View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8049_low_1 (Length: 683)

Name: NF8049_low_1
Description: NF8049
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8049_low_1
NF8049_low_1
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (15-667)||(6422818-6423470)
chr8 (69-646)||(6350955-6351532)
chr8 (63-634)||(6361834-6362405)
chr8 (15-663)||(6319991-6320639)
chr8 (63-667)||(7457690-7458294)
chr8 (63-667)||(7470092-7470696)
chr8 (15-663)||(6330453-6331101)
chr8 (69-658)||(6273166-6273755)
chr8 (63-663)||(6287411-6288011)
chr8 (26-648)||(6408803-6409425)
chr8 (26-639)||(6389554-6390164)
chr8 (65-639)||(6368611-6369182)
chr8 (294-403)||(6262182-6262291)
chr8 (324-405)||(6449659-6449740)
chr8 (323-403)||(6456125-6456205)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (294-403)||(42692108-42692217)
chr2 (575-634)||(42692389-42692448)
chr2 (357-421)||(42689613-42689677)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (324-403)||(9606278-9606357)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (357-405)||(46709188-46709236)
chr7 (357-404)||(46708223-46708270)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (345-405)||(36926355-36926415)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 637; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Original strand, 6422818 - 6423470
Alignment:
Q  15 ggcccgtatcggtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422818 ggcccgtatcggtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttg 6422917  T
Q  115 gctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422918 gctgtgcatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgt 6423017  T
Q  215 aagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctc 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6423018 aagggtatcactcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcggctgatcctttctcaggcatgaatctc 6423117  T
Q  315 ctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423118 ctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtgg 6423217  T
Q  415 aagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423218 aagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttg 6423317  T
Q  515 gagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatcc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423318 gagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaactcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatcc 6423417  T
Q  615 gaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaagctgg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423418 gaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaagctgg 6423470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 646
Target Start/End: Original strand, 6350955 - 6351532
Alignment:
Q  69 tcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgct 168  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  6350955 tcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgct 6351054  T
Q  169 catcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtcctt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  6351055 catcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattctttggtgtgattgtcctcaaataagacttctggtagtcctt 6351154  T
Q  269 agaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaa 368  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6351155 agcaagctcatcatactcaggtgatcctttctcaggcatgaatcttctactctttgttggccggttaaggatatatcctccatatggatattgtccgaaa 6351254  T
Q  369 ttaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactct 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6351255 ttaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactcttcacgggtttgcatcttaaaccaccatgtggcattct 6351354  T
Q  469 ttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacata 568  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  6351355 tcaggtcaccatgaccaacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatcagacttgtaatagaaattcacata 6351454  T
Q  569 ttctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcg 646  Q
    ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6351455 ttcaccaacccatgacttaatggcagcccatatttctagtccatcagaagcataaggataatcctctatcagaaggcg 6351532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 634
Target Start/End: Original strand, 6361834 - 6362405
Alignment:
Q  63 ttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6361834 ttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacctcttaaaggactcttttggctgtgaatcagaagtccagagatcaccttcaattctctctccaaggt 6361933  T
Q  163 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||    
T  6361934 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacttctataatggtcaagtcagtaagagtatcattcttgggtgttattgtcctcagataagacttctggta 6362033  T
Q  263 gtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgt 362  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  6362034 gtccttagcaagctcatcatactcaggggatccctgctcaggcatgaatcttctacttttagttggtcggttaacgatatatcctccatacggatattgt 6362133  T
Q  363 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtgg 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6362134 ccaaaattaactgctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagggtggtgcaagcttcaatcaactcctcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtag 6362233  T
