View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7933_high_13 (Length: 244)

Name: NF7933_high_13
Description: NF7933
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7933_high_13
NF7933_high_13
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (20-244)||(28754822-28755046)
chr3 (20-244)||(47124448-47124672)
chr3 (20-244)||(10384472-10384696)
chr3 (20-244)||(16329061-16329285)
chr3 (20-241)||(11960570-11960791)
chr3 (23-241)||(16337916-16338134)
chr3 (23-239)||(13319906-13320122)
chr3 (22-241)||(14574430-14574649)
chr3 (22-241)||(16827606-16827825)
chr3 (20-241)||(18133747-18133968)
chr3 (22-206)||(17493172-17493356)
chr3 (20-241)||(31694587-31694808)
chr3 (22-239)||(4678947-4679164)
chr3 (20-241)||(11303174-11303395)
chr3 (20-241)||(31939410-31939631)
chr3 (22-239)||(41178031-41178248)
chr3 (22-233)||(16380331-16380542)
chr3 (22-239)||(13942533-13942750)
chr3 (26-239)||(44777756-44777969)
chr3 (23-239)||(8758486-8758702)
chr3 (22-241)||(15228156-15228375)
chr3 (25-239)||(10906709-10906923)
chr3 (25-239)||(13253189-13253403)
chr3 (22-196)||(14580356-14580530)
chr3 (25-239)||(15401934-15402148)
chr3 (20-241)||(10419446-10419667)
chr3 (27-239)||(15339768-15339980)
chr3 (22-233)||(16835913-16836124)
chr3 (25-239)||(5424347-5424561)
chr3 (25-239)||(20061471-20061685)
chr3 (25-239)||(26791816-26792030)
chr3 (20-241)||(13971521-13971742)
chr3 (20-241)||(14087180-14087401)
chr3 (23-163)||(13299926-13300066)
chr3 (23-163)||(13310584-13310724)
chr3 (82-241)||(12360005-12360164)
chr3 (25-239)||(10006099-10006313)
chr3 (22-244)||(15248641-15248863)
chr3 (25-239)||(15588809-15589023)
chr3 (25-239)||(15724351-15724565)
chr3 (25-239)||(16636272-16636486)
chr3 (25-239)||(43163596-43163810)
chr3 (40-239)||(14875930-14876129)
chr3 (25-239)||(16411699-16411913)
chr3 (25-227)||(48425958-48426160)
chr3 (44-239)||(15347681-15347876)
chr3 (98-244)||(15209385-15209531)
chr3 (25-236)||(53384435-53384646)
chr3 (25-239)||(6601235-6601449)
chr3 (40-239)||(16756017-16756216)
chr3 (42-244)||(17490344-17490546)
chr3 (34-207)||(12498779-12498952)
chr3 (93-239)||(16806411-16806557)
chr3 (74-207)||(15062275-15062408)
chr3 (74-227)||(16371924-16372076)
chr3 (22-196)||(15015170-15015344)
chr3 (130-240)||(30138314-30138424)
chr3 (130-240)||(30147865-30147975)
chr3 (107-244)||(9523213-9523350)
chr3 (20-77)||(12359928-12359985)
chr3 (22-111)||(15234154-15234243)
chr3 (136-244)||(16491709-16491817)
chr3 (107-239)||(16692663-16692795)
chr3 (130-240)||(13966862-13966972)
chr3 (130-231)||(8273921-8274022)
chr3 (107-207)||(14126093-14126193)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (20-244)||(41509-41733)
scaffold0010 (20-241)||(46575-46796)
scaffold0010 (22-244)||(2820-3042)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (20-244)||(14566083-14566307)
chr8 (20-240)||(803289-803509)
chr8 (20-244)||(6604599-6604823)
chr8 (20-244)||(6680052-6680276)
chr8 (26-244)||(16270846-16271064)
chr8 (20-241)||(29303042-29303263)
chr8 (20-244)||(27355489-27355712)
chr8 (20-244)||(12305699-12305923)
chr8 (20-241)||(23655871-23656092)
chr8 (20-241)||(1267182-1267403)
chr8 (26-239)||(19852357-19852570)
chr8 (26-239)||(19858393-19858606)
chr8 (20-233)||(31416090-31416303)
chr8 (26-241)||(20009542-20009756)
chr8 (26-241)||(21841361-21841576)
chr8 (20-241)||(20975267-20975488)
chr8 (20-241)||(22051807-22052028)
chr8 (22-239)||(31570460-31570677)
chr8 (22-244)||(20389040-20389262)
chr8 (20-244)||(20395748-20395972)
chr8 (26-241)||(22371884-22372099)
chr8 (26-204)||(20985169-20985347)
chr8 (25-239)||(22128579-22128793)
chr8 (75-244)||(23949860-23950029)
chr8 (40-239)||(19483700-19483899)
chr8 (22-244)||(22248035-22248257)
chr8 (22-244)||(22377072-22377294)
chr8 (22-244)||(22383247-22383469)
chr8 (25-239)||(19113636-19113850)
chr8 (22-244)||(22988137-22988359)
chr8 (44-239)||(17673663-17673858)
chr8 (25-227)||(18857535-18857737)
chr8 (34-239)||(30312774-30312979)
chr8 (40-244)||(21921372-21921576)
chr8 (25-207)||(22119795-22119977)
chr8 (27-244)||(21393488-21393705)
chr8 (27-244)||(21787982-21788199)
chr8 (56-240)||(19978912-19979096)
chr8 (40-240)||(21166174-21166374)
chr8 (89-244)||(23650982-23651137)
chr8 (93-227)||(22132730-22132864)
chr8 (98-239)||(22040805-22040946)
chr8 (34-174)||(16407675-16407815)
chr8 (25-240)||(21043390-21043605)
chr8 (130-240)||(21196228-21196338)
chr8 (25-244)||(21251882-21252104)
chr8 (156-239)||(12274441-12274524)
chr8 (130-200)||(22316176-22316246)
chr8 (136-177)||(22623596-22623637)
chr8 (34-176)||(15534392-15534534)
chr8 (130-240)||(21850063-21850173)
chr8 (34-236)||(32601093-32601295)
chr8 (130-231)||(16876821-16876922)
chr8 (128-181)||(23156736-23156789)
chr8 (122-195)||(25283346-25283419)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (20-244)||(49153166-49153390)
chr7 (20-244)||(11305423-11305647)
chr7 (20-242)||(26117765-26117987)
chr7 (20-244)||(13967828-13968052)
chr7 (20-241)||(13022225-13022446)
chr7 (20-241)||(12457508-12457729)
chr7 (82-244)||(8211350-8211512)
chr7 (22-241)||(15101765-15101984)
chr7 (20-227)||(14285536-14285743)
chr7 (26-241)||(19148079-19148294)
chr7 (26-241)||(20747478-20747693)
chr7 (20-233)||(567-780)
chr7 (20-233)||(12456578-12456791)
chr7 (19-241)||(13666405-13666627)
chr7 (22-241)||(14263406-14263625)
chr7 (22-233)||(14434567-14434778)
chr7 (23-241)||(15341299-15341517)
chr7 (22-239)||(23505032-23505249)
chr7 (20-233)||(16949632-16949844)
chr7 (22-239)||(18053115-18053332)
chr7 (22-244)||(11771425-11771647)
chr7 (20-241)||(11387588-11387809)
chr7 (20-241)||(19613543-19613764)
chr7 (22-241)||(12205962-12206181)
chr7 (26-241)||(16071461-16071675)
chr7 (25-239)||(8708474-8708688)
chr7 (22-244)||(15204483-15204705)
chr7 (25-227)||(11236400-11236602)
chr7 (25-239)||(44790538-44790752)
chr7 (40-244)||(15625416-15625620)
chr7 (25-239)||(8199497-8199711)
chr7 (25-239)||(10871864-10872078)
chr7 (25-239)||(11552289-11552503)
chr7 (22-244)||(14040559-14040781)
chr7 (22-244)||(14350589-14350811)
chr7 (22-244)||(15153841-15154063)
chr7 (44-236)||(13686936-13687128)
chr7 (27-239)||(12688370-12688581)
chr7 (44-236)||(15160263-15160455)
chr7 (44-239)||(18550964-18551159)
chr7 (40-239)||(23202815-23203014)
chr7 (40-239)||(23508942-23509141)
chr7 (26-239)||(14333266-14333478)
chr7 (40-236)||(18178614-18178810)
chr7 (25-200)||(321224-321399)
chr7 (82-233)||(14130749-14130900)
chr7 (25-207)||(14955459-14955637)
chr7 (40-239)||(9596926-9597125)
chr7 (136-244)||(21662825-21662933)
chr7 (74-239)||(16554-16717)
chr7 (34-207)||(14212575-14212748)
chr7 (130-200)||(13354058-13354128)
chr7 (130-240)||(27107066-27107176)
chr7 (137-200)||(23642354-23642417)
chr7 (130-200)||(4440836-4440906)
chr7 (130-240)||(7824768-7824878)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (20-244)||(14886346-14886570)
chr5 (20-244)||(24797752-24797976)
chr5 (20-240)||(37542736-37542956)
chr5 (20-244)||(20343071-20343295)
chr5 (20-241)||(25848867-25849088)
chr5 (27-233)||(22503479-22503685)
chr5 (20-233)||(23079444-23079657)
chr5 (20-233)||(24619650-24619863)
chr5 (20-233)||(24715881-24716094)
chr5 (20-233)||(24748909-24749122)
chr5 (22-239)||(17268691-17268908)
chr5 (26-241)||(21496865-21497080)
chr5 (23-238)||(21890117-21890332)
chr5 (26-244)||(21831122-21831340)
chr5 (23-241)||(22462744-22462961)
chr5 (20-241)||(20774551-20774772)
chr5 (20-241)||(22235275-22235496)
chr5 (20-241)||(28894297-28894518)
chr5 (20-241)||(28915768-28915989)
chr5 (20-241)||(28923123-28923344)
chr5 (25-239)||(22332247-22332461)
chr5 (25-239)||(40709592-40709806)
chr5 (25-239)||(41771654-41771868)
chr5 (20-241)||(21680133-21680354)
chr5 (26-241)||(20822245-20822460)
chr5 (25-239)||(16357314-16357528)
chr5 (74-244)||(21563382-21563552)
chr5 (26-244)||(26738088-26738306)
chr5 (25-239)||(27519219-27519433)
chr5 (25-239)||(27611166-27611380)
chr5 (25-239)||(34567306-34567520)
chr5 (44-239)||(19770772-19770967)
chr5 (88-239)||(22349235-22349386)
chr5 (25-227)||(29475433-29475635)
chr5 (50-239)||(14999124-14999313)
chr5 (44-239)||(27684779-27684974)
chr5 (74-244)||(20467506-20467676)
chr5 (27-224)||(21338659-21338856)
chr5 (22-244)||(25423996-25424217)
chr5 (25-239)||(27667850-27668064)
chr5 (25-239)||(22135480-22135694)
chr5 (34-239)||(20800260-20800465)
chr5 (51-239)||(37290882-37291070)
chr5 (89-207)||(23441054-23441172)
chr5 (130-239)||(23574549-23574658)
chr5 (136-244)||(21407945-21408053)
chr5 (40-239)||(21881761-21881960)
chr5 (40-183)||(23517394-23517537)
chr5 (65-207)||(23472073-23472215)
chr5 (34-227)||(18776594-18776787)
chr5 (130-240)||(21936653-21936763)
chr5 (130-240)||(23504235-23504345)
chr5 (130-240)||(24582003-24582113)
chr5 (130-240)||(27011877-27011987)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (20-244)||(3263967-3264191)
chr4 (20-242)||(44661039-44661261)
chr4 (20-240)||(29452710-29452930)
chr4 (20-244)||(11206404-11206628)
chr4 (20-244)||(20891857-20892081)
chr4 (31-241)||(33223801-33224011)
chr4 (20-241)||(15358293-15358514)
chr4 (22-241)||(15002539-15002758)
chr4 (22-241)||(15246802-15247021)
chr4 (20-241)||(27901264-27901485)
chr4 (26-241)||(1648456-1648671)
chr4 (25-241)||(15414204-15414420)
chr4 (26-244)||(8706793-8707011)
chr4 (20-241)||(16148589-16148810)
chr4 (20-241)||(16152735-16152956)
chr4 (28-244)||(15078510-15078726)
chr4 (32-241)||(15320028-15320237)
chr4 (25-239)||(8387292-8387506)
chr4 (25-239)||(14302896-14303110)
chr4 (25-239)||(18298085-18298299)
chr4 (25-239)||(40473920-40474134)
chr4 (22-239)||(14160350-14160567)
chr4 (25-239)||(12477480-12477694)
chr4 (25-239)||(19777711-19777925)
chr4 (25-239)||(29038322-29038536)
chr4 (26-239)||(8052542-8052755)
chr4 (44-239)||(27712216-27712411)
chr4 (25-239)||(14681447-14681661)
chr4 (25-239)||(23956627-23956841)
chr4 (40-244)||(14850299-14850503)
chr4 (49-218)||(1639367-1639536)
chr4 (49-240)||(15146827-15147018)
chr4 (22-181)||(14695051-14695210)
chr4 (25-240)||(12524555-12524770)
chr4 (98-239)||(18226437-18226578)
chr4 (90-227)||(16354428-16354565)
chr4 (25-244)||(7091307-7091526)
chr4 (130-240)||(14998195-14998305)
chr4 (130-200)||(15292441-15292511)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (20-244)||(20828765-20828989)
chr2 (20-244)||(20833491-20833715)
chr2 (20-240)||(1064261-1064481)
chr2 (20-244)||(31831164-31831388)
chr2 (90-244)||(11357657-11357811)
chr2 (22-206)||(23277320-23277504)
chr2 (22-239)||(12574864-12575081)
chr2 (22-239)||(27788252-27788469)
chr2 (20-241)||(23294444-23294665)
chr2 (26-241)||(19651771-19651986)
chr2 (20-241)||(27364792-27365013)
chr2 (22-239)||(24876464-24876681)
chr2 (25-239)||(16925871-16926085)
chr2 (25-239)||(16999511-16999725)
chr2 (19-241)||(24949098-24949321)
chr2 (25-239)||(9610647-9610861)
chr2 (25-239)||(10869361-10869575)
chr2 (25-239)||(16923400-16923614)
chr2 (25-239)||(16982663-16982877)
chr2 (25-239)||(17064228-17064442)
chr2 (25-239)||(17067886-17068100)
chr2 (25-239)||(27371780-27371994)
chr2 (44-239)||(22324593-22324788)
chr2 (44-239)||(24710545-24710740)
chr2 (25-239)||(21144759-21144973)
chr2 (23-241)||(27209888-27210106)
chr2 (25-239)||(27218527-27218741)
chr2 (44-239)||(24262881-24263076)
chr2 (44-239)||(41608122-41608317)
chr2 (25-207)||(44385287-44385469)
chr2 (40-239)||(21324999-21325198)
chr2 (22-240)||(24819401-24819619)
chr2 (26-233)||(23111252-23111460)
chr2 (40-240)||(24675999-24676199)
chr2 (40-240)||(22756198-22756398)
chr2 (22-244)||(30210632-30210853)
chr2 (151-240)||(21125003-21125092)
chr2 (136-244)||(45530017-45530125)
chr2 (26-244)||(23066897-23067115)
chr2 (27-240)||(23107450-23107663)
chr2 (24-101)||(23099735-23099812)
chr2 (34-207)||(24707209-24707382)
chr2 (26-244)||(21890437-21890655)
chr2 (130-231)||(12640056-12640157)
chr2 (130-240)||(22276788-22276898)
chr2 (130-240)||(24831011-24831120)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (20-242)||(37677972-37678194)
chr1 (21-244)||(31539243-31539466)
chr1 (20-244)||(20295302-20295526)
chr1 (20-244)||(21951799-21952023)
chr1 (20-233)||(24098848-24099061)
chr1 (19-241)||(19662381-19662603)
chr1 (20-241)||(19855198-19855419)
chr1 (23-239)||(20856008-20856225)
chr1 (20-241)||(20939308-20939529)
chr1 (40-244)||(50619509-50619713)
chr1 (20-241)||(20835145-20835354)
chr1 (25-239)||(51332743-51332957)
chr1 (40-239)||(41352927-41353126)
chr1 (25-239)||(21831198-21831412)
chr1 (40-244)||(20139720-20139924)
chr1 (22-244)||(19760120-19760342)
chr1 (44-239)||(21837845-21838040)
chr1 (25-227)||(19107275-19107477)
chr1 (25-239)||(16349848-16350063)
chr1 (40-207)||(16373456-16373623)
chr1 (44-239)||(33390298-33390493)
chr1 (22-134)||(23197493-23197605)
chr1 (22-244)||(22109912-22110134)
chr1 (22-244)||(22113761-22113983)
chr1 (26-244)||(22361495-22361713)
chr1 (40-244)||(21749831-21750034)
chr1 (49-227)||(21025080-21025258)
chr1 (74-239)||(16077955-16078120)
chr1 (25-244)||(20250692-20250910)
chr1 (93-207)||(17044333-17044447)
chr1 (130-240)||(20830747-20830857)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (18-244)||(15887-16113)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (20-242)||(24365153-24365375)
chr6 (20-241)||(10468167-10468388)
chr6 (20-233)||(5296524-5296737)
chr6 (20-241)||(19435744-19435965)
chr6 (22-241)||(21472343-21472562)
chr6 (20-241)||(8762251-8762472)
chr6 (22-241)||(18795432-18795651)
chr6 (26-241)||(25768933-25769148)
chr6 (20-239)||(28282131-28282350)
chr6 (40-241)||(14380805-14381006)
chr6 (20-241)||(19454162-19454383)
chr6 (37-244)||(19488607-19488814)
chr6 (20-241)||(15460078-15460299)
chr6 (22-241)||(19880040-19880259)
chr6 (74-244)||(5838591-5838761)
chr6 (25-239)||(25113296-25113510)
chr6 (27-239)||(2874128-2874340)
chr6 (88-239)||(27188180-27188331)
chr6 (88-239)||(27260909-27261060)
chr6 (25-239)||(16626040-16626254)
chr6 (25-239)||(29591243-29591457)
chr6 (25-239)||(1542407-1542621)
chr6 (22-244)||(18966612-18966834)
chr6 (56-244)||(25609215-25609403)
chr6 (44-239)||(24312510-24312705)
chr6 (26-241)||(34644910-34645125)
chr6 (19-244)||(18197042-18197270)
chr6 (22-244)||(23079208-23079430)
chr6 (74-240)||(19865430-19865596)
chr6 (26-244)||(22078014-22078232)
chr6 (26-244)||(22434608-22434826)
chr6 (26-244)||(22443006-22443224)
chr6 (25-239)||(28262520-28262734)
chr6 (25-239)||(28341269-28341483)
chr6 (22-227)||(15896850-15897055)
chr6 (24-233)||(21563454-21563663)
chr6 (24-233)||(21569313-21569522)
chr6 (40-244)||(22761793-22761997)
chr6 (25-244)||(18407265-18407484)
chr6 (93-239)||(27566371-27566517)
chr6 (40-161)||(14379255-14379376)
chr6 (25-244)||(20636624-20636843)
chr6 (22-200)||(18436392-18436570)
chr6 (130-240)||(18837336-18837446)
chr6 (34-227)||(16926972-16927165)
chr6 (89-244)||(27330820-27330975)
chr6 (89-244)||(27391560-27391715)
chr6 (130-240)||(14624785-14624895)
chr6 (129-195)||(16098838-16098904)
chr6 (130-240)||(16381801-16381911)
chr6 (153-239)||(28291823-28291909)
chr6 (107-244)||(16962850-16962987)
chr6 (130-240)||(1648242-1648352)
chr6 (130-240)||(15077794-15077904)
chr6 (130-240)||(23996991-23997101)
chr6 (25-149)||(28287996-28288120)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-244)||(27167-27391)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (20-233)||(7321-7534)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (22-241)||(5659-5878)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (20-241)||(81008-81229)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (22-241)||(32319-32539)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (20-241)||(32495-32716)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (20-241)||(3660-3881)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (26-241)||(3085-3300)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (22-241)||(22554-22773)
scaffold0261 (22-241)||(14375-14594)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (22-241)||(864-1083)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (31-233)||(20311-20513)
scaffold0104 (31-233)||(23131-23333)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-241)||(28134-28355)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (20-233)||(43700-43913)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (20-241)||(149479-149700)
scaffold0011 (20-241)||(194880-195101)
scaffold0011 (65-244)||(25754-25933)
scaffold0011 (130-240)||(180834-180944)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (20-241)||(233-454)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (20-241)||(2497-2718)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (20-241)||(13077-13298)
scaffold0034 (20-241)||(68279-68500)
scaffold0034 (20-241)||(4129-4350)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (20-241)||(41826-42047)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-233)||(249530-249743)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (22-241)||(2508-2727)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (22-241)||(48212-48431)
scaffold0053 (22-233)||(57025-57236)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (31-241)||(27433-27643)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (20-241)||(20809-21030)
scaffold0114 (20-241)||(45426-45647)
scaffold0114 (25-244)||(19522-19741)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (25-241)||(3700-3916)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (22-241)||(1150-1369)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (26-241)||(5339-5554)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (22-241)||(20029-20248)
scaffold0058 (148-200)||(75508-75560)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (22-241)||(51041-51260)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (20-241)||(2531-2752)
scaffold0222 (20-241)||(7969-8190)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (20-241)||(4628-4849)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (20-241)||(56076-56297)
scaffold0076 (20-241)||(32853-33074)
scaffold0076 (130-240)||(41168-41278)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (20-241)||(51356-51577)
scaffold0067 (20-241)||(60390-60611)
scaffold0067 (20-241)||(66778-66999)
scaffold0067 (55-161)||(26389-26495)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (22-241)||(18257-18477)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (26-241)||(10702-10917)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (26-241)||(28966-29181)
scaffold0026 (40-244)||(29851-30055)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-241)||(792-1010)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (20-226)||(48382-48588)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (22-231)||(89623-89832)
scaffold0001 (22-231)||(90301-90510)
scaffold0001 (136-244)||(390492-390600)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (26-241)||(778-993)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (23-241)||(412-631)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (58-241)||(25079-25262)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (22-241)||(19758-19977)
scaffold0090 (22-241)||(23920-24139)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (26-244)||(24254-24472)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (20-206)||(323648-323834)
scaffold0004 (26-244)||(202650-202868)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (20-241)||(13475-13696)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (20-240)||(5512-5731)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (20-241)||(6414-6635)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (22-238)||(20895-21111)
scaffold0298 (22-241)||(11235-11454)
scaffold0298 (22-241)||(15005-15224)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (22-241)||(9986-10205)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (22-200)||(2663-2841)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (20-193)||(11690-11863)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (20-233)||(11962-12175)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (20-241)||(20617-20838)
scaffold0077 (130-240)||(27552-27662)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (26-244)||(244-462)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (22-244)||(17155-17377)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (20-206)||(10633-10819)
scaffold0235 (20-206)||(20847-21033)
scaffold0235 (130-200)||(26756-26826)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (31-241)||(261217-261427)
scaffold0005 (40-240)||(278026-278226)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (20-233)||(6130-6343)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (20-241)||(49690-49911)
scaffold0028 (27-237)||(9387-9597)
scaffold0028 (25-239)||(44065-44279)
scaffold0028 (25-194)||(797-966)
scaffold0028 (27-236)||(15850-16059)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (49-244)||(100754-100952)
scaffold0020 (74-240)||(181109-181275)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (26-241)||(331-546)
scaffold0139 (20-194)||(28173-28347)
scaffold0139 (20-194)||(34426-34600)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (20-241)||(13107-13330)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (26-241)||(95184-95399)
scaffold0029 (25-239)||(108992-109206)
scaffold0029 (22-239)||(113470-113687)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (41-244)||(218614-218817)
scaffold0012 (40-240)||(229953-230153)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (27-237)||(8279-8489)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (22-244)||(15783-16005)
scaffold0040 (26-244)||(112670-112888)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (22-244)||(116083-116305)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (20-244)||(1814-2038)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (20-180)||(728-887)
scaffold0120 (25-244)||(6929-7145)
scaffold0120 (40-224)||(12984-13168)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (25-239)||(7850-8064)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (22-244)||(39937-40159)
scaffold0064 (166-244)||(28090-28168)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (26-241)||(4685-4900)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (22-244)||(14257-14479)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (22-244)||(4937-5159)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (22-244)||(17587-17809)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (22-244)||(4777-4999)
scaffold0270 (22-244)||(11907-12129)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (22-244)||(31931-32153)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (121-241)||(40647-40767)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (25-149)||(27934-28058)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (26-244)||(6920-7138)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (115-221)||(6507-6613)
scaffold0149 (115-221)||(10938-11044)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (26-164)||(48090-48228)
scaffold0108 (185-238)||(48036-48089)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (34-227)||(3004-3197)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (38-239)||(39014-39215)
scaffold0042 (34-227)||(66328-66521)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (23-244)||(102139-102360)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (24-244)||(3637-3857)
scaffold0023 (34-174)||(28562-28702)
scaffold0023 (22-206)||(59699-59883)
scaffold0023 (25-244)||(131013-131232)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (25-244)||(1248-1467)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (25-244)||(26125-26344)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (20-146)||(5-131)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (115-241)||(773-899)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (151-241)||(17844-17934)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (22-240)||(11375-11593)
scaffold0018 (22-240)||(17567-17785)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (136-241)||(7093-7198)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (40-244)||(9876-10080)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (40-240)||(3104-3304)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (26-236)||(116-326)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (34-240)||(32763-32969)
scaffold0109 (34-240)||(9506-9712)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (98-239)||(22778-22919)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (22-146)||(2032-2156)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (40-244)||(19198-19402)
scaffold0324 (40-207)||(14407-14574)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (20-244)||(602-826)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (20-107)||(1-88)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (25-244)||(7512-7731)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (25-244)||(50338-50557)
scaffold0081 (40-240)||(34936-35136)
scaffold0081 (40-240)||(19512-19712)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (49-207)||(28-186)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (37-227)||(4546-4736)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (60-241)||(34097-34278)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (74-227)||(79724-79877)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (34-239)||(19257-19462)
scaffold0017 (93-239)||(56928-57074)
scaffold0017 (34-240)||(196668-196874)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (130-218)||(6322-6410)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (74-198)||(18445-18569)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (40-244)||(8283-8487)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (88-207)||(1357-1476)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (22-244)||(4770-4992)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (130-244)||(2373-2487)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (22-244)||(16561-16782)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (93-239)||(13379-13525)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (26-111)||(17-102)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (151-244)||(25026-25119)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (89-238)||(63276-63425)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (40-240)||(7087-7287)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (89-244)||(1582-1737)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (34-240)||(3595-3801)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (27-244)||(1799-2016)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (163-244)||(15742-15823)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (98-182)||(10270-10354)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (27-239)||(8308-8520)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (20-244)||(4046-4270)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (89-244)||(3280-3435)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (25-244)||(6955-7174)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (130-240)||(3230-3340)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (130-240)||(18957-19067)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (130-240)||(13818-13928)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (90-227)||(25897-26034)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (130-233)||(4075-4178)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (129-200)||(8215-8286)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (22-101)||(6863-6942)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (130-240)||(3452-3562)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (130-240)||(3161-3271)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (130-240)||(9896-10006)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (130-240)||(372-482)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (130-240)||(9147-9257)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (130-240)||(24304-24414)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (136-182)||(85811-85857)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (136-181)||(24931-24976)
scaffold0021 (130-195)||(32699-32764)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (136-240)||(8182-8286)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (136-244)||(2171-2279)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (129-200)||(10244-10315)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (130-240)||(6085-6194)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (130-240)||(24408-24518)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (130-240)||(15566-15676)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (32-77)||(3460-3505)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (32-77)||(30473-30518)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (25-158)||(39084-39217)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (107-236)||(8704-8833)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28755046 - 28754822
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28755046 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 28754947  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28754946 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 28754847  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28754846 cagtttgtttatgcctgtttgattt 28754822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47124672 - 47124448
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47124672 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattcttgagga 47124573  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47124572 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 47124473  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  47124472 cagtttgtttatgcctgtttgattt 47124448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10384696 - 10384472
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10384696 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 10384597  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10384596 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 10384497  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10384496 cagtttgtttatgcctgtttgattt 10384472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 16329061 - 16329285
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16329061 aggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgagga 16329160  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16329161 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 16329260  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||| || |||||||    
T  16329261 cagtttgtttatgcttgcttgattt 16329285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 11960570 - 11960791
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  11960570 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 11960669  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  11960670 gagtcacgatagtagtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgct 11960769  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11960770 cagtttgtttatgcatgtttga 11960791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 16337916 - 16338134
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16337916 atagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagag 16338015  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16338016 tcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctcag 16338115  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16338116 tttgtttatgcttgtttga 16338134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 13319906 - 13320122
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  13319906 atagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaag 13320005  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||    
T  13320006 tcacaagagtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgacgtcgctcag 13320105  T
Q  223 tttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  13320106 tttgtgtatgcgtgttt 13320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14574649 - 14574430
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || |    
T  14574649 gatagtgacttcaaggttgatgatcatggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaagaaa 14574550  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||     
T  14574549 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgagatgttgctcg 14574450  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14574449 gtttgtttatgcatgtttga 14574430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 16827606 - 16827825
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  16827606 gataatgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgtattcatgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 16827705  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
      ||| | ||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16827706 cccacaaaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 16827805  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16827806 gtttgtttatgcatgtttga 16827825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 18133747 - 18133968
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||    
T  18133747 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaattagtattcctgataatgacgagttgaaaaagttaattttggaaga 18133846  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  18133847 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 18133946  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  18133947 cattttgtgtatgcatgtttga 18133968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17493356 - 17493172
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  17493356 gatagtgacttaaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaa 17493257  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17493256 gtcacaagagtagcttaagtattcattctggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 17493172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 31694587 - 31694808
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  31694587 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagagga 31694686  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || || |||    
T  31694687 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgct 31694786  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  31694787 cattttgtgtatgcatgtttga 31694808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4679164 - 4678947
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  4679164 gatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 4679065  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  4679064 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 4678965  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  4678964 ttttgtgtatgcatgttt 4678947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 11303174 - 11303395
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || || || | ||||| | | |||||    
T  11303174 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttcaaaaggttgagtttagagga 11303273  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     || ||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  11303274 aaggcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgtgatgttgct 11303373  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  11303374 cagtttgtgtatgcgtgtttga 11303395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31939631 - 31939410
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  31939631 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagagga 31939532  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| | || || |||    
T  31939531 aagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgct 31939432  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  31939431 cattttgtgtatgcatgtttga 31939410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41178248 - 41178031
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| |    
T  41178248 gatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagaatcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttgatcctagaggaaa 41178149  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  41178148 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 41178049  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  41178048 ttttgtgtatgcatgttt 41178031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 16380331 - 16380542
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |    
T  16380331 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaa 16380430  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  || |||||  | ||||| |||||    
T  16380431 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtacgggttgaattgagatgtcgctca 16380530  T
Q  222 gtttgtttatgc 233  Q
     ||||| |||||    
T  16380531 ttttgtgtatgc 16380542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13942750 - 13942533
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  13942750 gatagtgacttccaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 13942651  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  13942650 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 13942551  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     || || ||||| |||||    
T  13942550 tttcgtgtatgcatgttt 13942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44777969 - 44777756
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |||||    
T  44777969 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtca 44777870  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
      ||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||    
T  44777869 taagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcatttt 44777770  T
Q  226 gtttatgcctgttt 239  Q
    || ||||| |||||    
T  44777769 gtgtatgcatgttt 44777756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 8758486 - 8758702
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||    
T  8758486 atagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 8758585  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||     
T  8758586 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 8758685  T
Q  223 tttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  8758686 tttgtgtatgcatgttt 8758702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15228375 - 15228156
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || |    
T  15228375 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaa 15228276  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  15228275 gtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcaca 15228176  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  15228175 gtttgtatatgcatgtttga 15228156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10906923 - 10906709
