View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7944_low_5 (Length: 255)

Name: NF7944_low_5
Description: NF7944
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7944_low_5
NF7944_low_5
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (13-185)||(12127563-12127735)
chr3 (21-185)||(53581581-53581745)
chr3 (13-185)||(13349157-13349329)
chr3 (13-185)||(33837807-33837984)
chr3 (13-185)||(31039555-31039727)
chr3 (13-185)||(1375995-1376168)
chr3 (13-185)||(36823977-36824149)
chr3 (13-185)||(50801596-50801768)
chr3 (13-185)||(50874112-50874284)
chr3 (13-172)||(17605508-17605667)
chr3 (19-179)||(3269398-3269558)
chr3 (13-185)||(53467349-53467521)
chr3 (13-186)||(8814799-8814972)
chr3 (19-178)||(27360025-27360183)
chr3 (20-185)||(3800218-3800384)
chr3 (21-185)||(50913006-50913170)
chr3 (19-185)||(27317661-27317828)
chr3 (13-185)||(32203175-32203343)
chr3 (13-148)||(22894545-22894679)
chr3 (19-185)||(48765214-48765383)
chr3 (48-185)||(26103649-26103785)
chr3 (13-185)||(29239592-29239763)
chr3 (13-114)||(8815081-8815182)
chr3 (22-167)||(45059534-45059681)
chr3 (22-167)||(6114827-6114974)
chr3 (22-167)||(12896683-12896830)
chr3 (22-167)||(47461740-47461887)
chr3 (22-167)||(7848573-7848719)
chr3 (22-167)||(21727691-21727838)
chr3 (28-151)||(37504603-37504727)
chr3 (21-81)||(54244747-54244807)
chr3 (22-167)||(6748652-6748798)
chr3 (47-165)||(34277513-34277630)
chr3 (22-167)||(51952247-51952395)
chr3 (22-165)||(17065774-17065918)
chr3 (57-121)||(30033084-30033148)
chr3 (22-150)||(7521421-7521551)
chr3 (22-167)||(11460196-11460342)
chr3 (22-165)||(994724-994868)
chr3 (22-145)||(8815399-8815523)
chr3 (22-167)||(6109166-6109313)
chr3 (42-167)||(26158254-26158381)
chr3 (54-146)||(29950609-29950701)
chr3 (54-146)||(29999763-29999855)
chr3 (22-85)||(4043765-4043828)
chr3 (22-167)||(27728237-27728386)
chr3 (22-85)||(30347776-30347839)
chr3 (21-63)||(30033154-30033196)
chr3 (22-146)||(995030-995155)
chr3 (65-165)||(12127587-12127687)
chr3 (65-165)||(50801620-50801720)
chr3 (65-165)||(50874160-50874260)
chr3 (65-106)||(53581605-53581646)
chr3 (58-167)||(2868201-2868312)
chr3 (22-85)||(3269235-3269298)
chr3 (22-85)||(17226204-17226267)
chr3 (22-85)||(26152512-26152575)
chr3 (19-62)||(30685186-30685229)
chr3 (22-150)||(51148014-51148143)
chr3 (128-165)||(29950657-29950694)
chr3 (128-165)||(29999811-29999848)
chr3 (65-106)||(48765318-48765359)
chr3 (65-98)||(53467464-53467497)
chr3 (141-185)||(22894875-22894919)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (21-185)||(13157556-13157723)
chr1 (19-185)||(36389456-36389622)
chr1 (13-185)||(16005596-16005769)
chr1 (13-185)||(26842989-26843161)
chr1 (13-185)||(28454737-28454909)
chr1 (21-185)||(5491601-5491765)
chr1 (19-185)||(34515126-34515294)
chr1 (19-179)||(51431884-51432045)
chr1 (20-184)||(50559248-50559412)
chr1 (13-167)||(10764648-10764803)
chr1 (13-185)||(16073429-16073603)
chr1 (13-184)||(24770622-24770792)
chr1 (21-184)||(41146283-41146446)
chr1 (19-185)||(6192421-6192589)
chr1 (19-185)||(34306437-34306607)
chr1 (49-185)||(13264563-13264699)
chr1 (13-185)||(8643028-8643197)
chr1 (69-185)||(463360-463476)
chr1 (19-146)||(33676084-33676212)
chr1 (21-179)||(4158108-4158265)
chr1 (13-185)||(14387246-14387417)
chr1 (21-185)||(42199885-42200049)
chr1 (21-185)||(42208753-42208917)
chr1 (13-183)||(158405-158576)
chr1 (19-185)||(32156015-32156181)
chr1 (21-185)||(45818813-45818977)
chr1 (13-185)||(3273364-3273537)
chr1 (13-114)||(28704453-28704554)
chr1 (78-185)||(3979434-3979541)
chr1 (21-146)||(23413706-23413831)
chr1 (21-185)||(32994184-32994334)
chr1 (13-150)||(13157272-13157411)
chr1 (89-185)||(27787868-27787964)
chr1 (22-165)||(13385776-13385921)
chr1 (75-165)||(32151919-32152009)
chr1 (13-98)||(20201691-20201776)
chr1 (13-110)||(28764540-28764637)
chr1 (19-167)||(39424264-39424413)
chr1 (19-167)||(16960278-16960427)
chr1 (22-185)||(27348129-27348290)
chr1 (22-146)||(47130976-47131101)
chr1 (22-167)||(14494367-14494514)
chr1 (57-165)||(32144027-32144135)
chr1 (13-84)||(10558203-10558274)
chr1 (28-167)||(27389527-27389670)
chr1 (13-85)||(3977963-3978035)
chr1 (30-109)||(10368092-10368172)
chr1 (22-151)||(20411195-20411326)
chr1 (22-114)||(50797663-50797755)
chr1 (47-183)||(9005149-9005282)
chr1 (13-74)||(463009-463070)
chr1 (13-114)||(24190834-24190935)
chr1 (57-141)||(32151834-32151918)
chr1 (22-167)||(36817648-36817795)
chr1 (22-165)||(20201739-20201884)
chr1 (139-185)||(33675853-33675899)
chr1 (101-167)||(43236241-43236307)
chr1 (28-121)||(3099574-3099667)
chr1 (22-167)||(12864332-12864477)
chr1 (100-148)||(32144129-32144177)
chr1 (22-167)||(32374579-32374726)
chr1 (55-185)||(28182165-28182295)
chr1 (100-146)||(32152003-32152049)
chr1 (22-167)||(52772244-52772391)
chr1 (65-165)||(28454761-28454861)
chr1 (65-165)||(36389498-36389598)
chr1 (65-165)||(13157596-13157699)
chr1 (125-185)||(47130812-47130872)
chr1 (130-165)||(6192465-6192500)
chr1 (13-72)||(32379581-32379640)
chr1 (22-81)||(43236152-43236211)
chr1 (65-165)||(16005620-16005721)
chr1 (60-98)||(32151972-32152010)
chr1 (65-98)||(463419-463452)
chr1 (61-98)||(3979484-3979521)
chr1 (65-98)||(13264587-13264620)
chr1 (65-98)||(26843104-26843137)
chr1 (65-98)||(27787907-27787940)
chr1 (22-83)||(28646760-28646821)
chr1 (65-98)||(51431902-51431935)
chr1 (22-147)||(27255650-27255777)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (13-185)||(27545753-27545925)
chr8 (21-185)||(13269265-13269430)
chr8 (13-185)||(2823633-2823805)
chr8 (13-185)||(10616284-10616456)
chr8 (13-185)||(26042972-26043144)
chr8 (13-177)||(32069015-32069179)
chr8 (19-185)||(35550623-35550789)
chr8 (21-185)||(5946818-5946982)
chr8 (13-161)||(26630022-26630171)
chr8 (13-185)||(1201662-1201834)
chr8 (21-185)||(25127870-25128036)
chr8 (21-185)||(30207168-30207332)
chr8 (19-185)||(13468332-13468499)
chr8 (19-178)||(36899736-36899897)
chr8 (13-185)||(184099-184272)
chr8 (28-185)||(3369720-3369876)
chr8 (13-185)||(8258353-8258525)
chr8 (13-185)||(34102993-34103165)
chr8 (19-185)||(25123377-25123543)
chr8 (30-184)||(45299620-45299774)
chr8 (21-185)||(9483951-9484116)
chr8 (19-172)||(23544836-23544990)
chr8 (21-185)||(30633096-30633260)
chr8 (13-185)||(26867954-26868127)
chr8 (47-185)||(29125741-29125879)
chr8 (21-185)||(32486958-32487123)
chr8 (21-181)||(9413809-9413969)
chr8 (25-185)||(13290501-13290661)
chr8 (21-185)||(10776976-10777138)
chr8 (21-121)||(17691216-17691316)
chr8 (13-132)||(39922359-39922478)
chr8 (28-185)||(39934432-39934590)
chr8 (13-121)||(25123652-25123760)
chr8 (21-177)||(35067000-35067159)
chr8 (19-112)||(7089934-7090028)
chr8 (22-167)||(1783003-1783149)
chr8 (13-95)||(42556675-42556757)
chr8 (79-185)||(44874165-44874271)
chr8 (28-109)||(23053922-23054003)
chr8 (22-165)||(19971483-19971627)
chr8 (22-165)||(21021186-21021330)
chr8 (22-165)||(31071555-31071698)
chr8 (22-167)||(9483650-9483796)
chr8 (90-185)||(1281915-1282010)
chr8 (30-150)||(30577877-30577999)
chr8 (22-150)||(14826358-14826487)
chr8 (22-167)||(21442129-21442275)
chr8 (22-97)||(18804323-18804398)
chr8 (130-185)||(23161350-23161405)
chr8 (117-180)||(42556759-42556822)
chr8 (19-105)||(34969910-34969996)
chr8 (61-165)||(1201710-1201814)
chr8 (65-165)||(10616332-10616432)
chr8 (65-165)||(45299643-45299743)
chr8 (22-85)||(4018669-4018732)
chr8 (65-165)||(32069063-32069163)
chr8 (22-167)||(41942860-41943003)
chr8 (22-85)||(3154203-3154266)
chr8 (22-85)||(14819308-14819371)
chr8 (101-167)||(21442400-21442466)
chr8 (128-165)||(184147-184184)
chr8 (65-98)||(13269289-13269322)
chr8 (128-165)||(17691256-17691293)
chr8 (65-98)||(23544847-23544880)
chr8 (61-98)||(25123486-25123523)
chr8 (128-165)||(26630070-26630107)
chr8 (65-98)||(27545868-27545901)
chr8 (65-98)||(36899847-36899880)
chr8 (128-165)||(39922393-39922430)
chr8 (61-98)||(39934452-39934489)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (13-185)||(938928-939100)
chr7 (13-185)||(28912115-28912287)
chr7 (13-185)||(9401647-9401819)
chr7 (19-185)||(19069429-19069595)
chr7 (13-185)||(25818517-25818690)
chr7 (21-185)||(454137-454301)
chr7 (13-185)||(11766154-11766326)
chr7 (19-185)||(18352312-18352479)
chr7 (13-185)||(15957205-15957377)
chr7 (13-185)||(38367847-38368019)
chr7 (28-185)||(41407375-41407532)
chr7 (12-185)||(2936673-2936847)
chr7 (13-185)||(2362785-2362955)
chr7 (13-181)||(2509312-2509479)
chr7 (13-181)||(23740075-23740244)
chr7 (13-179)||(38796814-38796981)
chr7 (23-185)||(27168254-27168416)
chr7 (13-185)||(6559390-6559559)
chr7 (13-185)||(2633883-2634053)
chr7 (13-185)||(6736504-6736674)
chr7 (65-165)||(27168292-27168392)
chr7 (19-185)||(41037391-41037558)
chr7 (22-167)||(32852909-32853055)
chr7 (22-167)||(11327648-11327795)
chr7 (22-167)||(12080751-12080897)
chr7 (22-167)||(15230117-15230263)
chr7 (22-167)||(38876166-38876313)
chr7 (30-167)||(14777979-14778117)
chr7 (22-165)||(20516974-20517119)
chr7 (22-167)||(28605494-28605639)
chr7 (22-167)||(37138934-37139081)
chr7 (22-167)||(48454543-48454690)
chr7 (26-114)||(3512505-3512593)
chr7 (22-151)||(18123080-18123211)
chr7 (129-184)||(3512711-3512766)
chr7 (22-181)||(45225430-45225592)
chr7 (22-185)||(27811975-27812140)
chr7 (22-165)||(24720315-24720459)
chr7 (22-121)||(27597131-27597231)
chr7 (22-151)||(14770143-14770273)
chr7 (22-151)||(15220594-15220724)
chr7 (22-165)||(22479260-22479404)
chr7 (22-167)||(34986577-34986724)
chr7 (22-85)||(18829833-18829896)
chr7 (22-165)||(8047972-8048112)
chr7 (39-151)||(14719010-14719123)
chr7 (101-181)||(45225297-45225378)
chr7 (23-167)||(7437798-7437944)
chr7 (65-165)||(25818541-25818642)
chr7 (128-166)||(38367894-38367932)
chr7 (65-98)||(2936697-2936730)
chr7 (144-185)||(7835347-7835388)
chr7 (65-98)||(11766178-11766211)
chr7 (65-98)||(28912139-28912172)
chr7 (49-167)||(43711964-43712084)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (21-185)||(6260992-6261156)
chr5 (13-185)||(14369784-14369956)
chr5 (20-182)||(25912042-25912204)
chr5 (13-185)||(4083755-4083927)
chr5 (13-185)||(4737949-4738121)
chr5 (14-185)||(31752133-31752304)
chr5 (13-182)||(7944308-7944476)
chr5 (21-185)||(17421711-17421875)
chr5 (19-185)||(33696070-33696236)
chr5 (22-185)||(2528784-2528949)
chr5 (21-185)||(2695097-2695260)
chr5 (13-185)||(6436440-6436612)
chr5 (13-185)||(12910015-12910187)
chr5 (13-185)||(39548835-39549005)
chr5 (47-185)||(31240271-31240409)
chr5 (13-178)||(17232909-17233074)
chr5 (13-185)||(28747779-28747952)
chr5 (19-185)||(39038536-39038703)
chr5 (19-185)||(22701743-22701908)
chr5 (28-183)||(10951074-10951229)
chr5 (19-185)||(17233273-17233437)
chr5 (21-183)||(22800641-22800804)
chr5 (21-185)||(13711032-13711198)
chr5 (13-179)||(9124725-9124893)
chr5 (19-185)||(3038904-3039057)
chr5 (13-117)||(32736345-32736449)
chr5 (13-162)||(857928-858079)
chr5 (21-182)||(33832736-33832899)
chr5 (60-185)||(8410658-8410783)
chr5 (13-94)||(11351811-11351892)
chr5 (13-121)||(15294119-15294227)
chr5 (22-167)||(11448772-11448919)
chr5 (22-167)||(30687915-30688062)
chr5 (30-181)||(15808995-15809149)
chr5 (22-146)||(26905956-26906080)
chr5 (22-148)||(4736850-4736977)
chr5 (22-167)||(1951434-1951580)
chr5 (39-148)||(17209894-17210004)
chr5 (22-115)||(37468625-37468719)
chr5 (19-179)||(10471017-10471175)
chr5 (22-185)||(33282276-33282441)
chr5 (40-148)||(37282237-37282346)
chr5 (22-167)||(1921499-1921646)
chr5 (22-165)||(3960639-3960783)
chr5 (13-81)||(17210137-17210204)
chr5 (22-151)||(29302105-29302236)
chr5 (65-165)||(25912083-25912183)
chr5 (19-183)||(38952207-38952372)
chr5 (22-121)||(17559225-17559325)
chr5 (22-147)||(37249361-37249488)
chr5 (22-151)||(17605096-17605226)
chr5 (29-181)||(33026252-33026406)
chr5 (94-148)||(40234162-40234216)
chr5 (61-98)||(4083775-4083812)
chr5 (65-165)||(14369808-14369908)
chr5 (65-165)||(31240285-31240385)
chr5 (19-164)||(3189723-3189867)
chr5 (49-143)||(38661242-38661337)
chr5 (23-69)||(19334841-19334887)
chr5 (128-165)||(2695137-2695174)
chr5 (65-98)||(17233024-17233057)
chr5 (65-98)||(17421735-17421768)
chr5 (61-98)||(22800749-22800786)
chr5 (128-165)||(32736364-32736401)
chr5 (61-94)||(39038556-39038589)
chr5 (65-98)||(39548948-39548981)
chr5 (125-165)||(8410659-8410699)
chr5 (28-167)||(30667588-30667725)
chr5 (58-151)||(33833090-33833185)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (13-185)||(34082557-34082729)
chr2 (13-178)||(33739537-33739702)
chr2 (23-185)||(16075075-16075237)
chr2 (13-185)||(11675142-11675315)
chr2 (19-185)||(18370228-18370394)
chr2 (19-185)||(23387159-23387325)
chr2 (19-185)||(1576649-1576815)
chr2 (13-185)||(16513106-16513275)
chr2 (13-185)||(23664738-23664911)
chr2 (21-185)||(1750221-1750384)
chr2 (13-181)||(29512111-29512281)
chr2 (21-185)||(768576-768741)
chr2 (13-185)||(8386687-8386862)
chr2 (13-185)||(42850006-42850178)
chr2 (13-185)||(37169547-37169718)
chr2 (13-181)||(13002058-13002226)
chr2 (21-185)||(41527927-41528092)
chr2 (22-133)||(23387064-23387176)
chr2 (22-167)||(9689387-9689534)
chr2 (22-165)||(33173549-33173692)
chr2 (22-167)||(44542897-44543043)
chr2 (19-99)||(29511962-29512042)
chr2 (22-185)||(6332288-6332453)
chr2 (13-106)||(39435142-39435235)
chr2 (69-185)||(17265317-17265433)
chr2 (57-121)||(20940000-20940064)
chr2 (22-167)||(39906281-39906428)
chr2 (19-112)||(45629733-45629823)
chr2 (39-165)||(2586431-2586558)
chr2 (17-151)||(9690165-9690300)
chr2 (22-167)||(20939722-20939868)
chr2 (13-87)||(32601381-32601455)
chr2 (22-167)||(22301990-22302136)
chr2 (47-179)||(29403983-29404115)
chr2 (22-149)||(30406473-30406601)
chr2 (22-181)||(39904687-39904849)
chr2 (19-114)||(41088785-41088880)
chr2 (22-151)||(22711045-22711175)
chr2 (22-165)||(4293216-4293360)
chr2 (22-167)||(44257506-44257654)
chr2 (65-165)||(33739585-33739685)
chr2 (22-121)||(3769659-3769759)
chr2 (22-151)||(38987023-38987154)
chr2 (22-85)||(1297602-1297665)
chr2 (29-63)||(20940070-20940104)
chr2 (22-150)||(15554034-15554163)
chr2 (65-98)||(16075099-16075132)
chr2 (65-98)||(18370337-18370370)
chr2 (61-98)||(23664854-23664891)
chr2 (13-62)||(44288895-44288944)
chr2 (153-185)||(29513923-29513955)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (13-185)||(26335775-26335947)
chr4 (19-185)||(9744143-9744309)
chr4 (19-185)||(15725213-15725379)
chr4 (13-185)||(49425765-49425937)
chr4 (13-179)||(20458837-20459004)
chr4 (19-185)||(6946679-6946840)
chr4 (21-185)||(33105946-33106110)
chr4 (13-185)||(46106708-46106880)
chr4 (21-185)||(52306802-52306966)
chr4 (19-185)||(40496153-40496320)
chr4 (13-185)||(38425657-38425829)
chr4 (13-184)||(45875794-45875965)
chr4 (13-183)||(11777501-11777671)
chr4 (53-185)||(14863007-14863138)
chr4 (13-177)||(23383931-23384092)
chr4 (21-182)||(16553462-16553623)
chr4 (29-185)||(4490699-4490856)
chr4 (13-185)||(29102019-29102192)
chr4 (13-185)||(6192960-6193133)
chr4 (19-185)||(4712691-4712858)
chr4 (19-161)||(142677-142819)
chr4 (65-185)||(6137556-6137676)
chr4 (19-178)||(14948163-14948322)
chr4 (13-150)||(43639068-43639208)
chr4 (13-185)||(36955391-36955562)
chr4 (22-181)||(52437437-52437599)
chr4 (19-121)||(102258-102361)
chr4 (22-185)||(26958590-26958754)
chr4 (13-185)||(54742482-54742658)
chr4 (21-85)||(38425572-38425636)
chr4 (19-185)||(40496480-40496640)
chr4 (22-167)||(42807911-42808058)
chr4 (78-185)||(33811079-33811186)
chr4 (22-167)||(5046641-5046787)
chr4 (22-167)||(10216252-10216398)
chr4 (22-181)||(48560054-48560215)
chr4 (76-185)||(49606053-49606162)
chr4 (22-167)||(6214054-6214201)
chr4 (22-167)||(3818815-3818963)
chr4 (22-167)||(13211886-13212032)
chr4 (65-185)||(6137532-6137652)
chr4 (22-167)||(7630128-7630275)
chr4 (22-167)||(13621169-13621315)
chr4 (22-151)||(49970682-49970811)
chr4 (22-146)||(30820489-30820614)
chr4 (128-185)||(43639011-43639068)
chr4 (22-167)||(17377564-17377711)
chr4 (21-84)||(13211553-13211616)
chr4 (22-165)||(21519804-21519949)
chr4 (23-151)||(51783970-51784100)
chr4 (19-167)||(41172481-41172630)
chr4 (22-167)||(12584286-12584433)
chr4 (22-167)||(14202870-14203017)
chr4 (22-151)||(17181037-17181170)
chr4 (22-167)||(50182246-50182390)
chr4 (22-151)||(5157085-5157215)
chr4 (22-151)||(13371298-13371428)
chr4 (22-151)||(13381499-13381629)
chr4 (22-165)||(34683048-34683193)
chr4 (65-161)||(15725237-15725333)
chr4 (22-150)||(30258127-30258256)
chr4 (60-165)||(49425813-49425918)
chr4 (65-165)||(6946703-6946803)
chr4 (65-165)||(9744185-9744285)
chr4 (65-165)||(26335799-26335899)
chr4 (19-147)||(53975202-53975330)
chr4 (65-104)||(4712715-4712754)
chr4 (22-85)||(17745300-17745363)
chr4 (22-85)||(47382306-47382369)
chr4 (22-150)||(578757-578889)
chr4 (101-167)||(13621395-13621461)
chr4 (65-98)||(11777616-11777649)
chr4 (128-165)||(14863093-14863130)
chr4 (61-98)||(23384043-23384080)
chr4 (65-98)||(52437546-52437579)
[»] scaffold0418 (3 HSPs)
scaffold0418 (19-185)||(5715-5881)
scaffold0418 (19-121)||(5394-5497)
scaffold0418 (129-165)||(5803-5839)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (13-182)||(4898438-4898607)
chr6 (21-185)||(3437993-3438157)
chr6 (13-185)||(14488327-14488499)
chr6 (13-185)||(25061683-25061854)
chr6 (19-179)||(4838310-4838476)
chr6 (19-185)||(33730550-33730713)
chr6 (13-185)||(18102717-18102890)
chr6 (28-185)||(30525362-30525518)
chr6 (13-184)||(11742352-11742523)
chr6 (19-179)||(4898125-4898286)
chr6 (13-185)||(21969886-21970058)
chr6 (12-185)||(15718237-15718411)
chr6 (19-185)||(11009912-11010080)
chr6 (81-185)||(18154573-18154677)
chr6 (19-185)||(11100085-11100254)
chr6 (28-184)||(26211286-26211442)
chr6 (22-167)||(11100381-11100528)
chr6 (22-167)||(16599070-16599217)
chr6 (22-181)||(15962738-15962900)
chr6 (22-186)||(9406610-9406775)
chr6 (22-167)||(10777944-10778091)
chr6 (22-150)||(9955796-9955926)
chr6 (39-167)||(29646266-29646396)
chr6 (22-167)||(1369900-1370046)
chr6 (21-110)||(5703852-5703941)
chr6 (22-149)||(5187771-5187899)
chr6 (22-165)||(8171928-8172072)
chr6 (22-167)||(31132877-31133024)
chr6 (22-167)||(4184262-4184407)
chr6 (22-179)||(26667866-26668026)
chr6 (22-85)||(11210298-11210361)
chr6 (61-165)||(25061703-25061807)
chr6 (142-185)||(228020-228063)
chr6 (22-85)||(15881927-15881990)
chr6 (22-81)||(24022875-24022934)
chr6 (147-185)||(11122528-11122566)
chr6 (101-167)||(20755437-20755503)
chr6 (128-165)||(4838397-4838434)
chr6 (128-165)||(11742438-11742475)
chr6 (65-98)||(14488351-14488384)
chr6 (65-98)||(33730574-33730607)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (19-185)||(9730-9897)
scaffold0015 (65-98)||(9840-9873)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (21-185)||(20619-20784)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (13-185)||(4092-4263)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (13-185)||(596-768)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (13-182)||(6574-6743)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (22-181)||(452367-452528)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (19-86)||(1378-1444)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (19-86)||(1624-1690)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (22-165)||(57947-58092)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (22-179)||(2767-2927)
scaffold0119 (22-179)||(14822-14982)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (22-150)||(26052-26182)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (22-81)||(82743-82802)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-148)||(65961-66087)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (29-106)||(22624-22701)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12127735 - 12127563
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12127735 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 12127636  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12127635 taggcattttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgttataactaaaaagtagtt 12127563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 53581745 - 53581581
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581745 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 53581646  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53581645 tgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 53581581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13349329 - 13349157
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13349329 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccaa 13349230  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13349229 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 13349157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 33837807 - 33837984
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33837807 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 33837906  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataa----ttaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  33837907 atagacatttgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaattaaaaagtagtt 33837984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 31039555 - 31039727
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31039555 tagcaaagatataactaaaaatttgttcaatacaccttaaggtgaatgatgctaaaacacacattctaaaaaataagtgcgtgtatgttagcaactccta 31039654  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31039655 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 31039727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 1375995 - 1376168
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1375995 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 1376094  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1376095 ataggcatttgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 1376168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36824149 - 36823977
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  36824149 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagtaactccaa 36824050  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36824049 taggcatttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 36823977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50801768 - 50801596
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  50801768 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaatgagtgtatgttagcaactccta 50801669  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50801668 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 50801596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 50874112 - 50874284
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  50874112 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaatgagtgtatgttagcaactccta 50874211  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50874212 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 50874284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17605667 - 17605508
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17605667 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttctaaaaaataagtgggggtatgttagcaactccta 17605568  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataa 172  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17605567 tatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtttgttttagcaagttataa 17605508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3269558 - 3269398
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  3269558 agatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttaccaactcctatatgca 3269459  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  3269458 tttgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgttataactaaaaa 3269398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 53467349 - 53467521
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |     
T  53467349 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaatataagttggtgtatgttagcaactcatg 53467448  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53467449 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 53467521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8814972 - 8814799
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8814972 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 8814873  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttc 186  Q
    ||  ||||| | || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8814872 taagcatttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttatgattaaaaagtagttc 8814799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27360183 - 27360025
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27360183 agatataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatag-ca 27360085  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    ||| | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27360084 tttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 27360025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3800384 - 3800218
Alignment:
Q  20 gatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||    
T  3800384 gatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacatctataagcat 3800285  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaa-gatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3800284 tttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 3800218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 50913006 - 50913170
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  50913006 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattctaaaaaataaatgggtgtatgttagcaactcctacaggcatt 50913105  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  50913106 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagttataactaaaaagtagtt 50913170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27317828 - 27317661
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaaca-caccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27317828 agatataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 27317729  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27317728 atttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 27317661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32203343 - 32203175
