View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7878_low_5 (Length: 250)

Name: NF7878_low_5
Description: NF7878
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7878_low_5
NF7878_low_5
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (11-250)||(6539-6778)
scaffold0621 (22-250)||(8481-8713)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (10-250)||(19267-19508)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (10-250)||(18005649-18005890)
chr7 (10-250)||(44014181-44014418)
chr7 (11-250)||(67749-67988)
chr7 (10-249)||(16219595-16219835)
chr7 (10-246)||(811012-811249)
chr7 (11-249)||(47831811-47832050)
chr7 (22-250)||(16056343-16056571)
chr7 (11-240)||(22072917-22073149)
chr7 (11-250)||(15754766-15755004)
chr7 (22-242)||(12901338-12901560)
chr7 (11-250)||(34200790-34201027)
chr7 (11-174)||(16495406-16495567)
chr7 (11-174)||(11995983-11996144)
chr7 (11-174)||(28505254-28505415)
chr7 (10-184)||(2280061-2280238)
chr7 (35-130)||(12255789-12255886)
chr7 (11-133)||(38227485-38227606)
chr7 (26-243)||(20220073-20220290)
chr7 (22-197)||(1867924-1868101)
chr7 (11-129)||(3564363-3564481)
chr7 (11-133)||(18456408-18456529)
chr7 (11-133)||(12698835-12698958)
chr7 (26-167)||(13647344-13647487)
chr7 (22-193)||(14044761-14044935)
chr7 (22-193)||(14354791-14354965)
chr7 (11-167)||(18430713-18430870)
chr7 (11-167)||(27216861-27217018)
chr7 (115-249)||(9389575-9389709)
chr7 (11-133)||(9509193-9509315)
chr7 (11-167)||(456322-456479)
chr7 (11-167)||(11393291-11393448)
chr7 (11-167)||(11972497-11972654)
chr7 (11-167)||(14949126-14949283)
chr7 (11-167)||(15376717-15376874)
chr7 (11-167)||(16232521-16232678)
chr7 (11-167)||(18640273-18640430)
chr7 (11-167)||(20385127-20385284)
chr7 (11-167)||(21189599-21189756)
chr7 (11-167)||(24702239-24702396)
chr7 (11-167)||(32125492-32125649)
chr7 (11-167)||(41522918-41523075)
chr7 (11-167)||(41525380-41525537)
chr7 (11-167)||(17061919-17062076)
chr7 (23-133)||(26212012-26212122)
chr7 (11-129)||(48273393-48273511)
chr7 (25-184)||(19486686-19486847)
chr7 (25-133)||(10063813-10063921)
chr7 (11-167)||(16410060-16410217)
chr7 (11-167)||(24704689-24704843)
chr7 (176-250)||(16324175-16324249)
chr7 (21-129)||(24275182-24275289)
chr7 (10-129)||(15144037-15144154)
chr7 (11-167)||(44116510-44116667)
chr7 (11-133)||(16386242-16386365)
chr7 (30-184)||(15008441-15008597)
chr7 (11-167)||(3386334-3386491)
chr7 (23-126)||(10589055-10589158)
chr7 (11-122)||(16213685-16213795)
chr7 (11-126)||(40443395-40443509)
chr7 (11-58)||(13869347-13869394)
chr7 (11-58)||(20110557-20110604)
chr7 (11-77)||(27847881-27847947)
chr7 (11-58)||(13831374-13831421)
chr7 (21-167)||(38898380-38898528)
chr7 (92-128)||(16324135-16324171)
chr7 (26-78)||(18203831-18203882)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (10-250)||(22921746-22921987)
chr1 (10-250)||(33681010-33681251)
chr1 (10-250)||(22237630-22237872)
chr1 (14-161)||(21754052-21754198)
chr1 (10-250)||(52927859-52928088)
chr1 (10-184)||(20248282-20248454)
chr1 (26-250)||(21861446-21861672)
chr1 (26-243)||(21896142-21896358)
chr1 (23-174)||(20918620-20918769)
chr1 (10-174)||(14295507-14295672)
chr1 (26-243)||(50613999-50614219)
chr1 (26-243)||(50621827-50622047)
chr1 (10-185)||(21161719-21161892)
chr1 (115-249)||(35981566-35981700)
chr1 (26-243)||(50686630-50686850)
chr1 (14-243)||(16368170-16368401)
chr1 (22-196)||(16758664-16758841)
chr1 (26-230)||(41049933-41050138)
chr1 (115-249)||(49261448-49261582)
chr1 (11-129)||(50210212-50210330)
chr1 (115-249)||(20636957-20637091)
chr1 (11-133)||(22532273-22532395)
chr1 (26-120)||(35261086-35261180)
chr1 (26-167)||(45574846-45574989)
chr1 (11-167)||(21475091-21475248)
chr1 (11-126)||(34509784-34509899)
chr1 (11-167)||(13988867-13989024)
chr1 (11-167)||(21923295-21923452)
chr1 (11-133)||(21026684-21026806)
chr1 (11-133)||(27250724-27250846)
chr1 (21-129)||(21840778-21840885)
chr1 (11-167)||(23593739-23593896)
chr1 (11-167)||(29298138-29298294)
chr1 (11-167)||(29776689-29776846)
chr1 (11-167)||(31612314-31612471)
chr1 (11-167)||(433013-433168)
chr1 (59-174)||(22130863-22130976)
chr1 (26-185)||(16093825-16093987)
chr1 (11-78)||(20847205-20847271)
chr1 (75-174)||(51130632-51130729)
chr1 (11-167)||(22123071-22123229)
chr1 (21-72)||(20454610-20454660)
chr1 (28-167)||(26064959-26065100)
chr1 (21-167)||(16361928-16362075)
chr1 (11-167)||(13212865-13213023)
chr1 (35-83)||(38801433-38801481)
chr1 (11-58)||(21342097-21342144)
chr1 (11-58)||(21346962-21347009)
chr1 (11-58)||(21707168-21707215)
chr1 (11-58)||(21711710-21711757)
chr1 (10-58)||(21714545-21714593)
chr1 (11-58)||(15860123-15860170)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (10-250)||(100377-100618)
scaffold0023 (10-250)||(40051-40292)
scaffold0023 (11-167)||(94412-94569)
scaffold0023 (11-167)||(44455-44613)
scaffold0023 (10-84)||(101502-101576)
scaffold0023 (11-80)||(119879-119948)
scaffold0023 (21-167)||(17444-17591)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (10-250)||(25175853-25176094)
chr2 (12-250)||(28405981-28406221)
chr2 (37-242)||(7617-7824)
chr2 (22-242)||(18786787-18787009)
chr2 (11-161)||(22134175-22134323)
chr2 (11-168)||(7679589-7679746)
chr2 (26-243)||(23207296-23207515)
chr2 (11-174)||(23071905-23072066)
chr2 (26-247)||(23791292-23791516)
chr2 (11-167)||(22105413-22105571)
chr2 (11-133)||(298809-298932)
chr2 (25-167)||(19671848-19671991)
chr2 (10-184)||(23708561-23708738)
chr2 (11-133)||(23060517-23060639)
chr2 (26-243)||(25108906-25109126)
chr2 (11-167)||(18808944-18809101)
chr2 (11-167)||(23130863-23131020)
chr2 (11-167)||(23133330-23133487)
chr2 (11-167)||(23709536-23709693)
chr2 (11-167)||(23712017-23712174)
chr2 (11-167)||(34402526-34402683)
chr2 (11-167)||(39682314-39682471)
chr2 (11-133)||(22337119-22337241)
chr2 (11-133)||(23076446-23076568)
chr2 (11-133)||(23285869-23285987)
chr2 (11-133)||(23654381-23654503)
chr2 (11-105)||(38138-38231)
chr2 (11-133)||(23660027-23660148)
chr2 (21-167)||(24367785-24367932)
chr2 (26-167)||(20520152-20520295)
chr2 (11-164)||(23135591-23135745)
chr2 (11-167)||(571398-571555)
chr2 (11-167)||(6725996-6726153)
chr2 (11-167)||(26505380-26505537)
chr2 (11-167)||(26507858-26508015)
chr2 (11-167)||(28577100-28577257)
chr2 (11-133)||(22731229-22731351)
chr2 (21-167)||(21155064-21155211)
chr2 (88-196)||(24697536-24697645)
chr2 (11-167)||(24898199-24898357)
chr2 (11-167)||(24900682-24900840)
chr2 (11-167)||(24903159-24903317)
chr2 (11-167)||(24905636-24905794)
chr2 (11-167)||(24908111-24908269)
chr2 (11-126)||(20309112-20309225)
chr2 (11-71)||(23040247-23040306)
chr2 (11-167)||(32039502-32039659)
chr2 (11-129)||(23103396-23103512)
chr2 (21-167)||(32214925-32215072)
chr2 (11-84)||(8946661-8946733)
chr2 (26-184)||(22413078-22413240)
chr2 (11-167)||(45029858-45030015)
chr2 (12-167)||(43137301-43137457)
chr2 (21-69)||(24643054-24643101)
chr2 (11-58)||(22738249-22738296)
chr2 (26-161)||(23004767-23004905)
chr2 (11-58)||(38967375-38967422)
chr2 (92-250)||(22459438-22459598)
chr2 (11-167)||(24529532-24529690)
chr2 (28-78)||(23287384-23287433)
chr2 (28-77)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (18-250)||(5654-5886)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (10-250)||(2522-2763)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (10-250)||(14574-14815)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (10-250)||(21673707-21673947)
chr8 (10-221)||(23760751-23760962)
chr8 (11-245)||(38855134-38855368)
chr8 (11-249)||(6520372-6520610)
chr8 (21-250)||(21285611-21285841)
chr8 (10-250)||(26355577-26355816)
chr8 (22-221)||(983312-983512)
chr8 (11-250)||(5866154-5866391)
chr8 (11-250)||(21490999-21491236)
chr8 (26-243)||(37116366-37116586)
chr8 (11-250)||(17140920-17141157)
chr8 (26-243)||(17266876-17267096)
chr8 (26-249)||(20498581-20498806)
chr8 (11-174)||(21249388-21249550)
chr8 (11-174)||(21255226-21255388)
chr8 (11-133)||(22626740-22626861)
chr8 (25-202)||(13508009-13508188)
chr8 (11-133)||(16092337-16092459)
chr8 (26-221)||(24353039-24353235)
chr8 (25-202)||(13597541-13597720)
chr8 (11-133)||(21918995-21919117)
chr8 (26-196)||(17439436-17439609)
chr8 (11-133)||(22875069-22875190)
chr8 (25-167)||(17612069-17612213)
chr8 (11-126)||(28649046-28649161)
chr8 (11-133)||(7372782-7372904)
chr8 (11-133)||(20536212-20536334)
chr8 (88-241)||(22364744-22364897)
chr8 (11-126)||(31971261-31971375)
chr8 (11-133)||(26219718-26219838)
chr8 (11-167)||(1484403-1484560)
chr8 (11-167)||(5853296-5853453)
chr8 (11-167)||(14409448-14409605)
chr8 (11-167)||(20046199-20046356)
chr8 (11-167)||(20403228-20403385)
chr8 (11-167)||(22001754-22001911)
chr8 (11-126)||(16199647-16199761)
chr8 (11-133)||(18818404-18818526)
chr8 (11-133)||(21923923-21924045)
chr8 (11-120)||(6759262-6759371)
chr8 (11-120)||(23406383-23406492)
chr8 (11-84)||(18879276-18879348)
chr8 (21-167)||(16413320-16413467)
chr8 (11-133)||(26225288-26225408)
chr8 (11-167)||(4483282-4483438)
chr8 (11-167)||(15203235-15203392)
chr8 (11-126)||(21395984-21396097)
chr8 (11-126)||(21790477-21790590)
chr8 (11-167)||(41598189-41598346)
chr8 (11-167)||(4542377-4542534)
chr8 (11-126)||(21389454-21389567)
chr8 (11-126)||(21778780-21778893)
chr8 (26-166)||(19801387-19801527)
chr8 (11-78)||(45131047-45131113)
chr8 (11-69)||(19896266-19896323)
chr8 (11-58)||(25484382-25484429)
chr8 (88-135)||(40492844-40492891)
chr8 (26-196)||(19154816-19154989)
chr8 (21-58)||(45290809-45290846)
chr8 (11-167)||(14823775-14823931)
chr8 (23-58)||(15070571-15070606)
chr8 (11-58)||(19937120-19937167)
chr8 (83-174)||(21383887-21383978)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (10-249)||(15470927-15471166)
chr3 (10-250)||(16103783-16104023)
chr3 (10-250)||(16097331-16097572)
chr3 (10-226)||(12174164-12174377)
chr3 (11-249)||(14234491-14234732)
chr3 (14-161)||(32307684-32307830)
chr3 (10-160)||(49668044-49668194)
chr3 (10-158)||(9512923-9513067)
chr3 (10-158)||(9520898-9521042)
chr3 (11-250)||(13210206-13210444)
chr3 (14-161)||(1644642-1644787)
chr3 (26-184)||(52523669-52523831)
chr3 (11-133)||(27165251-27165373)
chr3 (26-243)||(37251051-37251270)
chr3 (11-133)||(12399213-12399335)
chr3 (11-133)||(53301545-53301668)
chr3 (26-243)||(22110235-22110454)
chr3 (25-184)||(24340665-24340826)
chr3 (11-126)||(18438538-18438653)
chr3 (25-133)||(23274705-23274813)
chr3 (14-133)||(14572596-14572714)
chr3 (11-133)||(14972858-14972980)
chr3 (11-133)||(17487860-17487982)
chr3 (11-133)||(17499342-17499464)
chr3 (11-133)||(36166599-36166719)
chr3 (25-133)||(42386428-42386536)
chr3 (26-167)||(43925977-43926121)
chr3 (21-133)||(21618460-21618570)
chr3 (116-250)||(49389507-49389642)
chr3 (115-249)||(1465289-1465423)
chr3 (11-133)||(13442278-13442400)
chr3 (10-133)||(14576828-14576950)
chr3 (11-105)||(11424783-11424876)
chr3 (11-133)||(24153204-24153325)
chr3 (25-184)||(37642207-37642368)
chr3 (11-167)||(7781351-7781508)
chr3 (11-167)||(17463179-17463336)
chr3 (11-167)||(17672627-17672784)
chr3 (11-126)||(20698437-20698552)
chr3 (11-167)||(29172587-29172744)
chr3 (11-167)||(34159327-34159484)
chr3 (11-167)||(45606911-45607068)
chr3 (11-167)||(55476492-55476649)
chr3 (12-167)||(16282815-16282971)
chr3 (11-133)||(23083356-23083478)
chr3 (21-167)||(38961895-38962042)
chr3 (11-76)||(28194694-28194759)
chr3 (11-164)||(28848618-28848772)
chr3 (26-167)||(43550482-43550625)
chr3 (11-167)||(8899095-8899252)
chr3 (11-167)||(9707611-9707768)
chr3 (11-167)||(16454285-16454442)
chr3 (14-129)||(606324-606441)
chr3 (11-129)||(6469178-6469295)
chr3 (11-129)||(25476384-25476502)
chr3 (11-133)||(26686891-26687013)
chr3 (11-129)||(40213720-40213837)
chr3 (19-133)||(43840944-43841058)
chr3 (21-167)||(12567571-12567718)
chr3 (21-167)||(13544036-13544183)
chr3 (11-124)||(55500943-55501055)
chr3 (11-167)||(13151794-13151952)
chr3 (11-167)||(13154259-13154417)
chr3 (26-167)||(53070657-53070799)
chr3 (11-167)||(10247727-10247884)
chr3 (11-167)||(17446659-17446815)
chr3 (11-129)||(15977516-15977633)
chr3 (21-167)||(50242833-50242980)
chr3 (37-184)||(22147467-22147616)
chr3 (69-184)||(2051141-2051260)
chr3 (11-69)||(17737237-17737294)
chr3 (12-167)||(41123892-41124045)
chr3 (11-58)||(8499519-8499566)
chr3 (11-58)||(10556986-10557033)
chr3 (11-58)||(15412430-15412477)
chr3 (177-243)||(43927304-43927370)
chr3 (11-58)||(45577952-45577999)
chr3 (11-118)||(12119780-12119886)
chr3 (11-58)||(44494810-44494857)
chr3 (28-72)||(13919350-13919393)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (10-250)||(2681-2924)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (11-250)||(62202-62439)
scaffold0028 (10-250)||(132661-132895)
scaffold0028 (11-167)||(136681-136838)
scaffold0028 (11-167)||(139150-139307)
scaffold0028 (11-167)||(144088-144245)
scaffold0028 (11-167)||(134212-134369)
scaffold0028 (11-167)||(141619-141776)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (11-241)||(21502041-21502273)
chr5 (11-250)||(21329374-21329614)
chr5 (10-250)||(21565545-21565786)
chr5 (10-249)||(26011913-26012154)
chr5 (10-173)||(22959489-22959650)
chr5 (26-250)||(20026817-20027043)
chr5 (11-250)||(19668902-19669141)
chr5 (11-250)||(19660715-19660952)
chr5 (26-243)||(22178103-22178323)
chr5 (11-133)||(21729059-21729181)
chr5 (11-133)||(21808384-21808506)
chr5 (26-167)||(22144068-22144211)
chr5 (11-133)||(23390491-23390613)
chr5 (11-108)||(36314581-36314678)
chr5 (11-133)||(24493573-24493694)
chr5 (11-132)||(8286838-8286960)
chr5 (115-174)||(21741486-21741545)
chr5 (11-133)||(13025315-13025436)
chr5 (11-133)||(13095499-13095620)
chr5 (11-133)||(22412188-22412309)
chr5 (11-167)||(264772-264929)
chr5 (14-133)||(1096474-1096593)
chr5 (11-167)||(10732944-10733101)
chr5 (11-167)||(11581203-11581360)
chr5 (11-126)||(24529224-24529339)
chr5 (11-167)||(29329935-29330092)
chr5 (11-167)||(39363385-39363542)
chr5 (11-129)||(9077956-9078074)
chr5 (11-113)||(21997549-21997651)
chr5 (23-133)||(22075035-22075145)
chr5 (11-133)||(25421536-25421658)
chr5 (25-184)||(40725871-40726032)
chr5 (11-167)||(20909013-20909170)
chr5 (11-167)||(42245369-42245526)
chr5 (22-167)||(20902012-20902159)
chr5 (59-161)||(29448054-29448159)
chr5 (11-167)||(2154617-2154775)
chr5 (11-167)||(29345981-29346138)
chr5 (27-131)||(25431414-25431518)
chr5 (11-164)||(39245137-39245291)
chr5 (11-167)||(29348454-29348611)
chr5 (11-167)||(29350927-29351084)
chr5 (11-167)||(36154787-36154941)
chr5 (11-69)||(20918052-20918109)
chr5 (11-167)||(32027394-32027551)
chr5 (11-58)||(10775790-10775837)
chr5 (21-167)||(18319037-18319185)
chr5 (11-78)||(21293020-21293086)
chr5 (11-58)||(23064512-23064559)
chr5 (26-77)||(26740697-26740747)
chr5 (11-58)||(38619435-38619482)
chr5 (26-79)||(37723922-37723975)
chr5 (73-133)||(20766115-20766175)
chr5 (11-67)||(31061069-31061124)
chr5 (23-77)||(26732884-26732937)
chr5 (10-58)||(26704074-26704122)
chr5 (10-58)||(26973807-26973855)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (65-250)||(2095-2281)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-250)||(10542-10771)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (11-250)||(12770-13010)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (11-230)||(39706187-39706405)
chr4 (22-242)||(12288094-12288316)
chr4 (10-250)||(12774010-12774241)
chr4 (10-250)||(8846359-8846616)
chr4 (26-250)||(13727-13953)
chr4 (22-130)||(52243192-52243302)
chr4 (11-174)||(15551821-15551982)
chr4 (22-250)||(43198429-43198661)
chr4 (26-243)||(53082035-53082254)
chr4 (115-249)||(15099457-15099591)
chr4 (26-243)||(46640339-46640558)
chr4 (115-247)||(15190424-15190556)
chr4 (19-129)||(16377522-16377630)
chr4 (11-133)||(16239965-16240086)
chr4 (11-126)||(7088881-7088996)
chr4 (45-174)||(16596686-16596813)
chr4 (11-167)||(44615289-44615446)
chr4 (11-133)||(7798778-7798900)
chr4 (11-133)||(22636439-22636561)
chr4 (11-133)||(6899895-6900016)
chr4 (11-133)||(8574864-8574984)
chr4 (11-133)||(16270231-16270352)
chr4 (11-132)||(52873363-52873484)
chr4 (11-167)||(12311-12468)
chr4 (11-167)||(15118356-15118513)
chr4 (11-167)||(18215278-18215435)
chr4 (14-133)||(23374354-23374473)
chr4 (11-167)||(44773091-44773248)
chr4 (11-167)||(52312511-52312668)
chr4 (11-133)||(12902761-12902883)
chr4 (11-133)||(14280317-14280438)
chr4 (11-133)||(54798749-54798871)
chr4 (21-167)||(19618176-19618323)
chr4 (11-167)||(44928883-44929041)
chr4 (11-167)||(50222343-50222500)
chr4 (11-167)||(51463872-51464029)
chr4 (11-133)||(7893707-7893829)
chr4 (11-133)||(44052833-44052955)
chr4 (12-129)||(14038653-14038770)
chr4 (11-84)||(3096297-3096369)
chr4 (11-164)||(18239426-18239580)
chr4 (11-167)||(1837513-1837670)
chr4 (11-167)||(19242700-19242857)
chr4 (21-129)||(14970751-14970858)
chr4 (11-72)||(17046491-17046552)
chr4 (11-167)||(3515008-3515165)
chr4 (11-122)||(23803316-23803426)
chr4 (21-167)||(15355328-15355476)
chr4 (11-69)||(7641286-7641343)
chr4 (11-69)||(12610951-12611008)
chr4 (11-124)||(14053306-14053418)
chr4 (11-167)||(44102215-44102372)
chr4 (89-130)||(15464929-15464970)
chr4 (35-78)||(17333305-17333347)
chr4 (26-72)||(6190481-6190527)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (10-250)||(10418-10659)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (10-250)||(129908-130149)
scaffold0010 (26-130)||(60713-60818)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (10-250)||(132-372)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (10-250)||(19652198-19652437)
chr6 (10-249)||(23019408-23019649)
chr6 (22-249)||(19668386-19668615)
chr6 (66-250)||(22080616-22080800)
chr6 (11-250)||(1561307-1561545)
chr6 (11-250)||(28496351-28496588)
chr6 (11-250)||(29808762-29808999)
chr6 (22-175)||(9098465-9098620)
chr6 (11-108)||(27333238-27333335)
chr6 (11-108)||(27393978-27394075)
chr6 (10-122)||(4185827-4185939)
chr6 (10-162)||(20109140-20109295)
chr6 (16-122)||(4186376-4186482)
chr6 (11-133)||(16496248-16496370)
chr6 (10-180)||(31155346-31155515)
chr6 (11-129)||(29060544-29060662)
chr6 (11-120)||(20076704-20076812)
chr6 (22-130)||(25644335-25644444)
chr6 (11-167)||(1595550-1595707)
chr6 (11-129)||(18409826-18409944)
chr6 (11-167)||(22782228-22782385)
chr6 (11-129)||(19303540-19303657)
chr6 (11-167)||(2291184-2291341)
chr6 (14-184)||(8227453-8227625)
chr6 (11-167)||(12742318-12742475)
chr6 (11-167)||(18334596-18334753)
chr6 (11-167)||(19005047-19005204)
chr6 (11-167)||(19858923-19859080)
chr6 (11-126)||(20638285-20638400)
chr6 (11-167)||(24422548-24422705)
chr6 (11-167)||(33861795-33861952)
chr6 (11-167)||(33864279-33864436)
chr6 (11-129)||(25629354-25629472)
chr6 (11-167)||(20556898-20557053)
chr6 (21-167)||(30676714-30676861)
chr6 (62-122)||(4668217-4668277)
chr6 (62-122)||(4675064-4675124)
chr6 (11-167)||(8055030-8055187)
chr6 (11-167)||(26924644-26924801)
chr6 (11-133)||(17287791-17287913)
chr6 (19-133)||(20360955-20361069)
chr6 (11-167)||(25754810-25754967)
chr6 (11-129)||(20593777-20593895)
chr6 (11-113)||(25656630-25656731)
chr6 (21-167)||(34963384-34963531)
chr6 (11-164)||(1540918-1541072)
chr6 (26-167)||(18456735-18456877)
chr6 (21-129)||(25688513-25688620)
chr6 (11-126)||(16920634-16920747)
chr6 (138-230)||(28103796-28103887)
chr6 (11-126)||(35245590-35245703)
chr6 (26-243)||(23076749-23076969)
chr6 (11-69)||(25714421-25714478)
chr6 (11-167)||(3852021-3852178)
chr6 (26-129)||(18461895-18461997)
chr6 (28-72)||(22831524-22831568)
chr6 (21-167)||(16448530-16448678)
chr6 (88-194)||(18696569-18696675)
chr6 (11-58)||(22780297-22780344)
chr6 (26-243)||(35008167-35008387)
chr6 (17-70)||(11185515-11185568)
chr6 (88-196)||(18706387-18706495)
chr6 (174-250)||(27333162-27333238)
chr6 (174-250)||(27393902-27393978)
chr6 (28-105)||(33443068-33443146)
chr6 (26-69)||(18821904-18821946)
chr6 (10-54)||(4738631-4738675)
chr6 (138-186)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-249)||(6001-6240)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (11-245)||(6615-6850)
scaffold0333 (11-245)||(13995-14230)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-250)||(160685-160927)
scaffold0001 (21-167)||(501095-501242)
scaffold0001 (11-167)||(85583-85741)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (10-250)||(32538-32779)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (10-245)||(12942-13178)
scaffold0138 (88-243)||(18121-18277)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-184)||(22613-22788)
scaffold0037 (11-167)||(82073-82230)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (17-250)||(6822-7053)
scaffold0556 (89-250)||(8097-8259)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (11-246)||(916-1151)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-250)||(45669-45910)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (21-250)||(1096-1326)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (22-250)||(7953-8180)
scaffold0218 (54-168)||(29242-29354)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (26-243)||(6166-6386)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (26-242)||(136252-136471)
scaffold0021 (26-242)||(144960-145179)
scaffold0021 (26-129)||(174785-174886)
scaffold0021 (11-77)||(121770-121835)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-114)||(23897-24001)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (11-250)||(15665-15902)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (30-243)||(38339-38555)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (11-174)||(11296-11457)
scaffold0046 (11-174)||(2001-2162)
scaffold0046 (11-126)||(28418-28533)
scaffold0046 (11-63)||(4556-4608)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (26-243)||(128853-129072)
scaffold0022 (30-240)||(78345-78556)
scaffold0022 (11-133)||(116431-116551)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (10-250)||(32101-32335)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-174)||(1025-1186)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (11-133)||(38697-38819)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-250)||(12587-12812)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (11-133)||(3146-3267)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-242)||(103523-103737)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (11-113)||(15792-15894)
scaffold0020 (195-245)||(15714-15765)
scaffold0020 (10-58)||(178897-178945)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (37-250)||(53425-53640)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (26-243)||(97024-97244)
scaffold0006 (26-243)||(106302-106522)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (26-133)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (11-129)||(3185-3303)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (11-250)||(34127-34364)
scaffold0175 (19-58)||(285-324)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (19-133)||(39489-39602)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (26-243)||(19768-19987)
scaffold0080 (11-133)||(39917-40038)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (19-133)||(75210-75323)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-133)||(39862-39983)