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10906923 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 10906824  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  10906823 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 10906724  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  10906723 tgtgtattcctgttt 10906709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13253403 - 13253189
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  13253403 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 13253304  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  13253303 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 13253204  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  13253203 tgtgtattcctgttt 13253189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 14580356 - 14580530
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||  |||||||| ||||||| || ||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14580356 gatagtgatttcaagatcgatgatcaaggtgtattaaggtttcgaggtagaatttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggaga 14580455  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggt 196  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14580456 gtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 15401934 - 15402148
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  15401934 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 15402033  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  15402034 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 15402133  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  15402134 tgtgtattcctgttt 15402148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 10419446 - 10419667
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||| ||| ||||| | || || |||||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  10419446 aggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaaga 10419545  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||||| ||     
T  10419546 aagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaagaaggatgtcgcg 10419645  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  10419646 cggtttgtgtatgcgtgtttga 10419667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15339980 - 15339768
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||     
T  15339980 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcat 15339881  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  15339880 agaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 15339781  T
Q  227 tttatgcctgttt 239  Q
    | ||| |||||||    
T  15339780 tgtattcctgttt 15339768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 16835913 - 16836124
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||| | ||||| |    
T  16835913 gatagtgacttcaaagttgatgatcagggagtattaagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaatcaaaaaagttaattttagaggaaa 16836012  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  16836013 gtcacaagagtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 16836112  T
Q  222 gtttgtttatgc 233  Q
     ||||| |||||    
T  16836113 ttttgtgtatgc 16836124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 5424347 - 5424561
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  5424347 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 5424446  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  5424447 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 5424546  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  5424547 tgtgtattcctgttt 5424561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 20061471 - 20061685
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  20061471 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtc 20061570  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  20061571 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 20061670  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  20061671 tgtgtattcctgttt 20061685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 26791816 - 26792030
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  26791816 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 26791915  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  26791916 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 26792015  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  26792016 tgtgtattcctgttt 26792030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 13971521 - 13971742
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || || || || || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  13971521 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 13971620  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13971621 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgct 13971720  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  13971721 caatttgtgtatgcatgtttga 13971742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14087401 - 14087180
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || || || || || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  14087401 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 14087302  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  14087301 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgct 14087202  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  14087201 caatttgtgtatgcatgtttga 14087180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 13299926 - 13300066
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  13299926 atagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaag 13300025  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaa 163  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13300026 tcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13300066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 13310584 - 13310724
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  13310584 atagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaag 13310683  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaa 163  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13310684 tcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13310724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 12360005 - 12360164
Alignment:
Q  82 cctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12360005 cctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaga 12360104  T
Q  182 aactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12360105 agctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttga 12360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10006313 - 10006099
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10006313 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 10006214  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  10006213 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 10006114  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  10006113 tgtgtattcctgttt 10006099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15248863 - 15248641
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| ||||||| |||||  | || ||| |||||||| |||||||||| || |    
T  15248863 gatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaa 15248764  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  15248763 gtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 15248664  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  15248663 gtttgtgtattcctgtttgattt 15248641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 15588809 - 15589023
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  15588809 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 15588908  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  15588909 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 15589008  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  15589009 tgtgtattcctgttt 15589023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 15724351 - 15724565
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | |||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  15724351 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 15724450  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  15724451 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 15724550  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  15724551 tgtgtattcctgttt 15724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16636486 - 16636272
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16636486 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16636387  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16636386 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16636287  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16636286 tgtgtattcctgttt 16636272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43163810 - 43163596
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  43163810 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 43163711  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  43163710 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 43163611  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  43163610 tgtgtattcctgttt 43163596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 14875930 - 14876129
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| |    ||||| ||||    
T  14875930 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggttgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaaaagagttatagaagtagcttga 14876029  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  14876030 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 14876129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 16411699 - 16411913
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16411699 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaagagagtc 16411798  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16411799 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16411898  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16411899 tgtgtattcctgttt 16411913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48426160 - 48425958
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  48426160 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 48426061  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  48426060 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 48425961  T
Q  225 tgt 227  Q
    |||    
T  48425960 tgt 48425958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 15347681 - 15347876
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||    ||||| ||||||||    
T  15347681 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 15347780  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  15347781 tcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15347876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15209531 - 15209385
Alignment:
Q  98 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtc 197  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15209531 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 15209432  T
Q  198 tggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15209431 tgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttgattt 15209385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Original strand, 53384435 - 53384646
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  | |||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  53384435 agtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 53384534  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  53384535 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 53384634  T
Q  225 tgtttatgcctg 236  Q
    ||| ||| ||||    
T  53384635 tgtgtattcctg 53384646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6601449 - 6601235
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||| | || ||| |||| ||| |||| ||| |||| || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  6601449 agtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 6601350  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | |||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||    
T  6601349 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaacaagatgtggcacagtt 6601250  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  6601249 tgtgtattcctgttt 6601235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 16756017 - 16756216
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| |||| || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  16756017 gatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16756116  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || ||  | || ||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  16756117 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagattttctgggggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16756216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17490546 - 17490344
Alignment:
Q  42 tgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagt 141  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||||    
T  17490546 tgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagt 17490447  T
Q  142 attcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  17490446 attcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcttagtttgtgtattcttgtttga 17490347  T
Q  242 ttt 244  Q
    |||    
T  17490346 ttt 17490344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12498952 - 12498779
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    ||||    
T  12498952 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagta 12498853  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| ||||||    
T  12498852 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaa 12498779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 16806411 - 16806557
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||    
T  16806411 agagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctgg 16806510  T
Q  193 tggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  16806511 tggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16806557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15062408 - 15062275
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| | |||| |||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15062408 tttgtattcatgatgatgaagggatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 15062309  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    | | |||||  | || ||||||||||| ||||||    
T  15062308 tctaaagaagattttctggtggtctggattgaaa 15062275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16372076 - 16371924
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16372076 tttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 16371977  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  16371976 tctaaagaagatattctggtggtctgg-ttgaaacgcgatgtggcacagtttgt 16371924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 15015170 - 15015344
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  |   |||| ||||||| |||||| ||  |||  |||||||| ||||| | || || |    
T  15015170 gatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaa 15015269  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggt 196  Q
     ||||   ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15015270 ttcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggt 15015344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30138424 - 30138314
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  30138424 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 30138325  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  30138324 atgcttgtttg 30138314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30147975 - 30147865
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  30147975 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 30147876  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  30147875 atgcttgtttg 30147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9523350 - 9523213
Alignment:
Q  107 tgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||  |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |  | ||    
T  9523350 tgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaa 9523251  T
Q  207 aagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    | | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  9523250 acgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgattt 9523213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Original strand, 12359928 - 12359985
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttg 77  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  12359928 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttg 12359985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15234243 - 15234154
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgatt 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15234243 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgatt 15234154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Original strand, 16491709 - 16491817
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||  | ||| || | || ||||| |||||||| ||| | |    
T  16491709 ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagtttgtgtattctt 16491808  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||||||||    
T  16491809 gtttgattt 16491817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16692795 - 16692663
Alignment:
Q  107 tgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || || |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16692795 tgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcaggacttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16692696  T
Q  207 aagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
      | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  16692695 gcgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 16692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 13966862 - 13966972
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  | ||| |||||||||    
T  13966862 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaatcgctgagtttgttt 13966961  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  13966962 atgcttgtttg 13966972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 8273921 - 8274022
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  8273921 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 8274020  T
Q  230 at 231  Q
    ||    
T  8274021 at 8274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Original strand, 14126093 - 14126193
Alignment:
Q  107 tgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||| |||||    
T  14126093 tgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaagatttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 14126192  T
Q  207 a 207  Q
    |    
T  14126193 a 14126193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 41509 - 41733
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41509 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 41608  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41609 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 41708  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41709 cagtttgtttatgcctgtttgattt 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 46575 - 46796
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||    
T  46575 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaaga 46674  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  46675 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 46774  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  46775 cattttgtgtatgcatgtttga 46796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3042 - 2820
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  3042 gatagtgattttaaaatcgatgatcagggggtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaatgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 2943  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  2942 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcaca 2843  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  2842 gtttgtgtattcctgtttgattt 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14566307 - 14566083
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566307 aggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 14566208  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14566207 gagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 14566108  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  14566107 cagtttgtttatgcctgtttaattt 14566083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 803289 - 803509
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  803289 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctagagga 803388  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  803389 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgttgct 803488  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  803489 aagttcgtttatgcctgtttg 803509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6604823 - 6604599
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6604823 aggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 6604724  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6604723 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 6604624  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6604623 cagtttgtttatgcctgtttgattt 6604599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6680276 - 6680052
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6680276 aggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 6680177  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6680176 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 6680077  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6680076 cagtttgtttatgcctgtttgattt 6680052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 16270846 - 16271064
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270846 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtca 16270945  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16270946 caagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagttt 16271045  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16271046 gtttatgcctgtttgattt 16271064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 29303042 - 29303263
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||    
T  29303042 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattcttgtaga 29303141  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  29303142 gagtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgct 29303241  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  29303242 cagtttgtgtatgcatgtttga 29303263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27355712 - 27355489
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||||  |||||||||||| ||    
T  27355712 aggacagtgactttaaggttgatgatcagggtgtactgagattcagagggagagtttgtattcctgacagcgatgagttgaagg-gttgattcttgaaga 27355614  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27355613 tagtcacaagagtagattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 27355514  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27355513 cagtttgtttatgcctgtttgattt 27355489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12305923 - 12305699
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12305923 aggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattcttgaaga 12305824  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  12305823 gagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaattgtgatgttgct 12305724  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  12305723 cagtttttttatgcttgttttattt 12305699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23656092 - 23655871
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  23656092 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaaga 23655993  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
      ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||    
T  23655992 aggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgttgct 23655893  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  23655892 cagtttgtttatgcatgtttga 23655871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1267403 - 1267182
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  1267403 aggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 1267304  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || |||||     
T  1267303 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcc 1267204  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  1267203 cattttgtgtatgcatgtttga 1267182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19852570 - 19852357
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  19852570 gtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 19852471  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  19852470 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagttt 19852371  T
Q  226 gtttatgcctgttt 239  Q
     ||||||| |||||    
T  19852370 ttttatgcatgttt 19852357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19858606 - 19858393
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  19858606 gtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 19858507  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  19858506 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagttt 19858407  T
Q  226 gtttatgcctgttt 239  Q
     ||||||| |||||    
T  19858406 ttttatgcatgttt 19858393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 31416090 - 31416303
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  31416090 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 31416189  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  31416190 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgct 31416289  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || |||||||||||    
T  31416290 cattttgtttatgc 31416303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 20009542 - 20009756
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  20009542 gtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcttgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 20009641  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  20009642 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgatttgaagaaattattttggtggtc-cgtttgaaacgtgatgttgctcagttt 20009740  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  20009741 gtttatgcatgtttga 20009756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21841576 - 21841361
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || || |||||    
T  21841576 gtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 21841477  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||    
T  21841476 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctatgttt 21841377  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  21841376 gtttatgcatgtttga 21841361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 20975267 - 20975488
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| |  ||||| ||||||||| | |||||    
T  20975267 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagagga 20975366  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  20975367 aagtcacaagagtagcttgagtattcatacgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 20975466  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  20975467 cattttgtatatgcatgtttga 20975488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22052028 - 22051807
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||    
T  22052028 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagagga 22051929  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  22051928 aagtcacaagagtaggttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgct 22051829  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||| | ||||| |||||||    
T  22051828 cattttatgtatgcatgtttga 22051807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 31570460 - 31570677
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  31570460 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 31570559  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  31570560 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 31570659  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  31570660 ttttgtgtatgcatgttt 31570677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20389262 - 20389040
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |    
T  20389262 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 20389163  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||    |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||  | |||||||  ||    
T  20389162 gtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtggtccggattgaagcgtgatgttgtaca 20389063  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  20389062 gtttgtatatgcatgtttgattt 20389040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 20395748 - 20395972
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||  || || | ||  |||| ||| ||| ||| || || ||||| ||| | |||||| |||||||||| ||    
T  20395748 aggatggtgacttaaaagttgatgatcagggattgttgcgatttcgaggcagaatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaaga 20395847  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     ||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||     
T  20395848 aagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggca 20395947  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  20395948 cagtttgtttattcatgtttgattt 20395972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22372099 - 22371884
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| | |  || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  22372099 gtgatttcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaagaatattcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattatagaagaaagtca 22372000  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||   |||||||||||||||    
T  22371999 cagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccagattgaaacatgatgttgctcagttt 22371900  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  22371899 gtttatgcatgtttga 22371884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 20985169 - 20985347
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  20985169 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtca 20985268  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttg 204  Q
    |   ||||  || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20985269 cagaagtatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggtttg 20985347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 22128579 - 22128793
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  22128579 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtc 22128678  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  22128679 atagaagtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 22128778  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  22128779 tgtgtattcctgttt 22128793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23950029 - 23949860
Alignment:
Q  75 ttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgat 174  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  23950029 ttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 23949930  T
Q  175 ttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  23949929 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaagtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgattt 23949860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 19483700 - 19483899
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||  ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  19483700 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 19483799  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  19483800 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 19483899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 22248035 - 22248257
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22248035 gatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccaaggcagaatttgtattcctgacattgacgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22248134  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||| ||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  22248135 gtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 22248234  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22248235 gtttgtgtattcctgtttgattt 22248257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 22377072 - 22377294
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22377072 gatagtgattttaaaatcgatgatctgggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22377171  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||    
T  22377172 gtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcaca 22377271  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22377272 gtttgtgtattcctgtttgattt 22377294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 22383247 - 22383469
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22383247 gatagtgattttaaaatcgatgatcggggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22383346  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||    
T  22383347 gtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcaca 22383446  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22383447 gtttgtgtattcctgtttgattt 22383469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19113850 - 19113636
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  19113850 agtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 19113751  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  19113750 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 19113651  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  19113650 tgtgtattcctgttt 19113636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22988359 - 22988137
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||| ||| ||| |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22988359 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaatttctattccttacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22988260  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||    
T  22988259 gtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatatggcaca 22988160  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22988159 gtttgtgtattcctgtttgattt 22988137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 17673663 - 17673858
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  17673663 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 17673762  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  17673763 tcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 17673858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18857737 - 18857535
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||  ||||||| || || ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||    
T  18857737 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtc 18857638  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  18857637 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 18857538  T
Q  225 tgt 227  Q
    |||    
T  18857537 tgt 18857535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Original strand, 30312774 - 30312979
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  30312774 aaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 30312873  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |    
T  30312874 gcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtctattc 30312973  T
Q  234 ctgttt 239  Q
    ||||||    
T  30312974 ctgttt 30312979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 21921372 - 21921576
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |  ||  |||| ||| | |||||  |||||||||| ||||||||   |||||  ||||    
T  21921372 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttga 21921471  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| || ||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  21921472 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttt 21921571  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  21921572 gattt 21921576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 22119795 - 22119977
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||| || |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||    
T  22119795 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaatagagtc 22119894  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    |    ||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || | ||||||||||||||||    
T  22119895 atagaagttgcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaa 22119977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 21393488 - 21393705
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||||  |||| ||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||     
T  21393488 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccat 21393587  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| | |||||  | ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||    
T  21393588 agaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttg 21393687  T
Q  227 tttatgcctgtttgattt 244  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  21393688 tgtatgcttgtttgattt 21393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 21787982 - 21788199
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||||  |||| ||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||     
T  21787982 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccat 21788081  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| | |||||  | ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||    
T  21788082 agaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttg 21788181  T
Q  227 tttatgcctgtttgattt 244  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  21788182 tgtatgcttgtttgattt 21788199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19979096 - 19978912
Alignment:
Q  56 tgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagc 155  Q
    |||| ||| ||||| || ||||||| | ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19979096 tgagattccgaggtcgaatttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagc 19978997  T
Q  156 tacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| || ||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  19978996 tacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttg 19978912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 21166174 - 21166374