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32203343 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtg----ttgctaaaacatacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactctta 32203248  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32203247 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaagtagtt 32203175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 22894545 - 22894679
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22894545 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacat-ctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 22894643  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttag 148  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22894644 taaacatttgctaggatacacccacttattttttag 22894679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 48765214 - 48765383
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgtta---aaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatag 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  48765214 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctactaaaacacactttctacaaaataagtgggtgtatgttaacaactcctatgg 48765313  T
Q  116 acatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | |||| | |  |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48765314 atatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagtt 48765383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 185
Target Start/End: Original strand, 26103649 - 26103785
Alignment:
Q  48 cttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| ||||||||||||    
T  26103649 cttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgccagga--cacccacttatttttt 26103746  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26103747 agaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaaatagtt 26103785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 29239592 - 29239763
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  29239592 tagcaaagatataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacactcattctaaaaa--atgtaggtgtatgttagcaactcgta 29239689  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| |||||   |  |||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29239690 taggcatttgttaaaatacacccacatatttttttagaatgtgtgttttaccaagttataactaaaaagtagtt 29239763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8815182 - 8815081
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8815182 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacgttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 8815083  T
Q  113 ta 114  Q
    ||    
T  8815082 ta 8815081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 45059534 - 45059681
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  45059534 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 45059633  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  45059634 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 45059681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6114974 - 6114827
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  6114974 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 6114875  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  6114874 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 6114827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12896830 - 12896683
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  12896830 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 12896731  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  12896730 ttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagt 12896683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47461887 - 47461740
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||| || |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  47461887 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaattaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 47461788  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  47461787 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 47461740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7848719 - 7848573
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  7848719 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 7848620  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7848619 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 7848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21727838 - 21727691
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||   | |||||||| |  |||||| ||||| || |||    
T  21727838 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctacaggcat 21727739  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  21727738 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 21727691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37504727 - 37504603
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaag 126  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| ||||||||||||||   ||    
T  37504727 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgttag 37504628  T
Q  127 gatacactcacttattttttagaag 151  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  37504627 aatacacccacttattttttagaag 37504603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 54244807 - 54244747
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54244807 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaa 54244747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 6748652 - 6748798
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||  ||||    
T  6748652 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatt 6748751  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  6748752 tgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagt 6748798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 34277513 - 34277630
Alignment:
Q  47 ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||| ||||||||||||    
T  34277513 ccttgaggtgtatgttgttataacacatatttttaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacgttt-gtagaatacacccacttatttttt 34277611  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||  || |||||||||    
T  34277612 agaaggagtattttagcaa 34277630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51952395 - 51952247
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  51952395 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 51952296  T
Q  120 ttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  51952295 ttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagt 51952247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17065918 - 17065774
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  17065918 tataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 17065819  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || ||  || |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17065818 tgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 17065774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Original strand, 30033084 - 30033148
Alignment:
Q  57 aatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30033084 aatgttgctaacacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggcattt 30033148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7521551 - 7521421
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | ||||||||||  |||||| |||||||| |||    
T  7521551 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaatcctataggcat 7521452  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    ||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  7521451 ttgttagaatacacccacttattttttagaa 7521421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11460342 - 11460196
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||    |||||| |||||||| ||||    
T  11460342 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgctctagcaaatcctataggcatt 11460243  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || || ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  11460242 tgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 11460196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 994724 - 994868
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||  |  ||||||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  994724 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaacaattgggtgtgttctaccaaatcctataggcatt 994823  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  994824 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 994868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8815523 - 8815399
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  8815523 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttttagcaaatcctataggcatt 8815424  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttt 145  Q
    | | || ||||||  ||||||||||    
T  8815423 tgctagaatacacctacttattttt 8815399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 6109166 - 6109313
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| || ||||| |||    
T  6109166 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 6109265  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| || |||||||||||||   || |||||||||||    
T  6109266 ttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagt 6109313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 167
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158381
Alignment:
Q  42 atacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcactt 139  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| | || ||||||  ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  140 attttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagt 26158381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29950701 - 29950609
Alignment:
Q  54 gtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||   || |||||| ||||||||||||    
T  29950701 gtgaatgttgctaaaacacttcttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29950609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29999855 - 29999763
Alignment:
Q  54 gtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||   || |||||| ||||||||||||    
T  29999855 gtgaatgttgctaaaacacttcttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29999763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4043828 - 4043765
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  4043828 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 4043765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27728386 - 27728237
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacac--cttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |    
T  27728386 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttttagcaaatcctataggc 27728287  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||| |   ||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||||||    
T  27728286 atttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagt 27728237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 30347776 - 30347839
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  30347776 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 30347839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 30033196 - 30033154
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttg 63  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30033196 atataataaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttg 30033154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 995030 - 995155
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  | |||||| | |  |||||| |||||||| ||||    
T  995030 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaatcctataggcatt 995129  T
Q  121 tacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    | | || |||||  ||||||||||||    
T  995130 tgctagaatacaaccacttatttttt 995155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 12127587 - 12127687
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12127587 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagaaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 12127685  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  12127686 aa 12127687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 50801620 - 50801720
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  50801620 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacactcatttattttatagaagttgtgttttagc 50801718  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  50801719 aa 50801720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50874260 - 50874160
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  50874260 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacactcatttattttatagaagttgtgttttagc 50874162  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  50874161 aa 50874160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Original strand, 53581605 - 53581646
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53581605 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcttagcaa 53581646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Original strand, 2868201 - 2868312
Alignment:
Q  58 atgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgt 155  Q
    |||||| || ||||||| |||||| |||  || |||||||| |  |||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  2868201 atgttgctataacacacattctaacaaaattaagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagt 2868300  T
Q  156 gttttagcaagt 167  Q
    ||||||||||||    
T  2868301 gttttagcaagt 2868312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 3269235 - 3269298
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3269235 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 3269298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 17226204 - 17226267
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17226204 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 17226267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 26152512 - 26152575
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  26152512 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 26152575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30685229 - 30685186
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgtt 62  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30685229 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgtt 30685186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 51148014 - 51148143
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaa--aatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||  || | |||||||| |  |||||| ||||||||| ||    
T  51148014 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataga-at 51148112  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    || | || |  ||| ||||||||||||||||    
T  51148113 ttgctagaacgcacccacttattttttagaa 51148143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 29950657 - 29950694
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29950657 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29950694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 29999811 - 29999848
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29999811 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29999848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 48765359 - 48765318
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48765359 taaaacacaccttctaaaaaataaatgggtgtattttagcaa 48765318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53467497 - 53467464
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53467497 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 53467464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Original strand, 22894875 - 22894919
Alignment:
Q  141 ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22894875 ttttatagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 22894919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 13157556 - 13157723
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaac---tcctatagac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  13157556 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactgatcctatagac 13157655  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13157656 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 13157723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 36389456 - 36389622
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36389456 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 36389555  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36389556 tttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 36389622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16005769 - 16005596
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16005769 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 16005670  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16005669 ataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 16005596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 26842989 - 26843161
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26842989 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaataagtgggtgtgtgttagcaactccta 26843088  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26843089 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 26843161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28454909 - 28454737
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28454909 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaaaagtgggtgtatgttagcaactccta 28454810  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28454809 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaacagtagtt 28454737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 5491601 - 5491765
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5491601 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgattgttgctgaaacactacttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 5491700  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5491701 tactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 5491765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 34515126 - 34515294
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctataga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  34515126 agatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacgcatcttcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagg 34515225  T
Q  117 catttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||   || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34515226 catttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 34515294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51432045 - 51431884
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51432045 agatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttaggaactcctatagac 51431946  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51431945 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaaaa 51431884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 50559248 - 50559412
Alignment:
Q  20 gatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| |||    
T  50559248 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataaatagatgtatgttagcaactcctataggcat 50559347  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||   ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50559348 ttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 50559412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10764803 - 10764648
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10764803 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactctt 10764704  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10764703 atagacattttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagt 10764648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 16073429 - 16073603
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||    
T  16073429 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcc 16073528  T
Q  111 tatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || || |||||   | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16073529 tacaggcatttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 16073603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Original strand, 24770622 - 24770792
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24770622 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacat-ttaaggggaatgttgctaaaataaaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaaccccta 24770720  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24770721 taggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 24770792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41146446 - 41146283
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  41146446 atataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaagaaataagtgggcgtatgttaacaactccaatagacatt 41146347  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    | | |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41146346 tgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 41146283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 6192421 - 6192589
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaagg--tgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctataga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  6192421 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtgtgttagcaactcctatatg 6192520  T
Q  117 catttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| | || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6192521 catttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagttataactaaaaagtagtt 6192589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 34306437 - 34306607
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34306437 agatataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggca 34306536  T
Q  119 tttacaaggatacact----cacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34306537 tttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagttataactaaaaagtagtt 34306607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13264699 - 13264563
Alignment:
Q  49 ttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttag 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  13264699 ttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttag 13264600  T
Q  149 aagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13264599 aaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 13264563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8643197 - 8643028
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||   | | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8643197 tagcaaagatataactaaaaagttgttaa---cactttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 8643101  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||  ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8643100 tacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataaccaaaaagtagtt 8643028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Original strand, 463360 - 463476
Alignment:
Q  69 acacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  463360 acacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtt 463459  T
Q  169 ataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||||||||||    
T  463460 ataactaaaaagtagtt 463476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33676212 - 33676084
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33676212 agatataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcctatagac 33676113  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  33676112 atttgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 4158108 - 4158265
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  4158108 atataattaaaa-gttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctataagcatt 4158206  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |   |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4158207 tgttaggaaacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaa 4158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 14387246 - 14387417
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  14387246 tagcaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaataaatgggtgcatgttagcagctccta 14387345  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||||| || |||||  || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  14387346 tagccatttactagaatacatccattta-tttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaaatagtt 14387417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42200049 - 42199885
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||||    
T  42200049 atataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatt 42199950  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42199949 tgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagtagtt 42199885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42208917 - 42208753
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||||    
T  42208917 atataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatt 42208818  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42208817 tgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagtagtt 42208753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 158405 - 158576
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  158405 tagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaaatggatgtatgttagcaactcct 158504  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    ||||  |||| | |  || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158505 ataggaatttgctataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtag 158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32156181 - 32156015
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  32156181 agatataactaaaaaattgttaaatgcaccttaagatgaatgttgctaaaacaccgtttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctgtatgca 32156082  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32156081 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagttataaataaaaagtagtt 32156015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45818977 - 45818813
