View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8035_low_1 (Length: 891)

Name: NF8035_low_1
Description: NF8035
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8035_low_1
NF8035_low_1
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (85-378)||(5486144-5486437)
chr4 (413-749)||(52949600-52949936)
chr4 (416-747)||(50178365-50178698)
chr4 (418-753)||(20802406-20802743)
chr4 (416-754)||(24002211-24002552)
chr4 (416-754)||(23521753-23522093)
chr4 (416-753)||(44649037-44649373)
chr4 (440-756)||(47642388-47642705)
chr4 (416-756)||(56154492-56154834)
chr4 (416-756)||(29785409-29785752)
chr4 (416-752)||(12600761-12601099)
chr4 (419-753)||(49151976-49152311)
chr4 (417-752)||(55065207-55065543)
chr4 (416-755)||(38486130-38486466)
chr4 (419-756)||(9512216-9512555)
chr4 (416-753)||(21579900-21580238)
chr4 (421-689)||(2725011-2725280)
chr4 (438-762)||(37865618-37865944)
chr4 (416-753)||(52319200-52319541)
chr4 (416-754)||(33176905-33177245)
chr4 (416-756)||(9807028-9807368)
chr4 (416-702)||(33552715-33553003)
chr4 (418-664)||(38812484-38812731)
chr4 (419-719)||(55593793-55594096)
chr4 (416-664)||(46680383-46680632)
chr4 (416-664)||(50727786-50728035)
chr4 (416-664)||(50735800-50736049)
chr4 (446-753)||(21202614-21202922)
chr4 (419-694)||(32181197-32181473)
chr4 (418-719)||(6776486-6776789)
chr4 (416-753)||(3649511-3649849)
chr4 (416-715)||(20517894-20518196)
chr4 (422-754)||(20694249-20694578)
chr4 (416-621)||(36885939-36886145)
chr4 (417-702)||(47361287-47361570)
chr4 (418-755)||(29592773-29593106)
chr4 (411-700)||(44324210-44324500)
chr4 (416-751)||(16320398-16320731)
chr4 (415-754)||(36743561-36743901)
chr4 (472-756)||(37695470-37695755)
chr4 (416-621)||(1231318-1231524)
chr4 (416-621)||(36497224-36497430)
chr4 (419-719)||(54542898-54543198)
chr4 (418-754)||(2786838-2787175)
chr4 (419-670)||(41711805-41712057)
chr4 (416-609)||(2629824-2630018)
chr4 (423-616)||(24210331-24210525)
chr4 (416-745)||(50186411-50186741)
chr4 (418-621)||(4325798-4326002)
chr4 (522-754)||(43640972-43641205)
chr4 (418-747)||(42869862-42870182)
chr4 (416-664)||(29616134-29616379)
chr4 (416-621)||(50729415-50729621)
chr4 (416-669)||(11056001-11056255)
chr4 (416-754)||(22318257-22318596)
chr4 (418-621)||(28115259-28115462)
chr4 (450-747)||(34929795-34930094)
chr4 (422-667)||(39078622-39078868)
chr4 (411-754)||(7554825-7555169)
chr4 (416-702)||(26083264-26083550)
chr4 (418-713)||(53200518-53200815)
chr4 (418-575)||(6973788-6973946)
chr4 (528-747)||(37931801-37932020)
chr4 (419-550)||(14296645-14296777)
chr4 (419-550)||(14314893-14315025)
chr4 (417-752)||(30942664-30943000)
chr4 (417-584)||(42772832-42773000)
chr4 (418-621)||(23327925-23328107)
chr4 (418-595)||(25978487-25978664)
chr4 (673-755)||(52949517-52949599)
chr4 (571-753)||(14296471-14296654)
chr4 (521-747)||(13110209-13110434)
chr4 (571-753)||(14314719-14314902)
chr4 (474-610)||(9947947-9948084)
chr4 (418-548)||(56487162-56487288)
chr4 (519-616)||(43739473-43739570)
chr4 (57-142)||(5437599-5437684)
chr4 (540-712)||(7001770-7001940)
chr4 (790-851)||(5484369-5484430)
chr4 (474-620)||(45577619-45577770)
chr4 (543-609)||(38520518-38520584)
chr4 (475-610)||(3579142-3579279)
chr4 (369-409)||(5484499-5484539)
chr4 (416-492)||(13110443-13110519)
chr4 (416-474)||(2114191-2114249)
chr4 (643-753)||(50729627-50729737)
chr4 (17-54)||(5487179-5487216)
chr4 (568-662)||(42772724-42772818)
chr4 (418-495)||(44640457-44640533)
chr4 (706-754)||(36497105-36497153)
chr4 (691-754)||(36885819-36885882)
chr4 (519-609)||(52673830-52673920)
chr4 (559-620)||(40792425-40792486)
chr4 (582-664)||(56487292-56487374)
chr4 (57-89)||(5487110-5487142)
chr4 (544-616)||(21098546-21098618)
chr4 (692-747)||(38812420-38812475)
chr4 (692-747)||(46680641-46680696)
chr4 (712-753)||(2725288-2725329)
chr4 (57-98)||(5458897-5458938)
chr4 (691-752)||(11055161-11055222)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (416-755)||(31644317-31644656)
chr5 (418-752)||(3735230-3735565)
chr5 (416-747)||(11963218-11963551)
chr5 (422-754)||(7523041-7523376)
chr5 (416-754)||(35701147-35701487)
chr5 (418-755)||(32528584-32528923)
chr5 (416-752)||(2351552-2351890)
chr5 (416-748)||(7770165-7770498)
chr5 (416-756)||(4689584-4689925)
chr5 (416-746)||(34794765-34795097)
chr5 (415-753)||(39918379-39918718)
chr5 (404-752)||(24036105-24036451)
chr5 (419-719)||(31770480-31770782)
chr5 (418-702)||(24181512-24181798)
chr5 (416-753)||(8136710-8137047)
chr5 (416-702)||(31879962-31880250)
chr5 (475-752)||(4818085-4818364)
chr5 (417-702)||(29241300-29241587)
chr5 (416-753)||(18470314-18470652)
chr5 (433-753)||(22493322-22493643)
chr5 (418-753)||(6284188-6284524)
chr5 (462-753)||(21739093-21739381)
chr5 (423-754)||(41790356-41790688)
chr5 (416-702)||(7208116-7208404)
chr5 (416-702)||(41459511-41459798)
chr5 (423-754)||(7725702-7726034)
chr5 (418-616)||(39788202-39788401)
chr5 (422-663)||(553358-553601)
chr5 (422-758)||(32092874-32093208)
chr5 (416-664)||(40489298-40489546)
chr5 (418-702)||(23091192-23091478)
chr5 (538-753)||(40182335-40182551)
chr5 (413-689)||(5571540-5571803)
chr5 (416-669)||(8560868-8561121)
chr5 (471-621)||(28090461-28090612)
chr5 (416-620)||(27838960-27839164)
chr5 (418-621)||(5598484-5598688)
chr5 (450-732)||(700521-700805)
chr5 (416-752)||(37148475-37148797)
chr5 (464-621)||(22432243-22432401)
chr5 (427-747)||(5673021-5673329)
chr5 (416-532)||(4664924-4665041)
chr5 (416-620)||(17031162-17031367)
chr5 (645-753)||(20119642-20119750)
chr5 (691-754)||(548218-548281)
chr5 (646-754)||(27839187-27839295)
chr5 (416-453)||(21739016-21739053)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (416-753)||(31882896-31883234)
chr3 (416-755)||(50386330-50386670)
chr3 (416-754)||(33364652-33364991)
chr3 (416-756)||(28675659-28676001)
chr3 (417-756)||(51259655-51259996)
chr3 (418-747)||(29584753-29585084)
chr3 (416-745)||(12349045-12349376)
chr3 (418-747)||(47958308-47958639)
chr3 (422-754)||(1344587-1344921)
chr3 (416-747)||(2134948-2135281)
chr3 (416-747)||(21221235-21221567)
chr3 (411-717)||(40094411-40094719)
chr3 (416-754)||(51925082-51925421)
chr3 (416-747)||(3864551-3864881)
chr3 (413-747)||(25927198-25927535)
chr3 (433-747)||(25860312-25860628)
chr3 (438-702)||(20609544-20609810)
chr3 (418-702)||(44116862-44117148)
chr3 (427-702)||(34026590-34026867)
chr3 (417-754)||(4851338-4851670)
chr3 (416-752)||(38213227-38213565)
chr3 (416-712)||(42636277-42636575)
chr3 (416-664)||(20255007-20255255)
chr3 (419-756)||(39052715-39053055)
chr3 (422-756)||(24571151-24571486)
chr3 (416-756)||(53557669-53558011)
chr3 (419-750)||(3964164-3964496)
chr3 (416-753)||(21373812-21374141)
chr3 (416-754)||(5442162-5442490)
chr3 (416-658)||(49748785-49749028)
chr3 (416-747)||(29645944-29646277)
chr3 (416-752)||(22484617-22484954)
chr3 (417-663)||(51296544-51296789)
chr3 (415-746)||(3867522-3867849)
chr3 (421-754)||(10747089-10747406)
chr3 (416-615)||(50678809-50679009)
chr3 (423-669)||(54622678-54622924)
chr3 (473-752)||(26282315-26282599)
chr3 (419-621)||(19906767-19906970)
chr3 (416-753)||(45690780-45691112)
chr3 (417-615)||(24721496-24721695)
chr3 (416-621)||(3695181-3695372)
chr3 (416-563)||(41682927-41683075)
chr3 (416-511)||(43175591-43175686)
chr3 (477-619)||(39215404-39215547)
chr3 (565-747)||(53046670-53046848)
chr3 (416-584)||(6179467-6179637)
chr3 (565-755)||(41694925-41695094)
chr3 (433-621)||(52300442-52300633)
chr3 (477-616)||(34351303-34351443)
chr3 (425-620)||(44000267-44000462)
chr3 (544-680)||(44267688-44267824)
chr3 (632-753)||(43175441-43175563)
chr3 (522-669)||(25954408-25954554)
chr3 (522-609)||(8648538-8648625)
chr3 (415-616)||(8253684-8253885)
chr3 (513-609)||(14155433-14155528)
chr3 (476-538)||(53046605-53046668)
chr3 (706-754)||(20254946-20254994)
chr3 (422-603)||(26847349-26847532)
chr3 (566-620)||(8067082-8067136)
chr3 (540-610)||(19190717-19190786)
chr3 (551-609)||(23322158-23322216)
chr3 (571-609)||(32621886-32621924)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (415-751)||(31004015-31004352)
chr1 (416-753)||(50304532-50304870)
chr1 (416-754)||(844679-845019)
chr1 (416-754)||(42510404-42510744)
chr1 (416-753)||(42512725-42513060)
chr1 (418-756)||(6711003-6711344)
chr1 (419-753)||(16386734-16387069)
chr1 (417-753)||(1351391-1351728)
chr1 (416-747)||(51264381-51264714)
chr1 (418-747)||(16451013-16451344)
chr1 (416-753)||(41972792-41973130)
chr1 (415-747)||(45490829-45491163)
chr1 (422-747)||(32270244-32270566)
chr1 (417-756)||(35387267-35387608)
chr1 (416-747)||(24339593-24339925)
chr1 (419-753)||(28340262-28340597)
chr1 (417-663)||(32289300-32289547)
chr1 (416-702)||(26118170-26118458)
chr1 (448-747)||(12890124-12890425)
chr1 (419-754)||(7183797-7184134)
chr1 (418-756)||(50540221-50540561)
chr1 (416-752)||(17887828-17888167)
chr1 (418-752)||(41967805-41968142)
chr1 (416-751)||(11772587-11772923)
chr1 (416-754)||(16476110-16476449)
chr1 (416-756)||(6029251-6029597)
chr1 (416-702)||(30105634-30105923)
chr1 (418-754)||(39281774-39282111)
chr1 (416-747)||(44737997-44738329)
chr1 (423-674)||(16437322-16437574)
chr1 (418-747)||(17327606-17327937)
chr1 (539-752)||(38663014-38663227)
chr1 (416-700)||(45658755-45659040)
chr1 (418-752)||(1601049-1601387)
chr1 (416-735)||(15539845-15540165)
chr1 (417-753)||(46154780-46155125)
chr1 (416-752)||(51703118-51703455)
chr1 (418-621)||(5109742-5109945)
chr1 (416-752)||(26764750-26765082)
chr1 (422-747)||(6143947-6144273)
chr1 (414-621)||(49303307-49303515)
chr1 (448-747)||(13994062-13994362)
chr1 (446-755)||(16704604-16704915)
chr1 (521-757)||(25539732-25539968)
chr1 (438-747)||(38086973-38087283)
chr1 (416-747)||(10384254-10384581)
chr1 (416-664)||(42705192-42705442)
chr1 (422-664)||(3414814-3415058)
chr1 (418-618)||(7837149-7837351)
chr1 (455-665)||(50382394-50382608)
chr1 (418-548)||(8838983-8839114)
chr1 (416-519)||(21071730-21071833)
chr1 (419-511)||(38663231-38663323)
chr1 (480-702)||(20494927-20495134)
chr1 (416-610)||(26733579-26733774)
chr1 (466-669)||(25343213-25343418)
chr1 (679-751)||(23799683-23799755)
chr1 (416-495)||(40811326-40811405)
chr1 (547-620)||(46815816-46815889)
chr1 (473-620)||(6771382-6771530)
chr1 (464-618)||(504394-504549)
chr1 (475-616)||(570404-570549)
chr1 (549-702)||(34663858-34664012)
chr1 (464-575)||(7837433-7837545)
chr1 (526-593)||(23799603-23799670)
chr1 (418-615)||(39792826-39793023)
chr1 (547-617)||(40610739-40610809)
chr1 (416-472)||(25539981-25540037)
chr1 (560-616)||(33316435-33316491)
chr1 (550-621)||(16643272-16643343)
chr1 (561-620)||(46447678-46447737)
chr1 (642-752)||(8838820-8838930)
chr1 (417-495)||(17291718-17291796)
chr1 (706-756)||(34663819-34663869)
chr1 (416-461)||(16643187-16643232)
chr1 (544-609)||(21763187-21763252)
chr1 (584-618)||(30105007-30105041)
chr1 (474-575)||(30798605-30798706)
chr1 (632-669)||(21071689-21071726)
chr1 (723-756)||(30105929-30105962)
chr1 (565-610)||(32467926-32467971)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (416-756)||(43368074-43368415)
chr7 (416-752)||(47953066-47953404)
chr7 (416-752)||(26994106-26994444)
chr7 (416-754)||(10932438-10932778)
chr7 (416-753)||(34295292-34295623)
chr7 (418-753)||(3922586-3922923)
chr7 (416-754)||(36769450-36769790)
chr7 (419-753)||(11321769-11322105)
chr7 (416-756)||(38301221-38301557)
chr7 (419-747)||(21784752-21785082)
chr7 (416-747)||(43158567-43158900)
chr7 (416-754)||(18386399-18386738)
chr7 (424-747)||(18470565-18470888)
chr7 (416-756)||(9913398-9913738)
chr7 (416-756)||(9927086-9927426)
chr7 (416-756)||(46633569-46633906)
chr7 (416-747)||(41211081-41211415)
chr7 (416-747)||(1870015-1870349)
chr7 (416-741)||(26371690-26372017)
chr7 (417-747)||(32873654-32873983)
chr7 (417-754)||(43189124-43189464)
chr7 (416-747)||(30849127-30849460)
chr7 (411-702)||(40753081-40753374)
chr7 (411-755)||(43213801-43214141)
chr7 (417-754)||(48894592-48894930)
chr7 (416-664)||(47316579-47316828)
chr7 (419-747)||(329352-329687)
chr7 (419-664)||(44748660-44748906)
chr7 (416-664)||(29661288-29661536)
chr7 (416-689)||(11250561-11250831)
chr7 (538-750)||(26652745-26652957)
chr7 (466-756)||(30598939-30599231)
chr7 (419-753)||(20127163-20127500)
chr7 (453-753)||(23349209-23349510)
chr7 (416-730)||(1363536-1363850)
chr7 (423-746)||(3891930-3892239)
chr7 (416-669)||(17237036-17237290)
chr7 (422-747)||(37966856-37967182)
chr7 (416-744)||(11822116-11822437)
chr7 (416-593)||(16963174-16963352)
chr7 (448-742)||(22724444-22724739)
chr7 (416-745)||(48445405-48445735)
chr7 (453-747)||(21133252-21133549)
chr7 (416-746)||(22723913-22724244)
chr7 (416-610)||(34519527-34519722)
chr7 (565-752)||(47947636-47947824)
chr7 (417-610)||(26910293-26910486)
chr7 (540-747)||(41665581-41665788)
chr7 (416-669)||(46448525-46448779)
chr7 (519-753)||(46408771-46408998)
chr7 (500-669)||(34117412-34117581)
chr7 (418-519)||(26700588-26700689)
chr7 (632-753)||(12982178-12982300)
chr7 (417-669)||(15035133-15035388)
chr7 (527-610)||(48699417-48699500)
chr7 (416-510)||(41665479-41665573)
chr7 (538-608)||(22631759-22631829)
chr7 (519-600)||(29372764-29372845)
chr7 (551-616)||(42332072-42332137)
chr7 (546-610)||(35645466-35645530)
chr7 (540-664)||(46627135-46627259)
chr7 (706-756)||(16962984-16963034)
chr7 (706-756)||(40753042-40753092)
chr7 (685-747)||(47316835-47316897)
chr7 (521-602)||(8360580-8360660)
chr7 (588-621)||(16963116-16963149)
chr7 (691-752)||(34117349-34117410)
chr7 (559-619)||(8453285-8453344)
chr7 (464-620)||(29455778-29455933)
chr7 (583-620)||(7958635-7958672)
chr7 (416-497)||(16027808-16027889)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (416-753)||(34338681-34339020)
chr2 (416-742)||(9732810-9733138)
chr2 (417-754)||(18685706-18686045)
chr2 (416-753)||(33366481-33366820)
chr2 (423-753)||(35114656-35114988)
chr2 (417-754)||(2644968-2645306)
chr2 (418-755)||(32497784-32498123)
chr2 (418-753)||(30326214-30326550)
chr2 (418-753)||(37308527-37308864)
chr2 (419-747)||(19513571-19513902)
chr2 (416-664)||(7761453-7761702)
chr2 (417-747)||(17540591-17540924)
chr2 (416-702)||(33889165-33889453)
chr2 (421-754)||(5278720-5279054)
chr2 (419-753)||(44284508-44284836)
chr2 (419-729)||(7258791-7259104)
chr2 (417-747)||(30798370-30798700)
chr2 (416-711)||(32766384-32766681)
chr2 (448-746)||(16104152-16104452)
chr2 (446-747)||(42706235-42706539)
chr2 (418-747)||(2085949-2086270)
chr2 (416-740)||(28824437-28824762)
chr2 (416-755)||(6896039-6896378)
chr2 (419-756)||(3913343-3913681)
chr2 (416-753)||(40692176-40692507)
chr2 (416-747)||(42365454-42365787)
chr2 (422-747)||(39461191-39461518)
chr2 (416-756)||(37003771-37004091)
chr2 (416-753)||(13829310-13829636)
chr2 (416-755)||(16177763-16178101)
chr2 (450-753)||(4641387-4641690)
chr2 (416-747)||(11114750-11115080)
chr2 (416-719)||(40832349-40832655)
chr2 (416-756)||(10399750-10400086)
chr2 (418-747)||(38992953-38993280)
chr2 (457-620)||(12672395-12672559)
chr2 (416-667)||(9717182-9717411)
chr2 (433-607)||(26981606-26981781)
chr2 (419-756)||(30712726-30713067)
chr2 (419-747)||(27462685-27463012)
chr2 (519-754)||(26418793-26419029)
chr2 (416-522)||(37863246-37863352)
chr2 (418-614)||(41365992-41366189)
chr2 (519-711)||(12939284-12939478)
chr2 (416-596)||(38623184-38623365)
chr2 (416-669)||(8112253-8112511)
chr2 (423-544)||(18793180-18793300)
chr2 (423-755)||(41934451-41934785)
chr2 (550-747)||(20907472-20907664)
chr2 (522-601)||(1247171-1247250)
chr2 (416-669)||(45463002-45463243)
chr2 (691-752)||(9717113-9717174)
chr2 (420-492)||(12939202-12939274)
chr2 (476-603)||(15303180-15303308)
chr2 (580-747)||(18793306-18793474)
chr2 (632-728)||(26981786-26981884)
chr2 (540-606)||(26796247-26796313)
chr2 (466-609)||(40876554-40876697)
chr2 (706-756)||(33889126-33889176)
chr2 (571-620)||(35473036-35473085)
chr2 (632-715)||(1247065-1247148)
chr2 (471-517)||(6453249-6453295)
chr2 (522-620)||(37088278-37088376)
chr2 (629-666)||(38623394-38623431)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (416-753)||(10485030-10485367)
chr6 (416-751)||(17867708-17868045)
chr6 (416-751)||(17877491-17877828)
chr6 (450-747)||(24242541-24242840)
chr6 (416-754)||(15276856-15277196)
chr6 (416-753)||(10959872-10960210)
chr6 (419-756)||(3259546-3259890)
chr6 (416-747)||(24203240-24203572)
chr6 (422-756)||(2614764-2615100)
chr6 (416-746)||(32409771-32410103)
chr6 (419-752)||(3932729-3933064)
chr6 (421-742)||(10324035-10324358)
chr6 (418-747)||(11212134-11212465)
chr6 (419-702)||(166845-167130)
chr6 (417-752)||(17443135-17443466)
chr6 (416-753)||(31870016-31870357)
chr6 (414-753)||(14925373-14925713)
chr6 (416-747)||(18057397-18057729)
chr6 (416-756)||(11613710-11614037)
chr6 (416-737)||(15277199-15277522)
chr6 (416-621)||(11382068-11382272)
chr6 (416-682)||(34176772-34177040)
chr6 (459-712)||(32132342-32132597)
chr6 (421-621)||(11279132-11279333)
chr6 (416-747)||(3379589-3379920)
chr6 (418-751)||(18597079-18597413)
chr6 (416-757)||(32859919-32860261)
chr6 (417-662)||(3290635-3290868)
chr6 (416-740)||(11675293-11675619)
chr6 (418-747)||(14807939-14808251)
chr6 (419-621)||(9902580-9902783)
chr6 (462-621)||(4494079-4494240)
chr6 (416-744)||(29054239-29054566)
chr6 (418-754)||(8177803-8178141)
chr6 (452-754)||(34683948-34684244)
chr6 (416-747)||(23636101-23636433)
chr6 (414-495)||(14925134-14925215)
chr6 (420-489)||(33041403-33041472)
chr6 (423-609)||(9613990-9614177)
chr6 (419-620)||(7396048-7396249)
chr6 (632-753)||(29814736-29814858)
chr6 (660-756)||(32805346-32805442)
chr6 (660-753)||(28502330-28502423)
chr6 (456-619)||(35004087-35004251)
chr6 (426-599)||(9200316-9200491)
chr6 (544-620)||(27824698-27824774)
chr6 (422-489)||(13415861-13415928)
chr6 (642-747)||(4494244-4494350)
chr6 (679-753)||(11381964-11382038)
chr6 (559-669)||(29202990-29203099)
chr6 (691-747)||(11279016-11279072)
chr6 (560-616)||(27756314-27756370)
chr6 (706-756)||(34176713-34176763)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (419-756)||(8672953-8673292)
chr8 (421-756)||(22999126-22999463)
chr8 (416-757)||(41709644-41709987)
chr8 (416-754)||(27103829-27104169)
chr8 (418-756)||(34062996-34063336)
chr8 (418-751)||(10466948-10467272)
chr8 (416-755)||(45446324-45446665)
chr8 (411-752)||(7591337-7591669)
chr8 (416-747)||(32019896-32020229)
chr8 (416-753)||(34101379-34101718)
chr8 (416-753)||(39642755-39643093)
chr8 (416-702)||(4052404-4052690)
chr8 (416-755)||(31513478-31513819)
chr8 (416-754)||(6386446-6386786)
chr8 (453-755)||(29563158-29563462)
chr8 (416-753)||(3251551-3251890)
chr8 (416-714)||(41548529-41548828)
chr8 (416-702)||(37664177-37664466)
chr8 (416-753)||(29672217-29672557)
chr8 (416-754)||(37618287-37618626)
chr8 (421-751)||(15001340-15001671)
chr8 (416-702)||(30542917-30543205)
chr8 (416-719)||(5968759-5969064)
chr8 (416-756)||(25478116-25478453)
chr8 (416-755)||(30501015-30501355)
chr8 (422-756)||(40388909-40389244)
chr8 (416-747)||(7394709-7395042)
chr8 (416-747)||(35225540-35225872)
chr8 (422-747)||(12753226-12753552)
chr8 (420-747)||(13406834-13407163)
chr8 (416-753)||(32303503-32303819)
chr8 (418-747)||(45113933-45114263)
chr8 (419-753)||(31731935-31732257)
chr8 (420-664)||(14004943-14005188)
chr8 (416-746)||(37474598-37474910)
chr8 (418-700)||(29610952-29611235)
chr8 (411-618)||(37861866-37862073)
chr8 (418-747)||(17805567-17805899)
chr8 (416-620)||(21272689-21272877)
chr8 (416-715)||(16485704-16486004)
chr8 (415-601)||(17520619-17520805)
chr8 (416-491)||(38047481-38047556)
chr8 (422-751)||(10656587-10656919)
chr8 (543-736)||(6460152-6460344)
chr8 (538-712)||(27109559-27109735)
chr8 (542-620)||(10932741-10932819)
chr8 (438-618)||(16595067-16595247)
chr8 (547-619)||(10320304-10320376)
chr8 (448-610)||(22756338-22756501)
chr8 (474-602)||(54193-54322)
chr8 (661-747)||(21272590-21272676)
chr8 (473-620)||(36426201-36426347)
chr8 (706-754)||(14005216-14005264)
chr8 (706-753)||(4052368-4052415)
chr8 (685-747)||(955102-955164)
chr8 (566-620)||(3361789-3361843)
chr8 (556-609)||(14958975-14959027)
chr8 (566-620)||(5859518-5859572)
chr8 (556-610)||(11944890-11944944)
chr8 (541-610)||(3800964-3801033)
chr8 (706-755)||(37861765-37861814)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (417-756)||(101817-102158)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (416-754)||(2225-2564)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (416-753)||(23448-23785)
scaffold0054 (519-610)||(19922-20013)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (423-752)||(5332-5663)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (416-752)||(51311-51648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (416-747)||(15049-15382)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (458-752)||(17982-18278)
scaffold0169 (520-752)||(12527-12760)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (418-719)||(4467-4770)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (416-754)||(13573-13912)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (419-754)||(1532-1868)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (417-702)||(15260-15551)
scaffold0360 (565-620)||(13615-13670)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (422-754)||(42843-43174)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (416-700)||(18978-19262)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (417-728)||(2383-2695)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (422-664)||(372856-373099)
scaffold0004 (706-747)||(373127-373168)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (416-575)||(19041-19202)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (519-620)||(33535-33635)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (709-755)||(338756-338802)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 85 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5486437 - 5486144
Alignment:
Q  85 acttttaggggaatcgtttcagactcttgttgagaggccatggcagcaagttgtagagttgtagaatattgaaatgcattggaatcttggatgaatttgt 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5486437 actttgaggggaatcgtttcagactcttgctgataggccatggcagcaagttgtagagttgtagaatattgaaatgcattggaatcttggatgaatttgt 5486338  T
Q  185 gtgatttatatttgatttttactccaatttcagaaatccaatcatcaaccgttttataccataaaataatatgaagagtcggtctttggtaaatctccca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5486337 gtgatttatatttgatttttactcctatttcagaaatccaagcatcaaccgttttacaccaaaaaataatatgaagagtcggtctttggtaaatctctca 5486238  T
Q  285 attttcgaagtcttgctcctacatgtccctaagccattatgattaattaccattttttaacttctcaattccacattcctactactttatttta 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5486237 attttcgaagtcttgctcctacatgtccctaagccattatgattaattacaattttttaacttctcaattccacattcctactactttatttta 5486144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 413 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 52949936 - 52949600
Alignment:
Q  413 taggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacc 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52949936 taggggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacacgacaaaacaactctagttgtccagtgtttcatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaact 52949837  T
Q  513 ggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 611  Q
    ||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52949836 ggaggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagc 52949737  T
Q  612 attttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    ||||||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52949736 attttgtcccccaaaaatcgtataaaaca-aaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 52949638  T
Q  712 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgc 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52949637 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgc 52949600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 50178365 - 50178698
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50178365 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 50178464  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttc-tcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    |||| | |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50178465 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtgcctcagcaaaccacagcacaacttttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcat 50178564  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50178565 tttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgatgttctcccttgtattgtgatgttctttcttgtactg 50178664  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50178665 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 50178698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Original strand, 20802406 - 20802743
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20802406 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggataggacagaacaactttagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 20802505  T
Q  518 cagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20802506 caagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 20802605  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  20802606 gtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 20802705  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20802706 ctgttcagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 20802743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24002552 - 24002211
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24002552 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagtacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcaggtacaggacaaactgga 24002453  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002452 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 24002353  T
Q  615 tt-gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    || |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  24002352 tttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccaaaaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtact 24002253  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24002252 gttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 24002211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 23522093 - 23521753
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23522093 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 23521994  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521993 agcaagggataggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 23521894  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  23521893 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttttatcttgtactg 23521794  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23521793 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 23521753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 44649037 - 44649373
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44649037 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttatccagtttttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 44649136  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44649137 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccacaacacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 44649236  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44649237 ttgtcccccaaaaatcgtataaaac--aaaattattcaatgtcatcaaaatttgtcatgtgttgttctcccttgtattgtactgttctttcttgtactgt 44649334  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44649335 tctgtactgtacttgccgttttgcaaatcaaacgcaccc 44649373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 440 - 756
Target Start/End: Original strand, 47642388 - 47642705
Alignment:
Q  440 tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactca 538  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||| || ||| ||| |    
T  47642388 tgaaggacaggacagaacaactccagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggcacaggacaaactggaggtaagagacaagataaaaactga 47642487  T
Q  539 tatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaa 638  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || |||||||    
T  47642488 tatttttgtccctcagcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtcccccaaaaatcgtataaaa 47642587  T
Q  639 cataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgc 738  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47642588 caaaaaattattcaatgtcataaaaatttatcctgtgctgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgttctgtactatacttgttgttttgc 47642687  T
Q  739 aaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47642688 aaaccaaacgcaccctaa 47642705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 56154834 - 56154492
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  56154834 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggttaggacagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggaaaaactgga 56154735  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56154734 ggcaagggacagaacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 56154635  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| || |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  56154634 ttgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtactgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 56154535  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  56154534 ttctgtccagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccctaa 56154492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 29785409 - 29785752
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29785409 gggtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgg 29785508  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    || || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785509 agacaagggacagaacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacagctttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 29785608  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  29785609 tttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatact 29785708  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29785709 gttctgttcagtacttattgttttgcaaatcaaacacaccctaa 29785752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12601099 - 12600761
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12601099 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcaggtacaggacaaactgga 12601000  T
Q  516 g-gcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600999 gataagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 12600900  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || | ||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  12600899 ttgtccctaaaaaatcgtttaaaacaaaaaactactcaatgccataaaaaatttgtcaagtgctgttctgacttgtgttgtactgttctatcttgtactg 12600800  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12600799 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 12600761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Original strand, 49151976 - 49152311
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  49151976 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaactttagttatccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggatgc 49152075  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49152076 aagggacacgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaa-accaaaataacattttg 49152174  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  49152175 tccatcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactgttc 49152274  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49152275 tgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 49152311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 417 - 752
Target Start/End: Original strand, 55065207 - 55065543
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  55065207 ggtgcgtttaatttgctaaaaaat-aaggacatgacagaacaactctagttattcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggag 55065305  T
Q  517 gc--agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55065306 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 55065405  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || || | |||| ||||||    
T  55065406 ttgtccttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactattttatcttatactgt 55065505  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55065506 tatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 55065543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Original strand, 38486130 - 38486466
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38486130 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggataaactgga 38486229  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38486230 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctaacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 38486329  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |  ||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||| |||| ||     |||||||||||| ||||| ||||    
T  38486330 ttgtccctcaaaaatagtataaaacaaaaaattactcaacgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgcc-----ttgtgctgttctatcttgcactg 38486424  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  38486425 ttctgtctagtacttactgttttgcaaacgaaacacacccta 38486466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 9512216 - 9512555
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  9512216 tgcgtttgatttgctaaaaaacgaaggacatgatagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagataaactggaggc 9512315  T
Q  519 aggga-catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | | | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512316 aagtaacaggacaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 9512415  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||| | |||  || |||| |||||||||||||    
T  9512416 tccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctattctgtcttttgttgcactattctatcttgtactgttc 9512515  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9512516 tgtcacgtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 9512555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 21580238 - 21579900
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21580238 gggtgcgtttgatttgctaaaaaat-aaggacaggacagaacaattctaattgtccagtatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattgga 21580140  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21580139 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtctcacgtacaaattgtctaaaataccaaaatagcatg 21580040  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||  ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  21580039 ttgtccctcaaaaatcgtataaaactaaaaattactcaataccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 21579940  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21579939 ttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 21579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 421 - 689
Target Start/End: Original strand, 2725011 - 2725280
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-a 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  2725011 cgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactcttttaggtacaggacaaactggaggcaa 2725110  T
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725111 gggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgt-ccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 2725209  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgt 689  Q
    ||       || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  2725210 cctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgt 2725280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 438 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37865944 - 37865618
Alignment:
Q  438 aatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatact 536  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||| |||    
T  37865944 aatgaaggacacgacataacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaatctggaggcaagagacatgacaaaaact 37865845  T
Q  537 catatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataa 636  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||    
T  37865844 catatttttgtccctcaccaaatcacaacacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcagaaatcgtataa 37865745  T
Q  637 aacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttt 735  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  37865744 aacaaaaaattattcaatgccataaaaaaattgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttatgtcccgtacttactgttt 37865645  T
Q  736 tgcaaaccaaacgcaccctaattataa 762  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||    
T  37865644 tgcaaaccaaacacacccaaactataa 37865618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 52319541 - 52319200
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaaca-----actctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52319541 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacagaacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 52319442  T
Q  511 ccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52319441 ctggaggcaagggacaggacgaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatgtcaaaata 52319342  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttg 708  Q
     |||||||||||       || ||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  52319341 acattttgtccctcaaaaatcgtataaaac---aaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttg 52319245  T
Q  709 tactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52319244 tactgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 52319200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 33176905 - 33177245
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33176905 gggtacgtttgatttgctaaaaaataaaggatatgacagaacaattttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 33177004  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33177005 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgcacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 33177104  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || || | ||||  ||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  33177105 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacataaaattactcaatgccataaaatatttgtcctttgttgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttatactg 33177204  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||||   |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  33177205 ttctgtcaagtacttaccgttttgcaaaccaagcacaccct 33177245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9807368 - 9807028
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  9807368 gggtgcgtttgatttgctaaaacatgaaggataggacaggacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactaga 9807269  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || | ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807268 tgcaatggacaggacaaaaactcaactttttgt-cctcaccaaaccacagtacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 9807170  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||        || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9807169 tcgtcctccaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgccatacaaatttgtcctgtgctgttatgccttgtgttgtgctgttctatcttgtactgt 9807070  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  9807069 tctgtccagtacttactattttgcaaaccaaacacaccctaa 9807028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 33552715 - 33553003
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33552715 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacaaaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattgga 33552814  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33552815 tgcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 33552914  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | || | |||||| |||| |||||||    
T  33552915 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttttgccttgtgttgtactgttct 33553003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 418 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38812731 - 38812484
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38812731 gtgcgtttcatttgctaaaaaataaaggacaggacataacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 38812632  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812631 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 38812532  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    || ||       || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  38812531 gttccgcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcattgtcataaaaa 38812484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 55594096 - 55593793
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  55594096 tgcgtttgatttgctaaaaaaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtatttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgataaactggagg 55593997  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55593996 caagggacaggacaaaaactcatattttagtccctcaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 55593897  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  ||   | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  55593896 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgttttgcattgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 55593797  T
Q  716 ctgt 719  Q
    ||||    
T  55593796 ctgt 55593793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 46680383 - 46680632
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46680383 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaattctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 46680482  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46680483 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaaattgtctaaaataccataatagcatt 46680582  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  46680583 ttgtccctaaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 46680632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 50727786 - 50728035
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  50727786 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtcaagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgaa 50727885  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50727886 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 50727985  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50727986 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaa 50728035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 50735800 - 50736049
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  50735800 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtcaagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgaa 50735899  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50735900 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 50735999  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50736000 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaa 50736049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 446 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 21202922 - 21202614
Alignment:
Q  446 acaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttt 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||| |||    
T  21202922 acaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttaaggtacaggacaaactggaggcaagagacaggacaaaaactcataattt 21202823  T
Q  545 tgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaa 644  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || ||||||||| |||    
T  21202822 tgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtccc-caaaaatcgtataaaacaaaaa 21202724  T
Q  645 attattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaacc 743  Q
    |||| ||| || ||| ||||||||||  |||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||    
T  21202723 attactcattgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgttttgtgttgtgctgttctgtcttgtactgttttgtccagtacttactattttgcaaacc 21202624  T
Q  744 aaacgcaccc 753  Q
    |||| |||||    
T  21202623 aaacacaccc 21202614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 419 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 32181473 - 32181197
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  32181473 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacatgacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactagatgc 32181374  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32181373 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcg 32181274  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgt 694  Q
    ||||       |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  32181273 tcccccaaaaatagtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaatttgtcctgtgctgttctatcttgtattgt 32181197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 418 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 6776789 - 6776486
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  |||||    
T  6776789 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgatttaggtatagcacaaattggagg 6776690  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  6776689 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtaaaagttgtctaaaacatcaaaatatcatttt 6776590  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||| |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6776589 gtctctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 6776490  T
Q  716 ctgt 719  Q
    ||||    
T  6776489 ctgt 6776486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3649849 - 3649511
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |    
T  3649849 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacagaacaactccagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactgaa 3649750  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3649749 ggcaagggacaggacaaaaactaaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacaccaaaataacatt 3649650  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||        |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||   || ||||||    
T  3649649 tcgtcccccaaaaaacatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtgatgtgctgttatgccttgtgttgtgctgttctgcattatactgt 3649550  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
      ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3649549 gttgtccagtacttactattttgcaaaccaaacgcaccc 3649511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 715
Target Start/End: Original strand, 20517894 - 20518196
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20517894 gggtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgg 20517993  T
Q  515 aggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20517994 aggcaagagacaggacaaaaagtcatatttttgtccctcaccaaatcacagcataacttcttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 20518093  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || |||| |||||||||    
T  20518094 tttgtccctcaaaaattctataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactattctatcttgtact 20518193  T
Q  713 gtt 715  Q
    |||    
T  20518194 gtt 20518196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 422 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 20694578 - 20694249
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag- 520  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||      
T  20694578 gtttgatttgctaaaaactgaaggacaacacagaacaactctagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactgaaggcaaa 20694479  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20694478 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacgcaactttttgtccaacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 20694379  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata-aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    |       | |||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||| ||     ||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  20694378 cccaaaaattatataaaacaaaaaattactcattgccatacaaaatttgtcatgtgctattctgcc-----ttgtgttgttctatcttgtactgttctat 20694284  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20694283 ccattacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 20694249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 36886145 - 36885939
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36886145 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaagacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgga 36886046  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36886045 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaaattgtctaaaatacctaaatagcatt 36885946  T
Q  615 ttgtccc 621  Q
    |||||||    
T  36885945 ttgtccc 36885939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 417 - 702
Target Start/End: Original strand, 47361287 - 47361570
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47361287 ggtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 47361386  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47361387 ggcaagggacaagacaaa-attcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcc----aacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 47361481  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  47361482 ttgtccctaaaaattcgtataaaacaaaaaattactcaatatcataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 47361570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 418 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29593106 - 29592773
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29593106 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaccttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggatg 29593007  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||     
T  29593006 caagggacatgacaaaaactcatatttttgtacttcactaaaccacagcacaactttttgtcccacataaaagttgtctaaaaatccaaaatggcatttc 29592907  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||||       |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||| || |||| ||     ||||| |||||| |||||||||| |     
T  29592906 gtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaatgccaaaaaaatttgtcttgttctgttctgcc-----ttgtgttgttctgtcttgtactgata 29592812  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  29592811 tgtccagtatttactgttttgcaaaccaaacacacccta 29592773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 411 - 700
Target Start/End: Original strand, 44324210 - 44324500
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44324210 cttaagggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 44324309  T
Q  511 ccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |  ||||||   |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44324310 ctagaggcaaaagacgggacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgttttaaataccaaaata 44324409  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgtt 700  Q
    |||||| |||||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  44324410 gcatttcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcatgtgctgttctgccttatgttgtgctgtt 44324500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 416 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 16320731 - 16320398
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  16320731 gggtgcgtttgatatgctaaaaaat-aaggactggacagaacaactccagttgtccagtatttgatttgtaaaactgtctcaggtataggaaaaactgga 16320633  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||    
T  16320632 ggcaagggacaggataaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaggttgcctaaaatacaaaaatagaatt 16320533  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |  ||||       || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  16320532 tcatcccccaaaactcgtataaaac--aaaattattcaatgccataaaaatttgtcttgtgttgttctcccttctattgtgttgttctttcttgtattgc 16320435  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16320434 tttatacagtacttgctgttttgcaaatcaaacgcac 16320398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 415 - 754
