View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8023_high_13 (Length: 223)

Name: NF8023_high_13
Description: NF8023
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8023_high_13
NF8023_high_13
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-223)||(2154852-2155074)
chr7 (1-223)||(10916510-10916732)
chr7 (7-223)||(11424424-11424640)
chr7 (1-223)||(16503022-16503244)
chr7 (1-223)||(16518058-16518280)
chr7 (1-223)||(5128271-5128493)
chr7 (1-223)||(26435536-26435758)
chr7 (1-223)||(26537512-26537734)
chr7 (1-223)||(5146982-5147204)
chr7 (1-223)||(24592183-24592405)
chr7 (1-223)||(3445585-3445807)
chr7 (1-220)||(16736102-16736321)
chr7 (1-220)||(16751156-16751375)
chr7 (1-220)||(17523814-17524033)
chr7 (1-220)||(17529182-17529401)
chr7 (1-223)||(4144765-4144987)
chr7 (1-223)||(31564032-31564254)
chr7 (11-223)||(31125199-31125411)
chr7 (33-223)||(11441851-11442041)
chr7 (1-223)||(9618930-9619152)
chr7 (1-223)||(45387622-45387844)
chr7 (11-223)||(26669566-26669778)
chr7 (1-223)||(26319511-26319733)
chr7 (1-223)||(26274736-26274958)
chr7 (1-153)||(26513130-26513282)
chr7 (1-188)||(16449640-16449827)
chr7 (1-187)||(16041638-16041824)
chr7 (18-188)||(39210682-39210852)
chr7 (18-188)||(26485008-26485178)
chr7 (18-188)||(26682659-26682829)
chr7 (18-188)||(2775673-2775843)
chr7 (51-188)||(4200861-4200998)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-223)||(23717641-23717863)
chr5 (1-223)||(22998767-22998989)
chr5 (1-223)||(11549641-11549863)
chr5 (1-223)||(23752103-23752325)
chr5 (1-223)||(24687810-24688032)
chr5 (1-223)||(33777774-33777996)
chr5 (1-223)||(15658413-15658635)
chr5 (1-223)||(18500383-18500605)
chr5 (1-223)||(30934920-30935142)
chr5 (1-223)||(24970305-24970527)
chr5 (1-223)||(28649522-28649744)
chr5 (1-223)||(3789828-3790050)
chr5 (1-223)||(6874592-6874814)
chr5 (1-223)||(13324482-13324704)
chr5 (1-223)||(43078539-43078761)
chr5 (1-223)||(24681727-24681949)
chr5 (1-223)||(24724254-24724476)
chr5 (1-223)||(2511338-2511560)
chr5 (1-223)||(15758510-15758732)
chr5 (1-223)||(31826060-31826282)
chr5 (1-223)||(34616805-34617027)
chr5 (11-223)||(8665138-8665350)
chr5 (1-223)||(18375065-18375287)
chr5 (1-223)||(37755267-37755489)
chr5 (1-223)||(37358296-37358518)
chr5 (1-223)||(31431727-31431949)
chr5 (1-223)||(40473202-40473424)
chr5 (1-223)||(12132442-12132664)
chr5 (1-223)||(5638197-5638419)
chr5 (1-223)||(9317738-9317960)
chr5 (1-223)||(28959439-28959661)
chr5 (1-223)||(30152305-30152527)
chr5 (1-223)||(37671136-37671358)
chr5 (1-223)||(37770640-37770862)
chr5 (1-169)||(41675050-41675218)
chr5 (1-220)||(32599125-32599344)
chr5 (1-223)||(33516643-33516865)
chr5 (1-223)||(30029702-30029924)
chr5 (1-223)||(30168756-30168978)
chr5 (1-223)||(26480679-26480900)
chr5 (1-188)||(23892528-23892715)
chr5 (1-188)||(29888735-29888922)
chr5 (75-223)||(29966793-29966941)
chr5 (51-223)||(9548246-9548418)
chr5 (1-188)||(22888792-22888979)
chr5 (1-175)||(25199364-25199538)
chr5 (52-162)||(13184352-13184462)
chr5 (18-188)||(33877569-33877739)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-223)||(14665311-14665533)
chr4 (1-223)||(17014293-17014515)
chr4 (1-220)||(24592070-24592289)
chr4 (1-223)||(36344271-36344493)
chr4 (1-223)||(14763060-14763282)
chr4 (1-223)||(6570146-6570368)
chr4 (1-223)||(18800369-18800591)
chr4 (1-223)||(33673554-33673776)
chr4 (1-223)||(39850931-39851153)
chr4 (1-223)||(30754047-30754269)
chr4 (1-223)||(54833680-54833902)
chr4 (1-220)||(5006169-5006388)
chr4 (1-223)||(21969994-21970216)
chr4 (12-223)||(14098834-14099045)
chr4 (1-223)||(31126274-31126496)
chr4 (1-223)||(40105394-40105616)
chr4 (1-223)||(27163073-27163295)
chr4 (1-182)||(15228204-15228385)
chr4 (1-191)||(15284684-15284874)
chr4 (1-188)||(1900585-1900772)
chr4 (51-165)||(15391144-15391258)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-223)||(8296211-8296433)
chr3 (1-223)||(6192555-6192777)
chr3 (1-223)||(4796450-4796672)
chr3 (1-223)||(15740891-15741113)
chr3 (1-223)||(15892503-15892725)
chr3 (1-223)||(35881005-35881227)
chr3 (4-223)||(8301067-8301286)
chr3 (1-223)||(4721870-4722092)
chr3 (1-223)||(18330908-18331130)
chr3 (1-223)||(28021514-28021736)
chr3 (1-223)||(29148552-29148774)
chr3 (1-223)||(7073451-7073673)
chr3 (1-223)||(22387375-22387597)
chr3 (1-223)||(18276849-18277071)
chr3 (1-223)||(18307451-18307673)
chr3 (1-223)||(48466166-48466388)
chr3 (1-223)||(18292150-18292372)
chr3 (1-223)||(20576644-20576866)
chr3 (1-223)||(21674932-21675154)
chr3 (1-223)||(51782262-51782484)
chr3 (11-223)||(4346494-4346706)
chr3 (11-223)||(18242978-18243190)
chr3 (1-223)||(5609119-5609341)
chr3 (1-223)||(8211977-8212199)
chr3 (1-223)||(11110146-11110368)
chr3 (1-223)||(28115751-28115973)
chr3 (1-223)||(31964270-31964492)
chr3 (1-223)||(36996874-36997096)
chr3 (11-223)||(5467224-5467436)
chr3 (1-223)||(5596154-5596376)
chr3 (1-223)||(10396372-10396594)
chr3 (1-223)||(18051501-18051723)
chr3 (1-223)||(28339541-28339763)
chr3 (1-223)||(29664767-29664989)
chr3 (11-223)||(22870663-22870875)
chr3 (11-223)||(22885722-22885934)
chr3 (1-223)||(4417158-4417380)
chr3 (9-223)||(6542267-6542481)
chr3 (1-223)||(18225430-18225652)
chr3 (14-223)||(17984766-17984975)
chr3 (1-223)||(7996801-7997023)
chr3 (1-223)||(10643309-10643531)
chr3 (1-223)||(5013951-5014173)
chr3 (1-223)||(24328398-24328620)
chr3 (1-223)||(47023692-47023914)
chr3 (51-162)||(17993631-17993742)
chr3 (113-223)||(51797352-51797462)
chr3 (123-223)||(50133990-50134090)
chr3 (1-188)||(18530662-18530849)
chr3 (1-188)||(16626303-16626490)
chr3 (18-188)||(31033931-31034101)
chr3 (18-188)||(32293026-32293196)
chr3 (1-220)||(5652629-5652848)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-223)||(28882488-28882710)
chr2 (1-223)||(27434189-27434411)
chr2 (1-223)||(12655816-12656038)
chr2 (1-223)||(20838192-20838414)
chr2 (1-223)||(23128311-23128533)
chr2 (1-223)||(27777496-27777718)
chr2 (1-223)||(27817254-27817476)
chr2 (1-223)||(37375435-37375657)
chr2 (1-223)||(12587084-12587306)
chr2 (1-223)||(12716347-12716569)
chr2 (1-223)||(27803981-27804203)
chr2 (1-223)||(11634931-11635153)
chr2 (1-223)||(11641120-11641342)
chr2 (1-223)||(13936289-13936511)
chr2 (1-223)||(39890348-39890570)
chr2 (1-223)||(39051567-39051789)
chr2 (1-223)||(260498-260720)
chr2 (11-223)||(21676937-21677149)
chr2 (11-223)||(40233785-40233997)
chr2 (1-223)||(32050072-32050294)
chr2 (1-223)||(37685654-37685876)
chr2 (1-223)||(37700919-37701141)
chr2 (1-223)||(37925767-37925989)
chr2 (1-223)||(16829083-16829305)
chr2 (1-223)||(16892176-16892398)
chr2 (1-223)||(19416244-19416466)
chr2 (1-223)||(34861954-34862176)
chr2 (1-169)||(34286682-34286850)
chr2 (1-169)||(34291742-34291910)
chr2 (1-223)||(31876555-31876777)
chr2 (1-172)||(9349727-9349898)
chr2 (1-188)||(21702909-21703096)
chr2 (51-188)||(34303098-34303235)
chr2 (1-191)||(19456166-19456356)
chr2 (18-188)||(22925790-22925960)
chr2 (1-154)||(27119031-27119184)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-223)||(2136974-2137196)
chr8 (1-223)||(14557902-14558124)
chr8 (1-223)||(27608620-27608842)
chr8 (4-223)||(19688376-19688595)
chr8 (1-223)||(16277832-16278054)
chr8 (1-223)||(19674719-19674941)
chr8 (1-223)||(16283727-16283949)
chr8 (1-223)||(19286740-19286962)
chr8 (1-223)||(29829600-29829822)
chr8 (1-223)||(9354901-9355123)
chr8 (11-223)||(31354802-31355014)
chr8 (12-223)||(3329233-3329444)
chr8 (1-223)||(19208075-19208297)
chr8 (1-223)||(28361670-28361892)
chr8 (1-223)||(31489465-31489687)
chr8 (3-223)||(12092441-12092661)
chr8 (1-223)||(33259001-33259223)
chr8 (72-223)||(189372-189523)
chr8 (1-109)||(18791099-18791207)
chr8 (18-188)||(18710899-18711069)
chr8 (18-162)||(44563438-44563582)
chr8 (1-188)||(19658755-19658942)
chr8 (51-172)||(22080643-22080764)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-223)||(15424016-15424238)
chr6 (1-223)||(26918655-26918877)
chr6 (1-223)||(26989276-26989499)
chr6 (1-223)||(22934579-22934801)
chr6 (1-223)||(23857024-23857246)
chr6 (1-223)||(24304317-24304539)
chr6 (1-223)||(24863992-24864214)
chr6 (1-220)||(27290069-27290288)
chr6 (1-223)||(16750129-16750351)
chr6 (1-223)||(13298650-13298872)
chr6 (1-223)||(29549750-29549972)
chr6 (1-223)||(3696356-3696578)
chr6 (1-223)||(34463045-34463267)
chr6 (1-223)||(27485404-27485626)
chr6 (1-223)||(4545474-4545696)
chr6 (1-223)||(16674414-16674636)
chr6 (1-223)||(27272279-27272501)
chr6 (1-223)||(29501690-29501912)
chr6 (1-223)||(27044663-27044885)
chr6 (1-223)||(4723833-4724055)
chr6 (11-223)||(4758039-4758251)
chr6 (1-173)||(27019461-27019633)
chr6 (1-223)||(4773281-4773503)
chr6 (1-223)||(27008002-27008224)
chr6 (1-223)||(4525561-4525783)
chr6 (1-223)||(28207729-28207951)
chr6 (1-223)||(29573288-29573510)
chr6 (1-223)||(26116109-26116331)
chr6 (1-223)||(27359691-27359913)
chr6 (1-223)||(27450034-27450256)
chr6 (1-223)||(30557715-30557937)
chr6 (1-223)||(16943726-16943948)
chr6 (1-223)||(26777309-26777536)
chr6 (117-223)||(17025552-17025658)
chr6 (1-188)||(22456642-22456820)
chr6 (1-188)||(14142984-14143171)
chr6 (1-188)||(26788254-26788441)
chr6 (1-188)||(27196627-27196814)
chr6 (1-188)||(27252426-27252613)
chr6 (169-223)||(27000348-27000402)
chr6 (18-188)||(13521789-13521959)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-223)||(39825-40047)
scaffold0089 (1-223)||(46741-46963)
scaffold0089 (1-223)||(30041-30263)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (6-223)||(30730-30947)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-223)||(27570-27793)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-223)||(6292-6514)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-223)||(41793064-41793286)
chr1 (1-223)||(51638495-51638717)
chr1 (1-223)||(10962947-10963169)
chr1 (1-223)||(28585258-28585480)
chr1 (1-182)||(16207787-16207968)
chr1 (1-175)||(20461406-20461580)
chr1 (1-188)||(20340091-20340278)
chr1 (18-188)||(28152174-28152344)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-223)||(8822-9044)
scaffold0159 (11-223)||(20293-20505)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-223)||(9844-10066)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-223)||(14686-14908)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-223)||(25957-26179)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-223)||(8227-8449)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-223)||(6995-7217)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (6-223)||(46556-46780)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (117-223)||(1-107)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-188)||(2414-2601)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-172)||(21890-22044)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (10-172)||(383-545)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2155074 - 2154852
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155074 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 2154975  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  2154974 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 2154875  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2154874 atatttacagcggcatgatttgg 2154852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10916510 - 10916732
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916510 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 10916609  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  10916610 gctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 10916709  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10916710 atatttacagcggcatgatttgg 10916732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Original strand, 11424424 - 11424640
Alignment:
Q  7 aaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424424 aaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaa 11424523  T
Q  107 cagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatattt 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||     
T  11424524 cagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattc 11424623  T
Q  207 acagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  11424624 acagcggcatgatttgg 11424640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16503022 - 16503244
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503022 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 16503121  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16503122 gctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 16503221  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16503222 atatttacagcggcatgatttgg 16503244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16518058 - 16518280
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518058 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 16518157  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16518158 gctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 16518257  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16518258 atatttacagcggcatgatttgg 16518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5128493 - 5128271
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128493 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 5128394  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  5128393 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 5128294  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5128293 atattcacagcggcatgatttgg 5128271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26435758 - 26435536
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26435758 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcatgatcatg 26435659  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  26435658 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 26435559  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26435558 atattcacagcggcatgatttgg 26435536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26537512 - 26537734
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26537512 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 26537611  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  26537612 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 26537711  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26537712 atattcacagcggcatgatttgg 26537734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5146982 - 5147204
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5146982 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 5147081  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |    
T  5147082 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatc 5147181  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5147182 atattcacagcggcatgatttgg 5147204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24592183 - 24592405
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24592183 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 24592282  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  24592283 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 24592382  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  24592383 atattcacagcggcgtgatttgg 24592405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3445807 - 3445585
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445807 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 3445708  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  3445707 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatc 3445608  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  3445607 atattcacagcagcatgatttgg 3445585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16736102 - 16736321
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736102 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 16736201  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  16736202 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 16736301  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  16736302 atattcacggcggcatgatt 16736321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16751156 - 16751375
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16751156 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 16751255  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  16751256 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 16751355  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  16751356 atattcacggcggcatgatt 16751375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17524033 - 17523814
