View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8026_high_6 (Length: 383)

Name: NF8026_high_6
Description: NF8026
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8026_high_6
NF8026_high_6
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (9-370)||(35233904-35234265)
chr3 (7-370)||(54602786-54603148)
chr3 (7-370)||(1092176-1092537)
chr3 (7-370)||(35235005-35235367)
chr3 (7-370)||(40066150-40066512)
chr3 (7-336)||(54492881-54493208)
chr3 (7-370)||(20819384-20819745)
chr3 (7-370)||(32751347-32751709)
chr3 (7-370)||(24782735-24783104)
chr3 (64-370)||(54627686-54627991)
chr3 (168-290)||(55482038-55482160)
chr3 (7-161)||(40791516-40791669)
chr3 (9-162)||(20410995-20411147)
chr3 (64-142)||(32750904-32750982)
chr3 (64-142)||(54627244-54627322)
chr3 (9-142)||(50672415-50672545)
chr3 (7-142)||(24782251-24782373)
chr3 (7-142)||(40065651-40065785)
chr3 (7-141)||(55482161-55482293)
chr3 (7-139)||(35235734-35235865)
chr3 (7-142)||(54602290-54602422)
chr3 (64-142)||(20820113-20820191)
chr3 (64-142)||(35234604-35234682)
chr3 (9-137)||(31584851-31584978)
chr3 (7-133)||(46650974-46651100)
chr3 (232-303)||(55481556-55481627)
chr3 (7-54)||(55481502-55481549)
chr3 (13-54)||(33128582-33128623)
chr3 (64-133)||(40009979-40010048)
chr3 (127-176)||(41221894-41221943)
chr3 (1-54)||(44405261-44405314)
chr3 (233-293)||(40791666-40791726)
chr3 (7-54)||(8015516-8015563)
chr3 (7-54)||(29588949-29588995)
chr3 (9-54)||(14899342-14899387)
chr3 (9-54)||(33981560-33981605)
chr3 (9-54)||(38667280-38667325)
chr3 (9-54)||(39285080-39285125)
chr3 (9-54)||(40278272-40278317)
chr3 (1-54)||(42248868-42248921)
chr3 (9-54)||(43914601-43914646)
chr3 (9-54)||(49316202-49316247)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (7-370)||(44431347-44431710)
chr1 (7-370)||(21247108-21247470)
chr1 (7-366)||(25376895-25377250)
chr1 (7-310)||(29487447-29487750)
chr1 (7-368)||(39365001-39365362)
chr1 (71-334)||(42774944-42775206)
chr1 (7-370)||(46295086-46295448)
chr1 (25-370)||(16835026-16835370)
chr1 (7-368)||(1799355-1799725)
chr1 (7-298)||(16797891-16798183)
chr1 (7-176)||(48731384-48731554)
chr1 (7-142)||(23703635-23703768)
chr1 (7-142)||(16834529-16834661)
chr1 (7-142)||(44432076-44432210)
chr1 (7-129)||(40315396-40315518)
chr1 (1-161)||(45141627-45141785)
chr1 (7-142)||(1798928-1799062)
chr1 (7-142)||(46294603-46294737)
chr1 (64-142)||(19076191-19076269)
chr1 (64-142)||(19124081-19124159)
chr1 (64-137)||(27234630-27234703)
chr1 (65-161)||(18806844-18806939)
chr1 (7-142)||(21246615-21246747)
chr1 (71-121)||(11202034-11202084)
chr1 (64-142)||(23703242-23703319)
chr1 (233-293)||(18806936-18806996)
chr1 (7-54)||(40116841-40116888)
chr1 (7-54)||(26615691-26615738)
chr1 (252-298)||(16797356-16797402)
chr1 (9-54)||(9033733-9033778)
chr1 (9-54)||(27134436-27134481)
chr1 (9-54)||(38623726-38623771)
chr1 (7-54)||(13698214-13698261)
chr1 (7-54)||(26537667-26537714)
chr1 (7-54)||(32814967-32815014)
chr1 (7-54)||(35156051-35156098)
chr1 (7-54)||(42233528-42233575)
chr1 (7-54)||(48720934-48720981)
chr1 (9-52)||(49216873-49216916)
chr1 (9-54)||(8742523-8742568)
chr1 (9-54)||(9034497-9034542)
chr1 (9-54)||(11707387-11707432)
chr1 (1-54)||(22389082-22389135)
chr1 (9-54)||(35392647-35392692)
chr1 (9-54)||(36723930-36723975)
chr1 (9-54)||(43505901-43505946)
chr1 (9-54)||(46585495-46585540)
chr1 (7-55)||(12770231-12770279)
chr1 (10-54)||(38833673-38833717)
chr1 (7-55)||(52869823-52869871)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (7-370)||(25630340-25630690)
chr8 (7-370)||(15565185-15565547)
chr8 (7-354)||(44308270-44308612)
chr8 (2-368)||(25977-26353)
chr8 (70-370)||(12502312-12502602)
chr8 (81-368)||(20831949-20832234)
chr8 (7-142)||(26712-26846)
chr8 (9-142)||(25631059-25631189)
chr8 (7-142)||(12502977-12503109)
chr8 (86-179)||(6869218-6869311)
chr8 (9-137)||(9879060-9879187)
chr8 (7-142)||(25094294-25094428)
chr8 (7-142)||(20832599-20832733)
chr8 (64-141)||(15730713-15730789)
chr8 (64-142)||(15564740-15564818)
chr8 (7-45)||(37746462-37746500)
chr8 (65-122)||(14024126-14024183)
chr8 (7-54)||(3416830-3416877)
chr8 (7-54)||(26431463-26431510)
chr8 (7-54)||(31820464-31820511)
chr8 (8-54)||(9263841-9263887)
chr8 (7-45)||(31819881-31819919)
chr8 (7-45)||(39864105-39864143)
chr8 (9-54)||(3177949-3177994)
chr8 (9-54)||(12764252-12764297)
chr8 (9-54)||(39584486-39584531)
chr8 (233-293)||(15730801-15730861)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (7-359)||(48083108-48083457)
chr4 (7-370)||(6336631-6336993)
chr4 (7-370)||(56443292-56443652)
chr4 (66-368)||(55082656-55082958)
chr4 (7-338)||(1613610-1613940)
chr4 (7-280)||(42259966-42260239)
chr4 (168-336)||(12800507-12800675)
chr4 (7-139)||(36112038-36112170)
chr4 (7-161)||(17215099-17215249)
chr4 (9-143)||(42259445-42259577)
chr4 (7-142)||(1614729-1614863)
chr4 (7-142)||(56444016-56444149)
chr4 (64-161)||(39334197-39334293)
chr4 (7-142)||(55083297-55083431)
chr4 (7-142)||(12800375-12800514)
chr4 (7-116)||(23590641-23590749)
chr4 (64-109)||(4630745-4630790)
chr4 (233-293)||(17215246-17215306)
chr4 (7-54)||(15739577-15739624)
chr4 (7-54)||(52177266-52177313)
chr4 (9-54)||(220720-220765)
chr4 (64-121)||(6077361-6077418)
chr4 (64-121)||(7389574-7389631)
chr4 (7-107)||(7862765-7862864)
chr4 (233-293)||(39334140-39334200)
chr4 (7-54)||(4940991-4941038)
chr4 (7-54)||(36111642-36111689)
chr4 (7-55)||(25705985-25706033)
chr4 (7-54)||(9359752-9359799)
chr4 (7-54)||(12594737-12594784)
chr4 (7-46)||(23161260-23161299)
chr4 (7-54)||(23465773-23465820)
chr4 (7-54)||(38575705-38575751)
chr4 (7-54)||(40145809-40145856)
chr4 (9-47)||(205081-205119)
chr4 (9-51)||(1565108-1565150)
chr4 (71-121)||(48083832-48083882)
chr4 (12-54)||(55778130-55778172)
chr4 (12-54)||(55842310-55842352)
chr4 (1-54)||(7862024-7862077)
chr4 (1-54)||(22535859-22535912)
chr4 (9-54)||(29617464-29617509)
chr4 (9-54)||(38392193-38392238)
chr4 (9-54)||(39633471-39633516)
chr4 (9-54)||(40034254-40034299)
chr4 (9-54)||(41904617-41904662)
chr4 (9-54)||(42987938-42987983)
chr4 (9-54)||(46614609-46614654)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (7-370)||(26831693-26832055)
chr7 (8-370)||(15752388-15752742)
chr7 (7-370)||(14103479-14103842)
chr7 (7-370)||(14413496-14413859)
chr7 (64-370)||(36897611-36897916)
chr7 (7-265)||(26928236-26928494)
chr7 (147-336)||(42261054-42261242)
chr7 (7-161)||(29417916-29418069)
chr7 (7-142)||(14102981-14103115)
chr7 (7-142)||(14412998-14413132)
chr7 (64-142)||(15753119-15753197)
chr7 (64-164)||(42260899-42260998)
chr7 (7-161)||(17774454-17774605)
chr7 (64-142)||(26832424-26832502)
chr7 (68-142)||(44950521-44950594)
chr7 (7-130)||(34958968-34959090)
chr7 (233-293)||(34956171-34956231)
chr7 (7-105)||(43759652-43759749)
chr7 (233-293)||(29417859-29417919)
chr7 (7-54)||(33227831-33227878)
chr7 (9-54)||(16083148-16083193)
chr7 (9-54)||(24213265-24213310)
chr7 (9-54)||(33210425-33210470)
chr7 (9-54)||(34345846-34345891)
chr7 (7-54)||(2755911-2755958)
chr7 (7-54)||(23678764-23678811)
chr7 (7-54)||(31308402-31308448)
chr7 (7-45)||(21125574-21125612)
chr7 (8-54)||(29644889-29644935)
chr7 (9-54)||(19072076-19072121)
chr7 (9-54)||(21366409-21366454)
chr7 (9-54)||(34345388-34345433)
chr7 (9-54)||(35668410-35668455)
chr7 (105-142)||(36898282-36898319)
chr7 (105-142)||(36898351-36898388)
chr7 (9-54)||(38184340-38184385)
chr7 (9-54)||(38449974-38450019)
chr7 (9-54)||(48343734-48343779)
chr7 (6-54)||(33696651-33696699)
chr7 (7-55)||(45259061-45259109)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (7-370)||(6915022-6915373)
chr5 (15-370)||(5574136-5574489)
chr5 (7-370)||(17647948-17648309)
chr5 (1-142)||(17647443-17647583)
chr5 (7-179)||(24087261-24087432)
chr5 (7-161)||(19293021-19293175)
chr5 (9-161)||(5577166-5577315)
chr5 (7-142)||(5574852-5574986)
chr5 (7-133)||(26359676-26359801)
chr5 (7-142)||(26359302-26359436)
chr5 (7-114)||(8505843-8505950)
chr5 (232-301)||(20731469-20731538)
chr5 (2-142)||(6914284-6914419)
chr5 (233-293)||(5577109-5577169)
chr5 (233-293)||(19292964-19293024)
chr5 (7-54)||(6809376-6809423)
chr5 (64-126)||(37895848-37895910)
chr5 (7-54)||(20731022-20731069)
chr5 (7-54)||(34217198-34217245)
chr5 (7-54)||(38424853-38424900)
chr5 (8-54)||(14197888-14197934)
chr5 (9-54)||(25751872-25751917)
chr5 (9-54)||(38090493-38090538)
chr5 (7-54)||(2301299-2301346)
chr5 (7-54)||(7950952-7950999)
chr5 (7-54)||(38424265-38424312)
chr5 (7-46)||(38977723-38977762)
chr5 (1-55)||(9587668-9587722)
chr5 (9-54)||(746506-746551)
chr5 (9-54)||(2745395-2745440)
chr5 (200-277)||(20731087-20731163)
chr5 (9-54)||(27500818-27500863)
chr5 (9-54)||(29235619-29235664)
chr5 (9-54)||(29835975-29836020)
chr5 (9-54)||(36778357-36778402)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (7-370)||(1468-1829)
scaffold0340 (7-142)||(2186-2319)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (7-370)||(15830513-15830873)
chr2 (8-370)||(36207136-36207486)
chr2 (7-370)||(9708532-9708903)
chr2 (64-293)||(38937576-38937804)
chr2 (7-179)||(3106830-3107001)
chr2 (7-142)||(9708033-9708167)
chr2 (64-142)||(15830070-15830148)
chr2 (1-142)||(36207849-36207989)
chr2 (7-219)||(7277938-7278139)
chr2 (7-129)||(4646057-4646177)
chr2 (7-54)||(3106313-3106360)
chr2 (7-54)||(7337941-7337988)
chr2 (7-54)||(38935883-38935930)
chr2 (9-54)||(18060409-18060454)
chr2 (7-46)||(12138649-12138688)
chr2 (7-54)||(20463574-20463621)
chr2 (7-54)||(23849113-23849160)
chr2 (7-54)||(35059112-35059159)
chr2 (7-53)||(41425578-41425624)
chr2 (7-44)||(1090670-1090707)
chr2 (7-52)||(21545253-21545298)
chr2 (9-54)||(43207014-43207059)
chr2 (1-54)||(44747874-44747927)
chr2 (7-55)||(22064068-22064116)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (8-370)||(1563569-1563923)
chr6 (8-184)||(11099740-11099915)
chr6 (227-370)||(11099595-11099738)
chr6 (7-173)||(28538051-28538216)
chr6 (7-161)||(23075118-23075269)
chr6 (64-142)||(1563114-1563192)
chr6 (7-142)||(28537688-28537822)
chr6 (7-142)||(11099094-11099228)
chr6 (233-293)||(23075061-23075121)
chr6 (7-54)||(25404242-25404289)
chr6 (9-54)||(8590580-8590625)
chr6 (9-54)||(16894579-16894624)
chr6 (9-54)||(32597110-32597155)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-211)||(42198-42407)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (233-370)||(12971-13098)
scaffold0113 (64-142)||(12694-12772)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (174-293)||(425054-425172)
scaffold0002 (198-293)||(407643-407739)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (7-120)||(22290-22402)
[»] scaffold0945 (1 HSPs)
scaffold0945 (7-54)||(2102-2149)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (7-54)||(3390-3437)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (7-54)||(67224-67271)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (9-54)||(28598-28643)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-53)||(34150-34201)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 370
Target Start/End: Original strand, 35233904 - 35234265
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35233904 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgctttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggaggata 35234003  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35234004 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagtgcctaatgatataaaagacagcatagcaaa 35234103  T
Q  209 gtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtca 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35234104 gtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtca 35234203  T
Q  309 aaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35234204 aaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccactccctttatatt 35234265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 54603148 - 54602786
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54603148 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatctttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 54603050  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatat-tttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagc 205  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||     
T  54603049 tattagctaagttttaacgatatacaaccatatatgtttcttt-aaacgatcgaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagt 54602951  T
Q  206 aaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatg 305  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54602950 aaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataagacatgattggcataaccaagaattaccaagatg 54602851  T
Q  306 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  54602850 tcaaagtatatgactttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcctttatatt 54602786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 1092176 - 1092537
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1092176 agttttgtacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttgaaaatttatat-atatttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 1092274  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  1092275 t-ttagctaagttttgacggtatacaatcatatatgttcctttaaacgatcaaaaattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 1092373  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | |  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1092374 aagtacaaccacacttgccagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacttaattgacataaccaagaattaccaagatgt 1092473  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1092474 cacaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt 1092537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 35235005 - 35235367
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35235005 agttttgtacttatgtacaaaatgccccctgaacttgaaaatttatatattttttta-ttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 35235103  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  35235104 tattagctatgttttgatggtatataaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 35235203  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35235204 aagtacaaccacacatgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgt 35235303  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35235304 caaattatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 35235367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40066512 - 40066150
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40066512 agttttgtacttatgttcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagttactgcattatcactgaattgtggagca 40066414  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |    
T  40066413 tattagctaagttttgacggtatagaaccatatatgttcttttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagta 40066314  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40066313 aagtacaaccacacttgtcaaatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggtgtaaccaagaattaccaagatgt 40066214  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40066213 caaagtatatgactttgatattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 40066150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 54492881 - 54493208
