View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7991_low_25 (Length: 399)

Name: NF7991_low_25
Description: NF7991
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7991_low_25
NF7991_low_25
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (6-381)||(33962-34337)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (6-381)||(32377441-32377816)
chr8 (6-381)||(32431398-32431773)
chr8 (6-381)||(7341232-7341607)
chr8 (6-381)||(8422389-8422764)
chr8 (6-381)||(30304143-30304518)
chr8 (17-381)||(35965278-35965642)
chr8 (17-381)||(43370931-43371295)
chr8 (21-380)||(2145533-2145897)
chr8 (17-354)||(43688731-43689068)
chr8 (17-381)||(7169064-7169419)
chr8 (19-360)||(45455542-45455883)
chr8 (86-381)||(22581061-22581356)
chr8 (6-189)||(1115925-1116108)
chr8 (17-170)||(39751772-39751925)
chr8 (188-348)||(45116582-45116742)
chr8 (188-349)||(44321173-44321334)
chr8 (154-328)||(14401359-14401532)
chr8 (183-331)||(17316787-17316935)
chr8 (209-292)||(13781580-13781663)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (6-381)||(43622668-43623043)
chr7 (6-381)||(30787692-30788067)
chr7 (6-381)||(45764532-45764907)
chr7 (6-381)||(617282-617657)
chr7 (6-381)||(18106541-18106916)
chr7 (6-381)||(42500560-42500935)
chr7 (17-382)||(47062047-47062412)
chr7 (126-381)||(15067162-15067417)
chr7 (17-381)||(43827139-43827503)
chr7 (17-273)||(8400750-8401006)
chr7 (6-130)||(15060766-15060890)
chr7 (245-381)||(12116902-12117038)
chr7 (188-348)||(1297321-1297481)
chr7 (163-347)||(16795663-16795847)
chr7 (188-349)||(40445130-40445291)
chr7 (188-348)||(47867065-47867225)
chr7 (188-348)||(16794179-16794339)
chr7 (188-348)||(43378874-43379034)
chr7 (188-348)||(40794258-40794418)
chr7 (188-348)||(45172475-45172635)
chr7 (188-332)||(46791660-46791804)
chr7 (175-348)||(8193845-8194019)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (6-381)||(211974-212349)
chr2 (6-381)||(5348320-5348695)
chr2 (6-381)||(41561165-41561540)
chr2 (6-381)||(10622987-10623362)
chr2 (6-381)||(27274893-27275268)
chr2 (6-381)||(38946916-38947291)
chr2 (6-381)||(39795123-39795498)
chr2 (6-381)||(3802099-3802474)
chr2 (17-381)||(24750822-24751187)
chr2 (17-381)||(1098359-1098723)
chr2 (19-381)||(45476524-45476885)
chr2 (17-381)||(24604622-24604986)
chr2 (17-381)||(12907025-12907389)
chr2 (17-381)||(43948815-43949179)
chr2 (17-381)||(436475-436840)
chr2 (17-381)||(34920315-34920679)
chr2 (17-381)||(41007513-41007877)
chr2 (17-381)||(9655320-9655683)
chr2 (102-381)||(7264229-7264508)
chr2 (17-381)||(11692363-11692712)
chr2 (17-381)||(17996705-17997069)
chr2 (17-267)||(28354549-28354799)
chr2 (210-381)||(24941183-24941354)
chr2 (163-327)||(28423061-28423225)
chr2 (171-348)||(21535507-21535678)
chr2 (210-301)||(3353894-3353985)
chr2 (6-55)||(7264185-7264234)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (6-381)||(3946994-3947369)
chr1 (6-381)||(3984266-3984641)
chr1 (6-381)||(44466735-44467110)
chr1 (6-381)||(20350609-20350984)
chr1 (6-381)||(38774648-38775023)
chr1 (6-381)||(29355221-29355596)
chr1 (6-381)||(5079088-5079463)
chr1 (6-381)||(13630569-13630944)
chr1 (6-381)||(41454990-41455365)
chr1 (17-381)||(37016078-37016442)
chr1 (17-381)||(12649112-12649476)
chr1 (17-381)||(50116296-50116660)
chr1 (17-381)||(38691472-38691836)
chr1 (17-381)||(46974328-46974692)
chr1 (17-381)||(51663422-51663786)
chr1 (17-380)||(13174945-13175308)
chr1 (17-301)||(21942977-21943261)
chr1 (100-381)||(19497997-19498277)
chr1 (24-381)||(32106187-32106533)
chr1 (6-112)||(44619905-44620011)
chr1 (24-178)||(26466006-26466160)
chr1 (188-348)||(36360086-36360246)
chr1 (188-348)||(45472687-45472847)
chr1 (188-348)||(7403953-7404115)
chr1 (188-344)||(28863225-28863381)
chr1 (215-348)||(27283402-27283535)
chr1 (188-348)||(18887360-18887520)
chr1 (17-58)||(7980068-7980109)
chr1 (215-300)||(20240037-20240122)
chr1 (109-206)||(25231558-25231655)
chr1 (190-303)||(31445866-31445979)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (6-381)||(2034-2409)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (6-381)||(1611284-1611659)
chr6 (17-381)||(31147486-31147850)
chr6 (92-381)||(28357557-28357846)
chr6 (17-381)||(29287486-29287845)
chr6 (17-381)||(18607160-18607524)
chr6 (17-381)||(21357883-21358244)
chr6 (17-381)||(23961865-23962226)
chr6 (6-91)||(28251049-28251134)
chr6 (188-348)||(9095463-9095623)
chr6 (17-93)||(24220332-24220408)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (6-381)||(3949896-3950271)
chr3 (6-381)||(6742040-6742415)
chr3 (6-381)||(8159516-8159891)
chr3 (6-381)||(30946175-30946550)
chr3 (6-381)||(13746254-13746629)
chr3 (6-381)||(16445773-16446148)
chr3 (17-381)||(36816049-36816413)
chr3 (17-381)||(14399719-14400085)
chr3 (19-381)||(46991779-46992141)
chr3 (17-381)||(48249399-48249764)
chr3 (17-381)||(7841549-7841912)
chr3 (19-381)||(77553-77915)
chr3 (17-378)||(6504491-6504852)
chr3 (17-381)||(21954772-21955135)
chr3 (17-381)||(7838760-7839124)
chr3 (6-237)||(9428510-9428741)
chr3 (61-381)||(29949193-29949512)
chr3 (61-381)||(29998347-29998666)
chr3 (61-303)||(29908027-29908268)
chr3 (212-373)||(28610460-28610621)
chr3 (195-347)||(9556331-9556483)
chr3 (188-349)||(51548098-51548259)
chr3 (188-348)||(2284623-2284783)
chr3 (188-348)||(4120360-4120520)
chr3 (188-348)||(33940190-33940350)
chr3 (188-348)||(40467774-40467934)
chr3 (188-348)||(12491422-12491582)
chr3 (17-65)||(29930532-29930580)
chr3 (17-65)||(29979686-29979734)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (17-381)||(19072190-19072554)
chr4 (6-365)||(49565013-49565372)
chr4 (6-381)||(9891175-9891550)
chr4 (6-381)||(3404943-3405318)
chr4 (6-381)||(41024352-41024727)
chr4 (17-381)||(4769298-4769662)
chr4 (17-381)||(38463370-38463734)
chr4 (17-381)||(4976919-4977283)
chr4 (17-381)||(44049774-44050138)
chr4 (17-381)||(11502670-11503034)
chr4 (17-381)||(4978491-4978851)
chr4 (17-381)||(21471958-21472322)
chr4 (17-201)||(51643211-51643395)
chr4 (50-381)||(6182875-6183206)
chr4 (17-128)||(18580117-18580225)
chr4 (188-347)||(32716628-32716787)
chr4 (215-348)||(4617919-4618052)
chr4 (188-348)||(1591168-1591328)
chr4 (188-348)||(17916521-17916681)
chr4 (188-348)||(46517000-46517160)
chr4 (223-349)||(17496893-17497019)
chr4 (171-348)||(13897349-13897526)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (6-381)||(37819410-37819785)
chr5 (6-381)||(11031985-11032360)
chr5 (6-381)||(38858723-38859098)
chr5 (6-381)||(28884941-28885316)
chr5 (6-381)||(34078933-34079308)
chr5 (6-375)||(7020419-7020788)
chr5 (6-381)||(27866378-27866753)
chr5 (17-381)||(1036515-1036879)
chr5 (17-381)||(7799539-7799903)
chr5 (17-381)||(18536869-18537233)
chr5 (17-381)||(4202472-4202836)
chr5 (17-381)||(13566640-13566988)
chr5 (17-381)||(25895630-25895998)
chr5 (24-381)||(20287439-20287797)
chr5 (24-255)||(20286180-20286410)
chr5 (188-348)||(11819551-11819711)
chr5 (188-348)||(27013235-27013395)
chr5 (188-348)||(42343826-42343985)
chr5 (188-348)||(6553124-6553284)
chr5 (188-348)||(43295549-43295709)
chr5 (163-268)||(25053043-25053148)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (6-381)||(15890-16265)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (17-381)||(17233-17597)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (17-170)||(12426-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (257-381)||(25479-25603)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (264-360)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (188-348)||(28452-28612)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (215-332)||(4198-4315)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 33962 - 34337
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33962 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 34061  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 34161  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34162 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 34261  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34262 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 34337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32377816 - 32377441
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377816 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 32377717  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377716 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 32377617  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377616 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 32377517  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377516 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 32377441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32431773 - 32431398
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431773 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 32431674  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431673 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 32431574  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431573 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 32431474  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431473 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 32431398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 7341232 - 7341607
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341232 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 7341331  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341332 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 7341431  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341432 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 7341531  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7341532 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggtttt 7341607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8422764 - 8422389
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422764 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 8422665  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422664 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 8422565  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422564 tccattatattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 8422465  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422464 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 8422389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 30304518 - 30304143
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304518 tgaagaaccatagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 30304419  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304418 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 30304319  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304318 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 30304219  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304218 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 30304143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35965642 - 35965278
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965642 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 35965543  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  35965542 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 35965443  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  35965442 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcccttcgaccgat 35965343  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35965342 ttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 35965278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 43370931 - 43371295
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43370931 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 43371030  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43371031 cgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43371130  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  43371131 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgtcaacgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 43371230  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43371231 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 43371295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2145897 - 2145533
Alignment:
Q  21 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-----ggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2145897 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatc 2145798  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |    
T  2145797 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagt 2145698  T
Q  216 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  2145697 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 2145598  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2145597 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttt 2145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43689068 - 43688731
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43689068 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaattt 43688969  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  43688968 cgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgggctcatccaaaatccgttaagtt 43688869  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43688868 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 43688769  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43688768 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatga 43688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 7169064 - 7169419
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| | ||||||    
