View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7943_high_10 (Length: 440)

Name: NF7943_high_10
Description: NF7943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7943_high_10
NF7943_high_10
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-422)||(28163316-28163736)
chr1 (1-422)||(28126615-28127036)
chr1 (40-360)||(267342-267662)
chr1 (91-287)||(26136799-26136995)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (1-386)||(25492295-25492680)
chr6 (1-419)||(27717442-27717860)
chr6 (43-422)||(26656828-26657204)
chr6 (43-422)||(26762799-26763175)
chr6 (1-419)||(27530247-27530662)
chr6 (40-422)||(26647339-26647721)
chr6 (40-422)||(26753307-26753689)
chr6 (44-401)||(26143732-26144089)
chr6 (1-419)||(27610063-27610481)
chr6 (13-419)||(31285392-31285798)
chr6 (40-415)||(27337042-27337417)
chr6 (40-415)||(27397782-27398157)
chr6 (1-419)||(27591964-27592382)
chr6 (42-419)||(26862442-26862819)
chr6 (40-419)||(26884930-26885306)
chr6 (93-401)||(25483972-25484280)
chr6 (1-419)||(27676563-27676981)
chr6 (1-419)||(28787059-28787477)
chr6 (1-419)||(28793180-28793598)
chr6 (92-401)||(25580634-25580943)
chr6 (1-422)||(27603644-27604065)
chr6 (93-401)||(25539456-25539764)
chr6 (13-418)||(27679783-27680188)
chr6 (13-419)||(26624104-26624510)
chr6 (13-419)||(26730081-26730487)
chr6 (3-293)||(27215275-27215565)
chr6 (91-419)||(26824730-26825058)
chr6 (40-360)||(27697588-27697908)
chr6 (13-423)||(26803279-26803689)
chr6 (105-401)||(25511817-25512112)
chr6 (14-401)||(26056756-26057143)
chr6 (91-386)||(27426588-27426883)
chr6 (105-401)||(26076817-26077113)
chr6 (1-301)||(28781922-28782222)
chr6 (217-419)||(27705197-27705399)
chr6 (92-266)||(28326390-28326564)
chr6 (92-266)||(28504026-28504200)
chr6 (92-293)||(28227864-28228065)
chr6 (95-293)||(28235480-28235678)
chr6 (105-288)||(26812453-26812636)
chr6 (92-266)||(28182029-28182204)
chr6 (155-265)||(28240329-28240439)
chr6 (115-185)||(27576142-27576212)
chr6 (146-251)||(29477176-29477281)
chr6 (92-256)||(28296846-28297010)
chr6 (92-256)||(28515063-28515227)
chr6 (224-266)||(25074911-25074953)
chr6 (105-287)||(26950668-26950850)
chr6 (163-293)||(28243778-28243908)
chr6 (93-287)||(29826899-29827093)
chr6 (219-262)||(27664305-27664348)
chr6 (13-176)||(27705590-27705753)
chr6 (91-287)||(28097518-28097714)
chr6 (226-266)||(26975997-26976037)
chr6 (226-266)||(31289315-31289355)
chr6 (226-293)||(26938075-26938142)
chr6 (226-264)||(26849758-26849796)
chr6 (147-264)||(28490654-28490771)
chr6 (147-264)||(29803064-29803181)
chr6 (226-266)||(26636692-26636732)
chr6 (226-266)||(26742658-26742698)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-419)||(2482-2900)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (13-419)||(29272781-29273187)
chr8 (155-266)||(35984274-35984385)
chr8 (155-266)||(31906029-31906140)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-419)||(3655-4073)
scaffold0277 (1-419)||(12618-13036)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-419)||(8308-8726)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-419)||(18654416-18654834)
chr4 (1-408)||(18678510-18678917)
chr4 (1-386)||(18698372-18698757)
chr4 (1-386)||(18730476-18730861)
chr4 (91-386)||(18074672-18074967)
chr4 (1-419)||(18723024-18723442)
chr4 (109-287)||(5090025-5090203)
chr4 (279-407)||(18688577-18688705)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (91-386)||(60480-60775)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (92-293)||(28362-28563)
scaffold0038 (95-293)||(35642-35840)
scaffold0038 (155-265)||(40491-40601)
scaffold0038 (163-293)||(43940-44070)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (91-284)||(16691778-16691971)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (105-287)||(17992290-17992472)
chr2 (73-269)||(3280552-3280748)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (91-293)||(57363-57565)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (135-191)||(5879638-5879694)
chr3 (135-191)||(5917003-5917059)
chr3 (136-192)||(5982798-5982854)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28163736 - 28163316
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28163736 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctctttttgaaa-cagttagatcggacattaagttag 28163638  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163637 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 28163538  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163537 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 28163438  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
     ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28163437 tcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatc 28163338  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28163337 gtgcagtttcatatgcttcagg 28163316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28127036 - 28126615
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  28127036 tgttttctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttag 28126937  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28126936 gaggtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggc 28126837  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28126836 tttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcat 28126737  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28126736 gcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 28126637  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28126636 gggcagtttcatatgcttcagg 28126615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 267662 - 267342
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| ||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||    
T  267662 aacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggc 267563  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |  |  | ||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  267562 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcag 267463  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    |||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  267462 agtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattg 267363  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaa 360  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  267362 ttgagttggatggcttttaaa 267342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Original strand, 26136799 - 26136995
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||    
T  26136799 attaagttaggacatgttagtaaaggaattccaatcataaaagaaaggctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttgacaagctaaagc 26136898  T
Q  191 agctggaggctttggctggag-gactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
    || || ||| ||||| ||||| | || | |||| | |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  26136899 agttgcaggttttggttggagagcctag-ttggcttggtcctgggagtagagtcatcattaccacccgagacaaacatttgctatcatgtcatgggat 26136995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25492680 - 25492295
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||  |||||||  || |||||||||     
T  25492680 tgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaa 25492581  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  25492580 gaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagagga 25492481  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25492480 tttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcat 25492381  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    || ||| ||| |||| ||||   | |||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  25492380 gcagtagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatga 25492295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27717860 - 27717442