Q  463 cactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaatt 562  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  6362234 cattcttcaagtcaccatgaccgacctctacaagttctttccagaatgcttggagttcagaatcttgtgcaatagatgcatctgacttgtagtagaaatt 6362333  T
Q  563 cacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctc 634  Q
     ||||||||  |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  6362334 gacatattcatcaacccatgatttaatagcagcccatatttctagtccatctgaagcataagggtagtcctc 6362405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 663
Target Start/End: Original strand, 6319991 - 6320639
Alignment:
Q  15 ggcccgtatcggtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||  ||    
T  6319991 ggcccgtatcggtttctcaatgactcatcattgttccttttgatgagctttgcctcaatttcagccaacttccttccaaacctcttgaaagcttctaatg 6320090  T
Q  115 gctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgt 214  Q
    |||||| |||| ||||||||   ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||    
T  6320091 gctgtgaatcaaaagtccaagcctcaccttcatttctctgtccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctatgattgtaaggtcagt 6320190  T
Q  215 aagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctc 314  Q
     ||||||||  | || |||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |  || ||||||| |||||||  ||||    
T  6320191 tagggtatcattttttggtgtgattgtcctcagatacgccttctgaaagttcttagaaagctcgtcatactcagcagaccctttcttaggcatgtgtctc 6320290  T
Q  315 ctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtgg 414  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  6320291 cggctcttagttggtcggttaagtatatatcctccatatgggtattgaccaaaattaacagctgcatgatgtgctgaagcaatccatatgaggatagtgc 6320390  T
Q  415 aagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttg 514  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  6320391 aagcttcaatcaactctgtacaagtttgcatcttaaaccaccatgtagcattcttcaaatcaccatgacccacctctacaacttctctccaaaatgcttg 6320490  T
Q  515 gagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatcc 614  Q
     ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6320491 cagttcagaatcttgcgcaacagcaacatctgacttgtagtagaaattcacatattcttcaacccatgacttgatagcatcccatatctctagtccatca 6320590  T
Q  615 gaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaag 663  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  6320591 gcagcataagggtagtcctctatcagaaggcgaattccatgtggggaag 6320639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 63 - 667
Target Start/End: Original strand, 7457690 - 7458294
Alignment:
Q  63 ttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggt 162  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7457690 tttttctcgatttcagccaacttctttccaaacttcttgtaggcctgttttggttgtgaatcagaagtccagagatcaccttcaattctctctccaaggt 7457789  T
Q  163 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggta 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| | ||  |||||||||||  |||| |  ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7457790 attgttcatcagaagcatgccttgacaagacctctaagatggtcaagttagtaagggtatcattctttgcggtgattgtcctcaaataagtcttctggta 7457889  T
Q  263 gtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgt 362  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  7457890 gtccttagcaagctcatcatactcaacggatcctttctcaggcatgaatcttctactttttgttggtcggttaaggatatatcctccatacgcatattgt 7457989  T
Q  363 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtgg 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  7457990 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagaatggtgcaagcttctttcaactccgtacggttttgcatcttaaaccaccatgttg 7458089  T
Q  463 cactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaatt 562  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||   |||   | ||||| || ||||||||||||||    
T  7458090 cattcctaaagtcaccatgacccacctctacaagttctttccaaaatgcttggagttcagaatctttcacaacatctgcatcagacttgtagtagaaatt 7458189  T
Q  563 cacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaa 662  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||| |||    
T  7458190 cacatattcatcaacccatgacttaatagcagcccatatctctagtccatcagaagcataaggatagtcctctatcagaagtcgaacaccatgtggagaa 7458289  T
Q  663 gctgg 667  Q
    |||||    
T  7458290 gctgg 7458294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 63 - 667
Target Start/End: Original strand, 7470092 - 7470696
Alignment:
Q  63 ttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggt 162  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7470092 tttttctcaatttcagacaacttctttccaaacttcttgtaggcctgttttggctgtgaatcagaagtccagagatcaccttcaattctctctccaaggt 7470191  T
Q  163 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggta 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| | ||  |||||||||||  |||| |  ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7470192 attgttcatcagaagcatgccttgacaagacctctaagatggtcaagttagtaagggtatcattctttgcggtgattgtcctcaaataagtcttctggta 7470291  T
Q  263 gtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgt 362  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  7470292 gtccttagcaagctcatcatattcaacggatcctttctcaggcatgaatcttctactttttgttggtcggttaaggatatatcctccatacgcatattgt 7470391  T
Q  363 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtgg 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |    
T  7470392 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagaatggtgcaagcttctttcaactccgtacggtttggcatcttaaaccaccatgttg 7470491  T
