View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8041_low_5 (Length: 235)

Name: NF8041_low_5
Description: NF8041
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8041_low_5
NF8041_low_5
[»] chr7 (88 HSPs)
chr7 (19-214)||(46580536-46580727)
chr7 (23-214)||(14273583-14273770)
chr7 (23-210)||(16998665-16998848)
chr7 (34-215)||(1858707-1858884)
chr7 (19-197)||(9177526-9177700)
chr7 (23-197)||(13647492-13647664)
chr7 (19-208)||(17017328-17017513)
chr7 (36-215)||(25927129-25927301)
chr7 (37-215)||(13918404-13918578)
chr7 (19-210)||(17060284-17060472)
chr7 (90-217)||(32301353-32301476)
chr7 (114-214)||(16460717-16460817)
chr7 (112-220)||(14157054-14157162)
chr7 (114-214)||(14258519-14258619)
chr7 (114-214)||(16579827-16579927)
chr7 (114-214)||(16585736-16585836)
chr7 (112-217)||(10501373-10501478)
chr7 (19-217)||(42462015-42462209)
chr7 (37-199)||(48991266-48991422)
chr7 (35-210)||(11661345-11661516)
chr7 (23-210)||(14566241-14566424)
chr7 (23-210)||(16996295-16996477)
chr7 (23-210)||(18872399-18872582)
chr7 (23-217)||(16008610-16008800)
chr7 (19-197)||(16091844-16092017)
chr7 (114-210)||(20487614-20487710)
chr7 (23-210)||(18607526-18607709)
chr7 (112-210)||(38519445-38519543)
chr7 (23-209)||(130680-130864)
chr7 (19-173)||(9725520-9725670)
chr7 (19-206)||(11768779-11768964)
chr7 (56-161)||(2529951-2530052)
chr7 (34-210)||(14422023-14422196)
chr7 (90-199)||(14929152-14929257)
chr7 (90-199)||(15352618-15352723)
chr7 (19-217)||(9033206-9033401)
chr7 (35-210)||(11525440-11525612)
chr7 (112-217)||(20619446-20619552)
chr7 (138-214)||(15720064-15720140)
chr7 (19-105)||(14044922-14045008)
chr7 (19-105)||(14354952-14355038)
chr7 (19-198)||(15008359-15008533)
chr7 (149-214)||(8940318-8940383)
chr7 (19-90)||(14036387-14036458)
chr7 (19-90)||(14346417-14346488)
chr7 (37-209)||(1867874-1868040)
chr7 (123-207)||(837317-837401)
chr7 (123-207)||(1202497-1202581)
chr7 (123-207)||(16109474-16109558)
chr7 (149-209)||(38898181-38898241)
chr7 (123-207)||(833321-833405)
chr7 (123-207)||(1198501-1198585)
chr7 (139-200)||(10896687-10896748)
chr7 (139-200)||(15167285-15167346)
chr7 (23-87)||(18456278-18456342)
chr7 (130-209)||(18203887-18203965)
chr7 (164-215)||(45170089-45170140)
chr7 (134-207)||(38828304-38828377)
chr7 (149-197)||(15081900-15081948)
chr7 (164-215)||(18279375-18279426)
chr7 (164-215)||(18283338-18283389)
chr7 (167-217)||(8468783-8468833)
chr7 (168-217)||(14270032-14270081)
chr7 (61-198)||(2280021-2280155)
chr7 (164-215)||(33079-33130)
chr7 (164-215)||(70848-70899)
chr7 (164-215)||(74957-75008)
chr7 (164-215)||(12704742-12704793)
chr7 (164-215)||(12714836-12714887)
chr7 (164-215)||(12718640-12718691)
chr7 (164-215)||(12723551-12723602)
chr7 (164-215)||(16907284-16907335)
chr7 (164-215)||(26292367-26292418)
chr7 (164-215)||(39722238-39722289)
chr7 (22-108)||(48273550-48273636)
chr7 (24-198)||(12255657-12255827)
chr7 (134-207)||(13892670-13892742)
chr7 (115-198)||(20220142-20220222)
chr7 (34-163)||(147704-147829)
chr7 (164-208)||(16114220-16114264)
chr7 (164-208)||(16117373-16117417)
chr7 (168-205)||(11303402-11303439)
chr7 (180-217)||(15113009-15113046)
chr7 (168-205)||(16108659-16108696)
chr7 (168-205)||(23664923-23664960)
chr7 (168-205)||(29796763-29796800)
chr7 (168-205)||(29800582-29800619)
chr7 (134-207)||(34957416-34957488)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (19-216)||(22237880-22238073)
chr8 (19-220)||(19808223-19808420)
chr8 (23-216)||(17460917-17461106)
chr8 (23-197)||(25484104-25484274)
chr8 (34-215)||(14397738-14397915)
chr8 (19-208)||(16799561-16799748)
chr8 (41-208)||(23943876-23944039)
chr8 (19-209)||(20533269-20533455)
chr8 (19-209)||(19154746-19154932)
chr8 (19-210)||(37515778-37515965)
chr8 (20-198)||(17439367-17439541)
chr8 (84-210)||(23659480-23659602)
chr8 (19-200)||(14103085-14103262)
chr8 (114-215)||(25363154-25363255)
chr8 (23-198)||(40492717-40492887)
chr8 (19-210)||(20501962-20502149)
chr8 (87-210)||(17086082-17086201)
chr8 (18-199)||(22995927-22996105)
chr8 (19-207)||(22253026-22253210)
chr8 (19-206)||(23667885-23668069)
chr8 (112-217)||(17438166-17438272)
chr8 (148-214)||(23409864-23409930)
chr8 (112-210)||(5083103-5083202)
chr8 (112-210)||(18833635-18833733)
chr8 (114-210)||(22963364-22963461)
chr8 (138-210)||(23914110-23914183)
chr8 (19-140)||(22525659-22525776)
chr8 (114-168)||(21346185-21346239)
chr8 (139-200)||(44476753-44476814)
chr8 (139-200)||(44480015-44480076)
chr8 (19-197)||(28397635-28397809)
chr8 (149-214)||(16401983-16402054)
chr8 (149-197)||(19936956-19937004)
chr8 (164-215)||(18862728-18862779)
chr8 (164-215)||(21410922-21410973)
chr8 (164-215)||(21805414-21805465)
chr8 (164-215)||(21828097-21828148)
chr8 (23-163)||(27941519-27941655)
chr8 (131-205)||(35026831-35026903)
chr8 (115-198)||(37116434-37116517)
chr8 (115-205)||(22419367-22419455)
chr8 (128-197)||(2418839-2418906)
chr8 (139-200)||(8728620-8728682)
chr8 (164-215)||(19278366-19278417)
chr8 (164-215)||(21972668-21972719)
chr8 (164-215)||(21976753-21976804)
chr8 (164-215)||(43251785-43251836)
chr8 (168-210)||(1327013-1327055)
chr8 (142-183)||(21346241-21346282)
chr8 (22-87)||(26222945-26223010)
chr8 (115-198)||(17266945-17267028)
chr8 (131-172)||(18024465-18024506)
chr8 (134-207)||(21329104-21329176)
chr8 (134-207)||(21967540-21967612)
chr8 (129-198)||(22364748-22364816)
chr8 (134-207)||(34950622-34950694)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (19-214)||(10056707-10056898)
chr4 (19-197)||(23803090-23803264)
chr4 (23-197)||(51463697-51463867)
chr4 (23-189)||(630533-630695)
chr4 (23-197)||(12611106-12611273)
chr4 (19-209)||(17333352-17333540)
chr4 (19-210)||(13591787-13591974)
chr4 (19-210)||(32306856-32307043)
chr4 (19-199)||(14825551-14825728)
chr4 (23-209)||(26050340-26050521)
chr4 (23-210)||(18212805-18212988)
chr4 (114-214)||(17048086-17048186)
chr4 (112-208)||(16043087-16043183)
chr4 (23-210)||(24047164-24047347)
chr4 (112-210)||(14852825-14852924)
chr4 (124-217)||(40907137-40907230)
chr4 (112-210)||(15041911-15042010)
chr4 (112-210)||(15112414-15112513)
chr4 (112-210)||(40906987-40907084)
chr4 (149-214)||(14746570-14746635)
chr4 (19-199)||(15791857-15792034)
chr4 (24-198)||(52243059-52243230)
chr4 (123-207)||(4831496-4831580)
chr4 (123-207)||(4834791-4834875)
chr4 (123-207)||(14047715-14047799)
chr4 (19-179)||(26789441-26789598)
chr4 (150-217)||(14185045-14185112)
chr4 (123-216)||(30146453-30146546)
chr4 (136-209)||(26045268-26045340)
chr4 (164-215)||(12487683-12487734)
chr4 (164-215)||(14954250-14954301)
chr4 (164-215)||(25689842-25689893)
chr4 (164-215)||(27533998-27534049)
chr4 (170-215)||(10712828-10712873)
chr4 (170-215)||(10926598-10926643)
chr4 (168-220)||(19857584-19857636)
chr4 (22-108)||(54798627-54798713)
chr4 (168-205)||(49547744-49547781)
chr4 (164-215)||(4561417-4561468)
chr4 (164-215)||(5757021-5757072)
chr4 (164-215)||(9556502-9556553)
chr4 (25-108)||(14280474-14280557)
chr4 (164-215)||(14757505-14757556)
chr4 (164-215)||(33742350-33742401)
chr4 (168-210)||(15497041-15497083)
chr4 (168-205)||(14048732-14048769)
chr4 (168-205)||(36038025-36038062)
chr4 (168-217)||(52873148-52873197)
chr4 (164-208)||(17810251-17810295)
chr4 (56-153)||(44928821-44928914)
chr4 (23-85)||(43251193-43251255)
chr4 (22-87)||(8574742-8574807)
chr4 (168-205)||(15534336-15534373)
chr4 (56-101)||(20157189-20157234)
chr4 (56-85)||(44102404-44102433)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (19-214)||(14966237-14966428)
chr3 (23-214)||(324303-324490)
chr3 (19-214)||(52989584-52989774)
chr3 (23-220)||(16643234-16643427)
chr3 (19-214)||(21837493-21837683)
chr3 (23-197)||(43550307-43550477)
chr3 (36-215)||(5223371-5223546)
chr3 (23-197)||(50242985-50243155)
chr3 (34-215)||(15465142-15465319)
chr3 (19-205)||(13919408-13919589)
chr3 (93-220)||(54876322-54876445)
chr3 (23-203)||(12378003-12378178)
chr3 (114-215)||(12339773-12339874)
chr3 (114-210)||(10542384-10542480)
chr3 (114-214)||(14179439-14179539)
chr3 (114-210)||(14670995-14671091)
chr3 (114-214)||(43889578-43889678)
chr3 (19-205)||(9577700-9577882)
chr3 (19-199)||(316202-316379)
chr3 (114-214)||(12469969-12470069)
chr3 (114-210)||(14682494-14682590)
chr3 (114-214)||(16796554-16796654)
chr3 (23-210)||(23371337-23371520)
chr3 (23-210)||(51300634-51300817)
chr3 (93-214)||(17691644-17691760)
chr3 (114-214)||(18700259-18700359)
chr3 (23-210)||(14763591-14763774)
chr3 (23-210)||(10833969-10834151)
chr3 (112-187)||(44494901-44494976)
chr3 (112-220)||(28194754-28194863)
chr3 (19-208)||(15246093-15246279)
chr3 (57-202)||(23318615-23318754)
chr3 (112-210)||(37427787-37427885)
chr3 (23-187)||(15207032-15207193)
chr3 (144-217)||(3264997-3265070)
chr3 (149-214)||(11914003-11914068)
chr3 (19-208)||(15265214-15265400)
chr3 (19-204)||(32402821-32403002)
chr3 (144-217)||(36527809-36527882)
chr3 (123-207)||(8928390-8928474)
chr3 (123-207)||(34852617-34852701)
chr3 (23-87)||(24153074-24153138)
chr3 (139-200)||(38311759-38311820)
chr3 (23-162)||(9533416-9533551)
chr3 (122-208)||(14568921-14569007)
chr3 (24-198)||(52523593-52523763)
chr3 (164-215)||(15964944-15964995)
chr3 (164-215)||(15968868-15968919)
chr3 (164-215)||(15972792-15972843)
chr3 (139-200)||(20248741-20248803)
chr3 (164-215)||(11854708-11854759)
chr3 (164-211)||(19775744-19775791)
chr3 (22-153)||(29172491-29172618)
chr3 (61-198)||(2051102-2051235)
chr3 (164-215)||(4107480-4107531)
chr3 (164-215)||(4111332-4111383)
chr3 (164-215)||(7109673-7109724)
chr3 (164-215)||(7113608-7113659)
chr3 (164-215)||(11070043-11070094)
chr3 (164-215)||(11165612-11165663)
chr3 (164-215)||(15617349-15617400)
chr3 (164-215)||(22321639-22321690)
chr3 (164-215)||(22336694-22336745)
chr3 (164-215)||(27409727-27409778)
chr3 (164-215)||(28949699-28949750)
chr3 (164-215)||(30065921-30065972)
chr3 (164-215)||(37439719-37439770)
chr3 (164-215)||(55022842-55022893)
chr3 (170-215)||(4588862-4588907)
chr3 (22-87)||(21618627-21618692)
chr3 (22-87)||(36166776-36166841)
chr3 (168-205)||(54520977-54521014)
chr3 (129-209)||(43926034-43926114)
chr3 (168-197)||(12567723-12567752)
chr3 (168-197)||(13544188-13544217)
chr3 (134-207)||(14647688-14647760)
chr3 (168-205)||(29544812-29544849)
chr3 (183-215)||(11300532-11300564)
chr3 (57-85)||(23274882-23274910)
chr3 (19-63)||(37427930-37427974)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (23-217)||(225-415)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (19-214)||(9945-10136)
scaffold0107 (39-210)||(36253-36420)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (19-217)||(24458-24652)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (19-220)||(27472482-27472679)
chr2 (19-210)||(34874073-34874260)
chr2 (23-214)||(21081601-21081788)
chr2 (19-210)||(18358595-18358781)
chr2 (23-197)||(22173658-22173828)
chr2 (34-215)||(31345184-31345361)
chr2 (19-217)||(34137006-34137200)
chr2 (19-210)||(26392455-26392641)
chr2 (90-214)||(23069215-23069335)
chr2 (23-210)||(19662285-19662468)
chr2 (23-209)||(23287438-23287619)
chr2 (87-210)||(9241999-9242118)
chr2 (23-210)||(21073357-21073540)
chr2 (19-198)||(23004835-23005010)
chr2 (114-210)||(9784754-9784848)
chr2 (112-219)||(21237816-21237924)
chr2 (112-217)||(19201924-19202030)
chr2 (19-198)||(20520053-20520227)
chr2 (112-210)||(30643996-30644094)
chr2 (112-210)||(6261093-6261192)
chr2 (19-208)||(18546805-18546991)
chr2 (149-214)||(23707275-23707340)
chr2 (149-214)||(24918179-24918244)
chr2 (18-198)||(24697466-24697641)
chr2 (19-161)||(22412996-22413134)
chr2 (149-214)||(24681483-24681548)
chr2 (149-213)||(24671065-24671129)
chr2 (123-207)||(22703174-22703258)
chr2 (139-200)||(6482838-6482899)
chr2 (139-200)||(6486305-6486366)
chr2 (164-215)||(1283361-1283412)
chr2 (164-215)||(30345074-30345125)
chr2 (164-215)||(41531087-41531138)
chr2 (123-207)||(13101597-13101682)
chr2 (115-199)||(43947324-43947408)
chr2 (149-197)||(24642807-24642855)
chr2 (19-66)||(34859011-34859058)
chr2 (61-153)||(23708521-23708609)
chr2 (164-215)||(12901595-12901646)
chr2 (164-215)||(24628562-24628613)
chr2 (164-215)||(24649329-24649380)
chr2 (164-215)||(27379516-27379567)
chr2 (164-215)||(27383562-27383613)
chr2 (164-215)||(27601768-27601819)
chr2 (164-208)||(10101728-10101772)
chr2 (179-217)||(22459579-22459617)
chr2 (168-205)||(10684735-10684772)
chr2 (168-205)||(20261374-20261411)
chr2 (18-54)||(5985477-5985513)
chr2 (19-63)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (23-214)||(1739-1926)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (23-210)||(13881246-13881429)
chr1 (19-210)||(27653083-27653270)
chr1 (23-197)||(45574671-45574841)
chr1 (23-191)||(22130695-22130858)
chr1 (19-208)||(52940738-52940923)
chr1 (19-210)||(22124358-22124545)
chr1 (19-210)||(21043142-21043329)
chr1 (19-210)||(20958181-20958368)
chr1 (114-214)||(48603521-48603621)
chr1 (18-198)||(21533734-21533908)
chr1 (23-220)||(28312577-28312770)
chr1 (34-210)||(14800602-14800779)
chr1 (34-210)||(14809476-14809653)
chr1 (114-210)||(41781542-41781636)
chr1 (19-110)||(20345973-20346064)
chr1 (34-210)||(20437868-20438041)
chr1 (139-210)||(16372070-16372141)
chr1 (19-177)||(47190707-47190861)
chr1 (115-208)||(48520586-48520679)
chr1 (23-150)||(16093748-16093871)
chr1 (123-207)||(32649787-32649871)
chr1 (122-209)||(16381256-16381346)
chr1 (112-174)||(20329118-20329181)
chr1 (113-175)||(11945564-11945626)
chr1 (19-177)||(26065045-26065199)
chr1 (125-202)||(635944-636022)
chr1 (134-207)||(2332946-2333019)
chr1 (24-154)||(16758780-16758906)
chr1 (164-215)||(1925212-1925263)
chr1 (164-215)||(20924226-20924277)
chr1 (164-215)||(23819381-23819432)
chr1 (134-207)||(29534624-29534697)
chr1 (19-198)||(35260941-35261114)
chr1 (169-220)||(51326855-51326906)
chr1 (164-215)||(1010695-1010746)
chr1 (164-215)||(20228892-20228943)
chr1 (164-215)||(21407327-21407378)
chr1 (115-198)||(41049988-41050070)
chr1 (115-198)||(50614068-50614151)
chr1 (115-198)||(50621896-50621979)
chr1 (168-210)||(43543201-43543243)
chr1 (115-198)||(50686698-50686781)
chr1 (164-215)||(52639513-52639564)
chr1 (19-60)||(48520787-48520828)
chr1 (164-215)||(16375541-16375593)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (23-213)||(30138793-30138979)
chr5 (19-210)||(6765901-6766087)
chr5 (19-210)||(25576716-25576902)
chr5 (19-210)||(23469876-23470062)
chr5 (19-210)||(25574330-25574516)
chr5 (19-210)||(25575523-25575709)
chr5 (114-210)||(22107386-22107482)
chr5 (23-210)||(26732698-26732880)
chr5 (23-210)||(26740511-26740693)
chr5 (23-210)||(37598747-37598930)
chr5 (23-217)||(42960608-42960799)
chr5 (23-210)||(28370886-28371069)
chr5 (19-209)||(29448078-29448264)
chr5 (19-199)||(21328075-21328252)
chr5 (139-210)||(22336640-22336711)
chr5 (139-210)||(22340178-22340249)
chr5 (112-210)||(21809531-21809629)
chr5 (114-173)||(33895607-33895666)
chr5 (156-215)||(18356264-18356323)
chr5 (128-210)||(21731426-21731509)
chr5 (126-209)||(27988892-27988978)
chr5 (123-207)||(10816478-10816562)
chr5 (139-200)||(22750264-22750325)
chr5 (123-207)||(23538504-23538588)
chr5 (23-87)||(18418770-18418834)
chr5 (23-87)||(22412365-22412428)
chr5 (22-153)||(18318942-18319068)
chr5 (156-215)||(20910910-20910969)
chr5 (139-200)||(19511516-19511577)
chr5 (19-144)||(20572025-20572147)
chr5 (110-209)||(15796494-15796594)
chr5 (164-217)||(10753334-10753387)
chr5 (164-215)||(15236863-15236914)
chr5 (164-215)||(19472803-19472854)
chr5 (164-215)||(20295819-20295870)
chr5 (164-215)||(40723670-40723721)
chr5 (115-209)||(22178172-22178266)
chr5 (170-215)||(15236924-15236969)
chr5 (22-87)||(20765993-20766058)
chr5 (168-205)||(9776513-9776550)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (23-210)||(14979252-14979435)
chr6 (23-210)||(25619587-25619770)
chr6 (19-209)||(33443122-33443305)
chr6 (34-215)||(23414952-23415129)
chr6 (34-215)||(27556710-27556887)
chr6 (23-197)||(25754972-25755142)
chr6 (23-214)||(15817388-15817573)
chr6 (23-197)||(20556723-20556893)
chr6 (19-208)||(20224018-20224203)
chr6 (19-208)||(22118002-22118187)
chr6 (19-210)||(18453255-18453442)
chr6 (23-161)||(25752838-25752972)
chr6 (114-214)||(19773494-19773594)
chr6 (114-216)||(15705395-15705497)
chr6 (90-214)||(22806001-22806120)
chr6 (23-210)||(4476897-4477080)
chr6 (87-210)||(23838247-23838366)
chr6 (19-161)||(18696609-18696747)
chr6 (115-214)||(28103851-28103950)
chr6 (19-198)||(18706391-18706566)
chr6 (57-202)||(18896215-18896354)
chr6 (57-202)||(19362507-19362646)
chr6 (112-214)||(20136739-20136840)
chr6 (112-214)||(22196029-22196130)
chr6 (122-207)||(23539045-23539130)
chr6 (112-210)||(20182866-20182962)
chr6 (112-210)||(22153029-22153125)
chr6 (112-210)||(16493219-16493317)
chr6 (115-209)||(18177624-18177719)
chr6 (115-209)||(18199368-18199463)
chr6 (115-209)||(18204152-18204247)
chr6 (115-209)||(23076806-23076900)
chr6 (115-209)||(23538884-23538978)
chr6 (112-208)||(23528056-23528150)
chr6 (123-207)||(29416865-29416949)
chr6 (115-209)||(35008224-35008318)
chr6 (164-220)||(31477893-31477949)
chr6 (22-153)||(16448435-16448561)
chr6 (164-215)||(16760267-16760318)
chr6 (164-215)||(22949080-22949131)
chr6 (164-215)||(22953036-22953087)
chr6 (164-215)||(23871524-23871575)
chr6 (164-215)||(23875480-23875531)
chr6 (171-215)||(18955853-18955897)
chr6 (19-63)||(20078035-20078079)
chr6 (123-207)||(25738457-25738540)
chr6 (164-215)||(8243833-8243884)
chr6 (164-215)||(11566834-11566885)
chr6 (164-215)||(12618927-12618978)
chr6 (164-215)||(14472243-14472294)
chr6 (164-215)||(18917349-18917400)
chr6 (164-215)||(19870562-19870613)
chr6 (164-215)||(22862918-22862969)
chr6 (164-215)||(23395040-23395091)
chr6 (164-215)||(23989892-23989943)
chr6 (57-153)||(8227409-8227501)
chr6 (168-210)||(15875456-15875498)
chr6 (134-207)||(7429918-7429990)
chr6 (56-153)||(18456846-18456938)
chr6 (56-106)||(25644495-25644545)
chr6 (170-215)||(1644680-1644725)
chr6 (168-205)||(12942356-12942393)
chr6 (134-207)||(14594210-14594282)
chr6 (19-60)||(17229776-17229817)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (23-197)||(269-439)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-214)||(169611-169801)
scaffold0020 (112-210)||(142654-142753)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (23-216)||(15809-15995)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (19-197)||(3188-3362)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (19-214)||(67330-67520)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (34-215)||(39320-39497)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (23-197)||(12221-12391)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (34-215)||(17641-17818)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (34-215)||(31191-31368)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (19-214)||(486-675)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (20-189)||(121-286)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (23-214)||(105149-105334)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (23-197)||(82235-82409)
scaffold0037 (170-215)||(80424-80469)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (19-218)||(4557-4752)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (19-210)||(621-808)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (19-180)||(2287-2444)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (36-215)||(20088-20263)
scaffold0293 (19-210)||(17575-17762)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (37-217)||(10539-10715)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (19-199)||(22361-22538)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (19-199)||(13981-14158)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (19-177)||(3701-3855)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (19-200)||(522-699)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (19-210)||(18028-18215)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (114-210)||(6111-6207)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (114-214)||(20819-20919)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (114-214)||(126024-126124)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (23-210)||(132989-133172)