scaffold0026 (19-133)||(25908-26021)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (22-167)||(25121-25268)
scaffold0123 (88-196)||(619-727)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-133)||(1855-1977)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (11-133)||(32952-33073)
scaffold0120 (11-133)||(45932-46053)
scaffold0120 (11-129)||(16117-16235)
scaffold0120 (11-69)||(17389-17446)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (88-243)||(87-243)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-242)||(7943-8161)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-126)||(4853-4968)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (26-126)||(13147-13247)
scaffold0357 (22-130)||(16098-16206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (22-130)||(27747-27855)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (35-184)||(11492-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (35-184)||(38198-38349)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (11-129)||(17214-17334)
scaffold0056 (26-167)||(79288-79430)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (25-184)||(17969-18130)
scaffold0247 (21-167)||(2132-2280)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (14-129)||(26064-26179)
scaffold0122 (11-133)||(44702-44824)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (11-133)||(13215-13337)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (10-91)||(28806-28888)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (11-133)||(32946-33067)
scaffold0145 (11-133)||(38765-38886)
scaffold0145 (11-167)||(9750-9908)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-167)||(20748-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (11-167)||(37822-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-167)||(158454-158611)
scaffold0003 (11-129)||(339949-340064)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (11-133)||(3474-3596)
scaffold0292 (11-133)||(347-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (11-133)||(51917-52039)
scaffold0011 (11-133)||(167973-168095)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (26-243)||(569-787)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-243)||(267679-267898)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (21-129)||(10784-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (11-164)||(13393-13547)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-133)||(8528-8646)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (11-167)||(4695-4852)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (62-122)||(9133-9193)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (11-126)||(10427-10540)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (11-167)||(13948-14105)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (11-167)||(16785-16942)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (11-126)||(1293-1406)
scaffold0106 (11-126)||(7270-7383)
scaffold0106 (11-72)||(15295-15355)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (26-167)||(20383-20524)
scaffold0031 (11-133)||(128755-128876)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (11-133)||(1043-1165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (11-133)||(1956-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (11-133)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (11-126)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (11-126)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (25-133)||(24297-24406)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (26-243)||(1681-1900)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (11-133)||(6116-6241)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (11-72)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (21-129)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (26-126)||(51601-51699)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (11-167)||(40401-40558)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (23-126)||(13513-13615)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (19-133)||(4520-4633)
scaffold0228 (19-133)||(12102-12215)
scaffold0228 (19-133)||(22054-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (11-129)||(16599-16717)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-124)||(16286-16397)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-84)||(4716-4788)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (11-167)||(107-264)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (11-126)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (11-126)||(8483-8598)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (65-174)||(2398-2505)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (24-167)||(29946-30090)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (25-126)||(20928-21030)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (21-167)||(11299-11446)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (21-129)||(4308-4415)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (65-184)||(225465-225585)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (23-167)||(161093-161239)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (11-126)||(1053-1166)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (26-114)||(2694-2784)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (21-167)||(12253-12400)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (11-167)||(12065-12216)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (28-133)||(4545-4650)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-77)||(46999-47065)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (11-167)||(4215-4373)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (13-124)||(11447-11558)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (10-58)||(23842-23890)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (10-58)||(36453-36501)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (26-69)||(11982-12024)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (119-161)||(2261-2303)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (21-58)||(1395-1432)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (89-133)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6778
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6638  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6639 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 6738  T
Q  211 aaataacaacagcaagataacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6739 aaacaacaacagcaagataacaacttagtttttaacctct 6778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8713
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  122 catctcaaatat-ca-acataattcatataatgtatatacaat--tatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 217  Q
    |||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || |||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacat-cagtcttactggaacaac 8679  T
Q  218 aacagcaagataa-caacttagtttctaacctct 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8680 atcagcaagataaacaacttagtttcttacctct 8713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 19267 - 19508
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19267 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttact 19466  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19467 gaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaacctct 19508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 18005649 - 18005890
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005649 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 18005848  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18005849 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 18005890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 44014181 - 44014418
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014181 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014281 gcaaatcaac---atctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttact 44014377  T
Q  210 gaaataacaacagcaagataacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44014378 gaaacaacaacagcaagataacaacttagtttttaacctct 44014418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 67749 - 67988
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 67848  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67849 caaatcaacaacatctc-aatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactg 67947  T
Q  211 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  67948 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 67988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219595
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttac 16219637  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16219636 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctc 16219595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 811249 - 811012
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811249 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttac 811051  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaac 246  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  811050 tgaaactacaacagcaagataaataacttagtttctaac 811012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 47831811 - 47832050
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831811 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatg 47831910  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  47831911 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggcttact 47832009  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  47832010 gaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctc 47832050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056571
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  122 catctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaac 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaac 16056540  T
Q  221 agcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16056541 atcaagataaacaacttagtttcttacctct 16056571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 22072917 - 22073149
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22072917 catcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 22073016  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 207  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22073017 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggctta 22073115  T
Q  208 ctgaaataacaacagcaaga-taacaacttagtt 240  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22073116 ctgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15755004 - 15754766
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15755004 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15754905  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttac 208  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| |||||    
T  15754904 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttac 15754809  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15754808 tggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 15754766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901560
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12901438 aacatcacaac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  219 acagcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 34200790 - 34201027
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34200790 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 34200889  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  34200890 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttact 34200985  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |  | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34200986 gggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 34201027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 16495406 - 16495567
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495406 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495506 taaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11996144 - 11995983
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11996144 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 11996045  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11996044 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28505415 - 28505254
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  28505415 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggata 28505316  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28505315 taaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280061
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  2280238 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaa 2280139  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280138 tgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12255886 - 12255789
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  12255886 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 38227485 - 38227606
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38227485 catcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38227583  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  38227584 caagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220073
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   | |||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactggaacaacaacag 20220095  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  20220094 taagataagcaacttagtttct 20220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867924
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaa 197  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaa 1867924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3564481 - 3564363
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  3564481 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    | || |||||||||||||||    
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18456529 - 18456408
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  18456529 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18456431  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  18456430 caagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 12698835 - 12698958
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| |     
T  12698835 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647487
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 13647442  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647443 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  119 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 193  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  119 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 193  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 18430713 - 18430870
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  18430713 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaat 18430810  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430811 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 27216861 - 27217018
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  27216861 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389575
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatata-caatccaggcttactggaat 9389611  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     |||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  9389610 gacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacctc 9389575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 9509193 - 9509315
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | |    
T  9509193 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaatt 9509291  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  9509292 gcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 456322 - 456479
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  456322 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393291
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 11972497 - 11972654
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11972497 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14949283 - 14949126
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14949283 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15376874 - 15376717
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15376874 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 16232521 - 16232678
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16232521 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 18640273 - 18640430
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18640273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20385284 - 20385127
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20385284 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21189756 - 21189599
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21189756 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 24702239 - 24702396
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24702239 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 32125492 - 32125649
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32125492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 41522918 - 41523075
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41522918 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 41525380 - 41525537
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41525380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17062076 - 17061919
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||    
T  17062076 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatg 17061978  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061977 caagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212122
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 26212110  T
Q  122 catctcaaatat 133  Q
    ||||| ||||||    
T  26212111 catcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 48273393 - 48273511
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  48273393 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19486847 - 19486686
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  19486847 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 19486748  T
Q  125 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  19486747 ctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063813
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  125 ctcaaatat 133  Q
    |||||||||    
T  10063821 ctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 16410060 - 16410217
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16410060 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 24704689 - 24704843
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||    
T  24704689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatg 24704784  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704785 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324249
Alignment:
Q  176 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctct 16324249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 24275182 - 24275289
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24275182 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24275279  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  24275280 aacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15144154 - 15144037
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| ||    
T  15144154 acatcatcatc-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaa 15144058  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  15144057 tgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 44116510 - 44116667
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44116510 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16386365 - 16386242
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  16386365 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 16386266  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | | |||| |||||||| ||||||    
T  16386265 gtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  30 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  128 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 3386334 - 3386491
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |||    
T  3386334 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 3386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589158
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaa 10589153  T
Q  122 catct 126  Q
    |||||    
T  10589154 catct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 16213685 - 16213795
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16213685 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  110 gcaattcaacaac 122  Q
     ||| ||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 40443395 - 40443509
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  40443395 catcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 40443493  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  40443494 caattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 13869347 - 13869394
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869347 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 13869394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 20110557 - 20110604
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110557 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 20110604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27847947 - 27847881
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847947 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 13831374 - 13831421
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831374 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 13831421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38898528 - 38898380
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  38898528 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 38898431  T
Q  119 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38898430 caacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 38898380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 128
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22921987 - 22921746
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921987 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 22921788  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22921787 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 22921746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681251
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 33681208  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681209 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 33681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237872
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||  |    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcgc 22237828  T