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45818977 atataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcatatagacat 45818879  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  45818878 ttgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaattataactaaaaagaagtt 45818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3273537 - 3273364
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3273537 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 3273438  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| |||||   || || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  3273437 ataggcatttgttagaatgcacccacttattttttaaaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaaatagtt 3273364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28704554 - 28704453
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  28704554 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataaatgagtgtatattagcaactccta 28704455  T
Q  113 ta 114  Q
    ||    
T  28704454 ta 28704453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Original strand, 3979434 - 3979541
Alignment:
Q  78 ctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaa 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  3979434 ctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagttataactaaa 3979533  T
Q  178 aagtagtt 185  Q
    ||||||||    
T  3979534 aagtagtt 3979541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23413831 - 23413706
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23413831 atataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatacaagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacatt 23413732  T
Q  121 tacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    | | || |||||  ||||||||||||    
T  23413731 tgctagaatacatccacttatttttt 23413706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 32994184 - 32994334
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  32994184 atataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct--------------gggtgtatgttagcaaatcatatggccatt 32994269  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32994270 tgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 32994334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Original strand, 13157272 - 13157411
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13157272 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcc 13157371  T
Q  111 tatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    ||||| ||||| | |  || ||| ||||||||||||||||    
T  13157372 tataggcatttgctataattcacccacttattttttagaa 13157411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Original strand, 27787868 - 27787964
Alignment:
Q  89 gtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27787868 gtgggtgtatgttagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 27787964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13385921 - 13385776
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  13385921 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13385822  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  13385821 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaa 13385776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Original strand, 32151919 - 32152009
Alignment:
Q  75 cttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32151919 cttctataaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32152009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 20201691 - 20201776
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20201691 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattataaaaaataagtgggtgtat 20201776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 28764540 - 28764637
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  28764540 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtaagttatcaactcc 28764637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 39424264 - 39424413
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||||||| |    
T  39424264 agatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 39424363  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||| | || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  39424364 atttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagt 39424413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 16960278 - 16960427
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| || ||||| |    
T  16960278 agatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcatataggc 16960377  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16960378 atttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagt 16960427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 27348129 - 27348290
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  27348129 tataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacaccttataaaaaataaatgggtatgtgttagcaactcttatag-cattt 27348226  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
       || ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  27348227 gttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataactaaaaaatagtt 27348290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 47131101 - 47130976
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  47131101 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 47131002  T
Q  121 tacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    | | || |||||| ||||||||||||    
T  47131001 tgctagaatacacccacttatttttt 47130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 14494367 - 14494514
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  14494367 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 14494466  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  14494467 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 14494514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 32144027 - 32144135
Alignment:
Q  57 aatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtg 156  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  32144027 aatgttgctaaaacacatattctagaaaataagtgggtgtatgttagcaactcttatatgcatttgctgggatacacccacttattttttagaaggtgta 32144126  T
Q  157 ttttagcaa 165  Q
     ||||||||    
T  32144127 atttagcaa 32144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 10558203 - 10558274
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaa 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  10558203 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcatctaaaaa 10558274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27389670 - 27389527
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagca----actcctatagacatttac 123  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||    | |||||||| ||||| |    
T  27389670 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcaatcctataggcatttgc 27389571  T
Q  124 aaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
     || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  27389570 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 27389527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 3977963 - 3978035
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  3977963 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaccgcaccttcttaaaaa 3978035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 10368092 - 10368172
Alignment:
Q  30 aaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactc 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  10368092 aaaatttgttaaatacaccttaagttgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtggatgtaagttagcaactc 10368172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 20411195 - 20411326
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20411195 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagtcat 20411294  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||    
T  20411295 ttgctagaatacacccacttattttttagaag 20411326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Original strand, 50797663 - 50797755
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctata 114  Q
    ||||| |||||||||   |||||| |||| || || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  50797663 tataactaaaaagttaacaaatactccttgagatgtatgttgttataacccaccttctaaaaaataagtgggtgtatgatagcaactcctata 50797755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Original strand, 9005149 - 9005282
Alignment:
Q  47 ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| | |  ||||||  |||||||||||    
T  9005149 ccttgaggtgaatgttgttaaaacacttattctaaataatatgtgggtgtaagttagcaactcccacaatcatttgctaaaatacacctacttatttttt 9005248  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    ||||   ||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  9005249 agaa---gtgttttagcatgtcataactaagaagtag 9005282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 463009 - 463070
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacac 74  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  463009 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttcctaaaacacac 463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24190935 - 24190834
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| || |||    
T  24190935 tagcagagttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaataagtaagtgtatattagcatcttcta 24190836  T
Q  113 ta 114  Q
    ||    
T  24190835 ta 24190834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Original strand, 32151834 - 32151918
Alignment:
Q  57 aatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttat 141  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||    
T  32151834 aatgttcttaaaacacatattctataaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaagatacacccacttat 32151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 36817648 - 36817795
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||| ||||||||  ||    
T  36817648 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggaat 36817747  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  36817748 ttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagt 36817795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20201884 - 20201739
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||  ||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  20201884 tataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 20201785  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | |  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20201784 ttgctataatacacccacttattttttataatgtgtgttttagcaa 20201739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675853
Alignment:
Q  139 tattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 33675853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Original strand, 43236241 - 43236307
Alignment:
Q  101 tagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43236241 tagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagt 43236307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Original strand, 3099574 - 3099667
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || |||||| || ||||||| ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3099574 taaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattctaaaaaataaatagatgtatgttaacaactcctataaacattt 3099667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12864477 - 12864332
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||   |||||| | |||||||| |  |||||| || ||||| |||||    
T  12864477 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacacctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcattt 12864378  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
     | || |||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  12864377 gctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagt 12864332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 148
Target Start/End: Original strand, 32144129 - 32144177
Alignment:
Q  100 ttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttag 148  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  32144129 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag 32144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32374726 - 32374579
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||  |||| | |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  32374726 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacat 32374627  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||   | ||||||| |||||| ||| ||||||  || |||||||||||    
T  32374626 ttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagt 32374579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28182295 - 28182165
Alignment:
Q  55 tgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatg 154  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |  ||||| | |  ||||||  ||||||||||| |||   |    
T  28182295 tgaatgttgtcaaaacactcattctaaaaaataagtgggcgtaagttagcaactcccacaagcatttgctaaaatacaccaacttatttttttgaaagag 28182196  T
Q  155 tgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  28182195 tgttttaacatgtcataactaaaaagtagtt 28182165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Original strand, 32152003 - 32152049
Alignment:
Q  100 ttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  32152003 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 52772244 - 52772391
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat---gtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |    |||||||| |  |||||| || ||||| ||    
T  52772244 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgt-ataacacatcttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggca 52772342  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  52772343 tttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagt 52772391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 28454761 - 28454861
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28454761 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccactttttttttagaaggtgtgttttagc 28454859  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  28454860 aa 28454861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36389598 - 36389498
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36389598 taaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 36389500  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  36389499 aa 36389498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13157699 - 13157596
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactc-ctataga--catttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgtttta 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |  ||||||   || || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13157699 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgtctataggatcagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 13157600  T
Q  162 gcaa 165  Q
    ||||    
T  13157599 gcaa 13157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Original strand, 47130812 - 47130872
Alignment:
Q  125 aggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47130812 aggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggttataactaaaaagtagtt 47130872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6192500 - 6192465
Alignment:
Q  130 acactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192500 acacccacttattttttagaagatgtgttttagcaa 6192465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32379640 - 32379581
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacac 72  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  32379640 tagcaaagatgtaactaaaaagttgttaaatacatctcaaggtgaatgttgctaaaacac 32379581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Original strand, 43236152 - 43236211
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa 81  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  43236152 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 43236211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 16005620 - 16005721
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttag 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16005620 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttag 16005718  T
Q  163 caa 165  Q
    |||    
T  16005719 caa 16005721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 32152010 - 32151972
Alignment:
Q  60 gttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32152010 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 32151972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 463452 - 463419
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  463452 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 463419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3979521 - 3979484
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3979521 ttgttaaagcacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 3979484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 13264587 - 13264620
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13264587 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 13264620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26843137 - 26843104
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26843137 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 26843104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27787940 - 27787907
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27787940 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 27787907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 83
Target Start/End: Original strand, 28646760 - 28646821
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaa 83  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  28646760 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaa 28646821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 51431902 - 51431935
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51431902 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 51431935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 27255650 - 27255777
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||| || ||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  27255650 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 27255749  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttatttttta 147  Q
    || | || |||||| | |||||||||||    
T  27255750 ttgctagaatacaccctcttatttttta 27255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 27545753 - 27545925
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27545753 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 27545852  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27545853 taagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 27545925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13269430 - 13269265
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13269430 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 13269331  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13269330 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 13269265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2823805 - 2823633
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2823805 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataattgggtgtatgttagcaactccta 2823706  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2823705 tagacatttgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 2823633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 10616284 - 10616456
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10616284 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 10616383  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10616384 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 10616456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26043144 - 26042972
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26043144 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaactccta 26043045  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26043044 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 26042972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 32069015 - 32069179
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32069015 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 32069114  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaa 177  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32069115 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaa 32069179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35550789 - 35550623
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35550789 agatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaatataagtgggtgtatattagcaactcctataggca 35550690  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35550689 tttgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 35550623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5946982 - 5946818
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5946982 atataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatcggcat 5946883  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5946882 ttgctaggatacac-cacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 5946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 26630022 - 26630171
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26630022 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 26630121  T
Q  113 tagacattta-caaggatacactcacttattttttagaagatgtgtttta 161  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26630122 tagacatttagctaggatacacccacttatttttttgaagatgtgtttta 26630171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 1201662 - 1201834
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1201662 tagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 1201761  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  1201762 taggcatttgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagtt 1201834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 25127870 - 25128036
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25127870 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacagaca 25127969  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25127970 tttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 25128036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 30207168 - 30207332
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30207168 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 30207267  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaaga-tgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30207268 tgctagaatacacccacttatttttta-aagagtgtgttttagcaaattataattaaaaagtagtt 30207332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13468499 - 13468332
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13468499 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 13468400  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | |  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13468399 atttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaaaagtagtt 13468332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 36899736 - 36899897
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgc--cttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctataga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  36899736 agatataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctatacg 36899835  T
Q  117 catttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36899836 catttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 36899897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 184099 - 184272
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  184099 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacccata 184198  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  184199 tagacatttgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagttataactaaaaagtagtt 184272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Original strand, 3369720 - 3369876
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  3369720 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagg 3369819  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3369820 atacacccactta-tttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 3369876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8258525 - 8258353
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8258525 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttataaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 8258426  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  8258425 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaattataaccaaaaagtagtt 8258353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 34102993 - 34103165
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34102993 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 34103092  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||| | | ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34103093 taggcttttgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 34103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 25123377 - 25123543
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25123377 agatataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataaatggttgtatgttagcaacgcctatagaca 25123476  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25123477 tttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 25123543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45299774 - 45299620
Alignment:
Q  30 aaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggat 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||    
T  45299774 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctaggat 45299675  T
