View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7866_high_1 (Length: 916)

Name: NF7866_high_1
Description: NF7866
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7866_high_1
NF7866_high_1
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (1-900)||(32706981-32707888)
chr7 (1-136)||(8769531-8769666)
chr7 (1-138)||(18731019-18731156)
chr7 (3-135)||(43140701-43140833)
chr7 (1-140)||(31715631-31715770)
chr7 (1-141)||(23437149-23437289)
chr7 (2-141)||(35085736-35085875)
chr7 (1-139)||(10625333-10625471)
chr7 (2-139)||(47250796-47250933)
chr7 (2-141)||(2357305-2357444)
chr7 (1-140)||(9034564-9034703)
chr7 (2-136)||(34568585-34568719)
chr7 (2-135)||(44448162-44448295)
chr7 (1-140)||(9230926-9231065)
chr7 (1-139)||(11678702-11678840)
chr7 (1-139)||(31715871-31716008)
chr7 (1-139)||(35085989-35086127)
chr7 (1-138)||(23472805-23472942)
chr7 (2-138)||(11678953-11679088)
chr7 (1-141)||(23472590-23472730)
chr7 (1-139)||(2357066-2357204)
chr7 (1-135)||(39118013-39118147)
chr7 (1-138)||(44486181-44486318)
chr7 (1-132)||(21522226-21522355)
chr7 (1-137)||(26920166-26920302)
chr7 (2-126)||(41758691-41758815)
chr7 (1-140)||(5238449-5238588)
chr7 (1-139)||(24119713-24119851)
chr7 (1-141)||(8769279-8769419)
chr7 (1-140)||(43726491-43726630)
chr7 (1-135)||(21522467-21522599)
chr7 (1-139)||(47251146-47251283)
chr7 (1-141)||(32706729-32706869)
chr7 (1-125)||(47250570-47250694)
chr7 (1-136)||(38842035-38842168)
chr7 (1-136)||(44447916-44448050)
chr7 (1-139)||(36507058-36507196)
chr7 (1-141)||(473429-473569)
chr7 (1-141)||(34568833-34568977)
chr7 (4-137)||(48704061-48704193)
chr7 (1-98)||(9230716-9230813)
chr7 (1-138)||(37143764-37143900)
chr7 (1-138)||(44485581-44485718)
chr7 (1-141)||(38842271-38842410)
chr7 (2-141)||(43726241-43726378)
chr7 (59-138)||(47305127-47305206)
chr7 (1-138)||(22338272-22338410)
chr7 (1-138)||(31623673-31623810)
chr7 (1-139)||(473191-473326)
chr7 (1-135)||(28349630-28349763)
chr7 (2-139)||(22338523-22338663)
chr7 (59-140)||(37144070-37144151)
chr7 (13-139)||(43050383-43050510)
chr7 (59-141)||(15326869-15326951)
chr7 (75-125)||(19543503-19543553)
chr7 (67-140)||(10625104-10625177)
chr7 (9-93)||(47250942-47251027)
chr7 (2-94)||(23437402-23437494)
chr7 (75-125)||(40740044-40740094)
chr7 (2-115)||(47305377-47305490)
chr7 (75-139)||(24446296-24446360)
chr7 (2-102)||(36506848-36506948)
chr7 (2-49)||(24119955-24120002)
chr7 (75-126)||(36720491-36720542)
chr7 (75-126)||(43704957-43705008)
chr7 (75-125)||(45457099-45457149)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (1-140)||(52914950-52915089)
chr4 (1-139)||(40067347-40067485)
chr4 (1-138)||(21218096-21218233)
chr4 (2-139)||(29864175-29864312)
chr4 (1-138)||(32384653-32384790)
chr4 (1-140)||(9010503-9010642)
chr4 (1-136)||(29864424-29864559)
chr4 (1-135)||(1157455-1157589)
chr4 (1-127)||(25218095-25218221)
chr4 (2-139)||(54136090-54136227)
chr4 (3-139)||(21217846-21217982)
chr4 (1-139)||(9010754-9010892)
chr4 (1-139)||(12381303-12381441)
chr4 (1-140)||(52915192-52915333)
chr4 (1-138)||(10014465-10014601)
chr4 (1-138)||(10021606-10021742)
chr4 (1-138)||(27347597-27347734)
chr4 (1-134)||(33625868-33626001)
chr4 (1-138)||(33626113-33626250)
chr4 (1-126)||(53645463-53645588)
chr4 (1-140)||(43317128-43317267)
chr4 (12-139)||(46200483-46200610)
chr4 (1-139)||(44432873-44433011)
chr4 (1-139)||(45911823-45911961)
chr4 (2-135)||(2738883-2739016)
chr4 (1-134)||(33882198-33882331)
chr4 (1-141)||(25058830-25058970)
chr4 (2-138)||(34958832-34958967)
chr4 (1-141)||(43316877-43317016)
chr4 (1-120)||(4965889-4966008)
chr4 (1-116)||(25218333-25218448)
chr4 (1-138)||(18862689-18862827)
chr4 (1-135)||(37515702-37515836)
chr4 (1-135)||(45911582-45911716)
chr4 (1-135)||(46621176-46621310)
chr4 (1-138)||(25593340-25593477)
chr4 (1-138)||(40067597-40067734)
chr4 (1-138)||(44710403-44710540)
chr4 (1-138)||(45683117-45683254)
chr4 (1-134)||(46620931-46621064)
chr4 (2-139)||(48209947-48210084)
chr4 (1-141)||(38866395-38866535)
chr4 (1-140)||(27347846-27347985)
chr4 (2-139)||(22830795-22830933)
chr4 (1-135)||(29970196-29970329)
chr4 (23-137)||(54191855-54191969)
chr4 (1-138)||(45683366-45683503)
chr4 (2-137)||(28570671-28570806)
chr4 (1-135)||(8246995-8247129)
chr4 (1-138)||(1205626-1205763)
chr4 (2-135)||(34959081-34959214)
chr4 (1-138)||(46535523-46535659)
chr4 (2-134)||(44710653-44710785)
chr4 (1-136)||(8751289-8751424)
chr4 (1-135)||(25977771-25977906)
chr4 (2-141)||(43969777-43969916)
chr4 (2-135)||(1157206-1157342)
chr4 (1-135)||(1205381-1205514)
chr4 (1-135)||(4793848-4793981)
chr4 (1-138)||(24503939-24504077)
chr4 (1-127)||(24504189-24504315)
chr4 (2-140)||(32385062-32385199)
chr4 (1-138)||(8246769-8246904)
chr4 (2-141)||(11102224-11102364)
chr4 (1-137)||(21051360-21051496)
chr4 (1-137)||(46535771-46535907)
chr4 (1-135)||(22831046-22831181)
chr4 (1-135)||(38866648-38866783)
chr4 (3-138)||(46200736-46200871)
chr4 (1-88)||(54191638-54191725)
chr4 (2-139)||(44169978-44170116)
chr4 (1-141)||(4966117-4966257)
chr4 (4-140)||(10014716-10014851)
chr4 (4-140)||(10021857-10021992)
chr4 (1-135)||(15985469-15985604)
chr4 (28-137)||(11242740-11242849)
chr4 (1-93)||(44428616-44428708)
chr4 (1-138)||(9657667-9657804)
chr4 (1-106)||(21885073-21885178)
chr4 (1-139)||(54136340-54136474)
chr4 (59-141)||(44170288-44170370)
chr4 (1-93)||(21051596-21051688)
chr4 (1-139)||(9657896-9658034)
chr4 (57-139)||(44428512-44428594)
chr4 (1-85)||(42779573-42779657)
chr4 (81-136)||(43969556-43969611)
chr4 (75-125)||(28504590-28504640)
chr4 (75-125)||(41610528-41610578)
chr4 (75-125)||(46307569-46307619)
chr4 (97-138)||(10017815-10017856)
chr4 (23-64)||(43969599-43969640)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (1-135)||(1826040-1826174)
chr8 (1-135)||(1860485-1860619)
chr8 (1-141)||(23244764-23244904)
chr8 (1-141)||(24456901-24457041)
chr8 (1-141)||(37393726-37393866)
chr8 (1-140)||(37393475-37393614)
chr8 (1-139)||(3869198-3869336)
chr8 (1-141)||(18017787-18017927)
chr8 (1-140)||(35224016-35224155)
chr8 (2-140)||(30872781-30872919)
chr8 (1-138)||(40040162-40040299)
chr8 (1-141)||(11198454-11198594)
chr8 (1-140)||(5416810-5416949)
chr8 (1-127)||(31230624-31230750)
chr8 (1-138)||(21515449-21515586)
chr8 (1-138)||(31230862-31230999)
chr8 (1-133)||(14920660-14920792)
chr8 (2-138)||(18621997-18622133)
chr8 (1-141)||(30650187-30650327)
chr8 (1-136)||(119119-119253)
chr8 (1-140)||(35223772-35223911)
chr8 (1-140)||(6843493-6843634)
chr8 (1-135)||(18018035-18018169)
chr8 (1-138)||(40032426-40032564)
chr8 (3-140)||(11639050-11639187)
chr8 (1-138)||(18914500-18914637)
chr8 (1-138)||(39911917-39912054)
chr8 (1-142)||(29027221-29027358)
chr8 (1-139)||(8653935-8654073)
chr8 (1-135)||(26736128-26736262)
chr8 (5-126)||(40094487-40094608)
chr8 (1-140)||(7041878-7042012)
chr8 (1-136)||(30568525-30568660)
chr8 (2-137)||(39240031-39240166)
chr8 (1-139)||(14920410-14920548)
chr8 (1-127)||(39912168-39912294)
chr8 (2-139)||(1825809-1825945)
chr8 (2-139)||(1860254-1860390)
chr8 (1-114)||(7041653-7041766)
chr8 (1-139)||(33542383-33542521)
chr8 (2-141)||(44254862-44255001)
chr8 (1-135)||(8654185-8654319)
chr8 (1-135)||(9495272-9495406)
chr8 (2-135)||(16645795-16645931)
chr8 (1-135)||(23244518-23244652)
chr8 (57-139)||(24456733-24456815)
chr8 (1-135)||(39240268-39240402)
chr8 (19-140)||(21512411-21512531)
chr8 (2-139)||(44255112-44255249)
chr8 (2-138)||(119366-119502)
chr8 (1-141)||(758593-758733)
chr8 (1-141)||(12873297-12873435)
chr8 (1-140)||(36343960-36344098)
chr8 (1-135)||(758347-758481)
chr8 (1-119)||(26736374-26736492)
chr8 (1-141)||(28207002-28207142)
chr8 (30-138)||(40032706-40032815)
chr8 (1-136)||(3868946-3869084)
chr8 (27-135)||(6844715-6844823)
chr8 (1-141)||(40094724-40094864)
chr8 (2-140)||(18914262-18914396)
chr8 (2-140)||(12873055-12873193)
chr8 (1-138)||(28206766-28206903)
chr8 (1-83)||(44678433-44678515)
chr8 (1-135)||(29026971-29027109)
chr8 (2-99)||(33542634-33542731)
chr8 (1-136)||(5417062-5417197)
chr8 (59-139)||(44678316-44678396)
chr8 (1-140)||(30873027-30873166)
chr8 (57-136)||(44678518-44678596)
chr8 (1-119)||(410611-410729)
chr8 (1-141)||(35485868-35486008)
chr8 (1-127)||(5525882-5526006)
chr8 (1-83)||(30568331-30568413)
chr8 (1-136)||(26217072-26217206)
chr8 (2-65)||(40040412-40040475)
chr8 (75-132)||(35486186-35486243)
chr8 (95-139)||(11639378-11639422)
chr8 (75-126)||(7117111-7117162)
chr8 (1-64)||(9495106-9495169)
chr8 (75-126)||(43633135-43633186)
chr8 (1-55)||(11639299-11639353)
chr8 (2-84)||(32733765-32733847)
chr8 (1-50)||(19302273-19302322)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-138)||(9173901-9174038)
chr6 (1-141)||(33545071-33545211)
chr6 (1-140)||(3338475-3338614)
chr6 (1-139)||(25551346-25551484)
chr6 (1-135)||(25551585-25551719)
chr6 (1-139)||(33329205-33329343)
chr6 (1-139)||(35132600-35132738)
chr6 (1-137)||(6220305-6220441)
chr6 (1-139)||(3288929-3289067)
chr6 (1-135)||(24604878-24605011)
chr6 (1-115)||(35119060-35119174)
chr6 (2-135)||(33544825-33544958)
chr6 (2-125)||(11524778-11524901)
chr6 (1-136)||(29009956-29010091)
chr6 (1-138)||(3289159-3289296)
chr6 (1-138)||(12903221-12903358)
chr6 (1-138)||(14336902-14337039)
chr6 (2-139)||(3338727-3338862)
chr6 (1-135)||(6220059-6220193)
chr6 (1-138)||(7537854-7537992)
chr6 (1-127)||(24605123-24605248)
chr6 (1-135)||(31029527-31029661)
chr6 (1-115)||(33346501-33346615)
chr6 (1-127)||(1158599-1158727)
chr6 (1-142)||(19135695-19135836)
chr6 (1-138)||(31029773-31029910)
chr6 (1-141)||(2949293-2949428)
chr6 (1-139)||(14337151-14337288)
chr6 (1-138)||(1860735-1860871)
chr6 (51-137)||(11524706-11524792)
chr6 (1-126)||(24548490-24548615)
chr6 (1-139)||(2814560-2814698)
chr6 (1-139)||(11525015-11525152)
chr6 (1-139)||(29010203-29010341)
chr6 (1-141)||(1158840-1158978)
chr6 (30-138)||(32283026-32283134)
chr6 (75-139)||(33548180-33548244)
chr6 (1-93)||(33972455-33972547)
chr6 (1-139)||(35132850-35132977)
chr6 (4-135)||(13155842-13155973)
chr6 (4-135)||(13160698-13160829)
chr6 (1-127)||(13156088-13156209)
chr6 (1-127)||(13160944-13161065)
chr6 (2-116)||(29999653-29999767)
chr6 (1-116)||(2315601-2315716)
chr6 (5-93)||(2949544-2949632)
chr6 (1-138)||(24548241-24548378)
chr6 (1-135)||(31754207-31754341)
chr6 (2-110)||(12903461-12903569)
chr6 (1-140)||(17544702-17544840)
chr6 (75-135)||(33971931-33971991)
chr6 (52-139)||(17245624-17245711)
chr6 (1-60)||(33329455-33329514)
chr6 (1-49)||(33972293-33972341)
chr6 (75-126)||(3618793-3618844)
chr6 (52-138)||(6229687-6229772)
chr6 (734-807)||(7779848-7779921)
chr6 (62-135)||(17544457-17544529)
[»] chr2 (102 HSPs)
chr2 (1-141)||(13354426-13354566)
chr2 (1-139)||(31450665-31450803)
chr2 (1-139)||(41377354-41377491)
chr2 (2-139)||(5961668-5961805)
chr2 (1-136)||(43183585-43183720)
chr2 (1-138)||(4104408-4104545)
chr2 (1-138)||(20908760-20908897)
chr2 (1-141)||(21470292-21470432)
chr2 (1-139)||(13354176-13354314)
chr2 (1-139)||(28203109-28203247)
chr2 (2-135)||(39912630-39912764)
chr2 (2-138)||(4104159-4104295)
chr2 (1-140)||(27132509-27132648)
chr2 (1-139)||(25642517-25642655)
chr2 (5-139)||(27476620-27476754)
chr2 (1-134)||(16655610-16655743)
chr2 (1-138)||(37412827-37412964)
chr2 (2-138)||(4120764-4120900)
chr2 (1-137)||(12303786-12303922)
chr2 (1-137)||(16260872-16261007)
chr2 (23-139)||(16736100-16736216)
chr2 (1-141)||(34820528-34820668)
chr2 (1-140)||(18565064-18565203)
chr2 (1-137)||(38275704-38275842)
chr2 (1-140)||(39454449-39454588)
chr2 (1-135)||(28631523-28631657)
chr2 (1-135)||(37744637-37744771)
chr2 (1-138)||(27883468-27883605)
chr2 (1-138)||(31450915-31451052)
chr2 (1-138)||(32933840-32933977)
chr2 (1-134)||(34820283-34820416)
chr2 (1-138)||(41377603-41377740)
chr2 (1-138)||(41659745-41659882)
chr2 (2-138)||(27132760-27132896)
chr2 (1-137)||(36442383-36442519)
chr2 (1-140)||(5921635-5921774)
chr2 (2-133)||(25642273-25642404)
chr2 (1-140)||(32933589-32933728)
chr2 (1-140)||(43183832-43183971)
chr2 (2-140)||(12304404-12304542)
chr2 (1-139)||(16261119-16261257)
chr2 (1-127)||(21470544-21470669)
chr2 (1-138)||(17856199-17856336)
chr2 (5-138)||(28202860-28202993)
chr2 (1-136)||(34127814-34127948)
chr2 (1-140)||(35408770-35408909)
chr2 (1-139)||(20908510-20908648)
chr2 (1-141)||(39912875-39913017)
chr2 (2-140)||(45389129-45389267)
chr2 (1-138)||(16736347-16736484)
chr2 (3-136)||(37412595-37412728)
chr2 (1-139)||(44612732-44612871)
chr2 (2-138)||(10833285-10833421)
chr2 (1-140)||(16655855-16655994)
chr2 (1-135)||(27476369-27476504)
chr2 (4-135)||(38275480-38275611)
chr2 (1-140)||(39150074-39150213)
chr2 (1-135)||(4121012-4121146)
chr2 (25-135)||(18565276-18565386)
chr2 (1-127)||(28631285-28631411)
chr2 (1-138)||(36211350-36211487)
chr2 (1-140)||(14877481-14877618)
chr2 (1-141)||(44915737-44915876)
chr2 (2-141)||(36442130-36442269)
chr2 (1-139)||(15137053-15137191)
chr2 (2-127)||(12304035-12304160)
chr2 (3-140)||(17856440-17856577)
chr2 (1-134)||(34127570-34127703)
chr2 (1-141)||(27883706-27883850)
chr2 (51-138)||(36211698-36211785)
chr2 (1-135)||(27913897-27914031)
chr2 (1-135)||(32503786-32503920)
chr2 (31-141)||(39454712-39454822)
chr2 (1-139)||(40694194-40694332)
chr2 (1-115)||(40694424-40694538)
chr2 (2-139)||(33819646-33819781)
chr2 (2-125)||(15829733-15829856)
chr2 (9-120)||(34484303-34484414)
chr2 (27-136)||(37744451-37744560)
chr2 (28-119)||(11943764-11943855)
chr2 (51-138)||(20297410-20297497)
chr2 (1-139)||(27246232-27246370)
chr2 (1-115)||(39149867-39149981)
chr2 (1-99)||(44915988-44916086)
chr2 (1-139)||(27914142-27914280)
chr2 (2-141)||(33819394-33819532)
chr2 (2-93)||(36211591-36211682)
chr2 (1-135)||(41659985-41660119)
chr2 (1-135)||(32503549-32503683)
chr2 (59-135)||(1580148-1580224)
chr2 (1-119)||(16350320-16350438)
chr2 (75-141)||(44610859-44610924)
chr2 (75-135)||(34484238-34484298)
chr2 (75-125)||(677915-677965)
chr2 (1-138)||(3603504-3603642)
chr2 (52-138)||(23992206-23992292)
chr2 (61-138)||(38073790-38073867)
chr2 (75-141)||(2822301-2822367)
chr2 (75-125)||(15136364-15136414)
chr2 (75-125)||(26424819-26424869)
chr2 (75-125)||(31557104-31557154)
chr2 (75-125)||(34618517-34618567)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (1-141)||(23281259-23281399)
chr1 (1-135)||(29256835-29256969)
chr1 (1-141)||(25088013-25088153)
chr1 (2-139)||(5463368-5463505)
chr1 (1-141)||(45305659-45305798)
chr1 (2-138)||(51691874-51692010)
chr1 (1-140)||(16267939-16268077)
chr1 (1-139)||(10923612-10923750)
chr1 (1-141)||(33753222-33753362)
chr1 (1-136)||(18793693-18793828)
chr1 (1-140)||(30611218-30611357)
chr1 (1-140)||(30792438-30792577)
chr1 (1-140)||(34028970-34029109)
chr1 (1-127)||(10654278-10654404)
chr1 (1-139)||(28970418-28970556)
chr1 (2-140)||(32564200-32564337)
chr1 (1-135)||(42607525-42607659)
chr1 (2-138)||(22584602-22584738)
chr1 (1-140)||(6181865-6182004)
chr1 (1-136)||(21035987-21036122)
chr1 (1-140)||(34028719-34028858)
chr1 (12-139)||(34279501-34279628)
chr1 (1-136)||(35986234-35986369)
chr1 (1-132)||(50574766-50574897)
chr1 (1-127)||(24590237-24590363)
chr1 (1-135)||(49291232-49291366)
chr1 (1-138)||(13944760-13944897)
chr1 (1-138)||(22584351-22584488)
chr1 (1-138)||(24590474-24590611)
chr1 (2-135)||(50118350-50118483)
chr1 (1-141)||(37199170-37199310)
chr1 (1-140)||(9881550-9881688)
chr1 (1-140)||(10654028-10654166)
chr1 (1-136)||(11787742-11787877)
chr1 (1-136)||(51692120-51692254)
chr1 (1-135)||(6181619-6181753)
chr1 (1-139)||(33753465-33753602)
chr1 (1-139)||(37198931-37199069)
chr1 (1-139)||(46738973-46739110)
chr1 (1-139)||(51810136-51810274)
chr1 (1-127)||(52412609-52412735)
chr1 (1-139)||(52412847-52412985)
chr1 (2-135)||(30293263-30293395)
chr1 (1-141)||(14118527-14118667)
chr1 (1-137)||(16267716-16267852)
chr1 (1-141)||(24655835-24655975)
chr1 (2-137)||(42607752-42607887)
chr1 (2-129)||(51810388-51810515)
chr1 (1-139)||(14775744-14775882)
chr1 (1-135)||(24655589-24655723)
chr1 (1-139)||(32563958-32564096)
chr1 (1-139)||(36657750-36657888)
chr1 (1-139)||(46949755-46949893)
chr1 (1-138)||(14775984-14776121)
chr1 (26-139)||(50921365-50921478)
chr1 (1-141)||(4045096-4045236)
chr1 (1-141)||(30293010-30293150)
chr1 (5-125)||(50574527-50574647)
chr1 (1-137)||(50921061-50921197)
chr1 (1-140)||(44222190-44222329)
chr1 (2-136)||(11394910-11395044)
chr1 (2-140)||(19986372-19986510)
chr1 (1-141)||(4054545-4054686)
chr1 (1-137)||(30611469-30611606)
chr1 (1-140)||(25088265-25088403)
chr1 (1-139)||(4045348-4045486)
chr1 (1-115)||(21384960-21385073)
chr1 (1-151)||(29257072-29257222)
chr1 (8-114)||(32517629-32517735)
chr1 (1-135)||(34621884-34622018)
chr1 (2-115)||(5463140-5463253)
chr1 (3-141)||(18793943-18794082)
chr1 (1-141)||(20260628-20260768)
chr1 (1-93)||(5118096-5118188)
chr1 (1-141)||(21385185-21385325)
chr1 (23-135)||(36884725-36884837)
chr1 (10-141)||(1831661-1831792)
chr1 (1-135)||(10923365-10923500)
chr1 (3-138)||(34279240-34279375)
chr1 (1-139)||(11787990-11788127)
chr1 (2-88)||(13831272-13831358)
chr1 (2-140)||(13944509-13944647)
chr1 (28-141)||(36077268-36077381)
chr1 (52-136)||(5117995-5118079)
chr1 (1-93)||(28112795-28112887)
chr1 (32-135)||(19885985-19886088)
chr1 (1-135)||(1831913-1832047)
chr1 (1-135)||(40533928-40534062)
chr1 (1-140)||(4550849-4550988)
chr1 (5-93)||(11797220-11797308)
chr1 (3-139)||(27209168-27209304)
chr1 (1-137)||(36657501-36657638)
chr1 (1-135)||(45305412-45305547)
chr1 (1-115)||(49291016-49291130)
chr1 (1-78)||(9119541-9119618)
chr1 (52-141)||(28112718-28112807)
chr1 (1-101)||(46949985-46950085)
chr1 (52-135)||(19886214-19886297)
chr1 (1-139)||(40703114-40703252)
chr1 (1-71)||(30792689-30792759)
chr1 (59-141)||(48702187-48702269)
chr1 (51-140)||(9119290-9119379)
chr1 (61-134)||(11394697-11394769)
chr1 (52-137)||(11797147-11797232)
chr1 (1-127)||(2125458-2125577)
chr1 (1-135)||(32517762-32517894)
chr1 (2-119)||(40534175-40534292)
chr1 (733-800)||(29726183-29726250)
chr1 (2-139)||(40702867-40703001)
chr1 (57-139)||(19269359-19269441)
chr1 (30-126)||(20260440-20260536)
chr1 (59-139)||(27209456-27209536)
chr1 (2-136)||(31125938-31126065)
chr1 (756-808)||(33060597-33060649)
chr1 (1-65)||(50921309-50921373)
chr1 (2-85)||(36884954-36885037)
chr1 (75-117)||(6241274-6241316)
chr1 (75-125)||(6714698-6714748)
chr1 (5-115)||(21036235-21036345)
chr1 (75-125)||(32193530-32193580)
chr1 (79-141)||(33784299-33784361)
chr1 (75-125)||(34023569-34023619)
chr1 (75-125)||(37708574-37708624)
chr1 (75-125)||(46448736-46448786)
chr1 (75-140)||(29021580-29021645)
chr1 (1-102)||(31126178-31126279)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (2-140)||(34521264-34521402)
chr3 (1-140)||(41208649-41208788)
chr3 (1-139)||(44069372-44069510)
chr3 (1-138)||(54107669-54107806)
chr3 (1-140)||(4846845-4846984)
chr3 (1-139)||(26332318-26332456)
chr3 (1-135)||(34629985-34630119)
chr3 (1-136)||(10756720-10756855)
chr3 (1-135)||(54081287-54081420)
chr3 (1-141)||(15862424-15862564)
chr3 (1-140)||(45171066-45171205)
chr3 (1-139)||(7950274-7950412)
chr3 (1-142)||(26332567-26332712)
chr3 (1-139)||(28688239-28688377)
chr3 (1-139)||(41997818-41997956)
chr3 (2-139)||(54081533-54081671)
chr3 (1-139)||(54108369-54108507)
chr3 (1-126)||(7743014-7743139)
chr3 (8-141)||(43899330-43899463)
chr3 (2-138)||(31513863-31513999)
chr3 (1-137)||(45171316-45171452)
chr3 (3-139)||(45871696-45871832)
chr3 (2-140)||(12123088-12123226)
chr3 (1-135)||(21169669-21169803)
chr3 (3-141)||(28691364-28691502)
chr3 (1-135)||(40410715-40410849)
chr3 (1-134)||(7274892-7275024)
chr3 (1-138)||(7937812-7937949)
chr3 (3-140)||(12123330-12123467)
chr3 (1-138)||(15862182-15862319)
chr3 (1-138)||(44069123-44069260)
chr3 (1-138)||(50819466-50819603)
chr3 (1-138)||(50856261-50856398)
chr3 (2-138)||(8846326-8846462)
chr3 (3-135)||(34521508-34521640)
chr3 (1-141)||(41208398-41208538)
chr3 (3-134)||(22354946-22355077)
chr3 (1-140)||(31514112-31514250)
chr3 (1-140)||(35753680-35753819)
chr3 (2-141)||(50819217-50819356)
chr3 (2-141)||(50856508-50856647)
chr3 (2-135)||(14353298-14353430)
chr3 (29-138)||(52609639-52609748)
chr3 (1-133)||(53841275-53841407)
chr3 (1-140)||(40926009-40926148)
chr3 (23-138)||(43899111-43899226)
chr3 (2-140)||(46766863-46767002)
chr3 (1-139)||(19124188-19124326)
chr3 (1-139)||(28691113-28691251)
chr3 (13-135)||(35580210-35580332)
chr3 (1-138)||(8846076-8846213)
chr3 (1-141)||(40639366-40639506)
chr3 (1-136)||(40926260-40926394)
chr3 (1-127)||(17273788-17273914)
chr3 (2-136)||(51170631-51170765)
chr3 (1-139)||(52606128-52606265)
chr3 (1-110)||(17102626-17102735)
chr3 (1-138)||(27940272-27940409)
chr3 (1-138)||(47891513-47891650)
chr3 (1-137)||(19124421-19124556)
chr3 (3-127)||(45871940-45872064)
chr3 (1-139)||(5348817-5348955)
chr3 (1-135)||(10756957-10757091)
chr3 (1-139)||(17102383-17102521)
chr3 (1-111)||(28688017-28688127)
chr3 (1-135)||(37133280-37133414)
chr3 (1-138)||(40969255-40969392)
chr3 (1-139)||(52268353-52268490)
chr3 (28-141)||(38911494-38911607)
chr3 (4-135)||(2078724-2078855)
chr3 (2-142)||(14353042-14353182)
chr3 (1-137)||(29248320-29248456)
chr3 (1-135)||(2829410-2829545)
chr3 (1-135)||(29248557-29248691)
chr3 (75-141)||(41998137-41998203)
chr3 (2-115)||(27254007-27254120)
chr3 (1-140)||(5348577-5348716)
chr3 (1-93)||(22444435-22444527)
chr3 (1-136)||(33773039-33773175)
chr3 (2-126)||(53678445-53678569)
chr3 (27-134)||(49222040-49222147)
chr3 (12-138)||(51883859-51883985)
chr3 (2-135)||(17274026-17274159)
chr3 (52-133)||(35753408-35753489)
chr3 (1-93)||(35753477-35753569)
chr3 (1-140)||(40969503-40969642)
chr3 (51-139)||(54247271-54247358)
chr3 (1-140)||(2829657-2829795)
chr3 (1-140)||(9028189-9028328)
chr3 (1-100)||(53841065-53841164)
chr3 (2-138)||(588400-588537)
chr3 (1-138)||(9028440-9028577)
chr3 (31-136)||(53310001-53310106)
chr3 (75-139)||(7274652-7274716)
chr3 (68-136)||(7937645-7937713)
chr3 (1-135)||(40639120-40639254)
chr3 (59-138)||(53678740-53678818)
chr3 (52-138)||(13866964-13867050)
chr3 (11-140)||(20963547-20963677)
chr3 (59-141)||(51311825-51311907)
chr3 (1-141)||(46766619-46766760)
chr3 (1-38)||(52606367-52606404)
chr3 (31-127)||(33812735-33812831)
chr3 (23-141)||(43839959-43840076)
chr3 (52-136)||(49529120-49529204)
chr3 (75-125)||(13355188-13355238)
chr3 (62-135)||(21918500-21918573)
chr3 (61-138)||(33812852-33812929)
chr3 (81-138)||(43527023-43527080)
chr3 (75-126)||(31049073-31049124)
chr3 (88-119)||(38911432-38911463)
chr3 (75-125)||(47872529-47872579)
chr3 (59-141)||(51885671-51885753)
chr3 (13-137)||(43844359-43844484)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (1-141)||(4567-4707)
scaffold0809 (1-135)||(4341-4475)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (1-140)||(7399075-7399214)
chr5 (1-141)||(35263491-35263631)
chr5 (1-134)||(15267489-15267622)
chr5 (2-141)||(40589304-40589443)
chr5 (2-141)||(40589907-40590046)
chr5 (2-137)||(42710351-42710486)
chr5 (1-138)||(28392018-28392156)
chr5 (1-138)||(10656343-10656480)
chr5 (1-138)||(42710599-42710736)
chr5 (1-141)||(12593705-12593845)
chr5 (1-140)||(16353403-16353542)
chr5 (1-140)||(33699273-33699412)
chr5 (10-140)||(5088386-5088516)
chr5 (1-139)||(10656093-10656231)
chr5 (1-139)||(35263743-35263881)
chr5 (5-138)||(9692919-9693051)
chr5 (2-135)||(9693168-9693301)
chr5 (1-137)||(7210694-7210830)
chr5 (1-141)||(12694935-12695075)
chr5 (2-139)||(29023936-29024070)
chr5 (1-136)||(32272089-32272224)
chr5 (1-136)||(36751904-36752039)
chr5 (1-139)||(3878480-3878618)
chr5 (1-135)||(5624382-5624516)
chr5 (4-126)||(7399330-7399452)
chr5 (3-137)||(8418435-8418569)
chr5 (1-135)||(19205192-19205326)
chr5 (1-139)||(38416383-38416521)
chr5 (1-138)||(334296-334433)
chr5 (1-126)||(31656370-31656495)
chr5 (1-138)||(31656607-31656744)
chr5 (1-134)||(39706300-39706433)
chr5 (1-133)||(7210461-7210593)
chr5 (1-138)||(31908928-31909067)
chr5 (1-136)||(43570020-43570155)
chr5 (1-139)||(5087806-5087944)
chr5 (1-138)||(40589054-40589191)
chr5 (1-138)||(40589657-40589794)
chr5 (1-141)||(18514285-18514425)
chr5 (1-137)||(40774339-40774474)
chr5 (2-125)||(15476509-15476632)
chr5 (1-131)||(26289027-26289157)
chr5 (2-140)||(36752152-36752289)
chr5 (27-135)||(15476269-15476377)
chr5 (2-135)||(41859927-41860062)
chr5 (2-141)||(38416140-38416279)
chr5 (1-135)||(25923121-25923255)
chr5 (1-140)||(39706053-39706188)
chr5 (62-139)||(5460187-5460264)
chr5 (1-138)||(17861039-17861175)
chr5 (2-135)||(31909180-31909313)
chr5 (1-138)||(33763157-33763293)
chr5 (1-137)||(5152864-5153000)
chr5 (2-118)||(33762922-33763041)
chr5 (2-133)||(8418206-8418336)
chr5 (1-140)||(12593454-12593593)
chr5 (51-141)||(21750807-21750897)
chr5 (1-139)||(40774586-40774724)
chr5 (1-135)||(41372407-41372541)
chr5 (2-138)||(28391768-28391905)
chr5 (1-141)||(19204941-19205080)
chr5 (1-139)||(14143511-14143645)
chr5 (1-135)||(15670400-15670534)
chr5 (1-138)||(16353151-16353291)
chr5 (27-125)||(17736522-17736620)
chr5 (78-135)||(5460272-5460329)
chr5 (4-141)||(15267239-15267375)
chr5 (1-140)||(5152614-5152753)
chr5 (1-141)||(14051886-14052026)
chr5 (1-113)||(25923368-25923480)
chr5 (2-139)||(14143755-14143892)
chr5 (1-141)||(17861287-17861419)
chr5 (1-139)||(26289269-26289407)
chr5 (104-141)||(26288988-26289025)
chr5 (45-139)||(3879305-3879399)
chr5 (75-141)||(37192467-37192533)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-138)||(40601-40738)
scaffold0051 (1-140)||(40350-40489)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (1-139)||(11463-11601)
scaffold0236 (1-120)||(11231-11350)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (1-138)||(11736-11873)
scaffold0168 (1-141)||(11485-11625)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (1-138)||(45085-45222)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (1-135)||(13790-13924)
scaffold0188 (1-139)||(13541-13678)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (3-138)||(90805-90940)
scaffold0016 (3-88)||(91759-91844)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-140)||(177314-177453)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (2-136)||(65989-66123)
scaffold0045 (2-136)||(73321-73455)
scaffold0045 (1-127)||(65750-65876)
scaffold0045 (1-127)||(73082-73208)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-138)||(93188-93327)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (4-140)||(1474-1609)
scaffold1436 (1-93)||(1724-1815)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-93)||(11713-11805)
scaffold0444 (57-139)||(11638-11720)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (57-135)||(25970-26048)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (52-133)||(10920-11001)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (75-125)||(6231-6281)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (75-141)||(57019-57085)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 738; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 738; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 900
Target Start/End: Original strand, 32706981 - 32707888
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32706981 gtttttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggaccaaagcgatac 32707079  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaattaggacgaactaaatatagtttatagacatgtcatgtcacaatacaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32707080 tatctaaataattaagggactaaaaatacaatttagcctaacatttattaattaggatgaattaaatatactttatagacatgtcaagtcacaatacaca 32707179  T
Q  201 agattttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaataggaataaggatgatttggcgcgcagtttgggtggaagaattaaggaatttagtgataa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707180 agattttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaattggaataaggatgatttggc----agtttgggtggaagaattaaggaatttagtgataa 32707275  T
Q  301 ggaaattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacccttagttatttaaaaaatgctaacaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32707276 ggaaattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacctttagttatttaaaaaatgttaacaat 32707375  T
Q  401 tatatttgaatatcctactttcttaatactcattcaacacttcattttatctctatctcttgttatattcctttctttacatgtagaatgaatttgtatg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32707376 tatatttgaatatcctactttcttaacactcattcaacatttcattttatctctatctcttattatattcctttctttacatgtagaatgaatttggatg 32707475  T
Q  501 tacatataaagcattttcttttttagaatttgaaagactaggtggtcggttgccctacacatgaagttattggacatacaagactggttggccaccctgc 600  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32707476 tacatatagagcattttcttttttagaatttggaagact-ggtggtcggttgccctacacatgaagttattggacatacaagactgtttggccaccctgc 32707574  T
Q  601 aaaggaaattaaatatgagaaaccaaagctaactaaaactaatagtaaaataaacaaaagagccacatatggaggggtgca--------------cctaa 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||    
T  32707575 aaaggaaattaaatatgagaaaccaaagctaactaaaactaatagtaaaataaacaaaagagccacatatggaggggtgcacctaaaccttaaatcctaa 32707674  T
Q  687 actcataactctattgttttaataattaagacaataagcacttgaatgatgttggttcaatataaactccatatttatttttcgttgttttaaccaaatt 786  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707675 actcataactctattgtttcaataattaagacaataatcacttgaatgatgttggttcaatataaactacatatttatttttcgttgttttaaccaaatt 32707774  T
Q  787 gatatcaattaagttattattccagtcgcgatcactttctaattttagcaaaataaaattttaaacattgcatgattagtactctaggtacatagaaagt 886  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707775 gatatcaattaagatattattccagtcacgatcactttctaattttagcaaaataaaattttaaacattgcatgattagtactctaggtacatagaaagt 32707874  T
Q  887 gaaggatgattagt 900  Q
    ||||||||||||||    
T  32707875 gaaggatgattagt 32707888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 8769531 - 8769666
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  8769531 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 8769630  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8769631 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttag 8769666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18731156 - 18731019
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18731156 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatac 18731057  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18731056 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18731019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43140833 - 43140701
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43140833 ttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatacta 43140734  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43140733 tctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 43140701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31715770 - 31715631
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31715770 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggtcaaagcgatac 31715671  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31715670 tacctaaatagttaagagacaaaaaatacaatttagccta 31715631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23437289 - 23437149
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23437289 gtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 23437190  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  23437189 tacctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagcctaa 23437149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35085875 - 35085736
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35085875 tttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatact 35085776  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35085775 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35085736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 10625333 - 10625471
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||  |||||    
T  10625333 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaatgatac 10625432  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10625433 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10625471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 47250796 - 47250933
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  47250796 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatact 47250895  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47250896 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 47250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 2357305 - 2357444
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||  |||| |||||||    
T  2357305 tttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacgatact 2357404  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2357405 acctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagtctaa 2357444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9034564 - 9034703
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  9034564 gtttttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagcgatac 9034663  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9034664 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagccta 9034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 34568719 - 34568585
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34568719 tttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 34568620  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34568619 acctaaatagttaaaggacaaaaaatacaatttag 34568585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 44448162 - 44448295
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44448162 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatact 44448261  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44448262 acttaaataattaaaggactaaaaatccaattta 44448295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9230926 - 9231065
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||||||||||| |||| ||||||    
T  9230926 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtgaccaaaataaatcaaatcttaattaagggaccaaaacgatac 9231025  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9231026 tacctaaatcgttaagggaccaaaaatacaacttagccta 9231065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11678840 - 11678702
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  11678840 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatat 11678741  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11678740 tatctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 11678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 31715871 - 31716008
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  31715871 gtttttgaattaaaactaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttataggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 31715969  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31715970 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31716008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 35085989 - 35086127