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  54492881 agttttgcacttatgtgcaaaatgccgcctgaacttgaaaatttatatttttttg---ttatccttaaaagtgactgcattatcattgaattgtggagca 54492977  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  54492978 tattagttaagttttgacggtatacaaccatatatgttctccgaaacgatcaaacattaatgatgtattagagcctaatgatatgaaagtcagcataaca 54493077  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataacc-aagaattaccaagatg 305  Q
    ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  54493078 aagtataaccacacctgtcaaatgaaaaactaatgcatggtatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcatagccaaaaaattatcaagatg 54493177  T
Q  306 tcaaaatatatggctttgctattgctaattt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54493178 tcaaaatatatggctttgctattgctaattt 54493208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 20819384 - 20819745
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||         ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20819384 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttaaaaatttatat-atttttttcttatgctttaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 20819482  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||| |||||||| |    
T  20819483 tattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgattagaaagtcagcatagta 20819582  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20819583 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 20819682  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20819683 caaagtatatggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaa-tttcacttcctttatatt 20819745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32751709 - 32751347
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32751709 agttttgtacttatgtgcaaaatgcctcctgaatttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 32751611  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||   ||| |    
T  32751610 tattagctatgttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaatgtagta 32751511  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  32751510 aagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaacaattatcaacatgt 32751411  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32751410 caaaatatatggttttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 32751347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24783104 - 24782735
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24783104 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatatatttttt---ttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 24783008  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||| |    
T  24783007 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaatgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgagagtcagcatagta 24782908  T
Q  207 aagtacagccacac--------ctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacat-gaatgacatatgattggcataaccaagaatta 297  Q
    |||||||  |||||         ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  24782907 aagtacaatcacacttgtcagattgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataataaagcacataaaataatacatgattgacataaccaagaatta 24782808  T
Q  298 ccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24782807 ccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 24782735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 54627991 - 54627686
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacat 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  54627991 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacat 54627892  T
Q  164 taaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcac 263  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||| |||||||| |||||  ||||  ||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |||    
T  54627891 taaccatgtattagagtctaacgatat-gaagtctgcatagtaaagtacaaccacatttgtctgatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacac 54627793  T
Q  264 atgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccct 363  Q
    ||  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  54627792 atatataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatattgctttgctattgctaattttaaccacacaaaaaatttccacttcct 54627693  T
Q  364 ttatatt 370  Q
    |||||||    
T  54627692 ttatatt 54627686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 55482160 - 55482038
Alignment:
Q  168 catgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatga 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  55482160 catgtattatagcataatgatatgaaagtcagcatagcaacgtacagccacacttgtcatatgaaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataa 55482061  T
Q  268 atgacatatgattggcataacca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  55482060 atgacatatgattggcataacca 55482038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 40791516 - 40791669
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  40791516 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagca 40791614  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40791615 tattaactaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 40791669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20411147 - 20410995
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20411147 ttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaatttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtaaagcata 20411049  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatat-tttctctgaaacgatcaaaca 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  20411048 ttagctaagttttgacggtatacaaccatatatgtttct-ttaaacgatcaaaca 20410995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 32750904 - 32750982
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32750904 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtagagcatattagctaagttttgacggtatacaaccatatatt 32750982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 54627244 - 54627322
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54627244 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 54627322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50672545 - 50672415
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50672545 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat---tttttacttatccttaaaatttactgcattatcactgaattgtggagcata 50672449  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  50672448 ttaactaagttttgacgatgtacaaccatatatt 50672415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 24782251 - 24782373
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||             ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24782251 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccttaaacttgaaaatttatat-------------tccttaaaagtgattgcattatcactgaattgttgagca 24782337  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24782338 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 24782373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 40065651 - 40065785
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  40065651 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcattgaattgtggaaca 40065749  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40065750 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 40065785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 55482293 - 55482161
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||         || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  55482293 agttttgcacttatgtgcaaaatgtccactgaacttgaaaatttatat--tttttttctaattcttaaaagtgactgcattatcaccgaattgtggagca 55482196  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatat 141  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  55482195 tattagctaagttttgatggtatacaactatatat 55482161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35235865 - 35235734
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35235865 agttttgcacttatgcgaaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 35235767  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  35235766 tattagctaagttttgacgatatacaatcatat 35235734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 54602290 - 54602422
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  54602290 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactga--tgtggagca 54602386  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54602387 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 54602422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20820191 - 20820113
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  20820191 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggaacatattagctaagttttgtcgatatacaaccatatatt 20820113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35234682 - 35234604
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35234682 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtgcaacatattagctaagttttgacggtatacaatcatatatt 35234604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 31584851 - 31584978
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31584851 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgagcttgaaaatttatattttttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagcata 31584949  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccat 137  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31584950 ttagctaagttttgtcggtatacaaccat 31584978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46651100 - 46650974
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcact-gcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46651100 agttttgtacttatgtgcaaaatggctcctgaactttaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgacttgcattatcactgaattgtggagc 46651002  T
Q  106 atattagctaagtttttacggtatacaa 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  46651001 atattagctaagttttgacggtatacaa 46650974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 55481627 - 55481556
Alignment:
Q  232 aaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaaga 303  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55481627 aaaactaatgcattacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaataattaccaaga 55481556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 55481502 - 55481549
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55481502 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttgaaaatttatat 55481549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 33128582 - 33128623
Alignment:
Q  13 gcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128582 gcacttatgtgcaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 33128623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40010048 - 40009979
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaa 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  40010048 cttatccttaaaagtggctgcattatcactgaattgtaaaacatattagctatgttttgacggtacacaa 40009979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 176
Target Start/End: Original strand, 41221894 - 41221943
Alignment:
Q  127 tatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtatta 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41221894 tatacaaccatatatgttccctgaaatgatcaaacattaaccatgtatta 41221943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 44405314 - 44405261
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44405314 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttaaaaatttatat 44405261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 40791666 - 40791726
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40791666 aaactaatgcatggcatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 40791726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 8015563 - 8015516
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8015563 agttttgcacttatgtacaaattgccccttgaacttgaaaatttatat 8015516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29588995 - 29588949
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29588995 agttttgcacttatgtgcaaaatgt-ccgtgaacttgaaaatttatat 29588949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14899387 - 14899342
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14899387 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 14899342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 33981560 - 33981605
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  33981560 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatatatat 33981605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 38667280 - 38667325
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38667280 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 38667325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 39285080 - 39285125
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39285080 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 39285125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 40278272 - 40278317
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40278272 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 40278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42248921 - 42248868
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  42248921 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttaaaaatttatat 42248868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 43914646 - 43914601
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43914646 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat 43914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 49316202 - 49316247
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  49316202 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 49316247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 44431347 - 44431710
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44431347 agttttgtacttatgtgcaaaataccccatgaacttgaaaatttatattttttttttcttatctttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 44431446  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |    
T  44431447 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcttttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaatgatatgaaagtcaacatagta 44431546  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44431547 aagtacaaccgcacttgttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 44431646  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44431647 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatatt 44431710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21247470 - 21247108
