View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8019_low_3 (Length: 562)

Name: NF8019_low_3
Description: NF8019
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8019_low_3
NF8019_low_3
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (20-544)||(30185390-30185914)
chr2 (19-550)||(30056297-30056828)
chr2 (19-550)||(30119833-30120364)
chr2 (19-550)||(30134531-30135062)
chr2 (19-550)||(30789101-30789632)
chr2 (25-497)||(30067096-30067568)
chr2 (32-550)||(30250757-30251275)
chr2 (19-540)||(30028444-30028965)
chr2 (19-540)||(30222582-30223103)
chr2 (19-540)||(30112978-30113499)
chr2 (31-540)||(30170042-30170551)
chr2 (19-344)||(30021964-30022289)
chr2 (19-344)||(30038406-30038731)
chr2 (19-344)||(30080370-30080695)
chr2 (19-344)||(30107884-30108209)
chr2 (19-344)||(30232544-30232869)
chr2 (19-497)||(30101486-30101964)
chr2 (19-497)||(30091168-30091646)
chr2 (19-497)||(30127773-30128251)
chr2 (436-550)||(30021827-30021941)
chr2 (436-550)||(30038754-30038868)
chr2 (436-550)||(30080233-30080347)
chr2 (436-550)||(30108232-30108346)
chr2 (436-550)||(30232892-30233006)
chr2 (31-252)||(30278655-30278876)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 544
Target Start/End: Original strand, 30185390 - 30185914
Alignment:
Q  20 acatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattgg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30185390 acattccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattgg 30185489  T
Q  120 ctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30185490 ctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagatctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctc 30185589  T
Q  220 tgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacatc 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30185590 tgccactattgatatgtcttcaaacacacatccagccaaatccaatgttcggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacatc 30185689  T
Q  320 attccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcca 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30185690 attccaaataaactaacgacttttaactctctcatcccagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcca 30185789  T
Q  420 actttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30185790 actttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggcaagatgatctgatggcattttcgaagctcatccatccctggccattgttt 30185889  T
Q  520 tactttagtgtaccttttcacccca 544  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||    
T  30185890 tacttcattgtaccttttcatccca 30185914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30056828 - 30056297
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30056828 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 30056729  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30056728 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagttctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 30056629  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30056628 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatccagccaaattcaatgttcggatttttgtcaagagaaggagagatgatggtagagaaggggcaaacat 30056529  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30056528 cattccatataaactaacgacctttagctctatcatcccagagaagaagtcatcggggacttccaaattatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 30056429  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30056428 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaagtaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgat 30056329  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcaccccacaggtt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30056328 ttactttagtgtaccttttcaccccataggtt 30056297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 550
Target Start/End: Original strand, 30119833 - 30120364
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30119833 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30119932  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30119933 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30120032  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||| |||||||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30120033 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatcctgtaagaaccaatgtttggagttttgtcaagagacatagtgaagttggtggagacggggcaaacat 30120132  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |    
T  30120133 cattccatataaactaatgacctttagctctatcatcccagagaagaagtcatcggggactttcaaataatctcctatattctgaagctgcagtagcttc 30120232  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120233 aactctgggcacttcaacttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 30120332  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcaccccacaggtt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30120333 ttactttagtgtaccttttcaccccataggtt 30120364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 550
Target Start/End: Original strand, 30134531 - 30135062
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30134531 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30134630  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30134631 gttatattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30134730  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||| |||||||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30134731 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatcctgtaagaaccaatgtttggagttttgtcaagagacatagtgaagttggtggagacggggcaaacat 30134830  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |    
T  30134831 cattccatataaactaatgacctttagctctatcatcccagagaagaagtcatcggggactttcaaataatctcctatattctgaagctgcagtagcttc 30134930  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30134931 aactctgggcacttcaacttctcaggaagcttgtaaataaaagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 30135030  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcaccccacaggtt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30135031 ttactttagtgtaccttttcaccccataggtt 30135062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30789632 - 30789101
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30789632 gacatcccattggataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagcttgaaataagattcgcaggaatgaatctcagtctagagcagttg 30789533  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30789532 gttaaattcagcattcgaagattatttagttgccctatttcttttgggagctcattaaaatcagatctttcaaggctaagaatctctaaactcttcagct 30789433  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||||||| |||    