Q  130 acactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45299674 acacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaaattataattaaaaaatagt 45299620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9484116 - 9483951
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9484116 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 9484017  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||   | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9484016 ttgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 9483951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23544990 - 23544836
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23544990 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagac 23544891  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataa 172  Q
    ||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23544890 atttgttagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataa 23544836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30633260 - 30633096
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||    
T  30633260 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatt 30633161  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30633160 tgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 30633096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26868127 - 26867954
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  26868127 tagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttcttaaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcct 26868028  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||||| |  | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26868027 ataggcatttactataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaagtagtt 26867954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29125879 - 29125741
Alignment:
Q  47 ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  29125879 ccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaataagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacctatttttt 29125780  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29125779 ggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 29125741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32487123 - 32486958
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32487123 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaagataaatcttggtaaaacacacctttaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 32487024  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32487023 ttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagttataactaaaaagtagtt 32486958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 9413809 - 9413969
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9413809 atataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 9413908  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    | | || |||||   |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9413909 tgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagttataattaaaaagt 9413969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 13290501 - 13290661
Alignment:
Q  25 aattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |  |||||       
T  13290501 aattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcttacatgcatttgtt 13290600  T
Q  125 aggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13290601 agaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 13290661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 10776976 - 10777138
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10776976 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 10777075  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | | ||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10777076 ttgctaagatacatccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 10777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 17691216 - 17691316
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17691216 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacatt 17691315  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  17691316 t 17691316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39922478 - 39922359
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39922478 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactccta 39922379  T
Q  113 tagacatttacaaggataca 132  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  39922378 taggcatttgctaggataca 39922359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39934590 - 39934432
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacac-cttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaag 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||    
T  39934590 taaaaagttgttaaatataccttaatgtgaatgttgctaaaacactcatttaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgctag 39934491  T
Q  127 gatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
     ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  39934490 aatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaggtagtt 39934432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 25123652 - 25123760
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  25123652 tagcatagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaactctta 25123751  T
Q  113 tagacattt 121  Q
    || ||||||    
T  25123752 taaacattt 25123760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 35067000 - 35067159
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  35067000 atataattaaaaagttgttaattacaccttaagataaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctttaggta 35067099  T
Q  119 tttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaa 177  Q
    ||| | || |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  35067100 tttgctagaatacgcccacttatttttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaa 35067159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7090028 - 7089934
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  7090028 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgtgtgtatgttaacaactccta 7089934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 1783003 - 1783149
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  1783003 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 1783102  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1783103 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagt 1783149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 42556675 - 42556757
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtg 95  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42556675 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtg 42556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44874271 - 44874165
Alignment:
Q  79 taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||| |||||    
T  44874271 taaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcctacagacaattgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaacttataactaaaa 44874172  T
Q  179 agtagtt 185  Q
    |||||||    
T  44874171 agtagtt 44874165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23054003 - 23053922
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactc 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  23054003 taaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaatataagtaggtgtatgttagcaactc 23053922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19971627 - 19971483
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  19971627 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatt 19971528  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  19971527 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 19971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 21021186 - 21021330
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  21021186 tataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatt 21021285  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  21021286 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 21021330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 31071555 - 31071698
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||||    
T  31071555 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 31071654  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
     | || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  31071655 gctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaa 31071698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 9483650 - 9483796
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||  | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  9483650 tataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 9483749  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  9483750 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 9483796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1282010 - 1281915
Alignment:
Q  90 tgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||| | |||||||||| |||||| |||||   || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1282010 tgggtgcaagttagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaatgtagtt 1281915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 150
Target Start/End: Original strand, 30577877 - 30577999
Alignment:
Q  30 aaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||| |  |||||| | |||||| ||||| | |||    
T  30577877 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagg 30577976  T
Q  128 atacactcacttattttttagaa 150  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  30577977 atacacccgcttattttttagaa 30577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14826487 - 14826358
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | || ||||| |  |||||| |||||||  ||||    
T  14826487 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtaggtgtgttctagcaaatcctataagcatt 14826388  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||    
T  14826387 tgctagaatacacccacttattttttagaa 14826358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 21442129 - 21442275
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  21442129 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 21442228  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  21442229 ttgctagaatacac-cacttgttttttagaaggagtattttagcaagt 21442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 18804323 - 18804398
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgta 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18804323 tataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttctaaaaaataaatgggtgta 18804398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23161405 - 23161350
Alignment:
Q  130 acactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23161405 acacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 23161350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 180
Target Start/End: Original strand, 42556759 - 42556822
Alignment:
Q  117 catttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaag 180  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42556759 catttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaag 42556822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34969996 - 34969910
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagca 105  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || | |||| |||||||    
T  34969996 agatataaccaaaaagttattaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattgtaaaaaataagtagatgtacgttagca 34969910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1201814 - 1201710
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1201814 ttgttaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 1201716  T
Q  160 tagcaa 165  Q
    ||||||    
T  1201715 tagcaa 1201710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10616432 - 10616332
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10616432 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 10616334  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  10616333 aa 10616332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 45299643 - 45299743
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| | |||||| | | || | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45299643 taaaacacaccttcaaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctata-agagttgctagcatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 45299741  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  45299742 aa 45299743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4018732 - 4018669
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  4018732 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 4018669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32069163 - 32069063
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32069163 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagc 32069065  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  32069064 aa 32069063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 41942860 - 41943003
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| || ||||||| || ||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |  |||||| |||||||| || ||    
T  41942860 tataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaacaagtggg-gtgttctagcaaatcctataggca-tt 41942957  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
     | || |||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  41942958 gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagt 41943003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3154266 - 3154203
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  3154266 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 3154203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 14819308 - 14819371
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  |||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14819308 tataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 14819371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21442466 - 21442400
Alignment:
Q  101 tagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  21442466 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 21442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 184184 - 184147
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  184184 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 13269289 - 13269322
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13269289 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 13269322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17691293 - 17691256
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17691293 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 17691256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 23544847 - 23544880
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544847 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 23544880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25123523 - 25123486
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25123523 ttgttaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtat 25123486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26630107 - 26630070
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26630107 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 26630070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27545901 - 27545868
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27545901 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 27545868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36899880 - 36899847
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36899880 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 36899847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 39922393 - 39922430
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39922393 atacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaa 39922430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Original strand, 39934452 - 39934489
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39934452 ttgttaaaacacaccttctaaaaaataagttggtgtat 39934489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 939100 - 938928
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  939100 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaagtaagtgggtgtatgttagcaactccta 939001  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  939000 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 938928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28912287 - 28912115
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28912287 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 28912188  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28912187 tgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 28912115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 9401647 - 9401819
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9401647 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 9401746  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9401747 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgttataattaaaaagtagtt 9401819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19069595 - 19069429
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  19069595 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtttatgttagcaactcctatagcta 19069496  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19069495 tttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaactagtt 19069429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25818690 - 25818517
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25818690 tagcaaagatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 25818591  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25818590 ataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagcagtt 25818517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 454301 - 454137
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  454301 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 454202  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  454201 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagttttaactaaaaagtagtt 454137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11766326 - 11766154
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  11766326 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtggacgtatgttagcaactctta 11766227  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11766226 tatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 11766154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 18352312 - 18352479
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18352312 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 18352411  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18352412 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 18352479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 15957205 - 15957377
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15957205 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttct-aaaaataagtgggtgtatgttaacaactccta 15957303  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15957304 tagacatttgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 15957377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 38367847 - 38368019
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  38367847 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttgacaactccta 38367946  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38367947 taggcatttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 38368019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41407532 - 41407375
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  41407532 taaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaga 41407433  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41407432 atacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 41407375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2936847 - 2936673
Alignment:
Q  12 gtagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtg-ggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  2936847 gtagcaaatatataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaaataagtggtgtatgttagcaactcc 2936748  T
Q  111 tatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2936747 tattggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 2936673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2362955 - 2362785
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  2362955 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcct 2362856  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2362855 atagacatttgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttatcactaaaaagtagtt 2362785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 2509312 - 2509479
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2509312 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaagaataagtgggtgtatgttaacaactccta 2509411  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    ||  ||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2509412 tatgcatttgctagaatacacccactta-tttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 2509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23740244 - 23740075
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23740244 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatattgttaaaacactccttctaaaaaataagtgtgtgtatgttagcaactccta 23740145  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttatt-ttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    ||| |||||   || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23740144 taggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagt 23740075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 38796814 - 38796981
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38796814 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 38796913  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38796914 atagacatttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaa 38796981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168416
Alignment:
Q  23 ataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacattt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  | ||    
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctaccaaatgcctatag-gagtt 27168352  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
     | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27168353 gctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 27168416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6559559 - 6559390
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  6559559 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---aaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcata 6559463  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | |  |||||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6559462 taggcatttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 6559390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 2633883 - 2634053
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta-aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2633883 tagcatagatataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 2633982  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | || ||||||  |||||||||||   || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2633983 ataggcatttgctagaatacacctacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataaccaaaaagtagtt 2634053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 6736504 - 6736674
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6736504 tagcaaagatataactaaaaaattgttaactacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcct---aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 6736600  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  6736601 taggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagtt 6736674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27168392 - 27168292
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27168392 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagca 27168293  T
Q  165 a 165  Q
    |    
T  27168292 a 27168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41037558 - 41037391
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    ||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  41037558 agatataacgaaaaatttgttatatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgagtgtaagttagcaactcctataggc 41037459  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | |  |||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41037458 atttgctaaaatacacccagttatatttaagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 41037391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32853055 - 32852909
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  32853055 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatt 32852956  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  32852955 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 32852909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11327795 - 11327648
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  11327795 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11327696  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  11327695 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 11327648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12080897 - 12080751
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  12080897 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 12080798  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  12080797 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 12080751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15230263 - 15230117
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaa-aaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  15230263 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 15230164  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  15230163 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 15230117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 38876166 - 38876313