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21247470 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 21247372  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  21247371 tattagctaagttttgattgtatacaaccatatatgatcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattaaggtataatgatatgaaagtcagcatagta 21247272  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21247271 aagtacagccatacttgtcagatggaaaactaatacatgtgatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataaccaagaataaccaagatgt 21247172  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21247171 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 21247108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 366
Target Start/End: Original strand, 25376895 - 25377250
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25376895 agttttgcaattatgtgcaaaatgcctcttgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactaaattgtggagca 25376991  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  25376992 tattagctaagttttgacgctatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatatgaaagtcaacatagca 25377091  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25377092 aagtacagtcacacctgtcggatagaaaactaatgcatgacatacatagtgaagcacataaatcacatagaatttgcataaccaagaattactaagatgt 25377191  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactcccttta 366  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  25377192 caaaatatat-gattttctattgttaattttaaccacaccaataatttccacttccttta 25377250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 29487447 - 29487750
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||          ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29487447 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttgaaaaattataaaaaaaaattcttatccttaaaagtgactgcattatcacttaattgtggagca 29487546  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  29487547 tgttagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttccctcaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaatgatatgaaagtcagcatagca 29487646  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29487647 aagtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgatatatgattcgcataaccaagaattaccaagatgt 29487746  T
Q  307 caaa 310  Q
    ||||    
T  29487747 caaa 29487750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 368
Target Start/End: Original strand, 39365001 - 39365362
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39365001 agttttgtacttatgtgcaaaatgcctcatgaacttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 39365100  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||| |    
T  39365101 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtccaacgatatgaaagtcagcatagta 39365200  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  39365201 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataattaagaattaccaagatgt 39365300  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttata 368  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39365301 catagtatatggctttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata 39365362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 71 - 334
Target Start/End: Original strand, 42774944 - 42775206
Alignment:
Q  71 ttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccat 170  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  42774944 ttaaaagcgactgaattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcagacatttaccat 42775043  T
Q  171 gtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatg 270  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  42775044 gtattagagcctaatgatatgaa-gtcagcatagcaaagtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataataaagcacagaaatg 42775142  T
Q  271 acatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42775143 acatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattggtaat 42775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46295448 - 46295086
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46295448 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctggacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtagagca 46295350  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| |||| |||||||| |    
T  46295349 tattagctaagttttgacgatatacaacgatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattatagtctaacggtatgaaagtcagcatagta 46295250  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46295249 aagtacaaccacatttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattatcaagatgt 46295150  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46295149 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 46295086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16835370 - 16835026
Alignment:
Q  25 aaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16835370 aaaatgtcccttgaacttaaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttgac 16835272  T
Q  125 ggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||  |||    
T  16835271 ggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagttcaacgatatgaaagtcagcataataaagtacaaccacatttgt 16835172  T
Q  225 cacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgc 324  Q
    || ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16835171 cagatggaaaactaatacatgtcttacataatgaagcacataaataatacatgattgacatacccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgc 16835072  T
Q  325 tattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16835071 tattgctaattttaaccacaccaaaaatttctacttcctttatatt 16835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1799725 - 1799355
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1799725 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgagtgcattatcactgaattgtggagca 1799627  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  1799626 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatttgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtactagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 1799527  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1799526 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataatcaagaattaccaagatgt 1799427  T
Q  307 ----------caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttata 368  Q
              |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1799426 caaaggatgtcaaagtatatggctttcctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata 1799355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16798183 - 16797891
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||         || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16798183 agtttttcacttatgtgcaaaatgtccccagaacttgaaaatttatattttttttttctgatccttaaaagtgactgcattatcaccgaattgtggagta 16798084  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaag-acagcatagc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  16798083 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaactatatattagagcctaatgatatgaaagtccaacatagc 16797984  T
Q  206 aaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattac 298  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16797983 aaagtaaagtcacacctgtcagatgaaaaactaatatatggcatacataatgaagcacataaatggcacatgattgacataaccaagaattac 16797891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48731554 - 48731384
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnn-cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48731554 agttttgcacttatgcgcaaaatgccctctgaacttgaaaatttatatattttttttgcttatccttaaaagtgactgcattatcattgaattgtggagc 48731455  T
Q  106 atattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtatta 176  Q
    ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48731454 atattagcttagttttgacagcatataaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtatta 48731384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23703768 - 23703635
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23703768 agttttgcacttatgtgcaaaatgcctcctgaacttgaaaatttatat--attttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 23703671  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23703670 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatt 23703635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 16834529 - 16834661
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16834529 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat---tatgttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 16834625  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16834626 tattaactaagttttgacgatatacaaccatatatt 16834661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44432210 - 44432076
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44432210 agttttgcacttatgtgaaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttctccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 44432112  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44432111 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 44432076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40315518 - 40315396
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40315518 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatattttttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcacttaattgtggagca 40315419  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  40315418 tattagctaagttttgacggtat 40315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 45141627 - 45141785
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttg-aaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  45141627 ccctggagttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttggaaaatttatat--tttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttg 45141723  T
Q  100 tggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45141724 taaagcatattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 45141785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 1798928 - 1799062
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | || ||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1798928 agttttgcacttatgtgcaaaataccccataaatttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 1799026  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1799027 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 1799062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 46294603 - 46294737
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  46294603 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 46294701  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  46294702 tattagctaagttttgacgatatataatcatatatt 46294737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19076269 - 19076191
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19076269 cttatccttaaaagtgattgtattatcactgaattgtggaacatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 19076191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19124159 - 19124081
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19124159 cttatccttaaaagtgattgtattatcactgaattgtggaacatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 19124081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Original strand, 27234630 - 27234703
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccat 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27234630 cttatccttaaaagtgactgccttatcactgaattgtggaacatattaactaagttttgacggtatacaaccat 27234703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Original strand, 18806844 - 18806939
Alignment:
Q  65 ttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  18806844 ttatccttaaaagtgattgcattgtcactga-ttgtgaagcatattagctaagttttgtcggtatacaaccttatatgttccctgaaacaatcaaac 18806939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 21246615 - 21246747
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||||||||         ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  21246615 agttttgcacttatgtgcagaatgcctcataaacttgaaaatttatat--ttgttttcttatccttaaaaatgattgc-ttatcaatgaattgtggagca 21246711  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21246712 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 21246747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11202084 - 11202034
Alignment:
Q  71 ttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttt 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11202084 ttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttt 11202034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 23703242 - 23703319
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23703242 cttatccttaaa-gtgattgtattatcactgaattgtgtagcatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 23703319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 18806936 - 18806996
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18806936 aaactaatgcatgacatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 18806996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 40116888 - 40116841
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40116888 agttttgcacttatgtgcaaaatgtccctcgaacttgaaaatttatat 40116841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26615738 - 26615691
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26615738 agttttgcacttatgagcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat 26615691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16797402 - 16797356
Alignment:
Q  252 ataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattac 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16797402 ataatgaagcacataaatgacatatgattgacataatcaagaattac 16797356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 9033733 - 9033778
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9033733 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccttaaacttgaaaatttatat 9033778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 27134436 - 27134481
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27134436 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat 27134481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 38623771 - 38623726
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38623771 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccttaaacttgaaaatttatat 38623726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 13698261 - 13698214
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13698261 agttttccacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat 13698214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26537714 - 26537667
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  26537714 agttttgcacttatgtgcaaaatgcccctcgaacttaaaaatttatat 26537667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 32815014 - 32814967
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  32815014 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 32814967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 35156098 - 35156051
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  35156098 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 35156051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42233575 - 42233528