T  30789432 ctgcaactattgatatgtcttccaacacacatccagacaactccaatgatatgatttttgtcaagagacaaagagattttggtggaaaaggggtaagcat 30789333  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||| |||||||||| | ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  30789332 cattccatataaattaacaacctttagctctctcatcccggagaagaagtcatcagggactttcaaataatcacctatattttgaagtagaagtaacttc 30789233  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    | || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  | ||| ||| | |||||||| |    
T  30789232 agctctgggcactccagcttctcaggaagattgtaaatattagaccaaggtagaatgatttgatgacatttttgaatttgatctatcactggccattgtt 30789133  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcaccccacaggtt 550  Q
    |||    |||| |||||||||||||| |||||    
T  30789132 ttatcaaagtgaaccttttcaccccataggtt 30789101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30067568 - 30067096
Alignment:
Q  25 ccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattggctaag 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  30067568 ccacttgataaagcaattccccatgtataactcttccaagcatgttaagctcgaaataaggtttgcaggaatgaatctcagcccagagcaattggctaaa 30067469  T
Q  125 ttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctctgcca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30067468 ttcagcattcgaagattagttagttgtcctatttcttgggggagttctttaatatcagatctttcaaggttgagaatctctaaactcttcagctctgcaa 30067369  T
Q  225 ctattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacatcattcc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  30067368 ctattgatatgtcttctaacacacatccagccagctccagcgtttggatttttgtcaagatacgaagagatggtggtggagaaggagcaaacatcattcc 30067269  T
Q  325 acataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctccaacttt 424  Q
    | |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||| | || || ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |    
T  30067268 atataaactaacgaccgatagctctctcatcccagagaagaagtcatcggagatttttaaatactcacctatattttcaagtataagtagagtcaactct 30067169  T
Q  425 ggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagct 497  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30067168 gggcactccatcttctcaggaagattgtaaatataagaccaatgcagactgatctgatggcatttttggagct 30067096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30251275 - 30250757
Alignment:
Q  32 ataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattggctaagttcagca 131  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  30251275 ataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcgtgttaagcttgaaataagatatgcaggaatgaatcttagtgcagagcaattggctaagttcagca 30251176  T
Q  132 ttcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctctgccactattga 231  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  30251175 ttcgaagattagttagttgccctatttctttaggtagctctttaatatgagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaactctgcaacaattga 30251076  T
Q  232 tatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacatcattccacataaa 331  Q
    |||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30251075 tatgtcttctaatacacatccagaaagaaccaatgtttgaagttttgtcaagagataaagagatggtggtggagaaggggtaagtatcattccatataaa 30250976  T
Q  332 ctaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctccaactttggacaca 431  Q
     ||| ||| |||| |||||||||| | ||||| ||||| |  ||||||| |||| | ||| ||||||| | |||| | |||||||  | || ||| |||     
T  30250975 ttaatgacctttagctctctcatcccggagaagaagtcatcagggactttcaaaaagtcatctatattatgaagtagtagtagctttagctctgggcact 30250876  T
Q  432 ccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgta 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   || | ||||||| | |||||||| |||||||  |||||    
T  30250875 ccagcttttcaggaagcttgtaaatatatgaccaaggaatgattatctgatggcattttcttagttgatccatctctggccattgttttacttcggtgta 30250776  T
Q  532 ccttttcaccccacaggtt 550  Q
     |||||||||||| |||||    
T  30250775 tcttttcaccccataggtt 30250757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30028965 - 30028444
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30028965 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30028866  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30028865 gttaaattcagcattcgaagattggttagttgtcctatttcttctgggagctgtataatgtcagatctttcaaggctgagaatctctaaacttttcagtt 30028766  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  30028765 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatccccccagagtcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggaggtggggaaggggttaacat 30028666  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  |||||||  ||||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30028665 cattccatacaaatctagaacttttacttctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30028566  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||||||||| ||| |||   |||||||| |    
T  30028565 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagctgatctatcgttggccattgtt 30028466  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcac 540  Q
    | ||||  | ||||||||||||    
T  30028465 tgacttcggagtaccttttcac 30028444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30223103 - 30222582
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30223103 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30223004  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30223003 gttaaattcagcattcgaagattggttagttgtcctatttcttctgggagctgtataatgtcagatctttcaaggctgagaatctctaaacttttcagtt 30222904  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  30222903 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatccccccagagtcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggaggtggggaaggggttaacat 30222804  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  |||||||  ||||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30222803 cattccatacaaatctagaacttttacttctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30222704  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||||||||| ||| |||   |||||||| |    
T  30222703 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagctgatctatctttggccattgtt 30222604  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcac 540  Q
    | ||||  | ||||||||||||    
T  30222603 tgacttcggagtaccttttcac 30222582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30113499 - 30112978