Target Start/End: Original strand, 36743561 - 36743901
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36743561 ggggtgcgtttgatttgctaaa-aatgaaggatataacaaaacaactctagttgttcagtgtttgaattgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgg 36743659  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743660 aggcaagggacatgacaaaaattcatatttttgtccctcaccaaactacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 36743759  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       |  |||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||  | |||| ||||||||     
T  36743760 tttgtccctcaaaaattgtataaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgttctgccttatgttgtattattctatcttgtacc 36743859  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||| |   |||||| || |||| |||||||||| ||||||    
T  36743860 gttctatctagtacttactatttttcaaaccaaacacaccct 36743901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 472 - 756
Target Start/End: Original strand, 37695470 - 37695755
Alignment:
Q  472 agtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaac 570  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||| | | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37695470 agtgttttatttggaaaactgtttcaggtacatgataaattggaggtaagagacaagacaaaaactgatatttttgtccctcatcaaaccacaacacaac 37695569  T
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtg 670  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  37695570 tttttgtcccacgtacaggttgtctaaaatatcaaaataacatttcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtc 37695669  T
Q  671 ctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37695670 ttgtgctgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgttctgtacagtacttgttgttttgcaaactaaacgcaccctaa 37695755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 1231524 - 1231318
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1231524 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggataaactgga 1231425  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1231424 ggcaagagactggacaaaaactcatatttttgtccctcacaaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacatt 1231325  T
Q  615 ttgtccc 621  Q
    |||||||    
T  1231324 ttgtccc 1231318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 36497430 - 36497224
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36497430 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 36497331  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36497330 gacaagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtccaacatacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 36497231  T
Q  615 ttgtccc 621  Q
     ||||||    
T  36497230 ctgtccc 36497224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 54543198 - 54542898
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  54543198 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaga-catgacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactatttcaagtacaggacaaattggaggc 54543100  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54543099 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccatagcacaac-ttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatatcattttg 54543001  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| | |||| |||| ||||||| || |||||| |||    
T  54543000 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgacataaaaaatttgtcttgtgctgttctgctttgtgttgtactgttctatcctgtactattc 54542901  T
Q  717 tgt 719  Q
    |||    
T  54542900 tgt 54542898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 418 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 2787175 - 2786838
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |    
T  2787175 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacataacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacagtacaaactggatg 2787076  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||     
T  2787075 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccttcactaaaccacatcacaaatttttgtcccacgtacaaattatctaaaaatccaaaataacatttc 2786976  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||   ||||| || | |||| | ||||| |||||  ||||||||||||     
T  2786975 gtcccccaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgcaataaaaaattgtctagtgctgttttgccttatgttgtgttgttcggtcttgtactgtta 2786876  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2786875 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 2786838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 41712057 - 41711805
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  41712057 tgcgtttgatttactaaaaaatgaatgatagaacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaagctgtttcaggtacaggacaaactgaaggc 41711958  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41711957 aagggacaggacaaagactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtctcacgtacaggttgtctaaaataccaaaatagcatttcg 41711858  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtg 670  Q
    ||||       || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41711857 tcccccaaatatcgtataaaacaaaaaattattcaatagcataaaaatttgtg 41711805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 416 - 609
Target Start/End: Original strand, 2629824 - 2630018
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2629824 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacataacaactctagttgtcccgtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 2629923  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629924 ggcaaaggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccagaccaaatcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 2630018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 423 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24210525 - 24210331
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24210525 tttgatttgctaaaaaatgaaagataggacggaacaactctaattgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagg 24210426  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24210425 gacaggacaaaaactcatattattgtccctcaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 24210331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 416 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 50186741 - 50186411
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||    
T  50186741 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagaaagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaattgttttaggtgcaggacaaactaga 50186642  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50186641 ggcaagggacgggataaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttatcccacatacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatt 50186542  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |  ||       || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || | || |  ||| | ||||||| || | |||| ||||||    
T  50186541 tcgcaccccaaaaatcgtataaaataaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctatgttgttatgtcttatgttgtgctattttgtcttatactgt 50186442  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    || ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  50186441 tcagtcaagtacttactgttttgcaaaccaa 50186411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 418 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 4326002 - 4325798
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4326002 gtgcgtttgatttgctaaaaaataaagtacaagacaaaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactggagg 4325903  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4325902 caagggacaggagaaaaactcatatttttgtctctcacaaaaccgcaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 4325803  T
Q  617 gtccc 621  Q
    |||||    
T  4325802 gtccc 4325798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 522 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 43641205 - 43640972
Alignment:
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43641205 gacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 43641106  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
           || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  43641105 tcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtc 43641006  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43641005 tagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 43640972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42870182 - 42869862
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  42870182 gtgcgtttgatttgctaagaaatgaaggacatgacataacaactctagttgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttctggtacaggacaaactggggg 42870083  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca-ttt 615  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  42870082 caagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaac---ttgtcccacgtataagttgtctaaaatacaaaaatagcatttt 42869986  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||    ||| ||||    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  42869985 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatt----tgttctat----ccttatgttgtactgttctatcttgtactgtt 42869894  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  42869893 ctgtcgagtacttgctgttttgcaaaccaaac 42869862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29616379 - 29616134
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttc-aggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29616379 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaaggtacaggacaaactgg 29616280  T
Q  515 aggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29616279 aggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccct-----gaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaataacat 29616185  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  29616184 tttgtcccttaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 29616134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Original strand, 50729415 - 50729621
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  50729415 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactgga 50729514  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50729515 ggcaagggacatgacaaaaactgaaatttttgtctatcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 50729614  T
Q  615 ttgtccc 621  Q
    | |||||    
T  50729615 tcgtccc 50729621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11056255 - 11056001
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11056255 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggtcaggataaaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 11056156  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11056155 ggcaagggacaagacaaaaactgatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttatgtcccatgtacagattgtcaaaaataccaaaataacatt 11056056  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    | || ||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11056055 tcgtgcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaagatttgt 11056001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 22318257 - 22318596
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | |    
T  22318257 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaaccccagctgtctagtgtttgatttgtaaaactgttttagggacagaacaaactgaa 22318356  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| ||||||   | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22318357 ggcaagagacaggacaaaatttgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcttacgtagaagttgtctaaaacaccaaaataacatt 22318456  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||         ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||| | || |  ||||| ||||||||||||   ||||||| |    
T  22318457 ttgtcatccaaaaatcatataaaacaagaaattattcaatatcataaaaatttgtcatgtgttgttatgtcttgtgttgtgctgttctgcattgtactct 22318556  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22318557 tctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacgtaccct 22318596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 418 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 28115462 - 28115259
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  28115462 gtgcatttgatttgctaaaaaatgaagcaaagggcagaacaactcaagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttt-ggtacaagacaaactggagg 28115364  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28115363 caagggacaggagaaaaattgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttc 28115264  T
Q  617 gtccc 621  Q
    |||||    
T  28115263 gtccc 28115259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 34930094 - 34929795
Alignment:
Q  450 gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtc 548  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||     
T  34930094 gacagaataactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacagaataaactggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtt 34929995  T
Q  549 cctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaatta 648  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || ||||||||| ||| |||    
T  34929994 cctcaccaaaccacagcacaactttttgccccatatacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaattta 34929895  T
Q  649 ttcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     | |||| |||||||| |||||  |||||| |||| |||||| |||| || || | | |||||||||| |||   ||  || ||||||||||||||||||    
T  34929894 ctgaatgccataaaaattttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactattttattttgtactgttttgtctagtttttactgttttgcaaaccaaac 34929795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39078868 - 39078622
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||    
T  39078868 gtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactggaggcaag 39078769  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
     || | ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39078768 agataggacaaaacctgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaaatttttgtcctacgtacgagttgtctaaaacaccaaaataacattttgtcc 39078669  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaattt 667  Q
    |       |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||    
T  39078668 cccaaaaatcatataaaataagaaattattcaataccataaaaattt 39078622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 411 - 754
Target Start/End: Original strand, 7554825 - 7555169
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||  | | |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  7554825 cttaagggtgcgtttgatttgctaaaaagtgaaagatatgacagaacaatttcagctgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcatgtacaaaacaaa 7554924  T
Q  511 ccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | | | ||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7554925 ctgaatgcaagagacatgataaaaactcgtatttttgtccttcactaaaccataacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaaatccaaaata 7555024  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgt 709  Q
    |||||| | ||        || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||  ||||| ||||| |||| | ||||||    
T  7555025 gcatttcggcctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcgtgtgatgttctgtcttgtgttgtgttgttttgtcttgt 7555124  T
Q  710 actgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||||  || |  ||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  7555125 actgttaagtccaatacttactattttgcaaaccaaacacaccct 7555169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 26083550 - 26083264
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||| |||  |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  26083550 gggtgcgtttaatttgttagaaaatgaaggaca--acagaacaacttcagttgtttagtgtttgatttgtaaaattgtttcagggacagaacaaactgga 26083453  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaata-ccaaaatagcat 613  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  26083452 ggcaagggacatgacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcataactttttgtcccacttacaagttgtctaaaacacccaaaataacat 26083353  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    || |||||        |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| || || | |||||| ||||| ||||||    
T  26083352 ttcgtcccccaaaaagcatataaaacatgaaattattcaataccataaaaatttgtcgtgtactgttatgccttgtgttgtgttgttct 26083264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 418 - 713
Target Start/End: Original strand, 53200518 - 53200815
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||  || |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  53200518 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacataataacttcagctgtttagtgtttgatttgcaaaactgtttcagagacaggataaactggagg 53200617  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaac-tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    | ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  53200618 caaggaacatgacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaacttttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacatcaaaatagtattt 53200717  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
     |||||       ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || | |||| | ||||| |||||| | ||||||||    
T  53200718 cgtccctcaaaaatcatacaaaacaaaaaattattcaataccataaaaatttgttctgtgttgttatgccttatgttgtgatgttctgttttgtactg 53200815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 418 - 575
Target Start/End: Original strand, 6973788 - 6973946
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6973788 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggatagaacaacttttgttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtactggacaaacgggagg 6973887  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaacttttt 575  Q
    | |  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6973888 caattgacaggacaaaaactcataattttgtccctcgccaaaccacaacacaacttttt 6973946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 528 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 37932020 - 37931801
Alignment:
Q  528 acaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnn 627  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||          
T  37932020 acaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcctacatacaagttgtttaaaatgtcaaaatagcatttcgtcccccaaaa 37931921  T
Q  628 ntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtact 727  Q
     |  ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||| || | || | |||||||||||| ||| | |||||    
T  37931920 attgtataaaacgaaaaattattcaatgccataaaaagttgtcttgtgctgttctgccttgtattatgttattatgtcttgtactgttatgtccagtact 37931821  T
Q  728 tgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  37931820 tactgttttgcaaaccaaac 37931801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 14296777 - 14296645
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  14296777 tgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacataacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtataggacaaacttgaggc 14296678  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccc 550  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14296677 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccc 14296645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 14315025 - 14314893
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  14315025 tgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacataacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtataggacaaacttgaggc 14314926  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccc 550  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14314925 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccc 14314893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 417 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 30943000 - 30942664
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  30943000 ggtgtgtttgatttgttaaaaaat-aaggataagacagaacaactccagttattcagtgtttgatttataaaactgtttcagggacagaacaaattggag 30942902  T
Q  517 gcagg-gacatgacaaata-ctcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | |||  |||||| | || | |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||  | ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30942901 gcaagagacgggacaaaaaactgaaatttctgtctctcaccaaaccacaacacaacattttgcctcacatataagttgtctaaaacaccaaaatatcatt 30942802  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |  ||||       ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  30942801 tcatcccccaaaaatcatataaaacaagaaattattcaatgctataaaaatttgtcatatgctattataccttgtattgtaatgttcttaattgtactgt 30942702  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | ||| |  ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  30942701 tttgtccaatacttactgttttacaaaccaaaagcacc 30942664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 42773000 - 42772832
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||  ||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||    
T  42773000 ggtgcgtttgattcattaaaaaatgaatgacatgacataacaactttagttttcaagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacatgacaaacttgag 42772901  T
Q  517 gcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgt 584  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42772900 gcaagagacaagacaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgt 42772832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 418 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 23328107 - 23327925
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||                 
T  23328107 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaactctagttgtcatgtgtttgacttgtaaaactgtttcaggtacag------------- 23328021  T
Q  518 cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttc-tcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
             |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23328020 ---------gacaaaaactcatatttttgtccctcagcaaaccacaacacaacttttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 23327930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 418 - 595
Target Start/End: Original strand, 25978487 - 25978664
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  25978487 gtgcgtttgatttgttaaaaaataaaggacatgacaaaacaacttcaattatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagg-acatgacaaattggagg 25978585  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtct 595  Q
    | | | ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25978586 caatgaacaggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccatatcacaactttttgtctcacttacaagttgtct 25978664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 52949599 - 52949517
Alignment:
Q  673 gtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52949599 gtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtaccattctgtattgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 52949517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 14296654 - 14296471
Alignment:
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgt 669  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  14296654 tttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtctcccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgt 14296555  T
Q  670 gctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
     ||||||| |||| | |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  14296554 cctgtgctgttctgctttgtgttgtactgttctatattgttctgttctgtccagtacttattgttttgcaaatcaaacacaccc 14296471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 521 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13110434 - 13110209
Alignment:
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaa-ccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  13110434 ggacatgacaaa-actcatatttttgtccttcactaaaaccacaacacaactgtttgtcccacgtaaaatttgtctaaaaatccaaaatagcatttcgtc 13110336  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    ||       ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | | |||| ||||||  | || |||||| ||||||| |||| | |    
T  13110335 ccccaaaaatcatacaaaaca-aaaattatgcaatgccataaaaatttgttctgcgttgttctaccttgtgctatgttgttctatcttgtattgttttat 13110237  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  13110236 ccactacttactgttttgcaaaccaaac 13110209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 14314902 - 14314719
Alignment:
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgt 669  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14314902 tttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtctcccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgt 14314803  T
Q  670 gctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
     ||||||| |||| | |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| | ||||||  ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14314802 cctgtgctgttctgctttgtgttgtactgttctatattgttctgttctgtccagtacttattgtttagcaaatcaaacacaccc 14314719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9948084 - 9947947
Alignment:
Q  474 tgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactt 572  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||| | ||||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  9948084 tgtttgatttgtaaaactgtttaaggaacatgacaaacttgaggcaagagacatgacaaaaactaaaattcttatccctcactaaaccacattacaactt 9947985  T
Q  573 tttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9947984 tttgtctcacgtacaagttattcaaaataccaaaatag 9947947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 418 - 548
Target Start/End: Original strand, 56487162 - 56487288
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||    
T  56487162 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaagacatgacagaacaactctagtt-----gtgtttgatttgtaaaactgtttcagatataggacaaacttgagg 56487256  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtc 548  Q
    | ||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  56487257 caagggacaggacaaaaatttatatttttgtc 56487288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 519 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 43739570 - 43739473
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  43739570 agggacatgacaaaaactgaaattattgtccctcaccaaaccacaacacaacattttgtcccacatacaagttgtctaaaatattaaaataacatttt 43739473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 142
Target Start/End: Original strand, 5437599 - 5437684
Alignment:
Q  57 aactttgtttctttgtttgtccactaacacttttaggggaatcgtttcagactcttgttgagaggccatggcagcaagttgtagag 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5437599 aactttgcttctttgtttgtccactaatattttgaggggaatcgattttgactcttgttgagaagccatggaagcaagttgtagag 5437684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 540 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7001940 - 7001770
Alignment:
Q  540 atttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaac 639  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||        || ||||| ||    
T  7001940 atttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgttctatgtataagttgtct-aaataccaaaataaca-tttgtccaccaaaaatcgtataagac 7001843  T
Q  640 ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  7001842 caaaaattattcaatgccataaaaatttgtcctgtattgttctgtcttgtgttgtgatgttctgtcttgtact 7001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 790 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 5484430 - 5484369
Alignment:
Q  790 gaaaggttacaataaaaattttgtacctatatataggtctgatatattaattattcaataaa 851  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5484430 gaaaggttacaataaaatgtttgtacctatatacaggtctcatatattaattattcaataaa 5484369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 620
Target Start/End: Original strand, 45577619 - 45577770
Alignment:
Q  474 tgtttgatttgtaaaa-ctgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcat---atttttgtccctcaccaaaccacatcaca 568  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| |   ||   ||| |||| |||| | |||||||| ||||    
T  45577619 tgtttgatttgtaaaagctgttttatggacatgacaaactggaggcaagagacatgacaaaaaaaaatgaaattcttgttcctcgctaaaccacaacaca 45577718  T
Q  569 actttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45577719 actttttgtcccacgtgcaagttgtctaaaataccaaaatgacattttgtcc 45577770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 38520584 - 38520518
Alignment:
Q  543 tttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38520584 tttgtccctcaccaaaccacagcataattttttgtcccacgcacaagttgtataaaataccaaaata 38520518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3579279 - 3579142
Alignment:
Q  475 gtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatattt-ttgtccctcaccaaaccacatcacaactt 572  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |   | |||| || ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  3579279 gtttgattcgtaaatctgttttaggggcaggacaaacttgaggcaagggacatgacaaaaaagtaaatttattttccatcactaaaccatatcacaactt 3579180  T
Q  573 tttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  3579179 tttgtccaacattcaagttgtctaaaataccaaaatag 3579142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5484539 - 5484499
Alignment:
Q  369 ctttattttatcctactagcagagcagcaaacaaaaaataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5484539 ctttattttatcctactagcagagcagcaaacaaaaaataa 5484499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13110519 - 13110443
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactg 492  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110519 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaagacatgacagaaaaatttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactg 13110443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2114249 - 2114191
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagt 474  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2114249 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagt 2114191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 753
Target Start/End: Original strand, 50729627 - 50729737
Alignment:
Q  643 aaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaac 742  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||   || |||||| | || | ||| || || ||||||||||    
T  50729627 aaattatttaatatcataaaaatttgttctgtgctgttatgccttgtgttgtgctgttctgcattatactgtgccgtccagtatttactattttgcaaac 50729726  T
Q  743 caaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||    
T  50729727 caaacgcaccc 50729737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 5487216 - 5487179
Alignment:
Q  17 acgatggtgccgagtggaagagataggaaactgaagag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487216 acgatggtgccgagtggaagagataggaaactgaagag 5487179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 42772818 - 42772724
Alignment:
Q  568 aactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaa 662  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||        |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  42772818 aactttttgtcccacgtataagttatctaaaataccaaaataacattttttcctccaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaa 42772724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 44640533 - 44640457
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttt 495  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||  |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44640533 gtgcgtttgatctactaaaaaatgaatgacag-acagaacaacttcagttgtacagtgtttgatttgtaaaactgttt 44640457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 36497153 - 36497105
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497153 ttgtactgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 36497105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 36885882 - 36885819
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36885882 ttgtactgttctatcttgtactgttctgtctagtactcgctgttttgcaaaccaaacacaccct 36885819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 519 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 52673920 - 52673830
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  52673920 agggacatgacaaaaacagaaatttttgtccctcactaaacctcaacacaattttttgtctcacgtatgagttatctaaaatacaaaaata 52673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 559 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 40792486 - 40792425
Alignment:
Q  559 ccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40792486 ccacatcacaactttttgtttcatgtacaagttatctaaaatacaaaaatagctttttgtcc 40792425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 664
Target Start/End: Original strand, 56487292 - 56487374
Alignment:
Q  582 cgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  56487292 cgtacaagttgtttaaaataccaaaataacattttgtcctccaaaaatcatataaaacaaaaaatcaatcaatgacataaaaa 56487374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5487142 - 5487110
Alignment:
Q  57 aactttgtttctttgtttgtccactaacacttt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487142 aactttgtttctttgtttgtccactaacacttt 5487110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 544 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 21098618 - 21098546
Alignment:
Q  544 ttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21098618 ttgtctctcactaaaccacaacataactttttgtcgcacgtaaaatttgtctaaaatactaaaataacatttt 21098546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 38812475 - 38812420
Alignment:
Q  692 tgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38812475 tgtgttgttctgtcgtgtactgttttgtccggtacttgctgttttgcaaaccaaac 38812420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 747
Target Start/End: Original strand, 46680641 - 46680696
Alignment:
Q  692 tgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  46680641 tgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttactattttgcaaaccaaac 46680696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 712 - 753
Target Start/End: Original strand, 2725288 - 2725329
Alignment:
Q  712 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2725288 tgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 2725329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 98
Target Start/End: Original strand, 5458897 - 5458938
Alignment:
Q  57 aactttgtttctttgtttgtccactaacacttttaggggaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5458897 aactttgtttctttgtttgtccactaagattttcaggggaat 5458938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 11055222 - 11055161
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11055222 ttgtgttgttctgtcttgtactgtattgtatagtacttgctgttttgcaaacgaaacacacc 11055161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31644656 - 31644317
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgct-aaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31644656 gggtgcgtttgatttgcttaaaaaatgaaggacgggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgg 31644557  T
Q  515 aggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644556 aggcaagagcaagacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 31644457  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31644456 ttgtcccctaaaaatcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtcttgtgttgttctaccttgtattgtgctattc-ttcttgtactgt 31644358  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644357 tctgcactgtacatgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 31644317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 418 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 3735565 - 3735230
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  3735565 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagaacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaaccgtttcaggtacatgacaaaatggagg 3735466  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | | ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3735465 caatggacaggacaaaaactgatatttttgtccatcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 3735366  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||        || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3735365 gtcctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctatgctgttctcccttgtattgtgctattctttcttgtactgttc 3735266  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3735265 tgtacagtacctgctgttttgcaaaccaaacgcacc 3735230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11963551 - 11963218
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11963551 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 11963452  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963451 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtgcaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 11963352  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  11963351 ttgtccctcaaaaatcgtataaaatacaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttattctgctttgtgttgtactgttctatcttgtactg 11963252  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11963251 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 11963218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 422 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7523376 - 7523041
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-g 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7523376 gtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaag 7523277  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7523276 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 7523177  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaac-ataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    |       || |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7523176 ctcaaaaatcgtataaaacaaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctg 7523077  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7523076 tccaatacttcctgttttgcaaaccaaacacaccct 7523041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35701487 - 35701147
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  35701487 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttctggtacaggacaaactgga 35701388  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701387 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacataactttttgttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 35701288  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  35701287 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgtcctgtgttattctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 35701188  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35701187 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 35701147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 418 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32528923 - 32528584
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32528923 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaggacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaga 32528824  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528823 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 32528724  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  32528723 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttatgttgtactgttctatcttgtactgtt 32528624  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||| | |||||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  32528623 ctgtccagtacttactattttgcaaatcaaacacacccta 32528584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 2351890 - 2351552
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  2351890 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaggacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttaaggtataggacaaactgga 2351791  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2351790 ggcaagtgacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 2351691  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || || |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  2351690 ttgtccctcaaaaatcgtacaaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttatcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 2351591  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2351590 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 2351552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 416 - 748
Target Start/End: Original strand, 7770165 - 7770498
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7770165 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacaggacaaactgga 7770264  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  7770265 ggcaagggacaggacaaaaacacatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgcctaaaatacaaaaataacatt 7770364  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |  ||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||  |    
T  7770365 tcgagccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctattctgtcttgtgttgtgttgttctgtcttgtacgat 7770464  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacg 748  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7770465 tatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacg 7770498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 4689584 - 4689925
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4689584 gggttcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgga 4689683  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  4689684 ggcaagggacaggacaaaaacacatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgcctaaaatacaaaaataacatt 4689783  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |  ||       || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  4689784 tcgagccccaaaagtcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcatgtgttgttctgccttatgttgtgttgttctgtcttgtactgt 4689883  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689884 tatgtccattacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 4689925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 416 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34795097 - 34794765
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34795097 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccaatatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 34794998  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34794997 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtataagttgtctaaaataccaaaatagcatt 34794898  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtca-taaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||| ||       || ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  34794897 ttgttccccaaaattcgtataaaacaaaaaattattcaatgccacaaaaaatttatcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 34794798  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  34794797 ttctgtccaatacttactgttttgcaaaccaaa 34794765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 415 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 39918718 - 39918379
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  39918718 ggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaagacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacaagacaaactgg 39918619  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39918618 aggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacat 39918519  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       || ||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  39918518 tttgtcccccaaaaatcgtataaaacataaaattactcaatactataaaatatttgtcctgtgttgttctaccttgtgttgtactgttctatcttgtact 39918419  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||| | |||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  39918418 gttctgtccagtacttactg-attgcaaaccaaacacaccc 39918379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 404 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 24036451 - 24036105
Alignment:
Q  404 aaataagcttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtaca 503  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24036451 aaataagattaaggatgcgtttgatttgctaaaaaatgaaga-caggacaaaacaattcaagttgtccagtgtttgatttggaaaactgtttcaggtaca 24036353  T
Q  504 ggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaatac 602  Q
    | |||||  ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24036352 gcacaaattggaggcaagggacaggacaaaatctcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaatac 24036253  T
Q  603 caaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||||| |||||||  ||       || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||  ||| | ||||||||||||    
T  24036252 caaaataacattttgcaccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtc--aaaaatttgtcatgtgttgttctgtcttatgttgtgctgttct 24036155  T
Q  703 ttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  24036154 gtcttgtactgttcagtacagtacttattgttttgcaaaccaaacacacc 24036105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 719
Target Start/End: Original strand, 31770480 - 31770782
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  31770480 tgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacatgacataacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcatgtacaagacaaactggaggc 31770579  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31770580 aagggacaggacaaaaactcatatttttatccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctgaaataccaaaatagcattttg 31770679  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  31770680 tccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactgttc 31770779  T
Q  717 tgt 719  Q
    |||    
T  31770780 tgt 31770782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 418 - 702
Target Start/End: Original strand, 24181512 - 24181798
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24181512 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagc 24181611  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181612 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcataactttttgtcccacgtataagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 24181711  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||       || |||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  24181712 gtcccccaaagatcgtataaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 24181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8137047 - 8136710
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8137047 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacagaacaactctagttgtccagtgtttgttttgtaaaactgtttcagatacaggacaaactgga 8136948  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8136947 ggcaagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaataaca-- 8136850  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |  ||||||||| || |||| |||||| ||| ||||| |||| ||||| | || | |||||| |||| ||||||| |||||||||     
T  8136849 ttgtccccaaaaaatagtataaaacaaaacattactcaatgccataaaaaaattgtcctgtgttgttatgccttgtgttgtactgttctatcttgtacta 8136750  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  8136749 ttctgtccagtacttactgttttacaaaccaaacacaccc 8136710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 31879962 - 31880250
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31879962 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagatataacaactctagttgttcagtgtttgattagtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 31880061  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880062 ggcaagtgacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactatttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 31880161  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||| |||||| |||| |||||||    
T  31880162 ttgtcccccaacaatcgtataatacaaaaaattattcaatgtcataaaaaatttgtcatgtactgttctgccttgtgttgtactgttct 31880250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 475 - 752
Target Start/End: Original strand, 4818085 - 4818364
Alignment:
Q  475 gtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcaggga-catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaacttt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4818085 gtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggcaaggaacaagacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaacttt 4818184  T
Q  574 ttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgct 672  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |    
T  4818185 ttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtctt 4818284  T
Q  673 gtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||| | |||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4818285 gtgttgttctgccttgtgttgcactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 4818364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 417 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29241587 - 29241300
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  29241587 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggccaggccagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaattggag 29241488  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29241487 gcaagggacaggccaaaagctcatatttttgtccctcgccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttggctaaaatatcaaaatagcattt 29241388  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  29241387 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 29241300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 18470314 - 18470652
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |    
T  18470314 gggtgcttttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacagaacaactccagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactgaa 18470413  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18470414 ggcaagggacaagacaaaaactgaaatttttgtcccttaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaacaccaaaataacatt 18470513  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||        |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||   || ||||||    
T  18470514 tcgtcccccaaaaagcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgttctgtgctgttatgtcttgtattgtgctgttctgcattatactgt 18470613  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
     |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18470614 gctgtccagtacttactattttgcaaaccaaacgcaccc 18470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 433 - 753
Target Start/End: Original strand, 22493322 - 22493643
Alignment:
Q  433 taaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag-ggacatgacaa 531  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||    
T  22493322 taaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggataaactggagccaaaggacaagacaa 22493421  T
Q  532 atactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntca 631  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||       ||     
T  22493422 aaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcacacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgt-ccgcaaaaatcg 22493520  T
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgc 730  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| |  ||||||     
T  22493521 tataaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgttctgtgctgttctaccttgtgttgtgttattctgtcttgcactgttctgtccaatacttgt 22493620  T
Q  731 tgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  22493621 tgttttgcgaaccaaacacaccc 22493643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Original strand, 6284188 - 6284524
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| || |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6284188 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacggga--gaataactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgcttcaggtacaggacaaactggagg 6284285  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaatacc-aaaatagcattt 615  Q
