656)||(13517401-13517586)
chr6 (537-656)||(29556363-29556482)
chr6 (537-656)||(33369703-33369822)
chr6 (537-656)||(8898950-8899069)
chr6 (537-656)||(16937279-16937398)
chr6 (537-656)||(26665910-26666029)
chr6 (537-656)||(26771881-26772000)
chr6 (537-656)||(26792623-26792742)
chr6 (537-648)||(29579849-29579960)
chr6 (476-656)||(4532101-4532280)
chr6 (476-656)||(30551193-30551372)
chr6 (537-656)||(4539032-4539151)
chr6 (537-656)||(27014531-27014650)
chr6 (537-656)||(27201004-27201123)
chr6 (537-656)||(27248110-27248229)
chr6 (537-656)||(27355356-27355475)
chr6 (537-656)||(28167301-28167420)
chr6 (537-656)||(28214275-28214394)
chr6 (539-656)||(34457761-34457878)
chr6 (476-656)||(27491946-27492125)
chr6 (537-656)||(16680966-16681085)
chr6 (537-656)||(26109674-26109793)
chr6 (552-656)||(27064308-27064412)
chr6 (537-656)||(4779718-4779837)
chr6 (537-656)||(29508228-29508347)
chr6 (552-656)||(4764569-4764673)
chr6 (552-656)||(14138689-14138793)
chr6 (476-666)||(27283574-27283764)
chr6 (476-656)||(27209706-27209886)
chr6 (476-656)||(27239342-27239522)
chr6 (537-656)||(16756628-16756748)
chr6 (537-656)||(26927559-26927679)
chr6 (476-656)||(13292157-13292337)
chr6 (537-656)||(15405803-15405923)
chr6 (537-656)||(15417590-15417710)
chr6 (476-656)||(27025949-27026129)
chr6 (476-586)||(20131391-20131500)
chr6 (476-586)||(22201370-22201479)
chr6 (476-656)||(27031828-27032008)
chr6 (470-656)||(24298967-24299153)
chr6 (537-656)||(24870515-24870635)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (470-656)||(3452058-3452244)
chr7 (471-656)||(26268209-26268394)
chr7 (134-288)||(3452501-3452655)
chr7 (137-288)||(26267899-26268050)
chr7 (476-656)||(26678233-26678412)
chr7 (537-656)||(5140526-5140645)
chr7 (470-656)||(31130724-31130909)
chr7 (539-656)||(4138436-4138553)
chr7 (539-656)||(16744711-16744828)
chr7 (476-656)||(2780051-2780230)
chr7 (476-656)||(26663041-26663220)
chr7 (537-656)||(22148695-22148814)
chr7 (537-656)||(26442072-26442191)
chr7 (537-656)||(31083812-31083931)
chr7 (537-650)||(26596490-26596603)
chr7 (537-656)||(39206353-39206472)
chr7 (537-656)||(45738108-45738227)
chr7 (537-656)||(4206203-4206322)
chr7 (537-656)||(11447716-11447835)
chr7 (537-656)||(26313052-26313171)
chr7 (537-650)||(45394053-45394166)
chr7 (476-656)||(31557533-31557712)
chr7 (537-656)||(26519635-26519754)
chr7 (539-656)||(24585726-24585844)
chr7 (476-656)||(11417931-11418111)
chr7 (589-656)||(22152922-22152989)
chr7 (589-656)||(22208837-22208904)
chr7 (476-661)||(10848407-10848592)
chr7 (487-659)||(26508848-26509020)
chr7 (477-656)||(16443134-16443313)
chr7 (470-656)||(5165191-5165377)
chr7 (537-656)||(5154890-5155010)
chr7 (481-656)||(16048140-16048315)
chr7 (476-656)||(2161378-2161558)
chr7 (470-656)||(10910072-10910258)
chr7 (537-580)||(16511637-16511680)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (476-656)||(18249511-18249690)
chr3 (470-656)||(28345964-28346149)
chr3 (476-656)||(24334969-24335148)
chr3 (537-656)||(10402945-10403064)
chr3 (537-656)||(21681513-21681632)
chr3 (470-656)||(31957737-31957922)
chr3 (476-656)||(5020504-5020683)
chr3 (476-656)||(10649863-10650042)
chr3 (476-656)||(32297424-32297603)
chr3 (537-656)||(20570203-20570322)
chr3 (476-661)||(16617776-16617961)
chr3 (476-661)||(22041196-22041381)
chr3 (539-656)||(5589705-5589822)
chr3 (539-656)||(29658316-29658433)
chr3 (537-656)||(4630552-4630671)
chr3 (537-656)||(5602660-5602779)
chr3 (537-656)||(11103731-11103850)
chr3 (537-656)||(16404139-16404258)
chr3 (537-656)||(16599406-16599525)
chr3 (537-656)||(17970227-17970346)
chr3 (537-656)||(32445923-32446042)
chr3 (537-656)||(48472703-48472822)
chr3 (538-656)||(4340047-4340165)
chr3 (470-656)||(18231985-18232170)
chr3 (537-659)||(28028061-28028183)
chr3 (539-656)||(5717848-5717965)
chr3 (539-656)||(5728758-5728875)
chr3 (539-656)||(5763493-5763610)
chr3 (476-656)||(7080022-7080201)
chr3 (476-656)||(17978238-17978417)
chr3 (537-656)||(4423689-4423808)
chr3 (537-656)||(6536090-6536209)
chr3 (537-656)||(20072806-20072925)
chr3 (537-656)||(31029613-31029732)
chr3 (539-656)||(47030249-47030366)
chr3 (476-656)||(18285666-18285845)
chr3 (476-656)||(18300967-18301146)
chr3 (476-656)||(28109250-28109429)
chr3 (537-656)||(8218418-8218537)
chr3 (537-656)||(22864211-22864330)
chr3 (537-656)||(22879270-22879389)
chr3 (476-661)||(15368032-15368217)
chr3 (552-656)||(5473760-5473864)
chr3 (537-656)||(51788815-51788934)
chr3 (476-656)||(35887531-35887711)
chr3 (476-656)||(29142063-29142243)
chr3 (476-656)||(4789940-4790120)
chr3 (476-656)||(18058039-18058219)
chr3 (476-656)||(19701188-19701368)
chr3 (476-656)||(4728397-4728577)
chr3 (476-656)||(5658905-5659085)
chr3 (476-656)||(6208666-6208846)
chr3 (476-601)||(8282769-8282893)
chr3 (476-656)||(15734425-15734605)
chr3 (476-580)||(4690523-4690626)
chr3 (476-601)||(16423034-16423158)
chr3 (476-656)||(18337395-18337575)
chr3 (476-580)||(15886026-15886129)
chr3 (537-656)||(22380949-22381069)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (476-656)||(12847-13026)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (537-656)||(3647980-3648099)
chr1 (481-656)||(51645055-51645229)
chr1 (537-656)||(10951925-10952044)
chr1 (537-656)||(28591914-28592033)
chr1 (539-656)||(10969476-10969593)
chr1 (537-656)||(28156538-28156657)
chr1 (537-656)||(41786640-41786759)
chr1 (476-650)||(16201276-16201450)
chr1 (481-656)||(20333667-20333842)
chr1 (572-645)||(13769558-13769631)
chr1 (476-656)||(14692162-14692342)
chr1 (476-656)||(14694844-14695024)
chr1 (476-656)||(14697528-14697708)
chr1 (476-656)||(14700209-14700389)
chr1 (481-656)||(20467617-20467792)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (476-656)||(8187-8366)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (537-656)||(2488-2607)
scaffold0322 (476-659)||(12879-13062)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (537-656)||(2483-2602)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (537-656)||(14773-14892)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (537-656)||(10750-10869)
scaffold0143 (476-656)||(34103-34283)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (537-651)||(16412-16526)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (486-651)||(28128-28293)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (477-656)||(603-782)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (537-656)||(8966-9086)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (470-650)||(25809-25989)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (537-656)||(3921-4041)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (470-577)||(24213-24319)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (476-580)||(1309-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (537-580)||(13281-13324)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (537-580)||(39922-39965)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15775987 - 15775710
Alignment:
Q  11 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775987 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 15775888  T
Q  111 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775887 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 15775788  T
Q  211 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775787 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 15775710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15775474 - 15775288
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15775474 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 15775375  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15775374 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 532 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33265678 - 33265554
Alignment:
Q  532 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagt 631  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265678 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagt 33265579  T
Q  632 attgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  33265578 attgggcacgtagtggctcgtgcta 33265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 28355223 - 28355340
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355223 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 28355322  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  28355323 acgtagtggctcgtgcta 28355340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361363
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31361444  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31361443 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 31361363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 31483142 - 31483259
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483142 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 31483241  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  31483242 acgtagtggctcgtgcta 31483259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 12085937 - 12086116
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||| ||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  12085937 ttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12086035  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12086036 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 12086116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 9361556 - 9361437
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361556 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 9361457  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  9361456 gcacgtagtggctcgtgcta 9361437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18716409 - 18716290
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18716409 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18716310  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18716309 gcacgtagtggctcgtgcta 18716290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29836276 - 29836157
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29836276 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 29836177  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  29836176 gcacgtagtggctcgtgcta 29836157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 19201654 - 19201771
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201654 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 19201753  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19201754 acgtagtggctcgtgcta 19201771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 44567934 - 44567815
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 44567835  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  44567834 gcacgtagcggctcgcgcta 44567815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19681409 - 19681290
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19681409 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 19681310  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19681309 gcacgtagtggctcgtgcta 19681290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 475 - 661
Target Start/End: Original strand, 22074135 - 22074321
Alignment:
Q  475 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 574  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  22074135 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 22074233  T
Q  575 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22074234 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatca 22074321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341574
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21341492  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21341493 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 21341574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797517
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18797599  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18797598 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18797517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774379
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15774464  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15774463 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat 15774379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569963
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14570045  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14570044 catgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgcta 14569963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15776032 - 15775884
Alignment:
Q  134 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 232  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  15776032 gggacaaactgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 15775935  T
Q  233 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 283  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15775934 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 15775884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19695110 - 19695001