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35085989 gtttttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatac 35086088  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35086089 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 35086127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 23472805 - 23472942
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23472805 gtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgaaac 23472904  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23472905 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 23472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 11678953 - 11679088
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11678953 tttttgaat-aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 11679051  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11679052 acttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 11679088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23472730 - 23472590
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||  |||||| ||||||||||  || |||| ||||||    
T  23472730 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaattttaattaaaagaccaaaacgatac 23472631  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23472630 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 23472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2357204 - 2357066
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2357204 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 2357105  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  2357104 tatttaaatagttaagagatcaaaaatgcaatttagcct 2357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39118147 - 39118013
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  39118147 gtttttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaagggatcaaaacgatac 39118048  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39118047 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39118013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 44486181 - 44486318
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||  | | |||||||| ||| |||||||||||    
T  44486181 gttttggaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaatattaattaaaggaccaaagcgatac 44486280  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44486281 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44486318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21522355 - 21522226
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21522355 gtttttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaattttaattaagggaccaaagcgatac 21522258  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 132  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  21522257 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaat 21522226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 26920166 - 26920302
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26920166 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 26920265  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
     | | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26920266 aaccgaaatagataagggattaaaaatgcaatttagc 26920302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41758815 - 41758691
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  41758815 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 41758716  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    || |||||||||||||||| |||||    
T  41758715 atttaaatagttaagggacaaaaaa 41758691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5238588 - 5238449
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5238588 gtttttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 5238489  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  5238488 tacctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagccta 5238449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24119851 - 24119713
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  24119851 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatac 24119752  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||    
T  24119751 tatctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaatttagcct 24119713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8769419 - 8769279
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||    
T  8769419 gtttttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattcagggaccaaaacaatac 8769320  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8769319 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 8769279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 43726491 - 43726630
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||| | ||||    
T  43726491 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggaactaaaacaatac 43726590  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
     | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43726591 cacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 43726630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 21522467 - 21522599
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  21522467 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatgc 21522564  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21522565 tacctaaatagttaagggaccaaaaacacaattta 21522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 47251146 - 47251283
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||| || |||||| ||||    
T  47251146 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaagcaatac 47251244  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47251245 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcct 47251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32706869 - 32706729
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||   ||| | ||||    
T  32706869 gtttttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggtcaaaaacaatac 32706770  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32706769 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 32706729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 47250694 - 47250570
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||    
T  47250694 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaatgatac 47250595  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||    
T  47250594 tacctaaataattaagggacaaaaa 47250570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38842168 - 38842035
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  || |     
T  38842168 gtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggatcaaaataaatcgaattttaattaaggga-caaaatgacat 38842071  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38842070 tatcaaaatagttaaggaaccaaaattacaatttag 38842035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44448050 - 44447916
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | ||||    
T  44448050 gtttttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaacaatac 44447952  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  44447951 tatctaaatagttaacggaccaaaaatgcaatttag 44447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 36507058 - 36507196
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  36507058 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatac 36507157  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  36507158 taattaaatagttaagagaccaaaaacataatttagcct 36507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 473429 - 473569
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||  || |||||||||||    
T  473429 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaagcgatac 473528  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||| | | ||| ||| ||||||| |||||    
T  473529 tacctaaatagttaaagaattaacaatgcaatttaacctaa 473569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 34568833 - 34568977
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  34568833 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggacaaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagtgatac 34568932  T
Q  101 ----tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
        ||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  34568933 tacataaataaatagtaaagagaccaaaaatataatttagcctaa 34568977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 48704061 - 48704193
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48704061 tttgaattaaa-ctaacataaaggaccaaa-tgtgtatcggacagaaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 48704158  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
     ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  48704159 cctaaatagttaagggaccaaaaatatcatttagc 48704193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9230813 - 9230716
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9230813 gtttttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgat 9230716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37143900 - 37143764
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | |||||   ||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  37143900 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaagttaagataccaaat-aaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 37143802  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37143801 taattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 37143764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 44485581 - 44485718
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||     
T  44485581 gttttggaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaatattaattaaaggaccaaagcgataa 44485680  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44485681 tacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44485718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 38842271 - 38842410
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |  ||| ||||  | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |    
T  38842271 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagttagag-accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatgc 38842369  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  38842370 tacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttagtctaa 38842410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43726378 - 43726241
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  43726378 tttttgaattaaaactaatgaaaag-atcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaat-aaatcaaattttaattaagggaccaaagcgagact 43726281  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43726280 acttaaataattaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 43726241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47305206 - 47305127
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47305206 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 47305127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22338410 - 22338272
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| |||    
T  22338410 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggtaccaaagcaata 22338311  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22338310 ctaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 22338272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 31623673 - 31623810
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||| | ||||| || ||||  |||| ||||||    
T  31623673 gtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatcaaattttacttgagggtccaaaacgatac 31623772  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31623773 tacctgaataattaaggtactaaaaatgcaatttagcc 31623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 473326 - 473191
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||   ||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  473326 gtttttgacttaaaactaaaggaaaggac---aatgtgtaacagagaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 473230  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  473229 tgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaatttagcct 473191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28349630 - 28349763
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  28349630 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaaacaatac 28349728  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  28349729 taattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 28349763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 22338523 - 22338663
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gtta--atggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||  |   ||||||| ||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  22338523 tttttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgacataccaaaataaatgaaattttaattaagggacgaaagcgat 22338622  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22338623 actaattaattagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 22338663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 37144070 - 37144151
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  37144070 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 37144151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050383
Alignment:
Q  13 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 111  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||  || || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| | ||| ||  |||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatag 43050411  T
Q  112 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  43050410 ttaagggaccaaaaagacaaattagcct 43050383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15326951 - 15326869
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  15326951 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaaaaactaaaaatgcaatttagcctaa 15326869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19543553 - 19543503
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  19543553 ttttaattaagggatcaaagcgatactaaataaatagttaagggacgaaaa 19543503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10625177 - 10625104
Alignment:
Q  67 aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10625177 aaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 10625104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 47251027 - 47250942
Alignment:
Q  9 attaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag-agacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47251027 attaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 23437402 - 23437494
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaag 94  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| | ||||   |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23437402 tttttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 23437494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 40740044 - 40740094
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  40740044 ttttaattaagggaccaaagcgatactaaataaataattaagggactaaaa 40740094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Original strand, 47305377 - 47305490
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  ||| || |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  47305377 tttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggagcaaaacgatact 47305476  T
Q  102 atctaaatagttaa 115  Q
    |  |||||||||||    
T  47305477 aattaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Original strand, 24446296 - 24446360
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24446296 ttttaattgtgggatcaaagcgatagtaattaaatagttaagggacaaaaataacaatttagcct 24446360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 36506948 - 36506848
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    |  | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36506948 tttttaaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaaggatggaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaaacgatact 36506849  T
Q  102 a 102  Q
    |    
T  36506848 a 36506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 24119955 - 24120002
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 49  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24119955 ttttttaattaaaattaacagaaagaaccaaaatatgtaacagagaga 24120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 36720542 - 36720491
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  36720542 ttttagttaagggaccaaagcgataccaactaaatacttaagggactaaaaa 36720491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43705008 - 43704957
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43705008 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43704957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 45457099 - 45457149
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  45457099 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52915089 - 52914950
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  52915089 gtttttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 52914990  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52914989 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 52914950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40067485 - 40067347
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||     
T  40067485 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatat 40067386  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40067385 tacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcct 40067347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21218096 - 21218233
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21218096 gtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 21218195  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21218196 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 21218233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29864312 - 29864175
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29864312 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 29864213  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  29864212 acctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 29864175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32384790 - 32384653
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  32384790 gtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatac 32384691  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32384690 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 32384653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9010642 - 9010503
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  9010642 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 9010543  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9010542 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9010503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 29864424 - 29864559
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29864424 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 29864523  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29864524 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 29864559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1157455 - 1157589
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  1157455 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 1157554  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1157555 tacctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 1157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25218221 - 25218095
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  25218221 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatat 25218122  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  25218121 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 25218095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 54136227 - 54136090
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54136227 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 54136128  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54136127 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54136090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21217982 - 21217846
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21217982 ttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 21217883  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21217882 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 21217846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 9010754 - 9010892
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  9010754 gtttttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagagatac 9010853  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9010854 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 9010892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 12381303 - 12381441
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  12381303 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatgaaagcgatat 12381402  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  12381403 tgcctaaatagtttagggaccaaaaatacaattaagcct 12381441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 52915192 - 52915333
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  52915192 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatac 52915291  T
Q  101 tatctaaatagttaagggac--taaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  52915292 tacctaaatagttaagggacaaaaaaaatgcaatttagccta 52915333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10014601 - 10014465
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10014601 gtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaagcaatac 10014503  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10014502 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10014465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10021742 - 10021606
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10021742 gtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaagcaatac 10021644  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10021643 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10021606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27347734 - 27347597
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  27347734 gtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 27347635  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27347634 tatctaaatagtcaagggaccaaaaatataatttagcc 27347597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33626001 - 33625868
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33626001 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 33625902  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33625901 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 33626113 - 33626250
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33626113 gttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 33626212  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33626213 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 33626250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 53645588 - 53645463
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  53645588 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagggaccaaagcgatac 53645489  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  53645488 tatctaaatagttaagggacaaaaaa 53645463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 43317128 - 43317267
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  43317128 gtttttcaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 43317227  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  43317228 tacctaaatagttaggagactaaaaatgcaatttagccta 43317267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 46200610 - 46200483
Alignment:
Q  12 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 111  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  46200610 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 46200511  T
Q  112 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46200510 ttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 46200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44432873 - 44433011
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44432873 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagtgatac 44432972  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  44432973 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 44433011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 45911823 - 45911961
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  45911823 gtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 45911922  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45911923 tacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 45911961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2739016 - 2738883
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2739016 tttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatact 2738917  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2738916 acttaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 2738883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 33882198 - 33882331
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  33882198 gtttttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 33882297  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33882298 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25058970 - 25058830
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25058970 gtttttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 25058871  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  25058870 tacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatttaacctaa 25058830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34958967 - 34958832
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34958967 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagttaa-ggaacaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 34958869  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34958868 acctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 34958832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43317016 - 43316877
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  43317016 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaagggaccaaagcgatac 43316917  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43316916 taccttaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcctaa 43316877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4966008 - 4965889
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4966008 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggagcaaagcgatac 4965909  T
Q  101 tatctaaatagttaagggac 120  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  4965908 tacctaaatagttaaaggac 4965889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 25218333 - 25218448
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  25218333 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacgatac 25218432  T
Q  101 tatctaaatagttaag 116  Q
    || |||||||||||||    
T  25218433 tacctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 18862689 - 18862827
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18862689 gttttttaattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaagcgata 18862788  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18862789 ctacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18862827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 37515702 - 37515836
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37515702 gttttttaattaaaactaatggaattgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 37515801  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37515802 tacctaaatagttaagggactaaaaataaaattta 37515836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45911716 - 45911582
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  45911716 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 45911617  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || |||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  45911616 tacctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 45911582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 46621176 - 46621310
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  46621176 gttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaacgatac 46621275  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46621276 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 46621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 25593340 - 25593477
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  25593340 gtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatac 25593439  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25593440 tccctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 25593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40067597 - 40067734
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40067597 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagcgatac 40067696  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40067697 tacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcc 40067734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44710540 - 44710403
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||||| || |||||||||||    
T  44710540 gtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaatttttgttaagagaccaaagcgatac 44710441  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44710440 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 45683254 - 45683117
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  45683254 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatac 45683155  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||    
T  45683154 tacctaaatagttaagagatcaaaaatgtaatttagcc 45683117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46621064 - 46620931
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  46621064 gtttttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatac 46620965  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46620964 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 46620931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 48210084 - 48209947
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48210084 tttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatact 48209985  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  48209984 acctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 48209947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38866535 - 38866395
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  38866535 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaatggaccaaagcgatac 38866436  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38866435 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 38866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 27347846 - 27347985
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  27347846 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatac 27347945  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  27347946 tacctaaatagttaaggaacataaaatgcaattaagccta 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22830933 - 22830795
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22830933 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagctatac 22830834  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22830833 tagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattcagcct 22830795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29970329 - 29970196
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29970329 gtttttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagttaatg-accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatac 29970231  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29970230 tacctaaatagttatgggaccaaaaatgcaattta 29970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 54191855 - 54191969
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 122  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54191855 aaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgctatctaaatagttaagggacca 54191954  T
Q  123 aaaatacaatttagc 137  Q
    |||||||||||||||    
T  54191955 aaaatacaatttagc 54191969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 45683366 - 45683503
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||||| |||     
T  45683366 gtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaaggaaccaaagcaatat 45683465  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45683466 tacctaaatagttaaggaaccaaaaatacaatttagcc 45683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 28570671 - 28570806
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||     
T  28570671 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacc 28570770  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  28570771 acctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 28570806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 8246995 - 8247129
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||     
T  8246995 gtttttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagaaatat 8247094  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8247095 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 8247129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 1205626 - 1205763
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| || ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1205626 gtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaagggacaaaaataaatcgaattttaattaagggagaaaagcgatac 1205725  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1205726 tgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1205763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 34959081 - 34959214
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |    
T  34959081 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgataat 34959180  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  34959181 acctaaatagttaagggaccaaaattgcaattta 34959214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46535659 - 46535523
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |  ||| |||   ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  46535659 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgaacgaga-agaaactaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 46535561  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46535560 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 46535523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 44710653 - 44710785
