View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
	Query
	Query hiting target	Query hiting target's complemental strand
	Query's complemental strand hiting target	Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7872_high_1 (Length: 512)

Name: NF7872_high_1

Description: NF7872

Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]

Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)

[»] NF7872_high_1

[»] scaffold0022 (6 HSPs)

[»] chr7 (239 HSPs)

[»] chr5 (212 HSPs)

[»] chr8 (205 HSPs)

[»] chr3 (297 HSPs)

[»] chr4 (200 HSPs)

[»] scaffold0081 (2 HSPs)

[»] chr1 (210 HSPs)

[»] scaffold0004 (9 HSPs)

[»] scaffold0120 (4 HSPs)

[»] scaffold0047 (5 HSPs)

[»] scaffold0334 (2 HSPs)

[»] chr2 (211 HSPs)

[»] scaffold0025 (1 HSPs)

[»] scaffold0056 (6 HSPs)

[»] scaffold0020 (1 HSPs)

[»] scaffold0040 (4 HSPs)

[»] scaffold0064 (1 HSPs)

[»] scaffold0364 (3 HSPs)

[»] chr6 (228 HSPs)

[»] scaffold0290 (2 HSPs)

[»] scaffold0035 (4 HSPs)

[»] scaffold0161 (3 HSPs)

[»] scaffold0026 (9 HSPs)

[»] scaffold0861 (2 HSPs)

[»] scaffold0411 (2 HSPs)

[»] scaffold0359 (2 HSPs)

[»] scaffold0066 (1 HSPs)

[»] scaffold0916 (1 HSPs)

[»] scaffold0009 (2 HSPs)

[»] scaffold0116 (3 HSPs)

[»] scaffold0426 (1 HSPs)

[»] scaffold1359 (2 HSPs)

[»] scaffold0439 (1 HSPs)

[»] scaffold0146 (2 HSPs)

[»] scaffold0018 (3 HSPs)

[»] scaffold0015 (1 HSPs)

[»] scaffold0395 (1 HSPs)

[»] scaffold0273 (2 HSPs)

[»] scaffold0005 (6 HSPs)

[»] scaffold0269 (1 HSPs)

[»] scaffold0217 (5 HSPs)

[»] scaffold0210 (2 HSPs)

[»] scaffold0382 (1 HSPs)

[»] scaffold0249 (2 HSPs)

[»] scaffold0176 (1 HSPs)

[»] scaffold0488 (1 HSPs)

[»] scaffold0471 (2 HSPs)

[»] scaffold0479 (3 HSPs)

[»] scaffold0622 (2 HSPs)

[»] scaffold0227 (2 HSPs)

[»] scaffold1782 (2 HSPs)

[»] scaffold0337 (3 HSPs)

[»] scaffold0003 (3 HSPs)

[»] scaffold0388 (2 HSPs)

[»] scaffold0207 (2 HSPs)

[»] scaffold0065 (2 HSPs)

[»] scaffold0414 (2 HSPs)

[»] scaffold0185 (1 HSPs)

[»] scaffold0028 (3 HSPs)

[»] scaffold0324 (2 HSPs)

[»] scaffold0069 (1 HSPs)

[»] scaffold0007 (3 HSPs)

[»] scaffold0002 (6 HSPs)

[»] scaffold1331 (1 HSPs)

[»] scaffold0908 (1 HSPs)

[»] scaffold0132 (1 HSPs)

[»] scaffold0011 (4 HSPs)

[»] scaffold0074 (1 HSPs)

[»] scaffold0023 (2 HSPs)

[»] scaffold1709 (1 HSPs)

[»] scaffold0752 (1 HSPs)

[»] scaffold0739 (1 HSPs)

[»] scaffold0547 (1 HSPs)

[»] scaffold0473 (2 HSPs)

[»] scaffold0352 (1 HSPs)

[»] scaffold0151 (1 HSPs)

[»] scaffold0527 (3 HSPs)

[»] scaffold0280 (1 HSPs)

[»] scaffold0275 (1 HSPs)

[»] scaffold0193 (1 HSPs)

[»] scaffold0090 (2 HSPs)

[»] scaffold0045 (1 HSPs)

[»] scaffold0012 (5 HSPs)

[»] scaffold0010 (2 HSPs)

[»] scaffold0655 (2 HSPs)

[»] scaffold0452 (1 HSPs)

[»] scaffold0251 (2 HSPs)

[»] scaffold1321 (1 HSPs)

[»] scaffold1263 (1 HSPs)

[»] scaffold0607 (1 HSPs)

[»] scaffold0544 (1 HSPs)

[»] scaffold0497 (1 HSPs)

[»] scaffold0410 (1 HSPs)

[»] scaffold0297 (1 HSPs)

[»] scaffold0171 (2 HSPs)

[»] scaffold0113 (1 HSPs)

[»] scaffold0063 (1 HSPs)

[»] scaffold1898 (1 HSPs)

[»] scaffold0758 (1 HSPs)

[»] scaffold0490 (1 HSPs)

[»] scaffold0485 (2 HSPs)

[»] scaffold0407 (2 HSPs)

[»] scaffold0351 (2 HSPs)

[»] scaffold0211 (2 HSPs)

[»] scaffold0201 (3 HSPs)

[»] scaffold0272 (2 HSPs)

[»] scaffold0080 (1 HSPs)

[»] scaffold0078 (1 HSPs)

[»] scaffold0017 (3 HSPs)

[»] scaffold0226 (2 HSPs)

[»] scaffold0084 (6 HSPs)

[»] scaffold0522 (2 HSPs)

[»] scaffold0422 (1 HSPs)

[»] scaffold0216 (2 HSPs)

[»] scaffold0037 (3 HSPs)

[»] scaffold0261 (2 HSPs)

[»] scaffold0154 (1 HSPs)

[»] scaffold1102 (1 HSPs)

[»] scaffold0774 (1 HSPs)

[»] scaffold0073 (1 HSPs)

[»] scaffold0016 (3 HSPs)

[»] scaffold0738 (1 HSPs)

[»] scaffold0177 (1 HSPs)

[»] scaffold0772 (2 HSPs)

[»] scaffold0771 (2 HSPs)

[»] scaffold0178 (2 HSPs)

[»] scaffold0050 (2 HSPs)

[»] scaffold0627 (1 HSPs)

[»] scaffold0604 (1 HSPs)

[»] scaffold0387 (2 HSPs)

[»] scaffold0163 (2 HSPs)

[»] scaffold2108 (1 HSPs)

[»] scaffold1204 (1 HSPs)

[»] scaffold0888 (1 HSPs)

[»] scaffold0314 (1 HSPs)

[»] scaffold0267 (1 HSPs)

[»] scaffold0072 (1 HSPs)

[»] scaffold0068 (2 HSPs)

[»] scaffold1477 (1 HSPs)

[»] scaffold0391 (1 HSPs)

[»] scaffold0133 (2 HSPs)

[»] scaffold0105 (3 HSPs)

[»] scaffold0014 (3 HSPs)

[»] scaffold1212 (1 HSPs)

[»] scaffold0498 (1 HSPs)

[»] scaffold0243 (2 HSPs)

[»] scaffold0102 (1 HSPs)

[»] scaffold0795 (1 HSPs)

[»] scaffold0747 (1 HSPs)

[»] scaffold0034 (1 HSPs)

[»] scaffold2082 (1 HSPs)

[»] scaffold1900 (1 HSPs)

[»] scaffold0906 (2 HSPs)

[»] scaffold0867 (1 HSPs)

[»] scaffold0092 (1 HSPs)

[»] scaffold0027 (1 HSPs)

[»] scaffold0006 (1 HSPs)

[»] scaffold0570 (1 HSPs)

[»] scaffold0043 (4 HSPs)

[»] scaffold0481 (1 HSPs)

[»] scaffold0097 (1 HSPs)

[»] scaffold0077 (1 HSPs)

[»] scaffold0386 (1 HSPs)

[»] scaffold0374 (1 HSPs)

[»] scaffold0300 (1 HSPs)

[»] scaffold0199 (1 HSPs)

[»] scaffold0083 (3 HSPs)

[»] scaffold0767 (1 HSPs)

[»] scaffold0683 (1 HSPs)

[»] scaffold0318 (1 HSPs)

[»] scaffold0198 (1 HSPs)

[»] scaffold0110 (1 HSPs)

[»] scaffold1434 (1 HSPs)

[»] scaffold1390 (1 HSPs)

[»] scaffold1050 (1 HSPs)

[»] scaffold0329 (1 HSPs)

[»] scaffold0001 (1 HSPs)

[»] scaffold0477 (1 HSPs)

[»] scaffold0059 (1 HSPs)

[»] scaffold0099 (1 HSPs)

[»] scaffold0053 (1 HSPs)

Alignment Details

Target: scaffold0022 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 6)

Name: scaffold0022

Description:

Target: scaffold0022; HSP #1

Raw Score: 259; E-Value: 1e-144

Query Start/End: Original strand, 27 - 413

Target Start/End: Original strand, 159190 - 159574

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	159190	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttttgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttcttgt	159289	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaa	226	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	159290	gatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactaaacatcatgagcacttccttcagatgcttcaa	159389	T

Q	227	gcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	159390	gcttctttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctatactttaaacagacac-gaattattgtctatggtcctgcacacttgaacaa	159488	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	159489	atattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacacattgttacaaca	159574	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 39652 - 39913

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39652	gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatt	39751	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39752	cctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttttctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatt	39845	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39846	gacaatttttaataccttgttatcaccaaaactcttaaagggtaatgtt-aacacattttgttccaaca	39913	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 137712 - 137973

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	137712	gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatt	137811	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	137812	cctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttttctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatt	137905	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	137906	gacaatttttaataccttgttatcaccaaaactcttaaagggtaatgtt-aacacattttgttccaaca	137973	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 316 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 53226 - 53122

Alignment:

Q	316	cacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53226	cacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	53127	T

Q	414	atctc	418	Q
		\|\|\|\|\|
T	53126	atctc	53122	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 35 - 93

Target Start/End: Original strand, 39569 - 39627

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	39569	tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatg	39627	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 35 - 93

Target Start/End: Original strand, 137629 - 137687

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	137629	tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatg	137687	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 239)

Name: chr7

Description:

Target: chr7; HSP #1

Raw Score: 218; E-Value: 1e-119

Query Start/End: Original strand, 41 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9098271 - 9097899

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatga	140	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|
T	9098271	tgattaaatattttgaacagcctttgaagctttaattctctcatcttctgatgatcttcagcttctgatgaaaaactgcttctggtgataatgcttttga	9098172	T

Q	141	tgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgt	239	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9098171	tgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttgacttcagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttccatcttgt	9098072	T

Q	240	tgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc	339	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9098071	tgattccattgctctcatttgttcttccagaatctaagcttcaaagagacattaaatttttgtctatggtcctgcacagttgaacaaatattagcatatc	9097972	T

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9097971	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtagtgttaaacacattttgttccaaca	9097899	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2

Raw Score: 160; E-Value: 5e-85

Query Start/End: Original strand, 27 - 413

Target Start/End: Original strand, 13880720 - 13881094

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtca--tcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatg	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	13880720	tgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctctcctcttctgatgatgttcaactcctgatgaaaaactgcttcta	13880819	T

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13880820	gtgatgttgcttctgatgaa--------------cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcataaccacttttcttcagatgctt	13880905	T

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13880906	caagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctttgctttaaggagacactaaatttttgtatatggtcctgcacacttgaa	13881005	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13881006	caaatattagcatatccaattgacaatttttagtatcttgttatcattaaaactctaaagg-ttaatgttaaacacattttgttccaaca	13881094	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3

Raw Score: 136; E-Value: 1e-70

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 44467288 - 44467549

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgattt	245	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44467288	gcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactatacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaaacttcctttttgttgattc	44467387	T

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44467388	cattgctctattttgttcttccagaacctat---ttatgatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattg	44467481	T

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44467482	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagagtaatgttaaacacattttgttccaaca	44467549	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4

Raw Score: 124; E-Value: 1e-63

Query Start/End: Original strand, 161 - 411

Target Start/End: Original strand, 4494725 - 4494970

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	4494725	tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactatacttcaggagcacttctctttagatgcttcaagcttcctttttgttgatttcattgctctctttc	4494824	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4494825	gttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	4494918	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4494919	cttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatattaaacacattttgttccaa	4494970	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5

Raw Score: 117; E-Value: 2e-59

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 30026128 - 30026390

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30026128	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatt	30026227	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30026228	cctttgctctcttttgttcttccataacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatt	30026321	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30026322	gataatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	30026390	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6

Raw Score: 111; E-Value: 8e-56

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Original strand, 13880327 - 13880603

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13880327	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgacttcagaagcacttctcttcagacgctttaagctt	13880426	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13880427	cctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttatgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	13880520	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13880521	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttataatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	13880603	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 118 - 410

Target Start/End: Complemental strand, 12366700 - 12366414

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacat-caggagcccttc-cttc	215	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	12366700	gcttctggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtcatcacttcaggagcactttaaattcaggagcacttctcttt	12366601	T

Q	216	atatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgca	315	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	12366600	agatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctctttttttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgta	12366507	T

Q	316	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12366506	cacttgaacaaatattagcatattcaattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactctcaggg--taatgttaaacacattttgttcca	12366414	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 13692548 - 13692839

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	13692548	gcttctggtgatcttgcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctctt	13692647	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgc	314	Q
		\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13692648	cagacgccttaagcttcctttttcctgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctaa----taaagata---tcaatttttgtctatggtcttgt	13692740	T

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13692741	acacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	13692839	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 129 - 414

Target Start/End: Original strand, 28409257 - 28409534

Alignment:

Q	129	tgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaag	227	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|
T	28409257	tgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt---tcaatagcacttctcttcagacgcttcaaa	28409353	T

Q	228	cttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaa	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28409354	cttcctttttgtcgattcatttgctctcttttgttcttacagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtccagtacacttgaacaaa	28409447	T

Q	328	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28409448	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	28409534	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10

Raw Score: 108; E-Value: 5e-54

Query Start/End: Original strand, 118 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 13032037 - 13031743

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgtt--gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	13032037	gcttatggtgatcttctgcttctgatgaggtgtttctagtgaacttgcttctgatgacgtcattaatccaggagcactaaacttcaggagcacttttctt	13031938	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgc	314	Q
		\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	13031937	cagacgcttcaagcttcatccttgttgattccattgctctc-tttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggttatgt	13031845	T

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	13031844	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacattcaaagggtaatgttaaacatattttgttccaataa	13031745	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11

Raw Score: 107; E-Value: 2e-53

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 2500261 - 2500524

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	2500261	gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgat	2500360	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2500361	tccttagctctcttttgttcttccataacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaat	2500454	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2500455	tgacaatttttaataccatgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaatacattttgttccaaca	2500524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12

Raw Score: 107; E-Value: 2e-53

Query Start/End: Original strand, 118 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22577973 - 22577674

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttc	215	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	22577973	gcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttc	22577874	T

Q	216	atatgc--ttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt-gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtctt	312	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	22577873	tggagcacttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctccttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttttctatggtcat	22577780	T

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22577779	gtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaac	22577680	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13

Raw Score: 106; E-Value: 8e-53

Query Start/End: Original strand, 148 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 2913542 - 2913280

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2913542	cttctgatgaacttgcttttgatgacgtcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcatatgctttaagcttcctttttgttgatt	2913443	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	2913442	cctttgctctcttttgttcttccagaacctac----taaa--gatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaatt	2913349	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	2913348	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttttttccaaca	2913280	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14

Raw Score: 104; E-Value: 1e-51

Query Start/End: Original strand, 162 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13137830 - 13137578

Alignment:

Q	162	gcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|
T	13137830	gcttttgaagacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttacctctctttt	13137731	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13137730	gttcttccagaaccta------ataaagagatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagtatatccaatagacaatttttaatac	13137637	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13137636	cttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	13137578	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15

Raw Score: 104; E-Value: 1e-51

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 15088779 - 15088988

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	15088779	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaa---gatgtaaaatt	15088872	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15088873	tttgtctatggtcctccacacttgaacaaatattagcatatccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaaa	15088972	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15088973	acattttgttccaaca	15088988	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16

Raw Score: 102; E-Value: 2e-50

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 332029 - 332154

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	332029	aaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagctaatctaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggtttattgt	332128	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	332129	taaacacattttgttccaacaatctc	332154	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17

Raw Score: 101; E-Value: 8e-50

Query Start/End: Original strand, 27 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19237070 - 19236673

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctg-----------------atggtcttcagcttctgat	109	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19237070	tgcaatgctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctggtaatcttcagctcctaatgatcttcagcttctgat	19236971	T

Q	110	gaaaaactgcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccct	209	Q
		\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	19236970	gaaagaccgcttatggtgatgttgcttctgatgaggtggttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttgacttcaaaatcact	19236871	T

Q	210	-tccttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatg	307	Q
		\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	19236870	attcttcagatgcttcaggcttcctttttgttgattccataactcttaatttgttcttccagaacctacagatatatttaacc--------ttgtatata	19236779	T

Q	308	gtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgtt	407	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	19236778	gtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaaatgacaatttttaataccttgttatcgtcaaaactctcaaagggtagtgttaaacacatttggtt	19236679	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18

Raw Score: 100; E-Value: 3e-49

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Original strand, 11319628 - 11319903

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa-catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	11319628	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcatcacttcaggagcactttggcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagctt	11319727	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11319728	cctttttgttgatttcattgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	11319821	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11319822	tagcatatccaattgacaa-tattaatactttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacatattttgttccaaca	11319903	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 169 - 414

Target Start/End: Original strand, 11793167 - 11793405

Alignment:

Q	169	atgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttcctt-catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttcc	267	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11793167	atgacgtcatcactttaggagcactaaacttcaggagcacttcttttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttcgctctcttttgttcttcc	11793266	T

Q	268	agaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11793267	tgaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaattccatttgataatttttaataccttgttat	11793360	T

Q	368	catcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11793361	catcaaaactctcaaagggtaatgttaaacaca--ttgttccaacaa	11793405	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 155 - 418

Target Start/End: Original strand, 13648943 - 13649203

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgc	251	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	13648943	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaaacttcctttttgttgattcctttgc	13649042	T

Q	252	tctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatt	351	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13649043	tctcttttgttcttctagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatattgaattgacaatt	13649136	T

Q	352	tttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13649137	ttttataccttattatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	13649203	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21

Raw Score: 96; E-Value: 7e-47

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10883108 - 10882833

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	10883108	gcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcgtcacttcaggagcactttgacttcagtagcacttctcttcagacgctttaagctt	10883009	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10883008	catttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	10882915	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10882914	tagcatatccaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	10882833	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16556582 - 16556460

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16556582	tttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacagtttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaa	16556483	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16556482	acacattttgttccaacaatctc	16556460	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Original strand, 16609080 - 16609202

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16609080	tttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacagtttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaa	16609179	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16609180	acacattttgttccaacaatctc	16609202	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 222 - 418

Target Start/End: Original strand, 21695684 - 21695874

Alignment:

Q	222	ttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|
T	21695684	ttcaagcttcctttttgttgattccttaactctcttttgttcttccagaaccta------ataaagataccaaatttttgtctatggttctgtacatttg	21695777	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21695778	aacaaatattagcatatccaattaacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	21695874	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 199 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 48800509 - 48800300

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	48800509	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatt	48800416	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	48800415	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccatttgacaatttttaatacattgttatcatcaagaccttcaaaga-taatgttaaac	48800317	T

Q	398	acattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48800316	acactttgttccaacaa	48800300	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13730489 - 13730369

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	13730489	aaatttttatctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgt	13730390	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13730389	taaacacattttgttccaaca	13730369	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 27 - 150

Target Start/End: Complemental strand, 13894025 - 13893902

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	13894025	tgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatgatcttcagctcctgatgaaaaactgcttctggt	13893926	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgctt	150	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13893925	gatgttgcttctgatgaggtgctt	13893902	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 220 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16316422 - 16316230

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	16316422	gcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttctttcagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacact	16316329	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16316328	tgaacaaatattagcatatctaattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgtttcaacaatctc	16316230	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12174100 - 12173978

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	12174100	tttttgtctatagtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgactatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaacgttaa	12174001	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12174000	acacattttgttccaacaatctc	12173978	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 2265310 - 2265185

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	2265310	aaatttttgtctaaagttctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttttaagggttatcgt	2265211	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2265210	taaacacattttgttccaacaatctc	2265185	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 161 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 13018429 - 13018220

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	13018429	tgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcactaaacttcaggagcacttttcttcagacgcttgaagcttcatccttgttgattccattgctctc-ttt	13018331	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13018330	gttcttcccgaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaaccaatattagcatatcaaattgacaatttttaatac	13018237	T

Q	360	cttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13018236	cttgttatcatcaaaac	13018220	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 14426896 - 14427017

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	14426896	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	14426995	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14426996	cacatttcgttccaacaatctc	14427017	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 14193280 - 14193578

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgtt--gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-c	212	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|
T	14193280	gcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctc	14193379	T

Q	213	ttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt---tcatt-gctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatgg	308	Q
		\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14193380	ttcagacgcttcaagcttcatttttgttgattctttaattagctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatgg	14193473	T

Q	309	tcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttc	408	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14193474	tcttgtacacttgaacacatattaggatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacatattttgttc	14193573	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30944133 - 30944017

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	30944133	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaattttaaa	30944034	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30944033	cacattttgttccaaca	30944017	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 33606069 - 33606185

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	33606069	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttcttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaa	33606168	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33606169	cacattttgttccaaca	33606185	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 23279819 - 23279697

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	23279819	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaacaccttgttattatcaaaactctcaaagggtaatgt	23279720	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23279719	taaacacattttgttccaacaat	23279697	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 8998654 - 8998537

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	8998654	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttagtgtaaa	8998555	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8998554	acacattttgttccaaca	8998537	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 9069952 - 9070073

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|
T	9069952	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcagagggtaatgt	9070051	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9070052	taaacacattttgttccaacaa	9070073	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 294 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 16111661 - 16111540

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaa-caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	16111661	aatttttgtctatagtcctttacacttgaatcaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcttaagggttaatgt	16111562	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16111561	taaacacattttgttccaacaa	16111540	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 148 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 33691646 - 33691383

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa-catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgattt	245	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33691646	cttctaatgaacttgcttctgataacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgctttaaacttcctttttgttgattc	33691547	T

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33691546	ctttgctctctattgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattg	33691453	T

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt-aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33691452	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaaacacattttgttccaacaa	33691383	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 35952446 - 35952329

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	35952446	tttttgtctatagtcttgtacacttgaacaagtattagcatatccaattgacaatttttaatattttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaa	35952347	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	35952346	acacattttgttacaaca	35952329	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5000633 - 5000513

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	5000633	aaatttttttctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaatggtaatgt	5000534	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5000533	taaacacattttgttccaaca	5000513	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 257 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7487695 - 7487539

Alignment:

Q	257	tttgttcttccagaacctatactttaa--atagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt	354	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7487695	tttgctcttccagaacctatgctttgataaaagacacttaaattttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagtatatccaattgacaattttt	7487596	T

Q	355	aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7487595	aataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaactcattttgttccaaca	7487539	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 315 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 15701047 - 15700947

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15701047	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacgttaaacacattttgttccaacaa	15700948	T

Q	415	t	415	Q
		\|
T	15700947	t	15700947	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 224 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 14304234 - 14304041

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14304234	caagcttgctttttgtagattcaatagctctcatttgttcttccagaacctatacttggtttagagacacttaaatttttgtctatggtcctgcacactt	14304135	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14304134	gaacaaatattatcatattcaattgac-atttttaataccttgttatcatcaaaa--ctaaaagggtaatgttaaactcattttgttccaacaatct	14304041	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 19710774 - 19710656

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	19710774	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactattaaggtttattgttaaa	19710675	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19710674	cacattttgttccaacaat	19710656	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 13303200 - 13303319

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	13303200	aaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-ttttaataccttattatcatcaaaactttcaaagggtaatgt	13303298	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13303299	taaacacattttgttccaaca	13303319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 28622142 - 28622026

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	28622142	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatgttagcatatacaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattctcaagggttaatattaaa	28622043	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28622042	cacattttgttccaaca	28622026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 326 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23390775 - 23390688

Alignment:

Q	326	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23390775	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaacacattttgttccaaca	23390688	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 48236710 - 48236591

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	48236710	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattt--aataccttgttatcagcaaaactcttaagggttaatgttaaa	48236613	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	48236612	cacattttgtttcatcaatctc	48236591	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 5826350 - 5826469

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	5826350	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	5826449	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5826450	aaacacattttgttccaaca	5826469	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 15469846 - 15469966

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	15469846	aaatttttgtctatggtcctgtatgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	15469945	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15469946	taaacaccttttgttccaaca	15469966	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Original strand, 27872077 - 27872199

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|
T	27872077	aatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttataatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattatt	27872176	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27872177	gctaaacatattttgttccaaca	27872199	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13174326 - 13174208

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacactt-gaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	13174326	tttgtctatggtcctgtacactttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaa	13174227	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13174226	aacacattttgttccaaca	13174208	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 15216876 - 15216998

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	15216876	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	15216975	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15216976	atacattttgttccaacaatctc	15216998	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 26209289 - 26209171

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	26209289	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	26209190	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26209189	acacattttgttccaacaa	26209171	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 118 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13260575 - 13260278

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac--taaacatcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	13260575	gcttctggtgatcttgcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttttgacttcatgagcacttctctt	13260476	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgc	314	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	13260475	taaatgcttcaagcttcctttatgttaattccttatctctcttttgttcttcaataaccta------ataatgatatcaaatttttacctatggtcatgt	13260382	T

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13260381	acacttgaaaaaatattagcatatccaattgataatttttaataccatgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacatattttgttccaacaa	13260282	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 302 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19339030 - 19338915

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	19339030	tctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgctaaaca	19338931	T

Q	399	cattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19338930	aattttgttccaacaa	19338915	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 314 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 39284369 - 39284268

Alignment:

Q	314	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39284369	cacatttgaacaaatattagcatatccaattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	39284270	T

Q	414	at	415	Q
		\|\|
T	39284269	at	39284268	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 9709609 - 9709494

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|
T	9709609	ttttgtctatggttatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtacaa	9709515	T

Q	397	cacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9709514	cacattttgttccaacaatct	9709494	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 225 - 407

Target Start/End: Complemental strand, 29935219 - 29935043

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29935219	aagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaac	29935126	T

Q	325	aaa-tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgtt	407	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29935125	aaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatc-aaactcttaaaggataatgttaaacgcattttgtt	29935043	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30945166 - 30945050

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	30945166	ttttgtctatagtcctgtacatttgaacaaatattaacatgttcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaa	30945067	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30945066	tacattttgttccaaca	30945050	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 388

Target Start/End: Complemental strand, 32264498 - 32264407

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	32264498	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaatgatta	32264407	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 3476064 - 3475946

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	3476064	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	3475965	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3475964	atacattttgttccaacaa	3475946	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 4821858 - 4821976

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|
T	4821858	ttttttctatagtcctgtacactttaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcgaaactctcaagggtcaatgttaca	4821957	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	4821958	cacattttgttctaacaat	4821976	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 18419692 - 18419814

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18419692	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaatcattaaggtttattgtgaa	18419791	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18419792	acacattttgttccaacaatctc	18419814	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24882144 - 24882026

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	24882144	tttgtctatggtcctgtacgcttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaa	24882045	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24882044	acacattttgttccaacaa	24882026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6043951 - 6043834

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	6043951	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	6043852	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6043851	acacattttgttccaaca	6043834	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11086780 - 11086663

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11086780	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatattcaattgacaaattttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	11086681	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11086680	atacattttgttccaaca	11086663	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 19193458 - 19193575

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19193458	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	19193557	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19193558	acacattttgttccaaca	19193575	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 8183327 - 8183450

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg--attag	389	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	8183327	aaatatttgtctatactcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaatgttattat	8183426	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8183427	tgctaaacacattttgttccaaca	8183450	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18361421 - 18361297

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	18361421	taaattttagtctatggtcctgaacacttgaacaaatattagcatatccaattgac-ttttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggcaat	18361325	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18361324	gttaaacacattttgttccaacaatctc	18361297	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 14425806 - 14425925

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	14425806	ttttgtctatagtcctgtatacttgaanaaatatnaacatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	14425905	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14425906	aaacacattttgttccaaca	14425925	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15888028 - 15887914

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15888028	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	15887929	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15887928	tgttccaacaatctc	15887914	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 48382722 - 48382840

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	48382722	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	48382821	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48382822	acacattttgttccaacaa	48382840	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12733907 - 12733790

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	12733907	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	12733808	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12733807	acacattttgttccaaca	12733790	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 314 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 13172162 - 13172062

Alignment:

Q	314	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13172162	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagtggtattgtcaaacacattttgttccaaca	13172064	T

Q	414	at	415	Q
		\|\|
T	13172063	at	13172062	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 224 - 377

Target Start/End: Original strand, 16412327 - 16412482

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16412327	caagcatcctttttgtagattacattgctcttatttgttcttccagaacctatgcttgatttaaagacactcaattttttgtctatggttctgcacactt	16412426	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16412427	gaacaaatattagcatattcaattga-tatttttaataccttattatcatcaaaact	16412482	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 18441773 - 18441890

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18441773	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	18441872	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18441873	acacattttgttccaaca	18441890	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 299 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 24794512 - 24794393

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	24794512	ttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatttaattgacattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgctaa	24794413	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24794412	acatattttgttccaacaat	24794393	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 24788444 - 24788551

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttg	405	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24788444	tggtcttgtacacttaaaagaatattagcatatcctattgacaatttttaatacattgttatcaacaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttg	24788543	T

Q	406	ttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24788544	ttccaaca	24788551	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 30050085 - 30050196

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagc-atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30050085	tggtcctgtacacttgaacaattattagcgataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	30050184	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30050185	tgttccaacaat	30050196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 7339659 - 7339548

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	7339659	ttttgtctatagtcctgtacactcgaacaaatattagcatatccaatttacaatttttaataccttgttatcatcaaaacactca------agagttaaa	7339566	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7339565	cacattttgttccaacaa	7339548	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 13682880 - 13683003

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-------tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattag	389	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	13682880	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttat	13682979	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13682980	tgtgaaacacattttgttccaaca	13683003	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 296 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18047689 - 18047574

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	18047689	tttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcaaaaccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgaaaatgtta	18047594	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18047593	aacacattttgttccaacaa	18047574	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 299 - 388

Target Start/End: Complemental strand, 21381224 - 21381135

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	21381224	ttgtctatagtcttatacacttgaacaaatattagcatatccaagtaacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagaatta	21381135	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 29590568 - 29590685

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	29590568	tttgcctatggtactgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	29590667	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29590668	atacattttgttccaaca	29590685	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31116244 - 31116135

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31116244	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	31116145	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31116144	tgttccaaca	31116135	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 40054490 - 40054377

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	40054490	ctatggtcctgtatacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacaca	40054391	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40054390	ttttgttccaacaa	40054377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 9396700 - 9396619

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9396700	taaattttagtctatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt--caacttttaataccttgttatcatcaaaa	9396619	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 246 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 16307555 - 16307397

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16307555	cattgctctcatttgttcttccagaaccaatacttgacatata------atttttgactatggtcctgcacatttgaacaaatattagcatatccaatta	16307462	T

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag-gattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16307461	aca--ttgtaataccttgttatcatcaaaa--cttaagttggtaatgttaaacacattttgttccaaca	16307397	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 25201317 - 25201206

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25201317	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	25201218	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25201217	tgttccaacaat	25201206	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 589797 - 589907

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	589797	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	589896	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	589897	tgttccaacaa	589907	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Original strand, 603152 - 603266

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaata-ttagc-atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	603152	ctatggtcatgtacatttgaacaaataattagctagatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattcaggtttattgttaaacac	603251	T

Q	400	attttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	603252	attttgttccaacaa	603266	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 9065819 - 9065902

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9065819	taaatttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattaatatatccaattgata--ttttaataccttgttatcatcaaaact	9065902	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21002758 - 21002644

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21002758	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	21002659	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21002658	tgttccaacaatctc	21002644	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 8934080 - 8934197

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	8934080	tttgcctatggtcctgtagacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	8934179	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8934180	acacattttgttccaaca	8934197	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 10561297 - 10561406

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10561297	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaatagccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacattt	10561396	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10561397	tgttccaaca	10561406	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 299 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 48805638 - 48805522

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	48805638	ttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcgt--ccaattgacaatttttaatacattgttattttcaaaactcttaagggttattattgataa	48805541	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48805540	acacattttattccaacaa	48805522	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 5035691 - 5035805

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	5035691	ttttagtctatggtcctgcacatttgaacaaatattaacatatccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgtta	5035786	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5035787	aatacattttgttccaaca	5035805	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 326 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13890708 - 13890623

Alignment:

Q	326	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13890708	aatactagcatatccaattcacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctaaagg--taatgttaaacacattttgttccaaca	13890623	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 293 - 376

Target Start/End: Original strand, 15304929 - 15305010

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15304929	aaattttagtttatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaac	15305010	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 317 - 418

Target Start/End: Original strand, 9160307 - 9160410

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9160307	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacaatttgttccaacaa	9160406	T

Q	415	tctc	418	Q
		\|\|\|\|
T	9160407	tctc	9160410	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 9763026 - 9763110

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9763026	taaattttagtctaaggtcctgcacacttgaacagatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc	9763110	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 40052408 - 40052293

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40052408	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40052309	T

Q	404	tgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40052308	tgttccaacaatctct	40052293	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 167432 - 167546

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	167432	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	167531	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	167532	tgttccaacaatctc	167546	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 467331 - 467217

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	467331	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	467232	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	467231	tgttccaacaatctc	467217	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 1878043 - 1877960

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1878043	taaattttactctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatacctagttatcatcaaaact	1877960	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 2715966 - 2715852

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2715966	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	2715867	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2715866	tgttccaacaatctc	2715852	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4223160 - 4223274

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4223160	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4223259	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4223260	tgttccaacaatctc	4223274	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 5686052 - 5686166

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5686052	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5686151	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5686152	tgttccaacaatctc	5686166	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6877607 - 6877493

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6877607	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6877508	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6877507	tgttccaacaatctc	6877493	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 8012458 - 8012344

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8012458	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8012359	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8012358	tgttccaacaatctc	8012344	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 8617936 - 8618050

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8617936	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacataataaggttcattgtgaaacacattt	8618035	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8618036	tgttccaacaatctc	8618050	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 9085833 - 9085947

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9085833	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9085932	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9085933	tgttccaacaatctc	9085947	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 11096605 - 11096719

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11096605	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11096704	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11096705	tgttccaacaatctc	11096719	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 12221353 - 12221463

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12221353	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	12221452	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12221453	tgttccaacaa	12221463	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 20491556 - 20491666

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20491556	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	20491655	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20491656	tgttccaacaa	20491666	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 22089673 - 22089787

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22089673	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22089772	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22089773	tgttccaacaatctc	22089787	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24735322 - 24735436

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24735322	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24735421	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24735422	tgttccaacaatctc	24735436	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 26400453 - 26400339

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26400453	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26400354	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26400353	tgttccaacaatctc	26400339	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 26699404 - 26699290

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26699404	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26699305	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26699304	tgttccaacaatctc	26699290	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 38593472 - 38593358

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	38593472	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacac	38593373	T

Q	400	attttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38593372	attttgttccaacaa	38593358	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 44281063 - 44281173

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44281063	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattggcaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	44281162	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44281163	tgttccaacaa	44281173	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 3166301 - 3166410

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3166301	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	3166400	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3166401	tgttccaaca	3166410	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 4428810 - 4428706

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagga-ttagtg-ttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4428810	acacttaaacaaatattaacttgtccaattggcaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatttattgctgaaaca-attttgttccaac	4428712	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	4428711	aatctc	4428706	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 12454167 - 12454276

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12454167	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	12454266	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12454267	tgttccaaca	12454276	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 20990212 - 20990313

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20990212	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	20990311	T

Q	413	aa	414	Q
		\|\|
T	20990312	aa	20990313	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Original strand, 1368230 - 1368306

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1368230	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	1368306	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 315 - 387

Target Start/End: Complemental strand, 4411693 - 4411621

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatt	387	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	4411693	acacttaaacaaatattagcttgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcttaaagatt	4411621	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 41842085 - 41841965

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	41842085	aaatttttgtttacggtcctgtacgtttgaacaaatattagcaaattaaatcgacaatttttaataccttgttatcataaaaactctcaacagataatgt	41841986	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41841985	taaacacattttgttccaaca	41841965	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 541607 - 541718

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	541607	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	541706	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	541707	tgttccaacaat	541718	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 8001813 - 8001702

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8001813	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8001714	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8001713	tgttccaacaat	8001702	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 11572077 - 11571994

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11572077	taaattttagtatatggtcctgc-cacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc	11571994	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 14745420 - 14745309

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14745420	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcataaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	14745321	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14745320	tgttccaacaat	14745309	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 28 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 39284590 - 39284511

Alignment:

Q	28	gcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39284590	gcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctgatgatcttcagcttctg	39284511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 1250689 - 1250579

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1250689	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	1250590	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1250589	tgttccaacaa	1250579	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4212561 - 4212675

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	4212561	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacatattt	4212660	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4212661	tgttccaacaatctc	4212675	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 9171563 - 9171661

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9171563	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaagttcattgtaaaacacattttgttccaaca	9171661	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 9433814 - 9433928

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9433814	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaatggacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9433913	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9433914	tgttccaacaatctc	9433928	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 11005752 - 11005866

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11005752	tggtcctgtacacttgaacagttattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11005851	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11005852	tgttccaacaatctc	11005866	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 373

Target Start/End: Complemental strand, 12222254 - 12222175

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaa	373	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12222254	taaattttagtctatggtcatgcacacttgaacaaatactagcatatccaatt--aaacttttaataccttgttatcatcaa	12222175	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17960474 - 17960360

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17960474	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatacctagttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17960375	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17960374	tgttccaacaatctc	17960360	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 24745269 - 24745379

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24745269	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24745368	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24745369	tgttccaacaa	24745379	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 26653075 - 26652965

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26653075	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26652976	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26652975	tgttccaacaa	26652965	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 454549 - 454440

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	454549	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	454450	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	454449	tgttccaaca	454440	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 923355 - 923464

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	923355	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	923454	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	923455	tgttccaaca	923464	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 1193058 - 1193167

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1193058	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	1193157	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1193158	tgttccaaca	1193167	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 2705362 - 2705253

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2705362	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	2705263	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2705262	tgttccaaca	2705253	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4347672 - 4347563

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4347672	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4347573	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4347572	tgttccaaca	4347563	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 8628499 - 8628608

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8628499	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8628598	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8628599	tgttccaaca	8628608	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 9095547 - 9095656

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9095547	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9095646	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9095647	tgttccaaca	9095656	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17949868 - 17949759

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17949868	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17949769	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17949768	tgttccaaca	17949759	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 19417563 - 19417647

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19417563	taaatttttgtctatggtcctgcacacttgaataaatattagcatatccaatt---aatcttttattatcttgttatcatcaaaactc	19417647	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 22100288 - 22100397

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22100288	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22100387	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22100388	tgttccaaca	22100397	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 24095899 - 24096008

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24095899	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24095998	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24095999	tgttccaaca	24096008	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24244201 - 24244092

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24244201	tggtcctgtacatttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	24244102	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24244101	tattccaaca	24244092	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 26290101 - 26289992

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26290101	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26290002	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26290001	tgttccaaca	26289992	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 26389811 - 26389702

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26389811	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26389712	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26389711	tgttccaaca	26389702	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 37344751 - 37344860

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37344751	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	37344850	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37344851	tgttccaaca	37344860	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40041859 - 40041750

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40041859	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40041760	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40041759	tgttccaaca	40041750	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 297 - 370

Target Start/End: Complemental strand, 48062603 - 48062530

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcat	370	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48062603	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattaacatattcaattgacaatttttaatactttgttatcat	48062530	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 34 - 110

Target Start/End: Original strand, 4494645 - 4494721

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatg	110	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4494645	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatg	4494721	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19985529 - 19985453

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19985529	ccaatttacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaa	19985453	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 9803518 - 9803602

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9803518	taaattttagtctaaggtcctacacacttgaacagatattagcatatctaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc	9803602	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 317 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21769665 - 21769566

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21769665	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaaaatattttgttccaacaa	21769566	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 1776849 - 1776959

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1776849	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	1776948	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1776949	tgttccaacaa	1776959	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 1988126 - 1988240

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1988126	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	1988225	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1988226	tgttccaacaatctc	1988240	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 6866975 - 6866865

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6866975	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6866876	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6866875	tgttccaacaa	6866865	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 9063960 - 9063877

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9063960	taaatttttgtatatgatcctacacatttgaacaaatattatcatatccaattgaca--ttttaataccttgttatcattaaaact	9063877	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9261513 - 9261403

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaatacc-ttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|
T	9261513	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacctttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacttt	9261414	T

Q	403	ttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9261413	ttgttccaaca	9261403	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20311902 - 20311804

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20311902	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	20311804	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 20598587 - 20598670

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20598587	taaactttagtctatgttcctgcacacttgaacaaatattaacatatccaattg--aaattttaataccttattatcatcaaaact	20598670	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 42866413 - 42866527

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42866413	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	42866512	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42866513	tgttccaacaatctc	42866527	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 417

Target Start/End: Original strand, 178024 - 178137

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	178024	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaatagacaatttttaataccttgttatcaccaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	178123	T

Q	404	tgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	178124	tgttccaacaatct	178137	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 319 - 411

Target Start/End: Original strand, 1293298 - 1293393

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag---gattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	1293298	ttgaacaaaaattagcatatccaatttataatttgtaatactttattatcatcaaaactcttaagaattattattgttaaacacattttattccaa	1293393	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 9444410 - 9444519

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9444410	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaagttcattgtgaaacacattt	9444509	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9444510	tgttccaaca	9444519	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 368

Target Start/End: Original strand, 16422886 - 16422960

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatc	368	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16422886	taaattttagtctatggtcttgcatacttgaacaaatactagcatattcaattg--aacttttaataccttgttatc	16422960	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 22393763 - 22393872

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22393763	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttaacatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22393862	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22393863	tgttccaaca	22393872	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 24450768 - 24450877

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24450768	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	24450867	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24450868	tgttccaaca	24450877	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24930353 - 24930244

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24930353	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24930254	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24930253	tgttccaaca	24930244	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11078241 - 11078141

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11078241	acacttgaacagttattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	11078142	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	11078141	a	11078141	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 12597788 - 12597703

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12597788	taaatatttgtctatggtcctgcactcttgaacaaatatttgcatatcgaattg--atcttttaataccttgtaatcatcaaaactct	12597703	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 295 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24810955 - 24810838

Alignment:

Q	295	atttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \|\| \| \|
T	24810955	attttagtctatgatcctgcacacttgaacaaatattaacatatgcaattg--aacttttattaccttgttatcatcaaaacttatgaggcattgtttaa	24810858	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24810857	aactcattttgttccaacaa	24810838	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 212 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 13890800 - 13890737

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13890800	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctttcatttgttctcccagaaccta	13890737	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 16813250 - 16813334

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16813250	taaattttagtctatggtgctgcactcttgaacaaatattagcatattcaattg--aacttgtaatacattgttatcatcaaaactc	16813334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 1998747 - 1998857

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1998747	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	1998846	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1998847	tgttccaacaa	1998857	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 340 - 413

Target Start/End: Original strand, 5738884 - 5738958

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5738884	caattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtaaaacacattttgttccaaca	5738958	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 11016332 - 11016415

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	11016332	taaattttagtctatggtcctgcacgcttaaacaaatattagcatatccaatt--aaacttttaataccttattatcattaaaact	11016415	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 16307312 - 16307186

Alignment:

Q	292	taaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|
T	16307312	taaatttttagtctatagtcctgcacacttaaacaaatattagcatacccaattg--agcttttaatactttgttatcatcaaaact-taaaggtggtaa	16307216	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	16307215	tgttaaacacattttgttcccacaaactct	16307186	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 340 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23264307 - 23264233

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23264307	caattgacaatttttaataccttgttatcattaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	23264233	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 16316576 - 16316503

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16316576	ttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctgatgaacttcaacttctg	16316503	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22493941 - 22493832

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22493941	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaatatccaattgattatttttaataccttgttatcattaaaacttaataaggttaattgtgaaacacattt	22493842	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22493841	tgttccaaca	22493832	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 42877039 - 42877148

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42877039	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	42877138	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42877139	tgttccaaca	42877148	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 45922151 - 45922042

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45922151	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	45922052	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45922051	tgttccaaca	45922042	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 48710241 - 48710132

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48710241	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaattccttgttttcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	48710142	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48710141	tgttccaaca	48710132	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 312 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 3778323 - 3778259

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3778323	tgcacacttgaacaaatattaacatatcaaattg--aacttttaataccttgttataatcaaaactc	3778259	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 4550017 - 4550101

Alignment:

Q	292	taaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	4550017	taaatttttagtctatggtcatgcacacttaaacaaatattagcatattcgattg--aacttttaatactttgttatcattaaaact	4550101	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 13692489 - 13692540

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13692489	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatg	13692540	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 374

Target Start/End: Original strand, 23126266 - 23126346

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23126266	taaattttagtctatggtccgacacacttgaacaactattagcatatccaattg--aacttttaatattttgttatcatcaaa	23126346	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 112

Target Start/End: Complemental strand, 30944342 - 30944266

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30944342	ttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaagt-tg-catctcctgatgaactgcagcttctgatgaa	30944266	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 112

Target Start/End: Complemental strand, 30945375 - 30945299

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30945375	ttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaagt-tg-catctcctgatgaactgcagcttctgatgaa	30945299	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 10883192 - 10883119

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10883192	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctg	10883119	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 11793046 - 11793119

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11793046	ttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	11793119	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 24 - 76

Target Start/End: Complemental strand, 13730705 - 13730652

Alignment:

Q	24	ttatgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaag	76	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13730705	ttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaag	13730652	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 21283392 - 21283347

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21283392	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	21283347	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 21695540 - 21695613

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21695540	ttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctg	21695613	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 133 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 13730627 - 13730567

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	13730627	gcttatgatgagatgcttctaatgaacttgtttatgatgacgtcatcacttcaggagcact	13730567	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 14114410 - 14114491

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14114410	taaattttagtatatgatcatgcacatttgaacaaatattatcatatccaattg--aacttttaatacgtttttatcatcaaaa	14114491	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 14424060 - 14424141

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14424060	taaattttagtatatgatcatgcacatttgaacaaatattatcatatccaattg--aacttttaatacgtttttatcatcaaaa	14424141	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 8183164 - 8183211

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	8183164	tgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	8183211	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 334 - 377

Target Start/End: Original strand, 9070074 - 9070117

Alignment:

Q	334	catatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9070074	catatccaattgataatttttaatatcttgttatcatcaaaact	9070117	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 104

Target Start/End: Original strand, 44467203 - 44467274

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagctt	104	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44467203	ttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctt	44467274	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 2500177 - 2500222

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2500177	ttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct	2500222	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 13302949 - 13302994

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13302949	ttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	13302994	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 13648868 - 13648941

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	13648868	ttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctgatgagctttagcttctg	13648941	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 23649352 - 23649461

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23649352	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaaaacattgatatcataaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	23649451	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23649452	tgttccaaca	23649461	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 54 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 41842272 - 41842220

Alignment:

Q	54	tgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41842272	tgaacaacctttgaagctt-aagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg	41842220	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 43 - 107

Target Start/End: Original strand, 24788289 - 24788353

Alignment:

Q	43	attaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24788289	attaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctg	24788353	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 56 - 107

Target Start/End: Original strand, 331806 - 331856

Alignment:

Q	56	aacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	331806	aacaacctttgaagctttaagtccg-catctcctgatggacttcagcttctg	331856	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 302 - 345

Target Start/End: Complemental strand, 7185349 - 7185306

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7185349	tctatgatcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattg	7185306	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 77

Target Start/End: Original strand, 9069701 - 9069744

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt	77	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9069701	ttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagt	9069744	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 15088659 - 15088718

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	15088659	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctgatg	15088718	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 304 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 15870889 - 15870817

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15870889	tatggtcgttcacacttgactaaatattagcttatccaattta--acttttaataccttcttatcatcaaaactc	15870817	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 297 - 348

Target Start/End: Complemental strand, 16542813 - 16542762

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgaca	348	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16542813	ttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattaccatatccaattgaca	16542762	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 297 - 348

