View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8045_low_20 (Length: 434)

Name: NF8045_low_20
Description: NF8045
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8045_low_20
NF8045_low_20
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (23-419)||(18678343-18678739)
chr4 (18-419)||(18698183-18698584)
chr4 (18-419)||(18722868-18723269)
chr4 (18-419)||(18730287-18730688)
chr4 (22-419)||(18654260-18654657)
chr4 (123-419)||(18688409-18688705)
chr4 (19-413)||(18074756-18075150)
chr4 (172-312)||(5089844-5089984)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (172-413)||(27676413-27676654)
chr6 (172-413)||(27591814-27592055)
chr6 (18-413)||(27679944-27680339)
chr6 (18-413)||(27717292-27717687)
chr6 (18-413)||(31285553-31285948)
chr6 (18-413)||(27609913-27610308)
chr6 (34-413)||(26624281-26624660)
chr6 (34-413)||(26730258-26730637)
chr6 (172-419)||(26950891-26951138)
chr6 (235-419)||(27664001-27664185)
chr6 (235-419)||(25075078-25075262)
chr6 (235-419)||(26636857-26637041)
chr6 (235-419)||(26742823-26743007)
chr6 (235-419)||(26960336-26960520)
chr6 (256-419)||(26978612-26978775)
chr6 (18-413)||(26803440-26803835)
chr6 (235-419)||(26849923-26850107)
chr6 (20-419)||(26824815-26825214)
chr6 (34-419)||(28793369-28793754)
chr6 (170-413)||(27705047-27705290)
chr6 (34-419)||(28787248-28787633)
chr6 (219-414)||(26812723-26812918)
chr6 (45-407)||(25492118-25492480)
chr6 (19-413)||(27426405-27426799)
chr6 (43-314)||(26885089-26885357)
chr6 (172-413)||(27697379-27697620)
chr6 (34-314)||(27603596-27603876)
chr6 (176-413)||(26862732-26862969)
chr6 (43-413)||(26647498-26647868)
chr6 (43-413)||(26753466-26753836)
chr6 (46-281)||(27530229-27530461)
chr6 (256-413)||(28326710-28326867)
chr6 (256-413)||(28504346-28504503)
chr6 (259-419)||(26938264-26938424)
chr6 (43-247)||(25484078-25484282)
chr6 (256-406)||(28186626-28186776)
chr6 (43-283)||(25511911-25512150)
chr6 (43-247)||(25580741-25580945)
chr6 (43-283)||(26056941-26057181)
chr6 (43-283)||(26076911-26077151)
chr6 (43-247)||(26143887-26144091)
chr6 (18-118)||(28782095-28782195)
chr6 (43-313)||(27336988-27337258)
chr6 (43-313)||(27397728-27397998)
chr6 (175-314)||(26657116-26657252)
chr6 (175-314)||(26763087-26763223)
chr6 (256-413)||(28296533-28296690)
chr6 (256-413)||(28515383-28515540)
chr6 (172-247)||(25539691-25539766)
chr6 (256-407)||(28240589-28240736)
chr6 (219-413)||(29842785-29842979)
chr6 (43-283)||(27215471-27215711)
chr6 (256-407)||(28244027-28244178)
chr6 (190-312)||(28140701-28140823)
chr6 (219-413)||(29827181-29827375)
chr6 (43-99)||(26656984-26657040)
chr6 (43-99)||(26762955-26763011)
chr6 (43-102)||(25539562-25539621)
chr6 (267-313)||(28182361-28182407)
chr6 (41-117)||(27592110-27592186)
chr6 (262-296)||(2186064-2186098)
chr6 (60-117)||(27705343-27705400)
chr6 (333-405)||(25484368-25484440)
chr6 (333-405)||(25512200-25512272)
chr6 (333-405)||(25539852-25539924)
chr6 (365-405)||(26057263-26057303)
chr6 (365-405)||(26077233-26077273)
chr6 (365-405)||(26144209-26144249)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (18-413)||(2332-2727)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (18-419)||(29272625-29273026)
chr8 (354-407)||(14843757-14843810)
chr8 (365-413)||(35984640-35984688)
chr8 (355-413)||(31906385-31906443)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (43-413)||(28126468-28126838)
chr1 (32-413)||(267133-267514)
chr1 (172-419)||(26137036-26137283)
chr1 (43-284)||(28163298-28163539)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (34-413)||(12468-12847)
scaffold0277 (18-413)||(3505-3900)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (34-313)||(8497-8776)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (19-413)||(60564-60958)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (235-417)||(17992004-17992186)
chr2 (190-313)||(3280825-3280948)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (256-413)||(57087-57244)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (256-407)||(40751-40898)
scaffold0038 (256-407)||(44189-44340)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (256-413)||(1-158)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (256-313)||(16692099-16692156)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18678739 - 18678343
Alignment:
Q  23 acaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18678739 acaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaa 18678640  T
Q  123 tcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttca 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18678639 tcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttca 18678540  T
Q  223 agttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcag 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18678539 agttatgaagagattttaaaacgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcag 18678440  T
Q  323 aatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678439 aatgtgagtctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 18678343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18698584 - 18698183
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698584 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 18698485  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18698484 accaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttc 18698385  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18698384 cttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttt 18698285  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 417  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698284 tgcagaatgtgactctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 18698185  T
Q  418 ca 419  Q
    ||    
T  18698184 ca 18698183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18723269 - 18722868
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18723269 tgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaattacta 18723170  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18723169 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttc 18723070  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18723069 cttcaagttatgaagagattttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtat 18722970  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 417  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18722969 tgcagaatgtgagtctacattagatatgtatgaaagaattccagatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaa 18722870  T
Q  418 ca 419  Q
    ||    
T  18722869 ca 18722868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18730688 - 18730287
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18730688 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 18730589  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18730588 accaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttc 18730489  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18730488 cttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttt 18730389  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 417  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18730388 tgcagaatgtgattctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 18730289  T
Q  418 ca 419  Q
    ||    
T  18730288 ca 18730287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18654657 - 18654260
Alignment:
Q  22 gacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaacca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18654657 gacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagca 18654558  T
Q  122 atcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttc 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18654557 atcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttc 18654458  T
