View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7950_high_7 (Length: 564)

Name: NF7950_high_7
Description: NF7950
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7950_high_7
NF7950_high_7
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (20-545)||(26204267-26204792)
chr7 (20-545)||(26223905-26224429)
chr7 (65-509)||(26260299-26260743)
chr7 (40-544)||(26302211-26302715)
chr7 (65-544)||(26251275-26251754)
chr7 (73-472)||(26155623-26156022)
chr7 (65-544)||(26297875-26298354)
chr7 (73-543)||(19102789-19103259)
chr7 (73-472)||(26191700-26192099)
chr7 (52-505)||(26088196-26088649)
chr7 (52-505)||(26111984-26112437)
chr7 (65-472)||(26242827-26243234)
chr7 (78-509)||(26207851-26208282)
chr7 (52-472)||(26179497-26179917)
chr7 (78-500)||(26227412-26227834)
chr7 (73-472)||(26129002-26129401)
chr7 (108-544)||(26278169-26278602)
chr7 (251-472)||(26186862-26187082)
chr7 (73-208)||(26186677-26186812)
chr7 (402-449)||(41562683-41562730)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (65-495)||(44903680-44904110)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (168-217)||(5995044-5995093)
chr5 (342-468)||(17572404-17572530)
chr5 (157-209)||(17572660-17572712)
chr5 (157-209)||(17620000-17620052)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (154-495)||(16908519-16908863)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (154-211)||(14869802-14869859)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (342-438)||(12613700-12613796)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 545
Target Start/End: Original strand, 26204267 - 26204792
Alignment:
Q  20 agacgatgataaaggatacacggaaaagaacattggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26204267 agacgatgataaaggatacacggaaaagaacattggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaacgagtctgtgttgtatgtaagt 26204366  T
Q  120 tttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaagg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204367 tttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgctgaaatagctcatggtcttgaaaattctggtcataatttcatttgggttgttagagaaaagg 26204466  T
Q  220 ataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204467 ataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttct 26204566  T
Q  320 gatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggcca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204567 gatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggcca 26204666  T
Q  420 atgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattg 519  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204667 atatttgctgaacaattttacaatgagaagctgcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattg 26204766  T
Q  520 gtgaagaggtagtggtgagaagggag 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26204767 gtgaagaggtagtggtgagaagggag 26204792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 545
Target Start/End: Original strand, 26223905 - 26224429
Alignment:
Q  20 agacgatgataaaggatacacggaaaagaacattggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagt 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26223905 agacgatgataaaggatacacagaaaagaacattggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaacgagtctgtgttgtatgtaagt 26224004  T
Q  120 tttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaagg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224005 tttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgctgaaatagctcatggtcttgaaaattctggtcataatttcatttgggttgttagagaaaagg 26224104  T
Q  220 ataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224105 ataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattt-gagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttct 26224203  T
Q  320 gatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggcca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224204 gatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggcca 26224303  T
Q  420 atgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattg 519  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224304 atatttgctgaacaattttacaatgagaagctgcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattg 26224403  T
Q  520 gtgaagaggtagtggtgagaagggag 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26224404 gtgaagaggtagtggtgagaagggag 26224429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 65 - 509
Target Start/End: Original strand, 26260299 - 26260743
Alignment:
Q  65 agaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagta 164  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||    