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| ||  |  |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  21166174 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21166273  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||| | |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  21166274 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 21166373  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  21166374 g 21166374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23651137 - 23650982
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||| |||| ||  ||||    
T  23651137 atgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaaaagttgtt 23651038  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | |||| |||||    
T  23651037 ttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttggattt 23650982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 227
Target Start/End: Original strand, 22132730 - 22132864
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||    
T  22132730 agagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcattgaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctgg 22132829  T
Q  193 tggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22132830 tggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 22132864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22040946 - 22040805
Alignment:
Q  98 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtc 197  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||||||    
T  22040946 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtc 22040847  T
Q  198 tggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  22040846 tggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22040805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Original strand, 16407675 - 16407815
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  |||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  16407675 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 16407774  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgat 174  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16407775 gcttgagtattcacccaggagctacgaagatgtatcatgat 16407815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21043605 - 21043390
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |    
T  21043605 agtgattttaaaatcgatgatcaaagagtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagcc 21043506  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| || ||    
T  21043505 atagaagtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacaatt 21043406  T
Q  225 tgtttatgcctgtttg 240  Q
    ||| ||| | ||||||    
T  21043405 tgtgtattcttgtttg 21043390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 21196228 - 21196338
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||| |||  ||||  |||||||||    
T  21196228 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagatgttgttttggtggcctggaatgaaaaaggaaattgcatagtttgttt 21196327  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  21196328 atgcttgtttg 21196338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21252104 - 21251882
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |    
T  21252104 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagcc 21252005  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaa---aaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||   ||||   |||||||||| || |||||||| |   | |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | ||    
T  21252004 acagaagtaacctgagtattcatccgggagctacgacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttacaca 21251905  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  21251904 gtttgtatattcttgtttgattt 21251882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 239
Target Start/End: Original strand, 12274441 - 12274524
Alignment:
Q  156 tacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  12274441 tacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 12274524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22316246 - 22316176
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22316246 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggcctgg 22316176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Original strand, 22623596 - 22623637
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttg 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22623596 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 22623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15534534 - 15534392
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || | |||| ||| |||  | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||    
T  15534534 aaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcatgatgatgcagaaataaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagta 15534435  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgattt 176  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  15534434 gcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgattt 15534392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 21850063 - 21850173
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||| ||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  21850063 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgtttcggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 21850162  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  21850163 atgcttgtttg 21850173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32601295 - 32601093
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||| || ||  ||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  32601295 aaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgtattcccgacgatgcagagatgaaggaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 32601196  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | || ||  | || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |    
T  32601195 gcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgtattc 32601096  T
Q  234 ctg 236  Q
    |||    
T  32601095 ctg 32601093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 16876821 - 16876922
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  16876821 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 16876920  T
Q  230 at 231  Q
    ||    
T  16876921 at 16876922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 181
Target Start/End: Original strand, 23156736 - 23156789
Alignment:
Q  128 agagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  23156736 agagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaaga 23156789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25283419 - 25283346
Alignment:
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtgg 195  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| | |||||  || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25283419 gtcacaagagtagtttaagtattcatctaggagtgacgaagatgtatcaggatttgaagaaattgttttggtgg 25283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49153390 - 49153166
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49153390 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 49153291  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  49153290 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaaaagatgttgct 49153191  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49153190 cagtttgtttatgcctgtttgattt 49153166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 11305423 - 11305647
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11305423 aggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 11305522  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11305523 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaaaagggatgttgct 11305622  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11305623 cagtttgtttatgcctgtttgattt 11305647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 26117765 - 26117987
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26117765 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 26117864  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26117865 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 26117964  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26117965 cagttcgtttatgcctgtttgat 26117987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 13967828 - 13968052
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  13967828 aggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattctcgagga 13967927  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13967928 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 13968027  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13968028 cagtttgtttatgcctgtttgattt 13968052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13022446 - 13022225
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  13022446 aggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 13022347  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||    
T  13022346 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgttttgaagtgtgatgttgct 13022247  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  13022246 cagtttgtttatgcttgtttga 13022225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12457729 - 12457508
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  12457729 aggatagtgattttaaggttgatgaccaaggtgtgctgaggtttagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgagga 12457630  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||    
T  12457629 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagtgagatgttgct 12457530  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12457529 cagtttgtttatgcttgtttga 12457508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 8211350 - 8211512
Alignment:
Q  82 cctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8211350 cctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttaaaga 8211449  T
Q  182 aactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211450 aattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 8211512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 15101765 - 15101984
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  15101765 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 15101864  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| || |    
T  15101865 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtttctta 15101964  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  15101965 gtttgtctatgcatgtttga 15101984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Original strand, 14285536 - 14285743
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||    
T  14285536 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagagga 14285635  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  14285636 aagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 14285735  T
Q  220 cagtttgt 227  Q
    || |||||    
T  14285736 cattttgt 14285743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19148294 - 19148079
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || || |||||    
T  19148294 gtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 19148195  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  19148194 cataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 19148095  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  19148094 gtttatgcatgtttga 19148079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20747693 - 20747478
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || || |||||    
T  20747693 gtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 20747594  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  20747593 cataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 20747494  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  20747493 gtttatgcatgtttga 20747478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 567 - 780
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | | | ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  567 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 666  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  667 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgct 766  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || |||||||||||    
T  767 caatttgtttatgc 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12456791 - 12456578
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  12456791 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctaaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 12456692  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || || |||    
T  12456691 aagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagct 12456592  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || ||||| |||||    
T  12456591 cattttgtgtatgc 12456578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13666627 - 13666405
Alignment:
Q  19 aaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagg 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||    
T  13666627 aaggatagtgactttaaggttgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagagg 13666528  T
Q  119 agagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgc 218  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || ||    
T  13666527 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgc 13666428  T
Q  219 tcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||    
T  13666427 tcattttgtgtatgcatgtttga 13666405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 14263406 - 14263625
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  14263406 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 14263505  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   | |||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  14263506 gtcacagaaatagcctaagtattcatccaggaactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 14263605  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14263606 gtttgtttatgcgtgtttga 14263625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14434778 - 14434567
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |    
T  14434778 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaa 14434679  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||  | ||||| |||||    
T  14434678 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctca 14434579  T
Q  222 gtttgtttatgc 233  Q
     ||||| |||||    
T  14434578 ttttgtatatgc 14434567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15341517 - 15341299
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | || || |     
T  15341517 atagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaat 15341418  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||    
T  15341417 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcag 15341318  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  15341317 tttgtgtatgcatgtttga 15341299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 23505032 - 23505249
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  23505032 gataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 23505131  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  23505132 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 23505231  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  23505232 ttttgtgtatgcatgttt 23505249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 16949632 - 16949844
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  16949632 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgagatttagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 16949731  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||    
T  16949732 aagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccacgatttg-agaaactgttttggtggtccggtttcaagcgtgatgttgct 16949830  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || ||||| |||||    
T  16949831 cattttgtgtatgc 16949844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 18053115 - 18053332
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||  | ||||| |    
T  18053115 gatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcttagaggaaa 18053214  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  18053215 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 18053314  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  18053315 ttttgtgtatgcatgttt 18053332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 11771425 - 11771647
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||  |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  11771425 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtggtgagatttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 11771524  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  11771525 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcaca 11771624  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  11771625 gtttgtgtattcctgtttgattt 11771647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 11387588 - 11387809
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||    
T  11387588 aggatagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagagga 11387687  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     || |||  |||||  || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  11387688 aagccacaggagtaacttaagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgct 11387787  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  11387788 cattttgtttatgcatgtttga 11387809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19613764 - 19613543
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || ||||| || || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  19613764 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 19613665  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19613664 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgct 19613565  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  19613564 caatttgtgtatgcatgtttga 19613543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 12205962 - 12206181
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || |    
T  12205962 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaa 12206061  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||    
T  12206062 gtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgcaca 12206161  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  12206162 gtttgtatatgcatgtttga 12206181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 16071461 - 16071675
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || || || ||||||||| | ||||| || ||    
T  16071461 gtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgatgatttaaa-aagttgattttagaggaaagcca 16071559  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| || |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||    
T  16071560 tagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggttgaaacgtgatgttggtcagttt 16071659  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  16071660 gtttatgcatgtttga 16071675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8708688 - 8708474
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  8708688 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 8708589  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  8708588 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 8708489  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| |||||||    
T  8708488 tgtttattcctgttt 8708474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15204705 - 15204483
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||  || |||| ||| |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  15204705 gatagtgacttcaaggtcgatgatcagggaatgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagaga 15204606  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| | ||||| || ||    
T  15204605 gtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtggcaca 15204506  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  15204505 gtttgtatattcatgtttgattt 15204483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 11236400 - 11236602
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  11236400 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 11236499  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  11236500 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 11236599  T
Q  225 tgt 227  Q
    |||    
T  11236600 tgt 11236602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 44790538 - 44790752
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  44790538 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 44790637  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  44790638 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtt 44790737  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  44790738 tgtgtattcctgttt 44790752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15625620 - 15625416
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||||   ||||| ||||    
T  15625620 gatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttga 15625521  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||| || |||||||| ||| | |||||    
T  15625520 gtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtaatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 15625421  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  15625420 gattt 15625416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8199711 - 8199497
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  8199711 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 8199612  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  8199611 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 8199512  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  8199511 tgtgtattcctgttt 8199497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10872078 - 10871864
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10872078 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 10871979  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || || ||    
T  10871978 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatt 10871879  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  10871878 tgtgtattcctgttt 10871864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 11552289 - 11552503
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11552289 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtc 11552388  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||  |||||  | || |||||| ||||||||||| | ||||| || |||||    
T  11552389 acaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 11552488  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  11552489 tgtgtattcctgttt 11552503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14040781 - 14040559
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||   ||| ||| |||||||  ||| |||||| ||||    
T  14040781 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagaga 14040682  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  14040681 gtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 14040582  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  14040581 gtttgtgtattcctgtttgattt 14040559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14350811 - 14350589
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||   ||| ||| |||||||  ||| |||||| ||||    
T  14350811 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagaga 14350712  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  14350711 gtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 14350612  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  14350611 gtttgtgtattcctgtttgattt 14350589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 15153841 - 15154063
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15153841 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 15153940  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||   |||||| |||||||| || || |||||||  || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  15153941 gtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcaca 15154040  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  15154041 gtttgtgtattcttgtttgattt 15154063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13687128 - 13686936
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  13687128 atcaaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 13687029  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 236  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  13687028 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctg 13686936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12688581 - 12688370
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| |  || | ||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  12688581 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattctagaca-tgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcac 12688483  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
      |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||| || |||||||| | ||||| || |||||||    
T  12688482 aggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaacgagatgtggcacagtttg 12688383  T
Q  227 tttatgcctgttt 239  Q
    | ||| |||||||    
T  12688382 tgtattcctgttt 12688370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 15160263 - 15160455
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||   |||||  || |||||    
T  15160263 atcaaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtatatttagtat 15160362  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 236  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  15160363 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctg 15160455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 18550964 - 18551159
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  18550964 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 18551063  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  18551064 tcatccgggagctacgaagatgtatcataatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 18551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 23202815 - 23203014
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | || || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  23202815 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23202914  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23202915 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23203014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 23508942 - 23509141
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | || || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  23508942 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23509041  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23509042 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23509141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14333478 - 14333266
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||  |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  14333478 gtgattttaaaatcgatgatctaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtca 14333379  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  14333378 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagat-ttcttgtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagttt 14333280  T
Q  226 gtttatgcctgttt 239  Q
    || ||| |||||||    
T  14333279 gtgtattcctgttt 14333266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18178810 - 18178614
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||| || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||    ||||| ||||    
T  18178810 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttga 18178711  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 236  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  18178710 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctg 18178614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 321224 - 321399
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| || |||     
T  321224 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgagatagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtg 321323  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  321324 atagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 321399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14130900 - 14130749
Alignment:
Q  82 cctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  14130900 cctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaa 14130801  T
Q  182 aactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | |||||||||||||| | ||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14130800 agctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgc 14130749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14955637 - 14955459
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  14955637 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 14955538  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    ||  |||||| |||||||||||     ||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||| |||||||||||    
T  14955537 acaggagtagcttgagtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaa 14955459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9597125 - 9596926
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  9597125 gatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 9597026  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  9597025 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 9596926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662825
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||||| |    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||| ||||    
T  21662833 gtttaattt 21662825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Original strand, 16554 - 16717
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| ||    
T  16554 tttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa--tgtatcacga 16651  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  16652 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14212748 - 14212575
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca-cgagagt 132  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||| || ||  ||| |||  |||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  14212748 aaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgtattcccgacgatgcagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatcga-agt 14212650  T
Q  133 aggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    || |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||    
T  14212649 agcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaa 14212575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13354128 - 13354058
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13354128 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggactgg 13354058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 27107066 - 27107176
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  27107066 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 27107165  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  27107166 atgcttgtttg 27107176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23642417 - 23642354
Alignment:
Q  137 tgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  23642417 tgagtattcatccaggagcgacaaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 23642354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4440906 - 4440836
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  4440906 agtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttaaagaggttgttttggtggtctgg 4440836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7824878 - 7824768
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| | |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  7824878 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 7824779  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  7824778 atgcttgtttg 7824768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 14886346 - 14886570
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14886346 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 14886445  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14886446 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 14886545  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14886546 cagtttgtttatgcctgtttgattt 14886570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 24797752 - 24797976
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797752 aggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 24797851  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24797852 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 24797951  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24797952 cagtttgtttatgcctgtttgattt 24797976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 37542736 - 37542956
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37542736 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattcttgagga 37542835  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37542836 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaaaagggatgttgct 37542935  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37542936 cagtttgtttatgcctgtttg 37542956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20343295 - 20343071
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20343295 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 20343196  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20343195 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaaagagatgttgct 20343096  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20343095 cagtttgtttatgcctgtttgattt 20343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25849088 - 25848867
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25849088 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgatga 25848989  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25848988 tagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 25848889  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25848888 cagtttgtttatgcctgtttga 25848867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22503685 - 22503479
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22503685 tgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcat 22503586  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
     ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22503585 aagagtaggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttg 22503486  T
Q  227 tttatgc 233  Q
    |||||||    
T  22503485 tttatgc 22503479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 23079444 - 23079657
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  23079444 aggataatgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 23079543  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||    
T  23079544 gagtcacaaaagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgcgacgtagct 23079643  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  23079644 cagtttgtgtatgc 23079657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 24619650 - 24619863
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  24619650 aggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 24619749  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  24619750 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 24619849  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  24619850 cagtttgtgtatgc 24619863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 24715881 - 24716094
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  24715881 aggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 24715980  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  24715981 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 24716080  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  24716081 cagtttgtgtatgc 24716094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 24748909 - 24749122
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  24748909 aggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 24749008  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  24749009 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 24749108  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  24749109 cagtttgtgtatgc 24749122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 17268691 - 17268908
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  17268691 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 17268790  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||    
T  17268791 gtcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgtcgctca 17268890  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  17268891 ttttgtgtatgcatgttt 17268908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21497080 - 21496865
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||| | || || |||||    
T  21497080 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 21496981  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21496980 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 21496881  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  21496880 gtttatgcatgtttga 21496865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 21890117 - 21890332
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||| | | || || ||    
T  21890117 atagtgacttcaaggttggtgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaag 21890216  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
     ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  21890217 ccacaaaagtagctttagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcag 21890316  T
Q  223 tttgtttatgcctgtt 238  Q
    ||||||||||| ||||    
T  21890317 tttgtttatgcatgtt 21890332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 21831122 - 21831340
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  21831122 gtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcagaatttgtatccctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 21831221  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | | ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||    
T  21831222 caaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaagcgtgatgttgcacagttt 21831321  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  21831322 gtatatgcatgtttgattt 21831340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22462961 - 22462744
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  22462961 atagtgatttcaaggttgataa-caaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttggaagaaag 22462863  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||  |||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| |    
T  22462862 tcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagaaggctgtcgctcgg 22462763  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  22462762 tttgtgtatgcgtgtttga 22462744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20774772 - 20774551