Target Start/End: Original strand, 16622849 - 16622900

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgaca	348	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16622849	ttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattaccatatccaattgaca	16622900	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 229 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 13730547 - 13730501

Alignment:

Q	229	ttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13730547	ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta	13730501	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 35 - 93

Target Start/End: Original strand, 15468056 - 15468114

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	15468056	tagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	15468114	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 155 - 193

Target Start/End: Original strand, 24788355 - 24788393

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24788355	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	24788393	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 24 - 77

Target Start/End: Complemental strand, 48236932 - 48236878

Alignment:

Q	24	ttatgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt	77	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48236932	ttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagt	48236878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 39 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 13032087 - 13032046

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13032087	cgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct	13032046	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 13137914 - 13137869

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13137914	ttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtct	13137869	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 199 - 275

Target Start/End: Original strand, 13303111 - 13303188

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13303111	tcaggagcacttctcttcagacgctttaaacttcttttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccataaccta	13303188	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 326 - 359

Target Start/End: Complemental strand, 13890737 - 13890704

Alignment:

Q	326	aatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13890737	aatattagcatatcaaattgacaatttttaatac	13890704	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 345

Target Start/End: Original strand, 19143928 - 19143981

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19143928	taaattttaatctatggtccttcacaattgaacatatattagcatatccaattg	19143981	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 345

Target Start/End: Original strand, 20743327 - 20743380

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20743327	taaattttaatctatggtccttcacaattgaacatatattagcatatccaattg	20743380	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 28409178 - 28409223

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	28409178	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtct	28409223	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 42 - 90

Target Start/End: Complemental strand, 5000832 - 5000784

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctg	90	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5000832	gattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg	5000784	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 39284500 - 39284464

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39284500	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	39284464	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 212)

Name: chr5

Description:

Target: chr5; HSP #1

Raw Score: 186; E-Value: 1e-100

Query Start/End: Original strand, 27 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 25096829 - 25096457

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	25096829	tgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgatcttcagctccggatgaaaaactgcttttggt	25096730	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaa	226	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25096729	gatgttgcttctgacggggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt----------------caggagcactttcttcagatgcttcaa	25096646	T

Q	227	gcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25096645	acttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttctcacagaacctacgctttaagtaaacactaaatttttgtctatggtcctgcacatttgaacaa	25096546	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacac--attttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25096545	atattagcatattcaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacatattttgttccaacaa	25096457	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2

Raw Score: 186; E-Value: 1e-100

Query Start/End: Original strand, 27 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 25154799 - 25154427

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	25154799	tgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgatcttcagctccggatgaaaaactgcttttggt	25154700	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaa	226	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25154699	gatgttgcttctgacggggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt----------------caggagcactttcttcagatgcttcaa	25154616	T

Q	227	gcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25154615	acttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttctcacagaacctacgctttaagtaaacactaaatttttgtctatggtcctgcacatttgaacaa	25154516	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacac--attttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25154515	atattagcatattcaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacatattttgttccaacaa	25154427	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3

Raw Score: 162; E-Value: 3e-86

Query Start/End: Original strand, 297 - 490

Target Start/End: Complemental strand, 14086308 - 14086116

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14086308	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttt-aatatcttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	14086210	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctctgcaaatttttccatatatgagaggtaatcatccttcttgacatatttcctcttaaaaatagtgttaatctt	490	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14086209	cacattttgttccaacaatctctgcaaatatttccagatatgagaggtaatcgtccttcttgacatatttcctcttaaaaatagtgttaatctt	14086116	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 199 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 23412854 - 23412641

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	23412854	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgctcttccagaaccta------ataaagatatcaaatt	23412761	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	23412760	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaaatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaac	23412661	T

Q	398	acattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23412660	acattttgttccaacaatct	23412641	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5

Raw Score: 111; E-Value: 8e-56

Query Start/End: Original strand, 155 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 89345 - 89086

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgct	252	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|
T	89345	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagtagcactttgacttcagaagcacttctcttcagacacttcaagcttcctttttgttgattccttagct	89246	T

Q	253	ctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattt	352	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	89245	ctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtgcacttgaataaatattagcatatccaattgacaattt	89152	T

Q	353	ttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	89151	ttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagagtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	89086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 17815174 - 17815466

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	17815174	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctctt	17815273	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgc	314	Q
		\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17815274	cagatgttttaagcttcctttttgttgattcctttactctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcttgt	17815367	T

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17815368	acacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaaggataatgttaaacacattttgttccaaca	17815466	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7

Raw Score: 96; E-Value: 7e-47

Query Start/End: Original strand, 133 - 415

Target Start/End: Original strand, 20551101 - 20551363

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551101	gcttctgatgagatgcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatcactt----------------caggagcacttctcttcagatgcttcaagcttc	20551184	T

Q	232	cttctt-gttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551185	cttttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctctacacttgaacaaatat	20551278	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551279	tagcatatgcaattgacaatttttaataccttgttatgatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatcttgttccaacaat	20551363	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8

Raw Score: 96; E-Value: 7e-47

Query Start/End: Original strand, 161 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21072142 - 21071894

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|
T	21072142	tgcttctgatgacctcatcacttcaggagcactaaatttcatgagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctttttt	21072043	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21072042	gttctttcagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattaacatatccaattaacaatttttaatat	21071949	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21071948	cttattatcatcaaaactcttaaagagtaacattaaacacattttattccaacaa	21071894	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 4887389 - 4887505

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	4887389	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	4887488	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4887489	cacattttgttccaaca	4887505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 42244080 - 42244196

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	42244080	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacagtttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggtta-tgttaaa	42244178	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42244179	cacattttgttccaacaa	42244196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 19536059 - 19535933

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	19536059	aaatttttgtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcctatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactttcaaagggtaatgt	19535960	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19535959	taaacacattttgttccaacaatctct	19535933	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Original strand, 30743394 - 30743516

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	30743394	tttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttataatacattgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttag	30743493	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30743494	acacattttgttacaacaatctc	30743516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 220 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7745488 - 7745301

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	7745488	gcttcaagcttcctttttgttgatccatttgctctcttttgttctttcagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggttctgtacact	7745395	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7745394	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaatcttaaagggtgatgttaaacacattttgttccaaca	7745301	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 28464103 - 28463980

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta---g	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28464103	aaatttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactcttaaggattatttt	28464004	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28464003	tgctaaacacattttgttccaaca	28463980	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 31118242 - 31118359

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	31118242	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatttacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaa	31118341	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	31118342	cacattttgtttcaacaa	31118359	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21099619 - 21099341

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	21099619	gcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcatgagcacttttcttcagacgcttcaagcctc	21099520	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21099519	ctttttgttgattccatggctcttaatttgttcttccaaaacctaca-----aatatact-taacctt--gtatatggtcatgcacacttcaacaaatat	21099428	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21099427	tagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatc-aaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	21099341	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 26784723 - 26784839

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	26784723	ttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaattccttgttatcatcaaaactcttaaaggataatgttaaa	26784822	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26784823	cacattttgttccaaca	26784839	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 28139952 - 28140072

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|
T	28139952	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcaacaaaactcttaaaggttattgc	28140051	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28140052	taaacacattttgttccaaca	28140072	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 13523581 - 13523703

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	13523581	tttgcctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	13523680	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13523681	acacattttgttccaacaatctc	13523703	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20214859 - 20214742

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20214859	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	20214760	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20214759	acacattttgttccaaca	20214742	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 21910909 - 21911026

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	21910909	tttttgtctatgatcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaa	21911008	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21911009	acacattttgttccaaca	21911026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 21660606 - 21660730

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	21660606	ttttgtctatagtcctgtacacttgaaaaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	21660705	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21660706	aaacacattttgttccaacaatctc	21660730	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 26251454 - 26251571

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	26251454	tttttgtctatggtcctgcgcacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaact-taaaggtggtagtgtta	26251552	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26251553	aacacattttgttccaaca	26251571	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 3245196 - 3245072

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	3245196	aaatttttgcctatagtcttgtacgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	3245097	T

Q	393	t--aaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3245096	tgctaatacattttgttccaacaat	3245072	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 15517351 - 15517472

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|
T	15517351	aaatttttgtctaaagtcatgtatacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacat	15517450	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15517451	taagcacattttgttccaacaa	15517472	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 236 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 22403931 - 22403787

Alignment:

Q	236	ttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattag	333	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22403931	ttgtagattccattgctctcatttgttcttccataacatatgcttgaattaaagacactaaatttttgtctatggtcctccacacttgaacaaatattag	22403832	T

Q	334	catatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22403831	catatttaattgacattttttaatatcttgttatcatcaaaactc	22403787	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 140 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 642615 - 642348

Alignment:

Q	140	atgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttg	238	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	642615	atgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttgacttcaggatcacttttcttcagacgcttcaagcttcctttttg	642516	T

Q	239	ttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata	337	Q
		\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	642515	tcgattccatagctctcaatttgttctttcaaaacctaca-----aatatact-taacctt--gtatatggtcctgcacacttgaacaaatattagcata	642424	T

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	642423	tccaattgacaatttttaataccttattattatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacccattttattccaaca	642348	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6512219 - 6512103

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	6512219	ttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgttaaa	6512120	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6512119	cagattttgttccaaca	6512103	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 298 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 40032512 - 40032392

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	40032512	tttgtttatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattataaa	40032413	T

Q	396	acacattttgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40032412	acacattttgttccaacaatc	40032392	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Original strand, 9089292 - 9089417

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	9089292	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgaaattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttatttt	9089391	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9089392	tgctaaacacattttgttccaacaat	9089417	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9398513 - 9398399

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9398513	ttgtatatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaaaggtcatgttaaaca	9398414	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9398413	tattttgttccaaca	9398399	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12352588 - 12352474

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12352588	ttgtatatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatatacaattgacgatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaaca	12352489	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12352488	cattttgttccaaca	12352474	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 13534308 - 13534426

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	13534308	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	13534407	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13534408	acacattttgttccaacaa	13534426	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 302 - 418

Target Start/End: Original strand, 23478760 - 23478878

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23478760	tctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgttaaacac	23478859	T

Q	400	attttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23478860	attttgttccaacaatctc	23478878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 29138162 - 29138042

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	29138162	ttttgtttatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgct	29138063	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	29138062	aaacacattttgtttcaacaa	29138042	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 35985989 - 35985869

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	35985989	tttgtctatagccctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgtta	35985890	T

Q	395	aacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35985889	aacatattttgttccaacaat	35985869	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 1915794 - 1915911

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|
T	1915794	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttatcgtaaa	1915893	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1915894	acacattttgttccaaca	1915911	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11207707 - 11207590

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt-agcata-tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	11207707	ttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatatttagcaaagtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgttaa	11207608	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11207607	acacattttgttccaaca	11207590	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 33023030 - 33023147

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	33023030	ttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgttaa	33023129	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33023130	acacattttgttccaaca	33023147	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 40229053 - 40229170

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	40229053	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	40229152	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40229153	acatattttgttccaaca	40229170	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 34638773 - 34638964

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata----gacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	34638773	caagctccctttttgtagaatccattgctctaatttgttcttctagaacctatgcttgatatataaagacattaaatttttgtccattgtcctgcacact	34638872	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	34638873	tgaacaaatattagcatatccaattga-tattcttaataccttgttatcatcaaaactcaaaagg-gtaatgttaaacacattttattccaaca	34638964	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 105897 - 105778

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	105897	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	105798	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	105797	acacattttgttccaacaat	105778	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 25929935 - 25929813

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg--attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|
T	25929935	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttattattatcaaaactcttaaggttattatt	25929836	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25929835	gctaaacacattttcttccaaca	25929813	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 330 - 409

Target Start/End: Original strand, 33933741 - 33933820

Alignment:

Q	330	ttagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33933741	ttagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattaatgttaaacacattttgttcc	33933820	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 5430250 - 5430365

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	5430250	ttttgtatatagtcctgtacacttgaacaaatattagca------attgactatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	5430343	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5430344	cacattttgttccaacaatctc	5430365	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 13405480 - 13405598

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaa-caaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	13405480	tttgtctatggtcctgtacacttgaaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaa	13405579	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13405580	aacacattttgttccaaca	13405598	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Original strand, 23590114 - 23590227

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23590114	ttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatatccaattgacactttttaataccttgttatcatcaaaact-taaagtggtattgttaaaca	23590212	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23590213	tattttgttccaaca	23590227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20167831 - 20167714

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20167831	tttgtctttggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaa	20167732	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20167731	acacattttgttccaaca	20167714	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 311 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20624527 - 20624418

Alignment:

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttc	408	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20624527	ttgcccacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattttgttc	20624428	T

Q	409	caacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20624427	caacaatctc	20624418	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 248 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20237242 - 20237075

Alignment:

Q	248	ttgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact----aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20237242	ttgctctcatttgttcttccagaaccaatactttgtttaaagacttataaaattttagtctatgatcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	20237143	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20237142	tg--aacttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggcaatgttaaacacattttgttccaacaa	20237075	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Original strand, 20969568 - 20969686

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	20969568	taaattcttgtctatggtcttgcacacttaaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaagaccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaat	20969663	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20969664	gttaaacacattttgttccaaca	20969686	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 30115626 - 30115524

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	30115626	acacttgaacaaatactagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgctaaacacattttgtttcaa	30115527	T

Q	412	caa	414	Q
		\|\|\|
T	30115526	caa	30115524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Original strand, 32754451 - 32754562

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	32754451	tatggtcctgtacacttgagcaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacat	32754550	T

Q	402	tttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32754551	tttgttccaaca	32754562	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 297 - 388

Target Start/End: Complemental strand, 35931765 - 35931674

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35931765	ttttgtctatagtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttactactttgttatcatcaaaactcttaaggatta	35931674	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19477758 - 19477644

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19477758	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	19477659	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19477658	tgttccaacaatctc	19477644	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 21414696 - 21414818

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	21414696	tttgcctatggtcctgtacacttgaaaaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcttcaaaactcattaaggtttattgtgaa	21414795	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21414796	acacattttgttccaacaatctc	21414818	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21519833 - 21519719

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21519833	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	21519734	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21519733	tgttccaacaatctc	21519719	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 35542873 - 35542755

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	35542873	tttgcctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaataatcaattgacaatttttaacaccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	35542774	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35542773	acacattttgttccaacaa	35542755	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20416682 - 20416565

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20416682	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	20416583	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20416582	acacattttgttccaaca	20416565	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21198800 - 21198691

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21198800	tatggtcctgcatacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatgccttattatcatcaaaactcataaagggtaatgttaaacacattt	21198701	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21198700	tattccaaca	21198691	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 299 - 414

Target Start/End: Original strand, 32161182 - 32161300

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|
T	32161182	ttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaggggttaatattgctaa	32161281	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32161282	acacattttgttccaacaa	32161300	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 41566216 - 41566096

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	41566216	aaatttttgtttatggttctgtacacttgaacaaatataagcatatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactttcaaagggtaatgt	41566117	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41566116	caaacacattttgttccaaca	41566096	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 133 - 338

Target Start/End: Original strand, 23881289 - 23881489

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23881289	gcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcagtagacttcaagagcacttttcttcagacgcttcaagcttc	23881388	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23881389	attcttgttgattccattgctatcttttgttcttctagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtgtatgatcctgtacacttgaacaaatatt	23881482	T

Q	332	agcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|
T	23881483	agcatat	23881489	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 36095399 - 36095280

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgt-ta	394	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	36095399	tttgcctatgatcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	36095300	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36095299	aacacattttgttccaacaa	36095280	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 36096856 - 36096737

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgt-ta	394	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	36096856	tttgcctatgatcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	36096757	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36096756	aacacattttgttccaacaa	36096737	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 1109633 - 1109747

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1109633	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	1109732	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1109733	tgttccaacaatctc	1109747	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 17447200 - 17447314

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17447200	tggtcctgtacacttgaacaattattaacaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	17447299	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17447300	tgttccaacaatctc	17447314	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 34062393 - 34062279

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34062393	tggtcctgtacacttgaacaataattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	34062294	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34062293	tgttccaacaatctc	34062279	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 383

Target Start/End: Original strand, 11994297 - 11994382

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag	383	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11994297	tttgtctatagtcctgtacgcttgaacaactattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaag	11994382	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 17457816 - 17457925

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17457816	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	17457915	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17457916	tgttccaaca	17457925	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19463728 - 19463619

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19463728	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	19463629	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19463628	tgttccaaca	19463619	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21517500 - 21517391

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21517500	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	21517401	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21517400	tgttccaaca	21517391	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 42394770 - 42394661

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42394770	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	42394671	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42394670	tgttccaaca	42394661	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 10849151 - 10849270

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctta--aggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|
T	10849151	tttttgtctatagtcctgcacacttgaacaaatattagtatatcaaattgataatttttaatactttattatcatcaaaactcttaggattattattgct	10849250	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10849251	aaacatattttgttccaaca	10849270	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 37406403 - 37406303

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37406403	acacttgaacaattattagcaataactaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattttgttccaac	37406304	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	37406303	a	37406303	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 414

Target Start/End: Original strand, 43622369 - 43622468

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43622369	acttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	43622468	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 5291047 - 5291161

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5291047	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5291146	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5291147	tgttccaacaatctc	5291161	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20797468 - 20797354

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20797468	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	20797369	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20797368	tgttccaacaatctc	20797354	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23406219 - 23406105

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	23406219	tggtcctgtacacttgaaaaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaagcacattt	23406120	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23406119	tgttccaacaatctc	23406105	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23707177 - 23707063

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23707177	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	23707078	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23707077	tgttccaacaatctc	23707063	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24817357 - 24817471

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24817357	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	24817456	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24817457	tgttccaacaatctc	24817471	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24827945 - 24828059

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24827945	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	24828044	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24828045	tgttccaacaatctc	24828059	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 30227968 - 30228082

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30227968	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	30228067	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30228068	tgttccaacaatctc	30228082	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 31448309 - 31448195

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31448309	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	31448210	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31448209	tgttccaacaatctc	31448195	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 42053149 - 42053035

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42053149	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	42053050	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42053049	tgttccaacaatctc	42053035	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 43044159 - 43044269

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43044159	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacattt	43044258	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43044259	tgttccaacaa	43044269	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 8521614 - 8521505

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8521614	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	8521515	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8521514	tgttccaaca	8521505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 21706463 - 21706572

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21706463	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaatttacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	21706562	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21706563	tgttccaaca	21706572	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23392472 - 23392363

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23392472	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaatcattaaggttcattgtgaaacacattt	23392373	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23392372	tgttccaaca	23392363	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 24983925 - 24984034

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24983925	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacattt	24984024	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24984025	tgttccaaca	24984034	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 416

Target Start/End: Original strand, 9377933 - 9378045

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9377933	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	9378032	T

Q	404	tgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9378033	tgttccaacaatc	9378045	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 317 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20562085 - 20561982

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20562085	acttgaacaattattagtaataaccaaatgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	20561986	T

Q	415	tctc	418	Q
		\|\|\|\|
T	20561985	tctc	20561982	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 411

Target Start/End: Original strand, 21703599 - 21703706

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21703599	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	21703698	T

Q	404	tgttccaa	411	Q
		\| \|\|\|\|\|\|
T	21703699	ttttccaa	21703706	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 5301606 - 5301716

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5301606	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5301705	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5301706	tgttccaacaa	5301716	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 6499623 - 6499721

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6499623	acacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccctgttatcatcaaaacattcaaagggtaatattaaacatattttgttccaaca	6499721	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9346332 - 9346218

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9346332	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9346233	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9346232	tgttccaacaatctc	9346218	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 14040385 - 14040271

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14040385	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14040286	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14040285	tgttccaacaatctc	14040271	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 14558489 - 14558603

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14558489	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14558588	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14558589	tgttccaacaatctc	14558603	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22156893 - 22156779

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22156893	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22156794	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22156793	tgttccaacaatctc	22156779	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22685791 - 22685677

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22685791	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22685692	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22685691	tgttccaacaatctc	22685677	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23372300 - 23372186

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23372300	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23372201	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23372200	tgttccaacaatctc	23372186	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24588577 - 24588691

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24588577	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24588676	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24588677	tgttccaacaatctc	24588691	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24926627 - 24926741

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24926627	tggtcctgtacacttgaacaattattaacaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacattt	24926726	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24926727	tgttccaacaatctc	24926741	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27042701 - 27042815

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27042701	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27042800	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27042801	tgttccaacaatctc	27042815	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 27470349 - 27470235

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27470349	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27470250	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27470249	tgttccaacaatctc	27470235	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27603889 - 27604003

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27603889	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27603988	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27603989	tgttccaacaatctc	27604003	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 30070410 - 30070520

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30070410	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	30070509	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30070510	tgttccaacaa	30070520	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 31588800 - 31588717

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	31588800	taaatttttgtttatggtcttgcacactttaacaaatattagcatatccaattg--aaattttaataccttgttaccatcagaact	31588717	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 31843748 - 31843634

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31843748	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	31843649	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31843648	tgttccaacaatctc	31843634	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 34051732 - 34051622

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34051732	tggtcctgtacacttgaacaataattagcaataaccaattgacaagttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	34051633	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34051632	tgttccaacaa	34051622	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 35225861 - 35225747

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35225861	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35225762	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35225761	tgttccaacaatctc	35225747	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 36583012 - 36583126

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36583012	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36583111	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36583112	tgttccaacaatctc	36583126	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 39362103 - 39361989

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39362103	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39362004	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39362003	tgttccaacaatctc	39361989	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 40400808 - 40400694

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40400808	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40400709	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40400708	tgttccaacaatctc	40400694	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9335745 - 9335636

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9335745	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattt	9335646	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9335645	tgttccaaca	9335636	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 15694502 - 15694611

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15694502	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	15694601	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15694602	tgttccaaca	15694611	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 288 - 345

Target Start/End: Original strand, 16607895 - 16607952

Alignment:

Q	288	acactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16607895	acactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcgtatccaattg	16607952	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20551588 - 20551479

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551588	tggtcttgtatacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattt	20551489	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551488	tgttccaaca	20551479	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 30238495 - 30238604

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30238495	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	30238594	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30238595	tgttccaaca	30238604	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36228512 - 36228403

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36228512	tggtcttgtatacttaaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	36228413	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36228412	tgttccaaca	36228403	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 298 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 2152691 - 2152612

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2152691	tttgtctatggtcctacacacttgaacaaatattagcatatccaatt-atcatttttaatactttgttatcatcaaaactc	2152612	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 39 - 103

Target Start/End: Complemental strand, 21198998 - 21198934

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagct	103	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21198998	cgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagct	21198934	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 42042565 - 42042465

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42042565	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	42042466	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	42042465	a	42042465	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 7032599 - 7032710

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7032599	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	7032698	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7032699	tgttccaacaat	7032710	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 10754282 - 10754171

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10754282	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	10754183	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10754182	tgttccaacaat	10754171	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 27203599 - 27203488

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27203599	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	27203500	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27203499	tgttccaacaat	27203488	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6986086 - 6985972

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6986086	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6985987	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6985986	tgttccaacaatctc	6985972	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 14447506 - 14447620

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14447506	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaatagggttcactgtgaaacacattt	14447605	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14447606	tgttccaacaatctc	14447620	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 15739685 - 15739575

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15739685	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15739586	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15739585	tgttccaacaa	15739575	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 15993800 - 15993914

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15993800	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcatcgtgaaacacattt	15993899	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15993900	tgttccaacaatctc	15993914	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22146310 - 22146200

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22146310	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22146211	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22146210	tgttccaacaa	22146200	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22559251 - 22559141

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22559251	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	22559152	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22559151	tgttccaacaa	22559141	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23306634 - 23306520

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23306634	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcaataaggttcattttgaaacacattt	23306535	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23306534	tgttccaacaatctc	23306520	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23361899 - 23361789

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23361899	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23361800	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23361799	tgttccaacaa	23361789	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24566879 - 24566769

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24566879	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24566780	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24566779	tgttccaacaa	24566769	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 27623238 - 27623348

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27623238	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27623337	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27623338	tgttccaacaa	27623348	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 31358942 - 31358828

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31358942	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	31358843	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31358842	tgttccaacaatctc	31358828	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 34771702 - 34771592

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34771702	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	34771603	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34771602	tgttccaacaa	34771592	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 34782647 - 34782537

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34782647	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	34782548	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34782547	tgttccaacaa	34782537	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 36593567 - 36593677

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36593567	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36593666	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36593667	tgttccaacaa	36593677	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 37778834 - 37778944

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37778834	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	37778933	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37778934	tgttccaacaa	37778944	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 39491403 - 39491517

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39491403	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39491502	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39491503	tgttccaacaatctc	39491517	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6130578 - 6130469

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6130578	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6130479	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6130478	tgttccaaca	6130469	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6975596 - 6975487

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6975596	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6975497	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6975496	tgttccaaca	6975487	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 294 - 378

Target Start/End: Original strand, 12079197 - 12079279

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12079197	aatttttgtctatggttctgcttacttgaacaaatattagcatatctaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc	12079279	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14029832 - 14029723

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14029832	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14029733	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14029732	tgttccaaca	14029723	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 14569126 - 14569235

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14569126	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14569225	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14569226	tgttccaaca	14569235	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22675887 - 22675778

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22675887	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22675788	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22675787	tgttccaaca	22675778	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24807702 - 24807593

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24807702	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24807603	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24807602	tgttccaaca	24807593	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 27053326 - 27053435

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27053326	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27053425	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27053426	tgttccaaca	27053435	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31418418 - 31418309

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31418418	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaagtttcattgtgaaacacattt	31418319	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31418318	tgttccaaca	31418309	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 33952307 - 33952416

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33952307	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	33952406	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33952407	tgttccaaca	33952416	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 35215294 - 35215185

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35215294	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35215195	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35215194	tgttccaaca	35215185	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 40514479 - 40514588

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40514479	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40514578	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40514579	tgttccaaca	40514588	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 306 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 15768845 - 15768738

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15768845	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15768746	T

Q	404	tgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15768745	tgttccaa	15768738	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 315 - 374

Target Start/End: Complemental strand, 23389199 - 23389140

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23389199	acacttgaagaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaa	23389140	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23691629 - 23691554

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23691629	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	23691554	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17617468 - 17617354

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17617468	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaagaaggttctttgtgaaacacattt	17617369	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17617368	tgttccaacaatctc	17617354	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17729325 - 17729211

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17729325	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaaaaaggttctttgtgaaacacattt	17729226	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17729225	tgttccaacaatctc	17729211	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 324 - 378

Target Start/End: Original strand, 19749880 - 19749933

Alignment:

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19749880	caaatattagcatatccaattgaca-tttttaataccttgttatcatcaaaactc	19749933	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 297 - 355

Target Start/End: Original strand, 33933685 - 33933743

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttta	355	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33933685	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttta	33933743	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 36698019 - 36697905

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	36698019	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacaaattt	36697920	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36697919	tgttccaacaatctc	36697905	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 40 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 642700 - 642647

Alignment:

Q	40	gtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	642700	gtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatg	642647	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 1122391 - 1122500

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa-ctcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1122391	tggtcctgtacacttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaatttattaaggttcattatgaaacacattt	1122490	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1122491	tgttccaaca	1122500	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 14458118 - 14458227

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14458118	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaatagggttcactgtgaaacacattt	14458217	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14458218	tgttccaaca	14458227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 16004362 - 16004471

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16004362	tggtcctgtacacttgaacaattattaataataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16004461	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16004462	tgttccaaca	16004471	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23296066 - 23295957

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23296066	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcaataaggttcattttgaaacacattt	23295967	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23295966	tgttccaaca	23295957	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 27459950 - 27459841

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	27459950	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaaaacattt	27459851	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27459850	tgttccaaca	27459841	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31348328 - 31348219

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31348328	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	31348229	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31348228	tgttccaaca	31348219	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31814952 - 31814843

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31814952	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	31814853	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31814852	tgttccaaca	31814843	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 39352277 - 39352168

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39352277	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39352178	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39352177	tgttccaaca	39352168	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 39502610 - 39502719

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39502610	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39502709	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39502710	tgttccaaca	39502719	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 17606855 - 17606783

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17606855	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	17606783	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 17718673 - 17718601

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17718673	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	17718601	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 36687453 - 36687381

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36687453	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	36687381	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40390133 - 40390037

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40390133	ttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	40390037	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36084200 - 36084125

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36084200	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacatattctgttccaaca	36084125	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Original strand, 37708097 - 37708172

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37708097	ccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	37708172	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 242 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 18672552 - 18672415

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata	337	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18672552	atttcattgctctcatttgttctttcagaaccaattccttaattaaagacttataaatttttagtctatgtttctgcacacttgaacaaatattaacata	18672453	T

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18672452	ttcaattg--aacttttaatacttttttatcatcaaaact	18672415	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 23412964 - 23412899

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23412964	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	23412899	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 26119592 - 26119475

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	26119592	aatttttgactagtgtcctgcacacttgaaaaaatattaccatatccaattggca--gtttaataccttgttatcatcaaaa-tttaaaggtggtagtgt	26119496	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26119495	taaacactttttgttccaaca	26119475	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 42 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 7745683 - 7745619

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7745683	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcctgatgtacttcagcttct	7745619	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 318 - 377

Target Start/End: Original strand, 13692780 - 13692837

Alignment:

Q	318	cttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	13692780	cttgaacaaatattagcatatccaattgac--ttttcaataccttgttatcgtcaaaact	13692837	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 317 - 375

Target Start/End: Original strand, 18513836 - 18513892

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18513836	acttgaacaaatatttgcatatccaattg--aatttttaataccttgttatcatgaaaa	18513892	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 111

Target Start/End: Original strand, 20551033 - 20551111

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20551033	ttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga	20551111	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 9398743 - 9398670

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9398743	ttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaacttctg	9398670	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Original strand, 23881198 - 23881278

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23881198	tgcaatgctaggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg	23881278	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 26118412 - 26118330

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26118412	taaattttagtctatggttctgcacacttgaacaattattaacatattcaattg--aacattaaataccttgttatcatcaaaac	26118330	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 167 - 254

Target Start/End: Complemental strand, 9398639 - 9398551

Alignment:

Q	167	tgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctct	254	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	9398639	tgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagcagcacttctcttcaaatgcttcaagcttcctttttgttgattccatagctct	9398551	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 155 - 275

Target Start/End: Original strand, 21910770 - 21910893

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac--taaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgc	251	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	21910770	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcatttgc	21910869	T

Q	252	tctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21910870	tctcttttgttcttctagaaccta	21910893	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 6512429 - 6512370

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	6512429	ttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	6512370	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 13545518 - 13545459

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13545518	ttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	13545459	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 40 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 21072233 - 21072166

Alignment:

Q	40	gtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21072233	gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	21072166	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Original strand, 4887243 - 4887289

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	4887243	gcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	4887289	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 199 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 12352682 - 12352604

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctc-gtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	12352682	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccatagctctcaatttgttcttccagaatcta	12352604	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 291 - 379

Target Start/End: Original strand, 16182649 - 16182734

Alignment:

Q	291	ctaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16182649	ctaaattttattatatagtcttgcacactttaacatatattagcacatccaatt---attctttaatactttgttatcatcaaaactct	16182734	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 131 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 19536218 - 19536156

Alignment:

Q	131	ttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19536218	ttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	19536156	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 41 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 21099696 - 21099630

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21099696	tgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatcttctgatgaactttagcttctg	21099630	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 342

Target Start/End: Original strand, 27057652 - 27057702

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27057652	taaattattttctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	27057702	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 328 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 39798664 - 39798580

Alignment:

Q	328	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39798664	tattagtatatccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--attaaggtggtaatgttaaatacattttgttccaacaat	39798580	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 17815107 - 17815152

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17815107	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtct	17815152	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 296 - 344

Target Start/End: Original strand, 20575779 - 20575827

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20575779	ttttagtctatgatcctgcacagttgaacaaatattagcatatccaatt	20575827	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 77

Target Start/End: Complemental strand, 89420 - 89377

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt	77	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	89420	ttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagt	89377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 213 - 275

Target Start/End: Original strand, 6499525 - 6499588

Alignment:

Q	213	ttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctc-gtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	6499525	ttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatttcatagctctcaatttgttctttcaaaaccta	6499588	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 318 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 27275976 - 27275920

Alignment:

Q	318	cttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27275976	cttgaacaaatattagcatattcaattg--aacttttaataccttggaatcatcaaaac	27275920	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 40 - 107

Target Start/End: Original strand, 6499383 - 6499449

Alignment:

Q	40	gtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6499383	gtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtc--tcatcttcatatgaacttcagcttctg	6499449	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 6512348 - 6512311

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6512348	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	6512311	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 304 - 341

Target Start/End: Complemental strand, 17337786 - 17337749

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcca	341	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17337786	tatggtcttgcacacttaaacatatattagcatatcca	17337749	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 23412891 - 23412854

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23412891	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	23412854	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 312 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 24838053 - 24837993

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24838053	tgcacacttgatcatatattaacatatccaattg---atgtttaatactttgttatcatcaaaa	24837993	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 41566432 - 41566355

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41566432	ttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatga	41566355	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 146 - 182

Target Start/End: Complemental strand, 29138310 - 29138274

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcact	182	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29138310	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcact	29138274	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 205)

Name: chr8

Description:

Target: chr8; HSP #1

Raw Score: 184; E-Value: 2e-99

Query Start/End: Original strand, 27 - 413

Target Start/End: Original strand, 19707633 - 19708002

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	19707633	tgcaatgttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagcttctg-----------------gc	19707715	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	19707716	gatcttgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttaacttcaggagcacttttcttcagattcttca	19707815	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaaca	325	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19707816	agcttcctttttgttgattccattgccctcatttgttcttccataacctatactttaaatagacacttaatttttgtctatggtcttacacacttgaaca	19707915	T

Q	326	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19707916	aatattagcatatccaattgacaatttttaatattttgttatcatcaaaactctaaagg-ttaatgttaaacacattttgttccaaca	19708002	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2

Raw Score: 135; E-Value: 4e-70

Query Start/End: Original strand, 222 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 22461471 - 22461280

Alignment:

Q	222	ttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22461471	ttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcttttgttcttacagaacctatgctttaaagagacactaaatttttgtctatggtcctgcacacttg	22461372	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22461371	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacatattgttccaacaat	22461280	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3

Raw Score: 129; E-Value: 2e-66

Query Start/End: Original strand, 118 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 20382343 - 20382050

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttc	215	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	20382343	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttc	20382244	T

Q	216	atatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgca	315	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	20382243	agacgcttcaagcttcctttttgttgattccattactctcttttgttctttcagaaccta------ataaagatgtcaaatttttgtctatggtcctgta	20382150	T

Q	316	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20382149	cacttgaacaaatattagcatctccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgttaaacacattttgttccaacaat	20382050	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4

Raw Score: 126; E-Value: 9e-65

Query Start/End: Original strand, 34 - 413

Target Start/End: Original strand, 33082992 - 33083359

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttg	133	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|
T	33082992	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg-----------------gtgatcttg	33083074	T

Q	134	cttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa--acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	33083075	cttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaagagcacttttgacttcaagagcacttctcttcagacgctttaagctt	33083174	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgttt-gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaat	328	Q
		\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33083175	cttttttgttgattccatagctctcaattcgttcttccaaaacctatactttaagtagacactaaattttttgtccatggtcctgcacacttgaacaaat	33083274	T

Q	329	attagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	33083275	attaacatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcttaaagagcagtgttaaacacattttcttccaaca	33083359	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5

Raw Score: 123; E-Value: 6e-63

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Original strand, 24646557 - 24646837

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttc-atatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24646557	gcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactatacttcaggagcacttctctctagatgcttcaagcttc	24646656	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24646657	ctttttgttgattccattggtatcttttgttcttccaaaacctat---ttaagatgtca---aatttttttctatggtcctgtatacttgaacaaatatt	24646750	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24646751	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaaggttaatgttaaacacatattgttccaacaatctc	24646837	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6

Raw Score: 122; E-Value: 2e-62

Query Start/End: Original strand, 27 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18731014 - 18730628

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	18731014	tgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatcttctgctcctgatgaaagacagcttctggg	18730915	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	18730914	gatgtagcttctgatgaagtgcttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcatttcatgagaacttgacttcataatcacttttcttcatacgcttca	18730815	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18730814	agctttctttttgttgattccattgctcttaatttgttcttccagaaccaaca----aaatatact-taacctt--gtatttggtcctgcacacttgaac	18730722	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18730721	aaatattcgcgtatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	18730628	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7

Raw Score: 116; E-Value: 9e-59

Query Start/End: Original strand, 212 - 418

Target Start/End: Original strand, 18772928 - 18773131

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18772928	cttcaaatgcttcaagtttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttc-agaacttgtactttagagagacactaaatttttgtatatggtcc	18773026	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18773027	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaatacattttgttccaa	18773124	T

Q	412	caatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|
T	18773125	caatctc	18773131	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8

Raw Score: 110; E-Value: 3e-55

Query Start/End: Original strand, 119 - 414

Target Start/End: Original strand, 29693518 - 29693813

Alignment:

Q	119	cttatggtgatgtt--gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa---catcaggagcccttc-c	212	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|
T	29693518	cttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttttgtcttcaagagcacttctc	29693617	T

Q	213	ttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtctt	312	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	29693618	ttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctctgctctcttttgttcttctaggaccta------atattgattccaattttttgtctatggtcct	29693711	T

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29693712	gtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaac	29693811	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9

Raw Score: 104; E-Value: 1e-51

Query Start/End: Original strand, 133 - 421

Target Start/End: Original strand, 17914678 - 17914961

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17914678	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcattacttcaagagcactttgactttaggagcacttctcttcagatgcttcaagctt	17914777	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17914778	cctttctgttgattcctttgctctcttttattcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatat	17914871	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctctgc	421	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	17914872	tatcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcacaaag-gtaatgttaaacacattttgttccaacagtctctgc	17914961	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10

Raw Score: 102; E-Value: 2e-50

Query Start/End: Original strand, 27 - 382

Target Start/End: Complemental strand, 18722669 - 18722319

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	18722669	tgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatcttctgctcctgatgaaagacagcttctggg	18722570	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagc-ccttccttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	18722569	gatgtagcttctgatgaagtgcttctgatcaacttgcttctaatgacgtgatcatttcatgagaacttgacttcataatcacttttcttcatacgcttca	18722470	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctc-tcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18722469	agctttctttttgttgattccattgctcttaatttgttcttccagaacctaca----aaatatac-ttaa--ccttgtatttggtcctgcacacttgaac	18722377	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaa	382	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18722376	aaatattagcgtatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaa	18722319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11

Raw Score: 102; E-Value: 2e-50

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 19156415 - 19156676

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19156415	gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgatc	19156514	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19156515	cctttgctctcttttgttcttctagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatt	19156608	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19156609	gacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtagtgttaaacacattttgttccaaca	19156676	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12

Raw Score: 101; E-Value: 8e-50

Query Start/End: Original strand, 133 - 379

Target Start/End: Original strand, 19943456 - 19943698

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19943456	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatgtcgtcatcacttcaggagcactatacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttc	19943555	T

Q	232	cttcttg-ttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19943556	ttttttggttgattccattactctcttttgttcttctagaacctat---ttaagatgtca---agtttttgtctatggtcttgtacacttaaacaaatat	19943649	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19943650	tagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactct	19943698	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 212 - 404

Target Start/End: Original strand, 17702026 - 17702212

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17702026	cttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccataactctcttttgttattccagaaccta------ataaagataccaaatttttgtctatggtcc	17702119	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17702120	tgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacatttt	17702212	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 199 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 18321056 - 18320849

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	18321056	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcttttttgttgattccatagctatcttttgttcttccagaacgta------ataaagatatcaaatt	18320963	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	18320962	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaagattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctcaaagagtaatgttaaac	18320863	T

Q	398	acattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18320862	acattttgttccaa	18320849	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 297 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 45538227 - 45538113

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	45538227	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	45538128	T

Q	397	cacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45538127	cacattttgttccaa	45538113	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15335814 - 15335693

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15335814	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	15335715	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15335714	cacattttgttccaacaatctc	15335693	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15424879 - 15424758

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15424879	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	15424780	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15424779	cacattttgttccaacaatctc	15424758	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15516183 - 15516062

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15516183	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	15516084	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15516083	cacattttgttccaacaatctc	15516062	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 225 - 418

Target Start/End: Original strand, 22745783 - 22745970

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22745783	aagcttcctttttgttgattcctttgctcttttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatcgtcctgtacacttgaac	22745876	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22745877	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	22745970	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 224 - 378

Target Start/End: Original strand, 26833360 - 26833516

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26833360	caagcctcctttttgtagattctattgctctcatttgttcttccagaacctatgcttgaattaaagacattaaagttttgtctatggtcctgcacacttg	26833459	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26833460	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactc	26833516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 154 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 602645 - 602395

Alignment:

Q	154	atgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgct	252	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|
T	602645	atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactagacttcagcaacgcttctctttagacgcttcaaacttcctttttgttgattccttagct	602546	T

Q	253	ctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattt	352	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	602545	ctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaattccaattgacaattt	602452	T

Q	353	ttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	602451	ttaatatcttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgtt--acacattttgttccaa	602395	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 224 - 378

Target Start/End: Original strand, 23772679 - 23772831

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23772679	caagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttc-agaacctatgcttttaa-acacactaaatttttgtctatgctcctgcacacttgaa	23772776	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23772777	caaatattaatatatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	23772831	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 17797801 - 17797918

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17797801	ttttgtctaaagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaactctcaagggttagtgttaaa	17797900	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17797901	cacattttgttccaacaa	17797918	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 220 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19956195 - 19956004

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttca-ttgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacac	318	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	19956195	gcttcaagtttccttcttgttgattccaattgctctcatttgttcttccagaacttaagcttttaa-agatacaaaa--tttgtctatggtcctgcacac	19956099	T

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19956098	ttgaacaaatattagcatatccaatcgacaattttttaataccttattatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttattccaaca	19956004	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25

Raw Score: 88; E-Value: 4e-42

Query Start/End: Original strand, 125 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 16681245 - 16680961

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgc	221	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|
T	16681245	gtgatcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgc	16681146	T

Q	222	ttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	16681145	tttaagcttcatttttgttgattcatttgctatc--ttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttg	16681054	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16681053	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcagaaccttcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	16680961	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26

Raw Score: 88; E-Value: 4e-42

Query Start/End: Original strand, 161 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 17441727 - 17441478

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtt	258	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	17441727	tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttccttttcgttgattcctttgctctcttt	17441628	T

Q	259	tgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaata	358	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17441627	tgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacttcaacaaatattagcatatgcaattgacaatttttaata	17441534	T

Q	359	ccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17441533	acttgtcataatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttggttccaacaa	17441478	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27

Raw Score: 88; E-Value: 4e-42

Query Start/End: Original strand, 126 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23263552 - 23263259

Alignment:

Q	126	tgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac-taaacatcaggagcccttc-cttcatatg--c	221	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|
T	23263552	tgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttttacttcaggagcacttctcttcagaagcac	23263453	T

Q	222	ttcaagcttc-----------cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtc	310	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23263452	tttaagcttccttttggttttctttttgttgatttcattgctctcttttgttcttcgagaacct----ttta---agataacaaacttttgtctatggtc	23263360	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23263359	ctgtacacttgaacaaatattag--tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttcca	23263262	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 220 - 418

Target Start/End: Original strand, 16189307 - 16189499

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	16189307	gcttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtgtatggtcctatacact	16189400	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16189401	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgctatcatctaaactcacaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	16189499	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 3598101 - 3597980

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3598101	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctgaagagttaatgttaaa	3598002	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3598001	cacattttgttccaacaatctc	3597980	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 9320966 - 9321082

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	9320966	ttttgtctatagtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcataactcttaagggttaatgttaaa	9321065	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9321066	cacatttttttccaaca	9321082	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 123 - 404

Target Start/End: Complemental strand, 17525672 - 17525395

Alignment:

Q	123	tggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtca-tcactttgggagcactaaacatcaggagcccttcctt-catatg	220	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	17525672	tggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgatgtcaatcacttcaggagcacttgtcttcaggagcacttcttttcagatg	17525573	T

Q	221	cttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	17525572	cttcaatcttcatttttgttgatttctttgctctcttttgttctttcagatccta------ataatgatttcaattttttgtctatggtcatgtacactt	17525479	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17525478	gaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaaggtaatgttaaacacatttt	17525395	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 36105603 - 36105723

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	36105603	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaatactttgttatcatcaaaactcctaaggattaacgt	36105702	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	36105703	taaacacattttattccaaca	36105723	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40845146 - 40845026

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	40845146	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataatttgttatcatcaaaactcttgagggttattgc	40845047	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40845046	taaacacattttgttccaaca	40845026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 2811194 - 2811317

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|
T	2811194	taaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaattccaattgtcaatttttaataccttgttatcatcaaaactctttaaagtttatt	2811293	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2811294	gttaaacacattttgttccaacaa	2811317	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 6408094 - 6408218

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	6408094	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttatttt	6408193	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6408194	tgctaaacacattttgttccaacaa	6408218	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 21541368 - 21541486

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	21541368	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaaggtttattgtaaaa	21541467	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21541468	cacattttgttccaacaat	21541486	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 294 - 414

Target Start/End: Original strand, 18719342 - 18719459

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	18719342	aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactc-aaagg--taatgtt	18719438	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18719439	aaacacattttgttccaacaa	18719459	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 19927421 - 19927545

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	19927421	aaatttttgtctaaagtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaacttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgt	19927520	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19927521	t-aacacattttgttccaacaatctc	19927545	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18685175 - 18685063

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttg	405	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18685175	tggtcctgcacacttgaacaaatattcgcgtatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttg	18685076	T

Q	406	ttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18685075	ttccaacaatctc	18685063	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 294 - 414

Target Start/End: Original strand, 24551674 - 24551793

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	24551674	aatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatat-agcatatcaaattgacaatttttaatacatttttatcatcaaaactcttaagggttaatgtt	24551772	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24551773	aaacacattttgttccaacaa	24551793	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 293 - 384

Target Start/End: Original strand, 1238044 - 1238135

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1238044	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	1238135	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23352860 - 23352740

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	23352860	tttttgtctatggtcatgcatacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaa	23352763	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23352762	gcacattttgttccaacaatctc	23352740	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 8032409 - 8032527

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	8032409	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	8032508	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8032509	acacattttgttccaacaa	8032527	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 17267675 - 17267966

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttc	215	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	17267675	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctaataacgtcatcacttcagaagcactttgacttcaggcacacttctcttc	17267774	T

Q	216	atatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgca	315	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	17267775	agatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatatcaaaattttctctatggtcatgta	17267868	T

Q	316	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17267869	cacttgaaaaaatattattatatctaattgacaacttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttatttccaaca	17267966	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24832827 - 24832709

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac-cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	24832827	ttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttttttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaa	24832728	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24832727	acacattttgttccaacaa	24832709	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14989233 - 14989110

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	14989233	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattat	14989134	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	14989133	tgctaaacacattttattccaaca	14989110	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 299 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17518817 - 17518696

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|
T	17518817	ttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactgattaaggtttattataaaa	17518718	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17518717	catattttgttccaacaatctc	17518696	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18120900 - 18120779

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	18120900	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgaaaaattttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	18120801	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18120800	caaatacattttgttccaacaa	18120779	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 21301396 - 21301515

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	21301396	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgtt	21301495	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21301496	aaacatattttgttccaaca	21301515	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 417

Target Start/End: Original strand, 28903861 - 28903982

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	28903861	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	28903960	T

Q	396	acacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28903961	acatattttgttccaacaatct	28903982	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 220 - 415

Target Start/End: Original strand, 21933209 - 21933396

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21933209	gctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgcacact	21933302	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21933303	t--acaaatatttgcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcataaaaactctcaaagggtaatgttaaacgcattttgttccaacaat	21933396	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20255500 - 20255225

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	20255500	gcttctgatgagatacttctgatgaacttccttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcagttctcttcagacgctttaaactt	20255401	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20255400	cctttttgttgattcctttgctctcttttgttgttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctatacactttaacaaatat	20255307	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20255306	ttgcatatccaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttcaacacattttgttccaaca	20255225	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Original strand, 3844113 - 3844227

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3844113	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	3844212	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3844213	ttttgttccaacaat	3844227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 297 - 379

Target Start/End: Original strand, 18680177 - 18680259

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18680177	ttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	18680259	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 23783918 - 23784040

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23783918	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcataaaaactcattaaggtttattgtaaa	23784017	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23784018	acacattttgttccaacaatctc	23784040	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 45292989 - 45293109