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  44710653 tttttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaaacgatact 44710752  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    |  |||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  44710753 acataaatacttaagggatcaaaaatgcaattt 44710785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8751424 - 8751289
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||    
T  8751424 gttttttaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaattatac 8751325  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  8751324 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttag 8751289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25977906 - 25977771
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||||||||     
T  25977906 gtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaagcgatag 25977807  T
Q  101 tatctaaatagttaaggga-ctaaaaatacaattta 135  Q
    || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25977806 tacctagatagttaagggaccaaaaaatacaattta 25977771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 43969777 - 43969916
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43969777 tttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaagggaccaaagtaaatcgaattttaatcaagggatcaaaacgatact 43969876  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  43969877 acataaatagttaacgaaccaaaaataaaatttagcctaa 43969916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1157342 - 1157206
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt---taatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| ||||||||| ||||  | |||||||||||| | |||||||||    
T  1157342 tttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaggaaccaaagcgat 1157243  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1157242 attacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 1157206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1205514 - 1205381
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||   || || | |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1205514 gttttttaattaaaactaacggcaatgatcgaaatgtgtaacagagaaa-gttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 1205416  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1205415 tacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaattta 1205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 4793848 - 4793981
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4793848 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatac 4793947  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || |||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  4793948 tacctaaata-ataaggggtcaaaaatacaattta 4793981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24504077 - 24503939
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaa-ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | | |||| | |||    
T  24504077 gtttttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaaccaaaacaata 24503978  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24503977 ctacctaaataattaagggattaaaaatgcaatttagcc 24503939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 24504189 - 24504315
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||| |||||     
T  24504189 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaaacgatat 24504288  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24504289 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 24504315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 32385062 - 32385199
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32385062 ttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggat-aaagcgatact 32385160  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32385161 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32385199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8246904 - 8246769
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||     
T  8246904 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatat 8246806  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  8246805 tatctaaataattaa-ggaccaaaaatacaatttagcc 8246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 11102224 - 11102364
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  11102224 tttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatac 11102323  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11102324 taattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 11102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21051496 - 21051360
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  21051496 gtttttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaagagatcaaagcgatgc 21051397  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21051396 tacctaaataattaagggacaaaaaatgtaatttagc 21051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 46535771 - 46535907
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||| ||||| ||||||| | |||| || |||||||||  ||| |||| | ||||    
T  46535771 gttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaaggaccaagataaatagaattttaattagaggaccaaaacaatac 46535870  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46535871 tacctaaatagttaagtgaccaaaaatacaatttagc 46535907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 22831046 - 22831181
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22831046 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgata 22831145  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22831146 ctagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattta 22831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 38866648 - 38866783
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaag-aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||  | | ||||||||||    
T  38866648 gttttttatttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaaataaatcgaattttaattagagtaccaaagcgata 38866747  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38866748 ctacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaattta 38866783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 46200736 - 46200871
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46200736 ttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgttacta 46200835  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  46200836 cctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 46200871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 54191725 - 54191638
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 88  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  54191725 gtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga 54191638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44170116 - 44169978
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   || |||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  44170116 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagcgatac 44170017  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44170016 taattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44169978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 4966117 - 4966257
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||  |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  4966117 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagagacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaaacgatac 4966216  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
     | ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||    
T  4966217 cacctaaatagttaaggggcaagaaatgcaatttaccctaa 4966257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 10014716 - 10014851
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||     
T  10014716 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatacgatactac 10014814  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10014815 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10014851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 10021857 - 10021992
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||     
T  10021857 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatacgatactac 10021955  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10021956 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10021992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15985604 - 15985469
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  15985604 gtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgata 15985505  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15985504 ctagcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 15985469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 11242740 - 11242849
Alignment:
Q  28 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    |||||||||| |||| || |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11242740 accaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 11242839  T
Q  128 acaatttagc 137  Q
      ||||||||    
T  11242840 gtaatttagc 11242849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 44428708 - 44428616
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  44428708 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 44428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9657804 - 9657667
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  ||||||  |||||   | ||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  9657804 gtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgata 9657706  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9657705 ctaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 21885073 - 21885178
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  21885073 gtttttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagtgaccaaagcgatac 21885172  T
Q  101 tatcta 106  Q
    ||||||    
T  21885173 tatcta 21885178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 54136340 - 54136474
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| | || |    
T  54136340 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaacagaa----gttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaaaggatcaaaacaattc 54136435  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  54136436 tacctaaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagcct 54136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 44170288 - 44170370
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  44170288 accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagtctaa 44170370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 21051596 - 21051688
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  21051596 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 21051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 9657896 - 9658034
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||  | ||||||||| |||| |||| |||||    
T  9657896 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaggggaccaaaacgata 9657994  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9657995 ctaattaaatagttaagggatcaaaaatataatttagcct 9658034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44428594 - 44428512
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  44428594 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 44428512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42779657 - 42779573
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 85  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| |  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  42779657 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattttaattaag 42779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43969611 - 43969556
Alignment:
Q  81 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43969611 ttaagggaccaaagcaatactacataaataattaagggaccaaaaatacaatttag 43969556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28504640 - 28504590
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  28504640 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 41610528 - 41610578
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  41610528 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 41610578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 46307619 - 46307569
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  46307619 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 46307569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017815
Alignment:
Q  97 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10017815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43969640 - 43969599
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  43969640 aaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1826040 - 1826174
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1826040 gtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 1826139  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1826140 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1826174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1860485 - 1860619
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1860485 gtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 1860584  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1860585 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1860619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 23244764 - 23244904
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  23244764 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaactaagggaccaaagcgatac 23244863  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23244864 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatctaacctaa 23244904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 24456901 - 24457041
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24456901 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaggcgatac 24457000  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24457001 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 24457041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 37393726 - 37393866
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37393726 gtttttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatac 37393825  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37393826 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagtctaa 37393866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37393614 - 37393475
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  37393614 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatac 37393515  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37393514 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 37393475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 3869198 - 3869336
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  3869198 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaaaaaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 3869297  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3869298 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 3869336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18017927 - 18017787
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||| ||||    
T  18017927 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtgaccaaagcaatac 18017828  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18017827 tacctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagcctaa 18017787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35224016 - 35224155
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35224016 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatac 35224115  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35224116 taactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35224155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30872919 - 30872781
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  30872919 ttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatact 30872820  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30872819 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 30872781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40040299 - 40040162
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  40040299 gtttttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaattttaattaaggtaccaaagcgatac 40040200  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40040199 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 11198454 - 11198594
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  11198454 gttttttaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 11198553  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11198554 tgtctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11198594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5416949 - 5416810
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||| ||||||    
T  5416949 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaaatcaatcgaattttaattagaggaccaaaacgatac 5416850  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5416849 tacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 5416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31230750 - 31230624
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  31230750 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 31230651  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  31230650 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 31230624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21515449 - 21515586
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21515449 gtttttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 21515548  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21515549 tacgtaaatagttaaaagactaaaaatgtaatttagcc 21515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 31230862 - 31230999
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  31230862 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcaatac 31230961  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31230962 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31230999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 14920660 - 14920792
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  14920660 gttttcgaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 14920759  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14920760 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 18621997 - 18622133
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18621997 tttttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 18622096  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  18622097 atctaaatagttaagagaccaaaagtgcaatttagcc 18622133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30650327 - 30650187
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  30650327 gttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 30650228  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30650227 tacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagcctaa 30650187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 119253 - 119119
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||    
T  119253 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaagtaatac 119155  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  119154 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 119119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35223911 - 35223772
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  35223911 gtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtcaagggaccaaagcgatac 35223812  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35223811 tacctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35223772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6843634 - 6843493
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtta--atggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  6843634 gttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcatagtgat 6843535  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  6843534 actacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 6843493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18018035 - 18018169
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18018035 gtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggagcaaagcaatac 18018134  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18018135 ttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40032564 - 40032426
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  40032564 gttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaagagaccaaagcgata 40032465  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40032464 ctacctaaataattaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 40032426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11639187 - 11639050
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  11639187 ttttgaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgacgcta 11639088  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11639087 cctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagccta 11639050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 18914500 - 18914637
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  | |||||| |    
T  18914500 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacaagagcgatgc 18914599  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18914600 tacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 18914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39912054 - 39911917
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||     
T  39912054 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagcgaccaaagagataa 39911955  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  39911954 tatctaaataattaagggacaaaaaatgcaaattagcc 39911917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 29027221 - 29027358
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||    ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  29027221 gtttttgaattaaaactaacgaaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 29027316  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 142  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29027317 tacctaaatagttaagagaccaaaaatataatttagcctaac 29027358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8654073 - 8653935
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  8654073 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatac 8653974  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8653973 tacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 8653935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26736262 - 26736128
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | ||||||  |||||| |||||||||||    
T  26736262 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaattttaaaaaagggaccaaagcgatac 26736163  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26736162 tacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 26736128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40094608 - 40094487
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40094608 ttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacc 40094509  T
Q  105 taaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40094508 taaatagttaagggacaaaaaa 40094487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 7041878 - 7042012
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||     |||||| |||||||||||    
T  7041878 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt-----aagggaccaaagcgatac 7041972  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7041973 tatataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7042012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 30568525 - 30568660
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  30568525 gtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaaataagggaccaaatcgatac 30568624  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30568625 taactaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 30568660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39240166 - 39240031
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  39240166 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatact 39240067  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39240066 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 39240031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14920548 - 14920410
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| | ||||    
T  14920548 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgaccaaaacaatac 14920449  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  14920448 tacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattaagcct 14920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 39912168 - 39912294
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39912168 gtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 39912267  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  39912268 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 39912294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1825945 - 1825809
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || || | ||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  1825945 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataa-tcaaattttaattaagagatcaaaacgatgct 1825847  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1825846 ccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1860390 - 1860254
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || || | ||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  1860390 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataa-tcaaattttaattaagagatcaaaacgatgct 1860292  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860291 ccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1860254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7041766 - 7041653
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7041766 gtttttcaattaaaactttcgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 7041667  T
Q  101 tatctaaatagtta 114  Q
    || |||||||||||    
T  7041666 tacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33542521 - 33542383
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  33542521 gtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaaggagagaga-gttaaaataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaagcgata 33542423  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33542422 ctaattaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcct 33542383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44255001 - 44254862
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44255001 tttttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 44254902  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  |||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||    
T  44254901 acttaaatagttaaggatccaaaaatgcaatttagtctaa 44254862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 8654185 - 8654319
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | |||     
T  8654185 gtttttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggagcaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacaatat 8654284  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8654285 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 9495272 - 9495406
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||| ||||    
T  9495272 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaactttaattaacggaccaaagcaatac 9495371  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9495372 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 16645795 - 16645931
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacaga---gagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| ||   |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  16645795 tttttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgatgagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaat 16645894  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16645895 actacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23244652 - 23244518
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||    
T  23244652 gtttttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatac 23244553  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  ||||| ||||  |||| |||||| |||||||    
T  23244552 tacataaatggttagtggaccaaaaatgcaattta 23244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24456815 - 24456733
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24456815 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 24456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 39240268 - 39240402
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||| || |||| ||||||    
T  39240268 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaaacgatac 39240367  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  39240368 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 39240402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21512531 - 21512411
Alignment:
Q  19 acataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21512531 acataaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgatact-cctaaatagttaaggg 21512433  T
Q  119 actaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21512432 acgaaaaatacaatttagccta 21512411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 44255112 - 44255249
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | || |     
T  44255112 tttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacaatccc 44255211  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  44255212 acctaaatagttaaaggatcaaaaatacattttagcct 44255249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 119366 - 119502
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| | | |||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  119366 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattttaattaagggactaaagcgatact 119465  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  119466 acctaaatagttaagggatcaacaatgcaatttagcc 119502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 758593 - 758733
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||    
T  758593 gtttttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaaggaccaaagtgatac 758692  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  758693 tacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcctaa 758733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 12873297 - 12873435
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||  |||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||||    
T  12873297 gtttttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgatac 12873394  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12873395 taattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 12873435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36344098 - 36343960
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||   ||||    
T  36344098 gtttttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaaggaccaaaattaatcgaattttaattaagggaccaaaataatac 36343999  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  36343998 tacctaaataattaa-gaaccaaaaatacaatttagccta 36343960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 758481 - 758347
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  758481 gtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaattttaattaagggaccaaagcgatac 758382  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  758381 tacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 26736374 - 26736492
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||    
T  26736374 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtatcgaagagaagttaaaggaccacaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcaatac 26736473  T
Q  101 tatctaaatagttaaggga 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26736474 tatctaaatagttaaggga 26736492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 28207002 - 28207142
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  28207002 gtttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaac-gatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtcaaagcgata 28207100  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28207101 ctagcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcctaa 28207142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 40032706 - 40032815
Alignment:
Q  30 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac-taaaaata 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  40032706 caaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaagggacaaaaaaata 40032805  T
Q  129 caatttagcc 138  Q
    ||||||||||    
T  40032806 caatttagcc 40032815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3869084 - 3868946
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatat---gtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcga 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  3869084 gtttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtga 3868985  T
Q  98 tactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||||  |||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  3868984 tactacataaatagttaagggatcaaaagtgcaatttag 3868946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Original strand, 6844715 - 6844823
Alignment:
Q  27 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  6844715 gaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctacctaaatagttaagagaccaaaaa 6844814  T
Q  127 tacaattta 135  Q
    | |||||||    
T  6844815 tgcaattta 6844823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 40094724 - 40094864
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |  |||    
T  40094724 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacagtac 40094823  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  40094824 taattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgcctaa 40094864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18914396 - 18914262
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcg-agttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| | | |||||||||||    
T  18914396 tttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttttaattaaagaaccaaagcgatac 18914297  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | |     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18914296 ttt-----tagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 18914262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12873193 - 12873055
