View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7973_high_3 (Length: 317)

Name: NF7973_high_3
Description: NF7973
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7973_high_3
NF7973_high_3
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (104-299)||(25739466-25739661)
chr3 (104-231)||(29644943-29645070)
chr3 (106-228)||(33803295-33803417)
chr3 (104-231)||(29644622-29644749)
chr3 (104-231)||(12114603-12114730)
chr3 (104-231)||(15772844-15772971)
chr3 (104-231)||(37990680-37990807)
chr3 (104-231)||(42342429-42342556)
chr3 (104-231)||(43346832-43346959)
chr3 (113-231)||(15773182-15773300)
chr3 (104-228)||(35946515-35946639)
chr3 (104-231)||(52634666-52634792)
chr3 (104-231)||(37991018-37991145)
chr3 (104-221)||(22304569-22304686)
chr3 (104-228)||(8327897-8328021)
chr3 (104-231)||(32462941-32463069)
chr3 (105-221)||(39389070-39389186)
chr3 (104-231)||(42342131-42342258)
chr3 (104-231)||(53577354-53577481)
chr3 (115-231)||(1634366-1634483)
chr3 (104-229)||(45395694-45395819)
chr3 (104-229)||(54017857-54017982)
chr3 (138-221)||(51886561-51886644)
chr3 (107-221)||(4823655-4823769)
chr3 (104-231)||(41359806-41359929)
chr3 (101-231)||(54018236-54018366)
chr3 (115-228)||(21832395-21832508)
chr3 (115-231)||(32589694-32589809)
chr3 (104-231)||(45901703-45901831)
chr3 (104-231)||(49336728-49336855)
chr3 (104-214)||(3135114-3135224)
chr3 (147-231)||(31190007-31190091)
chr3 (104-231)||(32462599-32462727)
chr3 (104-212)||(39934996-39935104)
chr3 (104-228)||(47964559-47964683)
chr3 (104-231)||(25755384-25755511)
chr3 (144-231)||(39914242-39914329)
chr3 (104-229)||(44160586-44160710)
chr3 (145-228)||(9240142-9240225)
chr3 (105-231)||(3135496-3135629)
chr3 (105-211)||(42584864-42584970)
chr3 (170-232)||(43346639-43346701)
chr3 (104-231)||(22303996-22304116)
chr3 (113-228)||(33175711-33175829)
chr3 (104-228)||(47964956-47965080)
chr3 (145-221)||(50612534-50612610)
chr3 (104-231)||(53118016-53118142)
chr3 (114-224)||(3384317-3384427)
chr3 (154-232)||(11661524-11661602)
chr3 (104-226)||(39336270-39336392)
chr3 (129-225)||(7767380-7767476)
chr3 (170-221)||(22304246-22304297)
chr3 (148-221)||(37726504-37726577)
chr3 (189-229)||(12747878-12747918)
chr3 (8-82)||(25739060-25739134)
chr3 (104-231)||(11661941-11662069)
chr3 (112-163)||(22303708-22303759)
chr3 (112-166)||(52634995-52635049)
chr3 (189-229)||(33809134-33809174)
chr3 (112-167)||(17731953-17732008)
chr3 (112-167)||(19033184-19033239)
chr3 (152-226)||(9239838-9239912)
chr3 (104-227)||(33362336-33362460)
chr3 (197-229)||(2299968-2300000)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (104-231)||(1085657-1085784)
chr7 (107-231)||(7517570-7517694)
chr7 (104-231)||(7554015-7554142)
chr7 (104-231)||(30245067-30245194)
chr7 (104-231)||(40094815-40094942)
chr7 (112-231)||(22566711-22566830)
chr7 (104-231)||(30244260-30244387)
chr7 (104-226)||(40230332-40230454)
chr7 (104-232)||(24177424-24177552)
chr7 (103-231)||(36534824-36534952)
chr7 (104-231)||(23418-23545)
chr7 (104-231)||(22567080-22567206)
chr7 (104-231)||(34218075-34218202)
chr7 (104-231)||(45434626-45434753)
chr7 (104-221)||(37533052-37533168)
chr7 (112-231)||(1085297-1085417)
chr7 (104-232)||(9901634-9901760)
chr7 (104-232)||(16569185-16569313)
chr7 (104-232)||(16596349-16596477)
chr7 (104-219)||(6054562-6054677)
chr7 (104-231)||(47129085-47129212)
chr7 (103-221)||(14681510-14681628)
chr7 (112-230)||(36939782-36939900)
chr7 (104-221)||(29157565-29157682)
chr7 (104-231)||(45754706-45754832)
chr7 (107-233)||(118345-118471)
chr7 (116-231)||(36622950-36623065)
chr7 (104-231)||(45433231-45433358)
chr7 (104-214)||(11845198-11845308)
chr7 (138-228)||(28301618-28301708)
chr7 (126-231)||(43241485-43241590)
chr7 (104-231)||(24838742-24838870)
chr7 (148-232)||(30245483-30245567)
chr7 (148-231)||(30255329-30255412)
chr7 (105-218)||(37533406-37533519)
chr7 (138-231)||(41910669-41910762)
chr7 (112-228)||(8128490-8128606)
chr7 (151-231)||(30244691-30244771)
chr7 (107-213)||(19122740-19122845)
chr7 (153-230)||(36109007-36109084)
chr7 (104-231)||(30032557-30032684)
chr7 (117-231)||(20599304-20599418)
chr7 (104-166)||(30253547-30253609)
chr7 (171-228)||(40094502-40094559)
chr7 (179-231)||(36967345-36967397)
chr7 (107-231)||(41854625-41854748)
chr7 (104-228)||(37345909-37346035)
chr7 (104-166)||(4124129-4124191)
chr7 (170-216)||(44361570-44361616)
chr7 (186-221)||(14681287-14681322)
chr7 (104-166)||(28300294-28300357)
chr7 (105-168)||(37393112-37393174)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (105-231)||(299479-299605)
chr5 (104-231)||(26074822-26074950)
chr5 (104-233)||(40296356-40296485)
chr5 (104-228)||(13415801-13415925)
chr5 (104-232)||(25327924-25328052)
chr5 (112-231)||(12662701-12662820)
chr5 (104-231)||(15370089-15370216)
chr5 (104-228)||(36568608-36568732)
chr5 (112-231)||(6224186-6224305)
chr5 (104-219)||(18603161-18603276)
chr5 (104-231)||(26074602-26074729)
chr5 (112-215)||(41170640-41170743)
chr5 (104-221)||(32487394-32487510)
chr5 (104-228)||(26074187-26074311)
chr5 (104-231)||(26075202-26075330)
chr5 (104-231)||(34753066-34753193)
chr5 (104-231)||(36492258-36492385)
chr5 (104-226)||(35150002-35150123)
chr5 (113-233)||(11417027-11417145)
chr5 (104-228)||(41632775-41632899)
chr5 (104-225)||(3295056-3295176)
chr5 (104-221)||(6500451-6500567)
chr5 (104-221)||(6500823-6500939)
chr5 (104-228)||(1028558-1028682)
chr5 (105-233)||(42405638-42405766)
chr5 (104-221)||(624196-624313)
chr5 (104-229)||(3295386-3295509)
chr5 (116-221)||(5723844-5723949)
chr5 (104-221)||(9498695-9498812)
chr5 (104-221)||(29549296-29549413)
chr5 (114-218)||(2411010-2411114)
chr5 (104-216)||(38427553-38427664)
chr5 (104-221)||(623818-623935)
chr5 (104-221)||(27502077-27502194)
chr5 (104-228)||(36522278-36522402)
chr5 (104-195)||(15370428-15370519)
chr5 (104-221)||(26590951-26591068)
chr5 (104-209)||(33747783-33747888)
chr5 (105-228)||(24489248-24489369)
chr5 (126-229)||(42508604-42508707)
chr5 (145-231)||(35914839-35914925)
chr5 (151-228)||(39309677-39309754)
chr5 (179-231)||(35150737-35150789)
chr5 (179-231)||(35151028-35151080)
chr5 (104-228)||(36521937-36522061)
chr5 (138-229)||(31509615-31509706)
chr5 (155-231)||(300949-301025)
chr5 (144-219)||(26074320-26074395)
chr5 (146-219)||(7768852-7768925)
chr5 (186-228)||(13785732-13785774)
chr5 (145-231)||(35167920-35168006)
chr5 (114-231)||(41635242-41635359)
chr5 (126-219)||(42524719-42524811)
chr5 (189-229)||(36527209-36527249)
chr5 (186-231)||(26900093-26900138)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (104-228)||(24600355-24600479)
chr1 (107-229)||(41157367-41157489)
chr1 (104-229)||(17294569-17294694)
chr1 (104-231)||(26661563-26661690)
chr1 (105-231)||(41156981-41157107)
chr1 (104-221)||(32594757-32594874)
chr1 (104-228)||(22077536-22077660)
chr1 (104-231)||(41142362-41142490)
chr1 (104-231)||(34364915-34365042)
chr1 (107-221)||(44290502-44290616)
chr1 (104-218)||(50052064-50052178)
chr1 (104-229)||(5320006-5320131)
chr1 (107-231)||(31767205-31767329)
chr1 (104-231)||(37556101-37556228)
chr1 (104-232)||(37850641-37850769)
chr1 (127-231)||(41184489-41184593)
chr1 (104-231)||(34364497-34364624)
chr1 (104-231)||(39066241-39066368)
chr1 (112-221)||(44290873-44290983)
chr1 (104-221)||(41759483-41759600)
chr1 (104-216)||(3537640-3537752)
chr1 (104-220)||(3550721-3550837)
chr1 (104-231)||(29798189-29798316)
chr1 (112-230)||(40082398-40082515)
chr1 (104-211)||(5528795-5528902)
chr1 (104-231)||(11977270-11977397)
chr1 (144-231)||(21378122-21378209)
chr1 (104-231)||(26661939-26662066)
chr1 (146-225)||(45084378-45084457)
chr1 (104-229)||(66513-66638)
chr1 (144-221)||(3537228-3537305)
chr1 (104-229)||(3875372-3875497)
chr1 (104-233)||(34649426-34649555)
chr1 (104-229)||(38804396-38804521)
chr1 (104-221)||(48588529-48588646)
chr1 (104-228)||(1188629-1188753)
chr1 (104-229)||(9955899-9956026)
chr1 (105-226)||(22077871-22077991)
chr1 (103-228)||(66127-66254)
chr1 (104-229)||(5575098-5575221)
chr1 (104-229)||(22793270-22793396)
chr1 (104-213)||(14318875-14318984)
chr1 (104-228)||(19283496-19283620)
chr1 (108-228)||(30630683-30630803)
chr1 (104-221)||(45494015-45494137)
chr1 (138-228)||(44685449-44685540)
chr1 (104-226)||(1187405-1187527)
chr1 (104-230)||(37555721-37555846)
chr1 (127-228)||(24132049-24132150)
chr1 (174-231)||(35154150-35154207)
chr1 (104-221)||(44043813-44043935)
chr1 (106-228)||(22077153-22077287)
chr1 (170-228)||(50469188-50469246)
chr1 (155-228)||(4878796-4878869)
chr1 (104-228)||(24448270-24448394)
chr1 (104-160)||(32168739-32168795)
chr1 (189-231)||(45839617-45839659)
chr1 (138-194)||(4956218-4956274)
chr1 (106-166)||(35154046-35154106)
chr1 (189-221)||(50051777-50051809)
chr1 (104-166)||(10351215-10351277)
chr1 (189-221)||(47379911-47379943)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (104-231)||(25483326-25483453)
chr4 (104-231)||(34646688-34646815)
chr4 (104-235)||(41707504-41707634)
chr4 (104-234)||(36608700-36608830)
chr4 (104-228)||(3244490-3244614)
chr4 (104-228)||(36629230-36629354)
chr4 (104-231)||(22183303-22183430)
chr4 (112-231)||(1731694-1731813)
chr4 (104-231)||(4955356-4955483)
chr4 (104-231)||(50002416-50002543)
chr4 (104-221)||(50630794-50630911)
chr4 (104-228)||(2740693-2740817)
chr4 (104-231)||(52884877-52885005)
chr4 (113-231)||(3341118-3341236)
chr4 (104-226)||(39404013-39404135)
chr4 (104-224)||(54017634-54017754)
chr4 (104-231)||(22028000-22028127)
chr4 (106-231)||(10245910-10246034)
chr4 (104-228)||(52884688-52884813)
chr4 (104-221)||(55933163-55933280)
chr4 (104-231)||(16888855-16888983)
chr4 (104-228)||(39792899-39793023)
chr4 (127-231)||(49076510-49076614)
chr4 (104-231)||(36572009-36572136)
chr4 (104-231)||(22028408-22028537)
chr4 (104-206)||(45496820-45496922)
chr4 (104-221)||(41370357-41370474)
chr4 (104-221)||(49880160-49880277)
chr4 (113-231)||(54017750-54017870)
chr4 (104-228)||(54108908-54109029)
chr4 (108-228)||(2741064-2741184)
chr4 (104-228)||(32941162-32941286)
chr4 (112-212)||(44621011-44621111)
chr4 (107-226)||(3340802-3340921)
chr4 (104-231)||(4390140-4390267)
chr4 (104-231)||(39404388-39404515)
chr4 (112-227)||(44620654-44620768)
chr4 (112-223)||(49302902-49303015)
chr4 (104-218)||(50459724-50459838)
chr4 (114-228)||(54741227-54741341)
chr4 (104-231)||(54936190-54936313)
chr4 (104-221)||(6975495-6975612)
chr4 (104-228)||(28034222-28034346)
chr4 (120-230)||(51768115-51768225)
chr4 (144-215)||(20826223-20826294)
chr4 (113-212)||(44620362-44620461)
chr4 (104-226)||(34004624-34004744)
chr4 (152-229)||(3700357-3700434)
chr4 (144-228)||(10246340-10246424)
chr4 (112-228)||(20825829-20825945)
chr4 (155-231)||(45489421-45489497)
chr4 (107-166)||(31691207-31691266)
chr4 (170-231)||(19504695-19504756)
chr4 (104-211)||(54343047-54343147)
chr4 (104-231)||(43174496-43174624)
chr4 (155-227)||(44621420-44621492)
chr4 (104-203)||(18932788-18932887)
chr4 (107-231)||(54108527-54108651)
chr4 (104-231)||(16889575-16889703)
chr4 (155-231)||(44620286-44620362)
chr4 (107-227)||(49076873-49076992)
chr4 (180-231)||(11706636-11706687)
chr4 (170-221)||(50788088-50788139)
chr4 (104-166)||(23817720-23817782)
chr4 (147-219)||(40067045-40067118)
chr4 (155-231)||(44620934-44621011)
chr4 (104-216)||(760194-760305)
chr4 (173-229)||(45050593-45050649)
chr4 (104-223)||(23556905-23557024)
chr4 (105-163)||(11706584-11706641)
chr4 (138-231)||(11348401-11348494)
chr4 (113-199)||(3271806-3271895)
chr4 (194-229)||(12197370-12197405)
chr4 (104-166)||(43827495-43827556)
chr4 (202-231)||(23817783-23817812)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (104-231)||(15880253-15880380)
chr2 (104-231)||(28254278-28254405)
chr2 (104-231)||(36005921-36006047)
chr2 (104-221)||(14745708-14745825)
chr2 (104-221)||(36178646-36178763)
chr2 (104-221)||(41283516-41283633)
chr2 (104-231)||(6421375-6421502)
chr2 (113-228)||(962591-962706)
chr2 (104-231)||(16542439-16542566)
chr2 (104-226)||(35580765-35580886)
chr2 (104-232)||(15511536-15511662)
chr2 (113-231)||(31468800-31468914)
chr2 (104-221)||(37105924-37106041)
chr2 (112-221)||(37106188-37106297)
chr2 (105-231)||(38796660-38796788)
chr2 (112-228)||(28531363-28531479)
chr2 (144-231)||(38796299-38796386)
chr2 (104-221)||(14745335-14745452)
chr2 (138-231)||(31899501-31899594)
chr2 (104-224)||(1769889-1770009)
chr2 (104-231)||(6712966-6713094)
chr2 (112-228)||(37632646-37632762)
chr2 (104-228)||(42514642-42514766)
chr2 (104-221)||(5542666-5542783)
chr2 (105-221)||(5543040-5543156)
chr2 (104-228)||(40679670-40679794)
chr2 (113-228)||(33561501-33561616)
chr2 (114-221)||(36178320-36178427)
chr2 (104-229)||(29873578-29873703)
chr2 (102-229)||(30323456-30323583)
chr2 (144-231)||(40733507-40733594)
chr2 (146-224)||(7598606-7598684)
chr2 (104-229)||(30313170-30313294)
chr2 (170-231)||(36785670-36785731)
chr2 (138-230)||(12529103-12529195)
chr2 (104-231)||(29676893-29677025)
chr2 (104-231)||(33731636-33731765)
chr2 (104-205)||(6422126-6422227)
chr2 (112-229)||(37895110-37895227)
chr2 (104-228)||(5367448-5367572)
chr2 (118-228)||(16590881-16590986)
chr2 (104-224)||(7598225-7598345)
chr2 (112-203)||(36178220-36178311)
chr2 (173-231)||(6421294-6421352)
chr2 (107-225)||(29874067-29874185)
chr2 (186-231)||(3673075-3673120)
chr2 (112-231)||(31259665-31259787)
chr2 (144-228)||(33953852-33953936)
chr2 (138-213)||(29676543-29676618)
chr2 (104-210)||(40163413-40163520)
chr2 (186-231)||(3672709-3672754)
chr2 (154-231)||(40733873-40733950)
chr2 (148-228)||(9231242-9231322)
chr2 (104-228)||(33954303-33954426)
chr2 (104-228)||(41678409-41678534)
chr2 (104-157)||(35580479-35580534)
chr2 (189-229)||(43443108-43443148)
chr2 (104-159)||(6421793-6421848)
chr2 (104-228)||(23346228-23346353)
chr2 (104-166)||(3673123-3673185)
chr2 (144-205)||(28254193-28254254)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (104-231)||(3038331-3038458)
chr8 (104-231)||(9309345-9309472)
chr8 (104-226)||(45122098-45122220)
chr8 (104-231)||(25561856-25561984)
chr8 (104-231)||(33113408-33113535)
chr8 (104-221)||(3669687-3669804)
chr8 (104-232)||(147440-147568)
chr8 (104-231)||(30359261-30359388)
chr8 (104-231)||(34834866-34834993)
chr8 (112-231)||(43274828-43274947)
chr8 (105-223)||(45121952-45122070)
chr8 (112-231)||(6876911-6877031)
chr8 (112-231)||(34835199-34835318)
chr8 (107-231)||(70318-70441)
chr8 (113-221)||(1013921-1014029)
chr8 (107-231)||(8918808-8918932)
chr8 (104-228)||(9608738-9608862)
chr8 (106-229)||(5420643-5420766)
chr8 (116-228)||(9308970-9309084)
chr8 (104-231)||(30359599-30359726)
chr8 (104-221)||(30441081-30441202)
chr8 (104-207)||(45122638-45122741)
chr8 (104-221)||(3670060-3670177)
chr8 (104-228)||(4154707-4154831)
chr8 (107-231)||(37544534-37544658)
chr8 (104-231)||(8794101-8794228)
chr8 (108-226)||(40518577-40518695)
chr8 (104-221)||(6731904-6732012)
chr8 (104-229)||(40518061-40518188)
chr8 (105-196)||(9483229-9483320)
chr8 (104-230)||(32640573-32640694)
chr8 (138-228)||(41972151-41972241)
chr8 (104-221)||(1014286-1014403)
chr8 (104-230)||(5915863-5915984)
chr8 (104-221)||(20870614-20870733)
chr8 (112-231)||(34835464-34835584)
chr8 (112-231)||(34835730-34835850)
chr8 (104-231)||(147819-147937)
chr8 (112-211)||(18372043-18372142)
chr8 (117-231)||(45122996-45123108)
chr8 (112-226)||(1513964-1514078)
chr8 (105-219)||(40579548-40579662)
chr8 (113-231)||(45121706-45121823)
chr8 (112-231)||(9482653-9482770)
chr8 (105-229)||(9507769-9507898)
chr8 (138-228)||(9620751-9620841)
chr8 (149-223)||(18372785-18372859)
chr8 (144-214)||(41416252-41416322)
chr8 (112-214)||(18371710-18371807)
chr8 (138-231)||(18373006-18373098)
chr8 (112-217)||(18380066-18380171)
chr8 (104-227)||(12283867-12283989)
chr8 (149-223)||(18372342-18372416)
chr8 (148-211)||(25561729-25561792)
chr8 (125-228)||(33831971-33832074)
chr8 (131-218)||(3037776-3037865)
chr8 (104-214)||(6651510-6651611)
chr8 (104-198)||(9609108-9609202)
chr8 (104-229)||(4154322-4154446)
chr8 (179-223)||(18372487-18372531)
chr8 (189-228)||(18645713-18645752)
chr8 (170-216)||(20130454-20130500)
chr8 (186-228)||(20995524-20995566)
chr8 (113-226)||(5274770-5274883)
chr8 (138-219)||(18372678-18372758)
chr8 (107-195)||(32305503-32305591)
chr8 (109-217)||(43398114-43398225)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (104-231)||(2579913-2580040)
chr6 (104-221)||(3409259-3409376)
chr6 (104-228)||(10074404-10074528)
chr6 (112-221)||(14748387-14748496)
chr6 (104-221)||(29518503-29518620)
chr6 (104-221)||(29518920-29519037)
chr6 (104-221)||(32741179-32741296)
chr6 (107-231)||(2377744-2377868)
chr6 (104-231)||(16454565-16454692)
chr6 (105-231)||(2578485-2578610)
chr6 (104-221)||(26544049-26544166)
chr6 (104-228)||(10074032-10074156)
chr6 (104-231)||(6999837-6999964)
chr6 (104-231)||(16107668-16107795)
chr6 (104-231)||(16454897-16455024)
chr6 (104-221)||(2378126-2378243)
chr6 (104-221)||(3058226-3058343)
chr6 (104-221)||(3409660-3409777)
chr6 (104-217)||(3415462-3415575)
chr6 (104-228)||(10073657-10073779)
chr6 (112-221)||(35210204-35210313)
chr6 (112-215)||(9062399-9062501)
chr6 (104-221)||(1127360-1127477)
chr6 (104-233)||(1950226-1950355)
chr6 (112-231)||(2843544-2843664)
chr6 (113-216)||(32460630-32460733)
chr6 (104-228)||(10911558-10911683)
chr6 (138-231)||(16108053-16108146)
chr6 (112-231)||(593758-593877)
chr6 (105-228)||(2578877-2578999)
chr6 (104-229)||(6071124-6071249)
chr6 (105-221)||(1846748-1846864)
chr6 (104-228)||(12092523-12092647)
chr6 (145-232)||(5832108-5832195)
chr6 (104-231)||(5958644-5958771)
chr6 (170-231)||(2579212-2579273)
chr6 (104-216)||(2579533-2579645)
chr6 (109-223)||(31714669-31714781)
chr6 (104-229)||(8481919-8482043)
chr6 (194-229)||(7588355-7588390)
chr6 (113-206)||(2975567-2975660)
chr6 (137-217)||(17135143-17135223)
chr6 (189-229)||(33605646-33605686)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (104-229)||(5349-5474)
scaffold0078 (104-231)||(4972-5099)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (107-231)||(558-682)
scaffold0702 (151-221)||(230-300)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (104-231)||(5386-5514)
scaffold0734 (105-231)||(5767-5898)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (104-231)||(1147-1274)
scaffold0391 (169-231)||(3091-3153)
scaffold0391 (104-166)||(1732-1794)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (126-231)||(17519-17624)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (144-231)||(10192-10279)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (104-231)||(47350-47477)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (189-229)||(39830-39870)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 104 - 299
Target Start/End: Original strand, 25739466 - 25739661
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25739466 gagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggac 25739565  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacagagtaatctataaatacatttatatcagtgttctctaatcctcaagttttgttctcgctcgcaatacg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25739566 atataactcacacttgcacacaacaacagagtaatctataaatacatttatatcagtgttctctaatcctcaagttttgttctcgctcgcgatacg 25739661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 29644943 - 29645070
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29644943 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggac 29645042  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29645043 atataacttacacttgcacacaacaaca 29645070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 33803295 - 33803417
Alignment:
Q  106 gagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33803295 gagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 33803394  T
Q  206 ataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33803395 ataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 29644622 - 29644749
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  29644622 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggac 29644721  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29644722 atataactcacacttgcacacaaaaaca 29644749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 12114603 - 12114730
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  12114603 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggat 12114702  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12114703 atataacttacacttgcacacaacaaca 12114730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15772971 - 15772844
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  15772971 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggac 15772872  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15772871 atataactcacacttgcacacgacaaca 15772844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 37990680 - 37990807
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  37990680 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaac 37990779  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37990780 atataactcacacttgtacacaacaaca 37990807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 42342429 - 42342556