T  7169064 agaccacattccatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatct 7169154  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7169155 caaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7169254  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  7169255 gtttaacaattttccaacgattttggttatgaactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttagggtcactttgaccgat 7169354  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7169355 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 7169419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 360
Target Start/End: Original strand, 45455542 - 45455883
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45455542 accatattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcg 45455641  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45455642 aagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 45455741  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  45455742 ttaaaatttttccaacggttttggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgggatcacttcgatcgattt 45455841  T
Q  319 gacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45455842 gacatatttggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaaga 45455883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 381
Target Start/End: Original strand, 22581061 - 22581356
Alignment:
Q  86 ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagata 185  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||    
T  22581061 ggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaata 22581160  T
Q  186 ttttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaat 285  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  22581161 tcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgtacaagatgtcaat 22581260  T
Q  286 gtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22581261 gtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgcgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 22581356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 1115925 - 1116108
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115925 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaaacaaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 1116024  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1116025 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatgtttt 1116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39751925 - 39751772
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39751925 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatct 39751826  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39751825 cgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 39751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116742
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 45116681  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45116682 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45116742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321334
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||  | |||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgttattgt 44321272  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44321273 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 44321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14401532 - 14401359
Alignment:
Q  154 aacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcc 253  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||   |||  |||| |||||||| |||||| | |  |||||| | || |||| |    
T  14401532 aacacaatgtgaaagta-tactattcatgatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttttcgatagttttgttcatcgacttc 14401434  T
Q  254 acgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcg 328  Q
    || || || ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||    
T  14401433 acctataaaaccaacacgtataggatgtcattgtttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcg 14401359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 17316787 - 17316935
Alignment:
Q  183 atattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgcc 282  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||  |||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||| | | ||| ||||| |||||| |||| | ||||||    
T  17316787 atattttttgagctcacccacaatcatttaagttgtttaacaattttccgactgttttgatcatgaatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgcc 17316886  T
Q  283 aatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggtt 331  Q
    | |||||||| ||||||   | || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17316887 attgtttgagatagttgaaatcaactcaactgatatgacatattcggtt 17316935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13781663 - 13781580
Alignment:
Q  209 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgag 292  Q
    ||||||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||  ||||||||    
T  13781663 attaaattgctcaacacttttccgaccgttttggtcatggactccacttacaaaaccaacatctatcgaatgccgttgtttgag 13781580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43623043 - 43622668
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623043 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 43622944  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622943 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 43622844  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622843 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 43622744  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622743 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 43622668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 30787692 - 30788067
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787692 tgaagaaccagataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgca 30787791  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787792 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 30787891  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787892 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 30787991  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787992 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 30788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 45764532 - 45764907
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764532 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgcgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 45764631  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764632 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 45764731  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764732 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccagcatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 45764831  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764832 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 45764907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 617657 - 617282
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  617657 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgca 617558  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617557 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 617458  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617457 tccattaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 617358  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617357 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 617282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 18106541 - 18106916
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106541 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 18106640  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106641 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 18106740  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18106741 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgctaatgtttgaggtagttggggtga 18106840  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106841 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 18106916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 42500560 - 42500935
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500560 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 42500659  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500660 atatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 42500759  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500760 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 42500859  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500860 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 42500935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 382
Target Start/End: Original strand, 47062047 - 47062412
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47062047 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatc 47062146  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaat 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  47062147 tcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcgggctcatccaacatccgttaagt 47062245  T
Q  216 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  47062246 tgtttaaaaaatttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaaatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 47062345  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47062346 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttt 47062412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 126 - 381
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067417
Alignment:
Q  126 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  226 ttttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatat 15067361  T
Q  326 tcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067362 ttggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 15067417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43827503 - 43827139
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43827503 agaccacattgcatgacaaatatcaagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta-tct 43827405  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43827404 cgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43827305  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga-attcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||    
T  43827304 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacgtgtacaagatgccaatgtttgaggtagtttgggtcactttcgaccga 43827205  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43827204 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacatatgagaaagataaaaactttgtttgggtttt 43827139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 8400750 - 8401006
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8400750 agaccacattggatgacaaatatcaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatct 8400849  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8400850 cgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctcatccaacatctgttaagtt 8400949  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  8400950 gtttaacaattttctaacggttttggttatggatttcacctacaaaaccaacatgta 8401006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 130
Target Start/End: Original strand, 15060766 - 15060890
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060766 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 15060865  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggag 130  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  15060866 atatctaatctcgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12117038 - 12116902
Alignment:
Q  245 atggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattta 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12117038 atggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcggccgatttgacatattcggttgggtttggatttg 12116939  T
Q  345 tgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12116938 tgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 12116902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297481
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatttt 1297420  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| |  |  |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1297421 ttgaaatagttggagccacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 1297481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16795847 - 16795663
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||||| ||| || ||||  | |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||     
T  16795847 tgaaagtaaaactgttcaagacttattttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaaa 16795748  T
Q  263 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 347  Q
    || ||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||   | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16795747 acaaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttgaactcacttcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 16795663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445130
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 40445192  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40445191 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 40445130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867065
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 47867126  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47867125 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 47867065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794179