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  12873193 tttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaaggaccaaagtgatact 12873094  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |  ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  12873093 aattaaatagttaagggattaaaatcataatttagccta 12873055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28206903 - 28206766
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||   ||||   ||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  28206903 gtttttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaac-gatagaaaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagggaccaaagcgata 28206805  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  28206804 ctagcaaaatagttatgggaccaaaaattcaatttagcc 28206766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 44678433 - 44678515
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44678433 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatta 44678515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29027109 - 29026971
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |  ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  29027109 gttttagaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatac 29027010  T
Q  101 tatctaaa----tagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || |||||    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  29027009 tacctaaatagctagttaagggaccaaaaatgcaattta 29026971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 33542634 - 33542731
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||||||    
T  33542634 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaattttaattaaatgaccaaagcgata 33542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 5417062 - 5417197
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagaga-gacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || ||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5417062 gtttttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaac-gagaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgata 5417160  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5417161 ctacctaaatagttaagggaccaaaaatgcagtttag 5417197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44678396 - 44678316
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44678396 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 44678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 30873027 - 30873166
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||   ||||    
T  30873027 gtttttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggaatcaaactaatac 30873126  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30873127 taccaaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagccta 30873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Original strand, 44678518 - 44678596
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44678518 ggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaac-aaaaatacaatttag 44678596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 410611 - 410729
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||| ||||||    
T  410611 gtttttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaaacgatac 410710  T
Q  101 tatctaaatagttaaggga 119  Q
    ||   ||||||||||||||    
T  410711 taataaaatagttaaggga 410729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35486008 - 35485868
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||||||  |||||||||     
T  35486008 gtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaagggactaaagcgatat 35485909  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  | |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  35485908 taattgaatagttaagggatcaaaaacataatttagcctaa 35485868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5526006 - 5525882
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| | ||||||| | |||  |||| | || || |||| |||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  5526006 gtttttgaattaaaactaaaggaaatggccaaaatgtataa--gagataagtaaagggactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaatcgatac 5525909  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  5525908 tacctaaatagttaagggactaaaaat 5525882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 30568413 - 30568331
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 83  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30568413 gtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 30568331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26217206 - 26217072
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||| ||  ||||  |||||    
T  26217206 gtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaagggccaaaatgatac 26217108  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26217107 tacttaaatagttaagggaccaaaaaaataatttag 26217072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 40040412 - 40040475
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 65  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40040412 tttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaa 40040475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 132
Target Start/End: Original strand, 35486186 - 35486243
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  35486186 ttttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaat 35486243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Original strand, 11639378 - 11639422
Alignment:
Q  95 cgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11639378 cgatactacctaaatagttaagggacgaaaaatgcaatttagcct 11639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 7117111 - 7117162
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  7117111 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 7117162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9495169 - 9495106
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  9495169 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagttaagagaccaaa 9495106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43633186 - 43633135
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43633186 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43633135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 11639299 - 11639353
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa 55  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11639299 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaa 11639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32733847 - 32733765
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 84  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32733847 tttttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 32733765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19302322 - 19302273
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac 50  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19302322 gtttttgaattaaaactaacgcaaaagaccacaatgtgtaacagagagac 19302273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9174038 - 9173901
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  9174038 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatac 9173939  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9173938 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9173901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 33545071 - 33545211
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33545071 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgatac 33545170  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  33545171 tacctaaatagttaatgcaccaaaaatataatttagcctaa 33545211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3338614 - 3338475
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3338614 gtttttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 3338515  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3338514 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 3338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25551484 - 25551346
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25551484 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaagggaccaaagcaatac 25551385  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25551384 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 25551346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 25551585 - 25551719
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  25551585 gtttttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatac 25551684  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25551685 tacttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 25551719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33329343 - 33329205
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  33329343 gtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatac 33329244  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33329243 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcct 33329205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35132738 - 35132600
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  35132738 gtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattatgggaccaaagcgatac 35132639  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35132638 tacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 35132600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 6220305 - 6220441
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||    
T  6220305 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattgatggaccaaagcgatac 6220404  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6220405 tacctaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagc 6220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3289067 - 3288929
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3289067 gtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 3288968  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  3288967 tacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcct 3288929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24605011 - 24604878
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24605011 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagt-aagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 24604913  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24604912 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 35119060 - 35119174
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35119060 gtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 35119159  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    || ||||||||||||    
T  35119160 tacctaaatagttaa 35119174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33544958 - 33544825
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  33544958 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatact 33544859  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33544858 acttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33544825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11524901 - 11524778
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11524901 tttttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 11524802  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  11524801 acctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29010091 - 29009956
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29010091 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 29009992  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29009991 tacgtaaatagttaagggaccaaaaattcaatttag 29009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 3289159 - 3289296
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||     
T  3289159 gtttttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggcaccaaagcgatat 3289258  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  3289259 tacctaaatagtttagggaccaaaaatgcaatttagcc 3289296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12903358 - 12903221
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  12903358 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 12903259  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  12903258 tatctaaataattaaagaaccaaaaatacaatttagcc 12903221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14337039 - 14336902
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14337039 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 14336940  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  14336939 tagctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcc 14336902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 3338727 - 3338862
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||| ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3338727 ttttcgaattaaaactaacgaaa--gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaacgatact 3338824  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3338825 acttaaatagttaagggaccaaaaataaaatttagcct 3338862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6220193 - 6220059
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||     
T  6220193 gtttttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagacgaaagcgatat 6220094  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6220093 taattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 6220059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 7537854 - 7537992
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7537854 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacaaaagcgatac 7537953  T
Q  101 tatctaaatagttaagggac-taaaaatacaatttagcc 138  Q
     |  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7537954 cacttaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttagcc 7537992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 24605123 - 24605248
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24605123 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatac 24605221  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24605222 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 24605248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31029661 - 31029527
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31029661 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 31029562  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  31029561 tacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 31029527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33346615 - 33346501
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33346615 gtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 33346516  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    || ||||||||||||    
T  33346515 tacctaaatagttaa 33346501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1158727 - 1158599
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacat--aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  1158727 gtttttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgat 1158628  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  1158627 actacctaaatagttaaaggaccaaaaat 1158599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 19135695 - 19135836
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19135695 gttttttaattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagatcaaaacgatac 19135794  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 142  Q
    || ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19135795 tacctaaatacttaatggaccaaaaatgcaatttagcctaac 19135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 31029773 - 31029910
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| | ||||    
T  31029773 gtttttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggactaaaacaatac 31029872  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31029873 tatttaaatggttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31029910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2949428 - 2949293
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2949428 gtttttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaacaaag-----ttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 2949334  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  2949333 tacttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagcctaa 2949293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 14337151 - 14337288
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  14337151 gtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagtgatac 14337250  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14337251 tacctaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 14337288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 1860735 - 1860871
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1860735 gtttttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagagatac 1860834  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1860835 -acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1860871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11524792 - 11524706
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11524792 gttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagc 11524706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 24548490 - 24548615
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  24548490 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagtgatac 24548589  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||    
T  24548590 taattaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 2814560 - 2814698
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||    
T  2814560 gtttttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatac 2814659  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  2814660 taattaaatagttaagagaccaaaaacataatttggcct 2814698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 11525015 - 11525152
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  || | |||||  |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11525015 gttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaggaaa-gttaagagaccaaaataaattgaattttaaataagggaccaaaccgatac 11525113  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11525114 tacctaaattgttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 11525152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 29010203 - 29010341
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||  ||  || ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  29010203 gtttttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggggccaaaataaatcgaattttagttaagggaccacagcgatac 29010302  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  29010303 tacataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaatttagcct 29010341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 1158840 - 1158978
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  1158840 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaagggaccaaaataaatcaaattt-aattaagggaccaaagcgatac 1158937  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  1158938 tacttaaatagttaaggtaccaaaaatgcaagttagcctaa 1158978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32283134 - 32283026
Alignment:
Q  30 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 129  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||     
T  32283134 caaaatgtgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatat 32283035  T
Q  130 aatttagcc 138  Q
    |||||||||    
T  32283034 aatttagcc 32283026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Original strand, 33548180 - 33548244
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33548180 ttttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaattcaatttagcct 33548244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 33972455 - 33972547
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  33972455 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 33972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 35132850 - 35132977
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||           ||||||| ||||||| |||    
T  35132850 gtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataaat-----------taagggaccaaagcggtac 35132938  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35132939 tacctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagcct 35132977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13155973 - 13155842
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  13155973 tttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 13155874  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13155873 ctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13155842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13160829 - 13160698
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  13160829 tttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 13160730  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13160729 ctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 13156088 - 13156209
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||     ||||    
T  13156088 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atac 13156182  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  13156183 tacctaaatagttaagggacaaaaaat 13156209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 13160944 - 13161065
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||     ||||    
T  13160944 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atac 13161038  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  13161039 tacctaaatagttaagggacaaaaaat 13161065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Original strand, 29999653 - 29999767
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29999653 tttttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatact 29999752  T
Q  102 atctaaatagttaag 116  Q
    |  ||||||||||||    
T  29999753 aattaaatagttaag 29999767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2315716 - 2315601
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  2315716 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagcgaccaaagcgata 2315618  T
Q  100 ctatctaaatagttaag 116  Q
    |||  ||||||||||||    
T  2315617 ctaattaaatagttaag 2315601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 2949544 - 2949632
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2949544 ttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 2949632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24548378 - 24548241
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||| |||||    |||||||||    
T  24548378 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaactaaggctcaaaagcgata 24548280  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24548279 ctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24548241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31754341 - 31754207
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||  |||| |||| || ||||||||||| || |||| |||| |    
T  31754341 gtttttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagagattaaaataaatagaattttaattaagagaccaaaacgattc 31754242  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| |||  |||||||| || ||||||| ||||||    
T  31754241 tatataatcagttaaggaacaaaaaatataattta 31754207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 12903461 - 12903569
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | | || |||||| ||||| | | ||||| || |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  12903461 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaaggaatcaaaataattcgaattttaattaaaggaccaaagggatact 12903560  T
Q  102 atctaaata 110  Q
    | |||||||    
T  12903561 acctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 17544702 - 17544840
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |  | ||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17544702 gtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaacgataga-aaatcaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgata 17544800  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
     || | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17544801 ttagcaaaatagttacgggac-aaaaatgcaatttaaccta 17544840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33971991 - 33971931
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33971991 ttttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33971931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Original strand, 17245624 - 17245711
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17245624 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 17245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 33329455 - 33329514
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggac 60  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  33329455 gtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggac 33329514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 33972341 - 33972293
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 49  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33972341 gtttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagaga 33972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3618844 - 3618793
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3618844 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 3618793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 6229687 - 6229772
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  6229687 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagtta-gggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 6229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 734 - 807
Target Start/End: Original strand, 7779848 - 7779921
Alignment:
Q  734 gatgttggttcaatataaactccatatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagttattatt 807  Q
    |||||||||| ||||  | || |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7779848 gatgttggtttaatacgagctacatatttattttccatagttttaatcaaattgatatcagttaagtcattatt 7779921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17544529 - 17544457
Alignment:
Q  62 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17544529 aaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaagggac-aaaaatgcaattta 17544457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 102)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 13354426 - 13354566
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13354426 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatac 13354525  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13354526 tacctaaatagttaagggaccaaaattacaatttagcctaa 13354566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31450803 - 31450665
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  31450803 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatac 31450704  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31450703 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31450665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41377491 - 41377354
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41377491 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 41377392  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41377391 tacctaaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcct 41377354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5961805 - 5961668
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5961805 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaatttttaattatgggatcaaagcgatact 5961706  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5961705 acctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcct 5961668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43183720 - 43183585
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  43183720 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagcgatac 43183621  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43183620 tacctaaatagttaagggactaaaaatgtaatttag 43183585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 4104408 - 4104545
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4104408 gtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatac 4104507  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4104508 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 4104545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 20908760 - 20908897
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  20908760 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatac 20908859  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20908860 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 20908897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21470432 - 21470292
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21470432 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 21470333  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  21470332 tgcctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcctaa 21470292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13354314 - 13354176
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13354314 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 13354215  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13354214 tacctaaatagttaagggaccgaaaattcaatttagcct 13354176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 28203109 - 28203247
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28203109 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 28203208  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28203209 gacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 28203247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39912764 - 39912630
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  39912764 tttttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 39912665  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39912664 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4104295 - 4104159
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4104295 tttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagataccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 4104196  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4104195 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4104159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27132648 - 27132509
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  27132648 gtttttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 27132549  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27132548 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 27132509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 25642517 - 25642655
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25642517 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 25642616  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25642617 tacctaaatagttaagggaacaaaaatacaatttagcct 25642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 27476620 - 27476754
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  27476620 ttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacc 27476719  T
Q  105 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27476720 taaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcct 27476754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16655743 - 16655610
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||    
T  16655743 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaatgatac 16655644  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16655643 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 16655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 37412827 - 37412964
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  37412827 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaatgcgatac 37412926  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  37412927 tacttaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcc 37412964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4120900 - 4120764
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4120900 tttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttgattaagggaccaaagcgatact 4120801  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4120800 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 4120764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12303922 - 12303786
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12303922 gtttttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaagcgatac 12303823  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12303822 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 12303786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16261007 - 16260872
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16261007 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaaggaccaaaa-aaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 16260909  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16260908 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgctatttagc 16260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16736216 - 16736100
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 122  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16736216 aaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacca 16736117  T
Q  123 aaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16736116 aaaatgcaatttagcct 16736100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 34820528 - 34820668
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  34820528 gtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgagac 34820627  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34820628 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 34820668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18565203 - 18565064
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18565203 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagcgatac 18565104  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  18565103 tgcctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 18565064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 38275704 - 38275842
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg--ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38275704 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttacgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgat 38275803  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38275804 actacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 38275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39454588 - 39454449
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39454588 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 39454489  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39454488 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 39454449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28631523 - 28631657