Q  222 aagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18654457 aagttatgaagagattttaaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgca 18654358  T
Q  322 gaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18654357 gaatgtgaatctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaaca 18654260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 123 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18688705 - 18688409
Alignment:
Q  123 tcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttca 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688705 tcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttca 18688606  T
Q  223 agttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18688605 agttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcag 18688506  T
Q  323 aatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688505 aatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 18688409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 413
Target Start/End: Original strand, 18074756 - 18075150
Alignment:
Q  19 gttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaa 118  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||     
T  18074756 gttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactag 18074855  T
Q  119 ccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttcc 218  Q
    ||  ||||||| ||||||  |   ||| |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  18074856 cctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttcc 18074955  T
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  18074956 ttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacata 18075055  T
Q  319 tcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      ||||||  ||  ||||||||||  |||| |||  ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  18075056 gaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaaga 18075150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5089984 - 5089844
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |  ||  |||  | ||||||||||||  |||||||||||||  ||    ||||||||||||||||    
T  5089984 gctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaaccgtgtggtaacttatgcttctggccttc 5089885  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaag 312  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5089884 cattggctttagaagttgtgggttccaatttgtttggaaag 5089844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 172 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27676654 - 27676413
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27676654 gctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttc 27676555  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||    
T  27676554 cattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatat 27676455  T
Q  372 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  27676454 ccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaaga 27676413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 172 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27592055 - 27591814
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27592055 gctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttc 27591956  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||    
T  27591955 cattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatat 27591856  T
Q  372 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||    
T  27591855 ccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaaga 27591814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Original strand, 27679944 - 27680339
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27679944 tgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttacta 27680043  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    | || |||||   |||||| ||  |||| |||||||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27680044 agcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttc 27680143  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27680144 cttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcat 27680243  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||| ||  ||  ||||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  27680244 agaagattggaagcatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaaga 27680339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27717687 - 27717292
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27717687 tgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 27717588  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||  ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  27717587 acctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttc 27717488  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||  ||    
T  27717487 cttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacat 27717388  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
        |||||  ||  ||||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  27717387 agaggaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaaga 27717292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Original strand, 31285553 - 31285948
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31285553 tgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 31285652  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |  | ||||| | || ||| ||  |||| |||||||||| ||  |  |    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31285653 agtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttc 31285752  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  31285753 cttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcat 31285852  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       | ||||  ||  ||||||||||  |||| | |  ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31285853 agaaaaatggaagagtacattagatgggtatgacaagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaaga 31285948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27610308 - 27609913
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||    
T  27610308 tgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgcta 27610209  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||  ||||| | || ||| ||||||| |||| |||||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  27610208 acctgtcatgggataaaaagtatgcataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttc 27610109  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  27610108 cttcaggttacgaagagattttaaaccgtgctgttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacat 27610009  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
        |||||  ||| ||||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  27610008 agaggaatggaagtatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaaga 27609913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 413
Target Start/End: Original strand, 26624281 - 26624660
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||     
T  26624281 caactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataa 26624380  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    |||  |  |||| |||||||||| ||| |  |  | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26624381 aaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaaga 26624480  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtct 333  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||  ||| |    
T  26624481 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtat 26624580  T
Q  334 acattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26624581 acattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaaga 26624660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 413
Target Start/End: Original strand, 26730258 - 26730637
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||     