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  27717860 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 27717761  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  27717760 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 27717661  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27717660 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 27717561  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||| || ||  |||||||||    
T  27717560 gaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 27717461  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  27717460 gtgcagttgcatatgcttc 27717442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 26656828 - 26657204
Alignment:
Q  43 ttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctac 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||     
T  26656828 ttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactat 26656927  T
Q  143 atagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagt 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26656928 ctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagt 26657027  T
Q  243 catcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttg 342  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26657028 catcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttg 26657127  T
Q  343 aggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    || ||||||||||||| |    |||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26657128 agatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcagg 26657204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 26762799 - 26763175
Alignment:
Q  43 ttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctac 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||     
T  26762799 ttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactat 26762898  T
Q  143 atagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagt 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26762899 ctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagt 26762998  T
Q  243 catcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttg 342  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26762999 catcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttg 26763098  T
Q  343 aggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    || ||||||||||||| |    |||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26763099 agatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcagg 26763175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27530662 - 27530247
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27530662 tgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttag 27530563  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27530562 gaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggc 27530463  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  27530462 cttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacat 27530363  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    || ||| |||||||| |||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||    | || |||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  27530362 gcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttcaaa---gaaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaacc 27530266  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | ||| || | ||||||||    
T  27530265 gtgcacttacttatgcttc 27530247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 422
Target Start/End: Original strand, 26647339 - 26647721
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||| |  | | |||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  26647339 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggc 26647438  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26647439 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 26647538  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||| |||| | ||||| ||| |||| |||||||||    
T  26647539 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattg 26647638  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26647639 ttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcagg 26647721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 422
Target Start/End: Original strand, 26753307 - 26753689
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||| |  | | |||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  26753307 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggc 26753406  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26753407 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 26753506  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||| |||| | ||||| ||| |||| |||||||||    
T  26753507 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattg 26753606  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26753607 ttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcagg 26753689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 401
Target Start/End: Original strand, 26143732 - 26144089
Alignment:
Q  44 tgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctaca 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| || | |   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||      
T  26143732 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 26143831  T
Q  144 tagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26143832 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtc 26143931  T
Q  244 atcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttga 343  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| ||| |||  ||| |||  ||| |||| |||||||||||||    
T  26143932 atcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttga 26144031  T
Q  344 ggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccg 401  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  26144032 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaaccg 26144089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27610481 - 27610063
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  27610481 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 27610382  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  27610381 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 27610282  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27610281 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 27610182  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
       ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||| || ||  |||||||||    
T  27610181 aaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 27610082  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  27610081 gtgctgttgcatatgcttc 27610063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Original strand, 31285392 - 31285798
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||    ||||||||    
T  31285392 gatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtg 31285491  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||||||||||||||    
T  31285492 agggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggagg 31285591  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||    
T  31285592 acttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaaggg 31285691  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
    ||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| || ||  |||||||||| |||||| |||    
T  31285692 ttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 31285791  T
Q  413 atgcttc 419  Q
    || ||||    
T  31285792 attcttc 31285798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27337417 - 27337042
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||  |  | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27337417 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27337318  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27337317 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27337218  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||| |||| | ||||| |   |||| |||||||||    