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  42342429 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggac 42342528  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342529 atataactcacacttgcacacaacaaca 42342556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 43346832 - 43346959
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  43346832 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 43346931  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43346932 atataactcacacttgtacacaacaaca 43346959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15773300 - 15773182
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15773300 cacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactc 15773201  T
Q  213 acacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15773200 acacttgcacacaacaaca 15773182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35946639 - 35946515
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35946639 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 35946540  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  35946539 atataactcacacttgtacacaaca 35946515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52634792 - 52634666
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52634792 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 52634694  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52634693 atataactcacacttgtacacaacaaca 52634666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 37991018 - 37991145
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||    
T  37991018 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagac 37991117  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37991118 atataactcacacttgtacacaacaaca 37991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22304686 - 22304569
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22304686 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggac 22304587  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  22304586 atatagctcacacttgca 22304569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8328021 - 8327897
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||  || |||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8328021 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggac 8327922  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8327921 atataactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 32462941 - 32463069
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaac-ttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||   | |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  32462941 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtggga 32463040  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32463041 catataactcacacttgtacacaacaaca 32463069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39389186 - 39389070
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  39389186 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggaca 39389087  T
Q  205 tataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  39389086 tataactcacacttgca 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 42342131 - 42342258
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||     || ||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  42342131 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaac 42342230  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  42342231 atatgaatcacacttgcacacaacaaca 42342258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53577481 - 53577354
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||  |||||||| ||| |||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  53577481 gagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgac 53577382  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53577381 atataactcacacttgcacacaacaaca 53577354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 1634366 - 1634483
Alignment:
Q  115 cactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaac-ttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  1634366 cactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactca 1634465  T
Q  214 cacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||| |||||    
T  1634466 cacttgcacacagcaaca 1634483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 45395694 - 45395819
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||     
T  45395694 gagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggat 45395793  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  45395794 atataacttacacttgcacacaacaa 45395819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 54017857 - 54017982
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |  |  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  54017857 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggac 54017956  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  54017957 atataactcacacttgcacacaacaa 54017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51886644 - 51886561
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51886644 caatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 51886561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823655
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  207 taactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||    
T  4823669 taactcacacttgca 4823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 41359806 - 41359929
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| || |||||||||||||      
T  41359806 gagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg-- 41359903  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||    
T  41359904 --ataactcacacttgcacacaacaaca 41359929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Original strand, 54018236 - 54018366
Alignment:
Q  101 catgagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |  |  |||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||  |    
T  54018236 catgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcag 54018335  T
Q  201 gacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54018336 gacatataactcacacttgcacataacaaca 54018366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Original strand, 21832395 - 21832508
Alignment:
Q  115 cactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21832395 cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcac 21832494  T
Q  215 acttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||| ||||    
T  21832495 acttgcacataaca 21832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32589809 - 32589694
Alignment:
Q  115 cactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  32589809 cactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcac 32589711  T
Q  215 acttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||    
T  32589710 acttgcacacaacaaca 32589694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45901831 - 45901703
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaac-ttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  45901831 gagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtggga 45901732  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45901731 catataactcacacttgtacacaacaaca 45901703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 49336728 - 49336855
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  49336728 gagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgagac 49336827  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  49336828 atgtaactcacacttgtacacaacaaca 49336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Original strand, 3135114 - 3135224
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| || |||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3135114 gagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgggac 3135213  T
Q  204 atataactcac 214  Q
    |||||||||||    
T  3135214 atataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31190091 - 31190007
Alignment:
Q  147 tatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31190091 tatgggtcctctaacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaaca 31190007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 32462599 - 32462727
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaac-ttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||  |||||||| || |||||||||||   |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  32462599 gagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtggga 32462698  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32462699 catataactcacacttgtacacaacaaca 32462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Original strand, 39934996 - 39935104
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  39934996 gagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggac 39935095  T
Q  204 atataactc 212  Q
    |||||||||    
T  39935096 atataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 47964559 - 47964683
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |  ||  || ||||||||| |||||    
T  47964559 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcgggac 47964658  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  47964659 atacaactcacacttgcacacaaca 47964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25755511 - 25755384
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||  |||||| |||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  25755511 gagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagac 25755412  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25755411 atataactcacacttgtacacaacaaca 25755384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39914329 - 39914242
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914329 gtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 39914242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 44160586 - 44160710
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||   |||||||| |||| |||||||||| || ||  ||    
T  44160586 gagagacgccacattcttac-caaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaac 44160684  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
T  44160685 atataactgacacttgcatacaacaa 44160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9240225 - 9240142
Alignment:
Q  145 tttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9240225 tttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 3135496 - 3135629
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatggg--tcctcttacttatattat-----gttcaacttttactgttttatccgatg 197  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||     |||||||||||||| ||||||| || |    
T  3135496 agagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgagg 3135595  T
Q  198 tgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3135596 tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 3135629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  205 tataact 211  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43346701 - 43346639
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43346701 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaacag 43346639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22303996 - 22304116
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |       | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22303996 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaga-------cctttactattttatctgatgtgggac 22304088  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22304089 atataactcacacttgtacacaacaaca 22304116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175829
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttat---gggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| ||||||||||||   |||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  210 ctcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33175811 ctcacacttgtacacaaca 33175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 47964956 - 47965080
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| | ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |  ||| || ||||||||||   ||    
T  47964956 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaac 47965055  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  47965056 atataactcacacttgcacacaaca 47965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Original strand, 50612534 - 50612610
Alignment:
Q  145 tttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612534 tttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 50612610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 53118016 - 53118142
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||    
T  53118016 gagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 53118114  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53118115 atataactcacacttgcccacaacaaca 53118142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384427
Alignment:
Q  114 acactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    |||||||||| |||||| ||||  || | ||||||||||||||||| ||||||   |||| ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  214 cacttgcacac 224  Q
    | |||||||||    
T  3384417 cgcttgcacac 3384427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11661602 - 11661524
Alignment:
Q  154 cctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||  ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11661602 cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaccaacag 11661524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 39336270 - 39336392
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| || ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||| |  |   || |||||||||||||||    
T  39336270 gagagaggcaacactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggac 39336369  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39336370 atataactcacacttgcacacaa 39336392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767476
Alignment:
Q  129 accttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 225  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||   ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagacttacacaca 7767476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22304297 - 22304246
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304297 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22304246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37726577 - 37726504
Alignment:
Q  148 atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||| ||||||||||||||   | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37726577 atggatcctcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 37726504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747918
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 12747918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 25739060 - 25739134
Alignment:
Q  8 aataagtgtaccaagaacgcttgggtgagataatatgagtcttttctaacttaatctagatctgggttcgaatcc 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| || || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  25739060 aataagtgtaccaagaacacttggatgagataatatggatctcttttagcttaacctagatctggattcgaatcc 25739134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11662069 - 11661941
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaa-ccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||  ||||||| | ||||| |||| ||   |||||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  11662069 gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggg 11661970  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11661969 catttaactcacacttacatacaacaaca 11661941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 22303708 - 22303759
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttactt 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22303708 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52635049 - 52634995
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52635049 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttata 52634995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 33809134 - 33809174
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33809134 tatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 33809174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 167
Target Start/End: Original strand, 17731953 - 17732008
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  17731953 ccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttatat 17732008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 167
Target Start/End: Original strand, 19033184 - 19033239
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  19033184 ccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttatat 19033239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9239912 - 9239838
Alignment:
Q  152 gtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 226  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | || || | |||||||||| |||||||||    
T  9239912 gtcctcttatttataatgtgttcaacttttacttttgtatccgacggggaacttctaactcacacatgcacacaa 9239838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 33362336 - 33362460
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga- 202  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| |||| | ||||||||||  || ||     
T  33362336 gagagacgccacact--tacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccgacatgagat 33362433  T
Q  203 --catataactcacacttgcacacaac 227  Q
      ||||||||||||||||  |||||||    
T  33362434 atcatataactcacacttatacacaac 33362460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2300000 - 2299968
Alignment:
Q  197 gtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2300000 gtgggacatataacccacacttgcacacaacaa 2299968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 1085657 - 1085784
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1085657 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 1085756  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085757 atataactcacacttgcacacaacaaca 1085784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7517694 - 7517570
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7517694 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacata 7517595  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7517594 taactcacacttgcacacaacaaca 7517570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7554142 - 7554015
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7554142 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 7554043  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554042 atataactcacacttgcacacaacaaca 7554015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30245194 - 30245067
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  30245194 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaac 30245095  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30245094 atataactcacacttgtacacaacaaca 30245067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 40094815 - 40094942
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||    
T  40094815 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagac 40094914  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094915 atataactcacacttgcacacaacaaca 40094942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566830
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22566811 cacacttgcatacaacaaca 22566830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30244387 - 30244260
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30244387 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 30244288  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244287 atataactcacacttgtacacaacaaca 30244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 40230332 - 40230454
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40230332 gagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggac 40230431  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  40230432 atataacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24177552 - 24177424
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24177552 gagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggac 24177453  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24177452 atataactcatacttgcacacaacaacag 24177424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 36534824 - 36534952
Alignment:
Q  103 tgagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  36534824 tgagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtggga 36534923  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36534924 catataagttacacttgcacacaacaaca 36534952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 23418 - 23545
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  23418 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaac 23517  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23518 atataactcacaattgcacacaacaaca 23545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22567080 - 22567206
