View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8077_high_2 (Length: 360)

Name: NF8077_high_2
Description: NF8077
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8077_high_2
NF8077_high_2
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (1-195)||(32579680-32579870)
chr4 (1-195)||(33816303-33816493)
chr4 (1-180)||(28002788-28002963)
chr4 (2-150)||(50764955-50765099)
chr4 (1-150)||(35020863-35021012)
chr4 (2-204)||(37775893-37776091)
chr4 (2-150)||(30002473-30002617)
chr4 (2-150)||(33341633-33341777)
chr4 (1-195)||(19440435-19440625)
chr4 (1-195)||(25184347-25184537)
chr4 (8-195)||(19089240-19089423)
chr4 (2-193)||(39400243-39400430)
chr4 (1-195)||(3042853-3043043)
chr4 (1-195)||(49376201-49376391)
chr4 (2-150)||(47253975-47254119)
chr4 (2-150)||(55240937-55241081)
chr4 (2-190)||(7703744-7703928)
chr4 (1-150)||(1815535-1815680)
chr4 (1-195)||(36493476-36493666)
chr4 (1-150)||(55477723-55477868)
chr4 (2-150)||(34947927-34948071)
chr4 (2-194)||(32592319-32592507)
chr4 (1-147)||(7152039-7152181)
chr4 (1-195)||(34361278-34361469)
chr4 (8-195)||(37663528-37663711)
chr4 (1-195)||(6864269-6864459)
chr4 (1-195)||(17173524-17173714)
chr4 (10-190)||(26896330-26896507)
chr4 (29-150)||(35025399-35025515)
chr4 (10-195)||(29583987-29584168)
chr4 (1-187)||(32912374-32912557)
chr4 (1-195)||(17167947-17168137)
chr4 (1-195)||(25700843-25701033)
chr4 (2-150)||(4598217-4598361)
chr4 (10-195)||(17272207-17272388)
chr4 (2-142)||(37287963-37288099)
chr4 (9-190)||(46887950-46888127)
chr4 (3-150)||(5047798-5047941)
chr4 (1-150)||(879380-879525)
chr4 (1-195)||(4205218-4205408)
chr4 (2-150)||(23761306-23761450)
chr4 (8-150)||(46883946-46884080)
chr4 (8-150)||(27396857-27396993)
chr4 (1-150)||(50697475-50697621)
chr4 (3-150)||(9139465-9139606)
chr4 (1-82)||(38012088-38012169)
chr4 (90-150)||(38012581-38012641)
chr4 (38-150)||(23431826-23431934)
chr4 (10-146)||(42199972-42200106)
chr4 (1-150)||(4934044-4934179)
chr4 (8-71)||(56050171-56050234)
chr4 (1-44)||(35025530-35025573)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-195)||(48928059-48928249)
chr7 (1-195)||(35353317-35353507)
chr7 (1-195)||(37703260-37703450)
chr7 (3-180)||(46480906-46481079)
chr7 (1-195)||(41764840-41765030)
chr7 (1-195)||(17842346-17842536)
chr7 (1-195)||(37110083-37110273)
chr7 (1-198)||(27283953-27284148)
chr7 (1-150)||(9355633-9355778)
chr7 (1-150)||(32593014-32593158)
chr7 (1-150)||(32820860-32821005)
chr7 (8-195)||(30055743-30055926)
chr7 (1-150)||(18797536-18797681)
chr7 (1-195)||(29173732-29173921)
chr7 (2-195)||(6546729-6546918)
chr7 (2-125)||(5657313-5657432)
chr7 (16-150)||(26587899-26588029)
chr7 (1-190)||(24211950-24212136)
chr7 (10-150)||(8861503-8861639)
chr7 (2-150)||(15612566-15612710)
chr7 (1-190)||(23111401-23111586)
chr7 (2-150)||(25691351-25691495)
chr7 (1-194)||(31578827-31579016)
chr7 (2-125)||(12165953-12166072)
chr7 (11-195)||(12390411-12390591)
chr7 (1-150)||(10359021-10359166)
chr7 (1-150)||(44411347-44411492)
chr7 (28-150)||(22687467-22687585)
chr7 (1-180)||(37704391-37704566)
chr7 (33-195)||(7335034-7335192)
chr7 (1-150)||(31520548-31520693)
chr7 (10-150)||(26980524-26980660)
chr7 (1-150)||(11071415-11071557)
chr7 (8-196)||(32432668-32432852)
chr7 (8-139)||(34361996-34362123)
chr7 (1-195)||(4583128-4583318)
chr7 (1-150)||(37347230-37347375)
chr7 (2-88)||(33688127-33688213)
chr7 (1-180)||(10481814-10481989)
chr7 (1-150)||(43925310-43925449)
chr7 (2-81)||(44598876-44598955)
chr7 (2-150)||(21991846-21991981)
chr7 (1-180)||(15672536-15672714)
chr7 (1-82)||(43686249-43686330)
chr7 (90-195)||(38258873-38258978)
chr7 (1-48)||(48928469-48928516)
chr7 (1-63)||(38258754-38258816)
chr7 (1-82)||(38053670-38053751)
chr7 (35-103)||(27421219-27421283)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-195)||(14758262-14758452)
chr1 (1-150)||(15168326-15168471)