Q  209 tgaaataacaa-cagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22237829 tggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaacctct 22237872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754198
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T
Q  114 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21754152 -tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52928088 - 52927859
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928088 acatcaccatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 52927989  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
                ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  52927988 ------------catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 52927902  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52927901 tggaacaacaatagcaagataaacaacttagtttctaacctct 52927859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 20248282 - 20248454
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248282 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861446
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagc 21861474  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21861473 aagataaacaacttagtttcttacctct 21861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896142
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | |||||||||||||||   ||||||| |    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactga---aacaacaac 21896163  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttct 243  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  21896162 aagataaacaacttagtttct 21896142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 20918718  T
Q  123 atctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
      ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918719 --ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaac---ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613999
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  124 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50614021  T
Q  223 caaga-taacaacttagtttct 243  Q
     ||||  |||||||||||||||    
T  50614020 taagacaaacaacttagtttct 50613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621827
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  124 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50621849  T
Q  223 caaga-taacaacttagtttct 243  Q
     ||||  |||||||||||||||    
T  50621848 taagacaaacaacttagtttct 50621827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 21161719 - 21161892
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21161719 acatcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 185  Q
    |||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  21161818 gcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcatt 21161892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981566
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 35981602  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  35981601 gacaacatcaagataaataacttagtttctaacctc 35981566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686850
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 50686828  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  50686829 taagataagcaacttagtttct 50686850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16368401 - 16368170
Alignment:
Q  14 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  16368401 catcatcattcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatg 16368303  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||||||||||||| || |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  16368302 caaatcaacaacatctc-aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttact 16368205  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttct 243  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  16368204 gaaacaacaacagtaagataaacaacttaatttct 16368170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758841
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    |||||| |||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41050038 tctc-aacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 41049941  T
Q  223 caagataa 230  Q
     |||||||    
T  41049940 taagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261582
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||     
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caattccggcttactggaag 49261546  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     |||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  49261547 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctc 49261582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50210330 - 50210212
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50210330 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50210232  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  50210231 gcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637091
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     |||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctc 20637091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22532273 - 22532395
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22532273 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261086
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574846
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgt 45574891  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574890 ctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21475248 - 21475091
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21475248 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 34509784 - 34509899
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  34509784 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34509883 gcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 13988867 - 13989024
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13988867 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21923452 - 21923295
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21923452 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 21026684 - 21026806
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | |    
T  21026684 catcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaatt 21026782  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21026783 gcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27250846 - 27250724
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  27250846 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 27250748  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  27250747 gcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 21840778 - 21840885
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  21840778 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 21840875  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  21840876 aacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23593896 - 23593739
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23593896 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29298138 - 29298294
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29298138 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29776689 - 29776846
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  29776689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29776846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 31612314 - 31612471
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  31612314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 31612471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 433013 - 433168
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| |||    
T  433013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130863
Alignment:
Q  59 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  158 acaattatataccatta 174  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caac 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  123 atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 185  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20847271 - 20847205
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847271 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  75 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22123229 - 22123071
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  22123229 catcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 22123131  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||  |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22123130 gcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatat 22123071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20454660 - 20454610
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20454660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065100
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  126 tcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 16361928 - 16362075
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16361928 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16362025  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16362026 aacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatat 16362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13213023 - 13212865
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13213023 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 13212926  T
Q  110 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13212925 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 13212865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38801481 - 38801433
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801481 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 21342097 - 21342144
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342097 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21342144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 21346962 - 21347009
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21346962 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21347009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 21707168 - 21707215
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707168 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21707215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 21711710 - 21711757
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711710 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21711757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 21714545 - 21714593
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21714545 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 21714593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15860170 - 15860123
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860170 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac 15860123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 100377 - 100618
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  100377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatattaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttact 100576  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  100577 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 100618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40292 - 40051
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40292 acatcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttact 40093  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40092 gaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 40051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 94412 - 94569
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  94412 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 44455 - 44613
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44455 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 101502 - 101576
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101502 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 119879 - 119948
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119879 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17591 - 17444
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  17591 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 17494  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17493 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 25175853 - 25176094
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175853 acatcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 25176052  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25176053 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 25176094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406221
Alignment:
Q  12 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||     
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttacta 28406180  T
Q  211 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28406181 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 28406221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7617
Alignment:
Q  37 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 135  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  136 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 233  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaa 7626  T
Q  234 cttagtttc 242  Q
    |||||||||    
T  7625 cttagtttc 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786787
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18786909 aacgtcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcata-taatttaggcttactgaaacaaca 18786812  T
Q  219 acagcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  18786811 acagcatgataaacaacttagtttc 18786787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22134323 - 22134175
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22134323 catcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatg 22134225  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22134224 caa-tcaataacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatatacaa 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679746
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatata 168  Q
     || ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207515
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  124 tctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    ||||||   |  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||  || ||||||||     
T  23207396 tctcaacattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  224 aagataa-caacttagtttct 243  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttct 23207515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23072066 - 23071905
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  23072066 catcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaata 23071967  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071966 taaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791516
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaa 23791490  T
Q  223 caagat-aacaacttagtttctaacc 247  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  23791491 caagataaacaacttagtttccaacc 23791516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 22105413 - 22105571
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22105413 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 298932 - 298809
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  298932 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 298833  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  298832 gcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19671991
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 19671947  T
Q  125 ctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671948 ctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |     
T  23708738 acatcatcatctttcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaat 23708639  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat--caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||| ||| | |||||||||| ||   || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708638 tgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 23060517 - 23060639
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23060517 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23060615  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23060616 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109126
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 25109104  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  25109105 taagataagcaacttagtttct 25109126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 18808944 - 18809101
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18808944 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 23130863 - 23131020
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23130863 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 23133330 - 23133487
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23133330 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23709693 - 23709536
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23709693 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23712174 - 23712017
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23712174 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34402683 - 34402526
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34402683 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 39682314 - 39682471
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39682314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22337119 - 22337241
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22337119 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 23076446 - 23076568
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23076446 catcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 23076544  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076545 gcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 23285869 - 23285987
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| |||||| | ||    
T  23285869 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatcaattg 23285964  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  23285965 caattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23654503 - 23654381
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  23654503 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaatt 23654405  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23654404 gcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38231 - 38138
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38231 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 23660027 - 23660148
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||    
T  23660027 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatg 23660125  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  23660126 caaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 24367785 - 24367932
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24367785 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24367882  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367883 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520152
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 23135591 - 23135745
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23135591 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 571398 - 571555
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  571398 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 6725996 - 6726153
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6725996 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 26505380 - 26505537
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26505380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26505537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 26507858 - 26508015
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26507858 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26508015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 28577100 - 28577257
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  28577100 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||  ||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22731351 - 22731229
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22731253  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||| | ||||||    
T  22731252 gcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21155211 - 21155064
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  21155211 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 21155114  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155113 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697536
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  187 gatcatatta 196  Q
     |||||||||    
T  24697545 aatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24898357 - 24898199
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24898357 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24900840 - 24900682
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24900840 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24903317 - 24903159
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24903317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24905794 - 24905636
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24905794 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24908269 - 24908111
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24908269 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 20309112 - 20309225
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  20309112 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 20309209  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20309210 caattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23040306 - 23040247
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacata 71  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040306 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32039659 - 32039502
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32039659 catcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23103512 - 23103396
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| |||     
T  23103512 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaatt 23103415  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23103414 caattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32215072 - 32214925
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  32215072 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 32214975  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214974 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 8946661 - 8946733