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16794240  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16794239 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 16794179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378874
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| | | |||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtataggattctattgt 43378935  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  43378934 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgac 43378874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 40794258 - 40794418
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| ||  |||||   ||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  40794258 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactattttgagaatggattccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 40794357  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    || |  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40794358 tttaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 40794418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172475
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattat 45172536  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||| | || | ||| ||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  45172535 ttgaaatagtttgagtcacttcgacctatttgacatattcagttgattttgcatttatgac 45172475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 332
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791804
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || || ||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatagaatgccattgt 46791759  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttg 332  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||||||||||    
T  46791760 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttg 46791804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8194019 - 8193845
Alignment:
Q  175 tattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtat 274  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||||   | || |||||||| |||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||| |||||| ||||     
T  8194019 tattcaagacatattttggactcatccaacattggtaaagttgtttaataattttccgactgttttgataatgcattccacgtacaaaaccaacttgtac 8193920  T
Q  275 aggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg-atttatgac 348  Q
    | ||||||| |||||||  ||||| | || |  |||||  || |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8193919 atgatgccattgtttgaaatagttagagtcacctcaactaatatgacatattcggtttggttaggcatttatgac 8193845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 212349 - 211974
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212349 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 212250  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212249 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 212150  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212149 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 212050  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212049 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 211974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 5348320 - 5348695
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348320 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 5348419  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348420 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 5348519  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348520 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 5348619  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348620 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 5348695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 41561165 - 41561540
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561165 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 41561264  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561265 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 41561364  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561365 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 41561464  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561465 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 41561540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10623362 - 10622987
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623362 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 10623263  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10623262 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatctaaca 10623163  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623162 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 10623063  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623062 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 10622987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27275268 - 27274893
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275268 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 27275169  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275168 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 27275069  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275068 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 27274969  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27274968 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 27274893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 38946916 - 38947291
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38946916 tgaagaactagagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgca 38947015  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947016 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 38947115  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947116 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataagatgccaatgtttgaggtagttggggtga 38947215  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947216 cttcaactgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 38947291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 39795123 - 39795498
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795123 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 39795222  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795223 atatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 39795322  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795323 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 39795422  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795423 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 39795498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3802474 - 3802099
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802474 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 3802375  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3802374 atttctaatctcgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaact 3802275  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg-tttgaggtagttggggtg 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3802274 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgttttgaggtagtt-gggtg 3802176  T
Q  305 aattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3802175 acttcaaccgacttgacatattcagttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggtttt 3802099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 24750822 - 24751187
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24750822 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24750921  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24750922 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 24751021  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatg-tataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  24751022 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 24751121  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24751122 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 24751187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1098723 - 1098359
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1098723 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1098624  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1098623 cgaagttggaggagcacaactatacttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 1098524  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  1098523 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacatcgaccgat 1098424  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1098423 ttgacataatcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 1098359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Original strand, 45476524 - 45476885
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45476524 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcg 45476622  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  45476623 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgt 45476722  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  45476723 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaacgatct 45476822  T
Q  319 gacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45476823 gacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 45476885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24604986 - 24604622
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604986 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24604887  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  24604886 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 24604787  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  24604786 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 24604687  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24604686 tggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 24604622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12907389 - 12907025
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12907389 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaattt 12907290  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  12907289 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttggactcatccaacatccgttaagtt 12907190  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12907189 gtttaacaattttccaacggatttggttatggacttcacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 12907090  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12907089 ttgacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 12907025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43949179 - 43948815
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  43949179 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatct 43949080  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43949079 cgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43948980  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  43948979 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttctactgat 43948880  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43948879 ttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 43948815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 436475 - 436840
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  436475 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 436574  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  436575 cgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgggctcatctaacatcttttaagtt 436674  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaat-gtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  436675 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatggtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 436774  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  436775 tttgacatattccgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 436840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34920679 - 34920315
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34920679 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaattt 34920580  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  34920579 cgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 34920480  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  34920479 gtttaacaatattccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgat 34920380  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34920379 ttgatatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 34920315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41007877 - 41007513
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007877 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 41007778  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  41007777 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 41007678  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41007677 gtttaacaatttctcaacggttttgattatggactccacctacaaaactaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 41007578  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41007577 ttgatatattcggttgggtttcgatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttaggtttt 41007513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 9655320 - 9655683
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  9655320 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgt 9655419  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9655420 cgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 9655519  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  9655520 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgat 9655619  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9655620 ttgacatattcggttgggtttggatttgtaacacatgagaaa-aggaaaactttgtttgggtttt 9655683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264508