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	45292989	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgct	45293088	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45293089	aaacaaattttgttccaacaa	45293109	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 3833333 - 3833450

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	3833333	ctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaaaaca	3833432	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3833433	tttggttccaacaatctc	3833450	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 22674174 - 22674296

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22674174	aaattcttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-ttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattat	22674272	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22674273	tgataaacacattttgttccaaca	22674296	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20259312 - 20259190

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20259312	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	20259213	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20259212	acacattatgttccaacaatctc	20259190	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21045942 - 21045820

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	21045942	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	21045843	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21045842	acacattatgttccaacaatctc	21045820	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 21288777 - 21288901

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	21288777	ttttgtctatagtcctatacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaaggttattattgtt	21288876	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21288877	aaacgtattttgttccaacaatctc	21288901	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23185015 - 23184893

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	23185015	ttttgtctatggtcttatacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgttaa	23184916	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23184915	acatattttgttccaacaatctc	23184893	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 23371150 - 23371272

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23371150	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	23371249	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23371250	acacattttgttccaacaatctc	23371272	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 40003587 - 40003705

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	40003587	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	40003686	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40003687	acatattttgttccaacaa	40003705	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 43640171 - 43640291

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	43640171	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagtgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgc	43640270	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43640271	taaacatattttgttccaaca	43640291	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 299 - 415

Target Start/End: Original strand, 1745536 - 1745655

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	1745536	ttgtctatagtcatgtacacttgaataaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgctaa	1745635	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1745636	acatattttgttccaacaat	1745655	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 29379969 - 29380086

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	29379969	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacacattaaggtttattttaaa	29380068	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29380069	acacattttgttccaaca	29380086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 3844404 - 3844516

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3844404	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	3844503	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3844504	ttttgttccaaca	3844516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 39696582 - 39696681

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39696582	acacttgaacaaatattagcatatccacttgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacatattttgttccaacaa	39696681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23192380 - 23192256

Alignment:

Q	292	taaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	23192380	taaatttttagtttatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaa	23192285	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23192284	tgttaaactcattttgttccaacaatctc	23192256	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 23469146 - 23469032

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23469146	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	23469047	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23469046	tgttccaacaatctc	23469032	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 317 - 414

Target Start/End: Original strand, 43774286 - 43774386

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43774286	acttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacacattttgttccaaca	43774385	T

Q	414	a	414	Q
		\|
T	43774386	a	43774386	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 293 - 412

Target Start/End: Complemental strand, 18151438 - 18151315

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag---gatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18151438	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatatgagcatatccaattgacaattttttaatactttgatatcatcaaaactcttaagagttatta	18151339	T

Q	389	gtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18151338	ttgctaaacacattttgttccaac	18151315	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18534823 - 18534706

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18534823	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatgttagcaataaccaattgacaagttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	18534724	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18534723	acatattttgttccaaca	18534706	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 19461564 - 19461681

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19461564	tttgcctaaggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaatgtttattgtaaa	19461663	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19461664	acacattttgttccaaca	19461681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 19559242 - 19559359

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19559242	tttgcctaaggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaatgtttattgtaaa	19559341	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19559342	acacattttgttccaaca	19559359	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22166696 - 22166583

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22166696	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacaca	22166597	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22166596	ttttgttccaacaa	22166583	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 23380909 - 23381026

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23380909	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	23381008	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23381009	acacattttgttccaaca	23381026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 18154328 - 18154439

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18154328	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	18154427	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18154428	tgtttcaacaat	18154439	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 18158848 - 18158959

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18158848	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaaacacattt	18158947	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18158948	tgttccaacaat	18158959	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 26734702 - 26734591

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26734702	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	26734603	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26734602	tgttccaacaat	26734591	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30421215 - 30421097

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat--ttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	30421215	ttttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaaggataatgtta	30421116	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30421115	aacatattttgttccaaca	30421097	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18768807 - 18768697

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18768807	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	18768708	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18768707	tgttccaacaa	18768697	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 22663527 - 22663654

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22663527	aaatttttgtctataatcctatacacttgaacaaatattagcatattcagttgacaa-ttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattat	22663625	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	22663626	tgctaaacacattttgttcccacaatctc	22663654	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 30324997 - 30324883

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30324997	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttaattgtgaaacacattt	30324898	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30324897	tgttccaacaatctc	30324883	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22135547 - 22135434

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22135547	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatgaaaactcattaaggtttattgtaaaacaca	22135448	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22135447	ttttgttccaacaa	22135434	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22211082 - 22210965

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22211082	tttgtctatggttctatacacttgaacaaatattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	22210983	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22210982	acacattttgttccaaca	22210965	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 304 - 410

Target Start/End: Complemental strand, 22623055 - 22622947

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	22623055	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacat	22622956	T

Q	402	tttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22622955	tttgttcca	22622947	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 15969131 - 15969016

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15969131	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	15969032	T

Q	404	tgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	15969031	tgttccaacaaactct	15969016	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 418

Target Start/End: Original strand, 19418956 - 19419059

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19418956	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	19419055	T

Q	415	tctc	418	Q
		\|\|\|\|
T	19419056	tctc	19419059	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 9341722 - 9341836

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9341722	tggtcttgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9341821	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9341822	tgttccaacaatctc	9341836	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 19225528 - 19225642

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19225528	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatacctttttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	19225627	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19225628	tgttccaacaatctc	19225642	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23269580 - 23269470

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23269580	tggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	23269481	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23269480	tgttccaacaa	23269470	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 30314383 - 30314273

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30314383	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttaattgtgaaacacattt	30314284	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30314283	tgttccaacaa	30314273	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 40212849 - 40212735

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	40212849	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatattttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacaca	40212750	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40212749	ttttgttccaacaat	40212735	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 296 - 414

Target Start/End: Original strand, 22710962 - 22711077

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	22710962	ttttagtctatggtcctggacacttgaacaaatattagcttatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggaaatgtta	22711057	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22711058	aacacattttgttccaacaa	22711077	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 33560017 - 33559898

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	33560017	ttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattaacgtatccaattgacaatttttaatactttattatcttcaaaactcttaagggttattattgct	33559918	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33559917	aaacatattttgttccaaca	33559898	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 209857 - 209743

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	209857	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	209758	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	209757	tgttccaacaatctc	209743	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 242400 - 242514

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	242400	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	242499	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	242500	tgttccaacaatctc	242514	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 723480 - 723366

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	723480	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	723381	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	723380	tgttccaacaatctc	723366	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 795770 - 795884

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	795770	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	795869	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	795870	tgttccaacaatctc	795884	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 3358905 - 3358791

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3358905	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3358806	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3358805	tgttccaacaatctc	3358791	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 6151648 - 6151762

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6151648	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6151747	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6151748	tgttccaacaatctc	6151762	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 12194251 - 12194334

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12194251	taaatttttgtctatggtcatgcacacttgaaaaaatattagcatatccaatcgaca--ttttaatattttgttatcatcaaaact	12194334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 12438679 - 12438762

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12438679	taaatttttgtctatggtcatgcacacttgaaaaaatattagcatatccaatcgaca--ttttaatattttgttatcatcaaaact	12438762	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13688235 - 13688121

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13688235	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13688136	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13688135	tgttccaacaatctc	13688121	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15780413 - 15780299

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15780413	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15780314	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15780313	tgttccaacaatctc	15780299	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15791002 - 15790888

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15791002	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15790903	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15790902	tgttccaacaatctc	15790888	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 19129307 - 19129421

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19129307	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19129406	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19129407	tgttccaacaatctc	19129421	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20160916 - 20160806

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20160916	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattggcaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	20160817	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20160816	tgttccaacaa	20160806	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 20196551 - 20196661

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20196551	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattggcaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	20196650	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20196651	tgttccaacaa	20196661	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 23270908 - 23270830

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23270908	tttgactatggtcctgtgcacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	23270830	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 26111810 - 26111924

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26111810	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26111909	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26111910	tgttccaacaatctc	26111924	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 28691475 - 28691585

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28691475	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacattattatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	28691574	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28691575	tgttccaacaa	28691585	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 29077307 - 29077421

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29077307	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	29077406	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29077407	tgttccaacaatctc	29077421	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 29087558 - 29087672

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29087558	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	29087657	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29087658	tgttccaacaatctc	29087672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 36293479 - 36293593

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36293479	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36293578	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36293579	tgttccaacaatctc	36293593	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 44481680 - 44481794

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44481680	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	44481779	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44481780	tgttccaacaatctc	44481794	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 3221210 - 3221319

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3221210	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	3221309	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3221310	tgttccaaca	3221319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9856175 - 9856066

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9856175	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattt	9856076	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9856075	tgttccaaca	9856066	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 315 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 13430388 - 13430325

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13430388	acacttgaaaaaatattagcatattcaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactc	13430325	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23456956 - 23456881

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23456956	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	23456881	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 31215625 - 31215736

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaatac-cttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31215625	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacgtttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacatt	31215724	T

Q	403	ttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31215725	ttgttccaacaa	31215736	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 6318239 - 6318129

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6318239	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccatgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	6318140	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6318139	tgttccaacaa	6318129	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 18449947 - 18450057

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18449947	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	18450046	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18450047	tgttccaacaa	18450057	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 32087973 - 32087859

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	32087973	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacactt	32087874	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32087873	tgttccaacaatctc	32087859	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 36078513 - 36078627

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36078513	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	36078612	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36078613	tgttccaacaatctc	36078627	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 252985 - 253094

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	252985	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	253084	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	253085	tgttccaaca	253094	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 848671 - 848562

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	848671	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	848572	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	848571	tgttccaaca	848562	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 3348308 - 3348199

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3348308	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3348209	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3348208	tgttccaaca	3348199	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 5846704 - 5846813

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5846704	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5846803	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5846804	tgttccaaca	5846813	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 6161602 - 6161711

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6161602	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6161701	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6161702	tgttccaaca	6161711	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 9368866 - 9368975

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9368866	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9368965	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9368966	tgttccaaca	9368975	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13596214 - 13596105

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13596214	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13596115	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13596114	tgttccaaca	13596105	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 339 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 16436731 - 16436654

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16436731	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattttgttccaacaat	16436654	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 16747610 - 16747719

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16747610	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattatgaaacacattt	16747709	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16747710	tgttccaaca	16747719	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 17701880 - 17701953

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17701880	ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg	17701953	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 19139857 - 19139966

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19139857	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19139956	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19139957	tgttccaaca	19139966	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 26121488 - 26121597

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26121488	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26121587	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26121588	tgttccaaca	26121597	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 32077400 - 32077291

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	32077400	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacactt	32077301	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32077300	tgttccaaca	32077291	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 36304082 - 36304191

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36304082	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36304181	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36304182	tgttccaaca	36304191	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 329 - 413

Target Start/End: Original strand, 43645198 - 43645282

Alignment:

Q	329	attagcatatccaattgacaatttt-taataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43645198	attagcatattcgattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttccaaca	43645282	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 44492296 - 44492405

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44492296	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	44492395	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44492396	tgttccaaca	44492405	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 1208462 - 1208379

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1208462	taaattttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatctaat---caatcatttaataccttgttatcatcaaaact	1208379	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 290 - 377

Target Start/End: Original strand, 24635720 - 24635805

Alignment:

Q	290	actaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24635720	actaaattttagtctatggtcctgcacacttgaccaaatattagtatattcaattg--aacttttaatactttgttatcatcaaaact	24635805	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 298 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 7018094 - 7018016

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7018094	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaa	7018016	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 26 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 18321184 - 18321102

Alignment:

Q	26	atgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18321184	atgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	18321102	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23579578 - 23579468

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23579578	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccatgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23579479	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23579478	tgttccaacaa	23579468	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 31043309 - 31043195

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagc-atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31043309	tggtcctgtacacttgaacaattattagttataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattttgaaacacattt	31043210	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	31043209	tgttccaacactctc	31043195	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6576259 - 6576150

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6576259	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6576160	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	6576159	tgttctaaca	6576150	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 36089099 - 36089208

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36089099	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	36089198	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36089199	tgttccaaca	36089208	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 43248894 - 43249003

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43248894	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacgatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttaattgtgaaacacattt	43248993	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43248994	tgttccaaca	43249003	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 662860 - 662764

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	662860	ttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	662764	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 301 - 366

Target Start/End: Original strand, 16207632 - 16207698

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgtta	366	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16207632	gtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatctaattgacaattttttaataccttgtta	16207698	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 17689701 - 17689784

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	17689701	taaattttagtatatgttcctgcacacttgaacaaatattaacatatccaattg--atcttttaataccttgttatcattaaaact	17689784	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 312 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19505227 - 19505164

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19505227	tgcacacttgaacaaatattaacatatcaaattga--acttttaataccttgttatcatcaaaact	19505164	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 24 - 93

Target Start/End: Original strand, 21933007 - 21933077

Alignment:

Q	24	ttatgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21933007	ttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	21933077	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 42 - 157

Target Start/End: Complemental strand, 22461647 - 22461531

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcag--cttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatg	139	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|
T	22461647	gattaaatccttcgaacaacctttgaagcttaaattcgttcagcttctgatgatcttcagaacttctgatg-aaatctgcttctgctgaccttgcttctg	22461549	T

Q	140	atgaggtgcttctaatga	157	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22461548	atgaggtgcttctgatga	22461531	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 224 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 17916668 - 17916523

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	17916668	caagcttcctt-ttgtaaatttcattgctctcatttgttctttcagaacatatacttgactta-----taattttttat-tatggtcatgcacatttgaa	17916576	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17916575	caaatattagcatatgcaattgac-atttctaatacattattattatcaaaact	17916523	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 23339469 - 23339578

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23339469	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaatatccaattgattatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	23339568	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23339569	tgttccaaca	23339578	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 17937665 - 17937746

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17937665	taaatttttgtatatgtccatgcacgcttgaacaaatattaacatatccaattg--atcttttaataccttgttatcatcaaaa	17937746	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 244

Target Start/End: Original strand, 18680031 - 18680130

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac-taaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18680031	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactctcttcagatgcttaaagcttcctttttgttgatt	18680130	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 22745622 - 22745681

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22745622	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	22745681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 311 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 24497904 - 24497840

Alignment:

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24497904	ttgcacccctgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcttcaaaact	24497840	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 27 - 113

Target Start/End: Complemental strand, 18685420 - 18685334

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaa	113	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18685420	tgcaatgctagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatgatcttccgatcctgatgaaa	18685334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 27 - 93

Target Start/End: Original strand, 43645023 - 43645089

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	43645023	tgcaatgctaggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctttgattctctcatcttccgatg	43645089	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 1750672 - 1750781

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1750672	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatattttgttatcattaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	1750771	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1750772	tgttccaaca	1750781	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 34107398 - 34107289

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34107398	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcatatcttaataaggttcattgtgaaacacattt	34107299	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34107298	tgttccaaca	34107289	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 45567608 - 45567514

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45567608	acacttgaacaaatattagcgtatccaattgac-------aatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacgcattttgttccaa	45567516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 302 - 376

Target Start/End: Original strand, 13303516 - 13303587

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13303516	tctatgatcttgcacacttgaacaaatattagtatatccaattg---tttttcaatattttgttatcatcaaaac	13303587	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 292 - 344

Target Start/End: Original strand, 24122144 - 24122196

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24122144	taaattttaatctatggtcctgcacacttgaacacatattagcatatccaatt	24122196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 317 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 13581646 - 13581550

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13581646	acttgaacaaatattaacatatgcaattg--aacttttaatacctcgttatcatcaaaatttaaaagaagcattgttaaacacattttgctccaacaat	13581550	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 39693670 - 39693729

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	39693670	ttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	39693729	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 163 - 275

Target Start/End: Original strand, 43645081 - 43645196

Alignment:

Q	163	cttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccct-tccttcatatgcttcaagcttc-cttcttgttgatttcattgctc-tcgttt	259	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|
T	43645081	cttccgatgacgtcatcacttcaggagcactaaacttcaggagcgctattcttcagatgcttcaagcttctttttttgttgattccatagctcttaattt	43645180	T

Q	260	gttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	43645181	gttcttccataaccta	43645196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 14989394 - 14989348

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	14989394	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcact	14989348	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 212 - 274

Target Start/End: Original strand, 16207555 - 16207617

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacct	274	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16207555	cttcagatgcttcaagattcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacct	16207617	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 346

Target Start/End: Original strand, 17879985 - 17880039

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	346	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	17879985	taaattttttcctatggtcctgcacacttaaacaaatattagcatatctaattga	17880039	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 27740201 - 27740284

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	27740201	taaattttagtttatggttatgcacgcttgaacaaatattaacatattcaattg--aacttttaatactttgttatcctcaaaact	27740284	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 161 - 276

Target Start/End: Complemental strand, 18121028 - 18120911

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa-catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtt	258	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	18121028	tgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcaaacgctttaagcttcctttttgttgattcatttgctctcttt	18120929	T

Q	259	tgttcttccagaacctat	276	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18120928	tgttcttccagaacctat	18120911	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 16681319 - 16681247

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	16681319	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttct	16681247	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 146 - 194

Target Start/End: Original strand, 22674009 - 22674057

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta	194	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22674009	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacta	22674057	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Complemental strand, 23185242 - 23185202

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23185242	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta	23185202	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 24 - 75

Target Start/End: Original strand, 24646462 - 24646514

Alignment:

Q	24	ttatgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa	75	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24646462	ttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaa	24646514	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 302 - 376

Target Start/End: Original strand, 28890660 - 28890731

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28890660	tctatggtcctgcacacttaaatatatattagcatatccaatt---attctttaatactttgttatcatcaaaac	28890731	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 118 - 193

Target Start/End: Original strand, 16189186 - 16189261

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	16189186	gcttctggtgatcttgcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcactctaggagcact	16189261	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 16207441 - 16207500

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16207441	ttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	16207500	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 36105441 - 36105488

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	36105441	tgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	36105488	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 40845308 - 40845261

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	40845308	tgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	40845261	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 292 - 342

Target Start/End: Original strand, 12541976 - 12542026

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12541976	taaattttagtatatgatcctgcacagttgaacaaatattagcatatccaa	12542026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 37 - 79

Target Start/End: Original strand, 16189122 - 16189164

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16189122	gacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtct	16189164	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 53 - 107

Target Start/End: Original strand, 17267627 - 17267681

Alignment:

Q	53	ttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17267627	ttgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctg	17267681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 18151599 - 18151553

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	18151599	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	18151553	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 212 - 273

Target Start/End: Complemental strand, 18685263 - 18685201

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc-tcgtttgttcttccagaacc	273	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18685263	cttcatacgcttcaagctttctttttgttgattccattgctcttaatttgttcttccagaacc	18685201	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 133 - 183

Target Start/End: Original strand, 22745706 - 22745756

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22745706	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcactt	22745756	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 23263628 - 23263550

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagct-ttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23263628	ttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga	23263550	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 24832990 - 24832944

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24832990	gcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	24832944	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 75

Target Start/End: Original strand, 17914594 - 17914635

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa	75	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17914594	ttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa	17914635	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Original strand, 19943371 - 19943444

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19943371	ttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttct	19943444	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 20255581 - 20255536

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20255581	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtct	20255536	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 30421444 - 30421373

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30421444	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgt-tg-catcttctgatgaactgcagcttctg	30421373	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Original strand, 43640005 - 43640042

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43640005	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	43640042	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 1745368 - 1745404

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1745368	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	1745404	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 155 - 183

Target Start/End: Original strand, 18719211 - 18719239

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18719211	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	18719239	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 35 - 75

Target Start/End: Original strand, 19156332 - 19156372

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa	75	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19156332	tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaa	19156372	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #205

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 21288611 - 21288647

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21288611	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	21288647	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 297)

Name: chr3

Description:

Target: chr3; HSP #1

Raw Score: 184; E-Value: 2e-99

Query Start/End: Original strand, 27 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19249437 - 19249064

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	19249437	tgcaatgctaggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaatgatcttcagctcctgatgaaaaactgcttctagt	19249338	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta-aacatcaggagcccttc-cttcatatgcttc	224	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	19249337	gatgttgcttctgatgaggtgcttct---------------gatgacgtcatcacttcaggagcatttgaacttcagaaccacttttcttcagatgcttc	19249253	T

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19249252	aagcttcattcttgttgattccagtgctctcatttgttcttccagaacctatacttcaaagagacactaaatttttgtttatggtcctgcacacttgaac	19249153	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19249152	aaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatattaaacacattttgttccaacaa	19249064	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2

Raw Score: 180; E-Value: 6e-97

Query Start/End: Original strand, 35 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 12388889 - 12388526

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgc	134	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12388889	tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttcttatgatcttcagctcttgatgaaaaactgcttctagtgatgttgc	12388790	T

Q	135	ttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaagcttcctt	234	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12388789	ttctgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt----------------caggagcactttcttcagatgcttcaagcttcctt	12388706	T

Q	235	cttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagc	334	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	12388705	cttgttgattccattgctctcatatgttctcccaaaacccaagctttaagtagacactaaatttttgtctatggccctgctcacttgaacaaatattatc	12388606	T

Q	335	atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12388605	atatccaattgacaatttttaataccttgttttcatcaaaac-cctaatcggtaatgttaaacacattttgttccaacaat	12388526	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3

Raw Score: 174; E-Value: 2e-93

Query Start/End: Original strand, 125 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 16199752 - 16199464

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16199752	gtgatgttgcttctgatgaggtgcttcttatgaacttgcttctgatgacgtcatcagttcaggagcacttgacttcaggagcacttttcttcagatgctt	16199653	T

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	16199652	caagcttctttcttgttgattccattgctctcatttgttcctccagaacctatactttaaaaagacactaattttttgtctatggtcctgcgcacttgaa	16199553	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16199552	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctatagg-gtaatgttaaacacactttgttccaaca	16199464	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4

Raw Score: 138; E-Value: 6e-72

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Original strand, 20725399 - 20725599

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20725399	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttcttacataacctaagctttaaggagacactaaatttttgtctatggtcc	20725498	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20725499	tgcacacttgaacaaatattagcatattcaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttccaa	20725597	T

Q	412	ca	413	Q
		\|\|
T	20725598	ca	20725599	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5

Raw Score: 132; E-Value: 2e-68

Query Start/End: Original strand, 125 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14392947 - 14392663

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta-aacatcaggagcccttc-cttcatatgct	222	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	14392947	gtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttaacttcaggagcacttctcttcagatgct	14392848	T

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	14392847	tcaagcttcctttctgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttga	14392754	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14392753	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaatctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	14392663	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6

Raw Score: 128; E-Value: 6e-66

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Original strand, 52920631 - 52920912

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52920631	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagctt	52920730	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52920731	cctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatgatcctgtacacttgaacaaatat	52920824	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52920825	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaacaatctc	52920912	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Original strand, 15903425 - 15903702

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15903425	gcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttaaggagcacttctcttcagatgcttcaagctt	15903524	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaa-ta	329	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	15903525	cctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacatgtgaaaaaaata	15903618	T

Q	330	ttagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	15903619	ttagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggggtaatgttaaacacatttttttccaaca	15903702	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22804033 - 22803758

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22804033	gcttctgatgagatgcttctgaggaacttgcttttgatgacgtcatcactttaggagcacttaacttcaggagcacttctcttcaaatgtttcaagcttc	22803934	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22803933	ctttttgttgattccattgctctcttttgttcttctagaaccta----ataaagata-tcaaattttttgtctttggtcttgtacatttgaacaaatatt	22803839	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22803838	agcatatccaattgacaa-ttttaatatcttgttatcatcaaaactctcatagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	22803758	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 132 - 414

Target Start/End: Original strand, 6090957 - 6091235

Alignment:

Q	132	tgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta-aacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagct	229	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6090957	tgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcataacttcatgagcactttaacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagct	6091056	T

Q	230	tccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaata	329	Q
		\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6091057	tcatttttgttgatttcattgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaata	6091150	T

Q	330	ttagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6091151	ttagaatatgcaattgacaatttttaatagcttattatgatcaaaattctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaacaa	6091235	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10

Raw Score: 108; E-Value: 5e-54

Query Start/End: Original strand, 212 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 26417543 - 26417377

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaattttt-gtctatggtc	310	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	26417543	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttc-agtttctgtgctttaaagagacactaaattttttgcctatggtc	26417445	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26417444	ctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	26417377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11

Raw Score: 107; E-Value: 2e-53

Query Start/End: Original strand, 138 - 413

Target Start/End: Original strand, 41495205 - 41495475

Alignment:

Q	138	tgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttc	235	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41495205	tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgacttcagaagcacttctcttcagatgctttaagcttccttt	41495304	T

Q	236	ttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca	335	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41495305	ttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagca	41495398	T

Q	336	tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	41495399	tattcaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagaataatgttaaacacattttattccaaca	41495475	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12

Raw Score: 103; E-Value: 5e-51

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 29951371 - 29951093

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccct-tccttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29951371	gcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagtagcactattctacagatgcttcaagcttc	29951272	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29951271	ctttttgttgacttcttagctctcttttgttcttccaggacctaa----taaa-agatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatatt	29951177	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29951176	agcaagtccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgtt--acacattttgttccaacaatctc	29951093	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13

Raw Score: 103; E-Value: 5e-51

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 30000525 - 30000247

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccct-tccttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30000525	gcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagtagcactattctacagatgcttcaagcttc	30000426	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30000425	ctttttgttgacttcttagctctcttttgttcttccaggacctaa----taaa-agatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatatt	30000331	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30000330	agcaagtccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgtt--acacattttgttccaacaatctc	30000247	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14

Raw Score: 100; E-Value: 3e-49

Query Start/End: Original strand, 146 - 415

Target Start/End: Original strand, 28582346 - 28582611

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa-catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	28582346	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgttttaagcttcctttttgttgat	28582445	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28582446	ttctttactctctattgttcttccagaaccttt---ttaa---gatttcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaat	28582539	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28582540	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtagtgttaaacacactttgttccaacaat	28582611	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Original strand, 16032787 - 16032981

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16032787	cttcagatgcttcaagcttcatttttgttgattccaatgctctcttttgttcttccggaaccta------ataaagataccaaatttttgtctatggtcc	16032880	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16032881	tgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgtaaaacacattttgttccaa	16032979	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 29855812 - 29855930

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	29855812	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattaatgttaaa	29855911	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29855912	cacattatgttccaacaat	29855930	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 199 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 49642645 - 49642434

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	49642645	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatt	49642552	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	49642551	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaac	49642452	T

Q	398	a-cattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49642451	ataattttgttccaacaa	49642434	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 297 - 411

Target Start/End: Original strand, 11869471 - 11869585

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	11869471	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaa	11869570	T

Q	397	cacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11869571	cacattttgttccaa	11869585	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 224 - 417

Target Start/End: Original strand, 12397430 - 12397620

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12397430	caagcttccttcttgtaaagtcctttgctctaatttgttcttc-agaacctatacttcttaaggacactaaatttttgtctatggtcctgcacacttgaa	12397528	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12397529	caaatattagcatatctaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaacttaaaagg--taatgttaaagacattttgttccaacaatct	12397620	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 155 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17238864 - 17238611

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc	253	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|
T	17238864	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattccttagctc	17238765	T

Q	254	tcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttt	353	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	17238764	tcttttgttcttaaagaaccta------ataaagatatcaagtttttgtctagggtcctgtacagttgaacaaatattagcatatctaattgaaaatttt	17238671	T

Q	354	taataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17238670	taataccttattatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	17238611	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 140 - 413

Target Start/End: Original strand, 13824265 - 13824534

Alignment:

Q	140	atgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgc--ttcaagcttccttc	235	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13824265	atgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcaggagcacttcaagcttccttt	13824364	T

Q	236	ttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca	335	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13824365	ttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacct----tttaa---gataacaaatttttgtctatgatcctgtacacttgagcaaatattagcg	13824457	T

Q	336	tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	13824458	tatccagttgacaatttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacatattttattccaaca	13824534	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 224 - 415

Target Start/End: Original strand, 14073003 - 14073197

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14073003	caagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttccagaacatatgcttgatataaagacacttaaatttttgtttatggtcatgcacactt	14073102	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14073103	gaacaaatattagcatatccaattgatattttttaataccttgttatcataaaaactcaaaagtggtgttgtcaaacacattttgttccaacaat	14073197	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Original strand, 20646381 - 20646656

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	20646381	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactttgacttcaggagcacttctcttcaaacgctttaagctt	20646480	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	20646481	ccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttctagaacctaa----taatgata---tcaaattttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatat	20646573	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20646574	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatgaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	20646656	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 133 - 413

Target Start/End: Original strand, 31303612 - 31303891

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatga---cgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaag	227	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	31303612	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgctttaag	31303711	T

Q	228	cttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaa	327	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31303712	cttcctttttgttgattcttttgctctcttttgttcttccagaaactat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaa	31303805	T

Q	328	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	31303806	tattaacatattcaattgacaatttttaatacattgtaatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttattccaaca	31303891	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 221 - 413

Target Start/End: Original strand, 12968655 - 12968846

Alignment:

Q	221	cttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaat-ttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	12968655	cttcaagcttccttcttgttgattccattaccctcatttgttcttctagaacctatgctaaattaagacattgaagattttgtctatggtcctgtacact	12968754	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12968755	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	12968846	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 17697876 - 17698066

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	17697876	caaggttcctttttgtagattcaattgctctcatttgttcttccataacctatgcttggtttagagacacttaaatttttgtctatggtcttgcgcactt	17697975	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17697976	gaataaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacatttttttccaaca	17698066	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 22141129 - 22141251

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22141129	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaa	22141228	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22141229	acacattttgttccaacaatctc	22141251	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 15833779 - 15833900

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15833779	ttttgtctatagacttgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctaaaggtttattgttaaa	15833878	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15833879	cacattttgttccaacaatctc	15833900	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 49553265 - 49553145

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	49553265	aaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccctgttatcatcaaaactcttaaaggataatgt	49553166	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49553165	taaacacattttgttccaaca	49553145	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30

Raw Score: 88; E-Value: 4e-42

Query Start/End: Original strand, 241 - 415

Target Start/End: Original strand, 6713395 - 6713570

Alignment:

Q	241	gatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata	337	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	6713395	gatttcattgctctcatttgttcttccacaacctatgtttgatatacaaacacttaaatttttgtatatggtcttgcgcacttgaacaaatattaacata	6713494	T

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6713495	tccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagga-taatgttaagcacattttgttccaacaat	6713570	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 33583647 - 33583764

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	33583647	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgactattttgaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaa	33583746	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33583747	acacattttgttccaaca	33583764	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 33598267 - 33598384

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	33598267	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgactattttgaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaa	33598366	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33598367	acacattttgttccaaca	33598384	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 5216371 - 5216491

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	5216371	aaatttttgtctatagtcctggacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacgt	5216470	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5216471	taaacacatcttgttccaaca	5216491	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 38177466 - 38177346

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	38177466	aaattattgtctattgtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	38177367	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38177366	taaacacattttgttccaaca	38177346	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 51988781 - 51988665

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	51988781	ttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaa	51988682	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51988681	cacattttgttccaaca	51988665	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 146 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12963021 - 12962753

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	12963021	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgacttcaatagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgat	12962922	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	12962921	tccttagtcctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatatcaattttttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatctaat	12962828	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12962827	tgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaaggttaatgttaaacacaatttgttcaaacaatctc	12962753	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 15851343 - 15851442

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15851343	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctaaaggtttattgttaaacacattttgttccaacaa	15851442	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 512700 - 512822

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	512700	taaatttatgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcttgtccaattgtcaatttttaatagcttgttatcatcaaaaatcttaaggtttattg	512799	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	512800	ttaaacacattttgttccaacaa	512822	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Original strand, 3522646 - 3522768

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	3522646	aaatttctgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataacttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	3522745	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3522746	taaacatattttgttccaacaat	3522768	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 21636435 - 21636313

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	21636435	aaatttttgtctatcgtcttgtacgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagagttattgc	21636336	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	21636335	taaacagattttgtttcaacaat	21636313	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 46349583 - 46349485

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46349583	acacttgaacaaatattagcatatctaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaacacattttgttccaaca	46349485	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 49666173 - 49666045

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta---g	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49666173	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaaaaaatattagaatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattatttt	49666074	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49666073	tgctaaacacattttgttccaacaatctc	49666045	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 297 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 53056501 - 53056387

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	53056501	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatacaattaacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	53056402	T

Q	397	cacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53056401	cacattttgttccaa	53056387	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16658415 - 16658295

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	16658415	ttttgtctatgatcctgtatacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggta-tgttaaa	16658317	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16658316	catattttgttccaacaatctc	16658295	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24775272 - 24775155

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	24775272	ttttttctatagtcatgtacacttgaacaaatattaacatattcaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	24775173	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24775172	cacattttgttccaacaa	24775155	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 46796162 - 46796039

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	46796162	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattat	46796063	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46796062	tgctaaacacattttgttccaaca	46796039	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 224 - 407

Target Start/End: Complemental strand, 8728866 - 8728682

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8728866	caagcttcctttttgtaaattccattgctctcatttgttcttccagaacctatacttgaattaaagacatattaatttttgtctatggtcctgcacactt	8728767	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgtt	407	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8728766	gaacaaatattagcatatctaattgac-attttttataccttgttatcctcaaaactc-aaagtggtattgttaaacacattttgtt	8728682	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 224 - 407

Target Start/End: Complemental strand, 9080753 - 9080569

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9080753	caagcttcctttttgtaaattccattgctctcatttgttcttccagaacctatacttgaattaaagacatattaatttttgtctatggtcctgcacactt	9080654	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgtt	407	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9080653	gaacaaatattagcatatctaattgac-attttttataccttgttatcctcaaaactc-aaagtggtattgttaaacacattttgtt	9080569	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 11223932 - 11224048

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	11223932	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaaattttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatattaaa	11224031	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	11224032	cacattttattccaaca	11224048	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 242 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19197690 - 19197519

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacacta-aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19197690	atttcattgctctcatttgttcttccagaacctatgtttgatataaagacacttgaatctttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatat	19197591	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19197590	ccaattgac-atttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaagggtaatgttaaacgcattttgttccaaca	19197519	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 2785498 - 2785597

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	2785498	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacgttaaacacattttgtttcaacaa	2785597	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 212 - 414

Target Start/End: Original strand, 14969621 - 14969818

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	14969621	cttcagatgcttcaagattcctttttgttgattcatttgctctcgtttgttcttccataaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatgatct	14969714	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14969715	tgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaataccttgatattattaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttcca	14969814	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 22151645 - 22151764

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22151645	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtaaa	22151744	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22151745	acacattttgttccaacaat	22151764	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 146 - 417

Target Start/End: Original strand, 37467541 - 37467808

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	37467541	tgcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagctctttgacttcaggagcacttatcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgat	37467640	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	37467641	tccattgttctcttttgttctttcagaaccta------ataaagatatcacatttttgtctatgttcctgtacacttgaacaaatattagcatattcaat	37467734	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct-taaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	37467735	taacaa-ttttaataccgtgttatcatcaaaactctcaaaagggtaatgttaaacaaattttgttctaacaatct	37467808	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 292 - 419

Target Start/End: Original strand, 13654289 - 13654413

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	13654289	taaatttttgtctatggtcttgcacacttcaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgataat	13654384	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	13654385	gttaaacacattttgttccagcaatctct	13654413	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 14955862 - 14955960

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14955862	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcattaaaacttttaagggttaatgttaaacacattttgttccaaca	14955960	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 30054034 - 30053907

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	30054034	aaatatttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttataatcaaaa-tcttaaggattattat	30053936	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30053935	tgctaaacacattttgttccaacaatctc	30053907	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 31113618 - 31113496

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	31113618	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	31113519	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31113518	acacattttgttccaacaatctc	31113496	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 2561562 - 2561683

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|
T	2561562	aaatttttgtctatgatcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagagtaatg	2561661	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	2561662	ttaaacacattttatttcaaca	2561683	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12752374 - 12752258

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata-tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	12752374	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaaagtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaatgtttattgtaaaa	12752275	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12752274	cacattttgttccaaca	12752258	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 17022424 - 17022544

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacactt-gaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	17022424	ttttgtctatggtcctgtacactttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgta	17022523	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17022524	aaacacattttgttccaacaa	17022544	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1727795 - 1727678

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	1727795	ttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgctaa	1727696	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1727695	acaaattttgttccaaca	1727678	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 50300603 - 50300715

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	50300603	ttttgtctaaagtcttgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc----ggattaatgttaaa	50300698	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	50300699	cacattttgttctaaca	50300715	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 223 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 4243047 - 4242849

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacactaaa--tttttgtctatggtcttgcacac	318	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	4243047	tcaagcttcctttttgtaaattccattgctctcatttgttcttccataacctatacttagtttaaagacatgtaacttttttttctatggtcctgcacac	4242948	T

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	4242947	ttgaacaaatattagcatatccaattgac-atttttaatatcttgttatcatcaaaactcaaaatg-gtattgttaaacacattatgttccaacagtctc	4242850	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 21605419 - 21605301

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	21605419	aaatttttgtctatagtcttgtacgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttaaatatttttttatcatcaaaactcttaagagttattgc	21605320	T

Q	393	taaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21605319	taaacacattttgttccaa	21605301	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23680059 - 23679941

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23680059	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	23679960	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23679959	acacattttgttccaacaa	23679941	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24052296 - 24052178

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	24052296	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	24052197	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24052196	acacattttgttccaacaa	24052178	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 25398040 - 25397918

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacactt-gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	25398040	aaatttttgtctatggtcctgtacactttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcttaaaaggtaatt	25397941	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25397940	ttaaacacattttgttccaacaa	25397918	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 224 - 377

Target Start/End: Original strand, 10852077 - 10852232

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10852077	caagctttctttttgtagattcaattgctctcatttgttctttcagaacctatgcttgatttaaggacacttaaatttttgtttatggtcctgcacactt	10852176	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10852177	gaacaaatattagcatatccaattggc-atttttaataccttgttatcatcaaaact	10852232	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 40851348 - 40851467

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt---	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	40851348	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	40851447	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40851448	agacacattttgttccaaca	40851467	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 323 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 18142600 - 18142504

Alignment:

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18142600	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactttcaaagaggaatgttaaacacattttgttccaacaatctct	18142504	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 46828476 - 46828572

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46828476	acttgaacaaatattagcatatccaattgagaatttttaatactttgttatcatcaaaacttttaagggttattgctaaacacattttgttccaaca	46828572	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 47405228 - 47405109

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	47405228	aatttttttctatagtcatatacacttgaacagatattagcatatctaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgtt	47405129	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47405128	acacacattttgttccaaca	47405109	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 2028669 - 2028793

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---atta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	2028669	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattatta	2028768	T

Q	389	gtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2028769	ttgctaaacacgttttgttccaaca	2028793	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 13198885 - 13198767

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	13198885	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggcttattgtgaa	13198786	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13198785	acacattttgttccaacaa	13198767	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15662366 - 15662244

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	15662366	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattttgaa	15662267	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15662266	acacattttgttccaacaatctc	15662244	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 21736701 - 21736819

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	21736701	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattacggtttattgtaaa	21736800	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21736801	acacattttgttccaacaa	21736819	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 2246958 - 2247075

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	2246958	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	2247057	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2247058	acacattttgttccaaca	2247075	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 10529718 - 10529835

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	10529718	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaagatttattgtaaa	10529817	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10529818	acacattttgttccaaca	10529835	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 299 - 414

Target Start/End: Original strand, 13148665 - 13148782

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	13148665	ttgtctttggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaaa	13148764	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13148765	catattttgttccaacaa	13148782	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 246 - 415

Target Start/End: Original strand, 13699633 - 13699802

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13699633	cattgctctcttttgttctttcagaaccaatactttgatttaagacttataaatttttgtctatgatccttcacacttgaacaaatattagcatatccaa	13699732	T

Q	343	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13699733	ttgac--tttttaatatcttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaacaat	13699802	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 16077521 - 16077638

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	16077521	tttgcctatggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	16077620	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16077621	acacattttgttccaaca	16077638	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16670800 - 16670683

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	16670800	ctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacaca	16670701	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16670700	ttttgttccaacaatctc	16670683	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 27883959 - 27884071

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|
T	27883959	ctatggtcttgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaaa	27884058	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27884059	ttttgttccaaca	27884071	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Original strand, 15648083 - 15648206

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|
T	15648083	taaattttagtctatgatcctgcacacttaaacaaatattagcatatccaattg--aatttttaataccttgttatcgtcaaaact-taaagagataatg	15648179	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15648180	ttaaacacattttgttccaacaatctc	15648206	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 40800211 - 40800324

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	40800211	ttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaagtccaattgacaatctttaataccttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtaaaa	40800305	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40800306	cacattttgttccaacaat	40800324	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 41046109 - 41046227

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagc-atatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	41046109	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaa	41046208	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41046209	aacgcattttgttccaaca	41046227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 8739770 - 8739653

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	8739770	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	8739671	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8739670	acacattttgttccaaca	8739653	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9092008 - 9091891

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	9092008	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	9091909	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9091908	acacattttgttccaaca	9091891	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 231 - 417

Target Start/End: Original strand, 14007903 - 14008090

Alignment:

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttg-tctatggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14007903	cctttttgtagattccatagctctcatttgttcttctagaacctatgcttgatataaagacccttaaattttttatctatgatcctgcacacttgaacaa	14008002	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14008003	atattagtatatccaattgac-atttttaatactttgttatcatcaaaactaaaatgg--taatgttaaacacattttgttccaacaatct	14008090	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14077224 - 14077035

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14077224	caagcttcctt-ttgtagattccgttgctctcatttgttcttcaagaacctatgtttgatttaaagacacttaaatgtttgtctatggtcctgcacactt	14077126	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14077125	gaacaaatattagcacattcaattgac-atttttaataccctgttatcatcaaaactc-aaagtggtattgtcaaacacattttgttccaaca	14077035	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 16665769 - 16665652

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	16665769	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	16665670	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16665669	acacattttgttccaaca	16665652	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 27173413 - 27173530

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	27173413	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaacgtttattgtaaa	27173512	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27173513	acacattttgttccaaca	27173530	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 304 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15226636 - 15226520

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	15226636	tatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaacaccttgttatcatcaaaactcattaaggttttttgtgaaacacat	15226537	T

Q	402	tttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15226536	tttgttccaacaatctc	15226520	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 242 - 414

Target Start/End: Original strand, 50722040 - 50722212

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	50722040	atttcattgctctcgtttgttttttcaaaaccaaaacttgaattaaacactgataaattttagtctatggtgttgcacatttgaaccaatattagcatat	50722139	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	50722140	tcaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgtttcaacaa	50722212	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 242 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 50790809 - 50790637

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	50790809	atttcattgctctcgtttgttttttcaaaaccaaaacttgaattaaacactgataaattttagtctatggtgttgcacatttgaaccaatattagcatat	50790710	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	50790709	tcaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgtttcaacaa	50790637	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 1054283 - 1054405

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	1054283	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	1054382	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1054383	acacattttgtttcaacaatctc	1054405	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 1064729 - 1064847

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc-caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	1064729	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaaaatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	1064828	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1064829	acacattttgttccaacaa	1064847	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 1783724 - 1783614

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1783724	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	1783625	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1783624	tgttccaacaa	1783614	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4404853 - 4404967

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4404853	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	4404952	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	4404953	tgttccatcaatctc	4404967	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9390873 - 9390759

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9390873	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	9390774	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9390773	tgttccaacaatctc	9390759	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12409678 - 12409560

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	12409678	taaattttagtctatgatcttacacactagaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagaaacattg	12409582	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12409581	ttaaacacattttgttccaaca	12409560	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 297 - 379

Target Start/End: Original strand, 47208095 - 47208177

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	47208095	ttttgtctatggttctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcattaaaactct	47208177	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 304 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 8995592 - 8995479

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	8995592	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacat	8995493	T

Q	402	tttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8995492	tttgttccaacaat	8995479	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9380310 - 9380201

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9380310	tggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	9380211	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9380210	tgttccaaca	9380201	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 11168055 - 11168164

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11168055	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	11168154	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11168155	tgttccaaca	11168164	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Original strand, 11514173 - 11514296

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	11514173	taaattttagtctatggttctgcacacttgaacaaatattagcatattcaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgacaat	11514268	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11514269	gttaaacacattttgttccaacaatctc	11514296	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17157697 - 17157588

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17157697	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattt	17157598	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17157597	tgttccaaca	17157588	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19887007 - 19886898

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19887007	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	19886908	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19886907	tgttccaaca	19886898	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20627253 - 20627137

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	20627253	ttttgtatatggtccggtacacttgaacaaatattggcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtaaaa	20627159	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	20627158	cacattttgttcctacaatctc	20627137	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 23636292 - 23636401

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23636292	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	23636391	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23636392	tgttccaaca	23636401	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29933225 - 29933108

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|
T	29933225	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgcgaa	29933126	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29933125	acacattttgttccaaca	29933108	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29982379 - 29982262

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|
T	29982379	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgcgaa	29982280	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29982279	acacattttgttccaaca	29982262	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 49990658 - 49990775

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	49990658	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattaacaatgtacaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttttaaaatttattgtaaaa	49990757	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49990758	cacattttgttccaacaa	49990775	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 304 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9006144 - 9006028

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9006144	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacat	9006045	T

Q	402	tttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9006044	tttggtccaacaatctc	9006028	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 48337849 - 48337949

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48337849	acacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaac	48337948	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	48337949	a	48337949	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 51341436 - 51341552

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	51341436	tttgtttatggtcctgtatacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcttaaaatttattgttaaa	51341535	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	51341536	catattttgtttcaaca	51341552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 1794136 - 1794025

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1794136	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	1794037	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1794036	tgttccaacaat	1794025	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 338 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11907972 - 11907897

Alignment:

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11907972	tccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctcaaggtttattgttaaacacattttgttccaaca	11907897	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 133 - 353

Target Start/End: Original strand, 13948562 - 13948778

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13948562	gcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcacttctcttcagatgctttaagctt	13948661	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13948662	cctttttgttgattcctttgctctcttttgtttttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacatttgaacaaatat	13948755	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttt	353	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13948756	tagcatatccaattgaaaatttt	13948778	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 19705754 - 19705871

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	19705754	aaattttagtctatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatactttgttatcatcaaaa--cttaaggtggcaatg	19705849	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19705850	ttaaacacattttgttccaaca	19705871	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Original strand, 21317686 - 21317803

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	21317686	ttttgactatgatcctgcatacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tctttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaa	21317781	T

Q	396	acacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21317782	acacattttgttccaacaatct	21317803	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 29905831 - 29905708

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	29905831	ttttgcctatggtctagtacacttgaacaaatattatcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgcga	29905732	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29905731	aatacattttgttccaacaatctc	29905708	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 29946996 - 29946873

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	29946996	ttttgcctatggtctagtacacttgaacaaatattatcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgcga	29946897	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29946896	aatacattttgttccaacaatctc	29946873	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 29996150 - 29996027

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	29996150	ttttgcctatggtctagtacacttgaacaaatattatcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgcga	29996051	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29996050	aatacattttgttccaacaatctc	29996027	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 934209 - 934319

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	934209	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	934308	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	934309	tgttccaacaa	934319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 4457496 - 4457606

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4457496	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	4457595	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4457596	tgttccaacaa	4457606	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 5627669 - 5627555

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5627669	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5627570	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5627569	tgttccaacaatctc	5627555	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 7607978 - 7607868

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7607978	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	7607879	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7607878	tgttccaacaa	7607868	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 8758142 - 8758024

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	8758142	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcattaaaactcattaaggtttattgtgaa	8758043	T

Q	396	acaca-ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8758042	acacatttttgttccaaca	8758024	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16391250 - 16391136

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16391250	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	16391151	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16391150	tgttccaacaatctc	16391136	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 18118417 - 18118323

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18118417	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactttcaaagggtaatgttaaacgcgttttgttccaa	18118323	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20683450 - 20683336

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20683450	tggtcttgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	20683351	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20683350	tgttccaacaatctc	20683336	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 41684244 - 41684358

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41684244	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	41684343	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41684344	tgttccaacaatctc	41684358	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 11216375 - 11216262

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11216375	tggtcctgtacatttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttagcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	11216276	T

Q	404	tgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11216275	tgttccaacaatct	11216262	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 15650731 - 15650614

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	15650731	tttgcctatggtcctgtacactcgaaaaaatatttgcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	15650632	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15650631	acacattttgttccaaca	15650614	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17281075 - 17280958

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17281075	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaatttataatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	17280976	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17280975	acacatttttttccaaca	17280958	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18851344 - 18851239