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28631523 gtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagagagcaaagcgatac 28631622  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28631623 tacccaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 28631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 37744637 - 37744771
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37744637 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 37744736  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  37744737 tatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 37744771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27883605 - 27883468
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  27883605 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatat 27883506  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27883505 tacttaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 27883468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 31450915 - 31451052
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31450915 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaatcgatac 31451014  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  31451015 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 31451052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 32933840 - 32933977
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||     
T  32933840 gttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttatttaaaggaccaaagcgatat 32933939  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32933940 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32933977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34820416 - 34820283
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  34820416 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaaggaaccaaagcgatac 34820317  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34820316 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34820283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 41377603 - 41377740
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  41377603 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaagtgatac 41377702  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41377703 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 41377740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41659882 - 41659745
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  41659882 gtttttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41659783  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41659782 taattaaatagttaagggacaaaaaatataatttagcc 41659745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 27132760 - 27132896
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  27132760 tttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcgacact 27132859  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27132860 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27132896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 36442383 - 36442519
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36442383 gtttttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaataaattaaattttaattaaaggatcaaagcaatac 36442482  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36442483 tatctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagc 36442519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 5921635 - 5921774
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5921635 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggaacaaaaaaaaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatac 5921734  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5921735 tatataaatagttaagggatcaaaaacacaatttagccta 5921774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25642404 - 25642273
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | | |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  25642404 tttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatact 25642305  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642304 acttaaatagttaagggactaaaaatacaatt 25642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32933728 - 32933589
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  32933728 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagggatcaaagtgatac 32933629  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32933628 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32933589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 43183832 - 43183971
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  43183832 gtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 43183931  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  43183932 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 43183971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 12304404 - 12304542
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12304404 tttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatact 12304503  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12304504 acctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 12304542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 16261119 - 16261257
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16261119 gtttttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatac 16261218  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16261219 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 16261257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21470544 - 21470669
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  21470544 gttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga-ccaagcgatac 21470642  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21470643 tacctaaatagttaagggactaaaaat 21470669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17856336 - 17856199
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17856336 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 17856237  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  17856236 tacctaaataattaagggaccgaaaatgaaatttagcc 17856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28202993 - 28202860
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |    
T  28202993 ttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacc 28202894  T
Q  105 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28202893 taaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28202860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 34127814 - 34127948
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  34127814 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaa-tgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaactttagttaagggaccaaagcgatac 34127912  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34127913 tacttaaatagttaagggtccaaaaatacaatttag 34127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35408770 - 35408909
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  35408770 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaagcgatac 35408869  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  35408870 taattaaatagttaatggaccaaaaacataatttagccta 35408909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20908648 - 20908510
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  20908648 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatac 20908549  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20908548 tacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 20908510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 39912875 - 39913017
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39912875 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagtgata 39912974  T
Q  100 ctatct-aaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39912975 ctacctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 39913017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45389267 - 45389129
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  45389267 tttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgacact 45389168  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  45389167 acctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagccta 45389129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 16736347 - 16736484
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  16736347 gtttctgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaagggactacagcgatac 16736446  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     | ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16736447 aacctaaacagttaagggaccaaaagtgcaatttagcc 16736484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37412728 - 37412595
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| || ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  37412728 ttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatacta 37412629  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37412628 actaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44612732 - 44612871
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44612732 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 44612831  T
Q  101 tat--ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||   ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  44612832 tatacgtaaatagttaa-ggaccaaacatgcaatttagcct 44612871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 10833285 - 10833421
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  10833285 ttttttaattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattgagggactaaagcgatact 10833384  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10833385 acctaaatagctaagggaccaaaaatgcaattcagcc 10833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16655855 - 16655994
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  16655855 gttttttaattaaaactagtggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaaaacgatac 16655954  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16655955 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 16655994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27476504 - 27476369
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27476504 gtttttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaagcgata 27476405  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27476404 ctacctaaatagtctagggaccaaaaatacaattta 27476369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38275611 - 38275480
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  38275611 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcaatactac 38275512  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38275511 ataaatagttaagggatcaaaaatacaattta 38275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 39150074 - 39150213
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  39150074 gtttttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggtacaaaagcgatac 39150173  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  39150174 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagccta 39150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 4121012 - 4121146
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || |||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4121012 gtttttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacgatac 4121111  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4121112 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4121146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 18565276 - 18565386
Alignment:
Q  25 aggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18565276 aggaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaa 18565375  T
Q  125 aatacaattta 135  Q
    ||| |||||||    
T  18565376 aatgcaattta 18565386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28631411 - 28631285
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28631411 gtttttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatgc 28631312  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28631311 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 28631285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36211487 - 36211350
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  36211487 gtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacaatac 36211388  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  36211387 aacctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 36211350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14877618 - 14877481
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  14877618 gtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaa--gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgatac 14877521  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14877520 tacctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagccta 14877481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44915876 - 44915737
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  44915876 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 44915778  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44915777 taattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaacctaa 44915737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36442269 - 36442130
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||  || |||| |||||||    
T  36442269 ttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaatttttattaatagaccaaaacgatact 36442170  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36442169 acctaaatagtgaagggaacaaaaatacaatttagcctaa 36442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 15137053 - 15137191
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || |||    
T  15137053 gtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcggtac 15137152  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||    
T  15137153 tacctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaatttagcct 15137191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 12304035 - 12304160
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  12304035 tttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacgaaagcgatact 12304134  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  12304135 acctaaatagttaagggaccaaaaat 12304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 17856440 - 17856577
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    |||| |||||||||||||  |||  || ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  17856440 tttttaattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatacta 17856539  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17856540 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 17856577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34127703 - 34127570
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  || ||| |||||  ||| |||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  34127703 gtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatac 34127604  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34127603 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 27883706 - 27883850
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  27883706 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 27883805  T
Q  101 tatctaa----atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27883806 tacctaaatatatagttaagggatcgaaaatgcaatttagcctaa 27883850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Original strand, 36211698 - 36211785
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36211698 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttagcc 36211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27914031 - 27913897
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||  | ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27914031 gtttttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggactaaagcgatac 27913932  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  27913931 taattaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 27913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 32503786 - 32503920
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | ||||    
T  32503786 gttttcgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaatcaatac 32503885  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  32503886 tacctaaatagttaaaggactaagaatgcaattta 32503920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Original strand, 39454712 - 39454822
Alignment:
Q  31 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaataca 130  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  39454712 aaaatgtgtaacagagagaaattaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgca 39454811  T
Q  131 atttagcctaa 141  Q
    |||||| ||||    
T  39454812 atttagtctaa 39454822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40694332 - 40694194
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| | ||||||| || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||    
T  40694332 gtttttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaattaagggactaaaacgatac 40694233  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40694232 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 40694194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 40694424 - 40694538
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  40694424 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaattttaattaaaggaccaaagcgatac 40694523  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    || ||||||| ||||    
T  40694524 tacctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 33819646 - 33819781
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  33819646 tttttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagtgatact 33819744  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  33819745 acctaaacagttatgagac-aaaaatacaatttagcct 33819781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15829856 - 15829733
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15829856 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatact 15829757  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||    
T  15829756 acctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484414
Alignment:
Q  9 attaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaa 108  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  109 tagttaagggac 120  Q
    || |||||||||    
T  34484403 taattaagggac 34484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37744560 - 37744451
Alignment:
Q  27 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37744560 gaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 37744461  T
Q  127 tacaatttag 136  Q
    |  |||||||    
T  37744460 tgtaatttag 37744451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Original strand, 11943764 - 11943855
Alignment:
Q  28 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 119  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11943764 accaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaagtaccaaagcgatactacctaaatagttcaggga 11943855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20297497 - 20297410
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  20297497 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 20297410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 27246232 - 27246370
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||  ||||||   ||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  27246232 gtttttgaattaaaaataaccgaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatc 27246330  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27246331 ctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27246370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 39149981 - 39149867
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||  |||| |||||    
T  39149981 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaaaggactaaagtgatac 39149882  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    ||| |||||||||||    
T  39149881 tatttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 44915988 - 44916086
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||    
T  44915988 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaattttaattaagggaccaaaacgata 44916086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 27914142 - 27914280
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||    
T  27914142 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-agagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaaggaaccaaaacgata 27914240  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27914241 ctaattaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcct 27914280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33819532 - 33819394
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| || |||| || ||||    
T  33819532 tttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaagggaccaaat-aaatcaaattttaattaagagaccaaaacggtact 33819434  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||    
T  33819433 acctaaatagttaatggaccaaaagtgcaatttaacctaa 33819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 36211591 - 36211682
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  36211591 tttttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 36211682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 41659985 - 41660119
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | |||||   ||||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  41659985 gtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaagtgata 41660083  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  41660084 ctaattaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 41660119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32503683 - 32503549
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| |||||| |||   ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||    
T  32503683 gtttttgacttaaaattaaaggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaaggaagcaaaacgatac 32503584  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||| ||||  ||  ||||||||||||||    
T  32503583 tacctaaataattaatcgatcaaaaatacaattta 32503549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 135
Target Start/End: Original strand, 1580148 - 1580224
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  1580148 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 1580224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 16350320 - 16350438
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||| | |||     
T  16350320 gttttttaattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaaacaataa 16350419  T
Q  101 tatctaaatagttaaggga 119  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  16350420 taattaaatagttaaggga 16350438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44610924 - 44610859
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  44610924 ttttaattaaggga-caaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 44610859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34484298 - 34484238
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  34484298 ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 34484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 677915 - 677965
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  677915 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3603642 - 3603504
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||   ||||||| | | | | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3603642 gtttttgaattaaatttaacggaaaggactaaaatatgtaacagagataaacttaaaataccaaaacataacaaattttaatcaagggaccaaagcgata 3603543  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  3603542 ctaaataaatagttaagggacgaaaataacaattaagcc 3603504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 23992206 - 23992292
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23992206 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttcagggaccaaaaagacaatttagcc 23992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 38073790 - 38073867
Alignment:
Q  61 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  38073790 caaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaaatgatcaaaaatataatttagcc 38073867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2822367 - 2822301
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2822367 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaaacatttaagcctaa 2822301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15136414 - 15136364
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  15136414 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 15136364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 26424819 - 26424869
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  26424819 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 26424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31557154 - 31557104
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  31557154 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 31557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 34618517 - 34618567
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34618517 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 23281259 - 23281399
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23281259 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 23281358  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23281359 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 23281399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29256969 - 29256835
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  29256969 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 29256870  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29256869 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 29256835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25088153 - 25088013
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  25088153 gtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatac 25088054  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25088053 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 25088013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 5463368 - 5463505
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5463368 tttttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaacggaccaaagcgatact 5463467  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5463468 agctaaatagttaagggactaaaaatgcattttagcct 5463505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 45305659 - 45305798
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  45305659 gttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 45305757  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45305758 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 45305798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 51692010 - 51691874
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51692010 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 51691911  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51691910 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 51691874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16267939 - 16268077
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16267939 gtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 16268037  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16268038 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 16268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 10923612 - 10923750
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10923612 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 10923711  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10923712 cacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10923750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33753362 - 33753222
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33753362 gtttttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 33753263  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33753262 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 33753222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18793828 - 18793693
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18793828 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 18793729  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  18793728 tacctaaataattaagggaccaaaaatgaaatttag 18793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30611357 - 30611218
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  30611357 gttttttaattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgataa 30611258  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  30611257 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 30611218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30792577 - 30792438
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  30792577 gtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaagggatcaaagcgacag 30792478  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  30792477 tacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagccta 30792438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 34028970 - 34029109
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34028970 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagtgatac 34029069  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34029070 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34029109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 10654278 - 10654404
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10654278 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 10654377  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  10654378 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 10654404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28970556 - 28970418
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  28970556 gttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 28970457  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  28970456 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 28970418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 32564200 - 32564337
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32564200 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 32564298  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32564299 acctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagccta 32564337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42607659 - 42607525
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||     
T  42607659 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaattaagggaccaaaacgatat 42607560  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42607559 tatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 42607525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 22584602 - 22584738
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  22584602 ttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 22584701  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22584702 acctaattagttaagggaccaaaaatataatttagcc 22584738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6181865 - 6182004
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  6181865 gtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaagcgatac 6181964  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6181965 tacataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagccta 6182004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21036122 - 21035987
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21036122 gttttttaattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaatggaccaaagtgatac 21036023  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  21036022 tatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttag 21035987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34028858 - 34028719
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34028858 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagtgatac 34028759  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34028758 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34028719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Original strand, 34279501 - 34279628
Alignment:
Q  12 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 111  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  34279501 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 34279600  T
Q  112 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34279601 ttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 34279628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35986369 - 35986234
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35986369 gtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 35986270  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  35986269 tacctaaatagttaagggaacaaaaatgcaatttag 35986234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 50574766 - 50574897
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  50574766 gttttttaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 50574865  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 132  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50574866 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 50574897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24590363 - 24590237
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24590363 gtttttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 24590264  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  24590263 tacttaaatagttaagtgactaaaaat 24590237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 49291232 - 49291366
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  49291232 gtttttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 49291331  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49291332 tatctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 49291366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 13944760 - 13944897
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  13944760 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattctaattaagggatcaaaacgatac 13944859  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13944860 tacctaaatgattaagggaccaaaaatacaatttagcc 13944897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22584488 - 22584351