Alignment:
Q  102 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  202 aacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtataggatgccaatgtttgatgtagttggg 7264428  T
Q  302 gtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264429 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 7264508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11692712 - 11692363
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11692712 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatct 11692613  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  11692612 cgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgggcccatccaacatccgttaagtt 11692513  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  11692512 gtttaagaattttccaacggttttggttatggactccacctacaa---------------gatgccaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgat 11692428  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11692427 ttgacatattcagttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 11692363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17997069 - 17996705
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||    
T  17997069 agacaacattgcatgccaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatct 17996970  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||    
T  17996969 caaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatccgttacgtt 17996870  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||    
T  17996869 gtttaacaatattccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgat 17996770  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  17996769 ttgacatatttggttggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtgtggttttt 17996705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28354799 - 28354549
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28354799 agaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 28354700  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  28354699 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 28354600  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28354599 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24941354 - 24941183
Alignment:
Q  210 ttaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24941354 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttc 24941255  T
Q  310 aaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24941254 gatcgattggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 24941183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28423225 - 28423061
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| || || |||||| | ||||  |||||||||||     
T  28423225 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaa 28423126  T
Q  263 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattc 327  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  28423125 accaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaaccgatgtgacatattc 28423061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Original strand, 21535507 - 21535678
Alignment:
Q  171 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 270  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||   |||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||      | || ||||||||    
T  21535507 atactattcaagacatattttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatggact------ataaaaccaacat 21535600  T
Q  271 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||| | ||||||| | |||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  21535601 gtacatgatgccactatttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcggttggttttgcatatatgac 21535678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3353985 - 3353894
Alignment:
Q  210 ttaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3353985 ttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacaggatgttattgtttgagatagttggg 3353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 55
Target Start/End: Original strand, 7264185 - 7264234
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 55  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7264185 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaattgtgaagcaagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3947369 - 3946994
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947369 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 3947270  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947269 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 3947170  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947169 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 3947070  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947069 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 3946994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 3984266 - 3984641
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984266 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 3984365  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984366 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 3984465  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984466 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 3984565  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984566 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 3984641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 44466735 - 44467110
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466735 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 44466834  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466835 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 44466934  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466935 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 44467034  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467035 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 44467110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 20350609 - 20350984
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350609 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 20350708  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350709 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 20350808  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20350809 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtttgggtga 20350908  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350909 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 20350984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38775023 - 38774648
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38775023 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgca 38774924  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774923 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 38774824  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774823 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 38774724  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774723 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 38774648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29355596 - 29355221
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355596 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 29355497  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355496 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 29355397  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355396 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 29355297  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355296 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 29355221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 5079088 - 5079463
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5079088 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgca 5079187  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079188 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 5079287  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079288 tccattaagttgtttaacaattttcaaacggttttggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 5079387  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079388 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 5079463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 13630569 - 13630944
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630569 tgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 13630668  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13630669 atatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaaca 13630768  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630769 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 13630868  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630869 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 13630944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 41454990 - 41455365
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454990 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 41455089  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41455090 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaaca 41455189  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41455190 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaaggatgccaatgtttgaggtagttggggtca 41455289  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41455290 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggtttt 41455365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 37016078 - 37016442
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37016078 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 37016177  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37016178 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 37016277  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  37016278 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgat 37016377  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37016378 ttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 37016442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12649476 - 12649112
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  12649476 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatat 12649377  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12649376 ctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 12649277  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12649276 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 12649177  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12649176 ttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 12649112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50116660 - 50116296
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50116660 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgt 50116561  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  50116560 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccgttaagtt 50116461  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  50116460 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 50116361  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50116360 ttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggtttt 50116296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38691836 - 38691472
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38691836 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38691737  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  38691736 cgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 38691637  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  38691636 gtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 38691537  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38691536 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 38691472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 46974328 - 46974692
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46974328 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 46974427  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46974428 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 46974527  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  46974528 gtttaacaatcttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacaggtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaatcgat 46974627  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46974628 ttgacatattcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggtttt 46974692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 51663422 - 51663786
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  51663422 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatct 51663521  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  51663522 cgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcctttaagtt 51663621  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  51663622 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactctacctacaaaaccaacatgtataaaatgccagtgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 51663721  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51663722 ttgacatatttggttgagtttgaatatgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 51663786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 13174945 - 13175308
