View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7904_low_4 (Length: 508)

Name: NF7904_low_4
Description: NF7904
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7904_low_4
NF7904_low_4
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (21-500)||(29123429-29123908)
chr4 (21-500)||(22340331-22340810)
chr4 (17-489)||(18116384-18116857)
chr4 (26-500)||(4303193-4303667)
chr4 (17-489)||(36279205-36279677)
chr4 (21-489)||(23158152-23158620)
chr4 (17-489)||(51872433-51872905)
chr4 (17-328)||(6614197-6614508)
chr4 (26-494)||(8110675-8111143)
chr4 (9-492)||(15649066-15649549)
chr4 (26-417)||(15705634-15706025)
chr4 (21-502)||(12915543-12916024)
chr4 (21-327)||(17838698-17839004)
chr4 (322-500)||(17826772-17826950)
chr4 (187-500)||(3621420-3621733)
chr4 (26-473)||(50693772-50694219)
chr4 (26-473)||(36950958-36951405)
chr4 (17-473)||(17469142-17469598)
chr4 (17-334)||(29192472-29192789)
chr4 (8-230)||(34994465-34994687)
chr4 (17-77)||(4723310-4723370)
chr4 (21-164)||(12290544-12290687)
chr4 (386-457)||(24059760-24059831)
chr4 (17-257)||(24059391-24059631)
chr4 (21-123)||(3621321-3621423)
chr4 (107-155)||(25135116-25135164)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (17-489)||(74046-74518)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (17-489)||(40891766-40892238)
chr7 (23-489)||(586538-587004)
chr7 (9-492)||(9403131-9403607)
chr7 (9-492)||(37075589-37076072)
chr7 (17-489)||(12121334-12121806)
chr7 (17-489)||(24819445-24819917)
chr7 (17-477)||(36575396-36575856)
chr7 (9-492)||(34981587-34982070)
chr7 (26-500)||(20705483-20705957)
chr7 (26-500)||(20873527-20874001)
chr7 (8-119)||(3483065-3483176)
chr7 (17-167)||(21607986-21608136)
chr7 (21-286)||(27278354-27278619)
chr7 (17-164)||(31252966-31253113)
chr7 (173-468)||(27868804-27869099)
chr7 (392-473)||(22865766-22865847)
chr7 (392-473)||(47548969-47549050)
chr7 (392-473)||(47553412-47553493)
chr7 (389-473)||(27987585-27987669)
chr7 (368-473)||(18815411-18815516)
chr7 (130-233)||(18815651-18815754)
chr7 (130-233)||(27990209-27990312)
chr7 (389-462)||(8457213-8457286)
chr7 (116-206)||(8457469-8457559)
chr7 (17-260)||(5196381-5196624)
chr7 (8-230)||(45649422-45649644)
chr7 (17-69)||(18815815-18815867)
chr7 (17-75)||(22866164-22866222)
chr7 (17-75)||(27868658-27868716)
chr7 (389-470)||(5196753-5196834)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (17-489)||(41342810-41343282)
chr1 (21-500)||(49369519-49369998)
chr1 (17-489)||(27029700-27030172)
chr1 (17-489)||(10003679-10004151)
chr1 (21-332)||(5557019-5557330)
chr1 (17-164)||(44753748-44753895)
chr1 (17-132)||(48759777-48759892)
chr1 (21-273)||(45757435-45757687)
chr1 (368-457)||(24545091-24545180)
chr1 (28-155)||(37666112-37666239)
chr1 (389-498)||(28520830-28520939)
chr1 (392-451)||(37668976-37669035)
chr1 (17-206)||(40392461-40392642)
chr1 (389-456)||(26996083-26996150)
chr1 (131-257)||(26995826-26995952)
chr1 (17-69)||(26995713-26995765)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (21-492)||(23603015-23603485)
chr3 (21-489)||(23571623-23572091)
chr3 (21-500)||(42462472-42462951)
chr3 (9-492)||(17153806-17154289)
chr3 (17-489)||(3514432-3514904)
chr3 (26-500)||(8595014-8595488)
chr3 (21-500)||(48547306-48547785)
chr3 (9-444)||(53152132-53152567)
chr3 (17-489)||(9818808-9819280)
chr3 (21-500)||(42459294-42459761)
chr3 (9-164)||(32945631-32945786)
chr3 (28-276)||(30737247-30737495)
chr3 (17-145)||(8542253-8542381)
chr3 (17-473)||(16663724-16664180)
chr3 (17-141)||(9246777-9246901)
chr3 (17-465)||(39632858-39633306)
chr3 (8-334)||(10753802-10754128)
chr3 (392-473)||(52196409-52196490)
chr3 (392-456)||(10754186-10754250)
chr3 (9-64)||(44879735-44879790)
chr3 (17-230)||(52196035-52196248)
chr3 (116-156)||(28393365-28393405)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (21-500)||(58387-58866)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (9-492)||(23384583-23385066)
chr2 (21-481)||(38938224-38938684)
chr2 (9-488)||(21963148-21963627)
chr2 (17-492)||(32349622-32350097)
chr2 (9-439)||(27914653-27915083)
chr2 (82-489)||(30275703-30276109)
chr2 (315-488)||(21964639-21964812)
chr2 (17-268)||(22298660-22298911)
chr2 (392-473)||(1258584-1258665)
chr2 (17-201)||(33937067-33937249)
chr2 (116-233)||(20007345-20007462)
chr2 (364-472)||(22300858-22300966)
chr2 (17-72)||(30274477-30274532)
chr2 (17-201)||(1258208-1258393)
chr2 (170-215)||(43409013-43409058)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (9-488)||(5824972-5825451)
chr5 (26-500)||(11265782-11266256)
chr5 (9-492)||(6678577-6679058)
chr5 (21-494)||(27891450-27891923)
chr5 (9-384)||(10462244-10462619)
chr5 (21-469)||(29150057-29150504)
chr5 (17-477)||(31962686-31963146)
chr5 (8-473)||(38931508-38931973)
chr5 (392-473)||(29322916-29322997)
chr5 (17-336)||(8895132-8895451)
chr5 (392-470)||(8896369-8896447)
chr5 (26-75)||(29322550-29322599)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (17-489)||(26077728-26078200)
chr8 (9-333)||(2959748-2960072)
chr8 (26-473)||(26390260-26390706)
chr8 (21-276)||(31423430-31423685)
chr8 (301-494)||(31423238-31423431)
chr8 (219-473)||(29532307-29532561)
chr8 (21-213)||(29529926-29530117)
chr8 (392-473)||(10801698-10801779)
chr8 (95-153)||(18182108-18182166)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (17-489)||(18295398-18295870)
chr6 (21-500)||(667016-667496)
chr6 (21-500)||(28604878-28605357)
chr6 (23-489)||(2893991-2894457)
chr6 (21-473)||(7218368-7218820)
chr6 (21-489)||(17227680-17228156)
chr6 (17-416)||(9759578-9759977)
chr6 (21-155)||(14223505-14223639)
chr6 (8-473)||(5391535-5392000)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (21-473)||(224744-225194)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (368-473)||(11164-11269)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29123908 - 29123429
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| | |||| | || | ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  29123908 agtttgctttcatccaccaaaaagtttgaagtttaaccttttcaagaagagcttcaagatgatccatattgttttggaaaatcctcaaattgcgatcttt 29123809  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29123808 ccaaataacaaataaaaccgaaatccaaataatagacaaagctttcatagaattctttga-aaacctccaagagcacaaaactgattagcatgaggatat 29123710  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29123709 aaattgccttgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataatcgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatggtctctttcct 29123610  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29123609 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 29123510  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaaggg-aaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29123509 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 29123429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Original strand, 22340331 - 22340810
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| | |||| | || | ||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22340331 agtttgctttcatccaccaaaaagtttgaagtttaaccttttcaagaagagcttcaagatgatccatattgttttggaaaatcttcaaattgcgatcttt 22340430  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22340431 ccatataacaaataaaaccaaaatccaaataatagacaaagctttcatagaattctttgaaaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgaggatat 22340530  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22340531 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaaaccaattcgaaaccaagagccataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatctctttcct 22340630  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22340631 cctccttaccacacaaggccacacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatttagaaagagacg 22340730  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22340731 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaacactgcagtgatattgatgtcca 22340810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18116857 - 18116384
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggtttt-ggaaaatcctcctgttgcga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18116857 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaagtataacttccaaatgaacaatttggtttttggaaaatcctcctattgcga 18116758  T
Q  116 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |    
T  18116757 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaatgctttcatagaattctttgagaagcctccaagagcgcaaaactgattagcatttg 18116658  T
Q  216 gatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatct 315  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  18116657 tatataaattgccattaaaaaccgtaacaaaaccaagccaatccgatagcaaaagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaatgatccct 18116558  T
Q  316 ttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaag 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18116557 ttcctcctccttaccacataaggctccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcctcttgcgaagattgtcctttgtagcaaatctattcagaaag 18116458  T
Q  416 agacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18116457 agacgccaaacaaaaatgttaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 18116384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4303667 - 4303193
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |    
T  4303667 gctttcatccaccaaaaggtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgacccatatggttttggaaaatcttcatattgcgatctttccaaa 4303568  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||  |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  4303567 taacaaataaaatcgaaatccaaacaatagacaaagctttcgtagaactctttgaaaaacctccaagggcacaaaattgattagcatgggtatataaatt 4303468  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4303467 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgatatcaagagtcataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatggtccctttcctcctcc 4303368  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4303367 ttaccacacaaggccgcacaagaagaatctgtagcatgaaggatattcctcttgcgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaaaagacgccaaa 4303268  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4303267 caaaaatattaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 4303193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 36279677 - 36279205
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36279677 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtagaacttccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 36279578  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  36279577 ctttccatatagtatataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatataattctttgagaaacctccaagagcgcaaaactgattagcatgagt 36279478  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||    
T  36279477 atataaattgccattgaaaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataatcgaccataataagcacattggaaaaacaaatgatccctt 36279378  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    | ||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36279377 ttctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaagaacattcctcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 36279278  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36279277 accgccaaacaaaaatattaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 36279205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23158620 - 23158152
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23158620 agttagctttcaaccaccaaaacgtttgaaatttgactctttcaagtagaacttccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 23158521  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23158520 tcatatagtatataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaacctccaagagcgcaaaactgattagcatgagtatat 23158421  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  23158420 aaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataatcgaccataataatcatattggaaaaacaaatgatccctttcct 23158321  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23158320 cctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaagaacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaagagccg 23158221  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23158220 ccaaacaaaaatattaacttttaaggggactgctttaagccataaaaattgatcaaaatatgcagtgat 23158152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 51872433 - 51872905
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51872433 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 51872532  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
     |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||     
T  51872533 ttttccaaatagtatataaggccgatatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaacctcctagaccacaaaactgattagcatgagt 51872632  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    |||| ||||||||| ||  || ||||| ||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  51872633 atatgaattgccattaagaactgtaaccaaacctaaccaatccgatagcataagccataatcgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccctt 51872732  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||| | || ||  || | |||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51872733 tcctcctccttaccaaataaagcaccataggaaacattggtagcctcaagaacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 51872832  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51872833 gccgccaaacaaaaatattaacttttaagggtaccgctttaagccataaaaattgaacaaaatctgcagtgat 51872905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6614508 - 6614197
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6614508 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttgaaaaatcctcatgttgcgat 6614409  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  6614408 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatttgcatgtga 6614309  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6614308 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaatgatccctt 6614209  T
Q  317 tcctcctcctta 328  Q
    ||||||||||||    
T  6614208 tcctcctcctta 6614197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 494
Target Start/End: Original strand, 8110675 - 8111143
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||| | || || ||||| |||||||||| |||| |||| | |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  8110675 gctttcagccaccaataagtctgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcgagatgttcaacttggttctgaaaaatcctcctgttgcggtccttccaaa 8110774  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||    
T  8110775 taacaaataagaccgaaatccatataatagtaaaagctgtcctagaattctttgagaaccctccaagagcacaaaactgattagcatgtgaaaatatatt 8110874  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  8110875 gccatgaaacaccttaacaataccaaaccaattcgatatcaagagccataatcgaccataatgatcacattgaaaaaagaaatggtccctttcctcctcc 8110974  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||  | | ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8110975 ttaccacacaaggccgcgcaagacacattggaaacctcaaagacgttcctcttgcgcaggttgtcctttgttgcaagtctattcagaaagagacgccata 8111074  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattga 494  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8111075 caaaaatattaacctttaatggaaccgctttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttga 8111143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15649549 - 15649066