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  22567080 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggac 22567178  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22567179 atattactcacacttgcatacaacaaca 22567206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 34218075 - 34218202
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  34218075 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagac 34218174  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34218175 atataactcacatttgtacacaacaaca 34218202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45434753 - 45434626
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45434753 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggac 45434654  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45434653 atataacttacacttgtacacaacaaca 45434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 37533052 - 37533168
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  37533052 gagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 37533150  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37533151 atataactcacacttgca 37533168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 1085297 - 1085417
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat-ataac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||    
T  1085297 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccgatatgggacataaaaac 1085396  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1085397 tcacacttgcacacaacaaca 1085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9901760 - 9901634
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9901760 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggac 9901663  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  9901662 atataactcacacttatacacaataacag 9901634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16569313 - 16569185
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  16569313 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16569214  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16569213 atataactcacacttgcatacaacaacag 16569185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 16596349 - 16596477
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  16596349 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16596448  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16596449 atataactcacacttgcatacaacaacag 16596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6054677 - 6054562
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  6054677 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagac 6054578  T
Q  204 atataactcacacttg 219  Q
    |||||||| |||||||    
T  6054577 atataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47129212 - 47129085
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  47129212 gagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagac 47129113  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47129112 atataactcacacttgtgcacaacaaca 47129085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14681628 - 14681510
Alignment:
Q  103 tgagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  14681628 tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 14681529  T
Q  203 catataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14681528 catataacttacacttgca 14681510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Original strand, 36939782 - 36939900
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36939782 ccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataact 36939881  T
Q  212 cacacttgcacacaacaac 230  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  36939882 cacacttgcacagaacaac 36939900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29157682 - 29157565
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  29157682 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggac 29157583  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29157582 atataactcacacttgca 29157565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45754832 - 45754706
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  45754832 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgt-ggac 45754734  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754733 atataactcacacttgtacacaacaaca 45754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 118345 - 118471
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||    |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  118345 agacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacata 118444  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaacaga 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  118445 taacttacacttgcacacaacaacaga 118471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36623065 - 36622950
Alignment:
Q  116 actcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcaca 215  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623065 actcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 36622966  T
Q  216 cttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||| ||||    
T  36622965 cttgcacacaataaca 36622950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45433358 - 45433231
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||  ||||||| || ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||  |    
T  45433358 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatc 45433259  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45433258 atataactcacacttgtacacaacaaca 45433231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11845308 - 11845198
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  11845308 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaac 11845209  T
Q  204 atataactcac 214  Q
    |||||||||||    
T  11845208 atataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Original strand, 28301618 - 28301708
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301618 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43241590 - 43241485
Alignment:
Q  126 aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 225  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43241590 aaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaacatataactcacacttgcacaca 43241491  T
Q  226 acaaca 231  Q
    ||||||    
T  43241490 acaaca 43241485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 24838742 - 24838870
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcct-cttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  24838742 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttactcttttattcgatgtgaga 24838841  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24838842 catataacttacacttatacacaacaaca 24838870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245483
Alignment:
Q  148 atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacag 30245483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255329
Alignment:
Q  148 atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaaca 30255329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 37533406 - 37533519
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| | |||| | |||    
T  37533406 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaaca 37533505  T
Q  205 tataactcacactt 218  Q
    ||||||||||||||    
T  37533506 tataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 41910669 - 41910762
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||   | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41910669 caatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacacaacaaca 41910762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 8128490 - 8128606
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||  |||||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  8128490 ccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataact 8128589  T
Q  212 cacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  8128590 cacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244691
Alignment:
Q  151 ggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30244691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19122845 - 19122740
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19122845 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacata 19122747  T
Q  207 taactca 213  Q
    |||||||    
T  19122746 taactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109084
Alignment:
Q  153 tcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaac 230  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaac 36109084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30032684 - 30032557
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||  | ||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  30032684 gagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttacttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggac 30032585  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||    
T  30032584 atataactcacacatgtacgcaacaaca 30032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20599418 - 20599304
Alignment:
Q  117 ctcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||   |||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20599418 ctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacac 20599319  T
Q  217 ttgcacacaacaaca 231  Q
    ||  | |||||||||    
T  20599318 ttatagacaacaaca 20599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30253609 - 30253547
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30253609 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttata 30253547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094559
Alignment:
Q  171 gttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcacacaaca 40094559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Original strand, 36967345 - 36967397
Alignment:
Q  179 tttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36967345 tttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 36967397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41854748 - 41854625
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  || |   ||||| |||| |||| ||||||   |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  41854748 agacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacata 41854650  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  41854649 taactcatacttgcacacaaaaaca 41854625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37346035 - 37345909
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| |  ||| || |||| ||| |  |||    
T  37346035 gagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatgac 37345936  T
Q  204 --atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  37345935 atatataactcacacttgcacacaaca 37345909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Original strand, 4124129 - 4124191
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4124129 gagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttata 4124191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Original strand, 44361570 - 44361616
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacac 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44361570 tgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcacac 44361616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14681322 - 14681287
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14681322 ttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 14681287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Original strand, 28300294 - 28300357
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttat-gggtcctcttacttata 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  28300294 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttata 28300357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37393174 - 37393112
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatatt 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37393174 agagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatcttacttatatt 37393112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 299605 - 299479
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  299605 agagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggaca 299506  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  299505 tataactcacacttgcgcacaacaaca 299479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 26074822 - 26074950
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactctt-actcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26074822 gagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 26074921  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26074922 catataactcacacttgtacacaacaaca 26074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 40296356 - 40296485
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  40296356 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggac 40296455  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacaga 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40296456 atataactcacacttgcacacaccaacaga 40296485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 13415801 - 13415925
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  13415801 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggac 13415900  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13415901 atataactcacacttgcacacaaca 13415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25328052 - 25327924
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25328052 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggac 25327953  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25327952 atataactcacacttagacacaacaacag 25327924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 12662701 - 12662820
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12662701 ccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 12662800  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12662801 cacacttgcacacaacaaca 12662820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15370216 - 15370089
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |  ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15370216 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 15370117  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370116 atataactcacacttgcacacaacaaca 15370089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 36568608 - 36568732
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36568608 gagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggac 36568707  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36568708 atataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6224305 - 6224186
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6224305 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataact 6224206  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  6224205 cacacttgtacacaacaaca 6224186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Original strand, 18603161 - 18603276
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  18603161 gagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 18603260  T
Q  204 atataactcacacttg 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  18603261 atataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26074729 - 26074602
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||    
T  26074729 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 26074630  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26074629 atataactcacacttgtacacaaaaaca 26074602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41170743 - 41170640
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41170743 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 41170644  T
Q  212 caca 215  Q
    ||||    
T  41170643 caca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32487510 - 32487394
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32487510 gagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatagg-tgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 32487412  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32487411 atataactcacacttgca 32487394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 26074187 - 26074311
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  26074187 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgac 26074286  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26074287 atataactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 26075202 - 26075330
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactctt-actcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  26075202 gagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgaga 26075301  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26075302 catataaatcacacttgtacacaacaaca 26075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 34753066 - 34753193
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  34753066 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggac 34753165  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34753166 atataacttacatttgtacacaacaaca 34753193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 36492258 - 36492385
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||   |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36492258 gagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 36492357  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36492358 atataactcacacttgcaaacaacaaca 36492385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35150123 - 35150002
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  35150123 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggac 35150025  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35150024 atataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Original strand, 11417027 - 11417145
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  11417027 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataact- 11417125  T
Q  213 acacttgcacacaacaacaga 233  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11417126 -cacttgcacacaacaacaga 11417145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41632899 - 41632775
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  41632899 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 41632800  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  41632799 atataacttacacttgcacacaaca 41632775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Original strand, 3295056 - 3295176
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3295056 gagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3295155  T
Q  204 atataactcacacttgcacaca 225  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  3295156 atat-actcacacttgcacaca 3295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6500567 - 6500451
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  6500567 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggac 6500469  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6500468 atataactcacacttgca 6500451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6500939 - 6500823
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  6500939 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggac 6500841  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6500840 atataactcacacttgca 6500823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 1028558 - 1028682
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  1028558 gagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggac 1028657  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1028658 atataactcacacttgtacacaaca 1028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 42405638 - 42405766
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  || |  ||||||| ||||| |||||| ||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  42405638 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggaca 42405737  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaacaacaga 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42405738 tataactcacacttgtacacaacaacaga 42405766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 624313 - 624196
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||| | |||||||||    
T  624313 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggac 624214  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  624213 atataactcacacttgca 624196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 3295386 - 3295509
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  3295386 gagagacaacacactcttac-caaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaac 3295484  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  3295485 atat-actcacacttccacacaacaa 3295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 5723844 - 5723949
Alignment:
Q  116 actcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcaca 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723844 actctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttattattttatccgatgtgggacatataactcaca 5723943  T