T  26730258 caactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataa 26730357  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    |||  |  |||| |||||||||| ||| |  |  | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26730358 aaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaaga 26730457  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtct 333  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||  ||| |    
T  26730458 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtat 26730557  T
Q  334 acattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26730558 acattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaaga 26730637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 419
Target Start/End: Original strand, 26950891 - 26951138
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | |||  |  |||||| |||||    |||||||||||||||||    |||||| |||||||||    
T  26950891 gctcttgaattgttaagaatgatggcttttaaaagtaacaaaaatgattcaaggtatgatagtattttaaaccgtgcagttaaatatgctgctggccttc 26950990  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26950991 cattagctttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagactatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgaaagaattccacatgaagatat 26951090  T
Q  372 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26951091 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaggaacaaca 26951138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27664185 - 27664001
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |    
T  27664185 attttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaa 27664086  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27664085 ccttagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaaca 27664001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 25075078 - 25075262
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |||||||    
T  25075078 attttaaaccgtgcaattaaatatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaacttgtttggaatgagtacaacagaatgcgagtcta 25075177  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25075178 cattagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaaaatacttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaaca 25075262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 26636857 - 26637041
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26636857 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctt 26636956  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  26636957 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaaca 26637041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 26742823 - 26743007
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26742823 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctt 26742922  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  26742923 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaaca 26743007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 26960336 - 26960520
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  26960336 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctt 26960435  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  26960436 tattagataagtatgacagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaaca 26960520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 419
Target Start/End: Original strand, 26978612 - 26978775
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26978612 tatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaagcttgtttggaaagagtatagcagagtgtgagtctatattagataagtatggaagaa 26978711  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978712 ttccacctgaacatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 26978775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Original strand, 26803440 - 26803835
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||     
T  26803440 tgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactg 26803539  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||| ||||||  ||||||  |   ||| |||||| ||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |    
T  26803540 accagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtac 26803639  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26803640 cttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcat 26803739  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||||||  ||  ||||||||||   ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26803740 aaaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 26803835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 419
Target Start/End: Original strand, 26849923 - 26850107
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    |||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  26849923 attttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaagaatgcgagtcta 26850022  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| | |||||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  26850023 cattagataagtatgaaagaattccacatgcagatattcaaaagatacttagaataagctatgactctttggatgaagaacaaca 26850107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 419
Target Start/End: Original strand, 26824815 - 26825214
Alignment:
Q  20 ttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaac 119  Q
    |||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||   | | |||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||    
T  26824815 ttgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttac 26824914  T
Q  120 caatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttcct 219  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |  |  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||     
T  26824915 caatcatgagatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccg 26825014  T
Q  220 tcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtattt 319  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||      
T  26825015 tcaagttatgaacacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagagcatac 26825114  T
Q  320 cagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
     |  |||  ||  | ||||||||   ||| |||| |||||  || || | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  26825115 aaatatggaagggtgcattagatggatatgaaaggattcctgacaaaaagatccaagagatacttagagtaagctatgatgctttggaagaagagcaaca 26825214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 419
Target Start/End: Original strand, 28793369 - 28793754
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||  | ||||| | |||    
T  28793369 caactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatag 28793468  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    ||| ||  ||||||||  ||||| ||| |  |  | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||    
T  28793469 aaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 28793568  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtct 333  Q
      ||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||||  ||  |    
T  28793569 cgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggt 28793668  T
Q  334 acattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    || ||||||   ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  28793669 actttagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaaca 28793754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27705290 - 27705047
Alignment:
Q  170 atgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggcct 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27705290 atgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 27705191  T
Q  270 tccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagat 369  Q
    ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||   ||||||  ||  ||||||||||  |||| | || ||||| ||  ||||     
T  27705190 tccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagag 27705091  T