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15649549 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaagaagaacttccatatgaacaatttcgttttgaaaaatcctcct 15649450  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  15649449 gttacgatctttccaaatagaaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagtttgcatagaatgctttgagaatcctccaagtgcacaaaactgatta 15649350  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||| || ||||  | | |||| |||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15649349 gcatgtgaatataagtttccattgagcgccgtgacaaaacctaaccaatctgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaaaaataaat 15649250  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || |   ||||| ||   |  |||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||    
T  15649249 ggtctctttcctcctccttaccacataaagtaccacaaaaaacgttggtagcctcgaggacattccgcttgcgaagattatcctttgtagcaaggcgatt 15649150  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  15649149 cagaaagagcctccaaacaaaaatattaacctttaaagggactgctttaagccataataaatgatcaaactctgcattgatatt 15649066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15706025 - 15705634
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |    
T  15706025 gctttcatccaccaaaaggtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgacccatatggttttggaaaatcttcatattgcgatctttccaaa 15705926  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  15705925 taataaataaaaccgaaatccaaacaatagataaagctttcgtagaactctttgaaaaatctccaagggcacaaaattggttagcatgggtatataaatt 15705826  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15705825 gccatgaagcaccgtaacaaaaccaagtcaattcgatatcaagagccataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatccctttcctcctcc 15705726  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagag 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15705725 ttatcacacaaggccgcacaagaagcatctgtagcctgaaggatattcctcttgcgaagattgtcatttgtagcaagtccattcagagagag 15705634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 502
Target Start/End: Original strand, 12915543 - 12916024
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| | |||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12915543 agtttgctttcaaccaccaatacgtttgaagtttaaccctttccataagagcttctagatgatcaaagtgattttggaaaattctcctgttgcgatcttt 12915642  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |  |||  || ||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||| || |    
T  12915643 ccatataacatataagaccgaaatctaaataatagtaaacgctaacgtagacctccttgagaagccaccgagagcacaaaaatgattagcatgagtatgt 12915742  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||||   |||||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  12915743 aaattaccatgtaaaaccgtaacaataccaagccactgcgataccaagagccataaccgcccataatggtcacattgaaaaaataaattgtctctttcct 12915842  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12915843 cctccttaccacacaaggccgcacaagaaacattgttagccgcaaggacattccttttgcgcaagttgttctttgtagcaattctattcagaaagagacg 12915942  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtccatc 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  12915943 ccaaacaaaaatgttaacctttaacggaaccgccttaagccacaagaattggttaaaatcttcagtgatcttggtgtccatc 12916024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17839004 - 17838698
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17839004 agtttgctttcatccaccaaaaagtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgatccatatggttttggaaaatcttcatgttgcgatcttt 17838905  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  17838904 ccaaataacaaataaaaccaaaatccaaataatagacaaagctttcatggaattctttgaaaagcccccaagagcacaaaactgattagcatgtgtatat 17838805  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  17838804 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagtcaattcgatatcaagagccataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatcccttttct 17838705  T
Q  321 cctcctt 327  Q
    |||||||    
T  17838704 cctcctt 17838698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17826950 - 17826772
Alignment:
Q  322 ctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826950 ctccttaccacacaaggccgcacaagaagcatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaagattctcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgc 17826851  T
Q  422 caaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17826850 caaacaaaaatgttaacttttaaggaaaccactttaagccataaaaattgatcaaactctacagtgatattgatgtcca 17826772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 187 - 500
Target Start/End: Original strand, 3621420 - 3621733
Alignment:
Q  187 tccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  3621420 tccaagagcacaaaactgatgagcatgtgaaaatagattgccatgaaacacagtaacaataccaaaccaattcgttaacaagagccataaccgaccataa 3621519  T
Q  287 aaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggt 386  Q
      ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||  | | ||| ||| || |||||||| || ||||    
T  3621520 tgatcacattggaaaaaaaaatggtctctttcctcctccttaccacacaaggtcgcgcaagacacattggaaacctcaagaacgttcctcttacgcaggt 3621619  T
Q  387 tgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagt 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3621620 tgtcctttgttgcaagtctattcagaaaaagacgccatacaaaaatattaacctttaatgggaccggtttaagccataaaaattgattaaactctgcagt 3621719  T
Q  487 gatattgatgtcca 500  Q
    |||||||| |||||    
T  3621720 gatattgaagtcca 3621733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50694219 - 50693772
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||  || || || ||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  50694219 gctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaagaagaacttcaagatgatcaaagtgattctgaaaaattctcctgtttctatctttccaaa 50694120  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    |    ||||| ||||||||||||||||  | |||   | ||  | | || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||    
T  50694119 tgacgaataaaaccgaaatccaaataactgtaaaacatgtcctacacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagtagcatgagagtataaatt 50694020  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
     ||||  ||    ||||||| ||||| ||| |  ||||  || ||||| | | | ||||||  |||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  50694019 accattcaaagttgtaacaataccaaaccactgagaaattaaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacaaatgatccctttcctcttcc 50693920  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  |||   || |  | ||  ||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50693919 ttaccacacaaagtcgcgcaagccgtaagagtgggatcaattacatttcttttacgcaagttatcttttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 50693820  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  50693819 caaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataaaaattgat 50693772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 473
Target Start/End: Original strand, 36950958 - 36951405
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| |||  || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  36950958 gctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcaaagtgattctgaaaaattcttctgtttcgatctttccaaa 36951057  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    |    ||||| || || ||||| ||||  | |||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||    
T  36951058 tgacgaataaaacagacatccagataactgtaaatcctgtcctagatttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagtagcatgagagtataaatt 36951157  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
     ||||  |     ||||||||||||||||| |  ||||  || ||||| | | | ||||||  |||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  36951158 accattcagagttgtaacaaaaccaagccactgagaaattaaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacaaatgatccctttcctcttcc 36951257  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||| | ||| ||||   ||   || |  | ||  ||||| || || || |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36951258 ttaccacacaaagtcgcgcaagccataagagtgggatcaaatacatttcttttacgcaaattatcttttgtagcaagtctattcagaaagagacgccata 36951357  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36951358 caaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataaaaattgat 36951405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17469598 - 17469142
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| |||  || || || ||||| |||||||| | ||    
T  17469598 atgtaattcgctttcagccaccaaaatgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcaaagtgattctgaaaaattctcctgtttctat 17469499  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataa-tagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgag 215  Q
    ||||||| ||    |||||  | ||||| ||||||| || ||||  || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  17469498 ctttccaaatgacgaataaagctgaaattcaaataactataaaac-ctgtcctagacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagtagcatgag 17469400  T
Q  216 gatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatct 315  Q
      |||||||| ||||  |     ||||||| ||||||||| |  ||||  || ||||| | | | ||||||  |||||| | ||||||||||||||  ||    
T  17469399 agtataaattaccattcagagttgtaacaataccaagccactgagaaaataaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacaaatgatccct 17469300  T
Q  316 ttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaag 415  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  |||   || |  | ||  ||||| || ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17469299 ttcctcttccttaccaaacaaagtcgcgcaagccgtaagagtgggatcaattacatttcttttgcgcaagttatcttttgtagcaagtctattcagaaag 17469200  T
Q  416 agacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  17469199 agatgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataaaaaatgat 17469142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29192789 - 29192472
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | || | |||  || |  || ||||| |||||||| | ||    
T  29192789 atgtaattcgctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagtagagcttcaagataatcaaaatgatgctgaaaaattctcctgtttctat 29192690  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||| | ||    ||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||| |     
T  29192689 ctttctaaatgacgaataaaaccgaaatccaaataatagtaaaacctgtcatagagttttttgaaaaacccccaagagcacaaaattgagaagcatgtga 29192590  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    || |||||| ||||  ||    ||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| | | ||||||||  |||||| |||||||||| ||| |  |||    
T  29192589 atgtaaattaccattcaaagttgtaacaataccaagccactgagaaatcaagagccaaagtcgaccataatgatcacaatgaaaaaacagatggtccctt 29192490  T
Q  317 tcctcctccttaccacac 334  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  29192489 tcctcttccttaccacac 29192472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Original strand, 34994465 - 34994687
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| ||   || || || ||||| ||||    
T  34994465 tcgaacaaaatgtaattcgctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcagagtgattctgaaaaattctcc 34994564  T
Q  108 tgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatg 207  Q
    |||| | ||||||||| ||    ||||| || |||||||| ||||  | |||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  34994565 tgtttctatctttccaaatgacgaataaaacagaaatccatataactgtaaatcctgtcctagacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagt 34994664  T
Q  208 agcatgaggatataaattgccat 230  Q
    ||||||||  |||||||| ||||    
T  34994665 agcatgagagtataaattaccat 34994687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4723370 - 4723310
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttcca 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  4723370 atgtagttagccttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgacccttttaataagaacttcca 4723310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Original strand, 12290544 - 12290687
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||   |||| |||| | |||  || ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  12290544 agtttgctttcaaccaccaataagtctgaagtttaaccctttccgaaagagcttcgagatgttcactttggttctgaaaaatccttctatttcgatcttt 12290643  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctt 164  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12290644 ccaaataacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctt 12290687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 457
Target Start/End: Original strand, 24059760 - 24059831
Alignment:
Q  386 ttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgcttta 457  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  24059760 ttgtcctttgtagcaagtctactcataaagagacgtcaaacaaaaatattaacttttaacgaaaccgtttta 24059831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 24059391 - 24059631
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  ||   |  ||| |||  || || |  ||||| ||  |||| || |    
T  24059391 atgtagttcgctttcaaccaccaatatgtttggagtttaaccttttcaagaagtcctgtaagctgatcaaaatgattataaaaaattctattgttacggt 24059490  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||  | |||||     
T  24059491 cttttcagataacaaataagaccgaaatccaaataatagagaatgatgtccttgaattctttgagaaccctctaagagcttaaaactgatttgaatgagc 24059590  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaat 257  Q
    |||||| | ||||||||  || ||| | | |||||||||||    
T  24059591 atataagtcgccatgaagaactgtatcgataccaagccaat 24059631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 3621321 - 3621423
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||| |||| |||| | |||  || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3621321 agtttgctttcaaccaccaataagtctgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcaagatgttcattttggttctgaaaaatcctcctgttacgatcttt 3621420  T
Q  121 cca 123  Q
    |||    
T  3621421 cca 3621423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Original strand, 25135116 - 25135164
Alignment:
Q  107 ctgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatag 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25135116 ctgttacgatctttccaaataacaaataagactgaaatccaaataatag 25135164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 74046 - 74518
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74046 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttccagatgatcaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 74145  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| | |||| |     
T  74146 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaagtctcttagagcgcaaaactgattatcatgtgt 74245  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |   ||    
T  74246 atataaattgccatgaaacactgtaacaaaaccaagccaatttgatatcaaaagccataactgaccataataatcacattggaaaaacaaatggtccatt 74345  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74346 tcctcctccttaccacacaaggccccacaagaaacataggtagcctcaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 74445  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74446 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 74518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40892238 - 40891766
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40892238 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttccagatgatcaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 40892139  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| | |||| |     
T  40892138 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaagtctcttagagcgcaaaactgattatcatgtgt 40892039  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |   ||    