Q  463 cactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaatt 562  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||   |||   | ||||| || ||||||||||||||    
T  7470492 cattcctaaagtcaccatgacccacctctacaagttctttccaaaatgcttggagttcagaatctttcacaacatctgcatcagacttgtagtagaaatt 7470591  T
Q  563 cacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaa 662  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||| |||    
T  7470592 cacatattcatcaacccatgacttaatagcagcccatatctctagtccatcagaaacataaggatagtcctctatcagaagtcgaacaccatgtggagaa 7470691  T
Q  663 gctgg 667  Q
    |||||    
T  7470692 gctgg 7470696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 663
Target Start/End: Original strand, 6330453 - 6331101
Alignment:
Q  15 ggcccgtatcggtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||  ||    
T  6330453 ggcccgtatcggtttctcaatgactcatcattgttcctttcaatgagctttacctcaatttcagccaacttccttccaaacctcttgaaagcttctaatg 6330552  T
Q  115 gctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||  || |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||    
T  6330553 gctgtgaatctgaagtccaaacctcgccttcatttctctgtccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgataagacctctaagatcgtaaggtcagt 6330652  T
Q  215 aagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctc 314  Q
     ||||||||  | || |||||||||||| | | |||  |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||  ||||    
T  6330653 gagggtatcattttttggtgtgattgtccttagatacaccttttgaaagttcttagaaagctcggcatactcagcagaccctttctcaggcatgtgtctc 6330752  T
Q  315 ctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtgg 414  Q
    | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  6330753 cggcttttagttggtcggttaagtatatatcctccatatggatattgaccaaaattaacagctgcatgatgtgctgaagcaatccatatgaggatagtgc 6330852  T
Q  415 aagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttg 514  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  6330853 aagcttcaatcaactctgtacaagtttgcatcttaaaccaccatgtagcattcttcaaatcaccatgacccacctctacaacttctctccaaaatgcttg 6330952  T
Q  515 gagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatcc 614  Q
     ||||||| |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6330953 cagttcagaatcttgcgcaacagcagcatctgacgtgtagtagaaactcacatattcttcaacccatgacttgatagcatcccatatctctagtccatca 6331052  T
Q  615 gaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtgaag 663  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  6331053 gcagcataagggtagtcctctatcagaaggcgaattccatgtggggaag 6331101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 69 - 658
Target Start/End: Original strand, 6273166 - 6273755
Alignment:
Q  69 tcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgct 168  Q
    |||||||||||||||||  || | ||  ||||| | ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  6273166 tcaatttcagccaactttgttccgaatctcttgaaagcctctaatggttgtgaatcagaagtccaaagatcaccttcaattctctgtccaaggtattgtt 6273265  T
Q  169 catcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtcctt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| || || || ||    || |||||||||||  ||||| | ||||| || |||| |||    
T  6273266 catcagaagcatgtcttgacaagacctctataatggtcaagtcagttagtgtgtcatcttttggtgtgattgttctcaaaaacgccttttgatagttctt 6273365  T
Q  269 agaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaa 368  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||    
T  6273366 agaaagctcatcatactcgggggatcctttcttaggcattaatcttctgcttttagttggtcggttaagaatgtaaccaccgtacggatattgtccaaaa 6273465  T
Q  369 ttaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactct 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  || |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| | ||| | |    
T  6273466 ttaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagggtagtgcaagagtcaatcaactctgtgcgagtttgcatcttaacccaccatttagcatttt 6273565  T
Q  469 ttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacata 568  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6273566 tcaagtcaccgtgaccaacctctacaagttctttccaaaatgcttggagttcagaatcttgtccaatatttgcatctgacttgtagtagaaattcacata 6273665  T
Q  569 ttctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtgg 658  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  6273666 ttcttcaacccatgacttaataacagcccatatctctaatccatcagcagcataagggtagtcctctatcagaaggcgaaggccgtgtgg 6273755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 63 - 663
Target Start/End: Original strand, 6287411 - 6288011
Alignment:
Q  63 ttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggt 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||    
T  6287411 tttttctcaatttcagccagcttctttccaaacctcttgaaagcctcttttggttgtgaatcagaagtccaattatcaccttcaattctctgtccaaggt 6287510  T
Q  163 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggta 262  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || | ||  || ||| | ||  |||| |||| ||||||  ||||| | ||||| || ||    
T  6287511 attgttcatcagaagcatgtcttgacaagacttctataacagtcaagttagttaggatgtctttcttcggtgggattgttctcaaaaacgccttttgata 6287610  T
Q  263 gtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgt 362  Q
    || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  6287611 gttcttagaaagctcagcatactcagcagatcctttcttaggcattaatcttctgctttttgttggtcggttaagaatgtaaccaccgtacggatattgt 6287710  T