Q  370 atccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  27705090 atccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaaga 27705047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 419
Target Start/End: Original strand, 28787248 - 28787633
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||  | ||||| | |||    
T  28787248 caactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatag 28787347  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    ||| ||  ||||||||  ||||| ||| |  |  | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||    
T  28787348 aaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 28787447  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtct 333  Q
      ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||||  ||  |    
T  28787448 cgttttaaatcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggt 28787547  T
Q  334 acattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    || ||||||   ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  28787548 actttagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaaca 28787633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 414
Target Start/End: Original strand, 26812723 - 26812918
Alignment:
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatt 318  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || |||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26812723 ttcaagttatgattacattttaaatcgcgcagtaaaatatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatt 26812822  T
Q  319 tcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaa 414  Q
      ||| || || |||||||||||||||||| |||| |  |||   |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26812823 gaagagtgggaatctacattagataagtatgaaaggacgccacctgaagatatccaaaatatattcaaagtaagctttgatgctttggacaaagaa 26812918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25492480 - 25492118
Alignment:
Q  45 tttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgcat 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  25492480 tttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcat 25492381  T
Q  145 gaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaacc 244  Q
    | |||||||| | ||  |  |||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |    
T  25492380 gcagtagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacac 25492281  T
Q  245 gtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataa 344  Q
     |||| |    |||||||||||||||||||||||| ||| | || | || || || || |||||||| || ||   ||||||  ||| |||||||||| |    
T  25492280 ttgcaattacctatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtacattagatga 25492181  T
Q  345 gtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    |||| |||  |||   ||  |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25492180 gtatgaaaagattttcaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttgga 25492118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27426799 - 27426405
Alignment:
Q  19 gttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaa 118  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||     
T  27426799 gttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactag 27426700  T
Q  119 ccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttcc 218  Q
    ||  ||||||| ||||||  |   ||| |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  27426699 cctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttcc 27426600  T
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  27426599 ttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacata 27426500  T
Q  319 tcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      ||||||  ||  ||||||||||  |||| |||  ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  27426499 gaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaaga 27426405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 26885089 - 26885357
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||  |||||| |  |       
T  26885089 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 26885188  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    |||||||||||||||| | |  | || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26885189 atgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaag---acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 26885285  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagag 314  Q
    |||||||||    |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26885286 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagag 26885357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27697620 - 27697379
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||    
T  27697620 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagagattttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggccttc 27697521  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 371  Q
    | |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||   ||||||  ||| || |||||||  |||| | || ||||| ||  |||| ||    
T  27697520 cgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaagtatatattagatgggtatgacaggattcccaataaagagat 27697421  T
Q  372 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  27697420 ccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaaga 27697379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27603876 - 27603596
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||   | ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||  |||    
T  27603876 caactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatag 27603777  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    |||  | | ||| | |||||||| ||| || |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||  |||||||||    
T  27603776 aaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaaga 27603677  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagag 314  Q
      ||||||||||||||||    |||||||| || ||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603676 cgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 27603596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 413
Target Start/End: Original strand, 26862732 - 26862969
Alignment:
Q  176 ttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccatt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  26862732 ttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggccttccgtt 26862831  T
Q  276 agctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaa 375  Q
    || | | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||  | |  |||||||||  |||| |||  ||||| ||  |||| ||||||    
T  26862832 agttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggcaatgcacattagatgggtatgaaaagattcccaataaagagatccaa 26862931  T
Q  376 aagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26862932 aggatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaaga 26862969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Original strand, 26647498 - 26647868
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||  ||||| | ||||||  |       
T  26647498 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 26647597  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||  |||| | | |  |  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  26647598 atgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaa 26647697  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagat 342  Q
    |||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||  ||  ||||||||||    
T  26647698 ccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagat 26647797  T
Q  343 aagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26647798 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 26647868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Original strand, 26753466 - 26753836
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||  ||||| | ||||||  |       
