View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7894_low_20 (Length: 408)

Name: NF7894_low_20
Description: NF7894
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7894_low_20
NF7894_low_20
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (13-393)||(12029971-12030354)
chr3 (13-393)||(2049866-2050248)
chr3 (13-393)||(13838950-13839328)
chr3 (70-393)||(14842442-14842768)
chr3 (179-393)||(51158008-51158225)
chr3 (160-393)||(15858993-15859231)
chr3 (195-393)||(15936633-15936834)
chr3 (13-393)||(17912297-17912688)
chr3 (13-348)||(19260648-19260983)
chr3 (70-393)||(15614890-15615214)
chr3 (115-393)||(15938394-15938676)
chr3 (114-321)||(16744040-16744247)
chr3 (189-384)||(13975722-13975920)
chr3 (67-384)||(45860870-45861202)
chr3 (13-147)||(38168237-38168371)
chr3 (189-384)||(13954890-13955088)
chr3 (114-254)||(19231979-19232122)
chr3 (205-384)||(55316284-55316467)
chr3 (220-384)||(16821204-16821372)
chr3 (205-384)||(41270140-41270323)
chr3 (189-321)||(2449238-2449370)
chr3 (15-147)||(30153265-30153396)
chr3 (67-348)||(54651561-54651844)
chr3 (13-147)||(33342204-33342332)
chr3 (13-147)||(54685105-54685233)
chr3 (13-110)||(5240528-5240624)
chr3 (67-348)||(11986032-11986326)
chr3 (67-147)||(53771365-53771445)
chr3 (67-147)||(16261777-16261857)
chr3 (74-147)||(28558494-28558567)
chr3 (70-147)||(2449107-2449184)
chr3 (74-147)||(51960990-51961063)
chr3 (67-147)||(13954756-13954836)
chr3 (204-259)||(14080701-14080757)
chr3 (70-314)||(25058876-25059123)
chr3 (115-314)||(12902007-12902209)
chr3 (73-147)||(14285289-14285363)
chr3 (74-308)||(12264668-12264905)
chr3 (70-147)||(23492696-23492773)
chr3 (13-54)||(54037921-54037962)
chr3 (73-314)||(18911130-18911374)
chr3 (205-313)||(4145814-4145923)
chr3 (203-348)||(6228623-6228769)
chr3 (195-314)||(49232573-49232694)
chr3 (206-289)||(47784767-47784851)
chr3 (73-147)||(16933827-16933901)
chr3 (204-289)||(17191703-17191789)
chr3 (204-289)||(17204843-17204929)
chr3 (73-147)||(19947026-19947100)
chr3 (70-147)||(8268605-8268682)
chr3 (70-147)||(8275705-8275782)
chr3 (13-54)||(17955777-17955818)
chr3 (114-147)||(17955883-17955916)
chr3 (114-150)||(15857162-15857198)
chr3 (206-289)||(17139670-17139754)
chr3 (206-289)||(30207378-30207462)
chr3 (206-288)||(3576439-3576522)
chr3 (196-308)||(5228456-5228570)
chr3 (205-348)||(14814765-14814909)
chr3 (204-313)||(41661702-41661813)
chr3 (204-289)||(9590753-9590839)
chr3 (73-147)||(11477053-11477127)
chr3 (195-285)||(15468338-15468428)
chr3 (195-285)||(22275377-22275467)
chr3 (114-147)||(2844514-2844547)
chr3 (114-147)||(3992873-3992906)
chr3 (225-289)||(34560061-34560126)
chr3 (114-147)||(54038023-54038056)
chr3 (114-147)||(55513193-55513226)
chr3 (206-289)||(12953126-12953210)
chr3 (208-287)||(13301472-13301552)
chr3 (208-287)||(13312128-13312208)
chr3 (204-287)||(15517795-15517879)
chr3 (223-313)||(31412351-31412443)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (13-393)||(16211822-16212204)
chr7 (13-393)||(36052723-36053104)
chr7 (40-393)||(11580586-11580946)
chr7 (40-384)||(13036863-13037212)
chr7 (116-393)||(3060022-3060302)
chr7 (115-393)||(18253760-18254042)
chr7 (73-383)||(47480902-47481228)
chr7 (207-391)||(16478968-16479155)
chr7 (70-393)||(13321070-13321411)
chr7 (189-384)||(25292338-25292536)
chr7 (205-384)||(13572741-13572924)
chr7 (205-384)||(10989475-10989657)
chr7 (13-147)||(3049905-3050039)
chr7 (195-384)||(2437522-2437715)
chr7 (70-321)||(30261998-30262261)
chr7 (189-321)||(11516358-11516490)
chr7 (189-321)||(15441564-15441696)
chr7 (221-384)||(13911044-13911212)
chr7 (70-321)||(7293147-7293410)
chr7 (73-342)||(295849-296119)
chr7 (13-147)||(25124450-25124583)
chr7 (13-147)||(2029244-2029372)
chr7 (13-110)||(17817259-17817355)
chr7 (13-110)||(19049646-19049742)
chr7 (67-147)||(42056140-42056220)
chr7 (46-221)||(36024372-36024554)
chr7 (67-147)||(2190037-2190117)
chr7 (46-204)||(15709406-15709570)
chr7 (13-147)||(15516660-15516793)
chr7 (70-147)||(11516544-11516621)
chr7 (70-147)||(15441433-15441510)
chr7 (72-314)||(18979895-18980140)
chr7 (204-289)||(16914927-16915013)
chr7 (195-289)||(48622664-48622758)
chr7 (70-147)||(14113858-14113935)
chr7 (116-314)||(15950709-15950910)
chr7 (70-146)||(25292207-25292283)
chr7 (70-314)||(13758507-13758754)
chr7 (204-289)||(9611470-9611556)
chr7 (204-289)||(9839041-9839127)
chr7 (72-314)||(15927705-15927950)
chr7 (13-54)||(32493843-32493884)
chr7 (206-289)||(13377691-13377775)
chr7 (70-314)||(15759986-15760233)
chr7 (205-348)||(28722213-28722357)
chr7 (73-147)||(371417-371491)
chr7 (189-231)||(14113989-14114031)
chr7 (189-231)||(14423639-14423681)
chr7 (204-289)||(48356806-48356892)
chr7 (205-304)||(14271899-14272000)
chr7 (70-147)||(14423509-14423585)
chr7 (205-313)||(14935497-14935607)
chr7 (205-313)||(15363090-15363200)
chr7 (114-147)||(126738-126771)
chr7 (73-146)||(10000245-10000318)
chr7 (205-348)||(14940858-14940999)
chr7 (226-313)||(15358934-15359023)
chr7 (114-147)||(32493945-32493978)
chr7 (205-313)||(15368485-15368592)
chr7 (206-289)||(49047675-49047759)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (13-393)||(1180-1563)
scaffold0266 (13-393)||(3407-3789)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (13-348)||(121993-122327)
chr4 (40-393)||(13246486-13246844)
chr4 (46-393)||(15674940-15675296)
chr4 (114-393)||(54118167-54118451)
chr4 (46-381)||(10104101-10104445)
chr4 (216-393)||(31115685-31115865)
chr4 (189-384)||(13048221-13048420)
chr4 (205-384)||(10644284-10644467)
chr4 (189-321)||(26680331-26680463)
chr4 (46-261)||(33240891-33241112)
chr4 (189-321)||(10488693-10488825)
chr4 (189-321)||(16327926-16328058)
chr4 (205-384)||(47357719-47357902)
chr4 (204-381)||(40885569-40885749)
chr4 (67-147)||(15135859-15135939)
chr4 (67-147)||(15272163-15272243)
chr4 (65-223)||(31132543-31132707)
chr4 (40-146)||(55376420-55376525)
chr4 (70-348)||(17145529-17145809)
chr4 (70-147)||(16327795-16327872)
chr4 (70-147)||(16608968-16609045)
chr4 (70-147)||(26680517-26680594)
chr4 (205-344)||(7850107-7850247)
chr4 (73-147)||(32460561-32460635)
chr4 (116-314)||(18169107-18169308)
chr4 (73-314)||(7131940-7132184)
chr4 (22-147)||(40885368-40885491)
chr4 (73-147)||(8045272-8045346)
chr4 (206-289)||(15044990-15045074)
chr4 (73-314)||(22738406-22738650)
chr4 (72-147)||(14952085-14952160)
chr4 (70-314)||(20000860-20001107)
chr4 (77-147)||(14500074-14500144)
chr4 (204-289)||(18276596-18276682)
chr4 (204-289)||(47535064-47535150)
chr4 (360-393)||(111451-111484)
chr4 (70-147)||(10488879-10488956)
chr4 (223-348)||(18238175-18238301)
chr4 (195-314)||(19020623-19020744)
chr4 (239-337)||(8374623-8374722)
chr4 (206-289)||(13809511-13809595)
chr4 (206-289)||(15109350-15109434)
chr4 (70-146)||(26339327-26339403)
chr4 (204-294)||(7964711-7964802)
chr4 (205-287)||(15013283-15013365)
chr4 (70-140)||(13048090-13048160)
chr4 (73-147)||(14996445-14996519)
chr4 (115-147)||(16523146-16523178)
chr4 (205-303)||(40904934-40905034)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (13-393)||(20931401-20931783)
chr1 (13-393)||(20913093-20913468)
chr1 (13-393)||(37844275-37844658)
chr1 (40-393)||(20445735-20446094)
chr1 (40-393)||(20531500-20531858)
chr1 (40-393)||(20893476-20893833)
chr1 (114-391)||(41394280-41394560)
chr1 (70-388)||(45051484-45051803)
chr1 (219-393)||(2116310-2116488)
chr1 (116-393)||(22227865-22228146)
chr1 (116-393)||(22232562-22232843)
chr1 (220-384)||(18601137-18601305)
chr1 (205-384)||(5072392-5072575)
chr1 (189-321)||(51452623-51452755)
chr1 (70-147)||(51452809-51452886)
chr1 (204-348)||(22143360-22143505)
chr1 (70-147)||(2116558-2116635)
chr1 (70-146)||(7640806-7640882)
chr1 (206-289)||(17609090-17609174)
chr1 (206-289)||(20177337-20177421)
chr1 (204-348)||(21195117-21195262)
chr1 (116-147)||(15861327-15861358)
chr1 (239-314)||(17148704-17148781)
chr1 (195-314)||(18059756-18059877)
chr1 (114-147)||(21860334-21860367)
chr1 (206-278)||(36356294-36356367)
chr1 (114-147)||(44034870-44034903)
chr1 (70-146)||(22035755-22035831)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (13-393)||(16193542-16193923)
chr8 (13-393)||(43373291-43373675)
chr8 (13-393)||(24928615-24928998)
chr8 (114-393)||(16404899-16405179)
chr8 (207-391)||(6774264-6774451)
chr8 (207-393)||(24549038-24549227)
chr8 (189-393)||(17345626-17345832)
chr8 (205-384)||(21844576-21844759)
chr8 (205-384)||(21851969-21852152)
chr8 (205-384)||(30120787-30120970)
chr8 (70-321)||(22907083-22907346)
chr8 (189-321)||(5238218-5238350)
chr8 (189-321)||(24661248-24661380)
chr8 (189-321)||(43685677-43685809)
chr8 (13-147)||(24385551-24385684)
chr8 (205-384)||(16674396-16674579)
chr8 (264-384)||(222754-222878)
chr8 (264-384)||(736377-736501)
chr8 (264-384)||(860272-860396)
chr8 (40-147)||(41506634-41506741)
chr8 (70-147)||(5238404-5238481)
chr8 (70-147)||(24661117-24661194)
chr8 (70-147)||(43685863-43685940)
chr8 (67-146)||(7000472-7000551)
chr8 (264-322)||(691909-691967)
chr8 (73-147)||(21494314-21494388)
chr8 (204-289)||(26011656-26011742)
chr8 (116-314)||(22006176-22006377)
chr8 (73-314)||(13720803-13721047)
chr8 (73-147)||(3431134-3431208)
chr8 (73-147)||(22886654-22886728)
chr8 (115-308)||(16195374-16195570)
chr8 (206-289)||(17285366-17285450)
chr8 (204-259)||(23226075-23226131)
chr8 (70-314)||(16872923-16873170)
chr8 (204-289)||(15933460-15933546)
chr8 (204-289)||(25296320-25296406)
chr8 (204-289)||(25758340-25758426)
chr8 (73-314)||(13662140-13662384)
chr8 (205-289)||(21198152-21198237)
chr8 (114-147)||(24716761-24716794)
chr8 (223-348)||(33172331-33172457)
chr8 (204-289)||(5854776-5854862)
chr8 (204-246)||(23149985-23150027)
chr8 (114-147)||(274766-274799)
chr8 (114-147)||(641050-641083)
chr8 (114-147)||(826856-826889)
chr8 (70-155)||(17345879-17345964)
chr8 (115-147)||(2545265-2545297)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (13-393)||(41785-42165)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (13-393)||(462794-463165)
chr2 (40-393)||(36982289-36982648)
chr2 (57-385)||(8891306-8891639)
chr2 (114-393)||(20627237-20627520)
chr2 (65-393)||(24341259-24341596)
chr2 (114-393)||(43642880-43643164)
chr2 (114-383)||(19794628-19794901)
chr2 (70-348)||(25265258-25265549)
chr2 (189-384)||(17396653-17396851)
chr2 (70-321)||(19689270-19689533)
chr2 (40-211)||(22863169-22863342)
chr2 (189-321)||(23820202-23820334)
chr2 (193-391)||(7507848-7508049)
chr2 (189-321)||(14906440-14906572)
chr2 (205-384)||(19886665-19886848)
chr2 (189-321)||(20015142-20015274)
chr2 (13-147)||(9652700-9652828)
chr2 (67-147)||(21273901-21273980)
chr2 (70-314)||(12728529-12728776)
chr2 (70-314)||(34824612-34824859)
chr2 (70-147)||(14906309-14906386)
chr2 (70-147)||(23820388-23820465)
chr2 (70-314)||(8943983-8944230)
chr2 (70-314)||(12635740-12635987)
chr2 (40-146)||(32466177-32466281)
chr2 (67-147)||(17396519-17396599)
chr2 (70-314)||(12641514-12641761)
chr2 (72-147)||(20015328-20015403)
chr2 (15-54)||(22275139-22275178)
chr2 (204-289)||(24884848-24884934)
chr2 (73-147)||(33128372-33128446)
chr2 (206-289)||(68154-68238)
chr2 (70-314)||(16935730-16935977)
chr2 (70-314)||(17006390-17006637)
chr2 (15-54)||(22284372-22284411)
chr2 (73-147)||(17204659-17204733)
chr2 (115-314)||(23777962-23778164)
chr2 (73-147)||(28031092-28031166)
chr2 (114-147)||(22284278-22284311)
chr2 (70-314)||(3798475-3798722)
chr2 (208-287)||(19660044-19660124)
chr2 (70-146)||(23774444-23774520)
chr2 (212-286)||(19669116-19669191)
chr2 (116-147)||(25213372-25213403)
chr2 (206-276)||(22579863-22579933)
chr2 (223-348)||(9636848-9636974)
chr2 (114-147)||(22275045-22275078)
chr2 (115-147)||(7507757-7507789)
chr2 (114-146)||(15633538-15633570)
chr2 (206-289)||(22775206-22775290)
chr2 (206-289)||(22780584-22780668)
chr2 (206-285)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (13-393)||(8934-9316)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (13-393)||(36733-37120)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-335)||(51009-51328)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (13-394)||(127994-128376)
scaffold0008 (222-384)||(31696-31863)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (70-393)||(23507021-23507347)
chr5 (40-393)||(27182396-27182754)
chr5 (66-393)||(22053704-22054040)
chr5 (46-393)||(18530919-18531274)
chr5 (207-393)||(29188290-29188479)
chr5 (189-393)||(34939334-34939540)
chr5 (205-384)||(27009906-27010089)
chr5 (205-384)||(43443399-43443582)
chr5 (189-321)||(20623100-20623232)
chr5 (189-321)||(21233528-21233660)
chr5 (205-384)||(18777996-18778179)
chr5 (191-321)||(25900408-25900538)
chr5 (205-384)||(19499964-19500147)
chr5 (205-384)||(22366485-22366668)
chr5 (205-384)||(25426693-25426876)
chr5 (189-321)||(16536328-16536460)
chr5 (189-321)||(37052875-37053007)
chr5 (221-384)||(4200005-4200172)
chr5 (205-384)||(12439-12622)
chr5 (205-383)||(21073599-21073781)
chr5 (13-147)||(21651018-21651146)
chr5 (13-147)||(21205249-21205381)
chr5 (67-147)||(108680-108760)
chr5 (13-152)||(23981308-23981442)
chr5 (70-348)||(32950797-32951089)
chr5 (40-145)||(2032135-2032240)
chr5 (70-314)||(1219392-1219639)
chr5 (70-314)||(23514698-23514945)
chr5 (70-147)||(20623286-20623363)
chr5 (70-147)||(21233397-21233474)
chr5 (70-147)||(37053061-37053138)
chr5 (204-289)||(21310708-21310794)
chr5 (70-147)||(16536514-16536591)
chr5 (74-147)||(25005137-25005210)
chr5 (70-147)||(25900275-25900352)
chr5 (70-308)||(35790970-35791211)
chr5 (76-147)||(7529228-7529299)
chr5 (205-287)||(29918129-29918212)
chr5 (116-285)||(11211983-11212153)
chr5 (204-289)||(19862371-19862457)
chr5 (205-301)||(23981516-23981614)
chr5 (195-314)||(10777968-10778089)
chr5 (73-147)||(9730236-9730310)
chr5 (204-289)||(21297174-21297260)
chr5 (206-289)||(5450844-5450928)
chr5 (115-147)||(16105967-16105999)
chr5 (206-289)||(21222609-21222693)
chr5 (70-146)||(23328865-23328941)
chr5 (70-146)||(24616469-24616545)
chr5 (70-146)||(24712845-24712921)
chr5 (70-146)||(24745863-24745939)
chr5 (205-287)||(22885806-22885889)
chr5 (204-289)||(432625-432711)
chr5 (195-285)||(17471586-17471676)
chr5 (206-286)||(21617181-21617262)
chr5 (195-314)||(36989768-36989889)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (13-385)||(48662-49036)
scaffold0023 (222-384)||(36158-36324)
scaffold0023 (70-314)||(153879-154126)
scaffold0023 (115-147)||(61122-61154)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (13-393)||(171961-172343)
scaffold0001 (13-393)||(177664-178046)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (13-393)||(12171-12552)
[»] scaffold0162 (4 HSPs)
scaffold0162 (13-393)||(26244-26622)
scaffold0162 (74-393)||(8051-8384)
scaffold0162 (70-147)||(12063-12140)
scaffold0162 (203-289)||(7023-7110)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (41-393)||(23153503-23153860)
chr6 (116-393)||(14626045-14626325)
chr6 (70-391)||(1649976-1650298)
chr6 (77-348)||(35009314-35009598)
chr6 (189-393)||(1657748-1657954)
chr6 (189-345)||(15862578-15862734)
chr6 (41-184)||(23148266-23148409)
chr6 (67-381)||(29665941-29666261)
chr6 (205-384)||(25175628-25175811)
chr6 (205-384)||(27653987-27654170)
chr6 (205-384)||(16825756-16825941)
chr6 (40-274)||(27751603-27751849)
chr6 (67-147)||(23995247-23995327)
chr6 (33-147)||(26090059-26090172)
chr6 (72-314)||(16232029-16232274)
chr6 (73-145)||(15742078-15742150)
chr6 (70-314)||(1556142-1556389)
chr6 (204-289)||(16887791-16887877)
chr6 (204-289)||(18629607-18629693)
chr6 (270-380)||(27740907-27741021)
chr6 (73-147)||(32276617-32276691)
chr6 (207-304)||(17083200-17083298)
chr6 (73-147)||(18002353-18002427)
chr6 (73-147)||(18823241-18823315)
chr6 (205-287)||(29605614-29605696)
chr6 (204-259)||(35136012-35136068)
chr6 (70-314)||(23977906-23978153)
chr6 (73-135)||(16299844-16299906)
chr6 (205-289)||(17557018-17557102)
chr6 (195-314)||(18086821-18086942)
chr6 (70-308)||(19610161-19610402)
chr6 (46-90)||(14128505-14128548)
chr6 (206-289)||(21623330-21623414)
chr6 (204-259)||(33324884-33324940)
chr6 (116-147)||(4991396-4991427)
chr6 (204-313)||(33538369-33538479)
chr6 (73-147)||(18839096-18839170)
chr6 (204-289)||(22361764-22361850)
chr6 (70-147)||(1657616-1657693)
chr6 (70-155)||(15862781-15862866)
chr6 (195-314)||(16556137-16556258)
chr6 (195-314)||(16632693-16632814)
chr6 (114-147)||(19983191-19983224)
chr6 (195-314)||(22225736-22225857)
chr6 (114-147)||(35015056-35015089)
chr6 (206-289)||(18381684-18381768)
chr6 (206-289)||(18399100-18399184)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (13-393)||(272081-272463)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (61-393)||(5936-6270)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (69-393)||(247320-247649)
scaffold0012 (70-313)||(34030-34276)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (46-393)||(123018-123371)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (70-393)||(837-1162)
scaffold0175 (13-106)||(15238-15325)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (40-340)||(89303-89605)
scaffold0028 (40-240)||(107633-107835)
scaffold0028 (204-259)||(79731-79787)
scaffold0028 (116-147)||(130880-130911)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (118-393)||(19262-19543)
scaffold0195 (189-393)||(21346-21553)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (157-393)||(148777-149018)
scaffold0025 (46-383)||(8915-9261)
scaffold0025 (13-348)||(146704-147039)
scaffold0025 (13-89)||(149014-149090)
scaffold0025 (223-289)||(53508-53575)
scaffold0025 (205-313)||(85670-85779)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (125-393)||(4996-5268)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (192-393)||(48243-48447)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (115-393)||(107803-108085)
scaffold0026 (205-384)||(64527-64715)
scaffold0026 (205-255)||(89864-89915)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (220-393)||(9368-9544)
scaffold0215 (220-393)||(16266-16442)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (189-385)||(534-733)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (73-348)||(41752-42039)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (193-384)||(5593-5788)
scaffold0772 (70-147)||(5846-5923)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (205-393)||(5220-5411)
scaffold0022 (206-289)||(102923-103007)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (81-348)||(13610-13890)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (207-345)||(13331-13469)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (189-391)||(34460-34666)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (195-391)||(3020-3220)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (70-393)||(3778-4106)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (195-384)||(21110-21302)
scaffold0139 (220-384)||(14080-14247)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (205-384)||(100-283)
scaffold0116 (70-147)||(338-415)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (13-147)||(193296-193429)
scaffold0004 (223-313)||(27634-27726)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (205-384)||(43062-43245)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (13-147)||(12317-12450)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (189-321)||(26926-27058)
scaffold0141 (193-321)||(22671-22799)
scaffold0141 (70-147)||(22857-22934)
scaffold0141 (70-147)||(27112-27189)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (189-321)||(1582-1714)
scaffold0124 (70-147)||(1451-1528)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (189-321)||(37066-37198)
scaffold0078 (70-147)||(36935-37012)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (14-147)||(6343-6475)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (205-336)||(1308-1439)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (13-147)||(782-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (13-147)||(9786-9914)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (69-348)||(45134-45416)
scaffold0066 (69-348)||(54520-54802)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (13-147)||(17208-17336)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (189-348)||(3293-3453)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (192-348)||(56102-56259)
scaffold0084 (67-147)||(55965-56045)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (46-147)||(55904-56005)
scaffold0032 (70-147)||(108030-108107)
scaffold0032 (204-301)||(104622-104721)
scaffold0032 (205-289)||(93773-93858)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (67-147)||(13237-13317)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (70-314)||(10211-10458)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (67-147)||(57344-57424)
scaffold0058 (204-258)||(70306-70361)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (40-146)||(25532-25637)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (72-146)||(339-413)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (73-147)||(5549-5623)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (204-289)||(8172-8258)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (73-147)||(34266-34340)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (73-158)||(18015-18100)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (204-348)||(22428-22573)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (342-393)||(48570-48621)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (204-304)||(1347-1449)
scaffold0409 (204-304)||(9602-9704)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (70-314)||(1447-1694)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (204-301)||(22421-22520)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (195-337)||(53990-54132)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (335-393)||(1-59)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (204-289)||(2687-2773)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (73-147)||(5434-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (73-147)||(4304-4378)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (73-147)||(49710-49784)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (241-337)||(3529-3625)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (206-289)||(2317-2401)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (204-246)||(1545-1587)
scaffold0456 (204-246)||(8690-8732)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (206-259)||(10854-10908)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (73-147)||(95298-95372)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (205-289)||(76847-76932)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (114-147)||(80187-80220)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (206-289)||(6823-6907)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (204-351)||(961-1109)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (204-313)||(30101-30212)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (207-289)||(28698-28781)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (73-147)||(6068-6142)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (73-147)||(9370-9444)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (206-287)||(31184-31266)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (223-348)||(7693-7819)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (360-393)||(9438-9471)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (223-348)||(3354-3480)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (226-313)||(4742-4831)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (195-314)||(39783-39904)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (115-147)||(17209-17241)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (206-289)||(35640-35724)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 12029971 - 12030354
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12029971 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 12030070  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12030071 tctaaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgt 12030170  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12030171 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtga 12030270  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12030271 aagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaat 12030354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2050248 - 2049866
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2050248 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagtttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 2050150  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2050149 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 2050050  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2050049 gctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtga 2049950  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2049949 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaat 2049866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13839328 - 13838950
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |    