T  40892038 atataaattgccatgaaacactgtaacaaaaccaagccaatttgatatcaaaagccataactgaccataataatcacattggaaaaacaaatggtccatt 40891939  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40891938 tcctcctccttaccacacaaggccccacaagaaacataggtagcctcaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 40891839  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40891838 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 40891766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 489
Target Start/End: Original strand, 586538 - 587004
Alignment:
Q  23 ttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttcc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  586538 ttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaagaagaacttccaattaatcaatttggttttggaatatccttcggtttcgatctttcc 586637  T
Q  123 atatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  586638 atatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtgaaagctttcatataattctttgagaagcctccaagagcgcaaaactgattagcatgtgtatataa 586737  T
Q  223 attgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcc 322  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  586738 attgtcatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgatatcagaagccataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatccctttcctcc 586837  T
Q  323 tccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgcc 422  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||  ||  ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  586838 tccttaccacataaggccccacttgaaacattggtagcctcaaggacattccttttacgaagattgtcctttgtagcaagtctattcaaaaagagacgcc 586937  T
Q  423 aaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  586938 aaacaaaaatattaacctttaagggaaccgctttaagccataaaaaacgatcaaactctgcagtgat 587004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9403607 - 9403131
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9403607 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 9403508  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  9403507 gttacgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaatgctttgagaaacctccaagtgcacaaaactgattt 9403408  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9403407 gcatgtgaatataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaat 9403308  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  9403307 gatccctttcctcctccttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 9403208  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    |||         |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9403207 cag-------gtccaaacaaaaatattaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 9403131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37076072 - 37075589
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37076072 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagaagaacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 37075973  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |    
T  37075972 gttacgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagtttgcacagaatgctttgagaatccttcaagtgcacaaaactgatta 37075873  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||||||| |||  |  |||||||||| ||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37075872 gcatgtgaatataaattgtcattgagaaccgtaacaatacctaaccaatccgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaaaaacaaat 37075773  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  |||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  37075772 gatccctttcctcctccttgccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 37075673  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37075672 ctgaaagagcctccaaacaaaaatattaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 37075589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 12121334 - 12121806
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12121334 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 12121433  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||     
T  12121434 ctttccatatagtatataaggctgagatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaaccgcctagagcgcaaaactgattagcatgagt 12121533  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    |||||||||| |||  |  |||||||| ||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||   ||    
T  12121534 atataaattgtcattgagaaccgtaaccaaacctaaccaatccgatagcataagccataatcgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccatt 12121633  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12121634 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtatcctctagaacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 12121733  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12121734 gccgccaaacaaaaatattaacttttaagggtaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatttgcagtgat 12121806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 24819445 - 24819917
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24819445 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagagcactttggttttggaaaatcctcctgttgcgaa 24819544  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||     
T  24819545 ctttccatatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaaccacctaaagcgcaaaactgattagcatgaga 24819644  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| | || ||||| |||||||||||||  |||    
T  24819645 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataaacgaccataatagtcgcattggaaaaacaaatgatccctt 24819744  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||   |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24819745 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacgttggtagcctcaaggacgttcctcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaaa 24819844  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24819845 gccgccaaacaaaaatattgacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 24819917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 36575856 - 36575396
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36575856 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagagcactttggttttggaatatcctcctgttgcaat 36575757  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||     
T  36575756 ctttccaaatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaaccacctaaagcgcaaaactgattagcatgaga 36575657  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||    
T  36575656 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataaacgaccataaaagtcgcattggaaaaacaaatgatccctt 36575557  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36575556 tcctcctccttaccacatagagcaccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcctcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaaa 36575457  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaa 477  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36575456 gccgccaaacaaaaatattgacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaa 36575396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Original strand, 34981587 - 34982070
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34981587 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaagaagaacttccatatgaacaatttcgttttgaaaaatcctcct 34981686  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  34981687 gttacgatctttccaaatagaaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagtttgcatagaatgctttgagaatcctccaagtgcacaaaactgatta 34981786  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||| || ||||  | | |||| |||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  34981787 gcatgtgaatataagtttccattgagcgccgtgacaaaacctaaccaatctgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaagaataaat 34981886  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||   |  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||    
T  34981887 ggtctctttcctcctccttaccacataaagcaccacagaaaacgttggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaaggcgatt 34981986  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34981987 cagaaagagcctccaaacaaaaatattaacctttaaagggaccgctttaagccataaaaactgatcaaactctgcattgatatt 34982070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20705957 - 20705483
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||||||||||| | ||  | ||||| |||||||||  |||| |||| | |||  ||  |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  20705957 gctttcaaccaccaataagtccgaagtttaaccctttcagaaagagcttcgagatgttcatgttggttctgaaaaatcctcctatttcgatctttccaaa 20705858  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |  ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| |    
T  20705857 taacgaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctgacgtagacttcttggagaaccctccaagtgcacaaaactgatgagtatgtgaaaataaagt 20705758  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  20705757 gccatgaaacacagtaacaataccaaaccaattcgatatcaaaagccataaccggccataatgatcacattggaaaaacaaatggtctctttcctcctcc 20705658  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||  | | ||| ||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20705657 ttaccacacaaagccgcacaagccacattagaaacctcaagaacgtttctcttgcgcagattatcctttgttgcaagtctattcagaaaaagacgccata 20705558  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||| ||||| || || || || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20705557 caaaaatattaaccttcaatgggactggtttaagccataaaaattgagtaaactctgcagtgatattgaagtcca 20705483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20874001 - 20873527
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||||||||||| | ||  | ||||| |||||||||  |||| |||| | |||  ||  |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  20874001 gctttcaaccaccaataagtccgaagtttaaccctttcagaaagagcttcgagatgttcatgttggttctgaaaaatcctcctatttcgatctttccaaa 20873902  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |  ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| |    
T  20873901 taacgaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctgacgtagacttcttggagaaccctccaagtgcacaaaactgatgagtatgtgaaaataaagt 20873802  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  20873801 gccatgaaacacagtaacaataccaaaccaattcgatatcaaaagccataaccggccataatgatcacattggaaaaacaaatggtctctttcctcctcc 20873702  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||  | | ||| ||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20873701 ttaccacacaaagccgcacaagccacattagaaacctcaagaacgtttctcttgcgcagattatcctttgttgcaagtctattcagaaaaagacgccata 20873602  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||| ||||| || || || || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20873601 caaaaatattaaccttcaatgggactggtttaagccataaaaattgagtaaactctgcagtgatattgaagtcca 20873527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3483176 - 3483065
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3483176 tcgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaaaaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 3483077  T
Q  108 tgttgcgatctt 119  Q
    ||||||||||||    
T  3483076 tgttgcgatctt 3483065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 21607986 - 21608136
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  21607986 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaaaaagagcttccaaatgatcaatttggttttggaaaatcctcaatttgcgat 21608085  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttca 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21608086 cttttcatataataaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttca 21608136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 27278354 - 27278619
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||| ||||||| |||| | |||| |||| || |||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  27278354 agtttgctttcaaccaccaatacgattgaaatttaacccttttaagaagagcttcaagatgatcaatgtgattttagaaaattatactgttgcgatcttt 27278453  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    | |||||  |||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  27278454 caatataacaaataagaccaaaacccatataatagtaaaagctgttctagaattccttgagaaacctgcaagagcacaaaactgattagcatgtgtattt 27278553  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataa 286  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||    
T  27278554 aaattgccatgtaaaatcgtaacaataccaaaccaatgcaatatcaagagccataaccgaccataa 27278619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 31252966 - 31253113
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31252966 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaaatagaacctccaaaagagcgctttggttttggaatatcctcctgttgcgat 31253065  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctt 164  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  31253066 ctttccaaatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctt 31253113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 468
Target Start/End: Original strand, 27868804 - 27869099
Alignment:
Q  173 ttctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagcc 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| |  || | ||| || |    
T  27868804 ttctttgagaaacctccaaaagcacaaaattgattagcatgagaatgtaaattaccatgtagaaccgtaacaataccaagccactgtgagatcaaaagtc 27868903  T
Q  273 ataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacatt 372  Q
    | |   | ||||||  |||||| |||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||||| |||||| |    |   || |  | ||  |||||    
T  27868904 aaagccgtccataatgatcacaatgaaaaaacaaatggtccatatcctcttccttaccacacaaggtcgcacatgccacaagggtcggatcaataacatt 27869003  T
Q  373 cctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaa 468  Q
    |||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||    
T  27869004 ccttctgcgcaaattatcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaatatgttaacctttaacataaccgcttttagccataaaaa 27869099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22865847 - 22865766
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  22865847 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaactgctttcaaccataaaaattgat 22865766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Original strand, 47548969 - 47549050
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  47548969 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaactgctttcaaccataaaaattgat 47549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Original strand, 47553412 - 47553493
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  47553412 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaactgctttcaaccataaaaattgat 47553493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27987669 - 27987585
Alignment:
Q  389 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27987669 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccatacaaaaatattaacctttaacggaaccgctttatgccacaaaaaatgat 27987585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18815516 - 18815411
Alignment:
Q  368 acattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaa 467  Q
    ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  18815516 acattcctcttcctcagattatcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgctagacaaatatattaacctttaacggaaccgctttatgccacaaaa 18815417  T
Q  468 attgat 473  Q
    | ||||    
T  18815416 aatgat 18815411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18815754 - 18815651
Alignment:
Q  130 aaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgcca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||    
T  18815754 aaataagaccgaaatccaaataatagataagaatgtccatgaattttttgagaaccctccaagagcacaaaactgatttgaatgagtatttaaattgcca 18815655  T