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13174945 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaattt 13175044  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  13175045 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgtgctcatccaacatccgctaagtt 13175144  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  13175145 gtttaacaaatttccagcggttttggttatggactccacctacaaaaccatcatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 13175244  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttt 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  13175245 ttgacatattcggttgggtgtggatttgtgacccatgagaaagaggaaaaatttgtttgagttt 13175308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21943261 - 21942977
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  21943261 agaccacattgcatgacaaatgtcaaacaagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatct 21943162  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  21943161 cgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccatcattcgttaagtt 21943062  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21943061 gtttaacaaattttcaacggttttggttatggattccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggg 21942977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 100 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19497997
Alignment:
Q  100 gttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatactttt-gggctcat 19498179  T
Q  200 ccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttg 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 19498079  T
Q  300 gggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19498078 gggtcacttcgaccgatttgacatattcggtaggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 19497997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32106533 - 32106187
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| |  | |||| | | ||||||| |||||    
T  32106533 attgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagtt 32106434  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaac 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32106433 ggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatccaacatccattaagttgtttaac 32106334  T
Q  224 aattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacat 323  Q
    ||           ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  |  || ||||||||||    
T  32106333 aa-----------ttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcaccttgactgatttgacat 32106245  T
Q  324 attcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32106244 attcagttgattttggatttttgacacatgagaaagatgacaactttgtttgggtttt 32106187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 44620011 - 44619905
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620011 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 44619912  T
Q  106 atttcta 112  Q
    || ||||    
T  44619911 atatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26466160 - 26466006
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| | || | |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  26466160 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagtt 26466061  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactatt 178  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26466060 gaaggagcacaactatgtttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactactatt 26466006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360086
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcactgt 36360147  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||| | || |  |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  36360146 ttgaaatagtttgagtcacctcaacctatttgatatattcggttggttttgcatttatgac 36360086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472847
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 45472786  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45472787 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45472847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404115
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgcc--aat 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatatt 7404052  T
Q  286 gtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  7404053 gtttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgac 7404115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 344
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863381
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 28863324  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattta 344  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  28863325 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatttgattggttttgcattta 28863381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 348
Target Start/End: Original strand, 27283402 - 27283535
Alignment:
Q  215 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccg 314  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |  |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |  ||||||| || |  ||||||     
T  27283402 ttgtttaacaattttccgactgttttaatattggattccacgcacaaaaccaacttgtataggatgccattatttaaaatagttggagtcacctcaacct 27283501  T
Q  315 atttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27283502 atttgacatattcggttggttttgcatttatgac 27283535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18887520 - 18887360
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||||||||  || ||| |||||| |||| || |||    
T  18887520 ttttggtctcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgatttttttgataatggattccacgtacagaactaacttgtataagatgtcattgt 18887421  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18887420 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 18887360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7980109 - 7980068
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980109 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 7980068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 300
Target Start/End: Original strand, 20240037 - 20240122
Alignment:
Q  215 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 300  Q
    ||||||||||||||||  || | |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  20240037 ttgtttaacaattttctgactgctttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgtcattgtttgaaatagttgg 20240122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 25231558 - 25231655
Alignment:
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 206  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| | | | |||| ||  |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||    
T  25231558 tctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacat 25231655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Original strand, 31445866 - 31445979
Alignment:
Q  190 ttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgttt 289  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||| |||| |||||| | || ||||||||| | || |||||  ||||| | ||| || |||||    
T  31445866 ttgggctcatccaaaatctataaagttgtttaacactttttcaacagttttgatcatagactccacgcataaaaccaatgtgtattgaatgtcattgttt 31445965  T
Q  290 gaggtagttggggt 303  Q
     |||||||| ||||    
T  31445966 aaggtagttagggt 31445979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 2034 - 2409
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2034 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 2133  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 2233  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2234 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 2333  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 2409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1611659 - 1611284
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611659 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 1611560  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611559 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 1611460  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611459 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 1611360  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611359 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 1611284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 31147486 - 31147850
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31147486 agaccacattgcatgataaatttgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 31147585  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  31147586 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatacaacatccgttaagtt 31147685  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||    
T  31147686 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgtgttcacttcgaccgat 31147785  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31147786 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 31147850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357846
Alignment:
Q  92 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttttt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  192 gggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttga 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtataggatgcaaatgtttga 28357756  T
Q  292 ggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28357757 ggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 28357846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29287845 - 29287486
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| |    
T  29287845 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatat 29287750  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29287749 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaattt 29287650  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  29287649 gtttaa-aattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 29287551  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29287550 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 29287486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 18607160 - 18607524
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  18607160 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaattt 18607259  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  18607260 ttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 18607359  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||    
T  18607360 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaagtagttggggtcacttcgacagat 18607459  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18607460 ttgacatattcgattgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 18607524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21358244 - 21357883
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21358244 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 21358148  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21358147 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 21358048  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  21358047 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgat 21357948  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21357947 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 21357883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23962226 - 23961865
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23962226 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 23962130  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23962129 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 23962030  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  23962029 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgat 23961930  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23961929 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 23961865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 91
Target Start/End: Original strand, 28251049 - 28251134
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgac 91  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251049 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095623
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||| || |||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatagaatgtcattgt 9095562  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9095563 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 9095623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 24220332 - 24220408
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24220332 agaccacattgcatgacaaatatcaagtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 3949896 - 3950271
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949896 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 3949995  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949996 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 3950095  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950096 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 3950195  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3950196 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggtttt 3950271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 6742040 - 6742415
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742040 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 6742139  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742140 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 6742239  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742240 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 6742339  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742340 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 6742415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8159891 - 8159516