scaffold0019 (90-208)||(29285-29390)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (112-217)||(8097-8202)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (23-210)||(110726-110909)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (18-217)||(713-907)
scaffold0010 (19-154)||(60575-60706)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (19-209)||(206385-206570)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (114-210)||(21239-21335)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (127-214)||(15030-15117)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-210)||(85618-85805)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (114-220)||(915-1021)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (87-210)||(1967-2086)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (115-217)||(120074-120176)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (20-162)||(658-796)
scaffold0123 (23-177)||(25213-25362)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (114-210)||(6684-6780)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (19-210)||(55545-55733)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (19-128)||(2849-2954)
scaffold0357 (19-198)||(15960-16136)
scaffold0357 (19-198)||(13213-13390)
scaffold0357 (144-209)||(2737-2802)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (19-110)||(8296-8387)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (23-210)||(221072-221254)
scaffold0012 (164-215)||(189460-189511)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (23-207)||(9586-9765)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (112-210)||(3029-3128)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (112-217)||(1004-1110)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (112-214)||(75778-75880)
scaffold0054 (19-63)||(75689-75733)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (57-202)||(16818-16957)
scaffold0046 (57-202)||(25978-26117)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (87-210)||(3940-4060)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (19-210)||(29284-29472)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (112-210)||(10236-10334)
scaffold0485 (19-72)||(10358-10411)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (112-208)||(29747-29844)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (112-210)||(7438-7537)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (112-210)||(2620-2719)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (112-202)||(7510-7601)
scaffold0111 (112-202)||(14629-14720)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (115-205)||(101-191)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (19-209)||(19507-19693)
scaffold0106 (149-214)||(15225-15290)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (112-210)||(11219-11316)
scaffold0040 (112-210)||(22319-22416)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (149-214)||(628-693)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (149-214)||(1279-1344)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (117-217)||(7900-8000)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (149-217)||(4256-4324)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (57-202)||(57898-58037)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (117-199)||(1785-1868)
scaffold0914 (19-55)||(1928-1964)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (112-210)||(30404-30503)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (20-102)||(1308-1390)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (149-211)||(15069-15131)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (149-214)||(53825-53890)
scaffold0022 (115-198)||(128922-129005)
scaffold0022 (22-87)||(116608-116673)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (57-175)||(332423-332537)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (115-202)||(6116-6203)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (153-214)||(6932-6993)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (149-214)||(6889-6954)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (123-207)||(48403-48487)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (123-207)||(146261-146345)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (23-163)||(2357-2493)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (19-106)||(27527-27614)
scaffold0165 (56-198)||(27646-27785)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (164-215)||(367-418)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (164-215)||(11584-11635)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (164-215)||(32743-32794)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (164-215)||(36025-36076)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (164-215)||(36169-36220)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (115-198)||(97092-97175)
scaffold0006 (115-198)||(106370-106453)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (155-217)||(3323-3385)
scaffold0108 (19-60)||(3395-3436)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (114-168)||(13450-13502)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (164-215)||(14170-14221)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (164-215)||(58802-58853)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (164-215)||(422-473)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (164-215)||(3958-4009)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (164-215)||(5184-5235)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (164-215)||(12394-12445)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (164-215)||(65611-65662)
scaffold0029 (164-215)||(61695-61746)
scaffold0029 (164-215)||(80687-80738)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (115-209)||(6235-6329)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (115-209)||(38392-38486)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (115-209)||(18190-18284)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (168-205)||(1583-1620)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (168-205)||(3178-3215)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (170-215)||(207591-207636)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (169-217)||(10858-10906)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (56-85)||(11659-11688)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (56-85)||(15513-15542)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (134-207)||(16541-16613)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (134-207)||(209001-209073)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (134-207)||(163071-163143)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 88)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 46580536 - 46580727
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  46580536 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 46580631  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580632 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 46580727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14273770 - 14273583
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  14273770 tgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 14273675  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273674 tatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14273583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16998848 - 16998665
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  16998848 tgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagcagttataatatgatttaatgttgataa----taatgtaa 16998753  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998752 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16998665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858884
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 1858802  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858803 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1858884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 9177526 - 9177700
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||||    
T  9177526 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagtaat 9177621  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  9177622 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13647664 - 13647492
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatat--gatttaatgttgatagctagtaatgt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||    ||||||    
T  13647664 tgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctattataatatatgatttaatgttgatag----taatgt 13647569  T
Q  121 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13647568 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 17017328 - 17017513
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  17017328 gttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 17017423  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  17017424 gtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgtt 17017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 25927129 - 25927301
Alignment:
Q  36 ggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 135  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  25927129 ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatat 25927224  T
Q  136 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25927225 gcattatgtgaattatatatgatgtttaagt---tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25927301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 13918404 - 13918578
Alignment:
Q  37 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  13918404 gggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatg 13918499  T
Q  137 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13918500 cattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtttacgtgt 13918578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 17060284 - 17060472
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  17060284 gttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaat 17060379  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17060380 gtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgttta 17060472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301353
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgt 32301381  T
Q  190 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301380 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 32301353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 16460717 - 16460817
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460717 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16460816  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  16460817 g 16460817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Original strand, 14157054 - 14157162
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14157054 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 14157153  T
Q  212 gtgttgtct 220  Q
    |||||||||    
T  14157154 gtgttgtct 14157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14258619 - 14258519
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14258619 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14258520  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  14258519 g 14258519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16579927 - 16579827
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579927 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16579828  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  16579827 g 16579827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 16585736 - 16585836
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585736 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16585835  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  16585836 g 16585836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 10501373 - 10501478
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10501373 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 10501472  T
Q  212 gtgttg 217  Q
    ||||||    
T  10501473 gtgttg 10501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42462209 - 42462015
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||  |||  ||| |||||||| |||| |||||    | |||||||    
T  42462209 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgtt----gttagtaat 42462114  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462113 gtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991266
Alignment:
Q  37 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||| |||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat-tgatata-ttgtatatg 48991329  T
Q  137 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48991328 cattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11661516 - 11661345
Alignment:
Q  35 tggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  11661516 tggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtata 11661421  T
Q  135 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11661420 tgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 11661345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14566424 - 14566241
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  14566424 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 14566329  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14566328 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14566241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996295
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    |||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taatgtga 16996382  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16996381 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16996295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18872582 - 18872399
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  18872582 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 18872487  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18872486 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18872399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16008800 - 16008610
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||| |||    |||||  |    
T  16008800 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttag----taatgaga 16008705  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16008704 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 16008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16092017 - 16091844
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    | || ||||    
T  16092017 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgtt----gttaataat 16091922  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16091921 gttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatat 16091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20487710 - 20487614
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20487710 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatattta 20487614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18607709 - 18607526
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  18607709 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 18607614  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18607613 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatttttatatattgagatgttta 18607526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38519543 - 38519445
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38519543 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 38519445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130864
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgt-tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| || ||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||     
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgtt-at---tagtaatgtg 130775  T
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  130776 atatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 130864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 9725520 - 9725670
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||||    
T  9725520 gttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----taat 9725615  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 173  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725616 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 11768779 - 11768964
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||||    
T  11768779 gttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----taat 11768874  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg--attatcatttgatgttgttatatcttgagatg 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11768875 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 11768964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530052
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaa 2530046  T
Q  156 gatgtt 161  Q
    ||||||    
T  2530047 gatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14422196 - 14422023
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||    
T  14422196 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtat 14422101  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14422100 atgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 14422023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 199
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 14929247  T
Q  190 tgttatatct 199  Q
    |||| |||||    
T  14929248 tgttgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 199
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 15352713  T
Q  190 tgttatatct 199  Q
    |||| |||||    
T  15352714 tgttgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 9033206 - 9033401
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  | ||| || ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||     ||||    
T  9033206 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaa----taat 9033301  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9033302 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttg 9033401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525612
Alignment:
Q  35 tggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 134  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||   ||||||| | ||||||| |||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgtt-at---tagtaatttgatatattggtata 11525535  T
Q  135 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11525536 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 11525612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20619552 - 20619446
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20619552 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 20619453  T
Q  211 cgtgttg 217  Q
     ||||||    
T  20619452 tgtgttg 20619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720064
Alignment:
Q  138 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15720064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14045008 - 14044922
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045008 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14355038 - 14354952
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355038 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 15008359 - 15008533
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||||    
T  15008359 gttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaataat 15008454  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15008455 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940318
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 8940318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14036458 - 14036387
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036458 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14346488 - 14346417
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346488 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1868040
Alignment:
Q  37 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 136  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    | || |||||| |||||||||||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgtt----gttaataatgtgatatatttgtatatg 1867968  T