T  13839328 gagaagaaaaagggttagagagaagaa------cttgaagaattgaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtagggattactcttca 13839235  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13839234 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcg 13839135  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  13839134 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 13839035  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13839034 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 13838950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Original strand, 14842442 - 14842768
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || | |||||    
T  14842442 agcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaa 14842541  T
Q  170 tgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtt 269  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14842542 tgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgtt 14842641  T
Q  270 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattct 366  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  14842642 ggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattct 14842741  T
Q  367 tgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14842742 tgttcaattgatgttatggatgttaat 14842768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 179 - 393
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158225
Alignment:
Q  179 aattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  279 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaatt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||||||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  376 gatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| |||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaat 51158225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 160 - 393
Target Start/End: Original strand, 15858993 - 15859231
Alignment:
Q  160 aaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15858993 aaatttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 15859092  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttg 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||    
T  15859093 tgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 15859192  T
Q  355 agatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15859193 agttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 15859231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 195 - 393
Target Start/End: Original strand, 15936633 - 15936834
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15936633 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 15936732  T
Q  295 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgtta 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15936733 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  392 at 393  Q
    ||    
T  15936833 at 15936834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 17912297 - 17912688
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  17912297 gagaagaacaagggttaaagagaagagggagagcttgaagaatcaagg-ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctgaggtgggattaatcttta 17912395  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgtt-gtatgaattttgctta----------tggataattgtt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||  | | || ||||||| |  | | |          ||||||||||||    
T  17912396 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcatttattgcaattttcattatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgtt 17912495  T
Q  202 gcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg 301  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17912496 gctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatg 17912594  T
Q  302 ataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||| || |||   ||| | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  17912595 aaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaat 17912688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Original strand, 19260648 - 19260983
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260648 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagattaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttta 19260746  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19260747 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgt 19260846  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat-gataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgt 310  Q
    |||| || | |||||||||||||  ||| ||||| | || |||||||| |   ||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||  |    
T  19260847 gctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgtt 19260946  T
Q  311 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19260947 gaaaa-tatgctcaattggtgaattatactaagttgtt 19260983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15615214 - 15614890
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   | ||||  |    
T  15615214 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgc--attttctca 15615118  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||  ||| | ||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15615117 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgt 15615018  T
Q  269 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  15615017 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattc 15614918  T
Q  366 ttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614917 ttgctcaattgatgttatggttgttaat 15614890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 115 - 393
Target Start/End: Original strand, 15938394 - 15938676
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||| | |||| ||||    
T  15938394 taaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtg 15938493  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15938494 ctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 15938593  T
Q  314 aattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15938594 aattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 15938676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Original strand, 16744040 - 16744247
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  16744040 ttaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtg 16744139  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16744140 ctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 16744239  T
Q  314 aattgtgc 321  Q
    ||||||||    
T  16744240 aattgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975920
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttg---ttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45861202 - 45860870
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | || |||||     
T  45861202 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatattcattctttgcaatttt 45861103  T
Q  167 aaatg--ttgtatgaattttgct----------tatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 254  Q
      |||  ||||||||| |  | |           ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45861102 tcatgaattgtatgaaatgggttgaaaggaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgat 45861004  T
Q  255 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttg---ttaa 350  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||    
T  45861003 gattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaa 45860904  T
Q  351 tttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  45860903 tttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38168371 - 38168237
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  38168371 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttca 38168272  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168271 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955088
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttg---ttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19232122 - 19231979
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  19232122 ttaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 19232023  T
Q  211 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19232022 gtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 55316467 - 55316284
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55316467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 55316368  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  55316367 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 55316284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16821372 - 16821204
Alignment:
Q  220 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||    
T  16821372 ctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgt 16821273  T
Q  320 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16821272 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 16821204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41270323 - 41270140
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41270323 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 41270224  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  41270223 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 41270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449370
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30153396 - 30153265
Alignment:
Q  15 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||     
T  30153396 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggggtgagcttaggagctaaagagaagtctaagttgggattaatcttcatc 30153298  T
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54651844 - 54651561
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttc 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| || ||||||    
T  54651844 gtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttc 54651745  T
Q  167 aaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagat 265  Q
      ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  54651744 tcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgat 54651645  T
Q  266 tgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    |||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  54651644 tgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtgaattttgatatgttgtt 54651561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33342332 - 33342204
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  33342332 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttca 33342239  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342238 tctaaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 54685105 - 54685233
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  54685105 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaaattaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttca 54685198  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54685199 tccaaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 54685233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 5240528 - 5240624
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5240528 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa-tcaagattggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatctt 5240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 348
Target Start/End: Original strand, 11986032 - 11986326
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaa--tt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  || ||  |     
T  11986032 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaacttc 11986131  T
Q  165 tcaaatgttgtatgaatt---ttgctt-------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 254  Q
    ||   ||||||||||| |   ||| ||       || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||||    
T  11986132 tcctttgttgtatgaaatgggttgattggaatgaattgataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgat 11986231  T
Q  255 aattgtaagattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  || || ||||||  ||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11986232 aattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgtt 11986326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 53771445 - 53771365
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771445 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16261857 - 16261777
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261857 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28558567 - 28558494
Alignment:
Q  74 taggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28558567 taggagcaaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagagggttagtttttatcataatcat 28558494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 2449107 - 2449184
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449107 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 51960990 - 51961063
Alignment:
Q  74 taggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51960990 taggaggtaaagtgaagtctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 13954756 - 13954836
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954756 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14080757 - 14080701
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14080757 aaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 14080701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25059123 - 25058876
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||   || || || ||||||||  |  |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  25059123 agcttaggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctca 25059024  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  25059023 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 25058924  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  25058923 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 25058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Original strand, 12902007 - 12902209
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| |||||| |||| |||||||||    
T  12902007 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtg 12902106  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  12902107 ctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 12902206  T
Q  312 aaa 314  Q
    |||    
T  12902207 aaa 12902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14285363 - 14285289
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285363 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 308
Target Start/End: Original strand, 12264668 - 12264905
Alignment:
Q  74 taggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgtt 173  Q
    |||||||| ||||||||   | ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |||||    
T  12264668 taggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12264767  T
Q  174 gtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggt 272  Q
    |||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  12264768 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12264867  T
Q  273 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  12264868 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 12264905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23492773 - 23492696
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492773 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 54037921 - 54037962
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037921 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54037962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18911374 - 18911130
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||    
T  18911374 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 18911275  T
Q  173 tgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 271  Q
    ||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  18911274 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 18911175  T
Q  272 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18911174 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145923
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgat 303  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |   |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgat 4145913  T
Q  304 aagttgtgaa 313  Q
    |  |||||||    
T  4145914 atattgtgaa 4145923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Original strand, 6228623 - 6228769
Alignment:
Q  203 caaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaat 300  Q
    |||||||||||||| || | || ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6228623 caaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaat 6228722  T
Q  301 gataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  6228723 gatatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgtt 6228769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49232694 - 49232573
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  49232694 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 49232595  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  49232594 gtataaatgttaagttatgaaa 49232573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784851
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 16933827 - 16933901
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933827 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17191789 - 17191703
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17191789 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17191703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17204929 - 17204843
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17204929 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17204843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19947100 - 19947026
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 8268605 - 8268682
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8268605 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 8275705 - 8275782
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8275705 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 17955777 - 17955818
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17955777 gagaagaacaagggttagagagaagagggagaatttgaagaa 17955818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 17955883 - 17955916
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955883 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 150
Target Start/End: Original strand, 15857162 - 15857198
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857162 ttaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17139754 - 17139670
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17139754 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17139670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207378
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||| | ||||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 30207378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Original strand, 3576439 - 3576522
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  3576439 aattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5228570 - 5228456
Alignment:
Q  196 attgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caaatatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| |   | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  5228570 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatg 5228471  T
Q  294 taaaaatgataagtt 308  Q
    || ||||| ||||||    
T  5228470 tataaatgttaagtt 5228456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Original strand, 14814765 - 14814909
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||  || | || ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14814765 aaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 14814864  T
Q  303 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  14814865 tatattgtg--aattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgtt 14814909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41661813 - 41661702
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatg 301  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  41661813 aaaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 41661714  T
Q  302 ataagttgtgaa 313  Q
    |||  |||||||    
T  41661713 atatattgtgaa 41661702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 9590753 - 9590839
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |   |||||||||||| | ||||||||||    
T  9590753 aaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 9590839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 11477053 - 11477127
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11477053 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 11477127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Original strand, 15468338 - 15468428
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  15468338 aattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22275467 - 22275377
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||||||  || ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22275467 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2844547 - 2844514
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844547 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3992906 - 3992873
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992906 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34560126 - 34560061
Alignment:
Q  225 atgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  34560126 atgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 34560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 54038023 - 54038056
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038023 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55513226 - 55513193
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513226 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953126
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Original strand, 13301472 - 13301552
Alignment:
Q  208 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  13301472 ttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13301552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Original strand, 13312128 - 13312208
Alignment:
Q  208 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  13312128 ttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13312208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15517879 - 15517795
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  15517879 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15517795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Original strand, 31412351 - 31412443
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  31412351 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 31412443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16212204 - 16211822
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16212204 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagtttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttca 16212106  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16212105 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgt 16212006  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212005 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 16211906  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16211905 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaat 16211822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 36053104 - 36052723
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36053104 gagaagaacaatggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 36053006  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt--atggataattgttgcaaaattc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||||     
T  36053005 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaattt 36052906  T
Q  211 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 310  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052905 atactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 36052806  T
Q  311 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36052805 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaat 36052723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Original strand, 11580586 - 11580946
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  11580586 ggagaacttgaagaatcaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttaatctaaggtaaggggattagtctttatc 11580685  T
Q  140 ataatcatcatcatttt-gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt--gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgttt 235  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11580686 ataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgttt 11580785  T
Q  236 gtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580786 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 11580885  T
Q  336 ttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11580886 ttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 11580946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 40 - 384
Target Start/End: Original strand, 13036863 - 13037212