T  27337217 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattg 27337118  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatg 415  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337117 ttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatg 27337042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27398157 - 27397782
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||  |  | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27398157 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27398058  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27398057 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27397958  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||| |||| | ||||| |   |||| |||||||||    
T  27397957 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattg 27397858  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatg 415  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27397857 ttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatg 27397782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27592382 - 27591964
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||   ||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27592382 tgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27592283  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||| || |||||| | |  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  27592282 gaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgc 27592183  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |   ||    
T  27592182 tttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatat 27592083  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    || ||| ||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  27592082 gcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagc 27591983  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  27591982 gtgcagttgtatatgcttc 27591964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 419
Target Start/End: Original strand, 26862442 - 26862819
Alignment:
Q  42 cttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggcta 141  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| || | | ||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||  |||| |||    
T  26862442 cttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaagacta 26862541  T
Q  142 catagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagag 241  Q
     |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  26862542 aatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagtagag 26862641  T
Q  242 tcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| ||| |  |||  ||| ||||  ||||||||||    
T  26862642 tcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagcttttgaattgtt 26862741  T
Q  342 gaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttc 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26862742 gaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttc 26862819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 419
Target Start/End: Original strand, 26884930 - 26885306
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||| ||   | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||| |    
T  26884930 aacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagac 26885029  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26885030 tacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcag 26885129  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| || |||| || |   |||  ||| ||||| | ||||| | | ||||  ||||||||    
T  26885130 ggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattg 26885229  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgcttc 419  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26885230 ttgaggtggctggcctttaaa---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttc 26885306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 401
Target Start/End: Original strand, 25483972 - 25484280
Alignment:
Q  93 taagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25483972 taagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcag 25484071  T
Q  193 ctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaa 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   ||    
T  25484072 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaa 25484171  T
Q  293 gtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgt 392  Q
    |||  ||||| ||| |||  ||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  25484172 gtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 25484271  T
Q  393 tttaaaccg 401  Q
    |||||||||    
T  25484272 tttaaaccg 25484280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27676981 - 27676563
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||   ||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27676981 tgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27676882  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||| || |||||| | |  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27676881 gaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggc 27676782  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |   ||    
T  27676781 tttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatat 27676682  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    || ||| ||| |||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  27676681 gcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagc 27676582  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  27676581 gtgcagttgtatatgcttc 27676563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 28787059 - 28787477
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  28787059 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttag 28787158  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  28787159 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 28787258  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||    
T  28787259 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacat 28787358  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  28787359 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 28787458  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  28787459 gtgcagtttcttatgcttc 28787477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 28793180 - 28793598
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||   |  ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  28793180 tgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttag 28793279  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  28793280 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 28793379  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||    
T  28793380 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacat 28793479  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  28793480 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 28793579  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  28793580 gtgcagtttcgtatgcttc 28793598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 401
Target Start/End: Original strand, 25580634 - 25580943
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25580634 ttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagca 25580733  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaa 291  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |    
T  25580734 gctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattaca 25580833  T
Q  292 agtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatg 391  Q
    ||||  ||||| ||| |||  ||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||      
T  25580834 agtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagaga 25580933  T
Q  392 ttttaaaccg 401  Q
    ||||||||||    
T  25580934 ttttaaaccg 25580943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27604065 - 27603644