Q  363 ccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtgg 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  6287711 ccaaaattaacagccgcatgaagtgccgaagcaatccatatgaggatggtgcaagcctcaatcaactccttacgggtttgcatcttaaaccaccatttag 6287810  T
Q  463 cactcttt-aagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaat 561  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  6287811 ca-tctttcaagtcaccgtgacctacctctacaagttctttccagaatgcttggagttcagaatcttgtgcaatatttgcatctgacttgtagtagaaat 6287909  T
Q  562 tcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatcaaaaggcgaatgccgtgtggtga 661  Q
     |||||||||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  6287910 acacatattcttcaacccatgacttaattgctgtccatatctctaatccatcagcagcataagggtaatcttttatcagaaggcgaaggccgtgtgggga 6288009  T
Q  662 ag 663  Q
    ||    
T  6288010 ag 6288011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 648
Target Start/End: Original strand, 6408803 - 6409425
Alignment:
Q  26 gtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatca 125  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||     
T  6408803 gtttctcaatgattcatcgttgttcctttcaatgagcttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacttcttgaaggcctctactggctctgaatcg 6408902  T
Q  126 gaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||   ||||||    || ||||  |  | ||    | |||| ||      
T  6408903 taagtccaaagatcaccttcgattctgtgtccaatgtattgctcatcagaaacatgtgatgacaattgctccataacagacatgttcacacgggtttcca 6409002  T
Q  226 tcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagt 325  Q
    ||   |||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||| || ||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  6409003 tcaatggtgtgattgttctcaaatacgccttctcgaagtcctgagcaagctcgtcatactcaggggttcctttctcaggcatgaatcttctacttttagt 6409102  T
Q  326 tggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatc 425  Q
    |||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||| ||| |||    
T  6409103 tggtcggttaacaatgtatccaccgtaaggatattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagccatccaaatgagggtggtgcaagtttcaatc 6409202  T
Q  426 aactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcat 525  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  6409203 aactctgcacgagttttcatcttaaaccaccatgttgcatccttcaagtcaccatggcccacttctacaagttctttccagaatgcttggagctcggaat 6409302  T
Q  526 cttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataagg 625  Q
    | | |||||  || ||||||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  6409303 catctgcaacagctgcatctagcttgtaatagaaatttacatattcttcaacccatgacttaatagcagcccatatctctaatccatcagtagcataagg 6409402  T
Q  626 ataatcctcaatcaaaaggcgaa 648  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6409403 ataatcctctatcaaaaggcgaa 6409425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 639
Target Start/End: Original strand, 6389554 - 6390164
Alignment:
Q  26 gtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatca 125  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||     
T  6389554 gtttctcaatgattcatcgttgttcctttcaatgagcttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacttcttgaaggcctctactggctctgaatcg 6389653  T
Q  126 gaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||    || ||||  |  | ||    || ||||||      
T  6389654 taagtccaaagatcaccttcgattctgtgtccaatgtattgctcatcagaaacatgtgttgacaattgctccataacagatatgttcacaacggtatccg 6389753  T
Q  226 tcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagtccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagt 325  Q
    | || |||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6389754 tttttggtgtgattgttctcaaataagccttctcgtaatccttagcaagctcgtcatactcaggggttcctttctcaggcatgaatcttctgcttttagt 6389853  T
Q  326 tggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatc 425  Q
    |||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||    
T  6389854 tggtcggttaacaatgtatccaccgtacggatattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagggtggtgcaagtttcaatc 6389953  T
Q  426 aactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggcactctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcat 525  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| ||||    |  || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||    
T  6389954 aactctgtacgagtttccaatttaacccac---ttatcagtcttcgagtcaccatgacccacttctacaagttctttccaaaatgctttgagttcctcat 6390050  T
Q  526 cttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattcacatattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataagg 625  Q
    | | |  ||   |   |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  6390051 catctttaacatctttatctgacttgtagtagaaattgacatattcatcaacccatgacttaatagcagcccatatctctagtccatcaacagcatatgg 6390150  T
Q  626 ataatcctcaatca 639  Q
    ||||||||| ||||    
T  6390151 ataatcctctatca 6390164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 639
Target Start/End: Original strand, 6368611 - 6369182
Alignment:
Q  65 ttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgtatcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtat 164  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||    
T  6368611 ttcctcaatttcaatcaatttctttgcaaactttttgtaggcttctactggctttggatcagaagtccaaagatcaccttcagttctttgtccaaggtat 6368710  T