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  22584488 gtttttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaatgtgatac 22584389  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  22584388 tacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatatagcc 22584351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 24590474 - 24590611
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  24590474 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagtgatac 24590573  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24590574 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 24590611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 50118483 - 50118350
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  50118483 tttttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaagggaccaaagcgatact 50118384  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50118383 acctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 50118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 37199170 - 37199310
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  37199170 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccagaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 37199269  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  37199270 tacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttaacctaa 37199310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9881688 - 9881550
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  9881688 gtttttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttagggaccaaagcgatac 9881590  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9881589 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9881550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10654166 - 10654028
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  10654166 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcg-tac 10654068  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10654067 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 10654028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11787877 - 11787742
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  11787877 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataattcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 11787778  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  11787777 tacctaaatagttaagggatcaaaaattcaatttag 11787742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 51692120 - 51692254
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||     
T  51692120 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaaacgatat 51692218  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51692219 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 51692254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6181753 - 6181619
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  6181753 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatac 6181654  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  6181653 taactaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 6181619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 33753465 - 33753602
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  33753465 gtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 33753564  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33753565 tacctaaatagttatgggac-caaaatacaatttagcct 33753602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37199069 - 37198931
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||     
T  37199069 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatat 37198970  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  37198969 tgcctaaatagttaagaaaccaaaaatacaatttagcct 37198931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 46738973 - 46739110
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  46738973 gtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 46739072  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46739073 tacctaaatagttaggggac-aaaaatacaatttagcct 46739110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51810274 - 51810136
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  51810274 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatac 51810175  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  51810174 tacctaaatagttaagagactaaaaatgcaattttgcct 51810136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 52412735 - 52412609
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  52412735 gttttggaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 52412636  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  52412635 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 52412609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 52412847 - 52412985
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  52412847 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 52412946  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  52412947 cacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 52412985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 30293263 - 30293395
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30293263 tttttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaagcgatact 30293361  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30293362 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30293395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14118667 - 14118527
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  14118667 gtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagtaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagtgatac 14118568  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14118567 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 14118527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16267852 - 16267716
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||   || ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||     
T  16267852 gtttttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatat 16267753  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16267752 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 16267716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 24655835 - 24655975
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  24655835 gtttttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaagcgatac 24655934  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24655935 tacttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagcctaa 24655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 42607752 - 42607887
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||    
T  42607752 tttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaaacgatact 42607851  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  42607852 atctaaataattaagggatcaaaaatacaatttagc 42607887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 51810388 - 51810515
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  51810388 tttttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcaatttttaattcaggaacaaaagcgatact 51810487  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatac 129  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51810488 acctaaatagttaagggaccaaaaatac 51810515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14775882 - 14775744
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | | |||| | ||||    
T  14775882 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaaagaagcaaaacaatac 14775783  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14775782 tacctaaataattaagggaacaaaaatacaatttagcct 14775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24655723 - 24655589
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24655723 gtttttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagagaccaaaatgaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatac 24655624  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  24655623 tacctaaatacttaagggaccaaatatgcaattta 24655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32564096 - 32563958
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  32564096 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 32563997  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32563996 agcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 32563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 36657750 - 36657888
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36657750 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 36657849  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36657850 tgcataaatagttaagggaccaaaaatacaattttgcct 36657888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 46949893 - 46949755
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  46949893 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 46949794  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  46949793 tacctaaatagttaatgaattaaaaatgcaatttagcct 46949755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 14775984 - 14776121
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  14775984 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaaacgatac 14776083  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14776084 tacctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 14776121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 139
Target Start/End: Original strand, 50921365 - 50921478
Alignment:
Q  26 ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50921365 ggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 50921464  T
Q  126 atacaatttagcct 139  Q
    ||  ||||||||||    
T  50921465 atgtaatttagcct 50921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4045236 - 4045096
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4045236 gtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatac 4045137  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4045136 tacctaaatagttaaggggctaaaaatacaatttaacctaa 4045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30293150 - 30293010
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||    
T  30293150 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaataaagagaccaaagcgatac 30293051  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  30293050 tacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttaacctaa 30293010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50574647 - 50574527
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  50574647 ttgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatagaccaaagcgatactacc 50574548  T
Q  105 taaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  50574547 taaatagttaagggacaaaaa 50574527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 50921197 - 50921061
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  || ||||| |||||||||||||  | || ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  50921197 gtttttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaagggaccaaaataaatcggattttaattaagggaccaaagtgatac 50921098  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50921097 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 50921061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44222329 - 44222190
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  44222329 gtttttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatat 44222230  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  44222229 tacataaataattaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 44222190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 11394910 - 11395044
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | | |||    
T  11394910 tttttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacaaaact 11395009  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11395010 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 11395044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 19986372 - 19986510
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  19986372 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttatttaagagaccaaagtgatact 19986471  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  19986472 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttatccta 19986510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4054686 - 4054545
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatg-gaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||   ||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | || ||| |||||    
T  4054686 gtttttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaatcgata 4054587  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  4054586 ctatctaaatagttaaggggataaaaatacaatttagtctaa 4054545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 30611469 - 30611606
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaag-aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  30611469 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaattttaatttagggaccaaagcgata 30611568  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30611569 caacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagc 30611606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 25088265 - 25088403
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  25088265 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaagggaccgaactaaatcgaattttagttaa-ggaccaaaacgatac 25088363  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  25088364 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 25088403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 4045348 - 4045486
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  4045348 gtttttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaaggactaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagtgatac 4045447  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4045448 tacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcct 4045486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21385073 - 21384960
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21385073 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaag-accaaaataaatcgaattttaattaagggataaaagcgatac 21384975  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    ||  |||||||||||    
T  21384974 tacataaatagttaa 21384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 29257072 - 29257222
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||   ||||    
T  29257072 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaggggacaaaattaatac 29257171  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaa 151  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||  ||||||||    
T  29257172 tagctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattaaacctaaattttattaa 29257222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  8 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 107  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  108 atagtta 114  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 34621884 - 34622018
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  34621884 gtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacgatac 34621983  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  34621984 taattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 34622018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5463253 - 5463140
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |    
T  5463253 ttttttaattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatatt 5463154  T
Q  102 atctaaatagttaa 115  Q
    ||||||||| ||||    
T  5463153 atctaaataattaa 5463140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 18793943 - 18794082
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcg--atac 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  18793943 ttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaa-tgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatatac 18794041  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18794042 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18794082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 20260628 - 20260768
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  20260628 gtttttaaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaaggagagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgata 20260726  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20260727 ctaattaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 20260768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5118188 - 5118096
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5118188 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 5118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21385185 - 21385325
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  21385185 gtttttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatac 21385284  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21385285 tacttaaatagttaagggattaaaagtgcaatttagcctaa 21385325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36884837 - 36884725
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  36884837 aaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaaca 36884738  T
Q  123 aaaatacaattta 135  Q
    |||||||||||||    
T  36884737 aaaatacaattta 36884725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1831792 - 1831661
Alignment:
Q  10 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 109  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||    
T  1831792 ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaagaccaaagtgatactacctaaat 1831693  T
Q  110 agttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  1831692 agttaagagaccgaaaattcaatttagcctaa 1831661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10923500 - 10923365
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaa-actaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  10923500 gtttttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaagggaccaaagcgata 10923401  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10923400 ctacctaaataattaagggaccaaaaatataattta 10923365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34279375 - 34279240
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34279375 ttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgttacta 34279276  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  34279275 cctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 34279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 11787990 - 11788127
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11787990 gtttttgaattaaaactaacagaaag-agcaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 11788088  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |   |||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  11788089 tgcttaaataattaaaagaccaaaaatgcaatttagcct 11788127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 13831272 - 13831358
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13831272 tttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga 13831358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13944647 - 13944509
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  13944647 tttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaagggaccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatact 13944548  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  13944547 agctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 13944509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36077381 - 36077268
Alignment:
Q  28 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    |||||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  36077381 accaaaatttgtaacgaagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 36077282  T
Q  128 acaatttagcctaa 141  Q
     |||||||||||||    
T  36077281 gcaatttagcctaa 36077268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5118079 - 5117995
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5118079 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 5117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28112887 - 28112795
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28112887 gtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 28112795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19886088 - 19885985
Alignment:
Q  32 aaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 131  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||    
T  19886088 aaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 19885989  T
Q  132 ttta 135  Q
    ||||    
T  19885988 ttta 19885985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1831913 - 1832047
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||    
T  1831913 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaaacgatac 1832012  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1832013 tacatatatagttaagggaccaaaaatacaattta 1832047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40534062 - 40533928
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   | | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40534062 gtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagatagcgaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatac 40533963  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40533962 taattaaatagttaagagactaaaaatgcaattta 40533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 4550849 - 4550988
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  4550849 gtttttgaatttaacctaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgata 4550947  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  4550948 ctaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 4550988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11797308 - 11797220
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11797308 ttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 11797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27209304 - 27209168
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  27209304 ttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatatta 27209205  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
      |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27209204 attaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 27209168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36657638 - 36657501
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg--ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||    
T  36657638 gtttttgaattaaaactaacggaaaggac-aaaatatgtaacggagagaggagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggacccaagagat 36657540  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
     | | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  36657539 gcaaactaaatagttaggggacgaaaaatgcaatttagc 36657501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45305547 - 45305412
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||    
T  45305547 gtttttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaattaaaggaccaaagcaata 45305448  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  45305447 ctacctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 49291130 - 49291016
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||   ||||| ||||| | || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  49291130 gtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 49291031  T
Q  101 tatctaaatagttaa 115  Q
    || ||||||||||||    
T  49291030 tacctaaatagttaa 49291016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 9119541 - 9119618
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagtttt 78  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9119541 gtttttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28112807 - 28112718
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 28112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 46949985 - 46950085
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||    
T  46949985 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggagcaatgtgatac 46950084  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  46950085 t 46950085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 135
Target Start/End: Original strand, 19886214 - 19886297
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  19886214 ttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaattta 19886297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 40703114 - 40703252
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||    |||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40703114 gtttttaaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagcgata 40703212  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  40703213 ctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 40703252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 30792689 - 30792759
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatc 71  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  30792689 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatc 30792759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 48702187 - 48702269
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48702187 accaaaataaatccaattttaattaaaggaccaaaacgatactaacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 48702269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9119379 - 9119290
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  9119379 gttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaagtagttaagggataaaaaatataatttaaccta 9119290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11394769 - 11394697
Alignment:
Q  61 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  11394769 caaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagagac-aaaaatgcaattt 11394697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11797232 - 11797147
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  11797232 ttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaatttagc 11797147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 2125458 - 2125577
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||       |||| ||||| |||||||||||    
T  2125458 gttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaagggaccaaaataaatc------aaatttagggaccaaagcgatac 2125550  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2125551 tacctaaataattaagggaccaaaaat 2125577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 32517762 - 32517894
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||| |||||    
T  32517762 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa--aaccaaagtgatac 32517859  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || |||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  32517860 tacctaaatagataagggatcaaaaatgcaattta 32517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 119
Target Start/End: Original strand, 40534175 - 40534292
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||  |||| | |||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  40534175 ttttttaattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagcgatact 40534274  T
Q  102 atctaaatagttaaggga 119  Q
    |  |||||||||||||||    
T  40534275 aattaaatagttaaggga 40534292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 733 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29726250 - 29726183
Alignment:
Q  733 tgatgttggttcaatataaactccatatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagt 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29726250 tgatgtcggttcaatacaaactacatatttattttctgttgttttaatcaaactgctatcaattaagt 29726183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40703001 - 40702867
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||| ||||| |   | ||||||    
T  40703001 tttttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatttagggacc---gtgatact 40702905  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40702904 aattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 40702867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19269441 - 19269359
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19269441 ggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19269359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20260536 - 20260440
Alignment:
Q  30 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  20260536 caaaatgtgtaacggagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 139
Target Start/End: Original strand, 27209456 - 27209536
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27209456 accaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31126065 - 31125938
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||    
T  31126065 ttttttaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaa-------aagcgatact 31125973  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31125972 acctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 31125938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 756 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 33060649 - 33060597
Alignment:
Q  756 catatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagttattattc 808  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33060649 catatttatcttttgtcgttttgatcaaattgatatcaattaagttattattc 33060597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 50921309 - 50921373
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 65  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  50921309 gtttttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaa 50921373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Original strand, 36884954 - 36885037
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 85  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36884954 ttttttaattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaag 36885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6241316 - 6241274
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6241316 ttttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagg 6241274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 6714698 - 6714748
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  6714698 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6714748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 115
Target Start/End: Original strand, 21036235 - 21036345
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||||||||| | |||||  |||||||| ||||| | |||||||||| | | ||||| |||  || |    
T  21036235 ttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagtgatggtacc 21036334  T
Q  105 taaatagttaa 115  Q
    |||||||||||    
T  21036335 taaatagttaa 21036345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32193580 - 32193530
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  32193580 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggattaaaa 32193530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33784361 - 33784299
Alignment:
Q  79 aattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  33784361 aattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 33784299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 34023569 - 34023619
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34023569 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34023619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 37708574 - 37708624
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  37708574 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 37708624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 46448736 - 46448786
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  46448736 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 46448786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29021645 - 29021580
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  29021645 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagccta 29021580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 31126178 - 31126279
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||| ||| | ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||| | | |||||| ||||    
T  31126178 gtttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtgacatagaaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaatgtaccaaagcaatac 31126277  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  31126278 ta 31126279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34521402 - 34521264
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34521402 tttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 34521303  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34521302 acctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34521264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 41208649 - 41208788
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  41208649 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41208748  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41208749 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 41208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44069372 - 44069510
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  44069372 gtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatac 44069471  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44069472 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44069510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 54107806 - 54107669
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54107806 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 54107707  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  54107706 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54107669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 4846845 - 4846984
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4846845 gtttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatac 4846944  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4846945 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 4846984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26332456 - 26332318
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332456 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaagggaccaaagcgatac 26332357  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  26332356 tacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcct 26332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34630119 - 34629985
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  34630119 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatac 34630020  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34630019 tacttaaatagttaagggaccaaaaatataattta 34629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10756855 - 10756720