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  38876166 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 38876265  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38876266 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 38876313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14778117 - 14777979
Alignment:
Q  30 aaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaa-aaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagga 128  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||| | || |    
T  14778117 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaa 14778018  T
Q  129 tacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  14778017 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 14777979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20517119 - 20516974
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20517119 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 20517020  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20517019 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 20516974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28605639 - 28605494
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| | ||||||  ||||    
T  28605639 tataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaacaagtgggtgtgttttagcaaattctataggtattt 28605540  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
     | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  28605539 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 28605494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 37138934 - 37139081
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  37138934 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacat 37139033  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | |  |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  37139034 ttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 37139081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 48454543 - 48454690
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaa--aatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||  || | |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  48454543 tataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 48454642  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  48454643 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 48454690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 3512505 - 3512593
Alignment:
Q  26 attaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctata 114  Q
    ||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  3512505 attaaaaagttattaaatacatatgaaggtgaatgttgctaaaacataccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagtaattcctata 3512593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 18123080 - 18123211
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||   ||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  18123080 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 18123179  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18123180 ttgctaggatacacccacttagtttttagaag 18123211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 184
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512766
Alignment:
Q  129 tacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagttataactaaaaagtagt 3512766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45225592 - 45225430
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  45225592 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 45225493  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt-ataattaaaaagt 181  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  45225492 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagt 45225430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27812140 - 27811975
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||| ||| ||||    
T  27812140 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctgtaggcatt 27812041  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  27812040 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtagtt 27811975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24720459 - 24720315
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| || | ||||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||  ||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  24720459 tataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 24720360  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  24720359 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 24720315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27597231 - 27597131
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  27597231 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 27597132  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  27597131 t 27597131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14770273 - 14770143
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||  | ||| |||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  14770273 tataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcatt 14770174  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||    
T  14770173 tgctagaatacacccacttattttttagaag 14770143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15220724 - 15220594
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||  | ||| |||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  15220724 tataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcatt 15220625  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||    
T  15220624 tgctagaatacacccacttattttttagaag 15220594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22479404 - 22479260
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |  |||||||| ||||||  | |||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
T  22479404 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaacaagtgggtgtgttctatcaaatcctatatacatt 22479305  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22479304 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 22479260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34986724 - 34986577
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaa--aatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||  |||| |||  ||| |  |||||| || ||||| |||    
T  34986724 tataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataaataagtgaatgtgttctagcaaatcttataggcat 34986625  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  34986624 ttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagt 34986577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18829896 - 18829833
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18829896 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 18829833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 8047972 - 8048112
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| || ||| || |||   ||||| ||||| |||||||    
T  8047972 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtgtgt-tat---agcaaatcctacagacatt 8048067  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  8048068 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 8048112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 14719010 - 14719123
Alignment:
Q  39 taaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcac 137  Q
    |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| |  | |||||| |||    
T  14719010 taaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccac 14719109  T
Q  138 ttattttttagaag 151  Q
    ||||||||||||||    
T  14719110 ttattttttagaag 14719123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45225378 - 45225297
Alignment:
Q  101 tagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt-ataattaaaaagt 181  Q
    |||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  45225378 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagt 45225297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Original strand, 7437798 - 7437944
Alignment:
Q  23 ataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc--taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||   |||||| | |||||||| |  ||| || |||||||| ||||    
T  7437798 ataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatt 7437897  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| || |||||||||||||   || |||||||||||    
T  7437898 tgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagt 7437944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 25818541 - 25818642
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt-agaagatgtgttttag 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25818541 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccacttattttttaagaaggtgtgttttag 25818639  T
Q  163 caa 165  Q
    |||    
T  25818640 caa 25818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38367932 - 38367894
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaag 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38367932 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag 38367894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 2936697 - 2936730
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2936697 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 2936730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 7835347 - 7835388
Alignment:
Q  144 tttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7835347 tttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 7835388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 11766178 - 11766211
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11766178 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 11766211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 28912139 - 28912172
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28912139 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 28912172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43712084 - 43711964
Alignment:
Q  49 ttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcactta-tttttt 146  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| | ||||| |||||| | || ||| || |||||| ||||||    
T  43712084 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatactatatacatttgctagaatatacccacttattttttt 43711985  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  43711984 agaaggagtattttagcaagt 43711964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 6260992 - 6261156
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6260992 atataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 6261091  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6261092 tgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaaatagtt 6261156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14369956 - 14369784
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14369956 tagcaaagatataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 14369857  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14369856 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 14369784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 25912042 - 25912204
Alignment:
Q  20 gatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25912042 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25912141  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25912142 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 25912204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4083927 - 4083755
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4083927 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtacgttagcaactccta 4083828  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4083827 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 4083755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4738121 - 4737949
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4738121 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcata 4738022  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4738021 tgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 4737949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31752304 - 31752133
Alignment:
Q  14 agcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctat 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31752304 agcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcctat 31752205  T
Q  114 agacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || ||||| | || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31752204 aggcatttgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 31752133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7944476 - 7944308
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7944476 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactccta 7944378  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7944377 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 7944308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17421875 - 17421711
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17421875 atataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattctaaaaaataagtgggtgtatgttagaaactcctatagacatt 17421776  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17421775 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 17421711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33696236 - 33696070
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33696236 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 33696137  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33696136 tttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgttataactaaaaagtagtt 33696070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2528949 - 2528784
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528949 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 2528850  T
Q  121 tacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2528849 tgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactgaaaagtagtt 2528784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 2695097 - 2695260
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2695097 atataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 2695196  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2695197 tgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 2695260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6436612 - 6436440
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6436612 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattctaaaaaataagtggttgtatgttagcaactccta 6436513  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6436512 taggcatttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttacaactaaaaagtagtt 6436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 12910015 - 12910187
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12910015 tagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaatataagtgagtgtatgttagcaactccta 12910114  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12910115 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgttataactaaaaagtagtt 12910187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 39548835 - 39549005
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  39548835 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgataaa-cacaccatcaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaacttcta 39548932  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39548933 tagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 39549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 31240271 - 31240409
Alignment:
Q  47 ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  31240271 ccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttatttttt 31240370  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31240371 agaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 31240409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 17232909 - 17233074
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  17232909 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaataaatgaatgtatgttagcaactccta 17233008  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  17233009 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaaa 17233074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28747952 - 28747779
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28747952 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 28747853  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28747852 atagacatttgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 28747779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39038703 - 39038536
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |    
T  39038703 agatttaactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaataagtgggtctatgttagcaactcctatatgc 39038604  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39038603 atttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagtt 39038536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 22701743 - 22701908
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  22701743 agatataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtacgttagcaactcttataagca 22701842  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22701843 tttgctagaatacacccactta-tttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 22701908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10951229 - 10951074
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |      
T  10951229 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattcgaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgatata 10951130  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10951129 atacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaagtag 10951074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 17233273 - 17233437
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17233273 agatataactaaaaagttgttaaatatattttaaggtgaacgttgctaaaacaca--ttctaaaaaataaatgtgtgtatgttagcaactcctataggca 17233370  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17233371 tttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaattataattaaaaagtagtt 17233437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 22800641 - 22800804
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22800641 atataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaagaagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 22800740  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    || | || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  22800741 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtag 22800804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 13711032 - 13711198
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13711032 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13711131  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttatttttta-gaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | || |||||| ||||| ||||||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13711132 ttgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagttataatcaaaaagtagtt 13711198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9124893 - 9124725
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  9124893 tagcaaagatataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacttct 9124794  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |||| ||||| | || |||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9124793 ataggcatttgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 9124725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3039057 - 3038904
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3039057 agatataactaaaaa-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc------------gggtgtatgttagcaactcctataggca 3038971  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3038970 tttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 3038904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32736449 - 32736345
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  32736449 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaatttcta 32736350  T
Q  113 tagac 117  Q
    |||||    
T  32736349 tagac 32736345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 858079 - 857928
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  858079 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaataagtgggtgtctgttagcaactccta 857980  T
Q  113 tagaca-tttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttag 162  Q
    ||  || ||| | || |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  857979 tatgcattttgctagaatacacccacttacttttttaaaaggtgtgttttag 857928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33832899 - 33832736
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33832899 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcat 33832800  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttatt-ttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    ||   || |  ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33832799 ttgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 33832736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 185
Target Start/End: Original strand, 8410658 - 8410783
Alignment:
Q  60 gttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttt 159  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||   |||||||||||||||  |||||||    
T  8410658 gttgctaaaacacacattctaaaatataagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttt 8410757  T
Q  160 tagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8410758 tagcaagttataactaaaaagtagtt 8410783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 11351811 - 11351892
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggt 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11351811 tagcaaagatataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggt 11351892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15294227 - 15294119
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||    
T  15294227 tagcaaagacataattaaaaagttgttaaatacactttaagatgaatgttgttaaaacactcattttgaaaaataagtgagtgtacgttaacaactgcta 15294128  T
Q  113 tagacattt 121  Q
    |||||||||    
T  15294127 tagacattt 15294119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11448919 - 11448772
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  11448919 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11448820  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||  |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  11448819 ttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 11448772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 30687915 - 30688062
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  30687915 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 30688014  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  30688015 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 30688062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15809149 - 15808995
Alignment:
Q  30 aaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| | ||     
T  15809149 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 15809050  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt-ataattaaaaagt 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| || |||| ||||||||    
T  15809049 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagt 15808995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26906080 - 26905956
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||||    
T  26906080 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 26905981  T
Q  122 acaaggatacactcacttatttttt 146  Q
     | || |||||  ||||||||||||    
T  26905980 gctagaatacagccacttatttttt 26905956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4736977 - 4736850
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  4736977 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctataggcatt 4736878  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttag 148  Q
    | | || |||||  ||||||||||||||    
T  4736877 tgctagaatacatccacttattttttag 4736850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 1951434 - 1951580
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaa-aaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||     
T  1951434 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcata 1951533  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |   || |||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  1951534 tgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagt 1951580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Original strand, 17209894 - 17210004
Alignment:
Q  39 taaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcac 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |   ||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||    
T  17209894 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccac 17209993  T
Q  138 ttattttttag 148  Q
    |||||||||||    
T  17209994 ttattttttag 17210004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37468719 - 37468625
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatag 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| || || |||||  || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37468719 tataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaaatcctatag 37468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10471175 - 10471017
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||   ||||  ||| || ||||||||| |||||||||||| | | |||    
T  10471175 agatatagctaaaaagttgttaaaaacaccttaaggtgaatattgctaaaacacttattct--aaagtaagtgggtgtaagttagcaactcccacaaaca 10471078  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    ||| | |  |||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||    