Q  230 tgaa 233  Q
    ||||    
T  18815654 tgaa 18815651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27990312 - 27990209
Alignment:
Q  130 aaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgcca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  27990312 aaataagaccgaaatccaaataatagagaaggttgtccttgaattttttgagaaccctccaagagcacaaaactgatttgaatgagtatataaatcgcca 27990213  T
Q  230 tgaa 233  Q
    ||||    
T  27990212 tgaa 27990209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8457286 - 8457213
Alignment:
Q  389 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagcca 462  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  8457286 tcctttgtatcaagtctattcagaaagagacgccagacaaaaatattaacctttaacgaaaccgctttatgcca 8457213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8457559 - 8457469
Alignment:
Q  116 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgat 206  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8457559 tctttccagataacaaataagaccgaaatccaaataataaagaagactgtccttgaattttttgagaaccctccaagagcacaaaactgat 8457469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 5196381 - 5196624
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| | |||  || | |  ||| |||| |  || || ||||| ||||||||| |||    
T  5196381 atgtagtgcgctttcaaccaccaatacgtttagagtttaaccttttctacaagcgctgcaagctgatcaatctaattgtgaaaaattctcctgttgtgat 5196480  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||| || |||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||  |||  | || ||  | |||||||||||||||||||| |  | ||||      
T  5196481 cttttcaaataacaaataaggccgcaatccaaataatagtaaaagttgtcctagagattttagaatagcctccaagagcacaaaactgttttgaatgaat 5196580  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcg 260  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5196581 atttaagtcgccatgaaaaaccgtaacaataccaagccaattcg 5196624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45649644 - 45649422
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| || ||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || | | |||| ||   || || || ||||| ||||    
T  45649644 tcgaacaaaatgtaattcgctttcagccaccaaaacatttgaagtttaatcctttcaagaagagctccaagatgatcagagtgattctgaaaaattctcc 45649545  T
Q  108 tgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatg 207  Q
     ||| | |||||| || ||    ||||| || |||||||||||||  | |||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  45649544 agtttctatcttttcaaatgacgaataaaacagaaatccaaataactgtaaatcctgtcctagacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagt 45649445  T
Q  208 agcatgaggatataaattgccat 230  Q
    ||||||||  |||||||| ||||    
T  45649444 agcatgagagtataaattaccat 45649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18815867 - 18815815
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaag 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18815867 atgtagttcgctttcaaccaccaatatgtttggagtttaaccttttcaagaag 18815815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22866222 - 22866164
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttc 75  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22866222 atgtaattcgctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttc 22866164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Original strand, 27868658 - 27868716
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttc 75  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  27868658 atgtaattcgctttcaaccaccaatacgtttggattttaatcctttcaagaagagcttc 27868716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 470
Target Start/End: Original strand, 5196753 - 5196834
Alignment:
Q  389 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaatt 470  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || | ||| || || |||||||| | || ||| |||||||| |||||||    
T  5196753 tcctttgtagcaagtctatttagaaagagtcgtcagataaagatattcacttttaacgaaatcgccttaagccacaaaaatt 5196834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41343282 - 41342810
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41343282 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaagtataacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctattgcgat 41343183  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |     
T  41343182 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaatgctttcatagaattctttgagaagcctccaagagcgcaaaactgattagcatttgt 41343083  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  41343082 atataaattgccattaaaaaccgtaacaaaaccaagccaatccgatagcaaaagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaatgatccctt 41342983  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41342982 tcctcctccttaccacataaggctccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcctcttgcgaagattgtcctttgtagcaaatctattcagaaaga 41342883  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41342882 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 41342810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Original strand, 49369519 - 49369998
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||| || | |||| ||||||    
T  49369519 agtttgctttcatccaccaaaaggtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgacccaaatggttttggaaaatcttcatattgcaatcttt 49369618  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  49369619 ccaaataacaaataaaatcgaaatccaaataatagacaaagctttcgtataattctttgaaaaacctccaagggcataaaactggttagcatgagtatat 49369718  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49369719 aaattgtcatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgatatcaagagccataatcgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatccctttcct 49369818  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49369819 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagcatctgcagcctaaaggacattcctcttgcgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 49369918  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49369919 ccaaaaaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattggtgtcca 49369998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 27029700 - 27030172
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27029700 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagagcactttggttttggaatatcctcctgttgcgat 27029799  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||     
T  27029800 ctttccaaatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaaccacctaaagcgcaaaactgattagcatgaga 27029899  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  | |||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  27029900 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgagagcataagccataaacgtccataaactttgcattggaaaaacaaatgatctctt 27029999  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  27030000 tcctcctccttaccacatagagcaccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcctcttacgaagattatcctttatagcaagtctattcaaaaaaa 27030099  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27030100 gccgccaaacaaaaatattgacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 27030172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 10003679 - 10004151
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10003679 atgtaattagctttaaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaagagagcactttggttttggaatatccttctgttgcgat 10003778  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||     
T  10003779 ctttccaaatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaaccacctaaagcgcaaaactgattagcatgaga 10003878  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||  |||||||||||||  |||    
T  10003879 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcaaaagccataaccgaccataaaagtcgcattcgaaaaacaaatgatccctt 10003978  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||  ||  ||||||| || ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003979 tcctcctccttaccacaaagagcaccacaagaaacattggtagcctcaaagacattcttcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 10004078  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10004079 gccgccaagcaaaaatattgacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 10004151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Original strand, 5557019 - 5557330
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5557019 agtttgctttcaaccaccagtaagtttgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcgagatgatcaatttggtattgaaaaatcctcctgttgcgatcttt 5557118  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| | |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |  |    
T  5557119 ccaaacaacaaataagaccgaaatccatataatagtaaaagttatccaagaattctttgagaaagctccaagagcacaaaactgattagcatgtgaaatt 5557218  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  5557219 aaattatcttgaaacaccgtaacaataccaaaccaattcgatatcaagagtcataatcgaccataatgatcacattaaaaaaacaaatggtccctttcct 5557318  T
Q  321 cctccttaccac 332  Q
    ||||||||||||    
T  5557319 cctccttaccac 5557330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44753895 - 44753748
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44753895 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttggagtttgactctttcaagtagaaactccaaaagtgcactttggttttggaaaatccttctgttgcggt 44753796  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44753795 ctttccatatagtatataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctt 44753748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48759892 - 48759777
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48759892 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtaaaacctccaaaagaacaatttggttttggaaaatcttcctgttgcgat 48759793  T
Q  117 ctttccatatagtaaa 132  Q
    ||||||||||| ||||    
T  48759792 ctttccatatattaaa 48759777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 45757435 - 45757687
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | |  | |||| || | || |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  45757435 agtttgctttcaaccaccaaaatgtttgaagcttaaccctttcaagaagagcatttagatgatcactgtgattttggaaaattttcctgttgcaatcttt 45757534  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  |||||||||  || |||| ||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||   || |    
T  45757535 ccatataacaaataagacaaaagtccagataatagtaaaaggtgtcctagaattctttgagaagcctccaaaggcacaaaactgattaacatgtatatgt 45757634  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagcca 273  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||||||| | ||| | |||||||||    
T  45757635 aaattgccatgtaaaaccgtaataataccaagccagtgcgatatcaagagcca 45757687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24545180 - 24545091
Alignment:
Q  368 acattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgcttta 457  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  24545180 acatttctctttcgaagattatcctttgtagcaagtctgttcagaaagagacgccagacaaaaatattaacttttaacggaaccacttta 24545091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Original strand, 37666112 - 37666239
Alignment:
Q  28 tttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccatata 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||| ||| |  || ||||| |||||||| | ||||||||| ||     
T  37666112 tttcaaccaccaaaatgtttggagtttgaccctttcaagtagagcttcaagatgatcaaattgatgctgaaaaattctcctgtttctatctttccaaatg 37666211  T
Q  128 gtaaataagaccgaaatccaaataatag 155  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||    
T  37666212 atgaataaaaccgaaatccaaataatag 37666239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 389 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28520939 - 28520830
Alignment:
Q  389 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 488  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  28520939 tcctctgtagcaagtctattcaggaagagacgccatacaaatatattcacctttaacgaaaccgctttaagccacaaaaattgatgaaactcttcaatga 28520840  T
Q  489 tattgatgtc 498  Q
    | || |||||    
T  28520839 tgttaatgtc 28520830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 37668976 - 37669035
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaacc 451  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  37668976 tttgtatcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaacc 37669035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Original strand, 40392461 - 40392642
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  ||   |  ||| ||| |||||| |  ||||| ||  |||| || |    
T  40392461 atgtagttcgctttcaaccaccaatatgtttggagtttaaccttttcaagaagtcctgtaagttgatcaaattggttatcaaaaattctattgttacggt 40392560  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgat 206  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||   || |||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40392561 ctttccatataacaaataaggtcgaaatccaaataatag---atcctt-----gaattctttgagaaccctccaagagcacaaaactgat 40392642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 456
Target Start/End: Original strand, 26996083 - 26996150
Alignment:
Q  389 tcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgcttt 456  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  26996083 tcctttgcaccaagtctattcagaaagagacgccagacaaaaatattaacctttaacggaatcgcttt 26996150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 257
Target Start/End: Original strand, 26995826 - 26995952
Alignment:
Q  131 aataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgccat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||   ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| | |||||    
T  26995826 aataagaccgaaatccaaataacagagaatgttgtccttgaattttttgagaaccctccaagagtacaaaactgatttgaatgagcatataagtcgccat 26995925  T
Q  231 gaaacaccgtaacaaaaccaagccaat 257  Q
    |||  || ||| | | |||||||||||    
T  26995926 gaagaactgtatcgataccaagccaat 26995952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 26995713 - 26995765
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaag 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26995713 atgtagttcgctttcaaccaccaatatgtttggagtttaaccttctcaagaag 26995765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 21 - 492
Target Start/End: Original strand, 23603015 - 23603485
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| | |||| | || | ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  23603015 agtttgctttcatccaccaaaaggtttgaagtttaaccttttcaagaagagcttcaagatgatccatattgttttggaaaatcttcaagttgcgatcttt 23603114  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23603115 ccaaataacaaataaaatcgaaatccaaataatagacagagctttcatagaattctttgaaaatcctccaagagcacaaaactgaatagcatgaggatat 23603214  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23603215 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccatagtcgaccataaaaatcacattgaaaaaacagatgatctctttcct 23603314  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23603315 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatttgtag-ctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtccttagtagcaagtctattcagaaagagtcg 23603413  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23603414 ccaaacaaaaatgttaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactccgcaatgatatt 23603485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23572091 - 23571623