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17524033 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 17523934  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  17523933 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 17523834  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  17523833 atattcacggcggcatgatt 17523814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17529182 - 17529401
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17529182 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 17529281  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  17529282 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 17529381  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  17529382 atattcacggcggcatgatt 17529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4144765 - 4144987
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4144765 cagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 4144864  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  4144865 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 4144964  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4144965 atattcacagcggcatgatttgg 4144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31564032 - 31564254
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31564032 cagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 31564131  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  31564132 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 31564231  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31564232 atattcacagcggcatgatttgg 31564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31125411 - 31125199
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31125411 attatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 31125312  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  31125311 gaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 31125212  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  31125211 cggcatgatttgg 31125199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11442041 - 11441851
Alignment:
Q  33 atgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgt 132  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11442041 atgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgt 11441942  T
Q  133 gcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11441941 gcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgg 11441851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9619152 - 9618930
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  9619152 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgctcatg 9619053  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  9619052 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 9618953  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9618952 atattcacagcggcatgatttgg 9618930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45387844 - 45387622
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  45387844 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 45387745  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||  |||||| |    
T  45387744 actgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatc 45387645  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  45387644 atattcacagcggcatgatttgg 45387622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 26669566 - 26669778
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||     
T  26669566 attatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacaga 26669665  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |||||| ||||    
T  26669666 gaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacag 26669765  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  26669766 cggcatgatttgg 26669778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26319511 - 26319733
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  26319511 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcatgatcatg 26319610  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  26319611 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 26319710  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  26319711 atattcacagtggcatgatttgg 26319733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26274736 - 26274958
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  26274736 cagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 26274835  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  26274836 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 26274935  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26274936 atattcacagcggcatgatttgg 26274958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26513282 - 26513130
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26513282 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 26513183  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26513182 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16449640 - 16449827
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   |||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||    
T  16449640 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgatcatg 16449739  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  16449740 gtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctca 16449827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16041824 - 16041638
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||| ||||||| | |||| || |||| |||| |||||| ||    
T  16041824 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtg 16041725  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctc 187  Q
      | ||||| || ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  16041724 attaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctc 16041638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 39210682 - 39210852
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  39210682 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 39210781  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  39210782 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 39210852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26485178 - 26485008
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  26485178 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 26485079  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  26485078 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 26485008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 26682659 - 26682829
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  26682659 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 26682758  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  26682759 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 26682829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2775843 - 2775673
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    |||||||||||||||||   |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  2775843 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 2775744  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  2775743 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 2775673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4200998 - 4200861
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||    
T  4200998 tagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggag 4200899  T
Q  151 ttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  4200898 ttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 4200861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23717641 - 23717863
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717641 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 23717740  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23717741 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 23717840  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23717841 atatttacagcggcatgatttgg 23717863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22998767 - 22998989
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998767 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 22998866  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  22998867 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 22998966  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22998967 atatttacagcggcatggtttgg 22998989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549641
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttgg 11549641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23752103 - 23752325
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752103 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 23752202  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23752203 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 23752302  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23752303 atattcacagcggcatgatttgg 23752325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24687810 - 24688032
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24687810 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcatgatcatg 24687909  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24687910 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24688009  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24688010 atatttacagcggcatgatttgg 24688032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33777996 - 33777774
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777996 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 33777897  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  33777896 gctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 33777797  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33777796 atattcacagtggcatgatttgg 33777774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15658413 - 15658635
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15658413 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 15658512  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    
T  15658513 gctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatc 15658612  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  15658613 atattcacagcggcatgatttgg 15658635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18500383 - 18500605
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18500383 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18500482  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  18500483 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 18500582  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18500583 atattcacagcggcatgatttgg 18500605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30935142 - 30934920
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935142 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 30935043  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  30935042 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 30934943  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30934942 atatatacagcggcatgatttgg 30934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24970527 - 24970305
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970527 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 24970428  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |    
T  24970427 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatc 24970328  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  24970327 atatttacagcagcatgatttgg 24970305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28649744 - 28649522
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28649744 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 28649645  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  28649644 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 28649545  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28649544 atattcacagcggcatgatttgg 28649522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3790050 - 3789828
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3790050 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 3789951  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  3789950 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 3789851  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  3789850 atattcacagcggcatgatttgg 3789828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6874814 - 6874592
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6874814 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 6874715  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  6874714 gttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 6874615  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6874614 atattcacagcggcatgatttgg 6874592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13324482 - 13324704
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13324482 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 13324581  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  13324582 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 13324681  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  13324682 atattcacagcggcatgatttgg 13324704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43078761 - 43078539
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43078761 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 43078662  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  43078661 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 43078562  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  43078561 atattcacagcggcatgatttgg 43078539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24681949 - 24681727
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24681949 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 24681850  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24681849 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24681750  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  24681749 atattcacagcggcatgatttgg 24681727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24724476 - 24724254
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24724476 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 24724377  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24724376 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24724277  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  24724276 atattcacagcggcatgatttgg 24724254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2511560 - 2511338
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2511560 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 2511461  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  2511460 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 2511361  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  2511360 atattcacagcggcatgatttgg 2511338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15758510 - 15758732
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15758510 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 15758609  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  15758610 gctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 15758709  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  15758710 atattcacagcggcatgatttgg 15758732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31826060 - 31826282
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31826060 cagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 31826159  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  31826160 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatc 31826259  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31826260 atattcacagcggcatgatttgg 31826282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34617027 - 34616805
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34617027 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 34616928  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |    
T  34616927 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatc 34616828  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  34616827 atattcacagcggcatgatttgg 34616805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 8665138 - 8665350