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159891 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 8159792  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159791 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 8159692  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159691 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 8159592  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8159591 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacacgagaaagaagaaaactttgtttggatttt 8159516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 30946550 - 30946175
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946550 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 30946451  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946450 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 30946351  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946350 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 30946251  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30946250 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgcgaaagaagaaaactttgtttgggtttt 30946175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13746629 - 13746254
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746629 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 13746530  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746529 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 13746430  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746429 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 13746330  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746329 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 13746254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 16445773 - 16446148
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445773 tgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 16445872  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16445873 atatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaaca 16445972  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445973 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 16446072  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446073 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 16446148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36816413 - 36816049
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816413 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 36816314  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36816313 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 36816214  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  36816213 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 36816114  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36816113 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 36816049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 14399719 - 14400085
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14399719 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 14399818  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14399819 cgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 14399918  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  14399919 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcacttcgaccga 14400018  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga-agaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  14400019 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagagcaaaaactttgtttgtgtttt 14400085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 46992141 - 46991779
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  46992141 accacattgcatgacaaatatgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttt 46992042  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46992041 atgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 46991942  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  46991941 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgattt 46991842  T
Q  319 gacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46991841 gacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 46991779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 48249764 - 48249399
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249764 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 48249665  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48249664 ctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 48249565  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| |    
T  48249564 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcactttgaccaa 48249465  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48249464 tttgacatattcggttgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 48249399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7841912 - 7841549
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7841912 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7841813  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  7841812 cgaagttggaggagcacaacta-acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggttcatccaacatccgttaagtt 7841714  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  7841713 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttagaccgat 7841614  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7841613 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaacgaggaaaactttgtttgggtttt 7841549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 77915 - 77553
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  77915 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcg 77816  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  77815 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgggctcatccaacatttgttaagttgt 77716  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  77715 ttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgattt 77616  T
Q  319 gacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  77615 gacatattcggttgggtttggatttttgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 77553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6504852 - 6504491
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6504852 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacct 6504753  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6504752 cgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 6504653  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  6504652 ttttaacaattttccaaccgttttggttatggactccacctacataaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgat 6504553  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6504552 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgaggaagaggaaaactttgtttgggt 6504491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21955135 - 21954772
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21955135 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatct 21955037  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21955036 cgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgggctcatccaacatccattaagtt 21954937  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21954936 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 21954837  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21954836 ttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 21954772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 7838760 - 7839124
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7838760 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatct 7838859  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  7838860 tgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccgacatctgttaagtt 7838959  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  7838960 gtttaacaattttccaacggttttggtcatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 7839059  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7839060 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagtggaaaactttgtttgggtttt 7839124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9428741 - 9428510
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428741 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 9428642  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428641 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 9428542  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggt 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9428541 tccattaagttgtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 61 - 381
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949512
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29949391  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29949392 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29949491  T
Q  361 agaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  29949492 ggaaaactttgtttgggtttt 29949512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 61 - 381
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998666
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29998545  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29998546 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29998645  T
Q  361 agaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  29998646 ggaaaactttgtttgggtttt 29998666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908268
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29908225  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 303  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29908226 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggt 29908268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28610621 - 28610460
Alignment:
Q  212 aaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaa 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  | | |||      
T  28610621 aaatggtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaagatgtcaatgtttgaggtagttggaatcacttcgg 28610522  T
Q  312 ccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtt 373  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28610521 ccaatttgacatattcggttggatttggatttgtgacatatgagaaagagaaaatctttgtt 28610460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556331
Alignment:
Q  195 ctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggt 294  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||  |    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacaggatgtcattgtttgaaat 9556384  T
Q  295 agttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 347  Q
    |||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9556383 agttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 9556331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548098
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| || ||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 51548160  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51548159 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 51548098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284623
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 2284684  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  2284683 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgac 2284623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120360
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | |    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgacattct 4120421  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4120420 ttgaaatagttggagtcacattaacctatttgacatattcggttggttttgtatttatgac 4120360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 33940190 - 33940350
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || | |||||||| |||  | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  33940190 ttttggactcatccaacatcggtaaagtcgtttaacactttctcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 33940289  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33940290 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 33940350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467774
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| || |||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataaaatgtcattgt 40467835  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  40467834 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgaaatattcggttggttttgcatttatgac 40467774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491582
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||| || |||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 12491521  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  12491522 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatttggttggttttgcatttatgac 12491582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 29930532 - 29930580
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29930532 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29930580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 29979686 - 29979734
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29979686 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29979734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19072554 - 19072190
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072554 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 19072455  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072454 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 19072355  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19072354 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 19072255  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072254 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 19072190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49565372 - 49565013