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19695110 ctgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19695012  T
Q  570 gaaatgcatga 580  Q
    | |||||||||    
T  19695011 gtaatgcatga 19695001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249171
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33249253  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33249252 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 33249171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22139842 - 22139722
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  22139842 gtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 22139743  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  22139742 ggcacgtagtggctcgtgcta 22139722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260746
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatg 16260828  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16260827 catgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgcta 16260746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 2130552 - 2130672
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  2130552 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 2130651  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  2130652 ggcacgtagtggctcgtgcta 2130672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 19654610 - 19654730
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19654610 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19654709  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  19654710 ggcacgtaatggctcgtgcta 19654730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 580
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602240
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27602235  T
Q  576 catga 580  Q
    |||||    
T  27602236 catga 27602240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 580
Target Start/End: Original strand, 19910451 - 19910494
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19910451 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 19910494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 24813123 - 24813400
Alignment:
Q  11 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813123 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 24813222  T
Q  111 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813223 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 24813322  T
Q  211 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813323 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaagtggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 24813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 24813636 - 24813822
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24813636 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 24813735  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24813736 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099058
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 40098977  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40098978 catgactgttggtattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 40099058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 18793949 - 18794068
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18794048  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18794049 gcacgtagtggctcgtgcta 18794068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 20331743 - 20331860
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331743 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 20331842  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  20331843 acgtagtggctcgtgcta 20331860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31119935
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31119854  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31119855 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 31119935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840231
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 54840312  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  54840311 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgcta 54840231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6576796 - 6576677
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6576796 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgg 6576697  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6576696 gcacgtagtggctcgtgcta 6576677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24119601 - 24119482
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24119601 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 24119502  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24119501 gcacgtagtggctcgtgcta 24119482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701369
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5701450  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5701449 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 5701369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976544
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21976625  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21976624 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 21976544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24814645  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24814646 catgactgttggcattttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14105503 - 14105384
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105503 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 14105404  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  14105403 gcacgtagtggctcgtgcta 14105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 27156632 - 27156751
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27156632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgg 27156731  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27156732 gcacgtagtggctcgtgcta 27156751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 39857574 - 39857455
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857574 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 39857475  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  39857474 gcacgtagtggctcgtgcta 39857455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14752941
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14752860  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14752861 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 14752941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 34182263 - 34182382
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182263 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34182362  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  34182363 gcacatagtggctcgtgcta 34182382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 36323643 - 36323762
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36323643 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36323742  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  36323743 gcacgtagtggctcgtgcta 36323762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 36337852 - 36337971
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36337852 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36337951  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  36337952 gcacgtagtggctcgtgcta 36337971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 475 - 661
Target Start/End: Original strand, 15379482 - 15379668
Alignment:
Q  475 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 574  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  15379482 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaat 15379580  T
Q  575 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15379581 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatca 15379668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30760723 - 30760604
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  30760723 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 30760624  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  30760623 gcacgtagtggctcgtgcta 30760604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 33667107 - 33667226
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  33667107 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 33667206  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33667207 gcacgtagtggctcgtgcta 33667226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5012841 - 5012721
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt-g 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5012841 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 5012742  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  5012741 ggcacgtagtggctcgtgcta 5012721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 470 - 661
Target Start/End: Original strand, 15275865 - 15276056
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15275865 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 15275963  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15275964 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatca 15276056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 1907227 - 1907108
Alignment:
Q  538 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||    
T  1907227 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 1907128  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  1907127 gcacgtagtggctcgtgcta 1907108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585796
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24585714  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24585715 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24585796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15234838 - 15234659
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15234838 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15234740  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15234739 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 15234659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Original strand, 24813078 - 24813226
Alignment:
Q  134 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  24813078 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 24813175  T
Q  233 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 283  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24813176 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 24813226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 17019989 - 17019869
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  17019989 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 17019890  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  17019889 ggcacgcagtggctcgtgcta 17019869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14671950 - 14671910
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 577  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14671950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 14671910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 13178078 - 13178355
Alignment:
Q  11 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178078 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 13178177  T
Q  111 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178178 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttgaactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 13178277  T
Q  211 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178278 tgaaactgacttgacatcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 13178355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 13178638 - 13178824
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13178638 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 13178737  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13178738 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33882127 - 33881942
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33882127 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 33882029  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33882028 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 33881942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752183
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15752102  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15752103 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 15752183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2518000 - 2517881
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518000 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 2517901  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2517900 gcacgtagtggctcgtgcta 2517881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 9543934 - 9544053
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9544033  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  9544034 gcacgtagtggctcgtgcta 9544053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 15651967 - 15652086