Q  216 cttgca 221  Q
    ||||||    
T  5723944 cttgca 5723949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 9498695 - 9498812
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||| |||||| |||    
T  9498695 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagac 9498794  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9498795 atataactcacatttgca 9498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 29549296 - 29549413
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  29549296 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattttatctgatatggaac 29549395  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29549396 atataactcacacttgca 29549413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2411114 - 2411010
Alignment:
Q  114 acactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2411114 acactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactca 2411015  T
Q  214 cactt 218  Q
    |||||    
T  2411014 cactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38427664 - 38427553
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  38427664 gagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagatgttcaacctttacttttctatccaatgtgggac 38427566  T
Q  204 atataactcacac 216  Q
    |||||||||||||    
T  38427565 atataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 623935 - 623818
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||  ||||||| ||   |||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  623935 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagac 623836  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  623835 atataactcacacttgca 623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 27502077 - 27502194
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||  |||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  27502077 gagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggac 27502176  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27502177 atataactcacacttgca 27502194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 36522278 - 36522402
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  | | || ||||| ||||| |||    
T  36522278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagac 36522377  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  36522378 atataactcacactttcatacaaca 36522402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15370519 - 15370428
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccga 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370519 gagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 26590951 - 26591068
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||  || |||| ||| ||    
T  26590951 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaac 26591050  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    || ||| |||||||||||    
T  26591051 atttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33747888 - 33747783
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||   | || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33747888 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatttaacctttactattttatccgatgtgggac 33747789  T
Q  204 atataa 209  Q
    ||||||    
T  33747788 atataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 24489248 - 24489369
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||   |||| ||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  24489248 agagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggaca 24489345  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  24489346 tataactcacacttgaacacaaca 24489369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508604
Alignment:
Q  126 aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 225  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgtacaca 42508608  T
Q  226 acaa 229  Q
    ||||    
T  42508607 acaa 42508604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35914925 - 35914839
Alignment:
Q  145 tttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35914925 tttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatacttatacacaacaaca 35914839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39309754 - 39309677
Alignment:
Q  151 ggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39309754 ggtcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaaca 39309677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150737
Alignment:
Q  179 tttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35150737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151028
Alignment:
Q  179 tttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35151028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 36521937 - 36522061
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||| |   |||||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  36521937 gagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggac 36522036  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  36522037 atataactcacacttgcgcacaaca 36522061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31509706 - 31509615
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||   || ||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31509706 caatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 31509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 301025 - 300949
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  301025 ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttgtacacaaaaaca 300949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768852
Alignment:
Q  146 ttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttg 7768852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785774
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacacttccacacaaca 13785774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 231
Target Start/End: Original strand, 35167920 - 35168006
Alignment:
Q  145 tttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||| || ||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  35167920 tttatgggtcatcctacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttgtacacaacaaca 35168006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 41635242 - 41635359
Alignment:
Q  114 acactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    ||||||||||  ||||  |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  41635242 acactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactca 41635341  T
Q  214 cacttgcacacaacaaca 231  Q
     ||||  |||||||||||    
T  41635342 tacttatacacaacaaca 41635359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  126 aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| | |||  |||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaacttt-acttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 36527209 - 36527249
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36527209 tatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 36527249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Original strand, 26900093 - 26900138
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  26900093 ttttatctgatgtgggacatataactcaaatttgtacacaacaaca 26900138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 24600355 - 24600479
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  24600355 gagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 24600454  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24600455 atataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41157489 - 41157367
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41157489 agacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacata 41157390  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41157389 taactcacacttgcacacaacaa 41157367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17294694 - 17294569
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17294694 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 17294595  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  17294594 atataactcacacttgtacacaacaa 17294569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 26661563 - 26661690
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  26661563 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggac 26661662  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26661663 atataactcacacttgtacacaacaaca 26661690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41157107 - 41156981
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  41157107 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggaca 41157008  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41157007 tataattcacacttgcacacaacaaca 41156981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 32594757 - 32594874
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  32594757 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtaggac 32594856  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32594857 atataactcacacttgca 32594874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 22077536 - 22077660
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  22077536 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 22077635  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22077636 atataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41142490 - 41142362
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactctt-actcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41142490 gagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggga 41142391  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41142390 catataactcacacttgcacagaacaaca 41142362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34365042 - 34364915
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| | |||||||||||||| |||    
T  34365042 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgac 34364943  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364942 atataactcacacttgcacacaacaaca 34364915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 44290502 - 44290616
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44290502 agacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 44290601  T
Q  207 taactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||    
T  44290602 taactcacacttgca 44290616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 50052064 - 50052178
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50052064 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 50052163  T
Q  204 atataactcacactt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  50052164 atataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 5320006 - 5320131
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  5320006 gagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaac 5320105  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5320106 atataactcacacttgcatacaacaa 5320131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 31767205 - 31767329
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31767205 agacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacata 31767304  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31767305 taacccacacttgcacacaacaaca 31767329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37556228 - 37556101
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgtttt-atccgatgtggga 202  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  37556228 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgg-tcctcttacttataagatgttcaacctttactatttttatccgatgtggga 37556130  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37556129 catataactcacacttgtacacaacaaca 37556101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 37850641 - 37850769
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  37850641 gagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggac 37850740  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850741 atataactcacacttgcacacaacaacag 37850769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184593
Alignment:
Q  127 aaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T
Q  227 caaca 231  Q
    |||||    
T  41184589 caaca 41184593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34364624 - 34364497
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  34364624 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 34364525  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364524 atataactcacacttgcacacaacaaca 34364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 39066241 - 39066368
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||   |||||||| |||||| || |||||||||||| |     
T  39066241 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaat 39066340  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39066341 atataactcacacttgcacacaacaaca 39066368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 44290873 - 44290983
Alignment:
Q  112 ccacactctt-actcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataac 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44290873 ccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 44290972  T
Q  211 tcacacttgca 221  Q
    |||||||||||    
T  44290973 tcacacttgca 44290983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41759600 - 41759483
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41759600 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgac 41759501  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41759500 atataactcacacttgca 41759483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Original strand, 3537640 - 3537752
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3537640 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3537739  T
Q  204 atataactcacac 216  Q
    |||||||| ||||    
T  3537740 atataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3550837 - 3550721
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  3550837 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3550738  T
Q  204 atataactcacacttgc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  3550737 atataactcacacttgc 3550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29798316 - 29798189
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  29798316 gagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggac 29798217  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29798216 atataactcacacttgcatacaacaaca 29798189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40082515 - 40082398
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40082515 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 40082417  T
Q  212 cacacttgcacacaacaac 230  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  40082416 cacacttgcgcacaacaac 40082398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Original strand, 5528795 - 5528902
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  5528795 gagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 5528894  T
Q  204 atataact 211  Q
    ||||||||    
T  5528895 atataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11977397 - 11977270
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||  || |  ||||||| || ||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11977397 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggac 11977298  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11977297 atataactcacacttgtacacagcaaca 11977270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378209
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaaca 21378209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 26661939 - 26662066
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||| |||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||     
T  26661939 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggat 26662038  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26662039 atataactcacacttgtacacaacaaca 26662066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45084457 - 45084378
Alignment:
Q  146 ttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45084457 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgcacaca 45084378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 66513 - 66638
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||  | ||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||| ||| ||    
T  66513 gagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaac 66612  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  66613 atataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537305
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3537305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 3875372 - 3875497
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3875372 gagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgac 3875471  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  3875472 atataactgactcttgcacacaacaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34649555 - 34649426
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |  |||||||||| ||   |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34649555 gagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 34649456  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacaga 233  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34649455 atataactcacacttgtatacaacaacaga 34649426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 38804396 - 38804521
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  38804396 gagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttattcgatgtgggac 38804495  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
     ||||||||||||||| | |||||||    
T  38804496 gtataactcacacttgtaaacaacaa 38804521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 48588529 - 48588646
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  48588529 gagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggac 48588628  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  48588629 atagaactcacacttgca 48588646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 1188629 - 1188753
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||  || |||||| |  ||| || |||||||| ||| ||    
T  1188629 gagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaac 1188728  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1188729 atataactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9956026 - 9955899
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagttta-tgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgtttt-atccgatgtggg 201  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||    
T  9956026 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtggg 9955927  T
Q  202 acatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9955926 acatataactcacactaacacacaacaa 9955899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 22077871 - 22077991
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | || |||||||| |   |||    
T  22077871 agagacgccacactcttaccccaaaccttagg-ctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaaca 22077969  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22077970 tataactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 66127 - 66254
Alignment:
Q  103 tgagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttc-aacttttactgttttatccgatgtggg 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| || ||||||||||| |    
T  66127 tgagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgag 66226  T
Q  202 acat-ataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
T  66227 acatgattactcacacttgcacacaaca 66254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5575221 - 5575098
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||| |||||||    
T  5575221 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggac 5575122  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||    
T  5575121 atataattcaca--tgcacacaacaa 5575098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22793396 - 22793270
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaa-tgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| |||||| |||||||   | |||||| | |||| || ||| ||||||||||    
T  22793396 gagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctacttttctatacgatgtggga 22793297  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22793296 catataactcacacttgctcacaacaa 22793270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14318984 - 14318875
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||    
T  14318984 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaac 14318885  T
Q  204 atataactca 213  Q
    ||||||||||    
T  14318884 atataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 19283496 - 19283620
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| | ||| |   || ||||| |  ||| || |||||| ||||||||    
T  19283496 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggac 19283595  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19283596 atataactcacacttgcacacaaca 19283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Original strand, 30630683 - 30630803