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  8946661 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataa-caatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  122 catctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45030015 - 45029858
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45030015 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatat 45029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137457
Alignment:
Q  12 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-taatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 43137457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24643101 - 24643054
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24643101 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22738296 - 22738249
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738296 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 22738249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004905
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 38967375 - 38967422
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967375 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38967422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459438
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagat 189  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||  | |||  ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |  |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  190 catattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | |||  || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22459498 cgtatacat-cagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctct 22459438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24529690 - 24529532
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  24529690 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| | |||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatat 24529532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5886
Alignment:
Q  18 atcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5654 atcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  118 acaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5754 acaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T
Q  218 aacagcaagataacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5854 aacaacaagataaaaacttagtttttaacctct 5886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2763 - 2522
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2763 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 2564  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2563 gaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaacctct 2522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14815 - 14574
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14815 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttact 14616  T
Q  210 gaaataacaacagcaagata-acaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14615 gaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaacctct 14574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 21673707 - 21673947
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673707 acatgatcatcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21673806  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21673807 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttact 21673906  T
Q  210 gaaataacaacagcaagataacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21673907 gaaacaacaacaacaagataacaacttagtttttaacctct 21673947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760751
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23760962 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttact 23760763  T
Q  210 gaaataacaaca 221  Q
    |||| |||||||    
T  23760762 gaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38855368 - 38855134
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855368 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 38855269  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  38855268 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactg 38855170  T
Q  211 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaa 245  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38855169 aaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaa 38855134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 6520372 - 6520610
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520372 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6520471  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  6520472 caagtcatcaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactg 6520570  T
Q  211 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6520571 aaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaacctc 6520610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 21285611 - 21285841
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21285611 atcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 21285710  T
Q  121 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 219  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21285711 acatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaa 21285809  T
Q  220 cagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || |||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  21285810 caacaagataaagcacttagtttcttacctct 21285841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26355816 - 26355577
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355816 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatcaacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 26355619  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
      || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26355618 agaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaacctct 26355577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983312
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaaca 983315  T
Q  219 aca 221  Q
    |||    
T  983314 aca 983312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5866391 - 5866154
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5866391 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 5866292  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  5866291 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttact 5866196  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5866195 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 5866154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21490999 - 21491236
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21490999 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 21491098  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  21491099 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggca-tcagtcttact 21491194  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21491195 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 21491236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116586
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 37116564  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  37116565 taagataagcaacttagtttct 37116586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 17140920 - 17141157
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  17140920 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatg 17141019  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  17141020 taaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttact 17141115  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17141116 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 17141157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266876
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttct 17266876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498806
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||| | ||||| |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatc 20498779  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20498780 aagataaacaacttagtttcttacctc 20498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 21249388 - 21249550
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21249388 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21249487  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249488 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 21255226 - 21255388
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21255226 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21255325  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21255326 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22626740 - 22626861
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  22626740 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaata 22626838  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626839 caaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508009
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 202  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16092459 - 16092337
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16092459 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16092361  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  16092360 gcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353235
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 221  Q
    ||||||| |||  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597541
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 202  Q
    | |||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21919117 - 21918995
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21919117 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 21919019  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21919018 gcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439436
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22875069 - 22875190
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22875069 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 22875167  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22875168 caagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612069
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 17612114  T
Q  125 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612113 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28649161 - 28649046
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28649161 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 28649063  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28649062 gcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 7372782 - 7372904
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7372782 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 20536212 - 20536334
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20536212 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  187 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagttt 241  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 31971261 - 31971375
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  31971261 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattc 31971359  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31971360 caattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 26219718 - 26219838
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||    
T  26219718 catcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatg 26219815  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26219816 caagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 1484403 - 1484560
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1484403 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5853453 - 5853296
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  5853453 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14409605 - 14409448
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14409605 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20046356 - 20046199
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20046356 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 20403228 - 20403385
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20403228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 22001754 - 22001911
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22001754 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16199761 - 16199647
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  16199761 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaattt 16199663  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| | ||||||    
T  16199662 caattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18818526 - 18818404
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18818526 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | || |||||| ||||| ||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21924045 - 21923923
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | |    
T  21924045 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaatt 21923947  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  21923946 gcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 6759262 - 6759371
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6759262 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 6759360  T
Q  110 gcaattcaaca 120  Q
    |||| ||||||    
T  6759361 gcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 23406383 - 23406492
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23406383 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23406481  T
Q  110 gcaattcaaca 120  Q
    |||| ||||||    
T  23406482 gcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18879348 - 18879276
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879348 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16413467 - 16413320
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16413467 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16413370  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413369 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26225408 - 26225288
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||     
T  26225408 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaata 26225311  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26225310 caagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 4483282 - 4483438
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4483282 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15203392 - 15203235
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15203392 catcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21396097 - 21395984
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21396000  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21395999 caattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21790590 - 21790477
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21790493  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21790492 caattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 41598189 - 41598346
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41598189 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41598346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4542534 - 4542377
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  || | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4542534 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatat 4542377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21389567 - 21389454
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21389567 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21389470  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21389469 caattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21778893 - 21778780
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21778893 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21778796  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21778795 caattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801387
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  126 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattata 166  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 45131113 - 45131047
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131113 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 19896266 - 19896323
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19896266 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25484429 - 25484382
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25484429 catcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac 25484382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154816
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| |  |||  ||||||| |||||| | ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
     || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  19154889 acttaaacatcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatatta 19154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45290846 - 45290809
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290846 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45290809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 14823775 - 14823931
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||    
T  14823775 catcatcttaatcaatttagacca-ctcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14823931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070606
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 15070606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19937167 - 19937120
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19937167 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac 19937120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471166
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggcttac 15471124  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15471125 tgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctc 15471166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 16103783 - 16104023
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103783 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggatt-agtcttac 16103980  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 16104023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 16097331 - 16097572
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16097331 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 16097529  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctct 16097572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12174377 - 12174164
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    ||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||  | |||| |||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgca-tcagtcttac 12174182  T
Q  209 tgaaataacaacagcaag 226  Q
    || || ||||||||||||    
T  12174181 tggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 14234491 - 14234732
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234491 catcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 14234590  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  14234591 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggcttact 14234689  T
Q  210 ga--aataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    ||  || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14234690 gaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctc 14234732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307830
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T
Q  114 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32307784 -tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49668194 - 49668044
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668194 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  110 gcaattcaacaa-catctcaaatatcaacataattcatataatgtatataca 160  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  49668094 gcaat-caacaaacatctcatttatcaacataatccatttaaagtatataca 49668044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 158
Target Start/End: Original strand, 9512923 - 9513067
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512923 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 158  Q
    |||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9513023 gcaat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9513067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 158
Target Start/End: Original strand, 9520898 - 9521042
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520898 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 158  Q
    |||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9520998 gcaat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9521042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13210444 - 13210206
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13210444 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 13210345  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttac 208  Q
    ||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  13210344 caaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgca-tcagccttac 13210249  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || |||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13210248 tggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 13210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644642
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa 1644689  T
Q  114 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1644688 -tcaacaatatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  124 tctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 27165251 - 27165373
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  27165251 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatg 27165350  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165351 caagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251051
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37251170 tctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcagacttactggaacaacaacag 37251073  T
Q  223 caagat-aacaacttagtttct 243  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  37251072 taagataaacaacttagtttct 37251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 12399213 - 12399335
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  12399213 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 12399311  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12399312 gcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53301668 - 53301545
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  53301668 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 53301569  T
Q  111 caattca-acaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301568 caagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110235
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||  |||| | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110354 tctcaac-atcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatac-aattcaggcttactgaaacaacaacag 22110257  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  22110256 taagataagcaacttagtttct 22110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340665