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565372 tgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 49565273  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565272 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 49565173  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565172 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 49565073  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaa 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565072 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaa 49565013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 9891175 - 9891550
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891175 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 9891274  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9891275 atatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttggactcatccaaca 9891374  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891375 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 9891474  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891475 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 9891550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 3404943 - 3405318
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404943 tgaagaaccaaagaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 3405042  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405043 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 3405142  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405143 tccattaagttgtttaacaattttcaaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 3405242  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405243 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatggcacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 3405318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 41024352 - 41024727
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41024352 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgca 41024451  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024452 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 41024551  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  41024552 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtca 41024651  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024652 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 41024727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 4769298 - 4769662
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4769298 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctgattt 4769397  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4769398 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4769497  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4769498 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 4769597  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4769598 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggtttt 4769662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38463734 - 38463370
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38463734 agaccacactgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 38463635  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  38463634 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 38463535  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
T  38463534 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggagtcacttcgaccgat 38463435  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38463434 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 38463370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 4976919 - 4977283
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4976919 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 4977018  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  4977019 caaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 4977118  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4977119 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 4977218  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4977219 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttggttttt 4977283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 44049774 - 44050138
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44049774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatct 44049873  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44049874 cgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 44049973  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  44049974 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 44050073  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44050074 ttgacatattcggttgggtttaaatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 44050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 11502670 - 11503034
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11502670 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 11502769  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  11502770 cgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcaaacatccgttaagtt 11502869  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  11502870 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 11502969  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11502970 ttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaatactttgtttgggtttt 11503034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4978851 - 4978491
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978851 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaa----ggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4978756  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  4978755 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcttccaacgtctgttaagtt 4978656  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||    
T  4978655 gtttaacaattttcgaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgtcaatgtttgaggtagttagggtcacttcgatcgat 4978556  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4978555 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgatacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 4978491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 21471958 - 21472322
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  21471958 agaccacattggataa-aaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatct 21472056  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21472057 cgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 21472156  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtac-aagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  21472157 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaacaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcga 21472256  T
Q  316 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21472257 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagtttt 21472322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51643395 - 51643211
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51643395 agaccacattgcatgacaaatgtaaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatct 51643296  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  51643295 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 381
Target Start/End: Original strand, 6182875 - 6183206
Alignment:
Q  50 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattact 149  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| |  | |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||| |     
T  6182875 tacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttca 6182974  T
Q  150 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 249  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  6182975 ccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaa 6183074  T
Q  250 ctccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||    
T  6183075 ctccatctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcatctcgaccgatttgacaaatttagttggttttggatttttgaca 6183174  T
Q  350 catgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
      || |||||| || || ||||||||||||||    
T  6183175 gctgggaaagaggataattttgtttgggtttt 6183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18580225 - 18580117
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18580225 agacctcattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatct 18580129  T
Q  117 cgaagttggagg 128  Q
    ||||||| ||||    
T  18580128 cgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716787
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 32716727  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 347  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32716728 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 32716787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 348
Target Start/End: Original strand, 4617919 - 4618052
Alignment:
Q  215 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccg 314  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||| || |  |||||      
T  4617919 ttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggacgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaactt 4618018  T
Q  315 atttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4618019 atttgacatattcggttggttttgcatttatgac 4618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591328
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||| |||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 1591267  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1591268 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttgtgac 1591328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 17916521 - 17916681
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||    
T  17916521 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccattttgtatagaatgccattgt 17916620  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17916621 ttgaaatagttggagtcaccttaacccatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 17916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46517160 - 46517000
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||  |||||| || |||||| | ||| | |||||| |||| | |||| ||||||| ||| || |||    
T  46517160 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacgtttttccgactgttttgataatgaattccacgaacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 46517061  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| |  |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46517060 ttgaaatagttggagacacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 46517000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 349
Target Start/End: Original strand, 17496893 - 17497019
Alignment:
Q  223 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgaca 322  Q
    ||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||| || |||||||  ||||||| || |  |||||| ||| ||||    
T  17496893 caattttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtataagatgtcattgtttgaaatagttggagtcacctcaacctattagaca 17496992  T
Q  323 tattcggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17496993 tattcggttggttttgcatttatgaca 17497019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13897526 - 13897349
Alignment:
Q  171 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 270  Q
    |||||||| || | || ||||||| |||||||  |||  |||| ||||||||||||||  | || |||||| | ||||| ||| |||| || |||||| |    
T  13897526 atactattcaatacatattttggggtcatccagaatcggttaagttgtttaacaatttctcgactgttttgatcatggattcctcgtagaaaaccaactt 13897427  T
Q  271 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||| | |||| || |||||||| ||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  13897426 gtacatgatgtcattgtttgagatagttggagtcacctcacccgatatgacatattcggtgggttttgaatttatgac 13897349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37819785 - 37819410
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819785 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 37819686  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819685 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 37819586  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819585 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 37819486  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819485 cttcaaccgatttgacatattcggttaggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 37819410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11032360 - 11031985
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11032360 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgca 11032261  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032260 atatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 11032161  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032160 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 11032061  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032060 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 11031985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38859098 - 38858723
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859098 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 38858999  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858998 atatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 38858899  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858898 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 38858799  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858798 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 38858723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28885316 - 28884941