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572091 agttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaattagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 23571992  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23571991 ccatatagaaaataataccgaaatccaaataatagtaaatgctttcatagaattctttgagaagcctccaaaagcacaaaactgattagcatgtgtatat 23571892  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  23571891 aaattgccattaaaaaccgtagcaaaacctaaccaatccgatagcaaaagccataaccgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccctttcct 23571792  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23571791 cctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcgtcttgcgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 23571692  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23571691 tcatacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctacagtgat 23571623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Original strand, 42462472 - 42462951
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42462472 agttagctttcaaccaccaaaaagtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgattcgtatggttttggaaaatcctcatgttgcgatcttt 42462571  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
     || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  42462572 tcaaataacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaacctttcatataattctttgaaaagcctccaagagcacaaaactgattagcatgtgtatat 42462671  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42462672 aaattgccatgaaacatcgtaacaaaaccaagtcaatttgatatcaaaagccataaccgaccataataatcacattgaaaaaacaaatgatctctttcct 42462771  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42462772 cctccttatcatacaaggtcgcacaagatgcatttgtagcctgaaggacattcctcttgcgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaagaaacg 42462871  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42462872 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggagccgttttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtaatgttgatgtcca 42462951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17154289 - 17153806
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17154289 cgaacaatacgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaaaaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 17154190  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  17154189 gttgcaatctttccatatagtaaataagactgaaatccaaataatagtaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcgcaaaactgattt 17154090  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||||||| |||  |  |||||||||||||| | ||||| | | | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17154089 gcatgtgaatataaattgtcattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccaatagcataagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaat 17153990  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17153989 gatccctttcctcctctttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctatt 17153890  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17153889 cataaagagccgccaaataaaaatattaacttttaatggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcattgatatt 17153806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 3514432 - 3514904
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514432 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 3514531  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||     
T  3514532 ctttccaaatagtatataagaccgagatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaacctcctagagcgcaaaactgattagcatgagt 3514631  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  3514632 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatcggatagcataagccataagcgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccctt 3514731  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||   |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514732 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattgatagcctcaagaacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 3514831  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3514832 accgccaaacaaaaatattaacttttaagggtaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 3514904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Original strand, 8595014 - 8595488
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| | || | | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |    
T  8595014 gctttcatccaccaaaaggtttgaagtttaaccttttcaagaagagcttcaagataacccatatggttttggaaaatcttcatattgcgatctttccaaa 8595113  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || | |||||| | || ||||||    
T  8595114 taacaaataaaaccgaaatccaaacaatagacaaagctttcgtagaactctttgaaaaacatccaagggcacaaaattggttagcatgggtatgtaaatt 8595213  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8595214 gacatgaaacaccgtaacaaaaccaagcgaatttgatatcaagagccataaacgaccataataatcacattgaaaaaacaaatggtccctttcctcctcc 8595313  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8595314 ttagcacacaaggccgcacaagaagcatctgtagcctgaaggatattcctcttacgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 8595413  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8595414 caaaaatgttaacttttaaaggaaccgctttaagccatagaaattgatcaaactctgcaatgatattgatgtcca 8595488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Original strand, 48547306 - 48547785
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48547306 agtttgctttcaaccaccaataagtttgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcgagatgttcaatttggttctgaaaaatcctcctgttgcgatcttt 48547405  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |    
T  48547406 ccaaataacaaataagaccgaaatccatataatagtaaaagttgtcctagacttctttgagaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgtgaaatt 48547505  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  48547506 aaattgccttgagacaccgtaacaataccaaaccaattcgatatcaagagccataatcgaccataatgatcacattgaaaaaacaaatggtccctttcct 48547605  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48547606 cctccttaccacacaaggccgcgcaagaaacattggaaacctcaaggacgttcctcttgcgcaggttgtcctttgttgcaagtctattcagaaagagacg 48547705  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  48547706 ccagacaaaaatattaacctttaatggaactgctttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttgaagtcca 48547785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 53152567 - 53152132
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53152567 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagaagaacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 53152468  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  53152467 gttacgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagcttgcacagaatgctttgagaatcctccaagtgcacaaaactgatta 53152368  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||||||| |||  |  |||||||||| ||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53152367 gcatgtgaatataaattgtcattgagaaccgtaacaatacctaaccaatccgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaaaaacaaat 53152268  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  53152267 gatctctttcctcctccttgccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 53152168  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaa 444  Q
    | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  53152167 ctgaaagagcctccaaacaaaaatattaacttttaa 53152132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 9818808 - 9819280
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9818808 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagagcactttggttttgaaaaatcctcctgttgcgat 9818907  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||     
T  9818908 cttcccatatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagctttcataaaattctttgagaaaccacctaaagcgcaaaactgattagcatgaga 9819007  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  ||| |||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||   |     
T  9819008 atataaattgccattgagaaccataacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataaacgaccataaaagtcgcattggaaaaacaaatgatccttg 9819107  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9819108 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaaggacattcctcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaaa 9819207  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9819208 gccgccaaacataaatattgacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 9819280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 42459761 - 42459294
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | | |||| |||| | |||| |||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42459761 agtttgctttcaaccaccaatacgtttgaagtttaacccttaccataagagcttcaagatgatcaaaatgattttg-aaaattctcctgttgcgatcttt 42459663  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||  || | || || ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| || |    
T  42459662 ccatataacatataagaccgaaatccaaataatagtaaacgctaacatataactccttgagaagccaccgagagcacaaaactgattagcatgagaatgt 42459563  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||||   |||||||||||||| ||||| | |           
T  42459562 aaattaccatgtaaaaccgtaacaataccaagccactgcgataccaagagccataaccgtccataatggtcacattgaaaaaataaatggtct------- 42459470  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaaga-agtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagac 419  Q
        |||||||||||||| ||||||||| | | | | |||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42459469 ----cttaccacacaaggtcgcacaagatactttgt-tagcctcaaggacattccttttgtgcaagttgtcctttgtagcaattctattcagaaaaagac 42459375  T
Q  420 gccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  42459374 gtcaaacaaaaatgttaacctttaacggaacctccttaagccataagaattggttaaaatcttcagtgatgttgttgtcca 42459294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 32945631 - 32945786
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32945631 cgaacaatatgtagttaactttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 32945730  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctt 164  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32945731 gttacgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagctt 32945786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 30737247 - 30737495
Alignment:
Q  28 tttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccatata 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30737247 tttcaaccaccaatacgtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgatcaatgtgattttggaaaattctcctcttgcgatcttttcatata 30737346  T
Q  128 gtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgc 227  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | || ||||| ||    
T  30737347 acaaataagaccgaaatccatataatagtaaaagttgtcctagagttctttgagaaacctccaagagtacaaaactgattcgcatgtgtatgtaaatcgc 30737446  T
Q  228 catgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataa 276  Q
    |||| || | |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  30737447 catgtaaaatcgtaacaatactaagccaatgcgagatcaagagccataa 30737495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 8542253 - 8542381
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8542253 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgttcgaagtttaaccctttcaagaagagcttccagatgatcaatttggttttggaaaatcctcctgttacgat 8542352  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8542353 ctttcaatatagtaaataagaccaaaatc 8542381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 473
Target Start/End: Original strand, 16663724 - 16664180
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| ||| ||| || || ||||| || ||||| | ||    
T  16663724 atgtaattcgctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcaaattgattctgaaaaattcttctgtttctat 16663823  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| ||    ||||| || |||||||| ||||  | |||  || ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||     
T  16663824 ctttccaaatgacgaataaaactgaaatccagataactgtaaaacctgtcctagacatttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagtagcatgaga 16663923  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
     |||||||| ||||  |     ||||||| | ||||||| |  ||||  || ||||| | | | ||||||  |||||| | ||||||||||||||  |||    
T  16663924 gtataaattaccattcagagttgtaacaataacaagccactgagaaattaaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacaaatgatccctt 16664023  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||| |||||||||||||| | | | ||||  |||   || |  | ||  ||||| || ||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16664024 tcctcttccttaccacacaaagtcacgcaagccgtaagagtgggatcaattacatttcttttgcgcaaattatcttttgtagcaagtctattcagaaaga 16664123  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16664124 gacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataaaaattgat 16664180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 9246777 - 9246901
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9246777 atgtaattagctttcaaccaccaatatgtttgaagtttgactctttcaagtagaacctccaaaagaacactttggttttggaatatcctcctgttgtgat 9246876  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccga 141  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||    
T  9246877 ctttctaaatagtatataagaccga 9246901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 39633306 - 39632858
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |||  || |  || ||||| || ||||| | ||    
T  39633306 atgtaattcgctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagtagagcttcaagatgatcaaagtgatgctgaaaaattctgctgtttctat 39633207  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| ||    ||||| |  |||||||||||||||| |||  || ||  ||| || || || ||||| |||||||||||||| | |  |||||| |     
T  39633206 ctttccaaatgacgaataaaattgaaatccaaataatagtaaaacctgtcctagagtttttcgaaaaacccccaagagcacaaaattaagaagcatgtga 39633107  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    || |||||| ||||  ||    ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| | | ||||||||   ||||| |||||||||| |||||  |||    
T  39633106 atgtaaattaccattcaaagttgtaacaataccaagccaatgagaaatcaagagccaaagtcgaccataatggtcacaatgaaaaaacagatgatccctt 39633007  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||| ||||   ||   || |  | || |||||| || ||  | |  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  39633006 tcctcttccttaccacacgaagtcgcgcaagccataagagtggagtcaatgacatttcttttatgcaaattatcttttgtagcaagtctattcagaaaga 39632907  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataa 465  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  39632906 gacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataa 39632858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 334
Target Start/End: Original strand, 10753802 - 10754128
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| |  || ||||| || |    
T  10753802 tcgaacaagatgtaattcgctttcaaccaccaaaacgtctggagtttaaccctttcaagaagaacttcaagctgatcaaattgttgctgaaaaattcttc 10753901  T
Q  108 tgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatg 207  Q
    |||| | ||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||       
T  10753902 tgtttctatccttccatatgacaaataaaaccgaaatccaaataatagtaaaacctgtcacagattttttcgaaaaacctccaagagcgcaaaattggga 10754001  T
Q  208 agcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaa 307  Q
    |||||| | || |||||| ||||  ||    |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||| |   ||||||||  ||||||  ||||||||| |    
T  10754002 agcatgtgaatgtaaattaccattcaaagtggtaacaaatccaagccactgtgaaatcaaaagccaaagacgaccataatgatcacaaagaaaaaacaga 10754101  T
Q  308 tgatatctttcctcctccttaccacac 334  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  10754102 tgatccctttcctcttccttaccacac 10754128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Original strand, 52196409 - 52196490