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || ||    
T  20774772 aggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaaga 20774673  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
      ||||  |||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  20774672 aggtcataagagcaacttgagtattcacctgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgct 20774573  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  20774572 cggtttgtgtatgcatgtttga 20774551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 22235275 - 22235496
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  22235275 aggatagtgactttaaggtcgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgaagagttgaaaaagttaattttagagga 22235374  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | || || |||    
T  22235375 aagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgacgtcgct 22235474  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  22235475 cattttgtgtatgcatgtttga 22235496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 28894297 - 28894518
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| | || ||    
T  28894297 aggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaaga 28894396  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
      ||||  |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  28894397 aggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgct 28894496  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  28894497 cggtttgtgtatgcatgtttga 28894518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 28915768 - 28915989
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| | || ||    
T  28915768 aggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaaga 28915867  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
      ||||  |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  28915868 aggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgct 28915967  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  28915968 cggtttgtgtatgcatgtttga 28915989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 28923123 - 28923344
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| | || ||    
T  28923123 aggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaaga 28923222  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
      ||||  |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  28923223 aggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgct 28923322  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  28923323 cggtttgtgtatgcatgtttga 28923344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 22332247 - 22332461
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  22332247 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 22332346  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  22332347 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 22332446  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  22332447 tgtgtattcctgttt 22332461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40709806 - 40709592
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  40709806 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 40709707  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  40709706 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 40709607  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  40709606 tgtgtattcctgttt 40709592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41771868 - 41771654
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  41771868 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 41771769  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  41771768 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 41771669  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  41771668 tgtgtattcctgttt 41771654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 21680133 - 21680354
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || ||||| || || ||| | || | ||||||| | || ||    
T  21680133 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaaga 21680232  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  21680233 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgct 21680332  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  21680333 caatttgtgtatgcatgtttga 21680354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20822460 - 20822245
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||| ||| ||||| | || || |||||||| ||||||||||||||| | || || |||||    
T  20822460 gtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 20822361  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
      ||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| | |||||| || | ||||    
T  20822360 taagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaagaaggatgtcgcacggttt 20822261  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| |||||||    
T  20822260 gtgtatgcgtgtttga 20822245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16357528 - 16357314
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16357528 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16357429  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16357428 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16357329  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16357328 tgtgtattcctgttt 16357314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 21563382 - 21563552
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||| | || || ||||||   ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21563382 tttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatga 21563481  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21563482 cttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgattt 21563552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 26738088 - 26738306
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||| | |||| ||  |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  26738088 gtgattttaaaatcgatgatcatggtgcgttgagatttcgaggaagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 26738187  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  26738188 tagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagttt 26738287  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  26738288 gtgtattcctgtttgattt 26738306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27519433 - 27519219
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27519433 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 27519334  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  27519333 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 27519234  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  27519233 tgtgtattcctgttt 27519219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27611380 - 27611166
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27611380 agtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 27611281  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  27611280 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 27611181  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  27611180 tgtgtattcctgttt 27611166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34567520 - 34567306
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  34567520 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 34567421  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  34567420 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 34567321  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  34567320 tgtgtattcctgttt 34567306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19770967 - 19770772
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  19770967 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 19770868  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  19770867 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 19770772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22349386 - 22349235
Alignment:
Q  88 aatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgt 187  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | |    
T  22349386 aatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattt 22349287  T
Q  188 tttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  22349286 tctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22349235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 29475433 - 29475635
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  29475433 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 29475532  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  29475533 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 29475632  T
Q  225 tgt 227  Q
    |||    
T  29475633 tgt 29475635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Original strand, 14999124 - 14999313
Alignment:
Q  50 gtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcaccc 149  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| ||    
T  14999124 gtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcc 14999223  T
Q  150 aggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
     |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  14999224 gggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 14999313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 27684779 - 27684974
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  27684779 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 27684878  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  27684879 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27684974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 20467506 - 20467676
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||   ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  20467506 tttgtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 20467605  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||  || |||||||||| || |||||| | ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  20467606 tttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgattt 20467676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 21338659 - 21338856
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |  ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||     
T  21338659 tgattttaaaatcgatgatcagggagtattgagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcat 21338758  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
       ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  21338759 agaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtt 21338856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25424217 - 25423996
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  ||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  25424217 gatagtgattttaaaatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 25424118  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  25424117 gtcatagaagtaa-ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcaca 25424019  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  25424018 gtttgtgtattcttgtttgattt 25423996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 27667850 - 27668064
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||  |||| ||| |||| || || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27667850 agtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 27667949  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  27667950 atagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 27668049  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  27668050 tgtgtattcctgttt 27668064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22135694 - 22135480
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||  ||  ||||||| || || ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||    
T  22135694 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagaaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtc 22135595  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | | ||| || |||||    
T  22135594 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgaggtgtggcacagtt 22135495  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  22135494 tgtgtattcctgttt 22135480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20800465 - 20800260
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  20800465 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 20800366  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
       ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |    
T  20800365 acctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattc 20800266  T
Q  234 ctgttt 239  Q
    ||||||    
T  20800265 ctgttt 20800260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 37290882 - 37291070
Alignment:
Q  51 tgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcaccca 150  Q
    |||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || | ||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| ||     
T  37290882 tgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacattgaagagattaggaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccg 37290981  T
Q  151 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  37290982 ggagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 37291070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23441172 - 23441054
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||    
T  23441172 atgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatatt 23441073  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaa 207  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  23441072 ctggtggtctggattgaaa 23441054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23574658 - 23574549
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |    
T  23574658 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 23574559  T
Q  230 atgcctgttt 239  Q
    || |||||||    
T  23574558 attcctgttt 23574549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21408053 - 21407945
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||||| |    
T  21408053 ttgagtattcatgcaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaatttattttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21407954  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||| ||||    
T  21407953 gtttaattt 21407945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21881960 - 21881761
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||    ||||| ||||    
T  21881960 gatgaccatggtgtgttgagtttccgaggtcgtatttgtattcctgattatgtagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatagaagtagcttga 21881861  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||| || |||||||  | || ||||||||||| ||||||   ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  21881860 gtattcacccgagagctacgaagatgtatcataatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacacgatgtcgcacagtttgtgtattcctgttt 21881761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23517537 - 23517394
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| ||| |  |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  23517537 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23517438  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaa 183  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  23517437 gtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaaa 23517394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23472215 - 23472073
Alignment:
Q  65 gaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaat 164  Q
    |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||| | |    ||||| || |||||||| || ||||||| ||  ||    
T  23472215 gaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatccgggagctagaacgat 23472116  T
Q  165 gtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  23472115 gtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaa 23472073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18776787 - 18776594
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  18776787 aaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 18776688  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18776687 gcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 18776594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 21936653 - 21936763
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  21936653 agtagtttgagtattcacccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 21936752  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  21936753 atgcttgtttg 21936763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23504345 - 23504235
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  23504345 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 23504246  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  23504245 atgcttgtttg 23504235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24582113 - 24582003
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||   |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  24582113 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgtaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 24582014  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  24582013 atgcttgtttg 24582003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27011987 - 27011877
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |||| | |||  || || |||||||||    
T  27011987 agtagttttagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggtctggaatgaagaaggagattactgagtttgttt 27011888  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  27011887 atgcttgtttg 27011877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 3263967 - 3264191
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3263967 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 3264066  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3264067 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 3264166  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3264167 cagtttgtttatgcctgtttgattt 3264191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 44661039 - 44661261
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661039 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 44661138  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44661139 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 44661238  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgat 242  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  44661239 cagttcttttatgcctgtttgat 44661261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 29452710 - 29452930
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29452710 aggataatgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 29452809  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29452810 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgttgct 29452909  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  29452910 aagttcgtttatgcctgtttg 29452930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 11206404 - 11206628
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11206404 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 11206503  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11206504 gagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 11206603  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11206604 cagtttgtttatgcctgtttgattt 11206628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20892081 - 20891857
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||  |||| || || || |||||||||||||||||||| ||    
T  20892081 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtttcctgaggttcagagaaagagtttgtatttctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 20891982  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20891981 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 20891882  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||| || |||||||    
T  20891881 cagtttgtttatgcttgcttgattt 20891857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33224011 - 33223801
Alignment:
Q  31 ttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgaga 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||  |||    
T  33224011 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgtggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataaga 33223912  T
Q  131 gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttta 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  33223911 gtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgta 33223812  T
Q  231 tgcctgtttga 241  Q
    ||| |||||||    
T  33223811 tgcatgtttga 33223801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 15358293 - 15358514
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||| |    
T  15358293 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagta 15358392  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15358393 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaaacgtgatgttgct 15358492  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  15358493 cagtttgtgtatgcgtgtttga 15358514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 15002539 - 15002758
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || |    
T  15002539 gataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaagaaa 15002638  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  15002639 gtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 15002738  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  15002739 ttttgtctatgcatgtttga 15002758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15247021 - 15246802
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15247021 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcaggggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggaggaaa 15246922  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||   ||||| | |||||||||||    
T  15246921 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgagctgaaacgtgatgttgctca 15246822  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  15246821 gtttgtctatgcatgtttga 15246802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27901485 - 27901264
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  27901485 aggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaaga 27901386  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27901385 aagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgct 27901286  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  27901285 cagtttgtgtatgcgtgtttga 27901264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 1648456 - 1648671
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||    
T  1648456 gtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagattcagaagcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttaattctagaggaaagtca 1648555  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  1648556 caagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgcacagttt 1648655  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| |||||||    
T  1648656 gtgtatgcatgtttga 1648671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 15414204 - 15414420
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||    
T  15414204 agtgatttcaaggttcatgatcagggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtc 15414303  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  15414304 acagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggttttaaacgtgatgttgcacagtt 15414403  T
Q  225 tgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  15414404 tgtatatgcatgtttga 15414420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8707011 - 8706793
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  8707011 gtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 8706912  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | | ||||  || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  8706911 caaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcatgacttaaagaaattgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagttt 8706812  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  8706811 gtatatgcatgtttgattt 8706793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16148810 - 16148589
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  16148810 aggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggagga 16148711  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||  | || || |||    
T  16148710 aagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcgct 16148611  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  16148610 cagtttgtgtatgcgtgtttga 16148589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16152956 - 16152735
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  16152956 aggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggagga 16152857  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||  | || || |||    
T  16152856 aagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcgct 16152757  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  16152756 cagtttgtgtatgcgtgtttga 16152735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15078726 - 15078510
Alignment:
Q  28 gatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacg 127  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || |||||      
T  15078726 gatttcaaggtcgatgagcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcata 15078627  T
Q  128 agagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
      ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||    
T  15078626 gaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggttcggattgaaacgtgatgttgctcagtttgt 15078527  T
Q  228 ttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15078526 ttatgcatgtttgattt 15078510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15320237 - 15320028
Alignment:
Q  32 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagag 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  | || ||||||   ||    
T  15320237 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttacattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttaaaagaaagtcacagaag 15320138  T
Q  132 taggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 231  Q
    ||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||    
T  15320137 tagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcatagtttgtatat 15320038  T
Q  232 gcctgtttga 241  Q
    || |||||||    
T  15320037 gcatgtttga 15320028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8387506 - 8387292
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  8387506 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 8387407  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  8387406 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 8387307  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  8387306 tgtgtattcctgttt 8387292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 14302896 - 14303110
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||||| || |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14302896 agtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtc 14302995  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  14302996 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 14303095  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  14303096 tgtgtattcctgttt 14303110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18298299 - 18298085
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| | || ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  18298299 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtttagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 18298200  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  18298199 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 18298100  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  18298099 tgtgtattcctgttt 18298085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40474134 - 40473920
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  40474134 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 40474035  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  40474034 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 40473935  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  40473934 tgtgtattcctgttt 40473920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14160567 - 14160350
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| ||| | |||||| ||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14160567 gatagtgactttaaagttgatgaccaaggagtgttgagattccgcggtagaatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 14160468  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    | ||   |||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  14160467 gccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcaca 14160368  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  14160367 gtttgtgtattcctgttt 14160350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12477694 - 12477480
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  12477694 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 12477595  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  12477594 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 12477495  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  12477494 tgtgtattcctgttt 12477480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 19777711 - 19777925
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  19777711 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 19777810  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  19777811 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 19777910  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  19777911 tgtgtattcctgttt 19777925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 29038322 - 29038536
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  29038322 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 29038421  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  29038422 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 29038521  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  29038522 tgtgtattcctgttt 29038536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Original strand, 8052542 - 8052755
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||    
T  8052542 gtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattca 8052641  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  8052642 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagttt 8052741  T
Q  226 gtttatgcctgttt 239  Q
    || ||| |||||||    
T  8052742 gtgtattcctgttt 8052755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27712411 - 27712216
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  27712411 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 27712312  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  27712311 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27712216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14681661 - 14681447
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  14681661 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 14681562  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||| ||||||||||| | ||||| || |||||    
T  14681561 ataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 14681462  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  14681461 tgtgtattcctgttt 14681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23956841 - 23956627
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  23956841 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 23956742  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  23956741 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 23956642  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  23956641 tgtgtattcctgttt 23956627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 14850299 - 14850503
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||| |||    ||||| ||||    
T  14850299 gatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagtagcttga 14850398  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  14850399 gtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 14850498  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  14850499 gattt 14850503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 1639367 - 1639536
Alignment:
Q  49 ggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacc 148  Q
    |||||| |||||||  |||||||| |||||||  | || ||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||    
T  1639367 ggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 1639466  T
Q  149 caggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgc 218  Q
    |  ||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  1639467 cgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgc 1639536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 15146827 - 15147018
Alignment:
Q  49 ggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacc 148  Q
    |||||| |||| ||| ||||| || | ||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| |    
T  15146827 ggtgtgttgagattccgaggtcgaatatgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatc 15146926  T
Q  149 caggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    | |||||||| || |||||||||||| |||||||  | || |||| |||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| ||| ||||    
T  15146927 cgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtcgtctggattgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctatttg 15147018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14695210 - 14695051
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  14695210 gatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 14695111  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    ||||    ||||| ||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  14695110 gtcatataagtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 14695051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12524770 - 12524555
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||| | |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  ||| |||| | ||| || |||||||||| |||||||    
T  12524770 agtgattttaaaatcgatgatgaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacgatggagagattaaggagatgattcttgaagagagtc 12524671  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||   ||||| |||||||| || || | |||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  12524670 acagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacggtt 12524571  T
Q  225 tgtttatgcctgtttg 240  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  12524570 tgtgtattcctgtttg 12524555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 18226437 - 18226578
Alignment:
Q  98 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtc 197  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |||| |||||  | || ||||||||    
T  18226437 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtc 18226536  T
Q  198 tggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  18226537 tggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 18226578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Original strand, 16354428 - 16354565
Alignment:
Q  90 tgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttt 189  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||   | ||     
T  16354428 tgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttc 16354527  T
Q  190 tggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  16354528 tggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgt 16354565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7091526 - 7091307
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||  ||||||   ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  ||||| |||| ||||| |    
T  7091526 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtatgatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagcc 7091427  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  || |||||| | || |||||||| || |||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||    
T  7091426 atagaagtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaatt 7091327  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  7091326 tgtgtattcttgtttgattt 7091307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14998305 - 14998195
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  | ||| |||||||||    
T  14998305 agtagtttgagtattcattcaggagcgactaaaatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagatcgctgagtttgttt 14998206  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  14998205 atgcttgtttg 14998195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Original strand, 15292441 - 15292511
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  15292441 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggtctgg 15292511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20828989 - 20828765
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828989 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 20828890  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20828889 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgttgct 20828790  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20828789 cagtttgtttatgcctgtttgattt 20828765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20833715 - 20833491
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20833715 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 20833616  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20833615 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgttgct 20833516  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20833515 cagtttgtttatgcctgtttgattt 20833491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1064481 - 1064261
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064481 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 1064382  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1064381 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 1064282  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1064281 cagtttgtttatgcctgtttg 1064261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31831388 - 31831164
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31831388 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattcttgagga 31831289  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31831288 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaaaagagatgttgct 31831189  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  31831188 cagtttgtttatgcatgtttgattt 31831164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 11357657 - 11357811
Alignment:
Q  90 tgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11357657 tgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgttt 11357756  T