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8665138 attatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagg 8665237  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  8665238 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacag 8665337  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  8665338 cggcatgatttgg 8665350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18375065 - 18375287
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18375065 cagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 18375164  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |    
T  18375165 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatc 18375264  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18375265 atattcacagcggcatgatttgg 18375287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37755489 - 37755267
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37755489 cagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcatgatcatg 37755390  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  37755389 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 37755290  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37755289 atattcacagcggcatgatttgg 37755267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37358296 - 37358518
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37358296 cagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 37358395  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  37358396 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 37358495  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37358496 atattcacagcggcatgatttgg 37358518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31431949 - 31431727
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31431949 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 31431850  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  31431849 gctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 31431750  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31431749 atattcacagcggcatgatttgg 31431727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40473202 - 40473424
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  40473202 cagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatggtcatg 40473301  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  40473302 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 40473401  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  40473402 atattcacagcggcatgatttgg 40473424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12132664 - 12132442
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  12132664 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatgatcatg 12132565  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  12132564 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 12132465  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  12132464 atattcacagcggcatgatttgg 12132442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5638419 - 5638197
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5638419 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 5638320  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  5638319 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 5638220  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  5638219 atattcacaacggcatgatttgg 5638197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9317960 - 9317738
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  9317960 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 9317861  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  9317860 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 9317761  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9317760 atattcacagcggcatgatttgg 9317738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28959439 - 28959661
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28959439 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 28959538  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||   |||||||  |||||| |    
T  28959539 gctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatc 28959638  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28959639 atatttacagcggcatgatttgg 28959661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30152527 - 30152305
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  30152527 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 30152428  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  30152427 attgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 30152328  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  30152327 atattcacagcggcatgatttgg 30152305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37671136 - 37671358
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37671136 cagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 37671235  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   | || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  37671236 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 37671335  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37671336 atattcacagcggcatgatttgg 37671358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37770640 - 37770862
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37770640 cagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 37770739  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| |    
T  37770740 gctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatc 37770839  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37770840 atattcacagcggcatgatttgg 37770862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41675218 - 41675050
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41675218 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 41675119  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatc 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  41675118 gctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatc 41675050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 32599125 - 32599344
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32599125 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 32599224  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |    
T  32599225 gctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatc 32599324  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  32599325 atattcacagcggcatgatt 32599344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33516865 - 33516643
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  33516865 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 33516766  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  33516765 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 33516666  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  33516665 atattcacagcggcatgatttgg 33516643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30029924 - 30029702
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  30029924 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 30029825  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  30029824 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 30029725  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  30029724 atattcacagcggcatgatttgg 30029702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30168978 - 30168756
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30168978 cagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcatgatcatg 30168879  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |    
T  30168878 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatc 30168779  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  30168778 atattcacagcggcatgatttgg 30168756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26480900 - 26480679
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  26480900 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcatgatcatg 26480801  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  26480800 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccaga-gagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 26480702  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26480701 atattcacagcggcatgatttgg 26480679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23892715 - 23892528
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23892715 cagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcatgatcatg 23892616  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23892615 gttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 23892528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 29888735 - 29888922
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||| |    
T  29888735 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcacg 29888834  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29888835 gttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 29888922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 29966793 - 29966941
Alignment:
Q  75 catcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtc 174  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29966793 catcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtc 29966892  T
Q  175 taggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    | |||||| | |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29966893 tcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgg 29966941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 223
Target Start/End: Original strand, 9548246 - 9548418
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||| || ||||  |||||| |||||||   ||||| || |||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  9548246 tagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggag 9548345  T
Q  151 ttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9548346 ttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgg 9548418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22888979 - 22888792
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| || ||||  | |||||||||||    
T  22888979 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgatcatg 22888880  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||  || | || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22888879 gtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctca 22888792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25199538 - 25199364
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||| |||||||||  | |||| || ||||  |||||||||||||    
T  25199538 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgatcatg 25199439  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtct 175  Q
    |   ||||   | |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25199438 gtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtct 25199364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 13184352 - 13184462
Alignment:
Q  52 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagt 151  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13184352 agcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagt 13184451  T
Q  152 tgcgacgttac 162  Q
    ||| |||||||    
T  13184452 tgcaacgttac 13184462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33877739 - 33877569
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||    
T  33877739 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggctt 33877640  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||  |||||||  |||||| |||||    
T  33877639 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctca 33877569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14665533 - 14665311
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665533 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 14665434  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  14665433 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 14665334  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14665333 atatttacagcggcatgatttgg 14665311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17014515 - 17014293
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014515 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 17014416  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  17014415 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 17014316  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17014315 atatttacagcggcatgatttgg 17014293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24592070 - 24592289
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592070 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 24592169  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24592170 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24592269  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24592270 atatttacagcggcatgatt 24592289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36344271 - 36344493
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36344271 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 36344370  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  36344371 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 36344470  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  36344471 atattcacagcggcatgatttgg 36344493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14763060 - 14763282
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14763060 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 14763159  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  14763160 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 14763259  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  14763260 atattcacagcggcatgatttgg 14763282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6570368 - 6570146
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6570368 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcataatcatg 6570269  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  6570268 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 6570169  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6570168 atattcacagcggcatgatttgg 6570146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18800369 - 18800591
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18800369 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18800468  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  18800469 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 18800568  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18800569 atattcacagcggcatgatttgg 18800591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33673554 - 33673776
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33673554 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 33673653  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |    
T  33673654 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatc 33673753  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  33673754 atattcacagcggcatgatttgg 33673776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39851153 - 39850931
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39851153 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 39851054  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  39851053 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 39850954  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  39850953 atattcacagcggcatgatttgg 39850931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30754269 - 30754047
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30754269 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 30754170  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  30754169 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 30754070  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  30754069 atattcacagcggcatgatttgg 30754047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54833902 - 54833680
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54833902 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatg 54833803  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  54833802 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 54833703  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  54833702 atattcacagcggcatgatttgg 54833680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5006388 - 5006169