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52196409 tttgtagcaagtctattcagaaagaggcgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaaccgctttcaaccataaaaattgat 52196490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 456
Target Start/End: Original strand, 10754186 - 10754250
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgcttt 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  10754186 tttgtagcaagtctattcataaagagacgccaaacaaagatgttaaccttcaacggaaccgcttt 10754250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 44879735 - 44879790
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttca 64  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44879735 cgaacaatatgtagttagttttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttca 44879790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 52196035 - 52196248
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| ||   || || || ||||| || ||||| | ||    
T  52196035 atgtaatttgctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcagagtgattctgaaaaattcttctgtttctat 52196134  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| ||    ||||| || |||||||| ||||  | |||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||     
T  52196135 ctttccaaatgacgaataaaacagaaatccagataactgtaaatcctgtcctagacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagtagcatgaga 52196234  T
Q  217 atataaattgccat 230  Q
     |||||||| ||||    
T  52196235 gtataaattaccat 52196248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 28393365 - 28393405
Alignment:
Q  116 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataataga 156  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393365 tctttccagataacaaataagaccgaaatccaaataataga 28393405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 58866 - 58387
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58866 agtttgctttcaaccaccaatatgtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgatccatatggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 58767  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  58766 ccatataacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctatcatagcgttctttgagaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgtgtattt 58667  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  58666 aaattgtcgtgaaacaccgtaacaaaaccaagccaatttgatatcaagagccataaccgaccataattgtcacattgaaaaaacaaacggtccctttcct 58567  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58566 cctccttaccacacaaggccgcacaagaaatattggtagcctcaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 58467  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  58466 ccaaacaaaaatgttaacctttaagggaaccgctttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttgatgtcca 58387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Original strand, 23384583 - 23385066
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23384583 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacatttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 23384682  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  23384683 gttgtgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagtacaaaactgattt 23384782  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||   ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  23384783 gcatgtgaatataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaattcgatagcataagccataaccaaccataataatcacattggaagaacaaat 23384882  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  23384883 gatcactttcctcctctttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcatgtctatt 23384982  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23384983 cagaaagagccgccaaacaaaaatattaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 23385066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 481
Target Start/End: Original strand, 38938224 - 38938684
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||  | || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38938224 agtttgctttcaaccgccaaaaagtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatggtccatatggttttggaaaatcatcatgttgcgatcttt 38938323  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  38938324 ccaaataacaaataagacagaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgaaaagcctctaagagcacaaaaatgattagcatgtgtatat 38938423  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  38938424 aaattgccattaaacaccataacaaaaccaagccaattcgatatcaagagtcataatcgaccataataatcacattgaaaaaataaatggtccctttcct 38938523  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38938524 cctccttaccacataaggccgcacaagaagcatatgtagcctgaaagacattcctcttgcgaagattgtcctttgtagtaagtctattcagaaagagacg 38938623  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactct 481  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38938624 ccaaacaaaaatgttaatttttaagggaaccgctttaagccataaaaactgatcaaactct 38938684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 488
Target Start/End: Original strand, 21963148 - 21963627
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21963148 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaaggacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 21963247  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  21963248 gttgcgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagcttgcacaaaatgctttgagaaaccgccaagtgcacaaaactgatta 21963347  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| | |||||  || | ||  ||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21963348 gcatgtgaatataaattgccattaagaaccgtcacaaaacctaaccaatctgatagcataagccataacctaccataataatcacatcgaaaaaacaaat 21963447  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  21963448 gatccttttcctcctccttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 21963547  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 488  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21963548 cagaaagagcctccaaacaaaaatattaacttttaaagggaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 21963627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 32349622 - 32350097
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32349622 atgtagttaactttcaactaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagtagcaccttcaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 32349721  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||     
T  32349722 ctttccatatagtgtataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaacctcctagagcgcaaaactgattagcatgagt 32349821  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||||| || | ||||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  32349822 atataaattgccattgagaaccgtaacaaatcctaaccaatccgatagcataagccataatcgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccctt 32349921  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32349922 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaagaacattcctcttgcgaagaatatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 32350021  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    | | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32350022 gccacgaaacaaaaatattaacttttaagggaatcgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgatatt 32350097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27915083 - 27914653
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27915083 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaactttcaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 27914984  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  27914983 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactggttt 27914884  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27914883 gcatgtgaatataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatctgatatcataagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaat 27914784  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |  ||  || || ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27914783 gatccctttcctcctccttaccacatatagcaccataaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctatt 27914684  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaact 439  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  27914683 cagaaagaaccgtcaaacaaaaatattaact 27914653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Original strand, 30275703 - 30276109
Alignment:
Q  82 aacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgag 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30275703 aacaatttggttttggaaaattctcctgttgcgatcttttcatatagtatataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgag 30275802  T
Q  182 aaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgac 281  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  || |||||| |||    
T  30275803 aaacctcta-gagcgcaaaactgattagcatgagtatataaattgccgttgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgataacataagtcataatcgac 30275901  T
Q  282 cataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcg 381  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30275902 cataataatcacattggaaaaacaaatgatctctttcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaagaacattcctcttgcg 30276001  T
Q  382 aaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactct 481  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30276002 aagattatcctttgtagcgagtctattcagaaagagcctccaaacaaaaatattaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatct 30276101  T
Q  482 gcagtgat 489  Q
    ||||||||    
T  30276102 gcagtgat 30276109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 488
Target Start/End: Original strand, 21964639 - 21964812
Alignment:
Q  315 tttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaa 414  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21964639 tttcctcctccttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgattcagaaa 21964738  T
Q  415 gagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 488  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21964739 gagcctccaaacaaaaatattaacttttaaagggaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 21964812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Original strand, 22298660 - 22298911
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |||  || ||||| ||||| |||||||| | ||    
T  22298660 atgtaattcgctttcaaccaccaatacgtttggagtttaaccctttcaaggagagcttcaagatgatcaaagtgattttgaaaaattctcctgtttcaat 22298759  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||| |||||    ||||  |||||||||||||| | || |||  || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |     
T  22298760 cttttcatatgacgaatataaccgaaatccaaatgacagtaaagcctgtcctagagttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgggtagcatgtga 22298859  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaag 268  Q
     | |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  22298860 gtgtaaattaccatgtaaaaccgtaacaataccaagccaatgtgaaaccaag 22298911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Original strand, 1258584 - 1258665
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1258584 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgcaaaacaaatatgttaaccttcaacggaaccgcttttaaccataaaaattgat 1258665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33937249 - 33937067
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |||  || || || ||||| |||||||| | ||    
T  33937249 atgtaattcgctttcaaccaccaatacgtttggagtttaaccctttcaaggagagcttcaagatgatcaaagtgattctgaaaaattctcctgtttctat 33937150  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaa 201  Q
    ||||||| ||    ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||  ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33937149 ctttccaaatgacgaataaaaccgaaatccaaataacagtaaatcctgtcgtag--ttttttgaaaaacctccaagagcacaaaa 33937067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 20007345 - 20007462
Alignment:
Q  116 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgag 215  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||  | |||||    
T  20007345 tctttccagataacaaataagaccgaaatccaaataatagagaatgttatccttgaattttttgagaaccctccaagaacacaaaattgatttgaatgag 20007444  T
Q  216 gatataaattgccatgaa 233  Q
     |||||| | ||||||||    
T  20007445 catataagtcgccatgaa 20007462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 472
Target Start/End: Original strand, 22300858 - 22300966
Alignment:
Q  364 aaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccat 463  Q
    ||||||||| || ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||| |||| | ||||    
T  22300858 aaggacatttcttttgcgcaaattatcctttgtagcaggtctattcagaaagagacgtcttacaaatatgttaaccttcaacggaaccacttttaaccat 22300957  T
Q  464 aaaaattga 472  Q
    |||||||||    
T  22300958 aaaaattga 22300966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 30274477 - 30274532
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  30274477 atgtagttagctttcaaccaccaaaatgtttgaagtttgactctttcaagtagaac 30274532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 1258208 - 1258393
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttg-gaaaatcctcctgttgcga 115  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||| | |||| |||  || || ||  ||||| |||||||| | |    
T  1258208 atgtaattcgctttcaaccaccaatacatttggagtttaaccctttcaaagagagcttcaagatgatcaaagtgattatgaaaaaattctcctgtttcta 1258307  T
Q  116 tctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaa 201  Q
    |||||||| ||    ||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1258308 tctttccaaatgaagaataaaaccgaaatccaaataacagtaaatcttgtcctagagttttttgaaaaacctccaagagcacaaaa 1258393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43409058 - 43409013
Alignment:
Q  170 gaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgag 215  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43409058 gaattcttggaaaaacctccaagaccacaaaactgatgagaatgag 43409013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5825451 - 5824972
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5825451 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaaggacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 5825352  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  5825351 gttgcgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagcttgcacataatgctttgagaaaccgccaagtgcacaaaactgatta 5825252  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5825251 gcatgtgaatataaattgccattaagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatagcataagccataacctaccataataatcacatcgaaaaaacaaat 5825152  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  5825151 gatccctttcctcctccttaccacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 5825052  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 488  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5825051 cagaaagagcctccaaacaaaaatattaacttttaaagggaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtga 5824972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Original strand, 11265782 - 11266256
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| | |  || |  || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11265782 gctttcaaccaccaataagtttgaagtttaaccctttcaaggagagcttcaagatgatccaaatgatgctgaaaaatcctcctgttacgatctttccaaa 11265881  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||    
T  11265882 taacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatagacttccttgagaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgtgttgttaaatt 11265981  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
     || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11265982 tccgtgtagcaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaatcaagagccataaccgaccataatagtcacattgaaaaaacaaatggtccctttcctcctcc 11266081  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11266082 ttaccacacaaggccgcgcaagaaacattagtagcctcaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 11266181  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11266182 caaaaatattaacttttaaaggaaccgctttaagccataaaaattgaccaaactctgcagtgatgttgttgtcca 11266256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6679058 - 6678577
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6679058 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagaagaacttccagatgaacaatttggttttgaaaaatcctcct 6678959  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  6678958 gttacgatctttccaaatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagcttgcacagagtgctttgagactcctccaagtgcacaaaactgatta 6678859  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | ||| |||||| |||  |  |||||||||| ||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6678858 gcatgtgaataaaaattgtcattgagaaccgtaacaatacctaaccaatccgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaaaaacaaat 6678759  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctatt 408  Q
    |||  |||||||||||||||||| | || ||  ||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  6678758 gatcactttcctcctccttaccatataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtcgatt 6678659  T
Q  409 cagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 492  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6678658 cagaaagagcctccaaacaaaaatatt--cttctaaaggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatatt 6678577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 494
Target Start/End: Original strand, 27891450 - 27891923
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||  | |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27891450 agtttgctttcaaccaccaataagtttgaagtttaaccctttcaaaaagagctttgagatgttcaatttggttctgaaaaatcctcctgttgcgatcttt 27891549  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| | | ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  27891550 ccaaataacaaataagacctaaatccatataatagtaaaagatgtcctagacttctttgagaaccctccaagagcacaaaactgattagcatgtgaaaat 27891649  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27891650 atattgccatgaaacaccgtaacaataccaaaccaattcgatatcaagagccataatcgaccataatgatcacattgaaaaaacaaatggtccctttcct 27891749  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||  | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27891750 cctccttaccacacaaggccgcgcaagacacattggaaacctgaaggacgttcctcttgcgcaggttgtcctttgttgcaagtctattcagaaagagatg 27891849  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattga 494  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27891850 ccagacaaaaatattaacctttaatggaaccgctttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttga 27891923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10462619 - 10462244
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10462619 cgaacaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttaaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 10462520  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  10462519 attgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagtaaatgctttcacagaattctttgagaaacctccaagagcacaaatctggttt 10462420  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10462419 gcatgtgaatataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgatatcataagccataaccgaccataataatcacattggaaaaacaaat 10462320  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaag 384  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| || ||  ||||| ||  ||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10462319 gatccctttcctcctccttactacataaagcaccacaaaaaacattggtagcctcgaggacattcctcttgcgaag 10462244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 469
Target Start/End: Original strand, 29150057 - 29150504
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | |||| |||  || |||||||||||  | || || ||||||||    
T  29150057 agtttgctttcaaccacgaatacgtttgaagtttaaccctttcaataagagcttcaagatgatcaaagtgattttggaaaatttttctctttcgatcttt 29150156  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  | |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||| || |    
T  29150157 ccatataacatataagatcaaaatccaaataatagtaaacgctatcgtagaactctttgagaagctaccgagagcacaaaactgattagcatgagtattt 29150256  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||  || ||||  || | ||||||||||||  | ||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  29150257 aaattgtcatgtaaaaccgtaacaatacagagtcaatgtgatatcaagagccataaccggccataatggtcacattgaaaaaataaatggtctctttcct 29150356  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||   ||   ||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  29150357 cgtccttaccacagaaggccgcacaagatacattgttagcct-caggacattccttttgcgcaagttgtcctttgtagcaagtctattcaggaaaagaca 29150455  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaat 469  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29150456 ccaaacaaaaatattaacctttaacggaaccgccttaagccataaaaat 29150504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31963146 - 31962686
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||| || |  || ||||| |||||||| || |    
T  31963146 atgtaattcgctttcaaccaccaatacgtttggattttaaccctttcaagaagagcttctagatgatcaatgtgatgctgaaaaattctcctgtttcggt 31963047  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| ||   |||||  ||||||||| ||||||||| |||  || ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  31963046 ctttccaaatgacaaatagtaccgaaatcgaaataatagtaaaacctgtcctagagttctttgagaaacctccaagaccacaaaattgattagcatgaga 31962947  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    || |||||| ||||| |  | |||||||| ||||||||| |  || | ||| ||||| |   | ||||||  |||||| |||||||||||||| |  ||     
T  31962946 atgtaaattaccatgtagaatcgtaacaataccaagccactgtgagatcaaaagccaaagccgtccataatgatcacaatgaaaaaacaaatggtcccta 31962847  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    |   || |  | ||| ||||||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31962846 tcctcttccttaccacacaaggttgcacatgccacaagggtcggatcaagaacattccttctgcgcaaattatcctttgtagcaagtctattcagataga 31962747  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaa 477  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  31962746 gatgccaaacaaatatgttaacctttaacggaaccacttttagccataaaaattgagcaaa 31962686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 473
Target Start/End: Original strand, 38931508 - 38931973
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||  || || || ||||| ||||    
T  38931508 tcgaacaaaatgtaattcgctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttaaccctttcaagaagagcttcaagatgatcaaagtgattctgaaaaattctcc 38931607  T
Q  108 tgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatg 207  Q
    |||| | ||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||  | |||  || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||       
T  38931608 tgtttctatctttccaaatgatgaataaaaccgaaatccaaataactgtaaaacctgtcctagagttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgggt 38931707  T
Q  208 agcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaa 307  Q
    ||||||||   |||| || ||||  ||    ||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||| | | | ||||||  |||||| | |||||||| |    
T  38931708 agcatgagagcataagttaccattcaaagttgtaacaataccaagccactgagaaatcaaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacaga 38931807  T
Q  308 tgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctat 407  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||   ||   || |  | || |||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||    
T  38931808 cgatccctttcctcttccttaccacacaaagtcgcgcaagccataagagtgggatcaatgacatttcttttacgcaagttatcttttgtagcaagtctat 38931907  T
Q  408 tcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38931908 tcagaaagagatgccaaacaaatatgttaaccttcagcggaaccgctttcaaccataaaaattgat 38931973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Original strand, 29322916 - 29322997
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29322916 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaactgctttcaaccataaaaattgat 29322997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 336
Target Start/End: Original strand, 8895132 - 8895451
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  | |||| | |  || || || ||||| |||||||| | ||    
T  8895132 atgtaattcgctttcaaccactaaaccgtttgaagtttaaccctttcaagaagagctttaagatgatctaagtgattctgaaaaattctcctgtttctat 8895231  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| ||    ||||| || |||||||||||||  | |||  || ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||     
T  8895232 ctttccaaatgacgaataaaactgaaatccaaataactgtaaaacctgtcctagaattttttgagaaacctccaagagcacaaaattgggtagcatgaga 8895331  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
     ||||| || ||||  ||    ||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||| | | | ||||||  |||||| | |||||||| |||||  |||    
T  8895332 gtataagttaccattcaaatttgtaacaataccaagccactgagaaatcaaaagccaaagtcgcccataatgatcacaattaaaaaacatatgatccctt 8895431  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaa 336  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  8895432 tcctcttccttaccacacaa 8895451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Original strand, 8896369 - 8896447
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaatt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||||| | |||||||||||    
T  8896369 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaactatgttaaccttcaacagaaccgctttcaaccataaaaatt 8896447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 29322550 - 29322599
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttc 75  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29322550 gctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttc 29322599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26078200 - 26077728
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26078200 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaagaagaacatccaaaagaacaatatggttatggaaaatcctcctgttgcgat 26078101  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||     
T  26078100 ctttccaaatagtatataagaccgagatccaaataatagaaaaagctttcatagaattctttgagaaccctcctagagcgcaaaactgattagcatgagt 26078001  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| | || ||||| |||||||||||||  |||    
T  26078000 atataaattgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatcggataacataagccataagcgaccataatattcgcattggaaaaacaaatgatccctt 26077901  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26077900 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtagcctcaagaacattccttttgcgaagattgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 26077801  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26077800 gccgccaaacaaaaatattaacttttaagggtaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatctgcagtgat 26077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2960072 - 2959748
Alignment:
Q  9 cgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcct 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2960072 cgaacaatatgtagttcgctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgaccctttcaagaagaacttccatatgaacaatttcgttttgaaaaatcctcct 2959973  T
Q  109 gttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatga 208  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  2959972 gttacgatctttccaaatagaaaataagaccgaaatccaaataatagaaaaagtttacatagaatgctttgagaatcctccaagtgcacaaaactgatta 2959873  T
Q  209 gcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaat 308  Q
    ||||| | |||||| || ||||  | | |||| |||||||| | |||||  || | ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  2959872 gcatgtgaatataagtttccattgagcgccgtgacaaaacctaaccaatctgatagcataagccataaccgaccataataatcacattgaaagaataaat 2959773  T
Q  309 gatatctttcctcctccttaccaca 333  Q
    | | ||| |||||||||||||||||    
T  2959772 ggtctctgtcctcctccttaccaca 2959748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26390706 - 26390260
Alignment:
Q  26 gctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttccata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| | || | |||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26390706 gctttcaaccaccaaaacgtttgaagcttaatcctttcaagaagagcctctagatgatcactgtgattttggaaaattctcctgttgcgatctttccata 26390607  T
Q  126 tagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataaatt 225  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||   ||  || ||    
T  26390606 taacaaataagacagaagtccaaataatagtaaaagttgtcctagaattctttgagaaaccaccgagggcacaaaactggttagcatgtatatgcaattt 26390507  T
Q  226 gccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcctcc 325  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| || | | ||||||||  ||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||||    
T  26390506 gccatgtaaaaccgtaacaataccaagtcaatgcgatatcaagag-caaagtcgaccataatgatcgcattgaaagaacaaatggcccctttcgtcctcc 26390408  T
Q  326 ttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaa 425  Q
    |||||||||||||||  | ||||  |||   ||||| |||||||||||||  |||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26390407 ttaccacacaaggccatataagacatattattagccggaaggacattccttatgcttaaattgtccgttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaga 26390308  T
Q  426 caaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  26390307 caaaaatgttaacctttaatggtaccgccgtaagccataaaaattgat 26390260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31423685 - 31423430
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423685 agtttgctttcaaccaccaataagtttgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcgagatgatcaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 31423586  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
     || |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  31423585 tcaaataacaaataagaccgaaatccatataatagtaaaagttgtcctagagttctttgagaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgtgaattt 31423486  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataa 276  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  31423485 aaattgtcgtgaaacaccgtaacaataccaaaccaattcgatatcaagagccataa 31423430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 301 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31423431 - 31423238
Alignment:
Q  301 aaacaaatgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagca 400  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31423431 aaacaaatggtccctttcctcctccttaccacacaaggccgcgcaagaaacattggtaccttcaaggacgttcctcttgcgaaggttgttctttgttgca 31423332  T
Q  401 agtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattga 494  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31423331 agtctattcagaaagagacgtcagacaaaaatattaacctttaagggaaccgctttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttga 31423238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 219 - 473
Target Start/End: Original strand, 29532307 - 29532561
Alignment:
Q  219 ataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttc 318  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||| | | || |||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||    