T  10471077 tttgctaaaatacacccacttatgttttagaattagtgttttagcatgtcataactaaaaa 10471017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33282441 - 33282276
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| ||| |||| ||||    
T  33282441 tataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatccaataggcatt 33282342  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||||   || |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33282341 tgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagtt 33282276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37282346 - 37282237
Alignment:
Q  40 aaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcact 138  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| | |  |||||||||||    
T  37282346 aaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacactcact 37282247  T
Q  139 tattttttag 148  Q
    ||||||||||    
T  37282246 tattttttag 37282237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1921646 - 1921499
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||  |||||| ||| |||| |  |||||| |||||||| |||    
T  1921646 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaataagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 1921547  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  1921546 ttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagt 1921499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 3960639 - 3960783
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||| ||||| |  ||||    
T  3960639 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgcatt 3960738  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  3960739 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 3960783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17210204 - 17210137
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa 81  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17210204 tagcaaagatataactaaaaagttgt-aaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattctaa 17210137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 29302105 - 29302236
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   | ||| |||| |  |||||| |||||||| |||    
T  29302105 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 29302204  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    || | || |||||| | |||||||||||||||    
T  29302205 ttgctagaatacacccgcttattttttagaag 29302236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25912183 - 25912083
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25912183 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 25912085  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  25912084 aa 25912083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38952372 - 38952207
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||| | |||| ||||||||  |||||||| |||| ||||  | | | ||    
T  38952372 agatataactaaaaagttgttaaatacactttaatatgaatgtggctaaaacactcgttctaaaaaaataaatgggtgtaagttaacaacgtccacaaac 38952273  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    |||| | |  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  38952272 atttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgtcataactaaaaagtag 38952207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Original strand, 17559225 - 17559325
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  17559225 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatt 17559324  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  17559325 t 17559325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37249488 - 37249361
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  37249488 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 37249389  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttatttttta 147  Q
    || | || |||||| || ||||||||||    
T  37249388 ttgctagaatacacccatttatttttta 37249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17605226 - 17605096
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  17605226 tataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 17605127  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | |  | |||||| |||||||||||||||||    
T  17605126 tgctggaatacacccacttattttttagaag 17605096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33026406 - 33026252
Alignment:
Q  29 aaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |   ||||| |||||||| ||||| | ||     
T  33026406 aaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctaga 33026307  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt-ataattaaaaagt 181  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||| || |||| ||||||||    
T  33026306 atacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagt 33026252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Original strand, 40234162 - 40234216
Alignment:
Q  94 tgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttag 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40234162 tgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatgttttag 40234216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Original strand, 4083775 - 4083812
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4083775 ttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 4083812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 14369808 - 14369908
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14369808 taaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 14369906  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  14369907 aa 14369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31240385 - 31240285
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||| | | || | |  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31240385 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctata-agagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttttagc 31240287  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  31240286 aa 31240285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Original strand, 3189723 - 3189867
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaa-atatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||  || |||||| | | |||| | || |||| ||||||| | | ||    
T  3189723 agatataactaaaaagttgttaaatacactttgaagtgaatgttgtaaaaacaca--ttttaaaaagaaaagtggatataagttaacaactcccacaaac 3189820  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagca 164  Q
    |||| | || ||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  3189821 atttgctagaataaactcacttatattttaaaaaaagtgttttagca 3189867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  49 ttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattt 143  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19334887 - 19334841
Alignment:
Q  23 ataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaa 69  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  19334887 ataattaaaaatttgttaaatacaccctaaggtgcatgttgttaaaa 19334841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2695174 - 2695137
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2695174 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 2695137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17233057 - 17233024
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17233057 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 17233024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 17421735 - 17421768
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17421735 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 17421768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22800786 - 22800749
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22800786 ttgttaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtat 22800749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 32736364 - 32736401
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32736364 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32736401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 94
Target Start/End: Original strand, 39038556 - 39038589
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39038556 ttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgggt 39038589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39548981 - 39548948
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39548981 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 39548948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8410699 - 8410659
Alignment:
Q  125 aggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  8410699 aggatacactcacttatattttagaatgtgtgttttagcaa 8410659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 30667588 - 30667725
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| || |||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||| | |||||| ||||| | ||     
T  30667588 taaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaaagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgctaga 30667687  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||  ||| ||||||||||||   || |||||||||||    
T  30667688 ataca--cacatattttttagaatgagtattttagcaagt 30667725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Original strand, 33833090 - 33833185
Alignment:
Q  58 atgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  || ||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33833090 atgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaag 33833185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 34082557 - 34082729
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34082557 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 34082656  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34082657 taggcatttgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 34082729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 33739537 - 33739702
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33739537 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 33739636  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    ||| ||||| | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33739637 taggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaa 33739702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075075
Alignment:
Q  23 ataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcattta 16075138  T
Q  123 caaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16075137 ctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagtt 16075075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 11675142 - 11675315
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11675142 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 11675241  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11675242 taggcatttgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 11675315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 18370228 - 18370394
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  18370228 agatataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagaaactcttatagtca 18370327  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18370328 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 18370394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23387325 - 23387159
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23387325 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 23387226  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||   |||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23387225 tttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagttataactaaaaagtagtt 23387159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 1576649 - 1576815
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1576649 agatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttctgaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataatca 1576748  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  1576749 tttgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaattataactaaaaagtagtt 1576815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16513275 - 16513106
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16513275 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 16513176  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16513175 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagg---tgtatgttagcaaattataactaaaaagtagtt 16513106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 23664738 - 23664911
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  23664738 tagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcct 23664837  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  23664838 ataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagtt 23664911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1750384 - 1750221
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  1750384 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaataagt-ggtgtatgttagcaactcctacatgcatt 1750286  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1750285 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagtt 1750221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29512281 - 29512111
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  29512281 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacattttatggtgaatgttgctaaaacacacattctagaaaataagtgggtatatgttagcaacttcta 29512182  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttatt--ttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29512181 tagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 29512111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 768741 - 768576
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaac-acaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  768741 atataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 768642  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | | |||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  768641 ttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 768576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 8386687 - 8386862
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatg--tgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  8386687 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaaaaaagtggttgggtgtatgttagcaactcc 8386786  T
Q  111 tatagacatttacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||  ||||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8386787 tatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 8386862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 42850006 - 42850178
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42850006 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaatagatgggtgtatgttagcaattccta 42850105  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42850106 taggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 42850178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 37169547 - 37169718
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||    
T  37169547 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaacccata 37169645  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37169646 taggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 37169718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13002226 - 13002058
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  13002226 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacactcctcgtaaacaataagtaggtgtatgttagcaactccta 13002127  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    ||| ||||| | |  |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13002126 taggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtgataactaaaaagt 13002058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41528092 - 41527927
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  41528092 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatattgctaaaacactcattttaaaaaataagtgggtgtacgttagcaacttatatagacatt 41527993  T
Q  121 tacaaggatacactcactta-ttttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | |  |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41527992 tgctataatacacccacttacttttttagaatgtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 41527927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23387176 - 23387064
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacg-ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23387176 tataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 23387077  T
Q  121 tacaaggatacac 133  Q
    | | |||||||||    
T  23387076 tgctaggatacac 23387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 9689387 - 9689534
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||| ||||||  |||||| |||||||| |||    
T  9689387 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgagtgtattctagcaaatcctataggcat 9689486  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  9689487 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 9689534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33173692 - 33173549
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  33173692 tataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacattt 33173593  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
     | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33173592 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 33173549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44543043 - 44542897
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  44543043 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 44542944  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  44542943 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 44542897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 29511962 - 29512042
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29511962 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaataagtgggtgtatg 29512042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 6332288 - 6332453
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  6332288 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 6332387  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  6332388 tgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagtt 6332453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39435235 - 39435142
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  39435235 tagcaaagatataattaaagagttgttaaatacaatttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaacataagcgggtgtatattagcaa 39435142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Original strand, 17265317 - 17265433
Alignment:
Q  69 acacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt 168  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |     
T  17265317 acacacattctaaaaaataaatgggtgtacgttatgaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg 17265416  T
Q  169 ataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  17265417 ataactaagaagtagtt 17265433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Original strand, 20940000 - 20940064
Alignment:
Q  57 aatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20940000 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggcattt 20940064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 39906281 - 39906428
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  39906281 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 39906380  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  39906381 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 39906428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Original strand, 45629733 - 45629823
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  45629733 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacac---ctaaaaaataagtgggtatattctagcaactccta 45629823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2586558 - 2586431
Alignment:
Q  39 taaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcac 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||| |  |||||| |||||||| ||||| | || ||||||  ||    
T  2586558 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagttggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctac 2586459  T
Q  138 ttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||    
T  2586458 ttattttttagaaggagtattttagcaa 2586431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 151
Target Start/End: Original strand, 9690165 - 9690300
Alignment:
Q  17 agagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatag 115  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| | ||| |||| |  |||||| || |||||    
T  9690165 agagagataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcttatag 9690264  T
Q  116 acatttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
     ||||| | || |||||| |||||||||||||||||    
T  9690265 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaag 9690300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 20939722 - 20939868
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaa-aaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  20939722 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 20939821  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  20939822 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 20939868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Original strand, 32601381 - 32601455
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaata 87  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32601381 tagcaaagatataacaaaaaagttgttaagtataccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaata 32601455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 22301990 - 22302136
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  22301990 tataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 22302088  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||| |||||||   || |||||||||||    
T  22302089 ttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagt 22302136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29404115 - 29403983
Alignment:
Q  47 ccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  | |  ||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  29404115 ccttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctagaaaataagtgggtgtaagttagcaactctcacaagcatttgctaaaatacacccacttatttttt 29404016  T
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    ||||   |||||||||||| | |||| ||||||    
T  29404015 agaatgagtgttttagcaaatgataactaaaaa 29403983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 30406473 - 30406601
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| || |    
T  30406473 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcact 30406572  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttaga 149  Q
    | | |  |||||| |||||||||||||||    
T  30406573 tgctacaatacacccacttattttttaga 30406601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39904849 - 39904687
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | ||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  39904849 tataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 39904750  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagt 181  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||    
T  39904749 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagt 39904687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 41088880 - 41088785
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctata 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||| | ||  |  |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41088880 agatataattagaaagttgataaatataccttgacgtatacattgttataacacaccttctaaaaaataagtagatgtatgttagcaactcctata 41088785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 22711045 - 22711175
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||  ||||||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  22711045 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttataacaaatcctataggcatt 22711144  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||  |||||||||||||||||    
T  22711145 tgctagaatacatccacttattttttagaag 22711175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 4293216 - 4293360
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||  | |||||||| |  |||||| |  |||||  |||    
T  4293216 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaattatataggtatt 4293315  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4293316 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 4293360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44257654 - 44257506
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa---tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||    | |||||||| |  || ||| || ||||| ||    
T  44257654 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacaaatcttataggca 44257555  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  44257554 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 44257506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33739685 - 33739585
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33739685 taaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 33739587  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  33739586 aa 33739585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3769759 - 3769659
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  3769759 tataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 3769660  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  3769659 t 3769659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38987154 - 38987023
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  38987154 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 38987055  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    || | || |||||  ||||||  |||||||||    
T  38987054 ttgctagaatacatccacttacattttagaag 38987023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 1297602 - 1297665