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42233575 agttttgcacttatgtgcaaaatgccacctgaacttgaaaatttatat 42233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 48720934 - 48720981
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48720934 agttttacacttatgtgcaaaatgtcccccgaacttgaaaatttatat 48720981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 49216916 - 49216873
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttat 52  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49216916 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttat 49216873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 8742568 - 8742523
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8742568 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 8742523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9034542 - 9034497
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9034542 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 9034497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 11707432 - 11707387
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11707432 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 11707387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22389135 - 22389082
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  22389135 ccctaaagttttgcaattatgtgtaaaataccccccgaacttgaaaatttatat 22389082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 35392647 - 35392692
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35392647 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 35392692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 36723975 - 36723930
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  36723975 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 36723930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 43505946 - 43505901
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43505946 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 43505901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 46585540 - 46585495
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  46585540 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccttaaacttaaaaatttatat 46585495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 12770231 - 12770279
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  12770231 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccccaaacttaaaaatttatatg 12770279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Original strand, 38833673 - 38833717
Alignment:
Q  10 tttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  38833673 tttgcacttatgtgtaaaatgccccctaaactttaaaatttatat 38833717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 52869823 - 52869871
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  52869823 agttttacacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatatg 52869871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 25630340 - 25630690
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25630340 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcattgaattgtggagca 25630436  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25630437 tattaactaagttttgacggtatacaaccatatatgctccctgaagcgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatatgaaagtcagcatagca 25630536  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | ||||||||    
T  25630537 aagtagagccacacctttcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcata----------aacaagatgt 25630626  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  25630627 caaaatatatggctttgttattgctaattttaaccacaccataaatttccacttcctttatatt 25630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15565547 - 15565185
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15565547 agttttgtacttatgtgcaaaatgtcccctcaacttaaaaatttatat-agttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtagagca 15565449  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  15565448 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacgttaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 15565349  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15565348 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 15565249  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15565248 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttacacgtcctttatatt 15565185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 354
Target Start/End: Original strand, 44308270 - 44308612
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44308270 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 44308368  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |    
T  44308369 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagta 44308468  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| ||||    || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44308469 aagtacaaccac----gttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 44308564  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattt 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44308565 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattt 44308612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Original strand, 25977 - 26353
Alignment:
Q  2 cctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtg 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25977 cctaaagttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtg 26075  T
Q  102 gagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  26076 gagcatattagctaagttttgacggtacacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattatagtctaacgatatgaaagtcagca 26175  T
Q  202 tagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaa 301  Q
    ||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26176 tagtaaagtacaaccacgcttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaa 26275  T
Q  302 ----------gatgtcaaaatatatggctttgctattgc-taattttaaccacaccaaaaattttcactccctttata 368  Q
              ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26276 gatgtcaaaggatgtcaaagtatatggctttgctattgcttaattttaaccacaccaaaaatcttcacttcctttata 26353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 370
Target Start/End: Original strand, 12502312 - 12502602
Alignment:
Q  70 cttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaacca 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12502312 cttaaaagtgactgcattatcactgaattgtagagcatattagctaagcttctacgatatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaacca 12502411  T
Q  170 tgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaat 269  Q
    | ||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  12502412 tatattagagcttaatgatatgaacgtcagcataacaaagtacaaccacacatgtcagatggaaaactaatgcataacatacataataaagcacataaat 12502511  T
Q  270 gacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatat 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12502512 gacatatgattgacataaccaagaa----------gtcaaaatatatcgctttgctattgctcattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatat 12502601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 368
Target Start/End: Original strand, 20831949 - 20832234
Alignment:
Q  81 ctgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||  |||||||||||     
T  20831949 ctgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcatttaaacgataaaacattaaaaatgtattagagt 20832048  T
Q  181 ctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgatt 280  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| |   ||||||    
T  20832049 ctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatgcatgatt 20832148  T
Q  281 ggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttata 368  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  20832149 gacataaccaaaaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaac--caccaaaaatttccacttcctttata 20832234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26846 - 26712
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26846 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 26748  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  26747 tattagctaagttttgatgatatacaaccatatatt 26712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25631189 - 25631059
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25631189 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaagttactgcattatcactgaattctagagcata 25631093  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25631092 ttagctaagttttgacggtatacaagcatatatt 25631059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12503109 - 12502977
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||         ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12503109 agttttgcacttatgtgtaaaatgcatcctgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaaatgactgcattatcagtgaattgtggagca 12503013  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12503012 tattagctaagttttgtcggtatacaacaatatatt 12502977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 179
Target Start/End: Original strand, 6869218 - 6869311
Alignment:
Q  86 ttatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagag 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6869218 ttatcactgaattgtggagcatgttagctaaattttgacggtatacaatcatatatgttccatgaaacgatcaaacattaactatgtattagag 6869311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9879187 - 9879060
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9879187 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttaaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcata 9879089  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccat 137  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  9879088 ttagctaaattttgacgatatacaaccat 9879060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 25094294 - 25094428
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25094294 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttaaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 25094392  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25094393 tattaactaagttttgacgatatacaactatatatt 25094428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20832733 - 20832599
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  20832733 agttttgtacttatgtgcaaaataccccataaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgtattatcactgaattatggagca 20832635  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20832634 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 20832599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Original strand, 15730713 - 15730789
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatat 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15730713 cttatccttaaaagtgactgcattatcactga-ttgtgaagcatattagctaagttttgacggtatacaatcatatat 15730789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 15564740 - 15564818
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  15564740 cttatccttaaaagtgattatattatcactgaattgtggaacatattagctaagttttgatgatatacaaccatatatt 15564818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Original strand, 37746462 - 37746500
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaa 45  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37746462 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccttgaacttgaa 37746500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14024183 - 14024126
Alignment:
Q  65 ttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagttttt 122  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14024183 ttatccttaaaaatgattacattatcacttaattgtggagaatattagctaagttttt 14024126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 3416830 - 3416877
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3416830 agttttgcacttatgtgcaaaatgttccccgaacttgaaaatttatat 3416877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26431510 - 26431463
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  26431510 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccacaaacttaaaaatttatat 26431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31820511 - 31820464
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31820511 agttttccacttatgtgcaaaatgtcccctgaactttaaaatttatat 31820464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9263887 - 9263841
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  9263887 gttttgcacttatgtgcaaaatgctctttgaacttgaaaatttatat 9263841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Original strand, 31819881 - 31819919
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaa 45  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31819881 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaa 31819919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 39864143 - 39864105
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaa 45  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39864143 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaa 39864105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 3177949 - 3177994
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3177949 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 3177994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 12764252 - 12764297
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12764252 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 12764297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 39584531 - 39584486
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39584531 ttttgcacttatgtgctaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat 39584486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 15730801 - 15730861
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15730801 aaactaatgcatggcatacatgacgaaacacataaatgacatataattgacataaccaaga 15730861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 48083108 - 48083457
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||         ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48083108 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaatttaaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaagcgactgcaatatcactgaattgtggagca 48083204  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  48083205 tgttagctaaattttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcttaatgatatgaaagtcagcatagca 48083304  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatg--acatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagat 304  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48083305 aaatacagtcacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataaccaagaattaccaagat 48083404  T
Q  305 gtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcact 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48083405 gtcaaaatatatggctttgc--ttgctaattttaaccacaccaaaaatttccact 48083457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6336993 - 6336631
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6336993 agttttgtacttatatgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 6336895  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |    