T  26260299 agaattgttaaattggcttaactctaaccctaatgattctgtgttgtatgtaagttttggaagcttgactaggctttcttatgctcaggttgttgaaata 26260398  T
Q  165 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||  || |   ||||  |||||||    ||||||||| |||    
T  26260399 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttaggaaaaaagacggaggcgaagtcaaagacagttttcttcatgattttgagcaaa 26260498  T
Q  265 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26260499 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggcaccacagctccttatattggatcaccctgcaacaggagggattgtgactcactgtgg 26260598  T
Q  365 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgtt 464  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26260599 atggaactcaattcttgaaagcttgaactcgggtttgccaatgattgcatggccaatgtttgctgagcaattttacaatgagaagttgcttgttgatgtt 26260698  T
Q  465 ttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttgg 509  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26260699 ttgaagattggagtttcagttggatcaaaagtgaacaagttttgg 26260743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 40 - 544
Target Start/End: Original strand, 26302211 - 26302715
Alignment:
Q  40 cggaaaagaacattggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggct 139  Q
    |||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||     
T  26302211 cggagaagaactttggaaaagaaacagaattggtaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtattgtatgtaagttttggcagccttgtttggca 26302310  T
Q  140 ttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaa 239  Q
    | ||||||  ||| |||| ||| | || || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || || | |||| | |||| | |||||||    
T  26302311 tcctcatgctcagcttgtagaaattgcacacgggcttgaaaattcaggtcatagttttatttgggtcgtacgaaaatatgatagaaatgaggatgaagaa 26302410  T
Q  240 ggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaa 339  Q
    ||||| |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26302411 ggtttcctgcaagtatttgaggaaaggatgaaagaaagcaaaaaaggctatatcatatggaattgggcaccgcagcttctaatattggatcaccctgcaa 26302510  T
Q  340 caggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaatttta 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |    
T  26302511 caggagggattgtgactcactgttgttggaactcaattctcgaaagcttgaatgctggtttgccaatgatcacatggcccatttttgctgagcaatttaa 26302610  T
Q  440 caatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattggtgaagaggtagtggtgaga 539  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||| | | ||||||    
T  26302611 caacgagaagtttcttgttgatgttttgaagattggagtttctgttggatcaaaagagaacgagttttggaatagaattagtgtagaggcaattgtgaga 26302710  T
Q  540 aggga 544  Q
    |||||    
T  26302711 aggga 26302715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 544
Target Start/End: Original strand, 26251275 - 26251754
Alignment:
Q  65 agaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagta 164  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |     
T  26251275 agaattgcttaattggcttaactcgaagcaaaatgagtcagtattgtatgtaagttttggcagccttactaggcttcctcatgctcagcttgtagaaatt 26251374  T
Q  165 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaa 264  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | | | || | ||||||||||| | || |||||||||| ||  | | |||||| |||    
T  26251375 gcacatgggcttgaaaattcaggtcataattttatctgggttataaaaaaagatgataaagatgaggatggagaaggttttttgcaaaaatttgaggaaa 26251474  T
Q  265 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26251475 ggatgaaagaaagcaacaagggctatatcatctggaattgggcaccacaacttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcattgtgg 26251574  T
Q  365 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgtt 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  26251575 ttggaactcaactcttgaaagcttaaatgctggtttgccaatgatcacgtggccagtgtttgctgagcaattttacaatgagaagttgctagttgatgtt 26251674  T
Q  465 ttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattggtgaagaggtagtggtgagaaggga 544  Q
    |||||||| || ||| | || ||| ||||||  ||  |||| ||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26251675 ttgaagataggggtcccagtaggagcaaaagaaaataagttatggattaatattagtgaagaggaagtggtgagaaggga 26251754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 472
Target Start/End: Original strand, 26155623 - 26156022
Alignment:
Q  73 taaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatgg 172  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||  | |||  |||||||| ||| | || || ||    
T  26155623 taaattggcttaacacaaagcaaaatgagtccgtattgtatgtaagttttggaagtctaactaggcttgataatgctcagattgtagaaattgcacacgg 26155722  T