T  29532307 ataaattgccatgtaaaaccgtaacaatactaagccagtgcgatatcaagagccaaagtcgatcataatgatcgcattgaaagaacaaatgatccctttc 29532406  T
Q  319 ctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagaga 418  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||   ||||  ||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29532407 ctcctccttatcacacaaggccacacaagatatattattagctggaaggacattccttttgcttaaattgtcctttgtagcaagtctattcagaaagaga 29532506  T
Q  419 cgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29532507 cgccagacaaaaatgttaacatttaatggtaccgctttaagccataaaaattgat 29532561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 29529926 - 29530117
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | || | |||| || | || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29529926 agtttgctttcaaccaccaaaatgtttgaagcttaaccctttcaagaagagcatctagatgatcactgtgattttggaaaattcttctgttacgatcttt 29530025  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatg 213  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  29530026 ccatataacaaataagacagaagtccagataataggaaa-gttgtcctagaattctttgagaaacctacaagggcacaaaactgattagcatg 29530117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10801779 - 10801698
Alignment:
Q  392 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  10801779 tttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggaactgctttcaaccataaaaattgat 10801698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 18182108 - 18182166
Alignment:
Q  95 tggaaaatcctcctgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataat 153  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  18182108 tggaaaatcctcttgttacgatctttccaaataacaaataaaaccgaaattcaaataat 18182166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18295870 - 18295398
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18295870 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttgaagtttgactctttcaaatagaacctccaaaagaacaatttggttttggaaaatcctcttgttgcgat 18295771  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||     
T  18295770 ctttccatatagtatataaggccgagatccaaataatagtaaaagctttcatagaattctttgagaaacctcctagagcgcaaaactgattagcattagt 18295671  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
    ||||||||||||||  |  ||| |||||||||| | |||||  || | ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  18295670 atataaattgccattgagaaccataacaaaacctaaccaatctgatagcataagccataatcgaccataataatcgcattggaaaaacaaatgatccctt 18295571  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||  ||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295570 tcctcctccttaccacataaagcaccacaagaaacattggtaacctctagaacattcctcttgcgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaga 18295471  T
Q  417 gacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18295470 gccgccaaacaaaaatattaacttttaagggtaccgctttaagccataaaaattgatcaaaatatgcagtgat 18295398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Original strand, 667016 - 667496
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||| ||||  || |||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  667016 agtttgctttcaaccaccaatatctttgaagtta-acgctttcaagaagagcttcaaaatgatccatatggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 667114  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  667115 ccatataacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctttcatataattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgattagcatgtgtattt 667214  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagag----------ccataa---ttgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaa 307  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||          ||||||   | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  667215 aaattgccgtgaaacaccgtta-aaaaccaagccaatttgatatcaagagtcatagccgaccataatagtcgaccataatagtcacattgaaaaaacaaa 667313  T
Q  308 tgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctat 407  Q
    |  |  |||||||||||||||          |||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  667314 tagtccctttcctcctcctta----------ccgcacaagaaacatttgtagcctcaagtacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctat 667403  T
Q  408 tcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  667404 tcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacctttaagggaaccactttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatgttgatgtcca 667496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28605357 - 28604878
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| |||||||||| |||| |  | || ||||| |||||||||| |||| |||| | |||  || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28605357 agtttgctttcaaccgccaataattctgaagtttaaccctttcaaaaagagcttcaagatgttcattttggttctgaaaaatcctcctgttacgatcttt 28605258  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  28605257 ccaaataacaaataagaccgaaatccaaataatagtaaaagctgtcatagacttcttggagaaccctccaagagcacaaaactgatgagcatgtgaaaat 28605158  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  28605157 agattgccatgaaacacagtaacaataccaaaccaattcgatatcaagagccataaccgaccataatgatcacattggaaaaacaaatggtctctttcct 28605058  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||  | | ||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28605057 cctccttaccacacaaggccgcgcaagacacattggaaacctcaagaacgttcctcttacgcaggttgtcctttgttgcaagtctattcagaaaaagacg 28604958  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgatattgatgtcca 500  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28604957 ccatacaaaaatattaacctttaatgggaccggtttaagccataaaaattgattaaactctgcagtgatattgaagtcca 28604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 489
Target Start/End: Original strand, 2893991 - 2894457
Alignment:
Q  23 ttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatctttcc 122  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2893991 ttagctttcaaacaccaatatgtttggagtttgactctttcaagtagaaactccaaaagagcactttgattttggaaaatcctcctgttgcggtcttttc 2894090  T
Q  123 atatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatataa 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2894091 atatagtatataagaccgaaatccaaatgatagtaaaagcttgcatagaattctttgagaacccacctagagcgcaaaactgatgagcatgagaatataa 2894190  T
Q  223 attgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcctcc 322  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||| | |  ||||| |||||||||||||   | ||||||    
T  2894191 attgccattgagaaccgtaacaaaacctaaccaatccgaaatcataagccataaacgaccataatagttgcattggaaaaacaaatgatccatgtcctcc 2894290  T
Q  323 tccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgcc 422  Q
    || |||||||| || ||  ||||||||  ||  || |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2894291 tcgttaccacataaagcaccacaagaaacattggttgcctcaaggatattcctcttacgaagattatcctttgtagcaagtctattcagaaaaagccgcc 2894390  T
Q  423 aaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2894391 aaacaaaaatattaacttttaagggaaccgctttaagccatagaaattgatcaaaatctgcagtgat 2894457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7218820 - 7218368
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| | |||| |||| | ||||||||  || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  7218820 agtttgctttcaaccaccaatacgcttgaagtttaaccttttccaaaagagcttcaagatgaacaacctgtttttgaaatattctcctattgcgatcttt 7218721  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| |||  |  |||  ||||||| || ||  | | |||||||||||||  |||||||| || |    
T  7218720 ccatataacatataaaaccgaaatccaaatgatagtaaacgctaccgtagacctctttgaaaacccgactaaagcacaaaactgagtagcatgagtatgt 7218621  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttcct 320  Q
    ||  | ||||| ||  |||||| || |||||||||   ||| ||||||||||||||    || |||  ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  7218620 aagctaccatgtaaggccgtaaaaataccaagccaccgcgataccaagagccataaccacccgtaatgatcacattggaaaaataaatggtctctttcct 7218521  T
Q  321 cctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||   |||||| || ||||||||| || || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7218520 cctccttaccacacaaggccgcacaatatacattgttagcctcaaagacattccttttacgcaaattatcctttgtagcaagtctattcagaaaaagacg 7218421  T
Q  421 ccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7218420 ccaaacaaaaatgttaacctttaacggaaccgccttaagccataaaaattgat 7218368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 17227680 - 17228156
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |  | | |||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  17227680 agttcgctttcaaccaccaatacgtttggagtttaacccttttaagaagagctgcaagctaatcaatgtgattttgaaaaattcttttgttgcgatcttt 17227779  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattcttt--------gagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcat 212  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |   ||| || |||        || || |||||||||||| ||||||||| || ||    
T  17227780 ccaaataacaaataacaccgaaatccaaataatagtaaaagctgttctagagttttttttttttttgaaaagcctccaagagcagaaaactgattaggat 17227879  T
Q  213 gaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgata 312  Q
    ||  || ||||| ||  || || || ||||||| |||||||||||  || | ||||| ||| ||  |||| ||    || || |  ||||||||||| |     
T  17227880 gaatatttaaatcgcgctgtaaaactgtaacaataccaagccaatgtgagatcaagaaccacaaccgaccgtagtggtcgcacttgaaaaacaaatggtc 17227979  T
Q  313 tctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcaga 412  Q
     || |||||  ||| ||||||||||||||| ||||    |  || | | | |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17227980 cctgtcctctacctcaccacacaaggccgcgcaagtcacaagtgaaacatcaaggacattccttttgcgcaaattgtcctttgtagcaagtctatttaga 17228079  T
Q  413 aagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgatcaaactctgcagtgat 489  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17228080 aagagacgccagacaaatatgttcacatttaacggaactgctttaagccacaaaaaatgatgaaactcttcagtgat 17228156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9759977 - 9759578
Alignment:
Q  17 atgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||  |||||||| | || | |||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  9759977 atgtaattcgctttcaaccaccaatacatttgaagtttaaccctcccaagaagagcatcaagatgatcaatttgattttgaaatattctcctgttacgat 9759878  T
Q  117 ctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgagg 216  Q
    ||||||| |||  ||||||   ||||||||| |||  || |||  |  ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| ||    
T  9759877 ctttccaaataacaaataatgtcgaaatccatatagcagtaaagcccgtcctagagttctttgagaaacctccaagaggacaaaattggttagcatgtgg 9759778  T
Q  217 atataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctt 316  Q
     | |||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||  || | ||||||||| |   | || ||    || ||||||||||||| ||| |  |||    
T  9759777 gtgtaaattaccatgtaaaaccgtgacgataccaaaccaatgagagatcaagagccaaagccgcccgtagtggtcgcattgaaaaaacagatggtccctt 9759678  T
Q  317 tcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaaga 416  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||| |   |   || |||| || ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9759677 tcatcctccttaccacgcaaagccgcacaatacacaaaagtggcctcaaagacattccttttgcgcagattatcctttgtagcaagtctattcggaaaga 9759578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14223639 - 14223505
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| | |||| |||||| |||| |||  || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  14223639 agtttgcttttaaccaccaatacgtttgaagtttaaccgtttccataagagcttccagatgatcaaagtgatttcggaaaattctcttgttgcgatcatt 14223540  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatag 155  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  14223539 ccatataacatataagaccaaaatccaaataatag 14223505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5392000 - 5391535
Alignment:
Q  8 tcgaagaatatgtagttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcc 107  Q
    ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||| ||   || || || ||||| ||||    
T  5392000 tcgaacaaaatgtaattcgctttcagccaccaaaacgtttgaagtttaatcctttcaagaagagcttcaagatgatcagagtgattctgaaaaattctcc 5391901  T
Q  108 tgttgcgatctttccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatg 207  Q
    |||| | ||||||||| ||    ||||| || |||||||| ||||  | |||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||      
T  5391900 tgtttctatctttccaaatgacgaataaaacagaaatccatataactgtaaatcctgtcctagacttttttgagaaacctccaagagcacaaaattgagt 5391801  T
Q  208 agcatgaggatataaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaagccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaa 307  Q
    ||||||||  |||||||| ||||  ||    ||||| | ||||||||| |  ||||  || ||||| |   | ||||||  |||||| | |||||||||     
T  5391800 agcatgagagtataaattaccattcaaagttgtaactataccaagccactgagaaattaaaagccaaagacgcccataatgatcacaattaaaaaacaag 5391701  T
Q  308 tgatatctttcctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctat 407  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||   ||   || |  |  |  ||||| || || || |  || || ||||| ||||||||||    
T  5391700 tgatacctttcctcttccttaccacacaaagtcacgcaagccataagagtgggatctattacatttcttttacgcaaattatcttttgttgcaagtctat 5391601  T
Q  408 tcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  5391600 tcagaaataagcgccaaacaaaaatgttaaccttcaacggagccgctttcaaccataaaaattgat 5391535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 225194 - 224744
Alignment:
Q  21 agttagctttcaaccaccaaaacgtttggagtttgaccctttcaagaagaacttccaaatgaacaatttggttttggaaaatcctcctgttgcgatcttt 120  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| | |||| |||| | ||||||||  || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  225194 agtttgctttcaatcaccaatacgtttgaagtttaaccttttccaaaagagcttcaagatgaacaacctgcttttgaaatattctcctattgcgatcttt 225095  T
Q  121 ccatatagtaaataagaccgaaatccaaataatagaaaatgctttcaaagaattctttgagaaacctccaagagcacaaaactgatgagcatgaggatat 220  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||  |  |||  ||||||| || ||  | | ||||||||| |||  |||||||| || |    
T  225094 ccatataacaaataaaaccgaaatccaaatgatagtaaacgctaccgtagacctctttgaaaacccgactaaagcacaaaattgagtagcatgagtatgt 224995  T
Q  221 aaattgccatgaaacaccgtaacaaaaccaa--gccaattcgaaaccaagagccataattgaccataaaaatcacattgaaaaaacaaatgatatctttc 318  Q
    || || ||||| ||  ||| | ||| |  ||  |||    ||| ||||||||||||||    ||||||  ||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  224994 aagttaccatgtaaggccgca-caatataaatggccg---cgataccaagagccataaccacccataatgatcacattggaaaaataaatggtctctttc 224899  T
Q  319 ctcctccttaccacacaaggccgcacaagaagtatctgtagcctgaaggacattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagaga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||   |||||| |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  224898 ctcctccttaccacacaaggccgcacaatatacattgttagcctcaaggacattccttttacgcaaattgtcctttgtagcaagtctattcagaaaaaga 224799  T
Q  419 cgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaaattgat 473  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  224798 cgccaaacaaaaatgttaacctttaacggaaccgccttaagccataaaaattgat 224744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Original strand, 11164 - 11269
Alignment:
Q  368 acattcctcttgcgaaggttgtcctttgtagcaagtctattcagaaagagacgccaaacaaaaatgttaacttttaagggaaccgctttaagccataaaa 467  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||    
T  11164 acatttctcttccgcagattatcctttgtagaaagtctattcaggaagagacatcatacaaatatattaacctttaacggaacctctttgtgccacaaaa 11263  T
Q  468 attgat 473  Q
    | ||||    
T  11264 aatgat 11269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University