Q  190 tggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357757 tggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 11357811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23277504 - 23277320
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |    
T  23277504 gatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaa 23277405  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23277404 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaa 23277320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12575081 - 12574864
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12575081 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgcttagattcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 12574982  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  12574981 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 12574882  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  12574881 ttttgtgtatgcatgttt 12574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27788469 - 27788252
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  27788469 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 27788370  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  27788369 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctca 27788270  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  27788269 ttttgtgtatgcatgttt 27788252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23294665 - 23294444
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||| ||||  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23294665 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgataatttgaaaaagttaattctagagga 23294566  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  23294565 aagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagtgtgacgtcgct 23294466  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  23294465 cattttgtgtatgcatgtttga 23294444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 19651771 - 19651986
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||  |||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  19651771 gtgacttcaaggtggatgatcggggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 19651870  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||    
T  19651871 caagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcatttt 19651970  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| |||||||    
T  19651971 gtgtatgcatgtttga 19651986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 27364792 - 27365013
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || ||||| || || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  27364792 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 27364891  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  27364892 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgct 27364991  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  27364992 caatttgtgtatgcatgtttga 27365013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 24876464 - 24876681
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  24876464 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaga 24876563  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||| | ||||| || ||    
T  24876564 gtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcaca 24876663  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  24876664 gtttgtgtattcctgttt 24876681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16926085 - 16925871
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16926085 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16925986  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16925985 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtt 16925886  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16925885 tgtgtattcctgttt 16925871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16999725 - 16999511
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16999725 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16999626  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16999625 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtt 16999526  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16999525 tgtgtattcctgttt 16999511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24949321 - 24949098
Alignment:
Q  19 aaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggt-gtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgag 117  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||| | |||    
T  24949321 aaggatcgtgacttcaaggttgatgatcatggttgtgatgagattcagaggaagaatttgcattcctcatgatgatggtttgaaaaagttgattttagag 24949222  T
Q  118 gagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttg 217  Q
    || |||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | || ||||    
T  24949221 gaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgttg 24949122  T
Q  218 ctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||    
T  24949121 ctcattttgtgtatgcatgtttga 24949098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9610861 - 9610647
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  9610861 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 9610762  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  9610761 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 9610662  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  9610661 tgtgtattcctgttt 9610647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10869575 - 10869361
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10869575 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 10869476  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  10869475 ataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 10869376  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  10869375 tgtgtattcctgttt 10869361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16923614 - 16923400
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16923614 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16923515  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16923514 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16923415  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16923414 tgtgtattcctgttt 16923400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16982877 - 16982663
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16982877 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16982778  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16982777 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16982678  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16982677 tgtgtattcctgttt 16982663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17064442 - 17064228
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  17064442 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 17064343  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  17064342 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 17064243  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  17064242 tgtgtattcctgttt 17064228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17068100 - 17067886
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  17068100 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 17068001  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  17068000 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 17067901  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  17067900 tgtgtattcctgttt 17067886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27371994 - 27371780
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27371994 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 27371895  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  27371894 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 27371795  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  27371794 tgtgtattcctgttt 27371780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 22324593 - 22324788
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  22324593 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtgtcccagataatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtat 22324692  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  22324693 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22324788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24710740 - 24710545
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  24710740 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 24710641  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  24710640 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 24710545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 21144759 - 21144973
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  21144759 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtc 21144858  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  21144859 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 21144958  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21144959 tgtgtattcctgttt 21144973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 27209888 - 27210106
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||| | | | ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||  | || || ||    
T  27209888 atagtgatttcaagattgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcaaaatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatattagaagaaag 27209987  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||  |||| |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||      
T  27209988 tcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcgt 27210087  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  27210088 tttgtgtatgcgtgtttga 27210106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27218741 - 27218527
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27218741 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 27218642  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  27218641 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaacgagatgtggcacagtt 27218542  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  27218541 tgtgtattcctgttt 27218527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24263076 - 24262881
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||    ||||| ||||||||    
T  24263076 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtat 24262977  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  24262976 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 24262881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 41608122 - 41608317
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  41608122 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 41608221  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  41608222 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 41608317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 44385287 - 44385469
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||  ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  44385287 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaaattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 44385386  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||    
T  44385387 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaa 44385469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 21324999 - 21325198
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  21324999 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21325098  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||| |||||||    
T  21325099 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaattcgtatattcctgttt 21325198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 24819401 - 24819619
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||| | ||||    
T  24819401 gatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagaga 24819500  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||    
T  24819501 gtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcaca 24819600  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttg 240  Q
     ||||| ||| ||||||||    
T  24819601 atttgtgtattcctgtttg 24819619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23111460 - 23111252
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||| |||  || | ||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  23111460 gtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgagattctgaggcagaattttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtca 23111361  T
Q  126 cgagagtaggttga-gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |   ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||    
T  23111360 cataagtagctttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtgatgttgcacagtt 23111261  T
Q  225 tgtttatgc 233  Q
    ||| |||||    
T  23111260 tgtatatgc 23111252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24676199 - 24675999
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||  || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    |||||  |||    
T  24676199 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctga 24676100  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  24676099 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 24676000  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  24675999 g 24675999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 22756198 - 22756398
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  22756198 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 22756297  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||| | |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  22756298 gtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22756397  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  22756398 g 22756398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 30210632 - 30210853
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggtt-cagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggag 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||| ||| | |||| ||||||| |||||| ||  |||  |||| ||| ||||||| || ||     
T  30210632 gatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcag-gatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaa 30210730  T
Q  121 agtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctc 220  Q
    |||||| | ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||  | ||||| || |    
T  30210731 agtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttg-tttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcac 30210829  T
Q  221 agtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30210830 aatttgtgtatgcgtgtttaattt 30210853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125092
Alignment:
Q  151 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttg 21125092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45530125 - 45530017
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||||| |    
T  45530125 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 45530026  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||| ||||    
T  45530025 gtttaattt 45530017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23067115 - 23066897
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| || ||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23067115 gtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgcggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 23067016  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  23067015 tagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatattgcacagttt 23066916  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || |||   ||||||||||    
T  23066915 gtgtattattgtttgattt 23066897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 23107450 - 23107663
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||| ||||| ||     
T  23107450 tgattttaaaattgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccat 23107549  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||  ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||| ||||||| |||||| | ||||| || |||||||    
T  23107550 agaagtaacttgagtattaatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggcggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttg 23107649  T
Q  227 tttatgcctgtttg 240  Q
    | ||| ||||||||    
T  23107650 tgtattcctgtttg 23107663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 23099735 - 23099812
Alignment:
Q  24 tagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099735 tagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaa 23099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 24707209 - 24707382
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||  | |||||||  || ||||||| ||||||||    ||||    
T  24707209 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaattgatgaagaaaatggttcttgaagagagtcatagaagta 24707308  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||||||    
T  24707309 gcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtccggattgaaa 24707382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 21890437 - 21890655
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||| |  ||  | || ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  21890437 gtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 21890536  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| || ||| | |||||  ||||||||||||| || |||||  | |||||||| || |||    
T  21890537 tagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagcgcgatgttgcacaattt 21890636  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| | ||||||||||    
T  21890637 gtgtattcttgtttgattt 21890655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 12640056 - 12640157
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  12640056 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 12640155  T
Q  230 at 231  Q
    ||    
T  12640156 at 12640157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22276898 - 22276788
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||    |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  22276898 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctaaaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 22276799  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  22276798 atgcttgtttg 22276788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 24831011 - 24831120
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  24831011 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatca-gatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 24831109  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  24831110 atgcttgtttg 24831120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37678194 - 37677972
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37678194 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 37678095  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37678094 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 37677995  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgat 242  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  37677994 tagtttgtttatgcctgtttgat 37677972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 31539243 - 31539466
Alignment:
Q  21 ggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31539243 ggatagtgatttcaaaattgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggag 31539342  T
Q  121 agtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31539343 agtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctc 31539442  T
Q  221 agtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31539443 agtttgtttatgcctgtttgattt 31539466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20295526 - 20295302
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20295526 aggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 20295427  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20295426 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 20295327  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20295326 cagtttgtttatgcctgtttgattt 20295302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21952023 - 21951799
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  21952023 aggacagtgattttaaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatccttgaaga 21951924  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21951923 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgct 21951824  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21951823 cagtttgtttatgcctgtttgattt 21951799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 24098848 - 24099061
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | || ||    
T  24098848 aggatagtgacttcaaggttgacgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaaga 24098947  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||    
T  24098948 aagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgct 24099047  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || |||||||||||    
T  24099048 cattttgtttatgc 24099061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 19662381 - 19662603
Alignment:
Q  19 aaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagg 118  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  19662381 aaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagagg 19662480  T
Q  119 agagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgc 218  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||    
T  19662481 aaagtcacaagagtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgc 19662580  T
Q  219 tcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||    
T  19662581 tcaatttgtgtatgcatgtttga 19662603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19855419 - 19855198
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||    
T  19855419 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagagga 19855320  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19855319 aagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaaacgggatattgct 19855220  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||  |||| ||||| |||||||    
T  19855219 caaattgtgtatgcatgtttga 19855198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 20856008 - 20856225
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  20856008 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattaagaggcagaatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 20856107  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa-agggatgttgctca 221  Q
    |||  |||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     
T  20856108 tcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttttaaagaaggatgtcgctcg 20856207  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  20856208 gtttgtgtatgcgtgttt 20856225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 20939308 - 20939529
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| |||| || |||||| |||| || || || ||||| ||| | || ||    
T  20939308 aggatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaattttagaaga 20939407  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  20939408 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 20939507  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  20939508 cattttgtgtatgcatgtttga 20939529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 50619509 - 50619713
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||| ||||    
T  50619509 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttga 50619608  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  50619609 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 50619708  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  50619709 gattt 50619713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 20835145 - 20835354
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||| ||           || |||  |||||    
T  20835145 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcccgatgatgatga-----------tggttca-gagga 20835232  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20835233 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgct 20835332  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  20835333 cagtttgtgtatgcatgtttga 20835354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 51332743 - 51332957
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  51332743 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 51332842  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  51332843 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 51332942  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  51332943 tgtgtattcctgttt 51332957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 41352927 - 41353126
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||  ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  41352927 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 41353026  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  41353027 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 41353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21831412 - 21831198
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  21831412 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 21831313  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  21831312 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 21831213  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21831212 tgtgtattcctgttt 21831198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20139924 - 20139720
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||||||   ||||||  ||||||| || ||  |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  20139924 gatgaccaaggtgtgttgaggtttcaaggtaggatttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 20139825  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  20139824 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtctattcttgttt 20139725  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  20139724 gattt 20139720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 19760120 - 19760342
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||||| |||||  | || ||| |||  ||| |||||||||| ||||    
T  19760120 gatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgattccgaggtagaatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaagaga 19760219  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  19760220 gtcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 19760319  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  19760320 gtttgtatattcatgtttgattt 19760342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21838040 - 21837845
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  21838040 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 21837941  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  21837940 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 21837845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19107477 - 19107275
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |    
T  19107477 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagcc 19107378  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||  | ||||| || |||||    
T  19107377 acaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagcgagatgtggcacagtt 19107278  T
Q  225 tgt 227  Q
    |||    
T  19107277 tgt 19107275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 16349848 - 16350063
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtag-agtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagt 123  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| |||||| |||| ||| |||| || | |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  16349848 agtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagtaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagt 16349947  T
Q  124 cacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagt 223  Q
    ||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||    
T  16349948 catagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagt 16350047  T
Q  224 ttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||| ||| |||||||    
T  16350048 ttgtgtattcctgttt 16350063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16373623 - 16373456
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  16373623 gatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16373524  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    ||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16373523 gtattcatccgggagctgcgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaa 16373456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 33390298 - 33390493
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||    ||||| ||||||||    
T  33390298 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 33390397  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  33390398 tcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 33390493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Original strand, 23197493 - 23197605
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  23197493 gatagtgactttaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 23197592  T
Q  122 gtcacgagagtag 134  Q
    || || |||||||    
T  23197593 gtgacaagagtag 23197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22110134 - 22109912
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22110134 gatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22110035  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||    
T  22110034 gtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcaca 22109935  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22109934 gtttgtgtattcctgtttgattt 22109912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22113983 - 22113761
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  22113983 gatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 22113884  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||    
T  22113883 gtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcaca 22113784  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  22113783 gtttgtgtattcctgtttgattt 22113761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 22361495 - 22361713
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||  |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22361495 gtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 22361594  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        || |  ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | || |||||  |||||    
T  22361595 tagaagaaacttgagtattcatccgggagctacgaagatctatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcatagttt 22361694  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| | ||||||||||    
T  22361695 gtgtattcttgtttgattt 22361713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21750034 - 21749831
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||||| || ||| || | ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||    
T  21750034 gatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtaggatttgtattccagatgat-atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 21749936  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| | |||||    
T  21749935 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgttt 21749836  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  21749835 gattt 21749831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21025258 - 21025080
Alignment:
Q  49 ggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacc 148  Q
    |||||| |||| ||| ||||  || ||||||| |||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||  |||||||    ||||| |||||||||||||    
T  21025258 ggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagggaggaagaaaatgattcttgaaaagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 21025159  T
Q  149 caggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  21025158 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgt 21025080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Original strand, 16077955 - 16078120
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    |||| ||||||||  ||| |||| |||||||  | |||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  16077955 tttgcatccctgacgatgcagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 16078054  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| |||||  | || | |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  16078055 tttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20250910 - 20250692
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||| || |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  20250910 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgaggttttgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 20250811  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||  ||||| | |||||||| |||||    
T  20250810 atagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaacgtgatgttgcacagtt 20250712  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | | ||||||||    
T  20250711 tgtgtattcttatttgattt 20250692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Original strand, 17044333 - 17044447
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||    
T  17044333 agagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctgg 17044432  T
Q  193 tggtctggtttgaaa 207  Q
    |||||||||||||||    
T  17044433 tggtctggtttgaaa 17044447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 20830747 - 20830857
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  20830747 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 20830846  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  20830847 atgcttgtttg 20830857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 15887 - 16113
Alignment:
Q  18 caaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgag 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887 caaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgag 15986  T
Q  118 gagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15987 gagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttg 16086  T
Q  218 ctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16087 ctcagtttgtttatggctgtttgattt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24365375 - 24365153
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24365375 aggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 24365276  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24365275 gagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 24365176  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  24365175 cagttcgtttatgcctgtttgat 24365153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 10468167 - 10468388
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  10468167 aggatagtgacttcaaagttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaaga 10468266  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||    
T  10468267 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgct 10468366  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  10468367 cagtttgtttatgcatgtttga 10468388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 5296524 - 5296737
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  5296524 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 5296623  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     ||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  5296624 aagttacaagagtagcttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 5296723  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  5296724 cagtttgtgtatgc 5296737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19435965 - 19435744
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  |    
T  19435965 aggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaata 19435866  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  19435865 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgct 19435766  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| | ||||| |||||||    
T  19435765 cagtttatgtatgcgtgtttga 19435744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21472562 - 21472343
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |    
T  21472562 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaataatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 21472463  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21472462 gtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctca 21472363  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  21472362 gtttgtttatgcatgtttga 21472343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 8762251 - 8762472
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||  |    
T  8762251 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaata 8762350  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  8762351 aagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 8762450  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  8762451 cattttgtgtatgcgtgtttga 8762472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18795651 - 18795432
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  | || || |    
T  18795651 gatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatcttggaagaaa 18795552  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  18795551 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctca 18795452  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  18795451 atttgtgtatgcgtgtttga 18795432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25769148 - 25768933
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  25769148 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtca 25769049  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  25769048 cagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgattttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagttt 25768949  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  25768948 gtttatgcatgtttga 25768933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 28282131 - 28282350
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || |||||    
T  28282131 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagga 28282230  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  28282231 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgct 28282330  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  28282331 cattttgtgtatgcatgttt 28282350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 241
Target Start/End: Original strand, 14380805 - 14381006
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  14380805 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14380904  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14380905 gtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgttt 14381004  T