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18851344	acacttgaacaattattagcaataaccaattgattatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacatattttgttccaac	18851245	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	18851244	aatctc	18851239	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29460866 - 29460757

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29460866	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	29460767	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29460766	tgttccaaca	29460757	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29471718 - 29471609

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29471718	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	29471619	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29471618	tgttccaaca	29471609	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14254052 - 14253940

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|
T	14254052	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaatgaggtttattatgaaacaca	14253953	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14253952	ttttgttccaaca	14253940	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 316 - 418

Target Start/End: Original strand, 14581740 - 14581844

Alignment:

Q	316	cacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	14581740	cacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacatattgttctaaca	14581839	T

Q	414	atctc	418	Q
		\|\|\|\|\|
T	14581840	atctc	14581844	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 503837 - 503726

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	503837	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	503738	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	503737	tgttccaacaat	503726	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 526184 - 526073

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	526184	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	526085	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	526084	tgttccaacaat	526073	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 45858464 - 45858364

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45858464	acacttgaacaaatattagcttatccaattga-aaattttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacacattttgttccaa	45858366	T

Q	412	ca	413	Q
		\|\|
T	45858365	ca	45858364	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4744304 - 4744418

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	4744304	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacactt	4744403	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4744404	tgttccaacaatctc	4744418	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 5547275 - 5547161

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5547275	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5547176	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5547175	tgttccaacaatctc	5547161	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 5875947 - 5875833

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5875947	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5875848	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5875847	tgttccaacaatctc	5875833	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6220369 - 6220255

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6220369	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6220270	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6220269	tgttccaacaatctc	6220255	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9993562 - 9993448

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9993562	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	9993463	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9993462	tgttccaacaatctc	9993448	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12249117 - 12249003

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	12249117	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	12249018	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12249017	tgttccaacaatctc	12249003	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 13122228 - 13122342

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13122228	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13122327	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13122328	tgttccaacaatctc	13122342	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 13932279 - 13932362

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13932279	taaattttagtccatggttttgcacacttgaacaaatattaacatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaact	13932362	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 14466157 - 14466271

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14466157	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14466256	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14466257	tgttccaacaatctc	14466271	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 16476844 - 16476958

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16476844	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16476943	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16476944	tgttccaacaatctc	16476958	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17909655 - 17909541

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	17909655	tggtcctgtacacttgaaaaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtccattgtgaaacatattt	17909556	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17909555	tgttccaacaatctc	17909541	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 17961933 - 17962055

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|
T	17961933	tttgtatatggtcctgtacacttgaacaaatgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttaaatgtgaa	17962032	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17962033	acccatattgttcaaacaatctc	17962055	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 18006837 - 18006959

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|
T	18006837	tttgtatatggtcctgtacacttgaacaaatgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttaaatgtgaa	18006936	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18006937	acccatattgttcaaacaatctc	18006959	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 20721679 - 20721793

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20721679	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	20721778	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20721779	tgttccaacaatctc	20721793	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 21606418 - 21606544

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga-----caatttttaatac-cttgttatcatcaaaactcttaaggat	386	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	21606418	aaattttttcctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatccaatttttaatactttttttatcatcaaaactcttaagagt	21606517	T

Q	387	tagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21606518	tattgctaaacacattttgttccaaca	21606544	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24660484 - 24660598

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24660484	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24660583	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24660584	tgttccaacaatctc	24660598	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Original strand, 28169642 - 28169756

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa-ctcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	28169642	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaatttattatggtttattgtgaaacaca	28169741	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28169742	ttttgttccaacaat	28169756	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 37867013 - 37867127

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37867013	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	37867112	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37867113	tgttccaacaatctc	37867127	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 38195309 - 38195423

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38195309	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	38195408	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38195409	tgttccaacaatctc	38195423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 39372638 - 39372752

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39372638	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39372737	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39372738	tgttccaacaatctc	39372752	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 41694813 - 41694923

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41694813	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	41694912	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41694913	tgttccaacaa	41694923	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 246 - 377

Target Start/End: Original strand, 3087810 - 3087945

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcca	341	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3087810	cattgctctcttttgttcttctagaaccaatactttaatttaagccttacaaatttttagtttatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatcca	3087909	T

Q	342	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3087910	attgattttttttaatacattgttattatcaaaact	3087945	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5579285 - 5579176

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5579285	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5579186	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5579185	tgttccaaca	5579176	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 12858422 - 12858321

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12858422	acacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	12858323	T

Q	413	aa	414	Q
		\|\|
T	12858322	aa	12858321	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 13604827 - 13604936

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13604827	tggtcctgtacacttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	13604926	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13604927	tgttccaaca	13604936	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 15216014 - 15215901

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15216014	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttgaacaccttgttatcatcaaaactcattaatgttttttgtgaaacaca	15215915	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15215914	ttttgttccaacaa	15215901	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 33773487 - 33773378

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33773487	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	33773388	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33773387	tgttccaaca	33773378	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 37760236 - 37760345

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37760236	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattt	37760335	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37760336	tgttccaaca	37760345	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 16348262 - 16348162

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16348262	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	16348163	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	16348162	a	16348162	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 249 - 411

Target Start/End: Original strand, 16882627 - 16882791

Alignment:

Q	249	tgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	16882627	tgctctcatttgttcttccaggaccaatacttgaagtaaagacttgtaactttttgtttatggtcccgctcacttgaacaaatactagcatatcccattg	16882726	T

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16882727	ac-atttttaataccttattatcatcaaaact-taaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaa	16882791	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 293 - 410

Target Start/End: Original strand, 37413007 - 37413128

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg----atta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	37413007	aaatttttgtctatagtcctgtacacttaaacaaatattagcttgtccaattgactacttttaatattttgttatcatcaaaactcttaaggtttattta	37413106	T

Q	389	gtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37413107	ttgctaaacacattttgttcca	37413128	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Original strand, 15552402 - 15552525

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \|\|
T	15552402	taaattttagtctatggtcgtgtacgcttaaataaatataagcatatccaattg--aatttttaataccttgttatcgtcaaaact-taaagagacaatg	15552498	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15552499	ttaaacacattttgttccaacaatctc	15552525	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 5511261 - 5511375

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5511261	tggtcctgtacacttaaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5511360	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5511361	tgttccaacaatctc	5511375	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6500671 - 6500557

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	6500671	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	6500572	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6500571	tgttccaacaatctc	6500557	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 8775259 - 8775373

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8775259	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	8775358	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8775359	tgttccaacaatctc	8775373	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 12286648 - 12286538

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12286648	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattttgaaacacattt	12286549	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12286548	tgttccaacaa	12286538	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12296470 - 12296356

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12296470	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttagtaccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattttgaaacacattt	12296371	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12296370	tgttccaacaatctc	12296356	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13382933 - 13382819

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13382933	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13382834	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13382833	tgttccaacaatctc	13382819	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13393527 - 13393413

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13393527	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13393428	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13393427	tgttccaacaatctc	13393413	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 14476789 - 14476899

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14476789	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14476888	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14476889	tgttccaacaa	14476899	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 15093999 - 15093889

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15093999	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15093900	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15093899	tgttccaacaa	15093889	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 16487457 - 16487567

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16487457	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16487556	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16487557	tgttccaacaa	16487567	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 17761908 - 17761825

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17761908	taaattttagtctatggtcatacacacttgaacaaatattatcatatccaattg--aacttttaataccttgttattatcaaaact	17761825	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 18484628 - 18484742

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18484628	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	18484727	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18484728	tgttccaacaatctc	18484742	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19063228 - 19063145

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19063228	taaattttagtctatggtcatacacacttgaacaaatattatcatatccaattg--aacttttaataccttgttattatcaaaact	19063145	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 19778952 - 19779066

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19778952	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccatgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19779051	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19779052	tgttccaacaatctc	19779066	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 246 - 377

Target Start/End: Original strand, 20418508 - 20418641

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaattttt-gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcca	341	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	20418508	cattgctctcatttgttctttcaaaaccaatacttgaattaaagacttacaaatgtttagtctaaggtcctgcacacttgaacaaatattagcatattca	20418607	T

Q	342	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20418608	attgaca--ttttaataccttgttgtcatcaaaact	20418641	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 23757864 - 23757978

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23757864	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23757963	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23757964	tgttccaacaatctc	23757978	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 23768460 - 23768570

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23768460	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23768559	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23768560	tgttccaacaa	23768570	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24383187 - 24383077

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24383187	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24383088	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24383087	tgttccaacaa	24383077	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 24671064 - 24671174

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24671064	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24671163	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24671164	tgttccaacaa	24671174	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24706207 - 24706097

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	24706207	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcattaaaactcattaaggttcattgtgaaacacactt	24706108	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24706107	tgttccaacaa	24706097	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 28324500 - 28324386

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28324500	tggtcctgtacacttgaacagttattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	28324401	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28324400	tgttccaacaatctc	28324386	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 30399386 - 30399496

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30399386	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	30399485	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30399486	tgttccaacaa	30399496	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 38315288 - 38315398

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttt-taataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38315288	tggtcatgtacacttgaacaattataagcaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacatt	38315387	T

Q	403	ttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38315388	ttgttccaaca	38315398	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 54284774 - 54284691

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	54284774	taaatttttgtctatggtcctgcacacttggacaaatattagcatatccaattg--atcttttaacacctttttatcatcaaaact	54284691	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4174425 - 4174316

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4174425	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4174326	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4174325	tgttccaaca	4174316	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 4754889 - 4754998

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	4754889	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacactt	4754988	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4754989	tgttccaaca	4754998	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5536691 - 5536582

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5536691	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5536592	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5536591	tgttccaaca	5536582	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5865365 - 5865256

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5865365	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5865266	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5865265	tgttccaaca	5865256	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6180195 - 6180086

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6180195	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6180096	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6180095	tgttccaaca	6180086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 10099635 - 10099744

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10099635	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10099734	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10099735	tgttccaaca	10099744	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11272034 - 11271925

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11272034	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11271935	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11271934	tgttccaaca	11271925	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12237291 - 12237182

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	12237291	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	12237192	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12237191	tgttccaaca	12237182	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 13132471 - 13132580

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13132471	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13132570	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13132571	tgttccaaca	13132580	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 14321326 - 14321221

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14321326	acacttgaacaattattagcaataaccaattgacagtttttaataccttcttatcatcaaaactcaatgaggtttattatgaaacacattttgttccaac	14321227	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	14321226	aatctc	14321221	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 16493603 - 16493712

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16493603	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16493702	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16493703	tgttccaaca	16493712	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 19789589 - 19789698

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19789589	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19789688	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19789689	tgttccaaca	19789698	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20672865 - 20672756

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20672865	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	20672766	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20672765	tgttccaaca	20672756	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 23648314 - 23648423

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23648314	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23648413	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23648414	tgttccaaca	23648423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 35187961 - 35188070

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35187961	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35188060	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35188061	tgttccaaca	35188070	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 35575540 - 35575431

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35575540	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35575441	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35575440	tgttccaaca	35575431	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 37886127 - 37886236

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37886127	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	37886226	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37886227	tgttccaaca	37886236	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 38205845 - 38205954

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38205845	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	38205944	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38205945	tgttccaaca	38205954	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 39672552 - 39672443

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39672552	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtaaaacacattt	39672453	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39672452	tgttccaaca	39672443	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 342 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13298096 - 13298024

Alignment:

Q	342	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13298096	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcataaaggtttattgtgaaacacattttgttccaaca	13298024	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Original strand, 13978129 - 13978227

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13978129	ttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttcaatactttgttatcttcaaaacttttaggggttattattgctaaacacattttgttccaaca	13978227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 41 - 93

Target Start/End: Original strand, 16032673 - 16032725

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16032673	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatg	16032725	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 357 - 413

Target Start/End: Original strand, 33591197 - 33591253

Alignment:

Q	357	taccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33591197	taccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaacacattttgttccaaca	33591253	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 317 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 7794232 - 7794134

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7794232	acttgaacaattattagtagtaaccaattgacaatttt-aataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	7794134	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 296 - 367

Target Start/End: Complemental strand, 12726036 - 12725966

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12726036	tttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcata-ccaattgaaaatatttaataccttgttat	12725966	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 1470092 - 1470175

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1470092	taaattttagtatatgatcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccatgttatcatcaaaact	1470175	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 7920571 - 7920488

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7920571	taaattttagactaaggtcatgcacacttgaacaagtattagtatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaact	7920488	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 27244792 - 27244682

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27244792	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	27244693	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27244692	tgttccaacaa	27244682	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 28313884 - 28313774

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28313884	tggtcctgtacacttgaacagttattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	28313785	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28313784	tgttccaacaa	28313774	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 314 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 2903005 - 2902943

Alignment:

Q	314	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2903005	cacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatatcttgttatcatcaaaactc	2902943	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 5521439 - 5521548

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	5521439	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacatat	5521538	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5521539	tgttccaaca	5521548	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6490017 - 6489908

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	6490017	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	6489918	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6489917	tgttccaaca	6489908	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 8785844 - 8785953

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8785844	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	8785943	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8785944	tgttccaaca	8785953	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9981554 - 9981445

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9981554	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	9981455	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9981454	tgttccaaca	9981445	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 11531438 - 11531547

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11531438	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaatcttaataaggttcattgtgaaacacattt	11531537	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11531538	tgttccaaca	11531547	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13372339 - 13372230

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13372339	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13372240	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13372239	tgttccaaca	13372230	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 298 - 378

Target Start/End: Original strand, 19225777 - 19225855

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19225777	tttgtctatggtcttgcgcacttgaacaaatattagcatattcaattg--atcttttaatatcttgttaccatcaaaactc	19225855	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 39383292 - 39383401

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39383292	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccatgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39383391	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39383392	tgttccaaca	39383401	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 40288728 - 40288840

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa--ctcttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40288728	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaacttaataaggttcattgtgaaacacatt	40288827	T

Q	403	ttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40288828	ttgttccaacaat	40288840	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 339 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10654917 - 10654837

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10654917	ccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaatctc	10654837	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Original strand, 20725221 - 20725301

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20725221	tgcaatgctagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatcttcagcttctg	20725301	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 29951455 - 29951383

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29951455	ttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttct	29951383	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 30000609 - 30000537

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30000609	ttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttct	30000537	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 317 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 7804188 - 7804086

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	7804188	acttgaacaattattagtagtaaccaattgacaatttt-aataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttctaacat	7804090	T

Q	415	tctc	418	Q
		\|\|\|\|
T	7804089	tctc	7804086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10626577 - 10626502

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10626577	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	10626502	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 7494650 - 7494733

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7494650	taaatttttgactatggtcctgcacacttgaataaatattaacaatttcaattgaca--ttttaatactttgttatcatcaaaact	7494733	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 313 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 17768811 - 17768749

Alignment:

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17768811	gcacactcgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatatcttgttatcatcaaaact	17768749	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 313 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19070112 - 19070050

Alignment:

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19070112	gcacactcgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatatcttgttatcatcaaaact	19070050	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21155846 - 21155737

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21155846	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgaaaatttttaataccatgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	21155747	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21155746	tgttccaaca	21155737	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 27 - 111

Target Start/End: Original strand, 12968440 - 12968524

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	12968440	tgcaatgatagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttcaaatctttcagcttctgatggtcctcagctcctgatga	12968524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 246 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 16305031 - 16304900

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	16305031	cattgctctcatttgttcttccagaaccaatactttgttttaagacttataaaatttagtctattctcctgcacatttgaacaaatattagcatgtccaa	16304932	T

Q	343	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16304931	ttg--aacttttattaccttgttatcatcaaaac	16304900	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 19531849 - 19531949

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19531849	acacttgaacatttattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattttgttccaac	19531948	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	19531949	a	19531949	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 2561330 - 2561389

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	2561330	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	2561389	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 317 - 414

Target Start/End: Original strand, 14392387 - 14392486

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14392387	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataactagttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaa	14392486	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 301 - 375

Target Start/End: Original strand, 27851904 - 27851976

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27851904	gtctatggtcctgcatacttgaaaaaatattagtatatccaattg--aacttttaatgccttgttatcatcaaaa	27851976	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 304 - 377

Target Start/End: Original strand, 4508340 - 4508411

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4508340	tatggtcttgcacacttgaacatatattagcatatctagtt--cttcttttaataccttgttatcatcaaaact	4508411	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 301 - 413

Target Start/End: Original strand, 13558135 - 13558249

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	13558135	gtctttggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgaaaatttttaataccttattatcatcaaaacttaataatgttcattgtgaaaca	13558234	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13558235	cattttgttccaaca	13558249	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 6090874 - 6090947

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6090874	ttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	6090947	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 13824211 - 13824256

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13824211	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	13824256	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 14426985 - 14426905

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14426985	taaattttaatctttggtcctgcacacttgaacatatattagcatatccaattg---ttctttaatactttgttatcatcaaaa	14426905	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 14969469 - 14969514

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14969469	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	14969514	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 304 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 20311430 - 20311358

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20311430	tatggtcatgcacacttgaacatatattagcatatccaattg---ttcttaaatactttgttatcatcaaaactct	20311358	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 350 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 16794042 - 16793974

Alignment:

Q	350	tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggat-tagtgttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16794042	tttttaataccttgttatcatcaaaact--taaggtggtaaagttaaacacattttgttccaacaatctct	16793974	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 362 - 413

Target Start/End: Original strand, 21233264 - 21233315

Alignment:

Q	362	tgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21233264	tgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	21233315	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 25398290 - 25398231

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	25398290	ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatg	25398231	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 49642779 - 49642720

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	49642779	ttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	49642720	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19643306 - 19643223

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19643306	taaattttagtctatggtcctgcacaatttaacaaatattgacatatccaattg--atcttttaatatcttgtcatcatcaaaact	19643223	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 346

Target Start/End: Complemental strand, 19657801 - 19657747

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	346	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19657801	taaatcttagtctatggtcctgcccacttgaacagatattagcatatccaattga	19657747	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 35 - 93

Target Start/End: Original strand, 28582249 - 28582307

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	28582249	tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	28582307	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 327 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6252607 - 6252524

Alignment:

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	6252607	atattagcatatccaattgac--tttttaatactttgttatcattaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgtttcaaca	6252524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 317 - 377

Target Start/End: Original strand, 7477910 - 7477968

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7477910	acttgaacaaatattagcaatttcaattgaca--ttttaataccttgttttcatcaaaact	7477968	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 14393021 - 14392976

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14393021	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtct	14392976	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 30 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 26417701 - 26417620

Alignment:

Q	30	aatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	26417701	aatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatga	26417620	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 91

Target Start/End: Original strand, 31303528 - 31303585

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctga	91	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	31303528	ttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctga	31303585	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 52920547 - 52920620

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52920547	ttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	52920620	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 302 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 4767426 - 4767355

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4767426	tctatcgtcctgcacacttgaacatatattagcatatctaatt---attctttaatactttgttatcatcaaaac	4767355	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 9796528 - 9796610

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9796528	taaattttaatctatgatcctgcacacttgaacatatattaacatatccaattg---ttctttaatactttattatcatcaaaact	9796610	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 12963094 - 12963043

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	12963094	gattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	12963043	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 21636600 - 21636553

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21636600	tgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	21636553	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 36 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 38177658 - 38177615

Alignment:

Q	36	agacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38177658	agacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtct	38177615	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 49666336 - 49666289

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	49666336	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	49666289	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 363 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12723960 - 12723910

Alignment:

Q	363	gttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12723960	gttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacagattttgttccaaca	12723910	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 302 - 344

Target Start/End: Complemental strand, 16198737 - 16198695

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16198737	tctatgttcctgcacacttgaacaaatattagtatatccaatt	16198695	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 46796312 - 46796266

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	46796312	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	46796266	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 296 - 338

Target Start/End: Original strand, 46828380 - 46828422

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46828380	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatat	46828422	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 345

Target Start/End: Original strand, 4244359 - 4244412

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4244359	taaattttaatctatgatcttgcacacttgaacacatattaacttatccaattg	4244412	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 17238939 - 17238894

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17238939	ttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtct	17238894	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 140 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 25398201 - 25398148

Alignment:

Q	140	atgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25398201	atgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgtcacttcaggagcact	25398148	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 148 - 193

Target Start/End: Original strand, 40851184 - 40851229

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	40851184	cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	40851229	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 363 - 414

Target Start/End: Original strand, 9548568 - 9548620

Alignment:

Q	363	gttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9548568	gttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaacaa	9548620	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 351 - 379

Target Start/End: Original strand, 13949126 - 13949154

Alignment:

Q	351	ttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13949126	ttttaataccttgttatcatcaaaactct	13949154	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 294 - 330

Target Start/End: Original strand, 20050956 - 20050992

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20050956	aatttttgtctatgatcttgcacacttaaacaaatat	20050992	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 30054161 - 30054125

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30054161	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	30054125	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Original strand, 40800016 - 40800056

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40800016	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta	40800056	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Original strand, 47207849 - 47207889

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	47207849	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta	47207889	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Complemental strand, 47405438 - 47405398

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47405438	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta	47405398	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 200)

Name: chr4

Description:

Target: chr4; HSP #1

Raw Score: 170; E-Value: 5e-91

Query Start/End: Original strand, 41 - 415

Target Start/End: Original strand, 6641827 - 6642181

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatga	140	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	6641827	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaaattcagcttctg-----------------gtgatattgcttctga	6641909	T

Q	141	tgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccc-ttccttcatatgcttcaagcttccttcttgt	239	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6641910	tgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagaagcacatttcttcagatgcttcaagcttccttcttgt	6642009	T

Q	240	tgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc	339	Q
		\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6642010	tgactccattgctctcatttgttcttccagaacctatactttaaatagacattaaatttttgtatatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatc	6642109	T

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6642110	caattgacaatttttaatac---gttatcatcaaaattctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttccaacaat	6642181	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2

Raw Score: 139; E-Value: 2e-72

Query Start/End: Original strand, 218 - 416

Target Start/End: Original strand, 11916028 - 11916224

Alignment:

Q	218	atgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcaca	317	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11916028	atgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcattttttctttcagaacctatgctttaaagagacactaaatttttgtctatgatcttgcaca	11916127	T

Q	318	cttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	11916128	cttaaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaac-ctaaagg-gtagtgttaaacacattttgttccatcaatc	11916224	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3

Raw Score: 137; E-Value: 3e-71

Query Start/End: Original strand, 37 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 37435506 - 37435136

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgctt	136	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	37435506	gacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct--tgcctctgatga-gatgctt	37435410	T

Q	137	atgatgaggt-gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttcct	233	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37435409	ctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcct	37435310	T

Q	234	tcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattag	333	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37435309	ttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattag	37435216	T

Q	334	catatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37435215	catatccaattgacaatttttaataccttgttataatcaaaactctgaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	37435136	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4

Raw Score: 128; E-Value: 6e-66

Query Start/End: Original strand, 212 - 414

Target Start/End: Original strand, 17540720 - 17540920

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	17540720	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctatgcttgaaagagacactaaatttttgtctacggtcc	17540819	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17540820	tgcacacttgaacaaataatagcatatctaattgacaacttttaataccttgttaacatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaa	17540917	T

Q	412	caa	414	Q
		\|\|\|
T	17540918	caa	17540920	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5

Raw Score: 120; E-Value: 4e-61

Query Start/End: Original strand, 125 - 413

Target Start/End: Original strand, 16632651 - 16632935

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgct	222	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	16632651	gtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatggtgtcatcacttcagaagcactttgactttaggagcacttctcttcagatgct	16632750	T

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	16632751	tcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgtttttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctgtggtcttgtacacttga	16632844	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16632845	acaaagattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgttaaacacattttgttccaaca	16632935	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 161 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19620955 - 19620702

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtt	258	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	19620955	tgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgacttcaggagcacgtctcttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttt	19620856	T

Q	259	tgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaata	358	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19620855	tgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaata	19620762	T

Q	359	ccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19620761	ccttgttattatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	19620702	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7

Raw Score: 112; E-Value: 2e-56

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17787847 - 17787648

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaattttt-gtctatggtc	310	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	17787847	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttcttc-agaacatgtgctttaaagagacactaaattttttgtgcatggtc	17787749	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17787748	ctgcacacttgaacagatattagcatattcaattgacaattttcaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttcca	17787651	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8

Raw Score: 105; E-Value: 3e-52

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 41114563 - 41114363

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatacttt--aaatagacactaaatttttgtctatggt	309	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41114563	cttcatatgcttcaagcttccttctcgttgattccattgctctcatttgttcttcgagaacctaagctttaaaaagagacactaaa-ttttgtctatggt	41114465	T

Q	310	cttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41114464	cctgcacacttaaacaaat-ttagcgtattcatttgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttcc	41114367	T

Q	410	aaca	413	Q
		\|\|\|\|
T	41114366	aaca	41114363	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 223 - 414

Target Start/End: Original strand, 11901528 - 11901718

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	11901528	tcaagcttcctttttgttaattccattgttctcatttgttcttccagaacctatgcttaattaagacattcaaaattttgtttatggtcctgcagacttg	11901627	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11901628	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	11901718	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 297 - 419

Target Start/End: Original strand, 55732174 - 55732296

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	55732174	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	55732273	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	55732274	cacattttgttccaacagtctct	55732296	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 218 - 410

Target Start/End: Complemental strand, 12810998 - 12810812

Alignment:

Q	218	atgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcaca	317	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	12810998	atgctacaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtaca	12810905	T

Q	318	cttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12810904	cttgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatacttttttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttcca	12810812	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 29121754 - 29121870

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	29121754	ttttgtctatagtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	29121853	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29121854	cacattttgttccaaca	29121870	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 126 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 14604805 - 14604556

Alignment:

Q	126	tgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|
T	14604805	tgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgttt	14604706	T

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|
T	14604705	caagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacctaaa	14604612	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14604611	caaatattagcatatccaattgacaattcttaataccttgttatcatcaaaactct	14604556	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 3498013 - 3498129

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3498013	ttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaa	3498112	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3498113	catattttgttccaaca	3498129	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 3793470 - 3793586

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	3793470	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctgaagggttaatgttaaa	3793569	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3793570	cacatttagttccaaca	3793586	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 146 - 413

Target Start/End: Original strand, 9141095 - 9141358

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttga	242	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	9141095	tgcttctgaagaacttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaagcttcctttttgttga	9141194	T

Q	243	tttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9141195	ttcctttgctctcttttgttcttccataaccta------ataatgatattaaatttt-gtctatggtgctgtacacttgaataaatattagcatatccaa	9141287	T

Q	343	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9141288	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaagtcttaaagagtaatgttaaacacattttgttccaaca	9141358	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 54680277 - 54680395

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	54680277	ttttgtctataatcctgcacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	54680376	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	54680377	cacattttgttccaacaat	54680395	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 10693234 - 10693350

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	10693234	ttttgtctatagtactgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	10693333	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10693334	cacattttgttccaaca	10693350	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 10907000 - 10907116

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	10907000	ttttgtctatagtactgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	10907099	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10907100	cacattttgttccaaca	10907116	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 257 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12417380 - 12417223

Alignment:

Q	257	tttgttcttccagaacctatactttaaat----agacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattt	352	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	12417380	tttgttcttccagaacctatgcttgatatttaaagacattaaatttttgtctttggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac-attt	12417282	T

Q	353	ttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12417281	ttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	12417223	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 224 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10660981 - 10660796

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10660981	caagcttcctt-ttgtagattccattgctctcatttgaccttc-agaacctatgcatttaa-agacaccaaatatttgtctatggtcctgcacacttgag	10660885	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10660884	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcactaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	10660796	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 224 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10875126 - 10874941

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10875126	caagcttcctt-ttgtagattccattgctctcatttgaccttc-agaacctatgcatttaa-agacaccaaatatttgtctatggtcctgcacacttgag	10875030	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10875029	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcactaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	10874941	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 161 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 29680421 - 29680175

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtt	258	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	29680421	tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggaacacttctcttcagatacttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttt	29680322	T

Q	259	tgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaata	358	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29680321	tgttcttctagaaccta------ataatgattccaaatttt-gtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaata	29680229	T

Q	359	cc-ttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29680228	cctttgttattatcaaaactctcaaagcgtaatgttaaacatattttgttccaa	29680175	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 413388 - 413505

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	413388	ttttgtctatagccttgtacacttgaacaactattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	413487	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	413488	cacattttgttccaacaa	413505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14153714 - 14153593

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	14153714	taaatttttgtctatggtcctgtatacttgaaaaaatattagcttgtccaattgttaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggtttattg	14153615	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14153614	ttaaacacattttgttccaaca	14153593	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 16940344 - 16940464

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	16940344	aaatatttgtctgtagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaacactttgttatcatcaaaactcttaagagttattgc	16940443	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16940444	taaacacattttgttccaaca	16940464	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 133 - 404

Target Start/End: Original strand, 45833615 - 45833884

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttcctt-catatgcttcaagct	229	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45833615	gcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttttgtcttcaggagcgcttcttttcagatgcttcaagct	45833714	T

Q	230	tccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaata	329	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45833715	tcctttttgttgattcgtttgctctcttttgttcttccaaaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaata	45833808	T

Q	330	ttagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45833809	ttagcatatccaattgacaatttttgaataccttgttatgatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttt	45833884	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Original strand, 8106043 - 8106162

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	8106043	aatttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttagtgtcttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgat	8106142	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8106143	aaacacattttgttccaaca	8106162	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 14904054 - 14903928

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	14904054	aaatttttgtctatggtcatgtatacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcattacaactctcaaagggtaatgt	14903955	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	14903954	caaacacattttgttccaacaaactct	14903928	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 17993495 - 17993377

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17993495	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	17993396	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17993395	acacattttgttccaacaa	17993377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 16853859 - 16853975

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	16853859	ttttgtctatagtcctgtacgcttgaacaactattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacattaaa	16853958	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16853959	cacattttgttccaaca	16853975	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 19885067 - 19885187

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	19885067	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagaaaatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	19885166	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19885167	taaacacatttagttccaaca	19885187	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 223 - 413

Target Start/End: Original strand, 10250134 - 10250325

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10250134	tcaagcttcctttttttaaattccattgctctcatttgttcttctagaacccatgcttcatttaaagacactcaaatttttgtatatggtcctgcacact	10250233	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10250234	tgaacaaatattatcatatccaattgaatttttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	10250325	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 300 - 413

Target Start/End: Original strand, 1672797 - 1672912

Alignment:

Q	300	tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	1672797	tgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgctaaa	1672896	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1672897	ca-attttgttccaaca	1672912	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 300 - 413

Target Start/End: Original strand, 1675272 - 1675387

Alignment:

Q	300	tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	1675272	tgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgctaaa	1675371	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1675372	ca-attttgttccaaca	1675387	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 199 - 379

Target Start/End: Original strand, 14833680 - 14833855

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	14833680	tcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccaggtccta------ataatgattccaaatt	14833773	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14833774	tttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	14833855	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 16819023 - 16818901

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	16819023	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	16818924	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16818923	acacattttattccaacaatctc	16818901	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18774327 - 18774209

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18774327	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	18774228	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18774227	acacattttgttccaacaa	18774209	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Original strand, 22089917 - 22090031

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22089917	ttgtatatggtcatgcacacttgaaaaaataatagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaaca	22090016	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22090017	cattttgttctaaca	22090031	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 40846464 - 40846582

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaa-tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	40846464	tttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacattcaaagggtaatgtta	40846563	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40846564	aacacattttgttccaaca	40846582	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 3105185 - 3105062

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	3105185	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttataactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	3105086	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	3105085	tgctaaacacattttgttcaaaca	3105062	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19911671 - 19911554

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	19911671	ttttgcctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctcaaagggtagtattaaa	19911572	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	19911571	cgcattttgtttcaacaa	19911554	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 23509728 - 23509845

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23509728	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	23509827	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23509828	acacattttgttccaaca	23509845	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 302 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36209773 - 36209660

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	36209773	tctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaatac	36209674	T

Q	400	attttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36209673	attttgttccaaca	36209660	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 2652117 - 2652235

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	2652117	aaatttttgtctatggtcgtgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--ctaaaggtgatagtg	2652212	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	2652213	ttaaacacattttgttcaaacaa	2652235	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 13575876 - 13575761

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|
T	13575876	ttttgtctatggttatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtacaa	13575782	T

Q	397	cacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13575781	cacattttgttccaacaatct	13575761	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 14778125 - 14778002

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	14778125	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcagtaaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaa	14778026	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14778025	aacacattttgttccaacaatctc	14778002	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 17247658 - 17247757

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17247658	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttgtaaaaccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgctaaacatattttgttccaacaa	17247757	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 242 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19888923 - 19888746

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19888923	atttcattgctctcatttgttctttcagaactaatacttgaattaaagacttaaaaaatattgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatat	19888824	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19888823	ccaattgac-atttttaatacctttttatcatcaaaa--cgtatggtggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	19888746	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 25650874 - 25650748

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgaca-atttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|
T	25650874	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacatttttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaacg	25650775	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25650774	ttaaacacatttt-atccaacaatctct	25650748	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 146 - 414

Target Start/End: Original strand, 56034792 - 56035057

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	56034792	tgcttctgatgaacttgcttctgattacgtcatcacttcagaagcacttttacttcaggatcacttttcttcagacgcttcaagctttctttttgttgat	56034891	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56034892	tcatttgctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaat	56034985	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctt-aaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56034986	cgataatttttaataccttgttattatcaaaattcttaaaagggtaatattaaacacatttttttccaacaa	56035057	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15207056 - 15206942

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15207056	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	15206957	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15206956	tgttccaacaatctc	15206942	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17398409 - 17398292

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggat---tagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|
T	17398409	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaa--cttaaggattaatattgct	17398312	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17398311	aaacacattttgttccaaca	17398292	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Original strand, 55380624 - 55380738

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55380624	ttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatgttagcaaatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaattttcaaaggataatgttaaaca	55380723	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55380724	cattttgttccaaca	55380738	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 297 - 409

Target Start/End: Complemental strand, 9751275 - 9751160

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	9751275	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcgtatctaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgct	9751176	T

Q	394	aaacacattttgttcc	409	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9751175	aaacacattttgttcc	9751160	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 11536461 - 11536578

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	11536461	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	11536560	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11536561	ttttgttacaacaatctc	11536578	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18006703 - 18006586

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18006703	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	18006604	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18006603	acacattttgttccaaca	18006586	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 242 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21350402 - 21350230

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaa---atttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	21350402	atttcattgctctcgtttgttttttcataaccaaaacttgaattaaacactaataaattttagtctatggtcatgcacacttgaacaaatatcagaatat	21350303	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21350302	ccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgtttcaacaa	21350230	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 294 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 14356893 - 14356772

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	14356893	aatttttttctatggtcctacacacttgaacaaatattagcatattcaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgt	14356798	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14356797	taaacacattttgttccaacaatctc	14356772	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 133 - 408

Target Start/End: Original strand, 15139449 - 15139720

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15139449	gcttctgacgaggtgcttctaatgaacttgcttccgaagacatcatcacttctagagcacttgacttaaggagcacttttcttcaattgcttaaagcttc	15139548	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15139549	ctttttgttgattccatagctcttaatttgttcttccagaacctacaaattata------cttaatctt-gtatttggtcctgcacacttgaacaaatat	15139641	T

Q	331	tagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttc	408	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15139642	tagcatatccaattgacaattttttaataccatgttatcatcaaaacactcaaagggtaatgttaaacacattttgttc	15139720	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 297 - 384

Target Start/End: Original strand, 40861057 - 40861144

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40861057	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagg	40861144	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 8996922 - 8996808

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	8996922	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaaaaaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacaca	8996823	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8996822	ttttgttccaacaat	8996808	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 11515645 - 11515767

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11515645	tttgcctatggtcctttacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaattccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	11515744	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11515745	acacattttgttccaacaatctc	11515767	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 5873983 - 5874100

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	5873983	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacactttttaataccttgttatcatcaaaactcactaaggtttattgtgaaacaca	5874082	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5874083	ttttgttccaacaatctc	5874100	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 22191222 - 22191341

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	22191222	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcttatccagttgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaaggttattattgtt	22191321	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	22191322	aaacaaattttgtttcaaca	22191341	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Original strand, 24714038 - 24714151

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	24714038	ctatggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	24714137	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24714138	ttttgttccaacaa	24714151	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31266463 - 31266346

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	31266463	tttgcctatggtcttgtacacttgaacaagtattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	31266364	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	31266363	acacattttattccaaca	31266346	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 315 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 39419452 - 39419349

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39419452	acacttgaacaaatattagcgtatccaattcacaatttttaatattttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgttaaacacattttgttccaa	39419353	T

Q	412	caat	415	Q
		\|\|\|\|
T	39419352	caat	39419349	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 49001645 - 49001528

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	49001645	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttactgtgaa	49001546	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49001545	atacattttgttccaaca	49001528	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 242 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 16324305 - 16324168

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16324305	atttcattgctctcatttgttctttcaaaaccaatatttgaattaaagacttataactttttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatat	16324206	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16324205	ccaattgac-atttttaatacctttttatcatcaaaact	16324168	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 17812131 - 17812013

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	17812131	taaattttagtctatggtcttgcacatttgaacaaacattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaagtgacaatg	17812036	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17812035	ttaaacacattttgttccaacaa	17812013	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 384

Target Start/End: Original strand, 6517866 - 6517957

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	6517866	aaatttttgtctatagtcctataaacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttttaagg	6517957	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 10696225 - 10696336

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10696225	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	10696324	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10696325	tgttccaacaat	10696336	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 10909994 - 10910105

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10909994	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	10910093	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10910094	tgttccaacaat	10910105	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 212 - 414

Target Start/End: Original strand, 12601402 - 12601593

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12601402	cttcagatgccttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcc	12601495	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	12601496	tgtacac-----caaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttattacaa	12601590	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 388

Target Start/End: Original strand, 14571405 - 14571500

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	14571405	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaagttcttaagaatta	14571500	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 242 - 367

Target Start/End: Complemental strand, 14902275 - 14902149

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14902275	atttcattgctctcttttattctttcagaaccaatacttgaatttaagacttataaatttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatat	14902176	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14902175	ccaattg--aatttttaataccttgttat	14902149	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17700521 - 17700404

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	17700521	ttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctgaaagattattattgctaa	17700422	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17700421	acatattttgttccaaca	17700404	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 38514255 - 38514375

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg----attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|
T	38514255	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaaagggttattattgc	38514354	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38514355	taaacatattttgttccaaca	38514375	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 3391060 - 3391170

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3391060	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	3391159	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3391160	tgttccaacaa	3391170	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 25009379 - 25009489

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25009379	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	25009478	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25009479	tgttccaacaa	25009489	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 40470263 - 40470149

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40470263	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	40470164	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40470163	tgttccaacaatctc	40470149	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 11519677 - 11519794

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11519677	tttgcctatggtcctttacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaattccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	11519776	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11519777	acacattttgttccaaca	11519794	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 19244385 - 19244502

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	19244385	tttgcctatggtcatgtacacttgtacaaatattagcaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaac	19244484	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19244485	acacattttgttccaaca	19244502	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 19581858 - 19581967

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19581858	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	19581957	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19581958	tgttccaaca	19581967	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 39525809 - 39525692

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	39525809	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattaaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	39525710	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39525709	acacattttgttccaaca	39525692	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 304 - 415

Target Start/End: Original strand, 55651923 - 55652036

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	55651923	tatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaaattttaataccttgttatcatcaaaactaattaaggtttattgtgaaacacat	55652022	T

Q	402	tttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55652023	tttgttccaacaat	55652036	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 319 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15474859 - 15474757

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15474859	ttgaaaaaatattagcgtattcaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacacattttgttccaacaat	15474760	T

Q	416	ctc	418	Q
		\|\|\|
T	15474759	ctc	15474757	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17198072 - 17197972

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17198072	acacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	17197973	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	17197972	a	17197972	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Original strand, 10301151 - 10301262

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10301151	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacat	10301250	T

Q	402	tttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10301251	tttgttccaaca	10301262	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 18077561 - 18077450

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18077561	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	18077462	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18077461	tgttccaacaat	18077450	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 319 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 37985503 - 37985409

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37985503	ttgaacaaatattaacatatccaattgataatttt-aataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	37985409	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 23750838 - 23750936

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23750838	acacttgaacaaatattagcagttccaatttataatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatattaaacacattttgttccaaca	23750936	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 36018921 - 36019035

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36018921	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	36019020	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36019021	tgttccaacaatctc	36019035	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 47151736 - 47151626

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47151736	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgagaatttttaataccttgttatcatcaaaacttgttaaggtttattgtgaaacacattt	47151637	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47151636	tgttccaacaa	47151626	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 11542394 - 11542511

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|
T	11542394	tttgtctatggtcctgtaaacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaa	11542493	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11542494	acacattttgttccaaca	11542511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 25657737 - 25657846

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25657737	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	25657836	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25657837	tgttccaaca	25657846	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 33378816 - 33378932

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|
T	33378816	tttgtctgtggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttta-tggaaa	33378914	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33378915	acatattttgttccaaca	33378932	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40454007 - 40453898

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40454007	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	40453908	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40453907	tgttccaaca	40453898	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 301 - 414

Target Start/End: Original strand, 20577617 - 20577727

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20577617	gtctatggtcctgcgcacttgaacaaatattagcatatccaattg--aaattttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgaaaatgttaaacac	20577712	T

Q	400	attttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20577713	attttgttccaacaa	20577727	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 16305706 - 16305821

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttt-taataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16305706	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaagttcattgtgaaacacatt	16305805	T

Q	403	ttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16305806	ttgttccaacaatctc	16305821	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10750823 - 10750709

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10750823	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10750724	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10750723	tgttccaacaatctc	10750709	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10964592 - 10964478

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10964592	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10964493	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10964492	tgttccaacaatctc	10964478	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 16256454 - 16256568

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16256454	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16256553	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16256554	tgttccaacaatctc	16256568	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 17918637 - 17918751

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17918637	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17918736	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17918737	tgttccaacaatctc	17918751	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19818981 - 19818898

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19818981	taaatttttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--atcttttaataacttgttatcatcaaaact	19818898	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 21996998 - 21997112

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21996998	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	21997097	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21997098	tgttccaacaatctc	21997112	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27657221 - 27657335

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27657221	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27657320	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27657321	tgttccaacaatctc	27657335	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 30936747 - 30936633

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30936747	tggtcatgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	30936648	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30936647	tgttccaacaatctc	30936633	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 55755486 - 55755372

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55755486	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	55755387	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55755386	tgttccaacaatctc	55755372	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Original strand, 451170 - 451275

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	451170	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	451269	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	451270	aatctc	451275	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 5023314 - 5023423

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5023314	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	5023413	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5023414	tgttccaaca	5023423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 296 - 418

Target Start/End: Original strand, 18776353 - 18776472

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	18776353	tttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaacattagtaattccaattgaca--ttttaataccttgttaacatcaaaa--cataaggtaataatgtta	18776448	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18776449	aacacattgtgttccaacaatctc	18776472	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 27814620 - 27814511

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27814620	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	27814521	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27814520	tgttccaaca	27814511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 36029491 - 36029600

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36029491	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	36029590	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36029591	tgttccaaca	36029600	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 48371716 - 48371825

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48371716	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	48371815	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48371816	tgttccaaca	48371825	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 17526213 - 17526129

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17526213	taaattttagtatatggtcttgcacacttgaacacatattagcatatccaattg--aacttttaatacctcattatcatcaaaactc	17526129	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 419

Target Start/End: Original strand, 28066764 - 28066879

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28066764	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	28066863	T

Q	404	tgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	28066864	tgttccaacattctct	28066879	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 9914104 - 9913994

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9914104	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9914005	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9914004	tgttccaacaa	9913994	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10088019 - 10087905

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10088019	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10087920	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	10087919	tgttccaacagtctc	10087905	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10740266 - 10740156

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10740266	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10740167	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10740166	tgttccaacaa	10740156	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10954035 - 10953925

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10954035	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10953936	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10953935	tgttccaacaa	10953925	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 17276576 - 17276686

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17276576	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17276675	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17276676	tgttccaacaa	17276686	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18129916 - 18129806

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18129916	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	18129817	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18129816	tgttccaacaa	18129806	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18762758 - 18762644

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18762758	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	18762659	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18762658	tgttccaacaatctc	18762644	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 297 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 22675282 - 22675201

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22675282	ttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgtcaa-ttttaatatcttgttattatcaaaactct	22675201	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 24027760 - 24027646

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24027760	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24027661	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24027660	tgttccaacaatctc	24027646	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 24640868 - 24640982

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24640868	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24640967	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24640968	tattccaacaatctc	24640982	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 24652022 - 24652132

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24652022	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24652121	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24652122	tgttccaacaa	24652132	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 49518737 - 49518847

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49518737	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	49518836	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49518837	tgttccaacaa	49518847	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14843328 - 14843219

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14843328	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	14843229	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14843228	tgttccaaca	14843219	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 22007596 - 22007705

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22007596	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22007695	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22007696	tgttccaaca	22007705	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 30 - 107

Target Start/End: Original strand, 22089721 - 22089797

Alignment:

Q	30	aatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	22089721	aatgttaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattctttcatcttctgatgatctttagcttctg	22089797	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 292 - 376

Target Start/End: Original strand, 24619916 - 24619998

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24619916	taaatttttgtttatggttttgcacacttgaacaaatattagtatatccaattg--aacttttaatattttgttatcatcaaaac	24619998	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 25089308 - 25089417

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25089308	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	25089407	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25089408	tgttccaaca	25089417	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 27667794 - 27667903

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27667794	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27667893	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27667894	tgttccaaca	27667903	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 52704373 - 52704482

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52704373	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	52704472	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52704473	tgttccaaca	52704482	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 55744875 - 55744766

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55744875	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	55744776	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55744775	tgttccaaca	55744766	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 3498227 - 3498149

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3498227	ccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgctaaacatattttgttccaacaa	3498149	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 4948929 - 4949029

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4948929	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	4949028	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	4949029	a	4949029	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Original strand, 1604607 - 1604682

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1604607	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	1604682	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 16317931 - 16318042

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttt-taataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16317931	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaagttcattgtgaaacacatt	16318030	T

Q	403	ttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	16318031	ttgttctaacaa	16318042	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 16267047 - 16267157

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16267047	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttgataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16267146	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16267147	tgttccaacaa	16267157	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19954637 - 19954523

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	19954637	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaatacattt	19954538	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19954537	tgttccaacaatctc	19954523	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20648310 - 20648200

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20648310	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataagattcattgtgaaacacattt	20648211	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20648210	tgttccaacaa	20648200	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 461742 - 461851

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	461742	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaagtgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	461841	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	461842	tgttccaaca	461851	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 3188079 - 3187970

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3188079	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	3187980	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3187979	tgttccaaca	3187970	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 17929285 - 17929394

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17929285	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaatcgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17929384	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17929385	tgttccaaca	17929394	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18752148 - 18752039

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18752148	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	18752049	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18752048	tgttccaaca	18752039	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 20977807 - 20977930

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	20977807	aaatttttgtctatagttctgtacacttaaacaaatattagcgtgtccaattgacaatcttaaatactttgttatcttcaaaactctcaagggttatcat	20977906	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20977907	tgctaaacaaattttgttccaaca	20977930	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30926169 - 30926060

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30926169	tggtcctgtacatttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	30926070	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30926069	tgttccaaca	30926060	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 220 - 351

Target Start/End: Original strand, 3395935 - 3396060

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	3395935	gctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatctcaactttttgtctatggtcctgtacact	3396028	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatt	351	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3396029	tgaacaaatattaacatatccaattgacaatt	3396060	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Original strand, 4987903 - 4987999

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	4987903	ttgaacaattattagcaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacatttgtttccaaca	4987999	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 23088003 - 23088084

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23088003	taaattttagtatatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatattcaattg--aatgtttaatactttgttatcatcaaaa	23088084	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 346 - 413

Target Start/End: Original strand, 3398288 - 3398355

Alignment:

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3398288	acaatttttaataccttgttatgatcaaaattcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	3398355	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 8182531 - 8182420

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8182531	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataaattgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	8182432	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8182431	tgttccaacaat	8182420	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 27 - 105

Target Start/End: Original strand, 40846228 - 40846307

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttc	105	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40846228	tgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc	40846307	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 13306771 - 13306688

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13306771	taaattttagtttgtgatcttgcacgcttgaacaaatattagcatatctaattg--aacttttaatactttgttatcatcaaaact	13306688	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 14835746 - 14835636