    || |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6284286 catgggacaggacaaaaacttatttttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtccaaaataccaaaaatagcattt 6284385  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| | || |||||| |||| ||||||| |||| || |||    
T  6284386 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgtactgccttgtgttgtactgttctatcttatattgt 6284485  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  6284486 tctgtccagtacttgctgttttgtaaatcaaacacaccc 6284524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 462 - 753
Target Start/End: Original strand, 21739093 - 21739381
Alignment:
Q  462 ctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaacc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21739093 ctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaacc 21739192  T
Q  561 acatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata 660  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||| |||||||  ||||| ||||    
T  21739193 acagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaattgtataaaacaaaaaattacacaatgccata 21739292  T
Q  661 aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| ||    ||| || ||||  ||||| |||| ||||||| |||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21739293 aaaaatt----tgtcctgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttatattgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 21739381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 423 - 754
Target Start/End: Original strand, 41790356 - 41790688
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcaggg 522  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       
T  41790356 tttgattcgctaaaaaatgaaagacaggacagaacaattttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcag-tacaggacaaactggaggcaata 41790454  T
Q  523 a-catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41790455 aacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaaattgtctaaaatactaaaataacattttgtccc 41790554  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
           || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| | || |||||||||||     
T  41790555 ccaaaaatcgtataaaacataaaattactcaatgccataaaatatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctattttatactgttctgtc 41790654  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  41790655 cagtacttactgttttgtaaaccaaacacaccct 41790688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 7208116 - 7208404
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  7208116 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacgggacaaactgga 7208215  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     ||| | ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208216 tgcaagagacagaaccaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 7208315  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||| ||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| |||   |||||||||| |||||||    
T  7208316 ttgttcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaatatttgtcccgtgctgttccgtcttgtattgtactgttct 7208404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 41459798 - 41459511
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41459798 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtttagtatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 41459699  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41459698 ggcaagggacaaga-aaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccagagcacaactttttgttccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacatt 41459600  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtca-taaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  41459599 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccattaaatttttgtcctgtgctgttctaccttgtgttgtactgttct 41459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 423 - 754
Target Start/End: Original strand, 7725702 - 7726034
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gg 521  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||    
T  7725702 tttgatttgctaaaaaattaaggacaggacaaaacaacttcagttgtccagtgtttgattagtaaaattgtttcaggtgcagaacaaactggatgcaagg 7725801  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  7725802 gacatgacaaaaactcatatttttgtccttcattaaaccacaacacaactttttgtcccacgtataagttgtctaaatatccaaaatagcatttcgtccc 7725901  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtac 721  Q
           || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||      
T  7725902 ccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaattccataaaaatttgtcctatactattctaccttgtgttgtgatgtactgtcttgtactgttatgtct 7726001  T
Q  722 tgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
     |||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7726002 agtacttactgttttgcaaatcaaacacaccct 7726034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 418 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 39788401 - 39788202
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39788401 gtgcgtttgatttgttaaaaaataaaggacaggacagaacaattctagttgtccagtatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgtagg 39788302  T
Q  518 cag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39788301 caaaggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatactaaaataacatttt 39788202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 553601 - 553358
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  553601 gtttgatttgctaaaaaatgaagaatatgacagaacaactttaattgtctagtgtttgatttataaaactgtttcaagtacaggacaaactggaggcaag 553502  T
Q  522 -gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt-c 619  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  553501 agacaagacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtcc 553402  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa 663  Q
    ||       || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  553401 ccccaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgccataaaa 553358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 758
Target Start/End: Original strand, 32092874 - 32093208
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |     
T  32092874 gtttgattttataaaaaatgaaggacaagacagaacaactccagttgtgcagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggaacaggacaaattggaggcaaa 32092973  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||| | |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32092974 ggataggacaaaaactgaaatttttgt-cctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattatctaaaataccaaaatagcatttcgtcc 32093072  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       | ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||| || || |||||| |||  |||||||||||     
T  32093073 cccaaaaattatataaaacataaaaattttcaataccataaaaatttgtgttgtgctgttctgccttgtgttatgttgttctgtctcttactgttctgtc 32093172  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaatt 758  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32093173 cagtacttac--ttttgcaaatcaaacgcaccctaatt 32093208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 40489546 - 40489298
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  40489546 gggtgcgtttgatttgctaaaaaat-aaggacaggacagaataactctaattgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtagaagacaaactgga 40489448  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40489447 ggcaagggacgggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 40489348  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  40489347 ttgtccctcaaaaattgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 40489298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 418 - 702
Target Start/End: Original strand, 23091192 - 23091478
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23091192 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaatgacaagatataactactcaagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggataaactggagg 23091291  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23091292 caagggacaagacaaaaactcatatttttgtccgtcatcaaaccacaacacaactttttgtctcacgtataaattgtctaaaatatcaaaataacatttt 23091391  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataa-aaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||       || ||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||  |||| | ||||  ||||| |||| |||||||    
T  23091392 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaacattactcaatgccataagaaatttgtcttgtgttgttctatcttgtgttgtactgttct 23091478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40182551 - 40182335
Alignment:
Q  538 atatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaa 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||||    
T  40182551 atatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtctctcaaaaatcgtataaa 40182452  T
Q  638 acataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgtttt 736  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  40182451 acaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttttgccttgtgttgtactgttctttcttgtattgttctgtccagtacttgctgtttt 40182352  T
Q  737 gcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    | ||||||||| |||||    
T  40182351 ggaaaccaaacacaccc 40182335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 413 - 689
Target Start/End: Original strand, 5571540 - 5571803
Alignment:
Q  413 taggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||     
T  5571540 taggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaaaacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatt-------------caggtacaggacaaact 5571626  T
Q  513 ggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 611  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571627 ggaggcaagggacaggacaaaaattcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtccaacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 5571726  T
Q  612 attttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgt 689  Q
    |  |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  5571727 a--ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgt 5571803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Original strand, 8560868 - 8561121
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  8560868 gggtgcgtttgatttgctaaaaaacgaaggacgtgacataacaacttcagttattcagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacaggacaaactgaa 8560967  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     |||  ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8560968 agcaaaggacaagacaaaaactgatatttttgttcctcaccaaaccacatcacaactttttgttccaggtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 8561067  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    | |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8561068 tcgtccc-caaaaatcgtataaaacaaaaaattaatcaatgccataaaaatttgt 8561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 471 - 621
Target Start/End: Original strand, 28090461 - 28090612
Alignment:
Q  471 cagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaa 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28090461 cagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaaggcaaactggaggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaactacaacacaa 28090560  T
Q  570 ctttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28090561 ctttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatacaaaaataacattttgtccc 28090612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 416 - 620
Target Start/End: Original strand, 27838960 - 27839164
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  27838960 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgaa 27839059  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| || ||| ||  | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27839060 ggcaatggacaggataaa-acataaatttttgtccctcaccaaaccataaaacaactttttgtctcatgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcctt 27839158  T
Q  615 ttgtcc 620  Q
    ||||||    
T  27839159 ttgtcc 27839164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 418 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 5598688 - 5598484
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5598688 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagcacagaacagaacaactcaagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacgagacaaactggagg 5598589  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||     
T  5598588 caagggagaggacaaaaacagatatttttgtccttcatcaaacaacagcacaactttttgtctcacgtacaacttgtctaaaatatcaaaataacatttc 5598489  T
Q  617 gtccc 621  Q
    |||||    
T  5598488 gtccc 5598484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 450 - 732
Target Start/End: Original strand, 700521 - 700805
Alignment:
Q  450 gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtc 548  Q
    |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||  ||||| | ||||||||||||     
T  700521 gacaaaacaactctagttgttcaatgattgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaacaagagacaagggacaaaacaaaaattcatatttttgtt 700620  T
Q  549 cctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaatta 648  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||| |||||||    
T  700621 cctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttatctaaaataccaaaatattattttgtcccccgaaaatcatataaaacaaaaaatta 700720  T
Q  649 ttcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctg 732  Q
     ||| || |||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||  | || | |||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  700721 ctcattgccataaaaattttgtcatgtgctgttctaccttgtgttgtattattttgtcttgtactgttatgtccagtatttgctg 700805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Original strand, 37148475 - 37148797
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  37148475 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggatatgacagaacaactccagttgtcaattgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactgga 37148574  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||               ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37148575 ggcaagggacgggacaaaaactgaaatttttgttcctcaccaaaccacggcacaact---------------aagttgtctaaaacaccaaaatagcatt 37148659  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||         |||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  37148660 tcgtcccccaaaaagaatataaaataagaaattattcaataccataaaaatttgtcctgtgctgttataccttgtgttgtgctgttctgtattatactgt 37148759  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37148760 tttgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacgcacc 37148797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 464 - 621
Target Start/End: Original strand, 22432243 - 22432401
Alignment:
Q  464 agttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccac 562  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22432243 agttgtcctatgtttgatttgtaaaactgtttcaggttcaggataaactggaggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcatcaaaccac 22432342  T
Q  563 atcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22432343 aacacaattttttgtctcaagtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcgtccc 22432401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5673329 - 5673021
Alignment:
Q  427 atttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggaca 525  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||||         ||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  5673329 atttgctaaaaaatgaaggacaagacataacaactctagttgtttgatgtttgatttgt---------tcaggtacacgataaactggaggcaagggaca 5673239  T
Q  526 tgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnn 625  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||||||        
T  5673238 agtcaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtac-----gtctaaaatatcaaaataacattttgtcccccaa 5673144  T
Q  626 nnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgt 724  Q
       || ||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||| || || | || | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  5673143 aaatcgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaatatttgtcctttgatgttatgccttgtgttgtgctgttatatcttgtactgttctgtcaagt 5673044  T
Q  725 acttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| |||||||| |||||||||    
T  5673043 acttactgttttgtaaaccaaac 5673021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 416 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4665041 - 4664924
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  4665041 gggtgcgtttgatttgattaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttatccagtgtttgatttgtaaaacagtttcagggacaggacaaacagga 4664942  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaa 532  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  4664941 ggcaagggacatgacaaa 4664924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17031367 - 17031162
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| ||||||  | |||| ||||||| ||| ||||  ||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  17031367 gggtgcttttgatccgttaaaaaatgaaggacaagacaacacaactccacttgtataatgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagtacaaattgga 17031268  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| ||  | ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  17031267 ggcaaaggacaggacaaaaacataaatttttgcccctcattaaatcacagcacaacttttcgtcccacgtacaagttatttaaaatacaaaaatagcttt 17031168  T
Q  615 ttgtcc 620  Q
    ||||||    
T  17031167 ttgtcc 17031162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 645 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 20119750 - 20119642
Alignment:
Q  645 attattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaacca 744  Q
    |||||||||||  || |||||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  20119750 attattcaatgctattaaaatttgtcatgtactgttctgccttgtgttgtgctgttctatcttgtactgttctgtccaatacttactgttttgcaaacca 20119651  T
Q  745 aacgcaccc 753  Q
    ||| |||||    
T  20119650 aacacaccc 20119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 548281 - 548218
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  548281 ttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttaatgttttgcaaaccaaacacaccct 548218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 646 - 754
Target Start/End: Original strand, 27839187 - 27839295
Alignment:
Q  646 ttattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||| | ||||| || ||| |||||||  ||||||| | ||| || ||||||| ||||||||    
T  27839187 ttatttaatgtcataaaaaatggtcttgtgctattctgtcttatgttgtgttgctctatcttgtatcgttctgtccagtattttctgtttttcaaaccaa 27839286  T
Q  746 acgcaccct 754  Q
    |||||||||    
T  27839287 acgcaccct 27839295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 453
Target Start/End: Original strand, 21739016 - 21739053
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggaca 453  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21739016 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggaca 21739053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 31882896 - 31883234
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31882896 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 31882995  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31882996 ggcaagagacacgacaaaaactgatatttttgtgcctcagcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 31883095  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883096 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgttgttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 31883195  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31883196 tctgtactgtacttgctattttgcaaaccaaacacaccc 31883234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Original strand, 50386330 - 50386670
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50386330 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 50386429  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || ||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50386430 ggcaagagacatgacaaaaattgatatttttgtgcctcaacaaaccacagcacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 50386529  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||| ||       |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50386530 ttgttccccaaaaattgtataaaacaaaaaattattcaatgtgataaaaatttgtcctgtgctgttctcccttgtattgtgctgttcttttttgtactgt 50386629  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50386630 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaatgcacccta 50386670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 33364652 - 33364991
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33364652 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaacttcagttgtccagtgttttatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 33364751  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33364752 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgcccctcagcaaaccacatcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 33364851  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33364852 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgggttgttctctcttgtattgtgctattctttcttgtactgt 33364951  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33364952 tttgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 33364991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 28676001 - 28675659
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28676001 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaagaacaggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 28675902  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28675901 ggcaagggataggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 28675802  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  28675801 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 28675702  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28675701 ttctgtccagtacttattgttttgcaaaccaaacacaccctaa 28675659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 417 - 756
Target Start/End: Original strand, 51259655 - 51259996
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51259655 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 51259754  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51259755 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacggcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattt 51259854  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  51259855 tgtcccttaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcttgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 51259954  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51259955 tctatccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 51259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 29585084 - 29584753
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29585084 gtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 29584985  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584984 caagtgacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 29584885  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||        || ||||||| | ||||||| ||||||  || |||||||||| |||| || |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  29584884 gtccttcaaaaatcgtataaaataaaaaattactcaatgcaataaaaaatttgttctgtactgttctgccttatgttgtactgttctatcttgtactgtt 29584785  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29584784 ctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 29584753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 416 - 745
Target Start/End: Original strand, 12349045 - 12349376
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12349045 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacataacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 12349144  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349145 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacagcacaactttatgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 12349244  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  12349245 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 12349344  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    || ||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  12349345 ttatgtccaatacttgctcttttgcaaaccaa 12349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Original strand, 47958308 - 47958639
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  47958308 gtgcgtttgatttgctaaaaaacgatggacagtatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacaggaaaaactggagg 47958407  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958408 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaactacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 47958507  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  47958508 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgacataaaaaatttgttctatgctgttctgccttgtattgtagtgttctatcttgtattgtt 47958607  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47958608 ctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 47958639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 422 - 754
Target Start/End: Original strand, 1344587 - 1344921
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1344587 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactatttcaggtacaggacaaactggaggcaag 1344686  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344687 ggacaggacagaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 1344786  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  |||| | ||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  1344787 ctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaaattgtcatgtgatgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactgttttgt 1344886  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1344887 ccagtacttgctattttgcaaaccaaacacaccct 1344921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 2135281 - 2134948
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2135281 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 2135182  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  2135181 ggcaagggacagaacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattatctaaaataccaaaatagcact 2135082  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||  |    
T  2135081 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtaacg 2134982  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2134981 ttctgtctagtacttgctgttttgcaaaccaaac 2134948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 21221235 - 21221567
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21221235 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacagaacaactctagttgtccaatatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaa-ctgga 21221333  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21221334 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 21221433  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  21221434 ttgtccctcaaaaattgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgttctgccttatgttgtactgttctatcttgtactg 21221533  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  21221534 ttctgtctagtacttgctgtattgcaaaccaaac 21221567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 411 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 40094719 - 40094411
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40094719 cttaagggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacagaacaaa 40094620  T
Q  511 ccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40094619 ctggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtttcacgtacaaattgtctaaaataccaaaata 40094520  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttg 708  Q
    ||||||||||||       ||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||| | |||| |||||| ||||  |||||| |||||    
T  40094519 gcattttgtccctcaaaaatcgcataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtattgttctatcttg 40094420  T
Q  709 tactgttct 717  Q
    |||||||||    
T  40094419 tactgttct 40094411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 51925082 - 51925421
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  51925082 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggataggacagaacaactccagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 51925181  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  51925182 ggcaaaggacaggacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtttttaataccaaaataacatt 51925281  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  51925282 tcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtgctgttatgtcttgtactgt 51925381  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | | | | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51925382 tatatccagtacttaccgttttgcaaaccaaacgcaccct 51925421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 3864551 - 3864881
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3864551 gggtgcgtttcatttgctaaaaaatgag--acaggacagaacaactttagttgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgga 3864648  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3864649 ggcaaaggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcgccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 3864748  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || | | || | ||||  |||||| ||||||||||    
T  3864749 ttgtccc-caaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttatgcgttatgttgtaatgttctatcttgtactg 3864847  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  3864848 ttctgtgcagtacttactgttttgcaaaccaaac 3864881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 413 - 747
Target Start/End: Original strand, 25927198 - 25927535
Alignment:
Q  413 taggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  25927198 taggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgatggacaggacagaacaactctagttgtctaatgtttgatttgtaaaactgtttcaaatacaggacaaact 25927297  T
Q  513 ggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 611  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25927298 ggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaacacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataac 25927397  T
Q  612 attttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgta 710  Q
    ||||||| ||       || ||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  25927398 attttgttcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaatcactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgttctaccttgtattgtactgttctatcttata 25927497  T
Q  711 ctgttctgtactgtacttgctg-ttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  25927498 ctgttttgtccggtacttgttgtttttgcaaaccaaac 25927535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 433 - 747
Target Start/End: Original strand, 25860312 - 25860628
Alignment:
Q  433 taaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaa 531  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25860312 taaaaaatgaaggacttgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggacatgacaa 25860411  T
Q  532 atactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntca 631  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        ||     
T  25860412 aaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccgaaatagcattttgttctccaaaaatcg 25860511  T
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgc 730  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| | || | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |    
T  25860512 tataaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgtcctgtgttgttatgccttttgttgtgctgttctatcttgtactgttctgtccagtgcttac 25860611  T
Q  731 tgttttgcaaaccaaac 747  Q
     ||||||||||||||||    
T  25860612 cgttttgcaaaccaaac 25860628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 438 - 702
Target Start/End: Original strand, 20609544 - 20609810
Alignment:
Q  438 aatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatact 536  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||    
T  20609544 aatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggtggcaagggacaggacaaaaact 20609643  T
Q  537 catatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||     
T  20609644 catatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtatat 20609743  T
Q  637 aacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  20609744 aacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 20609810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 418 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 44117148 - 44116862
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44117148 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggactggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaaccgtttcaggtacaggacaaactggagg 44117049  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44117048 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccactgcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatttt 44116949  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||||||    
T  44116948 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgacttgtgttgtactgttct 44116862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 427 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 34026867 - 34026590
Alignment:
Q  427 atttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggaca 525  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  34026867 atttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctatttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtataggacaaactggaggcaagggaca 34026768  T
Q  526 tgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnn 625  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  34026767 tgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaattttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaa 34026668  T
Q  626 nnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
       || ||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  34026667 aaatcgtataaaacaaaaaattactcaataccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 34026590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 417 - 754
Target Start/End: Original strand, 4851338 - 4851670
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||    
T  4851338 ggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaag-----gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaagacaatttggag 4851432  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851433 gcaagggacaggacaaaaactcat--ttttgtccctcaccaacccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 4851530  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  4851531 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtcttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 4851630  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4851631 tttgtccggtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 4851670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 38213565 - 38213227
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  38213565 gggtgcgttttatttgctaaaaaatgaaagacaggatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtataggacaatctgga 38213466  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38213465 ggcaagagacaggacaaaaactcatatttttgtcactcacgaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataccatt 38213366  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||| |||| |||  | || || |||| | ||||||||||    
T  38213365 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgcctaatgttatgttgttttgtcttgtactg 38213266  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38213265 ttctgtacaatacttactgttttgcaaaccaaacacacc 38213227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 712
Target Start/End: Original strand, 42636277 - 42636575
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  42636277 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtataggacaaactgga 42636376  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42636377 ggcaagggacagaacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 42636476  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    |||||||       || | ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  42636477 ttgtccctcaaaaatcgtttaaaacaaaaaattacttaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactattctgtctagtact 42636575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20255255 - 20255007
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20255255 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 20255156  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20255155 ggcaaggaacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaacttcttgtcccac-tacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 20255057  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  20255056 ttgtccctcaaaaatcttataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 20255007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 39052715 - 39053055
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39052715 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaagacaagacaaaacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggcacaggacaaactggaggc 39052814  T
Q  519 ag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    |  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39052815 aatggacaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttg 39052914  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat--aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||       || |||||||||  |||||| ||||||  ||  ||||||||||  |||| | ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  39052915 tcccccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatgctataaaaaaatttgtcatgtgttgttctatcttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 39053014  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||| | | | || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39053015 ctgttcagcatttactattttgcaaaccaaacacaccctaa 39053055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24571486 - 24571151
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  24571486 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggcaag 24571387  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24571386 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaatacaaaaataggattttgtcc 24571287  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    |       ||  ||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| || |||| |||| | ||||  |||||| |||| || || |||||    
T  24571286 cccaaaaatcgaataaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtactgttctgccttatgttgtattgttctatcttatagtg-tctgt 24571188  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
     | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24571187 ccagtacttactgttttacaaaccaaacacaccctaa 24571151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 53557669 - 53558011
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| | | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  53557669 gggtgcatttgatttgctaaaaaataaaggatatgacagagcaactctagttgttcaatgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactgga 53557768  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53557769 ggcaatggacaggacaaaaactcatagttttgtccctcaccaaaccactgcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 53557868  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||| |  |||||| ||    
T  53557869 ttgtccttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttataccttgtattg 53557968  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53557969 ttctgtcaagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 53558011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 419 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 3964496 - 3964164
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||    
T  3964496 tgcgtttgatttgataaaaaatgaaggataggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcatggacatgacaaattggaggc 3964397  T
Q  519 agggacatg-acaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||  || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3964396 aaggaactggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcg 3964297  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata-aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||  | |||||| ||||||    
T  3964296 tccc-caaaaatcatataaaacataaaattattcaatatcatacaaaatttgtcttgtgctgttctgccttgtattgtgttgtgttgtcttgtgctgttc 3964198  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgca 750  Q
    | |   |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3964197 tatcaagtacttactgttttgcaaatcaaacgca 3964164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 21374141 - 21373812
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21374141 gggtgtgtttggtttgctaaaaaatgaagaaaatgacataacaacttcagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacttga 21374042  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374041 ggcaagggacaggacaaaatctcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 21373942  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |  ||         || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||         ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  21373941 tcttcggccaaaaatcgtataaaata-aaaattattcaatgccataaaaatttgtcctgtg--------tcttgtgttgtgctgttctgtcttgtattgt 21373851  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21373850 tctgtccaatacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 21373812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5442490 - 5442162
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  5442490 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaagctgtttcaggtacaagacaaactgga 5442391  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |||| ||    |||| |        |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5442390 ggcaagg----gacagag-------tttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtacaagctgtctaaaatatcaaaatagcattt 5442302  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| | || | ||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  5442301 tatccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttataccttgtattgtactgttctaaattgtactgt 5442202  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5442201 tctgtccagtacttgctattttgcaaaccaaacacaccct 5442162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 416 - 658
Target Start/End: Original strand, 49748785 - 49749028
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49748785 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggataggatagaacaactcaagttgtttagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 49748884  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  49748885 ggcaaaggacatgacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgttttaaataccaaaataacatt 49748984  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtca 658  Q
    | |||||       || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49748985 tcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtca 49749028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 29646277 - 29645944
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||    
T  29646277 gggtgcatttgattttctaaaaaatgaaggacaagacaaaacaattccagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacacgataaactgga 29646178  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29646177 ggcaagggataggacaaaaacatatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtttaaaataccaaaatagcatt 29646078  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaac-ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||  |||| | || | |||| | ||||| |||| | ||||||| ||    
T  29646077 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaaattatttaatgccataaaaatttgtcttgtgatgttataccttatgttgtgttgttttgtcttgtattg 29645978  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| |  |||||| | |||||||||||||||    
T  29645977 ttctgtccaatacttgttattttgcaaaccaaac 29645944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Original strand, 22484617 - 22484954
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  22484617 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggacaggacagaacaactccaattgtccagtgattgatttgtaaaacagtttcagggacatgacaaactgga 22484716  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||||||||||  ||   |||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22484717 ggcaagggacatgacaaaagctacaatttttgttccttgccaaactacaacacaactttttgtcccacgtataagttgtctaaaatacaaaaatagcatt 22484816  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       | |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||| ||| || |||| ||||||    
T  22484817 tcgtcacccaaaaattatataatacagaaaattattcaataccataaaaatttgtcttgtgctgttctaccttatgttgtgttgtcctatcttatactgt 22484916  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22484917 tatgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacacc 22484954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 417 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 51296789 - 51296544
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51296789 ggtgcgtttgatttgctaaa-aataaaga-cagaacagaacaactctaattgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 51296692  T
Q  517 gcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51296691 gcaaaggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaattttttgtcctaagtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcattt 51296592  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa 663  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  51296591 tgtccccaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaataccataaaa 51296544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 746
Target Start/End: Original strand, 3867522 - 3867849
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  3867522 ggggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacagaacaactccagttgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacatactgg 3867621  T
Q  515 aggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    || || | |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3867622 agacaagagacatgacaaaacctgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcctacgtacaagttttctaaaacaccaaaatagcat 3867721  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||  |||| | || | ||     |||||| |||||   ||||||||    
T  3867722 tttgtcccccaaaaatcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaacttgtcatgtgttgttatgcc-----ttgtgccgttctgcattgtactg 3867816  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  3867817 ttatgttcagtacttactgttttgcaaaccaaa 3867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 421 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 10747406 - 10747089
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag 520  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||     
T  10747406 cgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacaaaacaatttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaactattttaggtacaggacaaactggagacaa 10747307  T
Q  521 g-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    | || | |||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||                  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10747306 gagataggacaaaaactgatatttttgttcgtcagcaaaccaca------------------cgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtc 10747225  T
Q  620 ccnnnnnnn-tcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    ||        || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  10747224 cccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcttgtgctgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgtttta 10747125  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10747124 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 10747089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 416 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 50679009 - 50678809
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50679009 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagtacaagacataacaattcaagttgtccagtgtttgatttgaaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 50678910  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | | ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50678909 ggcaaagaacaggacaaaaactgatatttttgtctctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtatt 50678810  T
Q  615 t 615  Q
    |    
T  50678809 t 50678809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 669
Target Start/End: Original strand, 54622678 - 54622924
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||| ||    
T  54622678 tttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaaaacaacttcagttgtccggtatttgatttgtaaaactgtttcaggtactg-acaaactaaatgcaagg 54622776  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54622777 gacaggacaaaaactcatatttttgtcgctcacgaaaccacaacacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcgtccc 54622876  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
           || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54622877 ccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaattgt 54622924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 473 - 752
Target Start/End: Original strand, 26282315 - 26282599
Alignment:
Q  473 gtgtttgatttgtaaaactgtt---tcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcaca 568  Q
    ||||||||||||||||||| ||   | ||||||| ||||||| ||||| | | |||  |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  26282315 gtgtttgatttgtaaaactattatttaaggtacaagacaaactggaggtaagagacgggacaaaaacttatatttttgtctctcatcaaaccacagcaca 26282414  T
Q  569 actttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaattt 667  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26282415 actttttgtcccacgtataagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaattt 26282514  T
Q  668 gtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||  |||||| ||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26282515 gtcatgtgctgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctatccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 26282599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 19906970 - 19906767
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  19906970 tgcgattgatttgttaaaaaatgaaggacaggataaaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcagggacagaacaaactggaggc 19906871  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19906870 aagggacaggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaacaccaaaatagcatttcg 19906771  T
Q  618 tccc 621  Q
    ||||    
T  19906770 tccc 19906767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 45690780 - 45691112
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  45690780 gggtgcgtttgatttgctataaagtgaaggacaggatagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgcaaaactgtttcaggtacaggataaattgga 45690879  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||     || ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45690880 ggcaaaggacaggacaaaaactgatatttttctccctcacca-----cagcacaactttttgtctcacgcataagttgtctaaaataccaaaatcgcatt 45690974  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||        || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  45690975 tcgtcctccaaaaatcgtataaaaca-aaaattattcaatgctataaaaatttgtcatgtgttattctatcttatattgtgttgttctgtcttgtactgt 45691073  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| | | ||||||  ||||||| ||| ||||| |||||    
T  45691074 tctatccagtacttagtgttttgtaaatcaaacacaccc 45691112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 417 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24721695 - 24721496
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  24721695 ggtgcgtttaatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactggag 24721596  T