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10756855 gtttttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 10756756  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10756755 tacctaaatagctaagggaccaaaaatacaatttag 10756720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54081420 - 54081287
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  54081420 gtttttaaattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa-ggaccaaagcgatac 54081322  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54081321 tgcctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 54081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 15862424 - 15862564
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||| |||||    
T  15862424 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaataaagggacaaaagagatac 15862523  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15862524 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcctaa 15862564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45171205 - 45171066
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  45171205 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggccaaagcaatac 45171106  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45171105 tacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagccta 45171066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7950412 - 7950274
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| | ||||    
T  7950412 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaaacaatac 7950313  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7950312 tacataaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcct 7950274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 26332567 - 26332712
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaat-----ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagc 95  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26332567 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 26332666  T
Q  96 gatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 142  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  26332667 gatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcctaac 26332712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 28688239 - 28688377
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  28688239 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 28688338  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  28688339 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcct 28688377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41997956 - 41997818
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  41997956 gtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaaacgatac 41997857  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41997856 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 41997818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 54081533 - 54081671
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  54081533 tttttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatac 54081632  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54081633 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 54081671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 54108369 - 54108507
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54108369 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 54108468  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54108469 tagctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54108507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 7743014 - 7743139
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||   |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7743014 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatac 7743113  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  7743114 tacctaaatagttaagggaccaaaaa 7743139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 43899330 - 43899463
Alignment:
Q  8 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 107  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  43899330 aattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatattacctaa 43899429  T
Q  108 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  43899430 atagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 43899463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31513999 - 31513863
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  31513999 tttttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaatcaaagcgatact 31513900  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31513899 acctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 31513863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 45171316 - 45171452
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  || |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  45171316 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 45171415  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45171416 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagc 45171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 45871832 - 45871696
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    |||| |||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45871832 tttttaattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 45871733  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45871732 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 45871696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12123226 - 12123088
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  12123226 tttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatact 12123127  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12123126 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 12123088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21169803 - 21169669
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21169803 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 21169704  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21169703 tacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 21169669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 28691364 - 28691502
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28691364 ttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatgatcaaaataaatcaaattttaatttagggacaaaagcgatacta 28691463  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28691464 cctaaataattaagggacaaaaaatacaatttaacctaa 28691502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40410849 - 40410715
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  40410849 gttttttaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 40410750  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40410749 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 7274892 - 7275024
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  7274892 gtttttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 7274990  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  7274991 tacctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 7937812 - 7937949
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  7937812 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataattcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 7937911  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  7937912 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaatttagcc 7937949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 12123330 - 12123467
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12123330 ttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatacta 12123429  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12123430 cctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaaccta 12123467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15862319 - 15862182
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  15862319 gtttttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 15862220  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  15862219 tacctaaataattaagggacctaaaatggaatttagcc 15862182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44069260 - 44069123
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44069260 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatac 44069161  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44069160 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44069123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 50819466 - 50819603
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  50819466 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 50819565  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50819566 taccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50819603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50856398 - 50856261
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  50856398 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 50856299  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50856298 taccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 8846326 - 8846462
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  8846326 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagtgaccaaagcgatact 8846425  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846426 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 34521508 - 34521640
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || |||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34521508 ttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 34521607  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34521608 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41208538 - 41208398
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  41208538 gtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41208439  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41208438 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 41208398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22355077 - 22354946
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | |||| ||||||||    
T  22355077 ttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatacta 22354978  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354977 cctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 22354946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31514112 - 31514250
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||    
T  31514112 gtttttgaattaaagctaacggaaag-accaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 31514210  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31514211 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 31514250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35753680 - 35753819
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  35753680 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatttaaattaatggaccaaagcgatac 35753779  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||    
T  35753780 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 35753819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 50819356 - 50819217
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  50819356 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgct 50819257  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50819256 acgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50819217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 50856508 - 50856647
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  50856508 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgct 50856607  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50856608 acgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50856647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 14353298 - 14353430
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14353298 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaaggaccaagataaatcgaattttatttaagggaccaatgcgatact 14353396  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353397 acctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 14353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 52609639 - 52609748
Alignment:
Q  29 ccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaata 128  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  52609639 ccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatg 52609738  T
Q  129 caatttagcc 138  Q
     |||||||||    
T  52609739 gaatttagcc 52609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 53841275 - 53841407
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||| ||||    
T  53841275 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaagcaatac 53841374  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53841375 tagctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40926148 - 40926009
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40926148 gtttttcaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggatcaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaagcgatac 40926049  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  40926048 tacataaatagttaaaagaccaaaaatgcaatttaaccta 40926009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43899226 - 43899111
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||| |||| |    
T  43899226 aaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaaaggacca 43899127  T
Q  123 aaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43899126 aaaatgcaatttagcc 43899111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 46766863 - 46767002
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  46766863 ttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 46766962  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46766963 tagcaaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 46767002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19124326 - 19124188
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||  || ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| |||     
T  19124326 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaattttaattaggggaccaaagcaatat 19124227  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19124226 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19124188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28691251 - 28691113
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  28691251 gtttttaaattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaacaaagcaatac 28691152  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28691151 cacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 28691113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580332
Alignment:
Q  13 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagt 112  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  113 taagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaattta 35580332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8846213 - 8846076
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| || |||| | ||||    
T  8846213 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaattaatcgaattttagttaagagaccaaaacaatac 8846114  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846113 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 40639366 - 40639506
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  40639366 gtttttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 40639465  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  40639466 taattaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagcctaa 40639506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 40926260 - 40926394
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  40926260 gtttttcaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaatggaccaaagtgatac 40926358  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40926359 tacctaaatagttaggggactaaaaatgcaatttag 40926394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17273914 - 17273788
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  17273914 gttttttaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaaacgatac 17273815  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
       ||||||||||||||||| ||||||    
T  17273814 ggcctaaatagttaagggaccaaaaat 17273788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 51170631 - 51170765
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  51170631 ttttttaattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgatcaaaacgatact 51170730  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  51170731 acctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 51170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52606265 - 52606128
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  52606265 gttttttatttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 52606166  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  52606165 tacataaatagttaagggac-caaaatgcaatttagcct 52606128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 17102626 - 17102735
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  17102626 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaatggaccaaagcgatac 17102725  T
Q  101 tatctaaata 110  Q
    || |||||||    
T  17102726 tacctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27940409 - 27940272
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  27940409 gtttttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaagggaccaaagtgatac 27940310  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  27940309 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 27940272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47891650 - 47891513
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  47891650 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 47891551  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||| | | |||||||||    
T  47891550 taattaaattgttaagggaccaaatacataatttagcc 47891513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19124421 - 19124556
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| | || ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  19124421 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 19124520  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  19124521 tacctaaatagttaa-ggaccaaaaatataatttagc 19124556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 45871940 - 45872064
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45871940 tttttaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaatttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatacta 45872039  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  45872040 cctaaatagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 5348817 - 5348955
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  5348817 gtttttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaagcgatac 5348916  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5348917 taattaaatagttaaaggacaaaaaacataatttagcct 5348955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 10756957 - 10757091
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  10756957 gtttttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatac 10757056  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10757057 tgcctaaatagttaaaggacaaaaaatacaattta 10757091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17102521 - 17102383
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | |||     
T  17102521 gtttttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaagaaaacaatat 17102422  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| |||||  || |||||| |||||||||||    
T  17102421 tacctaaataattaagaaaccaaaaatgcaatttagcct 17102383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28688127 - 28688017
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28688127 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagtgatac 28688028  T
Q  101 tatctaaatag 111  Q
    || ||||||||    
T  28688027 tacctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37133414 - 37133280
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37133414 gtttttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 37133315  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  37133314 taattaaatagctaagggaccaaaaacataattta 37133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40969392 - 40969255
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  40969392 gtttttgaattaaaactgacggaaatgaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgata 40969294  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40969293 ctaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 40969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 52268353 - 52268490
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  52268353 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaag-accaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacgatac 52268451  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  52268452 taactaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 52268490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 38911494 - 38911607
Alignment:
Q  28 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| |||| |||| ||||||    
T  38911494 accaaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaat 38911593  T
Q  128 acaatttagcctaa 141  Q
    ||||||||||||||    
T  38911594 acaatttagcctaa 38911607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 2078724 - 2078855
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2078724 tttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatatta 2078822  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2078823 attaaatagttaagggactaaaaatacaattta 2078855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14353182 - 14353042
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| | ||||||| ||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14353182 tttttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 14353083  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 142  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  14353082 acctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaacctaac 14353042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29248456 - 29248320
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  29248456 gtttttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaattaaattttaattaagggactaaaacgatac 29248357  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
     | ||||||||||||   ||||||||| || ||||||    
T  29248356 cacctaaatagttaaataactaaaaatgcactttagc 29248320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2829545 - 2829410
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa-tggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    ||||||| ||||| | | ||||||||| || |||| | |||    
T  2829545 gtttttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaaaaccaaaataaatcaaatgttaattaagagaccaaaacaata 2829446  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2829445 ctacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 29248557 - 29248691
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |||||||||| |||  ||||  ||||    
T  29248557 gtttttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaaggactaaagtaatac 29248656  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29248657 tatctaaatagttaagggagcataaatacaattta 29248691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Original strand, 41998137 - 41998203
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41998137 ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 41998203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27254120 - 27254007
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | |||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27254120 tttttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 27254021  T
Q  102 atctaaatagttaa 115  Q
      ||||||||||||    
T  27254020 gcctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5348716 - 5348577
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5348716 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattgagggaccaaagcgata 5348618  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5348617 ctaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaaccta 5348577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 22444435 - 22444527
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22444435 gttttcgaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaaggaaccgaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 33773039 - 33773175
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||   ||||   ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  33773039 gtttttaaattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaatcaagggatcaaagtgata 33773138  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33773139 ctaattaaatagttaagggaccaaaaacacaatttag 33773175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 53678569 - 53678445
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   || |||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53678569 tttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatact 53678470  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    || |||||| ||||||||| |||||    
T  53678469 atttaaataattaagggaccaaaaa 53678445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 49222147 - 49222040
Alignment:
Q  27 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||  || | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49222147 gaccaaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaaaagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 49222048  T
Q  127 tacaattt 134  Q
    ||||||||    
T  49222047 tacaattt 49222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 51883985 - 51883859
Alignment:
Q  12 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaata 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  51883985 aaaactaacataaaagaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaata 51883887  T
Q  111 gttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51883886 gttaagggattaaaaatgcaatttagcc 51883859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 17274026 - 17274159
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||   ||||  ||||  |||||||| || |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  17274026 tttttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaacgatgagaaattaagagaccaaaataattcgaattttaattaaaagaccaaagcgatact 17274125  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17274126 acctaaatagttaaaggaccaaaaatacaattta 17274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35753489 - 35753408
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35753489 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 35753569 - 35753477
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35753569 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35753477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40969503 - 40969642
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  40969503 gtttttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagactaaagcgata 40969601  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  40969602 ctaattaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 40969642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 54247358 - 54247271
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54247358 gttaagggaccaaaataaatcaaattttaatcaatggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 54247271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2829657 - 2829795
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||  || |||| | |||     
T  2829657 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaatcaataa 2829756  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  2829757 tacataaatagttaa-ggatcaaaaatgcaatttagccta 2829795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9028328 - 9028189
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||  ||  |||||  || ||||| ||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||    
T  9028328 gtttttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaattttaacttagggaccaaagtgatac 9028229  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9028228 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 9028189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 53841164 - 53841065
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  53841164 gtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagcgaccaaagcgatac 53841065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 588400 - 588537
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||||     
T  588400 ttttttaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaatcaaattttaattaaggaaccgaagcgatat 588499  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||    
T  588500 taattaaatagttaagatatcaaaaatgcaatttagcc 588537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 9028440 - 9028577
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  || ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| | ||||    
T  9028440 gtttttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacaatac 9028539  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || || ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  9028540 tagcttaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttagcc 9028577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 53310001 - 53310106
Alignment:
Q  31 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaataca 130  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||    
T  53310001 aaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactacctaaataattaggagactaaaaatgca 53310100  T
Q  131 atttag 136  Q
    ||||||    
T  53310101 atttag 53310106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7274716 - 7274652
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7274716 ttttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 7274652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7937713 - 7937645
Alignment:
Q  68 aatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  7937713 aatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaatttag 7937645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40639254 - 40639120
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  40639254 gtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatttgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgata 40639156  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40639155 ctaattaaatagttaaagaactaaaaatgcaattta 40639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 138
Target Start/End: Original strand, 53678740 - 53678818
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  53678740 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga-taaaaacgcaatttagcc 53678818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 13866964 - 13867050
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13866964 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 13867050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963677
Alignment:
Q  11 taaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  110 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaaggcaattaagccta 20963677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 51311825 - 51311907
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||    
T  51311825 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagcctaa 51311907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 46766760 - 46766619
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  46766760 gttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgata 46766661  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
     || | ||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  46766660 ttagcaaaatagtaaaaggaccaaaaatgcaatttaacctaa 46766619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 52606367 - 52606404
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52606367 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 52606404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33812831 - 33812735
Alignment:
Q  31 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33812831 aaaatgtgtaacggatagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 33812735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43840076 - 43839959
Alignment:
Q  23 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggact 121  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||  || || ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  43840076 aaaggaccaaaacgtgtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagttaaggga-- 43839979  T
Q  122 aaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  43839978 aaaaaaacaatttagcctaa 43839959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 49529120 - 49529204
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49529120 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 49529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13355238 - 13355188
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13355238 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 13355188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21918573 - 21918500
Alignment:
Q  62 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21918573 aaaaaaaatcaaattttaatttagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 33812852 - 33812929
Alignment:
Q  61 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  33812852 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaatttagcc 33812929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43527080 - 43527023
Alignment:
Q  81 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  43527080 ttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 43527023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 31049073 - 31049124
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31049073 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 31049124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38911463 - 38911432
Alignment:
Q  88 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38911463 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 38911432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 47872579 - 47872529
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  47872579 ttttagttaagggagcaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaa 47872529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 51885671 - 51885753
Alignment:
Q  59 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  51885671 accaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacctaa 51885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 43844359 - 43844484