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885316 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 28885217  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885216 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 28885117  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885116 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtattggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 28885017  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28885016 cttcaaccgatttgacataatccgttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttggatttt 28884941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Original strand, 34078933 - 34079308
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34078933 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgca 34079032  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34079033 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaaca 34079132  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34079133 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtca 34079232  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34079233 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 34079308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7020788 - 7020419
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020788 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 7020689  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7020688 atttctaatctcgaagttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaaca 7020589  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7020588 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtca 7020489  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttg 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7020488 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttagatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttg 7020419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27866753 - 27866378
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  27866753 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgca 27866654  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27866653 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaaca 27866554  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  27866553 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtca 27866454  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27866453 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 27866378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 1036515 - 1036879
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1036515 agaccacattgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1036614  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1036615 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagtt 1036714  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  1036715 gtttaacaattttccaacggttttggttacggactcaacctacaaaatcaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 1036814  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1036815 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 1036879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7799903 - 7799539
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7799903 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7799804  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7799803 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7799704  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  7799703 gtttaacaattttccaacggttttggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 7799604  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7799603 ttaacatattcggttgggtttggatttgtgagacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 7799539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18537233 - 18536869
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18537233 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 18537134  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18537133 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 18537034  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18537033 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaactaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 18536934  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18536933 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 18536869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4202836 - 4202472
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202836 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4202737  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4202736 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4202637  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  4202636 gtttaacaattttccaacagttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgat 4202537  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4202536 ttgacatattctgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 4202472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13566988 - 13566640
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566988 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13566889  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  13566888 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggatcattcaacatccattaagtt 13566789  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||                ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13566788 gt----------------ggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 13566705  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13566704 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 13566640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25895998 - 25895630
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25895998 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatat 25895899  T
Q  117 cgaa----gttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccatta 212  Q
    | |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25895898 ctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccatta 25895799  T
Q  213 aattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaac 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||    
T  25895798 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgcttgaggtagttggggtcacttcgac 25895699  T
Q  313 cgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25895698 cgatttgacatattcgggtgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttttttgggtttt 25895630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 381
Target Start/End: Original strand, 20287439 - 20287797
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||    
T  20287439 attgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggtgacaagacggggttccagtttctaatctcaaagtt 20287538  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgttt-aa 222  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |   | |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||    
T  20287539 ggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaa 20287638  T
Q  223 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgaca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  20287639 caattttccaacggttctggttatggactccacctaccaaaccaacatgtacaagatgcctatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgatttgaca 20287738  T
Q  323 tattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20287739 tattcggttggctttgaatttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 20287797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 20286180 - 20286410
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    | |||| ||||||||||| |||||    
T  20286180 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagtt 20286279  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaac 223  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | ||| |||      
T  20286280 ggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgcttagttg-ttatg 20286378  T
Q  224 aattttccaacggttttggttatggactccac 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286379 aattttccaacagttttggttatggactccac 20286410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819711
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgctattgt 11819650  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11819651 ttgaaatagttggagtcaccttaacttatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 11819711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013235
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 27013296  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  27013295 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 27013235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 42343826 - 42343985
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  42343826 ttttggactcatccaacatc-agtatattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 42343924  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42343925 ttgaaatagttggagtaacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgac 42343985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 6553124 - 6553284
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||    
T  6553124 ttttggactcatccaacttcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtatagaatgccattgt 6553223  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  |||| || || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6553224 ttgaaatagtgggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 6553284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295709
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | |    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattat 43295648  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  43295649 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggtttgttctgcatttatgac 43295709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Original strand, 25053043 - 25053148
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |||||||||||     
T  25053043 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaatatcgataaagctgtttaacaattttccggctgttttgataatggattccacgtacaaa 25053142  T
Q  263 accaac 268  Q
    ||||||    
T  25053143 accaac 25053148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16265 - 15890
Alignment:
Q  6 tgaagaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgca 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265 tgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgca 16166  T
Q  106 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16165 atttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaact 16066  T
Q  206 tccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16065 tccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga 15966  T
Q  306 attcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15965 cttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 17233 - 17597
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17233 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatct 17332  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||    
T  17333 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttaggctcatccaacatctgttaagtt 17432  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  17433 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgat 17532  T
Q  317 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17533 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttt 17597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 12426 - 12580
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaa-ggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12426 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatc 12525  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12526 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25603 - 25479
Alignment:
Q  257 tacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgaga 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25603 tacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccaatttgacatattcggttgggtttggatttatgacatatgaga 25504  T
Q  357 aagaagaaaactttgtttgggtttt 381  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  25503 aagaggaaaactttgttttggtttt 25479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 264 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 100 - 4
Alignment:
Q  264 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  100 ccaagatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaaga 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28612 - 28452
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| || || || || |||||| ||||||| ||| || |||    
T  28612 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattctacataaaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 28513  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28512 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 332
Target Start/End: Original strand, 4198 - 4315
Alignment:
Q  215 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccg 314  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||| || || |||||| |||| |  |||||| |||||||  ||||||| || |  |||||      
T  4198 ttgtttaacaattttctgactgttttgataatggattccacatataaaaccaacttgtagaaaatgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaacat 4297  T
Q  315 atttgacatattcggttg 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4298 atttgacatattcggttg 4315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University