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  27604065 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 27603966  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||| ||  ||||    
T  27603965 gaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggc 27603866  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| | | ||    
T  27603865 tttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagtat 27603766  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    ||  || ||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||    
T  27603765 gcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgttttaaacc 27603666  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttcagg 422  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  27603665 gtgcagtttcatatgcttcagg 27603644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 93 - 401
Target Start/End: Original strand, 25539456 - 25539764
Alignment:
Q  93 taagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25539456 taagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcag 25539555  T
Q  193 ctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaa 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| || |||||||||||||   ||    
T  25539556 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaa 25539655  T
Q  293 gtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgt 392  Q
    |||  ||||  |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  25539656 gtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagat 25539755  T
Q  393 tttaaaccg 401  Q
    |||||||||    
T  25539756 tttaaaccg 25539764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 418
Target Start/End: Original strand, 27679783 - 27680188
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||||    | | ||| ||||||||||    ||||||||    
T  27679783 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtg 27679882  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || |||| ||| | ||||||||||||||    
T  27679883 agggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggagg 27679982  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  27679983 acttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaaggg 27680082  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
    ||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| |||||| |||    
T  27680083 ttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 27680182  T
Q  413 atgctt 418  Q
    ||||||    
T  27680183 atgctt 27680188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Original strand, 26624104 - 26624510
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| |||||||| |    ||||||||    
T  26624104 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtg 26624203  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   |   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26624204 agggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagg 26624303  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||| |||| |  ||||| ||| |||||    
T  26624304 gcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaaggg 26624403  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
    |||||||| ||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| |||    
T  26624404 ttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 26624503  T
Q  413 atgcttc 419  Q
    |||||||    
T  26624504 atgcttc 26624510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Original strand, 26730081 - 26730487
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||| ||| |||||||| |    ||||||||    
T  26730081 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtg 26730180  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   |   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26730181 agggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagg 26730280  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||| |||| |  ||||| ||| |||||    
T  26730281 gcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaaggg 26730380  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
    |||||||| ||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| |||    
T  26730381 ttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcat 26730480  T
Q  413 atgcttc 419  Q
    |||||||    
T  26730481 atgcttc 26730487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Original strand, 27215275 - 27215565
Alignment:
Q  3 ttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttagga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||| |||||||  ||   ||||||||||    
T  27215275 ttttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttagga 27215374  T
Q  103 ggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  27215375 ggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctt 27215474  T
Q  203 tggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27215475 tggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttactaacctatcatgggatagaaag 27215565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 419
Target Start/End: Original strand, 26824730 - 26825058
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | || ||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  26824730 attaagttaggaggtgttagtcaaggtattcaaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagc 26824829  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataga 290  Q
    | || || ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||    
T  26824830 aactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgagataga 26824929  T
Q  291 aagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgat 390  Q
    |   ||| |||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |     
T  26824930 attaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaacac 26825029  T
Q  391 gttttaaaccgagcagtttcatatgcttc 419  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26825030 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttc 26825058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27697908 - 27697588
Alignment:
Q  40 aacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 139  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||| | ||||||  | ||||||| ||||| ||||    ||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||    
T  27697908 aacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggc 27697809  T
Q  140 tacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 239  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27697808 tatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcag 27697709  T
Q  240 agtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattg 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||  | | |||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  27697708 agtcatcatcaccacccgagataaacacttactagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattg 27697609  T
Q  340 ttgaggtggatggcttttaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27697608 ttgaggtggatggcttttaaa 27697588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 26803279 - 26803689
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||  | ||| | | || |||||||    |||| |||    
T  26803279 gatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtg 26803378  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||| ||| |||| |||||  |||| ||   |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  26803379 aggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggagg 26803478  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
    ||  |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| |   |||| ||| | |||    
T  26803479 acctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagagggg 26803578  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  26803579 ttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcat 26803678  T
Q  413 atgcttcaggt 423  Q
    |||||||||||    