T  6336894 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaccatagta 6336795  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336794 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 6336695  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  6336694 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacactaaaaatttccacttcctttatatt 6336631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 56443292 - 56443652
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56443292 agttttgtacttatgtgcaaaatgcccc--gaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagttactgcattatcactgaattgtggagca 56443388  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  56443389 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtcttagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 56443488  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  56443489 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaacacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaaaaattacaaagatgt 56443588  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  56443589 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacatcaaaaatttccacttcctttatatt 56443652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Original strand, 55082656 - 55082958
Alignment:
Q  66 tatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacatta 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  55082656 tatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaaattttgacggtatacaacaatatatgttcctttaaacgatcaaacatta 55082755  T
Q  166 accatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacat 265  Q
    || |||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||| |||| ||| ||| || ||||| || |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  55082756 actatgtattagagtttaacgatatgaaagtcaacatagtaaaggacaaccatacttgtcagatagaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacat 55082855  T
Q  266 gaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactcccttt 365  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55082856 aaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttccttt 55082955  T
Q  366 ata 368  Q
    |||    
T  55082956 ata 55082958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 1613610 - 1613940
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  1613610 agttttgtacttatgtgcaaaatgcctcctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactaaattgtggagca 1613708  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  1613709 tattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgtccctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 1613808  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1613809 aagtacaaccacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 1613908  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaatttta 338  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1613909 caaagtatatggctttgttattgttaatttta 1613940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42260239 - 42259966
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  42260239 agttttgcacttatgtgcaaaataccccctgaatttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgattgcattatcacttaattgtgtagca 42260140  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42260139 tattggctaagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtatttgaacttaatgatatgaaagtcagcatagca 42260040  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgatt 280  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42260039 aagtacagtcacacctgtcagaaggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgatt 42259966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 168 - 336
Target Start/End: Original strand, 12800507 - 12800675
Alignment:
Q  168 catgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatga 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  12800507 catgtattggagcctaatgatatgaaagtcaacatagcaaagtacaaccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacaaaatgaagcacataa 12800606  T
Q  268 atgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt 336  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800607 ataacatatgattgacataaccaaaaactacaaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt 12800675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36112170 - 36112038
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  36112170 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatattttgtttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggaaca 36112071  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatat 139  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36112070 tattagctaaattttgacggtatacaaccatat 36112038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 17215099 - 17215249
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17215099 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactga-ttgtgaagca 17215194  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17215195 tattagttaagttttgacggtattcaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 17215249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 42259445 - 42259577
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42259445 ttttgcactcatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat--tttatttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcata 42259542  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatattt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42259543 ttagctaagttttgacggtatacaatcatatattt 42259577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1614863 - 1614729
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1614863 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaaaagactgcattatcactgaattgtggagca 1614765  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  1614764 tattagctaagttttgacgatatataaccatatatt 1614729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 56444149 - 56444016
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  56444149 agttttgcacttatgtgcaaaatgcctcta-aacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 56444052  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  56444051 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 56444016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39334293 - 39334197
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39334293 cttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagcatattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 39334197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 55083431 - 55083297
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||  |    
T  55083431 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattattactaaattgtagaaga 55083333  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  55083332 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 55083297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 12800375 - 12800514
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaa-cttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcatta---tcactgaattgtgg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| |    
T  12800375 agttttgcacttatgtgcaaaatgcccgtttaaacttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgattgcattattatcactgaattgtag 12800474  T
Q  103 agcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  12800475 agcatattagctatgttttgacggtatacaatcatgtatt 12800514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 23590641 - 23590749
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||    
T  23590641 agttttgcacttatgtgcaaaatgtctcctgaacttgaaaatttatat-tttttttccttatccttaaaagtgattacattatcactaaattgtggaaca 23590739  T
Q  107 tattagctaa 116  Q
    ||||||||||    
T  23590740 tattagctaa 23590749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 4630745 - 4630790
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatat 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630745 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatat 4630790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 17215246 - 17215306
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17215246 aaactaatgcatggcatacataatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 17215306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15739624 - 15739577
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15739624 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat 15739577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 52177313 - 52177266
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52177313 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat 52177266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 220765 - 220720
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  220765 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccttgaacttgaaaaattatat 220720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 6077418 - 6077361
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttt 121  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  6077418 cttatccttaaaagtgaatgcattatcactgaattatggagcataatagctaaatttt 6077361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 7389574 - 7389631
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttt 121  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  7389574 cttatccttaaaagtgaatgcattatcactgaattatggagcataatagctaaatttt 7389631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7862864 - 7862765
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7862864 agttttacacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat-atatttttcttatccttaaatgtgactgcattttcattgaattgtggagca 7862766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39334200 - 39334140
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39334200 aaaccaatgcatgacatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 39334140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 4941038 - 4940991
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  4941038 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccccgaacttaaaaatttatat 4940991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 36111642 - 36111689
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36111642 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat 36111689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25706033 - 25705985
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25706033 agttttgcacttatgtgcaaaatgtctcccgaacttgaaaatttatatg 25705985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 9359752 - 9359799
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  9359752 agttttgaacttatgtgtaaaatgccctttaaacttgaaaatttatat 9359799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 12594737 - 12594784
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12594737 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 12594784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 23161260 - 23161299
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaa 46  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23161260 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaa 23161299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 23465773 - 23465820
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  23465773 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccccgaacttaaaaatttatat 23465820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38575705 - 38575751
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38575705 agttttgcacttatgtgcaaaatg-ccctcgaacttgaaaatttatat 38575751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 40145809 - 40145856
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40145809 agttttacacttatgtgcaaaatgtcccccgaacttgaaaatttatat 40145856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 205119 - 205081
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaa 47  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  205119 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccttaaacttgaaaa 205081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 1565108 - 1565150
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaattta 51  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1565108 ttttgcacttatgtgtaaaatgccccttaaacttaaaaattta 1565150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48083882 - 48083832
Alignment:
Q  71 ttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttt 121  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  48083882 ttaaaagtgaatgcattatcactgaattgtgcagcatatgaactaagtttt 48083832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 55778172 - 55778130
Alignment:
Q  12 tgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55778172 tgcacttatgtgcaaaatgtctcctgaacttgaaaatttatat 55778130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 55842352 - 55842310
Alignment:
Q  12 tgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55842352 tgcacttatgtgcaaaatgtctcctgaacttgaaaatttatat 55842310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 7862024 - 7862077
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7862024 ccctaaagttttgcacttacgtgcaaaatgtcccccgaacttaaaaatttatat 7862077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22535912 - 22535859
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  22535912 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgcccctcaaacttaaaaatttatat 22535859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29617509 - 29617464
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29617509 ttttgcacttatgtgcaaaataccccttaaacttgaaaatttatat 29617464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 38392193 - 38392238
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38392193 ttttgcacttatgtgcaaaatggcccctaaacttgaaaatttatat 38392238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 39633516 - 39633471
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39633516 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat 39633471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 40034299 - 40034254
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40034299 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat 40034254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 41904662 - 41904617
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41904662 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 41904617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42987983 - 42987938
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  42987983 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccgtaaacttgaaaatttatat 42987938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 46614654 - 46614609
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  46614654 ttttgcacttatgtgtaaaatgccaaatgaacttgaaaatttatat 46614609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 26831693 - 26832055