Q  137 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1867969 cattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837401
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202581
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 16109474 - 16109558
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16109474 tatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833405
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198585
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 18456278 - 18456342
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456278 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  130 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 45170089 - 45170140
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45170089 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 45170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38828377 - 38828304
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38828377 atgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18279426 - 18279375
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18279426 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18279375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18283389 - 18283338
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18283389 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18283338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468783
Alignment:
Q  167 tgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 8468783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 14270032 - 14270081
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14270032 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 14270081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280155
Alignment:
Q  61 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaata 2280116  T
Q  160 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33130 - 33079
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33130 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 70848 - 70899
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  70848 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 70899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 74957 - 75008
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  74957 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 75008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 12704742 - 12704793
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12704742 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12704793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12714887 - 12714836
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12714887 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12714836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12718691 - 12718640
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12718691 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12718640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12723602 - 12723551
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12723602 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12723551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 16907284 - 16907335
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16907284 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16907335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26292418 - 26292367
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26292418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 26292367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39722289 - 39722238
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39722289 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 39722238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255827
Alignment:
Q  24 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 123  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 12255751  T
Q  124 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| || || ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  12255752 ataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatc 12255827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892670
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 13892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 20220142 - 20220222
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20220142 taatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 147829 - 147704
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| ||||||  ||    |||||  ||||||||||||    
T  147829 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtgag----taatgagatatatttgtat 147734  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgttta 163  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147733 aagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16114264 - 16114220
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16114264 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16114220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16117417 - 16117373
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16117417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16117373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11303439 - 11303402
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11303439 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 11303402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15113009
Alignment:
Q  180 catttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttg 15113009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 16108659 - 16108696
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16108659 gatgttgattaccgtttgatgttgttatatcttgagat 16108696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 23664923 - 23664960
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23664923 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29796800 - 29796763
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29796800 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29800619 - 29800582
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800619 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29800582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34957488 - 34957416
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34957488 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtagg-gttgactatcatttgatattgtcatattttgagatgt 34957416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 22237880 - 22238073
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  22237880 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 22237975  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237976 gtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 19808223 - 19808420
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  19808223 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttgatag----taat 19808318  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19808319 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgt 19808418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 17460917 - 17461106
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  17460917 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 17461012  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17461013 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 25484104 - 25484274
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  25484104 tgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 25484199  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25484200 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 14397738 - 14397915
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  14397738 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 14397833  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14397834 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 14397915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799561
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944039
Alignment:
Q  41 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcatt 23943971  T
Q  141 atgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  23943972 atgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 23944039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 20533269 - 20533455
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||    
T  20533269 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagtaat 20533364  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  20533365 gtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 19154746 - 19154932
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  19154746 gttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tactaat 19154841  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  19154842 gtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37515965 - 37515778
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||||    
T  37515965 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----taat 37515870  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37515869 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgttta 37515778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439541
Alignment:
Q  20 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataa----taatg 17439462  T
Q  120 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17439463 tgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659480
Alignment:
Q  84 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 23659507  T
Q  184 tgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23659506 tgatgttgttatatctcaagatgttta 23659480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 14103085 - 14103262
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |||    
T  14103085 gttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----taa 14103179  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103180 tgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 25363154 - 25363255
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25363154 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 25363253  T
Q  214 gt 215  Q
    ||    
T  25363254 gt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 40492717 - 40492887
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    
T  40492717 tgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaa 40492812  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||||||||||||| |   |||||||| || ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40492813 tatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 40492887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502149
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 20502057  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20502058 atgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatattta 20502149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Original strand, 17086082 - 17086201
Alignment:
Q  87 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  17086082 tataatatgatttgatgttgatag----taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttgg 17086177  T
Q  187 tgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  17086178 tattgttatatcttgagatgttta 17086201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22996105 - 22995927
Alignment:
Q  18 agttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagta 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| | |     ||    
T  22996105 agttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaa----ta 22996010  T
Q  117 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22996009 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 22253026 - 22253210
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||  |||    ||||    
T  22253026 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttag----taat 22253121  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    || ||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22253122 gtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23668069 - 23667885
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| || ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||||    
T  23668069 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----taat 23667974  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23667973 gtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 23667885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 17438166 - 17438272
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17438166 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 17438265  T
Q  211 cgtgttg 217  Q
     ||||||    
T  17438266 tgtgttg 17438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409864
Alignment:
Q  148 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23409864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 5083103 - 5083202
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5083103 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 5083202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18833733 - 18833635
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18833733 tagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgttta 18833635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 22963364 - 22963461
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22963364 gtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 22963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914110
Alignment:
Q  138 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23914110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22525776 - 22525659
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    | | |||||    
T  22525776 gttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgtt----gttggtaat 22525681  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcatt 140  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22525680 gtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 168
Target Start/End: Original strand, 21346185 - 21346239
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346185 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397635
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||     |||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaa----taa 28397715  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  28397714 tgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402054
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatc------atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 16402054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 18862728 - 18862779
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18862728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18862779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21410973 - 21410922
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21410973 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21410922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21805465 - 21805414
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21805465 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21805414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 21828097 - 21828148
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21828097 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21828148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 27941519 - 27941655
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  27941519 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 27941614  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941615 tatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Original strand, 35026831 - 35026903
Alignment:
Q  131 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35026831 tatatgcattatgtgaattatatatgatgttttaa--gatgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37116517 - 37116434
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 205
Target Start/End: Original strand, 22419367 - 22419455
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22419367 taatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttatatcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 197
Target Start/End: Original strand, 2418839 - 2418906
Alignment:
Q  128 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2418839 ttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 19278366 - 19278417
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19278366 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19278417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 21972668 - 21972719
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21972668 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21972719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 21976753 - 21976804
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21976753 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21976804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43251836 - 43251785
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43251836 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 43251785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 1327013 - 1327055
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 1327055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 183
Target Start/End: Original strand, 21346241 - 21346282
Alignment:
Q  142 tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21346241 tgtgaattatataagatatttaagttgttgttgattatcatt 21346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 17266945 - 17267028
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17266945 taatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  131 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 172  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21329176 - 21329104
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  21329176 atgcattatgtggataatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 21329104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 21967540 - 21967612
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  21967540 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 21967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22364816 - 22364748
Alignment:
Q  129 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22364816 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950622
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgt 34950622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10056898 - 10056707
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  10056898 gttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 10056803  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056802 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 10056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 23803090 - 23803264
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  23803090 gttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taat 23803185  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23803186 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgattttatgttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 51463697 - 51463867
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  51463697 tgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 51463792  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51463793 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Original strand, 630533 - 630695
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  630533 tgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 630628  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  630629 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 630695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12611273 - 12611106
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  12611273 tgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 12611178  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12611177 tatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17333540 - 17333352