Q  517 g-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |  | ||||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24721595 gtaaaggacaggacaaaaactaaaattttggtacctcaacaaaccacaacacaactttttatcccacatacaagttgtctaaaacaccaaaatagcattt 24721496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Original strand, 3695181 - 3695372
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  3695181 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacatgacaaactgga 3695280  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3695281 ggcaagggacaggacaaaaa---------------ctcaccaaaccacatcacaaccttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtatt 3695365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 416 - 563
Target Start/End: Original strand, 41682927 - 41683075
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41682927 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 41683026  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccaca 563  Q
    ||| || |||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  41683027 ggcaagagacaagacaaaaactgatacttttgtccctcagcaaaccaca 41683075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 416 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43175686 - 43175591
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaac 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43175686 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactatttcaggtataggacaaac 43175591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 619
Target Start/End: Original strand, 39215404 - 39215547
Alignment:
Q  477 ttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaacttttt 575  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||  |||| ||| ||||| |||| || |||||    
T  39215404 ttgatttgtaaaactgtttcaagaacaggacaaaccggaggtaagggacaagacaaaaactgaaatttttaccccttaccgaaccaaatcataatttttt 39215503  T
Q  576 ctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39215504 gtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtc 39215547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 565 - 747
Target Start/End: Original strand, 53046670 - 53046848
Alignment:
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  53046670 cacaactttttgtcccacgtac-----gtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 53046764  T
Q  665 -tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     ||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  53046765 atttgttctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtattgttctgttcagtacttgttgttttgcaaaccaaac 53046848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6179637 - 6179467
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||    
T  6179637 gggtgcgtttgattttataaaaaatgaaggacaggataaaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcagaaacaggtcaaactgga 6179538  T
Q  516 gg-cagggacatgacaaatactcatatttttgt-ccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgt 584  Q
    ||  ||||||| |||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  6179537 ggtaagggacaggacaaaaactgtaatttttgtcccctcgccaaaccacagcacaactttttgtcacacgt 6179467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 755
Target Start/End: Original strand, 41694925 - 41695094
Alignment:
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41694925 cacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaatactgaaatagcattttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaa 41695024  T
Q  665 tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||||| ||||||                    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41695025 tttgttctgtgc--------------------tgttctttcttgtactgttttgt-ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 41695094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 433 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 52300633 - 52300442
Alignment:
Q  433 taaagaatgaagaacaggacagaacaactc---tagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatga 528  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||    | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||  || |||||||| | ||| | |||||| ||    
T  52300633 taaaaaatgaaggacatgacagaacaacttcggttgttgtccaatgtttgattcataaaactgtttcagagacgggacaaactgcaggtaagggacagga 52300534  T
Q  529 caaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  52300533 caaaaactgaaatttttgtccatcaccaaaccacaacgcaattttttgtccca-gtacaagttgtctaaaacaccaaaatatcatttcgtccc 52300442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 616
Target Start/End: Original strand, 34351303 - 34351443
Alignment:
Q  477 ttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaacttttt 575  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| |   |||| |||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34351303 ttgatttgtaaaactgtttcagggacatgacaaactagaggaaatagacacgacaaaaacaaaaattattgtccctcatcaaaccacaacacaacttttt 34351402  T
Q  576 ctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
     || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34351403 gtcgcacatacaagttgtctaaaatatcaaaataacatttt 34351443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 44000462 - 44000267
Alignment:
Q  425 tgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag-gga 523  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  || | | || ||||   |||||  |||    
T  44000462 tgatttgctaaa-aatgaatgacatgacatgacaactctagttgtaccgtgtttcatttgtaaaactgtttttgggaaatgataaactcaaggcaaagga 44000364  T
Q  524 catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||| ||  |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  44000363 catgacaaaaacagaattttttttccctcactaaaccacatcacaattttttgtcccacgtacaagttatctgaaatacaaaaatagttttttgtcc 44000267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 544 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 44267824 - 44267688
Alignment:
Q  544 ttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataa 643  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||         |||||||||||| ||    
T  44267824 ttgtccctcgccaaaccacaacataactttttatcccacatacaaattgtctaaaatacaaaaatagcatttcgtcatccaaaaatcatataaaacaaaa 44267725  T
Q  644 aattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctatt 680  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||  |||||||||    
T  44267724 aattattgaatacgataaaaatttgtcttgtgctatt 44267688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 43175563 - 43175441
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgc 730  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||| |  |||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  43175563 tataaaacaaaaaattactcaataccataaaaaatttatcgtgtgctgttctgtcttgtattatactgttctatcttgtactgttttgtccagtacttgc 43175464  T
Q  731 tgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  43175463 tgttttgcaaaccaaacacaccc 43175441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25954554 - 25954408
Alignment:
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  25954554 gacacgacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaattacagcacaactttttgtctcacatataagttgtttaaaatactaatataacatttcgtccc 25954455  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
            | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25954454 caaaaag-cgtataaaataaaaaattattcaatatcataaaaatttgt 25954408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 609
Target Start/End: Original strand, 8648538 - 8648625
Alignment:
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8648538 gacatgacaaaaactgaaattcttgttcctaactaaactacatcacaactttttgtcacaagtacaaattgtctaaaataccaaaata 8648625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8253885 - 8253684
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||| | | ||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  8253885 ggggtgcgtttgatctactaaaaaatgaaggataagacaagacaactctagttgtataatgttcgatttgtaaagttgtttcaaggacaagacaaactgg 8253786  T
Q  515 aggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    || | ||| |||||| ||| ||| |  || ||||| || || |||||||  ||||||| |||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8253785 agtcaaggaacatgataaaaactgaagttcttgtctct-actaaaccacgacacaactctttgccccaattaaaagttgtctaaaataccaaaataacat 8253687  T
Q  614 ttt 616  Q
    |||    
T  8253686 ttt 8253684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 609
Target Start/End: Original strand, 14155433 - 14155528
Alignment:
Q  513 ggaggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||| ||| || | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14155433 ggaggaagggacatgacaaaaactgaaatttta-tccctcactaaatcataacacaactttttgtctcaagtacaagttgtctaaaatatcaaaata 14155528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 538
Target Start/End: Original strand, 53046605 - 53046668
Alignment:
Q  476 tttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg-cagggacatgacaaatactca 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||    
T  53046605 tttgatttgtaaaactgtttcaggtataggacaaactggaggtaagggacaggacaaaaactca 53046668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 706 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 20254994 - 20254946
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20254994 ttgtactgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 20254946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 26847532 - 26847349
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||||  ||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||  | |  |||||  |||||| ||    
T  26847532 gtttgatttgctaaaaaatgaagcatatgacatgacaactccacttgtatagtgtttaatttgtaaaactgtttaagtgatataacaaattggaggcaag 26847433  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaac-tttttctcccacgtacaagttgtctaaaatacc 603  Q
     |||| |||||| ||| | |||  ||||||| |  ||| |||| || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26847432 agacaggacaaaaactgaaattcatgtcccttataaaatcacaacaaaacttttttgtcccacatacaagttgtctaaaatacc 26847349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 566 - 620
Target Start/End: Original strand, 8067082 - 8067136
Alignment:
Q  566 acaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8067082 acaactttttgtcacacgtacaagttatataaaatatcaaaatagctttttgtcc 8067136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19190786 - 19190717
Alignment:
Q  540 atttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  19190786 atttgtgtccctcactaaaccacatcacaa-tttttgtctcacatataagttatctaaaatacaaaaatag 19190717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 551 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 23322216 - 23322158
Alignment:
Q  551 tcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23322216 tcactaaaccacaacacaactttttatctctcgtacaagttgtctaatatatcaaaata 23322158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 571 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 32621924 - 32621886
Alignment:
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32621924 tttttgtcccatgtacaagttgtctaaaataccaaaata 32621886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 415 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 31004352 - 31004015
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31004352 ggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgg 31004253  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31004252 aggcacgggacaggacaaaaactgatgtttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtat 31004153  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    || |||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31004152 ttcgtcccccaaaaatcctataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcctgtgatgttctcccttgtattgcgctgttctttcttgtactg 31004053  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004052 ttctgtacagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 31004015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 50304870 - 50304532
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50304870 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 50304771  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50304770 ggcaagaaacaagacaaaaactgatatttttgtccctctgcaaaccacagcacaactttttgtctcacgtttaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 50304671  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||        || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50304670 ttgtcctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctgttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 50304571  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50304570 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 50304532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 844679 - 845019
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  844679 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 844778  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844779 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 844878  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  844879 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 844978  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  844979 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 845019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42510744 - 42510404
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42510744 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaggacaactctagttgtccagtgtttgattcgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 42510645  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510644 gacaagggacaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 42510545  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  42510544 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 42510445  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  42510444 ttctgtccagtacttactgttttgcaaatcaaacacaccct 42510404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 42512725 - 42513060
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42512725 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 42512824  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  42512825 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtgcctcagcaaaccacaacacaactttttgtcctacgtacaaattgtctaaaatatcaaaatagaatt 42512924  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42512925 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtgataaaaatttgtcctgtgctgttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 42513024  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  42513025 tctgtactgtact---tgttttgcaaaccaaacgcaccc 42513060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 418 - 756
Target Start/End: Original strand, 6711003 - 6711344
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6711003 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagagg 6711102  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711103 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaattttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 6711202  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  6711203 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctattttgtactgtt 6711302  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgc-aaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6711303 ctgtccagtacttgatgttttgcaaaaccaaacacaccctaa 6711344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 16387069 - 16386734
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16387069 tgcgtttgattt-ctaaaaaatgaaggacatgacagaacagttctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagaggc 16386971  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386970 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 16386871  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16386870 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtattgtactgttctatcttgtactgttc 16386771  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386770 tgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 16386734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 417 - 753
Target Start/End: Original strand, 1351391 - 1351728
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1351391 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 1351490  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351491 gcaaggaacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 1351590  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||| |       |||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1351591 tgtctctcaaaaatcatataaaaca-aaaaatactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 1351689  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1351690 tctgtcaagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 1351728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 51264714 - 51264381
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264714 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaataactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 51264615  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51264614 ggcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtttaaaatactaaaatagcatt 51264515  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  51264514 ttgtcctttaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctattctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactg 51264415  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51264414 ttctgtccaatacttgctgatttgcaaaccaaac 51264381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16451344 - 16451013
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16451344 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacataacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 16451245  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16451244 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 16451145  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  16451144 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctattctgccatgtgttgtactattctatcttgtactgtt 16451045  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  16451044 ctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 16451013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 41973130 - 41972792
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41973130 gggtgagtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacaggacaaactgga 41973031  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41973030 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacactacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 41972931  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  41972930 ttgtccc-tcaaaatcgtataaaacaaaaaattacttaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 41972832  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41972831 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 41972792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 415 - 747
Target Start/End: Original strand, 45490829 - 45491163
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45490829 ggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaagacaggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactgg 45490928  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45490929 aggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 45491028  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata-aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||| || |    
T  45491029 tttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccatacaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtattgttctatcttatatt 45491128  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  45491129 gttctgtccagtaattgctgttttgcataccaaac 45491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 422 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 32270566 - 32270244
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  32270566 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtagaggacaaactggaggcaag 32270467  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32270466 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtcc 32270367  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||    ||| |||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||     
T  32270366 ctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatt----tgtcctattctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactgttttgtc 32270271  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  32270270 cagtacttgctgttttgcaaaccaaac 32270244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 417 - 756
Target Start/End: Original strand, 35387267 - 35387608
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387267 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 35387366  T
Q  517 g-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387367 gtaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 35387466  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| | |    
T  35387467 tatccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctaccttgtgttgtactgttctatcttgtattat 35387566  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35387567 tatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacagaccctaa 35387608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 24339593 - 24339925
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24339593 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtataactgtttcaggtacatgacaaactgga 24339692  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcacc-aaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24339693 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaaccacaacacaactttttttcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca- 24339791  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
     |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  24339792 -ttgtcccccaaacatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtact 24339890  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  24339891 gttctgtccagtatttgctgttttgcagaccaaac 24339925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Original strand, 28340262 - 28340597
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28340262 tgcgtttgatttgctaaaaaat-aaggacaggatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggc 28340360  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340361 aagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 28340460  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  28340461 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaaattgtcatgtactgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttc 28340560  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| |  ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  28340561 tgtccaatacttactgttttgtaaaccaaacacaccc 28340597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 417 - 663
Target Start/End: Original strand, 32289300 - 32289547
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32289300 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattggag 32289399  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32289400 gcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgttccacgtacaagttgtttaaaataccaaaatagcattt 32289499  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa 663  Q
    ||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289500 tgtccctcaaaaattatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa 32289547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 26118170 - 26118458
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26118170 gggtgcgtatgatttgctaaaaaatgaaggacatgacataacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 26118269  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118270 ggcaaaggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtaaaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 26118369  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  26118370 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 26118458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 448 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 12890425 - 12890124
Alignment:
Q  448 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  12890425 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttctggtacaggataaactggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttg 12890326  T
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaat 646  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       || ||||||||| |||||    
T  12890325 tccctcatcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaagataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaat 12890226  T
Q  647 tattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    || |||||| ||| |||||||| | ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||    
T  12890225 tactcaatgccataaaaaatttatcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtctagtacttactattttgcaaaccaa 12890126  T
Q  746 ac 747  Q
    ||    
T  12890125 ac 12890124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7184134 - 7183797
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7184134 tgcgtttgatttgctaaaatttgaaagacaggacagaataactttagttgtccagtgtttgatatgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggc 7184035  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7184034 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaatatagtattttg 7183935  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    || |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  | ||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  7183934 tctctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtattgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactgttc 7183835  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7183834 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 7183797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 418 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 50540561 - 50540221
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  50540561 gtgcgtttgatttgctaaaaaagaaaggacagaacaaaacagctctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactggagg 50540462  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50540461 caagggacaggacataaactcatatttttgtccttcatcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 50540362  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       ||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||  | ||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  50540361 gtcccccaaaaatcatataaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgccctgtgctgttctgacgtgtgttgtactgttctatcttatactgtt 50540262  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50540261 ctgtcaagtacttactgttttgcaaaccaaacacactctaa 50540221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17888167 - 17887828
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17888167 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaatgacatgacaaaacaactctagttgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgga 17888068  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17888067 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcgccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 17887968  T
Q  615 ttgt-cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    |||| |||       || |||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  17887967 ttgtccccccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtattgttctatcttgtact 17887868  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
     |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17887867 attctgtcccgtacttactgttttgcaaaccaaacacacc 17887828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 418 - 752
Target Start/End: Original strand, 41967805 - 41968142
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttg-ctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41967805 gtgcgtttgatttgactaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtatttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagag 41967904  T
Q  517 gcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41967905 gcaagagacaagacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagccttt 41968004  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||| |       |  ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||  | |||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  41968005 tgtctcccaaaaattgtataaaacaaaaaattactcattgtcataaaaaatttgtcatgtattgttccgccttgtgttgtgttgttctgtcttgtactgt 41968104  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41968105 tctgtccagcacttactgttttgcaaaccaaacacacc 41968142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 751
Target Start/End: Original strand, 11772587 - 11772923
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  11772587 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggacaggacataacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaaggcaatctgga 11772686  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||    
T  11772687 ggcaaaggacaagacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacctacaaattgttttaaataccaaaatagtatt 11772786  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  11772787 tcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaataattcaaaaccataaaaatttgtcctgtgctattctgccttgtgttgtgttgttatgtcttgtactgt 11772886  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    | ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11772887 tatgtccagtacttaccgttttgcaaaccaaacgcac 11772923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 16476110 - 16476449
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16476110 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggagaggagaggacaattttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 16476209  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16476210 tgcaagggacaggataaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacggcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 16476309  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| | || | |||| | | ||| |||||| |||| || |||    
T  16476310 ttgtcccccaaaaattgtataaaacataaaattattcaatgccatacaaatttgtcatgtggtgttatgccttatgtcgtgttgttctatcttatattgt 16476409  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16476410 tatgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 16476449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 6029251 - 6029597
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatga-----agaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6029251 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaa 6029350  T
Q  511 ccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | | |||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6029351 ctgaaggcaagggacaggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacaccaaaata 6029450  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgt 709  Q
     ||||| |||||        |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||   || |    
T  6029451 acatttcgtcccccaaaaagcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcctgtgctgttatgccttgtgttgtgctgttctgcattat 6029550  T
Q  710 actgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6029551 actgtgctgtccagtacttactattttgcaaaccaaacgcaccctaa 6029597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 30105634 - 30105923
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  30105634 gggtgcttttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtaaaggacaaactgg 30105733  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30105734 aggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcataactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 30105833  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||||||       || ||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||| | ||| | |||| |||||| |||| |||||||    
T  30105834 tttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattacttaatgccataaaaaatttgtccagtgttgttctgccttgtgttgtactgttct 30105923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 418 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39282111 - 39281774
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |    
T  39282111 gtgcgtttgatttgctaaaacatgaaggacatgacaagataacttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttaaggtacaggacaaactagatg 39282012  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39282011 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttc 39281912  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| | || | | |||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  39281911 gtcctccaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaagttgtcatgtgttgttatgcattgtgttgtgctgttctatcttatactattc 39281812  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39281811 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 39281774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 44737997 - 44738329
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  44737997 gggtgcgtttgttttgctaaaaaatgaaagacaagacagaacaactctaattgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaacttgga 44738096  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  44738097 ggcaagggacaggaccaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatagcaaaatag-ttt 44738195  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    || | ||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  44738196 ttattcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctaccttgtgttgtattgttctatcttctactg 44738295  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  44738296 ttctgtctagtacttgctgttttgcaaaccaaac 44738329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 423 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16437574 - 16437322
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag-g 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |    
T  16437574 tttgatttgctaaaaaatgaaggacagaatagaacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcagctacaggacaaactagaggcaaag 16437475  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16437474 gacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtcct 16437375  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgt 674  Q
           || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16437374 tcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaatttgtcctgt 16437322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Original strand, 17327606 - 17327937
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17327606 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacaaaacaactctagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagt 17327705  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  17327706 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtctcatgtacaaattatctaaaataccaaaataatatttt 17327805  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || |||||||||  |||||| |||| | ||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  17327806 gtcccccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaacgccataaaaaatttgtcctatgttgttctgccttgtattgtactgttctatcttatactgtt 17327905  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| |  ||||| || ||||||||| |||||    
T  17327906 ctgtccaatacttacttttttgcaaatcaaac 17327937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 539 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 38663227 - 38663014
Alignment:
Q  539 tatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaa 638  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       || |||||||    
T  38663227 tatttttgtccctcagcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacattttgtccctcaaaaatcgtataaaa 38663128  T
Q  639 cataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgc 738  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38663127 caaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgttgttctcccttatattgtgttgttctttcttgtactgttttgtactgtacttgctgttttgc 38663028  T
Q  739 aaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||||||||||||    
T  38663027 aaaccaaacgcacc 38663014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 45659040 - 45658755
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  45659040 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggacaggacaaaacaactccagttgtctagtgtctgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactgga 45658941  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | | ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45658940 gacaaaggacaagacaaaaactgatatttttgtcgctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacctacaagttgttttaaataccaaaatagcatt 45658841  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgtt 700  Q
    | |||||       |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  45658840 tcgtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaaagccataaaaatttgtcatgtgctattctgtcttgtgttgtgctgtt 45658755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 418 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 1601387 - 1601049
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1601387 gtgcgtttgatttgctaaa-aatgaagaacatgacagaacaactttagttgttcagtgtttgatttgtaaaacggtttcaggtacaggacaaactggagg 1601289  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||| |  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1601288 caagggatagaacaaaaactcat--ttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 1601191  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctccc-----ttgtattgtgctgttctttcttgta 710  Q
    ||||        || || |||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||  |||| | |||| ||     |||| ||||| ||||||||||||||    
T  1601190 gtccaccaaaaatcgtacaaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgtcttgtgttgttctgccttgtgttgtgttgtgttgttctttcttgta 1601091  T
Q  711 ctgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1601090 ctgttttgtccagtacttactgttttgcagaccaaacacacc 1601049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 416 - 735
Target Start/End: Original strand, 15539845 - 15540165
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  15539845 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaaggacagaacaaactgga 15539944  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| ||||||  || | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15539945 ggcaagagacaggacaaaacctgaaacttttgtctttcaccaaaccacagcacaactttttgtcatacgtagaagttgtctaaaacaccaaaataacatt 15540044  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  |||| | || | |||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  15540045 ttgtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaataccataaaaacttgtcatgtgttgttatgccttgtgttgtgctgttctgcattgtactgt 15540144  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttt 735  Q
    ||||| | |||||| ||||||    
T  15540145 tctgtccagtacttactgttt 15540165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 417 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 46155125 - 46154780
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  46155125 ggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctaattgttcagtgtttgatttgtaaaattatttcaggtactggacaaactggag 46155026  T
Q  517 g-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcac-------caaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaat 608  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||       ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46155025 gtgagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaactacaaactacagcacaactttttgtcccacttacaagttgtctaaaataccaaaat 46154926  T
Q  609 agcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttctt 707  Q
    | ||||||||||        || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  || |  ||||| || | ||||||| ||||    
T  46154925 aacattttgtccttcaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgccgttatgtcttgtgttatactgttctatctt 46154826  T
Q  708 gtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
     ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  46154825 atactgttttgtccagtacttactgttttgcaaactaaacacaccc 46154780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Original strand, 51703118 - 51703455
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttg-ctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |     
T  51703118 gggtgcgtttgatttgactaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaagtacaggataaactga 51703217  T
Q  515 aggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  51703218 aggcaagggacagaacaaaaactcatatttttgttcctcacc-aaccacaacacaactttttgtcccacctacatgttgtctaaaatacaaaaataacat 51703316  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||  | || | |||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  51703317 tttgtccc-tcaaaatggtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtattgttttgccttgtgttgttctgttatatcttgtact 51703415  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51703416 gttttgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 51703455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 418 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 5109945 - 5109742
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  5109945 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagtgcaggacagaacaactccagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaattggagg 5109846  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  5109845 caagggacaggacaaaaactcatgtttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtccaaagtacaagttgtctaaaat-gcaaaataacatttt 5109747  T
Q  617 gtccc 621  Q
    |||||    
T  5109746 gtccc 5109742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Original strand, 26764750 - 26765082
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||    
T  26764750 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaagacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtacaattgttttaggtacaagataaactgga 26764849  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26764850 ggcaaaggacaggacaaaaacttatatttttgtccctcaccgaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataatatt 26764949  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || |||     ||||||  ||||||||  |||||||||||| || |  | |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  26764950 tcgtccctcaaaaatcgtat-----ataaaaaaattcaatgctataaaaatttgtcctatattgttctgccttgtgttgtgttgttctatcttgtactgt 26765044  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  26765045 tctgtccagtacttactgttttgcaaatcaaacacacc 26765082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 422 - 747
Target Start/End: Original strand, 6143947 - 6144273
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-g 520  Q
    |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| |    
T  6143947 gtttgatttgatacaaaatgaaggacaggacagaacaactgcagttgtccaatgtttgatttgtaaaacagtttcagagacatgacaaactggaggcaag 6144046  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||   |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  6144047 ggacaggacaaaaactgcaatttttgtccctcggcaaaccacaacacaactttttctcccacgtagaagttgtctaaaacacaaaaataacattttgtca 6144146  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||| | |||| |||| | ||||| ||  || ||||||||||||||||     
T  6144147 cccaaaaatcatataaaacagaaaattattcaataccataaaaatttgtcttgtgatgttctgccttatgttgtgttgccctatcttgtactgttctgtt 6144246  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | ||  || ||||||||||||||||||    
T  6144247 cagtgattactgttttgcaaaccaaac 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 414 - 621
Target Start/End: Original strand, 49303307 - 49303515
Alignment:
Q  414 aggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  49303307 aggggtgcgtttgatttgctaaaaaataaagtacaagacaaaacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtataagacaaactg 49303406  T
Q  514 gaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca 612  Q
    ||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49303407 gagacaagggacaagagaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaattttttatcctacgtacaagttgtctaaaatactaaaataaca 49303506  T
Q  613 ttttgtccc 621  Q
    |||||||||    
T  49303507 ttttgtccc 49303515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 448 - 747
Target Start/End: Original strand, 13994062 - 13994362
Alignment:
Q  448 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagggacatg-acaaatactcatatttttg 546  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||| |||  || ||||| ||| | |||||||    
T  13994062 aggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcatggacatgacaaattggaggcaaggaactggacaaaaactgaaatttttg 13994161  T
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaat 646  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  13994162 tccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcatgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcgtccc-caaaaatcatataaaacataaaat 13994260  T
Q  647 tattcaatgtcata-aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||| |||||||||||| |||  | |||| |  |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13994261 tattcaatatcatacaaaatttgtcttgtgttgttctgccttgtattgtgttgtgttgtcttatgttgttttgttctgtacttattgttttgcaaaccaa 13994360  T
Q  746 ac 747  Q
    ||    
T  13994361 ac 13994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16704915 - 16704604
Alignment:
Q  446 acaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttt 544  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||    
T  16704915 acaggacagaacaacttcaattgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactggaggcaagggacacgacaaaaacatatatttt 16704816  T
Q  545 tgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaa 644  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        || ||||||||| |||    
T  16704815 tgtcccttaccaaaccacatcacaactctttgtctcacatacaagttgtctaaaataccaaaatagctttttgtcctccaaaaatcgtataaaacaaaaa 16704716  T
Q  645 a-ttattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaacc 743  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||| | || | || || |||||| ||||||  |||| ||| | |||||| |||||||| |||||    
T  16704715 atttatttaatgccataaaaatttgtcttgtactattctgctttatgttttgttgttctgtcttgtgttgttatgtccagtactttctgttttgaaaacc 16704616  T
Q  744 aaacgcacccta 755  Q
    |||| |||||||    
T  16704615 aaactcacccta 16704604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 521 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 25539968 - 25539732
Alignment:
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  25539968 ggacaagacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacctacaagttgttttaaataccaaaatagcatttcgtcc 25539869  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||| | |||||||||||| |||     
T  25539868 cccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaaagccataaaaatttgtcctgtgctattctgccttgtgttgtattgttatgtcttgtactgttatgtc 25539769  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaat 757  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25539768 cagtacttaccgttttgcaaaccaaacgcaccctaat 25539732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 438 - 747
Target Start/End: Original strand, 38086973 - 38087283
Alignment:
Q  438 aatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag-ggacatgacaaatact 536  Q
    ||||||| | |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||||||| |||    
T  38086973 aatgaaggataggacaaaacaacttcagttgtcctgtgtttgatttataaaacagtttcaagtacaggataaaatggatgcaatggacatgacaaaaact 38087072  T
Q  537 catatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataa 636  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||       |   ||||    
T  38087073 catatttttgtccttcactaaaccacatcacaactttttgtcccaagtacaagttgtctaaaaatccaaaatagcatttcgttccccaaaaattgcataa 38087172  T
Q  637 aacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgtttt 736  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||||||    
T  38087173 agcaaaatattattcaatgccataaaaatttgtcctgtgctgttctgccttatgttgtactgttctgtcttgtactgttatgtccagtacttaatgtttt 38087272  T
Q  737 gcaaaccaaac 747  Q
    |||||||||||    
T  38087273 gcaaaccaaac 38087283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10384581 - 10384254
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||    
T  10384581 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagaactg-----aacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaattatttcaggtacagtacaaattgga 10384487  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     |||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||   ||||||| ||||    
T  10384486 tgcaaaggacaagacaaaaactcatatttttgtccttcactaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattatctaaaaattcaaaataacatt 10384387  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| | ||| | || | || ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  10384386 tcgtcccccaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgcaataaaaaattgtccagtgttgttttgccctgtgttgtgctgttcggtcttgtactgt 10384287  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | ||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  10384286 tatgcccagtacttactgttttgcaaaccaaac 10384254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 42705192 - 42705442
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | | || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42705192 gggtgcgtttgatttgcgaaaaaataaagaatatgtcataacaactctgattgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 42705291  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaata-ctcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    | || |||||  || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42705292 gacaagggacgggaaaaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaacttttcgtcccacgtacaagttgtctgaaatgtcaaaatagcat 42705391  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||||||||       |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  42705392 tttgtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaattactcattgccataaaaa 42705442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 664
Target Start/End: Original strand, 3414814 - 3415058
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    |||||||||| ||||  |||||| | | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||| | ||    
T  3414814 gtttgatttgttaaaatatgaaggatatgacaaaacaactctaattatccagtgtttgatttgtaaaactattttaggtactggacaatctggagacgag 3414913  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3414914 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaactacatcataattttttatcccacgtactagttgtttaaaataccaaaatagcattttgtcc 3415013  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaac-ataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |       ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  3415014 cccaaaaatcatataaaacaaaaaaattactcaatgccataaaaa 3415058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 418 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 7837351 - 7837149
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| | | || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  7837351 gtgcgcttgatttgctaaaaaaatgaaggatatgatagaacaacttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggaacatgacaaactagag 7837252  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| ||||||||||||| | | |  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7837251 gcaagggacatgacaaaaattgaattttttgtccattaccaaatcacatcacaactttttgtctcacagacaagttgtctaaaatatcaaaatagtattt 7837152  T
Q  616 tgt 618  Q
    |||    
T  7837151 tgt 7837149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 455 - 665