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651967 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 15652066  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  15652067 gcacgtagtggctcgtgcta 15652086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 40466757 - 40466874
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466757 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 40466856  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  40466857 acgtagtggctcgtgcta 40466874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158856
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30158937  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30158936 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 30158856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523220
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33523301  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33523300 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 33523220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43085083
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 43085164  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43085163 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgcta 43085083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5644755 - 5644636
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644755 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5644656  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  5644655 gcacgtagtggctcgtgcta 5644636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6881248 - 6881129
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6881248 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 6881149  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6881148 gcacgtagtggctcgtgcta 6881129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 18368736 - 18368855
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368736 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18368835  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18368836 gcacgtagtggctcgtgcta 18368855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28656200 - 28656081
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656200 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 28656101  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28656100 gcacgtagtggctcgtgcta 28656081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 28953001 - 28953120
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28953001 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 28953100  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28953101 gcacgtagtggctcgtgcta 28953120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 37664710 - 37664829
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37664710 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 37664809  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  37664810 gcacgtagtggctcgtgcta 37664829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 11330587 - 11330470
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330587 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 11330488  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  11330487 acgtagcggctcgtgcta 11330470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 535 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12139119 - 12138998
Alignment:
Q  535 atgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 634  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12139119 atgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 12139020  T
Q  635 gggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  12139019 gggcacgtagtggctcgtgcta 12138998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494093
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18494012  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18494013 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgcta 18494093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036262
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30036343  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30036342 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 30036262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37351989
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||   || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttcc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37351908  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37351909 catgactgttggcatttggtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 37351989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3796488 - 3796369
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3796488 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 3796389  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3796388 gcacgtagtggctcgtgcta 3796369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 9324419 - 9324300
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324419 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9324320  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  9324319 gcacgtagtggctcgtgcta 9324300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 13435875 - 13435994
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13435875 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 13435974  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  13435975 gcacgtagtggctcgtgcta 13435994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26487329 - 26487210
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487329 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26487230  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26487229 gcacgtagtggctcgtgcta 26487210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31438392 - 31438273
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31438392 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31438293  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  31438292 gcacgtagtggctcgtgcta 31438273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 32589481 - 32589600
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32589481 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgggaaagacaagacattggagtattgg 32589580  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32589581 gcacgtagtggctcgtgcta 32589600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 34623454 - 34623335
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34623454 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 34623355  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  34623354 gcacgtagtggctcgtgcta 34623335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 37745555 - 37745674
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37745555 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgg 37745654  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  37745655 gcacgtagtggctcgtgcta 37745674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 13317966 - 13318151
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13317966 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13318064  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13318065 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 13318151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24730970 - 24730793
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24730970 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24730872  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggc 648  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24730871 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggc 24730793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30175489 - 30175304
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| || |||||||  |||||||||||||| ||    
T  30175489 ctgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgctt 30175391  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30175390 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 30175304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 537 - 661
Target Start/End: Original strand, 18121639 - 18121764
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18121639 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacatttagagtattg 18121738  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18121739 ggcacgtagtggctcgtgctatatca 18121764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658818
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8658737  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8658738 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgcta 8658818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25207304 - 25207122
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25207304 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25207206  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25207205 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat 25207122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25271460 - 25271278
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25271460 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25271362  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25271361 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat 25271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 537 - 650
Target Start/End: Original strand, 31819627 - 31819740
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819627 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31819726  T
Q  637 gcacgtagtggctc 650  Q
    |||| |||||||||    
T  31819727 gcacatagtggctc 31819740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 37761929 - 37761810
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37761929 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagaatattgg 37761830  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  37761829 gcacgtagtggctcgtgcta 37761810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22895422 - 22895243
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22895422 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgc 22895324  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22895323 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 22895243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 41681638 - 41681523
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||     || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41681638 gtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagtcattagagtattgg 41681543  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  41681542 gcacgtagtggctcgtgcta 41681523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556170
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11556252  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11556251 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 11556170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23727053
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 23727135  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  || |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23727134 catgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 23727053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784298
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33784380  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33784379 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 33784298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33299472 - 33299352
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  33299472 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 33299373  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  33299372 ggcacgtagtggctcgtgcta 33299352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180142
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13180060  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13180061 catgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 13180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Original strand, 13178033 - 13178181
Alignment:
Q  134 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  13178033 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 13178130  T
Q  233 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 283  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13178131 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 13178181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992466
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 22992384  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22992385 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 22992466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898712