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1297602 tataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 1297665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20940104 - 20940070
Alignment:
Q  29 aaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttg 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20940104 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttg 20940070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 15554034 - 15554163
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||  |  ||||||| |  |||||| |||||| ||||||    
T  15554034 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctattgacatt 15554133  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    |   || |||||| ||||||||||||||||    
T  15554134 tgttagaatacacccacttattttttagaa 15554163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 16075099 - 16075132
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16075099 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 16075132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18370370 - 18370337
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18370370 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 18370337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23664891 - 23664854
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23664891 ttgttaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtat 23664854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44288944 - 44288895
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgtt 62  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  44288944 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgtt 44288895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 29513923 - 29513955
Alignment:
Q  153 tgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29513923 tgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 29513955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26335947 - 26335775
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26335947 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 26335848  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26335847 taggcatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 26335775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 9744143 - 9744309
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  9744143 agatataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatattagcaactcctataggca 9744242  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9744243 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataaataaaaagtagtt 9744309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15725379 - 15725213
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15725379 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggca 15725280  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  15725279 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaaatagtt 15725213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 49425765 - 49425937
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  49425765 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtacgttagcaacttcta 49425864  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49425865 taggcatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaacttataactaaaaagtagtt 49425937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 20458837 - 20459004
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20458837 tagcaaagatatagttaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 20458936  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |||| ||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20458937 ataggcatttgctagaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6946840 - 6946679
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6946840 agatataactaaaaagttgttaaatac-----atggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 6946746  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6946745 tttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 6946679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33106110 - 33105946
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33106110 atataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33106011  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33106010 tgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataatcaaaaaatagtt 33105946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46106880 - 46106708
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  46106880 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccaa 46106781  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46106780 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 46106708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52306966 - 52306802
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52306966 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 52306867  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  52306866 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaacttataactaaaaagtagtt 52306802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 40496153 - 40496320
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40496153 agatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagac 40496252  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40496253 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 40496320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 38425657 - 38425829
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38425657 tagcaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 38425756  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || | |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38425757 taggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 38425829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45875965 - 45875794
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45875965 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 45875866  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45875865 taggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagtagt 45875794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 11777501 - 11777671
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11777501 tagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattctaaaaaataattgggtgtatgttagcaactccta 11777600  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtag 183  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11777601 taagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtag 11777671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14863138 - 14863007
Alignment:
Q  53 ggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaaga 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14863138 ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaag- 14863040  T
Q  153 tgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14863039 tgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 14863007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23383931 - 23384092
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23383931 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 23384027  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaa 177  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||    
T  23384028 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaa 23384092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16553623 - 16553462
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16553623 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16553524  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    | | || |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16553523 tgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 16553462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490699
Alignment:
Q  29 aaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctata 4490757  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4490756 atacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 4490699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29102192 - 29102019
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaag-ttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  29102192 tagcaaagatataactaaaaaaattgttaaatacactttaaggtaaatgttgctaaatcacaccttctacaaaacaagtgagtgtatgttaacaactcct 29102093  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29102092 ataaacatttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 29102019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 6192960 - 6193133
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  6192960 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaatgagtgggtgtatgttagcaacacct 6193059  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6193060 ataagcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataacaaaaaagtagtt 6193133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4712858 - 4712691
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4712858 agatataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctataggc 4712759  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||  | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4712758 attcgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 4712691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 142819 - 142677
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  142819 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 142720  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgtttta 161  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  142719 tttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgtttta 142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 6137556 - 6137676
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6137556 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagta 6137655  T
Q  165 agttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6137656 agttataactaaaaagtagtt 6137676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14948322 - 14948163
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14948322 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcatttagaca 14948223  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaa 178  Q
    |||   ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  14948222 tttgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagttataactaaaa 14948163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43639208 - 43639068
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaag-ttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactc 109  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43639208 tagcaaagatataattaaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctagaaaaaataagtggatgtatgttagcaactc 43639109  T
Q  110 ctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    ||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  43639108 ctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaa 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36955562 - 36955391
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  36955562 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatatactttaaggtgaatgttgctaaaacacttatactaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcata 36955464  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36955463 taggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 36955391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 52437437 - 52437599
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat---gtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |    |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  52437437 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtgggtgtgttctagcaactcctatagaca 52437536  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagt 181  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52437537 tttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 52437599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 102258 - 102361
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-taaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  102258 agatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtttatgttagcaactcctataggc 102357  T
Q  118 attt 121  Q
    ||||    
T  102358 attt 102361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26958754 - 26958590
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| || ||||| ||||    
T  26958754 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatt 26958655  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26958654 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagtagtt 26958590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54742658 - 54742482
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtat--gttagcaact 108  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||| |  |||| |||||    
T  54742658 tagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaaataagtgggtgtgtaagttaacaact 54742559  T
Q  109 cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | ||||| ||||| | |  |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  54742558 cttataggcatttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaagtagtt 54742482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 38425572 - 38425636
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38425572 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 38425636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40496640 - 40496480
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40496640 agatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttctaaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagac 40496541  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | | |||      |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  40496540 atttgcta-gat------acttatttgttaagagatgtgttttagcaggttataactaaaaaatagtt 40496480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 42807911 - 42808058
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  42807911 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 42808010  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  42808011 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 42808058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33811186 - 33811079
Alignment:
Q  78 ctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaa 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |  |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33811186 ctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaa 33811087  T
Q  178 aagtagtt 185  Q
    ||||||||    
T  33811086 aagtagtt 33811079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 5046641 - 5046787
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  5046641 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 5046740  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5046741 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 5046787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 10216252 - 10216398
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  10216252 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 10216351  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  10216352 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 10216398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48560215 - 48560054
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  48560215 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 48560116  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagtt-ataattaaaaagt 181  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| || |||| ||||||||    
T  48560115 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagt 48560054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49606162 - 49606053
Alignment:
Q  76 ttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataatta 175  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||    
T  49606162 ttctaaaaaataagttgatgtatgttagcagcttctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagttatagata 49606063  T
Q  176 aaaagtagtt 185  Q
    ||||||||||    
T  49606062 aaaagtagtt 49606053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6214201 - 6214054
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  6214201 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 6214102  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  6214101 ttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagt 6214054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3818963 - 3818815
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa---tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||| |||||||||||   || |||||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  3818963 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataaaca 3818864  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    ||| | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  3818863 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 3818815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13212032 - 13211886
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  13212032 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13211933  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13211932 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 13211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6137652 - 6137532
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6137652 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 6137554  T
Q  164 aagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  6137553 aaggtataactaaaaagtagtt 6137532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7630275 - 7630128
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  7630275 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 7630176  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| ||||||  |||||||||  || |||||||||||    
T  7630175 ttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagt 7630128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13621315 - 13621169
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  13621315 tataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13621216  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  13621215 ttgctaggatacac-cacttattttttagaatgagtattttagcaagt 13621169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 49970811 - 49970682
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  49970811 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaacaagtgggtgtgt-ttagcaaatcctataggcatt 49970713  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||    
T  49970712 tgctagaatacacccacttattttttagaag 49970682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 30820489 - 30820614
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  30820489 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaattggtgtattctagcaaatcctataggcatt 30820588  T
Q  121 tacaaggatacactcacttatttttt 146  Q
    | | || | |||| ||||||||||||    
T  30820589 tgctagaagacacccacttatttttt 30820614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43639068 - 43639011
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43639068 atacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagcagtt 43639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17377711 - 17377564
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  |||||| |||||||| | |    
T  17377711 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggctt 17377612  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  17377611 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 17377564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 13211553 - 13211616
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaa 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13211553 atataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaa 13211616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21519949 - 21519804
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||| |  ||| || |||||||| |||    
T  21519949 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagtaaatcctataggcat 21519850  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21519849 ttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaa 21519804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 51783970 - 51784100
Alignment:
Q  23 ataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaa-aaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||||    
T  51783970 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 51784069  T
Q  122 acaaggatacactc-acttattttttagaag 151  Q
     | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  51784070 gctagaatacaccctacttattttttagaag 51784100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41172630 - 41172481
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||   |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||| |  |||||| || ||||| |    
T  41172630 agatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcttataggc 41172531  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  41172530 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 41172481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 12584286 - 12584433
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgtt--agcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |   | | |||||||  ||||| | |||||| |||    
T  12584286 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaattctataggcat 12584385  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  12584386 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 12584433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 14202870 - 14203017
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||   | ||| |||| |  |||||| |||||||| |||    
T  14202870 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 14202969  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  14202970 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 14203017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17181170 - 17181037
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa----aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||| | |||||||  |  |||||| |||||||| |    
T  17181170 tataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaacaagtgggtgcgttctagcaaatcctataggc 17181071  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    |||| | || |||||| |||||||||||||||||    
T  17181070 atttgctagaatacacccacttattttttagaag 17181037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50182390 - 50182246
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |  ||||| ||||    
T  50182390 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat--tataggcatt 50182293  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |   || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  50182292 tgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagt 50182246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5157215 - 5157085
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||| |  |||||| |||||||| | ||    
T  5157215 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcctt 5157116  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||    
T  5157115 tgctagaatacacccacttattttttagaag 5157085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13371428 - 13371298
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  13371428 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13371329  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||    
T  13371328 tgctagaatacaaccacttatgttttagaag 13371298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13381629 - 13381499
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  13381629 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13381530  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaag 151  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||    
T  13381529 tgctagaatacaaccacttatgttttagaag 13381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 34683048 - 34683193
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||   ||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  |||||| || ||||| |||    
T  34683048 tataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 34683147  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  34683148 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaa 34683193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Original strand, 15725237 - 15725333
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgtttta 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15725237 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaacatacactcacttattttttagaaggtgtgtttta 15725333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 30258127 - 30258256
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||  | ||| |||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  30258127 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatt 30258226  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||    
T  30258227 tgctagaatacacccacttattttttagaa 30258256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 49425918 - 49425813
Alignment:
Q  60 gttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgtt 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||  ||   || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49425918 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtaggtgtatcctagcaaatgcctatagaagttgctaacg-tacacccacttattttttagaaggtgtgtt 49425820  T
Q  159 ttagcaa 165  Q
    |||||||    
T  49425819 ttagcaa 49425813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 6946703 - 6946803
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6946703 taaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 6946801  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  6946802 aa 6946803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9744285 - 9744185