Target Start/End: Original strand, 50382394 - 50382608
Alignment:
Q  455 aacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag----ggacatgacaaatactcatatttttgtccc 550  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |    ||||| |||||| ||| | ||||||||||     
T  50382394 aacaactctacatgtttagtgtttgatttttaaaactgtttcagggacataacaaactggaggaggcaatggacaggacaaaaactgaaatttttgtcct 50382493  T
Q  551 tcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattatt 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||       |||||||||||| || ||||||    
T  50382494 tcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacacaaaaataacattttgtccctcaaaaatcatataaaacaaaatattatt 50382593  T
Q  651 caatgtcataaaaat 665  Q
    ||||  |||||||||    
T  50382594 caataccataaaaat 50382608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 418 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8839114 - 8838983
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8839114 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactccaattgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttctggtacaagacaaactggagg 8839015  T
Q  518 -cagggacatgacaaatactcatatttttgtc 548  Q
      | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8839014 aaatggacatgacaaaaactgatatttttgtc 8838983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 416 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 21071833 - 21071730
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  21071833 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagtacatgacagaacaacttcaattgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacatgacaaactgga 21071734  T
Q  516 ggca 519  Q
    ||||    
T  21071733 ggca 21071730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 419 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 38663323 - 38663231
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaac 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  38663323 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaaggacaggataaac 38663231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 480 - 702
Target Start/End: Original strand, 20494927 - 20495134
Alignment:
Q  480 atttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctc 578  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||                 | ||    
T  20494927 atttgtaaaattgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccatcaccaa-----------------tgtc 20495009  T
Q  579 ccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgct 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  20495010 ccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatagtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgct 20495109  T
Q  678 attctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
     |||| |||| | |||| |||||||    
T  20495110 gttctgccttatgttgtactgttct 20495134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 26733774 - 26733579
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||   | || ||||||||  ||    
T  26733774 gggtgcatttgacttgctaaaaaatgaagaacaagacatgacaacttcagttgtacgatgtttgatttgtaaaactgtttttaggaccggacaaactaga 26733675  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    | | | |||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26733674 gacgatggacatgacaaaaactgaaattcttgtcccccactaaaccataacacaactttttgcctcatgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 26733579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 466 - 669
Target Start/End: Original strand, 25343213 - 25343418
Alignment:
Q  466 ttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag--ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccaca 563  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||   ||| | || ||| || ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25343213 ttgtcctgcgtttgatttataaaacagtttcatatacaggacaaactggatgcaaatggataggataaaaacacatatttttgtccttcactaaaccata 25343312  T
Q  564 tcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa 663  Q
      |||||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||       ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25343313 gtacaactttttgtcgcacgtacaagttgtccaaaaatccaaaatagtatttcgtccctcaaaaatcgcataaagcaaaaaattattcaatgtcataaaa 25343412  T
Q  664 atttgt 669  Q
    ||||||    
T  25343413 atttgt 25343418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 679 - 751
Target Start/End: Original strand, 23799683 - 23799755
Alignment:
Q  679 ttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23799683 ttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgttctatacagtacttactgttttgtaaaccaaacgcac 23799755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 40811326 - 40811405
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttt 495  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40811326 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaaaacaactttagttgtccagcgtttgatttataaaactgttt 40811405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 547 - 620
Target Start/End: Original strand, 46815816 - 46815889
Alignment:
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46815816 tccctcactaaaccatatcacaaccttttttcccacgtactagttgtctaaaataccaaaataacattttgtcc 46815889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 473 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 6771530 - 6771382
Alignment:
Q  473 gtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaact 571  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||   ||| | ||||||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  6771530 gtgtttgatttataaaactgttttagggacatgataaattagagacaagggacaagacaaaaactaaaattcttgtcactcactaaatcacaacacaact 6771431  T
Q  572 ttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  6771430 ttttctcccacatacaagttgactaaaatatcaaaataatattttgtcc 6771382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 618
Target Start/End: Original strand, 504394 - 504549
Alignment:
Q  464 agttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccac 562  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||||  ||||| ||| | | ||||||| ||||| ||||||     
T  504394 agttgtacagcgtttgatttgcaaaattgttttagggacaagacaaacttgaggcaagggacaacacaaaaactgaaaattttgtctctcactaaaccat 504493  T
Q  563 atcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    | ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  504494 aacacaattttttgtcccacatagaagttgtctaaaataccaaagtagctttttgt 504549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 475 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 570549 - 570404
Alignment:
Q  475 gtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca--gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacat--cacaac 570  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||| || |||| |||||||  ||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  570549 gtttgatttataaaattgtttcagcgacaagataaactggaggcaaagggacatgataaaaacagaaatttttgtccctcaccaaaccacaatgcacaac 570450  T
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  570449 tttttgtctcgcgtataagttgtctaaaatatcaaaataacatttt 570404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 549 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 34664012 - 34663858
Alignment:
Q  549 cctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaatta 648  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |       |||||||||||| |||||||    
T  34664012 cctcaccaaaccacaacacaactttttgacccacttataaattgtctaaaatatcaaaataacattttgtcactcaaaaatcatataaaacaaaaaatta 34663913  T
Q  649 ttcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
     | |||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | |||| |||||||    
T  34663912 cttaatgccataaaaaatttgtcatgtgctcttctaccttatgttgtactgttct 34663858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7837545 - 7837433
Alignment:
Q  464 agttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccac 562  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||| | | |  ||||||||| | | |||| |||    
T  7837545 agttgttcagtgtttgatttataaaactgtttcaggaacatgacaaactagaggcaggggacatgacaaaaattgaattttttgtccattatcaaatcac 7837446  T
Q  563 atcacaacttttt 575  Q
    |||||||||||||    
T  7837445 atcacaacttttt 7837433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 593
Target Start/End: Original strand, 23799603 - 23799670
Alignment:
Q  526 tgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgt 593  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  23799603 tgacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttatcgcacgtttaagttgt 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 39793023 - 39792826
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |  ||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||  ||||     
T  39793023 gtgcgtttgatttgctaaa-aatggaggacatgaaatgacaacttaggttgtacagtgtttgatttgcaaaactgttttagggacaagataaattggaga 39792925  T
Q  518 cagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||   || |||||||| | | | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  39792924 caaaagatatgacaaaaattgaaattcttgtccttcaccaaaccacaacacaacttgttgtttcacgtacaaattgtctaaaataataaaataacattt 39792826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 40610809 - 40610739
Alignment:
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40610809 tccctcatcaaaccacaacacaactttttatcacatatataagttgtctaaaataccaaaataacattttg 40610739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25540037 - 25539981
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtcca 472  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25540037 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggataggacagaacaactccagttgtcca 25539981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 33316491 - 33316435
Alignment:
Q  560 cacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33316491 cacaacacaactttttcttacacgtacaagttgtctaaattacaaaaatagcatttt 33316435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 550 - 621
Target Start/End: Original strand, 16643272 - 16643343
Alignment:
Q  550 ctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16643272 ctcaccaaatcacgacacaactttttgtcccacatacaggttgtctaaaatacaaaaataccatttcgtccc 16643343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 561 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 46447737 - 46447678
Alignment:
Q  561 acatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  46447737 acatcacaactttttgttccacgtacaagttatctaaaatatcaaaatagtcttttgtcc 46447678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 642 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 8838930 - 8838820
Alignment:
Q  642 aaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaa 741  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| |||   ||| || ||||||||||||    
T  8838930 aaaattattcaatgctataaaaatttgttatgtgtttttctatcttgtgttgtgttgttctgtcttatacagttatgtctagtatttactgttttgcaaa 8838831  T
Q  742 ccaaacgcacc 752  Q
    |||||||||||    
T  8838830 ccaaacgcacc 8838820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17291796 - 17291718
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttt 495  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  17291796 ggtgtgtttgatctgctaaaaaattgagaacatgacaggacaactccagttgtacggtatttgatttgtaaaactgttt 17291718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34663869 - 34663819
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34663869 ttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 34663819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 461
Target Start/End: Original strand, 16643187 - 16643232
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaact 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  16643187 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaact 16643232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 609
Target Start/End: Original strand, 21763187 - 21763252
Alignment:
Q  544 ttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21763187 ttgtccctcaccaaactacatcacaactttttagccaaaatacgaattgtctaaaataccaaaata 21763252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 30105041 - 30105007
Alignment:
Q  584 tacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30105041 tacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgt 30105007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 575
Target Start/End: Original strand, 30798605 - 30798706
Alignment:
Q  474 tgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcaggg-acatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactt 572  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |||  |||||  |||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30798605 tgtttgatttgaaagactgttttagggacataacaaattggaggcaggggacatgacaaa-actgaaagtcttgtccctcactaacccacatcacaactt 30798703  T
Q  573 ttt 575  Q
    |||    
T  30798704 ttt 30798706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 632 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21071726 - 21071689
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21071726 tataaaacaaaaaattattcaatgtaataaaaatttgt 21071689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 723 - 756
Target Start/End: Original strand, 30105929 - 30105962
Alignment:
Q  723 gtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30105929 gtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 30105962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 610
Target Start/End: Original strand, 32467926 - 32467971
Alignment:
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32467926 cacaactttttgtcctacgtacaagttgtctacaatatcaaaatag 32467971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43368415 - 43368074
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43368415 gggtccgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtataggacaaactgga 43368316  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||  |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43368315 ggcaagagacgggacaaaaactgatatttttgtgcctcagcaaaccacagcacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 43368216  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43368215 ttgtccctccaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtgataaaaatttgtcatgtgctgttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 43368116  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43368115 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 43368074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 47953404 - 47953066
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47953404 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaacgacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 47953305  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953304 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 47953205  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  47953204 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 47953105  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  47953104 ttctgtccagtacttgctgttttgcagagcaaacacacc 47953066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Original strand, 26994106 - 26994444
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26994106 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 26994205  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994206 ggcaagggacaggacaaaatctcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 26994305  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  26994306 ttgtccctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtcctg 26994405  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26994406 ttctgtccagtactttctgttttgcaaaccaaacacacc 26994444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 10932438 - 10932778
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10932438 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 10932537  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932538 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaactacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 10932637  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || |||| |||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10932638 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctatgctgttctgccgtgtgttgtactgttctatcttgtactg 10932737  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10932738 ttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 10932778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 34295292 - 34295623
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34295292 gggtgcgtttgattagctaaaaaataaaagataggacagaacaactccagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 34295391  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |||| |      ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34295392 ggcaag------acaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattt 34295485  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34295486 tgtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcttgtgctgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgtt 34295585  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34295586 ttgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 34295623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Original strand, 3922586 - 3922923
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3922586 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgttttatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 3922685  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3922686 caagggacaagacaaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcatttt 3922785  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3922786 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaaatactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactggtctatcttgtactgtt 3922885  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3922886 ctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 3922923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 36769450 - 36769790
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36769450 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactaga 36769549  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769550 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 36769649  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||| |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  36769650 ttgtctctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 36769749  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36769750 ttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 36769790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Original strand, 11321769 - 11322105
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11321769 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaagaacatgacagaacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgattcaggtacaggacaaactggaggc 11321868  T
Q  519 ag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11321869 aacggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 11321968  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| || |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  11321969 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtactgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttc 11322068  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11322069 tgtccgatacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 11322105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 38301557 - 38301221
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38301557 gggtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgg 38301458  T
Q  515 aggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38301457 aggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccacaacacaactttttgtcccacg-acaagttgtctaaaatatcaaaataacat 38301359  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||||       || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38301358 tttgtcccccaaaaatcgtattaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatctgtgttgt-----tctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactg 38301264  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38301263 ttctgtactgtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccctaa 38301221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21785082 - 21784752
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  21785082 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggcacatgacaaactggaggc 21784983  T
Q  519 agg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21784982 aagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 21784883  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||        || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  21784882 tcctccaaaaatcgtataaaacataaaattactcaatgccataaaagatttgttctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttt 21784783  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  21784782 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 21784752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 43158567 - 43158900
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43158567 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 43158666  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43158667 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacatcaaaatagcatt 43158766  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  43158767 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtactgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactg 43158866  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     ||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  43158867 ctctatctagtacttgctgttttgcaaaccaaac 43158900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 18386738 - 18386399
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18386738 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 18386639  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18386638 ggcaagggacaggacaaa-actcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 18386540  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| ||||  |||||| | |||||| |    
T  18386539 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtattgttctattttgtaccg 18386440  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18386439 ttttgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaactcaccct 18386399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 424 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18470888 - 18470565
Alignment:
Q  424 ttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcaggga 523  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  18470888 ttgatttgctacaaaatgaaggacaggatagaacaactctagttgtcgagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaag-a 18470790  T
Q  524 catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnn 623  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  18470789 caggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacagcataactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtccctc 18470690  T
Q  624 nnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtact 722  Q
         |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |     
T  18470689 aaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtcca 18470590  T
Q  723 gtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18470589 gtacttgctgttttgcaaaccaaac 18470565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9913738 - 9913398
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  9913738 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccggtgtttgatttgtaaaactatttcaggtacaggataaactaga 9913639  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9913638 ggcaagggacaggacaaaaattgatatttt-gtcgctcaccaaaccacatcacaactttttttcccacgtacaggttgtctaaaataccaaaataacatt 9913540  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9913539 tcgtcccccaaaaatcgtataaaactaaaaattattcaattccataaaaatttgtcatgtggtgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgt 9913440  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9913439 tctgtacagtatttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 9913398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9927426 - 9927086
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  9927426 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccggtgtttgatttgtaaaactatttcaggtacaggataaactaga 9927327  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9927326 ggcaagggacaggacaaaaattgatatttt-gtcgctcaccaaaccacatcacaactttttttcccacgtacaggttgtctaaaataccaaaataacatt 9927228  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9927227 tcgtcccccaaaaatcgtataaaactaaaaattattcaattccataaaaatttgtcatgtggtgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgt 9927128  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9927127 tctgtacagtatttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 9927086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 46633906 - 46633569
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  46633906 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacaggacaaactgga 46633807  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || |    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633806 ggaa----caagacaaaaactcatatttttatccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 46633711  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  46633710 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactat 46633611  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46633610 tatgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 46633569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 41211081 - 41211415
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  41211081 gggtacgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactcaagttgcccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactaga 41211180  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca-t 613  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41211181 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 41211280  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||| ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || || | |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  41211281 tttatccctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctatgttgttctgccttgtgttgtattgttctatcttgtact 41211380  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41211381 gttttgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 41211415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 1870349 - 1870015
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  1870349 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacagtgcagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagataaactgga 1870250  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1870249 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacatt 1870150  T
Q  615 ttgtccc-nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    |||||||        || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  1870149 ttgtccctaaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttatcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatattgtact 1870050  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1870049 gttatgtacagtacatgctgttttgcaaaccaaac 1870015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 416 - 741
Target Start/End: Original strand, 26371690 - 26372017
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26371690 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgcaaaactatttcaggtacaggacaaactgga 26371789  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26371790 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatactaaaatagcatt 26371889  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| | ||||   || | |||| ||||||| ||||||||||    
T  26371890 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcatgtgatgttctgttttatgttgtactgttctatcttgtactg 26371989  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaa 741  Q
    || ||| | |||||| ||||||| ||||    
T  26371990 ttatgtccagtacttactgtttttcaaa 26372017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 417 - 747
Target Start/End: Original strand, 32873654 - 32873983
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  32873654 ggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaac---tctagttgtccattgtttgatttgtaaaattgtttcaggtaccggataaactggag 32873750  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32873751 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctgaaataccaaaatagcattt 32873850  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  32873851 tgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 32873950  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32873951 tctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 32873983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 417 - 754
Target Start/End: Original strand, 43189124 - 43189464
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43189124 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatggaggacatgacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttataaaaatgtttcaggtacaggacaaactggag 43189223  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43189224 gtaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttatcccacgtacaagttgtctagaataccaaaatagtattt 43189323  T
Q  616 tgt-cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||| |||       || ||| |||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  43189324 tgtccccccaaaaatcgtatgaaacaacaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgcactattctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 43189423  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43189424 ttatgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 43189464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 30849127 - 30849460
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  30849127 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacagaacaattctagttgtccaatgattgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactggt 30849226  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30849227 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccatatacaagttgtataaaataccaaaataacatt 30849326  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  30849327 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaaattgtcctgtgttgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactg 30849426  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  30849427 ttctgtcaagtacttactgttttgcaaaccaaac 30849460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 411 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 40753374 - 40753081
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40753374 cttaagggtgcgtttgatttgctaaaaaataagggacatgacagaacaactctcgttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 40753275  T
Q  511 ccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40753274 ctggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 40753175  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| | |||| |||| |||||||    
T  40753174 gcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgctttgtgttgtactgttct 40753081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 411 - 755
Target Start/End: Original strand, 43213801 - 43214141
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  43213801 cttatgggtacgtttgatttgctaaaaaatgaagaacaggacagaacaacttcagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgttttcagtacaggacaaa 43213900  T
Q  511 ccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | | |||| ||||||| || |||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43213901 ctgaaggcaagggacaagataaaagctgatatttttgtccttcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtcaaaaataccaaaata 43214000  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgt 709  Q
    |||||| || ||       || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||     
T  43214001 gcatttcgtgcctcaaaaatcctataaaacaaaaaatgattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctgttctaccttgtgttgtgctgttttgtcttgc 43214100  T
Q  710 actgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||||||      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43214101 actgtt-----atgtacttgttgttttgcaaaccaaacacacccta 43214141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 417 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 48894930 - 48894592
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  48894930 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacagtacaaactggat 48894831  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||  |||||||| |||||    
T  48894830 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtcattcactaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaaatcatctaaaaatccaaaataacattt 48894731  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| || | |||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  48894730 tgtcccccaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgcaataaaaaattgtccagtgctgttttaccttgtgttgtactgttcggtcttgtactgtt 48894631  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
     |||    || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  48894630 atgtcaaatatttactgttttgcaaaccaaacacaccct 48894592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 47316579 - 47316828
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47316579 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaataactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacaggacaaactgga 47316678  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47316679 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacatgcaagttgtctaaattaccaaaatagcatt 47316778  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47316779 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 47316828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 419 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 329687 - 329352
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactcta------gttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacc 512  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||| |      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  329687 tgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaagacaaaacaactccaactccagttgtcccgtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaact 329588  T
Q  513 ggaggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 611  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  329587 ggaggcaaaggacaagacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgcctaaaacaccaaaatagc 329488  T
Q  612 attttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    ||||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||| || || | |||||| ||||||||||||   ||||||    
T  329487 attttgtcccccaaaaatcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcatgtactgttatgccttgtgttgtgctgttctgcattgtac 329388  T
Q  712 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  329387 tgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 329352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44748906 - 44748660
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  44748906 tgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactagaggc 44748807  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748806 aagggacagaacaaaaactcaaatttttgtccctcaccaaaccacaatacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 44748707  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  44748706 tcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaaa 44748660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29661536 - 29661288
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  29661536 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatag-atagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtagaactgattcaggtacatgacaaactgga 29661438  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29661437 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcatt 29661338  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  29661337 ttgtcccacaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgctataaaaa 29661288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 416 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 11250831 - 11250561
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11250831 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttcatttgtaaaattgtttcaggtacaggacaaactgga 11250732  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11250731 ggcaagggacaggacaaaaaatcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtccca-----tagttgtctaaaataccaaactagcatt 11250637  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgt 689  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11250636 ttgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaataccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgt 11250561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 538 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 26652957 - 26652745
Alignment:
Q  538 atatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaa 637  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        || ||||||    
T  26652957 atatttttgtccctcagcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtccgccaaaaatcgtataaa 26652858  T
Q  638 acataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttg 737  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  26652857 acaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctatgctgttctcccttgtattgtgctgttttttcttatactgttatgtactgtacttgatgtttta 26652758  T
Q  738 caaaccaaacgca 750  Q
    |||||||||||||    
T  26652757 caaaccaaacgca 26652745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 756
Target Start/End: Original strand, 30598939 - 30599231
Alignment:
Q  466 ttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacat 564  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  30598939 ttgtccactgtttcatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggacaggacaaaagctcatatttttgtccctcatcaaaccacaa 30599038  T
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaa 663  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||       || |||||||||  |||||| ||||| |||| ||||    
T  30599039 cacaactttttgtctcaagtacaaattatctaaaataccaaaataacattttgtcccctaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatttcataaaaa 30599138  T
Q  664 atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30599139 atttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttactgttttgtaaaccaaacacaccctaa 30599231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 20127500 - 20127163
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20127500 tgcgtttgatttgctaataaatgaaagataggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttttaaaactatttcaggtacaggacaaactggaggc 20127401  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     ||||||| ||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  20127400 aagggacaggacaaaagctgatatttttgttcctcagcaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaatttgtgtaaaataccaaaatgacatttcg 20127301  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataa----aattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||       || ||||||||| ||    ||| ||||||||  | ||||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  20127300 tcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaaataataattcaatgctacaaaaatttgtcatgtgctgttctatcttgtgttgtgttgttttgtcttgtactg 20127201  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20127200 ttc--tatcgtacttactgttttgcaaaccaaacgcaccc 20127163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 453 - 753
Target Start/End: Original strand, 23349209 - 23349510
Alignment:
Q  453 agaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccct 551  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23349209 agaactactccagttgtccagtgtttgaattgtaaaactatttcaagtacatgacaaactggaggcaagggacagaacaaaaactgatatttttgtccct 23349308  T
Q  552 caccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattc 651  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||       || || |||||| ||||||||||    
T  23349309 caccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaatactaaaatgacatttcgtcccccaacaatcgtagaaaacaaaaaattattc 23349408  T
Q  652 aatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||  |||||| |||||||||||| ||| |  ||||| || ||||||||||||||| |||    
T  23349409 aatgttataaaaatttgtcatgtgctgttctaccttatgttgttttgttctatcttgtactgttatgtccattacttactattttgcaaaccaaacacac 23349508  T
Q  752 cc 753  Q
    ||    
T  23349509 cc 23349510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 1363850 - 1363536
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  1363850 gggtgcctttgatttgctaaaaaataaaggataggacaaaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcatgtacaggacaaactgga 1363751  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  1363750 ggcaagggacatgacaaaagctgatatttttgtccctcatcaaaccacatcacaactttttgtctcacgtacaggttgtcaaaaatacaaaaatagcatt 1363651  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | || ||       |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| |||| |  |||| |||||| |||| || |||    
T  1363650 tcgtacccaaaaatt-gtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcatgtgttgttctaccttctgatgtgttgttctatcttatattgt 1363552  T
Q  715 tctgtactgtacttgc 730  Q
    | ||| | ||||||||    
T  1363551 tatgtccagtacttgc 1363536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 746
Target Start/End: Original strand, 3891930 - 3892239
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                |||||||| ||||||| ||    
T  3891930 tttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccaatgtttgatttgtaa----------------ggacaaactggaggcaagg 3892013  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3892014 gacaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaatcacagcacaactttttgtcctacgtacaagttgtctagaataccaaaatagcattttgttcc 3892113  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
           || | ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  3892114 tcaaaaatcgtgtaaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatatgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactgttctgtc 3892213  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    | |||||| |||||||||||||||||    
T  3892214 cagtacttactgttttgcaaaccaaa 3892239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 17237290 - 17237036
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  17237290 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaattatttcaggtacagtacaaactgga 17237191  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||  |||||||| ||||    
T  17237190 tgcaaggaacatgacaaaaactcatatttttgtcattcactaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaaattatctaaaaatccaaaataacatt 17237091  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    | |||||       || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  17237090 tcgtcccccaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgcaataaaaaattgt 17237036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 37967182 - 37966856
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||    
T  37967182 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaaaacaactttagttctccggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaattggatgcaag 37967083  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  37967082 ggacaagacaaaaacccatatttttgtctttcactagaccacatcacaactttttgttccacgtacaagttatctaaaaatccaaaatagcatttcgtcc 37966983  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       || ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| | |||| || | || |||     
T  37966982 caaaaaaatcgtataaaacaaaaaattatttaataccataaaaatttgttatgtactattctgctttgtgttgtgctgttatgtcttatattattatgtc 37966883  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
      |||||| || |||||||||||||||    
T  37966882 tagtacttactattttgcaaaccaaac 37966856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 416 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11822437 - 11822116
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11822437 gggtgcgtttgatttactaaaaaataaaggacaggacagaacaacttcacttgtccagtgtttgattcgtaaaactgtttgaggtacaggacaaactgga 11822338  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||      ||||| |||||   ||||||||||||    
T  11822337 tgcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccttcactaaaccacaacacaactttttgtcccac------gttgtttaaaaattcaaaatagcatt 11822244  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||| || || | |||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||    
T  11822243 tcgtcccccaaaaatcgtataaaaaaaaaaa--attcaatgccataaaaatttgtcctatgttgttctgccttgtgttgtgttgttctattttatactgt 11822146  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaacca 744  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  11822145 tatgttcagtacttactgttttgcaaacca 11822116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 416 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16963352 - 16963174
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  16963352 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactaga 16963253  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgt 593  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16963252 ggcaagggataggacaaaaactcatatttttgtcccttatcaaaccacaatacaactttttgtcccacgtacaagttgt 16963174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 448 - 742
Target Start/End: Original strand, 22724444 - 22724739
Alignment:
Q  448 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttg 546  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||   |||||||    
T  22724444 aggacagaacaattccagttgttcagcgtttgatttgtaaaacagtttcagggacaggacaaactggaggcaagggatatgacaaaagctgcaatttttg 22724543  T
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaat 646  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |       |||||||| ||| |||||    
T  22724544 tccctcaccaaaccacagcgcaactttatgtcccacgtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatttcgtcgcccaaaaatcatataatacagaaaat 22724643  T
Q  647 tattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaac 742  Q
    ||||||||  || |||||||| |  |||| | |||| |||| | ||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  22724644 tattcaataccagaaaaatttatcttgtgttgttctgccttatgttgtgatattctatcttgtactgttctgtccagtacttactattttgcaaac 22724739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 416 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 48445735 - 48445405
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  48445735 gggtgcgtttaatttgttaaaaaatgaaggaaaagacagaacaactccagttatccaatgtttaatttgtaaaactgtttgagggacagaacaaactgga 48445636  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| || | | |||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  48445635 ggcaagggacatgacaaaaactgaaatttttgtccttcaccaaatcacaggacaactttttgtctcgcatacaagttgtctaaaacacgaaaataacatt 48445536  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | || | |||||| ||||| |||| |   |||||||||    
T  48445535 ttgtcccccaaaaatcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcatgtgttgttatgccttgtgttgtgttgttatgcattgtactgt 48445436  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    | ||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  48445435 tttgtccagtacttactgtcttgcaaaccaa 48445405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 453 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21133549 - 21133252
Alignment:
Q  453 agaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccct 551  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||| || |||||    
T  21133549 agaacaactctagttatttaatgtttaatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactgaaggcaagggacaagacaaaaactgatattattttccct 21133450  T
Q  552 caccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaac-ataaaattatt 650  Q
    ||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |       || |||||||| | ||||||| |    
T  21133449 caataaaccacatcacaactttttgtctcacatacaaattgtctaaaataccaaaatagcatttcgtctcccaaaaatcgtataaaacaaaaaaattact 21133350  T
Q  651 caatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||| || |||||| ||||||||    
T  21133349 caatgtcataaaaaatttgtactgtgttgttctgccttgtgttgtgatgttctttcttgtattgttatgtatagtacttactattttgccaaccaaac 21133252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 416 - 746
Target Start/End: Original strand, 22723913 - 22724244
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||    
T  22723913 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggatgtgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcagggaccggacaaactcga 22724012  T
Q  516 gg-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||  ||||||| |||||| |||   || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22724013 ggtaagggacaggacaaaaactgcaatgtttgtccatcgccaaaccacaacgcaactttttatcccacgtacaagttgtataaaatacaaaaatagcatt 22724112  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||| | |||| |||| | ||||| ||| || |||| |||| |    
T  22724113 tcgtcacccaaaaatcatataatacagaaaattattcaataccataaaaatttatcttgtgttgttctgccttatgttgtgttgtcctatcttatactat 22724212  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    | ||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  22724213 tttgtccggtatttactattttgcaaaccaaa 22724244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 416 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 34519722 - 34519527
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||    
T  34519722 gggtgcgtttgatttaataaaaaataaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgttcgaattgtaaaacagtttcagggacatgacaagctgga 34519623  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    |||| |||||| |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34519622 ggcaagggacaggacaaaaactgcaatttttgtccctcgccaaaccacaacacaactttttgtcccaggtacaagttgtctaaaatacaaaaatag 34519527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 565 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 47947824 - 47947636
Alignment:
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaa 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  47947824 cacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 47947725  T
Q  664 atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  47947724 atttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcagagcaaacacacc 47947636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 417 - 610
Target Start/End: Original strand, 26910293 - 26910486
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26910293 ggtgcgtttgatttgatata-aatgaaggacatgacagaacaactacagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcagggacagggcaaactggag 26910391  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    || ||||||| || ||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26910392 gcaagggacaggataaaaactgcaatttttgtccctcgccaaaccacaacacaactttttgtcacacgtacaagttgtcaaaaatacaaaaatag 26910486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 540 - 747
Target Start/End: Original strand, 41665581 - 41665788
Alignment:
Q  540 atttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaac 639  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |       | |||||||||    
T  41665581 atttttgtccctcgccaaaccacatcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatttcgtcacccaaaaattatataaaac 41665680  T