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	14835746	tggtcctgtacacttgaacagtcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattatgaaaaacattt	14835647	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14835646	tgttccaacaa	14835636	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17674366 - 17674274

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17674366	ttgaacaaatattagcatatccaattaac-acttttaataccttgttatcattaaaactc-aaagtagtattgtcaaacacattttattccaaca	17674274	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19809989 - 19809906

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19809989	taaatttttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagtatattcaattg--atcttttaataacttgttagcatcaaaact	19809906	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 15560754 - 15560645

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15560754	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaatttataatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	15560655	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15560654	tgttccaaca	15560645	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19943985 - 19943876

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	19943985	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaatacattt	19943886	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19943885	tgttccaaca	19943876	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 290 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 10328162 - 10328078

Alignment:

Q	290	actaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10328162	actaaattttagtctaaggtcctgcatacttgaacaaatattaacgtatccaattg--atcttttgataccttgttatcatcaaaac	10328078	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 15139372 - 15139423

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15139372	gattaaatccattgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatg	15139423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 45833531 - 45833590

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	45833531	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	45833590	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 2940704 - 2940787

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2940704	taaattttagtctacggtcccgcaaacttgaacaaatattagcatgtccaattg--agcttttaatatcttgttatcatcaaaact	2940787	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 37 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 19621032 - 19620958

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19621032	gacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga	19620958	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 41 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 41114738 - 41114668

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	41114738	tgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctcctgatga	41114668	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 53442467 - 53442565

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53442467	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaattattaataccttgttatcatcaaaacttaataaagttcattgtgaaacacattttgttccaaca	53442565	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 37 - 107

Target Start/End: Original strand, 56034714 - 56034784

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56034714	gacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctg	56034784	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 23123568 - 23123641

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23123568	ttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	23123641	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 39 - 107

Target Start/End: Original strand, 23750661 - 23750730

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23750661	cgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	23750730	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 43346104 - 43345995

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43346104	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaattccttgttttcatcataacttaataaggttcattgtgaaacacattt	43346005	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43346004	tgttccaaca	43345995	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 111

Target Start/End: Original strand, 55380419 - 55380504

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55380419	tgcaatgttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctgatga	55380504	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 309 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 8677294 - 8677227

Alignment:

Q	309	tcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8677294	tcttgcacacttgaacatatattaacatattcaattgt---tttttaatactttgttatcatcaaaactct	8677227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 16632585 - 16632636

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16632585	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	16632636	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 329 - 375

Target Start/End: Original strand, 7503920 - 7503966

Alignment:

Q	329	attagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7503920	attagcatatccaattgacaatttttaatacgtcgctatcatcaaaa	7503966	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 42 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 37985578 - 37985541

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37985578	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	37985541	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 39 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 17788023 - 17787951

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	17788023	cgtgattaaatcatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctaatgatcttcaactcctgatga	17787951	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 133 - 193

Target Start/End: Original strand, 40846320 - 40846380

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	40846320	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	40846380	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 55380494 - 55380530

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	55380494	gcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	55380530	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 159 - 193

Target Start/End: Original strand, 3395855 - 3395889

Alignment:

Q	159	cttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3395855	cttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcact	3395889	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Original strand, 10693070 - 10693116

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10693070	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	10693116	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Original strand, 10906836 - 10906882

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10906836	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	10906882	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 45 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 12811141 - 12811107

Alignment:

Q	45	taaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12811141	taaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	12811107	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Original strand, 14571243 - 14571289

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	14571243	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	14571289	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 92

Target Start/End: Original strand, 19666509 - 19666567

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgat	92	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	19666509	ttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgat	19666567	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 9141049 - 9141094

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9141049	ttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtct	9141094	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 12601238 - 12601283

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12601238	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtct	12601283	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 19884839 - 19884911

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19884839	ttagacgagattaaatccat-gaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctg	19884911	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 308 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 21809700 - 21809636

Alignment:

Q	308	gtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21809700	gtcttacacacttaaacatatattagcatatccaattg---ttttttaatattttgttatcatcaaaa	21809636	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 42 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 29680510 - 29680473

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29680510	gattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtct	29680473	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 112 - 157

Target Start/End: Complemental strand, 41114649 - 41114604

Alignment:

Q	112	aaaactgcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatga	157	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	41114649	aaaactgcttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga	41114604	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 297 - 341

Target Start/End: Complemental strand, 3499375 - 3499331

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcca	341	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	3499375	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatcca	3499331	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 6517704 - 6517740

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6517704	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	6517740	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 17398576 - 17398540

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17398576	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	17398540	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 22191057 - 22191093

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22191057	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	22191093	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Complemental strand, 22675494 - 22675454

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22675494	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta	22675454	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 212 - 275

Target Start/End: Original strand, 40846384 - 40846448

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctc-gtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40846384	cttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccataactctcaatttgttctttcagaaccta	40846448	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)

Name: scaffold0081

Description:

Target: scaffold0081; HSP #1

Raw Score: 167; E-Value: 3e-89

Query Start/End: Original strand, 27 - 418

Target Start/End: Original strand, 40772 - 41157

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	40772	tgcaatgctaggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgatgatcttcag------atggaaaactgcttctggt	40865	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	40866	gatgttgcttctaatgaggtgcttctgatgatcttacttctgatgacatcaccacttcaggagcccttgagttcagaaccacttttcttcagatggttca	40965	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaaca	325	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	40966	aacttcctttttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctaagctttaaagagacacttaatttttgtctatggtcttgcaca-atgaaca	41064	T

Q	326	aatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41065	aatattagcatatccaattgacaattttttaataccttgctatcatcaaaactctaaagg-ctaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	41157	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 350 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 56952 - 56887

Alignment:

Q	350	tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56952	tttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaa	56887	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 210)

Name: chr1

Description:

Target: chr1; HSP #1

Raw Score: 159; E-Value: 2e-84

Query Start/End: Original strand, 125 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21191741 - 21191453

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21191741	gtgatattgtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaggacttgacttcaggagcacttttcttcagatgctt	21191642	T

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	21191641	caagcttccttcttgttgattccaatgctctcgtttgttcttccagaacct-tactttaaatagacactaaatttttgtatatggtcctgcacatttgaa	21191543	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21191542	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcctcaaaact-ttaaagggtaatgttagacacattttgttccaacaa	21191453	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2

Raw Score: 145; E-Value: 4e-76

Query Start/End: Original strand, 27 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12613761 - 12613374

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttc------tgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgct	120	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|
T	12613761	tgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttcagctcgtgatgatcttcagcttctgatgaaagaacgct	12613662	T

Q	121	tatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagccct-tccttcatat	219	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|
T	12613661	tttggtgatgttgcttctgatgaggtggttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagaatcactattcttcagat	12613562	T

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctc-gtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacac	318	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	12613561	gcttcaagcttcctttttgttgattccatagctcttagttttttcttccagaacctaca----aaatata---tttaaccttgtatatggtcctacacac	12613469	T

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12613468	ttgaacaaatattagtatatccaattgacaatttttaataccttgttattatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	12613374	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3

Raw Score: 130; E-Value: 4e-67

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18896361 - 18896162

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18896361	cttcagatgcttcatgcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctatgatttaaagagacacaaaatttttgtctatggtcc	18896262	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18896261	tgcacacttaaacaaattttagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagga-taatgttaaacacattttgttccaa	18896164	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4

Raw Score: 119; E-Value: 1e-60

Query Start/End: Original strand, 147 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 16235152 - 16234891

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttcctt-catatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	16235152	gcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgtgtcttcaggagcacttcttttcagatgcttcaagcttcctttttgttgat	16235053	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata-gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16235052	tccattgctctcttttgttcttccagaacct----ttttaatatgaca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaa	16234960	T

Q	343	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16234959	ttgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaa	16234891	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5

Raw Score: 118; E-Value: 6e-60

Query Start/End: Original strand, 146 - 413

Target Start/End: Original strand, 10757645 - 10757906

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10757645	tgcttctgatgaacttgctcctgatgacgtcatcactttaggagcactaaacttcaagagcacttctcttcaaacgcttcaagcttcctt-ttgttgatt	10757743	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	10757744	ccttagctctcttttgttctttcagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacactttaacaaatattagcatattcaatt	10757837	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	10757838	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgtttcaaca	10757906	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 129 - 413

Target Start/End: Original strand, 2268749 - 2269030

Alignment:

Q	129	tgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|
T	2268749	tgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgctaca	2268848	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaaca	325	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2268849	aacttcctttttgatgattcatttgctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctattgtcttgtacacttgaaca	2268942	T

Q	326	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2268943	aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttttaaaggataatgttaaacacattttgttccaaca	2269030	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7

Raw Score: 103; E-Value: 5e-51

Query Start/End: Original strand, 42 - 413

Target Start/End: Original strand, 48704354 - 48704701

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatgat	141	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	48704354	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatcta--gcttctgatga-gatgcttctgat	48704450	T

Q	142	gaggt-gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgt	239	Q
		\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	48704451	gaactagcttctgatgaccttgtttctgatgacgtcatcactt----------------caggagcacttctctttagatgcttcaagcttcatttttgt	48704534	T

Q	240	tgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc	339	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48704535	tgatttcattgctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatc	48704628	T

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48704629	caattga-aaattttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaaca	48704701	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 133 - 414

Target Start/End: Original strand, 35402033 - 35402322

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagct	229	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35402033	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaggtcatcacttcaggagcacttgtgtcttcaggagcgcttctcttcatatgcttcaagct	35402132	T

Q	230	tccttcttgtt-----------gatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacac	318	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	35402133	tcctttttgttttctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccataaccttt---ttaagatgaca---aatttttgtctatggttttgtacac	35402226	T

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35402227	ttgaacaaatattagcatatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaatctctcaaagagtaatgttaaacacattttgttccaacaa	35402322	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23036215 - 23036095

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	23036215	aaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	23036116	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23036115	taaacacattttgttccaaca	23036095	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 199 - 418

Target Start/End: Original strand, 36134467 - 36134681

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|
T	36134467	tcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatt	36134560	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	36134561	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactatcagagggtaatgttaaac	36134660	T

Q	398	acattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36134661	acattttgttccaacaatctc	36134681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 1578126 - 1578335

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	1578126	tcaggagcacttctcttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttctttcagaaccta------ataaagatatcaaatt	1578219	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	1578220	tttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaacgttaaac	1578319	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1578320	acattttgttccaaca	1578335	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 33256050 - 33255930

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	33256050	aaatttttgtctatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaatccttaaagggtaatgt	33255951	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33255950	taaacacattttgttccaaca	33255930	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 33276222 - 33276102

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	33276222	aaatttttgtctatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaatccttaaagggtaatgt	33276123	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33276122	taaacacattttgttccaaca	33276102	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14

Raw Score: 91; E-Value: 7e-44

Query Start/End: Original strand, 224 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 24227749 - 24227597

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24227749	caagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttc-agaacctatgcttttaa-acacactaaatttttgtctatgctcctgcacacttgaa	24227652	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24227651	caaatattaatatatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	24227597	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Original strand, 2835076 - 2835196

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	2835076	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaacattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagggttaatgttaaa	2835175	T

Q	397	cacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2835176	cacattttgatccaacaatct	2835196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 294 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 25448067 - 25447947

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|
T	25448067	aatttttgtctattgtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgtt	25447968	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25447967	aaacatattttgttccaacaa	25447947	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 133 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22600036 - 22599757

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagct	229	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22600036	gcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagct	22599937	T

Q	230	tccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaata	329	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	22599936	tcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccaaaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaataagta	22599843	T

Q	330	ttagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22599842	ttagcatatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaactttcaaagggtaatgttaaacacattttgtttcaacaa	22599757	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 23065332 - 23065454

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23065332	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	23065431	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23065432	acacattttgttccaacaatctc	23065454	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 304 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 26701832 - 26701722

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26701832	tatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattt	26701733	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26701732	tgttccaacaa	26701722	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 35040521 - 35040638

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	35040521	ttttgtctatagtcttttacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttattatcaaaactcttatgggttaatgttaaa	35040620	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35040621	catattttgttccaacaa	35040638	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 44201375 - 44201492

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	44201375	tttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	44201474	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44201475	acacattttgttccaaca	44201492	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 44821240 - 44821119

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	44821240	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaattttagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagtgttattgc	44821141	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44821140	taaacacattttgttccaacaa	44821119	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22201532 - 22201412

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	22201532	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacctttttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	22201433	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22201432	taaacacattttgttccaaca	22201412	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22427056 - 22426936

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	22427056	aaatttttgtcaatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcattaaaactcttaaaggataatgt	22426957	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22426956	taaacatattttgttccaaca	22426936	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 25448227 - 25448111

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	25448227	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatgaacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	25448128	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25448127	cacattttgttccaaca	25448111	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 38282965 - 38283085

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	38282965	aaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	38283064	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	38283065	caaacacattttgttcaaaca	38283085	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 22154167 - 22154376

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|
T	22154167	tcaggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcatttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatt	22154260	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	22154261	tttgtctatggtcatgtacacttgaataaatattagcatatccaattggcaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatttttaac	22154360	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	22154361	acattttgtttcaaca	22154376	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 20255438 - 20255560

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20255438	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	20255537	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20255538	acacattttgttccaacaatctc	20255560	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 199 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20954241 - 20954029

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	20954241	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttctaaaaccta------ataatgattccaaatt	20954148	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|
T	20954147	tttatctatggtcctgtacacttgaacgaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttataatcaaaactc--aaagggtaatcttaaac	20954050	T

Q	398	acattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20954049	acattttgttccaacaatctc	20954029	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 48569908 - 48569781

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	48569908	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaa-tattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattat	48569810	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	48569809	tgctaaacacattttgttccaacaatctc	48569781	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 30572550 - 30572673

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	30572550	aaatttttgtctatagtcttggacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactcttaaggattattat	30572649	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30572650	tgctaaacacattttgttccaaca	30572673	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 292 - 412

Target Start/End: Complemental strand, 1090240 - 1090123

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	1090240	taaatttttgtctatggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac-atttttaataccttgttatcatcaaagctc-aaagga-taatg	1090144	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1090143	ttaaacacattttgttccaac	1090123	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22464484 - 22464365

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	22464484	tttgtctatggtctat-acacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgttaaac	22464386	T

Q	398	acattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22464385	atattttgttccaacaatctc	22464365	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 32785650 - 32785530

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	32785650	aaatttttgtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcatatccaatggacaatttctaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	32785551	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32785550	taaacacattttgttccaaca	32785530	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 5930076 - 5930195

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	5930076	tttgtctacggtcttgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattataaa	5930175	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5930176	acacattttgttccaacaat	5930195	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 293 - 412

Target Start/End: Original strand, 29216165 - 29216284

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	29216165	aaatttttgtctatagtcctgtacatttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	29216264	T

Q	393	taaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29216265	taaacatattttgttccaac	29216284	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Original strand, 30893445 - 30893564

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|
T	30893445	aatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattaacaaatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgtt	30893544	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	30893545	aaacacattttattccaaca	30893564	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 299 - 415

Target Start/End: Original strand, 19038390 - 19038508

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	19038390	ttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaa	19038489	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19038490	cacattttgttccaacaat	19038508	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 19170040 - 19169918

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	19170040	ttttgtctacggtcttgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaa	19169941	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19169940	aacacattttgttccaacaatct	19169918	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 52350402 - 52350284

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	52350402	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	52350303	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52350302	acacattttgttccaacaa	52350284	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 28380392 - 28380509

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	28380392	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	28380491	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28380492	acacattttgttccaaca	28380509	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 12284822 - 12284942

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	12284822	aaatttttgtctatgatcctgtacacttgaaaaaatattagcaaatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcttaaaaggtaatgt	12284921	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12284922	taaacacattttgttccaaca	12284942	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 39200719 - 39200608

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	39200719	ttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccgattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaa-----agggtaaaa	39200625	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39200624	cacattttgttccaaca	39200608	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 20799459 - 20799577

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20799459	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	20799558	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20799559	acacattttgttccaacaa	20799577	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 229 - 377

Target Start/End: Original strand, 9658990 - 9659142

Alignment:

Q	229	ttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaa--atagaca-ctaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaaca	325	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9658990	ttcctttttgtaaattgcattgatctcatgtgttcttccagaacctatacttgaattatagatatttaattttttgtctaaggtcatgcacacttgaaca	9659089	T

Q	326	aatattagcatatccaattgaca-atttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9659090	aatattagcatatccaattgacatatttttaataccttgttatcatcaaaact	9659142	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21204624 - 21204505

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	21204624	ttttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgcc	21204525	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21204524	aaacaaattttgttccaaca	21204505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 1900715 - 1900835

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	1900715	aaatttttgtctatggtcctgtacatttgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttttcatcaaaactctcaaagggtaatgt	1900814	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1900815	caaacacattttgttccaaca	1900835	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 300 - 413

Target Start/End: Original strand, 675967 - 676082

Alignment:

Q	300	tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	675967	tgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaac	676066	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	676067	acattttgttccaaca	676082	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 7744762 - 7744640

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	7744762	ttttgtttagggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgataatttttaatactttgttatcatcaaaactcttagggtttattgttaa	7744663	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7744662	tcacattttgttccaacaatctc	7744640	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Original strand, 17371471 - 17371565

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17371471	ttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactattaaggtttattgtaaaacacattttgttccaaca	17371565	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 20909814 - 20909936

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	20909814	aaatttttgtctatggttctgcacagttgaacaaatattagcatatccaatt-aatatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgt	20909910	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20909911	taaacacattttgttccaacaatctc	20909936	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21134859 - 21134735

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	21134859	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattaacgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgct	21134760	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21134759	aaataaattttgttccaacaatctc	21134735	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 22643295 - 22643417

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatca-tcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22643295	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcattaaaaattattaaggtttattgtaaa	22643394	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22643395	acatattttgttccaacaatctc	22643417	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 23025145 - 23025269

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	23025145	aaatttttgtctatagtcctgtacacttaaacaaatattagcgtgtccaaatgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	23025244	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23025245	tgctaaacacattttgttccaacaa	23025269	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14387812 - 14387695

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	14387812	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	14387713	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14387712	acacattttgttccaaca	14387695	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 23927422 - 23927539

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23927422	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	23927521	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23927522	acacattttgttccaaca	23927539	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 46180582 - 46180465

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	46180582	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaa	46180483	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46180482	acacattttgttccaaca	46180465	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11194749 - 11194637

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	11194749	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	11194650	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11194649	ttttgttccaaca	11194637	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 10251389 - 10251490

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10251389	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttcttatcatcaaatctcttaagggttattattgctaaacacattttgttccaa	10251488	T

Q	412	ca	413	Q
		\|\|
T	10251489	ca	10251490	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 242 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18129786 - 18129615

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18129786	atttcattgctctcatttgttctttcagaaccaatacttgaattaaagacttataaattttagtctatggtcctgcacacttaaacaaatattagcatat	18129687	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18129686	ctaattgaca--ttttaataccttattatcatcaaa--gcttaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	18129615	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 293 - 376

Target Start/End: Original strand, 19717887 - 19717970

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19717887	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaattccttgttatcatcaaaac	19717970	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 297 - 388

Target Start/End: Original strand, 46089367 - 46089458

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46089367	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactcttaaggatta	46089458	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18310658 - 18310540

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18310658	tttgtctatggttctgtacacttgaataaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	18310559	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	18310558	acacattttgttcaaacaa	18310540	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 225 - 414

Target Start/End: Original strand, 18615234 - 18615416

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18615234	aagcttcctttttgtagattccactgctctcatttgttcttcc------tatgctttaattaaagacactaaatttttgtccatggtcctacacacttga	18615327	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18615328	acaaatattagcatatctaattgac-atttttaatacattgttatcatcaaaactc--aaagggtaataataaacacattttgttccaacaa	18615416	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 293 - 410

Target Start/End: Original strand, 21703214 - 21703334

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	21703214	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatataagcatatccaattgacaatttttaatactttcctatcatcaaaactcttagggatcattat	21703313	T

Q	390	tgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21703314	tgctaaacacattttgttcca	21703334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 22019734 - 22019851

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagc-atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22019734	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	22019832	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22019833	acatattttgttccaacaa	22019851	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22609680 - 22609562

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22609680	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	22609581	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22609580	acatattttgttccaacaa	22609562	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 296 - 381

Target Start/End: Complemental strand, 2327102 - 2327017

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctta	381	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2327102	tttttgtctatagtcctagacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctta	2327017	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 304 - 415

Target Start/End: Original strand, 12947243 - 12947356

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	12947243	tatggtcttgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacat	12947342	T

Q	402	tttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12947343	tttgttccaacaat	12947356	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 227 - 413

Target Start/End: Original strand, 16870278 - 16870455

Alignment:

Q	227	gcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16870278	gcttccttgttgtaaatttcattgctctcatttgttctttcagaacctatacttgaatta-----taa---tttgactatggttctgcacacttgaacaa	16870369	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16870370	atattaacatatccaattgac-atttttaatatcttgttatcatcaaaact-taaaggtaataatggtaaacacattttgttccaaca	16870455	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 28474617 - 28474734

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	28474617	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaac	28474716	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28474717	acacattttgttccaaca	28474734	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 292 - 371

Target Start/End: Complemental strand, 16478465 - 16478388

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatc	371	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16478465	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatc	16478388	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 377

Target Start/End: Original strand, 22655877 - 22655957

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22655877	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	22655957	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 47195788 - 47195899

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47195788	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	47195887	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47195888	tgttccaacaat	47195899	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 153985 - 153871

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	153985	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	153886	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	153885	tgttccaacaatctc	153871	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 19215983 - 19216111

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	19215983	aaatttttgtctttagtcctgtacacttaaacaaatattagcgtgtccaattgaaaatcttaaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	19216082	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	19216083	tgttaaacacattttgttccaacactctc	19216111	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Original strand, 7679752 - 7679857

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7679752	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	7679851	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	7679852	aatctc	7679857	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 305 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20866989 - 20866877

Alignment:

Q	305	atggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaattttt--aataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	20866989	atggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacaca	20866890	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20866889	ttttgttccaaca	20866877	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20883567 - 20883443

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagc-atatccaattgacaattttt--aataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	20883567	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaattttttcaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgta	20883468	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	20883467	aaacacattttattccagcaatctc	20883443	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 26547938 - 26547821

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	26547938	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaaattttaatatcttgttaccatcaaaacttattaaggtttaatgtaaa	26547839	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26547838	acatattttgttccaaca	26547821	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 5974275 - 5974383

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5974275	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattattaaggttcattgtaaaacacatttt	5974374	T

Q	405	gttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5974375	gttccaaca	5974383	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 7310187 - 7310303

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct-taaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	7310187	tttgtatatggtcttgtacccttgaacaaatattagctagtccaattgataatttttaatatcttgttatcattaaaactctcaaaggtttattgttaaa	7310286	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7310287	cacattttgttccaaca	7310303	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 146 - 289

Target Start/End: Complemental strand, 17024822 - 17024678

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17024822	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcagaagcacttaactttagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatt	17024723	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagac	289	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	17024722	ccattgatctcatttgttcttccagaacctatacttcaaagagac	17024678	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 224 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 20109736 - 20109579

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaa--atagacactaaa--tttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|
T	20109736	caagcttcctttttgtagattccattgttctcatttgttcttccagaacctatgcttaatttatagatacttaaattttttgtttatggtactgcacatt	20109637	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20109636	tgaacaaatattagcatatccactagac-atttttaatatcttgttatcatcaaaactc	20109579	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 45070321 - 45070209

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	45070321	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaaacaca	45070222	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	45070221	ttttattccaaca	45070209	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 294 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 28492132 - 28492013

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|
T	28492132	aatttttgtctatgatcgtgtacacttgaacaaatattaacatatccaattgacaa-ttttaatatcttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgtt	28492034	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatc	416	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	28492033	aa--acattttgttcgaacaatc	28492013	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 9050170 - 9050056

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	9050170	ctatggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatatttaaaaccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacaca	9050071	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9050070	ttttgttccaacaat	9050056	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 24253038 - 24253136

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24253038	acttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	24253136	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 39587479 - 39587589

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39587479	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	39587578	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39587579	tgttccaacaa	39587589	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Original strand, 42285007 - 42285127

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	42285007	tttttttctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactctcaagggttattattgc	42285106	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	42285107	taaacaaattttattccaaca	42285127	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20441013 - 20440904

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20441013	tggtcctgtacacttgaacaattataagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	20440914	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20440913	tgttccaaca	20440904	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 322 - 390

Target Start/End: Complemental strand, 34255178 - 34255110

Alignment:

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34255178	aacaaatattagtgtgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt	34255110	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 23359064 - 23358953

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23359064	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	23358965	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23358964	tgttccaacaat	23358953	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Original strand, 37642629 - 37642750

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|
T	37642629	ttttgtctatagtcctgtacaattgaacaaatattagcgtatccaatttacaattttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttaatattgc	37642728	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37642729	taaacacattttgttccaacaa	37642750	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 147910 - 147800

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	147910	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattagggttcattgtgaaacacattt	147811	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	147810	tgttccaacaa	147800	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4167753 - 4167867

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4167753	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4167852	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4167853	tgttccaacaatctc	4167867	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 5833747 - 5833861

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5833747	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5833846	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5833847	tgttccaacaatctc	5833861	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 7507831 - 7507945

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7507831	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	7507930	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7507931	tgttccaacaatctc	7507945	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12623494 - 12623380

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12623494	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12623395	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12623394	tgttccaacaatctc	12623380	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18381616 - 18381506

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18381616	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattagggtttattgtgaaacacattt	18381517	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18381516	tgttccaacaa	18381506	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 19179454 - 19179568

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19179454	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19179553	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19179554	tgttccaacaatctc	19179568	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 35400842 - 35400728

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35400842	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35400743	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35400742	tgttccaacaatctc	35400728	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 35648368 - 35648254

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35648368	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35648269	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35648268	tgttccaacaatctc	35648254	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 36246689 - 36246575

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36246689	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36246590	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36246589	tgttccaacaatctc	36246575	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 38095571 - 38095685

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38095571	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	38095670	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38095671	tgttccaacaatctc	38095685	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 39193790 - 39193680

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39193790	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtccattgtgaaacacattt	39193691	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39193690	tgttccaacaa	39193680	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 47618217 - 47618103

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47618217	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	47618118	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47618117	tgttccaacaatctc	47618103	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4250278 - 4250169

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4250278	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttattaaggttaattgtgaaacacattt	4250179	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4250178	tgttccaaca	4250169	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 319 - 414

Target Start/End: Original strand, 21544425 - 21544524

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21544425	ttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttcaatactttgttatcttcaaaacttttaagggttattattgctaaacacattttgttccaacaa	21544524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 51628882 - 51628773

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51628882	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	51628783	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51628782	tgttccaaca	51628773	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 17957758 - 17957870

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|
T	17957758	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacgatttttaatacattgttatcatcaaaactcattaaggtttattatgaaacaca	17957857	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17957858	tattgttccaaca	17957870	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19735875 - 19735767

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19735875	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaaaaggttcattgtgaaacacatttt	19735776	T

Q	405	gttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19735775	gttccaaca	19735767	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 5844332 - 5844443

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5844332	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5844431	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5844432	tgttccaacaat	5844443	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18516891 - 18516768

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|
T	18516891	taaatttttgtctatgatcatgtacacttgaacaaattttagcaattccaattgaca--ttttaatactttgttatcatcaaaagt-taaagtggtaatg	18516795	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18516794	ttaaactcattttgttccaacaatctc	18516768	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 297 - 384

Target Start/End: Complemental strand, 21120763 - 21120676

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21120763	ttttgtctataatcctgtacactagaacaaatattagtgtatgcaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagg	21120676	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 301 - 414

Target Start/End: Original strand, 33085050 - 33085165

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	33085050	gtctttggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttaattgtgaaaca	33085149	T

Q	399	cattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33085150	cattttgttccaacaa	33085165	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 2539029 - 2539139

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2539029	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	2539128	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2539129	tgttccaacaa	2539139	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 3172117 - 3172231

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3172117	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	3172216	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3172217	tgttccaacaatctc	3172231	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 11736926 - 11737036

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11736926	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11737025	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11737026	tgttccaacaa	11737036	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 12614029 - 12613919

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12614029	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12613930	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12613929	tgttccaacaa	12613919	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 12731041 - 12731155

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12731041	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12731140	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12731141	tgttccaacaatctc	12731155	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 12741634 - 12741748

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12741634	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12741733	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12741734	tgttccaacaatctc	12741748	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 12897696 - 12897586

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12897696	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12897597	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12897596	tgttccaacaa	12897586	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 21864155 - 21864269

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21864155	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	21864254	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21864255	tgtttcaacaatctc	21864269	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23580056 - 23579946

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23580056	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaaaaaggttcattgtgaaacacattt	23579957	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23579956	tgttccaacaa	23579946	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 340 - 413

Target Start/End: Original strand, 26577164 - 26577238

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26577164	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaaca	26577238	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 35404069 - 35403959

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35404069	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35403970	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35403969	tgttccaacaa	35403959	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 35637716 - 35637606

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35637716	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35637617	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35637616	tgttccaacaa	35637606	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 38106196 - 38106306

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38106196	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	38106295	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38106296	tgttccaacaa	38106306	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 47607609 - 47607499

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47607609	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	47607510	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47607509	tgttccaacaa	47607499	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 5242157 - 5242266

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5242157	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5242256	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5242257	tgttccaaca	5242266	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5639423 - 5639314

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5639423	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5639324	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5639323	tgttccaaca	5639314	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 7518428 - 7518537

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7518428	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	7518527	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7518528	tgttccaaca	7518537	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 9134686 - 9134795

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9134686	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttaattgtgaaacacattt	9134785	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9134786	tgttccaaca	9134795	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10997497 - 10997388

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10997497	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	10997398	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10997397	tgttccaaca	10997388	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 11976417 - 11976526

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11976417	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11976516	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11976517	tgttccaaca	11976526	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13664935 - 13664826

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13664935	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13664836	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13664835	tgttccaaca	13664826	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 333 - 406

Target Start/End: Complemental strand, 17024674 - 17024602

Alignment:

Q	333	gcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgt	406	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17024674	gcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactgtaaagg-gtaatgttaaacacattttgt	17024602	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 19188314 - 19188423

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19188314	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	19188413	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19188414	tgttccaaca	19188423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 21165341 - 21165454

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|
T	21165341	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattatgaaacac	21165440	T

Q	400	attttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21165441	attttgttccaaca	21165454	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 21895713 - 21895822

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21895713	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	21895812	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21895813	tgttccaaca	21895822	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 25057044 - 25057153

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25057044	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	25057143	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25057144	tgttccaaca	25057153	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 339 - 415

Target Start/End: Original strand, 35013449 - 35013526

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35013449	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaat	35013526	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 36117675 - 36117784

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36117675	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36117774	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36117775	tgttccaaca	36117784	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36236142 - 36236033

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36236142	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36236043	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36236042	tgttccaaca	36236033	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36536793 - 36536684

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36536793	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36536694	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36536693	tgttccaaca	36536684	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 46686577 - 46686468

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46686577	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	46686478	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	46686477	tgttccaaca	46686468	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 21984977 - 21985078

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21984977	acacttgaagaaatattattgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcataactcttaagggttattattgctaatcaaattttgttccaa	21985076	T

Q	412	ca	413	Q
		\|\|
T	21985077	ca	21985078	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 31359642 - 31359724

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31359642	taaattatagtctatggtcctgcacacgtgaacaaatattaacatattcaattga-actttttaataccttgttatcatcaaaa	31359724	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 51656142 - 51656027

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51656142	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacatt	51656043	T

Q	403	ttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51656042	ttgttccaacaatctc	51656027	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 3182719 - 3182829

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3182719	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattt	3182818	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3182819	tgttccaacaa	3182829	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 4178392 - 4178501

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4178392	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttctcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4178491	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4178492	tgttccaaca	4178501	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 326 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4249610 - 4249521

Alignment:

Q	326	aatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4249610	aatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttattaaggttaattgtgaaacacattttgttccaaca	4249521	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 326 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4249934 - 4249845

Alignment:

Q	326	aatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4249934	aatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaacttattaaggttaattgtgaaacacattttgttccaaca	4249845	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 247 - 414

Target Start/End: Original strand, 23054662 - 23054830

Alignment:

Q	247	attgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaa--tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23054662	attgttctcatttgttcttccagaccctatgcttgaattaaagacacttaaattttttgtctatggtcctgcacactaaaacaaatattagcatatccaa	23054761	T

Q	343	ttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23054762	ttggcaa-ttataata-catgttatcatcaaaact-aaaagtggtattgtcaaacacattttgttccaacaa	23054830	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 5649980 - 5649908

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5649980	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	5649908	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 17024910 - 17024830

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17024910	tgcaatgttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctg	17024830	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 294 - 377

Target Start/End: Original strand, 21617034 - 21617115

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21617034	aatttttatctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatattcaattg--atcttttaatactttgttattatcaaaact	21617115	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 338 - 413

Target Start/End: Original strand, 17400965 - 17401040

Alignment:

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17400965	tccaattgacaatttttaataccttggtatcatcaaaactctcaaagggtaatggtaaacatattttgttccaaca	17401040	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 25399716 - 25399800

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25399716	taaattttagtctatgatcatgtacacttgaacaagtattagcatatccaattg--aactcttaatactttgttatcatcaaaactc	25399800	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 293 - 412

Target Start/End: Complemental strand, 21682930 - 21682811

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaat-ttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	21682930	aaattttagtctatggtcctacacactttaacaaatattagcatatccaattgactttataataatactttgttatcatcaaaa--cttaaggtgacaat	21682833	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21682832	gttaaacacattttgttccaac	21682811	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 22153999 - 22154072

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22153999	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	22154072	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30291806 - 30291697

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa-ctcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30291806	tggtcctgtacacttgaacaattattaataataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaatttaataaggttcattgtgaaacacattt	30291707	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30291706	tgttccaaca	30291697	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 20954411 - 20954352

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	20954411	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	20954352	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 38282708 - 38282767

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	38282708	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	38282767	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 9347616 - 9347728

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	9347616	ctatggtcctgcacacttgaacaattattaacaataccaattgaca--ttttagtaccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacatat	9347711	T

Q	402	tttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9347712	tttgttacaacaatctc	9347728	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 111

Target Start/End: Original strand, 10757563 - 10757641

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	10757563	ttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttgatga	10757641	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 37 - 107

Target Start/End: Original strand, 12284568 - 12284638

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12284568	gacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctg	12284638	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19063507 - 19063397

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19063507	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgattatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataagtttcattgtgaaacacattt	19063408	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19063407	tgttccaacaa	19063397	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 118 - 183

Target Start/End: Original strand, 19717733 - 19717798

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19717733	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcactt	19717798	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Original strand, 21878261 - 21878334

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgac-aatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21878261	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgactaatttttaataccttgttatcatcaaaact	21878334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 33256289 - 33256244

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33256289	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	33256244	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 33276461 - 33276416

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33276461	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	33276416	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 149 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 26701981 - 26701853

Alignment:

Q	149	ttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagc-ccttccttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttca	247	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	26701981	ttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcacttgacttcaggagcacttttcttcatacgcttcaagcttcccttatgttgattcca	26701882	T

Q	248	ttgctc-tcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26701881	tagctcttaatttgttcttccagaaccta	26701853	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 1900487 - 1900546

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	1900487	ttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	1900546	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 312 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 2819038 - 2818974

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2819038	tgcacacttgaacaaatattaacatatccaattg--gacttttaatattttgttatcatcaaaactc	2818974	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 10154471 - 10154552

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10154471	taaattgtagtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcaaatccaattg--atcttttaatac--tgttatcatcaaaact	10154552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 241

Target Start/End: Original strand, 21029019 - 21029114

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagc-ccttccttcatatgcttcaagcttccttcttgttg	241	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21029019	gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttgaggagcacttttcttcatatgctttaagcttcctttttgttg	21029114	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 23036465 - 23036406

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23036465	ttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg	23036406	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 28492342 - 28492283

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	28492342	ttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	28492283	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 118 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 33256222 - 33256147

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	33256222	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcact	33256147	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 118 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 33276394 - 33276319

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	33276394	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcact	33276319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 225 - 275

Target Start/End: Original strand, 1900653 - 1900703

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1900653	aagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta	1900703	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 37 - 79

Target Start/End: Original strand, 19717669 - 19717711

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19717669	gacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	19717711	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 2268670 - 2268715

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	2268670	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtct	2268715	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 294 - 378

Target Start/End: Original strand, 18209488 - 18209570

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18209488	aatttttgtttatggtcctgcacacttgaataaatagtagcatatctagttg--atcttttaatactttgttatcattaaaactc	18209570	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Original strand, 2267231 - 2267271

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2267231	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta	2267271	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 212 - 268

Target Start/End: Original strand, 2267363 - 2267419

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttcca	268	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2267363	cttcatatgctttaagcttcctttttgttgatttctttactctctattgttcttcca	2267419	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 75

Target Start/End: Complemental strand, 21191811 - 21191763

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa	75	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21191811	tgcaatgttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa	21191763	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 25448390 - 25448354

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25448390	gcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	25448354	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 22600112 - 22600061

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22600112	gattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	22600061	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 77

Target Start/End: Original strand, 29215939 - 29215982

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt	77	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29215939	ttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagt	29215982	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 155 - 244

Target Start/End: Original strand, 30893310 - 30893401

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac-taaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30893310	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagtttcctctttgttgatt	30893401	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 35401959 - 35402010

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35401959	gattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg	35402010	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 36134339 - 36134390

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36134339	gattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatcttctgatg	36134390	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 46089218 - 46089265

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	46089218	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	46089265	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 92

Target Start/End: Original strand, 1578009 - 1578067

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgat	92	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	1578009	ttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgat	1578067	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 28492258 - 28492212

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	28492258	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttgaggagcact	28492212	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 297 - 338

Target Start/End: Original strand, 2267441 - 2267482

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2267441	ttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatat	2267482	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 353 - 413

Target Start/End: Original strand, 16672653 - 16672714

Alignment:

Q	353	ttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16672653	ttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	16672714	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 199 - 275

Target Start/End: Original strand, 19717798 - 19717875

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19717798	tcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttattgattcctttgccctcttttgttcttccagaaccta	19717875	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 42 - 107

Target Start/End: Original strand, 21028943 - 21029008

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21028943	gattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatattctaatgatattcagcttctg	21029008	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 140 - 193

Target Start/End: Original strand, 22154090 - 22154143

Alignment:

Q	140	atgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	22154090	atgagatgcttctaaggaacttgcttctaatgacgtcatcactttaggaacact	22154143	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 329

Target Start/End: Complemental strand, 26279778 - 26279741

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaata	329	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26279778	taaatttttgtctatggtcctgcatacttgaacaaata	26279741	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 32785875 - 32785831

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32785875	ttagacgagattaaatccat-gaacaacctttgaagctttaagtct	32785831	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 292 - 344

Target Start/End: Original strand, 12398121 - 12398173

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	12398121	taaattttaatctatagtcatgcacacttgaacatatattagcatattcaatt	12398173	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 133 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 20954327 - 20954267

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	20954327	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatgacgtcatcacttcaggagcact	20954267	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 21984811 - 21984847

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21984811	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	21984847	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 133 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 23036383 - 23036323

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	23036383	gcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcact	23036323	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 42284842 - 42284878

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42284842	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	42284878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 9)

Name: scaffold0004

Description:

Target: scaffold0004; HSP #1

Raw Score: 149; E-Value: 2e-78

Query Start/End: Original strand, 112 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 244158 - 243864

Alignment:

Q	112	aaaactgcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc	211	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|
T	244158	aaaactgcttctggtgatgttgcttctgatgaggtacttttgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcacttgacttcagaacctcttt	244059	T

Q	212	-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtc	310	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	244058	tcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctaatttgttcttccagaacctatgcttcaaagagacactaaatttttgtctatggtc	243959	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	243958	ctgcacac-------aatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttcca	243867	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 133 - 415

Target Start/End: Original strand, 220464 - 220739

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	220464	gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcacttgacttcaggagcacttttcttcagacgcttcaaggttc	220563	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	220564	ctttttgttgattccatagctctcaatttgttctttcagaacctaca-----aatatact-taacctt--gtatatggtcctacacacttaaacaaatac	220655	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	220656	tagcatatccaattgacaatttt-aataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttcgaacaat	220739	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 294 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 30599 - 30475

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|
T	30599	aatttttgtctgtagtcatgtacacttgaacaaatattagtatatccaattgaatatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgtt	30500	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30499	aaacacattttgttccaacaatctc	30475	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 225 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 377366 - 377183

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	377366	aagcttccttttagttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatagtcatgtatacttgaac	377273	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	377272	aaaaattagcatatccaattgacaattttttaatatcttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	377183	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 293 - 384

Target Start/End: Original strand, 211786 - 211878

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	211786	aaatttttgtctatagtcatgtacactagaacaaatattagtatatccaattgacaattttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagg	211878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 220380 - 220453

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	220380	ttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatgaacttcagcttctg	220453	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 133 - 194

Target Start/End: Complemental strand, 377443 - 377382

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta	194	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	377443	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacta	377382	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 39 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 244248 - 244177

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	244248	cgtgattaaatcttttgaacagcctttgaaacttcaattctctcatcttct-atgatcttcagctcctgatga	244177	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 225 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 30661 - 30611

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30661	aagcttccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta	30611	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 4)

Name: scaffold0120

Description:

Target: scaffold0120; HSP #1

Raw Score: 140; E-Value: 4e-73

Query Start/End: Original strand, 132 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 36660 - 36379

Alignment:

Q	132	tgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36660	tgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactatactttaggatcacttctcttcagatgcttcaagctt	36561	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36560	ccttttatttgattccattgctctcttttgttcttccataacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	36467	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36466	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	36379	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2

Raw Score: 140; E-Value: 4e-73

Query Start/End: Original strand, 132 - 418

Target Start/End: Original strand, 42345 - 42626

Alignment:

Q	132	tgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42345	tgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactatactttaggatcacttctcttcagatgcttcaagctt	42444	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42445	ccttttatttgattccattgctctcttttgttcttccataacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	42538	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42539	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	42626	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 36743 - 36671

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36743	ttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttct	36671	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Original strand, 42262 - 42334

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42262	ttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttct	42334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 5)

Name: scaffold0047

Description:

Target: scaffold0047; HSP #1

Raw Score: 137; E-Value: 3e-71

Query Start/End: Original strand, 213 - 413

Target Start/End: Original strand, 10177 - 10376

Alignment:

Q	213	ttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtctt	312	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	10177	ttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattcaattgctctcattcgttcttccagaatctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcct	10276	T

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10277	gcacacatgaacaaatattagcatatcaaattgacaatttttaataccttgttatcatccaaactctaaaag-gtaatgttaaacacattttgttccaac	10375	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 199 - 379

Target Start/End: Original strand, 30514 - 30689

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	30514	tcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccaggtccta------ataatgattccaaatt	30607	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30608	tttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	30689	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Original strand, 10038 - 10118

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10038	tgcaatgctagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatcttctgatgaacttcagcttctg	10118	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40162 - 40053

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40162	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40063	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40062	tgttccaaca	40053	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #5

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 32580 - 32470

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	32580	tggtcctgtacacttgaacagtcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattatgaaaaacattt	32481	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32480	tgttccaacaa	32470	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)

Name: scaffold0334

Description:

Target: scaffold0334; HSP #1

Raw Score: 131; E-Value: 1e-67

Query Start/End: Original strand, 118 - 418

Target Start/End: Original strand, 10005 - 10301

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttc	215	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	10005	gcttctggtgatcttgcttatgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcagaagcatttctcttc	10104	T

Q	216	atatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgca	315	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	10105	agatgcttcaagcttcctttttgttgattccattcctctcttttgttctttcagaacctat----tgaa--gatatcaaatttttgtctatggtcatgta	10198	T

Q	316	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10199	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaagaccttgttatcatcaaaactctcaatgggtaatgttaaacacattttgttccaacaat	10298	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 339 - 373

Target Start/End: Complemental strand, 19469 - 19435

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaa	373	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19469	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaa	19435	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 211)

Name: chr2

Description:

Target: chr2; HSP #1

Raw Score: 130; E-Value: 4e-67

Query Start/End: Original strand, 199 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 41121566 - 41121350

Alignment:

Q	199	tcaggagc-ccttccttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41121566	tcaggagcacctttcttcagatgcttcaagcttccttcttgtttattccattgctttcatttgttcttcgagaacttatactttaaaaagacactaaatt	41121467	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	41121466	tttggttgtggtcctacacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaac	41121368	T

Q	398	acattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41121367	acattttattccaacaat	41121350	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2

Raw Score: 127; E-Value: 2e-65

Query Start/End: Original strand, 27 - 415

Target Start/End: Original strand, 22272262 - 22272632

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	22272262	tgcaatgatagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctg-----------------gt	22272344	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttca	225	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22272345	gatgttgcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaggagtatttgacttcagaaactcttttcttcagttgcttca	22272444	T

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaat-agacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22272445	accttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctatgctttaaaagagacactaaatttt-gt-tatggttctgcacacttgaac	22272542	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22272543	aaatattaacatatctaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaatacattttgttccaacaat	22272632	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3

Raw Score: 122; E-Value: 2e-62

Query Start/End: Original strand, 138 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21537122 - 21536852

Alignment:

Q	138	tgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttct	236	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|
T	21537122	tgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactagacttcaggagcacttctcttcagatattttaagtttcctttt	21537023	T

Q	237	tgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcat	336	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21537022	tgttgatttcatagctctcttttgttcttccaaaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcat	21536929	T

Q	337	atccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21536928	atccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatgttgttccaaca	21536852	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4

Raw Score: 121; E-Value: 9e-62

Query Start/End: Original strand, 212 - 401

Target Start/End: Original strand, 44881450 - 44881639

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaataga--cactaaatttttgtctatggt	309	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44881450	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttcttccagaacctatgccttaaaaagagacactaaatttt-gtctatggt	44881548	T

Q	310	cttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44881549	cctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaatacattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacat	44881639	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5

Raw Score: 115; E-Value: 3e-58

Query Start/End: Original strand, 220 - 413

Target Start/End: Original strand, 19115434 - 19115625

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|
T	19115434	gcttcaagcttccttcctgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacctatggtttaaagagacactaaatttgtgtctatggccctgcatact	19115533	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19115534	tgaacaaatattagcatatcaaattgataatttttaatactttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	19115625	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6

Raw Score: 112; E-Value: 2e-56

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 24850544 - 24850264

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24850544	gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcattacttcaggagcacttgacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttc	24850445	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24850444	ctttttgttgattccttagctctcttttgttcttcgagaaccta------ataaagatatcaattttttttatatggtcctgcacacttgaacaaatatt	24850351	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24850350	agcatatccaattgacaacttttaataccttgttataatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttctaacaatctc	24850264	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7

Raw Score: 110; E-Value: 3e-55

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18430737 - 18430536

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact--aaatttttgtctatggt	309	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18430737	cttcatacgcttcaagcttccttcttgttgattatattgctctcatttgttcttccagaacctatactcaattaagacactgaaattttttgtctatggt	18430638	T

Q	310	cttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	18430637	ccagtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcaaaag--ttaatgttaaacacattttattcc	18430540	T

Q	410	aaca	413	Q
		\|\|\|\|
T	18430539	aaca	18430536	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 220 - 415

Target Start/End: Original strand, 18703082 - 18703275

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18703082	gcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctaacttgttcttgtagaacctatgctttaaagagacactaaatgtttgtctatggttctgcacaca	18703181	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18703182	tgaataaatattagcacatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgtttcaacaat	18703275	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 199 - 414

Target Start/End: Original strand, 38781668 - 38781878

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	38781668	tcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcaattgctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgaca---aatt	38781761	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	38781762	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccagttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttttaaaggataatgttaaac	38781861	T

Q	398	acattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38781862	acattttgttccaacaa	38781878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10

Raw Score: 108; E-Value: 5e-54

Query Start/End: Original strand, 221 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 26618896 - 26618705

Alignment:

Q	221	cttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaat-agacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	26618896	cttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagatc-tatgctttaaaagagacactaaatttttgtctatggtcctgcacact	26618798	T

Q	320	tgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26618797	tgaacaaatattagcatatcccagttgacaatttttaatatcttgttattatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	26618705	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11

Raw Score: 105; E-Value: 3e-52

Query Start/End: Original strand, 132 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9015251 - 9014971

Alignment:

Q	132	tgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagct	229	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9015251	tgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcacttttacttcaagagcacttctcttcagatgcttcaagct	9015152	T

Q	230	tccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtcta---tggtcttgcacacttgaacaa	326	Q
		\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9015151	tccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaa---gatttcaaatttttgtctactatggtcatgtacacttgaacaa	9015058	T

Q	327	atattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9015057	atattaacatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaaagttaaacacattttgttccaaca	9014971	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12

Raw Score: 105; E-Value: 3e-52

Query Start/End: Original strand, 155 - 414

Target Start/End: Original strand, 25829346 - 25829602

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgc	251	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	25829346	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgc	25829445	T

Q	252	tctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatt	351	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25829446	tctcttttgttcttccagaaccta------atagtgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatt	25829539	T

Q	352	tttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25829540	tttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	25829602	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13

Raw Score: 101; E-Value: 8e-50

Query Start/End: Original strand, 44 - 419

Target Start/End: Original strand, 24576183 - 24576551

Alignment:

Q	44	ttaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatgatga	143	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	24576183	ttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcctaatgaactttagcttctggtgatct--tgcttatgatgatat-gcttctgatga	24576279	T

Q	144	ggt-gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgtt	240	Q
		\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	24576280	actagcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttcatgaacacttatcttcatatgtttcaagcttcctttttgtt	24576379	T

Q	241	gatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcc	340	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24576380	gattccattgctccctttttttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatcc	24576473	T

Q	341	aattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	24576474	aattgacaatttttaat-ccttgttatcatcaaaactctcaaaaggtaatgttaaacatattttgttccaacattctct	24576551	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14

Raw Score: 100; E-Value: 3e-49

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22454869 - 22454588

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22454869	gcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctgacgacgttatcacttcaagagcactagacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttc	22454770	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcg-tttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22454769	ctttttgttgatttcatagctcttaatttgttcttccagaacctacg-----aaaaaatgcttaacctt-gtatatggtcctgcacacttgattaaatat	22454676	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22454675	tagcatatccgattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	22454588	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 133 - 412

Target Start/End: Original strand, 30667210 - 30667485

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30667210	gcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgggagcacttctcttcagatgcttcaagctt	30667309	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	30667310	cctttttgttgattcaattgctctctattgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctaaagtcctgtacacttgaacaattat	30667403	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30667404	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgtaatcatcaaaactctaaaagggtaatgttaagaacattttgttccaac	30667485	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 28711432 - 28711311

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	28711432	ttttgtctatagtctagtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	28711333	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28711332	cacattttgttccaacaatctc	28711311	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17

Raw Score: 98; E-Value: 5e-48

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 40782675 - 40782968

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta--aacatcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	40782675	gcttctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactttcaggagcacttctctt	40782774	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc-tcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttg	313	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	40782775	cagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagcccctaatttgctctttcagaaccta------ataatgatatcaaatttttgtctatggtcatg	40782868	T

Q	314	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40782869	tacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	40782968	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18

Raw Score: 96; E-Value: 7e-47

Query Start/End: Original strand, 296 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 34321622 - 34321503

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	34321622	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattgttaa	34321523	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34321522	acacattttgttccaacaat	34321503	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 161 - 413

Target Start/End: Original strand, 19540648 - 19540895

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	19540648	tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactagacttcaggaacacttttcttcagacgctttaagctttctttttgttgattccttagctctctttt	19540747	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19540748	gttcttccaaaacctaa----taaatatatc--aaatttttgtctatggttctgtacacttgagcaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	19540841	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19540842	cttgttatcctcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaaca	19540895	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 417

Target Start/End: Original strand, 22317989 - 22318113

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|
T	22317989	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaattt	22318088	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22318089	taaacacattttgttccaacaatct	22318113	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 38631242 - 38631451

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	38631242	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcatttttgttgatttctttgctctcttttgtttttccagaaccta------ataatgatttcaaatt	38631335	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	38631336	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattaacttatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaac	38631435	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38631436	acattttgttccaaca	38631451	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 293 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 31967772 - 31967647

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	31967772	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	31967673	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31967672	tgttaaacacattttgttccaacaat	31967647	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 199 - 418

Target Start/End: Original strand, 24377358 - 24377571

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|
T	24377358	tcaggagcacttctcttcagatgcttctagcttcctttttgttgattctattgctctcttttgttcttct-gaaccta------ataaagatatcaaatt	24377450	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24377451	tttgtctatggttttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgtcatcatcaaaacattcaaaggataatgttaaac	24377550	T

Q	398	acattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24377551	acattttgttccaacaatctc	24377571	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23184099 - 23183983

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	23184099	tttgtatatggtcttgcacacttgaacaaatattagtatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaac	23184000	T

Q	398	acattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23183999	acattttgttccaacaa	23183983	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 23595356 - 23595240

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	23595356	tttgtatatggtcttgcacacttgaacaaatattagtatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaac	23595257	T

Q	398	acattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23595256	acattttgttccaacaa	23595240	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 224 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 24302742 - 24302550

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaat-ttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24302742	caagctccctttttgtaaatttcattgctctcatttgttcttccagaacctattcttgatataaagacacttaaatattttatctatagttctgcacact	24302643	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24302642	tgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtattgttaaacacattttgttccaacaa	24302550	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 28700931 - 28700815

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	28700931	ttttgtctatagccctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	28700832	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	28700831	cacattttattccaaca	28700815	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31800608 - 31800485

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggt---cttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	31800608	aaatttttgtctatagtgatcttgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcttaagggttaa	31800509	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31800508	tgttaaacacattttgttccaaca	31800485	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 133 - 367

Target Start/End: Original strand, 23235228 - 23235458

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	23235228	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaagagcacttctcttcagacgctttaagctt	23235327	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23235328	actttttgttgattcaattgctctcttttgttcttctagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatat	23235421	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23235422	tagcatatccagttgacaatttttaataccttgttat	23235458	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31327675 - 31327559

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	31327675	ttttgtctatagtcatgtacgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggtttgatgttaaa	31327576	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31327575	cacattttgttccaaca	31327559	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31334396 - 31334280

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	31334396	ttttgtctatagtcatgtacgcttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggtttgatgttaaa	31334297	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31334296	cacattttgttccaaca	31334280	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21025186 - 21025068

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	21025186	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	21025087	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21025086	acacattttgttccaacaa	21025068	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 24814279 - 24814157

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	24814279	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgttaa	24814180	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24814179	acatattttgttccaacaatctc	24814157	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 33074619 - 33074741

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	33074619	taaatttttgtctatagtactgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatattttgttattatcaaaactcttaagggttattg	33074718	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33074719	ctaaacacattttgttccaacaa	33074741	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 296 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10009487 - 10009371

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	10009487	tttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagtatatccaattgacaatttttaata-cttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaa	10009389	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10009388	acacattttgttccaaca	10009371	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 28140353 - 28140236

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	28140353	ttttgtctatggtcttgtacacctgaacaaatattagcatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaa	28140254	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28140253	catattttgttccaacaa	28140236	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17966872 - 17966752

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	17966872	aaatttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	17966773	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17966772	taaacacattttattccaaca	17966752	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 22802855 - 22802971

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22802855	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacttcgttatcatcaaaactcttaacggttaatgttaaa	22802954	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22802955	cacattttgatccaaca	22802971	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 224 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 24440551 - 24440357

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt----taaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	24440551	caagcttcctttttgtaaattccattgctctcgtttgttcttctagaacctatacttgctctaaagacatac-aactttttgtctatggtcctgctcact	24440453	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24440452	tgaacaaatattagcatattcaattgac-atttttaatacattgttatcatcaaaactc-aaagtagtattattaaacaaattttgttccaacaatct	24440357	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 147 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 39037521 - 39037295

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgattt	245	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39037521	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttaacttcagtagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattc	39037422	T

Q	246	cattgctctc-gtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39037421	catagctctcaatttgttcttccagaaccta-----caaatatac-ttaa--tcttgtatactgtcctgcacacttcaacaaatattagcatatccaatt	39037330	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39037329	gacaatttttaataaattgttatcatcaaaactct	39037295	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19297304 - 19297186

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19297304	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	19297205	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19297204	acacattttgttccaacaa	19297186	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 199 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 22187931 - 22187756

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	22187931	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgctgattcctttgctctattttgttcttccataaccta------ataatgattccaaatt	22187838	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22187837	tttgtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	22187756	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1586762 - 1586639

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	1586762	aaatttttgtctatagtcctgtacactcgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaaggttattat	1586663	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1586662	tgctaaacacattttgttccaaca	1586639	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 213 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 13963807 - 13963613

Alignment:

Q	213	ttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtctt	312	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	13963807	ttcagatgtttcaaacgtcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcat	13963714	T

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	13963713	gtacacttgaacaaatattagcatatctaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaagggtaatattaaagacattttattccaac	13963614	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 162 - 379

Target Start/End: Original strand, 30621437 - 30621650

Alignment:

Q	162	gcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	30621437	gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgagagcacttctctttagatgcttgaagcttcctttttgttgattccattgctctctatt	30621536	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	30621537	gttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttatgtctatggtcctgtacacttgaacaattattagcatatccaattgagaatttttaaaac	30621630	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30621631	cttgttatcatcaaaactct	30621650	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 162 - 379

Target Start/End: Original strand, 30624058 - 30624271

Alignment:

Q	162	gcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	30624058	gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgagagcacttctctttagatgcttgaagcttcctttttgttgattccattgctctctatt	30624157	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	30624158	gttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttatgtctatggtcctgtacacttgaacaattattagcatatccaattgagaatttttaaaac	30624251	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30624252	cttgttatcatcaaaactct	30624271	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 212 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 18376735 - 18376544

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18376735	cttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataacgatatcaaatttttgtatatggtcc	18376642	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18376641	tgcatacttgaacaaatattagcat-------tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaa	18376549	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 123 - 413

Target Start/End: Original strand, 22260615 - 22260902

Alignment:

Q	123	tggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatat	219	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|
T	22260615	tggtgatcttccttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcatttttgtcttcaggagcacttctcttcagac	22260714	T

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	22260715	gccttaaacttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttctagaaccta------ataatgattcaaaaattttgtctatggtcctgtacact	22260808	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22260809	tgaataaatattagcatatccaattgaaattttttaataccttgttatcaccacaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	22260902	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 296 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20568468 - 20568350

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	20568468	tttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatactttgttgtcatcaaaactctcaatgggtaatgttaa	20568369	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20568368	gcacattttgttccaacaa	20568350	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22776034 - 22775910

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	22776034	aaatttttgtctatagtcctgtacactcgaacaaatattagcatatcaaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	22775935	T

Q	393	t---aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22775934	tgccaaacacattttattccaacaa	22775910	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 22781412 - 22781288

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	22781412	aaatttttgtctatagtcctgtacactcgaacaaatattagcatatcaaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	22781313	T

Q	393	t---aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22781312	tgccaaacacattttattccaacaa	22781288	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 14581832 - 14581955

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	14581832	aaatttttgtctatagtcctggacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatattttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	14581931	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14581932	tgctaaacatattttgttccaaca	14581955	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23392393 - 23392276

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	23392393	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttctaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	23392294	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23392293	acacattttgttccaaca	23392276	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24793704 - 24793587

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	24793704	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	24793605	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24793604	acatattttgttccaaca	24793587	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 312 - 413

Target Start/End: Original strand, 25189749 - 25189850

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	25189749	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtattgttaaacacattttattccaa	25189848	T

Q	412	ca	413	Q
		\|\|
T	25189849	ca	25189850	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 28550648 - 28550525

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	28550648	aaatttttgtctagagtcttgtacacttgaacaaatattagaatatccaattgacaatttttaatattttgttaacatcaaaactcttaaggattattat	28550549	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28550548	tgttaaacaaattttgttccaaca	28550525	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 40332459 - 40332582

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	40332459	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttattatcatcaaaactcttaaggattattat	40332558	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40332559	tgctaaacatattttgttccaaca	40332582	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 44840802 - 44840925

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	44840802	aaatttttgtctatagtcctatacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggactattat	44840901	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44840902	tgctaaacatattttgttccaaca	44840925	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 411

Target Start/End: Original strand, 3277367 - 3277490

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatg--gtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---att	387	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	3277367	aaatttttgtctatatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttatt	3277466	T

Q	388	agtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3277467	attgctaaacagattttgttccaa	3277490	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 6573858 - 6573740

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	6573858	ttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttcaatacattgttatcatcaaaacctttaaagggtaatgttat	6573759	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6573758	acacattttgttccaacaa	6573740	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19312665 - 19312543

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19312665	tttgtctatggtcctgttcacttgaacaaatattaacaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	19312566	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19312565	acacattttattccaacaatctc	19312543	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 19356871 - 19356989

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19356871	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaa	19356970	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19356971	acacattttgttccaacaa	19356989	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 26867645 - 26867759

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26867645	tggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	26867744	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26867745	tgttccaacaatctc	26867759	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 316 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 35743787 - 35743689

Alignment:

Q	316	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	35743787	cacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaaggttaacgttaaacgcattttgttctaacaa	35743689	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17968869 - 17968752

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17968869	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	17968770	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17968769	acacattttgttccaaca	17968752	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19497669 - 19497552

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19497669	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	19497570	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19497569	acacattttgttccaaca	19497552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20646242 - 20646125

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	20646242	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	20646143	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20646142	acacattttgttccaaca	20646125	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 242 - 413

Target Start/End: Original strand, 24158159 - 24158321

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatcca	341	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24158159	atttcattgctctcatttgttctttcagaacctatacttgaattata------attttttactatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatcca	24158252	T

Q	342	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24158253	attaaca--ttttaataccttgttatcatcaaaac-ctaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	24158321	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36784483 - 36784366

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	36784483	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	36784384	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36784383	acacattttgttccaaca	36784366	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 294 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 44366866 - 44366749

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	44366866	aatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatttacaatttttattactttgttagcataaaaactcttaagagttattgct	44366767	T

Q	394	aaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44366766	aaacacattttgttccaa	44366749	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 45086854 - 45086737

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|
T	45086854	ttttgtctgtagtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctttaaggttaatgttaga	45086755	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	45086754	cacattttattccaacaa	45086737	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 297 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20151770 - 20151653

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	20151770	ttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattaccatatccaatttacaattttttaataccttgttatcatcaaaac-ctcaaagggtaatgttaa	20151672	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20151671	acacattttgttccaacaa	20151653	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 22764223 - 22764345

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22764223	tttgcctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcataaaaactaaataaggtttattgtgaa	22764322	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22764323	acacattttgttccaacaatctc	22764345	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 26880234 - 26880348

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26880234	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	26880333	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	26880334	tgttccaacagtctc	26880348	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 28379508 - 28379394

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28379508	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	28379409	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28379408	tgttccaacaatctc	28379394	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 24275591 - 24275708

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	24275591	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaaattttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	24275690	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24275691	acacattttgttccaaca	24275708	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 6081725 - 6081844

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	6081725	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattaacaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	6081824	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6081825	acacattttgttccaacaat	6081844	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 296 - 375

Target Start/End: Original strand, 21846481 - 21846559

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21846481	tttttgtctatggtcctgcacacctgaacaaatattagcatatccaattgac-atttttaataccttgttatcatcaaaa	21846559	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 22755863 - 22755981

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat--ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	22755863	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaa	22755962	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22755963	aacatattttgttccaaca	22755981	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 298 - 407

Target Start/End: Original strand, 1084443 - 1084553

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	1084443	tttgtctttggtcctgtatacttgaacaaatattagcaatgttcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaaggtttattgtaaaa	1084542	T

Q	397	cacattttgtt	407	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1084543	cacattttgtt	1084553	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20417317 - 20417203

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20417317	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	20417218	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20417217	tgttccaacaatctc	20417203	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 21172121 - 21172007

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21172121	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	21172022	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21172021	tattccaacaatctc	21172007	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 27978059 - 27977945

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|
T	27978059	ctatggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaagatttattgtgaaacata	27977960	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27977959	ttttgttccaacaat	27977945	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 303 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 28064588 - 28064474

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|
T	28064588	ctatggtcatgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaagatttattgtgaaacata	28064489	T

Q	401	ttttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28064488	ttttgttccaacaat	28064474	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 967160 - 967048

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	967160	ctatggtcctgtacacctgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacgca	967061	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	967060	ttttgttccaaca	967048	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 293 - 377

Target Start/End: Original strand, 24844454 - 24844537

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24844454	aaatttttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga-tatttttaatacattgttatcatcaaaact	24844537	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 10267534 - 10267648

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10267534	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	10267633	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10267634	tgttccaacaatctc	10267648	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 10278111 - 10278225

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10278111	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	10278210	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10278211	tgttccaacaatctc	10278225	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18768578 - 18768468

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18768578	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	18768479	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18768478	tgtgccaacaa	18768468	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 225 - 375

Target Start/End: Original strand, 20569774 - 20569924

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaataga--cactaaatttttgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20569774	aagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttccagaacctatgcttgatttaaaaacacttaaattt-gtctatggttcttcacacttga	20569872	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20569873	acaaatgttaacatatccaattga-tatttttaataccttgttatcatcaaaa	20569924	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 27 - 112

Target Start/End: Complemental strand, 23595540 - 23595455

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	23595540	tgcaatgctaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggtgaa	23595455	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 28374169 - 28374060

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28374169	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	28374070	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	28374069	ttttccaaca	28374060	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 242 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 15668400 - 15668229

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc	339	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15668400	atttcattgttctcctttgttcttccagaaccaattctttgtttaaagacataatattttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatc	15668301	T

Q	340	caattgacaatttttaatac-cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15668300	caattg--aacttttaatacgtttgttatcatcaaaactc-aatgtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	15668229	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 292 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 19643455 - 19643335

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|
T	19643455	taaattttagtatatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatattcaattg--aacttgtaataccttgttatcatcaaaactcaaaaaga-cattg	19643359	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19643358	ttagacacattttgttccaacaat	19643335	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 22774932 - 22775044

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22774932	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataactaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaacttatttaggtttattgtgaaacaca	22775031	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22775032	ttttgttccaaca	22775044	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 22780310 - 22780422

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	22780310	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataactaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaacttatttaggtttattgtgaaacaca	22780409	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22780410	ttttgttccaaca	22780422	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 339 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 28731542 - 28731462

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28731542	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaatctc	28731462	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Original strand, 22249543 - 22249618

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22249543	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacattttgttccaaca	22249618	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 212 - 362

Target Start/End: Complemental strand, 25037066 - 25036922

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25037066	cttcagatgctttaagcttcgtttttgttgattcctttgctctctttttttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttctgtctatggtcc	25036973	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacctt	362	Q
		\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25036972	tgtacacatgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatacctt	25036922	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 212 - 362

Target Start/End: Complemental strand, 25041173 - 25041029

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25041173	cttcagatgctttaagcttcgtttttgttgattcctttgctctctttttttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttctgtctatggtcc	25041080	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacctt	362	Q
		\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25041079	tgtacacatgaacaattattagcatatccaattgacaatttttaatacctt	25041029	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4210431 - 4210545

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4210431	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4210530	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4210531	tgttccaacaatctc	4210545	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9907850 - 9907736

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9907850	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9907751	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9907750	tgttccaacaatctc	9907736	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 11405158 - 11405044

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11405158	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11405059	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11405058	tgttccaacaatctc	11405044	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 22960020 - 22959906

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22960020	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22959921	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22959920	tgttccaacaatctc	22959906	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 24338092 - 24337978

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24338092	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24337993	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24337992	tgttccaacaatctc	24337978	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 24425207 - 24425093

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24425207	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataacgaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattatgaaacacattt	24425108	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24425107	tgttccaacaatctc	24425093	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27221940 - 27222054

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27221940	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27222039	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27222040	tgttccaacaatctc	27222054	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 29244762 - 29244876

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29244762	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	29244861	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29244862	tgttccaacaatctc	29244876	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 35253558 - 35253672

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35253558	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35253657	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35253658	tgttccaacaatctc	35253672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 35264167 - 35264281

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35264167	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35264266	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35264267	tgttccaacaatctc	35264281	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 43083188 - 43083302

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43083188	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	43083287	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43083288	tgttccaacaatctc	43083302	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 43093797 - 43093907

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43093797	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	43093896	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43093897	tgttccaacaa	43093907	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 43345947 - 43346061

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43345947	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	43346046	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43346047	tgttccaacaatctc	43346061	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 16777394 - 16777503

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16777394	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	16777493	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16777494	tgttccaaca	16777503	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24414695 - 24414586

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24414695	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattatgaaacacattt	24414596	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24414595	tgttccaaca	24414586	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 38585762 - 38585649

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacac	399	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	38585762	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacac	38585663	T

Q	400	attttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	38585662	attttgttctaaca	38585649	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 28720954 - 28720878

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28720954	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaa	28720878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 34478468 - 34478579

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34478468	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	34478567	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34478568	tgttccaacaat	34478579	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 35274775 - 35274886

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35274775	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	35274874	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35274875	tgttccaacaat	35274886	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9772994 - 9772880

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9772994	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9772895	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9772894	tgttccaacaatctc	9772880	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 21650220 - 21650110

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21650220	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	21650121	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21650120	tgttccaacaa	21650110	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 30795325 - 30795423

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30795325	acttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtccattgtgaaacacattttgttccaaca	30795423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 32218414 - 32218524

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32218414	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	32218513	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32218514	tgttccaacaa	32218524	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 34804048 - 34803934

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34804048	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	34803949	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34803948	tgttccaacaatctc	34803934	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 36251549 - 36251439

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36251549	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36251450	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36251449	tgttccaacaa	36251439	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 38208300 - 38208410

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38208300	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	38208399	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38208400	tgttccaacaa	38208410	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 40222873 - 40222987

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40222873	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40222972	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40222973	tgttccaacaatctc	40222987	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1098900 - 1098791

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1098900	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	1098801	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1098800	tgttccaaca	1098791	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 4100307 - 4100416

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4100307	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4100406	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4100407	tgttccaaca	4100416	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 4221023 - 4221132

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4221023	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4221122	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4221123	tgttccaaca	4221132	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5020710 - 5020601

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5020710	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtaaaacacattt	5020611	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5020610	tgttccaaca	5020601	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 8523691 - 8523800

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8523691	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8523790	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8523791	tgttccaaca	8523800	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9897262 - 9897153

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9897262	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9897163	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9897162	tgttccaaca	9897153	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11388496 - 11388387

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11388496	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11388397	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11388396	tgttccaaca	11388387	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11394842 - 11394733

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11394842	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11394743	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11394742	tgttccaaca	11394733	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18392289 - 18392180

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18392289	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	18392190	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18392189	tgttccaaca	18392180	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 22914552 - 22914443

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22914552	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	22914453	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22914452	tgttccaaca	22914443	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29699760 - 29699651

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29699760	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	29699661	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29699660	tgttccaaca	29699651	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 30488511 - 30488402

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30488511	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	30488412	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30488411	tgttccaaca	30488402	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 39169776 - 39169667

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39169776	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	39169677	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39169676	tgttccaaca	39169667	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 41121690 - 41121610

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	41121690	tgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatcttcagcttctg	41121610	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 33705781 - 33705697

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33705781	taaattttagtctatgatcctgaacacttaaacaaatattagcatatctaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaactc	33705697	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 346

Target Start/End: Original strand, 14867564 - 14867618

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	346	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14867564	taaatttttgtctatgatcatgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	14867618	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 324 - 378

Target Start/End: Original strand, 25196321 - 25196374

Alignment:

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25196321	caaatattagcatatccaattgaca-tttttaataccttgttatcatcaaaactc	25196374	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 29255341 - 29255451

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29255341	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaagttcattgtgaaacacattt	29255440	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29255441	tgttccaacaa	29255451	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 373

Target Start/End: Original strand, 33240993 - 33241072

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaa	373	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33240993	taaattatagtctatggtcttgcacatttgaacaaatattagcatatccaattg--atcttttaatactttgttatcatcaa	33241072	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 373

Target Start/End: Original strand, 33248914 - 33248993

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaa	373	Q
		\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33248914	taaattatagtctatggtcttgcacatttgaacaaatattagcatatccaattg--atcttttaatactttgttatcatcaa	33248993	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 43355562 - 43355672

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43355562	tggtcctgtacacttgaaaaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	43355661	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43355662	tgttccaacaa	43355672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9762458 - 9762349

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9762458	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9762359	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9762358	tgttccaaca	9762349	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 20236934 - 20237043

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20236934	tggtcatgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcaataagattcattgtgaaacacattt	20237033	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20237034	tgttccaaca	20237043	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24327422 - 24327313

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24327422	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatgatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	24327323	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24327322	tgttccaaca	24327313	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 34789905 - 34789796

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34789905	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	34789806	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34789805	tgttccaaca	34789796	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 40251734 - 40251843

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40251734	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	40251833	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	40251834	tgttccaaca	40251843	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 7005495 - 7005423

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7005495	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	7005423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 27 - 103

Target Start/End: Complemental strand, 18430911 - 18430835

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagct	103	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18430911	tgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatgatcttcagct	18430835	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 375

Target Start/End: Original strand, 22383840 - 22383924

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacc-ttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22383840	taaattttttactgtggtcctacacacttgaacaaatattagcatatccaattgacttattttaatacctttgttatcatcaaaa	22383924	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Original strand, 27862339 - 27862415

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27862339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacactttgttccaacaa	27862415	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 224 - 374

Target Start/End: Complemental strand, 10896234 - 10896091

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	10896234	caagcttcccttttgtagtttttattgctctcatttgttcctccagaacctatgcttgattta------aattttttctctatgattttgcacacttaaa	10896141	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10896140	caaatattagcatgtccaattggc-atttttaatacattgttatcatcaaa	10896091	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20070558 - 20070460

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20070558	acttgaacaattattagtaataactaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	20070460	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 89

Target Start/End: Original strand, 25189527 - 25189589

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttct	89	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25189527	tgcaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttct	25189589	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 342

Target Start/End: Original strand, 25918990 - 25919040

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25918990	taaattttagtctatggtcttacacacttgaacaaatattagcatatccaa	25919040	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 30 - 111

Target Start/End: Original strand, 18702870 - 18702951

Alignment:

Q	30	aatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18702870	aatgatagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatga	18702951	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 22454961 - 22454880

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22454961	tgcaatgttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatcttctgaagaacttcagcttctg	22454880	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 296 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 21910845 - 21910768

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	21910845	tttttttctatggtcctgcacacttgaacaagtattatcatattcaattgtca--ttttaataccttgttatcataaaaa	21910768	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 118 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 10009645 - 10009570

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10009645	gcttctggtgatctttcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	10009570	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 22524599 - 22524515

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22524599	taaattttagtttatgatcccgcacacttgaacaaatattaacatatccaattg--aacttttagtaccttgttatcatctaaactc	22524515	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 27 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 26619072 - 26618986

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcag--cttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26619072	tgcaatgataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgttgatcttcagaacttctgatga	26618986	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 88

Target Start/End: Complemental strand, 18376869 - 18376815

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttc	88	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	18376869	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatcttc	18376815	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 304 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 19320157 - 19320086

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19320157	tatggtcctgcacacttgaaaaaatattaatatattcaattga--acttttaataccttgttatcatcaaaact	19320086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 342 - 388

Target Start/End: Complemental strand, 22785449 - 22785403

Alignment:

Q	342	attgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22785449	attgaaaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggatta	22785403	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 42 - 111

Target Start/End: Original strand, 19115227 - 19115296

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	19115227	gattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagcacctgatga	19115296	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 294 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 19497281 - 19497199

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19497281	aatttttgtctatgattctgcatacttaaacaaatattaacatatccaattgataa--tttaatatattgttatcatcaaaactc	19497199	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 47 - 112

Target Start/End: Complemental strand, 23184261 - 23184198

Alignment:

Q	47	aatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	23184261	aatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattct-tcatcttctgatgatcttcagcttctggtgaa	23184198	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 107

Target Start/End: Original strand, 24377230 - 24377311

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24377230	tgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctg	24377311	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 104

Target Start/End: Original strand, 44881296 - 44881373

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagctt	104	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44881296	tgcaatgatagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagctt	44881373	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 106

Target Start/End: Complemental strand, 21537203 - 21537139

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	21537203	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatcttct	21537139	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 9015325 - 9015274

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9015325	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	9015274	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 13963941 - 13963882

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13963941	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactgatg	13963882	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 30667126 - 30667185

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	30667126	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctgatg	30667185	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 38781536 - 38781595

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	38781536	ttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatg	38781595	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 44840639 - 44840686

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	44840639	tgcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	44840686	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 133 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 22187981 - 22187931

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22187981	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	22187931	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 334 - 413

Target Start/End: Original strand, 24964105 - 24964186

Alignment:

Q	334	catatccaattgacaatttt--taataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	24964105	catatccaattgacaatttttttaataccttattatcatcaaaaccttcaaaggataatgttaaacacattttgttcaaaca	24964186	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 300 - 377

Target Start/End: Original strand, 26816288 - 26816362

Alignment:

Q	300	tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26816288	tgtctatggtgttacacact-gaacaaatattaacatatctaattgatc--ttttaataccttgttatcatcaaaact	26816362	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 37 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 28140579 - 28140505

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28140579	gacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatctcccgatgaacttcagcttctgatga	28140505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 133 - 183

Target Start/End: Original strand, 38781618 - 38781668

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	38781618	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	38781668	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 92

Target Start/End: Complemental strand, 39037605 - 39037547

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgat	92	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39037605	ttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatcttctgat	39037547	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17857125 - 17857016

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17857125	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatcccatgttaaaatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17857026	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17857025	tgttccaaca	17857016	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 42 - 107

Target Start/End: Original strand, 19540561 - 19540626

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19540561	gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaacttcagcttctg	19540626	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 23235144 - 23235189

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23235144	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtct	23235189	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 35 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 24850628 - 24850551

Alignment:

Q	35	tagacgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|
T	24850628	tagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcagcatctggtga	24850551	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 25829271 - 25829344

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25829271	ttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctg	25829344	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 346

Target Start/End: Original strand, 22683770 - 22683810

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	346	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22683770	tggtcatgcacacttgaacaaatattagcatatctaattga	22683810	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 302 - 346

Target Start/End: Complemental strand, 27640015 - 27639971

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattga	346	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	27640015	tctatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatattcaattga	27639971	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 133 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 28140515 - 28140455

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	28140515	gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcact	28140455	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 349 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 17815826 - 17815759

Alignment:

Q	349	atttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17815826	atttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacacattttgttccaacaat	17815759	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 22260543 - 22260602

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22260543	ttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatg	22260602	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 25037214 - 25037163

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	25037214	gattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	25037163	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 25041321 - 25041270

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	25041321	gattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	25041270	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 302 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 27765386 - 27765316

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27765386	tctatggtcctgcacatttgaacatatattaacatatccaatt---attctttaatactttgttatcatcaaaa	27765316	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #201

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 33074459 - 33074506

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	33074459	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	33074506	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #202

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 37 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 10009709 - 10009639

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10009709	gacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	10009639	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #203

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 14792788 - 14792705

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14792788	taaattttagtctatagtcatgctcacttgaataaatattaggatattgaattga--acttttaatatcttattatcatcaaaact	14792705	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #204

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 312 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 22311279 - 22311218

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22311279	tgcacacttgaacaaatattagtatatccaattg---ttcttcaatactttgttatcatcaaaac	22311218	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #205

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 75

Target Start/End: Complemental strand, 20151998 - 20151957

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa	75	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20151998	ttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa	20151957	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #206

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 20568713 - 20568640

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20568713	ttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctg	20568640	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #207

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 223 - 276

Target Start/End: Original strand, 21846404 - 21846457

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctat	276	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21846404	tcaagcttcctttttgtaaattttattgctctcatttgttctttcagaacctat	21846457	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #208

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 148 - 193

Target Start/End: Original strand, 22802693 - 22802738

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	22802693	cttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	22802738	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #209

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 309 - 342

Target Start/End: Complemental strand, 24764202 - 24764169

Alignment:

Q	309	tcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24764202	tcttgcacacttgaacaaatattagtatatccaa	24764169	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #210

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Complemental strand, 6574085 - 6574045

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6574085	ttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta	6574045	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #211

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 232 - 268

Target Start/End: Original strand, 22755805 - 22755841

Alignment:

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttcca	268	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22755805	cttcttgatgatttctttgctctcgtttgttcttcca	22755841	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)

Name: scaffold0025

Description:

Target: scaffold0025; HSP #1

Raw Score: 127; E-Value: 2e-65

Query Start/End: Original strand, 29 - 367

Target Start/End: Original strand, 74705 - 75026

Alignment:

Q	29	caatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtga	128	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	74705	caatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgt--tgtttctgatga	74802	T

Q	129	tgttgcttatgatgaggt-gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttcaag	227	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	74803	ggt-gcttatgatgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcaggagcact---------------tttcttcagatgcttcaac	74886	T

Q	228	cttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaa	327	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	74887	ctttcttcttgttgattccactgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaagtagacactaaatttttgtctatggtcctacacacttgaacaaa	74986	T

Q	328	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	74987	tataagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	75026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 6)

Name: scaffold0056

Description:

Target: scaffold0056; HSP #1

Raw Score: 126; E-Value: 9e-65

Query Start/End: Original strand, 118 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 36086 - 35784

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc------	211	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	36086	gcttatggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcatttgacttcagaagctcttttttttt	35987	T

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaa-atagacactaaatttttgtctatggtc	310	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35986	cttcaaatccttcaaacttccatcttgttgattctattgctctcatttgttcttccagaacctatggtttaatagagacactaaatttt-gtctatggtc	35888	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35887	ctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgggaatttgtaatcccttgttatcatcaaaaatctaaagg-gtaatgttaaatacattttgttcca	35789	T

Q	411	acaat	415	Q
		\|\|\|\|\|
T	35788	acaat	35784	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 34534 - 34410

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	34534	ttttgtctatagtcctgtacacctgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	34435	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34434	aaacacattttgttccaacaatctc	34410	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 25380 - 25261

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	25380	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	25281	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25280	aaacacattttgttccaaca	25261	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 104

Target Start/End: Complemental strand, 36160 - 36083

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagctt	104	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36160	tgcaatgatagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagctt	36083	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 25546 - 25499

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25546	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	25499	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #6

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 34699 - 34653

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	34699	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	34653	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)

Name: scaffold0020

Description:

Target: scaffold0020; HSP #1

Raw Score: 123; E-Value: 6e-63

Query Start/End: Original strand, 212 - 414

Target Start/End: Original strand, 145172 - 145371

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	145172	cttcagatgcttcaagcttctttcttgtagatttcattgttctcatttgttcttc-agaacatgtgctttaaagagacactaaatttttgtctatggtcc	145270	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	145271	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactc-aaagggtga-tgttaaacacattttgttccaa	145368	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 4)

Name: scaffold0040

Description:

Target: scaffold0040; HSP #1

Raw Score: 121; E-Value: 9e-62

Query Start/End: Original strand, 212 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 1308 - 1105

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1308	cttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattatgttgctctcatttgttcttccagaacctaagctttaaagagacaataaacttttgtctatggtcc	1209	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1208	tgcacacttgaacaaatattagtatatccaattgacaatttttaatacctttttatcatcaaa---ctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaa	1112	T

Q	412	caatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|
T	1111	caatctc	1105	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 70170 - 70292

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	70170	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattaggaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	70269	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	70270	acacattttgttccaacaatctc	70292	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 236 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 3817 - 3635

Alignment:

Q	236	ttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatta	332	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3817	ttgttaatttcattgctctcttttgttcttccagaactaatacttgaaattaagacttataaatttttgtctatgggcctgcatatttgaaaaaatatta	3718	T

Q	333	gcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	3717	gcatatccaattgac--tttttattattttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacagtttgttccaataatctc	3635	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 39 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1413

Alignment:

Q	39	cgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	1485	cgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctcctgatga	1413	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)

Name: scaffold0064

Description:

Target: scaffold0064; HSP #1

Raw Score: 120; E-Value: 4e-61

Query Start/End: Original strand, 27 - 268

Target Start/End: Complemental strand, 43895 - 43652

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggt	126	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	43895	tgcaatgttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatgatcttcatctcctgatgaaaaactgcttctggt	43796	T

Q	127	gatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcac-taaacatcaggagc-ccttccttcatatgcttc	224	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	43795	gatgttgcttctgattaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttgaacttcagaacctcttttcttcagatgcttc	43696	T

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttcca	268	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	43695	aagcttccttcttgctgattccattgctctaatttgttcttcca	43652	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)

Name: scaffold0364

Description:

Target: scaffold0364; HSP #1

Raw Score: 117; E-Value: 2e-59

Query Start/End: Original strand, 146 - 337

Target Start/End: Original strand, 6230 - 6422

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6230	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaacacttgacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatt	6329	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata	337	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	6330	ccattgctctcatttgttcttctagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcctgcacactttaacaaatatttgcata	6422	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 225 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10214 - 10020

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10214	aagcttcctttttgtaatttccattgctcttttttgttcttccaaaacctatacttgaattaaagacatataactttctgtctatggtcatgcacacttg	10115	T

Q	322	aacaaatattagcata-tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10114	aacaaatattagcatatttcaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--tttaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	10020	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 27 - 106

Target Start/End: Original strand, 6142 - 6221

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	6142	tgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaacttcaacttct	6221	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 228)

Name: chr6

Description:

Target: chr6; HSP #1

Raw Score: 117; E-Value: 2e-59

Query Start/End: Original strand, 125 - 415

Target Start/End: Original strand, 26943781 - 26944055

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgcttc	224	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	26943781	gtgatgttgcttctaatgaggtgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact---------------ttccttcagatgcttc	26943865	T

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26943866	aagcaaccttcttgttgatcccattgctctcatttgttcttttagaacatatacttcaaagagacactcaatttttgtctttggtcctgcacacttgaac	26943965	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26943966	aaatattagtatatcaaattgacaatttttattgcattgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacattttgttccaacaat	26944055	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2

Raw Score: 114; E-Value: 1e-57

Query Start/End: Original strand, 161 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14100366 - 14100119

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	14100366	tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactatacttcaggagtacttctctccagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctctttt	14100267	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14100266	gttcttccagaacctat----ttaatatatc--aaatttttgtctatggtcctatacatttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	14100173	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14100172	attgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	14100119	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 13435742 - 13436035

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgtt--gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-ct	213	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	13435742	gcttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttactttaggagcacttctct	13435841	T

Q	214	tcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttg	313	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	13435842	tcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttctttcagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctg	13435935	T

Q	314	cacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13435936	tacatttgaacaaatattagcatatccaattgaaaattattaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttagacacattttgttccaaca	13436035	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4

Raw Score: 112; E-Value: 2e-56

Query Start/End: Original strand, 148 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 34451592 - 34451328

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	34451592	cttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgctgatt	34451493	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34451492	cctttgctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctttggtcctgtacgcttgaacaaatattagcatatccaatt	34451399	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34451398	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaat	34451328	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5

Raw Score: 110; E-Value: 3e-55

Query Start/End: Original strand, 221 - 413

Target Start/End: Original strand, 19473115 - 19473307

Alignment:

Q	221	cttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttt-tgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|
T	19473115	cttcaagcttccttcttattgattctattgctcccatttgttctcctagaacctaagctttaagtagacactaaattttttgtctatgtttctacacact	19473214	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19473215	tgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagga-taatgttaaacacattttgttccaaca	19473307	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 161 - 414

Target Start/End: Original strand, 19624217 - 19624466

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtt	258	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|
T	19624217	tgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttt	19624316	T

Q	259	tgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaata	358	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19624317	tgttcttccagaaccta------ataatgatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatctaattgacaatttttaata	19624410	T

Q	359	ccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19624411	ctttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgctccaacaa	19624466	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7

Raw Score: 101; E-Value: 8e-50

Query Start/End: Original strand, 138 - 309

Target Start/End: Complemental strand, 10640353 - 10640181

Alignment:

Q	138	tgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttct	236	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10640353	tgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgacttcagaacctcttttcttcatatgcttcaagcttccttct	10640254	T

Q	237	tgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggt	309	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10640253	tgttgatttcattgctctcatttgttcttccaaaatctatacttcaaagagacactaaatttttgtctatggt	10640181	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8

Raw Score: 101; E-Value: 8e-50

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 19086444 - 19086653

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	19086444	tcaggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatatcaaatt	19086537	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19086538	tttgtctatggtcttgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaac	19086637	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19086638	acattttgttccaaca	19086653	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 146 - 414

Target Start/End: Original strand, 24117068 - 24117332

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	24117068	tgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgctttaagcttcctttttgttgat	24117167	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24117168	tccttagctctcttttgttcttccataacctaat-----aata-atatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaat	24117261	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24117262	tgacaatttttaatacattgttatcatcaaaactttcaaaaggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	24117332	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 224 - 414

Target Start/End: Original strand, 17928117 - 17928305

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttt-tgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17928117	caagcttcctttttgttgaatctattgctctcatttgttcttc-agaacctatgctttttaaagacactaaattttttgtctatggtcatgtacacttga	17928215	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17928216	acaaatattagcatatccaattgacaatttttattaccttgttatcataaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	17928305	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11

Raw Score: 96; E-Value: 7e-47

Query Start/End: Original strand, 159 - 404

Target Start/End: Complemental strand, 20112609 - 20112369

Alignment:

Q	159	cttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgt	257	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|
T	20112609	cttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacacttgactttaggagcacttctctttagatgcttcaagcttcctttttgttgattccatagccctctc	20112510	T

Q	258	ttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaat	357	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20112509	ttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaattccaattgacaatttttaat	20112416	T

Q	358	accttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20112415	accttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacatttt	20112369	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 15955074 - 15955190

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15955074	ttttttctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	15955173	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15955174	cacattttgttccaaca	15955190	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Original strand, 17381812 - 17381933

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	17381812	taaaattttttctatagtcatgtacacttgaacaagtattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatg	17381911	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17381912	ttaaacacattttgttccaaca	17381933	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 26971976 - 26971855

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	26971976	aaatttttgtttatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaaggctaatgt	26971877	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26971876	taaacacattttgttccaacaa	26971855	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 9718226 - 9718346

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	9718226	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	9718325	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9718326	taaacacattttattccaaca	9718346	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12715290 - 12715082

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	12715290	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccaggtccta------ataatgattccaaatt	12715197	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	12715196	tttgtttatggtcctgtacacttgaacaaatattaatatatccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactctcaagga-taatgttaaac	12715098	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	12715097	acattttattccaaca	12715082	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 223 - 413

Target Start/End: Original strand, 12348434 - 12348625

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|
T	12348434	tcaagcttcctttttctagatttcattgctctcatttgttcttcgagaacctatgcttgatttaaagacactaaaatttttctctacggtcctgcacagt	12348533	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12348534	tgagaaaatattagcatatccaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagga-taatgttaaacacattttgttccaaca	12348625	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 225 - 418

Target Start/End: Original strand, 13602476 - 13602662

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13602476	aagcttcctttttgttgattccttttctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaac	13602569	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13602570	aaatattagcatatccaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaaaacattttgttccaacaatctc	13602662	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19

Raw Score: 86; E-Value: 7e-41

Query Start/End: Original strand, 212 - 404

Target Start/End: Original strand, 15987502 - 15987688

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15987502	cttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttttttcagaaccta------ataacgatatcaaatttttgtatatggtcc	15987595	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15987596	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttt	15987688	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20

Raw Score: 84; E-Value: 1e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 11525369 - 11525250

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11525369	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	11525270	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11525269	acacattttgttccaacaat	11525250	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 16877601 - 16877723

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	16877601	ttttgtctataatcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaatactttgttatcatcaaaattcttaagggttaatgttaa	16877700	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16877701	acacattttgttccaacaatctc	16877723	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 220 - 414

Target Start/End: Original strand, 19689032 - 19689220

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	19689032	gcttcaaacttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacact	19689125	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19689126	taaacaaatattagcatgtacaattcacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	19689220	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 21618624 - 21618742

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21618624	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataatttgttatcatcaaaactcttaagggttaacgttaaa	21618723	T

Q	397	cacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21618724	cacattttattccaacaat	21618742	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 12423607 - 12423728

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|
T	12423607	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatctaactgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagagttatttc	12423706	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12423707	taaacacattttgttccaacaa	12423728	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 402

Target Start/End: Original strand, 16336538 - 16336647

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	16336538	aaatttttgtctatagtcatctacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattgt	16336637	T

Q	393	taaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16336638	taaacacatt	16336647	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 132 - 379

Target Start/End: Original strand, 23284790 - 23285031

Alignment:

Q	132	tgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23284790	tgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcacttgacttcaggagcacttctcttcagatgtttcaagctt	23284889	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	23284890	cctttttgttgattccatagttctcttttgttcttccagaagcta------ataaagatatcaaatctttgt-tatgctcctgtacacttgaacaaagat	23284982	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23284983	tagcatatccaattgacaatttttaatatctaattatcatcaaaactct	23285031	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 18384021 - 18384141

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|
T	18384021	aaatttttgtctatggtcctgtacactttaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgt	18384120	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18384121	taaaaacattgtgctccaaca	18384141	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 224 - 418

Target Start/End: Original strand, 25592838 - 25593034

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaa--atagacactaaatttttgtct--atggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25592838	caagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttccagaacttatgctttattcaaagacacttaatttttttttttatgatcctgcacact	25592937	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25592938	tgaacaaatattagcatatccaattga-tatttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagtagcattgtcaaacacattttgttccaacaatctc	25593034	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 7812314 - 7812504

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata-gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	7812314	caagcttcctttttgtagattcaattgctttcatttgttcttccagaacctatgcttgatttaagacattcaaatttttgtctatggtcctgcacccttg	7812413	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7812414	aacaaatattagcatatataattgacattttttaatactttgttatcattaaaactcaaaagg-gtaatgttaaacacattttgttccaaca	7812504	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 19626137 - 19626326

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatact---ttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19626137	caagcttcctttttgtagtttccatttctctcatttgttattccaaaacctatgctcgatttaa-agacattaaagttttgtctatggtcctgcacactt	19626235	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19626236	gaacaaatattagcatctccaaataacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	19626326	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 31931964 - 31932083

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	31931964	tttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattagggtttattgtaaa	31932063	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31932064	acacattttgttccaacaat	31932083	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 11236039 - 11236161

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11236039	tttgtctatggtcctctacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	11236138	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11236139	acacattttgttccaacaatctc	11236161	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 223 - 378

Target Start/End: Original strand, 23298259 - 23298414

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact--aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23298259	tcaagcttcctttttgtagattccattgctctcatttgttcttc-agaacctatgctttaaagagacgtttcaaatttttgtctatggtcctgcacactt	23298357	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23298358	ta-caaatattagcatattcaattgacatcttttaataccttgttatcatcaaaactc	23298414	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 294 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 20487667 - 20487550

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	20487667	aatttttgtctatagtcctgtagacttgaacaaatattaccatatccaattgacaatttttaatattttgttatcatcaaaactcttaagagttaatgtt	20487568	T

Q	394	aaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20487567	aaacacattttgttccaa	20487550	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 29918386 - 29918511

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \| \|\|\|
T	29918386	aaatttttgtctataatcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatgcctagttatcatcaaaactctcaaagggtgatgt	29918485	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29918486	taaacacattttgttccaacaatctc	29918511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 21625481 - 21625607

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa--tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|
T	21625481	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagaatatccaattgacaatttttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaat	21625580	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21625581	gttaaacacatttt-ttccaacaatctc	21625607	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 23005884 - 23005692

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23005884	caagctttctttttgtaaattccattgctctcatgtgttcttccagatcctatacttgaattaaagacatttaactttttgtctattgtcctgcacactt	23005785	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23005784	gaacaaatattagcatattcaatagacattttttaataccttgttatcatcaaaact-taaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	23005692	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 23782482 - 23782674

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23782482	caagctttctttttgtaaattccattgctctcatgtgttcttccagatcctatacttgaattaaagacatttaactttttgtctattgtcctgcacactt	23782581	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23782582	gaacaaatattagcatattcaatagacattttttaataccttgttatcatcaaaact-taaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	23782674	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 212 - 378

Target Start/End: Original strand, 3680784 - 3680943

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata-gacactaaatttttgtctatggtc	310	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3680784	cttcagatgctttaagcttccttcttgtagatttctttgctctcttttgttccttcaaaac--------taaataagataccaaatttttgtctatggtc	3680875	T

Q	311	ttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3680876	atgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactc	3680943	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 18378636 - 18378762

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|
T	18378636	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactctaaaaggttaatg	18378735	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18378736	ttaaacacatttttttccaacaatctc	18378762	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 293 - 379