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  13036863 ggagaacttgaagaatcaaggattggagtaagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcacc 13036962  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036963 ataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 13037062  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037063 atgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 13037162  T
Q  338 gctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13037163 gctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatg 13037212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 116 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3060022
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgct 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  216 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 315  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  316 ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 3060022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 115 - 393
Target Start/End: Original strand, 18253760 - 18254042
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||| | |||||||||    
T  18253760 taaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtg 18253859  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18253860 ctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 18253959  T
Q  314 aattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18253960 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 18254042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 383
Target Start/End: Original strand, 47480902 - 47481228
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaat-- 170  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||  ||      
T  47480902 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcattt 47481001  T
Q  171 gttgtatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||| | | ||           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481002 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 47481101  T
Q  260 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgag 356  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   |||||    
T  47481102 tatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgag 47481201  T
Q  357 atttgattcttgttcaattgatgttat 383  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  47481202 ttatgattcttgttcaattgatgttat 47481228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479155
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 306  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  307 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgtta 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgtta 16479155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13321411 - 13321070
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||  |    
T  13321411 agcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctca 13321312  T
Q  170 t--gttgtatgaattttgctta-----------tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataa 256  Q
    |  ||||||||||| | | ||            |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321311 tttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataa 13321212  T
Q  257 ttgtaagattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttg----ttaa 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    || |    
T  13321211 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttga 13321113  T
Q  351 tttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13321112 attgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 13321070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292536
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||   ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572741
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13572741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10989657 - 10989475
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10989657 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 10989558  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  10989557 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 10989475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3050039 - 3049905
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3050039 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaaggattggagtgaacttaagagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 3049940  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049939 tctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2437715 - 2437522
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 294  Q
    |||| |||| ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2437715 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 2437616  T
Q  295 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaa-ttttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2437615 aaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatg 2437522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 30261998 - 30262261
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||   |    
T  30261998 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 30262097  T
Q  170 tg--ttgtatgaattttgctta----------tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
    ||  ||||||||| |  | | |          |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30262098 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 30262197  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30262198 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516358
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441696
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 384
Target Start/End: Original strand, 13911044 - 13911212
Alignment:
Q  221 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13911044 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 13911143  T
Q  321 ctcaattggtgaattt-tgctaa----gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||||| | ||||    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13911144 ctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 13911212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7293410 - 7293147
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||   |    
T  7293410 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 7293311  T
Q  170 tg--ttgtatgaattttgctta----------tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
    ||  ||||||||| |  | | |          |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7293310 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataat 7293211  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7293210 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 7293147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 342
Target Start/End: Original strand, 295849 - 296119
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || | |||||||  |    
T  295849 ttaggagctaaattgaagtacaagttgggattaatctttgctagaggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactt 295947  T
Q  173 tgtatgaa-ttttgctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 270  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||| || || || | || ||||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  295948 tgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttg 296047  T
Q  271 gtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa 342  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||| |   ||| ||||||||||||||||    
T  296048 gtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaaatggtgaattttgctaa 296119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25124583 - 25124450
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||    
T  25124583 gagaagaacaaggattagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcatta 25124485  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124484 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2029372 - 2029244
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  2029372 gagaagagcaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaaaattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatcttta 2029279  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029278 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 17817259 - 17817355
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17817259 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa-tcaagattggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatctt 17817355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 19049742 - 19049646
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19049742 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa-tcaagattggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatctt 19049646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 42056140 - 42056220
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056140 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36024554 - 36024372
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaag-ggggttagtctttatcataat 144  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36024554 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaaggggggttagtcttcatcataat 36024455  T
Q  145 catcatcat--tttgtgaaa--tttcaaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaact 221  Q
    |||||||||  ||| |  ||  |||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36024454 catcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaattcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 2190037 - 2190117
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2190037 gtgagcttaggagttaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggcggttagtttttatcataatcat 2190117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15709570 - 15709406
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15709570 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagaggattagtcttcatcataatc 15709471  T
Q  146 atcatc----attttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgca 204  Q
    ||||||    ||||||  |  |||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  15709470 atcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgca 15709406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 15516660 - 15516793
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | || ||  |||||||| ||||||||    |||| || |||||| |      
T  15516660 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa-tcaagattggggtaagtctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatct 15516758  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516759 tcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11516621 - 11516544
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516621 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 15441433 - 15441510
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441433 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 314
Target Start/End: Original strand, 18979895 - 18980140
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatg 171  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |||    
T  18979895 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 18979994  T
Q  172 ttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 270  Q
    |||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  18979995 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 18980094  T
Q  271 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18980095 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18980140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 16914927 - 16915013
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914927 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Original strand, 48622664 - 48622758
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622664 aattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 14113858 - 14113935
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113858 agcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950910
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T
Q  313 aa 314  Q
    ||    
T  15950909 aa 15950910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 25292207 - 25292283
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25292207 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatca 25292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13758754 - 13758507
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  13758754 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 13758655  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  13758654 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 13758555  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13758554 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13758507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9611556 - 9611470
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611556 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9839127 - 9839041
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839127 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15927950 - 15927705
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatg 171  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |||    
T  15927950 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 15927851  T
Q  172 ttgtatgaattttgcttatggat-aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 270  Q
    |||||||||  | | ||   ||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  15927850 ttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgg 15927751  T
Q  271 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15927750 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15927705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 32493843 - 32493884
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493843 gagaagaacaagggttagagagaagagtgagagcttgaagaa 32493884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377691
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 15759986 - 15760233
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  15759986 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 15760085  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||  || | ||||    
T  15760086 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgt 15760185  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15760186 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722213
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 28722258  T
Q  303 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  28722257 tatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgtt 28722213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 371491 - 371417
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371491 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatat 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatat 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48356892 - 48356806
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  48356892 aaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 48356806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 304
Target Start/End: Original strand, 14271899 - 14272000
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  14271899 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatga 14271998  T
Q  303 ta 304  Q
    ||    
T  14271999 ta 14272000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 14423509 - 14423585
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14423509 agcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtc-ttatcataatcat 14423585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14935607 - 14935497
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| |  | || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14935607 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 14935508  T
Q  303 taagttgtgaa 313  Q
    ||  |||||||    
T  14935507 tatattgtgaa 14935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15363200 - 15363090
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| |  | || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  15363200 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 15363101  T
Q  303 taagttgtgaa 313  Q
    ||  |||||||    
T  15363100 tatattgtgaa 15363090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 126771 - 126738
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126771 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Original strand, 10000245 - 10000318
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||  |||||| | | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10000245 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 10000318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14940999 - 14940858
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||   | ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14940999 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataatt---aaattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 14940903  T
Q  303 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  14940902 tatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgtt 14940858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15359023 - 15358934
Alignment:
Q  226 tgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  15359023 tgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 15358934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 32493945 - 32493978
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493945 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15368592 - 15368485
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||   | ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  15368592 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataatt---aaattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 15368496  T
Q  303 taagttgtgaa 313  Q
    ||  |||||||    
T  15368495 tatattgtgaa 15368485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 49047675 - 49047759
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||| ||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  49047675 aatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 49047759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1563 - 1180
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  1563 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgtgattaatcttta 1465  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1464 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcg 1365  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1364 tgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 1265  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1264 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 1180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 3407 - 3789
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3407 gagaaaaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 3505  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  3506 tctaaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgt 3605  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3606 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 3705  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3706 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 3789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 122327 - 121993
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  122327 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttta 122229  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  122228 tctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgt 122129  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122128 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 122029  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122028 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 121993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13246844 - 13246486
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13246844 ggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatc 13246745  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13246744 ataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgt 13246645  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246644 atgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 13246545  T
Q  338 gctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13246544 gctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 13246486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Original strand, 15674940 - 15675296
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15674940 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 15675039  T
Q  146 atcatcat--tttgtgaaattt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 239  Q
    ||||||||  ||| || |||||  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675040 atcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 15675139  T
Q  240 gcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675140 gcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 15675239  T
Q  340 taagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||  |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15675240 taagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 15675296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 393
Target Start/End: Original strand, 54118167 - 54118451
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  54118167 ttaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 54118266  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||    
T  54118267 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtg 54118366  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54118367 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaat 54118451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 10104101 - 10104445
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10104101 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 10104200  T
Q  146 atcatcat--tttgtgaaattt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 239  Q
    ||||||||  ||| |  |||||  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104201 atcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 10104300  T
Q  240 gcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104301 gcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 10104400  T
Q  340 taagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 381  Q
    |||||||||  |   ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10104401 taagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 216 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115685
Alignment:
Q  216 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  316 ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 31115685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048420
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644284
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 10644284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680331
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26680331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33241112 - 33240891
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33241112 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaagcgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 33241013  T
Q  146 atcatcat--tttgtgaaattt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 239  Q
    ||||||||  ||| || |||||  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33241012 atcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 33240913  T
Q  240 gcatgaattgatgataattgta 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  33240912 gcatgaattgatgatgattgta 33240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488693
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328058
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47357902 - 47357719
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47357902 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 47357803  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  47357802 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 47357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 381
Target Start/End: Original strand, 40885569 - 40885749
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 302  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  40885569 aaaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgt 40885668  T
Q  303 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 381  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40885669 caagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 15135859 - 15135939
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135859 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 15272163 - 15272243
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272163 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31132707 - 31132543