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  5006388 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 5006289  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  5006288 gctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 5006189  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5006188 atattcacagcggcatgatt 5006169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21970216 - 21969994
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  21970216 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 21970117  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||   ||| | |    
T  21970116 attaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatc 21970017  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21970016 atattcacagcggcatgatttgg 21969994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14099045 - 14098834
Alignment:
Q  12 ttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaggg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  14099045 ttatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagag 14098946  T
Q  112 aagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagc 211  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |||||| |||||    
T  14098945 aagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagc 14098846  T
Q  212 ggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||    
T  14098845 ggcatgatttgg 14098834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31126274 - 31126496
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  31126274 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 31126373  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  31126374 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 31126473  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31126474 atattcacagcggcatgatttgg 31126496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40105394 - 40105616
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  40105394 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 40105493  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  40105494 attaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 40105593  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  40105594 atattcacagcggcatgatttgg 40105616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27163073 - 27163295
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  27163073 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 27163172  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27163173 attgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27163272  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27163273 atattcacagcggcatgatttgg 27163295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15228385 - 15228204
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||| ||||||||||| | |||| || | || ||||||||||||||    
T  15228385 cagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatg 15228286  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagct 182  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15228285 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagct 15228204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15284684 - 15284874
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | ||||    ||||  |||||||||||||    
T  15284684 cagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgatcatg 15284783  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacat 191  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  15284784 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacat 15284874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1900772 - 1900585
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || | |||||||   ||||||||||||| |||| | |  ||| || ||||  ||||||| |||||    
T  1900772 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggtcatg 1900673  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||| |||||| |||||    
T  1900672 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctca 1900585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 165
Target Start/End: Original strand, 15391144 - 15391258
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||| || |||| |||||||||| ||||   |||| ||| |||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  15391144 tagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgattatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggag 15391243  T
Q  151 ttgcgacgttacgga 165  Q
    |||| || |||||||    
T  15391244 ttgcaacattacgga 15391258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8296433 - 8296211
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296433 cagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 8296334  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8296333 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 8296234  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8296233 atatttacagcggcatgatttgg 8296211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6192777 - 6192555
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192777 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 6192678  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  6192677 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 6192578  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6192577 atatttacagcggcatgatttgg 6192555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4796450 - 4796672
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796450 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 4796549  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  4796550 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 4796649  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4796650 atattcacagcggcatgatttgg 4796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15740891 - 15741113
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740891 cagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 15740990  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  15740991 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 15741090  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15741091 atatttacagcggcatgatttgg 15741113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15892503 - 15892725
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892503 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 15892602  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  15892603 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 15892702  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15892703 atatttacagcggcatgatttgg 15892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35881227 - 35881005
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881227 cagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 35881128  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  35881127 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatc 35881028  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  35881027 atattcacagcggcatgatttgg 35881005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 8301067 - 8301286
Alignment:
Q  4 tcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301067 tcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggct 8301166  T
Q  104 gaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccata 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  8301167 gaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcata 8301266  T
Q  204 tttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8301267 tttacagcggcatgatttgg 8301286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4722092 - 4721870
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4722092 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 4721993  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  4721992 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 4721893  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  4721892 atattcacaacggcatgatttgg 4721870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18331130 - 18330908
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18331130 cagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 18331031  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  18331030 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 18330931  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18330930 atattcacagcggcatgatttgg 18330908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28021736 - 28021514
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28021736 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 28021637  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28021636 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 28021537  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28021536 atattcacagcggcatgatttgg 28021514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29148552 - 29148774
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29148552 cagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 29148651  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  29148652 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 29148751  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29148752 atatttacagcggcatgatttgg 29148774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7073673 - 7073451
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7073673 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcatgatcatg 7073574  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  7073573 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 7073474  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  7073473 atgttcacagcggcatgatttgg 7073451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22387375 - 22387597
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22387375 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 22387474  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  22387475 gctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 22387574  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22387575 atattcacagcggcatgatttgg 22387597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18276849 - 18277071
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18276849 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18276948  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  18276949 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 18277048  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18277049 atattcacagcggcatgatttgg 18277071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18307451 - 18307673
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18307451 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18307550  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  18307551 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 18307650  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18307651 atattcacagcggcatgatttgg 18307673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48466388 - 48466166
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48466388 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 48466289  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  48466288 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 48466189  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  48466188 atattcacagcggcatgatttgg 48466166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18292150 - 18292372
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18292150 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18292249  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  18292250 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 18292349  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18292350 atattcacagcggcatgatttgg 18292372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20576644 - 20576866
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20576644 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 20576743  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  20576744 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 20576843  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  20576844 atattcacagcggcatgatttgg 20576866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21675154 - 21674932
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21675154 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 21675055  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  21675054 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 21674955  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21674954 atattcacagcggcatgatttgg 21674932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51782484 - 51782262
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51782484 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 51782385  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  51782384 gttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 51782285  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  51782284 atattcacagcggcatgatttgg 51782262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 4346494 - 4346706
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4346494 attatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 4346593  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  4346594 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 4346693  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  4346694 cggcatgatttgg 4346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18243190 - 18242978
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18243190 attatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 18243091  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  18243090 gaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 18242991  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  18242990 cggcatgatttgg 18242978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5609119 - 5609341
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5609119 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 5609218  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  5609219 gttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 5609318  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5609319 atattcacagcggcatgatttgg 5609341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8212199 - 8211977
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8212199 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 8212100  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  8212099 gctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 8212000  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8211999 atattcacagcggcatgatttgg 8211977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11110146 - 11110368
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11110146 cagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11110245  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||| | |    
T  11110246 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatc 11110345  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  11110346 atattcacagcggcatgatttgg 11110368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28115751 - 28115973
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  28115751 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 28115850  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |    
T  28115851 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatc 28115950  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28115951 atattcacagcggcatgatttgg 28115973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31964270 - 31964492
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31964270 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 31964369  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  31964370 gctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 31964469  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31964470 atattcacagcggcatgatttgg 31964492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36996874 - 36997096
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36996874 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 36996973  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  36996974 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatc 36997073  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  36997074 atattcacagcggcatgatttgg 36997096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5467436 - 5467224