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26831693 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatatatattttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 26831792  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |    
T  26831793 t-ttagctaagttttgacggtatacaataatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagta 26831891  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26831892 aagtacagccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 26831991  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26831992 cacagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 26832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Original strand, 15752388 - 15752742
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcat 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||||||    
T  15752388 gttttgcacttatgtgcaaagtgtcccttgaacttgaaaatttatat-ttttttttcttatctttaaaagtgattgcatta---ctgaattgtggagcat 15752483  T
Q  108 attagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaa 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15752484 attagataagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaccgatcaaacattaaccatccattagagcctaatgatataaaagtcagcatagcaa 15752583  T
Q  208 agtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtc 307  Q
    || ||| ||    |||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15752584 agaacaacc----ctgtcaaatagaaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtc 15752679  T
Q  308 aaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15752680 gaaatatatggctttgttattgctaatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 15752742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14103842 - 14103479
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtccct-tgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  14103842 agttttgtatttatgtgtaaaatgcccccatgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcattgaaatgtggagc 14103744  T
Q  106 atattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagc 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||     
T  14103743 atattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagt 14103644  T
Q  206 aaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatg 305  Q
    ||||||||  || || ||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14103643 aaagtacaatcatacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagata 14103544  T
Q  306 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14103543 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 14103479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14413859 - 14413496
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtccct-tgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  14413859 agttttgtatttatgtgtaaaatgcccccatgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcattgaaatgtggagc 14413761  T
Q  106 atattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagc 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||     
T  14413760 atattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagt 14413661  T
Q  206 aaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatg 305  Q
    ||||||||  || || ||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14413660 aaagtacaatcatacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagata 14413561  T
Q  306 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14413560 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 14413496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 370
Target Start/End: Original strand, 36897611 - 36897916
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaa-gtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaaca 162  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  36897611 cttatccttaaaaagtgactgcattatcactgaattgtagagcatattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaaca 36897710  T
Q  163 ttaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagca 262  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||  | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  36897711 ttaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttg--agatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagca 36897808  T
Q  263 catgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccc 362  Q
    ||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36897809 cataaataatacatgattggcatagtcaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattgcaaattttaaccacaccaaaaattttcacttcc 36897908  T
Q  363 tttatatt 370  Q
    ||||||||    
T  36897909 tttatatt 36897916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 26928236 - 26928494
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26928236 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatatatattttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 26928335  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |    
T  26928336 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaaatcagcatagta 26928435  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacat 265  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  26928436 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacat 26928494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 336
Target Start/End: Original strand, 42261054 - 42261242
Alignment:
Q  147 ctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||  ||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  42261054 ctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcttaatcaaatgaaattcagtatagcaa-gtacaaccacacatgtcagatagaaaaataatgcatga 42261152  T
Q  247 catagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt 336  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42261153 catacataataaagcacataaatgacatatgtttggtataaccaaaaattatcaagatgtcaaaatatatggttttgctattgctaattt 42261242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29418069 - 29417916
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  29418069 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatattttttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagca 29417971  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29417970 tattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 29417916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 14102981 - 14103115
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14102981 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaatttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 14103079  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14103080 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 14103115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 14412998 - 14413132
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14412998 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaatttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 14413096  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14413097 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 14413132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15753197 - 15753119
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15753197 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagccaagttttaacggtatacaaccatatatt 15753119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 42260899 - 42260998
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacat 163  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42260899 cttatccttagaagtgactgcattatcactga-ttgtgaaacatattagctaaattttgacggtatacaaccatatatgttctctgaaacgatcaaacat 42260997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 17774454 - 17774605
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||         ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||    
T  17774454 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaaattgaaaatttatat--attttttcttatccttaaaagtgactacattgtcactga-ttgtgaatca 17774550  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17774551 tattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 17774605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26832502 - 26832424
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26832502 cttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgcggagcatattagctatgttttgacgatatacaaccatatatt 26832424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44950594 - 44950521
Alignment:
Q  68 tccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44950594 tccttaaaagtgactgcattatcattgaattgtggagcatattagctaag-tttgacggtatacaaccatatatt 44950521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34959090 - 34958968
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||    
T  34959090 agttttacacttatgtgcaaaatgtcccctgaacttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcgctg-attgtgaagca 34958992  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtata 130  Q
    |||||| ||||||||  |||||||    
T  34958991 tattagttaagttttgtcggtata 34958968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34956231 - 34956171
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34956231 aaactaatgcatgacatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 34956171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 43759652 - 43759749
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43759652 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatctttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagc 43759749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29417919 - 29417859
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29417919 aaactaatgcatggcatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 29417859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 33227831 - 33227878
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33227831 agttttgcacttatgtgcaaaatgcccgttgaacttgaaaatttatat 33227878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 16083148 - 16083193
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16083148 ttttgcacttatgtgcaaaatgacccttaaacttgaaaatttatat 16083193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24213310 - 24213265
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24213310 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccttaaacttgaaaatttatat 24213265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 33210425 - 33210470
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33210425 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat 33210470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 34345891 - 34345846
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34345891 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctcaacttgaaaatttatat 34345846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2755958 - 2755911
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  2755958 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccatgaacttaaaaatttatat 2755911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 23678811 - 23678764
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23678811 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 23678764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 31308402 - 31308448
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31308402 agttttgcacttatgtgcaaaatg-cccctgaacttgaaaatttatat 31308448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 21125612 - 21125574
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaa 45  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21125612 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaa 21125574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29644935 - 29644889
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  29644935 gttttgcacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatatatat 29644889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19072121 - 19072076
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19072121 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 19072076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 21366409 - 21366454
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21366409 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 21366454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 34345388 - 34345433
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34345388 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 34345433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 35668455 - 35668410
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  35668455 ttttgcacttatgtgtaaaatgccccctaaacttaaaaatttatat 35668410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36898319 - 36898282
Alignment:
Q  105 catattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36898319 catattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 36898282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36898388 - 36898351
Alignment:
Q  105 catattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36898388 catattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 36898351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 38184340 - 38184385
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38184340 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 38184385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 38449974 - 38450019
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  38449974 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttaaaaatttatat 38450019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 48343734 - 48343779
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48343734 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 48343779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 33696651 - 33696699
Alignment:
Q  6 gagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  33696651 gagttttgcacttatgtgcaaaatgctccccgaacttgaaaatttatat 33696699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 45259061 - 45259109
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  45259061 agttttgcacttatgtgtaaaatgccccccaaacttaaaaatttatatg 45259109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6915373 - 6915022
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  6915373 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaattaatat--tttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcacttaattgtagagca 6915276  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||    
T  6915275 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaatcatgtattagagcctaatgatatgaaagtcaacataaca 6915176  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||          |||| ||    
T  6915175 aagtacaaccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataacc----------aagacgt 6915086  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  6915085 caaaatatatggctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaattcccacttcctttatatt 6915022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 5574136 - 5574489