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatg 23898794  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23898793 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgcta 23898712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23632906 - 23632842
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacac 601  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  23632906 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 23632842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976737
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24976742  T
Q  576 catga 580  Q
    |||||    
T  24976741 catga 24976737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30941566 - 30941446
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30941566 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattg 30941467  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||||||| ||||    
T  30941466 ggcacacagtggctcgtgcta 30941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 24609181 - 24609141
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 577  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24609181 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 24609141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3791149 - 3790872
Alignment:
Q  11 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3791149 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcataggata 3791050  T
Q  111 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791049 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 3790950  T
Q  211 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790949 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaacctggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3790659 - 3790473
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3790659 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3790560  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3790559 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679311
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37679230  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37679231 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 37679311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694576
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37694495  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37694496 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 37694576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19409897
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19409816  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19409817 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 19409897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 34161789 - 34161670
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161789 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34161690  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  34161689 gcacgtagtggctcgtgcta 34161670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 22921372 - 22921557
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22921372 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 22921470  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921471 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 22921557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 253948 - 254065
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253948 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 254047  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  254048 acgtagtggctcgtgcta 254065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27783169 - 27783052
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783169 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27783070  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  27783069 acgtagtggctcgtgcta 27783052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 39045178 - 39045295
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045178 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 39045277  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  39045278 acgtagtggctcgtgcta 39045295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930024
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13929943  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13929944 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 13930024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822751
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16822670  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16822671 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16822751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898729
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16898810  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16898809 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16898729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056581
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32056662  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056661 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 32056581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12593762 - 12593643
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593762 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 12593663  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  12593662 gcacgtagtggctcgtgcta 12593643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 541 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 34298093 - 34297978
Alignment:
Q  541 tatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 640  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298093 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 34297994  T
Q  641 gtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34297993 gtagtggctcgtgcta 34297978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 37384603 - 37384484
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37384603 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 37384504  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  37384503 gcacgtagtggctcgtgcta 37384484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31883285 - 31883100
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31883285 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31883187  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31883186 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 31883100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 9343283 - 9343400
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343283 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 9343382  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  9343383 acgtagtgactcgtgcta 9343400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16168424 - 16168307
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168424 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16168325  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16168324 acgtagtggctcgtgcta 16168307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 21670469 - 21670586
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670469 aatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 21670568  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  21670569 acgtagtggctcgtgcta 21670586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932206
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37932287  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37932286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgcta 37932206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3789391 - 3789272
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789391 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 3789292  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3789291 gcacgtagtggctcgtgcta 3789272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27123448 - 27123329
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27123448 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27123349  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27123348 gcacgtagtggctcgtgcta 27123329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 40240471 - 40240352
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40240471 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 40240372  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  40240371 gcacgtagtggctcgtgcta 40240352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 648
Target Start/End: Original strand, 12709852 - 12710029
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12709852 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 12709950  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggc 648  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12709951 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggc 12710029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27810649 - 27810532
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810649 aataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27810550  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  27810549 acgtagtggctcgtgcta 27810532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 37945161 - 37945278
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945161 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 37945260  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  37945261 acgtagtggctcgtgcta 37945278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 34868582 - 34868463
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  34868582 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 34868483  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  34868482 gcacgtagtggctcgtgcta 34868463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27397350 - 27397159
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27397350 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 27397252  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27397251 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatca 27397159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 11628479 - 11628598
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11628479 gtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 11628578  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  11628579 gcacgtagtggctcgtgcta 11628598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896898
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 39896979  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39896978 catgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 39896898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 651
Target Start/End: Original strand, 21696423 - 21696597
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  21696423 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21696521  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21696522 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 21696597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 661
Target Start/End: Original strand, 19449639 - 19449830
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19449639 ctgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19449737  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    | || ||||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19449738 gtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatca 19449830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 34268216 - 34268336
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  34268216 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 34268315  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  34268316 ggcacgtagtggctcgtgcta 34268336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 31868102 - 31868222
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  31868102 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 31868201  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31868202 ggcacgtagtggctcgtgcta 31868222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3791194 - 3791130
Alignment:
Q  134 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3791194 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatt 3791130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23117723 - 23117603
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga-tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtatt 634  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||    
T  23117723 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcga-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 23117625  T
Q  635 gggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  23117624 gggcacgtagtggctcgtgcta 23117603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 656
Target Start/End: Original strand, 27427761 - 27427886
Alignment:
Q  532 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagag 630  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||    