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  5467436 attatcattcatcaaactttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 5467337  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  5467336 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 5467237  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  5467236 cggcatgatttgg 5467224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5596154 - 5596376
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5596154 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 5596253  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  5596254 gctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 5596353  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5596354 atattcacagcggcatgatttgg 5596376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10396594 - 10396372
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10396594 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 10396495  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  10396494 gctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 10396395  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  10396394 atattcacagcggcatgatttgg 10396372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18051723 - 18051501
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18051723 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacatgatcatg 18051624  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |    
T  18051623 gctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatc 18051524  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  18051523 atgttcacagcggcatgatttgg 18051501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28339763 - 28339541
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28339763 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 28339664  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  28339663 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 28339564  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28339563 atattcacagcggcatgatttgg 28339541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29664767 - 29664989
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29664767 cagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 29664866  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  29664867 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 29664966  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  29664967 atattcacagcggcgtgatttgg 29664989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 22870663 - 22870875
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22870663 attatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 22870762  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  22870763 gaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacag 22870862  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  22870863 cggcatgatttgg 22870875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 22885722 - 22885934
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22885722 attatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 22885821  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  22885822 gaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacag 22885921  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  22885922 cggcatgatttgg 22885934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4417380 - 4417158
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  4417380 cagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggcatgatcatg 4417281  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  4417280 gctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 4417181  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4417180 atattcacagcggcatgatttgg 4417158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 6542267 - 6542481
Alignment:
Q  9 aaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaaca 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6542267 aaattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaaca 6542366  T
Q  109 gggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttac 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| ||    
T  6542367 gagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcac 6542466  T
Q  209 agcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||    
T  6542467 agcggcatgatttgg 6542481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18225652 - 18225430
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18225652 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 18225553  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||| |    
T  18225552 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatc 18225453  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  18225452 atattcacagtggcatgatttgg 18225430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 17984766 - 17984975
Alignment:
Q  14 atcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaa 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17984766 atcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaa 17984865  T
Q  114 gctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcgg 213  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||| |||||||    
T  17984866 gctttacacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcgg 17984965  T
Q  214 catgatttgg 223  Q
    ||||||||||    
T  17984966 catgatttgg 17984975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7997023 - 7996801
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  7997023 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 7996924  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||  |||||| |    
T  7996923 actgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatc 7996824  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  7996823 atattcacagcggcatgatttgg 7996801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10643531 - 10643309
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  10643531 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 10643432  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||  |||||| |    
T  10643431 actgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatc 10643332  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  10643331 atattcacagcggcatgatttgg 10643309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5014173 - 5013951
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  5014173 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 5014074  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  5014073 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 5013974  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5013973 atattcacagcggcatgatttgg 5013951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24328620 - 24328398
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24328620 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 24328521  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  24328520 attaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 24328421  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  24328420 atattcacagcggcatgatttgg 24328398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47023914 - 47023692
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  47023914 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 47023815  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  47023814 attaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 47023715  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  47023714 atattcacagtggcatgatttgg 47023692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 162
Target Start/End: Original strand, 17993631 - 17993742
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17993631 tagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggag 17993730  T
Q  151 ttgcgacgttac 162  Q
    |||| |||||||    
T  17993731 ttgcaacgttac 17993742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51797462 - 51797352
Alignment:
Q  113 agctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  51797462 agctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcg 51797363  T
Q  213 gcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||    
T  51797362 gcatgatttgg 51797352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134090
Alignment:
Q  123 agcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  50134090 g 50134090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18530849 - 18530662
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| || | || ||||||||||||||    
T  18530849 cagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatg 18530750  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||   | |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  18530749 gtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctca 18530662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16626303 - 16626490
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |  ||||  |||||||||||||    
T  16626303 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgatcatg 16626402  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  16626403 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 16626490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 31033931 - 31034101
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  31033931 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 31034030  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  31034031 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 31034101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32293196 - 32293026
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  32293196 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 32293097  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  32293096 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 32293026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5652848 - 5652629
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| | |||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   ||||||||| |||||||| | | |||| || ||||  |||||||||||||    
T  5652848 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 5652749  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||||| |||||||| | || | |    
T  5652748 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctcaatc 5652649  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  5652648 atgttcacagcagcatgatt 5652629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28882710 - 28882488
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882710 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 28882611  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28882610 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 28882511  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28882510 atatttacagcggcatgatttgg 28882488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27434189 - 27434411
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434189 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 27434288  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27434289 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 27434388  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27434389 atatttacagcggcatgatttgg 27434411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12656038 - 12655816
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12656038 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcatgatcatg 12655939  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  12655938 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 12655839  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  12655838 atatttacggcggcatgatttgg 12655816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20838414 - 20838192
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838414 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 20838315  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  20838314 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 20838215  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  20838214 aaatttacagcggcatgatttgg 20838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23128311 - 23128533
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128311 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 23128410  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23128411 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 23128510  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23128511 atatttacagcggcatgatttgg 23128533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27777718 - 27777496
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27777718 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27777619  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27777618 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27777519  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27777518 atattcacagcggcatgatttgg 27777496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27817476 - 27817254
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27817476 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27817377  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27817376 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27817277  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27817276 atattcacagcggcatgatttgg 27817254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37375657 - 37375435
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37375657 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgttcatg 37375558  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |    
T  37375557 gctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatc 37375458  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37375457 atattcacagcggcatgatttgg 37375435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12587306 - 12587084
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12587306 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 12587207  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  12587206 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 12587107  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  12587106 atattcacagcggcatgatttgg 12587084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12716347 - 12716569
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12716347 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatg 12716446  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  12716447 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 12716546  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  12716547 atattcacagcggcatgatttgg 12716569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27804203 - 27803981
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27804203 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27804104  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27804103 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27804004  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27804003 atattcacagcggcatgatttgg 27803981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11634931 - 11635153
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  11634931 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 11635030  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |    
T  11635031 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatc 11635130  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  11635131 atattcacagcggcatgatttgg 11635153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11641120 - 11641342
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  11641120 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatg 11641219  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |    
T  11641220 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatc 11641319  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  11641320 atattcacagcggcatgatttgg 11641342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13936289 - 13936511