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||    
T  17333540 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagtaat 17333445  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17333444 gtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 13591787 - 13591974
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||||    
T  13591787 gttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----taat 13591882  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13591883 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgttta 13591974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 32306856 - 32307043
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||||    
T  32306856 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag----taat 32306951  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32306952 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14825728 - 14825551
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||    
T  14825728 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagtaat 14825633  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14825632 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050521
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taatgtga 26050435  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26050436 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26050521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18212988 - 18212805
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  18212988 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 18212893  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18212892 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18212805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 17048086 - 17048186
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048086 gtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 17048185  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  17048186 g 17048186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16043183 - 16043087
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043183 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 24047164 - 24047347
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  24047164 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 24047259  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24047260 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgttta 24047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 14852825 - 14852924
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14852825 tagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40907230 - 40907137
Alignment:
Q  124 atatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40907230 atatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttg 40907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 15041911 - 15042010
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15041911 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15042010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15112513 - 15112414
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15112513 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15112414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40907084 - 40906987
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40907084 tagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 40906987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746635
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14746635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791857
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||     |||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaa----taa 15791940  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15791939 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243230
Alignment:
Q  24 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52243154  T
Q  124 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  52243155 ataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 4831496 - 4831580
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4831496 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 4834791 - 4834875
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4834791 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14047799 - 14047715
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14047799 tatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789441
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg-atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||  || | ||  ||| ||||| || |||| |||||    | || |||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgtt----gttaataa 26789504  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgattat 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789503 tgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185045
Alignment:
Q  150 atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttg 14185045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30146546 - 30146453
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 216  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  30146546 tatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045340
Alignment:
Q  136 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26045340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12487734 - 12487683
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12487734 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 12487683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 14954250 - 14954301
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14954250 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 14954301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25689893 - 25689842
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25689893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25689842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27534049 - 27533998
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27534049 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 27533998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712828
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10712828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926598
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10926598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19857636 - 19857584
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19857636 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtct 19857584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 49547744 - 49547781
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547744 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 4561417 - 4561468
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4561417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 5757021 - 5757072
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5757021 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5757072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9556553 - 9556502
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9556553 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 9556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  25 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 14757505 - 14757556
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14757505 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14757556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33742401 - 33742350
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33742401 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33742350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 15497041 - 15497083
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15497041 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15497083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14048769 - 14048732
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14048769 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36038062 - 36038025
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36038062 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 52873148 - 52873197
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  52873148 gatgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttg 52873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17810295 - 17810251
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17810295 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 17810251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928914
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtt---ta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 43251193 - 43251255
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 85  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251193 tgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15534373 - 15534336
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15534373 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 15534336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14966428 - 14966237
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  14966428 gttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 14966333  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966332 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14966237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324303
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 324395  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324394 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 324303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 52989584 - 52989774
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  52989584 gttatgagttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 52989678  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989679 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 52989774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16643427 - 16643234
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  16643427 tgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 16643332  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  16643331 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtct 16643234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21837683 - 21837493
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||||    
T  21837683 gttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatag----taat 21837588  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837587 gtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 21837493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 43550307 - 43550477
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  43550307 tgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 43550402  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43550403 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5223546 - 5223371
Alignment:
Q  36 ggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 135  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  5223546 ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatat 5223451  T
Q  136 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5223450 gcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 5223371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50243155 - 50242985
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  50243155 tgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 50243060  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50243059 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15465319 - 15465142
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  15465319 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatataatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 15465224  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15465223 atgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13919589 - 13919408
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||    
T  13919589 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----gat 13919494  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  13919493 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876445
Alignment:
Q  93 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 192  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 54876417  T
Q  193 tatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54876418 tatatcttgagatgtttacgtgctgtct 54876445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12378178 - 12378003
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  12378178 tgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatttaa 12378083  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 203  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  12378082 tata-ttgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12339874 - 12339773
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339874 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 12339775  T
Q  214 gt 215  Q
    ||    
T  12339774 gt 12339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 10542384 - 10542480
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542384 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14179539 - 14179439
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14179539 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14179440  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  14179439 g 14179439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14671091 - 14670995
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671091 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14670995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 43889578 - 43889678
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43889578 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 43889677  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  43889678 g 43889678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577700
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 9577787  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9577786 gtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 9577700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 316379 - 316202
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||||||    ||||    
T  316379 gttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttgatag----taat 316284  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  316283 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12470069 - 12469969
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12470069 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgt 12469970  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  12469969 g 12469969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14682590 - 14682494
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14682590 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgttta 14682494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16796654 - 16796554
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16796654 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgt 16796555  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  16796554 g 16796554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 23371337 - 23371520
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  23371337 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 23371432  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371433 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23371520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51300817 - 51300634
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  51300817 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 51300722  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51300721 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 51300634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691760
Alignment:
Q  93 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 192  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17691644 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttat 17691739  T
Q  193 tatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17691740 tatatc-tgagatgtttacgtg 17691760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 18700259 - 18700359
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18700259 gtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 18700358  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  18700359 g 18700359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 14763591 - 14763774
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||| |||    |||||  |    
T  14763591 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttag----taatgaga 14763686  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14763687 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14763774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 10833969 - 10834151
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  10833969 tgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 10834064  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10834065 tatatt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44494976 - 44494901
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494976 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 44494901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28194863 - 28194754
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28194863 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 28194764  T
Q  211 cgtgttgtct 220  Q
     ||| |||||    
T  28194763 tgtgctgtct 28194754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15246279 - 15246093
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||||    
T  15246279 gttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----taat 15246184  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15246183 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Original strand, 23318615 - 23318754
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318615 tataatattactgatgaactgtgaatctgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
     |||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23318710 ttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37427885 - 37427787
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37427885 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgttta 37427787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15207193 - 15207032
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     |||||| |    
T  15207193 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----taatgtga 15207098  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15207097 tataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgat 15207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265070
Alignment:
Q  144 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttg 3265070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914068
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 11914068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15265400 - 15265214
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  |||||  | ||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||||    
T  15265400 gttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----taat 15265305  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15265304 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 32402821 - 32403002
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| |||| ||||||||  |||||    | ||||||    
T  32402821 gttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttg----cgagtaat 32402915  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 204  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32402916 gtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527809
Alignment:
Q  144 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttg 36527809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 8928390 - 8928474