Q  640 ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgca 739  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | | || | ||||||||| || ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| |    
T  41665681 agaaaattattcaataccataaaaatttgtcttgtgctattatgcgttatgttgtgctgtcctatcttgtattgttatgttccgtacttactgttttgta 41665780  T
Q  740 aaccaaac 747  Q
    ||||||||    
T  41665781 aaccaaac 41665788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Original strand, 46448525 - 46448779
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaat-gaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  46448525 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatagaaga-caagatagaacaacttcagttgtctagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacggtacaaactgg 46448623  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| || || |||||||  |||||||| |||    
T  46448624 atgcaagggacatgataaaaactcatatttttgtccgtcactaaaccacagcacaactttttgtcccatgtataaattatctaaaaatccaaaataacat 46448723  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    || |||||       || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  46448724 ttcgtcccctaaaaatcttataaaacaaaaaattattcaatgcaataaaaaattgt 46448779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 519 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 46408998 - 46408771
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46408998 agggacaggacaaa-actcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtccgacatacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatattgt 46408900  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    | |       || ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||       |||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||     
T  46408899 ctctcaaaaatcgtataaaataaaaaattactcaatgccataaaaa------atgtgatgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttcta 46408806  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46408805 tccaatacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 46408771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 500 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 34117581 - 34117412
Alignment:
Q  500 tacaggacaaaccggaggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaa 599  Q
    ||||||||||||   ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  34117581 tacaggacaaacttaaggcaaggatatgataaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaattttttgttccatgtacaagttgtctaaaa 34117482  T
Q  600 taccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    | |||||||||||||| |||||       || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34117481 tgccaaaatagcatttcgtcccccaaaaatcgtataaaacgaaaaattattcaatgccataaaaatttgt 34117412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 418 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 26700689 - 26700588
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26700689 gtgcgtttgatttggtaaaaaatgaaggacatgacataacaattccagttgtccagtgtttgatttgtataactgtttcaggtacatgacaaactggagg 26700590  T
Q  518 ca 519  Q
    ||    
T  26700589 ca 26700588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 12982300 - 12982178
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaattt-gtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgc 730  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||    
T  12982300 tataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctctccagtacttgc 12982201  T
Q  731 tgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  12982200 tcttttgcaaaccaaacacaccc 12982178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 417 - 669
Target Start/End: Original strand, 15035133 - 15035388
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaa--ctgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||| || | || ||||| ||||||||||  ||| | || | ||||||||||| ||    
T  15035133 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaatacatgacatgacaactctaattatacaatgtttaatttgtaaaaaactgctccaaggacaggacaaactgg 15035232  T
Q  515 aggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    | |||  ||||| ||| || | | | ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  15035233 aagcaaaggacaggacgaaaattgaaattcttgttcctcaccagaccacaacacaactttttgtaccacatacaaattgtctaaaatatcaaaataacat 15035332  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    |||| ||        || || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15035333 tttgcccaccaaaaatcgtacaaaacaaaaaattattcaataccataaaaatttgt 15035388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 527 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 48699500 - 48699417
Alignment:
Q  527 gacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699500 gacaaaaactgaaattcttgtccctcactaaaccacaacacaactatttgttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 48699417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 510
Target Start/End: Original strand, 41665479 - 41665573
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  41665479 gggtgtgtttgatttgataaataataaaggataggacagaacaactccagttgtccagtgtttcaattataaaactgtttcaagaacaggacaaa 41665573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22631829 - 22631759
Alignment:
Q  538 atatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaat 608  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22631829 atatttttgtccttcaccaaaccacaacataactttttgttatacgtacaagttgtctaaaataccaaaat 22631759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 600
Target Start/End: Original strand, 29372764 - 29372845
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaat 600  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  29372764 agggacacgacaaaaactaaaatttttgtccgtcactaaaccacaacacaactttctgttccatgtacaagttgtctaaaat 29372845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 42332137 - 42332072
Alignment:
Q  551 tcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42332137 tcaccaaaccacatcacaactttttgtctcacatacaaattgtcttaaatatcaaaataacatttt 42332072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35645530 - 35645466
Alignment:
Q  546 gtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35645530 gtccctcactaaaccacaacacaactttttatcgtacgtacaagttgtctaaaataataaaatag 35645466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 46627259 - 46627135
Alignment:
Q  540 atttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaac 639  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |       |  ||||||||    
T  46627259 atttttatccctcatcaaaccacagcacaattttttgtctcacgtacggattgtctaaaatacaaaaatagtatttcgtctcccaaaaattgtataaaac 46627160  T
Q  640 ataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  46627159 aaaaaattattcaatgccataaaaa 46627135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16963034 - 16962984
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16963034 ttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 16962984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40753092 - 40753042
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40753092 ttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 40753042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 685 - 747
Target Start/End: Original strand, 47316835 - 47316897
Alignment:
Q  685 cttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  47316835 cttgtgttgtactgttctatcttgtaccgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 47316897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 8360660 - 8360580
Alignment:
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaatac 602  Q
    |||||||||||| | | | ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  8360660 ggacatgacaaaaaataaaattcttgtctcacactaaaccacatcacaactttttgt-cctcgtacaagttgtctaaaatac 8360580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 16963149 - 16963116
Alignment:
Q  588 agttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963149 agttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 16963116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 34117410 - 34117349
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34117410 ttgtgttgttctgtcttgtactgttatgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacacc 34117349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 559 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 8453344 - 8453285
Alignment:
Q  559 ccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8453344 ccacatcacaactttttgtcct-cgtacaaattgtctaaaatatcaaaataacattttgtc 8453285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 620
Target Start/End: Original strand, 29455778 - 29455933
Alignment:
Q  464 agttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccac 562  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||  |||| | |||  ||||||| ||||||| ||||| | | | ||| |||||| || |  ||| ||    
T  29455778 agttgtgcaatgtttgatttgtaacactatttcagagacagtagaaattggaggcaagggacataacaaaaagtgaaattcttgtccttcgcttaacaac 29455877  T
Q  563 atcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  29455878 aacacaactttttgtcccacatactagttat--aaaataccaaaatagcgttttgtcc 29455933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 7958672 - 7958635
Alignment:
Q  583 gtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7958672 gtacaagttgtctaaaataccaaaatagttttttgtcc 7958635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 497
Target Start/End: Original strand, 16027808 - 16027889
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttca 497  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| |||| | | ||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  16027808 gggtgcatttgatcagctaaagaacgaaggatatgacaagataactctagttgtatagtgtttgatttgtaaaattgtttca 16027889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34339020 - 34338681
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34339020 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 34338921  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338920 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgaccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgcacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 34338821  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  34338820 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 34338721  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34338720 ttctgtccagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccc 34338681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 416 - 742
Target Start/End: Original strand, 9732810 - 9733138
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9732810 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 9732909  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9732910 ggcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 9733009  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  9733010 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgccgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 9733109  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaac 742  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9733110 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaac 9733138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 417 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 18686045 - 18685706
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18686045 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaataactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 18685946  T
Q  517 gc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    || | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  18685945 gcaaaggacaagacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatattaaaataacattt 18685846  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  18685845 tgtccctcaaaaatcctataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 18685746  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18685745 tctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 18685706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 33366820 - 33366481
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33366820 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaattctaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 33366721  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33366720 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccacaacacaactttttctcccacatacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 33366621  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||    
T  33366620 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgacttgtgttgtactgttctatcttgtattg 33366521  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33366520 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 33366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 423 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 35114988 - 35114656
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  35114988 tttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacaggacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagaggcaagg 35114889  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35114888 gacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaattttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 35114789  T
Q  622 nnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
           || ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  35114788 tcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaaaatttgtcctgtgccgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtc 35114689  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35114688 cagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 35114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 417 - 754
Target Start/End: Original strand, 2644968 - 2645306
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2644968 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggatagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 2645067  T
Q  517 gcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645068 gcaaggagaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 2645167  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    || ||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||| |||||||    
T  2645168 gttcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtccagtgctgttctgccttatgttgtactgttctatcttatactgtt 2645267  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    || |   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2645268 ctatcaagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccct 2645306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 418 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32498123 - 32497784
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  32498123 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagggcatggcagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgaagg 32498024  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32498023 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtacctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 32497924  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  32497923 gtccttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttttgttgtactgttctatcttgtattgtt 32497824  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32497823 ctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacacccta 32497784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Original strand, 30326214 - 30326550
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30326214 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagagcaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggagg 30326313  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30326314 caggggacaggacaaaaactcata-ttttgtctctcgccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtatttt 30326412  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  30326413 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaattccataaaaattttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtacggttctatcttgtactgtt 30326512  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30326513 ctgtccagtacttgctcttttgcaaaccaaacacaccc 30326550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 37308864 - 37308527
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37308864 gtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggag 37308765  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37308764 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaatagtattt 37308665  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || || |||  | ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  37308664 tgtccctaaaaaatcgta-aaacaaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgt 37308566  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37308565 tctgtccagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccc 37308527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 747
Target Start/End: Original strand, 19513571 - 19513902
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19513571 tgcgtttcatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttttccaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacgggagg 19513670  T
Q  518 cag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19513671 caaaggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 19513770  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       |||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||| | ||||| ||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19513771 gtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaataccataaaaaatttgtcccgtgctgttctgtcttctattgtactgttctatcttgtactgtt 19513870  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     | | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19513871 ttatccagtacttactgttttgcaaaccaaac 19513902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 7761453 - 7761702
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  7761453 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactaga 7761552  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761553 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 7761652  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7761653 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaa 7761702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 417 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 17540924 - 17540591
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17540924 ggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaagatatgacagaacaattttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactggag 17540825  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaatacc-aaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17540824 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaaatagtatt 17540725  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  17540724 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatatgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 17540625  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  17540624 ttctatccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 17540591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 33889453 - 33889165
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  33889453 gggtgcgtttgatttactaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaattgtttcagatacaggacaaactgga 33889354  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33889353 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttttccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 33889254  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  33889253 ttgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaataccataaaaaatttgttatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 33889165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 421 - 754
Target Start/End: Original strand, 5278720 - 5279054
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca- 519  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  5278720 cgtttgatttgctaaaaaat-aaggatatgacagaacaactctaattgttaggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactggaggcaa 5278818  T
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5278819 gggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaattttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 5278918  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    |        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5278919 cttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtattgttctatcttgtactgttctg 5279018  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5279019 tcaagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 5279054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 44284836 - 44284508
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44284836 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactagagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggc 44284737  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44284736 aagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctcactaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataacaaaatagcattttg 44284637  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||        |||||| |||||||||||||    
T  44284636 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttg--------tgttctatcttgtactgttc 44284545  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44284544 tgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 44284508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 419 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7259104 - 7258791
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7259104 tgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagctgtctagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggc 7259005  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca-tttt 616  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7259004 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttt 7258905  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  7258904 gtccctcaaaaattgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtactattctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 7258805  T
Q  716 ctgtactgtacttg 729  Q
    |||| | |||||||    
T  7258804 ctgtccagtacttg 7258791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 417 - 747
Target Start/End: Original strand, 30798370 - 30798700
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30798370 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagggcag-acagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactggag 30798468  T
Q  517 gca-gggacatgacaaata-ctcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30798469 gcaagggacaggaaaaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttatcccacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcatt 30798568  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata-aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| | |||  |||| |||||||||  |||||| ||||  ||  |||  | ||||||| |||| |||||    
T  30798569 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactaaataccatacaaaatttgtcatgtgctgttctgtct--tatgttactgttctatcttatactg 30798666  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30798667 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 30798700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 711
Target Start/End: Original strand, 32766384 - 32766681
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32766384 gggtgcgtttgatttgctaaaaaacgaaggacagaacagaacaactataattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 32766483  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaac-tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32766484 ggcaagggacaggacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaacttttttgtcctacgtacaggttgtctaaaataccaaaataacat 32766583  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    || ||||        || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32766584 ttcgtcctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcctgtgttgttctcccttgcattgtgttgttctttcttgtac 32766681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 448 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 16104452 - 16104152
Alignment:
Q  448 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttg 546  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  16104452 aggacagaacaactatagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacacgacaaattggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttg 16104353  T
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaat 646  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| |||||    
T  16104352 tccctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaaattgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaat 16104253  T
Q  647 tattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaa 745  Q
    || |||||| ||| |||||||||  ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  16104252 tactcaatgccataaaaaatttgccctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttttgtccagtacttgttgttttgcaaaccaa 16104153  T
Q  746 a 746  Q
    |    
T  16104152 a 16104152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 446 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42706539 - 42706235
Alignment:
Q  446 acaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttt 544  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  42706539 acaggacagaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggataagacaaaaactcatatttt 42706440  T
Q  545 tgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaac-ataa 643  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||| | ||    
T  42706439 tgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaa 42706340  T
Q  644 aattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaac 742  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||   || ||| |||||||||||||    
T  42706339 aattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgtcttgtgttgtattgttctatcttgtactgttatgtcaagtgcttactgttttgcaaac 42706240  T
Q  743 caaac 747  Q
    |||||    
T  42706239 caaac 42706235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 2086270 - 2085949
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2086270 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacaga-caactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggagg 2086172  T
Q  518 cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    ||        ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2086171 ca--------acaaaaactcatatttttgtccctacccaaaccacagtacaactttttgtttcacgtacaagttgtctgaaataccaaaataacattttg 2086080  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2086079 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatggcataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttc 2085980  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2085979 tgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 2085949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 416 - 740
Target Start/End: Original strand, 28824437 - 28824762
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  28824437 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacagcacatactgga 28824536  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28824537 gtcaagggtcaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttatctcacgtgcaagttgtctaaaatactaaaatagcatt 28824636  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |  ||       |  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  28824637 tcgcaccccaaaaattgtataaaacaaaaatttattccatgtcataaaaatttgtcatgtattgttctgtcttatgttgtgctgttctgtcttgtactgt 28824736  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaa 740  Q
    || || | |||||| |||||||||||    
T  28824737 tcagtccagtacttactgttttgcaa 28824762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 6896378 - 6896039
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  6896378 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaagacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacaaaacaaactgga 6896279  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6896278 ggcaagggacaggataaaaactgaaatttttgtccctcaccaaacaacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaacaccaaaatagcatt 6896179  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||        |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | || | |||||| ||||| ||||||   || ||||||    
T  6896178 tcgtcccccaaaaggcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcatgtgttgttatgccttgtgttgtgttgttctgcattatactgt 6896079  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6896078 tctgt-tagtacttactgttttgcaaaccaaacgcacccta 6896039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 3913343 - 3913681
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  3913343 tgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacatgacaaaacaattctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtatatgacaaactggaggc 3913442  T
Q  519 aggga-catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | | | || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913443 aagaaacaggacaaaaactcacatgtttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 3913542  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttct 717  Q
      ||       || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | || || | |||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  3913543 ctccccaaaaatcgtataaaacaaaatattattcaatgccataaaaatttatcctatgttgttctgccttgtgttgtgttgttctgtcttatactgttct 3913642  T
Q  718 gtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
     |   ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3913643 atcaagtatttactgttttgcaaatcaaacacaccctaa 3913681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40692507 - 40692176
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  40692507 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccagtgtttaatttgtgaaactgttttaggtacaagacaaactgga 40692408  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  40692407 gacaagggacaggacaaaaactcgtatttttgtccctcaccaaaccacagaacaactttttgtcccacgtacaagttgtct--------aaaatagcatt 40692316  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  40692315 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttttgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 40692216  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    || |||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  40692215 ttatgtctagtatttactgttttgcaaatcaaacacaccc 40692176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42365787 - 42365454
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  42365787 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacataacaactctagttgtctagtgtttgatttgtaaaaccgtttcaggtacatgacaaactgga 42365688  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42365687 ggcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccttcatcaaaccacaacacaactttttatatcacggacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 42365588  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||| |  ||    
T  42365587 ttgtcccctaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttatcttgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatgttg 42365488  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    || | | |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  42365487 ttttttccaatacttactgttttgcaaaccaaac 42365454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 422 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 39461518 - 39461191
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  39461518 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggatagaacaattttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaag 39461419  T
Q  522 -gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatca---caactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     |||| |||||| | |    |||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39461418 tgacaggacaaaaattg---tttttgtccctcaccaaatcacaacaacacaactttttatctcacgtacaagctgtctaaaataccaaaatagcattttg 39461322  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||     
T  39461321 tccctcaaaaatcgtataaaataaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtattgtta 39461222  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  39461221 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 39461191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 37003771 - 37004091
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                   
T  37003771 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacataacaactcaagttgtccagtgtttgatttgtaaatctgtttcaggt--------------- 37003855  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
           |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37003856 -------acataacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaataacattt 37003948  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgc-tgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||       || ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| || | ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  37003949 tgtccctcaaaaatcgtataaaataaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtccttgtgctgttttaccttgtattgtactgttctatcttatactg 37004048  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37004049 ttctgtctagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 37004091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 13829636 - 13829310
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            ||||||||| |||    
T  13829636 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtgaaac------------aggacaaactgga 13829549  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    || | |||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13829548 ggtaagggacaggacaaaaactgaaatttttgtccatcactagaccacatcacaactttttgtcccaggtacaagttatctaaaacaccaaaatatcatt 13829449  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  13829448 tcgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaatatcataaaaatttgttctgtgatgttctgccttgtgttgtgctgttctgctttgtactgt 13829349  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    | ||| |  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  13829348 tttgtccaataattactgttttgcaaaccaaacgcaccc 13829310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Original strand, 16177763 - 16178101
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  16177763 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacataacaactccaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggataaactgga 16177862  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16177863 ggcaatggacaggacataaactgatatttttgtcgcttaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatggaatt 16177962  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       || ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||  ||||| ||||| || | | ||||| |||||    
T  16177963 tcgtcccccaaaaatcgtataaaac--aaaattattcaatgctataaaaatttgtcgtgtgttgttctatcttgtgttgtgttgatatgtcttgcactgt 16178060  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  16178061 tctgtccagtacttactgttttgcaaaccaatcacacccta 16178101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 450 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 4641690 - 4641387
Alignment:
Q  450 gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagggacatgacaaatactcatatttttgtcc 549  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||   ||||| | |||||||||||||     
T  4641690 gacagaacaactttagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggt-gggacggaacaaaaattcatatttttgtct 4641592  T
Q  550 ctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattat 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||| |||||||     
T  4641591 ctcaccaaaccacagcacaactttttgtctcacatacaagttgtttaaaataccaaaatagcattttgttcctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattac 4641492  T
Q  650 tcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacg 748  Q
    ||||||  || |||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||     
T  4641491 tcaatggtataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttatgttgtactgttctatattttactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaagcaaaca 4641392  T
Q  749 caccc 753  Q
    |||||    
T  4641391 caccc 4641387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11115080 - 11114750
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  11115080 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactccaattgtccaatgtttgatttgtaaa-ctgtt-cagttacaggacaaactgga 11114983  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11114982 ggcaagggacaggacaaaaaatcatatttttgttcctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgcacaagttgtctaaaattccaaaatagtatt 11114883  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||        || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |  | |  | ||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||  |    
T  11114882 tcgtccgctaacaatcgtataaaacgaaaaattattcaatgccataaaaatttttcttatattgttctgtcttgtgttgtgttgttctgtcttgtacaat 11114783  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | |||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  11114782 tatgtttagtacttactgttttgcaaaccaaac 11114750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 719
Target Start/End: Original strand, 40832349 - 40832655
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| ||| |||||||||| || |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  40832349 gggtgcttttaatttgctaaaaaaggaagcacatgacataacaacttaagttgtccagtgtttgatttgtaaagctatttcaggtacaagacaaactgga 40832448  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40832449 ggcaagggacaggacaaaaacggatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagtagtctaaaataccaaaatagtatt 40832548  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataa--aattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    | |||||       || ||||||||| ||  ||| |||||||   ||||||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40832549 tcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaataataattcaataatataaaaatttgtcatgtgttgttctaccttgtgttgtgctgttctatcttgtact 40832648  T
Q  713 gttctgt 719  Q
     ||||||    
T  40832649 attctgt 40832655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 10399750 - 10400086
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  10399750 gggtgtgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgatagaacaacttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaactatttcaggtacaggacaaactaga 10399849  T
Q  516 ggcaggg-acatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     ||| |  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  10399850 tgcaagatacaggacaaaaactcatatttttgtccttcactaaaccacaacacaactttttgtctcatgtataagttgtctaaaaatccaaaatagcatt 10399949  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||     || |||| | ||||| |||| | ||||||||| |    
T  10399950 ttgtcccccaaaagtcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttatcatgtg-----ctgccttatgttgtgatgttttgtcttgtactat 10400044  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | ||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10400045 tgtgttcagtactcactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 10400086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Original strand, 38992953 - 38993280
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  38992953 gtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggacatgacagaataactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcaggaagaggacaaactggagg 38993052  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | ||||||| |||||| |||   |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38993053 caagggacaggacaaaaactacaatttttgttcctcgtcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatttc 38993152  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||| |       | |||||| ||| |||||||||||||  |||   |||||||  |||| | |||| |||| | ||||||||| || |||| || |||||    
T  38993153 gtcacccaaaaataatataatacagaaaattattcaataccat---aatttgtcttgtgttgttctgccttatgttgtgctgtcctatcttatattgttc 38993249  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  38993250 tgtccagtacttactattttgcaaaccaaac 38993280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 457 - 620
Target Start/End: Original strand, 12672395 - 12672559
Alignment:
Q  457 caactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcacc 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12672395 caactctagttgtcctgtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtataggacaaactggaggcaagggacgggacaaaatctcatatttttgtccctcacc 12672494  T
Q  556 aaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12672495 aaaccacaacacaagtttttatcccaagtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 12672559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 416 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9717411 - 9717182
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  9717411 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacag----------- 9717323  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
               |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9717322 -----------gacaaaaactcatgtttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtattt 9717234  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaattt 667  Q
    ||||||       || ||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  9717233 tgtccctcaaaaatcgtatcaaacaaaaaattacccaatgccataaaaattt 9717182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 433 - 607
Target Start/End: Original strand, 26981606 - 26981781
Alignment:
Q  433 taaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaa 531  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  26981606 taaaaaatgaaggacagaacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttccagatacaagacaaacgggaggcaaatgacatgacaa 26981705  T
Q  532 atactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaa 607  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26981706 aaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacaaaactttttgttctacgtacaagttgtctaaaataccaaaa 26981781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30713067 - 30712726
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  30713067 tgcgtttgatttgttaaaaaatgaaagacatgacaaaacaactccagttatccagtgtttgatttgtaatactgtttcagggacagaacaacctggaggc 30712968  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcacca----aaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
     ||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  30712967 aagggacaggacacaaactgaaatttttgtccctcaccaaattaaccacaacacaactttttatcccacgtagaagttgtctaaaacaccaaaatatcat 30712868  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||  ||||       |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||| || | |  ||| ||||| ||||||   ||||||||    
T  30712867 ttcatccc-caaaaatcatataaaacaaaaaattattcaataccataaaaatttgtcctttgctgttatgcgctgtgttgtgttgttctgcattgtactg 30712769  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||| | |||||| || |||| |||||||||| || |||||    
T  30712768 ttctgtccagtacttacttttttacaaaccaaacacatcctaa 30712726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 419 - 747
Target Start/End: Original strand, 27462685 - 27463012
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||  |||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |    
T  27462685 tgcgtttgattttttaaaagatgaaagacaggatataacaatttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacatgacaaactgtagac 27462784  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27462785 aagggacaagacaaaagctgttatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttatcac-catacatattgtcaaaaataccaaaatagcatttcg 27462883  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttct 717  Q
    | ||       || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||| |    
T  27462884 tgccctaaaaatcgta-aaaacaaaaaattattcaatgtcatataaatttgtcatgtgttgttctaccttgtgttgtgctgttctgttttgcactgtttt 27462982  T
Q  718 gtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27462983 atccaatacttgctgttttgcaaaccaaac 27463012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 519 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 26419029 - 26418793
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26419029 agggacatgacaaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttat 26418930  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttct 717  Q
    |||       |  ||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26418929 cccccaaaaattgtataaaacaaaaaattactcattgccataaaatttttgtcatgtgttgttctgccttgcgttgtgctgttctgtcttgcactgttct 26418830  T
Q  718 gtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||    ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26418829 gtcaaatacttactgttttgcaaaccaaacacaccct 26418793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 522
Target Start/End: Original strand, 37863246 - 37863352
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37863246 gggtgcgcttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 37863345  T
Q  516 ggcaggg 522  Q
    |||||||    
T  37863346 ggcaggg 37863352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 418 - 614
Target Start/End: Original strand, 41365992 - 41366189
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||| | |||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  41365992 gtgcgtttgatttgctaaaaactgaaaaacaagatagaacaactccaattgtgcaatgtttgatttgtgaaacagtttcagggacatgacaaactggagg 41366091  T
Q  518 cagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    || | || | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41366092 caagagataggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaattttttgtctcacatacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 41366189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 519 - 711
Target Start/End: Original strand, 12939284 - 12939478
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12939284 agggacatgacaaaaactgatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaactttttatctcacgtacaagttgtctaagataccaaaataacattttgt 12939383  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaa--attattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    |||       |||||||||||| |||  | |||||||||| || ||||||| |  |||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12939384 cccccaaaaatcatataaaacaaaaaacaatattcaatgttattaaaatttatcttgtgttgttctgccttgtgttgtgctgttctgtcttgtac 12939478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 416 - 596
Target Start/End: Original strand, 38623184 - 38623365
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| |||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  38623184 gggtgtgtttgatttgttaaaaattgaaggacatgacataacaacttcagttatccaatgtttgatttgtaaaactgtttcagggacaggacaaacttga 38623283  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtcta 596  Q
    ||| | ||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38623284 ggcaatggaaaagacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacatacaagttgtcta 38623365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8112511 - 8112253
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccag-tgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||| ||||||||| |||||  || ||||||| ||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  8112511 gggtgtgtttgatttactaaaagataaagaacatgacaatactactctagttgtcaaggtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacagaacaaactgg 8112412  T
Q  515 aggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtct-aaaataccaaaatagca 612  Q
    ||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  8112411 aggcaagagacaatacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacaacacaactttttgttccagatacaaatagtctaaaaataccaaaataaca 8112312  T
Q  613 -ttttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcata-aaaatttgt 669  Q
     |||| ||||       || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8112311 tttttttcccttaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcatacaaaatttgt 8112253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 423 - 544
Target Start/End: Original strand, 18793180 - 18793300
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||    
T  18793180 tttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgctcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacagtacaaa--ggaggcaagg 18793277  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttt 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  18793278 gacatgacaaaaactcatatttt 18793300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 423 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41934785 - 41934451
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaa-ctctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg 521  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |  |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |   || |||| ||| |||      
T  41934785 tttgatttgttaaaaaatgaagaacatgatatgacaaactcaagttgtatagtgtgtgatttgtaaaactgattaagggatgagataaactggatgcaaa 41934686  T
Q  522 -gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
     |||| |||||| ||| | ||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41934685 agacaagacaaaaactgaaattcttgtacttcactaaaccacaacacaactttttgtcctacgtataagttgtctaaaataccaaaataacattttgtcc 41934586  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
            |||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||  || | |||| |  ||||| ||||| |||||| |||||||||||  | ||    
T  41934585 accaaaaatcatataagacataaaatcattcaataccgtaaaaatttgttatgcgttattttatcttgtgttgtgttgttctatcttgtactgtgttata 41934486  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41934485 cggtacttactgttttgcaaattaaacgcacccta 41934451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 550 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 20907664 - 20907472
Alignment:
Q  550 ctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattat 649  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||| | |||||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||       || || |||||| ||||||||    
T  20907664 ctcaccaaaccacagaacaattttttgtcctatgtacaaattgtataaaatactaaaataacattttatcccccaaaaatcgtacaaaacaaaaaattat 20907565  T
Q  650 tcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| |||||||||||||  | || | |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  20907564 tcaatgacataaaaatttgtcatatgttgttctccc-----ttgtgttgttctttcttgtactgttctatacggtacctgctattttgcaaaccaaac 20907472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 1247250 - 1247171
Alignment:
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaata 601  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1247250 gacaggacaaaatctcatatttttgtccctcaccaaaccactgcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaata 1247171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 669
Target Start/End: Original strand, 45463002 - 45463243
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||  | | |||| |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  45463002 gggtgcgtttgatttgttaaacaaatgaaagagatgacataacaactccagttgttcaacatttgatttgtaaaactgcttcaggtacaagacaaacagg 45463101  T
Q  515 aggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||||            |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  45463102 aggca------------atagacatatttttgtcactcaccaaaccacaacacaactttttgtcatacgtacagattgtctaaaatatcaaaataacatt 45463189  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgt 669  Q