T  27427761 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggag 27427860  T
Q  631 tattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27427861 tattgggcacgtaatggctcgtgcta 27427886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28889236 - 28889061
Alignment:
Q  481 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28889236 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatga 28889138  T
Q  581 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
      ||||    |||||||||||   ||| | | || ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28889137 ctgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgcta 28889061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12662418 - 12662375
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12662418 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 12662375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20844908 - 20844802
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20844908 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 20844810  T
Q  570 gaaatgca 577  Q
    | ||||||    
T  20844809 gtaatgca 20844802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 470 - 666
Target Start/End: Original strand, 27622913 - 27623109
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622913 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 27623012  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatcatagaa 666  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27623013 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaa 27623109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 13517401 - 13517586
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13517401 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13517499  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13517500 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 13517586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29556482 - 29556363
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556482 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29556383  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  29556382 gcacgtagtggctcgtgcta 29556363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 33369703 - 33369822
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369703 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 33369802  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33369803 gcacgtagtggctcgtgcta 33369822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 8898950 - 8899069
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 8899049  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  8899050 gcacgtagtggctcgtgcta 8899069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 16937279 - 16937398
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937279 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16937378  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16937379 gcacgtagtggctcgtgcta 16937398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 26665910 - 26666029
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665910 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26666009  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26666010 gcacgtagtggctcgtgcta 26666029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 26771881 - 26772000
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26771881 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26771980  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26771981 gcacgtagtggctcgtgcta 26772000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26792742 - 26792623
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26792742 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 26792643  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26792642 gcacgtagtggctcgtgcta 26792623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29579960 - 29579849
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579960 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29579861  T
Q  637 gcacgtagtggc 648  Q
    ||||||||||||    
T  29579860 gcacgtagtggc 29579849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4532101
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4532182  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4532181 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagcta 4532101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551372
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30551291  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30551292 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 30551372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 4539032 - 4539151
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539032 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4539131  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4539132 gcacgtagtggctcgtgcta 4539151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27014650 - 27014531
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014650 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27014551  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27014550 gcacgtagtggctcgtgcta 27014531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27201123 - 27201004
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27201123 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27201024  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27201023 gcacgtagtggctcgagcta 27201004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 27248110 - 27248229
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248110 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27248209  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27248210 gcacgtagtggctcgagcta 27248229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 27355356 - 27355475
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27355356 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27355455  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  27355456 gcacgtagtggctcgtgcta 27355475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28167420 - 28167301
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167420 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28167321  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28167320 gcacgtagtggctcgtgcta 28167301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28214394 - 28214275
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28214394 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28214295  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28214294 gcacgtagtggctcgtgcta 28214275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 34457761 - 34457878
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457761 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 34457860  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    || |||||||||| ||||    
T  34457861 acatagtggctcgtgcta 34457878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491946
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27492027  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27492026 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgcta 27491946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16681085 - 16680966
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16681085 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16680986  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  16680985 gcacatagtggctcgtgcta 16680966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 26109674 - 26109793
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26109674 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 26109773  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26109774 gcacgtagtggctcgtgcta 26109793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 552 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27064412 - 27064308
Alignment:
Q  552 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064412 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 27064313  T
Q  652 ggcta 656  Q
     ||||    
T  27064312 tgcta 27064308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4779837 - 4779718
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4779837 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaattttgg 4779738  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4779737 gcacgtagtggctcgtgcta 4779718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29508347 - 29508228
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29508347 gtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacatcagagtattgg 29508248  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  29508247 gcacgtagtggctcgtgcta 29508228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 552 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4764673 - 4764569
Alignment:
Q  552 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4764673 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 4764574  T
Q  652 ggcta 656  Q
     ||||    
T  4764573 tgcta 4764569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 552 - 656
Target Start/End: Original strand, 14138689 - 14138793
Alignment:
Q  552 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14138689 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 14138788  T
Q  652 ggcta 656  Q
     ||||    
T  14138789 tgcta 14138793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 476 - 666
Target Start/End: Original strand, 27283574 - 27283764
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27283574 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27283672  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacac-gacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatcatagaa 666  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| |  || | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27283673 catgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaa 27283764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209706
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27209788  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27209787 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 27209706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239522
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27239440  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27239441 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 27239522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16756748 - 16756628
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  16756748 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 16756649  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16756648 ggcacgtagtggctcgtgcta 16756628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26927679 - 26927559
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  26927679 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 26927580  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26927579 ggcacgtagtggctcgtgcta 26927559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292337
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 13292255  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13292256 catgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 13292337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 15405803 - 15405923
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15405803 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15405902  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  15405903 ggcacgtagtggctcgtgcta 15405923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 15417590 - 15417710
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15417590 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15417689  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  15417690 ggcacgtagtggctcgtgcta 15417710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025949
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 27026031  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27026030 catgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 27025949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131391
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 20131402  T
Q  576 catgatggttg 586  Q
    |||||||||||    
T  20131401 catgatggttg 20131391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 586
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201479
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 22201468  T
Q  576 catgatggttg 586  Q
    |||||||||||    
T  22201469 catgatggttg 22201479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031828
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatg 27031910  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  27031909 catgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgcta 27031828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 24298967 - 24299153