Q  173 acttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaa 272  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  |||||  ||||| |   ||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  26155723 tctcgaaaattcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaaaaggagagcgatgagagtgaaaacactttccttcaagattttgaggaaaggatgaaa 26155822  T
Q  273 gaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaact 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26155823 gaaagcaaaaagggatatatcatatggaattgggcaccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggagggattgtgactcactgtggttggaact 26155922  T
Q  373 caattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagat 472  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  26155923 caactctcgaaagcttgaattctggtttgccaatgattacatggccaatgtttggtgatcaattttacaatgaaaagttgcttgttgatgttttgaagat 26156022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 544
Target Start/End: Original strand, 26297875 - 26298354
Alignment:
Q  65 agaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagta 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||  ||| |||| ||| |     
T  26297875 agaattgctaaattggcttaattcgaaggaaaatgaatctgtattgtatgtaagttttggcagctttactaggcttccttatgctcagcttgtagaaatt 26297974  T
Q  165 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaa 264  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |    | |||| |||||| | || |||||||||||||  ||| |||||| |||    
T  26297975 gttcatgggcttgaaaattcaggtcataattttatctgggttataaaaagggatgatacagatgaggatggagaaggttttctgcaagaatttgaggaaa 26298074  T
Q  265 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 364  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26298075 ggattaaagaaagcagcaagggctatatcatatgggactgggcaccgcaacttctgatattggaccaccctgcaacaggaggaattgtgactcattgtgg 26298174  T
Q  365 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgtt 464  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26298175 ttggaactcaactctcgaaagcttgaatgctggtttgccaatgatcacatggcctatttttgctgagcaattttacaatgagaagttgcttgttgatgtt 26298274  T
Q  465 ttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattggtgaagaggtagtggtgagaaggga 544  Q
    || ||||| || ||| | || ||| ||||||  ||| |||| ||||||  |||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  26298275 ttaaagataggggtcccagtcggagcaaaagaaaacaagttatggcttgacattagtgtagagaaagtggtgagaaggga 26298354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 73 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19103259 - 19102789
Alignment:
Q  73 taaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatgg 172  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    |||| |||||||| ||| | || || ||    
T  19103259 taaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtattgtatgtaagttttggaagtctaactaggcttgaaaatgatcagattgtagaaatcgcacacgg 19103160  T
Q  173 acttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaa 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||| || | ||||||  ||||| |  |||||||   ||||||||||  ||||||||||    
T  19103159 tcttgaaaattcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaaaatgagagagatgagagtgaaaacagttttctacaagattttgaggcaaggatgaaa 19103060  T
Q  273 gaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaact 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19103059 gaaagcaaaaagggatatatcatatggaattgggcaccgcaacttctgatattggatcaccctgcaacaggagggattgtgactcactgtggttggaact 19102960  T
Q  373 caattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagat 472  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||    
T  19102959 caattctcgaaagcttgaattcgggtttgccaatgatcacatggccaatttttgctgagcagttttacaatgaaaagttgctcgtcgatgttttgaagat 19102860  T
Q  473 tggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttggcttagcattggtgaagaggtagtggtgagaaggg 543  Q
     || ||||  || ||| ||||||| ||| |||| |||  ||||  | |||||| | ||||||||| |||||    
T  19102859 aggggtcggagtaggagcaaaagtaaacaagttatggaatagccctagtgaagggatagtggtgaaaaggg 19102789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 472
Target Start/End: Original strand, 26191700 - 26192099
Alignment:
Q  73 taaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatgg 172  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||  ||| |||| ||| | || |||||    
T  26191700 taaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtactttatgtaagctttggaagtttaactaggctaactcatgctcagcttgtagaaattgcacatgg 26191799  T
Q  173 acttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaa 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||  |||||  ||||| |  |||| ||   ||||||||||  ||||||||||    
T  26191800 gcttgaaaattcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaaaatgatatggatgagagtgaaaacagtttcctacaagattttgagggaaggatgaaa 26191899  T