Q  240 ga 241  Q
    ||    
T  14381005 ga 14381006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19454383 - 19454162
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  19454383 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgattttcgagga 19454284  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||  || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  19454283 aagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 19454184  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  19454183 caatttgtgtatgcatgtttga 19454162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 19488607 - 19488814
Alignment:
Q  37 gttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggt 136  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||   ||||| |    
T  19488607 gttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaattcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagct 19488706  T
Q  137 tgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 236  Q
    | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19488707 taagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatg 19488806  T
Q  237 tttgattt 244  Q
    ||||||||    
T  19488807 tttgattt 19488814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15460299 - 15460078
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  15460299 aggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaaga 15460200  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||     
T  15460199 aagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaagaaggatgtcgcg 15460100  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||| ||||| |||||||    
T  15460099 cggtttgtgtatgcgtgtttga 15460078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19880259 - 19880040
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  19880259 gatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 19880160  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  19880159 gccacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgatgttgctca 19880060  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  19880059 atttgtgtatgcctgtttga 19880040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 5838591 - 5838761
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5838591 tttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 5838690  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  5838691 tttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgattt 5838761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25113510 - 25113296
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  25113510 agtgattttaaattcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 25113411  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  25113410 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 25113311  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  25113310 tgtgtattcctgttt 25113296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 2874128 - 2874340
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || |||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||||     
T  2874128 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcat 2874227  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  2874228 agaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 2874327  T
Q  227 tttatgcctgttt 239  Q
    | ||| |||||||    
T  2874328 tgtattcctgttt 2874340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27188331 - 27188180
Alignment:
Q  88 aatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgt 187  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |    
T  27188331 aatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattt 27188232  T
Q  188 tttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  27188231 tctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgttt 27188180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 27260909 - 27261060
Alignment:
Q  88 aatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgt 187  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |    
T  27260909 aatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattt 27261008  T
Q  188 tttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  27261009 tctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgttt 27261060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 16626040 - 16626254
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16626040 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16626139  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  16626140 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16626239  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16626240 tgtgtattcctgttt 16626254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 29591243 - 29591457
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  29591243 agtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 29591342  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  29591343 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 29591442  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  29591443 tgtgtattcctgttt 29591457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 1542407 - 1542621
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||| || |||| ||| |||  ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  1542407 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtctgttgagattccgagagagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 1542506  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||   ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||    
T  1542507 acagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtt 1542606  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1542607 tgtgtattcctgttt 1542621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 18966612 - 18966834
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||| || | ||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  18966612 gatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgtgatttcgaggtagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatgattcttgaagaga 18966711  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | ||||| || |||||  | ||    
T  18966712 gtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaatagtgatgtgccaca 18966811  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     ||||| ||| | ||||||||||    
T  18966812 atttgtgtattcatgtttgattt 18966834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 25609215 - 25609403
Alignment:
Q  56 tgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagc 155  Q
    |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||    
T  25609215 tgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagc 25609314  T
Q  156 tacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||| ||| | ||||||||||    
T  25609315 tacaaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtgatgttgcaccgtttgtgtattcttgtttgattt 25609403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 24312510 - 24312705
Alignment:
Q  44 atcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtat 143  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||    
T  24312510 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 24312609  T
Q  144 tcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  24312610 tcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 24312705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 34644910 - 34645125
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||| |  |||||| | || || |||||    
T  34644910 gtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcagaggcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaagattgattttggaagaaagtca 34645009  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | ||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||    
T  34645010 caagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtgatgttgctcagttt 34645109  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| |||||||    
T  34645110 gtatatgcgtgtttga 34645125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 18197042 - 18197270
Alignment:
Q  19 aaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagg 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| ||||||| || ||  | || ||| |||||||| |||||||||| |    
T  18197042 aaggatagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaag 18197141  T
Q  119 agagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg---tttgaaaagggatgt 215  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||    |||||| | |||||    
T  18197142 agagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttggtggtcgggattattgaaacgtgatgt 18197241  T
Q  216 tgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  18197242 ggcacagtttgtgtattcctgtttgattt 18197270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23079430 - 23079208
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23079430 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagggagaatttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 23079331  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||  |    
T  23079330 gtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtagcata 23079231  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     ||||| ||| ||||||||||||    
T  23079230 atttgtgtattcctgtttgattt 23079208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19865596 - 19865430
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  19865596 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatta 19865497  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    | |||||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  19865496 tctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttg 19865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 22078014 - 22078232
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| ||||||  |  ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22078014 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 22078113  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||    
T  22078114 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagttt 22078213  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| | ||||||||||    
T  22078214 gtgtattcttgtttgattt 22078232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22434826 - 22434608
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||| ||| | || ||||||| |||| | |||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22434826 gtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 22434727  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||    
T  22434726 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagttt 22434627  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| ||||||| ||||    
T  22434626 gtgtattcctgtttaattt 22434608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22443224 - 22443006
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||| ||| | || ||||||| |||| | |||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22443224 gtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 22443125  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||    
T  22443124 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagttt 22443025  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| ||||||| ||||    
T  22443024 gtgtattcctgtttaattt 22443006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 28262520 - 28262734
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  | |||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  28262520 agtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 28262619  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  28262620 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtt 28262719  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  28262720 tgtgtattcctgttt 28262734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 28341269 - 28341483
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  | |||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  28341269 agtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 28341368  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  28341369 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtt 28341468  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  28341469 tgtgtattcctgttt 28341483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15897055 - 15896850
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| || |||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  15897055 gatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgcgattacgaggcagaattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagaga 15896956  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  15896955 gtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 15896856  T
Q  222 gtttgt 227  Q
    ||||||    
T  15896855 gtttgt 15896850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 21563454 - 21563663
Alignment:
Q  24 tagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagt 123  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| | ||||| ||     
T  21563454 tagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagc 21563553  T
Q  124 cacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagt 223  Q
    |||  |||||  || || || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |    
T  21563554 cacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaat 21563653  T
Q  224 ttgtttatgc 233  Q
    |||| |||||    
T  21563654 ttgtgtatgc 21563663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 21569313 - 21569522
Alignment:
Q  24 tagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagt 123  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| | ||||| ||     
T  21569313 tagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagc 21569412  T
Q  124 cacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagt 223  Q
    |||  |||||  || || || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |    
T  21569413 cacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaat 21569512  T
Q  224 ttgtttatgc 233  Q
    |||| |||||    
T  21569513 ttgtgtatgc 21569522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 22761793 - 22761997
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||    
T  22761793 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 22761892  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| | ||| | |||||    
T  22761893 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttatgtattcttgttt 22761992  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  22761993 gattt 22761997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 18407265 - 18407484
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  18407265 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 18407364  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  18407365 atagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaacgcgatgttgcacagtt 18407464  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    | | ||| | ||||||||||    
T  18407465 tttgtattcttgtttgattt 18407484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 27566371 - 27566517
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||    
T  27566371 agagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctgg 27566470  T
Q  193 tggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  27566471 tggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 27566517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 161
Target Start/End: Original strand, 14379255 - 14379376
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  14379255 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14379354  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaa 161  Q
    || |||| || |||||||||||    
T  14379355 gtgttcatccgggagctacaaa 14379376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 20636624 - 20636843
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||| ||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  20636624 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 20636723  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||    
T  20636724 atagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtt 20636823  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  20636824 tgtgtattcttgtttgattt 20636843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18436570 - 18436392
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  |   |||| ||||||| |||||| ||  |||  | || ||||||||||| || || |    
T  18436570 gatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatcaaaaagttgattctggaagaaa 18436471  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |||||   ||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  18436470 gtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctgg 18436392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 18837336 - 18837446
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  18837336 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttaaagagattgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgttt 18837435  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  18837436 atgcttgtttg 18837446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 16926972 - 16927165
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||||||   ||||    
T  16926972 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcacagaagta 16927071  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||    |||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||    
T  16927072 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgt 16927165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 27330820 - 27330975
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||| | |||||  | ||    
T  27330820 atgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttatt 27330919  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  27330920 ttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgattt 27330975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 27391560 - 27391715
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||| | |||||  | ||    
T  27391560 atgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttatt 27391659  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  27391660 ttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgattt 27391715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 14624785 - 14624895
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  14624785 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgttctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 14624884  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  14624885 atgcttgtttg 14624895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16098904 - 16098838
Alignment:
Q  129 gagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtgg 195  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16098904 gagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 16098838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 16381801 - 16381911
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  16381801 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 16381900  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  16381901 atgcttgtttg 16381911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 239
Target Start/End: Original strand, 28291823 - 28291909
Alignment:
Q  153 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  28291823 agctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 28291909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 244
Target Start/End: Original strand, 16962850 - 16962987
Alignment:
Q  107 tgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||| | |||||  | |||||||||||||| |||||    
T  16962850 tgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaatatattttggtggtctggattgaa 16962949  T
Q  207 aagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
      | ||||| || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  16962950 gcgcgatgtggcacagtttgtgtactcttgtttgattt 16962987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 1648242 - 1648352
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  1648242 agtagtttgagtattcatccaagagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 1648341  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  1648342 atgcttgtttg 1648352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 15077794 - 15077904
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |  |||| | |||  ||||| ||||||| |    
T  15077794 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctagaatgaagaaggaaattgctgagtttgtat 15077893  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  15077894 atgcttgtttg 15077904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23997101 - 23996991
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  23997101 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagattttaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 23997002  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  23997001 atgcttgtttg 23996991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 28287996 - 28288120
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || ||  | |||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  28287996 agtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 28288095  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcaccc 149  Q
    |    ||||| ||||||||||||||    
T  28288096 atagaagtagcttgagtattcaccc 28288120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27391 - 27167
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27391 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttgagga 27292  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  27291 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagatatgttgct 27192  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  27191 cattttgtttatgcttgtttgattt 27167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 7321 - 7534
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  7321 aggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaaga 7420  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7421 gagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgct 7520  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  7521 cagtttgtttatgc 7534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5659
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |    
T  5878 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaa 5779  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  5778 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 5679  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  5678 gtttgtctatgcatgtttga 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 81008 - 81229
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  81008 aggacagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattcttgaaga 81107  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||    
T  81108 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaatgtgacgttgct 81207  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  81208 cagtttgtgtatgcatgtttga 81229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32539 - 32319
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  32539 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaa 32440  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactg-ttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctc 220  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  32439 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctc 32340  T
Q  221 agtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  32339 agtttgtctatgcatgtttga 32319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 32495 - 32716
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  32495 aggatagtgacttcaaggtagatgatcagggtgtaatgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaaga 32594  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  32595 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 32694  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  32695 cagtttgtgtatgcatgtttga 32716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3881 - 3660
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  3881 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagga 3782  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  3781 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggtctgggttgaaacgtgatgttgct 3682  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  3681 cagtttgtgtatgcgtgtttga 3660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3300 - 3085
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||  ||||    
T  3300 gtgatttcaaggttgatggtgagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaagaatgtca 3201  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  3200 caaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 3101  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  3100 gtttatgcatgtttga 3085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 22554 - 22773
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  22554 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 22653  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| | | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  22654 gtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 22753  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  22754 gtttgtctatgcatgtttga 22773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 14375 - 14594
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  14375 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 14474  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| | | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| || |    
T  14475 gtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttactaa 14574  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  14575 gtttgtctatgcatgtttga 14594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 864 - 1083
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||| || || |    
T  864 gatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattctagaagaaa 963  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  964 gtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 1063  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  1064 gtttgtgtatgcgtgtttga 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20311
Alignment:
Q  31 ttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgaga 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  20513 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 20414  T
Q  131 gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttta 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||    
T  20413 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgta 20314  T
Q  231 tgc 233  Q
    |||    
T  20313 tgc 20311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23333 - 23131
Alignment:
Q  31 ttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgaga 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  23333 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 23234  T
Q  131 gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttta 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||    
T  23233 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgta 23134  T
Q  231 tgc 233  Q
    |||    
T  23133 tgc 23131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28355 - 28134
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28355 aggatagtgactataaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggagga 28256  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  28255 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgct 28156  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  28155 caatttgtgtatgcatgtttga 28134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43913 - 43700
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  43913 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattctagaaga 43814  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || || |||    
T  43813 gagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacttgacgtagct 43714  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    |||||||| |||||    
T  43713 cagtttgtgtatgc 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 149700 - 149479
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  149700 aggaaagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggagga 149601  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  149600 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgct 149501  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  149500 cagtttgtctatgcatgtttga 149479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 194880 - 195101
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||||    
T  194880 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagagga 194979  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  194980 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 195079  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  195080 cattttgtgtatgcatgtttga 195101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 25754 - 25933
Alignment:
Q  65 gaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaat 164  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  25754 gagggagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 25853  T
Q  165 gtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  25854 gtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattt 25933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 180944 - 180834
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |   ||||||||||| || |  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  180944 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcatgattttaatatgttgttttggtggccttgaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 180845  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  180844 atgcttgtttg 180834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 454 - 233
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  454 aggatagtgacttcaaggttgatgaccagggtgtattgagattcagaggtagaatttatattcctgaaaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 355  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||    
T  354 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacatgacgttgct 255  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  254 cagtttgtgtatgcatgtttga 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2718 - 2497
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||    
T  2718 aggatagtgactttaaggttgatgattagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattttagagga 2619  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2618 aagtcacaagagtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaagtgatgttgct 2519  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  2518 cagtttgtgtatgcgtgtttga 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 13077 - 13298
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  13077 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 13176  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  13177 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgct 13276  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  13277 cagtttgtgtatgcatgtttga 13298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 68500 - 68279
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  68500 aggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaaga 68401  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  68400 aagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaagagggatgtcgct 68301  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  68300 cagtttgtgtatgcgtgtttga 68279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4350
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || || || | ||| ||| | |||||    
T  4129 aggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagagga 4228  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  4229 aagtcacaagagtagcttaagtattcattcgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 4328  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  4329 caatttgtgtatgcgtgtttga 4350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42047 - 41826
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |||||    
T  42047 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtccagaggaagaatttgtattcctaataatgacgagttgaaaaagttgattttagagga 41948  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  41947 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 41848  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  41847 cattttgtgtatgcatgtttga 41826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 249743 - 249530
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  |    
T  249743 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaaa 249644  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||    
T  249643 aagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagct 249544  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || ||||| |||||    
T  249543 cattttgtatatgc 249530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 2508 - 2727
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| | || || |    
T  2508 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttggaagaaa 2607  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  2608 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtccggtttgaagcgtgatgttgctca 2707  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  2708 atttgtgtatgcatgtttga 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 48212 - 48431
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |    
T  48212 gatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaa 48311  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    | ||   |||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||   |||||||||||    
T  48312 gccataggagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacctgatgttgctca 48411  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  48412 gtttgtttatgcatgtttga 48431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 57025 - 57236
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||| || |||||| ||||    ||||| ||||| ||| | ||||| |    
T  57025 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgaggttcaggggaagaatttgcattcctgatgatgacagtttgaaaaagttaattttagaggaaa 57124  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  57125 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 57224  T
Q  222 gtttgtttatgc 233  Q
     ||||| |||||    
T  57225 ttttgtgtatgc 57236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27643 - 27433
Alignment:
Q  31 ttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgaga 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||   |    
T  27643 ttcaatgttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaa 27544  T
Q  131 gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttta 230  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27543 gtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgctcagtttgttta 27444  T
Q  231 tgcctgtttga 241  Q
    ||| |||||||    
T  27443 tgcatgtttga 27433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20809
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  21030 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattccttacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 20931  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  20930 aagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgtagct 20831  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||| ||||||| |||||||    
T  20830 caatttatttatgcatgtttga 20809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45647 - 45426
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  45647 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagatgtagaatttgtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 45548  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  45547 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggtccggtttgaaacgcgacgttgct 45448  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| | ||||| |||||||    
T  45447 cagtttttgtatgcatgtttga 45426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 19522 - 19741
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |    
T  19522 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagcc 19621  T
Q  125 acgaga-gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagt 223  Q
    |  ||| |||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||    
T  19622 at-agatgtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagt 19720  T
Q  224 ttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    | || ||| | ||||||||||    
T  19721 tcgtgtattcttgtttgattt 19741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3916 - 3700
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  3916 agtgacttcaaggttgatgttcagggtgtgttgaggttcagagggagaatttgcattccagataatgatgagttgaaaaagtttattctggaagaaagtc 3817  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    || ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  3816 acaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtt 3717  T
Q  225 tgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  3716 tgtctatgcatgtttga 3700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 1150 - 1369
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || || |    
T  1150 gatagtgatttcaaggttgatgatcaaggagtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaagaaa 1249  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1250 gtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 1349  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  1350 gtttgtttatgcatgtttga 1369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5554 - 5339
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| |||| |||| | || || |  ||    
T  5554 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaagaaataca 5455  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  5454 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 5355  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  5354 gtttatgcatgtttga 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20248 - 20029
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||    
T  20248 gatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaga 20149  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||||    
T  20148 gtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctactaatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctca 20049  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  20048 gtttgtgtatgcatgtttga 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 75560 - 75508
Alignment:
Q  148 ccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  75560 ccaggagcgacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggcctgg 75508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 51041 - 51260
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||||| | || || |    
T  51041 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaa 51140  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||  || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  51141 gtcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctca 51240  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  51241 gtttgtttatgcatgtttga 51260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 2531 - 2752
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  2531 aggatagtgacttcaaggtcgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaaggatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 2630  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  2631 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgct 2730  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || || || ||||| |||||||    
T  2731 catttcgtgtatgcatgtttga 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8190 - 7969
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || |||||| |||| |  ||||| ||||| ||| | |||||    
T  8190 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttaattttagagga 8091  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||  | || || |||    
T  8090 gagtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgct 7991  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  7990 cattttgtgtatgcatgtttga 7969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4849
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  4628 aggataatgacttcaaggttgatgattagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 4727  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  4728 aagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgct 4827  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  4828 cagtttgtgtatgcatgtttga 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 56076 - 56297
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||    
T  56076 aggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaga 56175  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  56176 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgaagttgct 56275  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  56276 cagtttgtgtatgcatgtttga 56297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 32853 - 33074
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| || ||||| || || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  32853 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 32952  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  32953 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgct 33052  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  33053 caatttgtgtatgcatgtttga 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41278 - 41168
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  41278 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 41179  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  41178 atgcttgtttg 41168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 51356 - 51577
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  51356 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaaga 51455  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||    
T  51456 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgct 51555  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |  ||||| ||||| |||||||    
T  51556 cgttttgtatatgcgtgtttga 51577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 60390 - 60611
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  60390 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaaga 60489  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||    
T  60490 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgct 60589  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |  ||||| ||||| |||||||    
T  60590 cgttttgtatatgcgtgtttga 60611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 66778 - 66999
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  66778 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaaga 66877  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||    
T  66878 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgct 66977  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |  ||||| ||||| |||||||    
T  66978 cgttttgtatatgcgtgtttga 66999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26495 - 26389
Alignment:
Q  55 ctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggag 154  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| || ||||    
T  26495 ctgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggag 26396  T
Q  155 ctacaaa 161  Q
    |||||||    
T  26395 ctacaaa 26389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18477 - 18257
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || |    
T  18477 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaa 18378  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactg-ttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctc 220  Q
    || || | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  18377 gtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgatggtttgggttgaaatgtgatgttgctc 18278  T
Q  221 agtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  18277 agtttgtttatgcatgtttga 18257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10917 - 10702
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || | ||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  10917 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaagaaagtca 10818  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   |||||  | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  10817 cagaagtagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgttgctcagttt 10718  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  10717 gtttatgcatgtttga 10702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29181 - 28966
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || || ||    
T  29181 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagcca 29082  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  29081 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgcttagttt 28982  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  28981 gtttatgcatgtttga 28966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30055 - 29851
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||||||  ||||| |||||||  |||||||  ||||||| ||  |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||    
T  30055 gatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 29956  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| || ||| | ||||   |||||| || |||||| |||||| | ||||||||  ||||||| ||| | |||||    
T  29955 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaacgcgatgttgcagagtttgtgtattcttgttt 29856  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  29855 gattt 29851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1010 - 792
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  1010 atagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 911  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||  |||| |  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  910 tcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcag 811  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  810 tttgtgtatgcgtgtttga 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 48382 - 48588
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||    
T  48382 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagagga 48481  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || || |||    
T  48482 aagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagct 48581  T
Q  220 cagtttg 226  Q
    |||||||    
T  48582 cagtttg 48588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 89623 - 89832
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || || |    
T  89623 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaa 89722  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||     
T  89723 gtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgttgatct 89822  T
Q  222 gtttgtttat 231  Q
    ||| ||||||    
T  89823 gttcgtttat 89832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Original strand, 90301 - 90510
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || || |    
T  90301 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaa 90400  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||     
T  90401 gtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgttgatct 90500  T
Q  222 gtttgtttat 231  Q
    ||| ||||||    
T  90501 gttcgtttat 90510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Original strand, 390492 - 390600
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| | |    
T  390492 ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtattctt 390591  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||||||||    
T  390592 gtttgattt 390600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 993 - 778
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||| | |  || || ||    
T  993 gtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtagaaagcca 894  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||     
T  893 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaaacgtgatgttgctcagttc 794  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  793 gtttatgcatgtttga 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 412 - 631
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattctt-gaggaga 121  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || || || |    
T  412 atagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttttagaagaaa 511  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  |||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||     
T  512 gtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcg 611  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  612 gtttgtgtatgcgtgtttga 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Original strand, 25079 - 25262
Alignment:
Q  58 aggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagcta 157  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25079 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagcta 25178  T
Q  158 caaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25179 cgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttga 25262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19977 - 19758
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||| |    
T  19977 gatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaa 19878  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  19877 gtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgctta 19778  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  19777 atttgtgtatgcatgtttga 19758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24139 - 23920
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||| |    
T  24139 gatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaa 24040  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  24039 gtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgctta 23940  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  23939 atttgtgtatgcatgtttga 23920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 24254 - 24472
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  24254 gtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 24353  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    | | ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||    
T  24354 caaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagttt 24453  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  24454 gtatatgcttgtttgattt 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 323834 - 323648
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| || | |||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||||    
T  323834 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattttggagga 323735  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  323734 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 323648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 202650 - 202868
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||    
T  202650 gtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgcggtagaatttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtca 202749  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||| |  ||||||| ||||||    
T  202750 cagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccgcattcaaacgtaatgttgcacagttt 202849  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  202850 gtatatgaatgtttgattt 202868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 13475 - 13696
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||| |||| || | |||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13475 aggatagtgacttcaaggttgatgaaaagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattctagagga 13574  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  13575 aagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 13674  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  13675 cattttgtgtatgcatgtttga 13696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 5512 - 5731
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  5512 aggatagtgacttcaaagttgatgattagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaaga 5611  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||  |||||||| | || || |||    
T  5612 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagct 5710  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  5711 cagtttgtgtatgcatgtttg 5731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 6414 - 6635
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||||    
T  6414 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagatttagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagagga 6513  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  6514 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgct 6613  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  6614 cattttgtgtatgcatgtttga 6635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21111 - 20895
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  21111 gatagtgacttcaaggttaatgatcagggtatattgaagttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 21012  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  21011 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaaacgtgatgttgctca 20912  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtt 238  Q
    ||| || ||||| ||||    
T  20911 gttggtgtatgcgtgtt 20895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 11235 - 11454
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||| || ||||||||||| ||  |||| ||||||||| | ||||| |    
T  11235 gatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaa 11334  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    | ||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  11335 gccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 11434  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  11435 ttttgtgtatgcatgtttga 11454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 15005 - 15224
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||| || ||||||||||| ||  |||| ||||||||| | ||||| |    
T  15005 gatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaa 15104  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    | ||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  15105 gccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 15204  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  15205 ttttgtgtatgcatgtttga 15224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 9986 - 10205
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |    
T  9986 gatagtgacttcaaggttgatgatctgggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 10085  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| || |||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  10086 gtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaaaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcaca 10185  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  10186 gtttgtatatgcatgtttga 10205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 2663 - 2841
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||| |    
T  2663 gatagtgacttcaaggttgatgatgagggtgtgttgaggttcggagaaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagaggaaa 2762  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  2763 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11863 - 11690
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  | || ||    
T  11863 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcataggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatcttagaaga 11764  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggt 193  Q
     |||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11763 aagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 11962 - 12175
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||    
T  11962 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagatga 12061  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | ||||| |||    
T  12062 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggttcggtttgaattgtgatgtcgct 12161  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || ||||| |||||    
T  12162 cattttgtgtatgc 12175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 20617 - 20838
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||| | ||  |    
T  20617 aggatagtgactttaaggttgatgatcatggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaa 20716  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  20717 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatcttgatttgaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtgatgttgct 20816  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  20817 cagtttgtctatgcgtgtttga 20838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 27552 - 27662
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  27552 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgggatgaagaaggagattgctgagtttgttt 27651  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  27652 atgcttgtttg 27662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 244 - 462
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| || | ||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  244 gtgatttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaacttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 343  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||    
T  344 tagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcacagttt 443  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  444 gtatatgcatgtttgattt 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 17155 - 17377
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| || | ||| |||| ||| ||||||| | |||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  17155 gataatgacttcaaggttgatgatcaggaggtgttgcgattctgaggcagaatttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 17254  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  17255 gtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 17354  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  17355 gtttgtgtattcctgtttgattt 17377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 10633 - 10819
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||| ||| | |||||    
T  10633 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagagga 10732  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  10733 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaa 10819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 20847 - 21033
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||| ||| | |||||    
T  20847 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagagga 20946  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  20947 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaa 21033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26826 - 26756
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  26826 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtggcctgg 26756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 261427 - 261217
Alignment:
Q  31 ttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgaga 130  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||  ||||| |||    
T  261427 ttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtgttcttgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaggtcacaaga 261328  T
Q  131 gtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttta 230  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  261327 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgta 261228  T
Q  231 tgcctgtttga 241  Q
    ||| |||||||    
T  261227 tgcatgtttga 261217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 278026 - 278226
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||  || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||||||||    
T  278026 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaggttga 278125  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| | |||||    
T  278126 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcatgttt 278225  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  278226 g 278226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6343 - 6130
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||    
T  6343 aggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagagatagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagagga 6244  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||||||  | ||||| |||    
T  6243 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaagcgagatgtcgct 6144  T
Q  220 cagtttgtttatgc 233  Q
    || ||||| |||||    
T  6143 cattttgtgtatgc 6130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 49690 - 49911
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| | ||| |||| || |||||||| || ||| |||| | ||||||| | || ||    
T  49690 aggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 49789  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
     |||||| |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  49790 aagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgct 49889  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  49890 caatttgtgtatgcatgtttga 49911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9597 - 9387
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  9597 tgatttgaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcac 9498  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
      |||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  9497 aggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 9398  T
Q  227 tttatgcctgt 237  Q
    | ||| |||||    
T  9397 tgtattcctgt 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44279 - 44065
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||  ||| |||||||  | || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  44279 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagagagaatttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 44180  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  44179 acagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 44080  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  44079 tgtgtattcctgttt 44065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 797 - 966
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| |  ||  |||||||| | |||||| ||||||| || |||||||    
T  797 agtgattttaaaatcgatgatcatggtgtattgaggtttcgaggtagaatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtc 896  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 194  Q
    || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  897 acaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16059 - 15850
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16059 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcac 15960  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
      |||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  15959 aggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 15860  T
Q  227 tttatgcctg 236  Q
    | ||| ||||    
T  15859 tgtattcctg 15850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 100754 - 100952
Alignment:
Q  49 ggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtatt---c 145  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||| ||||||| || ||||||   |    
T  100754 ggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattattc 100853  T
Q  146 acccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  100854 atctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgattt 100952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 181275 - 181109
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  181275 tttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 181176  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    | |||||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  181175 tctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttg 181109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 331 - 546
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||    
T  331 gtgacttcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtca 430  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  431 cagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatgacctgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagttt 530  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||| |||||||    
T  531 gtttatgcatgtttga 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28347 - 28173
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  28347 aggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagagga 28248  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 194  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28247 aagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34600 - 34426
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  34600 aggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagagga 34501  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 194  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34500 aagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 13107
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || || || | ||| ||| | |||||    
T  13330 aggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagagga 13231  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccagg-agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg-tggtctggtttgaaaagggatgttg 217  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |    
T  13230 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggaagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtgatgtcg 13131  T
Q  218 ctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||    
T  13130 ctcaatttgtgtatgcatgtttga 13107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 95184 - 95399
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||| ||||| | || || |||||||| || |||||||| ||| | || || |||||    
T  95184 gtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtattgagatttagaggtagaatttgtgttcccgacaatgaagaattaaagaagttaattttagaagaaagtca 95283  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
      |||| |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  95284 taagagcaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggttt 95383  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
    || ||||| |||||||    
T  95384 gtgtatgcatgtttga 95399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 108992 - 109206
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  108992 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 109091  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  109092 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 109191  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  109192 tgtgtattcctgttt 109206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 113687 - 113470
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| | ||| || || ||| |||| | | ||||| | || || |    
T  113687 gatagtgattgcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgattttggaagaaa 113588  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||  | ||||||||| |    
T  113587 gtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtgatgttgctta 113488  T
Q  222 gtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  113487 gtttgtgtatgcatgttt 113470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 244
Target Start/End: Original strand, 218614 - 218817
Alignment:
Q  41 atgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgag 140  Q
    ||||||||||  || |||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||    
T  218614 atgatcagggattgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgag 218713  T
Q  141 tattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttg 240  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||  || ||||||||    
T  218714 tattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgaattcctgtttg 218813  T
Q  241 attt 244  Q
    ||||    
T  218814 attt 218817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 230153 - 229953
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||| ||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||    ||||| ||||    
T  230153 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttatattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttga 230054  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| | |||||    
T  230053 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgttt 229954  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  229953 g 229953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8489 - 8279
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  8489 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcac 8390  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
      |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  8389 aggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 8290  T
Q  227 tttatgcctgt 237  Q
    | ||| |||||    
T  8289 tgtattcctgt 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16005 - 15783
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||| || | ||||||| |||||  | || ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  16005 gatagtgacttcaaagtcgatgatcagggtgtgttgagatttcgagatataatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 15906  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | || || || ||    
T  15905 gtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgagacgtggcaca 15806  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| |||  |||||||||||    
T  15805 gtttgtgtattactgtttgattt 15783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 112670 - 112888
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||||  |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  112670 gtgattttaaaatcgatgatcgaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgatgaggagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 112769  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||    
T  112770 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaattt 112869  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| | ||||| ||||    
T  112870 gtgtattcttgtttaattt 112888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 116083 - 116305
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  116083 gatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 116182  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  116183 gtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgca 116282  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  116283 gtttgtgtattcatgtttgattt 116305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2038 - 1814
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||| | |||||| ||||||| || ||    
T  2038 aggatagtgactttaaagttgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcttgacaatgatgagataaagaagatgattctcgaaga 1939  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||  |     
T  1938 gagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtgaca 1839  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||    
T  1838 cagtttgtgtattcatgtttgattt 1814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 728 - 887
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||    
T  728 aggatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatga-gagttgaaaaagttgattttagagga 826  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaag 180  Q
     |||||| | ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  827 aagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7145 - 6929
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| | |||| | ||||| ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  7145 agtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttaaggtttagaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 7046  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| | |||    |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  7045 atagaagtagcttgagtattcatccaggagctacgaagatgtaccacgatctaaag---ttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtt 6949  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  6948 tgtgtatacttgtttgattt 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13168 - 12984
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||||| || || ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||    
T  13168 gatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtaggatttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 13069  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| |||||    
T  13068 gtattcaccctggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaacgagatgttgcacagtt 12984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8064 - 7850
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  8064 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 7965  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  7964 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 7865  T
Q  225 tgtttatgcctgttt 239  Q
    ||| ||| |||||||    
T  7864 tgtgtattcctgttt 7850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40159
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||| ||  |||| ||| ||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||| | || || |    
T  39937 gatagtgacttcaaggttgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaatttgtattccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagata 40036  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
     ||||   ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||    
T  40037 ttcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcaca 40136  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  40137 gtttgtatatgcatgtttgattt 40159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Original strand, 28090 - 28168
Alignment:
Q  166 tatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28090 tatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgattt 28168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4900 - 4685
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || ||||  ||||||||| | || || || ||    
T  4900 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaagaaagcca 4801  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
    |   ||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||    
T  4800 cagaagtagcttaagtattcatccgggagctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggttgaaacgtgatattgctcagttt 4701  T
Q  226 gtttatgcctgtttga 241  Q
     ||||||| |||||||    
T  4700 ttttatgcgtgtttga 4685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 14257 - 14479
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14257 gatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcggtttcgaggcagaatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 14356  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||||  | ||    
T  14357 gtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgacaca 14456  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  14457 gtttgtgtattcatgtttgattt 14479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5159 - 4937
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||| || | ||  |||| ||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5159 gatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 5060  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||  | ||||| ||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  5059 gtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgtggcaca 4960  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  4959 gtttgtgtattcctgtttgattt 4937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17809 - 17587
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  17809 gataatgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaga 17710  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||| | ||||| || ||    
T  17709 gtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaatgcgatgtggcaca 17610  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  17609 gtttgtgtattcctgtttgattt 17587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4999 - 4777
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||  ||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  4999 gatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 4900  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||  |    
T  4899 gtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcata 4800  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  4799 gtttgtgtattcctgtttgattt 4777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 11907
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| || ||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||  ||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  12129 gatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 12030  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||  |    
T  12029 gtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcata 11930  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  11929 gtttgtgtattcctgtttgattt 11907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 31931 - 32153
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  31931 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 32030  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||  |||||||| || || |||||||| || |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  32031 gtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcaca 32130  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||    