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 24340727  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  24340726 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 18438538 - 18438653
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  18438538 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 18438636  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18438637 gcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274813
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  125 ctcaaatat 133  Q
    |||||||||    
T  23274805 ctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 14572596 - 14572714
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  |    
T  14572596 catcaacatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgaga 14572694  T
Q  114 ttcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  14572695 gtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 14972858 - 14972980
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14972858 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14972956  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  14972957 gcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 17487860 - 17487982
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17487860 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 17499342 - 17499464
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17499342 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 36166599 - 36166719
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  36166599 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 36166696  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  36166697 caagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  124 tctcaaatat 133  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618570
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  121 acatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389507
Alignment:
Q  116 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||     
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 49389507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465289
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||  | |  ||| ||||||||||| |||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaata-aacaatccaggcttactggaat 1465325  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     ||| || |||| | || ||||||||||||||||||    
T  1465324 gacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctc 1465289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 13442278 - 13442400
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13442278 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 13442376  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  13442377 gcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14576950 - 14576828
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | |    
T  14576950 acatcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataa-caacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaatt 14576852  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14576851 gcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11424876 - 11424783
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424876 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24153325 - 24153204
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24153325 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24153227  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  24153226 caagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37642368 - 37642207
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  37642368 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 37642269  T
Q  125 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  37642268 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7781508 - 7781351
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  7781508 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 17463179 - 17463336
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17463179 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 17672627 - 17672784
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17672627 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20698552 - 20698437
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | |    
T  20698552 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaatt 20698454  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20698453 gcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29172744 - 29172587
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29172744 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 34159327 - 34159484
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34159327 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45607068 - 45606911
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45607068 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 55476492 - 55476649
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55476492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282815
Alignment:
Q  12 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23083478 - 23083356
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  23083478 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38962042 - 38961895
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  38962042 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 38961945  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961944 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 28194694 - 28194759
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 76  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194694 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28848772 - 28848618
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28848772 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550482
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 43550527  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550526 ctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 8899095 - 8899252
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8899095 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9707768 - 9707611
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  9707768 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16454442 - 16454285
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16454442 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 606441 - 606324
Alignment:
Q  14 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  606441 catcatcattcatcttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatg 606343  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||||||||||||||||    
T  606342 caattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6469295 - 6469178
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6469295 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25476502 - 25476384
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25476502 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaa-aaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 26686891 - 26687013
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  26686891 catcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 26686989  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686990 gcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40213837 - 40213720
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| |||    
T  40213837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 43840944 - 43841058
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  43840944 tcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 43841042  T
Q  118 acaacatctcaaatat 133  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  43841043 acatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 12567571 - 12567718
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12567571 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 12567668  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567669 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 13544036 - 13544183
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  13544036 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 13544133  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544134 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 55500943 - 55501055
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55500943 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  110 gcaattcaacaacat 124  Q
    |||| ||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13151952 - 13151794
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13151952 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13154417 - 13154259
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13154417 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070657
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10247884 - 10247727
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10247884 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17446815 - 17446659
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17446815 catcatcttaatcaacttagacga-ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 15977516 - 15977633
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15977516 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 50242833 - 50242980
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  50242833 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaac 50242930  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  50242931 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 50242980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  37 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 135  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  136 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  69 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  165 tataccattaacaacaacat 184  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 17737237 - 17737294
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17737237 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124045
Alignment:
Q  12 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41124045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 8499519 - 8499566
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499519 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 8499566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 10556986 - 10557033
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10556986 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10557033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 15412430 - 15412477
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412430 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 15412477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927370
Alignment:
Q  177 aacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 243  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 43927370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45577999 - 45577952
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577999 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45577952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12119886 - 12119780
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12119886 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  110 gcaattcaa 118  Q
    |||| ||||    
T  12119788 gcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 44494810 - 44494857
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44494810 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac 44494857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919393
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatag 13919393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2924 - 2681
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2924 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggct 2727  T
Q  206 tactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2726 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 2681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 62202 - 62439
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  62202 catcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatg 62301  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  62302 ca---caacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactg 62398  T
Q  211 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  62399 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 62439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 132661 - 132895
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  132661 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaa 132760  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  132761 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 132852  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  132853 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctct 132895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 136681 - 136838
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  136681 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 139150 - 139307
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  139150 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 144088 - 144245
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  144088 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 134212 - 134369
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  134212 catcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 141619 - 141776
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  141619 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21502273 - 21502041
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21502273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatg 21502174  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502173 caagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 21502074  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagttt 241  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21502073 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21329614 - 21329374
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21329614 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatt 21329515  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21329514 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 21329416  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21329415 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttacctct 21329374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 21565545 - 21565786
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565545 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 21565743  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21565744 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 21565786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011913
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  26012154 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaa 26012055  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 207  Q
    ||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26012054 tgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggctta 26011956  T
Q  208 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26011955 ctgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaacctc 26011913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22959650 - 22959489
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959650 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatt 173  Q
    |||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026817
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||     
T  20026943 tcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacata-taattcaggcttactgaaacaactacaa 20026846  T
Q  223 caagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20026845 caagataaacaacttagtttcttacctct 20026817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 19668902 - 19669141
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668902 catcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 19669001  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta--gatcatattaattcaggctta 207  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||||  | |||| ||||    
T  19669002 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgca-tcagtctta 19669097  T
Q  208 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19669098 ctggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaacctct 19669141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19660952 - 19660715
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||     
T  19660952 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaata 19660853  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  19660852 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttact 19660757  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19660756 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 19660715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178103
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacag 22178125  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  22178124 taagataagcaacttagtttct 22178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21729181 - 21729059
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21729181 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21729083  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21729082 gcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21808506 - 21808384
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21808506 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21808408  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21808407 gcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144211
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23390613 - 23390491
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23390613 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 36314581 - 36314678
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314581 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 24493573 - 24493694
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24493573 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24493671  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  24493672 caagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8286960 - 8286838
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  8286960 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaat 8286862  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaata 132  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286861 tgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 13025315 - 13025436
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13025315 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13025413  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  13025414 caagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 13095499 - 13095620
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13095499 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13095597  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  13095598 caagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22412188 - 22412309
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22412188 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 22412286  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22412287 caagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 264929 - 264772
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  264929 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 1096474 - 1096593
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| ||||||    
T  1096474 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgca 1096572  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  1096573 aatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10733101 - 10732944
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10733101 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11581360 - 11581203
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11581360 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 24529224 - 24529339
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  24529224 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29329935 - 29330092
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29329935 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 39363385 - 39363542
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39363385 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 9077956 - 9078074
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  9077956 catcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21997651 - 21997549
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21997651 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  110 gcaa 113  Q
    ||||    
T  21997552 gcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075145
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataa-caacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 22075133  T
Q  122 catctcaaatat 133  Q
    ||||| ||||||    
T  22075134 catcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 25421536 - 25421658
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25421536 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 25421634  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421635 gcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Original strand, 40725871 - 40726032
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  40725871 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 40725970  T
Q  125 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40725971 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 20909013 - 20909170
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20909013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42245526 - 42245369
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  42245526 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20902012
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaaca 20902062  T
Q  121 acatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902061 acgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448159
Alignment:
Q  59 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 155  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  156 atacaa 161  Q
    ||||||    
T  29448154 atacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2154775 - 2154617