Q  273 gaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaact 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191900 gaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggcaccacagcttcagatattggatcaccctgcaacaggtggaattgtgactcactgtggttggaact 26191999  T
Q  373 caattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagat 472  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26192000 cgattcttgaaagcttgaatgctggtttgccaatgatcgcgtggccaatgtttgccgagcaattttacaatgagaagttgcttgttgatgttttgaagat 26192099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 52 - 505
Target Start/End: Original strand, 26088196 - 26088649
Alignment:
Q  52 ttggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaaca 151  Q
    ||||||||||  |||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||  | |||  ||    
T  26088196 ttggaaaagaggaagagtggctaaattggcttaactcaaaggaaaatgagtccgtattgtatgtaagttttggaagtctaattaggcttgataatgctca 26088295  T
Q  152 gattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgata 251  Q
    |||||| ||| | || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  || | || |  |||||  ||||| |   ||| ||   |    
T  26088296 gattgtagaaattgcacacggtctcgaaaattcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaatatgagagggatgagagtgaaaacactttccttcaa 26088395  T
Q  252 gattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattg 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26088396 gattttgaggaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggcaccacaacttctgatattggatcatcctgcaacaggagggattg 26088495  T
Q  352 tgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagct 451  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  26088496 tgactcactgtggttggaactcgattcttgaaagcttgaatgctggtttgccaatgatcgcatggccaatatttgctgagcaattttacaatgaaaagtt 26088595  T
Q  452 tcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagtt 505  Q
     |||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| ||| ||||    
T  26088596 gcttgttgatgttttgaagataggggtcccagttggagcaaaagtaaacgagtt 26088649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 52 - 505
Target Start/End: Original strand, 26111984 - 26112437
Alignment:
Q  52 ttggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaaca 151  Q
    ||||||||||  |||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||  | |||  ||    
T  26111984 ttggaaaagaggaagagtggctaaattggcttaactcaaaggaaaatgagtccgtattgtatgtaagttttggaagtctaattaggcttgataatgctca 26112083  T
Q  152 gattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgata 251  Q
    |||||| ||| | || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  || | || |  |||||  ||||| |   ||| ||   |    
T  26112084 gattgtagaaattgcacacggtctcgaaaattcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaatatgagagggatgagagtgaaaacactttccttcaa 26112183  T
Q  252 gattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattg 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26112184 gattttgaggaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggcaccacaacttctgatattggatcatcctgcaacaggagggattg 26112283  T
Q  352 tgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagct 451  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  26112284 tgactcactgtggttggaactcgattcttgaaagcttgaatgctggtttgccaatgatcgcatggccaatatttgctgagcaattttacaatgaaaagtt 26112383  T
Q  452 tcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagtt 505  Q
     |||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| ||| ||||    
T  26112384 gcttgttgatgttttgaagataggggtcccagttggagcaaaagtaaacgagtt 26112437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 65 - 472
Target Start/End: Original strand, 26242827 - 26243234
Alignment:
Q  65 agaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagta 164  Q
    ||||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||  ||| |||| ||| |     
T  26242827 agaattgctaaattggcttaacctgaagcaaaatgagtctgtattgtatgtaagttttggcagccagactaggtttcctcatgctcagcttgtagaaatt 26242926  T
Q  165 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaa 264  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | | | || | ||||||| ||| | || ||||||||| |||  ||| |||||| |||    
T  26242927 gctcacgggcttgaaaattcaggtcataattttatctgggttataaaaaaagatgataaagttgaggatggagaaggtttcctgcaagaatttgaggaaa 26243026  T
Q  265 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26243027 ggatgaaagaaagcaacaagggctatatcatatgggactgggcaccgcaacttctgatattggatcacccagcaacaagaggaattgtgactcactgtgg 26243126  T