T  26753466 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 26753565  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||  |||| | | |  |  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  26753566 atgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaa 26753665  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagat 342  Q
    |||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||  ||  ||||||||||    
T  26753666 ccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagat 26753765  T
Q  343 aagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26753766 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 26753836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27530461 - 27530229
Alignment:
Q  46 ttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgcatg 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   | | || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||| | |||||| ||  ||||    
T  27530461 ttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatg 27530362  T
Q  146 aagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccg 245  Q
     |||||||||| ||  | ||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27530361 cagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttcaaag---aaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaaccg 27530265  T
Q  246 tgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctat 281  Q
    |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27530264 tgcacttacttatgcttctggccttccattagctat 27530229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Original strand, 28326710 - 28326867
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||| | ||| ||||| || ||||| |||| |    
T  28326710 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaagga 28326809  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||| |   || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28326810 ttcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaaga 28326867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Original strand, 28504346 - 28504503
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||| | ||| ||||| || ||||| |||| |    
T  28504346 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaagga 28504445  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||| |   || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28504446 ttcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaaga 28504503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 419
Target Start/End: Original strand, 26938264 - 26938424
Alignment:
Q  259 gcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattc 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | || ||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26938264 gcttctggccttccattagctttagaagttgtaggttcccatttgtttggaaagtgtatagcagaatgggaatctacattagctaagtatgaaaggattc 26938363  T
Q  359 caaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    || ||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  26938364 cacacggacatgttcaaaagatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaaca 26938424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 25484078 - 25484282
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| | |   || ||  |    
T  25484078 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 25484177  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||||||   ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484178 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 25484277  T
Q  243 ccgtg 247  Q
    |||||    
T  25484278 ccgtg 25484282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 406
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186776
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||  | ||| ||||| || ||||| |||| |    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 28186725  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgg 406  Q
    ||||  |  || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28186726 ttcccgataaaaagatccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgg 28186776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 25511911 - 25512150
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||   || || | |  |    
T  25511911 gctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatggattacaagt-acac 25512009  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| |||||||||| ||  |  |  | | ||||||   ||||||||| | ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25512010 atgcagtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 25512109  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatag 283  Q
    ||||| |||    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25512110 ccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 25512150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 25580741 - 25580945
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| | |   || ||  |    
T  25580741 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 25580840  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||||||   ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25580841 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagagattttaaa 25580940  T
Q  243 ccgtg 247  Q
    |||||    
T  25580941 ccgtg 25580945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 26056941 - 26057181
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||| |     || ||  |    
T  26056941 gctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacac 26057040  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| |||||||||| ||  |  |  | | ||||||||||| |||||  | |  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26057041 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaa 26057140  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatag 283  Q
    ||||| |||    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26057141 ccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 26057181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 26076911 - 26077151
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||| |     || ||  |    
T  26076911 gctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacac 26077010  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| |||||||||| ||  |  |  | | ||||||||||| |||||  | |  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26077011 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaa 26077110  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatag 283  Q
    ||||| |||    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26077111 ccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 26077151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 26143887 - 26144091
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| | |   || ||  |    
T  26143887 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 26143986  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||||||   ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26143987 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaa 26144086  T
Q  243 ccgtg 247  Q
    |||||    
T  26144087 ccgtg 26144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 28782095 - 28782195
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28782095 tgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 28782194  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  28782195 a 28782195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27337258 - 27336988
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||  ||||| | ||||||  |       
T  27337258 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 27337159  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||  |||| | | |  | |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  27337158 atgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaa 27337059  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