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9744285 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatag-gagttgctaatatacacccacttattttttagaaggtgtgttgtagc 9744187  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  9744186 aa 9744185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 26335799 - 26335899
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26335799 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctaacaaatgcctatag-gagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 26335897  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  26335898 aa 26335899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 53975202 - 53975330
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| | |||    
T  53975202 agatataacttaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatgttgctaacacacttcttttaaaaaataagtatgtgtgagttagcaactcctacataca 53975301  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttatttttta 147  Q
    ||| | || ||||||| | |||| |||||    
T  53975302 tttgctagaatacacttagttatgtttta 53975330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 104
Target Start/End: Original strand, 4712715 - 4712754
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4712715 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattttagc 4712754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17745363 - 17745300
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17745363 tataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 17745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47382369 - 47382306
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  47382369 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaa 47382306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 578757 - 578889
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaa--acacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| || |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||  |||||| |||||||| |    
T  578757 tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaaaagcaaatgggtgtattctagcaaatcctataggc 578856  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  578857 atttgctagaatacacccacttattttttagaa 578889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Original strand, 13621395 - 13621461
Alignment:
Q  101 tagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  13621395 tagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 13621461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11777649 - 11777616
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11777649 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 11777616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 14863093 - 14863130
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14863093 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 14863130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23384080 - 23384043
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23384080 ttgttaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtat 23384043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 52437579 - 52437546
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52437579 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 52437546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5881 - 5715
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5881 agatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagaca 5782  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5781 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 5715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 5394 - 5497
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5394 agatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttctaaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagac 5493  T
Q  118 attt 121  Q
    ||||    
T  5494 attt 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 165
Target Start/End: Original strand, 5803 - 5839
Alignment:
Q  129 tacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5803 tacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Original strand, 4898438 - 4898607
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4898438 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 4898537  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4898538 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 4898607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 3437993 - 3438157
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3437993 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgctgctaaaatacaacttctaaaaaatatgtgggtgtatgttaccaactcttataggcatt 3438092  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3438093 tgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 3438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14488499 - 14488327
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  14488499 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcata 14488400  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14488399 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 14488327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25061854 - 25061683
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25061854 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 25061756  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25061755 taggcatttgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 25061683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4838476 - 4838310
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4838476 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 4838377  T
Q  119 tttac------aaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    |||||       ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4838376 tttactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4838310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33730713 - 33730550
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |    |||||||||||||||||||| |    
T  33730713 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagag----tatgttagcaactcctataggc 33730618  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33730617 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 33730550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18102890 - 18102717
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcct 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  18102890 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaataagttggtgtatgtcagcaacttct 18102791  T
Q  112 atagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18102790 ataggcatttgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagttataactaaagagtagtt 18102717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Original strand, 30525362 - 30525518
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  30525362 taaaaagttgttaa-tacaccttaaggtgaatcttgctaaaatacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaga 30525460  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30525461 atacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaattataactaaaaagtagtt 30525518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11742523 - 11742352
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11742523 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 11742424  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||| ||||| | ||||||||| || ||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11742423 taggcatttgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaaatagt 11742352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 4898125 - 4898286
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4898125 agatataactaaaaagttgtccaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggca 4898224  T
Q  119 tttacaaggatacactcacttatttttta-gaagatgtgttttagcaagttataattaaaaa 179  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4898225 tttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4898286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 21969886 - 21970058
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  21969886 tagcaaagatataactaaaatgttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaatataatttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaactctta 21969985  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || |||||| | || |||||   |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21969986 taaacatttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagttataactaaaaagtagtt 21970058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15718411 - 15718237
Alignment:
Q  12 gtagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15718411 gtagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaattaagtgggtgtaagttagcaactcc 15718312  T
Q  111 tatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| |||||   || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  15718311 tataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagtt 15718237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 11009912 - 11010080
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||    
T  11009912 agatataattaaaatattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaagactcattctaaaaaataagtgggtctatgttaacaactcctatatgca 11010011  T
Q  119 tttacaaggatacactcac--ttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| | || ||||||||||  || ||||||    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11010012 tttgctagaatacactcactttttttttttttttgaagtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 11010080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18154677 - 18154573
Alignment:
Q  81 aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaag 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||     
T  18154677 aaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagttataacaaaaaaa 18154578  T
Q  181 tagtt 185  Q
    |||||    
T  18154577 tagtt 18154573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11100254 - 11100085
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatg--tgggtgtatgttagcaactcctataga 116  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||  ||  ||| ||||| |||||||||||||||      
T  11100254 agatataactaaatagttgttacatacagcttaagatgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaagtgaatggttgtatattagcaactcctatatg 11100155  T
Q  117 catttacaaggatacactcacttatttttt-agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| | || || ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11100154 catttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 11100085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Original strand, 26211286 - 26211442
Alignment:
Q  28 taaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaagg 127  Q
    |||||||||| ||||||| |||   || | |||||| || |||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||| ||||| | ||     
T  26211286 taaaaagttgataaatacacctcggggcgtatgttgctataacatacgttctaaaaaataaatgggtgtatgttagcaattcttgtaggcatttgctaga 26211385  T
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagt 184  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26211386 atacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataattaaaaagtagt 26211442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 11100381 - 11100528
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||  |||| | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  11100381 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11100480  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  11100481 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 11100528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 16599070 - 16599217
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |   || ||||| | ||||  | |||||||| |||    
T  16599070 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagttggtgtgttttagtgaatcctataggcat 16599169  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16599170 ttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 16599217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 15962738 - 15962900
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  15962738 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 15962837  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagt 181  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15962838 tttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagt 15962900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9406775 - 9406610
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa-aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  9406775 tataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaataggtgtatattagcaattcctatatgcatt 9406676  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttc 186  Q
    | | || |||||| |||||||| |||| ||   |||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  9406675 tgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaaaactaaaaagtagttc 9406610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 10777944 - 10778091
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta--aaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  10777944 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacat 10778043  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | ||||||||| |||||  ||||||||||  || |||||||||||    
T  10778044 ttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagt 10778091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 9955796 - 9955926
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa--tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  9955796 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 9955895  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  9955896 ttgctagaatacacccacttattttttagaa 9955926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29646396 - 29646266
Alignment:
Q  39 taaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttacaaggatacactca 136  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||    
T  29646396 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccca 29646297  T
Q  137 cttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  29646296 cttattttttagaaggagtattttagcaagt 29646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 1369900 - 1370046
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||| | |||||||| |  || ||| |||||||||||||    
T  1369900 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatt 1369999  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    | | || |||||  || ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1370000 tgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagt 1370046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 5703852 - 5703941
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5703852 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtagatgttgctaaaa-actccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcc 5703941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 5187771 - 5187899
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| || |||||||| |  ||||||  |||| || ||||    
T  5187771 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaaacctacaggcatt 5187870  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttaga 149  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||    
T  5187871 tgctagaatacacccacttattttttaga 5187899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8172072 - 8171928
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||  | |||||||| |  |||||| || ||||| ||||    
T  8172072 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatt 8171973  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  8171972 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 8171928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 31132877 - 31133024
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||   | |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  31132877 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 31132976  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  31132977 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 31133024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 4184262 - 4184407
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatat--gtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| |   |||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  4184262 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt--acgttgttataacgcaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 4184359  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    || | || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  4184360 ttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagt 4184407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 26667866 - 26668026
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  26667866 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 26667965  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaa 179  Q
    ||   || |||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| ||||||    
T  26667966 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 11210298 - 11210361
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11210298 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 11210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 25061703 - 25061807
Alignment:
Q  61 ttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaact-cctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||| | |||||||  | || | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25061703 ttgttaaaacacaccttctaacaaataagttggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 25061801  T
Q  160 tagcaa 165  Q
    ||||||    
T  25061802 tagcaa 25061807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 228020 - 228063
Alignment:
Q  142 tttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  228020 tttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 228063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 15881927 - 15881990
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 85  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15881927 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 15881990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24022934 - 24022875
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa 81  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  24022934 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 24022875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Original strand, 11122528 - 11122566
Alignment:
Q  147 agaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122528 agaaggtgtattttagcaagttataattaaaaagtagtt 11122566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Original strand, 20755437 - 20755503
Alignment:
Q  101 tagcaactcctatagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt 167  Q
    |||||| |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20755437 tagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagt 20755503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 4838397 - 4838434
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4838397 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 4838434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 165
Target Start/End: Original strand, 11742438 - 11742475
Alignment:
Q  128 atacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11742438 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 11742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 14488351 - 14488384
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14488351 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 14488384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 33730574 - 33730607
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33730574 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 33730607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 9730 - 9897
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9730 agatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggcgtatgttagcaactcctataggc 9829  T
Q  118 atttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9830 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9840
Alignment:
Q  65 taaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9873 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 9840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 20619 - 20784
Alignment:
Q  21 atataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-tatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20619 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 20718  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20719 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 20784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4263 - 4092
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4263 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactccta 4164  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||  ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4163 taagcatttgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagttataactaaaaagtagtt 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 596
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  768 tagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaagatgaatgcttctaaaacacacattctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 669  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagtt 185  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  668 taggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaagctataactaaaaagtagtt 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6743 - 6574
Alignment:
Q  13 tagcagagatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactccta 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  6743 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataattgggtgtgtgttagcaactccta 6644  T
Q  113 tagacatttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataattaaaaagta 182  Q
    ||| ||||| | ||||||||   | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6643 taggcatttgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagta 6574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 452367 - 452528
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 120  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||| |  |||||| || ||||| ||||    
T  452367 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgcgtgtgttctagcaaatcgtataggcatt 452466  T
Q  121 tacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagt 181  Q
    |   || |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  452467 tgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagt 452528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 1378 - 1444
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1378 agatataactaaaaagttgttaaatacac-ttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaat 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 1624 - 1690
Alignment:
Q  19 agatataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1624 agatataactaaaaagttgttaaatacac-ttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 58092 - 57947
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||   | || ||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  58092 tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagttggtgttttctagcaaatcctataggcat 57993  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaa 165  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  57992 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 57947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2927 - 2767
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  2927 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 2828  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaa 179  Q
    ||   || |||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| ||||||    
T  2827 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14982 - 14822
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa--aaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  14982 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 14883  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaa 179  Q
    ||   || |||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| ||||||    
T  14882 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 26052 - 26182
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct--aaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||  | |||||||| |  |||||| || ||||| |||    
T  26052 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcat 26151  T
Q  120 ttacaaggatacactcacttattttttagaa 150  Q
    || | || |||||| ||||||| ||||||||    
T  26152 ttgctagaatacacccacttatattttagaa 26182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Original strand, 82743 - 82802
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaa 81  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  82743 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 82802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 65961 - 66087
Alignment:
Q  22 tataattaaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaactcctatagacattt 121  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | | || ||||| |||||| || |||||| ||| |||| |||| || |||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  65961 tataactaaaaagttgataaatgctctttgaggtgtatgttgctacaacacatcttttaaagaataagtaggtgtatgttaataactcctatatgcattt 66060  T
Q  122 acaaggatacactcacttattttttag 148  Q
     | || || ||| || |||||||||||    
T  66061 gctagaattcacacaattattttttag 66087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22701
Alignment:
Q  29 aaaaagttgttaaatacgccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaatatgtgggtgtatgttagcaa 106  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  22624 aaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacacttttgaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaa 22701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University