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13936289 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcatgatcatg 13936388  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  13936389 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 13936488  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  13936489 atattcacagcggcatgatttgg 13936511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39890570 - 39890348
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39890570 cagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 39890471  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  39890470 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 39890371  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  39890370 atattcacagcggcatgatttgg 39890348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39051567 - 39051789
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39051567 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 39051666  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  39051667 gctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 39051766  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  39051767 atattcacagcggcatgatttgg 39051789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 260498 - 260720
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  260498 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcgtg 260597  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||  |||||| |    
T  260598 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatc 260697  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  260698 atattcacagcggcatgatttgg 260720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 21676937 - 21677149
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  21676937 attatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 21677036  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  21677037 gaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacag 21677136  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  21677137 cggcatgatttgg 21677149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40233997 - 40233785
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  40233997 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacaga 40233898  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| || ||||    
T  40233897 gaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacag 40233798  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  40233797 cggcatgatttgg 40233785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32050294 - 32050072
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  32050294 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 32050195  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||| | |    
T  32050194 attaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatc 32050095  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  32050094 atattcacagcggcatgatttgg 32050072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37685654 - 37685876
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  37685654 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 37685753  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  37685754 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 37685853  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37685854 atattcacagcggcatgatttgg 37685876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37700919 - 37701141
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  37700919 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 37701018  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  37701019 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 37701118  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37701119 atattcacagcggcatgatttgg 37701141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37925989 - 37925767
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  37925989 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 37925890  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  37925889 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 37925790  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  37925789 atattcacagcggcatgatttgg 37925767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16829083 - 16829305
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  16829083 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 16829182  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  16829183 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 16829282  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16829283 atattcacagcggcatgatttgg 16829305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16892398 - 16892176
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  16892398 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 16892299  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  16892298 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 16892199  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16892198 atattcacagcggcatgatttgg 16892176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19416244 - 19416466
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  19416244 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 19416343  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  19416344 attaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 19416443  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19416444 atattcacagcggcatgatttgg 19416466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34862176 - 34861954
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  34862176 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 34862077  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  34862076 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 34861977  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  34861976 atattcacagcggcatgatttgg 34861954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34286850 - 34286682
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34286850 cagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 34286751  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatc 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34286750 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatc 34286682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34291910 - 34291742
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34291910 cagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 34291811  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatc 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34291810 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatc 34291742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31876777 - 31876555
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  31876777 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 31876678  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  31876677 attgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 31876578  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31876577 atattcacagcggcatgatttgg 31876555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 9349727 - 9349898
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9349727 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 9349826  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaag 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||    
T  9349827 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaag 9349898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 21702909 - 21703096
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||| |||||| ||    
T  21702909 cagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtg 21703008  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    | | ||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  21703009 gttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctca 21703096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Original strand, 34303098 - 34303235
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  | |||| ||||||||||||| |   |||| ||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34303098 tagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatcattgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggag 34303197  T
Q  151 ttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34303198 ttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 34303235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19456166 - 19456356
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || ||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||  | |||| |  ||||  |||||||||||||    
T  19456166 cagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgatcatg 19456265  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacat 191  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  19456266 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacat 19456356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 22925790 - 22925960
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    |||||||||||| |||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  22925790 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 22925889  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  22925890 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 22925960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27119184 - 27119031
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| | |||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   ||||||||| |||||||| | | |||| || ||||  |||||||||||||    
T  27119184 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 27119085  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgc 154  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  27119084 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgc 27119031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2136974 - 2137196
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2136974 cagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 2137073  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |    
T  2137074 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatc 2137173  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2137174 atatttacagcggcatgatttgg 2137196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14558124 - 14557902
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558124 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 14558025  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  14558024 actgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 14557925  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14557924 acatttacagcggcatgatttgg 14557902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27608620 - 27608842
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608620 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 27608719  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27608720 gctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 27608819  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27608820 atattcacagcggcatgatttgg 27608842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19688595 - 19688376
Alignment:
Q  4 tcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688595 tcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggct 19688496  T
Q  104 gaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccata 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||    
T  19688495 gaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcata 19688396  T
Q  204 tttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19688395 tttacagcggcatgatttgg 19688376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16278054 - 16277832
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278054 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 16277955  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16277954 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 16277855  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  16277854 atatttacggcggcatgatttgg 16277832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19674941 - 19674719
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19674941 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 19674842  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  19674841 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 19674742  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19674741 atattcacagcggcatgatttgg 19674719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16283949 - 16283727
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16283949 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtatgatcatg 16283850  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  16283849 gctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatc 16283750  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  16283749 atgttcacagcggcatgatttgg 16283727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19286962 - 19286740
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19286962 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatg 19286863  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  19286862 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 19286763  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19286762 atattcacagcggcatgatttgg 19286740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29829822 - 29829600
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29829822 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 29829723  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  29829722 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 29829623  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  29829622 atattcacagcggcatgatttgg 29829600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9355123 - 9354901
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9355123 cagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 9355024  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |    
T  9355023 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatc 9354924  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9354923 atattcacagcggcatgatttgg 9354901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31355014 - 31354802
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31355014 attatcatccatcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagg 31354915  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  31354914 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 31354815  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  31354814 cggcatgatttgg 31354802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 3329233 - 3329444
Alignment:
Q  12 ttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaggg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3329233 ttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagag 3329332  T
Q  112 aagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagc 211  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||     
T  3329333 aagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagt 3329432  T
Q  212 ggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||    
T  3329433 ggcatgatttgg 3329444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19208075 - 19208297
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  19208075 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 19208174  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  19208175 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 19208274  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19208275 atattcacagcggcatgatttgg 19208297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28361670 - 28361892
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28361670 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 28361769  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  28361770 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 28361869  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28361870 atattcacagcggcatgatttgg 28361892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31489465 - 31489687