Q  165 tgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtatcgctcttgggtgtgattgtcttcaaatatgccttctggtagt 264  Q
    | ||||| || | ||||| | || || ||    ||| |  | |   ||  |||||| ||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||    
T  6368711 tcctcattaggatcatgcatggataataccagcatagtattcataacttcaagggtttcaacctttggtgtgattgtcgtcaaatatgtcttcatgtagt 6368810  T
Q  265 ccttagaaagctcagcatactcgggtgatcctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtcc 364  Q
    ||||||  |||||   | ||||  ||||||||||| | |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||    
T  6368811 ccttagcgagctccttaaactcatgtgatcctttcactggcatgaatcttatggttttagttggtcggttaaggatgtaccctccatactgatattgtcc 6368910  T
Q  365 aaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttcgatcaactccgcacgagtttgcatcttaaaccaccatgtggca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||| | |||||||| ||  |||| ||||    |  ||    
T  6368911 aaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatatgagggtggtgcaagtttcaatcaactctgtacgagtttccaatttaacccac---ttatca 6369007  T
Q  465 ctctttaagtcaccatgacccacctctacaagttccttccagaatgcttggagttcagcatcttgtgcaatggcagcatctgatttgtagtagaaattca 564  Q
     |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||| | |  ||   |   |||||| | ||| |||||||| |    
T  6369008 gtcttcaagtcaccatgacctacttctacaagttctttccaaaatgctttgagttcctcatcatctttaacatctttatctgactcgtaatagaaattga 6369107  T
Q  565 catattctccaacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctcaatca 639  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  6369108 catattcatcaacccatgacttaatagcagcccatatctctagtccatctgaagcatatggataatcctctatca 6369182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 403
Target Start/End: Original strand, 6262182 - 6262291
Alignment:
Q  294 cctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaag 393  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||   |||||| ||||| |  ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6262182 cctttctcaggcattaatcgcctactaagagttggacggtttaatatgaaacctccatacggatattgtccaaaattaacagctgcatgaagagctgaag 6262281  T
Q  394 caatccatat 403  Q
    || |||||||    
T  6262282 cagtccatat 6262291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 405
Target Start/End: Original strand, 6449659 - 6449740
Alignment:
Q  324 gttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataa 405  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  6449659 gttggacggttcaggatatatcctccgtaaggatattgtccgaaattaacagctgcatgaagagcagaagcagtccatataa 6449740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 6456125 - 6456205
Alignment:
Q  323 agttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatat 403  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6456125 agttggacggttcaggatatatcctccataaggatactgtccaaagttaactgctgcatgaagagctgaagcagtccatat 6456205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 403
Target Start/End: Original strand, 42692108 - 42692217
Alignment:
Q  294 cctttctcaggcatgaatctcctgctcttagttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaag 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||| |  ||  | ||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42692108 cctttctcaggcatgaatctcctactgagagttggacggtttaatattaaacctccgtaggaatactgtccaaaattaacagctgcatgaagagctgaag 42692207  T
Q  394 caatccatat 403  Q
    ||||||||||    
T  42692208 caatccatat 42692217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 634
Target Start/End: Original strand, 42692389 - 42692448
Alignment:
Q  575 aacccatgtcttgatagcagcccatatctctagtccatccgaagcataaggataatcctc 634  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||    
T  42692389 aacccatgtctttattgcagcccatatctctaatccatcatgagcataagggtaatcctc 42692448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 42689677 - 42689613
Alignment:
Q  357 tattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataaggatggtggaagcttc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||    
T  42689677 tattgtccaaaattaacagctgcgtggagggctgaagccgtccatatgatgatagtgcaagcttc 42689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9606357 - 9606278
Alignment:
Q  324 gttggtcggttaaggatgtatcctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatat 403  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  9606357 gttggacggtttagaatataacctccataaggatattgtccaaaattaacagctgcatgaagagcagaagcagtccatat 9606278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 405
Target Start/End: Original strand, 46709188 - 46709236
Alignment:
Q  357 tattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataa 405  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46709188 tattgtccaaagtttacagctgcatgtagagctgaagcaatccatataa 46709236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 404
Target Start/End: Original strand, 46708223 - 46708270
Alignment:
Q  357 tattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatata 404  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46708223 tattgtccaaattttacagctgcatgtagggctgaagcaatccatata 46708270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 36926415 - 36926355
Alignment:
Q  345 cctccatatgggtattgtccaaaattaacagctgcatgaagtgctgaagcaatccatataa 405  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  36926415 cctccatatggatactgtccaaagttgactgcagcatggagagctgaagcaatccatataa 36926355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University