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30113499 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30113400  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30113399 gttaaattcagcattcgaagattggttagttgtcctatttcttctgggagctgtataatgtcagatctttcaaggctgagaatctctaaacttttcagtt 30113300  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  30113299 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatccccccagagtcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggaggtggggaaggggttaacat 30113200  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  ||| |||  ||||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30113199 cattccatacaaatctagaactcttacttctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30113100  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgat 518  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||||||||| ||| |||   |||||||| |    
T  30113099 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagctgatctatcattggccattgtt 30113000  T
Q  519 ttactttagtgtaccttttcac 540  Q
    | ||||  | ||||||||||||    
T  30112999 tgacttcggagtaccttttcac 30112978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30170551 - 30170042
Alignment:
Q  31 gataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattggctaagttcagc 130  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||| || | |    
T  30170551 gataaaacaattgcccatgtacaattcttccaagcatgtcaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtccagagcagcttgttaaatttaac 30170452  T
Q  131 attcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctctgccactattg 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  30170451 attcgaagattagctagttgtcctatttcttttgggaggtcggtaatatcagatttttcaaggcttaaaatctctaaacttttcaactctgcaactattg 30170352  T
Q  231 atatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacatcattccacataa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||   | | |||||| ||| ||  |||| |||||| |||| || |  ||| ||| ||| || |||||||||||| | ||    
T  30170351 atatgtcttctaacacacatcctgaaagaaccaatgattgaatgcttgttaagagacgaagggaaggaggtggagtaggagtcaacatcattccatacaa 30170252  T
Q  331 actaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctccaactttggacac 430  Q
    |  ||  || ||||  |||||  ||||||| || || || |  |||| || ||||| |||||||||| ||| |||    ||||| | ||||| |||||||    
T  30170251 atcaagaacctttagttctcttgtctcagaaaaaaactcatcagggattttcaaatgatcacctatagtttgaagaacgagtagtttcaactctggacac 30170152  T
Q  431 accagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgt 530  Q
     ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  || ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  30170151 tccaacttctcaggaagctcttcaatataagaccaagggaaaatgatttgatggcatttttgaagctggtctatctctggccattgttttacttgagtgt 30170052  T
Q  531 accttttcac 540  Q
    | ||||||||    
T  30170051 atcttttcac 30170042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30022289 - 30021964
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30022289 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30022190  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30022189 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30022090  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30022089 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatccagtaagaaccaatgtttggagtttcgtcaagagacatagtgaagttggtggagagggggcaaacat 30021990  T
Q  319 cattccacataaactaacgactttta 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30021989 cattccatataaactaatgaccttta 30021964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 30038406 - 30038731
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30038406 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30038505  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30038506 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30038605  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30038606 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatccagtaagaaccaatgtttggagtttcgtcaagagacatagtgaagttggtggagagggggcaaacat 30038705  T
Q  319 cattccacataaactaacgactttta 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30038706 cattccatataaactaatgaccttta 30038731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30080695 - 30080370
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30080695 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30080596  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30080595 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30080496  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30080495 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatccagtaagaaccaatgtttggagtttcgtcaagagacatagtgaagttggtggagagggggcaaacat 30080396  T
Q  319 cattccacataaactaacgactttta 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30080395 cattccatataaactaatgaccttta 30080370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 30107884 - 30108209
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30107884 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30107983  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30107984 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30108083  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30108084 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatccagtaagaaccaatgtttggagtttcgtcaagagacatagtgaagttggtggagagggggcaaacat 30108183  T
Q  319 cattccacataaactaacgactttta 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30108184 cattccatataaactaatgaccttta 30108209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 30232544 - 30232869
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||    
T  30232544 gacatcccattgaataaagcaattccccatgtacaactcttccaagcacgttaagctggaaataagatttgcaggaatgaatctcaatgcagaacagttg 30232643  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30232644 gttagattcaacattcgaagattatttagttgtcctatttcttttgggagctctttaatatcagatctttcaagcctgagaatctctaaacttttcaact 30232743  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||| ||| |||||||||   || || | |||| |||| |||| ||||||    
T  30232744 ctgcaactattgatatgtcttctaacacacatccagtaagaaccaatgtttggagtttcgtcaagagacatagtgaagttggtggagagggggcaaacat 30232843  T
Q  319 cattccacataaactaacgactttta 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30232844 cattccatataaactaatgaccttta 30232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30101964 - 30101486