Alignment:
Q  65 gagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat--tttgtgaaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||    
T  31132707 gagtgagcttaggagctaaagtggagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaa 31132608  T
Q  163 --tttcaaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgt 223  Q
      |||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31132607 tttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 31132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 55376420 - 55376525
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  55376420 ggagaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatc 55376518  T
Q  140 ataatca 146  Q
    |||||||    
T  55376519 ataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Original strand, 17145529 - 17145809
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  17145529 agcttaggagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 17145628  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  |   || ||| | ||||| ||  ||||||||||||  ||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||| | ||||    
T  17145629 tgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgt 17145728  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  17145729 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatactcaattagtgaattttgatatgttgtt 17145809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 16327795 - 16327872
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327795 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggcctaatcttcatataaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 16608968 - 16609045
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16608968 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26680594 - 26680517
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680594 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7850247 - 7850107
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    |||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| ||| |||||||| || |||  ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||  |    
T  7850247 aaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtga 7850148  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtg-aattttgctaagt 344  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7850147 agttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagt 7850107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 32460561 - 32460635
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32460561 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 32460635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169107
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  313 aa 314  Q
    ||    
T  18169108 aa 18169107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Original strand, 7131940 - 7132184
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||    
T  7131940 ttaggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 7132039  T
Q  173 tgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 271  Q
    | ||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  7132040 tatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 7132139  T
Q  272 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  7132140 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7132184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 40885368 - 40885491
Alignment:
Q  22 aagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattag-agtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggt 120  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||||||  ||||||| | |||||   ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  40885368 aagggttagagagaagaggaa---cttgaagaatcaaggatttggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggt 40885464  T
Q  121 aagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  40885465 aagggggttagaattcatcataatcat 40885491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8045346 - 8045272
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045346 ttaggagctaaagtgaagtctaagtttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044990
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15044990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22738650 - 22738406
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||  |||||| | | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||| || | ||||  ||||    
T  22738650 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgt 22738551  T
Q  173 tgtatgaattttg-cttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 271  Q
    ||||||||  | | || | | | ||||| ||  ||||||||| ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  22738550 tgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 22738451  T
Q  272 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22738450 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaa 22738406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14952160 - 14952085
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952160 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20001107 - 20000860
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  20001107 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 20001008  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || |    
T  20001007 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttct 20000908  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  20000907 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 20000860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 14500074 - 14500144
Alignment:
Q  77 gagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14500074 gagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttaggcttcatcataatcat 14500144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18276682 - 18276596
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  18276682 aaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18276596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 47535064 - 47535150
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| || |||||||    
T  47535064 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaa 47535150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 111484 - 111451
Alignment:
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111484 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 111451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10488956 - 10488879
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  10488956 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaaggtggttggtctttatcttaatcat 10488879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Original strand, 18238175 - 18238301
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||    
T  18238175 tgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtg 18238272  T
Q  321 ctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  18238273 ctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 18238301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19020744 - 19020623
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19020744 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 19020645  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19020644 gtataaatgttaagttatgaaa 19020623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374623
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 336  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattagtgaattt 8374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809595
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaa 13809595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109434
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26339403 - 26339327
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26339403 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 26339327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 294
Target Start/End: Original strand, 7964711 - 7964802
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 294  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7964711 aaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaagtatgt 7964802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Original strand, 15013283 - 15013365
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  15013283 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15013365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 140
Target Start/End: Original strand, 13048090 - 13048160
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatca 140  Q
    |||||||||| |||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  13048090 agcttaggagttaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagttaagggggttagtctttatca 13048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14996519 - 14996445
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14996519 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 303
Target Start/End: Original strand, 40904934 - 40905034
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  40904934 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 40905033  T
Q  303 t 303  Q
    |    
T  40905034 t 40905034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20931783 - 20931401
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20931783 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaataatcaag-attggagtgagcttagcagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 20931685  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20931684 tctaaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgt 20931585  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20931584 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatga 20931485  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931484 aaattgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 20931401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20913468 - 20913093
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20913468 gagaagaacaagggttagagagaagagggagaaattgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 20913370  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20913369 tctaaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgt 20913270  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20913269 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatga 20913170  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913169 aaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt----aatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 20913093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 37844275 - 37844658
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  37844275 gagaagaataagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaattttta 37844371  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  37844372 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 37844471  T
Q  211 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt-g 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||  | |    
T  37844472 atgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatag 37844571  T
Q  310 tgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844572 tgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 37844658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20446094 - 20445735
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20446094 ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggagttagtctttatc 20445995  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20445994 ataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttg 20445895  T
Q  237 tatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445894 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 20445795  T
Q  337 tgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||  |   ||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20445794 tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaat 20445735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20531858 - 20531500
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  20531858 ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagataaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggaaattagtctttatc 20531759  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20531758 ataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgt 20531659  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531658 atgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 20531559  T
Q  338 gctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||  |   ||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20531558 gctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaat 20531500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Original strand, 20893476 - 20893833
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  20893476 ggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatc 20893575  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20893576 ataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgt 20893674  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893675 atgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 20893774  T
Q  338 gctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||  |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20893775 gctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 20893833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 114 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41394560 - 41394280
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  41394560 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 41394461  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394460 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 41394361  T
Q  314 aattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgtta 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41394360 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgtta 41394280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45051803 - 45051484
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   | ||||  |    
T  45051803 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgc--attttctca 45051707  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||  ||| | ||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051706 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 45051607  T
Q  269 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  45051606 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattc 45051507  T
Q  366 ttgttcaattgatgttatggttg 388  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  45051506 ttgctcaattgatgttattgttg 45051484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 219 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2116488 - 2116310
Alignment:
Q  219 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2116488 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatgg 2116389  T
Q  319 tgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgaga-tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2116388 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaat 2116310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227865
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  315 attgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaat 22227865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232562
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  315 attgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaat 22232562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 18601137 - 18601305
Alignment:
Q  220 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  18601137 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgt 18601236  T
Q  320 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18601237 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 18601305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 5072392 - 5072575
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5072392 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 5072491  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5072492 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 5072575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452623
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51452886 - 51452809
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452886 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Original strand, 22143360 - 22143505
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  22143360 aaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatg 22143459  T
Q  302 ataagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattttgctaagttgtt 348  Q
     ||| || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  22143460 ttaacttatg--aattatgctcaaatggttgaattatgctatgttgtt 22143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2116635 - 2116558
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  2116635 agcttatgagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaaaggggttagtgattatcataatcat 2116558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 7640806 - 7640882
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7640806 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 7640882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17609174 - 17609090
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17609174 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17609090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20177421 - 20177337
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  20177421 aattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 20177337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21195262 - 21195117
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||    
T  21195262 aaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatg 21195163  T
Q  302 ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    |||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21195162 atatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgtt 21195117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148704
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17148704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 18059756 - 18059877
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  18059756 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 18059855  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  18059856 gtataaatgttaagttatgaaa 18059877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21860367 - 21860334
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860367 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 278
Target Start/End: Original strand, 36356294 - 36356367
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaatt 278  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36356294 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaaatgttgttggtgaaatt 36356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 44034870 - 44034903
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034870 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22035831 - 22035755
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22035831 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 22035755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 16193542 - 16193923
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  16193542 gagaagaactagggttagagagaagagggagagcttaaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattcatcttta 16193640  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16193641 tctaaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgt 16193739  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193740 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 16193839  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193840 aaattgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 16193923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 43373291 - 43373675
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43373291 gagaagaacaagggttaaagagaagaaggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 43373389  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt--atggataattgttgcaaaattc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||  ||| ||||||    
T  43373390 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattc 43373489  T
Q  211 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373490 gtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 43373589  T
Q  311 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43373590 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaat 43373675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 24928615 - 24928998
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24928615 gagaagaacaagggttagagagaagagggagatcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttta 24928713  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24928714 tctaaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcg 24928813  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  24928814 tgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 24928913  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||   ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24928914 aaaattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaat 24928998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 114 - 393
Target Start/End: Original strand, 16404899 - 16405179
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||    
T  16404899 ttaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcg 16404997  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  16404998 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtg 16405097  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16405098 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaat 16405179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 6774264 - 6774451
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 306  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774264 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 6774363  T
Q  307 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgtta 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6774364 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgtta 6774451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 207 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24549227 - 24549038
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 306  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549227 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 24549128  T
Q  307 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549127 ttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaat 24549038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345626
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggt 386  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  | | ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgt 17345633  T
Q  387 tgttaat 393  Q
    |||||||    
T  17345632 tgttaat 17345626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844759
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatg 21844759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852152
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatg 21852152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30120970 - 30120787
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30120970 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 30120871  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30120870 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 30120787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 22907083 - 22907346
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||   |    
T  22907083 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 22907182  T
Q  170 tg--ttgtatgaattttgctta----------tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
    ||  ||||||||| |  | | |          |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22907183 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 22907282  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22907283 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22907346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238218
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661380
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685677
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 24385551 - 24385684
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  24385551 gagaagaacaagggttggagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttca 24385649  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385650 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 16674396 - 16674579