Alignment:
Q  108 gacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatat 207  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  30630683 gacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatat 30630782  T
Q  208 aactcacacttgcacacaaca 228  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  30630783 aaatcacacttgcacataaca 30630803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 45494015 - 45494137
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatat-tatg---ttcaacttttactgttttatccgatgtg 199  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45494015 gagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 45494114  T
Q  200 ggacatat-aactcacacttgca 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  45494115 ggacatataaactcacacttgca 45494137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44685540 - 44685449
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaa-cttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44685540 caatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 1187405 - 1187527
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| |  ||| || ||| ||||||| |||    
T  1187405 gagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagac 1187504  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  1187505 atataattcacacttgcacacaa 1187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37555846 - 37555721
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | | |  |||| || |||||||||||||| | | |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  37555846 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatgtattcaaccttcactattttatccgatgtgggac 37555748  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaac 230  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37555747 ttataactcacacttttacacaacaac 37555721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 24132049 - 24132150
Alignment:
Q  127 aaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||   |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24132049 aaaccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaa 24132148  T
Q  227 ca 228  Q
    ||    
T  24132149 ca 24132150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154207
Alignment:
Q  174 caacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35154207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 44043813 - 44043935
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttca------acttttactgttttatccgatg 197  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||      ||| ||||| |||||| |||||    
T  44043813 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcgatg 44043912  T
Q  198 tgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  44043913 tgggacatataact-acacttgca 44043935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 22077153 - 22077287
Alignment:
Q  106 gagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatc------------c 193  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| || ||||            |    
T  22077153 gagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgattttctatcc 22077252  T
Q  194 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077253 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 22077287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 50469188 - 50469246
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50469188 tgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 50469246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878796
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||| |||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaaca 4878796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24448394 - 24448270
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||| |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||  ||| || | |  |||||   ||    
T  24448394 gagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatgttcaacttccacttttctttgagatgtctaac 24448295  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  24448294 atataacttacacttgcacacaaca 24448270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 32168739 - 32168795
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctctta 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  32168739 gagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctctta 32168795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45839659 - 45839617
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45839659 tatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 45839617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4956274 - 4956218
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccg 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||    
T  4956274 caatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 166
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  106 gagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051809
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 50051809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10351277 - 10351215
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  10351277 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttata 10351215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Original strand, 47379911 - 47379943
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379911 tatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25483453 - 25483326
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  25483453 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 25483354  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483353 atataactcacacttgcacacaacaaca 25483326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 34646688 - 34646815
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34646688 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggac 34646787  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34646788 atataactcacacttgtacacaacaaca 34646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 41707504 - 41707634
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41707504 gagagacaccacactcttac-caaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 41707602  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacagagt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41707603 atataactcacacttgtacacaacaatagagt 41707634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 36608700 - 36608830
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36608700 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggac 36608799  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacagag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608800 atataactcacacttgcacacaacaacagag 36608830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 3244490 - 3244614
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  3244490 gagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 3244589  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3244590 atataactcacacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36629354 - 36629230
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  36629354 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggac 36629255  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  36629254 atataactcacacttgaacacaaca 36629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22183303 - 22183430
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  22183303 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggat 22183402  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183403 atataactcacacttgcacacaacaaca 22183430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 1731694 - 1731813
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1731694 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataact 1731793  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1731794 cacatttgcacacaacaaca 1731813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 4955356 - 4955483
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||| || |||    
T  4955356 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaactattttatccgatatgagac 4955455  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955456 atataactcacacttgcacacaacaaca 4955483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50002543 - 50002416
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  50002543 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 50002444  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50002443 atataactcacacttgcaaacaacaaca 50002416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 50630794 - 50630911
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  50630794 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 50630893  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  50630894 atataactcacgcttgca 50630911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2740817 - 2740693
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  || |||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2740817 gagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggac 2740718  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2740717 atataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52885005 - 52884877
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactc-aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52885005 gagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884906  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884905 catataactcacacttgcacacaacaaca 52884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3341236 - 3341118
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3341236 cacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 3341137  T
Q  213 acacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3341136 acacttgcacacaacaaca 3341118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39404135 - 39404013
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| | |||| ||||    
T  39404135 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggac 39404036  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  39404035 atataactcacacttgtacacaa 39404013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 54017634 - 54017754
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  54017634 gagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggac 54017733  T
Q  204 atataactcacacttgcacac 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54017734 atataactcacacttgcacac 54017754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22028000 - 22028127
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  22028000 gagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggac 22028099  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22028100 atataagtcacacttgcacacaacaaca 22028127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10246034 - 10245910
Alignment:
Q  106 gagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  10246034 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcat 10245936  T
Q  206 ataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10245935 ataactcacacttgcacacaacaaca 10245910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52884813 - 52884688
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactc-aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||| | || |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52884813 gagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884714  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52884713 catataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 55933163 - 55933280
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  55933163 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggac 55933262  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55933263 atataactcacacttgca 55933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 16888855 - 16888983
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   | |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  16888855 gagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggac 16888954  T
Q  204 atataactcacacttg-cacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16888955 atataactcacacttgccacacaacaaca 16888983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 39792899 - 39793023
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  39792899 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggac 39792998  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  39792999 atataactcacacttgtacacaaca 39793023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076614
Alignment:
Q  127 aaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaa 49076609  T
Q  227 caaca 231  Q
    |||||    
T  49076610 caaca 49076614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36572136 - 36572009
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  36572136 gagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggac 36572037  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36572036 atataactcacacttgtacacaacaaca 36572009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22028408 - 22028537
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaactttta--ctgttttatccgatgtggg 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||   | ||||||||||||| ||    
T  22028408 gagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtagg 22028507  T
Q  202 acatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22028508 acatataagtaacacttgcacacaacaaca 22028537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45496922 - 45496820
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  45496922 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccgatgtgggac 45496823  T
Q  204 ata 206  Q
    |||    
T  45496822 ata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41370474 - 41370357
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  41370474 gagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggac 41370375  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41370374 atataactcacacttgca 41370357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49880277 - 49880160
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| | |||||||||    
T  49880277 gagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggac 49880178  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49880177 atataactcacacttgca 49880160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017870
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggg--acatataac 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatatataac 54017849  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  54017850 tcacatttgcacacaacaaca 54017870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54109029 - 54108908
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54109029 gagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 54108931  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
      |||||| ||||||||||||||||    
T  54108930 --ataactgacacttgcacacaaca 54108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2741184 - 2741064
Alignment:
Q  108 gacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  2741184 gacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatat 2741085  T
Q  208 aactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  2741084 aactcacacttgcacataaca 2741064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 32941162 - 32941286
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||  |||    
T  32941162 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgttcaacctttactgttctttccgatgtaagac 32941261  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  32941262 atataactcacacttgcagacaaca 32941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44621111 - 44621011
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44621111 ccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaact 44621012  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  44621011 c 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3340921 - 3340802
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  3340921 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacata 3340822  T
Q  207 taactcacacttgcacacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3340821 taactcacacttgcacacaa 3340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 4390140 - 4390267
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| | | | || ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  4390140 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggat 4390239  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  4390240 atgtaactcacacttgcacacaacaaca 4390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39404515 - 39404388
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  39404515 gagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggac 39404416  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39404415 atataactcacacttgtacacaacaaca 39404388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44620768 - 44620654
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44620768 ccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataact 44620670  T
Q  212 cacacttgcacacaac 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  44620669 cacacttgcacacaac 44620654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49303015 - 49302902
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttac--ttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataa 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  49303015 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataa 49302916  T
Q  210 ctcacacttgcaca 223  Q
    ||||||||| ||||    
T  49302915 ctcacacttacaca 49302902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50459838 - 50459724
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  50459838 gagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaac 50459739  T
Q  204 atataactcacactt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  50459738 atataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 54741227 - 54741341
Alignment:
Q  114 acactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  54741227 acactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattca 54741326  T
Q  214 cacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||    
T  54741327 cacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54936313 - 54936190
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||      
T  54936313 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg-- 54936216  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
      |||||||||||||| |||||||||||    
T  54936215 --ataactcacacttgtacacaacaaca 54936190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 6975495 - 6975612
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  6975495 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgagac 6975594  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6975595 atataactcacatttgca 6975612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28034346 - 28034222
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||||| |  ||| || ||||||||| |||||    
T  28034346 gagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggac 28034247  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  28034246 atataattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 51768115 - 51768225
Alignment:
Q  120 ttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||    
T  51768115 ttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttg 51768214  T
Q  220 cacacaacaac 230  Q
    |||||||||||    
T  51768215 cacacaacaac 51768225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20826294 - 20826223
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcaca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826294 gtttatgggttctcttacttataacgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44620461 - 44620362
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620461 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 34004624 - 34004744
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| | |||||||  ||||| |||    
T  34004624 gagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgac 34004721  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34004722 atataactcacacttgcacacaa 34004744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3700434 - 3700357
Alignment:
Q  152 gtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3700434 gtccttttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 3700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10246424 - 10246340
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10246424 gtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaaca 10246340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20825945 - 20825829
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | |   |||||||||| |||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20825945 ccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataact 20825846  T