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30101964 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30101865  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30101864 gttaaattcagcattcgaagattggttagttgtcctatttcttctgggagctgtataattacagatctttcaaggctaagaatctctaaacttttcagtt 30101765  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  | | | |||||||| |||||    
T  30101764 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatcccgccagaatcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggagctggggaaggggttaacat 30101665  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  ||  ||||  |||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30101664 cattccatacaaatctagaaccgttaaagctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30101565  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagct 497  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  30101564 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagct 30101486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30091646 - 30091168
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30091646 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30091547  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30091546 gttaaattcaacattcgaagattagatagttgtcctatttcttctgggagctgtataattacagatctttcaaggctaagaatctctaaacttttcagtt 30091447  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  | | | |||||||| |||||    
T  30091446 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatcccgccagaatcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggagctggggaaggggttaacat 30091347  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  ||  ||||  |||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30091346 cattccatacaaatctagaaccgttaaagctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30091247  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagct 497  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  30091246 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagct 30091168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30128251 - 30127773
Alignment:
Q  19 gacatcccactcgataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattg 118  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  30128251 gacatcccattggataaagcaatttcccatgtacaactcttctaagcatgttaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcaacctagagcagttg 30128152  T
Q  119 gctaagttcagcattcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagct 218  Q
    | ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30128151 gttaaattcaacattcgaagattagatagttgtcctatttcttctgggagctgtataattacagatctttcaaggctaagaatctctaaacttttcagtt 30128052  T
Q  219 ctgccactattgatatgtcttctaacacacatcctcccaaatccaatgtttggatttttgtcaagagatgaagagatgatggtagagaaggggtaaacat 318  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |  ||||||||| |  |||||||||| |   |||||||  | | | |||||||| |||||    
T  30128051 ccaaaactattgatatgtcttctaactcacatcccgccagaatcaatgtttgaaggtttgtcaagaaagagagagatggagctggggaaggggttaacat 30127952  T
Q  319 cattccacataaactaacgacttttaactctctcatctcagagaataagtcgttggggacttccaaataatcacctatattttcaagttgaagtagctcc 418  Q
    ||||||| | |||   |  ||  ||||  |||||||| ||||||| || || |  | ||||| |||||  || |||||||| | |||| ||||||||  |    
T  30127951 cattccatacaaatctagaaccgttaaagctctcatcccagagaaaaactcatcagagactttcaaattgtcgcctatattatgaagtagaagtagcctc 30127852  T
Q  419 aactttggacacaccagcttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagct 497  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  30127851 aactctgggcactccaacttctcaggaagctcattaatataagaccaaggcaaaatgatttgatggaacttttgaagct 30127773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30021941 - 30021827
Alignment:
Q  436 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30021941 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 30021842  T
Q  536 ttcaccccacaggtt 550  Q
    ||||||||| |||||    
T  30021841 ttcaccccataggtt 30021827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Original strand, 30038754 - 30038868
Alignment:
Q  436 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30038754 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 30038853  T
Q  536 ttcaccccacaggtt 550  Q
    ||||||||| |||||    
T  30038854 ttcaccccataggtt 30038868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30080347 - 30080233
Alignment:
Q  436 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30080347 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 30080248  T
Q  536 ttcaccccacaggtt 550  Q
    ||||||||| |||||    
T  30080247 ttcaccccataggtt 30080233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Original strand, 30108232 - 30108346
Alignment:
Q  436 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30108232 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 30108331  T
Q  536 ttcaccccacaggtt 550  Q
    ||||||||| |||||    
T  30108332 ttcaccccataggtt 30108346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Original strand, 30232892 - 30233006
Alignment:
Q  436 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcatttttgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30232892 cttctcaggaagcttgtaaatataagaccaaggaaggatgatctgatggcattttcgaagctcatccatcccaggccattgatttactttagtgtacctt 30232991  T
Q  536 ttcaccccacaggtt 550  Q
    ||||||||| |||||    
T  30232992 ttcaccccataggtt 30233006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30278876 - 30278655
Alignment:
Q  31 gataaaacaattccccaagtacaactcttccaagcaagttaggcttgaaataagatttgcaggaatgaatctcagtctagagcaattggctaagttcagc 130  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |  |  ||||||    
T  30278876 gataaaacaatttcccatgtacaactcttccaggcacttcaagcttgaaataagatttgcaggaatgaatctgagttgagagcagtttgtcagattcagc 30278777  T
Q  131 attcgaagattagttagttgtcttatttctttagggagctctgtaatatctgatctttcaaggctgagaatctctaaactcttcagctctgccactattg 230  Q
    || ||||||||||  |||||||  |||||||| || || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30278776 atccgaagattagcaagttgtccgatttcttttggaaggtcagtaatatcagatttttcaaggctgagaatctctaaacttttcagctctgcaactattg 30278677  T
Q  231 atatgtcttctaacacacatcc 252  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  30278676 aaatgtcacctaacacacatcc 30278655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University