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  2154775 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 2154617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29345981 - 29346138
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29345981 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431518
Alignment:
Q  27 ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 25431512  T
Q  126 tcaaat 131  Q
    | ||||    
T  25431513 ttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 39245137 - 39245291
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39245137 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29348454 - 29348611
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29348454 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29348611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 29350927 - 29351084
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29350927 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29351084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36154941 - 36154787
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36154941 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 36154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20918109 - 20918052
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918109 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 32027394 - 32027551
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32027394 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataa-caacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32027551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10775837 - 10775790
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18319185 - 18319037
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  18319185 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 18319088  T
Q  119 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319087 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21293086 - 21293020
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293086 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064559
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 23064559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 38619435 - 38619482
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38619482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 79  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  73 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 31061069 - 31061124
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaa 67  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31061069 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaa 31061124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 26704074 - 26704122
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26704074 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26704122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 26973807 - 26973855
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26973807 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26973855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2095
Alignment:
Q  65 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  165 tataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctct 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10771
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  122 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaac 220  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaac 10740  T
Q  221 agcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10741 agcaagataaacaacttagtttcttacctct 10771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 12770 - 13010
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12770 catcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12869  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12870 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggcttact 12968  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12969 ggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaacctct 13010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39706405 - 39706187
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706405 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 39706306  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 210  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39706305 caagtcatgaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggcttacta 39706207  T
Q  211 aaataacaacagcaagataa 230  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  39706206 aaacaacaacagcaagataa 39706187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288094
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12288216 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaaca 12288119  T
Q  219 acagcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12288118 acagcaagataaacaacttagtttc 12288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 12774010 - 12774241
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774010 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 12774199  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12774200 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 12774241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 8846359 - 8846616
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgata-------------- 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |                  
T  8846359 acatcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  96 --taacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcat 192  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 8846558  T
Q  193 attaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||  | |||| ||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8846559 atgca-tcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaatctct 8846616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13727
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||      
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacata 13755  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13754 aagataaacaacttagtttcttacctct 13727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243192
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  120 aacatctcaaa 130  Q
    |||||||||||    
T  52243202 aacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 15551821 - 15551982
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  15551821 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaagg 15551920  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551921 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198429
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  120 aacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 217  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || | |    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcatt-agtcttactggaacatc 43198463  T
Q  218 aacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  43198462 aacaacaagataaacaacttagttttttacctct 43198429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082035
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 53082057  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  53082056 taagataagcaacttagtttct 53082035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099591
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15099555  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
     |||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  15099556 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctc 15099591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640339
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46640458 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacag 46640361  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  46640360 taagataagcaacttagtttct 46640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190556
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15190522  T
Q  215 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacc 247  Q
     |||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  15190523 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacc 15190556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16377630 - 16377522
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  16377630 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16377533  T
Q  119 caacatctcaa 129  Q
    |||||||||||    
T  16377532 caacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16240086 - 16239965
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16240086 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataa-caatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16239988  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  16239987 caagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 7088881 - 7088996
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7088881 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7088979  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||||| ||||||||    
T  7088980 gcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  45 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  144 catataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 44615289 - 44615446
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44615289 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 7798778 - 7798900
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7798778 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22636439 - 22636561
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22636439 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 6899895 - 6900016
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||    
T  6899895 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatg 6899993  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  6899994 caagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8574984 - 8574864
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  8574984 catcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 8574887  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8574886 taattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16270352 - 16270231
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16270352 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16270254  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  16270253 caagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52873484 - 52873363
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  52873484 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52873386  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaata 132  Q
    |||| |||||| ||||| |||||    
T  52873385 gcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12468 - 12311
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12468 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15118513 - 15118356
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15118513 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18215435 - 18215278
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18215435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44773248 - 44773091
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44773248 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 52312511 - 52312668
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  52312511 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 12902761 - 12902883
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  12902761 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 12902859  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | |||||| |||||||| ||||||    
T  12902860 gtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 14280317 - 14280438
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14280317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54798871 - 54798749
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  54798871 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19618323 - 19618176
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19618323 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 19618226  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618225 aacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44929041 - 44928883
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || |||    
T  44929041 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50222500 - 50222343
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50222500 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 50222343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51464029 - 51463872
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  51464029 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 51463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 7893707 - 7893829
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7893707 catcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7893805  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893806 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 44052833 - 44052955
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44052833 catcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 44052931  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  44052932 gcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  12 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 3096297 - 3096369
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096297 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18239580 - 18239426
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18239580 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1837670 - 1837513
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | |||    
T  1837670 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 19242700 - 19242857
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19242700 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19242797  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14970858 - 14970751
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  14970858 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 14970761  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  14970760 aacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 17046491 - 17046552
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046491 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 3515008 - 3515165
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||| || || || |||| |||||| |||    
T  3515008 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-aaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 3515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23803426 - 23803316
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23803426 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  110 gcaattcaacaac 122  Q
    |||| ||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15355476 - 15355328
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  15355476 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 15355379  T
Q  119 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355378 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7641343 - 7641286
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7641343 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 12610951 - 12611008
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12610951 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14053418 - 14053306
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  14053418 catcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 14053320  T
Q  111 caattcaacaacat 124  Q
    ||||||| ||||||    
T  14053319 caattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 44102215 - 44102372
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44102215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| | |||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44102372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 17333305 - 17333347
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 78  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333305 actcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190527
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacatag 6190527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10418
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659 acatcaccatcttcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 10560  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  10559 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 10461  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10460 tggaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 10418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 129908 - 130149
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129908 acatcttcatcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 130007  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  130008 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 130106  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  130107 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 130149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60713
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  124 tctcaaa 130  Q
    |||||||    
T  60719 tctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 132 - 372
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || ||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcac 330  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagataacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  331 tagaacaacaacagcaagataacaactcagtttctaacctct 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 19652198 - 19652437
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652198 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatcaacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 19652395  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19652396 ggaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 19652437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019649
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23019408 acatcatcatctttcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 23019507  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 207  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  23019508 tgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggctta 23019606  T
Q  208 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23019607 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctc 23019649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668615
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    |||||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||  |||| |||||||||| ||||    
T  19668486 aacatcac-aacatcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcata-tacatcagacttactgaaacaaca 19668583  T
Q  219 acagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19668584 acagcaagataaacaacttagtttcttacctc 19668615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080616
Alignment:
Q  66 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattat 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  166 ataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctct 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctct 22080616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 1561307 - 1561545
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1561307 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1561406  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttac 208  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| |||||    
T  1561407 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttac 1561502  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1561503 tggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 1561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28496588 - 28496351
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28496588 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 28496489  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||    
T  28496488 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttact 28496393  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  28496392 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactct 28496351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29808999 - 29808762
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29808999 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 29808900  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||    
T  29808899 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttact 29808804  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  29808803 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactct 29808762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098465
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaa 175  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27333335 - 27333238
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333335 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27394075 - 27393978
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394075 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4185939 - 4185827
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4185939 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaat 4185840  T
Q  110 gcaattcaacaac 122  Q
    |||||||| ||||    
T  4185839 gcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109295
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  20109140 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaa 20109239  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 162  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  20109240 tgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaat 20109295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 4186376 - 4186482
Alignment:
Q  16 tcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 115  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4186376 tcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 4186475  T
Q  116 caacaac 122  Q
    || ||||    
T  4186476 catcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 16496248 - 16496370
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  16496248 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 16496346  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16496347 gcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31155515 - 31155346
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31155515 acatcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaa 31155417  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 180  Q
    ||||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155416 tgcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 29060544 - 29060662