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24298967 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24299065  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  24299066 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgcta 24299153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24870635 - 24870515
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  24870635 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 24870536  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  24870535 ggcacgtaatggctcgtgcta 24870515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3452244 - 3452058
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3452244 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3452145  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  3452144 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 3452058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 471 - 656
Target Start/End: Original strand, 26268209 - 26268394
Alignment:
Q  471 tgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 570  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26268209 tgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 26268308  T
Q  571 aaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26268309 aaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 26268394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3452655 - 3452501
Alignment:
Q  134 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452655 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 3452556  T
Q  234 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452555 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3452501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Original strand, 26267899 - 26268050
Alignment:
Q  137 acaagctgttcttggact-gaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26267899 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca-gaaacatattcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 26267997  T
Q  236 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26267998 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaataggggtg 26268050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678412
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26678331  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26678332 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 26678412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 5140526 - 5140645
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5140526 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5140625  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  5140626 gcacgtagtggctcgtgcta 5140645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31130909 - 31130724
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31130909 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31130811  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31130810 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 31130724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 4138436 - 4138553
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138436 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 4138535  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4138536 acgtagtggctcgtgcta 4138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 16744711 - 16744828
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744711 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16744810  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16744811 acgtagtggctcgtgcta 16744828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2780051
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2780132  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2780131 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 2780051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663220
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26663139  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663140 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 26663220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22148814 - 22148695
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22148814 gtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 22148715  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  22148714 gcacgtagtggctcgtgcta 22148695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26442191 - 26442072
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442191 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26442092  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26442091 gcacgtagtggctcgtgcta 26442072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 31083812 - 31083931
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083812 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 31083911  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  31083912 gcacgtagtggctcgtgcta 31083931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 537 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 26596603 - 26596490
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596603 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26596504  T
Q  637 gcacgtagtggctc 650  Q
    ||||||||||||||    
T  26596503 gcacgtagtggctc 26596490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 39206353 - 39206472
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39206353 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 39206452  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  39206453 gcacgtagtggctcgtgcta 39206472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 45738227 - 45738108
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45738227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 45738128  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  45738127 gcacgtagtggctcgtgcta 45738108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4206322 - 4206203
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4206322 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 4206223  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4206222 gcacgtagtggctcgtgcta 4206203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 11447835 - 11447716
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11447835 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 11447736  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  11447735 gcacgtagtggctcgtgcta 11447716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 26313052 - 26313171
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313052 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26313151  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26313152 gcacgtagtggctcgtgcta 26313171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 537 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 45394166 - 45394053
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45394166 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 45394067  T
Q  637 gcacgtagtggctc 650  Q
    ||||||||||||||    
T  45394066 gcacgtagtggctc 45394053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557712
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 31557631  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31557632 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgcta 31557712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26519754 - 26519635
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26519754 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 26519655  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26519654 gcacgtagtggctcgtgcta 26519635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 24585726 - 24585844
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattggg 637  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24585726 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacatttagagtattggg 24585825  T
Q  638 cacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  24585826 cacgtagtggctcgtgcta 24585844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418111
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11418029  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11418030 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 11418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22152989 - 22152922
Alignment:
Q  589 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22152989 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 22152922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22208904 - 22208837
Alignment:
Q  589 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22208904 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 22208837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848407
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 10848494  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10848493 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatca 10848407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 487 - 659
Target Start/End: Original strand, 26508848 - 26509020
Alignment:
Q  487 aatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttg 586  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  26508848 aatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttg 26508946  T
Q  587 atagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
      |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26508947 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat 26509020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 656
Target Start/End: Original strand, 16443134 - 16443313
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16443134 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataa-aagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16443232  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16443233 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgcta 16443313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5165377 - 5165191
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5165377 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 5165279  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5165278 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 5165191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5155010 - 5154890
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5155010 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5154911  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  5154910 ggcacgtagtggctcgtgcta 5154890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16048315 - 16048140
Alignment:
Q  481 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||    
T  16048315 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  581 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16048140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161378
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2161460  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2161459 catgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 2161378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 10910072 - 10910258
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10910072 ctgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 10910170  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttca-cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||| ||  ||||    ||||||||||| | |||| | | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10910171 gtaatgcacgactgttggcgatttgtagacac-agttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgcta 10910258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 580
Target Start/End: Original strand, 16511637 - 16511680
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16511637 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 16511680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249511
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18249592  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18249591 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18249511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28346149 - 28345964
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28346149 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 28346051  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28346050 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 28345964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334969
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24335050  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24335049 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24334969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10403064 - 10402945