Q  212 cacacttgcacacaaca 228  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  20825845 cacatttgtacacaaca 20825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 45489421 - 45489497
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45489421 ctcttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaaca 45489497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31691266 - 31691207
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31691266 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19504756 - 19504695
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19504756 tgttcaacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 19504695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Original strand, 54343047 - 54343147
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||       |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54343047 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 54343139  T
Q  204 atataact 211  Q
    ||||||||    
T  54343140 atataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43174624 - 43174496
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgtttt-atccgatgtggga 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||    ||  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||| ||| |||||| |     
T  43174624 gagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtgg 43174525  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43174524 catataactcacacttgtacacaacaaca 43174496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621420
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaac 227  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaac 44621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Original strand, 18932788 - 18932887
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||   | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18932788 gagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54108651 - 54108527
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagttt-atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||| |||||| |||||||| || ||||||      
T  54108651 agacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac-- 54108554  T
Q  206 ataactcacacttgc-acacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54108553 ataactcacacttgcaacacaacaaca 54108527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 16889575 - 16889703
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  || |  |||||||  ||||||||||||||   | |||||| |||||| || |||||||| || |||    
T  16889575 gagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagac 16889674  T
Q  204 atataactcacacttg-cacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16889675 atataactcacacttgccacacaacaaca 16889703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620286
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaaca 44620286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 49076873 - 49076992
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||    ||| |||||||||| |||||||| |||   |||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||    
T  49076873 agacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttact-ataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacata 49076971  T
Q  207 taactcacacttgcacacaac 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49076972 taactcacacttgcacacaac 49076992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706687
Alignment:
Q  180 ttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgcacacaacaaca 11706687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 50788088 - 50788139
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50788088 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 50788139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Original strand, 23817720 - 23817782
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23817720 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttata 23817782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40067118 - 40067045
Alignment:
Q  147 tatgggtcctcttacttatattatgttcaactttt-actgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067118 tatgtgtcctcttacttataatgtgttcaactttttacacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620934
Alignment:
Q  155 ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatg-tgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgtccacaacaaca 44620934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 760305 - 760194
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   |  ||||| || | | || ||| |||||||||||    
T  760305 gagagacaccacacttttac-caaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggac 760207  T
Q  204 atataactcacac 216  Q
    |||||||||||||    
T  760206 atataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050593
Alignment:
Q  173 tcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 45050593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 23556905 - 23557024
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||| | |||||| |||||  ||||||||| |  ||| || ||||||||||   ||    
T  23556905 gagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttctatccgatgtaaaac 23557004  T
Q  204 atataactcacacttgcaca 223  Q
    || |||||||||||||||||    
T  23557005 atttaactcacacttgcaca 23557024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 163
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttactt 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 11348401 - 11348494
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||   |||||||| |  ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11348401 caatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgcacacaacaaca 11348494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3271895 - 3271806
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatatta---tgttcaacttttactgttttatccgatgtg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| ||   |||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  3271895 cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12197405 - 12197370
Alignment:
Q  194 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12197405 gatgtgggacctataactcacacttgcacacaacaa 12197370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43827556 - 43827495
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43827556 gagagacaccacactctta-tccaaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatttata 43827495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 231
Target Start/End: Original strand, 23817783 - 23817812
Alignment:
Q  202 acatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 acatataactcacacttgcacacaacaaca 23817812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15880380 - 15880253
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  15880380 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaac 15880281  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15880280 atataactcacacttgtacacaacaaca 15880253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 28254278 - 28254405
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  28254278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgggac 28254377  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28254378 atataagtcacactggcacacaacaaca 28254405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 36005921 - 36006047
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36005921 gagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggac 36006019  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36006020 atataactcacacttgtacacaacaaca 36006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 14745708 - 14745825
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  14745708 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 14745807  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14745808 atataactcacacttgca 14745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 36178646 - 36178763
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36178646 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178745  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36178746 atataactcacacttgca 36178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 41283516 - 41283633
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  41283516 gagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggac 41283615  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41283616 atataactcacacttgca 41283633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6421502 - 6421375
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6421502 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 6421403  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6421402 atataactcacacttgtgcacaacaaca 6421375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 962706 - 962591
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  962706 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactc 962607  T
Q  213 acacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||| ||||||    
T  962606 acacttgcatacaaca 962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16542566 - 16542439
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16542566 gagagatgctacactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 16542467  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16542466 ttataactcacacttgcacacaacaaca 16542439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 35580765 - 35580886
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35580765 gagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-tcctctcacttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggac 35580863  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35580864 atataactcacacttgcacacaa 35580886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 15511536 - 15511662
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15511536 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgac 15511635  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15511636 atataact--cacttgcacacaacaacag 15511662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468914
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    ||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  213 acacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaaca 31468914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37106041 - 37105924
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  37106041 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 37105942  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37105941 atataactcacacttgca 37105924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37106297 - 37106188
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106297 ccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 37106198  T
Q  212 cacacttgca 221  Q
    ||||||||||    
T  37106197 cacacttgca 37106188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 38796660 - 38796788
Alignment:
Q  105 agagacgccaca--ctcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  38796660 agagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtggga 38796759  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796760 catataactcacacttgcacacaacaaca 38796788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 28531363 - 28531479
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  28531363 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataact 28531462  T
Q  212 cacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  28531463 cacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796386
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 38796386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 14745335 - 14745452
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  14745335 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggac 14745434  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14745435 atataactcacagttgca 14745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 31899501 - 31899594
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31899501 caatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaacaaca 31899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1770009 - 1769889
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | | ||  | ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1770009 gagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgac 1769910  T
Q  204 atataactcacacttgcacac 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1769909 atataactcacacttgcacac 1769889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6713094 - 6712966
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaa-ccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6713094 gagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgaga 6712995  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6712994 catataactcacacttgtatacaacaaca 6712966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 37632646 - 37632762
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37632646 ccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 37632745  T
Q  212 cacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  37632746 cacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42514766 - 42514642
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||    
T  42514766 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggac 42514667  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  42514666 atataactcacacttgcatacaaca 42514642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 5542666 - 5542783
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  5542666 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggac 5542765  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5542766 atataactcacacttgca 5542783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Original strand, 5543040 - 5543156
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  5543040 agagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggaca 5543139  T
Q  205 tataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  5543140 tataactcacacttgca 5543156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 40679670 - 40679794
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||  ||||| || |||||||| ||||||    
T  40679670 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggac 40679769  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  40679770 atataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561616
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  213 acacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  33561601 acacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178427
Alignment:
Q  114 acactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  214 cacttgca 221  Q
    ||||||||    
T  36178420 cacttgca 36178427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 29873578 - 29873703
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  29873578 gagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggac 29873677  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||    
T  29873678 atgtaacacacccttgcacacaacaa 29873703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30323583 - 30323456
Alignment:
Q  102 atgagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||   |||||||| |  | | || |||| ||| ||||    
T  30323583 atgagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttggg 30323484  T
Q  202 acatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30323483 acatataacacacacttgcacacaacaa 30323456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40733594 - 40733507
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40733594 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7598684 - 7598606
Alignment:
Q  146 ttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacac 224  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598684 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacac 7598606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30313294 - 30313170
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| |  ||| || ||||||||||| |||    
T  30313294 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttata-agtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagac 30313196  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30313195 atataacacacgcttgcacacaacaa 30313170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 36785670 - 36785731
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785670 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 36785731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Original strand, 12529103 - 12529195
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaac 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12529103 caatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaac 12529195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29677025 - 29676893
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtc-----ctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||     |||| || ||||   |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  29677025 gagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 29676926  T
Q  199 gggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29676925 gggacatataactcacacctgcacacaacaaca 29676893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33731765 - 33731636
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  33731765 gagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagat 33731666  T
Q  204 atataactc--acacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33731665 atataactcacacacttgaacacaacaaca 33731636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6422227 - 6422126
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  6422227 gagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggac 6422128  T
Q  204 at 205  Q
    ||    
T  6422127 at 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 37895110 - 37895227
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| || || |||||| ||   | ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  37895110 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatataact 37895209  T
Q  212 cacacttgcacacaacaa 229  Q
    || ||| |||||||||||    
T  37895210 caaactcgcacacaacaa 37895227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5367572 - 5367448
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||| |||| || |||||||||||   |||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  5367572 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttgctcttttatccgatctgggac 5367473  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||    
T  5367472 atatatatcacacttgtacacaaca 5367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16590986 - 16590881
Alignment:
Q  118 tcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgtttt-atccgatgtgggacatataactcacac 216  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||      |||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16590986 tcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacac 16590893  T
Q  217 ttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||    
T  16590892 ttgcacacaaca 16590881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7598345 - 7598225
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||| |||||| || ||| |||||| | ||    
T  7598345 gagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaac 7598246  T
Q  204 atataactcacacttgcacac 224  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  7598245 atataattcacacttgcacac 7598225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Original strand, 36178220 - 36178311
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36178220 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421294
Alignment:
Q  173 tcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 6421294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874185
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  | |||||   |||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  207 taactcacacttgcacaca 225  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  29874167 taacacacacttgtacaca 29874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3673120 - 3673075
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673120 ttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 3673075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 31259665 - 31259787
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatcc---gatgtgggacatata 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||  ||||||||||| |||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||   |||||| ||||||||    
T  31259665 ccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgagacatata 31259764  T
Q  209 actcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  31259765 actcgcacttacacacaacaaca 31259787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 33953852 - 33953936