Alignment:
Q  13 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  || || |||| |||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  43844359 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatag 43844458  T
Q  112 ttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||    
T  43844459 ttaaaggaccaaaaaaataatttagc 43844484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4707
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4567 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 4666  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4667 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4475 - 4341
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||| ||||     
T  4475 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatcaaatttcaattaaggaaccaaagtgatag 4376  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4375 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7399214 - 7399075
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7399214 gtttttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 7399115  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7399114 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7399075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35263631 - 35263491
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35263631 gttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 35263532  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35263531 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35263491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 15267489 - 15267622
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15267489 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 15267588  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  15267589 tacctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaattt 15267622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 40589304 - 40589443
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  40589304 tttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 40589403  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40589404 acctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 40589907 - 40590046
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  40589907 tttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 40590006  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40590007 acctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40590046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42710486 - 42710351
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  42710486 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaagaactaaagcgatact 42710387  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  42710386 accgaaatagttaaatgactaaaaatgcaatttagc 42710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 28392018 - 28392156
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28392018 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgata 28392117  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  28392118 ctacctaaatagttaagagaccaaaaatagaatttagcc 28392156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 10656343 - 10656480
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  10656343 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatac 10656442  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10656443 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 10656480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 42710599 - 42710736
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  42710599 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 42710698  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42710699 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 42710736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 12593705 - 12593845
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  12593705 gtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcaatac 12593804  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  12593805 tacctaaatagttaaaggactaaaaatgtaatttaacctaa 12593845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16353403 - 16353542
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16353403 gttttttaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatac 16353502  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16353503 tacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 16353542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33699412 - 33699273
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  33699412 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaacgatac 33699313  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  33699312 tacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagccta 33699273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088516
Alignment:
Q  10 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  110 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagccta 5088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10656231 - 10656093
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10656231 gtttttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatac 10656132  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10656131 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 10656093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 35263743 - 35263881
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||    
T  35263743 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagtcatac 35263842  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35263843 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 35263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9693051 - 9692919
Alignment:
Q  5 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 104  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9693051 ttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacc 9692952  T
Q  105 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9692951 taaatagtt-agggaccaaaaatacaatttagcc 9692919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 9693168 - 9693301
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  9693168 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgatttttaattaagggaccaaatcgatact 9693267  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9693268 acctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 7210694 - 7210830
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7210694 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 7210793  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  7210794 tacctaaatagttaagtgaccaagaatgcaatttagc 7210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 12694935 - 12695075
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12694935 gtttttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 12695034  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12695035 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttggcctaa 12695075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29024070 - 29023936
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  29024070 tttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaa---atcgaattttaattaaggaaccaaagcgatact 29023974  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29023973 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 29023936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 32272089 - 32272224
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  32272089 gtttttaaattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatat 32272188  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  32272189 tatctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttag 32272224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36752039 - 36751904
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  36752039 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatac 36751940  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36751939 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttag 36751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3878618 - 3878480
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  3878618 gtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaacgaccaaagcgatac 3878519  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3878518 tacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 3878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5624516 - 5624382
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5624516 gtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 5624417  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5624416 tacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 5624382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 7399330 - 7399452
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  7399330 tttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 7399429  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  7399430 ctaaataattaagggacaaaaaa 7399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 8418435 - 8418569
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8418435 tttttaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaacggaccaaagcgatacta 8418534  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8418535 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 8418569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 19205192 - 19205326
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19205192 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatac 19205291  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  19205292 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 38416383 - 38416521
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| || ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38416383 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgagcaaagcgatac 38416482  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38416483 tacctaaataattaagagaccaaaaatacaatttagcct 38416521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 334433 - 334296
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  334433 gtttttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 334334  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  334333 tacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcc 334296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31656495 - 31656370
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31656495 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 31656396  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  31656395 tacctaaatagttaagggaccaaaaa 31656370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 31656607 - 31656744
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31656607 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 31656706  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |  ||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31656707 tgcctaataagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31656744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 39706300 - 39706433
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||    
T  39706300 gtttttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaagaatac 39706399  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 134  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39706400 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7210593 - 7210461
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||     
T  7210593 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaaacgatag 7210494  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  7210493 tacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31909067 - 31908928
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31909067 gtttttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggatcaaagcgatac 31908968  T
Q  101 tatctaa--atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31908967 tacctaaatatagttaaggcaccaaaaatacaatttagcc 31908928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 43570020 - 43570155
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  43570020 gtttttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaagggaacaaagcgatgc 43570119  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43570120 tatctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttag 43570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5087944 - 5087806
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5087944 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagcgatac 5087845  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  5087844 tacctaaatagttaagggaccaaaaattcaatttcgcct 5087806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40589191 - 40589054
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||| || ||    
T  40589191 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaac 40589092  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589091 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40589794 - 40589657
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||| || ||    
T  40589794 gtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaac 40589695  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589694 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18514425 - 18514285
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||| |||| || ||||| |||||    
T  18514425 gtttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagggatac 18514326  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18514325 ttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18514285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40774474 - 40774339
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||    
T  40774474 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaatcga-ttttaattaagggactaaaacaatac 40774376  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40774375 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgaaatttagc 40774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 15476509 - 15476632
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15476509 tttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 15476608  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  15476609 acctaaataattaagggactaaaa 15476632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26289157 - 26289027
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26289157 gtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaagcgatac 26289058  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 131  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26289057 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaa 26289027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 36752152 - 36752289
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36752152 tttttaaattaaaaccaatgaaaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa-ggattgaagcgatact 36752250  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36752251 acataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 36752289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15476377 - 15476269
Alignment:
Q  27 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 126  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15476377 gaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 15476278  T
Q  127 tacaattta 135  Q
    || ||||||    
T  15476277 tataattta 15476269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 41859927 - 41860062
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41859927 tttttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatact 41860026  T
Q  102 at--ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  41860027 atacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 41860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38416279 - 38416140
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   | ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38416279 tttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 38416180  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  38416179 acctaaataattaagagattaaaaatgcaatttagcctaa 38416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25923255 - 25923121
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| | |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  25923255 gtttttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaccgatac 25923156  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25923155 tacctaaatagttaagggatcaaaaatacaattta 25923121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39706188 - 39706053
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||        
T  39706188 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcg---- 39706093  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39706092 tacataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 39706053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460187
Alignment:
Q  62 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 5460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17861175 - 17861039
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |     
T  17861175 gtttttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaacat 17861077  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  17861076 tacctaaatagttaaaggaccaaaaatataatttagcc 17861039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 31909180 - 31909313
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  31909180 ttttttaattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaaacgatact 31909279  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  31909280 acctaaacagttaagggaccaaaaatgcaattta 31909313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 33763157 - 33763293
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| ||   ||| |  |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  33763157 gtttttgaattaaaaccaaaggaaatgtacaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatac 33763256  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33763257 ta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 33763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 5152864 - 5153000
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  5152864 gtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 5152963  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 137  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5152964 taaataaatagttaagggaccaaaaacataatttagc 5153000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33763041 - 33762922
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt--taatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  33763041 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataagggatcaaaataaatcgaattttaatttaagggaccaaagcgat 33762942  T
Q  99 actatctaaatagttaaggg 118  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  33762941 actacctaaataattaaggg 33762922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8418336 - 8418206
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  8418336 tttttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaa-gaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatact 8418238  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  8418237 acctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12593593 - 12593454
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||| | ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||    
T  12593593 gtttttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggaaccaatataaatcgaattttagttaagggactgaagcgatac 12593494  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12593493 tacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 12593454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21750897 - 21750807
Alignment:
Q  51 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21750897 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcctaa 21750807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 40774586 - 40774724
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40774586 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagcgatac 40774685  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||    
T  40774686 tagctaaataattaaggaatcaaaaatgcaatttagcct 40774724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 41372407 - 41372541
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  41372407 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatat 41372506  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  41372507 taattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 41372541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28391905 - 28391768
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||||    
T  28391905 tttttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagggatcaaaataaatcgaactttaattaagggaccaaagtaatac 28391806  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28391805 tgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattgagcc 28391768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19205080 - 19204941
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | |   || |  ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19205080 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaaggtatttaa-gccatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 19204982  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19204981 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 19204941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14143645 - 14143511
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||   | |||| ||||||    
T  14143645 gtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggactaaaataaatc-aattttaattaa-aaaccaaaacgatac 14143549  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14143548 tatctaaatagttaagggac-aaaaatataatttagcct 14143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 15670400 - 15670534
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||   | |||| ||||||    
T  15670400 gtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaataaccaaaacgatac 15670499  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15670500 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 15670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16353291 - 16353151
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16353291 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatac 16353192  T
Q  101 tatctaaa---tagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||   |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16353191 tacctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 16353151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Original strand, 17736522 - 17736620
Alignment:
Q  27 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17736522 gaccaacatgtgtaacagagagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 5460272 - 5460329
Alignment:
Q  78 taattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5460272 taattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 5460329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15267375 - 15267239
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  15267375 tttgaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactac 15267276  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15267275 ct-aatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 15267239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5152753 - 5152614
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaaca-gagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||    
T  5152753 gtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaagaagataga-gttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggccaaagtcata 5152655  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5152654 ctaattacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 5152614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14052026 - 14051886
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||   | |||| | |||     
T  14052026 gtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaattttaattaaaaaaccaaaacaatat 14051927  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14051926 tacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaacctaa 14051886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25923368 - 25923480
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | ||||    
T  25923368 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacaatac 25923467  T
Q  101 tatctaaatagtt 113  Q
    ||  |||||||||    
T  25923468 tacataaatagtt 25923480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 14143755 - 14143892
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||| ||| || |||||  |||||    
T  14143755 ttttttaattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagagaccaaagtaatact 14143854  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14143855 acttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 14143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 17861287 - 17861419
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| |||      ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17861287 gtttttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------tttaattaa-ggaccaaagtgatac 17861379  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17861380 tacctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagcctaa 17861419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 26289269 - 26289407
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaa-ctaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 99  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| || ||  |||||| ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  26289269 gtttttgaattaaaaaccaacgaaaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagttaa-ggatcaaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaaacgata 26289367  T
Q  100 ctatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  26289368 ctatttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatctagcct 26289407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26289025 - 26288988
Alignment:
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26289025 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 26288988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 139
Target Start/End: Original strand, 3879305 - 3879399
Alignment:
Q  45 agagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||| ||| | | |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3879305 agagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 3879399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Original strand, 37192467 - 37192533
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  37192467 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 37192533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40601 - 40738
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  40601 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatac 40700  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40701 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40489 - 40350
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40489 gtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatac 40390  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40389 tatctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagccta 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 11463 - 11601
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11463 gtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 11562  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11563 tacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 11601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11350 - 11231
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  11350 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcaatac 11251  T
Q  101 tatctaaatagttaagggac 120  Q
    || |||||||||||||||||    
T  11250 tacctaaatagttaagggac 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 11736 - 11873
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  11736 gtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatac 11835  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11836 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11625 - 11485
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11625 gtttttaaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 11526  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11525 tttctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 45085 - 45222
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||     
T  45085 gtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaatttttaattaagggagcaaagcgataa 45184  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45185 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 45222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13924
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||  |||  |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13790 gtttttgaattaaaatcaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 13889  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13890 tacctaaatagttaggggaccaaaaatacaattta 13924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13678 - 13541
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| || |    
T  13678 gtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcggattttaactaagggaccaaagcaattc 13579  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  13578 taactaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcct 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 90940 - 90805
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  90940 ttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaatttcaattaagggacaaaagcgatacta 90841  T
Q  103 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  90840 cctaaatagttaagggactaaaaatgcaatgtagcc 90805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Original strand, 91759 - 91844
Alignment:
Q  3 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 88  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  91759 ttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 91844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 177314 - 177453
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |   ||||     
T  177314 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggatcgatctgataa 177413  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  177414 tacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 177453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 65989 - 66123
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||| |  ||| |||||||    
T  65989 tttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaaacgatact 66088  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  66089 acctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 66123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 73321 - 73455
Alignment:
Q  2 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||| |  ||| |||||||    
T  73321 tttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaaacgatact 73420  T
Q  102 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 136  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  73421 acctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 73455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 65876 - 65750
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||     
T  65876 gttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatat 65777  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  65776 tacctaaatagttaagagaccaaaaat 65750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73082
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||     
T  73208 gttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatat 73109  T
Q  101 tatctaaatagttaagggactaaaaat 127  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  73108 tacctaaatagttaagagaccaaaaat 73082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 93327 - 93188
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  93327 gtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagtgactaaaacgat 93228  T
Q  99 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 138  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  93227 actaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 93188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1609 - 1474
Alignment:
Q  4 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 103  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  1609 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatgcgatactac 1511  T
Q  104 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 140  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  1510 ctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagccta 1474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1724 - 1815
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1724 gtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11805 - 11713
Alignment:
Q  1 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||    
T  11805 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaagggaccaaa 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11638
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 139  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  11720 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 11638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26048 - 25970
Alignment:
Q  57 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| |||| | |||||||    
T  26048 ggaccaaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaattta 25970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11001
Alignment:
Q  52 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 133  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10920 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaagacaatt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6281
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  6231 ttttaattatgggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagacgaaaa 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 57085 - 57019
Alignment:
Q  75 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 141  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  57085 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagaacaattaagcctaa 57019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University