Target Start/End: Original strand, 18435957 - 18436043

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18435957	aaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaactct	18436043	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17608082 - 17607965

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17608082	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	17607983	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17607982	acacattttgttccaaca	17607965	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 224 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 18171862 - 18171672

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18171862	caagcttgctttttgtaaattccattgctcttatttgttcttccagaacctatacttgaattaaagacatttaactttttgtctattgccctgcacactt	18171763	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18171762	gaacaaatattagcatatccaattaacattttttaataccttgttatcataaaaact-taaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaa	18171672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 22802511 - 22802627

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	22802511	ttttgtctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtaaaa	22802605	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22802606	cacattttgttccaacattctc	22802627	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 24399033 - 24399152

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	24399033	taaatttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt--cactttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgataat	24399128	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24399129	gttaaacacattttgttccaacaa	24399152	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 313 - 413

Target Start/End: Original strand, 16528926 - 16529026

Alignment:

Q	313	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16528926	gcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcgcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaac	16529025	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	16529026	a	16529026	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 24728396 - 24728205

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24728396	caagcttcctttttgtaaattttattgctctcatttgttcttccacaacctatacttgaattaaagacatttaacttcttatctatggtcttgcacactt	24728297	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24728296	gaagaaatattagcatatccaattaac-atttttaataccttgttattatgaaaact-taaaggtgataatgttaaacacattttgttccaaca	24728205	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 18499145 - 18499263

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18499145	tttgcctatggtcctgtgcacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	18499244	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18499245	acacattttgttccaacaa	18499263	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 18555794 - 18555912

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	18555794	ttttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaa	18555893	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18555894	aacacattttgttccaaca	18555912	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 19876177 - 19876298

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|
T	19876177	taaattcttgtctatggtcttgaacacttgaacaaatattagcatatccaattgacattttttaataccatgttatcatcaaaacac-aaagtggtattg	19876275	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19876276	ctaaacacattttgttccaacaa	19876298	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 224 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 24718597 - 24718442

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24718597	caagcttcctttttgtaaattttattgctctcatttgttcttccagaacctatacttgaattaaagacatttaacttcttatctatggtcttgcacactt	24718498	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24718497	gaagaaatattaacatatccaattgac-ttttttaataccttattatcatcaaaact	24718442	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 410

Target Start/End: Original strand, 25675705 - 25675819

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	25675705	tttgcctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	25675804	T

Q	396	acacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25675805	acacattttgttcca	25675819	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 410

Target Start/End: Original strand, 25679781 - 25679895

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	25679781	tttgcctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	25679880	T

Q	396	acacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25679881	acacattttgttcca	25679895	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 292 - 378

Target Start/End: Original strand, 32336160 - 32336246

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32336160	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatctaattgacattttttaatatcttgttgtcatcaaaactc	32336246	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 11206486 - 11206603

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11206486	tttgcctatggtcctttacacttgaacaattattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	11206585	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11206586	acacattttgttccaaca	11206603	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 13913559 - 13913676

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13913559	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacg	13913658	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13913659	ttttgttccaacaatctc	13913676	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 303 - 414

Target Start/End: Original strand, 13928698 - 13928811

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	13928698	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	13928797	T

Q	401	ttttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13928798	ttttgttccaacaa	13928811	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 291 - 411

Target Start/End: Original strand, 15302552 - 15302672

Alignment:

Q	291	ctaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|
T	15302552	ctaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccgattgacaattttttaatacattgttatcatcaaaactctcaaagggtaa	15302651	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15302652	tgtt-aacacattttgttccaa	15302672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 297 - 382

Target Start/End: Original strand, 21235483 - 21235568

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaa	382	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21235483	ttttgtctatggtcctgtatacttgaataaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaa	21235568	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 294 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 22056481 - 22056364

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	22056481	aatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaatttacaatttttattactttgttagcataaaaactcttaagagttattgct	22056382	T

Q	394	aaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22056381	aaacacattttgttccaa	22056364	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 22309334 - 22309451

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	22309334	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	22309433	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22309434	acacattttgttccaaca	22309451	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Original strand, 5845628 - 5845740

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	5845628	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	5845727	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5845728	ttttgttccaaca	5845740	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18825892 - 18825774

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18825892	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	18825793	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18825792	acacattttgttccaacaa	18825774	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19289035 - 19288913

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	19289035	tttgtctatgtttctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcattaagatttattgtaaa	19288936	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19288935	acacattttgttccaacaatctc	19288913	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 33351709 - 33351585

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	33351709	aaatttttatctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcctatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaattcttgaggattattat	33351610	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33351609	tgctaaacacattttattccaacaa	33351585	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 340 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7618130 - 7618057

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7618130	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaacacattttgttccaaca	7618057	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 18925400 - 18925295

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18925400	acacttgaacaattattaggaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggatcattgtgaaacacattttgttccaac	18925301	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	18925300	aatctc	18925295	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19832763 - 19832646

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	19832763	ttttgtctatagtcctgtatacttaaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactctgttatcatcaaaactcttaagggttaacgttaaa	19832664	T

Q	397	caca-ttttgttccaaca	413	Q
		\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19832663	catatttttgttccaaca	19832646	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 25722610 - 25722493

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	25722610	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattttgaa	25722511	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25722510	acacattttgttccaaca	25722493	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 225 - 378

Target Start/End: Original strand, 25930754 - 25930910

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	25930754	aagcttcctttttgtagattccattgctcttatttgttctttcaaaacctatgcttcatttaaagacattcaaatttttgtctatggtcatgcacagttg	25930853	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25930854	aacaaatattagtatatccaattaacattttttaataccttgttatcaccaaaactc	25930910	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 12349347 - 12349472

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa--tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---att	387	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	12349347	aaatttttgtctgtagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttttattactttgttatcatcaaaactcttaagggttatt	12349446	T

Q	388	agtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12349447	attgctagacacattttgttccaaca	12349472	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 226 - 374

Target Start/End: Complemental strand, 16462480 - 16462327

Alignment:

Q	226	agcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|
T	16462480	agcttcctttttgtaaattccattcctctcatttgttcttccagaacctatgtttgatataaagacatttaaatttttgtctatggtccttcacaattga	16462381	T

Q	323	acaaatattagcatatccaattgac--aatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16462380	acaaatattagcatatccaattgacatattttttaataccttgttatcatcaaa	16462327	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17745383 - 17745271

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	17745383	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	17745284	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17745283	ttttgttccaaca	17745271	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20730483 - 20730372

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	20730483	ttttgtctatgatcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacgttgttttcatcaaaactctcaa-----agggtaaaa	20730389	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20730388	cacattttgttccaaca	20730372	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 304 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 25686381 - 25686265

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25686381	tatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattcacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttatttaggtttattgtgaaacacat	25686282	T

Q	402	tttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25686281	tttgttccaacaatctc	25686265	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 404

Target Start/End: Complemental strand, 139129 - 139023

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	139129	ttttgtctataatcatgtacacttgaacaaatat-agcatatacaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcttaagggttaatgtcaaa	139031	T

Q	397	cacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	139030	cacatttt	139023	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 404

Target Start/End: Complemental strand, 147150 - 147044

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	147150	ttttgtctataatcatgtacacttgaacaaatat-agcatatacaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcttaagggttaatgtcaaa	147052	T

Q	397	cacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	147051	cacatttt	147044	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 412

Target Start/End: Complemental strand, 16264929 - 16264819

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	16264929	ttttgtctatggtcatgtacactttaacaaaaattagcatatccaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaactctcaa-----agggtaaaa	16264835	T

Q	397	cacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16264834	cacattttgttccaac	16264819	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 247 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 17445510 - 17445377

Alignment:

Q	247	attgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaat--agacact-aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	17445510	attgctctcatttgttcttccagaacatatgcttgaattcaagacatttaaatttttgtctatggtccttcacacttgaacaaatattagcatatccagt	17445411	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17445410	taac-atttttaataccttcttatcatcaaaactc	17445377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 25735210 - 25735091

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	25735210	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaa	25735111	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25735110	acacattttattccaacaat	25735091	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 30401270 - 30401151

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	30401270	tttgcctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	30401171	T

Q	396	acaca-ttttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30401170	atacatttttgttccaacaa	30401151	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 292 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 31127149 - 31127028

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	31127149	taaattttagtctacggtcctgcacacttgaacaaatactagcatatcgaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaat	31127054	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31127053	gttaaacacattttgttccaacaatc	31127028	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 318 - 413

Target Start/End: Original strand, 32544668 - 32544763

Alignment:

Q	318	cttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32544668	cttgaacaaatattagcatatccaattgtcaatttttaatactttgttaacatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	32544763	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18834305 - 18834187

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	18834305	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaagatttattgtgaa	18834206	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18834205	acacattttgttccaacaa	18834187	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 25788233 - 25788347

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25788233	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	25788332	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25788333	tgttccaacaatctc	25788347	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 8654210 - 8654319

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8654210	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	8654309	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8654310	tgttccaaca	8654319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10547418 - 10547309

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10547418	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	10547319	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10547318	tgttccaaca	10547309	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11252725 - 11252616

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11252725	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	11252626	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11252625	tgttccaaca	11252616	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17316317 - 17316194

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt--	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	17316317	aaatttttgtctatagtcctgtacacttaaacaaatattagcgtgtccaattgacaatcttaaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	17316218	T

Q	391	-gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17316217	ggctaaatacattttgttccaaca	17316194	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 322 - 418

Target Start/End: Original strand, 19483189 - 19483288

Alignment:

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19483189	aacaaatattagcgtgtccaattgacaatcttaaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgttaaacacattttgttccaacaatctc	19483288	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 319 - 415

Target Start/End: Original strand, 20636137 - 20636236

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20636137	ttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactattaagggttattattgctaaacacattttgttccaacaat	20636236	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 304 - 415

Target Start/End: Original strand, 25519236 - 25519349

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25519236	tatggtcctgtatacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacat	25519335	T

Q	402	tttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25519336	tttgttccaacaat	25519349	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 25800866 - 25800975

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25800866	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	25800965	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25800966	tgttccaaca	25800975	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 31572937 - 31573054

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	31572937	tttgtatatggtcctgtacacttgaacaatcattagcagtaaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	31573036	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31573037	acacattttgttccaaca	31573054	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 339 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 19461625 - 19461545

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19461625	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacattttgttccaacaatctc	19461545	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 225 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 30451364 - 30451210

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	30451364	aagcttcctttttatagattccattgctctcatttgttcttc-agaacctatgcttcatttaaagacattcaaatttttgtctatgatcctgaacacttg	30451266	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30451265	agcaaatattagcatatctaattgtcattttttaataccttgttatcatcaaaact	30451210	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 297 - 415

Target Start/End: Original strand, 26590014 - 26590135

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	26590014	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgaatccaattgacaatttttaatattttattatcttcaaaaatcttaagggttattattgct	26590113	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26590114	aaacacattttgttccaacaat	26590135	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9122812 - 9122698

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9122812	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	9122713	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9122712	tgttccaacaatctc	9122698	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12727128 - 12727014

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12727128	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattt	12727029	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12727028	tgttccaacaatctc	12727014	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Original strand, 12828236 - 12828334

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12828236	acttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	12828334	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 14758660 - 14758743

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14758660	taaattttagtctatggtccttcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaact	14758743	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 125 - 223

Target Start/End: Original strand, 19470886 - 19470984

Alignment:

Q	125	gtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttccttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	19470886	gtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcacttgacttcaggagcactttcttcaaatgctt	19470984	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 20029568 - 20029458

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20029568	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttagtaccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattt	20029469	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20029468	tgttccaacaa	20029458	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20062319 - 20062205

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20062319	tggtcctgtacacttgaacaatttatagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattt	20062220	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20062219	tgttccaacaatctc	20062205	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 294 - 413

Target Start/End: Original strand, 26186062 - 26186178

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattag-tgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|
T	26186062	aattttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tctttcataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtcgcgatgt	26186157	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26186158	taaacacattttgttccaaca	26186178	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 27166098 - 27165980

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	27166098	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgaaattttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	27165999	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27165998	acacattttgttccaacaa	27165980	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9933342 - 9933225

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	9933342	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactaactaaggtttattgtgaa	9933243	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9933242	acatattttgttccaaca	9933225	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 12382456 - 12382565

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12382456	tggtcctgtacacttgaacaataattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	12382555	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12382556	tgttccaaca	12382565	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 378

Target Start/End: Original strand, 21128618 - 21128699

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21128618	tttgtttatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatttccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	21128699	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 319 - 384

Target Start/End: Original strand, 22387216 - 22387281

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22387216	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagg	22387281	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 16122895 - 16122783

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	16122895	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacaca	16122796	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	16122795	ttttattccaaca	16122783	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Original strand, 4293273 - 4293384

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	4293273	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcagcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacat	4293372	T

Q	402	tttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	4293373	tttattccaaca	4293384	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7375411 - 7375313

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7375411	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaaca	7375313	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 12952784 - 12952666

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc-caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	12952784	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaaaatcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattctaaa	12952685	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12952684	acacattttattccaacaa	12952666	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 16930949 - 16931063

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16930949	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16931048	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16931049	tgttccaacaatctc	16931063	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 17043148 - 17043270

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17043148	tttgtgtatggtcctgtatacttgaacaattgttagcaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	17043247	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17043248	acacatattgttctaacaatctc	17043270	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 17064737 - 17064859

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17064737	tttgtgtatggtcctgtatacttgaacaattgttagcaaaaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	17064836	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17064837	acacatattgttctaacaatctc	17064859	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17982200 - 17982086

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17982200	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17982101	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17982100	tgttccaacaatctc	17982086	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17984389 - 17984275

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17984389	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	17984290	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17984289	tgttccaacaatctc	17984275	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 26025975 - 26026089

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26025975	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26026074	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26026075	tgttccaacaatctc	26026089	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 26865304 - 26865418

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26865304	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26865403	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26865404	tgttccaacaatctc	26865418	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27342210 - 27342324

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27342210	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27342309	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27342310	tgttccaacaatctc	27342324	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27384949 - 27385063

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	27384949	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacccattt	27385048	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27385049	tgttccaacaatctc	27385063	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27402950 - 27403064

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27402950	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27403049	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27403050	tgttccaacaatctc	27403064	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 27475362 - 27475476

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	27475362	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacccattt	27475461	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27475462	tgttccaacaatctc	27475476	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 32972228 - 32972114

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32972228	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	32972129	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32972128	tgttccaacaatctc	32972114	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9305 - 9196

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9305	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	9206	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9205	tgttccaaca	9196	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7750915 - 7750806

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7750915	tggtcatgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	7750816	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7750815	tgttccaaca	7750806	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9112175 - 9112066

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9112175	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	9112076	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9112075	tgttccaaca	9112066	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 10971207 - 10971098

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10971207	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	10971108	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10971107	tgttccaaca	10971098	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11146896 - 11146787

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	11146896	tggtcctgtacacttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacactt	11146797	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11146796	tgttccaaca	11146787	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12716479 - 12716370

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12716479	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggtttattgtgaaacacattt	12716380	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12716379	tgttccaaca	12716370	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17577444 - 17577335

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17577444	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttaacatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	17577345	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17577344	tgttccaaca	17577335	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Original strand, 27373321 - 27373426

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27373321	acacttgaacaatcattagtataaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	27373420	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	27373421	aatctc	27373426	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Original strand, 27463671 - 27463776

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27463671	acacttgaacaatcattagtataaaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	27463770	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	27463771	aatctc	27463776	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 27504861 - 27504970

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27504861	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	27504960	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27504961	tgttccaaca	27504970	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 28573233 - 28573342

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28573233	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	28573332	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28573333	tgttccaaca	28573342	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 29766076 - 29766193

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	29766076	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattgttagcaataaccaattgacaatttttaatatgttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaa	29766175	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29766176	acacattttgttccaaca	29766193	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7582652 - 7582552

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	7582652	acacttgaacaattattagcaatttccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggcttattgtaaaacatattttattccaac	7582553	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	7582552	a	7582552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Original strand, 13145452 - 13145570

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	13145452	taaatttttgtctatcgtcctgcacacttgaataaatattagcatatccaattgac--tttttgatatcttgttaccatcaaaa--cttaaggtggtaat	13145547	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13145548	gttaaacacagtttgttccaaca	13145570	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 14069824 - 14069700

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaata-ttagc-atatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	14069824	tttgactatggtcctgtaaacttgaacaaataattagctagatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttattcaggtttattgtt	14069725	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14069724	aaacacatttttttccaacaatctc	14069700	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 293 - 365

Target Start/End: Complemental strand, 15531389 - 15531318

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgtt	365	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15531389	aaatttttatctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-ttttaataccttgtt	15531318	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 339 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 30119877 - 30119801

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30119877	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaacaa	30119801	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 319 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 19065793 - 19065696

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19065793	ttgaacaaatattagcgtttccaattgacaatttttaatattttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacaaattttgttccaaca	19065696	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 3661898 - 3662012

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3661898	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3661997	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3661998	tgttgcaacaatctc	3662012	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10402765 - 10402655

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10402765	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaattcttttttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	10402666	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10402665	tgttccaacaa	10402655	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 298 - 406

Target Start/End: Complemental strand, 17741356 - 17741246

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17741356	tttgcctatggtcctgtacacatgaacaattattagcaataaccaattgagaatttttaatactttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	17741257	T

Q	396	acacattttgt	406	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17741256	acacattttgt	17741246	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 312 - 377

Target Start/End: Original strand, 17868153 - 17868216

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17868153	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaatttaca--ttttaataccttgttatcatcaaaact	17868216	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 312 - 377

Target Start/End: Original strand, 17877936 - 17877999

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17877936	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaatttaca--ttttaataccttgttatcatcaaaact	17877999	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 25986631 - 25986741

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25986631	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	25986730	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25986731	tgttccaacaa	25986741	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 26036549 - 26036659

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26036549	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	26036648	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26036649	tgttccaacaa	26036659	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 315 - 415

Target Start/End: Original strand, 29385276 - 29385378

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29385276	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	29385375	T

Q	413	aat	415	Q
		\|\|\|
T	29385376	aat	29385378	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 34817472 - 34817358

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34817472	tggtcctgtacacttgaacaatcattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	34817373	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34817372	tgttccaacaatctc	34817358	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 3383633 - 3383742

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3383633	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3383732	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3383733	tgttccaaca	3383742	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9772589 - 9772480

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9772589	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9772490	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9772489	tgttccaaca	9772480	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 11049114 - 11049223

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11049114	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11049213	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11049214	tgttccaaca	11049223	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11992549 - 11992440

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11992549	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	11992450	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11992449	tgttccaaca	11992440	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12526072 - 12525963

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12526072	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12525973	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12525972	tgttccaaca	12525963	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 13055986 - 13056095

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13055986	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13056085	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13056086	tgttccaaca	13056095	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 16960137 - 16960246

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16960137	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16960236	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16960237	tgttccaaca	16960246	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 18726770 - 18726879

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18726770	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	18726869	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18726870	tgttccaaca	18726879	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Original strand, 26875937 - 26876038

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26875937	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	26876036	T

Q	413	aa	414	Q
		\|\|
T	26876037	aa	26876038	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 27413609 - 27413718

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27413609	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	27413708	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27413709	tgttccaaca	27413718	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 27506422 - 27506531

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27506422	tggtcatgtacacttgaacaatcattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	27506521	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27506522	tgttccaaca	27506531	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31982289 - 31982180

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31982289	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	31982190	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31982189	tgttccaaca	31982180	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 32961609 - 32961500

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32961609	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	32961510	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32961509	tgttccaaca	32961500	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 298 - 377

Target Start/End: Original strand, 17048085 - 17048165

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17048085	tttgcctatggtcctttacatttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	17048165	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 292 - 419

Target Start/End: Original strand, 20462269 - 20462393

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|
T	20462269	taaattttagtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagtatatccaat--ataacttttaacatcttgttatcttcaaaactc-aaaggggcattg	20462365	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20462366	ttaaatacattttgttccaacaatctct	20462393	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 296 - 375

Target Start/End: Original strand, 23231528 - 23231605

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23231528	tttttgtctatggtcctgcatagttaaataaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa	23231605	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 5497506 - 5497395

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5497506	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	5497407	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5497406	tgttccaacaat	5497395	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 301 - 414

Target Start/End: Original strand, 12866058 - 12866173

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	12866058	gtctttggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaaca	12866157	T

Q	399	cattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12866158	cattttgttccaacaa	12866173	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 4631402 - 4631516

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	4631402	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttctttgtgaaacatattt	4631501	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4631502	tgttccaacaatctc	4631516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 27 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 10640432 - 10640366

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10640432	tgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctctcagcttctgatg	10640366	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 12394827 - 12394910

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12394827	taaattttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatatctaattgatca--tttaatactttgttatcatcaaaact	12394910	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 12855537 - 12855651

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12855537	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaacacttaataaggttcattgtgaaacacattt	12855636	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12855637	tgttccaacaatctc	12855651	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 14051100 - 14050986

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaata-ttagc-atatccaattgacaattttt-aataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|
T	14051100	ctatggtcctgtaaacttgaacaaataattagccagatccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttattcaggtttattgttaaata	14051001	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14051000	cattttgttccaaca	14050986	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 301 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 31542583 - 31542469

Alignment:

Q	301	gtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|
T	31542583	gtctttggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgcgaaaca	31542484	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31542483	cattttgttccaaca	31542469	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 32311365 - 32311251

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32311365	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaaaaaggttctttgtgaaacacattt	32311266	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32311265	tgttccaacaatctc	32311251	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 3672562 - 3672671

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3672562	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3672661	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	3672662	tgttgcaaca	3672671	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 296 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 10704351 - 10704236

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	10704351	tttttatctatggtcctgcacacttgaataagtattagcatattcaattggca--ttttaatactttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgtta	10704256	T

Q	395	aacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10704255	aacacatattgttccaacaa	10704236	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 294 - 378

Target Start/End: Original strand, 20462640 - 20462722

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20462640	aattttagtctatgatcctacacacatgaacaaatattagcatatccaatt--caacttttaataacttgttatcatcaaaactc	20462722	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 199 - 342

Target Start/End: Original strand, 25597756 - 25597894

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	25597756	tcaggagcacttctcttcagatgcttttagcttcctttttgttgattccattgctctcttttattcttctagaaccta------ataatgattccaaatt	25597849	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25597850	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaa	25597894	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 26044711 - 26044820

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	26044711	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacatattt	26044810	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26044811	tgttccaaca	26044820	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Original strand, 3394585 - 3394657

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3394585	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	3394657	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 312 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 15477583 - 15477520

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15477583	tgcacacttgaacaaatattagcatattcaattg---aattttaataccttgttatcatcaaaactc	15477520	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 22527817 - 22527745

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22527817	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	22527745	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 27797990 - 27797918

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27797990	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	27797918	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 32300676 - 32300604

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32300676	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	32300604	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 317 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 32761568 - 32761472

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32761568	acttaaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataacttgttaacatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaa	32761472	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 315 - 377

Target Start/End: Original strand, 15542284 - 15542344

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15542284	acacttgaacaaatattagaatatccaattg--aacttttaataccttgttatcatcaaaact	15542344	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 28251244 - 28251137

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28251244	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	28251145	T

Q	404	tgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28251144	tgttccaa	28251137	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 31719488 - 31719405

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31719488	taaattttagtatatgatcttgcacacttgaacaaatattaacatattcaattg--aacttttaatatcttattatcatcaaaact	31719405	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 1905396 - 1905505

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1905396	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaaattttaataacatgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	1905495	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1905496	tgttccaaca	1905505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 340 - 409

Target Start/End: Complemental strand, 24508074 - 24508005

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24508074	caattgacaatttttaatatcttattatcatcaaaactctcaaaagttaatgttaaacacattttgttcc	24508005	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 34806840 - 34806731

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34806840	tggtcctgtacacttgaacaatcattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaagttcattgtgaaacacattt	34806741	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34806740	tgttccaaca	34806731	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Original strand, 23284707 - 23284779

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23284707	ttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttct	23284779	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 9717986 - 9718045

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9717986	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	9718045	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 15987377 - 15987436

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15987377	ttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttctgatg	15987436	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 32544408 - 32544467

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	32544408	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	32544467	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 339 - 413

Target Start/End: Original strand, 33199877 - 33199952

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33199877	ccaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	33199952	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 34 - 112

Target Start/End: Original strand, 29918160 - 29918237

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29918160	ttagacgagattaaatccat-gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaa	29918237	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 42 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 14100438 - 14100369

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14100438	gattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga	14100369	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 45 - 112

Target Start/End: Original strand, 19688920 - 19688985

Alignment:

Q	45	taaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19688920	taaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttctgatgaa	19688985	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 42 - 93

Target Start/End: Original strand, 13602323 - 13602374

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	13602323	gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	13602374	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 15531630 - 15531571

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15531630	ttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatg	15531571	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 292 - 374

Target Start/End: Original strand, 15552304 - 15552384

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	15552304	taaattttagtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcatattcaattg--aacttttaatatattgttgtcatcaaa	15552384	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 27 - 106

Target Start/End: Original strand, 19470805 - 19470884

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	19470805	tgcaatgctaggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaacttct	19470884	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 21625243 - 21625302

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	21625243	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatg	21625302	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 26972234 - 26972175

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	26972234	ttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	26972175	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 133 - 183

Target Start/End: Original strand, 13602399 - 13602449

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13602399	gcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	13602449	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 16742582 - 16742665

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16742582	taaattttagtttatggttctgcacatttgaacaaatattagcatataaaattg--aacttctaatatcttgttatcatcaaaact	16742665	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 37 - 107

Target Start/End: Original strand, 19624125 - 19624195

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19624125	gacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	19624195	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 133 - 183

Target Start/End: Original strand, 25597706 - 25597756

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25597706	gcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatgacgtcatcactt	25597756	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 350 - 414

Target Start/End: Original strand, 7669763 - 7669828

Alignment:

Q	350	tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7669763	tttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttaattgtgaaacacattttgttccaacaa	7669828	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 15302343 - 15302388

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15302343	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtct	15302388	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 25597622 - 25597667

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25597622	ttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtct	25597667	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #217

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003

Query Start/End: Original strand, 72 - 152

Target Start/End: Original strand, 3680655 - 3680735

Alignment:

Q	72	ttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttct	152	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	3680655	ttaattctctcagcttctgatgatcttcagttcttgatgaaaaattgcttctggtgatgttgcttctaatgaggtgattct	3680735	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #218

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 296 - 375

Target Start/End: Original strand, 27989122 - 27989195

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27989122	tttttgtctatggtcttgcacactt----aaatattaacatatccaattg--atcttttaatacattgctatcatcaaaa	27989195	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #219

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 155 - 193

Target Start/End: Original strand, 15302418 - 15302456

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	15302418	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	15302456	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #220

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 293 - 377

Target Start/End: Original strand, 25596038 - 25596120

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25596038	aaattttattctatggtccttctcacttgaacaaatattaagatatgcaattg--aacttttaataccttactatcatcaaaact	25596120	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #221

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 12715426 - 12715366

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	12715426	ttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	12715366	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #222

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 220 - 275

Target Start/End: Original strand, 16528837 - 16528893

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc-tcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16528837	gcttcaagcttcttttttgttgatttcatagctcttaatttgttcttccagaaccta	16528893	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #223

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 17608247 - 17608211

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17608247	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	17608211	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #224

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 19065951 - 19065915

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19065951	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	19065915	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #225

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 149 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 19832924 - 19832880

Alignment:

Q	149	ttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	19832924	ttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	19832880	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #226

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 220 - 268

Target Start/End: Complemental strand, 20730553 - 20730505

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttcca	268	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20730553	gcttaaagcttcctttttgttgatttctttgctctctattgttcttcca	20730505	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #227

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 74

Target Start/End: Original strand, 21235256 - 21235296

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttta	74	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	21235256	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta	21235296	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #228

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 292 - 344

Target Start/End: Complemental strand, 22562464 - 22562412

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22562464	taaattttaatctatagtcctgcacacttgaacatatattcgcatatccaatt	22562412	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)

Name: scaffold0290

Description:

Target: scaffold0290; HSP #1

Raw Score: 113; E-Value: 5e-57

Query Start/End: Original strand, 133 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 18505 - 18228

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18505	gcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagctt	18406	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18405	cctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaaaaccta------ataaagatatcaaatttttgtttatggttctgtacacttgaacaaatat	18312	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	18311	tagcatttccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgtcaaacacattttgttctaacaa	18228	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 18589 - 18544

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	18589	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatct	18544	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)

Name: scaffold0035

Description:

Target: scaffold0035; HSP #1

Raw Score: 112; E-Value: 2e-56

Query Start/End: Original strand, 123 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 19368 - 19081

Alignment:

Q	123	tggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgc	221	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|
T	19368	tggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcaggagcacttgacttcaggagcacttctcttcagacgc	19269	T

Q	222	ttcaagcttccttctt-gttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	19268	ttcaagcttccttttttgttgactccttagctctcttttgttcttccataaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacactt	19175	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct-taaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19174	gaacaaatattagcatatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtta-tgttaaacacattttgttccaacaa	19081	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 246 - 413

Target Start/End: Original strand, 30155 - 30319

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttt-tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30155	cattgctctcatttgttcttc-agaacctatgcattcaa-agacactgaattttttgtctatggtcctacacacttgaacaaatattagcgtatccaatt	30252	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	30253	gacaaattttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttcttccaaca	30319	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 98903 - 98780

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	98903	aaatttttttccatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaacggttattat	98804	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	98803	tgctaaacacattttgttccaaca	98780	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 43 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19395

Alignment:

Q	43	attaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19431	attaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtct	19395	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 3)

Name: scaffold0161

Description:

Target: scaffold0161; HSP #1

Raw Score: 111; E-Value: 8e-56

Query Start/End: Original strand, 164 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9989 - 9747

Alignment:

Q	164	ttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgtt	262	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	9989	ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactatacttcaggagcacttctcttcatattcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgtt	9890	T

Q	263	cttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacctt	362	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9889	cttccagaac---tatttaagat-gtca---aatttttgtttatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatcca-ttgacaatttttaatacctt	9798	T

Q	363	gttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9797	gtaatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	9747	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 312 - 379

Target Start/End: Original strand, 5467 - 5530

Alignment:

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5467	tgcacacttgaacatatattaacatatgcaattg----tttttaatactttgttatcatcaaaactct	5530	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 42 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 10068 - 10002

Alignment:

Q	42	gattaaatcctttgaacaaccttt-gaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10068	gattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	10002	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 9)

Name: scaffold0026

Description:

Target: scaffold0026; HSP #1

Raw Score: 111; E-Value: 8e-56

Query Start/End: Original strand, 157 - 418

Target Start/End: Original strand, 8146 - 8404

Alignment:

Q	157	atcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc	253	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|
T	8146	atcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaagcttactttttgttgattcctttgctc	8245	T

Q	254	tcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttt	353	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8246	tcttttgttcttccagaaccta------ataatgatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttt	8339	T

Q	354	taataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8340	taataccttgttatcatcaaaactcttaaagtgtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	8404	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 151625 - 151511

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	151625	ttgtatatggtcctacacacttcaacaaatattagcatatctaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtagtgctaaaca	151526	T

Q	399	cattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	151525	cattttgttccaaca	151511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Original strand, 115902 - 116023

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	115902	aaatttttctttattgtcctgtacacttgaacaaatattagcaaattcaattgacaatttttcataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	116001	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	116002	taaacacattttgttccaacaa	116023	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 118 - 413

Target Start/End: Original strand, 60226 - 60513

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-ctt	214	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	60226	gcttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatgacgtcatcacatcaggagcacttttgtcttcaagagcatttctctt	60325	T

Q	215	catatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgc	314	Q
		\|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	60326	cagacgccttaagcttcatttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgatgtcaaatttttgtctatggtcctgt	60419	T

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	60420	acacttgaacaaatattagcatatccaattga-----tttaataaattgttatcatctaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	60513	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 40 - 90

Target Start/End: Complemental strand, 151833 - 151783

Alignment:

Q	40	gtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctg	90	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	151833	gtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctg	151783	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 123 - 194

Target Start/End: Complemental strand, 151784 - 151713

Alignment:

Q	123	tggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta	194	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	151784	tggtgatcttgcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacta	151713	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 37 - 93

Target Start/End: Original strand, 60162 - 60218

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	60162	gacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg	60218	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 105 - 193

Target Start/End: Original strand, 115718 - 115806

Alignment:

Q	105	ctgatgaaaaactgcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	115718	ctgatgaacatcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcact	115806	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 37 - 107

Target Start/End: Original strand, 8072 - 8142

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	8072	gacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactttagcttctg	8142	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)

Name: scaffold0861

Description:

Target: scaffold0861; HSP #1

Raw Score: 109; E-Value: 1e-54

Query Start/End: Original strand, 133 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4554

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	4831	gcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaaactt	4732	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4731	cctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct------tataatgattccaaatttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatat	4638	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	4637	taacatatccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacatttagttctaacaa	4554	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Complemental strand, 4915 - 4856

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4915	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg	4856	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)

Name: scaffold0411

Description:

Target: scaffold0411; HSP #1

Raw Score: 105; E-Value: 3e-52

Query Start/End: Original strand, 138 - 410

Target Start/End: Original strand, 12441 - 12709

Alignment:

Q	138	tgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcacta--aacatcaggagcccttcc-ttcatatgcttcaagcttcctt	234	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12441	tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcagctcaggagcacttttatcttcaggagaacttttattcaaatgcttcaagcttcctt	12540	T

Q	235	cttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagc	334	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12541	tttgttgattccattactctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagc	12634	T

Q	335	atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcca	410	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12635	atatccaattgacaa-ttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttcca	12709	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411; HSP #2

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 12352 - 12397

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12352	ttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtct	12397	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)

Name: scaffold0359

Description:

Target: scaffold0359; HSP #1

Raw Score: 105; E-Value: 3e-52

Query Start/End: Original strand, 124 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5585 - 5299

Alignment:

Q	124	ggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgc	221	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|
T	5585	ggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcagacgc	5486	T

Q	222	ttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt-gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|
T	5485	ttcaaggttccttttagttgattcatttgctctcattttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcctgtacgctt	5392	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5391	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	5299	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 37 - 105

Target Start/End: Complemental strand, 5655 - 5587

Alignment:

Q	37	gacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttc	105	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5655	gacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc	5587	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)

Name: scaffold0066

Description:

Target: scaffold0066; HSP #1

Raw Score: 104; E-Value: 1e-51

Query Start/End: Original strand, 161 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 60740 - 60488

Alignment:

Q	161	tgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|
T	60740	tgcttctgatgacgtcctcacttcaggagcactaaacttcaggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagcttcctttt	60641	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	60640	tttctttcagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgaaaaattttaatac	60547	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	60546	cttgttatcatgaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaatctc	60488	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)

Name: scaffold0916

Description:

Target: scaffold0916; HSP #1

Raw Score: 103; E-Value: 5e-51

Query Start/End: Original strand, 223 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 2438 - 2248

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|
T	2438	tcaagcttactttttgtagatttcattgctctcatttgttcttccagaacctatgcttgaattaaagacactaaatttttgtctatgatcctacacactt	2339	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2338	gaacaaatattagcatattcaattgacattttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaagggtaatgttaaatacattttgttccaaca	2248	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)

Name: scaffold0009

Description:

Target: scaffold0009; HSP #1

Raw Score: 99; E-Value: 1e-48

Query Start/End: Original strand, 224 - 413

Target Start/End: Original strand, 269043 - 269228

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	269043	caagcttcctttttctagattctattgctctcatttgttcttcaa-aacctgtgcttttaa-agacactaaatttttgtctatggtcctgcacatttgaa	269140	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	269141	caactattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc--aaaggttaatgttaaacacattttgttccaaca	269228	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 334 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9247 - 9163

Alignment:

Q	334	catatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9247	catatccaattgacaatttttaataccttgctattatcaaaactcttaaagggtattgttaaacacattttgttccaacaatctc	9163	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)

Name: scaffold0116

Description:

Target: scaffold0116; HSP #1

Raw Score: 97; E-Value: 2e-47

Query Start/End: Original strand, 140 - 409

Target Start/End: Complemental strand, 20848 - 20583

Alignment:

Q	140	atgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttctt	237	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	20848	atgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattacttcaggagcacttctcttcagacgcttcaaacttccttttt	20749	T

Q	238	gttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcata	337	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	20748	gttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aattttt-tctatggtcatgtacaattgaacaaatattatctta	20656	T

Q	338	tccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagga-ttagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20655	tccaattgacaatttttactaccttgttatcatcaaaactctcaaggatttaatgttaaacacattttgttcc	20583	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 33786 - 33900

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33786	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcttcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	33885	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	33886	ttttccaacaatctc	33900	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20894

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20939	ttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtct	20894	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)

Name: scaffold0426

Description:

Target: scaffold0426; HSP #1

Raw Score: 95; E-Value: 3e-46

Query Start/End: Original strand, 225 - 418

Target Start/End: Original strand, 13932 - 14119

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaac	324	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13932	aagcttccttttcgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtttatggtcttgtacacttgaac	14025	T

Q	325	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14026	aaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaaagttaaacacattttgttccaacaatctc	14119	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)

Name: scaffold1359

Description:

Target: scaffold1359; HSP #1

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 413 - 292

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	413	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	314	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	313	cacattttgttccaacaatctc	292	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1503 - 1384

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	1503	ttttgtctatagtcctgtatacttgaataaatattaacatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	1404	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1403	aaacacattttgttccaaca	1384	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)

Name: scaffold0439

Description:

Target: scaffold0439; HSP #1

Raw Score: 94; E-Value: 1e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6315

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	6436	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgt	6337	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6336	tcaacacattttgttccaacaa	6315	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)

Name: scaffold0146

Description:

Target: scaffold0146; HSP #1

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 155 - 413

Target Start/End: Original strand, 15335 - 15588

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctc	253	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|
T	15335	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattccttagctc	15434	T

Q	254	tcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttt	353	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	15435	tcttttgttcttaaagaaccta------ataaagatatcaagtttttgtctagggtcctgtacagttgaacaaatattagcatatctaattgaaaatttt	15528	T

Q	354	taataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15529	taataccttattatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	15588	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 15260 - 15305

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15260	ttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtct	15305	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 3)

Name: scaffold0018

Description:

Target: scaffold0018; HSP #1

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 52888 - 53008

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	52888	aaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacagtttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgt	52987	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	52988	taaacacattttgttccaaca	53008	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 56840 - 56960

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	56840	aaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgaaagtttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgt	56939	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56940	taaacacattttgttccaaca	56960	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6223 - 6101

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	6223	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgttaa	6124	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6123	acatattttgttccaacaatctc	6101	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)

Name: scaffold0015

Description:

Target: scaffold0015; HSP #1

Raw Score: 93; E-Value: 5e-45

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 61189 - 61309

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	61189	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattgt	61288	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|
T	61289	taaacacattttattctaaca	61309	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)

Name: scaffold0395

Description:

Target: scaffold0395; HSP #1

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 133 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 13417 - 13137

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttc	231	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13417	gcttctgatgagatgcttctgatgaacatgcttttaatgacatcatcacttcaggagcactaaatttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttc	13318	T

Q	232	cttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatatt	331	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13317	ttttttgttgattctttagctttcttttggtttttcagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatatt	13224	T

Q	332	agcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13223	agcatatcaaattgaaattttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaatacattttgttccaacaatctc	13137	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)

Name: scaffold0273

Description:

Target: scaffold0273; HSP #1

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 212 - 367

Target Start/End: Original strand, 8131 - 8291

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgt----tgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaat-agacactaaatttttgtctat	306	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8131	cttcagatgcttcaagcttacttcttgtacgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacatgtgctttaaaagagacactaaatttttgtctat	8230	T

Q	307	ggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8231	ggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatctgattgacaatttttaataccttgttat	8291	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 41 - 111

Target Start/End: Original strand, 5775 - 5845

Alignment:

Q	41	tgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatga	111	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	5775	tgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatga	5845	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 6)

Name: scaffold0005

Description:

Target: scaffold0005; HSP #1

Raw Score: 92; E-Value: 2e-44

Query Start/End: Original strand, 126 - 379

Target Start/End: Original strand, 212573 - 212822

Alignment:

Q	126	tgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgctt	223	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|
T	212573	tgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgttt	212672	T

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaa	323	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \| \|\|
T	212673	caagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctatggtcatgtacacctaaa	212766	T

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	212767	caaatattagcatatccaattgacaattcttaataccttgttatcatcaaaactct	212822	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 199 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 6019 - 5844

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|
T	6019	tcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccaggtccta------ataatgattccaaatt	5926	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5925	tttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	5844	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 61605 - 61728

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	61605	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcagtaaccaattgacaattttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaa	61704	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	61705	aacacattttgttccaacaatctc	61728	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 388

Target Start/End: Complemental strand, 245971 - 245876

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggatta	388	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	245971	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaagttcttaagaatta	245876	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 3953 - 4063

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	3953	tggtcctgtacacttgaacatttattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattatgaaaaacattt	4052	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4053	tgttccaacaa	4063	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 246133 - 246087

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	246133	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	246087	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)

Name: scaffold0269

Description:

Target: scaffold0269; HSP #1

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 7696 - 7817

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	7696	tttgtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggtttattgttaaa	7795	T

Q	397	cacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7796	cacattttgttccaacaatctc	7817	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 5)

Name: scaffold0217

Description:

Target: scaffold0217; HSP #1

Raw Score: 90; E-Value: 3e-43

Query Start/End: Original strand, 212 - 413

Target Start/End: Original strand, 19342 - 19537

Alignment:

Q	212	cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtct	311	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	19342	cttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtttatggtcc	19435	T

Q	312	tgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaa	411	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19436	tctacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggataatgttaaacacattttgttccaa	19535	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 296 - 414

Target Start/End: Original strand, 9950 - 10071

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|
T	9950	tttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcacatccaattgataatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgc	10049	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10050	taaacacattttgttccaacaa	10071	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 21843 - 21723

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|
T	21843	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcttacaaactctttagagttattgc	21744	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21743	taaacacattttgttccaaca	21723	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 296 - 342

Target Start/End: Complemental strand, 6659 - 6613

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaa	342	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6659	ttttagtctatggtcttgcacacgtgaacatttattagcatatccaa	6613	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #5

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 21988 - 21951

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21988	tgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcactt	21951	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)

Name: scaffold0210

Description:

Target: scaffold0210; HSP #1

Raw Score: 89; E-Value: 1e-42

Query Start/End: Original strand, 155 - 404

Target Start/End: Original strand, 1878 - 2124

Alignment:

Q	155	tgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgc	251	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|
T	1878	tgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcattttagtcttcaggagcacttctctgcagatgctttaagcttcctttttattgattcctttgc	1977	T

Q	252	tctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatt	351	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	1978	tctcttttgttcttccaggacctat---ttaagttgcca--aattttttgtctatggtcttgtacact-gaacaaatattagcatatccagatgacaatt	2071	T

Q	352	tttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2072	tttaataccttgttatcatcaaaactcttaaaaggtaatgttaaacacatttt	2124	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Original strand, 1803 - 1876

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1803	ttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	1876	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)

Name: scaffold0382

Description:

Target: scaffold0382; HSP #1

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 10981 - 10859

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	10981	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	10882	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10881	acacattttgttccaacaatctc	10859	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)

Name: scaffold0249

Description:

Target: scaffold0249; HSP #1

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 17499 - 17371

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	17499	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattat	17400	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17399	tgctaaacacattttgtttcaacaatctc	17371	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 17661 - 17625

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17661	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	17625	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)

Name: scaffold0176

Description:

Target: scaffold0176; HSP #1

Raw Score: 87; E-Value: 2e-41

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 9566 - 9694

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag---gattag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	9566	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgtaatcatcaaaactcttaagagttattat	9665	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9666	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	9694	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)

Name: scaffold0488

Description:

Target: scaffold0488; HSP #1

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11328 - 11212

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	11328	ttttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaaattttaatactttgctatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaa	11229	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	11228	cacattttgtttcaaca	11212	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)

Name: scaffold0471

Description:

Target: scaffold0471; HSP #1

Raw Score: 85; E-Value: 3e-40

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 3720 - 3840

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	3720	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaatactttgttatcatcaaaactcctaaggattaacgt	3819	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3820	taaacacattttattccaaca	3840	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 146 - 193

Target Start/End: Original strand, 3558 - 3605

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	3558	tgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	3605	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)

Name: scaffold0479

Description:

Target: scaffold0479; HSP #1

Raw Score: 83; E-Value: 4e-39

Query Start/End: Original strand, 199 - 413

Target Start/End: Original strand, 10230 - 10440

Alignment:

Q	199	tcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatt	297	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|
T	10230	tcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttattgattctttagatctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca--aattt	10324	T

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaac	397	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10325	tttgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcaaatccaattgaaaatatttaataccttgttatcatcaaaactcttaaagggtaatgttaaac	10424	T

Q	398	acattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10425	agattttgttccaaca	10440	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Original strand, 10193 - 10230

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10193	tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	10230	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #3

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 34 - 106

Target Start/End: Original strand, 10112 - 10184

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttct	106	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	10112	ttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcaacttct	10184	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)

Name: scaffold0622

Description:

Target: scaffold0622; HSP #1

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 223 - 413

Target Start/End: Original strand, 2963 - 3153

Alignment:

Q	223	tcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaa--atagacactaaa--tttttgtctatggtcttgcacac	318	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2963	tcaagcttccattttgtagattcacttgctctcatttgttcttc-agaacctatgctttattcaaagacactcaaattttttgtctatggtcttgcacac	3061	T

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3062	ttgaagaaatattagcatatccaattga-tatttttaataccttgttatcatcaaaactcataggg--tactgttaaacacattttgttccaaca	3153	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2

Raw Score: 45; E-Value: 2e-16

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1629 - 1511

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	1629	taaatttttgtttatggttctgctcactttaacaattattagaatatccaattaac--tttttaatatcttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaat	1534	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1533	gttaaacacattttgttccaaca	1511	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)

Name: scaffold0227

Description:

Target: scaffold0227; HSP #1

Raw Score: 82; E-Value: 2e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 23043 - 23168

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	23043	aaatttttgtctatggtcatgtacactttaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaatacctttttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	23142	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23143	taaacatattttgttccaacaatctc	23168	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 22819 - 22878

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22819	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	22878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1782 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)

Name: scaffold1782

Description:

Target: scaffold1782; HSP #1

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 305 - 413

Target Start/End: Original strand, 736 - 843

Alignment:

Q	305	atggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatttt	404	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	736	atggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctaaagg-gtaatgttaaacacatttt	834	T

Q	405	gttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	835	attccaaca	843	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1782; HSP #2

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 731 - 633

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	731	acacttgaacaaatattaacatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttgaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	633	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)

Name: scaffold0337

Description:

Target: scaffold0337; HSP #1

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 15044 - 15164

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	15044	aaatttgtgtctatggtcatgtacacttgaacaaatattagcgtattcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgt	15143	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15144	taaacacattttgttccaaca	15164	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 340 - 409

Target Start/End: Original strand, 1291 - 1360

Alignment:

Q	340	caattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttcc	409	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1291	caattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactctcaaaagttaatgttaaacacattttgttcc	1360	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #3

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 14791 - 14836

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	14791	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	14836	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)

Name: scaffold0003

Description:

Target: scaffold0003; HSP #1

Raw Score: 81; E-Value: 7e-38

Query Start/End: Original strand, 297 - 417

Target Start/End: Complemental strand, 89796 - 89676

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	89796	ttttgtctatgatcctgtacactttaacaaatattagcatatctaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaaggttaatgttaaa	89697	T

Q	397	cacattttgttccaacaatct	417	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	89696	catattttgttccaacaatct	89676	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 224 - 377

Target Start/End: Original strand, 1039 - 1194

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactt--taaatagacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1039	caagcatcctttttgtagattacattgctcttatttgttcttccagaacctatgcttgatttaaagacactcaattttttgtctatggttctgcacactt	1138	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1139	gaacaaatattagcatattcaattga-tatttttaataccttattatcatcaaaact	1194	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 292 - 368

Target Start/End: Original strand, 11598 - 11672

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatc	368	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11598	taaattttagtctatggtcttgcatacttgaacaaatactagcatattcaattg--aacttttaataccttgttatc	11672	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)

Name: scaffold0388

Description:

Target: scaffold0388; HSP #1

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 246 - 413

Target Start/End: Original strand, 4752 - 4919

Alignment:

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac--taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	4752	cattgctctcatttgttcttccagaacctatacttgaattaaagacgttaaacttttgtcaatagtcctgcacacttgaacaaatattagcatatctaat	4851	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	4852	tgacaatttttaataccttgttattattaaaactc--aaagggtaatgttaaacacattttgctccaaca	4919	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008

Query Start/End: Original strand, 292 - 377

Target Start/End: Original strand, 5732 - 5815

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5732	taaattttagtctatggtcctgcacaattaaataaatattagtatgtccaattgaaa--ttttaatatcttgttatcatcaaaact	5815	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)

Name: scaffold0207

Description:

Target: scaffold0207; HSP #1

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 299 - 418

Target Start/End: Original strand, 21027 - 21151

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattag----tgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	21027	ttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagttattgct	21126	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21127	gaacacattttgttccaacaatctc	21151	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 299 - 390

Target Start/End: Original strand, 11127 - 11219

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11127	ttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgttcaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagt	11219	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)

Name: scaffold0065

Description:

Target: scaffold0065; HSP #1

Raw Score: 80; E-Value: 3e-37

Query Start/End: Original strand, 147 - 413

Target Start/End: Original strand, 1944 - 2206

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatt	244	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1944	gcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacactttaagcttcatttttgttgatt	2043	T

Q	245	tcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt	344	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|
T	2044	ccttcgctctcttttgttcttccagaac--ataat---aat-gatttcaaatttatgtctatggtcatatacacttgaacaaatattagcgtatacaatt	2137	T

Q	345	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2138	gacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	2206	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Original strand, 1833 - 1878

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1833	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	1878	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)

Name: scaffold0414

Description:

Target: scaffold0414; HSP #1

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 6864 - 6736

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	6864	aaatatttgtctatagttatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatacttttttatcatcaaaactcttaagggttattat	6765	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6764	tgctaaacacattttgttccaacaatctc	6736	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 2867 - 2976

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2867	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattatgaaacacattt	2966	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2967	tgttccaaca	2976	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)

Name: scaffold0185

Description:

Target: scaffold0185; HSP #1

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 9703 - 9825

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	9703	tttgtctatggtcctgtacacttaaacaaatattagcaatatccaattgacaattttgaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	9802	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9803	acacattttgttccaacaatctc	9825	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 3)

Name: scaffold0028

Description:

Target: scaffold0028; HSP #1

Raw Score: 79; E-Value: 1e-36

Query Start/End: Original strand, 328 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 5303 - 5213

Alignment:

Q	328	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5303	tattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgataaacacattttgttccaacaatctc	5213	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 15131 - 15240

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15131	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	15230	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15231	tgttccaaca	15240	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 53833 - 53724

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53833	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttttataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	53734	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53733	tgttccaaca	53724	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)

Name: scaffold0324

Description:

Target: scaffold0324; HSP #1

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Original strand, 10331 - 10440

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10331	tatggtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattt	10430	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10431	tgttccaaca	10440	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 27 - 112

Target Start/End: Original strand, 10091 - 10177

Alignment:

Q	27	tgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacaacc-tttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctgatgaa	112	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	10091	tgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctgatgaacttcagcttctggtgaa	10177	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)

Name: scaffold0069

Description:

Target: scaffold0069; HSP #1

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 299 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4944

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|
T	5067	ttgtctatagtcttgtacacttgaacaaatattaacgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgctaa	4968	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4967	acaaattttgttccaacaatctct	4944	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)

Name: scaffold0007

Description:

Target: scaffold0007; HSP #1

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 143473 - 143598

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|
T	143473	aaatttttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcatatctaattggcaatttttaataccttgttatcatcaagaatcttaaagggtaatgt	143572	T

Q	393	taaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	143573	taaatacattttgttccaacaatctc	143598	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 58991 - 58869

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	58991	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	58892	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	58891	aaacattttattccaacaatctc	58869	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 319 - 354

Target Start/End: Complemental strand, 21747 - 21712

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt	354	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21747	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttt	21712	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 6)

Name: scaffold0002

Description:

Target: scaffold0002; HSP #1

Raw Score: 78; E-Value: 4e-36

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 481497 - 481380

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	481497	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattttaaa	481398	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	481397	acacattttgttccaaca	481380	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 299 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 156337 - 156220

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	156337	ttgtctttggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaaa	156238	T

Q	397	cacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	156237	catattttgttccaacaa	156220	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 292 - 376

Target Start/End: Original strand, 112562 - 112644

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	112562	taaaattttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaac	112644	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 117678 - 117787

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	117678	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	117777	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	117778	tgttccaaca	117787	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 300 - 376

Target Start/End: Original strand, 116178 - 116252

Alignment:

Q	300	tgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	116178	tgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aatttttaatatcttgttatcatcaaaac	116252	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 347321 - 347212

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	347321	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacagattt	347222	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	347221	tgttccaaca	347212	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)

Name: scaffold1331

Description:

Target: scaffold1331; HSP #1

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 297 - 405

Target Start/End: Complemental strand, 335 - 227

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	335	ttttgtctatagttctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaa	236	T

Q	397	cacattttg	405	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	235	cacattttg	227	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)

Name: scaffold0908

Description:

Target: scaffold0908; HSP #1

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 302 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 3590 - 3478

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3590	tctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcaatgtacaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggtttattgttaaacaca	3491	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3490	ttttgttccaaca	3478	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)

Name: scaffold0132

Description:

Target: scaffold0132; HSP #1

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 304 - 419

Target Start/End: Complemental strand, 37761 - 37645

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacatt	402	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|
T	37761	tatggtcctgtacacttgaacaaatattagcagtgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaaggtttattgtaaaacatatt	37662	T

Q	403	ttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	37661	ttgttccaacaatctct	37645	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)

Name: scaffold0011

Description:

Target: scaffold0011; HSP #1

Raw Score: 77; E-Value: 2e-35

Query Start/End: Original strand, 293 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 65153 - 65030

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	65153	aaatttttgtctatagtcttgtatacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcattaaaactcgtaaggattattat	65054	T

Q	393	t--aaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	65053	tgctaacacattttgttccaacaa	65030	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 135120 - 134993

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	135120	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattaggatatccaattgacaatttttaatactttgttatgatcaaaactcttaaggatttttat	135021	T

Q	393	t--aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	135020	tgctaacacattttcttccaacaatctc	134993	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 292 - 418

Target Start/End: Original strand, 59915 - 60039

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	59915	taaatttttatctatggtcctgtacacttgaagaaatattaacatattcaattgaca-tttttaataccttgttatcatcaaaactc-aaagtggtatta	60012	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	60013	ttaaacacattatgttccaacaatctc	60039	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 299 - 408

Target Start/End: Complemental strand, 516 - 408

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaaca	398	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	516	ttgtatatggtcctgcatacttgaagaaatat-agcatatccatctgactatttttaatacattcttatcatcaaaagtctcaagagataatgttaaaca	418	T

Q	399	cattttgttc	408	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	417	aattttgttc	408	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)

Name: scaffold0074

Description:

Target: scaffold0074; HSP #1

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 31997 - 32116

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\|
T	31997	taaatttttgtctatgatcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaact-taaagtgataatg	32093	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32094	ttaaacacattttgttccaacaa	32116	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)

Name: scaffold0023

Description:

Target: scaffold0023; HSP #1

Raw Score: 76; E-Value: 6e-35

Query Start/End: Original strand, 163 - 414

Target Start/End: Original strand, 103812 - 104060

Alignment:

Q	163	cttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaa--catcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgttt	259	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	103812	cttctgatgacgtcatcactttagtagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagcttcctatttgttgattcatttgctctctttt	103911	T

Q	260	gttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatac	359	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	103912	gttctttcagaaccttt---ttaagatgtca---aatttttgtctaaggtcctgtacacttgaaaaaatattagcatatccaattgtcattttttaatac	104005	T

Q	360	cttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	104006	cttgttattatcaaaacttttaaaggataatgttaaacacatttggttccaacaa	104060	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 43 - 107

Target Start/End: Original strand, 103724 - 103788

Alignment:

Q	43	attaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	103724	attaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg	103788	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1709 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold1709

Description:

Target: scaffold1709; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 315 - 405

Target Start/End: Original strand, 4 - 94

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttg	405	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaagagttaatgttaaacacattttg	94	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold0752

Description:

Target: scaffold0752; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 2415 - 2529

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2415	tggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacattt	2514	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2515	tgttccaacaatctc	2529	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold0739

Description:

Target: scaffold0739; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 2566 - 2688

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	2566	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	2665	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2666	atacattttgttccaacaatctc	2688	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold0547

Description:

Target: scaffold0547; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 1275 - 1397

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	1275	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	1374	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1375	acacattttattccaacaatctc	1397	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)

Name: scaffold0473

Description:

Target: scaffold0473; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 2450 - 2326

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	2450	ttttgtctatagttctgtacacttgaacaaatataagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattattattgct	2351	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	2350	aaacacattttgttccaataatctc	2326	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 147 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 2598 - 2552

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	2598	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	2552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold0352

Description:

Target: scaffold0352; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 556 - 432

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---atta	388	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	556	taaaattttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaaggattatta	457	T

Q	389	gtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	456	ttgttagatacattttgttccaaca	432	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)

Name: scaffold0151

Description:

Target: scaffold0151; HSP #1

Raw Score: 75; E-Value: 3e-34

Query Start/End: Original strand, 297 - 418

Target Start/End: Original strand, 11782 - 11906

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|
T	11782	ttttgtttatagtcttgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttatttttgct	11881	T

Q	394	aaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11882	aaacacattttgttccaacaatctc	11906	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)

Name: scaffold0527

Description:

Target: scaffold0527; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 254 - 377

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	254	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatttttttatcatcaaaactcttaaggattattat	353	T

Q	393	ta---aacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	354	tgctgaacacattttgttccaaca	377	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 8317 - 8440

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	8317	aaatttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaatatttttttatcatcaaaactcttaaggattattat	8416	T

Q	393	ta---aacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8417	tgctgaacacattttgttccaaca	8440	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4019 - 3910

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4019	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	3920	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3919	tgttccaaca	3910	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)

Name: scaffold0280

Description:

Target: scaffold0280; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17510 - 17393

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17510	tttgtctatggtcctgtacacttaaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	17411	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	17410	acacattttattccaaca	17393	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)

Name: scaffold0275

Description:

Target: scaffold0275; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 8658 - 8781

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	8658	aaatttttgtctatagtcctgtacacttgaataaatattagcatatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatat	8757	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8758	tgctaatcacattttgttccaaca	8781	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)

Name: scaffold0193

Description:

Target: scaffold0193; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 16164 - 16285

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtg	391	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|
T	16164	aaatttttgtctatggtcttgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaattttttaatactcagttatcatcaaaactctgaaagtgtaatg	16263	T

Q	392	ttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16264	ttaaacaaattttgttccaaca	16285	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)

Name: scaffold0090

Description:

Target: scaffold0090; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 1200 - 1317

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	1200	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaattttaaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	1299	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1300	acacattttgttccaaca	1317	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 5580 - 5697

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	5580	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaattttaaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	5679	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5680	acacattttgttccaaca	5697	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)

Name: scaffold0045

Description:

Target: scaffold0045; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 87324 - 87205

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|
T	87324	ttttgtctatagtcatgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttattattgct	87225	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	87224	aaacatattttgttccaaca	87205	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 5)

Name: scaffold0012

Description:

Target: scaffold0012; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7320 - 7203

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	7320	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	7221	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7220	acacattttgttccaaca	7203	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 141377 - 141496

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	141377	tttgactatggtcctgtacacttgaacaactattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	141476	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	141477	atacattttgttccaacaat	141496	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 128201 - 128323

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	128201	tttgactatggtcatgtacacttgaacaactattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcgaaactcattaaggtttattgtgaa	128300	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	128301	atacattttgttccaacaatctc	128323	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 297 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 215205 - 215127

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	215205	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccatttaaaaaattttaataccttattgtcatcaaaa	215127	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 64555 - 64446

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	64555	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaattttttatactttgttttcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	64456	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	64455	tgttccaaca	64446	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)

Name: scaffold0010

Description:

Target: scaffold0010; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 1e-33

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 117676 - 117793

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	117676	tttgtctatggtcctatacacttgaacaaatattagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	117775	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	117776	agacattttgttccaaca	117793	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 224274 - 224165

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	224274	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	224175	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	224174	tgttccaaca	224165	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)

Name: scaffold0655

Description:

Target: scaffold0655; HSP #1

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Original strand, 5517 - 5633

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	5517	ttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcagtatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaaa	5616	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5617	catattttgttccaaca	5633	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 8587 - 8477

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8587	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8488	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8487	tgttccaacaa	8477	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)

Name: scaffold0452

Description:

Target: scaffold0452; HSP #1

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1592 - 1476

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|
T	1592	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataacttattagcatcagaactcttaagggttaatgctaaa	1493	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	1492	cacattttattccaaca	1476	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)

Name: scaffold0251

Description:

Target: scaffold0251; HSP #1

Raw Score: 73; E-Value: 4e-33

Query Start/End: Original strand, 297 - 413

Target Start/End: Original strand, 8076 - 8192

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaa	396	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	8076	ttttgtctatgatcctgtacacttgaacaaatattagcatatctaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactttcaaagggtaatgttaaa	8175	T

Q	397	cacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	8176	cacattttcttccaaca	8192	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 7846 - 7905

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	7846	ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	7905	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold1321

Description:

Target: scaffold1321; HSP #1

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 635 - 516

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	635	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatactagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	536	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	535	acatattttgttccaacaat	516	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold1263

Description:

Target: scaffold1263; HSP #1

Raw Score: 72; E-Value: 2e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 828 - 709

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	828	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatactagcaatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	729	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	728	acatattttgttccaacaat	709	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0607

Description:

Target: scaffold0607; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 293 - 418

Target Start/End: Original strand, 7299 - 7426

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaag---gattag	389	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	7299	aaatttttgtctatagtcctgtaaacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-ttttaatactttgttatcatcaaaactcttaagcattattat	7397	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7398	tgctaaacatattttgttccaacaatctc	7426	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0544

Description:

Target: scaffold0544; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9605 - 9483

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	9605	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattatcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	9506	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9505	acacattttgttccaacaatctc	9483	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0497

Description:

Target: scaffold0497; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9848

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	9970	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	9871	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9870	agacattttgttccaacaatctc	9848	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0410

Description:

Target: scaffold0410; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 7113 - 7235

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	7113	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaaaaaccaattgagaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	7212	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7213	acacattttgttccaacaatctc	7235	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0297

Description:

Target: scaffold0297; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 17376 - 17498

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt-taa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	17376	tttgtctatggtcctatatacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaaggcttattgtaaaa	17475	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17476	acacattttgttccaacaatctc	17498	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)

Name: scaffold0171

Description:

Target: scaffold0171; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 146 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 27316 - 27052

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacat-caggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgat	243	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	27316	tgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgccttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgat	27217	T

Q	244	ttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaat	343	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	27216	tcctttgctctcttttgttatttcagaacctat---ttaa---gatgttagatatttttctatggtcctgtacacttgaacaaatataatcatattcaat	27123	T

Q	344	tgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|
T	27122	tgacagtttttaataccttgctgtcatcaaaattcttagagggtaatgttaaacacattttgttctaacaa	27052	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 27397 - 27324

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	27397	ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcatctg	27324	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0113

Description:

Target: scaffold0113; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 324 - 414

Target Start/End: Original strand, 3160 - 3250

Alignment:

Q	324	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3160	caaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactctcaaagggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	3250	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)

Name: scaffold0063

Description:

Target: scaffold0063; HSP #1

Raw Score: 71; E-Value: 6e-32

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 15440 - 15562

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	15440	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattcaggtttattgtgaa	15539	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15540	atacattttgttccaacaatctc	15562	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1898 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)

Name: scaffold1898

Description:

Target: scaffold1898; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1108

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt-taa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	1225	tttgtctatggtcctgtatacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactattaaggtttattgtaaaa	1126	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1125	acacattttgttccaaca	1108	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)

Name: scaffold0758

Description:

Target: scaffold0758; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 292 - 414

Target Start/End: Original strand, 4626 - 4745

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|
T	4626	taaattttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtgacaat	4721	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4722	gttaaacacattttgttccaacaa	4745	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)

Name: scaffold0490

Description:

Target: scaffold0490; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 224 - 415

Target Start/End: Original strand, 7637 - 7828

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacac---taaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7637	caagcttcctttttgtaaattctattgccctcatttgttctttcagaactcatacttgaattaaatacttataaatttttgtcaatggtcctgcacactt	7736	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7737	aaacaaatattagcatatccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaacttaagatga-taatgttaaacacattttgttccaacaat	7828	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)

Name: scaffold0485

Description:

Target: scaffold0485; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 220 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9171 - 8985

Alignment:

Q	220	gcttcaagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacact	319	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|
T	9171	gcttcaagcttcctt-ttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctat---ttaagatgtca---aatttttttctacgatcctgtacact	9079	T

Q	320	tgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9078	tgaacaaatattaccatatccagttgacaatttttaatatcttgttatcaccaaaactctgaaagggtaatgttaaacacattttgttccaaca	8985	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 148 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 9262 - 9217

Alignment:

Q	148	cttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	9262	cttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact	9217	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)

Name: scaffold0407

Description:

Target: scaffold0407; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 2e-31

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 11798 - 11681

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	11798	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaa	11699	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11698	acacattttgttccaaca	11681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 15624 - 15512

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	15624	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacaca	15525	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15524	ttttgttccaaca	15512	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)

Name: scaffold0351

Description:

Target: scaffold0351; HSP #1

Raw Score: 69; E-Value: 1e-30

Query Start/End: Original strand, 242 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 9083 - 8911

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9083	atttcattgctctcttttgttctttcagaaccaatactttgatttaagacttataaaattttgtctatgttcctgcacacttgaacaaatattagcatat	8984	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8983	ctaattgac--tttttaataccttgttatcatcaaaa--cataaggtggtaatgttaaacacattttgttccaacaa	8911	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 318 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 18377 - 18280

Alignment:

Q	318	cttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18377	cttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcatatcttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	18280	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)

Name: scaffold0211

Description:

Target: scaffold0211; HSP #1

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 27779 - 27681

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27779	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttaacatcaaaactctcaaagggtaatgtt-aacacattttgttccaacaa	27681	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 299 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 15309 - 15187

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|
T	15309	ttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcttatccaatttacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaggggttaatattgctaa	15210	T

Q	396	acacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15209	acacattttgttccaacaatctc	15187	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 3)

Name: scaffold0201

Description:

Target: scaffold0201; HSP #1

Raw Score: 68; E-Value: 4e-30

Query Start/End: Original strand, 224 - 415

Target Start/End: Original strand, 19359 - 19552

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacact-aaatttttgtctatggtcttgcacactt	320	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|
T	19359	caagcttcctttttgtagattcaatttctctcatttgttcttccataacctatgcttcatttaaagacacttaaatttgtgtctatggtcctacacactt	19458	T

Q	321	gaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19459	gaacaaatattagcatatccaattggcattttttaatactttgttatcataaaaactc-aaagtggtattgtcaaacacattttcttccaacaat	19552	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 7252 - 7361

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7252	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaatgtttattgtgaaacacattt	7351	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7352	tgttccaaca	7361	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #3

Raw Score: 52; E-Value: 1e-20

Query Start/End: Original strand, 298 - 407

Target Start/End: Original strand, 7803 - 7914

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	7803	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaatagccaattgataatttttaataccttgttatcatcaaaacttactaaggtttattgtgaa	7902	T

Q	396	acacattttgtt	407	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7903	acacattttgtt	7914	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)

Name: scaffold0272

Description:

Target: scaffold0272; HSP #1

Raw Score: 67; E-Value: 2e-29

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 12978 - 12864

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12978	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	12879	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12878	tgttccaacaatctc	12864	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 13283 - 13210

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13283	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgaaaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	13210	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)

Name: scaffold0080

Description:

Target: scaffold0080; HSP #1

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 16622 - 16739

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	16622	tttgcctatggtcctgtacacttgaccaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcattaaaactcattaaggtttattgtaaa	16721	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16722	acacattttgttccaaca	16739	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)

Name: scaffold0078

Description:

Target: scaffold0078; HSP #1

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 224 - 378

Target Start/End: Complemental strand, 31565 - 31410

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31565	caagcttcctttttgtagtttccattgc-ctcttttgtttttctagaacctatgcttgaattaaagatattaaagttttgtctatggtcctgcacactta	31467	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc	378	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31466	aacaaatattagcatatccaattgctaatttttaataacttgttatcatcaaaactc	31410	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)

Name: scaffold0017

Description:

Target: scaffold0017; HSP #1

Raw Score: 66; E-Value: 6e-29

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 40017 - 39901

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	40017	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatc-aaactcattaaggtttattgtaaa	39919	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	39918	acacattttgttccaaca	39901	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 304 - 413

Target Start/End: Original strand, 180817 - 180928

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	180817	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacat	180916	T

Q	402	tttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	180917	tttgttccaaca	180928	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 304 - 417

Target Start/End: Original strand, 175905 - 176020

Alignment:

Q	304	tatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	175905	tatggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaatacctttttatcataaaaactcattaaggtttattgtgaaacacat	176004	T

Q	402	tttgttccaacaatct	417	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	176005	tttgttccaacaatct	176020	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)

Name: scaffold0226

Description:

Target: scaffold0226; HSP #1

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 306 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 18893 - 18781

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18893	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	18794	T

Q	404	tgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18793	tgttccaacaatc	18781	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 306 - 416

Target Start/End: Complemental strand, 28287 - 28175

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28287	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaattaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaacacattt	28188	T

Q	404	tgttccaacaatc	416	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28187	tgttccaacaatc	28175	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 6)

Name: scaffold0084

Description:

Target: scaffold0084; HSP #1

Raw Score: 65; E-Value: 2e-28

Query Start/End: Original strand, 293 - 413

Target Start/End: Original strand, 49700 - 49820

Alignment:

Q	293	aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgt	392	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|
T	49700	aaatttttttctatggtcatgtacacttgaacaaaaattagcatatccaattgacaattttcaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgt	49799	T

Q	393	taaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49800	taaacttattttgttccaaca	49820	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 56456 - 56347

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56456	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaattccttgttatcattaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattt	56357	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	56356	tgttccaaca	56347	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 348 - 419

Target Start/End: Original strand, 32856 - 32927

Alignment:

Q	348	aatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctct	419	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	32856	aatttttaataccttgttatcatcaaaaccttcaaagggtaatgttaaacacattttgttctaacaatctct	32927	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 32628 - 32687

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	32628	ttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg	32687	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 34 - 93

Target Start/End: Original strand, 49475 - 49534

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatg	93	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	49475	ttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctgatg	49534	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 225 - 269

Target Start/End: Original strand, 49638 - 49682

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccag	269	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	49638	aagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccag	49682	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)

Name: scaffold0522

Description:

Target: scaffold0522; HSP #1

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 295 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 11273 - 11193

Alignment:

Q	295	atttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11273	atttttgtcaatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaact	11193	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522; HSP #2

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 292 - 415

Target Start/End: Complemental strand, 3993 - 3873

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggat--tag	389	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|
T	3993	taaatgtttgtcaatagtcctgcacacttgaacaaatattagcatattcaattgaca--ttttaataccttgttatcatcaaaa--cttaa-gatggtaa	3899	T

Q	390	tgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3898	tgttaaacacattttgttccaacaat	3873	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)

Name: scaffold0422

Description:

Target: scaffold0422; HSP #1

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 298 - 418

Target Start/End: Original strand, 12135 - 12258

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgt-ta	394	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	12135	tttgtctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtaaa	12234	T

Q	395	aacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	12235	aaaacattttgttccaataatctc	12258	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)

Name: scaffold0216

Description:

Target: scaffold0216; HSP #1

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 299 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 29983 - 29866

Alignment:

Q	299	ttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|
T	29983	ttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaggggttaatattgctaa	29884	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29883	acacattttgttccaaca	29866	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 528 - 628

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	528	acacttgaacaattattagcaatagccaattgacaattttgaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattttgttccaac	627	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	628	a	628	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 3)

Name: scaffold0037

Description:

Target: scaffold0037; HSP #1

Raw Score: 64; E-Value: 9e-28

Query Start/End: Original strand, 297 - 411

Target Start/End: Original strand, 87283 - 87396

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|
T	87283	ttttgtctatggccctgcacagttgaacaaatattagcatatccaattgac-atttttaataccttgttatcatcaaaac-ctaaaggtggtaatgttaa	87380	T

Q	396	acacattttgttccaa	411	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	87381	acacattttgttccaa	87396	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 329 - 413

Target Start/End: Original strand, 86937 - 87019

Alignment:

Q	329	attagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	86937	attagcatattcaattgacaatttttaataccattttatcatcaaaaatcaaatgg--taatgttaaacacattttgttccaaca	87019	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 224 - 333

Target Start/End: Original strand, 78756 - 78864

Alignment:

Q	224	caagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttt-tgtctatggtcttgcacacttga	322	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|
T	78756	caagcttccttttagaggattccattgctctcatttgttcttc-agaacctatgcttaata-agacactaatttttttgtctatggtccttcacacttca	78853	T

Q	323	acaaatattag	333	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	78854	acaaatattag	78864	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)

Name: scaffold0261

Description:

Target: scaffold0261; HSP #1

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 147 - 379

Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5596

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaaacatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagcttccttcttgttgattt	245	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5823	gcttctgatgaacttacttctgaagacgtcattactttagaagcacttcacttcatgagcacttttcttcagatgcttcaaacttcctttttgttgattc	5724	T

Q	246	cattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg	345	Q
		\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5723	cttagctctcttttgttcttccagaaccta------ataaagatatcaaatttttgtgtatggttctgtacacttgaacaaatgttggcaaatccaattg	5630	T

Q	346	acaatttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5629	acatcttttagtaccttgttatcatcaaaactct	5596	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 9128 - 9019

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9128	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	9029	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9028	tgttccaaca	9019	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)

Name: scaffold0154

Description:

Target: scaffold0154; HSP #1

Raw Score: 63; E-Value: 4e-27

Query Start/End: Original strand, 298 - 414

Target Start/End: Original strand, 36110 - 36228

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	36110	tttgcctatggtcctgtacacttgaaaaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	36209	T

Q	396	acacattttgttccaacaa	414	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	36210	atacattttgtttcaacaa	36228	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)

Name: scaffold1102

Description:

Target: scaffold1102; HSP #1

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 2777 - 2660

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	2777	tttgcctatggtcctgtacacttgaaaaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcttcaaaactcattaaggtttattgtgaa	2678	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2677	acacattttgttccaaca	2660	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)

Name: scaffold0774

Description:

Target: scaffold0774; HSP #1

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6047 - 5930

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	6047	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatatcttgtcatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	5948	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	5947	acacattttcttccaaca	5930	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)

Name: scaffold0073

Description:

Target: scaffold0073; HSP #1

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 303 - 418

Target Start/End: Original strand, 58863 - 58979

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	58863	ctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttt-aataccttgttatcatcaaaactcatccaggtttattgtaaaacaca	58961	T

Q	401	ttttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	58962	ttttgttccaacaatctc	58979	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)

Name: scaffold0016

Description:

Target: scaffold0016; HSP #1

Raw Score: 62; E-Value: 1e-26

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 163699 - 163816

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	163699	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaaaaaccaattgacaatttttagtaccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaa	163798	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	163799	acacattttgttccaaca	163816	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 315 - 413

Target Start/End: Original strand, 5 - 105

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5	acacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaaatcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	104	T

Q	413	a	413	Q
		\|
T	105	a	105	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 315 - 374

Target Start/End: Original strand, 3269 - 3328

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaa	374	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3269	acacttgaagaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaa	3328	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)

Name: scaffold0738

Description:

Target: scaffold0738; HSP #1

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 339 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 4338 - 4258

Alignment:

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4338	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtaaaacacattttgttccaacaatctc	4258	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)

Name: scaffold0177

Description:

Target: scaffold0177; HSP #1

Raw Score: 61; E-Value: 6e-26

Query Start/End: Original strand, 319 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 20089 - 19987

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg---attagtgttaaacacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20089	ttgaacaaatattagcgtatccaattggaaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagggttattattgctaaacacattttgttccaacaat	19990	T

Q	416	ctc	418	Q
		\|\|\|
T	19989	ctc	19987	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0772

Description:

Target: scaffold0772; HSP #1

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 225 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 689 - 501

Alignment:

Q	225	aagcttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaata--gacactaaa-tttttgtctatggtcttgcacacttg	321	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	689	aagcttcctttttataaattacattgctctcttttgttcttccagaacatatacttgaattaacgacatacaactttttatatatgatcctgcacacttg	590	T

Q	322	aacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	589	aacaaatattagcatatgcaattgaca--tattaataccttgttatcatcaaaa--cttaaggtggtaatgttaaacacattttgttccaaca	501	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 150 - 259

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	150	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	249	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	250	tgttccaaca	259	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0771

Description:

Target: scaffold0771; HSP #1

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 133 - 353

Target Start/End: Original strand, 702 - 918

Alignment:

Q	133	gcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcactaa-acatcaggagcccttc-cttcatatgcttcaagctt	230	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	702	gcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcacttctcttcagatgctttaagctt	801	T

Q	231	ccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatat	330	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	802	cctttttgttgattcctttgctctcttttgtttttccagaaccta------ataatgattccaaatttttgtctatggtcctgtacatttgaacaaatat	895	T

Q	331	tagcatatccaattgacaatttt	353	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	896	tagcatatccaattgaaaatttt	918	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 351 - 379

Target Start/End: Original strand, 1266 - 1294

Alignment:

Q	351	ttttaataccttgttatcatcaaaactct	379	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1266	ttttaataccttgttatcatcaaaactct	1294	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0178

Description:

Target: scaffold0178; HSP #1

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 21785 - 21896

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21785	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	21884	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	21885	tgttccaacaat	21896	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178; HSP #2

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 27287 - 27398

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27287	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	27386	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27387	tgttccaacaat	27398	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0050

Description:

Target: scaffold0050; HSP #1

Raw Score: 60; E-Value: 2e-25

Query Start/End: Original strand, 298 - 415

Target Start/End: Original strand, 35591 - 35710

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa-ctcttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\| \|\|
T	35591	tttgtctatggtcatgtacactcgaacaaatattagcaatgtccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaatttattaaagtttattgtaaa	35690	T

Q	396	acacattttgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35691	acacattttgttccaacaat	35710	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 147 - 183

Target Start/End: Original strand, 35442 - 35478

Alignment:

Q	147	gcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	35442	gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt	35478	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)

Name: scaffold0627

Description:

Target: scaffold0627; HSP #1

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 7772 - 7662

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7772	tggtcctgtacacttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	7673	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7672	tgttccaacaa	7662	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)

Name: scaffold0604

Description:

Target: scaffold0604; HSP #1

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 319 - 437

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\|
T	319	tttgcctatggtcctgtacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattatgaa	418	T

Q	396	acacat-tttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	419	atacatctttgttccaaca	437	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0387

Description:

Target: scaffold0387; HSP #1

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 16596 - 16486

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16596	tggtcttgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	16497	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16496	tgttccaacaa	16486	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 319 - 384

Target Start/End: Original strand, 7799 - 7864

Alignment:

Q	319	ttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg	384	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7799	ttgaacaaatattagcgtatccaattgacaatttttaatactttgttatcttcaaaactcttaagg	7864	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)

Name: scaffold0163

Description:

Target: scaffold0163; HSP #1

Raw Score: 59; E-Value: 9e-25

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 36463 - 36365

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36463	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgttaaacacattttgttccaaca	36365	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Original strand, 30040 - 30156

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaa	395	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|
T	30040	tttgcctatggtcctgaacacttgaacaaatattagcaataaccaattgacaatttttaatactgtgttatcatcaaaactcattaaggttta-ttataa	30138	T

Q	396	acacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	30139	acacattttgttccaaca	30156	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2108 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold2108

Description:

Target: scaffold2108; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 161 - 270

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	161	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaatacattt	260	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	261	tgttccaaca	270	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold1204

Description:

Target: scaffold1204; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 2110 - 2001

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2110	tggtcctgtacacttgaacaattattagaaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaattcattaaggtttattgtgaaacacattt	2011	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2010	tgttccaaca	2001	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold0888

Description:

Target: scaffold0888; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 286 - 375

Target Start/End: Complemental strand, 3869 - 3780

Alignment:

Q	286	agacactaaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaa	375	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	3869	agacactaaatttttctctatggtcctacacacttgaacaaatatttgcatatccaattgacattttttaatactttggtatcataaaaa	3780	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold0314

Description:

Target: scaffold0314; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20449 - 20340

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20449	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacattt	20350	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20349	tgttccaaca	20340	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold0267

Description:

Target: scaffold0267; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 5895 - 5786

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5895	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaatagccaattgacaatttttaataccttattatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	5796	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5795	tgttccaaca	5786	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold0072

Description:

Target: scaffold0072; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 36402 - 36301

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36402	acacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	36303	T

Q	413	aa	414	Q
		\|\|
T	36302	aa	36301	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)

Name: scaffold0068

Description:

Target: scaffold0068; HSP #1

Raw Score: 58; E-Value: 4e-24

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 7338

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7447	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaatttacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	7348	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	7347	tgttccaaca	7338	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2

Raw Score: 56; E-Value: 6e-23

Query Start/End: Original strand, 306 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 10311 - 10204

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10311	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	10212	T

Q	404	tgttccaa	411	Q
		\| \|\|\|\|\|\|
T	10211	ttttccaa	10204	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)

Name: scaffold1477

Description:

Target: scaffold1477; HSP #1

Raw Score: 57; E-Value: 1e-23

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1373 - 1261

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	1373	ctatggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttataaagttttattgtgaaacaca	1274	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1273	ttttgttccaaca	1261	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)

Name: scaffold0391

Description:

Target: scaffold0391; HSP #1

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 317 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1901 - 1803

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1901	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtaaaacacattttgttccaaca	1803	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)

Name: scaffold0133

Description:

Target: scaffold0133; HSP #1

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 31680 - 31794

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31680	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	31779	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	31780	tgttccaacaatctc	31794	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 317 - 408

Target Start/End: Complemental strand, 42185 - 42092

Alignment:

Q	317	acttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttc	408	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	42185	acttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcgtcaaaactcactaaggttcattgtgaaacacattttgttc	42092	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)

Name: scaffold0105

Description:

Target: scaffold0105; HSP #1

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 47280 - 47166

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47280	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	47181	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47180	tgttccaacaatctc	47166	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 8529 - 8639

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8529	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	8628	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	8629	tgttccaacaa	8639	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 36646 - 36536

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36646	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	36547	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	36546	tgttccaacaa	36536	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)

Name: scaffold0014

Description:

Target: scaffold0014; HSP #1

Raw Score: 55; E-Value: 2e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 34800 - 34690

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34800	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	34701	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34700	tgttccaacaa	34690	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 348 - 418

Target Start/End: Original strand, 211153 - 211224

Alignment:

Q	348	aatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	211153	aatttttaataccttgttatcttcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattttgttccaacaatctc	211224	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 348 - 418

Target Start/End: Original strand, 217022 - 217093

Alignment:

Q	348	aatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	217022	aatttttaataccttgttatcttcaaaactcattaaggtttattgtgaaacacattttgttccaacaatctc	217093	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1212 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)

Name: scaffold1212

Description:

Target: scaffold1212; HSP #1

Raw Score: 54; E-Value: 9e-22

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 69 - 178

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	69	tggtcctgtacacttgaacaattattagcaataaccaattgacaattttaaataccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtgaaacacattt	168	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	169	tgttccaaca	178	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)

Name: scaffold0498

Description:

Target: scaffold0498; HSP #1

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 292 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 2962

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagt	390	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|
T	3080	taaattttagtttttggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattg--aacttttaatacattgttattatcaaaa--cttaaggtaacaat	2985	T

Q	391	gttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	2984	gtaaaacacattttgttccaaca	2962	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)

Name: scaffold0243

Description:

Target: scaffold0243; HSP #1

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 302 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 4730 - 4615

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4730	tctatggtcctatacacttgaacaaatatcagcatatctaattgacaa-ttttaattccttgttatcattaaaactctcaaagggtaatattaaacacat	4632	T

Q	402	tttgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4631	tttgtttcaacaatctc	4615	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 79

Target Start/End: Complemental strand, 4961 - 4916

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct	79	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4961	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct	4916	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)

Name: scaffold0102

Description:

Target: scaffold0102; HSP #1

Raw Score: 53; E-Value: 3e-21

Query Start/End: Original strand, 303 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 51781 - 51669

Alignment:

Q	303	ctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca	400	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	51781	ctatggtcctgtatactttaacaattattagcaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttattaaggtttattgtgaaataca	51682	T

Q	401	ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	51681	ttttgttccaaca	51669	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)

Name: scaffold0795

Description:

Target: scaffold0795; HSP #1

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Original strand, 157 - 267

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	157	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatatcttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	256	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	257	tgttccaacaa	267	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)

Name: scaffold0747

Description:

Target: scaffold0747; HSP #1

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 418

Target Start/End: Original strand, 3345 - 3459

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3345	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	3444	T

Q	404	tgttccaacaatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	3445	tgttccaacaatctc	3459	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)

Name: scaffold0034

Description:

Target: scaffold0034; HSP #1

Raw Score: 51; E-Value: 5e-20

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 81805 - 81695

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	81805	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	81706	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	81705	tgttccaacaa	81695	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2082 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold2082

Description:

Target: scaffold2082; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 75 - 184

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	75	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	174	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	175	tgttccaaca	184	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1900 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold1900

Description:

Target: scaffold1900; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 315 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1068

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1169	acacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaac	1070	T

Q	413	aa	414	Q
		\|\|
T	1069	aa	1068	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)

Name: scaffold0906

Description:

Target: scaffold0906; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 315 - 418

Target Start/End: Complemental strand, 4197 - 4092

Alignment:

Q	315	acacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattttgttccaac	412	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	4197	acacttgaacaattattagtaataaccatttgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattttgttctaac	4098	T

Q	413	aatctc	418	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	4097	aatctc	4092	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906; HSP #2

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 146 - 183

Target Start/End: Complemental strand, 4349 - 4310

Alignment:

Q	146	tgcttctaatgatctt--gcttctgatgacgtcatcactt	183	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4349	tgcttctaatgatcttctgcttctgatgacgtcatcactt	4310	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0867

Description:

Target: scaffold0867; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 4944 - 4835

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4944	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	4845	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4844	tgttccaaca	4835	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0092

Description:

Target: scaffold0092; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 292 - 376

Target Start/End: Original strand, 8418 - 8500

Alignment:

Q	292	taaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	8418	taaattttagtatatgctcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaatt--aaacttttaataccttgttatcatccaaac	8500	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0027

Description:

Target: scaffold0027; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 6551 - 6442

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6551	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	6452	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	6451	tgttccaaca	6442	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0006

Description:

Target: scaffold0006; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 2e-19

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 154700 - 154591

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	154700	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	154601	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	154600	tgttccaaca	154591	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0570

Description:

Target: scaffold0570; HSP #1

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1272

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa--tttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgtt	393	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|
T	1391	tttgtctatggtcctgtaaacttgaacaaatattagcaatttccaattgacaccttttttaataccttgttatcatcaaaacttattaagttttattgta	1292	T

Q	394	aaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1291	aaacatattttgttccaaca	1272	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 4)

Name: scaffold0043

Description:

Target: scaffold0043; HSP #1

Raw Score: 49; E-Value: 8e-19

Query Start/End: Original strand, 242 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 25486 - 25351

Alignment:

Q	242	atttcattgctctcgtttgttcttccagaacctatactttaaatagacact---aaatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat	338	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	25486	atttcattgctctcgtttgttattccaaaaccaatactttgttttaagacttataaatttttgtctatggtcctgcacacttgaacaaatattaacatac	25387	T

Q	339	ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25386	ctaattg--aactattaatacattgttatcatcaaaac	25351	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2

Raw Score: 47; E-Value: 1e-17

Query Start/End: Original strand, 335 - 401

Target Start/End: Complemental strand, 75998 - 75932

Alignment:

Q	335	atatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaaggattagtgttaaacacat	401	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	75998	atatccaattgaaaattttaaatactttgttatcatcaaaactcttaagggttaatgttaaacacat	75932	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3

Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001

Query Start/End: Original strand, 305 - 376

Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1557

Alignment:

Q	305	atggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1626	atggtcctgtacacgtgaacaaatattagcatattcaattg--aacttttaatacattgttatcatcaaaac	1557	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005

Query Start/End: Original strand, 297 - 339

Target Start/End: Complemental strand, 78089 - 78047

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatc	339	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	78089	ttttgtctatagtcctgtacacttgaacaaatattagcatatc	78047	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)

Name: scaffold0481

Description:

Target: scaffold0481; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 298 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 12507 - 12390

Alignment:

Q	298	tttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagca--tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgtta	394	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|
T	12507	tttgcctatggtcctttacacttgaacaattattatcaattatc-aattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcattaaggtttattgtga	12409	T

Q	395	aacacattttgttccaaca	413	Q
		\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12408	catacattttgttccaaca	12390	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)

Name: scaffold0097

Description:

Target: scaffold0097; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 297 - 367

Target Start/End: Original strand, 45967 - 46038

Alignment:

Q	297	ttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaa-tttttaataccttgttat	367	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	45967	ttttgtctattgtcttgtacacttgaacaaatattagcaaatccaattgacaattttttaataccttattat	46038	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)

Name: scaffold0077

Description:

Target: scaffold0077; HSP #1

Raw Score: 48; E-Value: 3e-18

Query Start/End: Original strand, 306 - 411

Target Start/End: Complemental strand, 34835 - 34728

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	34835	tggtcctgtacacttgaacaatcattagcaataaccaattgacaatttttaatacgttgttatcatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	34736	T

Q	404	tgttccaa	411	Q
		\|\|\| \|\|\|\|
T	34735	tgtaccaa	34728	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)

Name: scaffold0386

Description:

Target: scaffold0386; HSP #1

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 12903 - 13012

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	12903	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	13002	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13003	tgttccaaca	13012	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)

Name: scaffold0374

Description:

Target: scaffold0374; HSP #1

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 17062 - 16953

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17062	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaatatccaattgacaatttttaataccttgttttcatcataacttaataaggttcattgtgaaacacattt	16963	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16962	tgttccaaca	16953	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0300 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)

Name: scaffold0300

Description:

Target: scaffold0300; HSP #1

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 44 - 153

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	44	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccttgttaacatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	143	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	144	tgttccaaca	153	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)

Name: scaffold0199

Description:

Target: scaffold0199; HSP #1

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 23130 - 23239

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23130	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	23229	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	23230	tgttccaaca	23239	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)

Name: scaffold0083

Description:

Target: scaffold0083; HSP #1

Raw Score: 46; E-Value: 5e-17

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 53583 - 53692

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53583	tggtcctgtacacttgaacaataattagtaataaccaattaacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcaataaggttcattgtgaaacacattt	53682	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	53683	tgttccaaca	53692	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 34 - 107

Target Start/End: Complemental strand, 25943 - 25870

Alignment:

Q	34	ttagacgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctgtcatcttctgatggtcttcagcttctg	107	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	25943	ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctg	25870	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 228 - 275

Target Start/End: Complemental strand, 25779 - 25732

Alignment:

Q	228	cttccttcttgttgatttcattgctctcgtttgttcttccagaaccta	275	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	25779	cttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaaccta	25732	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)

Name: scaffold0767

Description:

Target: scaffold0767; HSP #1

Raw Score: 44; E-Value: 8e-16

Query Start/End: Original strand, 306 - 415

Target Start/End: Original strand, 5154 - 5265

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactc-ttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5154	tggtcctgtacacttgaacaataattagaaataaccaattaacaatttttaatacattgttaacatcaaaactcattaaggttcattgtgaaacacattt	5253	T

Q	404	tgttccaacaat	415	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5254	tgttccaacaat	5265	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)

Name: scaffold0683

Description:

Target: scaffold0683; HSP #1

Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003

Query Start/End: Original strand, 296 - 377

Target Start/End: Original strand, 721 - 800

Alignment:

Q	296	tttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	721	ttttagtctatggtcctgcacacttgaacaaatattagcatagccaattg--aacttttaatttcatgttatcatcaaaact	800	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)

Name: scaffold0318

Description:

Target: scaffold0318; HSP #1

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 20302 - 20193

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagcatat-ccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20302	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaattaccaattgacaatttttaatactttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	20203	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	20202	tgttccaaca	20193	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)

Name: scaffold0198

Description:

Target: scaffold0198; HSP #1

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 47 - 156

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	47	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatacattgttaacatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattt	146	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	147	tgttccaaca	156	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)

Name: scaffold0110

Description:

Target: scaffold0110; HSP #1

Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Original strand, 107 - 216

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact-cttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	107	tggtcatgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaataccatgttaacatcaaaactaaataaggttcattgtgaaacacattt	206	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	207	tgttccaaca	216	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)

Name: scaffold1434

Description:

Target: scaffold1434; HSP #1

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002

Query Start/End: Original strand, 118 - 193

Target Start/End: Complemental strand, 687 - 612

Alignment:

Q	118	gcttatggtgatgttgcttatgatgaggtgcttctaatgatcttgcttctgatgacgtcatcactttgggagcact	193	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	687	gcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcact	612	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1390 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)

Name: scaffold1390

Description:

Target: scaffold1390; HSP #1

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 306 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1737

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1846	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaattctttgttatcatcaaatcttaataaggttcattgtgaaacacattt	1747	T

Q	404	tgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1746	tgttccaaca	1737	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)

Name: scaffold1050

Description:

Target: scaffold1050; HSP #1

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 307 - 413

Target Start/End: Complemental strand, 1417 - 1314

Alignment:

Q	307	ggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaactcttaagg-attagtgttaaacacattttg	405	Q
		\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1417	ggtcctgcacacttgaacaaatattagcaatttcaattgata--ttttaatatcttgttatcatcaaaa--tttaaggtggtaatgttaaacacattttg	1322	T

Q	406	ttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1321	ttccaaca	1314	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0329 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)

Name: scaffold0329

Description:

Target: scaffold0329; HSP #1

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003

Query Start/End: Original strand, 294 - 377

Target Start/End: Original strand, 4661 - 4741

Alignment:

Q	294	aatttttgtctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	4661	aattttagtatatggtcctgcacacttgaaaatatattagcatatccaattg---ttttttactaccttgatatcatcaaaact	4741	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)

Name: scaffold0001

Description:

Target: scaffold0001; HSP #1

Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002

Query Start/End: Original strand, 306 - 414

Target Start/End: Complemental strand, 407918 - 407808

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattt	403	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	407918	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgacaatttttaatactttgttttcatcaaatcttaataagtttcattgtgaaacacattt	407819	T

Q	404	tgttccaacaa	414	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	407818	tgttccaacaa	407808	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)

Name: scaffold0477

Description:

Target: scaffold0477; HSP #1

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 306 - 377

Target Start/End: Complemental strand, 5906 - 5832

Alignment:

Q	306	tggtcttgcacacttgaacaaatattagca-tatccaattgacaa--tttttaataccttgttatcatcaaaact	377	Q
		\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5906	tggtcctgtacacttgaacaattattagtaataaccaattgactaattttttaataccttgttatcatcaaaact	5832	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)

Name: scaffold0059

Description:

Target: scaffold0059; HSP #1

Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001

Query Start/End: Original strand, 351 - 413

Target Start/End: Original strand, 1 - 64

Alignment:

Q	351	ttttaataccttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacacattttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1	ttttaataccttgttatcatcaaaacttaataaggttcattgtgaaacacattttgttccaaca	64	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)

Name: scaffold0099

Description:

Target: scaffold0099; HSP #1

Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002

Query Start/End: Original strand, 343 - 413

Target Start/End: Original strand, 19890 - 19963

Alignment:

Q	343	ttgacaatttttaat-accttgttatcatcaaaac-tcttaaggattagtgttaaacaca-ttttgttccaaca	413	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19890	ttgacaatttttaattaccttgttatcatcaaaacttattaaggttcattgtaaaacacatttttgttccaaca	19963	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)

Name: scaffold0053

Description:

Target: scaffold0053; HSP #1

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007

Query Start/End: Original strand, 302 - 376

Target Start/End: Original strand, 28290 - 28361

Alignment:

Q	302	tctatggtcttgcacacttgaacaaatattagcatatccaattgacaatttttaataccttgttatcatcaaaac	376	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28290	tctatgatcctgcactcttgaacaaatattagtatatccaattga---tcttcaatattttgttatcatcaaaac	28361	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]