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16674396 aaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 16674495  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  16674496 agttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 16674579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222878
Alignment:
Q  264 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatg 222878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736501
Alignment:
Q  264 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatg 736501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860396
Alignment:
Q  264 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatg 860396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Original strand, 41506634 - 41506741
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||    
T  41506634 ggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaagagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagttttcatc 41506733  T
Q  140 ataatcat 147  Q
    ||||||||    
T  41506734 ataatcat 41506741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5238481 - 5238404
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238481 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 24661117 - 24661194
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661117 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43685940 - 43685863
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685940 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 146
Target Start/End: Original strand, 7000472 - 7000551
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  7000472 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaagtaagggggttagttttcatcataatca 7000551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691967
Alignment:
Q  264 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 21494314 - 21494388
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21494314 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 21494388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26011742 - 26011656
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  26011742 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006377
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T
Q  313 aa 314  Q
    ||    
T  22006376 aa 22006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Original strand, 13720803 - 13721047
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||    
T  13720803 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13720902  T
Q  173 tgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 271  Q
    ||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  13720903 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 13721002  T
Q  272 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13721003 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13721047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 3431134 - 3431208
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431134 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttggattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22886728 - 22886654
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886728 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16195570 - 16195374
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||     
T  16195570 taaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtt 16195471  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 308  Q
    |||   |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16195470 ctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 16195374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17285450 - 17285366
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17285450 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17285366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Original strand, 23226075 - 23226131
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23226075 aaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 23226131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 16872923 - 16873170
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  16872923 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 16873022  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  16873023 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 16873122  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16873123 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16873170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15933546 - 15933460
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15933546 aaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 15933460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25296406 - 25296320
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    ||||||||||||| ||||||||||    
T  25296406 aaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25296320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25758426 - 25758340
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    ||||||||||||| ||||||||||    
T  25758426 aaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25758340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Original strand, 13662140 - 13662384
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt 172  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  ||||    
T  13662140 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13662239  T
Q  173 tgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 271  Q
    ||||||||  | | || ||  | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||  ||||| || ||| | |||| ||    
T  13662240 tgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtggg 13662339  T
Q  272 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13662340 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13662384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 21198152 - 21198237
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21198152 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 21198237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 24716761 - 24716794
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716761 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33172457 - 33172331
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||    
T  33172457 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtg 33172360  T
Q  321 ctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  33172359 ctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 33172331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5854862 - 5854776
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |   |||||||||||||  ||||||||||    
T  5854862 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaa 5854776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23150027 - 23149985
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150027 aaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 274799 - 274766
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274799 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 641050 - 641083
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641050 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 826856 - 826889
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826856 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17345964 - 17345879
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 155  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  17345964 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcttaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 17345879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42165 - 41785
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42165 gagaagaacaagggttagagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggactgagcttaggaggtaaattgaagtctaagttgggattaatattta 42069  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42068 tctaaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 41969  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41968 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtga 41869  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41868 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaat 41785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 463165 - 462794
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  463165 gagaagaacaagggttagagaggagagggagagcttgaagaatt------------gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 463078  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  463077 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 462978  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462977 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 462878  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  462877 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 462794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Original strand, 36982289 - 36982648
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36982289 ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagctgaggagctaaattgaagcctaagttggtattagtctttatctaaggtaagggggttagtctttatc 36982388  T
Q  140 ataatcatcatcatttt-gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttg 236  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982389 ataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttg 36982488  T
Q  237 tatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 336  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982489 tattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 36982588  T
Q  337 tgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||| ||||||||  |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36982589 tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaat 36982648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 57 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8891639 - 8891306
Alignment:
Q  57 aaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891639 aaggattggagtgagcttaggaactaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttt 8891540  T
Q  157 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 254  Q
    || || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8891539 gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgat 8891440  T
Q  255 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat--- 351  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       
T  8891439 aattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaga 8891340  T
Q  352 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 385  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8891339 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 8891306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 114 - 393
Target Start/End: Original strand, 20627237 - 20627520
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20627237 ttaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgt 20627336  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20627337 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtga 20627436  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20627437 aaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaat 20627520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 393
Target Start/End: Original strand, 24341259 - 24341596
Alignment:
Q  65 gagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat--tttgtgaaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||    
T  24341259 gagtgagcttaggagctaaaatgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaa 24341358  T
Q  163 ttt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 258  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341359 tttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 24341458  T
Q  259 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttga 355  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||    
T  24341459 gtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattga 24341558  T
Q  356 gatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24341559 gatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 24341596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 393
Target Start/End: Original strand, 43642880 - 43643164
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  43642880 ttaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttg 43642979  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  43642980 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtg 43643079  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttg---ttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  43643080 aaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaat 43643164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 383
Target Start/End: Original strand, 19794628 - 19794901
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||    
T  19794628 ttaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgt-aaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcg 19794726  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  19794727 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 19794826  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19794827 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 19794901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Original strand, 25265258 - 25265549
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||  |    
T  25265258 agcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaatgtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctca 25265357  T
Q  170 t--gttgtatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataa 256  Q
    |  ||||||||||| | | ||           ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25265358 tttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataa 25265457  T
Q  257 ttgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265458 ttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgtt 25265549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396851
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttg---ttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 19689270 - 19689533
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||   |    
T  19689270 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 19689369  T
Q  170 tg--ttgtatgaattttgctta----------tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
    ||  ||||||||| |  | | |          |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19689370 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 19689469  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19689470 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22863342 - 22863169
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22863342 ggagaacttgaagaatcaaggattggggtgagcttaggagctaaattgcagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatc 22863243  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  22863242 ataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820202
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 391
Target Start/End: Original strand, 7507848 - 7508049
Alignment:
Q  193 ataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 292  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507848 ataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatat 7507947  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttg-ttcaattgatgttatggttgt 389  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||| |||||| || || |||||||||||| |||||    
T  7507948 gtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttggctaagttgttgttaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgt 7508047  T
Q  390 ta 391  Q
    ||    
T  7508048 ta 7508049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906572
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 19886665 - 19886848
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  19886665 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgata 19886764  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  19886765 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 19886848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015142
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 9652700 - 9652828
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  9652700 gagaagaataagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaaacctaagttgggattaatcttca 9652793  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652794 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 21273901 - 21273980
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21273901 gtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaa-ggggttagtctttatcataatcat 21273980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12728776 - 12728529
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  12728776 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 12728677  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  12728676 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 12728577  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12728576 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34824859 - 34824612
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  34824859 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 34824760  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  34824759 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 34824660  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  34824659 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 34824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 14906309 - 14906386
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906309 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23820465 - 23820388
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820465 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8944230 - 8943983
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  8944230 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 8944131  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||    
T  8944130 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgt 8944031  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  8944030 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 8943983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 12635740 - 12635987
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | || |  |    
T  12635740 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctca 12635839  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  12635840 tgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 12635939  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12635940 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12635987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32466281 - 32466177
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  32466281 ggagaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaa-ggggttagtcttcatc 32466184  T
Q  140 ataatca 146  Q
    |||||||    
T  32466183 ataatca 32466177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 17396519 - 17396599
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396519 gtgagcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 12641514 - 12641761
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  12641514 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 12641613  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  12641614 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 12641713  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12641714 ggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12641761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20015403 - 20015328
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015403 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22275178 - 22275139
Alignment:
Q  15 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275178 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 22275139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24884934 - 24884848
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884934 aaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33128446 - 33128372
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128446 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68154
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16935977 - 16935730
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  16935977 agcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 16935878  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||  |||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  16935877 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 16935778  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16935777 gcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16935730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17006637 - 17006390
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  17006637 agcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 17006538  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||  |||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  17006537 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 17006438  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17006437 gcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17006390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22284411 - 22284372
Alignment:
Q  15 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22284411 gaagaacaagggttagagagaagagagagagcttgaagaa 22284372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17204733 - 17204659
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17204733 ttaggagttaaagtgaagtctaagtttggattaatcataacctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 17204659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Original strand, 23777962 - 23778164
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | |||| |||| |||||||||    
T  23777962 taaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 23778061  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||   |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||| | |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  23778062 ctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 23778161  T
Q  312 aaa 314  Q
    |||    
T  23778162 aaa 23778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 28031092 - 28031166
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031092 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22284311 - 22284278
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284311 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 3798475 - 3798722
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat-catcattttgtgaaatttcaa 168  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||| || | ||||      
T  3798475 agcttatgagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttt-tgcattttctc 3798573  T
Q  169 atgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattg 267  Q
    ||||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||    
T  3798574 atgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttg 3798673  T
Q  268 ttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  3798674 tgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 3798722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19660124 - 19660044
Alignment:
Q  208 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660124 ttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23774520 - 23774444
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23774520 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 23774444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 19669116 - 19669191
Alignment:
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 286  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||    
T  19669116 tgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 276
Target Start/End: Original strand, 22579863 - 22579933
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaa 276  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |   ||||||||||||    
T  22579863 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatgataattgaattgttgttggtgaaa 22579933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9636974 - 9636848
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||    
T  9636974 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatg 9636877  T
Q  321 ctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  9636876 ctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 9636848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22275078 - 22275045
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275078 ttaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15633570 - 15633538
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633570 ttaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775290
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||||| | ||||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 22775290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780668