Q  365 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgtt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26243127 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgattacgtggccagtgtcttctgagcaattttacaatgagaagttgcttgttgatgtt 26243226  T
Q  465 ttgaagat 472  Q
    || |||||    
T  26243227 ttaaagat 26243234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 509
Target Start/End: Original strand, 26207851 - 26208282
Alignment:
Q  78 tggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttg 177  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||| | || || ||  ||||||  |||||||| ||| |||||||||| || |    
T  26207851 tggcttaattcaaagccaaatgattctgtgttgtacataagttttggaagcttgacaagactccctcatgctcagattgtagaaatagctcatggtctgg 26207950  T
Q  178 aaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaag 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |  |||||||| ||||||||   ||||||| || |||||||||||||||     
T  26207951 aaaattccggtcataatttcatttgggttgttaggaaaaaagatggagaaggaggtgaagatggttttcttgaagattttaagcaaaggatgaaagaaaa 26208050  T
Q  278 caaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaatt 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26208051 caaaaagggatatatcatatggaattgggcaccacagcttctcatattaggccaccctgcaacaggagggatagtgactcattgtggttggaattcaatt 26208150  T
Q  378 cttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattggag 477  Q
    ||||||||| | | |  |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  26208151 cttgaaagccttagtgttggtttacccatgattgcatggccaatgtttgctgagcaattttacaatgagaaattgcttgttgatgttttgaagattggag 26208250  T
Q  478 tcgcggttggatcaaaagtgaaccagttttgg 509  Q
    |  | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  26208251 tttcagttggatcaaaagtgaacaaattttgg 26208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 472
Target Start/End: Original strand, 26179497 - 26179917
Alignment:
Q  52 ttggaaaagatcaagaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaaca 151  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||| || | ||||  ||    
T  26179497 ttggaaaagaggaagaatggctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtattatatgtaagttttggtagccttgttaggtttccgcatgctca 26179596  T
Q  152 gattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgata 251  Q
    | |||| ||| | || || || |||||||| |||||||| ||||| || |||||| | | | || | ||||||||||| | || ||||||||| |||  |    
T  26179597 gcttgtagaaattgcgcacgggcttgaaaactcaggtcaaaattttatctgggttataaaaaaatatgataaagatgaagatggagaaggtttcctgcaa 26179696  T
Q  252 gattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattg 351  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26179697 gaatttgaggaaaggttgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggcatcacaacttctgatattagatcaccctgcaacaggagggattg 26179796  T
Q  352 tgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagct 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  26179797 tgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagtgtgaactcgggtttgccaatgatcacgtggccggtgtttgctgagcaattttacaacgagaagtt 26179896  T
Q  452 tcttgttgatgttttgaagat 472  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26179897 gcttgttgatgttttgaagat 26179917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 500
Target Start/End: Original strand, 26227412 - 26227834
Alignment:
Q  78 tggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttg 177  Q
    ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  26227412 tggcttaattcaaagccgaatgattctgtgttgtatgtaagttttggaagcttgacaagactctctcattcccagattgtagaaatagctcatggtcttg 26227511  T
Q  178 aaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttct-gatagattttgagaaaaggatgaaagaaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |  |  ||||| || ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  26227512 aaaattcaggtcataatttcatttgggttgttaggaaaaaagatggagaaggagacgaagacgggtttcttgat-gattttaagcaaaggatgaaagaaa 26227610  T
Q  277 gcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaat 376  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26227611 acaaaaagggatatatcatatggaattgggcaccacaacttctcatattaggtcaccctgcaacagcaggggtagtgactcattgtggttggaactcaat 26227710  T
Q  377 tcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattgga 476  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  26227711 tcttgaaagcttgagtgttagtttgccaattattacatggccaatgtttgcggagcagttttacaatgagaagcttcttgtttttgttttgaagatagta 26227810  T
Q  477 gtcgcggttggatcaaaagtgaac 500  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  26227811 gtttcggttggatcaaaagtgaac 26227834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 472
Target Start/End: Original strand, 26129002 - 26129401
Alignment:
Q  73 taaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatgg 172  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  | |||  |||||||| ||| | || || ||    
T  26129002 taaattggcttaactcaaagcaaaatgagtccgtactgtatgtaagttttggaagtctaactaggcttgataatgctcagattgtagaaattgcacacgg 26129101  T
Q  173 acttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaa 272  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  |||||  ||||| |   ||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  26129102 tctcgaaaattcaggtcataattttatatgggttgtaaggaaaaaggagagcgatgagagtgaaaacaatttccttcaagattttgaggaaaggatgaaa 26129201  T
Q  273 gaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaact 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26129202 gaaagaaaaaagggctatatcatatggaattgggcaccacagctccttatattggatcaccctgccataggaggaattgtgactcattgtggttggaact 26129301  T
Q  373 caattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagat 472  Q
    ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  26129302 caactctcgaaagcttaaatgctggtttgccaatgattacatggccaaggtttggcgatcaattttacaatgaaaagttgctcgttgatgttttgaagat 26129401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 544
Target Start/End: Original strand, 26278169 - 26278602
Alignment:
Q  108 ttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttg 207  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||| | || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  26278169 ttgtatgtaagctttggcagccttattaggcttcctcatgctcagcttgtagaaattgcacacgggcttgaaaattcaggtcataattttatctgggtta 26278268  T
Q  208 ttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggc 307  Q
    | |   ||||  |||||||||| | || ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26278269 taa---aaaataataaagatgaggatggagaaggtttcctgcaagaatttgagaaaaggatgaaagaaagcaacaagggctacatcatatgggattgggc 26278365  T
Q  308 cccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatg 407  Q
     ||||| || |||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  26278366 accacaactgctgatattggaataccctgcaatcggagggattgtgactcattgtggttggaactcaactcttgaaagcgtaaatgctggtttgccaatg 26278465  T
Q  408 ataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaagtgaaccagtttt 507  Q
    || || |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| ||| |||| |    
T  26278466 atcacgtggccagtgtttgccgaggaattttacaatgagaagttgcttgttgatgttttgaagataggggtcccagttggagcaaaagtaaacaagttat 26278565  T
Q  508 ggcttagcattggtgaagaggtagtggtgagaaggga 544  Q
    ||  || |||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  26278566 ggactaacattagtgtagaggaaatggtgagaaggga 26278602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 251 - 472
Target Start/End: Original strand, 26186862 - 26187082
Alignment:
Q  251 agattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaatt 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26186862 agattttgagaaa-gaatgaaagaaagcaaaaagggatatatcatatggaattgggcaccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggagggatt 26186960  T
Q  351 gtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagc 450  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||     
T  26186961 gtgactcactgttgttggaactcaattctggaaagcgtgaactcgggtttgccaatgatcacatggccaatgtctgaggagcaattttacaatgagaagt 26187060  T
Q  451 ttcttgttgatgttttgaagat 472  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  26187061 tgcttgttgatgttttgaagat 26187082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 26186677 - 26186812
Alignment:
Q  73 taaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagtagctcatgg 172  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||  | |||||||||  | |||  |||||||| ||| | || || ||    
T  26186677 taaattggcttaactcaaagcaaattgagtccgtactgtatttaagttttggaagtgtaactaggcttgataatgctcagattgtagaaattgcacacgg 26186776  T
Q  173 acttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgt 208  Q
     ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  26186777 tcttgaaaattcagatcataattttatctgggttgt 26186812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 449
Target Start/End: Original strand, 41562683 - 41562730
Alignment:
Q  402 ccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaag 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41562683 ccaatgataacttggccaatgtttgctgaacaattctttaatgagaag 41562730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 65 - 495
Target Start/End: Original strand, 44903680 - 44904110
Alignment:
Q  65 agaattggtaaattggcttaattctaaggaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaggctttctcatgaacagattgttgaagta 164  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||| ||| |     