T  32131 gtttgtgtattcctatttaattt 32153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40767 - 40647
Alignment:
Q  121 agtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctc 220  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40767 agtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctc 40668  T
Q  221 agtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  40667 agtttgtttatgcatgtttga 40647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28058 - 27934
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28058 agtgatttcaagattgatgattagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattcttgaagagagtc 27959  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcaccc 149  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  27958 acaagagtagattgagtattcaccc 27934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7138 - 6920
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  7138 gtgattttaaagtcgatgaccttggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtca 7039  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||||||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||    
T  7038 tagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcacagttt 6939  T
Q  226 gtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| | ||||||||||    
T  6938 gtgtattcttgtttgattt 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 6507 - 6613
Alignment:
Q  115 gaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatg 214  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  6507 gaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 6606  T
Q  215 ttgctca 221  Q
    |||||||    
T  6607 ttgctca 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 10938 - 11044
Alignment:
Q  115 gaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatg 214  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  10938 gaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 11037  T
Q  215 ttgctca 221  Q
    |||||||    
T  11038 ttgctca 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 48228 - 48090
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  48228 gtgatttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtca 48129  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaat 164  Q
    | | ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||    
T  48128 caaaagtagcttaagtattcatccgggagctacagaaat 48090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48089 - 48036
Alignment:
Q  185 tgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48089 tgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtttatgcatgtt 48036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 3004 - 3197
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||| |  ||||||| |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  3004 aaagtcgatgaccatggtgtgttgaggttccgaggtcggatttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 3103  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| | |||| | ||||| || ||||||||    
T  3104 gcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaacgcgatgtggcacagtttgt 3197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Original strand, 39014 - 39215
Alignment:
Q  38 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggtt 137  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||| ||| | || ||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||    ||||| ||    
T  39014 ttgatgaccatggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagactcatagaagtagctt 39113  T
Q  138 gagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgt 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  39114 gagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatctgaagaaaattttatggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcctgt 39213  T
Q  238 tt 239  Q
    ||    
T  39214 tt 39215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 66521 - 66328
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  66521 aaagttgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 66422  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | |||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  66421 gcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgt 66328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 102360 - 102139
Alignment:
Q  23 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 122  Q
    |||||||||| ||| | ||||| || |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  102360 atagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagag 102261  T
Q  123 tcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcag 222  Q
    |||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||   |||||  | |||    
T  102260 tcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgtcacag 102161  T
Q  223 tttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||    
T  102160 tttgtgtattcctatttgattt 102139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Original strand, 3637 - 3857
Alignment:
Q  24 tagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagt 123  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| |||| | |||| ||| |||||||| ||||||| |||||   ||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  3637 tagtgattttaaaatcgatgctcaaggtgcgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagt 3736  T
Q  124 cacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagt 223  Q
    ||    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |    
T  3737 catagaagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaat 3836  T
Q  224 ttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||| ||| ||||||| ||||    
T  3837 ttgtgtattcctgtttaattt 3857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Original strand, 28562 - 28702
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  28562 aaagtcgatgaccatggtgtgttgagtttccgaggtcggatttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 28661  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgat 174  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  28662 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgat 28702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 59883 - 59699
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  |   |||| ||||||| |||||| ||  |||  |||||||| ||||| | || || |    
T  59883 gatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaa 59784  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||   ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || |||||    
T  59783 gtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtccgggttgaa 59699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 131232 - 131013
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |    
T  131232 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagcc 131133  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    || |  ||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | || |||||  ||||    
T  131132 atagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcaaagtt 131033  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  131032 tgtgtattcttgtttgattt 131013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 1248 - 1467
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  ||||  |||| |||||||    
T  1248 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtc 1347  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  1348 ataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatatatcatgatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtgatgtggcacagtt 1447  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  1448 tgtgtattcttgtttgattt 1467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 26125 - 26344
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  26125 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 26224  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    | ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  26225 atagaaatagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtt 26324  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  26325 tgtatattcttgtttgattt 26344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 5
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  131 aggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagga 32  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattca 146  Q
     |||||| ||||||| || ||||||||    
T  31 aagtcacaagagtagcttaagtattca 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 899 - 773
Alignment:
Q  115 gaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatg 214  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | || |    
T  899 gaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacg 800  T
Q  215 ttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  799 tcgctcattttgtgtatgcatgtttga 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 17844 - 17934
Alignment:
Q  151 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17844 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttga 17934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 11375 - 11593
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||| | ||||    
T  11375 gatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagaga 11474  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||    
T  11475 gtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcaca 11574  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttg 240  Q
     ||||| ||| ||||||||    
T  11575 atttgtgtattcctgtttg 11593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 17567 - 17785
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||| | ||||    
T  17567 gatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagaga 17666  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||    
T  17667 gtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcaca 17766  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttg 240  Q
     ||||| ||| ||||||||    
T  17767 atttgtgtattcctgtttg 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 7093
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  236 gtttga 241  Q
    ||||||    
T  7098 gtttga 7093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10080 - 9876
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| | |||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  10080 gatgaccaaggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 9981  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  9980 gcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattcttgttt 9881  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  9880 gattt 9876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3104
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| |||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||    
T  3304 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtttaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 3205  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  3204 gtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 3105  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  3104 g 3104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 116 - 326
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 125  Q
    ||||||| ||| | |||||| | || ||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || || || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  116 gtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtca 215  T
Q  126 cgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagttt 225  Q
        ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  216 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagttt 315  T
Q  226 gtttatgcctg 236  Q
    || ||| ||||    
T  316 gtgtattcctg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 32763 - 32969
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    ||||    
T  32763 aaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagta 32862  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |    
T  32863 gcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattc 32962  T
Q  234 ctgtttg 240  Q
    |||||||    
T  32963 ctgtttg 32969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9712 - 9506
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  9712 aaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 9613  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |    
T  9612 gcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattc 9513  T
Q  234 ctgtttg 240  Q
    |||||||    
T  9512 ctgtttg 9506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22919 - 22778
Alignment:
Q  98 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtc 197  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  22919 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtc 22820  T
Q  198 tggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  22819 tggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtatattcctgttt 22778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 2032 - 2156
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||| | |    
T  2032 gatagtgacttcaaggttaatgatcagggtgtgttgaggttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagaaaa 2131  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattca 146  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||    
T  2132 gtcacaagagtagcttaagtattca 2156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 19198 - 19402
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| ||    ||||  ||||    
T  19198 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 19297  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| | |||||| ||||| |||||    
T  19298 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacggtttgtgtatgcttgttt 19397  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  19398 gattt 19402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 14407 - 14574
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| ||    ||||  ||||    
T  14407 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 14506  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  14507 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaa 14574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 826 - 602
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||| |||||||  |||||||  ||| ||| || ||  | || ||| |||||||  |||||||||| ||    
T  826 aggatagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttgaggtttcgaggtaggatttctattccagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaaga 727  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||    ||||  |||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  726 gagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgttgca 627  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||    
T  626 caatttgtgtattcttgtttgattt 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagtt 107  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  88 aggatagtgactttatggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 7512 - 7731
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |    
T  7512 agtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtaggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagcc 7611  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||    
T  7612 atagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtt 7711  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  7712 tgtgtattcttgtttgattt 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 50557 - 50338
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  50557 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtattgaggtttcgaggtagaatttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 50458  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| | |||||  | ||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  50457 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtt 50358  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||  ||| | ||||||||||    
T  50357 tgcgtattcttgtttgattt 50338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35136 - 34936
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    |||||  | |    
T  35136 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaa 35037  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||| |  ||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  35036 gtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgttt 34937  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  34936 g 34936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19712 - 19512
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    |||||  | |    
T  19712 gatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaa 19613  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||| |  ||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  19612 gtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgttt 19513  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  19512 g 19512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Original strand, 28 - 186
Alignment:
Q  49 ggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacc 148  Q
    |||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||    
T  28 ggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 127  T
Q  149 caggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    | |||||||| || |||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  128 cgggagctacgaagatgtttcatgatctgaagaaaattttctagtggtctggtttgaaa 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 4546 - 4736
Alignment:
Q  37 gttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggt 136  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||| ||||| || |||| || |||||  |||||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||    ||||| |    
T  4546 gttgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgcattcctgacgatgaagagatgaagataatgattcttgaagagggtcatagaagtagct 4645  T
Q  137 tgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  4646 tgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgt 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34278 - 34097
Alignment:
Q  60 gttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctaca 159  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||| || || ||| | || | ||||||| | || || |||||| |||| || |||||||| || || ||||||||     
T  34278 gttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacg 34179  T
Q  160 aaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttga 241  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  34178 aagatgtatcacgatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttttttatgcatgtttga 34097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Original strand, 79724 - 79877
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  79724 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatga 79823  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    | | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  79824 tctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgt 79877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Original strand, 19257 - 19462
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||||||||| || |||| | |||||||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||    ||||    
T  19257 aaagttgatgaccatggtgcgttgaggttccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatataagta 19356  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| |    
T  19357 gcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatggtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtattc 19456  T
Q  234 ctgttt 239  Q
    ||||||    
T  19457 ctgttt 19462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 57074 - 56928
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||    
T  57074 agagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctgg 56975  T
Q  193 tggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  56974 tggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 56928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 196668 - 196874
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||    ||||    
T  196668 aaagttgatgaccatcgtgtgttgagattccgaggtcgtatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagccatagaagta 196767  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||  | || ||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |    
T  196768 gcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaacgagatgtggcatagtttgtgtattc 196867  T
Q  234 ctgtttg 240  Q
     ||||||    
T  196868 ttgtttg 196874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 6322 - 6410
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgc 218  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6322 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgc 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18569
Alignment:
Q  74 tttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatga 173  Q
    ||||||| |||||  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  18445 tttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatga 18544  T
Q  174 tttgaagaaactgttttggtggtct 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  18545 tttgaagaagttgttttggtggtct 18569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Original strand, 8283 - 8487
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |||    ||| | || |    
T  8283 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaa 8382  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||| || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  8383 gtatccatccgggagctacgcagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcatgttt 8482  T
Q  240 gattt 244  Q
    |||||    
T  8483 gattt 8487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1476 - 1357
Alignment:
Q  88 aatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgt 187  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  | |    
T  1476 aatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattt 1377  T
Q  188 tttggtggtctggtttgaaa 207  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  1376 tctggtggtctggtttgaaa 1357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 4770 - 4992
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  |   | || ||||||| |||||||||  |||  |||| ||| ||||||| || || |    
T  4770 gatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaattgaatttgtattcctgataatacagaaatgaaaaagatgattctggaagaaa 4869  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    |||||   ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||    
T  4870 gtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagcgagatgttgcaca 4969  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4970 atttgtgtatgcatgtttaattt 4992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2487 - 2373
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| || |||||| | || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |    
T  2487 agtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagtttgtgt 2388  T
Q  230 atgcctgtttgattt 244  Q
    || | ||||||||||    
T  2387 attcttgtttgattt 2373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16782 - 16561
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 121  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||  |||||||  |||||||| |||| || || ||  |||  ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  16782 gatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtcttgaggtttcgaggtagaatttgcattccagacgatgt-gagatgaagaaaatgattcttgaagaga 16684  T
Q  122 gtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctca 221  Q
    ||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  16683 gtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcaca 16584  T
Q  222 gtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  16583 gtttgtgtattcttgtttgattt 16561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13525 - 13379
Alignment:
Q  93 agagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttgg 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||    
T  13525 agagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctgg 13426  T
Q  193 tggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  13425 tggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 17
Alignment:
Q  26 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgatt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  102 gtgatttcaaggttgatgatcagggggtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataacgatgagttgaaaaagttgatt 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 244
Target Start/End: Original strand, 25026 - 25119
Alignment:
Q  151 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  25026 ggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcatgtttgattt 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 63276 - 63425
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||  | ||    
T  63276 atgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagatatt 63375  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtt 238  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  63376 ctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtt 63425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 7087 - 7287
Alignment:
Q  40 gatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttga 139  Q
    ||||||||||| ||| || | ||  |||||||| ||||||| ||| |  |||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  7087 gatgatcagggagtgttgcgtttttgaggtagaatttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttga 7186  T
Q  140 gtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgttt 239  Q
    |||| || || |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||| | |||||| | ||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  7187 gtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctcggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtatattcatgttt 7286  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  7287 g 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1582
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||||   ||||    
T  1737 atgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgcaccatgatttgaagatgttgtt 1638  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| |||||||| |||||  | |||||||| | |||||| ||| | ||||||||||    
T  1637 ttgatggtctggattgaagcgtgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgattt 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 3595 - 3801
Alignment:
Q  34 aaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagta 133  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||  ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||    
T  3595 aaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 3694  T
Q  134 ggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 233  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |    
T  3695 gcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattc 3794  T
Q  234 ctgtttg 240  Q
    |||||||    
T  3795 ctgtttg 3801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1799
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||| | || ||| |||||||| ||||||| |  ||  |||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||     
T  2016 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttcagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcat 1917  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||| | ||||| || || ||||    
T  1916 agaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgtggcacaatttg 1817  T
Q  227 tttatgcctgtttgattt 244  Q
    | ||| |  |||||||||    
T  1816 tgtattctggtttgattt 1799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Original strand, 15742 - 15823
Alignment:
Q  163 atgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15742 atgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattt 15823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Original strand, 10270 - 10354
Alignment:
Q  98 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaa 182  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10270 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaa 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8520 - 8308
Alignment:
Q  27 tgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcac 126  Q
    |||||| ||| | |||| ||| |||||| |||| |||  ||| ||| ||||||| || || |||| |||| | | |||| |||||||||| ||||||||     
T  8520 tgattttaaaatcgatggtcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagagagtcat 8421  T
Q  127 gagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttg 226  Q
       ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||    
T  8420 agaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttcaaaagaaatgtggcacagtttg 8321  T
Q  227 tttatgcctgttt 239  Q
    | ||| |||||||    
T  8320 tgtattcctgttt 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4270 - 4046
Alignment:
Q  20 aggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgagga 119  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||| ||  ||||  || ||||||| | |||  |||| ||| | |||||| ||||| | || ||    
T  4270 aggatagtgactttagagttgatgaccaaggtgtgctgagatttcgaggccgaatttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaaga 4171  T
Q  120 gagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgct 219  Q
    ||||||    ||||| |||||||||||    ||| |||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||     
T  4170 gagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggca 4071  T
Q  220 cagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||    
T  4070 caatttatttattcatgtttgattt 4046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3435 - 3280
Alignment:
Q  89 atgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgtt 188  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    ||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||| | |||||  ||||    
T  3435 atgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgtt 3336  T
Q  189 ttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgattt 244  Q
     ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  3335 ctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgattt 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7174 - 6955
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  7174 agtgattttaaaatcgataatcaaggtgtactgaggttttgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagcc 7075  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtt 224  Q
    |    ||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||    
T  7074 atagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacagtt 6975  T
Q  225 tgtttatgcctgtttgattt 244  Q
    ||| ||| | || |||||||    
T  6974 tgtgtattcttgcttgattt 6955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3340
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  3230 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 3329  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  3330 atgcttgtttg 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19067 - 18957
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  19067 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgttt 18968  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  18967 atgcttgtttg 18957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13818
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  13928 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgttt 13829  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  13828 atgcttgtttg 13818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26034 - 25897
Alignment:
Q  90 tgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttt 189  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||   | ||     
T  26034 tgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttc 25935  T
Q  190 tggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgt 227  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  25934 tggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgt 25897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4178 - 4075
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||| | |||  ||||| ||||||| |    
T  4178 agtagtttgagtattcacccaagagcgactaagatgtatcatgatttgaagagattgttttgatggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtat 4079  T
Q  230 atgc 233  Q
    ||||    
T  4078 atgc 4075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8286 - 8215
Alignment:
Q  129 gagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8286 gagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggctgttttggtggcctgg 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 6863 - 6942
Alignment:
Q  22 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  6863 gatagtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaa 6942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3562 - 3452
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||| | |||||||||    
T  3562 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattggtgagtttgttt 3463  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  3462 atgcttgtttg 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 3161 - 3271
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  3161 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 3260  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  3261 atgcttgtttg 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10006 - 9896
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  10006 agtagtttgagtattcatccaggagcgactacgatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgttt 9907  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  9906 atgcttgtttg 9896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 372
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||    
T  482 agtagtttgagtattcatctaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaatgatattgctgagtttgttt 383  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  382 atgcttgtttg 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Original strand, 9147 - 9257
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  9147 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 9246  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  9247 atgcttgtttg 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24414 - 24304
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  24414 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 24315  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  24314 atgcttgtttg 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 85811 - 85857
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaa 182  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85811 ttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaa 85857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24976 - 24931
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  24976 ttgagtattcacccaggagctactaagatgtatcaggatttgaaga 24931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Original strand, 32699 - 32764
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtgg 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  32699 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8286
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |  |||| | |||  ||||| ||||||||||||| |    
T  8182 ttgagtattcacctaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctagaatgaagaaggaatttgctgagtttgtttatgctt 8281  T
Q  236 gtttg 240  Q
    |||||    
T  8282 gtttg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2279 - 2171
Alignment:
Q  136 ttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcct 235  Q
    ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||| | |    
T  2279 ttgagtattcatccgggagctccgaagatgtagcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattctt 2180  T
Q  236 gtttgattt 244  Q
    |||| ||||    
T  2179 gttttattt 2171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10315 - 10244
Alignment:
Q  129 gagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctgg 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  10315 gagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6194 - 6085
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||||| |||||||||    
T  6194 agtagtttgagtat-catccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgttt 6096  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  6095 atgcttgtttg 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24518 - 24408
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||  | || |||||||||   |||||| | ||||| || |||||||| |    
T  24518 agtagcttgagaattcatcgaggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctaaattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 24419  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    || ||||||||    
T  24418 attcctgtttg 24408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15676 - 15566
Alignment:
Q  130 agtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagggatgttgctcagtttgttt 229  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||| | |||  ||| | |||||||||    
T  15676 agtagtttaagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgtttagtttgttt 15577  T
Q  230 atgcctgtttg 240  Q
    |||| ||||||    
T  15576 atgcttgtttg 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Original strand, 3460 - 3505
Alignment:
Q  32 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttg 77  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  3460 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Original strand, 30473 - 30518
Alignment:
Q  32 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttg 77  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  30473 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 30518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 39084 - 39217
Alignment:
Q  25 agtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 124  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||  |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  39084 agtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgatgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 39183  T
Q  125 acgagagtaggttgagtattcacccaggagctac 158  Q
    |   |||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  39184 ataggagtaacttgagtattcatccgggagctac 39217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8833 - 8704
Alignment:
Q  107 tgattcttgaggagagtcacgagagtaggttgagtattcacccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||| | ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  8833 tgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8734  T
Q  207 aagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 236  Q
    | | ||||| ||  ||||||| ||| ||||    
T  8733 acgagatgtggcaaagtttgtgtattcctg 8704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University