T  26803679 atgcttcaggt 26803689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 401
Target Start/End: Original strand, 25511817 - 25512112
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25511817 tgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttg 25511916  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcgg 304  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||   |||||  ||||| |    
T  25511917 gctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcat-ggattacaagtacacatgcag 25512015  T
Q  305 taaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccg 401  Q
    || |||||||| |||  | | |||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25512016 tagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccg 25512112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 401
Target Start/End: Original strand, 26056756 - 26057143
Alignment:
Q  14 atgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtga 113  Q
    |||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |  ||||||||   |||| ||||| ||  ||   | |||||| || |||||||||    
T  26056756 atgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtga 26056855  T
Q  114 gggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagga 213  Q
    ||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26056856 gggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggagga 26056955  T
Q  214 ctcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggt 313  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||  ||||| ||| ||||||    
T  26056956 cttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggt 26057055  T
Q  314 tgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccg 401  Q
    || |||  ||| |||| |||||||| |||||  | |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26057056 tgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccg 26057143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27426883 - 27426588
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  27426883 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 27426784  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataga 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27426783 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 27426684  T
Q  291 aagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    ||  |   |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27426683 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatga 27426588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 401
Target Start/End: Original strand, 26076817 - 26077113
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26076817 tgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttg 26076916  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcgg 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||  ||||| |    
T  26076917 gctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcag 26077016  T
Q  305 taaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccg 401  Q
    || |||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||||  | |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26077017 tagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccg 26077113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 28781922 - 28782222
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||  |  | | ||||||||||    
T  28781922 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttag 28782021  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  | ||    
T  28782022 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgc 28782121  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  28782122 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacgcat 28782221  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28782222 g 28782222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27705399 - 27705197
Alignment:
Q  217 gattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgt 316  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |   || | ||| ||||||||     
T  27705399 gattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggttga 27705300  T
Q  317 atggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcatatgc 416  Q
    |||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  27705299 atgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgc 27705200  T
Q  417 ttc 419  Q
    |||    
T  27705199 ttc 27705197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 28326390 - 28326564
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||    
T  28326390 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagca 28326489  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
      || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28326490 attgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 28504026 - 28504200
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||    
T  28504026 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagca 28504125  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
      || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28504126 attgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28504200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Original strand, 28227864 - 28228065
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| || || |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||    
T  28227864 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccagtcttaaagcaaaggcttcaccgaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagca 28227963  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaa 291  Q
      ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||| |||    
T  28227964 attgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaa 28228063  T
Q  292 ag 293  Q
    ||    
T  28228064 ag 28228065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 293
Target Start/End: Original strand, 28235480 - 28235678
Alignment:
Q  95 agttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagct 194  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||  ||||  |    
T  28235480 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 28235579  T
Q  195 ggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
    | ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||||    
T  28235580 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaag 28235678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Original strand, 26812453 - 26812636
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||   ||||  || ||| ||||    
T  26812453 tgttagtgaaggaattccaatcataaaagataggctgcatcaaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaccaaagcaattgaaggttttg 26812552  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggata 288  Q
    | |||||  |  | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||    
T  26812553 gttggagagcctggttggctcggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacagacatttgctatcatgtcatgggata 26812636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 28182029 - 28182204
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaa-caaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||| |||    
T  28182029 ttaagttaggagatgtcaacgagggaactccaatcataaaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagc 28182128  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |  || ||| ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28182129 aattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaaca 28182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 265
Target Start/End: Original strand, 28240329 - 28240439
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28240329 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 28240428  T
Q  255 tcgagacaaac 265  Q
    |||||||||||    
T  28240429 tcgagacaaac 28240439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27576212 - 27576142
Alignment:
Q  115 ggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaact 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27576212 ggaattccaatcataaaacaaaggctacatacaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaact 27576142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29477281 - 29477176
Alignment:
Q  146 gaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcat 245  Q
    |||||||| ||||| | || || |||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||  |    
T  29477281 gaaagaaagttcttctcatcctagatgatgtggacagactagagcaaatggaggctttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagcagagttgt 29477182  T
Q  246 cattac 251  Q
    ||||||    
T  29477181 cattac 29477176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28297010 - 28296846
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  |  ||||| ||||    
T  28297010 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagca 28296911  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactc 256  Q
      || | | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28296910 attgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28296846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 28515063 - 28515227
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  |  ||||| ||||    
T  28515063 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagca 28515162  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactc 256  Q
      || | | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28515163 attgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 266
Target Start/End: Original strand, 25074911 - 25074953
Alignment:
Q  224 tcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074911 tcggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 25074953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 287
Target Start/End: Original strand, 26950668 - 26950850
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||| || | |||||||| |||||||| |||||| |  ||||  || ||| ||||    
T  26950668 tgttaatgaaggaattccaatcataaaacgaaggctatatcagaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaataaagcaattgcaggttttg 26950767  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
      |||||  |  | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || | |||||||||||    
T  26950768 attggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtgacaaacatttgttatcatgtcatgggat 26950850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Original strand, 28243778 - 28243908
Alignment:
Q  163 attcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 262  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  28243778 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 28243877  T
Q  263 aacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
     ||| || ||||   |||||||||| |||||    
T  28243878 gacatttgctaaaaagtcatgggattgaaag 28243908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 287
Target Start/End: Original strand, 29826899 - 29827093
Alignment:
Q  93 taagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||| | |||||||||||||| || || |||||  ||  |||     
T  29826899 taagctaggagatgttaacgaaggaattccaataataaagcaaaggctaggacgaaagaaagtacttttgattcttgacgacgttgacaacatgaggcaa 29826998  T
Q  193 ctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
     || | | | |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||    
T  29826999 ttgcaagttatggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactcgagaccaacatttgctaacaagtcatgggat 29827093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27664348 - 27664305
Alignment:
Q  219 ttggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664348 ttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 27664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27705753 - 27705590
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||  | ||||| | || |||||||    |||| |||    
T  27705753 gatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtg 27705654  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgt 176  Q
    |||| ||| || |||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27705653 aggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28097714 - 28097518
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||||||| || ||  |  | ||| || |||    
T  28097714 attaagttagcagatactagtgagggaattccaatcataaaacaaaggctacaacaaaagaaggttctattgattctcgacgacattaataaattgaagc 28097615  T
Q  191 agctggaggctttggctgga-ggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  28097614 agctgcaagctatggctggagggact-gattggtttggtgctggcagtagagtgattgttaccactcgagataaaaacttgctagcaagtcatgggat 28097518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 26975997 - 26976037
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975997 ggtcatggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 31289315 - 31289355
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289315 ggtcctggaagcagagtcatcattaccacttgagacaaaca 31289355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 293
Target Start/End: Original strand, 26938075 - 26938142
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||    
T  26938075 ggtcatggaagcaaagtcattgttaccactcgagacaaacatttgctatcatgtcatgggattgaaag 26938142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 26849758 - 26849796
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 264  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849758 ggtcatggtagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28490771 - 28490654
Alignment:
Q  147 aaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatc 246  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||  | |||||  | |||||| ||  || |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  28490771 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatc 28490672  T
Q  247 attaccactcgagacaaa 264  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  28490671 attacgactcgggacaaa 28490654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29803181 - 29803064
Alignment:
Q  147 aaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatc 246  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||  | |||||  | |||||| ||  || |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  29803181 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatc 29803082  T
Q  247 attaccactcgagacaaa 264  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  29803081 attacgactcgggacaaa 29803064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 26636692 - 26636732
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26636692 ggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaaca 26636732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 26742658 - 26742698
Alignment:
Q  226 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 266  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26742658 ggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaaca 26742698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2900 - 2482
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||| |||   ||||||||| | |||||| ||  |   || |||||||| |    
T  2900 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttg 2801  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||  | ||    
T  2800 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgc 2701  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2700 tttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcat 2601  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||| || ||  |||||||||    
T  2600 gaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaacc 2501  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  2500 gtgcagttgcatatgcttc 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29273187 - 29272781
Alignment:
Q  13 gatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||  | ||| ||| ||||||||||    ||||||||    
T  29273187 gatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtg 29273088  T
Q  113 agggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggagg 212  Q