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |  ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33953852 gtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactcacatttgcacacaaca 33953936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29676618 - 29676543
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactca 213  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676618 caatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 40163413 - 40163520
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaat-acaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||| |  ||| ||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  40163413 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggga 40163512  T
Q  203 catataac 210  Q
    ||||||||    
T  40163513 catataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3672754 - 3672709
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3672754 ttttattcgatgtgggacatataactcatacttgcacacaacaaca 3672709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40733950 - 40733873
Alignment:
Q  154 cctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||   |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40733950 cctcttacttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9231322 - 9231242
Alignment:
Q  148 atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9231322 atggatcctcttatttataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatacttacacacaaca 9231242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 33954303 - 33954426
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||  || |||||| ||| | | | |||||| ||||| ||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  33954303 gagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggcataga-tttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtgggac 33954401  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33954402 atataactcacacttgcacacaaca 33954426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 41678409 - 41678534
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||   |||| ||| |   || || |||| |||||| |||    
T  41678409 gagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagac 41678507  T
Q  204 --atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  41678508 atatataactcacacttgcacacaaca 41678534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Original strand, 35580479 - 35580534
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactct--tactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctc 157  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35580479 gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 43443108 - 43443148
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43443108 tatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 43443148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6421848 - 6421793
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctctt 159  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  6421848 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23346353 - 23346228
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||   |||| ||| |||||| || ||| ||||||| |||    
T  23346353 gagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagac 23346255  T
Q  204 atata--actcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23346254 atatataactcacactcgcacacaaca 23346228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3673185 - 3673123
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3673185 gagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttata 3673123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Original strand, 28254193 - 28254254
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254193 gtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 3038331 - 3038458
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3038331 gagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3038430  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3038431 atataactcacacttgtacacaacaaca 3038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9309472 - 9309345
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9309472 gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggac 9309373  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309372 atataactcacacttgcacacaacaaca 9309345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 45122098 - 45122220
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  45122098 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 45122197  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45122198 atataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 25561856 - 25561984
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactc-aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25561856 gagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtggga 25561955  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25561956 catataactcacacttgtagacaacaaca 25561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 33113408 - 33113535
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  33113408 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 33113507  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33113508 atataactcaaacttgtacacaacaaca 33113535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3669804 - 3669687
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  3669804 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3669705  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3669704 atataactcacacttgca 3669687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 147568 - 147440
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  147568 gagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 147469  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  147468 atataactcacacttacacgcaacaacag 147440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30359388 - 30359261
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  30359388 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac 30359289  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30359288 atataactcacacttgtacacaacaaca 30359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34834993 - 34834866
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  34834993 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggac 34834894  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34834893 atataactcacacttgtacacaacaaca 34834866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 43274828 - 43274947
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43274828 ccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatataact 43274927  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  43274928 cacacttatacacaacaaca 43274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Original strand, 45121952 - 45122070
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  45121952 agagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggaca 45122051  T
Q  205 tataactcacacttgcaca 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45122052 tataactcacacttgcaca 45122070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 6876911 - 6877031
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac-atataac 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6876911 ccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataac 6877010  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6877011 tcacacttgcacacaacaaca 6877031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34835318 - 34835199
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34835318 ccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataact 34835219  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  34835218 cacccttgtacacagcaaca 34835199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 70318 - 70441
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  70318 agacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacata 70417  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||    
T  70418 taactcac-tttgtacacaacaaca 70441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 1013921 - 1014029
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1013921 cacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactc 1014020  T
Q  213 acacttgca 221  Q
    |||||||||    
T  1014021 acacttgca 1014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 8918808 - 8918932
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||     
T  8918808 agacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatg 8918907  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8918908 taactcacacttgcacacaacaaca 8918932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9608862 - 9608738
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  9608862 gagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 9608763  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9608762 atataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5420766 - 5420643
Alignment:
Q  106 gagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  5420766 gagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacat 5420667  T
Q  206 ataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||  |||||||||| |||||||    
T  5420666 ataatacacacttgcatacaacaa 5420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9309084 - 9308970
Alignment:
Q  116 actcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtg--ggacatataactca 213  Q
    |||||| | ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9309084 actcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactca 9308985  T
Q  214 cacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||    
T  9308984 cacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30359726 - 30359599
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  30359726 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagac 30359627  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30359626 atataactcacacttgtacacaacaaca 30359599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30441202 - 30441081
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata-tta---tgttcaacttttactgttttatccgatgtg 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  30441202 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtg 30441103  T
Q  200 ggacatataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30441102 ggacatataactcacacttgca 30441081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45122741 - 45122638
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  45122741 gagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggcc 45122642  T
Q  204 atat 207  Q
    ||||    
T  45122641 atat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3670177 - 3670060
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3670177 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggac 3670078  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3670077 atataactcacacttgca 3670060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 4154707 - 4154831
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  4154707 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggac 4154806  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4154807 atataactcacacttgcacacaaca 4154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 37544534 - 37544658
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  37544534 agacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgactta 37544633  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  37544634 taactcacacttgtgcacaacaaca 37544658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8794228 - 8794101
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||||| | | |  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||    
T  8794228 gagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgagac 8794129  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8794128 atataactcacacttgtacacaacaaca 8794101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40518695 - 40518577
Alignment:
Q  108 gacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatat 207  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  40518695 gacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatat 40518596  T
Q  208 aactcacacttgcacacaa 226  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40518595 aactcacacttgaacacaa 40518577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6732012 - 6731904
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||         ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6732012 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt---------tcaacctttactattttatccgatgtgggac 6731922  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6731921 atataactcacacttgca 6731904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40518188 - 40518061
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttac--tgttttatccgatgtggg 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||  |||||||||   |||||||| |||||  | |||||||| ||||||     
T  40518188 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtgga 40518089  T
Q  202 acatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40518088 acatataactcacacttgaacacaacaa 40518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 196
Target Start/End: Original strand, 9483229 - 9483320
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgat 196  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  9483229 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Original strand, 32640573 - 32640694
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||      |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  32640573 gagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttac-----ctatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 32640667  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaac 230  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32640668 agataactcacacttccacgcaacaac 32640694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41972241 - 41972151
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972241 caatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 1014286 - 1014403
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||   || ||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  1014286 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgac 1014385  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1014386 atataactcacacttgca 1014403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5915984 - 5915863
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||   |||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  5915984 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----cttataaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggac 5915890  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaac 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5915889 atataactcacacttgcacacaacaac 5915863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 20870614 - 20870733
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  20870614 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaac 20870713  T
Q  204 --atataactcacacttgca 221  Q
      ||||||||||||||||||    
T  20870714 atatataactcacacttgca 20870733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34835584 - 34835464
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatc-cgatgtgggacatataac 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  34835584 ccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataac 34835485  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  34835484 tcacccttgtacacagcaaca 34835464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34835850 - 34835730
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatc-cgatgtgggacatataac 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  34835850 ccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataac 34835751  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  34835750 tcacccttgtacacagcaaca 34835730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 147937 - 147819
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||         |||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  147937 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt---------tatatgttgttcaacatttacttttttatcagatgtgggac 147847  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147846 atataactcacacttgcacacaacaaca 147819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Original strand, 18372043 - 18372142
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372043 ccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45123108 - 45122996
Alignment:
Q  117 ctcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacac 216  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||   |  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123108 ctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttacttaaggt--gtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 45123011  T
Q  217 ttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  45123010 ttgcacacagcaaca 45122996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 1513964 - 1514078
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1513964 ccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataact 1514063  T
Q  212 cacacttgcacacaa 226  Q
    || ||||| ||||||    
T  1514064 catacttgtacacaa 1514078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 40579548 - 40579662
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| || ||  |||    
T  40579548 agagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaaca 40579647  T
Q  205 tataactcacacttg 219  Q
    ||||| |||||||||    
T  40579648 tataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 45121706 - 45121823
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  |  |||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  45121706 cacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactc 45121804  T
Q  213 acacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  45121805 acacttgtacacaacaaca 45121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 9482653 - 9482770
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  9482653 ccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataact 9482752  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
      |||||| |||||||||||    
T  9482753 --cacttgtacacaacaaca 9482770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9507898 - 9507769
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactg---ttttatccgatgtg-- 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||   | |||||| |||||||   |||||||| || ||      
T  9507898 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactgtacttttatccaatatgga 9507799  T
Q  200 ggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9507798 ggagatataactcacacttgcacacaacaa 9507769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Original strand, 9620751 - 9620841
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||| |||| || |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9620751 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 9620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372859
Alignment:
Q  149 tgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca 223  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactttcaca 18372859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Original strand, 18371710 - 18371807
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18371710 ccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttactta----atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataact 18371804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 18373006 - 18373098
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  18373006 caatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac-tgtacacaacaaca 18373098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 18380066 - 18380171
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | || |||||| || || ||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  18380066 ccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataact 18380165  T
Q  212 cacact 217  Q
    ||||||    
T  18380166 cacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12283989 - 12283867
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||| ||| | |||||| ||  || |||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  12283989 gagagacactacactcttatccaaaaccttaagact-tgagtttatgtgtcattttacttttaagatattcaacatttacttttttatctgacgtgggac 12283891  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaac 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  12283890 atataacttacacttgcacacaac 12283867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372416
Alignment:
Q  149 tgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca 223  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactttcaca 18372416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  148 atgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33832074 - 33831971