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403064 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 10402965  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  10402964 gcacgtagtggctcgtgcta 10402945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21681632 - 21681513
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 21681533  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21681532 gcacgtagtggctcgtgcta 21681513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Original strand, 31957737 - 31957922
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31957737 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31957835  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31957836 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 31957922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020504
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5020585  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5020584 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 5020504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649863
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10649944  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10649943 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 10649863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297424
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32297505  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32297504 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 32297424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 20570203 - 20570322
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20570203 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggggagacaagacattagagtattgg 20570302  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20570303 gcacgtagtggctcgtgcta 20570322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 476 - 661
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16617961
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 16617874  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16617875 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatca 16617961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 476 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041196
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 22041283  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22041282 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatca 22041196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 5589705 - 5589822
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589705 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 5589804  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  5589805 acgtagtgactcgtgcta 5589822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 29658316 - 29658433
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658316 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 29658415  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  29658416 acgtagtggctcgtgcta 29658433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4630671 - 4630552
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4630671 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4630572  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4630571 gcacgtagtggctcgtgcta 4630552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 5602660 - 5602779
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5602660 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 5602759  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  5602760 gcacgtagtggctcgtgcta 5602779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 11103731 - 11103850
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103731 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 11103830  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  11103831 gcacgtagtggctcgtgcta 11103850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 16404139 - 16404258
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16404139 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16404238  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16404239 gcacgtagtggctcgtgcta 16404258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16599525 - 16599406
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599525 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16599426  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16599425 gcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 17970227 - 17970346
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 17970326  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17970327 gcacgtagtggctcgtgcta 17970346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32446042 - 32445923
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32446042 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 32445943  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32445942 gcacgtagtggctcgtgcta 32445923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 48472822 - 48472703
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48472822 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 48472723  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  48472722 gcacgtagtggctcgtgcta 48472703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Original strand, 4340047 - 4340165
Alignment:
Q  538 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattggg 637  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4340047 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattggg 4340146  T
Q  638 cacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  4340147 cacgtagtggctcgtgcta 4340165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18232170 - 18231985
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18232170 ctgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 18232072  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    | |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18232071 gtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18231985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 537 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 28028183 - 28028061
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28028183 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtaatgg 28028084  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  28028083 gcaagtagtggctcgtgctacat 28028061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5717965 - 5717848
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5717965 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5717866  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5717865 acgtagtggctcgtgcta 5717848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5728875 - 5728758
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728875 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5728776  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5728775 acgtagtggctcgtgcta 5728758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Original strand, 5763493 - 5763610
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763493 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5763592  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5763593 acgtagtggctcgtgcta 5763610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 7080103  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7080102 catgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978417
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 17978336  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17978337 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 17978417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4423808 - 4423689
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4423808 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4423709  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4423708 gcacgtagtggctcgtgcta 4423689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 6536090 - 6536209
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6536090 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 6536189  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6536190 gcacgtagtggctcgtgcta 6536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 20072925 - 20072806
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20072925 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacggggaagacaagacatcagagtattgg 20072826  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20072825 gcacgtagtggctcgtgcta 20072806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 31029613 - 31029732
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31029613 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31029712  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  31029713 gcacgtagtggctcgtgcta 31029732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 47030366 - 47030249
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47030366 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggc 47030267  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  47030266 acgtagtggctcgtgcta 47030249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285845
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18285764  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18285765 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18285845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301146
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18301065  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18301066 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18301146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109429
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatg 28109348  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28109349 catgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 28109429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8218537 - 8218418
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8218537 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaaggcgttagagtattgg 8218438  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  8218437 gcacgtggtggctcgtgcta 8218418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 22864211 - 22864330
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864211 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22864310  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  22864311 gcacgtagtggctcgtgcta 22864330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 22879270 - 22879389
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879270 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22879369  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  22879370 gcacgtagtggctcgtgcta 22879389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 476 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15368032
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15368119  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacatca 661  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15368118 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatca 15368032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 552 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5473864 - 5473760
Alignment:
Q  552 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5473864 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 5473765  T
Q  652 ggcta 656  Q
     ||||    
T  5473764 tgcta 5473760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 51788934 - 51788815
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  51788934 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 51788835  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  51788834 gcacgtagtggctcgtgcta 51788815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887531
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 35887613  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35887612 catgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 35887531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142243
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 29142161  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29142162 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 29142243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790120
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4790038  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4790039 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgcta 4790120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18058039
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18058121  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18058120 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18058039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701188
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19701270  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19701269 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 19701188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728397