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29060544 catcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29060642  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  29060643 gcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 20076704 - 20076812
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  20076704 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 20076802  T
Q  111 caattcaaca 120  Q
    ||| ||||||    
T  20076803 caaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644444
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  121 acatctcaaa 130  Q
    ||||||||||    
T  25644435 acatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 1595550 - 1595707
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1595550 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18409944 - 18409826
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18409944 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaat 18409846  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18409845 gcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 22782228 - 22782385
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22782228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19303657 - 19303540
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  19303657 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 19303559  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19303558 caagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2291341 - 2291184
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  2291341 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8227625 - 8227453
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  8227625 catcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 8227526  T
Q  114 ttcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
     | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  8227525 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 12742318 - 12742475
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12742318 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18334753 - 18334596
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18334753 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 19005047 - 19005204
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19005047 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19859080 - 19858923
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19859080 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20638400 - 20638285
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20638400 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 20638302  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||| | ||||||||    
T  20638301 gcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 24422548 - 24422705
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24422548 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 33861795 - 33861952
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33861795 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 33864279 - 33864436
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33864279 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25629472 - 25629354
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25629472 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatta-caacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20557053 - 20556898
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||    
T  20557053 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30676861 - 30676714
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30676861 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaac 30676764  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676763 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  62 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  62 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 8055030 - 8055187
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8055030 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8055187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26924801 - 26924644
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  26924801 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26924644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17287913 - 17287791
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |    
T  17287913 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20361069 - 20360955
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  20361069 tcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 20360971  T
Q  118 acaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||| ||||||    
T  20360970 tcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 25754810 - 25754967
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25754810 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 25754967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 20593777 - 20593895
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20593777 catcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 20593875  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20593876 gcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Original strand, 25656630 - 25656731
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25656630 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  110 gcaa 113  Q
    ||||    
T  25656728 gcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 34963384 - 34963531
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  34963384 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 34963481  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963482 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1541072 - 1540918
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  1541072 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456877
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18456877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 25688513 - 25688620
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  25688513 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaac 25688610  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  25688611 aacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16920747 - 16920634
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  16920747 catcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaatt 16920650  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    | ||||| ||||||||    
T  16920649 ccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 230  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 35245590 - 35245703
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | |     
T  35245590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaattt 35245687  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35245688 caattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076969
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| ||| |||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttct 23076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 25714421 - 25714478
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25714421 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3852178 - 3852021
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||  |||    
T  3852178 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 3852021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  125 ctcaa 129  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831568
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16448678 - 16448530
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  16448678 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 16448581  T
Q  119 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448580 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 194
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  187 gatcatat 194  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22780344 - 22780297
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780344 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac 22780297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008387
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  35008366 taagataagcaacttagtttct 35008387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 11185515 - 11185568
Alignment:
Q  17 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacat 70  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11185515 catcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  187 gatcatatta 196  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333162
Alignment:
Q  174 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctct 27333162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393902
Alignment:
Q  174 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctct 27393902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 4738675 - 4738631
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  4738675 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaa 4738631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6001
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6141  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  6140 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 6042  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctc 249  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  6041 gaaacaataacagcaagataaataacttagtttttaacctc 6001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 6615 - 6850
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6615 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 6714  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6715 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttact 6813  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaa 245  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6814 aaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 13995 - 14230
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13995 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 14094  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14095 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttact 14193  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaa 245  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14194 aaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 160685 - 160927
Alignment:
Q  8 ggacatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  160685 ggacatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaa 160784  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||    
T  160785 atgcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtctt 160882  T
Q  207 actgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  160883 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctct 160927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 501095 - 501242
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  501095 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 501192  T
Q  120 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  501193 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 501242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 85741 - 85583
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  85741 catcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  110 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||| |||| ||| || |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 85583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32779
Alignment:
Q  10 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  32538 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 32637  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 207  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32638 tgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggctta 32735  T
Q  208 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32736 ctgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttacctct 32779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13178
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    |||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggcttac 13140  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13141 tgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaa 13178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18121
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  187 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 243  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18177 aaacata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttct 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22788 - 22613
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22788 acatcatcaccttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22689  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22688 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 82073 - 82230
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  82073 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 82230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 6822 - 7053
Alignment:
Q  17 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattc 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6822 catcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatc 6921  T
Q  117 aacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaata 215  Q
    |||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |    
T  6922 aacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaaca 7017  T
Q  216 acaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7018 acaacagcaagataaacaacttagtttctaacctct 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 250
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8259
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  188 atcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctct 8259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 916
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1151 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatg 1052  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||    
T  1051 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggcttact 954  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaac 246  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  953 gaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaac 916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45910 - 45669
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45910 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    | || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 45712  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45711 tggaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaacctct 45669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1326
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||    
T  1096 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatca 1195  T
Q  121 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 219  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||| || |||||    
T  1196 acatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttactggaacaacaa 1294  T
Q  220 cagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  1295 caacaagataaaaaacttagtttcttacctct 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7953
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 218  Q
    |||||| | || |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  8080 aacatcac-aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcata-taattcaggcttactga---aaca 7986  T
Q  219 acagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7985 acagcaagataaacaacttagtttcttacctct 7953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29242
Alignment:
Q  54 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatg 152  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  153 tatatacaattatata 168  Q
    ||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatata 29242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6166
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 6188  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
      |||||| |||||||||||||    
T  6187 tgagataagcaacttagtttct 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136252
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 221  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaaca 136274  T
Q  222 gcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  136273 gcaagataaacaacttagtttc 136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144960
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 221  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaaca 144982  T
Q  222 gcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  144981 gcaagataaacaacttagtttc 144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174886
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatc 174882  T
Q  126 tcaa 129  Q
    ||||    
T  174883 tcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 121770 - 121835
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  121770 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23897
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T
Q  110 gcaat 114  Q
    |||||    
T  23901 gcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 15665 - 15902
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15665 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||  || |||| ||||||    
T  15765 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaa-tcagtcttact 15860  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | |  |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15861 ggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 15902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38555
Alignment:
Q  30 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  128 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 226  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 38537  T
Q  227 ataa-caacttagtttct 243  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38538 ataagcaacttagtttct 38555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11457
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11296 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11396 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 2001 - 2162
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2001 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 2100  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2101 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 28418 - 28533
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  28418 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 28516  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||||||||||||||    
T  28517 gcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 4556 - 4608
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaaca 63  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4556 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128853
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  128874 taagataagcaacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78556
Alignment:
Q  30 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  128 aaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 226  Q
    ||  |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  78444 aac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 78541  T
Q  227 ataa-caacttagtt 240  Q
    |||| ||||||||||    
T  78542 ataagcaacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 116431 - 116551
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||    
T  116431 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatg 116528  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  116529 caagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 32101 - 32335
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32101 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaa 32200  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 208  Q
    || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  32201 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 32292  T
Q  209 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32293 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctct 32335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 1025
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1186 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
     || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1086 taaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38819 - 38697
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  38819 catcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 38720  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  38719 caagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12812
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  126 tcaaata--tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    |||||||  |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||   ||| || |||||||||| |||||||||    
T  12687 tcaaatacttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacatt-agacttactgaaacaacaacagc 12784  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  12785 aagataaacaacttagtttattacctct 12812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3267 - 3146
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  3267 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 3169  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3168 caagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103523
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  120 aacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 219  Q
    ||||||      ||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  103637 aacatc------at--acataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  220 cagcaagat-aacaacttagtttc 242  Q
    ||| ||||| || |||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttc 103523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15894 - 15792
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15894 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 15795  T
Q  111 caa 113  Q
    |||    
T  15794 caa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15765 - 15714
Alignment:
Q  195 taattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaa 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15765 taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 15714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 178897 - 178945
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  178897 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53425
Alignment:
Q  37 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 135  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  136 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 233  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||  ||||| |||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaa 53442  T