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31489465 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 31489564  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  31489565 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 31489664  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31489665 atattcacagcggcatgatttgg 31489687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 12092441 - 12092661
Alignment:
Q  3 gtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12092441 gtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggc 12092540  T
Q  103 tgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccat 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  12092541 tgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcat 12092640  T
Q  203 atttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  12092641 attcacagcggcatgatttgg 12092661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33259223 - 33259001
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  33259223 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 33259124  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  33259123 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 33259024  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  33259023 atattcacaacggcatgatttgg 33259001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 189523 - 189372
Alignment:
Q  72 aggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189523 aggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaa 189424  T
Q  172 gtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  189423 gtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttgg 189372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18791207 - 18791099
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18791207 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggcatgatcatg 18791108  T
Q  101 gctgaacag 109  Q
    |||||||||    
T  18791107 gctgaacag 18791099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18711069 - 18710899
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  18711069 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 18710970  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  18710969 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 18710899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44563582 - 44563438
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  44563582 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 44563483  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttac 162  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  |||||||    
T  44563482 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttac 44563438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 19658755 - 19658942
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| | |||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||| | | |||| || ||||  |||||||||||||    
T  19658755 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 19658854  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||||| |||||    
T  19658855 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctca 19658942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Original strand, 22080643 - 22080764
Alignment:
Q  51 tagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggag 150  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||| || | || |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  22080643 tagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggag 22080742  T
Q  151 ttgcgacgttacggacatcaag 172  Q
    |||| || ||||| || |||||    
T  22080743 ttgcaacattacgaacgtcaag 22080764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15424016 - 15424238
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15424016 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcatgatcatg 15424115  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  15424116 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatc 15424215  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15424216 atatttacagcggcatgatttgg 15424238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26918877 - 26918655
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918877 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 26918778  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  26918777 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 26918678  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26918677 atattcacagcggcatgatttgg 26918655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26989499 - 26989276
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaatta-tcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989499 cagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcat 26989400  T
Q  100 ggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  26989399 ggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgat 26989300  T
Q  200 catatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26989299 catatttacagcggcatgatttgg 26989276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22934579 - 22934801
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934579 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 22934678  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  22934679 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 22934778  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22934779 atatttacagcggcatgatttgg 22934801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23857024 - 23857246
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857024 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 23857123  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23857124 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 23857223  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23857224 atatttacagcggcatgatttgg 23857246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24304317 - 24304539
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24304317 cagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatggtcatg 24304416  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24304417 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24304516  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24304517 atatttacagcggcatgatttgg 24304539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24864214 - 24863992
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24864214 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 24864115  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24864114 gctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 24864015  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24864014 atatttacagcggcatgatttgg 24863992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27290069 - 27290288
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290069 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 27290168  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || | |    
T  27290169 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatc 27290268  T
Q  201 atatttacagcggcatgatt 220  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  27290269 atatttacagtagcatgatt 27290288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16750351 - 16750129
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16750351 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 16750252  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16750251 gctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 16750152  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16750151 atattcacagcggcatgatttgg 16750129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13298650 - 13298872
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298650 cagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 13298749  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  13298750 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 13298849  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13298850 atatttacagcggcatgatttgg 13298872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29549972 - 29549750
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549972 cagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 29549873  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |    
T  29549872 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatc 29549773  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  29549772 atgttcacagcggcatgatttgg 29549750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3696578 - 3696356
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3696578 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcgtg 3696479  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |    
T  3696478 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatc 3696379  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  3696378 atattcacagcggcatgatttgg 3696356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 34463045 - 34463267
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34463045 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 34463144  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  34463145 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 34463244  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  34463245 atattcacagcggcatgatttgg 34463267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27485626 - 27485404
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27485626 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27485527  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27485526 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 27485427  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27485426 atattcacagcggcatgatttgg 27485404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4545474 - 4545696
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4545474 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 4545573  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  4545574 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 4545673  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4545674 atattcacagcggcatgatttgg 4545696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16674636 - 16674414
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16674636 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 16674537  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  16674536 gctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 16674437  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16674436 atattcacagcggcatgatttgg 16674414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27272279 - 27272501
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272279 cagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 27272378  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27272379 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatc 27272478  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  27272479 atattcacagcagcatgatttgg 27272501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29501912 - 29501690
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29501912 cagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 29501813  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  29501812 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 29501713  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  29501712 atattcacagcggcatgatttgg 29501690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27044885 - 27044663
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27044885 cagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27044786  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27044785 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27044686  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27044685 atattcacagcggcatgatttgg 27044663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4723833 - 4724055
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4723833 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 4723932  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  4723933 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 4724032  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4724033 atattcacagcggcatgatttgg 4724055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4758251 - 4758039
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4758251 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 4758152  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  4758151 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 4758052  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  4758051 cggcatgatttgg 4758039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27019633 - 27019461
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019633 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 27019534  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27019533 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4773503 - 4773281
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4773503 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 4773404  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  4773403 gctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 4773304  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4773303 atattcacagcggcatgatttgg 4773281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27008224 - 27008002
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27008224 cagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27008125  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |    
T  27008124 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatc 27008025  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27008024 atattcacagcggcatgatttgg 27008002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4525783 - 4525561
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4525783 cagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 4525684  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  4525683 gctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 4525584  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4525583 atattcacagcggcatgatttgg 4525561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28207951 - 28207729
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28207951 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatg 28207852  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  28207851 gctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 28207752  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28207751 atattcacagcggcatgatttgg 28207729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29573510 - 29573288
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  29573510 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 29573411  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  29573410 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 29573311  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  29573310 atattcacagcggcatgatttgg 29573288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26116109 - 26116331
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26116109 cagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 26116208  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  26116209 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 26116308  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26116309 atattcacagcggcatgatttgg 26116331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27359691 - 27359913
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27359691 cagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27359790  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27359791 gctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27359890  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27359891 atattcacagcggcatgatttgg 27359913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27450034 - 27450256
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27450034 cagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 27450133  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  27450134 gctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 27450233  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27450234 atattcacagcggcatgatttgg 27450256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30557715 - 30557937