Alignment:
Q  125 caaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacac 224  Q
    ||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||| || | | | | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33832074 caaaaccttaaaaaaaagtgtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgcacac 33831975  T
Q  225 aaca 228  Q
    ||||    
T  33831974 aaca 33831971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 218
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  131 cttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac--atataactcacactt 218  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6651611 - 6651510
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||         |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  6651611 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctc---------ttattttcaacctttactattttatccgatgtgagac 6651521  T
Q  204 atataactcac 214  Q
    |||||||||||    
T  6651520 atataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9609202 - 9609108
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  9609202 gagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttacttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 4154322 - 4154446
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||| |  ||| || |||| ||||| ||||    
T  4154322 gagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggac 4154420  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  4154421 atataactcacatttgcacacaacaa 4154446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 18372487 - 18372531
Alignment:
Q  179 tttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18372487 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacactttcaca 18372531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645752
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 18645752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20130500 - 20130454
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacac 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20130500 tgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcacac 20130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 20995524 - 20995566
Alignment:
Q  186 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995524 ttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 20995566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5274883 - 5274770
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||   |||||||| | | || |||||| | |||| | |||||||||||    
T  5274883 cacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattcaatgtagaacatataactc 5274784  T
Q  213 acacttgcacacaa 226  Q
    | ||||||||||||    
T  5274783 atacttgcacacaa 5274770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 18372678 - 18372758
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 219  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  18372678 caatgggtttatgagtcctcttacttata-agtgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatcacacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32305591 - 32305503
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccga 195  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||    
T  32305591 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Original strand, 43398114 - 43398225
Alignment:
Q  109 acgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctc---ttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacat 205  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||  |||||| |||||||||||||   ||| |||||   |||||||| |||||| || |||||||| || || ||    
T  43398114 acgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatat 43398213  T
Q  206 ataactcacact 217  Q
    ||||||||||||    
T  43398214 ataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 2579913 - 2580040
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2579913 gagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 2580012  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580013 atataactcacacttgcacacaacaaca 2580040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3409376 - 3409259
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  3409376 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3409277  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3409276 atataactcacacttgca 3409259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 10074404 - 10074528
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10074404 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggac 10074503  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  10074504 ctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 14748387 - 14748496
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14748387 ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 14748486  T
Q  212 cacacttgca 221  Q
    ||||||||||    
T  14748487 cacacttgca 14748496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29518620 - 29518503
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29518620 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 29518521  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29518520 atataactcacacttgca 29518503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29519037 - 29518920
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29519037 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 29518938  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29518937 atataactcacacttgca 29518920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32741296 - 32741179
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32741296 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 32741197  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32741196 atataactcacacttgca 32741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2377868 - 2377744
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2377868 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 2377769  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  2377768 taactcacacttgtgcacaacaaca 2377744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16454692 - 16454565
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16454692 gagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggac 16454593  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16454592 acataactcacacttgtacacaacaaca 16454565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 2578485 - 2578610
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  2578485 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggaca 2578583  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2578584 tataactcacacttgtacacaacaaca 2578610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26544166 - 26544049
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26544166 gagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 26544067  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26544066 atataactcacacttgca 26544049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 10074032 - 10074156
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  10074032 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggat 10074131  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10074132 atataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 6999837 - 6999964
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6999837 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggac 6999936  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  6999937 atataactcacacttatacacaataaca 6999964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16107795 - 16107668
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  16107795 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacac 16107696  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16107695 atataactcacacttgtacacaacaaca 16107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16455024 - 16454897
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  16455024 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggac 16454925  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  16454924 acataactcacatttgtacacaacaaca 16454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2378243 - 2378126
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2378243 gagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 2378144  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2378143 atataactcacacttgca 2378126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3058343 - 3058226
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3058343 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3058244  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3058243 atataactaacacttgca 3058226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3409777 - 3409660
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  3409777 gagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtac 3409678  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3409677 atataactcacacttgca 3409660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3415575 - 3415462
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  3415575 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggac 3415476  T
Q  204 atataactcacact 217  Q
    ||||||||||||||    
T  3415475 atataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 10073657 - 10073779
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10073657 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggac 10073754  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  10073755 atataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35210313 - 35210204
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35210313 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataact 35210214  T
Q  212 cacacttgca 221  Q
    ||||||||||    
T  35210213 cacacttgca 35210204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 9062399 - 9062501
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062399 ccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 9062497  T
Q  212 caca 215  Q
    ||||    
T  9062498 caca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1127477 - 1127360
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  1127477 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggat 1127378  T
Q  204 atataactcacacttgca 221  Q
    |||||||||||| |||||    
T  1127377 atataactcacagttgca 1127360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 1950226 - 1950355
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1950226 gagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 1950325  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaacaga 233  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1950326 atataactcacacttatacgcaacaacaga 1950355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2843664 - 2843544
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatggg-tcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  2843664 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataac 2843565  T
Q  211 tcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||  ||||||||||    
T  2843564 tcacaattgtgcacaacaaca 2843544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  213 acac 216  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10911683 - 10911558
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttac-tgttttatccgatgtggga 202  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||    
T  10911683 gagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtagga 10911584  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10911583 catataactcacacttgcatacaaca 10911558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16108146 - 16108053
Alignment:
Q  138 caatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108146 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 16108053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 593758 - 593877
Alignment:
Q  112 ccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataact 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  || |  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  593758 ccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaact 593857  T
Q  212 cacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  593858 cacacttgcactcagcaaca 593877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 2578877 - 2578999
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||   | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2578877 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggaca 2578975  T
Q  205 tataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  2578976 tataaatcacacttgctcacaaca 2578999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6071249 - 6071124
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| || ||| |||||||   |||||||| |  ||| || ||| | |||||||||    
T  6071249 gagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaatgtgggac 6071150  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6071149 atataactcacacttgcacacaacaa 6071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1846864 - 1846748
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggaca 204  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  1846864 agagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagaca 1846765  T
Q  205 tataactcacacttgca 221  Q
    || || |||||||||||    
T  1846764 tagaattcacacttgca 1846748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 12092523 - 12092647
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||   || ||||| |  ||| || |||||||||||||||    
T  12092523 gagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggac 12092622  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaaca 228  Q
    || |||| ||| |||||||||||||    
T  12092623 atctaacacacccttgcacacaaca 12092647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 232
Target Start/End: Original strand, 5832108 - 5832195
Alignment:
Q  145 tttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  5832108 tttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtgcacaacaacag 5832195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 5958644 - 5958771
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    |||||||  ||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  5958644 gagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacac 5958743  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5958744 atataactcacaattgcacaccacaaca 5958771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 2579212 - 2579273
Alignment:
Q  170 tgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2579212 tgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaaca 2579273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Original strand, 2579533 - 2579645
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||   | | | || |||||| |||| |||||||||||||    
T  2579533 gagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggac 2579632  T
Q  204 atataactcacac 216  Q
    |||||||||||||    
T  2579633 atataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31714781 - 31714669
Alignment:
Q  109 acgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| |  ||| || |||||||||| ||||||||     
T  31714781 acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat- 31714684  T
Q  209 actcacacttgcaca 223  Q
    | |||||||||||||    
T  31714683 agtcacacttgcaca 31714669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8482043 - 8481919
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| | |||||   |||||||| |  ||| || |||| ||||||| ||    
T  8482043 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtgg-ac 8481945  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8481944 atataactcacacttgcacacaacaa 8481919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 229
Target Start/End: Original strand, 7588355 - 7588390
Alignment:
Q  194 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588355 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 7588390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2975660 - 2975567
Alignment:
Q  113 cacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||||| || |||  |||||||||||||    
T  2975660 cacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggacata 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Original strand, 17135143 - 17135223
Alignment:
Q  137 acaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacact 217  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||   | || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135143 acaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33605686 - 33605646
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33605686 tatctgatgtgagacatatagctcacacttgcacacaacaa 33605646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5474 - 5349
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  5474 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaac 5375  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5374 atataactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5099 - 4972
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||  || || ||| ||||||||| | ||||||||| |||    
T  5099 gagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaacctttactgttctctccgatgtgagac 5000  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4999 atataattcacacttgcacacaacaaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 558 - 682
Alignment:
Q  107 agacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacata 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  558 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 657  T
Q  207 taactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  658 taactcacacttgtgcacaacaaca 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 230 - 300
Alignment:
Q  151 ggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 221  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5514 - 5386
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaacctt-aatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtggga 202  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  5514 gagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtagga 5415  T
Q  203 catataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5414 catataactcacacttgcacacaacaaca 5386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5898 - 5767
Alignment:
Q  105 agagacgccacactcttactcaaaac-----cttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||      |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5898 agagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 5799  T
Q  200 ggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5798 cgacatataactcacacttgcacacaacaaca 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1274
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||||   |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  1147 gagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggac 1246  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1247 atataactcacacttgtacacaacaaca 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 3091 - 3153
Alignment:
Q  169 atgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3091 atgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaaca 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 166
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1794
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttata 166  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1732 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttata 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Original strand, 17519 - 17624
Alignment:
Q  126 aaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 225  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17519 aaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgacatataactcacacttgcacaca 17618  T
Q  226 acaaca 231  Q
    ||||||    
T  17619 acaaca 17624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10279
Alignment:
Q  144 gtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtgcacaacaaca 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47477 - 47350
Alignment:
Q  104 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaatacaatgagtttatgggtcctcttacttatattatgttcaacttttactgttttatccgatgtgggac 203  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||   |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||    
T  47477 gagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagac 47378  T
Q  204 atataactcacacttgcacacaacaaca 231  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  47377 atttaattcacacttgcacacatcaaca 47350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39870 - 39830
Alignment:
Q  189 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39870 tatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaacaa 39830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University