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8928390 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 34852617 - 34852701
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34852617 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 24153074 - 24153138
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24153074 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9533551 - 9533416
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  9533551 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 9533456  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533455 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Original strand, 14568921 - 14569007
Alignment:
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14568921 atataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatcatgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523763
Alignment:
Q  24 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52523687  T
Q  124 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  52523688 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15964995 - 15964944
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15964995 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15964944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15968919 - 15968868
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15968919 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15968868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15972843 - 15972792
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15972843 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15972792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11854759 - 11854708
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854759 agttgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19775791 - 19775744
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775791 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 19775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172618
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||    ||||| |||     
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttga----tagtattgtg 29172586  T
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 2051102 - 2051235
Alignment:
Q  61 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  2051102 atattaatgatgatttgtgaagctgctataagatgattga-tgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg 2051196  T
Q  160 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2051197 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 4107480 - 4107531
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4107480 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4107531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 4111332 - 4111383
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4111332 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4111383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7109724 - 7109673
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7109724 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7109673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7113659 - 7113608
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7113659 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7113608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11070094 - 11070043
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11070094 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11070043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 11165612 - 11165663
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11165612 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11165663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15617400 - 15617349
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15617400 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15617349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22321690 - 22321639
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22321690 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22321639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22336745 - 22336694
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22336745 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 27409727 - 27409778
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27409727 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27409778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28949750 - 28949699
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28949750 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 28949699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30065972 - 30065921
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30065972 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 30065921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 37439719 - 37439770
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37439719 agttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgt 37439770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 55022893 - 55022842
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55022893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 55022842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 4588862 - 4588907
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4588862 tgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgt 4588907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54521014 - 54520977
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54521014 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926034
Alignment:
Q  129 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 43926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12567752 - 12567723
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567752 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 12567723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13544217 - 13544188
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544217 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 13544188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647760
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14647760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 29544812 - 29544849
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29544812 gatgttgattaccatttgatgttgttatgtcttgagat 29544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300564
Alignment:
Q  183 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11300564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 37427974 - 37427930
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427974 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 225
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  415 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 320  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  319 tatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10136
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  9945 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 10040  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10041 gtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36253
Alignment:
Q  39 gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgca 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttag----taatgtgatatagttgtatatgca 36325  T
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324 ttatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 36253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 24458 - 24652
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  24458 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taat 24553  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24554 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttg 24652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27472679 - 27472482
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||    
T  27472679 gttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttgatag----taat 27472584  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27472583 ataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgt 27472484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 34874073 - 34874260
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |    
T  34874073 gttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----aagtatt 34874168  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874169 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 34874260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 21081601 - 21081788
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  21081601 tgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatac----taatgtaa 21081696  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21081697 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtg 21081788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 18358595 - 18358781
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||    
T  18358595 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgttata-tatgatttaatgttgatag----taat 18358689  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358690 gtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 22173658 - 22173828
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  22173658 tgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 22173753  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22173754 tatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31345361 - 31345184
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  31345361 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataatatgaattagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 31345266  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31345265 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 31345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34137200 - 34137006
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || ||||  ||| ||||||||||| | |||||     ||||||||    
T  34137200 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgtta----ctagtaat 34137105  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34137104 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttg 34137006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26392641 - 26392455
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  ||        
T  26392641 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaag---- 26392546  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26392545 gtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26392455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069335
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggc----aatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatat 23069310  T
Q  190 tgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23069311 tgttatatcttgagatgtttacgtg 23069335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 19662285 - 19662468
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  19662285 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 19662380  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19662381 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23287619 - 23287438
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    ||||||||| |    
T  23287619 tgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagtaatgtga 23287524  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23287523 tatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9242118 - 9241999
Alignment:
Q  87 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 186  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242118 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 9242023  T
Q  187 tgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  9242022 tattgttatatcttgagatgttta 9241999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 21073357 - 21073540
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  21073357 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 21073452  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21073453 tatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21073540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23005010 - 23004835
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    | || | ||    
T  23005010 gttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgtt----gttaatgat 23004915  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  23004914 gttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9784848 - 9784754
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9784848 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgttta 9784754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21237924 - 21237816
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21237924 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T
Q  211 cgtgttgtc 219  Q
     ||| ||||    
T  21237824 tgtgctgtc 21237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 19201924 - 19202030
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201924 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 19202023  T
Q  211 cgtgttg 217  Q
     ||||||    
T  19202024 tgtgttg 19202030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 20520053 - 20520227
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    | | || ||||    
T  20520053 gttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatg----tcgttaataat 20520148  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  20520149 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 30643996 - 30644094
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30643996 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 30644094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 6261093 - 6261192
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatat-gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6261093 tagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 6261192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 18546805 - 18546991
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||   || ||||||||  ||| |||||| |||    ||||    
T  18546805 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttag----taat 18546900  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  18546901 gtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707340
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918179
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24918179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 24697466 - 24697641
Alignment:
Q  18 agttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    | || |||    
T  24697466 agttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgtt----gttaataa 24697560  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| |||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24697561 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 22412996 - 22413134
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||||    
T  22412996 gttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaataat 22413091  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 161  Q
    || |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  22413092 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt 22413134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681483
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24681483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671065
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 24671065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22703258 - 22703174
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22703258 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1283412 - 1283361
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283412 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1283361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 30345074 - 30345125
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30345074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 30345125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 41531087 - 41531138
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41531087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 41531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 13101597 - 13101682
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-gttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13101597 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatcttgagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 43947324 - 43947408
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  43947324 taatgtgatatatt-gtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 34859011 - 34859058
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 66  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34859011 gttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 153
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708609
Alignment:
Q  61 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901646
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12901595 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12901646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 24628562 - 24628613
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24628562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24628613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24649380 - 24649329
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24649380 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24649329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 27379516 - 27379567
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27379516 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27379567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 27383562 - 27383613
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27383562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27601819 - 27601768
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27601819 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27601768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Original strand, 10101728 - 10101772
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10101728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 10101772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459617
Alignment:
Q  179 tcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttg 22459617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 10684735 - 10684772
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684735 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 10684772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20261411 - 20261374
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20261411 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 20261374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 5985513 - 5985477
Alignment:
Q  18 agttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 54  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5985513 agttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 5985477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 63  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 1739 - 1926
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  1739 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 1834  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1835 tatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtg 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 13881246 - 13881429
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  13881246 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 13881341  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13881342 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 13881429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 27653083 - 27653270