    |||| ||| |||| |||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || |||| ||  | ||||||||||||||    
T  29273087 aggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggagg 29272988  T
Q  213 actcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaaggg 312  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  29272987 acatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaaggg 29272888  T
Q  313 ttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgagcagtttcat 412  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  29272887 ctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcat 29272788  T
Q  413 atgcttc 419  Q
    |||||||    
T  29272787 atgcttc 29272781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 266
Target Start/End: Original strand, 35984274 - 35984385
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| ||||||  | |||||| | |||  ||| |||||||| |||||||| ||    
T  35984274 ttcttttgattctagatgatgttgacaaaatagaacagctagaggccttggttggagggtttgattggcttggttctggcagcagagttatcattacaac 35984373  T
Q  255 tcgagacaaaca 266  Q
    ||| ||||||||    
T  35984374 tcgggacaaaca 35984385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 266
Target Start/End: Original strand, 31906029 - 31906140
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| | || || |||||||| |||| ||||||| || ||||| | |||  |||||||||||| || ||||| ||    
T  31906029 ttcttttgattctagatgatgttgataaaatagaacaactggaggccttggttggaggattctattggcttggttctggaagcagagttattattacaac 31906128  T
Q  255 tcgagacaaaca 266  Q
    | | ||||||||    
T  31906129 tagggacaaaca 31906140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4073 - 3655
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |   || ||||||||||    
T  4073 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttag 3974  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  ||||    
T  3973 gaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggc 3874  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  3873 tttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgcat 3774  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  3773 gaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 3674  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3673 gtgcagtttcatatgcttc 3655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13036 - 12618
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | | ||||||||    
T  13036 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttag 12937  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  12936 gaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 12837  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  12836 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcat 12737  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  || |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  12736 gaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 12637  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||||||||||||||    
T  12636 gtgcagtttcatatgcttc 12618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 8308 - 8726
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | | ||||||||    
T  8308 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttag 8407  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | ||    
T  8408 gaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgc 8507  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  8508 tttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcat 8607  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  || |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  8608 gaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatc 8707  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8708 gtgcagtttcatatgcttc 8726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18654834 - 18654416
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  18654834 tgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttag 18654735  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |  ||| | ||    
T  18654734 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgc 18654635  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||    
T  18654634 tttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcat 18654535  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  ||||||||| ||| |     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18654534 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 18654435  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  18654434 gtgcagttgcgtatgcttc 18654416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18678917 - 18678510
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||||||||    
T  18678917 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttag 18678818  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||  |||| || ||| | ||    
T  18678817 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgc 18678718  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||    
T  18678717 tttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcat 18678618  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  ||||||||| ||| | |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  18678617 gaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaac 18678518  T
Q  401 gagcagtt 408  Q
    | ||||||    
T  18678517 gtgcagtt 18678510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18698757 - 18698372
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |   |  | | ||||||||||    
T  18698757 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttag 18698658  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || ||| | ||    
T  18698657 gaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgc 18698558  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||    
T  18698557 tttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccat 18698458  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    |  ||||||||| ||| |     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18698457 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatga 18698372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18730861 - 18730476
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |   |  | | ||||||||||    
T  18730861 tgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttag 18730762  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || ||| | ||    
T  18730761 gaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgc 18730662  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||    
T  18730661 tttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccat 18730562  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    |  ||||||||| ||| |     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18730561 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatga 18730476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 386
Target Start/End: Original strand, 18074672 - 18074967
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  18074672 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 18074771  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataga 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18074772 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 18074871  T
Q  291 aagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    ||  |   |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18074872 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatga 18074967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18723442 - 18723024
Alignment:
Q  1 tgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctccttctgaaaacagttagatcggatattaagttag 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||    | ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||  |  | | ||||| ||||    
T  18723442 tgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttag 18723343  T