Alignment:
Q  15 acttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagct 114  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5574136 acttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattaccactgaattgtggagcat-ttagct 5574233  T
Q  115 aagtttttacggtatacaaccatatat-tttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtaca 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  5574234 aagttttgacggtatacaatcatatatgtttcttt-aaacgttcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtaca 5574332  T
Q  214 gccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaata 313  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  5574333 gccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccgataattaccaagatgtcacagta 5574432  T
Q  314 tatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5574433 tatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 5574489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17648309 - 17647948
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17648309 agttttgtacttatgtgcaaaatgcctcctgaacttaaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactaaattgtggagca 17648211  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  17648210 tattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 17648111  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17648110 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatatatgattgacataaccaagaattaacaagatgt 17648011  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17648010 cagagtatatggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaa-tttcacttcctttatatt 17647948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 17647443 - 17647583
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17647443 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgt 17647541  T
Q  101 ggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17647542 ggagcatattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 17647583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24087432 - 24087261
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||         ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24087432 agttttgtatttatgtgcaaaatgtcacatgaacttgaaaatttttat-atttttttcttatccttaaaattgactgcattatcactgaattgtgaagca 24087334  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagag 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24087333 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccaagtattagag 24087261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19293175 - 19293021
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnn-cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagc 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19293175 agttttgcacttatgtgcaaaatatcccctgaacttgaaaatttatatatttttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagc 19293077  T
Q  106 atattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19293076 atattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 19293021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5577315 - 5577166
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  5577315 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacatgaaaatttatat--tttttttcttatccttaaaagtgactgcattgtcactga-ttgtgaagcata 5577219  T
Q  109 ttagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5577218 ttaactaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 5577166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5574986 - 5574852
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  5574986 agttttgcacttatatgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgtattatcactgaattgtggagca 5574888  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5574887 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 5574852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26359801 - 26359676
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  26359801 agttttgtactcatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggaaca 26359703  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaa 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26359702 tattagctaagttttgacggtatacaa 26359676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 26359302 - 26359436
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||         ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  26359302 agttttgcatttatgtgcaaaatgtcccctaaacttaaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagta 26359400  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26359401 tattaactaagttttgacgatatacaaccatatatt 26359436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8505950 - 8505843
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8505950 agttttgtacttatgtgcaaaatgccctctgaacttgaaaatttatatattttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 8505851  T
Q  107 tattagct 114  Q
    ||||||||    
T  8505850 tattagct 8505843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20731538 - 20731469
Alignment:
Q  232 aaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20731538 aaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataactaagaattaccaa 20731469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 6914284 - 6914419
Alignment:
Q  2 cctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtg 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||     
T  6914284 cctaaagttttgcgcttatgtgcaaaatgtctcttgaacttgaaaatttatat---ttttttcttatccttaaaa-tgactgcattatcactcaattgta 6914379  T
Q  102 gagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  6914380 gagcatattagctaagttttgacgat-tacaactatatatt 6914419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5577169 - 5577109
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5577169 aaactaatgcatgacatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 5577109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19293024 - 19292964
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19293024 aaactaatgcatgacatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 19292964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 6809423 - 6809376
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6809423 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat 6809376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37895910 - 37895848
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacgg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  37895910 cttatccttaaaaatgactgcattatcacttaattgtggagcatattaattaagttttgacgg 37895848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 20731022 - 20731069
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20731022 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgcacttgaaaatttatat 20731069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 34217245 - 34217198
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34217245 agttttgcacttatgtgcaaaatgtccgttgaacttaaaaatttatat 34217198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 38424900 - 38424853
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38424900 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccatgaacttgaaaatttatat 38424853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14197934 - 14197888
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14197934 gttttgcacttatatgcaaaatgccccttgaacttgaaaatttatat 14197888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 25751872 - 25751917
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25751872 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat 25751917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 38090493 - 38090538
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38090493 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccataaacttgaaaatttatat 38090538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2301346 - 2301299
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2301346 agttttacacttatgtgcaaaatgcccctttaacttgaaaatttatat 2301299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 7950952 - 7950999
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7950952 agttttgcactaatgtgcaaaataccccttgaacttgaaaatttatat 7950999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38424265 - 38424312
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  38424265 agttttgcacttatgtgcaaaatatccctcgaacttaaaaatttatat 38424312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 38977723 - 38977762
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaa 46  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38977723 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaa 38977762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 9587668 - 9587722
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9587668 ccctaaagttttgcatttatatgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatatg 9587722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 746506 - 746551
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  746506 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 746551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2745440 - 2745395
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  2745440 ttttgcacttatgtgcaaaacgccccttaaacttgaaaatttatat 2745395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20731163 - 20731087
Alignment:
Q  200 catagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatg 277  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||  |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20731163 catagcaaagtacaaccacac-tctcggatggaaaaataatacatgacatgcataatgaagcacataaatgatatatg 20731087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 27500863 - 27500818
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27500863 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 27500818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 29235619 - 29235664
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29235619 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat 29235664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29836020 - 29835975
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  29836020 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccataaatttgaaaatttatat 29835975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 36778357 - 36778402
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36778357 ttttgcacttatatgcaaaatgtccctcaaacttgaaaatttatat 36778402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 1468 - 1829
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1468 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcattgaattgtggagca 1566  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| |    
T  1567 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatgttcctttaatcgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaa-gtcagcatagta 1665  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  1666 aagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattcgcataactaagaattatcaagatgt 1765  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1766 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt 1829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2319 - 2186
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||         ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  2319 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccca-aacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaaatgattgcattatcactgaattgtggagca 2222  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  2221 tattagctaagttttgatgatatacaaccatatatt 2186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15830873 - 15830513
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15830873 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatatttttttt---ttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 15830777  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |    
T  15830776 tattagctaagttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagta 15830677  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15830676 aagtacaaccacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 15830577  T
Q  307 caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15830576 caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatatt 15830513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Original strand, 36207136 - 36207486
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36207136 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccatgaacttgaaaatttatat---ttttttcttattcttaaaagtgattgcattatcacttaattgtggagcat 36207232  T
Q  108 attagctaagtttttacggtata--caaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  36207233 attagctaagttttgacggtatatacaaccatatatgttccctgaaacgaacaaacattaaccatgtattagagc-taatgatatgaaagtcagcatagc 36207331  T
Q  206 aaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatg 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||          |||||||||    
T  36207332 aaagtacaaccacacctgtcacatggaaaattaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacata----------accaagatg 36207421  T
Q  306 tcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  36207422 tcaacatatatgcctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaatttcaacttcctttatatt 36207486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9708903 - 9708532
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9708903 agttttgtacttatgtgcaaaatgccccctgaactttaaaatttatat--tttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 9708806  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  9708805 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagta 9708706  T
Q  207 aagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 306  Q
    ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9708705 aagtagaatcacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgt 9708606  T
Q  307 ----------caaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9708605 caaaggatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt 9708532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 293
Target Start/End: Original strand, 38937576 - 38937804
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacat 163  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||| ||    
T  38937576 cttattcttaaaagtgactgcattatcactga-ttgtaaaacatattagataagttttgacggtatacaaccacatatgttacatgaaacgatcaaaaat 38937674  T
Q  164 taaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcac 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||  |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |  ||||| |||    
T  38937675 taaccatgtattagagcctgatgatgtgaaagtcagcataataaagtacaactacacctgtcagatgaaaaactaatgcatagcatacacgatgaaacac 38937774  T
Q  264 atgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38937775 ataaatgacatataattggcataaccaaga 38937804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3107001 - 3106830