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  27653083 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatag----taat 27653178  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653179 gtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 27653270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 45574671 - 45574841
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  45574671 tgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 45574766  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45574767 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttcttatat 45574841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 22130695 - 22130858
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  22130695 tgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctactataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 22130790  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22130791 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-tgattatgatttgatgttg 22130858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 52940738 - 52940923
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  52940738 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 52940833  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52940834 gtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124358
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 22124450  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22124449 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22124358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043329
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 21043237  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21043238 gagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21043329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20958368 - 20958181
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||    ||||    
T  20958368 gttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttag----taat 20958273  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20958272 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgttta 20958181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48603621 - 48603521
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48603621 gtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgt 48603522  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  48603521 g 48603521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 21533734 - 21533908
Alignment:
Q  18 agttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||     ||    
T  21533734 agttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgataga----aa 21533828  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21533829 tgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatc 21533908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28312770 - 28312577
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||  |||    |||||  |    
T  28312770 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagatataatatgatttgatgtttttag----taatgaga 28312675  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28312674 tatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtct 28312577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800602
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14800683  T
Q  130 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14800682 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14800602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809476
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14809557  T
Q  130 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14809556 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14809476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 41781542 - 41781636
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41781542 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgttta 41781636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20346064 - 20345973
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 110  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346064 gttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Original strand, 20437868 - 20438041
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| ||| || |||    |||||  ||||||||||||    
T  20437868 ttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgctgttag----taatgagatatatttgtat 20437963  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20437964 atgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 20438041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372070
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16372070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190707
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||    |||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttag----taa 47190767  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 177  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190766 tgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 47190707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520586
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt 48520586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 150
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093871
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |  |||||| |    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttga----ttttaatgtga 16093843  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaatta 150  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16093844 tatatttgtatatacattacatgaatta 16093871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32649871 - 32649787
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32649871 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  122 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329118
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945564
Alignment:
Q  113 agtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttga 11945564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26065199 - 26065045
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||   || ||||    
T  26065199 gttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatg-tcat---taataat 26065104  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 177  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||    
T  26065103 gtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatt 26065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 635944 - 636022
Alignment:
Q  125 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  635944 tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgttatatcttga 636022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 2332946 - 2333019
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2332946 atgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758780
Alignment:
Q  24 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 123  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   || |||||| ||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtt---ta-taatgtgat 16758811  T
Q  124 atatttgtatatgcattatgtgaattatata 154  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758810 ataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 1925212 - 1925263
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1925212 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1925263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 20924226 - 20924277
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20924226 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20924277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 23819381 - 23819432
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23819381 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23819432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29534697 - 29534624
Alignment:
Q  134 atgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29534697 atgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 35260941 - 35261114
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||    | || ||||    
T  35260941 gttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgtt----gttaataat 35261036  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || || || ||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  35261037 gtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326855
Alignment:
Q  169 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtct 51326855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1010746 - 1010695
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1010746 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 1010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 20228892 - 20228943
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20228892 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21407378 - 21407327
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21407378 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21407327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 41049988 - 41050070
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41049988 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 50614068 - 50614151
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50614068 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 50621896 - 50621979
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50621896 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43543243 - 43543201
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43543243 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 43543201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50686781 - 50686698
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50686781 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52639564 - 52639513
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52639564 agttgttgttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 52639513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 48520828 - 48520787
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 60  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520828 gttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 16375541 - 16375593
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttg-atgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16375541 agttgttgttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16375593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 30138793 - 30138979
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    ||||||||    
T  30138793 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttcgtag----taatgtaa 30138888  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138889 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6766087 - 6765901
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||    
T  6766087 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgttata-tatgatttaatgttgatag----taat 6765993  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765992 gtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576902
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag----taat 25576811  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25576812 gtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23470062 - 23469876
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  23470062 gttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttag----taat 23469967  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  23469966 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-atggtatatcttgagatgttta 23469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574516
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25574425  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25574426 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575709
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25575618  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25575619 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25575709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107482
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 22107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732880
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26732793  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26732794 tatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26732880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 26740511 - 26740693
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26740511 tgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26740606  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26740607 tatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 37598747 - 37598930
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  37598747 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 37598842  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37598843 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 37598930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42960799 - 42960608
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttgggg-taggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||      
T  42960799 tgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgag 42960704  T
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42960703 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42960608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 28370886 - 28371069
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||| | |||||| |||    |||||  |    
T  28370886 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatctgatgttgttag----taatgaga 28370981  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28370982 tatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 28371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29448264 - 29448078
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    || |||     
T  29448264 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgttataatatgatttgatgttga----taataag 29448169  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29448168 gtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 29448078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 21328075 - 21328252
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||   | |||    
T  21328075 gttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgtt-ata---aataa 21328170  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21328171 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatct 21328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336640
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22336640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340178
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22340178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 21809531 - 21809629
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21809531 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21809629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 33895607 - 33895666
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895607 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt 33895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356264
Alignment:
Q  156 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 21731426 - 21731509
Alignment:
Q  128 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21731426 ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21731509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 209
Target Start/End: Original strand, 27988892 - 27988978
Alignment:
Q  126 atttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27988892 atttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10816562 - 10816478
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10816562 tatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 10816478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23538588 - 23538504
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23538588 tatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18418834 - 18418770
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18418834 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22412428 - 22412365
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22412428 tgagttgatctt-ggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319068
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 18319036  T
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatat 18319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910969
Alignment:
Q  156 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20910969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  139 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20572147 - 20572025
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||  ||| || | | ||||||| |||||    | ||||||    
T  20572147 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgtt----gttagtaa 20572052  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgt 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20572051 tgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15796594 - 15796494
Alignment:
Q  110 gctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  15796594 gctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgtt 15796495  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  15796494 t 15796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10753387 - 10753334
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753387 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttg 10753334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 15236863 - 15236914
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236863 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 19472803 - 19472854
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19472803 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20295870 - 20295819
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20295870 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20295819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 40723670 - 40723721
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40723670 agttgttgttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgt 40723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 22178172 - 22178266
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  22178172 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 15236924 - 15236969
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236924 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9776550 - 9776513
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9776550 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 9776513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 14979252 - 14979435
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  14979252 tgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 14979347  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14979348 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 14979435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 25619587 - 25619770
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  25619587 tgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 25619682  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25619683 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33443305 - 33443122
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  33443305 gttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat 33443210  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33443209 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagt---tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23415129 - 23414952
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  23415129 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 23415034  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23415033 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23414952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27556887 - 27556710