Q  101 gaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggc 200  Q
    |||||||||||||| ||||| |    |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||    
T  18723342 gaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgc 18723243  T
Q  201 tttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||| | |||||| |||||||    
T  18723242 tttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgcat 18723143  T
Q  301 gcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaacc 400  Q
    |  ||||||||| ||| |     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18723142 gaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 18723043  T
Q  401 gagcagtttcatatgcttc 419  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  18723042 gagcagttgcgtatgcttc 18723024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5090203 - 5090025
Alignment:
Q  109 agtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||  ||| |||||| |    
T  5090203 agtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccg 5090104  T
Q  209 gaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
    ||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5090103 gagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggat 5090025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18688705 - 18688577
Alignment:
Q  279 tcatgggatagaaagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttca 378  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| | |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  18688705 tcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttca 18688606  T
Q  379 agttatgatgatgttttaaaccgagcagt 407  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  18688605 agttatgaagagattttaaaccgtgcagt 18688577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 386
Target Start/End: Original strand, 60480 - 60775
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  || |||    
T  60480 attaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagc 60579  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataga 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  60580 aactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagataga 60679  T
Q  291 aagtatgcatgcggtaaaagggttgtatggaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 386  Q
    ||  |   |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  60680 aaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatga 60775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Original strand, 28362 - 28563
Alignment:
Q  92 ttaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||| || || |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||    
T  28362 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccagtcttaaagcaaaggcttcaccgaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagca 28461  T
Q  192 gctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaa 291  Q
      ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||| |||    
T  28462 attgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaa 28561  T
Q  292 ag 293  Q
    ||    
T  28562 ag 28563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 293
Target Start/End: Original strand, 35642 - 35840
Alignment:
Q  95 agttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagct 194  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||| |||||||| ||||||||  || ||||  ||||  |    
T  35642 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 35741  T
Q  195 ggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
    | ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||||    
T  35742 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaag 35840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 265
Target Start/End: Original strand, 40491 - 40601
Alignment:
Q  155 ttcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccac 254  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  40491 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 40590  T
Q  255 tcgagacaaac 265  Q
    |||||||||||    
T  40591 tcgagacaaac 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Original strand, 43940 - 44070
Alignment:
Q  163 attcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 262  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43940 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 44039  T
Q  263 aacacttactaacctgtcatgggatagaaag 293  Q
     ||| || ||||   |||||||||| |||||    
T  44040 gacatttgctaaaaagtcatgggattgaaag 44070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 284
Target Start/End: Original strand, 16691778 - 16691971
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |   |||    
T  16691778 attaagttaggacatgttagtgaaggaattccaataataaaacaaaggctacaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagc 16691877  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgg 284  Q
    |  || | | | ||| |||||  | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16691878 aattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacaagtcatgg 16691971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17992472 - 17992290
Alignment:
Q  105 tgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttg 204  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||  ||||  || ||| ||||    
T  17992472 tgttaatgaaggtattccaatcataaagcaaaggctatgtcaaaagaaagttctcttgattctcgatgacatcgacaaactaaagcaattgcaggttttg 17992373  T
Q  205 gctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggat 287  Q
    | |||||  |  | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  17992372 gttggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggat 17992290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 3280552 - 3280748
Alignment:
Q  73 aaaacagttagatcggatattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatg 172  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | || ||  |||| ||| |||||||||    
T  3280552 aaaactgttggattggacattaagttaggagatagtagtgagggaattccaatcataaagcaaaggctacaccggaaaaaggttctattggttcttgatg 3280651  T
Q  173 atgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactt 269  Q
    | ||  || || || ||||| || | |  || |||||||| || ||||||||  ||  ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3280652 acgttaacgaattgaagcaggtgcaagtcttagctggagggcttgattggtttagtgttggtagtagggtgatcattaccactcgagacaaacactt 3280748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 57565 - 57363
Alignment:
Q  91 attaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagc 190  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||  || | |||||||| ||||||||  || | ||| |||    
T  57565 attaagttagtagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagc 57466  T
Q  191 agctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataga 290  Q
    |  |  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |  |||||||||| ||    
T  57465 aattacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagcaggtcatgggattga 57366  T
Q  291 aag 293  Q
    |||    
T  57365 aag 57363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5879694 - 5879638
Alignment:
Q  135 aaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5879694 aaggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgatgatgtggacaaagtggagca 5879638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5917059 - 5917003
Alignment:
Q  135 aaggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagca 191  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5917059 aaggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgatgatgtggacaaagtggagca 5917003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5982854 - 5982798
Alignment:
Q  136 aggctacatagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcag 192  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  5982854 aggcttcaaagaaagaaagtccttttgattcttgataatgtcgacaaagtgcagcag 5982798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University