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 4728479  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4728478 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 4728397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658905
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5658987  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5658986 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 5658905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208666
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 6208748  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6208747 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 6208666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 601
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8282893
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8282867  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacac 601  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||    
T  8282868 catgactgttggcagtttgtagacac 8282893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734605
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatg 15734523  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15734524 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 15734605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690523
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4690528  T
Q  576 catga 580  Q
    |||||    
T  4690527 catga 4690523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 16423158 - 16423034
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16423158 ttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16423060  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacac 601  Q
    |||||  ||||   ||||||||||||    
T  16423059 catgactgttggcggtttgtagacac 16423034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337395
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 18337477  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18337476 catgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 18337395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 580
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886129
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15886124  T
Q  576 catga 580  Q
    |||||    
T  15886125 catga 15886129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 22380949 - 22381069
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| ||||||||    
T  22380949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattg 22381048  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  22381049 ggcacgtagtggctcgtgcta 22381069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12847
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12928  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12927 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 12847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3648099 - 3647980
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648099 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 3648000  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3647999 gcacgtagtggctcgtgcta 3647980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 481 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 51645229 - 51645055
Alignment:
Q  481 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51645229 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  581 tggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
      ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 51645055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10952044 - 10951925
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952044 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgg 10951945  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  10951944 gcacgtagtggctcgtgcta 10951925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28592033 - 28591914
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28592033 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 28591934  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28591933 gcacgtagtggctcgtgcta 28591914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10969593 - 10969476
Alignment:
Q  539 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969593 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 10969494  T
Q  639 acgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  10969493 acgtagtgactcgtgcta 10969476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28156657 - 28156538
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28156657 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28156558  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28156557 gcacgtagtggctcgtgcta 28156538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 41786640 - 41786759
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41786640 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgtcagagtattgg 41786739  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  41786740 gcacgtagtggctcgtgcta 41786759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 476 - 650
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201450
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16201374  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 650  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16201375 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16201450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 481 - 656
Target Start/End: Original strand, 20333667 - 20333842
Alignment:
Q  481 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20333667 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20333765  T
Q  581 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20333766 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 20333842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13769631 - 13769558
Alignment:
Q  572 aatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagt 645  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13769631 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaatacattagagtattgggcacgtagt 13769558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692342
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14692260  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14692261 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 14692342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695024
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14694942  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14694943 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 14695024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697708
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14697626  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14697627 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 14697708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700389
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14700307  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14700308 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 14700389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 20467792 - 20467617
Alignment:
Q  481 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20467792 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20467694  T
Q  581 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
      ||||  || ||||||||||   |||   | || ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20467693 ctgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgcta 20467617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8366
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8285  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 8366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2488
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2607 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 2508  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2507 gcacgtagtggctcgtgcta 2488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12879
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12964  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggctacat 659  Q
     ||||  ||||  |||| ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12963 tatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat 12879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2602
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2483 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 2582  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2583 gcacgtagtggctcgtgcta 2602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14892 - 14773
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 14793  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  14792 gcacgtagtggctcgtgcta 14773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10869 - 10750
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10869 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacagggaagacaagacattagaatattgg 10770  T
Q  637 gcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  10769 gcacgtagtggctcgtgcta 10750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 34103
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34185  T
Q  576 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34184 catgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgcta 34103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 537 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16526 - 16412
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 636  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16526 gtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaaaacatcagagtattgg 16427  T
Q  637 gcacgtagtggctcg 651  Q
    |||||||||||||||    
T  16426 gcacgtagtggctcg 16412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 28293 - 28128
Alignment:
Q  486 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  28293 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 28195  T
Q  586 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 651  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28194 ggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 28128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 782 - 603
Alignment:
Q  477 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 576  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  782 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 684  T
Q  577 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  683 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgcta 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9086
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  8966 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 9065  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  9066 ggcacgtagtggctcgtgcta 9086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 650
Target Start/End: Original strand, 25809 - 25989
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||| | ||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25809 ctgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagtttt-atcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 25907  T
Q  570 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 650  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25908 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctc 25989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 656
Target Start/End: Original strand, 3921 - 4041
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  3921 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 4020  T
Q  636 ggcacgtagtggctcgggcta 656  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  4021 ggcacgcagtggctcgtgcta 4041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 577
Target Start/End: Original strand, 24213 - 24319
Alignment:
Q  470 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 569  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24213 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24311  T
Q  570 gaaatgca 577  Q
    | ||||||    
T  24312 gtaatgca 24319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 580
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1412
Alignment:
Q  476 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 575  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 1407  T
Q  576 catga 580  Q
    |||||    
T  1408 catga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 580
Target Start/End: Original strand, 13281 - 13324
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13281 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 580
Target Start/End: Original strand, 39922 - 39965
Alignment:
Q  537 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39922 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University