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3107001 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccatgaacttaaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagca 3106903  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagag 179  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3106902 tattagttaagttttaacgatatacaaccatatatgttccctgaaacgaccaaacattaaccatgtattagag 3106830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 9708033 - 9708167
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9708033 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcactgaattgtggagca 9708131  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9708132 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 9708167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 15830070 - 15830148
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  15830070 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcataatagctaagttttgacgatatataaccatatatt 15830148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36207989 - 36207849
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||         ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  36207989 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgctctctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaaatgaatgcattatcactgaattgt 36207891  T
Q  101 ggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36207890 ggacaatattagctaagttttgacggtatacaatcatatatt 36207849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 7277938 - 7278139
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||||||||||||         ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||    
T  7277938 agttttgcacttatgtgcgaaattccccctggacttgaaaatttatat-atttttttcttattcttaaaagtgactgcattatcactgaactatgaagca 7278036  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagca 206  Q
    ||||| ||||||||| ||          ||||||| |||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  7278037 tattaactaagttttgac----------catatatgttccataaaacgatcaaacattaaccgcgtattagagcataatgatatgatagtcagcatagca 7278126  T
Q  207 aagtacagccaca 219  Q
    ||||||| |||||    
T  7278127 aagtacacccaca 7278139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 4646057 - 4646177
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||         |||||||||||||||  ||| |||||||| || |||| |||||    
T  4646057 agttttgcacttatttgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat--attttttcttatccttaaaagtggctgaattatcaccgacttgtagagca 4646154  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  4646155 tattagctaagttttgacggtat 4646177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 3106313 - 3106360
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3106313 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat 3106360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 7337941 - 7337988
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7337941 agttttgcacttaagtgcaaaatgacccttgaacttgaaaatttatat 7337988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38935883 - 38935930
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38935883 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccgtgaacttgaaaatttatat 38935930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18060454 - 18060409
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18060454 ttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat 18060409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 12138649 - 12138688
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaa 46  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12138649 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttgaaa 12138688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20463621 - 20463574
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20463621 agttttacacttatgtgcaaaatgctccttgaacttgaaaatttatat 20463574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 23849113 - 23849160
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23849113 agttttgcaattatgtgcaaaatgtcccccgaacttgaaaatttatat 23849160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 35059159 - 35059112
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  35059159 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 35059112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 41425578 - 41425624
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttata 53  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  41425578 agttttgcacttatgtgcaaaataccccatgaacttgaaaatttata 41425624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Original strand, 1090670 - 1090707
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttga 44  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1090670 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccttgaacttga 1090707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21545298 - 21545253
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttat 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||    
T  21545298 agttttgcacttatgtgcaaaatgcctcctgaacttgaaaatttat 21545253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 43207014 - 43207059
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43207014 ttttgcatttatgtgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat 43207059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 44747927 - 44747874
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||    
T  44747927 ccctaaagttttgcacttatgtgcaaaatgcccatcgaacttaaaaatttatat 44747874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 22064068 - 22064116
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatg 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  22064068 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttaaaaatttatatg 22064116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1563923 - 1563569
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcat 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||||||    
T  1563923 gttttgcacttatgtgcaaagtgtcccttgaacttgaaaatttatat-ttttttttcttatctttaaaagtgattgcatta---ctgaattgtggagcat 1563828  T
Q  108 attagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagcatagcaa 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1563827 attagataagttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaccgatcaaacattaaccatccattagagcctaatgatataaaagtcagcatagcaa 1563728  T
Q  208 agtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtc 307  Q
    || ||| ||    |||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1563727 agaacaacc----ctgtcaaatagaaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtc 1563632  T
Q  308 aaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1563631 gaaatatatggctttgttattgctaatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt 1563569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11099915 - 11099740
Alignment:
Q  8 gttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcat 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11099915 gttttgtacttatgtgtaaaatgtcccctgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatccttaaaagtgactgcattatcactaaattgtggagcat 11099817  T
Q  108 attagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaa 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11099816 attagctaagttttgacggtatacaaccatatatgctcctttatacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaa 11099740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11099738 - 11099595
Alignment:
Q  227 catggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgcta 326  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11099738 catggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggcttcgcta 11099639  T
Q  327 ttgctaattttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11099638 ttgctaattttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatatt 11099595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28538216 - 28538051
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||         || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28538216 agttttgtacttatgtgcaaaatgtcctctgaacttgaaaaattatatatttttttcct-atccttaaaagtgactgcattatcactaaattgtggagca 28538118  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgta 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  28538117 tattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgta 28538051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23075269 - 23075118
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  23075269 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctgaacttgaaaatttatat--ttttattcttatccttaaaagtgattgcattgtcactga-ttgtgaagca 23075173  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaac 161  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23075172 tattagctaagttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaac 23075118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 1563114 - 1563192
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1563114 cttatccttaaaagtgactgcattatcactgaattgtggagcatattagccaagttttaacggtatacaaccatatatt 1563192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 28537688 - 28537822
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  28537688 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgtattatcactgaattttggagca 28537786  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28537787 tattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 28537822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 11099094 - 11099228
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  11099094 agttttgtacttatttgcaaaatgtcccctaaacttgaaaatttatat-tttgttttcttatccttaaaagtgattgcattatcggtgaattgtggagca 11099192  T
Q  107 tattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11099193 aattagctaagttttgacgatatacaaccatatatt 11099228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23075121 - 23075061
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23075121 aaactaatgcatggcatacatgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga 23075061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 25404242 - 25404289
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  25404242 agttttgcacttatgtgcaaaatgtcccctaaacttaaaaatttatat 25404289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 8590625 - 8590580
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8590625 ttttgcacttatgtgcaaaatgcccgctgaacttgaaaatttatat 8590580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 16894579 - 16894624
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16894579 ttttgcacttatgtgcaaaatgccccataaacttgaaaatttatat 16894624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 32597155 - 32597110
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  32597155 ttttgcacttatgtgcaaaatgctccttaaacttgaaaatttatat 32597110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42407 - 42198
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42407 ccctaaagttttgtacttatgtgcaaaatgccccgtgaacttgaaaatttatat-atttttttcttatctttaaaagtgactgcattatcactgaattgt 42309  T
Q  101 ggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatataaaagacagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  42308 ggagcatattagctaagttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagc 42209  T
Q  201 atagcaaagta 211  Q
    |||| ||||||    
T  42208 atagtaaagta 42198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13098 - 12971
Alignment:
Q  233 aaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgcta 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13098 aaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaaga----------tgtcaaaatatatggctttgttattgcta 13009  T
Q  333 attttaaccacaccaaaaattttcactccctttatatt 370  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13008 attttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatatt 12971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12772
Alignment:
Q  64 cttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagcatattagctaagtttttacggtatacaaccatatatt 142  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12694 cttatccctaaaagtgattgtattatcactgaattgtagagcatattagctaagttttgagggtatacaaccatatatt 12772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 425172 - 425054
Alignment:
Q  174 ttagagcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgaca 273  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  425172 ttagagcctaatt-tatgaaagtcagcatagcaaagtacaacaacacctgtcagattgaaaactaatccatgacatacataatgaagcacataaatgaca 425074  T
Q  274 tatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  425073 tatgattggcataaccaaga 425054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 407739 - 407643
Alignment:
Q  198 agcatagcaaa-gtacagccacacctgtcacatggaaaactaatgcatgacatagataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaaga 293  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  407739 agcatagcaaaagtacaacaacacatgtcagattgaaaactaatgcatgacatacaaaatgaagaacataaatgacatatgattggaataaccaaga 407643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 22290 - 22402
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatatgnnnnnnnncttatccttaaaagtcactgcattatcactgaattgtggagca 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||         ||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  22290 agttttgtacttatgtgcaaaataccccctgaacttgaaaatttatat-tttttttccttatacttaaaagtgactactttatcactaaattgtggaaca 22388  T
Q  107 tattagctaagttt 120  Q
    ||||||||||||||    
T  22389 tattagctaagttt 22402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0945 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0945
Description:

Target: scaffold0945; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2149 - 2102
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  2149 agttttgcacttatgtgcaaaatgcccatcgaacttgaaaatttatat 2102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 3390 - 3437
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3390 agttttgcacttatgtgcaaaatgccccccgaacttgaaaatttatat 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 67271 - 67224
Alignment:
Q  7 agttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  67271 agttttacacttatgtgcaaaatgacccctgaacttgaaaatttatat 67224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 28643 - 28598
Alignment:
Q  9 ttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttatat 54  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28643 ttttacacttatgtgcaaaatgccccttaaacttgaaaatttatat 28598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34201 - 34150
Alignment:
Q  1 ccctagagttttgcacttatgtgtaaaatgtcccttgaacttgaaaatttata 53  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34201 ccctaaagttttacacttaagtgcaaaatg-cccttgaacttgaaaatttata 34150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University