T  44903680 agaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtgttgtatgtaagttttggaagccttactaagctttttcatgctcagcttgtagaaatt 44903779  T
Q  165 gctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaaggataaagatgatggtgaagaaggttttctgatagattttgagaaaa 264  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |||| |||| ||| ||    || |||||||| |||  |||||||||| |||    
T  44903780 gcacatgggcttgaaaagtcaggtcataattttatctgggttgtaaggaaaaatgatagagacgagaacgaggaaggtttcctgcaagattttgaggaaa 44903879  T
Q  265 ggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 364  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903880 gggtgaaagaaagcaacaagggctatatcatatggaattgggcaccgcagcttctcatattggatcaccctgcaacaggaggaattgtgactcactgtgg 44903979  T
Q  365 ttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagcttcttgttgatgtt 464  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  44903980 ttggaactcaactcttgaaagcattagtgttggtttgccaatgatcacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaggttgcttgttgatgtt 44904079  T
Q  465 ttgaagattggagtcgcggttggatcaaaag 495  Q
    |||||||| || ||| | |||||| ||||||    
T  44904080 ttgaagataggggtcccagttggagcaaaag 44904110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5995093 - 5995044
Alignment:
Q  168 catggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5995093 catgcacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagaaaaaa 5995044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17572530 - 17572404
Alignment:
Q  342 ggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttaca 441  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||| ||||  |    
T  17572530 ggaggaatggtgagtcattgtggttggaatacaatagttgaaagcatgaatgttggtttgcctatggtgacttggcctttgtttgctgaacattttttta 17572431  T
Q  442 atgagaagcttcttgttgatgttttga 468  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||    
T  17572430 atgagaagttggttgttgatgtgttga 17572404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17572712 - 17572660
Alignment:
Q  157 ttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgtt 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  17572712 ttgaaatagctcatgcacttgaaacttcaagccatgatttcatttgggttgtt 17572660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 17620000 - 17620052
Alignment:
Q  157 ttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgtt 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  17620000 ttgaaatagctcatgcacttgaagcttcaagccataatttcatttgggttgtt 17620052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16908863 - 16908519
Alignment:
Q  154 ttgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttagagaaa---aggataaagatgatggtgaagaaggttttctgat 250  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||  |||   | |||   || || ||||| || |||||| |||     
T  16908863 ttgttgaaatagctcatgcacttgaagattctggccatgatttcatttgggttgttaggaaaatcgaagatgccgaagacggtgatgatggttttttgag 16908764  T
Q  251 agattttgagaaaaggatgaaagaaagcaaaaagggctatatcatatggaattgggccccacagcttctgatattggatcaccctgcaacaggaggaatt 350  Q
     || |||||||| || ||||||||||| || || |||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| | || ||   ||||   ||||   ||    
T  16908763 tgagtttgagaagagaatgaaagaaagaaacaaaggctatttgatatggggttgggcaccacagcttctgatactagagcatggtgcagttggagctgtt 16908664  T
Q  351 gtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaattttacaatgagaagc 450  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| | |||||  | ||| | ||||| ||| ||   || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||     
T  16908663 gtgactcattgtgggtggaacactattatggaaagtgtaaatgcaggtttaccattggctacttggccattgtttgctgaacagtttttcaatgag-aga 16908565  T
Q  451 ttctt-gttgatgttttgaagattggagtcgcggttggatcaaaag 495  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  16908564 ttgttggttgatgtgttgaagattggtgtggcagttggagcaaaag 16908519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 14869802 - 14869859
Alignment:
Q  154 ttgttgaagtagctcatggacttgaaaattcaggtcataatttcatttgggttgttag 211  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14869802 ttgttgaaatagctcatgcacttgaacattctggccatgatttcatttgggttgttag 14869859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Original strand, 12613700 - 12613796
Alignment:
Q  342 ggaggaattgtgactcactgtggttggaactcaattcttgaaagcttgaattctggtttgccaatgataacatggccaatgtttgctgaacaatttt 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||  ||| ||||| ||| | || |||||  | ||||||||||||||||    
T  12613700 ggaggaattgtgactcattgtggttggaacacagtagttgaaagtttgaatgttgggttgcctatggtgacttggcctttatttgctgaacaatttt 12613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University