    | |||||       || ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  45463190 tcgtccc-cagaaatcgtataaaacaaaaaattatttaatgcaataaaaatttgt 45463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 9717174 - 9717113
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9717174 ttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 9717113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 492
Target Start/End: Original strand, 12939202 - 12939274
Alignment:
Q  420 gcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactg 492  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12939202 gcgtttgatttactaaaaaatgaaggataagacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttataaaactg 12939274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 603
Target Start/End: Original strand, 15303180 - 15303308
Alignment:
Q  476 tttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcaggg-acatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttt 574  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||| |  |||||||||| ||  | |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  15303180 tttgatttgtaaaactgcttcagagacaggacaaactagaggcaagacacatgacaaaaacataaatttttgtcctttatcaaactacatcacaactttt 15303279  T
Q  575 tctcccacgtacaagttgtctaaaatacc 603  Q
    | | |||| |  |||||||||||||||||    
T  15303280 tgttccacatgtaagttgtctaaaatacc 15303308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 747
Target Start/End: Original strand, 18793306 - 18793474
Alignment:
Q  580 cacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgcta 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |  ||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||  |||| |     
T  18793306 cacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtcctccaaaaattgtataaaacaaaaaattactcaatcccataaaaaatttgtcttgtgatg 18793405  T
Q  679 ttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| |||| | |||| ||||||| | || ||||||| ||| | ||||||  | |||||||||||||||    
T  18793406 ttctaccttatgttgtactgttctattttatactgttttgtccagtacttattattttgcaaaccaaac 18793474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 632 - 728
Target Start/End: Original strand, 26981786 - 26981884
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa--tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtactt 728  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  26981786 tataaaacaaaaaattactcattgtcataaaaaaatttatcctgtgctgttctgccttgtgttgtgctgttttgtcttgtactgttctgtccagtactt 26981884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26796313 - 26796247
Alignment:
Q  540 atttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaa 606  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26796313 atttgtgtccctcactaaagcacaacgcaactttttgtcacacgtacaagttgtctaaaataccaaa 26796247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 609
Target Start/End: Original strand, 40876554 - 40876697
Alignment:
Q  466 ttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacat 564  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| ||  |||  ||||||||     
T  40876554 ttgtccaatgtttgatttgtaaaactattttaaggacatgacacaccggaggtaagggacatgacaaaagctcaaatttttatctttcattaaaccacaa 40876653  T
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||||| |||||  ||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  40876654 cacaac-ttttcatccaagtacaaattgtttaatataccaaaata 40876697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33889176 - 33889126
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33889176 ttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaa 33889126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 620
Target Start/End: Original strand, 35473036 - 35473085
Alignment:
Q  571 tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35473036 tttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccataatatccttttgtcc 35473085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 632 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 1247148 - 1247065
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||| || | || | |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  1247148 tataaaataaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcttgtactgtactgctttgtgttgtgttgttctgtcttgtactgtt 1247065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 471 - 517
Target Start/End: Original strand, 6453249 - 6453295
Alignment:
Q  471 cagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6453249 cagtgtttgatttttaaaattgtttcagggacaggataaaccggagg 6453295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 37088376 - 37088278
Alignment:
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||  ||| |  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37088376 gacaagacaaaaactgaaattcttgtccctcactaagccacaacacatcttttcatcctaaatacatgatgtttaaaataccaaaatagcattttgtcc 37088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 629 - 666
Target Start/End: Original strand, 38623394 - 38623431
Alignment:
Q  629 tcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatt 666  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38623394 tcatataaaacaaaaaattattcaatatcataaaaatt 38623431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 10485367 - 10485030
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  10485367 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacaaaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaattatttcaggtacaggacaaactgga 10485268  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10485267 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 10485168  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10485167 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaatatttgtcctgtgttgtt-tcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 10485069  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10485068 tctgtactgtacttgctgttttacaaaccaaacgcaccc 10485030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 416 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 17868045 - 17867708
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17868045 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagctgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 17867946  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17867945 ggcaagggacaagataaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaatagcatt 17867846  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  17867845 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatgttgtactg 17867746  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17867745 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 17867708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 416 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 17877828 - 17877491
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17877828 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagctgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 17877729  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17877728 ggcaagggacaagataaaaactcatatttttgtccctcatcaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaatagcatt 17877629  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  17877628 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatgttgtactg 17877529  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17877528 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 17877491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24242840 - 24242541
Alignment:
Q  450 gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtc 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24242840 gacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaagggacacaacaaaaactcatatttttgtc 24242741  T
Q  549 cctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaatta 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| |||||||    
T  24242740 cctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaatta 24242641  T
Q  649 ttcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24242640 ctcaatgtcataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactcttttatcttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 24242541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 15276856 - 15277196
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15276856 gggtgcatttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtctaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 15276955  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15276956 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttttcccacgtacaagttgtctaaaagaacaaaatagcatt 15277055  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||  |||| | |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  15277056 ttgtccctcaaaaatcttataaaacaaaaaattactcaatgccataaaatttttgtcatgtgttgttctgccttatgttgtactgttctatcttgtactg 15277155  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15277156 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 15277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 10960210 - 10959872
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10960210 gggtacgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgaa 10960111  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10960110 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaacaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatt 10960011  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  |||| | |||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  10960010 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaatatcattcaatgccataaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgctgtgatgttctgtcttgtactgt 10959911  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10959910 tctatccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 10959872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3259890 - 3259546
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3259890 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggc 3259791  T
Q  519 agg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259790 aagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 3259691  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatt------tgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |      |||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  3259690 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtac 3259591  T
Q  712 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3259590 tgttctgtccaatccttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 3259546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24203572 - 24203240
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24203572 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactatagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactgga 24203473  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24203472 ggcaagagacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 24203373  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |  ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24203372 ttgtccctcaaaatt-gtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttttgccttgtgttgtactgttctatcatgtactg 24203274  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24203273 ttctgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaac 24203240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 2615100 - 2614764
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-g 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  2615100 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccactgtttgatttgtaaaattgtttcaggtacaggacaaattggaggcaag 2615001  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2615000 ggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 2614901  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    |       || ||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  2614900 ctcaaaaatcgtataaaataaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactgttttgt 2614801  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2614800 ccagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccctaa 2614764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 416 - 746
Target Start/End: Original strand, 32409771 - 32410103
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32409771 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaataactctagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 32409870  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32409871 gacaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccactcacaagttgtctaaaataccaaaatagtatt 32409970  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  32409971 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 32410070  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    ||||||   ||| || |||||||||||| ||||    
T  32410071 ttctgtctagtatttactgttttgcaaatcaaa 32410103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 752
Target Start/End: Original strand, 3932729 - 3933064
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3932729 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaattctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggc 3932828  T
Q  519 -agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
     |||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3932829 aaggggcaggacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttg 3932928  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |  ||||| |||| ||||||| |||| |||||||     
T  3932929 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttttgtcttgtgttgtactgttctatcttatactgttt 3933028  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | | |  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  3933029 tatccaatacttgttattttgcaaaccaaacacacc 3933064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 421 - 742
Target Start/End: Original strand, 10324035 - 10324358
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca- 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  10324035 cgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaactctagttgttcagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagaggcaa 10324134  T
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10324135 gggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtc 10324234  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    ||       || ||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10324235 cccaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatcccataaaaaatttgttctgtgctgttctaccttgtgttgtaatgttctatcttgtactgttctg 10324334  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaac 742  Q
    | | |||||| |||||||||||||    
T  10324335 tccggtacttactgttttgcaaac 10324358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11212465 - 11212134
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag- 516  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11212465 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacgggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaga 11212366  T
Q  517 gcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11212365 taagggacatgacaaaaactcatacttttgtccctcaccaaaccacaacataaccttttgtctcacgtgcaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 11212266  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       ||  |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  11212265 gtccctcaaaaatcgaataaaacaaaaaattactcaaggccataaaacatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 11212166  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11212165 ctgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaac 11212134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 702
Target Start/End: Original strand, 166845 - 167130
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  166845 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaactctacttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactagaggc 166944  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  166945 aagggacataacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttcg 167044  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||       |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  167045 tcccttaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 167130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 417 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17443466 - 17443135
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||     
T  17443466 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggaca-----actttagttgtccagtgtttgatttgtaaaaccatttcaggtacaggacaaactagat 17443372  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17443371 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttatccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 17443272  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
     ||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17443271 cgtcctccaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaatttgtcctgtgctgttatgccttgtgttgtgttgttctatcttgtactgtt 17443172  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17443171 ctgtccaatatttgctgttttgcaaaccaaacacacc 17443135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 31870016 - 31870357
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtaca---ggacaaacc 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||     
T  31870016 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggactggacataacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtctcaggaacaacagaacaaact 31870115  T
Q  513 ggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagc 611  Q
     |||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  31870116 agaggcaagggacaaaacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtataggttgtctaaaatacaaaaatagc 31870215  T
Q  612 attttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtac 711  Q
    |||| |||||       || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31870216 atttcgtcccccaaaactcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaatttgtcatgtgttgttctcccttatattgtgttgttctttcttgtac 31870315  T
Q  712 tgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31870316 tgttatgtacaatacttgatgttttgcaaaccaaacgcaccc 31870357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 414 - 753
Target Start/End: Original strand, 14925373 - 14925713
Alignment:
Q  414 aggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccg 513  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14925373 aggggtgcgtttgattcgttaaaaaatgaaggacaggacatgacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacta 14925472  T
Q  514 ga-ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagca 612  Q
    || |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925473 gatgtaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcccacttacaagttgtctaaaataccaaaatagca 14925572  T
Q  613 ttttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||  |||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  14925573 ttccgtcccctaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaatttgtcctgtgctgttatgccttgtgttgtgttgttctatcttttact 14925672  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| ||| | |||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  14925673 gttatgtcccgtacttacttctttgcaaaccaaacacaccc 14925713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18057729 - 18057397
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||    
T  18057729 gggtgcgtttgattcgctaaaaaatgaaggacaggataggacaacttcaattgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttgagatacatgacaaactaga 18057630  T
Q  516 -ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057629 tgtaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 18057530  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  18057529 tcgtcctctaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaatttgtcctgtgctattatgccttgtgttgtgctgttctatcttttactgt 18057430  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  18057429 tctatccaatacttactgttttgcaaaccaaac 18057397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Original strand, 11613710 - 11614037
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11613710 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaatgga 11613809  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11613810 gacaaggaacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtataaaataccaaaatagcatt 11613909  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||               |||| ||||||| || |||||||    
T  11613910 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtg---------------ttgtactgttctatcgtgtactg 11613994  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11613995 ttctgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 11614037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 416 - 737
Target Start/End: Original strand, 15277199 - 15277522
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  15277199 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaagacaagacaaaacaactctatttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttaaggtacaggacaaactgga 15277298  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15277299 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttatcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 15277398  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||         || |||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| ||||| | || | |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  15277399 ttgtcttccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatgctataaaaaatttgttctgtgttgttttaccttgtgttgtactgttctatcttatactg 15277498  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttg 737  Q
    |||||| | |||||| ||||||||    
T  15277499 ttctgtccagtacttactgttttg 15277522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 416 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 11382272 - 11382068
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11382272 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 11382173  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382172 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgt--ctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 11382075  T
Q  615 ttgtccc 621  Q
    |||||||    
T  11382074 ttgtccc 11382068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 416 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34177040 - 34176772
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34177040 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtcacttgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 34176941  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34176940 ggcaagtgacatgacaaaaactcatatttttgtctctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtacaagtagtctaaaataccaaaatagcatt 34176841  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattct 682  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  34176840 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttct 34176772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 459 - 712
Target Start/End: Original strand, 32132342 - 32132597
Alignment:
Q  459 actctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32132342 actctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaa 32132441  T
Q  558 accacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtc 657  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || |||||||||  |||||| |||||| |    
T  32132442 tccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcattttgtcccccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatgcc 32132541  T
Q  658 at-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  32132542 ataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtact 32132597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 421 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 11279333 - 11279132
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca- 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  11279333 cgtttgatttgctaaaaaatgaaagacgggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactggaggcat 11279234  T
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11279233 gggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttatc 11279134  T
Q  620 cc 621  Q
    ||    
T  11279133 cc 11279132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3379920 - 3379589
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3379920 gggtacgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgatagaacaactttagttgtccagtgtttgatttataaaactgtttcagatacaggacaaactgga 3379821  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3379820 ggcaagagacaagacaaaaactgatatttttgtcgctcaccaaaccatagcacaactttttgtctcacatacaagttgtcttaaataccaaaatagcatt 3379721  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaac-ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    | ||||        ||||||||||| | |||||| |||||||   | ||||||||   ||| || |||| | |||| ||||| | |||| ||||||| ||    
T  3379720 tcgtcctccaaaaatcatataaaacaaaaaaattgttcaatg--cttaaaatttgacatgtactgttctgcattgtgttgtgttattctgtcttgtattg 3379623  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  3379622 ttctgtccgatacttgcggttttgcaaaccaaac 3379589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 418 - 751
Target Start/End: Original strand, 18597079 - 18597413
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| || |||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  18597079 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacgggattgaacaatttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggatatgacaaaccggagg 18597178  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| | ||     
T  18597179 caagggacatgacaaaatctgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtataagttgtctaaaacgctaaaatagtacttc 18597278  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||||       |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||| | |||| ||| || ||||| ||||||   |||||||||||    
T  18597279 gtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattattcaataccataaaaatttattatgtgttgttctacctagtgttgtgttgttctgctttgtactgttc 18597378  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    ||| |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18597379 tgtccaatacttactgttttacaaaccaaatgcac 18597413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 416 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 32860261 - 32859919
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  32860261 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggacatgacaaaacaactccaattgtccagtgtttgatttgtaaaacagtttcagggacatgacaaactgga 32860162  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||||||||||  ||   |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  32860161 ggcaagggacatgacaaaagctgcaatttttgtccatcgccaaaccacagcacaaccttttgtctcacgtacaagttttctaaaatacaaaaataacatt 32860062  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||    
T  32860061 tcgtcacccaaaaatcaaataatacagaaaattattcaataccataaaaatttgtattgtgctgttctgccttatattgtgttgtcctatcttgtactgt 32859962  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaat 757  Q
    | ||| |  ||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  32859961 tatgtccaatacttactgttctacaaatcaaacacaccctaat 32859919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 3290868 - 3290635
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||           ||| ||||    
T  3290868 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtataactgtgtca-----------aactggag 3290780  T
Q  517 gca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290779 gcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttt--tcccacgtataagttgtctaaaataccaaaatagcattt 3290682  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaa 662  Q
    ||||||       |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3290681 tgtccctcaaaaatcatataaaacaaacaattattcaatgtcataaa 3290635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 416 - 740
Target Start/End: Original strand, 11675293 - 11675619
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11675293 gggtgcgtttgatttgctaaaaaaataaagacaagacaaaacaattccagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 11675392  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||     
T  11675393 ggcaaaggacaggacaaaaactgatatttttgtctctcaccaaaccataacacaactttttatcccacgtacaagctttgtaaaatacctaaatggcatc 11675492  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaac-ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    | |||||       || |||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||| | |||| | ||||| |||||| ||||||| ||    
T  11675493 tcgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaaattattcaatgctatagaaatttgtcatgtgctattttaccttttgttgtgttgttctgtcttgtattg 11675592  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaa 740  Q
    || ||| |  ||||| |||||||||||    
T  11675593 ttatgtccaatacttactgttttgcaa 11675619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Original strand, 14807939 - 14808251
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 | ||||  ||||    
T  14807939 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaa-----------------ataaactagagg 14808021  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||| | || ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||     
T  14808022 caagggataggataaaaattgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtataggttgtctaag-taccaaaataacatttc 14808120  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
     ||||       || ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14808121 atcccccaaaaatcgtataaaactaaaaattattcaattccataaaaatttgtcctgtgctattctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgttc 14808220  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  14808221 tgtacaatatttgttgttttgcaaaccaaac 14808251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Original strand, 9902580 - 9902783
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  9902580 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggatagaacaacttcagttgttcagtgtttaatttgttgaactgtttcaggtataggacaaactagaggt 9902679  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9902680 aagggacaggacaaaaactgatatttttgtccctcattaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttcg 9902779  T
Q  618 tccc 621  Q
    ||||    
T  9902780 tccc 9902783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 462 - 621
Target Start/End: Original strand, 4494079 - 4494240
Alignment:
Q  462 ctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaata-ctcatatttttgtccctcaccaaac 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4494079 ctagttgtccagtgtttgatttgtaagactctttcaggtacaggacaaactggaggcaagtgacaggacaaaaaactcatatttttgtccctcaccaaac 4494178  T
Q  560 cacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccc 621  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4494179 cacagtacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccgaaataacattttgtccc 4494240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 416 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29054566 - 29054239
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| || |  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||    
T  29054566 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggacagaacagaataattaaagctgtccaatgtttgatttgtaaaacagtttcaggaacaggacaaattgga 29054467  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29054466 agcaagggacatgacaaaaactacaatttttgtccctcgccaaaccacagcacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaata-caaaataacatt 29054368  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       |||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |  |||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  29054367 tcgtcacccaaaaatcatataatacagaaaattattcaataccat-aaaatttatcttgtgctgttctgtcttatgttgtgttgtcctatcttgtactgt 29054269  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaacca 744  Q
    | ||| | ||||||  | ||||||||||||    
T  29054268 tatgtccagtacttattattttgcaaacca 29054239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 418 - 754
Target Start/End: Original strand, 8177803 - 8178141
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| || | |||||||  | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  8177803 gtgcgattgatttgctaaaaaataaaggacatgaaaaaacaacttcaattatccggtgtttgatttataaaactgtttcaggtacaaaacaaactggagg 8177902  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| || ||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8177903 caagggacaggataaaaa-tgatatttttgtcccttaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgttcaagttgtctaaaataccaaaataacatttc 8178001  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaac--ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||       |||||||||||  | |||| | |||||||  || |||| ||||  ||| || ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  8178002 gtcccccaaaaatcatataaaacaaaaaaaaatgttcaatgctattaaaacttgtcatgtactgttctgtcttgtgttgtgctattctatcttgtattgt 8178101  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||| | | || |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  8178102 tctatccagtgcttcatgttttgcaaaccaaacacaccct 8178141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 452 - 754
Target Start/End: Original strand, 34683948 - 34684244
Alignment:
Q  452 cagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccc 550  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  34683948 cagaccaactctagttgtccagtttttgatttgtaaaa--------ggtacatgacaaactggaggcaagggacacgacaaaaactcat--ttttgtccc 34684037  T
Q  551 tcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtct-aaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattat 649  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        || ||||||||| |||||||     
T  34684038 tcaccaaaccacaacacaactttttgttccacgtacaagttgtctaaaaataccaaaatagcattttgtcctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattac 34684137  T
Q  650 tcaatgtcataaa--aatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| |||||||||    ||| | ||||| | || | |||| | ||||| ||| || |||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  34684138 tcattgtcataaacttttttatcctgtgttgttatgccttatgttgtgttgtcctgtcttgtactgttttgtccaatacttactgttttgcaaaccaaac 34684237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 23636433 - 23636101
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||    
T  23636433 gggtacgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaacttcagttgttcagtgtttgatttgtaaaattgttttaggtacatgataaactgga 23636334  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || ||| | | || ||| ||||||||||||||   |||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  23636333 tgcaaggaataggataaaaactcatatttttgttattcattaaaccacaacacaaatttttgtctcacgtacaagttatttaaaaatccaaaatagcatt 23636234  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  ||| |  |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  23636233 tcgtccccccaaaattgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaactgtcatgtacagttctgccttctgttgtgttgttctgtcttgtactgt 23636134  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | | | | ||| || ||||||||||||||||||    
T  23636133 tatatccagtatttactgttttgcaaaccaaac 23636101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 495
Target Start/End: Original strand, 14925134 - 14925215
Alignment:
Q  414 aggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14925134 aggggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacatgacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgttt 14925215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 420 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 33041472 - 33041403
Alignment:
Q  420 gcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaa 489  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33041472 gcgtttgatttgttaaaaaatgaagaataggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaa 33041403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 9614177 - 9613990
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agg 521  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||  |||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||    
T  9614177 tttgatctgctaaaaaatgaaggacataacaagaaaacttcagttgtacaatgtttgatttgtaaaactgtttcaaggacaggataaactggaggcaagg 9614078  T
Q  522 gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||||||||||   | |  |||||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9614077 gacatgacaaaatttgaagtttttgttactcactaaaccgcaacacaattttttgttccacgtataagttgtctaaaatactaaaata 9613990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 620
Target Start/End: Original strand, 7396048 - 7396249
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||   |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| | ||| ||    
T  7396048 tgcgtttgatttgctaagaaatgaaggacatgacaaaacaatttcagttgtatggtgtttgatttgtaaagctgtttctgggacatgacaagctggaagc 7396147  T
Q  519 ag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    |  ||||| |||||| ||  | || || ||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||    
T  7396148 aatggacaggacaaaaacagaaatctt-gtccctcactaaaccactacacaactttttgtctcacgtacaagttatctaaaatacaaaaatagtgttttg 7396246  T
Q  618 tcc 620  Q
    |||    
T  7396247 tcc 7396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 29814858 - 29814736
Alignment:
Q  632 tataaaacataaaattattcaatgtcataaaaat-ttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgc 730  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||  |||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |    
T  29814858 tataaaacaaaacattactcaatgccataaaaaaattgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttac 29814759  T
Q  731 tgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  29814758 tgttttgcaaaccaaacacaccc 29814736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 660 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 32805442 - 32805346
Alignment:
Q  660 aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32805442 aaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtattgttctatcttgtactgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 32805346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 660 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 28502423 - 28502330
Alignment:
Q  660 aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28502423 aaaaaattgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 28502330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 456 - 619
Target Start/End: Original strand, 35004087 - 35004251
Alignment:
Q  456 acaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcac 554  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||   | ||| || ||||||||| || | |||| |||||| ||| |  |||||||| ||||     
T  35004087 acaactccagttgtgcggtgtttgatttgtaaaacggtttataggacaagataaaccggagacaagagacaagacaaaaactaaattttttgtctctcat 35004186  T
Q  555 caaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
      ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  35004187 ataaccacaacacaactctttgtcccacgtacaagttttctaaaatatcaaaatagatttttgtc 35004251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 9200316 - 9200491
Alignment:
Q  426 gatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc--aggga 523  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| ||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||  |||||  || ||    
T  9200316 gatttgctaaaaagttaaggacaagacatgacaactcaagttgtacaatgtttgatttgtaaaactgttttaaagacatgacaaactagaggctaagaga 9200415  T
Q  524 catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaa 599  Q
    || |||||| ||  | ||| || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  9200416 caagacaaaaacaaaaattcttctccctcaccaaaccatataacaactttttgtcccacatacaaattgtttaaaa 9200491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 620
Target Start/End: Original strand, 27824698 - 27824774
Alignment:
Q  544 ttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27824698 ttgtccctcattataccacatcacaactttttgtcccacgtacgagttatccaaaatacaaaaatagctttttgtcc 27824774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13415928 - 13415861
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaa 489  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13415928 gtttgatttgctaaaaaacgaaagacagaacataacaactctagttgtacagtgtttgatttgtaaaa 13415861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 642 - 747
Target Start/End: Original strand, 4494244 - 4494350
Alignment:
Q  642 aaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaa 740  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| | |||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  4494244 aaaattactcattgccataaaaaatttgtcctgtgttgttctgccttatgttgtgctgttctatcctgtactgttctgtctagtacttactgttttgcaa 4494343  T
Q  741 accaaac 747  Q
    |||||||    
T  4494344 accaaac 4494350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 11382038 - 11381964
Alignment:
Q  679 ttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  11382038 ttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgttcagtacttactattttgcaaaccaaacacaccc 11381964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 559 - 669
Target Start/End: Original strand, 29202990 - 29203099
Alignment:
Q  559 ccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtca 658  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||        |||||||| ||| | |||| |||||| |||    
T  29202990 ccacaacacaactttttctctcaagtacaagttgtttaaaatacc-aaagagcattttgtccacaaaaattcatataagacaaataattgttcaatatca 29203088  T
Q  659 taaaaatttgt 669  Q
    |||||||||||    
T  29203089 taaaaatttgt 29203099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11279072 - 11279016
Alignment:
Q  691 ttgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  11279072 ttgtactgttctatcttgtactgttctatccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 11279016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 560 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 27756370 - 27756314
Alignment:
Q  560 cacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27756370 cacaacacaactttttgtcccccgtataagttgtctaaaatatcaaaataacatttt 27756314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34176763 - 34176713
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34176763 ttgtactgttctgtccagtacttaccgttttgcaaaccaaacccaccctaa 34176713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 8672953 - 8673292
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8672953 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactatagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactggaggc 8673052  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8673053 aagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 8673152  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| || | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  8673153 tccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcctgtgctgttttgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttt 8673252  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8673253 tgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 8673292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 421 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 22999463 - 22999126
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-a 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22999463 cgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccggttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaa 22999364  T
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaac-tttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22999363 gagacaggacaaaaactgatatttttgtccctcagcaaaccatagcaaaacttttttgtcccacgtacaacttgtctaaaatatcaaaatagcattttgt 22999264  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    ||        || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22999263 cctccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgttctgtgctgttctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttttg 22999164  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999163 tattgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 22999126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 416 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 41709987 - 41709644
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41709987 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 41709888  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41709887 ggcaaatgacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtccaacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcatt 41709788  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||    
T  41709787 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaaattgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtattg 41709688  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaat 757  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41709687 ttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccctaat 41709644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 27104169 - 27103829
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27104169 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaactctagttgttcaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 27104070  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104069 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccactgcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 27103970  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  27103969 ttgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtaatgttctatcttgtactg 27103870  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27103869 ttctgtccagtacttgttgttttgcaaatcaaacacaccct 27103829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 418 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34063336 - 34062996
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34063336 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactctttcaggtacaggacaaactggagg 34063237  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063236 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcgccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 34063137  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    |||||       || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| | | || |||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  34063136 gtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgtgctgccttatgttgtactgttctatcttgtactgtt 34063037  T
Q  716 ctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34063036 ctgtccagtacttgcggttttgcaaaccaaacacaccctaa 34062996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 418 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 10467272 - 10466948
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10467272 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgttttaggtacaggacaaactggagg 10467173  T
Q  518 c-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    | || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10467172 caagagacaagacaaaaactgatatttttgttcctcagcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatttt 10467073  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    |||||       || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||          |    
T  10467072 gtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattctatgtcataaaaatttgtcctgtgctgttctcccttgtattgtgttgttctttc----------c 10466983  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466982 tgtattgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 10466948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 45446665 - 45446324
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45446665 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataagacaaaataactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacacgacaaactgga 45446566  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45446565 ggcaagggacaggataaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 45446466  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  45446465 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 45446366  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45446365 ttctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacacccta 45446324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 411 - 752
Target Start/End: Original strand, 7591337 - 7591669
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7591337 cttaagggtgcgtttgttttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 7591436  T
Q  511 ccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | |||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7591437 ctggaggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtgcctcagcaaaccacaacacaactttttgtcacacgtataagttgtctaaaatatcaaaata 7591536  T
Q  610 gcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgt 709  Q
    ||||||||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||       
T  7591537 gcattttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctgttctcccttgtattgtactgttctttct--- 7591633  T
Q  710 actgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7591634 -------tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 7591669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 32019896 - 32020229
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32019896 gggtgcgtttgatttgctaaaaattgaaggacaggacagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 32019995  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || ||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32019996 agcaaggggtaggacaaaaactcatatttttatccctcaccaaaccacagcacaactttttgttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtatt 32020095  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  32020096 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 32020195  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32020196 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaac 32020229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34101718 - 34101379
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34101718 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 34101619  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101618 ggcaagggacaacacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacataacttttttttccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 34101519  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  34101518 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaacgccataaaaaatttgtcctgtgatgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatactg 34101419  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    || ||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  34101418 ttttgtccagtacttacttttttgcaaaccaaacacaccc 34101379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 39643093 - 39642755
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39643093 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttttaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 39642994  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39642993 ggcaagggacaagataaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttctgtcccacgtacaggttgtctaaaataccaaaatagcatt 39642894  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |  ||||       |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  39642893 tcatcccccaaaaattgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcttgtgatgttctctcttacattgtgttgttctttcttgtactat 39642794  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39642793 tctgtacaatacttactattttgcaaaccaaacgcaccc 39642755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4052690 - 4052404