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||||| | ||||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9316 - 8934
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9316 gagaagaacaagggttagagagaatagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 9218  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9217 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgt 9118  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9117 gctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtga 9018  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9017 aaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 36733 - 37120
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaat---tgaagtccaagttgggattaatct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||||||    
T  36733 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagaagtgaagcctaagttgggattaatct 36831  T
Q  110 ttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||    
T  36832 ttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaa 36931  T
Q  208 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagt 37031  T
Q  308 tgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||   ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37032 tgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaat 37120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Original strand, 51009 - 51328
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  51009 gagaagaacaagggttagagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 51105  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51106 tcttaggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 51205  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51206 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtga 51305  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaatt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51306 aaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 127994 - 128376
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  127994 gagaagaacaacagttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagattaggagataaaatgaagcctaagttgggattaatcttta 128092  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  128093 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 128192  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  128193 gcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtga 128292  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  128293 aaattgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgttaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatg 128376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 222 - 384
Target Start/End: Original strand, 31696 - 31863
Alignment:
Q  222 gtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  31696 gtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 31795  T
Q  322 tcaattggtgaattt-tgctaa----gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||||||||||||||| | ||||    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31796 tcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 31863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23507347 - 23507021
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||| |||| |||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  23507347 agcttaggagttaaagtgaagcataagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaa 23507248  T
Q  170 tgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507247 tgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 23507148  T
Q  270 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  23507147 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattct 23507048  T
Q  367 tgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23507047 tgttcaattgatgttatggttgttaat 23507021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Original strand, 27182396 - 27182754
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  27182396 ggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatc 27182495  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27182496 ataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgt 27182595  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182596 atgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 27182695  T
Q  338 gctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182696 gctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 27182754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 66 - 393
Target Start/End: Original strand, 22053704 - 22054040
Alignment:
Q  66 agtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat--tttgtgaaat 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  22053704 agtgagcttaggagctaaagtgaagtctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaat 22053803  T
Q  164 tt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 259  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22053804 ttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttg 22053903  T
Q  260 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgag 356  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||    
T  22053904 tatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgag 22054003  T
Q  357 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22054004 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaat 22054040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Original strand, 18530919 - 18531274
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18530919 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 18531018  T
Q  146 ---atcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatg 240  Q
       ||||||||||||  |  |||||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531019 gtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatg 18531118  T
Q  241 catgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgct 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18531119 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgct 18531218  T
Q  341 aagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||  |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  18531219 aagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaat 18531274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 207 - 393
Target Start/End: Original strand, 29188290 - 29188479
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 306  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188290 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 29188389  T
Q  307 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29188390 ttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaat 29188479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939334
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 385  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattgtgaatt-gagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  386 ttgttaat 393  Q
     |||||||    
T  34939341 ctgttaat 34939334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009906
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 27009906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 43443399 - 43443582
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43443399 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 43443498  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43443499 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatg 43443582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623100
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233660
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 18777996 - 18778179
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18777996 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 18778095  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18778096 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 18778179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900538
Alignment:
Q  191 ggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  291 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19500147 - 19499964
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19500147 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 19500048  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  19500047 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 19499964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 22366485 - 22366668
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22366485 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 22366584  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22366585 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 22366668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25426876 - 25426693
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25426876 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 25426777  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  25426776 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 25426693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536328
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052875
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 221 - 384
Target Start/End: Original strand, 4200005 - 4200172
Alignment:
Q  221 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  4200005 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 4200104  T
Q  321 ctcaattggtgaattttgctaa----gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    || |||||||||||||  || |    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4200105 ctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 4200172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12622 - 12439
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  12622 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgata 12523  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  12522 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 12439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 383
Target Start/End: Original strand, 21073599 - 21073781
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21073599 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 21073698  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 383  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21073699 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 21073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21651146 - 21651018
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21651146 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttca 21651053  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21651052 tctaaggtaagggggttaatatttatcataatcat 21651018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21205381 - 21205249
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  21205381 gagaagaacaagggttagagagaagtgggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatcttca 21205283  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21205282 tctaagataa-gggattagtctttatcataatcat 21205249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 108680 - 108760
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108680 gtgagcttaggaggtaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 152
Target Start/End: Original strand, 23981308 - 23981442
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||    ||||| ||| |||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  23981308 gagaagaacaagggttaga----agagg-agatcttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcttca 23981402  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatca 152  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23981403 tcttaggtaagggggttagtcttcatcaaaatcataatca 23981442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32951089 - 32950797
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaa--tttca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||  || ||  | ||     
T  32951089 agcttaggagctaaattgaagtctaagtttgaattaatcattatttaaggtaagggggttagtcttcatcataaccatgttcaattattgcaacttctcc 32950990  T
Q  168 aatgttgtatgaatt---ttgctt-------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 257  Q
      ||||||||||| |   ||| ||       || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| || || || |||| |||||||||||    
T  32950989 tttgttgtatgaaatgggttgattggaatgaattgataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataat 32950890  T
Q  258 tgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatg-ataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  32950889 tgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgtt 32950797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2032240 - 2032135
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||    
T  2032240 ggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagttttcatc 2032141  T
Q  140 ataatc 145  Q
    ||||||    
T  2032140 ataatc 2032135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 1219392 - 1219639
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  1219392 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 1219491  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||| | ||||    
T  1219492 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgt 1219591  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1219592 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1219639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23514945 - 23514698
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  23514945 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 23514846  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  23514845 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 23514746  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23514745 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20623363 - 20623286
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623363 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 21233397 - 21233474
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233397 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37053138 - 37053061
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053138 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 21310708 - 21310794
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310708 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16536591 - 16536514
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536591 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25005210 - 25005137
Alignment:
Q  74 taggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25005210 taggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 25005137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 25900275 - 25900352
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900275 agcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 308
Target Start/End: Original strand, 35790970 - 35791211
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  35790970 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 35791069  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  35791070 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 35791169  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 308  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  35791170 gagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 35791211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7529299 - 7529228
Alignment:
Q  76 ggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7529299 ggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 7529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918129
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 285
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212153
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19862457 - 19862371
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862457 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 301
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981614
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatg 23981614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 10777968 - 10778089
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  10777968 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 10778067  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  10778068 gtataaatgttaagttatgaaa 10778089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 9730236 - 9730310
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730236 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 21297174 - 21297260
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21297174 aaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21297260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450928
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 21222609 - 21222693
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21222609 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21222693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23328941 - 23328865
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23328941 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 23328865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24616545 - 24616469
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24616545 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24712921 - 24712845
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24712921 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24712845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24745939 - 24745863
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24745939 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24745863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22885889 - 22885806
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  22885889 aaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22885806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 432711 - 432625
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |   |||||||||||| | ||||||||||    
T  432711 aaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 432625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Original strand, 17471586 - 17471676
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  17471586 aattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21617262 - 21617181
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 286  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||    
T  21617262 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttc 21617181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 36989768 - 36989889
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  36989768 aattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 36989867  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  36989868 gtataaatgttaagttatgaaa 36989889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 49036 - 48662
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||  |||| | | |||    
T  49036 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagattgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagtttagattgagcatta 48938  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48937 cctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgt 48838  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48837 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtga 48738  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 385  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48737 aaattgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgg 48662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36324 - 36158
Alignment:
Q  222 gtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  36324 gtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T
Q  322 tcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    | ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  36224 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatg 36158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 153879 - 154126
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  153879 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 153978  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  153979 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 154078  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  154079 gggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 154126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 172343 - 171961
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  172343 gagaagaacaagggttagagagaaaagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 172245  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  172244 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgt 172145  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  172144 gctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 172045  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  172044 aaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 171961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 178046 - 177664
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  178046 gagaagaacaagggttagagagaaaagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 177948  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  177947 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgt 177848  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  177847 gctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 177748  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  177747 aaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 177664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12552 - 12171
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  12552 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaaaaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttaggattaatctcta 12453  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaa-ttttgcttatggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12452 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcg 12354  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12353 tgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtg 12254  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt-aatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12253 aaaattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgtaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaat 12171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 26244 - 26622
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  26244 gagaagaaaaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagatgggattaatcttca 26337  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctta-tggataattgttgcaaaattcg 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||    
T  26338 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcg 26437  T
Q  212 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 26537  T
Q  312 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatt---tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26538 aaaattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 26622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Original strand, 8051 - 8384
Alignment:
Q  74 taggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaat-- 170  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||  ||      
T  8051 taggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 8150  T
Q  171 gttgtatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||| | | ||           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8151 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattg 8250  T
Q  260 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatttgagatt 359  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||     
T  8251 tatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgaattatgatg 8350  T
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
     ||  | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  8351 agaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaat 8384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12140 - 12063
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12140 agcttaggagctaaattgaagccaaagtttggattaatcattatctaagataagggggttagtcttcatcataatcat 12063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 289
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7110
Alignment:
Q  203 caaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| ||||||||  |||||||||    
T  7023 caaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaa 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23153860 - 23153503
Alignment:
Q  41 gagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatca 140  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23153860 gagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatca 23153761  T