    |||||||||    |||| ||| ||| |||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27337058 ccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27336988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27397998 - 27397728
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||  ||||| | ||||||  |       
T  27397998 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 27397899  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    ||| ||||  |||| | | |  | |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  27397898 atgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaa 27397799  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
    |||||||||    |||| ||| ||| |||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27397798 ccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27397728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Original strand, 26657116 - 26657252
Alignment:
Q  175 cttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccat 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |    | || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||| || ||||| |    
T  26657116 cttgaattgttgagatggatggcttttagag---acaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttccct 26657212  T
Q  275 tagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagag 314  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  26657213 tagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagag 26657252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Original strand, 26763087 - 26763223
Alignment:
Q  175 cttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccat 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |    | || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||| || ||||| |    
T  26763087 cttgaattgttgagatggatggcttttagag---acaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttccct 26763183  T
Q  275 tagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagag 314  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  26763184 tagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagag 26763223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296533
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||  | ||| |||||  | ||||| |||| |    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaagga 28296591  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      || |    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28296590 gacccattagaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaaga 28296533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515540
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||  | ||| |||||  | ||||| |||| |    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaagga 28515482  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      || |    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28515483 gacccattagaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaaga 28515540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 247
Target Start/End: Original strand, 25539691 - 25539766
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 247  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25539691 gctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagattttaaaccgtg 25539766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 407
Target Start/End: Original strand, 28240589 - 28240736
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttgga-aagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaaga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||   |||||| || || ||||||||  ||||| ||||     
T  28240589 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 28240687  T
Q  355 attccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  28240688 attccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttgga 28240736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29842979 - 29842785
Alignment:
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttt-tttggaaagagtat 317  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  29842979 ttcaagctatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggt-ccagctttgtttggaaagaatat 29842881  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||||||  | ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29842880 agaagaatggaaatctacattagataggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatgctttggaggaaga 29842785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 27215471 - 27215711
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||   |||    
T  27215471 gctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttactaacctatcatgggatagaaagattgc 27215570  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    || | |||   ||  | | |   ||| | |||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27215571 atcacgtaagcggtctatatgacgaagaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcatttttaa 27215670  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatag 283  Q
     |||||| |    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27215671 tcgtgcacttacttatgtttctggccttccattagctatag 27215711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 407
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244178
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||   ||||||  | ||| ||||||||  ||||  ||| |    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 28244126  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    |||| |   || | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28244127 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 28244178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 312
Target Start/End: Original strand, 28140701 - 28140823
Alignment:
Q  190 tggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtag 289  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28140701 tggaaggcatttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtag 28140800  T
Q  290 tgggttccaacttttttggaaag 312  Q
    | ||||| | ||| |||||||||    
T  28140801 ttggttctagcttgtttggaaag 28140823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 413
Target Start/End: Original strand, 29827181 - 29827375
Alignment:
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatt 318  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||| ||   || |||||||||| |||     
T  29827181 ttcaagatatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtcccgcgttgtttggaaagaatata 29827280  T
Q  319 tcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      ||||||  | |||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  29827281 gaagaatggaaatctatattagatagatatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaaataagttttgatgctttggaggaaga 29827375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 26656984 - 26657040
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccact 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26656984 gctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccact 26657040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 26762955 - 26763011
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccact 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26762955 gctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccact 26763011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 102
Target Start/End: Original strand, 25539562 - 25539621
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||    
T  25539562 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgt 25539621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 28182361 - 28182407
Alignment:
Q  267 ccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28182361 ccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28182407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27592186 - 27592110