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4052690 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattgga 4052591  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052590 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 4052491  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  4052490 ttgtccctcaaaaatcgtataaaac--aaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 4052404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Original strand, 31513478 - 31513819
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||    
T  31513478 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttatccagtgtttgatttgtaaaattgtttcaggtagatgacaaactgga 31513577  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31513578 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcctaggtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 31513677  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  31513678 ttgtccttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 31513777  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    || ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31513778 ttttgtccaatacttactgttttgcaaaccaaacacacccta 31513819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 6386786 - 6386446
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6386786 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaaaacataacaactgtagttgtccagtgtttgatttataaaactgtttcaggtataggacaaactgga 6386687  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    || |   || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6386686 ggtaaaagataggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 6386587  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  6386586 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgttttgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 6386487  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6386486 ttctgtccagtacttgttgttttgcaaaccaaacacaccct 6386446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 453 - 755
Target Start/End: Original strand, 29563158 - 29563462
Alignment:
Q  453 agaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccct 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29563158 agaacaactctagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactcgaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccct 29563257  T
Q  552 caccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattc 651  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       || ||||||||| ||||||| ||    
T  29563258 caccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactc 29563357  T
Q  652 aatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgca 750  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29563358 aatgccataaaaaatttgtcatgtgttgttctaccttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgttcaatacttgctgttttgcaaaccaaacaca 29563457  T
Q  751 cccta 755  Q
    |||||    
T  29563458 cccta 29563462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 3251551 - 3251890
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3251551 gggtgcgtttgatttgctaaaaaataaaggataagacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttataaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 3251650  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3251651 ggcaagcgacagaacaaaaacttatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttatcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 3251750  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| || ||    
T  3251751 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctatgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttatattg 3251850  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3251851 ttctgtccgatacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 3251890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 41548828 - 41548529
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  41548828 gggtgcgtttaatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacatgacaaactgga 41548729  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41548728 ggcaagagacaggacaaaaactgatatttttgtacctcagcagaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacatt 41548629  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41548628 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgatgttctcccttgtattgtgttgttctttcttgtactgt 41548529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 37664177 - 37664466
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37664177 gggtgcgtttgatttgctaaaaaaatgaaggacaggacagaataactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactag 37664276  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37664277 aggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 37664376  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||| |       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| | |||| |||| |||||||    
T  37664377 tttgtcgctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcttgtgctgttctgcattgtgttgtactgttct 37664466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 29672217 - 29672557
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgcta-aagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29672217 gggtgcgtttgatttgctttaaaaatgaaggacaagacagaacaactctagttgtccagtgtttgattcgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactag 29672316  T
Q  515 aggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcat 613  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29672317 aggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcat 29672416  T
Q  614 tttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||  ||||||| ||||||| |    
T  29672417 tttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccatgaaaaatttgtcctgtgttgttctgtcttgtgttgcactgttctatcttgtatt 29672516  T
Q  713 gttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||||| | || ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  29672517 gttctgtccagttcttactgttttacaaaccaaacacaccc 29672557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 37618287 - 37618626
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  37618287 gggtgcgtttgatttgctagaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccggtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattgga 37618386  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37618387 ggcaaaggacaggacaaaaactgatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgttttaaataccaaaatagcatt 37618486  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |||||       |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  37618487 tcgtcccccaaaaattgtataaaacaaaaaattattcaatgccataaacatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtgctgttatgttttgtactgt 37618586  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    | ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37618587 tatgtccagtacttaccgttttgcaaaccaaacgcaccct 37618626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 421 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 15001671 - 15001340
Alignment:
Q  421 cgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcag 520  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15001671 cgtttgatttgataaaaaatgaaggacaggacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacaggacaaactggaggcaa 15001572  T
Q  521 g-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
      ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15001571 tagacagaacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttatctaaaataccaaaatagcattt-gtc 15001473  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    ||       |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |  |||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15001472 ccccaaaaatcatataaaacagaaaattattcaataccataaaaaatttatcttgtgttgttctgccttgtgttgtgctgttctgtcttgtactgttctg 15001373  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15001372 tccagtacttactgttttgcaaaccaaacgcac 15001340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 416 - 702
Target Start/End: Original strand, 30542917 - 30543205
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30542917 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacataacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaactgga 30543016  T
Q  516 ggcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30543017 ggcaatggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaacttttcgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 30543116  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    |||||||       || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||||    
T  30543117 ttgtcccccaaaaatcgtataaaacataaaattactcaatgccataaaatatttgtcctgtgttgttctgccttgtgttgtactgttct 30543205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 416 - 719
Target Start/End: Original strand, 5968759 - 5969064
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  5968759 gggtgcgtttaatttgctaaaaaatgaaggataggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttaaggtacatgacaaactaga 5968858  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5968859 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaactttttatcccacgtacaaattgtctaaaataccaaaataacatt 5968958  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || || | |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  5968959 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctatgttgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactg 5969058  T
Q  714 ttctgt 719  Q
    ||||||    
T  5969059 ttctgt 5969064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25478453 - 25478116
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25478453 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacataacaactctagttgtccagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 25478354  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    | | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25478353 gacaagggacaggaaaaaaactcatatttttgtccctcatcaaatcacagcacaactttttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtatt 25478254  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||    ||| || |||| |||||| ||||  |||||| |||| ||||||    
T  25478253 ttgtccctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatt----tgtcctgttctgccttgtgttgtattgttctatcttatactgt 25478158  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | |||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25478157 tttgtcaagtacttactgttttacaaaccaaacacaccctaa 25478116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 416 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30501355 - 30501015
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30501355 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatggcagaacaacttcagttgcccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactgga 30501256  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  30501255 ggcaagggacaggacaaaaacacatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgcctaaaatacaaaaataacatt 30501156  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | |  ||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || | || |  ||| | ||||| |||||| ||||||||| |    
T  30501155 tcgagccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctatggtgttttgtcttatgttgtgttgttctgtcttgtactat 30501056  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    | |||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30501055 tatgtcaagtatttgttgttttgcaaaccaaacgcacccta 30501015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40389244 - 40388909
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  40389244 gtttgatttgctagaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactggaggcaaa 40389145  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||    
T  40389144 ggacaggacaaaaactgatatttttatctctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacatacaagttgttttaaatgccaaaatagcatttcgtcc 40389045  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       || ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| | ||||||||| || |||     
T  40389044 cccaaaaatcgtataaaataaaaaattattcaatgccataaaattttttcctgtgttgttctgccttgtgttgtgctgttatgtcttgtactcttatgtc 40388945  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  40388944 cagtacttaccattttgcaaaccaaacgcaccctaa 40388909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Original strand, 7394709 - 7395042
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  7394709 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttacaaaactgtttcaggtacatgacaaactaga 7394808  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7394809 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccataacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 7394908  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    ||||||        ||  |||||||| ||||||| ||| || ||| ||||| |||| || |||| ||||  ||||| |||| ||||||| |||| || ||    
T  7394909 ttgtccttcaaaaatcgcataaaacaaaaaattactcagtgccataaaaaacttgtcctatgctgttctgtcttgtgttgtactgttctatcttatattg 7395008  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||   |||| | ||||||||||||||||||    
T  7395009 ttctgtcaagtacctactgttttgcaaaccaaac 7395042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 35225872 - 35225540
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  35225872 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggataggacagaacaactccagttgtccagtgtttggtttgtaaaacagtttcagggacaggacaaactgga 35225773  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35225772 ggcaagggacaggacaaaaactgcaatttttgtccctcgccaaaccacatcacaactttttgtcacaagtacaagttgtctaaaatacaaaaatagcatt 35225673  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||  ||||| ||||| ||| || ||||||||| |    
T  35225672 tcgtcacccaaaaatcatataaaacaggaaattattcaataccataaaaatttgtcttgtgttgttctgtcttgtgttgtgttgtcctgtcttgtactat 35225573  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  35225572 tctgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 35225540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 422 - 747
Target Start/End: Original strand, 12753226 - 12753552
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-ag 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  12753226 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacaaaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaagactgtttcaggtacaggacaaactgaaggcaaa 12753325  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
     |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12753326 tgacaagacaaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgtcc 12753425  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaa-atttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt 719  Q
    |       || |||||||||  |||||| |||||| |||||||  |||||  |||| | ||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  12753426 cccaaaaatcgtataaaacaacaaattactcaatgccataaaatttttgtcatgtgttgttctgtcttgtgttgtattgttctatcttgtactgttctgt 12753525  T
Q  720 actgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12753526 ccaatactt-ctgttttgcaaaccaaac 12753552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 420 - 747
Target Start/End: Original strand, 13406834 - 13407163
Alignment:
Q  420 gcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca 519  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  13406834 gcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatagggcagaacaactctagttgtctagtgtttaatttgtaaaactgtttcaggtatatgacaaactggaggca 13406933  T
Q  520 ggga-catgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
     ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13406934 aggaacagaacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcataattttttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 13407033  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttct 717  Q
     ||       || ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||  |||| | |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  13407034 gccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgctataaaaaatttgtcatgtgttgttctgccttgtgttgtactgttctatattgtactgttct 13407133  T
Q  718 gtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    || | |||||| |||||||| |||||||||    
T  13407134 gtccagtacttactgttttgtaaaccaaac 13407163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Original strand, 32303503 - 32303819
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  32303503 gggtgcgtttgatttgctaaaaaacgaaggaaatgatagaacaactttagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacag----------- 32303591  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
               |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303592 -----------gacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 32303680  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  32303681 tgtccctcaaaaatcatataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttttgttgtactgttctatcttgtactgt 32303780  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32303781 tctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 32303819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 45114263 - 45113933
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  45114263 gtgcgtttgatttgctaaaacatgaaggacaggacatgacaacttcaattgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacagaacaaacgagatg 45114164  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45114163 caagggagaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcataggtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttc 45114064  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | || | |||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  45114063 gtcctccaaaaatcgtataaaacataaaattattcaatgtcatacaaatttatcatgtgttgttatgccttgtgttgtgctgctctatcttgtactgtta 45113964  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  45113963 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaac 45113933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 31732257 - 31731935
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||  |||||    
T  31732257 tgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaac--------------gacaaacttgaggc 31732172  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732171 aagggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtctcacatacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 31732072  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa-tttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttc 716  Q
    ||||       || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||| |||| |||    
T  31732071 tccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaattttgtcatgtgctattctgtcttgtgttgtactgttctatcttatacttttc 31731972  T
Q  717 tgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31731971 tgtccagtacttactgttttgcaaaccaaacacaccc 31731935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 420 - 664
Target Start/End: Original strand, 14004943 - 14005188
Alignment:
Q  420 gcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca 519  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14004943 gcgtttgatttgctaaaaaatgaaggataggacataacaattttagttgtccagtatttgatttgtaaaactgtttgaggtacaggacaaactggaggca 14005042  T
Q  520 -gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14005043 agggacaagacaaaaactcatatttttgtccatcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacattttgt 14005142  T
Q  619 cccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    ||        |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14005143 ccataaaaaattgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaa 14005188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 416 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 37474910 - 37474598
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37474910 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 37474811  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||                   |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37474810 ggcaagagacaggacaaaaacttatatttttgtccctcagcaaaccaca-------------------gtacaagttgtctaaaataccaaactagcgtt 37474730  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    || | ||       || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37474729 tttttccccaaaaatcgtataaaataaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcatgtgctgttatcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgc 37474630  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaa 746  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37474629 tatatgctgtacttgctgttttgcaaaccaaa 37474598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 418 - 700
Target Start/End: Original strand, 29610952 - 29611235
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29610952 gtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacatgacagaacaacttcagttgtccaatgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactggagg 29611051  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29611052 caagggacaggacaaaaactgaaatttttgtccctcgccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtaaaagttgtctaaaacaccaaaatagcatttc 29611151  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgtt 700  Q
    |||||        |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || | |||||| ||||| ||||    
T  29611152 gtcccccaaaaagcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcctgtgttgttatgccttgtgttgtgttgtt 29611235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 411 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 37862073 - 37861866
Alignment:
Q  411 cttaggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37862073 cttatgggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacata-caactctagttgttcaatgtttgattagtaaaactgtttcaggtacaggacaaa 37861975  T
Q  511 ccggaggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    | ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861974 ctggaggcaagtgacaggacaaaaactcatatttttatccctcaccaaaccacatcataactatttgtcctacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 37861875  T
Q  610 gcattttgt 618  Q
    |||||||||    
T  37861874 gcattttgt 37861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 418 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 17805899 - 17805567
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||| |||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  17805899 gtgcgtttaatttgtttaaaaatgaaggacataacagaccaactctaattgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaagtacaggacaaactagagg 17805800  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17805799 caagggacaagacaaaaactcatatttttgttcctcaccaaaccaaagcacaactctttgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatttt 17805700  T
Q  617 gtcc-cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    |||| |       || ||||||||| ||||||| ||  || | | |||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  17805699 gtcctcccaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcgttgccctaaaaaatttgtcctgtgttgttctaccttgtgttgtgttattctgtcttgtactgt 17805600  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    | |||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  17805599 tttgtcaagtacttactgttttgcaaaccaaac 17805567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 416 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 21272877 - 21272689
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  21272877 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaatgacacgagagaacaactttagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagatacagc---------- 21272788  T
Q  516 ggcagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
          |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21272787 ------gacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatactaaaatagcattt 21272694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 416 - 715
Target Start/End: Original strand, 16485704 - 16486004
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||  | |    
T  16485704 gggtgcgtttgatttgataaagaatgaaggacatgatagaacaatttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaatagtttcagggacatgacaaattgaa 16485803  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| | |||||  ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16485804 ggcaaaggacagaacaaaaactgcaatttttgtccctcgccaaaccacagcacaactttttgtcctacgtataagttttctaaaatacaaaaatagcatt 16485903  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    | ||| |       |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||    
T  16485904 tcgtcacccaaaaatcatataatacagaaaattattcaataccataaaaatttgttttgtgctgttctgccttatattgtgttgtcctatcttgtattgt 16486003  T
Q  715 t 715  Q
    |    
T  16486004 t 16486004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17520805 - 17520619
Alignment:
Q  415 ggggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||  ||    
T  17520805 ggggtgtgtttaatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactccagttgtccggtgtttgatttgtaaaagtgttttaggtgcatgataaaatgg 17520706  T
Q  515 aggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaata 601  Q
    |||| ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  17520705 aggcaagggacagggcaaaaacttata-ttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacatacaagttgtccaaaata 17520619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 38047556 - 38047481
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaact 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38047556 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaact 38047481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 422 - 751
Target Start/End: Original strand, 10656587 - 10656919
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggcagg 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||   | ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||  ||| |||||||  ||||||      
T  10656587 gtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgtcagaacaacctcaattgtccagtatttgatttgtaaatcttttttagagacatgacaaactagaggcaaa 10656686  T
Q  522 -gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
     |||| |||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  10656687 agacaggacaaaaactgaattttttgtccttcacaaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaaattgtctaaaatatcaaaataacaatttgtcc 10656786  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgt- 719  Q
            || ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||  |  | | || |  ||||| ||||| |||||| ||||||||| || |||     
T  10656787 acaaaaaatcgtataaaagaaaaaattattcaataacataaaaatttgtcatacgttgttatgtcttgtgttgtgttgttctctcttgtactattatgtt 10656886  T
Q  720 -actgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcac 751  Q
     | | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10656887 caatatacttattgttttgcaaaccaaacgcac 10656919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 543 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 6460344 - 6460152
Alignment:
Q  543 tttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttc-tcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacat 641  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||        || ||||| ||      
T  6460344 tttgtctctcaccaaaccacatcacaacttttttgtcccacgtataagttgtctaaaataccaaaataacattttgtccataaaaaatcgtataagac-- 6460247  T
Q  642 aaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgtttt 736  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||||| | || ||||||||| |||   |||||| |||||||    
T  6460246 aaaattattcaataccataaaaatttgtcctgtgctactctgccctgtgctgtgctgttttgtcctgtactgttttgtcaagtacttactgtttt 6460152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 538 - 712
Target Start/End: Original strand, 27109559 - 27109735
Alignment:
Q  538 atatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaa 637  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||       |||||||||    
T  27109559 atatttttgttccttaccaaaccacaacacaactttttgtcccgcgtacaaattgtttaaaataccaaaataacatttcgtcccccaaaaatcatataaa 27109658  T
Q  638 ac--ataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtact 712  Q
    ||  | ||||||||||||||  || ||||||||| |||| |  |||| | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27109659 acaaaaaaaattattcaatgctattaaaatttgtcctgtaccgttctgcattgtattgtgttgttctatcttgtact 27109735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 542 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 10932819 - 10932741
Alignment:
Q  542 ttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10932819 ttttgtccctcactaaaccacatcacaacttttagttccacgtacaatttgtctaaaataccaaaatagtcttttgtcc 10932741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 438 - 618
Target Start/End: Original strand, 16595067 - 16595247
Alignment:
Q  438 aatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatact 536  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||  | |||||||||||||||  |||||| || |||| |||||| | ||||| |||||| |||||| ||     
T  16595067 aatgaaggacatgacaggacaacaccagttgtatattgtttgatttgtaaat-tgtttctgggacagaacaaactgtaggcaagggacaggacaaaaaca 16595165  T
Q  537 catatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
       | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16595166 tgaagttttgtccctcgctaatccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttatctaaaatacaaaaatagctttttgt 16595247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 547 - 619
Target Start/End: Original strand, 10320304 - 10320376
Alignment:
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10320304 tccctcaccaaaccacaacacaactttttaccacacgtacaagttgtctaaaatatcaaaataacattttgtc 10320376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 610
Target Start/End: Original strand, 22756338 - 22756501
Alignment:
Q  448 aggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agggacatgacaaatactcatatttttg 546  Q
    |||||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||   ||||| || |||| |||||| ||  | ||||||     
T  22756338 aggacaaaacaactccagttatacaatgtttgatttgtaaaactgtttctgggataggacaaatttgaggcaagagacaagacaaaaacataaattttta 22756437  T
Q  547 tccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22756438 tccctcattataccacaacacaactttttgtatcacgtacaagttatctaaaatacaaaaatag 22756501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 54322 - 54193
Alignment:
Q  474 tgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||  || ||||||||||||| ||  | |||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  54322 tgtttgatttgtaaaactgtttctgagacatgacaatccggacacaagggacatgacaaaaacataaatttttgtcctttgctaaaccacatcacaactt 54223  T
Q  573 tttctcccacgtacaagttgtctaaaatac 602  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  54222 tttgtcccacatacaagttatcgaaaatac 54193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 661 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21272676 - 21272590
Alignment:
Q  661 aaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21272676 aaaatttgtcctatgctgttctgccttgtgttgtactgatctatcttgtattgttctgtccaatacttgctgttttgcaaaccaaac 21272590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 620
Target Start/End: Original strand, 36426201 - 36426347
Alignment:
Q  473 gtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaact 571  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||| |  |||||| |||| | |||||| ||| | | |||||||  | || |||||||| |||| ||    
T  36426201 gtgtttgatttgtaaaattggttcag--acacgacaatcttgaggcaagggataagacaaaaactaaaaattttgtcatttactaaaccacaacacatct 36426298  T
Q  572 ttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36426299 ttttgtctcacatacaagttgtctaaaataccaaaatagtcttttgtcc 36426347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 754
Target Start/End: Original strand, 14005216 - 14005264
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14005216 ttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 14005264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 4052415 - 4052368
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4052415 ttgtactgttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 4052368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 685 - 747
Target Start/End: Original strand, 955102 - 955164
Alignment:
Q  685 cttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  955102 cttgtgttgtactgttctatcttgtactgttctgtcaagtacttgctgttttgtaaaccaaac 955164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 620
Target Start/End: Original strand, 3361789 - 3361843
Alignment:
Q  566 acaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3361789 acaactttttctctcaagtacaagttgtctaatctaccaaaataacattttgtcc 3361843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 14959027 - 14958975
Alignment:
Q  556 aaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaata 609  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14959027 aaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaag-tgtctaaaatatcaaaata 14958975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 566 - 620
Target Start/End: Original strand, 5859518 - 5859572
Alignment:
Q  566 acaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5859518 acaactttttgtcatacgtacaagttatctaaaatactaaaatagtattttgtcc 5859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11944944 - 11944890
Alignment:
Q  556 aaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||||||||  |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11944944 aaaccacactacaactttttgtctcatgtacaatttgtctaaaataccaaaatag 11944890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 610
Target Start/End: Original strand, 3800964 - 3801033
Alignment:
Q  541 tttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  3800964 tttttgttcctcattaaaccacatcacaactttttgtttcacatactagttatctaaaatacaaaaatag 3801033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37861814 - 37861765
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  37861814 ttgtactgttctgtccagtacttactgttttgcaaatcaaacacacccta 37861765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 417 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 102158 - 101817
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||    
T  102158 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacatgacagaacaactctagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcatgtacaggacaacttggag 102059  T
Q  517 gcag-ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102058 gcaacggacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 101959  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  101958 tgtccctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctaccttatattgtactgttctatcttatactgt 101859  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccctaa 756  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  101858 tctgtccggtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccctaa 101817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2564
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2225 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggatagaacaactttagttttc-agtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaattgga 2323  T
Q  516 ggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2324 ggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagtttt 2423  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  2424 ttgtcccataaaaatcctataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcatgtgctgttctgccttgtgttgtactattctatcttgtactg 2523  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2524 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacaccct 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 416 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23448
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23785 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagggcaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaacttga 23686  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23685 ggcaagggacatgacaaaaactcatatttttgtccttcaccaaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataaca-- 23588  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  23587 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtccagtgctgttctgccttgtgttgtattgttctatcttgtactg 23488  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccc 753  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23487 ttctgtccagtatttgctgttttgcaaaccaaacacaccc 23448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 20013 - 19922
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatag 610  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20013 agggatatgacaaaaactgaaattcttgtcactcactaaaccactgtacaactttttgtttcacgtacaagttgtttgaaataccaaaatag 19922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 423 - 752
Target Start/End: Original strand, 5332 - 5663
Alignment:
Q  423 tttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc-agg 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  5332 tttgatttgctaaaaaatgaaggacagaacagaacaacttcagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaactggaggcaagg 5431  T
Q  522 gacatgac-aaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  5432 gacaggacaaaaaacacatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttgtcccacatacaagttgcctaaaatacaaaaataacatttcgagc 5531  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  5532 cccaaaaatcgtataaaacaaaaaattattcaatgtcataaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtgttgttctgtcttgtactgttatgtc 5631  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5632 cagtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 5663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 170; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 416 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 51648 - 51311
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  51648 gggtgcgtttgatttgataaaaaatgaaggacaaaacagaacaactttaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtgcagaacaaactgga 51549  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51548 tgcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtccctca-caaaccacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaatatcaaaatagcatt 51450  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||  |||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  51449 ttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttgtcttgtgctgttctgtcttgtattatactgttctatattgtactg 51350  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51349 ttctgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 51311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 416 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 15382 - 15049
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15382 gggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaagacaaaacaactctaattgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaactgga 15283  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15282 ggcaagggacaagacaaaaactcatatttttgtcccccaccaaaccacaacacaactttttgtctcacgtacaagttgtctaaaatactaaaatagtatt 15183  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgc-tgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactg 713  Q
    |||||||       || |||||||||  |||||| |||||| ||||||  ||| | | |||| | |||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||    
T  15182 ttgtcccccaaaaatcttataaaacaacaaattactcaatgccataaattttttttcatgtgttgttctgccttatgttgtactgttctattttgtactg 15083  T
Q  714 ttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15082 ttctgtccggtacttactgttttgcaaaccaaac 15049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 458 - 752
Target Start/End: Original strand, 17982 - 18278
Alignment:
Q  458 aactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcacca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17982 aactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacatgacaaattggaggcaagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcacca 18081  T
Q  557 aaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgt 656  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||| ||||||| ||||||     
T  18082 aaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtccctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgc 18181  T
Q  657 cat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
     || ||||||||||  |||||| ||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18182 tataaaaaatttgtcttgtgctgttctgacatgtgttgtactgttctatcttgtactgttctatccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 18278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 520 - 752
Target Start/End: Original strand, 12527 - 12760
Alignment:
Q  520 gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 619  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12527 gggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtc 12626  T
Q  620 ccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctg 718  Q
    ||       || ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||  |||||| ||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||     
T  12627 cctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgctataaaaaatttgtcttgtgctgttctgacatgtgttgtactgttctatcttgtactgttcta 12726  T
Q  719 tactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacc 752  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12727 tccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacc 12760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 155; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 418 - 719
Target Start/End: Original strand, 4467 - 4770
Alignment:
Q  418 gtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  |||||    
T  4467 gtgcgtttgatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgatttaggtatagcacaaattggagg 4566  T
Q  518 ca-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatttt 616  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  4567 caagggacaggacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtaaaagttgtctaaaacatcaaaatatcatttt 4666  T
Q  617 gtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgtt 715  Q
    ||| |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  4667 gtctctaaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgtcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttctatcttgtactgtt 4766  T
Q  716 ctgt 719  Q
    ||||    
T  4767 ctgt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 155; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 416 - 754
Target Start/End: Original strand, 13573 - 13912
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  13573 gggtgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaggacagaacaactccagttgtccagtgtttgatttgtaaaattgtttcagggacagaacaaactgga 13672  T
Q  516 ggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    ||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13673 ggcaagggataggacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacagtacaactttttgtcccacttacaagttgtctaaaacaccaaaatagcatt 13772  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
      |||||        |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| || ||||||   || ||||||    
T  13773 ccgtcccccaaaaagcatataaaacaagaaattattcaataccataaaaatttgtcctgtgcaattatgccttgtattttgttgttctgcattatactgt 13872  T
Q  715 tctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13873 tctgtccagtacttactgttttgcaaatcaaacgcaccct 13912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 1532 - 1868
Alignment:
Q  419 tgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggc 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  1532 tgcgtttgatttgttaaaaaatgaaggacaaaacagaacaacttcagttctccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaaggataggacaaactggaggc 1631  T
Q  519 a-gggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttg 617  Q
    | |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1632 aagggacaagacaaaaactgaaatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaaaaccaaaatagcatttcg 1731  T
Q  618 tcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttct 717  Q
    ||||       |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| |   |||||| |||||    
T  1732 tccctcaaaagtcatataaaacaaaaaattattcaataccataaaaatttgttctgtgttgttctctcttgtgttgtgctgttttgctttgtacagttct 1831  T
Q  718 gtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
    ||    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1832 gtcaaatacttattgttttgcaaatcaaacgcaccct 1868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 417 - 702
Target Start/End: Original strand, 15260 - 15551
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15260 ggtgcgtttgatttgctaaaaaatgaagaacatgatagaacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggataaactggag 15359  T
Q  517 gcaggg---------acatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaa 607  Q
    ||| ||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15360 gcaagggacaagatcacatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccatgtacaagttgtctaaaataccaaaa 15459  T
Q  608 tagcattttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttct 702  Q
    ||||||||    ||       || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  15460 tagcattt----cctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgtcataaaaaatttatcctgtgctgttctgccttgtgttgtactgttct 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 620
Target Start/End: Original strand, 13615 - 13670
Alignment:
Q  565 cacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13615 cacaactttttgtcacatgtacaagttgtctagaataccaaaatagtattttgtcc 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 422 - 754
Target Start/End: Original strand, 42843 - 43174
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-g 520  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  42843 gtttgatttgttaaaaaatgaaggataagacagaacaactcca-tagtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaacaaactggaggcaag 42941  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    |||||  ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42942 ggacagaacaaaaactgaaatttgtgtccctcaccaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaa-ttgtctaaaacaccaaaatagcatgttgtcc 43040  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgttctgta 720  Q
    |       ||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||  ||||  |||| | |||||||||||||||||||   |||||||| |||||     
T  43041 ccaaacaatcatataaaacaagaaattattcaataccacaaaaatttgatctgtattattatgccttgtattgtgctgttctgcattgtactgctctgtc 43140  T
Q  721 ctgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcaccct 754  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43141 tagtacttactgttttgcaaaccaaacgcaccct 43174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 416 - 700
Target Start/End: Original strand, 18978 - 19262
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgga 515  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18978 gggtgcctttaatttgctaaaaaatgaaggacaggacagaacaattatatttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtt-caggtacaggacaaactgga 19076  T
Q  516 ggcagg-gacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcatt 614  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19077 ggcaagagacaggacaaa-actcatatttttgtccctcaccaaatcacagcacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaataacatt 19175  T
Q  615 ttgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgtt 700  Q
    ||||||        || ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||   |||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  19176 ttgtccttcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaaatttgccatgtgctgttctaccttgtgttgtactgtt 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 417 - 728
Target Start/End: Original strand, 2383 - 2695
Alignment:
Q  417 ggtgcgtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggag 516  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  2383 ggtgcgtttgatttgctaaaaattgaaggacaagacataacaactctagttgttcagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaagacaaattggag 2482  T
Q  517 g-cagggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 615  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2483 gaaagggacaggacaaaaactcatatctttgtccctaaccaaaccacaacacaac-tattgtctcacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattt 2581  T
Q  616 tgtcccnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcat-aaaaatttgtgctgtgctattctcccttgtattgtgctgttctttcttgtactgt 714  Q
    ||||||       || ||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| ||||  |||||| |||| ||||||    
T  2582 tgtcccccaaaaatcgtataaaacaaaaaattacccaatctcataaaaaatttgtcatgtgttgttctaccttgtgttgtattgttctatcttatactgt 2681  T
Q  715 tctgtactgtactt 728  Q
    | ||| | ||||||    
T  2682 tatgtccagtactt 2695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 422 - 664
Target Start/End: Original strand, 372856 - 373099
Alignment:
Q  422 gtttgatttgctaaagaatgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccggaggca-g 520  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |    
T  372856 gttttatttgctaaaaaatgaaggatatgacagaacaattttagttgtcaaatgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacagaaaaaactggagacaag 372955  T
Q  521 ggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgtcc 620  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  372956 ggatatgacaaaaactcatatttttgtccctcaccaaaccataacacaactttttgtcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatatcattttgtcc 373055  T
Q  621 cnnnnnnntcatataaaacataaaattattcaatgtcataaaaa 664  Q
    |       || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  373056 ctcaaaaatcgtataaaacaaaaaattactcaatgccataaaaa 373099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 706 - 747
Target Start/End: Original strand, 373127 - 373168
Alignment:
Q  706 ttgtactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaac 747  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  373127 ttgtactgttctgttcagtacttgctgttttgcaaaccaaac 373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 575
Target Start/End: Original strand, 19041 - 19202
Alignment:
Q  416 gggtgcgtttgatttgctaaagaa-tgaagaacaggacagaacaactctagttgtccagtgtttgatttgtaaaactgtttcaggtacaggacaaaccgg 514  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  19041 gggtgcgtttgatttgttaaaaaaatgaaggataggacataacaattccagttatccagtgtttgatttgtaaaactgtttcagggacagaataaacagg 19140  T
Q  515 aggc-agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaacttttt 575  Q
    |||| | ||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  19141 aggcaatggacaggacaaaaactgaaatttttgtccctcatcaaagctcaacacaacttttt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 620
Target Start/End: Original strand, 33535 - 33635
Alignment:
Q  519 agggacatgacaaatactcatatttttgtccctcaccaaaccacatcacaactttttctcccacgtacaagttgtctaaaataccaaaatagcattttgt 618  Q
    |||||||||||||| | | | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  33535 agggacatgacaaaaa-tgaaattcttgtccctcatcaaaccacaacacaactttttgtcccacgtacaaattgtataaaataccaaaataggcttttgt 33633  T
Q  619 cc 620  Q
    ||    
T  33634 cc 33635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 709 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 338802 - 338756
Alignment:
Q  709 tactgttctgtactgtacttgctgttttgcaaaccaaacgcacccta 755  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  338802 tactgttatgtccagtacttgctgttttgcaaaccaaacacacccta 338756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University