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  27556887 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 27556792  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27556791 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgttgttatatattgagatgtttacgtgt 27556710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25755142 - 25754972
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  25755142 tgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 25755047  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25755046 tatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 15817388 - 15817573
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    ||||||      
T  15817388 tgagttgatctt-ggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctgt-ataatatgatttgatgttgttag----taatgtgg 15817481  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15817482 tatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 15817573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 20556723 - 20556893
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  20556723 tgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 20556818  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20556819 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20224203 - 20224018
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  20224203 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaat 20224108  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  20224107 gtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22118187 - 22118002
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  22118187 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaat 22118092  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  22118091 gtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18453442 - 18453255
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| |||||| |||    ||||    
T  18453442 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttag----taat 18453347  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18453346 gtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgttta 18453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25752972 - 25752838
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  25752972 tgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 25752877  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752876 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 19773494 - 19773594
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19773494 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 19773593  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  19773594 g 19773594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Original strand, 15705395 - 15705497
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15705395 gtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttactt 15705494  T
Q  214 gtt 216  Q
    |||    
T  15705495 gtt 15705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806001
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatgg----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatat 22806026  T
Q  190 tgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22806025 tgttatatcttgtgatgtttacgtg 22806001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4477080 - 4476897
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||    ||||| |  ||||  | |||||||||| |||| |||||| |||    |||||  |    
T  4477080 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagttataatataatttgatgttgttag----taatgaga 4476985  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4476984 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 4476897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23838366 - 23838247
Alignment:
Q  87 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 186  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838366 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 23838271  T
Q  187 tgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  23838270 tattgttatatcttgagatgttta 23838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18696747 - 18696609
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||||    
T  18696747 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgtt----gttaataat 18696652  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 161  Q
    || |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696651 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 28103851 - 28103950
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28103851 taatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtg 28103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18706566 - 18706391
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |||    
T  18706566 gttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaataa 18706471  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    ||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||    
T  18706470 tgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 18706391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896354
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataaaa-gatttaatgttgttag----taatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 18896309  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18896310 atgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362507
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaag 19362552  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19362551 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20136840 - 20136739
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20136840 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 20136742  T
Q  212 gtg 214  Q
    |||    
T  20136741 gtg 20136739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Original strand, 22196029 - 22196130
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22196029 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 22196127  T
Q  212 gtg 214  Q
    |||    
T  22196128 gtg 22196130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23539130 - 23539045
Alignment:
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23539130 atatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 23539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182866
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153125
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16493317 - 16493219
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16493317 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 16493219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 18177624 - 18177719
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18177624 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 18199368 - 18199463
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18199368 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18204247 - 18204152
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18204247 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23076900 - 23076806
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  23076900 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23538978 - 23538884
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23538978 taatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Original strand, 23528056 - 23528150
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||| |||||||||||||    
T  23528056 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttga--ttgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 29416865 - 29416949
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29416865 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35008318 - 35008224
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  35008318 taatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 31477893 - 31477949
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31477893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtct 31477949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448561
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 16448529  T
Q  122 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatat 16448561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16760318 - 16760267
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16760318 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 16760267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22949131 - 22949080
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22949131 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22949080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22953087 - 22953036
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22953087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22953036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23871575 - 23871524
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23871575 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23871524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23875531 - 23875480
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23875531 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23875480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18955897
Alignment:
Q  171 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18955897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 20078035 - 20078079
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078035 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25738540 - 25738457
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25738540 tatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8243884 - 8243833
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8243884 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 8243833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11566885 - 11566834
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11566885 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11566834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 12618927 - 12618978
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12618927 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12618978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14472294 - 14472243
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14472294 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14472243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 18917349 - 18917400
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18917349 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 18917400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19870613 - 19870562
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19870613 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19870562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22862969 - 22862918
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22862969 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22862918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23395091 - 23395040
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23395091 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23395040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23989943 - 23989892
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23989943 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23989892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227501
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15875498 - 15875456
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15875498 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15875456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429918
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 7429918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456846
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| ||     || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-----tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1644725 - 1644680
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1644725 tgttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgt 1644680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12942393 - 12942356
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12942393 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 12942356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594282
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14594282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 60  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 269
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  439 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagcttttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 344  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  343 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatttgatgttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 169611 - 169801
Alignment:
Q  20 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 119  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     |||||    
T  169611 ttataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatatttataa----taatg 169706  T
Q  120 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169707 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 169801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 142753 - 142654
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142753 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 142654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15995 - 15809
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||    ||||||||    
T  15995 tgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgttataacata---taatgttgatag----taatgtaa 15903  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15902 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 15809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 3188 - 3362
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||    
T  3188 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttgatag----taat 3283  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3284 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatat 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 67520 - 67330
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  67520 gttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttgatag----taat 67425  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  67424 gtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttg-ggtgtttacgtg 67330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39497 - 39320
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  39497 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 39402  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39401 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 39320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12391 - 12221
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||    
T  12391 tgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctattataatatggtttaatgttgatag----taatgtaa 12296  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12295 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17641
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  17818 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 17723  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17722 atgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31368 - 31191
Alignment:
Q  34 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  31368 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 31273  T
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31272 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 31191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 675 - 486
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||    ||||    
T  675 gttatgagttgatctt-ggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctgt-ataatataatttgatgttgttag----taat 582  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  581 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 121
Alignment:
Q  20 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 119  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatg 191  T
Q  120 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  190 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 105334 - 105149
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||    |||||| |    
T  105334 tgagttgatctt-ggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctgt-ataatatgatttgatgttgttag----taatgtga 105241  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  105240 tatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 105149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 82409 - 82235
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  82409 tgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgtaatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 82314  T
Q  123 tatatttgtat----atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 197  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  82313 tatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80469
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 80469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 4557 - 4752
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||    
T  4557 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagtaat 4652  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| || ||||| | |||||||    
T  4653 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatattattatatctggatatgttaatgtgttgt 4752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 621 - 808
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatag----taat 716  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  717 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgttta 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2444
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  2287 gttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat 2382  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatc 180  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2383 ttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatc 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 20088 - 20263
Alignment:
Q  36 ggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 135  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  20088 ggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttttatat 20183  T
Q  136 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20184 gcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatattgttaaatcttgagatgtttacgtgt 20263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17762 - 17575
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| | |||| | |    ||||    
T  17762 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttgg----taat 17667  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17666 gtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 17575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10539
Alignment:
Q  37 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| |||||||     
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctgt-ataatatgattttaatgttgatat----taatgtgatataattgtatac 10621  T
Q  136 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10620 gcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttg 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22538 - 22361
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||    
T  22538 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagtaat 22443  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  22442 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 13981 - 14158
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||    
T  13981 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagtaat 14076  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14077 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3701
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  3855 gttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaat 3760  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3759 gtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 522 - 699