Q  141 taatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgta 238  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153760 taatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgta 23153661  T
Q  239 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153660 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 23153561  T
Q  339 ctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||  |   ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23153560 ctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaat 23153503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 393
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626325
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgct 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||   || | ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  216 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 315  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  316 ttgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaat 14626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 391
Target Start/End: Original strand, 1649976 - 1650298
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   | ||||  |    
T  1649976 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgc--attttctca 1650072  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||  ||| | ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650073 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 1650172  T
Q  269 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1650173 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattc 1650272  T
Q  366 ttgttcaattgatgttatggttgtta 391  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||    
T  1650273 ttgctcaattgatgttattgttgtta 1650298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 348
Target Start/End: Original strand, 35009314 - 35009598
Alignment:
Q  77 gagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaat--gttg 174  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||  ||  ||||    
T  35009314 gagctaaagtgaagccaaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttg 35009413  T
Q  175 tatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaag 263  Q
    ||||||| | | ||           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35009414 tatgaatatgggttgaattgaagaaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatg 35009513  T
Q  264 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009514 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgtt 35009598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657954
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggt 386  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  | | ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgt 1657947  T
Q  387 tgttaat 393  Q
    |||||||    
T  1657948 tgttaat 1657954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862578
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt 345  Q
     |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtt 15862578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23148409 - 23148266
Alignment:
Q  41 gagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatca 140  Q
    |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23148409 gagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatca 23148310  T
Q  141 taatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23148309 taatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29666261 - 29665941
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||    
T  29666261 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaacataagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttc 29666162  T
Q  167 aaat-gttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaaga 264  Q
      || ||||||||||  | |  | ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29666161 tcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatga 29666062  T
Q  265 ttgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaatt---tgagatt 359  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||     
T  29666061 ttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagata 29665963  T
Q  360 tgattcttgttcaattgatgtt 381  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  29665962 tgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25175811 - 25175628
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25175811 aaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 25175712  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  25175711 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 25175628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 27653987 - 27654170
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27653987 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 27654086  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  27654087 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatg 27654170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 16825756 - 16825941
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaag--attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatga 302  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16825756 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 16825855  T
Q  303 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| |||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16825856 taagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 16825941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27751849 - 27751603
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27751849 ggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatc 27751750  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgt-tgtatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatg 227  Q
    ||||||||  ||||||  || ||||||  || | ||||||||| | | ||           |||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27751749 ataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgtgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatg 27751650  T
Q  228 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtga 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27751649 ttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23995327 - 23995247
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995327 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26090172 - 26090059
Alignment:
Q  33 agaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| | | |||  ||||||||||||||||||    
T  26090172 agaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgaggttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagt 26090074  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||    
T  26090073 ctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16232274 - 16232029
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatg 171  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |||    
T  16232274 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 16232175  T
Q  172 ttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 270  Q
    |||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  16232174 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 16232075  T
Q  271 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16232074 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16232029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Original strand, 15742078 - 15742150
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742078 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1556389 - 1556142
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  1556389 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 1556290  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  1556289 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 1556190  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1556189 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1556142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 16887791 - 16887877
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887791 aaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 18629607 - 18629693
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629607 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740907
Alignment:
Q  270 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgatt 364  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgatt 27740923  T
Q  365 cttgttcaattgatgt 380  Q
    | ||||||||||||||    
T  27740922 catgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 32276617 - 32276691
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276617 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 304
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083298
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 304  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgata 17083298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 18002353 - 18002427
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002353 ttaggagctaaagtgaaggctaagtttagattaatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 18823241 - 18823315
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823241 ttaggagctaaagtgaagtttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605614
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Original strand, 35136012 - 35136068
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35136012 aaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 35136068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23978153 - 23977906
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  23978153 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 23978054  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||||| || ||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  23978053 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 23977954  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23977953 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23977906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 16299844 - 16299906
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctt 135  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  16299844 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctt 16299906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 17557018 - 17557102
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17557018 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttg-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17557102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 18086821 - 18086942
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  18086821 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 18086920  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  18086921 gtataaatgttaagttatgaaa 18086942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19610402 - 19610161
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  19610402 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctga 19610303  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || ||| | ||||    
T  19610302 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgt 19610203  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 308  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  19610202 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 19610161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 90
Target Start/End: Original strand, 14128505 - 14128548
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaag 90  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14128505 cttgaagaactaaggattgg-gtgagcttaggagctaaattgaag 14128548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21623414 - 21623330
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  21623414 aattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaa 21623330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33324940 - 33324884
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33324940 aaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattg 33324884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Original strand, 33538369 - 33538479
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||    
T  33538369 aaaattcgtgctctaactatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtg 33538467  T
Q  302 ataagttgtgaa 313  Q
    ||| ||||||||    
T  33538468 atatgttgtgaa 33538479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 18839096 - 18839170
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839096 ttagaagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 22361764 - 22361850
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22361764 aaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaa 22361850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 1657616 - 1657693
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||||     |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657616 agcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15862866 - 15862781
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 155  Q
    |||||||||| | ||||||||    |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  15862866 agcttaggaggtgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 15862781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 16556137 - 16556258
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  16556137 aattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 16556236  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  16556237 gtataaatgttaagttatgaaa 16556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 16632693 - 16632814
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  16632693 aattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 16632792  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  16632793 gtataaatgttaagttatgaaa 16632814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 19983191 - 19983224
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983191 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 22225736 - 22225857
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  22225736 aattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 22225835  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  22225836 gtataaatgttaagttatgaaa 22225857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 35015056 - 35015089
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015056 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381768
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||| |||||| || | ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaa 18381768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399100
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| | |||||| ||||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaa 18399100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 272463 - 272081
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  272463 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttaaagaatcaag-attggagtgagctcaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttta 272365  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||| |||    
T  272364 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgt 272265  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 312  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  272264 actccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 272165  T
Q  313 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||   ||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  272164 aaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaat 272081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 61 - 393
Target Start/End: Original strand, 5936 - 6270
Alignment:
Q  61 attagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtga 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |    
T  5936 attagagtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaa 6035  T
Q  161 aatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 260  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036 attctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 6135  T
Q  261 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagat 358  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  6136 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgttaattgagat 6235  T
Q  359 ttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6236 ttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaat 6270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 69 - 393
Target Start/End: Original strand, 247320 - 247649
Alignment:
Q  69 gagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  247320 gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaa 247419  T
Q  169 atgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagatt 266  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  247420 atgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgatt 247519  T
Q  267 gttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgat 363  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |   ||||| | ||||    
T  247520 gagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgat 247619  T
Q  364 tcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  247620 tcttgttcaattgatgttatgactgttaat 247649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 313
Target Start/End: Original strand, 34030 - 34276
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttc-aa 168  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  34030 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 34129  T
Q  169 atgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
     ||||||||||| |  | | ||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  34130 ttgttgtatgaaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 34229  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  34230 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 34276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Original strand, 123018 - 123371
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  123018 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcaccataatc 123117  T
Q  146 atcatcattttgtgaaattt-caaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgca 242  Q
    ||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  123118 atcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgca 123217  T
Q  243 tgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123218 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa 123317  T
Q  343 gttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||  |   || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123318 gttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 123371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Original strand, 837 - 1162
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtcca-agttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaa 168  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   || | ||||    
T  837 agcttaggagctgaattgaa-tcaagagttggggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaa 935  T
Q  169 atgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  936 atgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 1035  T
Q  269 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||    
T  1036 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagattttattct 1135  T
Q  367 tgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1136 tgttcaagtgatgttatggatgttaat 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15325 - 15238
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15325 gagaagaacaaaggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaa 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 340
Target Start/End: Original strand, 89303 - 89605
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  89303 ggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatc 89402  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  89403 atgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgt 89502  T
Q  238 atgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  89503 atgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattat 89602  T
Q  338 gct 340  Q
    |||    
T  89603 gct 89605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 107633 - 107835
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  107633 ggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatc 107732  T
Q  140 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 237  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  107733 atgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgt 107832  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  107833 atg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 79787 - 79731
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  79787 aaaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 79731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 118 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19262
Alignment:
Q  118 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  215 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  315 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaat 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21346
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  386 ttgttaat 393  Q
     |||||||    
T  21353 ctgttaat 21346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148777
Alignment:
Q  157 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  255 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  352 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 148777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9261 - 8915
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| | || ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  9261 cttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagtgtgttagtcttcatcataatc 9162  T
Q  146 atcatcat--tttgtgaaattt--caaatgttgtatgaattttgctta--tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 239  Q
    ||||||||  ||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9161 atcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtat 9062  T
Q  240 gcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9061 gcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 8962  T
Q  340 taagttgttaat---ttgagatttgattcttgttcaattgatgttat 383  Q
    |||||||||  |   ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8961 taagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttat 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 147039 - 146704
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  147039 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 146941  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgcaaaattcgt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  146940 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcat 146841  T
Q  213 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg-ataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgt 310  Q
    |||  || | |||||| ||||||  ||| ||||| | ||| ||||||| |   ||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||  |    
T  146840 gctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgtt 146741  T
Q  311 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  146740 gaaaa-tatgctcaattggtgaattatgctaggttgtt 146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 149090 - 149014
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  149090 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaa 149014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53575 - 53508
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  53575 tgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85670
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 302  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  85779 aaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 85681  T
Q  303 taagttgtgaa 313  Q
    ||  |||||||    
T  85680 tatattgtgaa 85670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5268
Alignment:
Q  125 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctta-tggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  224 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 323  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  324 aattggtgaattttgctaagttgttaatt---tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |    |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48447 - 48243
Alignment:
Q  192 gataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaata 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48447 gataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatg 48348  T
Q  292 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48347 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatg 48248  T
Q  389 ttaat 393  Q
    |||||    
T  48247 ttaat 48243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 115 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 108085 - 107803