Alignment:
Q  41 atgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||    
T  27592186 atgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttacta 27592110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 296
Target Start/End: Original strand, 2186064 - 2186098
Alignment:
Q  262 tctggccttccattagctatagaagtagtgggttc 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2186064 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttc 2186098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27705400 - 27705343
Alignment:
Q  60 tgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  27705400 tgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttacta 27705343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 405
Target Start/End: Original strand, 25484368 - 25484440
Alignment:
Q  333 tacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25484368 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 25484440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 405
Target Start/End: Original strand, 25512200 - 25512272
Alignment:
Q  333 tacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25512200 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 25512272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 405
Target Start/End: Original strand, 25539852 - 25539924
Alignment:
Q  333 tacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25539852 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 25539924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 405
Target Start/End: Original strand, 26057263 - 26057303
Alignment:
Q  365 aagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26057263 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 26057303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 405
Target Start/End: Original strand, 26077233 - 26077273
Alignment:
Q  365 aagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26077233 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 26077273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 405
Target Start/End: Original strand, 26144209 - 26144249
Alignment:
Q  365 aagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttg 405  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26144209 aagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttg 26144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2727 - 2332
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2727 tgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 2628  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |||  ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  2627 acctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttc 2528  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||  ||    
T  2527 cttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacat 2428  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
        |||||  ||  ||||||||||  |||| | || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  2427 agaggaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaaga 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29273026 - 29272625
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||| |||    
T  29273026 tgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgcta 29272927  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    ||   ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |    
T  29272926 acttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtac 29272827  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29272826 cttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggat 29272727  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 417  Q
       ||||||  ||  ||||||||||   ||| |||  ||||| ||  ||   |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  29272726 agaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaggatccaccagatacttaaagtaagttatgatgctttggaagaagagcaa 29272627  T
Q  418 ca 419  Q
    ||    
T  29272626 ca 29272625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14843810 - 14843757
Alignment:
Q  354 aattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14843810 aattccaaacgaagacatcaaaatgatactacaagtaagctttgatgctttgga 14843757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 413
Target Start/End: Original strand, 35984640 - 35984688
Alignment:
Q  365 aagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  35984640 aagacatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttagaggaaga 35984688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 413
Target Start/End: Original strand, 31906385 - 31906443
Alignment:
Q  355 attccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31906385 attccaaataaagagatccaaaatatactcaaagtaagttttgatgctttggaggaaga 31906443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28126838 - 28126468
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| | |||||| || ||    
T  28126838 gctttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgc 28126739  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 242  Q
    |||  ||| ||||| ||| |     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  28126738 atgcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaa 28126639  T
Q  243 ccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagat 342  Q
    ||| |||||    |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||  ||  ||||||||||    
T  28126638 ccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagat 28126539  T
Q  343 aagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||| |||  ||||||||  || | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  28126538 ggatatgaaaagattccaaataaaaagatccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaaga 28126468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 267514 - 267133
Alignment:
Q  32 aacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||  |||| || |||||||||  ||||| | |    
T  267514 aacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggat 267415  T
Q  132 agaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaa 231  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| |  |    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||| |||  |     
T  267414 agaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaat 267315  T
Q  232 gagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagt 331  Q
    ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||  ||     
T  267314 gagattttaattcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagg 267215  T
Q  332 ctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
     ||||||||||  |||| | |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  267214 gtacattagatgggtatgataagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaaga 267133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 419
Target Start/End: Original strand, 26137036 - 26137283
Alignment:
Q  172 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   |   |||||||||||  | ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  26137036 gctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaagtaaccacaatgactcaagttatgattatattttaaacagtgcagttaaatatgcttctggccttc 26137135  T
Q  272 cattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 371  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   ||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  26137136 cgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatctacattacagaagtatgaaaggattccacatgaagatat 26137235  T
Q  372 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaaca 419  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26137236 ccaaaacatacttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaaca 26137283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28163539 - 28163298
Alignment:
Q  43 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 142  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||    
T  28163539 gctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgc 28163440  T
Q  143 atgaagtagaagggatgtct---acggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagatttt 239  Q
    ||   ||||||||| ||| |   ||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28163439 attcggtagaagggttgtatgggacggaa---gcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgtttt 28163343  T
Q  240 aaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctataga 284  Q
    ||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28163342 aaatcgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttataga 28163298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12847 - 12468
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| | ||     
T  12847 caactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataa 12748  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    ||| || |||||||||  ||||| ||| |     | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||    
T  12747 aaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 12648  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtct 333  Q
      ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||||  ||  |    
T  12647 cgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggt 12548  T
Q  334 acattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||||||||   ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12547 acattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3505
Alignment:
Q  18 tgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttacta 117  Q
    ||||||| || |||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  3900 tgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgcta 3801  T
Q  118 accaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttc 217  Q
    |  | ||||| | |||||| || |||||||||  ||||| ||| |  |  | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |    
T  3800 agaagtcatgggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtac 3701  T
Q  218 cttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtat 317  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  3700 cttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgat 3601  T
Q  318 ttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
       ||||||  ||  ||||||||||   ||| |||  ||||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3600 agaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccaccagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Original strand, 8497 - 8776
Alignment:
Q  34 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgaggtag 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| | ||     
T  8497 caactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataa 8596  T
Q  134 aaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 233  Q
    ||| || |||||||||  ||||| ||| |     | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||    
T  8597 aaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 8696  T
Q  234 gattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
      ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8697 cgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaaga 8776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 413
Target Start/End: Original strand, 60564 - 60958
Alignment:
Q  19 gttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtcgaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaa 118  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||     
T  60564 gttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactag 60663  T
Q  119 ccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtagaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttcc 218  Q
    ||  ||||||| ||||||  |   ||| |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  60664 cctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttcc 60763  T
Q  219 ttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  60764 ttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacata 60863  T
Q  319 tcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
      ||||||  ||  ||||||||||  |||| |||  ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  60864 gaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaaga 60958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17992186 - 17992004
Alignment:
Q  235 attttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtcta 334  Q
    ||||||||||||| |||    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||| ||  | | |     
T  17992186 attttaaaccgtgtagttaaatatgctgctggcctcccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagtgtttagcagattggaaatgtg 17992087  T
Q  335 cattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaa 417  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17992086 cattggataagtatgaaaggataccacctgaagatatccaaaatatactaaaaataagctttgatgctctggatgaagaacaa 17992004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 313
Target Start/End: Original strand, 3280825 - 3280948
Alignment:
Q  190 tggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtag 289  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||  |  || ||||||| |||||    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||     
T  3280825 tggaaggcttttaaaagtaagcaagttaattcaagttatgagcacgttctaaaccgcgcagtaaattatgcttctggccttccattggcattagaagtat 3280924  T
Q  290 tgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  3280925 taggttccaacttgtttggaaaga 3280948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 57244 - 57087
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||   ||||||  | ||| ||||| || ||||| |||| |    
T  57244 tatgcttcaggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 57145  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||| |   || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57144 ttcccattaaaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaaga 57087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 407
Target Start/End: Original strand, 40751 - 40898
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttgga-aagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaaga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||   |||||| || || ||||||||  ||||| ||||     
T  40751 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 40849  T
Q  355 attccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  40850 attccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttgga 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 407
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44340
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||   ||||||  | ||| ||||||||  ||||  ||| |    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 44288  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 407  Q
    |||| |   || | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 44340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Original strand, 1 - 158
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 355  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||||  ||  ||||||||||   ||| |||  |    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 100  T
Q  356 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaaga 413  Q
    |||| ||  || | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  101 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaaga 158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 16692099 - 16692156
Alignment:
Q  256 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttttttggaaaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16692099 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtaggatctaacttgtttggaaaga 16692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University