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |||    
T  522 gttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----taa 616  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 200  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617 tgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 18028 - 18215
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    || | |||||||    
T  18028 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgat----attgttagtaat 18123  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18124 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatattta 18215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6207
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6111 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20919 - 20819
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20919 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 20820  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  20819 g 20819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 126124 - 126024
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  126124 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 126025  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  126024 g 126024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 133172 - 132989
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    ||||   |    
T  133172 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taataaga 133077  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  133076 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  90 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29390 aatatgatttactgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagta---------tttaagatgatgttgattatcatttgatat 29304  T
Q  190 tgttatatcttgagatgtt 208  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29303 tgttatatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8202 - 8097
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8202 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 8103  T
Q  212 gtgttg 217  Q
    ||||||    
T  8102 gtgttg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 110909 - 110726
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |    
T  110909 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgaga 110814  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  110813 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 110726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 713
Alignment:
Q  18 agttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 117  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    |||    
T  907 agttatgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taa 813  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  812 tgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttg 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 60575 - 60706
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || | ||    
T  60575 gttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgtt----gttaattat 60670  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 154  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60671 gtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 206385 - 206570
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| |||    ||||    
T  206385 gttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttag----taat 206480  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  206481 gtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21335 - 21239
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21335 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15117
Alignment:
Q  127 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 85805 - 85618
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaa 117  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||| ||||     |||    
T  85805 gttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagctat-ataatatgattttaatgtcgatat----taa 85711  T
Q  118 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||| ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85710 tgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 85618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 915
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1021 gtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgt 922  T
Q  214 gttgtct 220  Q
    | |||||    
T  921 gctgtct 915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1967
Alignment:
Q  87 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 186  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 1991  T
Q  187 tgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  1990 tattgttatatcttgagatgttta 1967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 120176 - 120074
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  120176 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 120077  T
Q  215 ttg 217  Q
    |||    
T  120076 ttg 120074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 658
Alignment:
Q  20 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaataatg 701  T
Q  120 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 162  Q
    | |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  700 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25362 - 25213
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||     || |||||| |    
T  25362 tgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-----taataatgtga 25268  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 177  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  25267 tatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatt 25213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6780 - 6684
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6780 gtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 55545 - 55733
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||||    
T  55545 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----taat 55640  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55641 gtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2954 - 2849
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  2954 gttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat 2859  T
Q  119 gtaatatatt 128  Q
    ||||||||||    
T  2858 gtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 15960 - 16136
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || ||||    
T  15960 gttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taat 16055  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16056 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13390 - 13213
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || ||||    
T  13390 gttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taat 13295  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga--tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13294 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2737
Alignment:
Q  144 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8387 - 8296
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 110  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387 gttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221254
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||    |||||| |    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttag----taatgtga 221167  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  221168 tatagttgtatatgcattatgtggattatataagac-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 221254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 189460 - 189511
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  189460 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 9586 - 9765
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  9586 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 9681  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9682 tatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaagt-gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 9765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3128 - 3029
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3128 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1004
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1110 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattcttatatcttgagatgttta 1011  T
Q  211 cgtgttg 217  Q
     ||||||    
T  1010 tgtgttg 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Original strand, 75778 - 75880
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  75778 tagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 75877  T
Q  212 gtg 214  Q
    |||    
T  75878 gtg 75880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 75689 - 75733
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75689 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Original strand, 16818 - 16957
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16818 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-attagttaatgtt----gttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 16912  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16913 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26117
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978 tataatattacttatgatctgtgaatctgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 26072  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  26073 atgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatcttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3940
Alignment:
Q  87 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttg 185  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4060 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttg 3965  T
Q  186 atgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
     |  |||||||||||||||||||||    
T  3964 gtaatgttatatcttgagatgttta 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 29284 - 29472
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| |  ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||||    
T  29284 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----taat 29379  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29380 gtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagttta 29472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 10236
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10334 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgttta 10236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 72  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29844 - 29747
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29844 tagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 7438 - 7537
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7438 tagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttgagatgttta 7537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 2620 - 2719
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  2620 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggatatatcttgagatgttta 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7601 - 7510
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7601 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14720 - 14629
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  14720 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 101
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  191 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 19507 - 19693
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| ||| || |||||| |||||||||     ||||    
T  19507 gttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataa----taat 19602  T
Q  119 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19603 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgttt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15290
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11219
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11316 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22319
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22416 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 22319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 628
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1344
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7900
Alignment:
Q  117 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgt 7902  T
Q  216 tg 217  Q
    ||    
T  7901 tg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 217
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4324
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 58037 - 57898
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  58037 tataatattactgatgatctgttaaactgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaa 57943  T
Q  157 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  57942 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1785
Alignment:
Q  117 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat-ataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1868 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 55  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30503 - 30404
Alignment:
Q  112 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30503 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgttta 30404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1390
Alignment:
Q  20 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 102  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1308 ttataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15069
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 15069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53890
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 53890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 128922 - 129005
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  128922 taatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  22 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 332537 - 332423
Alignment:
Q  57 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 156  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  332537 tataatattactgatgttctatgaatctgttatattatgattttatgttgaaag----taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaatt 332442  T
Q  157 atgtttaagttgatgttga 175  Q
    |||||||||||||||||||    
T  332441 atgtttaagttgatgttga 332423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Original strand, 6932 - 6993
Alignment:
Q  153 taagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6954
Alignment:
Q  149 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48487 - 48403
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48487 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 146345 - 146261
Alignment:
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  146345 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 2357 - 2493
Alignment:
Q  23 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    |||||  |    
T  2357 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taatgaga 2452  T
Q  123 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2453 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 27527 - 27614
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27527 gttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27785
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 155  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||      
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgt 27741  T
Q  156 g-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    | |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  27742 gaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 367
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11635
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11584 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32794
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32743 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 32794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 36025 - 36076
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36025 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 36169 - 36220
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36169 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 97175 - 97092
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  97175 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 106453 - 106370
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  106453 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3323
Alignment:
Q  155 agatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttg 3323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3395
Alignment:
Q  19 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 60  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3436 gttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 168
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13502
Alignment:
Q  114 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 168  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13450 gtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 14170 - 14221
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14170 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgt 14221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 58802 - 58853
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  58802 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 58853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 422
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  473 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4009
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3958 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5235
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5184 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12394
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 65611 - 65662
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  65611 agttgttgttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgt 65662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 61695 - 61746
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  61695 agttgttgttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 61746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 80738 - 80687
Alignment:
Q  164 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  80738 agttgttgttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 80687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6329
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38486 - 38392
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||| |  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  38486 taatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 18190 - 18284
Alignment:
Q  115 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 209  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  18190 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1620 - 1583
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1620 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3178
Alignment:
Q  168 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 207591 - 207636
Alignment:
Q  170 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  207591 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgt 207636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Original strand, 10858 - 10906
Alignment:
Q  169 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10858 atgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 10906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  56 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 209001
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 163071 - 163143
Alignment:
Q  134 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 207  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  163071 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 163143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University