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||  ||| ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||| | |||||||||    
T  108085 taaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtg 107986  T
Q  214 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  107985 ctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaa 107886  T
Q  314 aattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  107885 aattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 107803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64715
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 299  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  300 tgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 64715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Original strand, 89864 - 89915
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgata 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89864 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 89915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 220 - 393
Target Start/End: Original strand, 9368 - 9544
Alignment:
Q  220 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9368 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 9467  T
Q  320 gctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9468 gctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaat 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 220 - 393
Target Start/End: Original strand, 16266 - 16442
Alignment:
Q  220 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16266 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 16365  T
Q  320 gctcaattggtgaattttgctaag---ttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16366 gctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaat 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 385
Target Start/End: Original strand, 534 - 733
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 385  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||  || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42039 - 41752
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaat-g 171  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |  ||||||  || |    
T  42039 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattg 41940  T
Q  172 ttgtatgaattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 260  Q
    |||||||||| | | ||           ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41939 ttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 41840  T
Q  261 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41839 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgtt 41752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5788 - 5593
Alignment:
Q  193 ataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5788 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatat 5689  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5688 gtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 5593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5846
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5923 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 205 - 393
Target Start/End: Original strand, 5220 - 5411
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5220 aaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 5319  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5320 agttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaat 5411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 102923 - 103007
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |   ||||| |||||||| ||||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 103007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13890 - 13610
Alignment:
Q  81 taaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatt--tcaaatgttgtatg 178  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  || ||||  |||  |||||||||    
T  13890 taaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatg 13791  T
Q  179 aattttgctt-----------atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattg 267  Q
    ||| | | ||           ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13790 aatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattg 13691  T
Q  268 ttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13690 ttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgtt 13610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Original strand, 13331 - 13469
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 306  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13331 attcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 13430  T
Q  307 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13431 ttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagtt 13469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 391
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34666
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttc-aattgatgttatg 384  Q
     | |||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |   ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||     
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  385 gttgtta 391  Q
    |||||||    
T  34660 gttgtta 34666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3220 - 3020
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 294  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3220 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgt 3121  T
Q  295 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttaat---ttgagatttgattcttgttc-aattgatgttatggttgtt 390  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  3120 aaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgtt 3021  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  3020 a 3020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4106 - 3778
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| || |||||| |  | |||||||||||| |||||  |||||||||||||   || ||| || | ||||  |    
T  4106 agcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 4007  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4006 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 3907  T
Q  269 tggtgaaattacatgttcaaatatgta-aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgatt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3906 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatt 3807  T
Q  365 cttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3806 cttgttcaattgatgttatgaatgttaat 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 384
Target Start/End: Original strand, 21110 - 21302
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 294  Q
    |||| |||| ||||||||||||    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21110 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 21209  T
Q  295 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21210 aaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatg 21302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 14080 - 14247
Alignment:
Q  220 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 319  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14080 ctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgt 14179  T
Q  320 gctcaattggtgaattttgctaagttgt---taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14180 gctcaattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatg 14247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 100
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 338
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  415 agcttaggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcat 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 193296 - 193429
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  193296 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttca 193394  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193395 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27726 - 27634
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  27726 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 27634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43245 - 43062
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43245 aaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 43146  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 384  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  43145 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatg 43062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 12317 - 12450
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12317 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggattgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggatgaatcttta 12415  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12416 tctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26926
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22799 - 22671
Alignment:
Q  193 ataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  22799 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatat 22700  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22699 gtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22934 - 22857
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27189 - 27112
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1714
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1528
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1451 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37198
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  289 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 36935 - 37012
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36935 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 6343 - 6475
Alignment:
Q  14 agaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttat 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  6343 agaagaacaagagttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattattccttat 6441  T
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6442 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 336
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1439
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1308 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 1407  T
Q  305 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 336  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1408 agttatgaatattgtgctcaattggtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 782 - 910
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  782 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttca 875  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  876 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 9786 - 9914
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  9786 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttca 9879  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9880 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45416 - 45134
Alignment:
Q  69 gagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaa 168  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||      
T  45416 gagcttaggagcttaattgaagcctaagtttggattaaccattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 45317  T
Q  169 at-gttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagatt 266  Q
    || ||||||||||  | | || ||| ||||||||||  |||||||||| |    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45316 attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgatt 45217  T
Q  267 gttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  45216 gtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgtt 45134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54802 - 54520
Alignment:
Q  69 gagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaa 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||      
T  54802 gagcttaggagcttaattgaagcttaagtttggattaaccattatctaaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 54703  T
Q  169 at-gttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagatt 266  Q
    || ||||||||||  | | || ||| ||||||||||  |||||||||  |   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54702 attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgatt 54603  T
Q  267 gttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    || ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  54602 gtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgtt 54520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 17208 - 17336
Alignment:
Q  13 gagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatcttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |    
T  17208 gagaagaacaagggttagagagaagaa------cttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctcca 17301  T
Q  113 tttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17302 tctaaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3293
Alignment:
Q  189 atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacat-gttca 287  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttca 3354  T
Q  288 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    || |||||| ||||   ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3353 aagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatggtgaattttgctaagttgtt 3293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Original strand, 56102 - 56259
Alignment:
Q  192 gataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg--ttcaaa 289  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  || ||     
T  56102 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaag 56201  T
Q  290 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    |||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56202 tatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgtt 56259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 55965 - 56045
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  55965 gtgaacttaggagataaattaaagcctaagtttggattaatcattatctacggtcagggggttagtcttcatcataatcat 56045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 56005 - 55904
Alignment:
Q  46 cttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56005 cttgaagaatcaagaattggagagagcttaggagctaaattgaagcctaaattgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 55906  T
Q  146 at 147  Q
    ||    
T  55905 at 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 108030 - 108107
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108030 agcttaggagctgaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 104622 - 104721
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||    
T  104622 aaaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatg 104721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93858
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataattgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaa 93858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 13237 - 13317
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13237 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 10211 - 10458
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  10211 agcttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctca 10310  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  10311 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 10410  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  10411 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 57344 - 57424
Alignment:
Q  67 gtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57344 gtgagcttagtagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 258
Target Start/End: Original strand, 70306 - 70361
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataatt 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70306 aaaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 70361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25637 - 25532
Alignment:
Q  40 ggagagcttgaagaactaaggattagagtgagcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 139  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25637 ggagaacttgaagaatcaagaattag-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatc 25539  T
Q  140 ataatca 146  Q
    |||||||    
T  25538 ataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 413 - 339
Alignment:
Q  72 cttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  413 cttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5623 - 5549
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5623 ttaggagctaaaatgaagcccaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8258 - 8172
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  8258 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 34266 - 34340
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34266 ttaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18100 - 18015
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 158  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Original strand, 22428 - 22573
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| | |||| || ||    
T  22428 aaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtg 22527  T
Q  302 ataagttgtgaaaattgtgctcaatt-ggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
     ||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22528 ttaacttgtg--aattatgctcaattgggtgaattatgctaagttgtt 22573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48621 - 48570
Alignment:
Q  342 agttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48621 agttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaat 48570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1449
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  1347 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 1446  T
Q  302 ata 304  Q
    |||    
T  1447 ata 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Original strand, 9602 - 9704
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  9602 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 9701  T
Q  302 ata 304  Q
    |||    
T  9702 ata 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 1447 - 1694
Alignment:
Q  70 agcttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||     ||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| || | ||||  |    
T  1447 agcttaggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctca 1546  T
Q  170 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 268  Q
    |||||||||||  | | || ||| | ||||||||| ||| |||||| |   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  1547 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 1646  T
Q  269 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1647 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 22421 - 22520
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatg 301  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  22421 aaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatg 22520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54132 - 53990
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatg 293  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | | ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  54132 aattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatg 54033  T
Q  294 taaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    || || || ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  54032 tataattgttaagttgtg-aaattatacccaattggtgaatttt 53990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 393
Target Start/End: Original strand, 1 - 59
Alignment:
Q  335 tttgctaagttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  1 tttgctaagttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaat 59  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2687
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  2773 aaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5508
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5434 ttaggagctaaagtgaagcctaagattggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4378
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4304 ttaggagctaaagtgaagcaaaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 49710 - 49784
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49710 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 49784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3529
Alignment:
Q  241 catgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 337  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtg-aaattatacccaattggtgaatttt 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2401
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 1545 - 1587
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1545 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 8690 - 8732
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8690 aaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 259  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 95372 - 95298
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  95372 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 95298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 76847 - 76932
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  76847 aaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 76932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 80220 - 80187
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80220 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6823
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 351
Target Start/End: Original strand, 961 - 1109
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatg 301  Q
    |||||||||| || || | |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  961 aaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 1060  T
Q  302 ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttaat 351  Q
    |||  ||| |  |||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||    
T  1061 atatattggg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttaat 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30212 - 30101
Alignment:
Q  204 aaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatg 301  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  30212 aaaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 30113  T
Q  302 ataagttgtgaa 313  Q
    |||  |||||||    
T  30112 atatattgtgaa 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28698
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || |   ||||||||||||||| |||||||||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaa 28698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 6068 - 6142
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6068 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttaaacataatcat 6142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 9370 - 9444
Alignment:
Q  73 ttaggagctaaattgaagtccaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9370 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 9444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31266 - 31184
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  31266 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttca 31184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Original strand, 7693 - 7819
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||    
T  7693 tgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtg 7790  T
Q  321 ctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7791 ctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 7819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9471 - 9438
Alignment:
Q  360 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9471 tgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 9438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3354
Alignment:
Q  223 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 320  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  ||||| |    
T  3480 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattggg 3383  T
Q  321 ctc-aattggtgaattttgctaagttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3382 ctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 3354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4742
Alignment:
Q  226 tgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  4831 tgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39904 - 39783
Alignment:
Q  195 aattgttgcaaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39904 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 39805  T
Q  293 gtaaaaatgataagttgtgaaa 314  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  39804 gtataaatgttaagttatgaaa 39783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35724 - 35640
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 289  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |   ||||| |||||||| ||||||||||    
T  35724 aattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 35640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University