Q  234 cttagtttctaacctct 250  Q
    |||||||||| ||||||    
T  53441 cttagtttcttacctct 53425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97244
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 97222  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     |||| || |||||||||||||    
T  97223 taagaaaagcaacttagtttct 97244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106522
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 106500  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     |||| || |||||||||||||    
T  106501 taagaaaagcaacttagtttct 106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  126 tcaaatat 133  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3303 - 3185
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  3303 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 3205  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  3204 gtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 34127 - 34364
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  34127 catcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatg 34226  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 209  Q
     || ||||||||   |||| |||||| | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||    
T  34227 taaatcaacaac---tcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttact 34322  T
Q  210 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctct 250  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34323 ggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctct 34364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 285 - 324
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  285 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac 324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 39489 - 39602
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  39489 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39587  T
Q  119 caacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||    
T  39588 caacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19768
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| |  |||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacag 19790  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  19789 taagataagcaacttagtttct 19768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 39917 - 40038
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  39917 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 40015  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||  |||| ||||||| ||||||    
T  40016 catgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 75323 - 75210
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  75323 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 75225  T
Q  119 caacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||    
T  75224 caacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 39862 - 39983
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  39862 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatg 39960  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  39961 caagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 25908 - 26021
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  25908 tcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaa 26006  T
Q  119 caacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||    
T  26007 caacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25268
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  187 gatcatatta 196  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 1855 - 1977
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  1855 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33073 - 32952
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  33073 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 32975  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32974 caattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 45932 - 46053
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  45932 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 46030  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  46031 caattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 16117 - 16235
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||    
T  16117 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaat 16215  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||  ||||| ||||||||    
T  16216 gcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17446 - 17389
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Original strand, 87 - 243
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  187 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttct 243  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  187 aatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttct 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7943
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 223  Q
    | ||| | ||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| || |||| || |||| ||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtctcactggaacaacatcagc 7963  T
Q  224 aagat-aacaacttagtttc 242  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  7962 aagataaacaacttagtttc 7943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 4853 - 4968
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  4853 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 4951  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||||||||||||||    
T  4952 gcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13247
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  126 t 126  Q
    |    
T  13247 t 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16098
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  122 catctcaaa 130  Q
    |||||||||    
T  16106 catctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27747
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  122 catctcaaa 130  Q
    |||||||||    
T  27755 catctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11643
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-at 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  11492 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 11591  T
Q  134 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11592 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38349 - 38198
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-at 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  38349 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 38250  T
Q  134 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38249 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17334 - 17214
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc---aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  17334 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaa 17236  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17235 atgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79288
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatat 79288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17969
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 18031  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  18030 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2132
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  2280 atcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 2183  T
Q  119 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2182 taacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  14 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  113 attcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44824 - 44702
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44824 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 13215 - 13337
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13215 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28888 - 28806
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28888 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 32946 - 33067
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  32946 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 33044  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  33045 caagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 38765 - 38886
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38765 catcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38863  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  38864 caaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 9750 - 9908
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  9750 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagt 9847  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9848 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 9908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 20748 - 20905
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20748 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 37822 - 37979
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  37822 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 158611 - 158454
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  158611 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 340064 - 339949
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  340064 catcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat- 339968  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  339967 caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 3474 - 3596
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  3474 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 347 - 468
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | ||    
T  347 catcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattg 445  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     || |||||||||||| ||||||    
T  446 gaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 51917 - 52039
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  51917 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 168095 - 167973
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  168095 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 167997  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  167996 gcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 569 - 787
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    || | || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 765  T
Q  223 caagat-aacaacttagtttct 243  Q
      |||| |||||||||||||||    
T  766 ttagataaacaacttagtttct 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267898
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  223 caagataa-caacttagtttct 243  Q
     ||| ||| |||||||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttct 267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 10784 - 10891
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  10784 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 10881  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  10882 aacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 13393 - 13547
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13393 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8528
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  8646 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattg 8551  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||    
T  8550 caagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 4695 - 4852
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4695 catcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  62 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10427
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | |     
T  10540 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaattt 10443  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  10442 caattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 13948 - 14105
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13948 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 16785 - 16942
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16785 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1406
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  1293 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaatt 1390  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1391 caattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 7270 - 7383
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  7270 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatcaaatt 7367  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7368 caattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15355 - 15295
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15355 catcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacatag 15295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20383
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  126 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 128755 - 128876
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | | |  |   ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  128755 catcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 128853  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  128854 caagtcaacaacatcttaaatat 128876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 1043
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  1165 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 1067  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  1066 gcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 1956 - 2078
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  1956 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatt 2054  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  2055 gcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22887 - 23008
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22887 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15580 - 15466
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  15580 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattt 15482  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15481 caattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 32071 - 32184
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  32071 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaattt 32168  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32169 caattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  123 atctcaaatat 133  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1681
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||  |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 222  Q
    |||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | | |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  1800 tctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactggaacaacaatag 1703  T
Q  223 caagata-acaacttagtttct 243  Q
     ||||||  |||||||||||||    
T  1702 taagataggcaacttagtttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6241 - 6116
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac--caacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |    
T  6241 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaa 6142  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||    
T  6141 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4950 - 4890
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4950 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacatag 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9360
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  9253 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 9350  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  9351 aacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51699
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||||||| |||||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatc 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 40401 - 40558
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  40401 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacat--aattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13615
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | ||||| ||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcgattcatcaac 13611  T
Q  123 atct 126  Q
    ||||    
T  13612 atct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 4520 - 4633
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  4520 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 4617  T
Q  118 acaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  4618 acaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 12102 - 12215
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  12102 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 12199  T
Q  118 acaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  12200 acaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22167
Alignment:
Q  19 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  22054 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 22151  T
Q  118 acaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  22152 acaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16717 - 16599
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16717 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 16619  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    | || |||||| ||||||||    
T  16618 ggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 16286 - 16397
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  16286 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 16383  T
Q  111 caattcaacaacat 124  Q
    ||||||| ||||||    
T  16384 caattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 4716 - 4788
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4716 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 107 - 264
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  107 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5245 - 5132
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  5245 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaatt 5148  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5147 caattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 8483 - 8598
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  8483 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaatt 8581  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||    
T  8582 gcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2398
Alignment:
Q  65 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 163  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  164 atataccatta 174  Q
    ||||| |||||    
T  2408 atataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30090
Alignment:
Q  24 aacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || ||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T
Q  123 atctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     |||||| |||  ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30044 gtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21030
Alignment:
Q  25 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  124 tct 126  Q
    |||    
T  21028 tct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 11299 - 11446
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  11299 atcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 11396  T
Q  120 aacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11397 aacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4415
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  4308 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatcaac 4405  T
Q  120 aacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||    
T  4406 aacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  65 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 162  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  163 tatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 161239 - 161093
Alignment:
Q  23 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-ca 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  161239 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-atcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 161142  T
Q  121 acatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161141 acatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 1053
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| | |     
T  1166 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatcaattt 1069  T
Q  111 caattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1068 caattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12400 - 12253
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | ||| || ||||| | || |||||| ||||||| |||||    
T  12400 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaac 12303  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12302 aacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatat 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 12065 - 12216
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12065 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta-------aacagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 133
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4650
Alignment:
Q  28 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T
Q  127 caaatat 133  Q
     ||||||    
T  4644 taaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 46999 - 47065
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 77  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  46999 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4373
Alignment:
Q  11 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-cgacagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  110 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11447
Alignment:
Q  13 tcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | | |    
T  11558 tcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttc 11460  T
Q  112 aattcaacaacat 124  Q
    |||||| ||||||    
T  11459 aattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23890
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23842 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 23890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 36453 - 36501
Alignment:
Q  10 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36453 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 36501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  26 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 1432 - 1395
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1432 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University