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  30557715 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 30557814  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  | |||| |    
T  30557815 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatc 30557914  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  30557915 atattcacagcggcatgatttgg 30557937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16943726 - 16943948
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  16943726 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 16943825  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  16943826 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 16943925  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  16943926 atattcacagtggcatgatttgg 16943948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26777309 - 26777536
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26777309 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 26777408  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgt-----gcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattctt 195  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| | ||     ||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||    
T  26777409 gctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctcacacactt 26777508  T
Q  196 cgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26777509 cgatcatattcacagcggcatgatttgg 26777536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17025658 - 17025552
Alignment:
Q  117 ttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  17025658 ttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcat 17025559  T
Q  217 gatttgg 223  Q
    |||||||    
T  17025558 gatttgg 17025552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22456642 - 22456820
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||  | |||| || | || ||||||||||||||    
T  22456642 cagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgatcatg 22456741  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||  ||||||||||| ||||| |||||         |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22456742 gtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 22456820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 14142984 - 14143171
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||| | || ||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  14142984 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 14143083  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  14143084 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 14143171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26788441 - 26788254
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||| | || ||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  26788441 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 26788342  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  26788341 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 26788254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27196814 - 27196627
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||| | || ||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  27196814 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 27196715  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  27196714 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 27196627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27252426 - 27252613
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||| | || ||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  27252426 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 27252525  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  27252526 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 27252613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27000402 - 27000348
Alignment:
Q  169 caagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27000402 caagtgtaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgg 27000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 13521789 - 13521959
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||    
T  13521789 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggctt 13521888  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||  |||||||  |||||| |||||    
T  13521889 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctca 13521959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39825 - 40047
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39825 cagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 39924  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  39925 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 40024  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40025 atatttacagcggcatgatttgg 40047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 46741 - 46963
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46741 cagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 46840  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  46841 gctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatc 46940  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  46941 atatttacagcggcatgatttgg 46963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30263 - 30041
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30263 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgtgatcatg 30164  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    
T  30163 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatc 30064  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  30063 atatttacagtggcatgatttgg 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30947 - 30730
Alignment:
Q  6 aaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30947 aaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaa 30848  T
Q  106 acagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  30847 acagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatt 30748  T
Q  206 tacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30747 tacagcggcatgatttgg 30730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27793 - 27570
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaatta-tcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27793 cagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcat 27694  T
Q  100 ggctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgac 199  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  27693 ggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgat 27594  T
Q  200 catatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27593 catatttacagcggcatgatttgg 27570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6514 - 6292
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6514 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 6415  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  6414 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 6315  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6314 atattcacagcggcatgatttgg 6292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41793064 - 41793286
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41793064 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 41793163  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  41793164 gttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 41793263  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  41793264 atattcacagcggcatgatttgg 41793286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51638717 - 51638495
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51638717 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 51638618  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  51638617 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 51638518  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  51638517 atattcacagcggcatgatttgg 51638495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10963169 - 10962947
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10963169 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcatgatcatg 10963070  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||   ||||| |    
T  10963069 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatc 10962970  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  10962969 atattcacagcggcatgatttgg 10962947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28585480 - 28585258
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28585480 cagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 28585381  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  28585380 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 28585281  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28585280 atattcacagcggcatgatttgg 28585258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 16207787 - 16207968
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  |||||||||||||    
T  16207787 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 16207886  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagct 182  Q
    |   ||||  || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16207887 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagct 16207968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20461580 - 20461406
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| || | ||  |||||||||||||    
T  20461580 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgatcatg 20461481  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtct 175  Q
    |   ||||  || ||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  20461480 gtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtct 20461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 20340091 - 20340278
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    || |||||||||||||||  |  ||| || | ||  |||||||||||||    
T  20340091 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatg 20340190  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  20340191 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctca 20340278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28152344 - 28152174
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||    
T  28152344 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 28152245  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
     ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  28152244 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctca 28152174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8822 - 9044
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8822 cagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 8921  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  8922 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatc 9021  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9022 atattcacagcggcatgatttgg 9044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20505 - 20293
Alignment:
Q  11 attatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20505 attatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaga 20406  T
Q  111 gaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacag 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  20405 gaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacag 20306  T
Q  211 cggcatgatttgg 223  Q
    |||||||||||||    
T  20305 cggcatgatttgg 20293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10066 - 9844
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10066 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatg 9967  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  9966 gctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 9867  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9866 atattcacagcggcatgatttgg 9844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14686 - 14908
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  14686 cagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 14785  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  14786 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 14885  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  14886 acattcacagcggcatgatttgg 14908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25957 - 26179
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25957 cagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatg 26056  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||   ||||| |    
T  26057 gctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatc 26156  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26157 atattcacagcggcatgatttgg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8449 - 8227
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8449 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatg 8350  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  8349 gctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 8250  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8249 atattcacagcggcatgatttgg 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6995 - 7217
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  6995 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatg 7094  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgacc 200  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  7095 attgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatc 7194  T
Q  201 atatttacagcggcatgatttgg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  7195 atattcacagtggcatgatttgg 7217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 46556 - 46780
Alignment:
Q  6 aaaaaattatcattcatcaagcttt-ggatgtcg-tcttgaacagtatagcaacccaaa-ggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgat-catgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46556 aaaaaattatcattcatcaagcttttggatgtcaatcttgaacagtaaagcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatgg 46655  T
Q  102 ctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtc-taggagc-tgcctcacattcttcga- 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||| ||     
T  46656 ctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgat 46755  T
Q  199 ccatatttacagcggcatgatttgg 223  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  46756 tcatatttacagcagcatgatttgg 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Original strand, 1 - 107
Alignment:
Q  117 ttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctcacattcttcgaccatatttacagcggcat 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcat 100  T
Q  217 gatttgg 223  Q
    |||||||    
T  101 gatttgg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2414 - 2601
Alignment:
Q  1 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatg 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    || |||||||||||||||  |  ||| || | ||  |||||||||||||    
T  2414 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatg 2513  T
Q  101 gctgaacagggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctgcctca 188  Q
    |   ||||| || |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  2514 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctca 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22044 - 21890
Alignment:
Q  18 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagggaagctt 117  Q
    ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   ||||||||| |||||||| |  ||||| || |||| |||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  22044 ttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggctt 21945  T
Q  118 tgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaag 172  Q
     ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21944 ggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaag 21890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 383 - 545
Alignment:
Q  10 aattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacag 109  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||   || |||||| |||||||| |  |||||  | |||| |||||||||||||||   ||||     
T  383 aattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgatcatggtcaaacaa 482  T
Q  110 ggaagctttgcacagcttaatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaag 172  Q
    |||  ||| ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  483 ggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaag 545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University