chr1 (1-150)||(16415876-16416021)
chr1 (1-195)||(8222358-8222548)
chr1 (1-172)||(28564562-28564729)
chr1 (1-190)||(2959978-2960163)
chr1 (10-150)||(11742169-11742305)
chr1 (1-195)||(15383163-15383354)
chr1 (1-196)||(30254653-30254844)
chr1 (1-150)||(27227286-27227431)
chr1 (1-195)||(32267264-32267454)
chr1 (1-195)||(37451515-37451705)
chr1 (1-195)||(47682250-47682440)
chr1 (2-150)||(7078864-7079008)
chr1 (1-195)||(46931639-46931830)
chr1 (8-150)||(22170948-22171086)
chr1 (1-150)||(25160862-25161008)
chr1 (8-195)||(34012138-34012321)
chr1 (2-147)||(3535154-3535295)
chr1 (1-150)||(27267001-27267146)
chr1 (1-130)||(51129089-51129214)
chr1 (1-194)||(27563662-27563851)
chr1 (2-150)||(47279420-47279564)
chr1 (2-150)||(48353773-48353917)
chr1 (10-209)||(19899510-19899706)
chr1 (3-195)||(32216287-32216475)
chr1 (1-140)||(40885043-40885178)
chr1 (1-150)||(23999577-23999723)
chr1 (8-150)||(27532783-27532920)
chr1 (1-150)||(4330511-4330656)
chr1 (1-150)||(21289830-21289975)
chr1 (28-150)||(1547528-1547646)
chr1 (8-150)||(28769890-28770028)
chr1 (1-150)||(30326752-30326898)
chr1 (2-193)||(38823445-38823632)
chr1 (1-146)||(1359740-1359881)
chr1 (8-190)||(9902815-9902993)
chr1 (1-194)||(27763067-27763257)
chr1 (3-150)||(15752261-15752404)
chr1 (1-150)||(10922957-10923102)
chr1 (2-142)||(3309384-3309520)
chr1 (2-150)||(39393615-39393759)
chr1 (1-148)||(238316-238459)
chr1 (17-150)||(31621349-31621479)
chr1 (6-150)||(31962851-31962992)
chr1 (1-148)||(33725414-33725546)
chr1 (1-150)||(42721269-42721411)
chr1 (1-150)||(10181808-10181954)
chr1 (1-123)||(37618729-37618847)
chr1 (1-150)||(41926387-41926531)
chr1 (9-110)||(18422889-18422986)
chr1 (2-84)||(38759764-38759846)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-150)||(7234837-7234985)
chr6 (1-195)||(20768316-20768506)
chr6 (1-190)||(3879704-3879889)
chr6 (1-150)||(6090987-6091132)
chr6 (9-150)||(33892817-33892954)
chr6 (1-150)||(33619059-33619212)
chr6 (2-150)||(4318627-4318771)
chr6 (1-195)||(1946068-1946260)
chr6 (1-150)||(5627625-5627771)
chr6 (10-150)||(29182407-29182540)
chr6 (1-150)||(21016923-21017062)
chr6 (28-150)||(7054577-7054696)
chr6 (2-56)||(30353253-30353307)
chr6 (2-150)||(6089138-6089275)
chr6 (2-188)||(8513463-8513638)
chr6 (97-150)||(33724064-33724117)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-195)||(14409092-14409282)
chr5 (1-190)||(2888201-2888386)
chr5 (1-189)||(33908467-33908650)
chr5 (1-150)||(25669810-25669955)
chr5 (1-150)||(35826282-35826427)
chr5 (1-150)||(42342955-42343100)
chr5 (1-195)||(22255416-22255606)
chr5 (1-150)||(24886321-24886466)
chr5 (3-150)||(22981029-22981172)
chr5 (1-180)||(699384-699559)
chr5 (1-150)||(5830126-5830272)
chr5 (8-195)||(35511233-35511416)
chr5 (1-150)||(22973878-22974023)
chr5 (1-195)||(31705363-31705553)
chr5 (2-150)||(7693456-7693600)
chr5 (2-150)||(8741681-8741825)
chr5 (14-195)||(38527988-38528165)
chr5 (8-149)||(35504606-35504743)
chr5 (1-195)||(36866996-36867186)
chr5 (1-195)||(40133619-40133809)
chr5 (1-189)||(8437199-8437383)
chr5 (1-197)||(12910589-12910781)
chr5 (3-150)||(15992336-15992479)
chr5 (10-190)||(22019866-22020042)
chr5 (1-196)||(31786396-31786587)
chr5 (16-150)||(39573060-39573190)
chr5 (1-195)||(17157782-17157972)
chr5 (10-195)||(27330547-27330728)
chr5 (2-150)||(32563375-32563519)
chr5 (1-195)||(27318239-27318428)
chr5 (1-150)||(7208660-7208805)
chr5 (2-196)||(9200459-9200649)
chr5 (9-150)||(19120101-19120238)
chr5 (1-150)||(25889604-25889749)
chr5 (1-190)||(36860658-36860843)
chr5 (8-121)||(13956187-13956296)
chr5 (8-195)||(23115981-23116156)
chr5 (28-205)||(28416292-28416465)
chr5 (2-150)||(35934131-35934275)
chr5 (15-150)||(25500722-25500853)
chr5 (10-150)||(5837798-5837934)
chr5 (11-150)||(43308456-43308591)
chr5 (68-195)||(43254156-43254279)
chr5 (10-122)||(1428983-1429094)
chr5 (2-139)||(15724723-15724856)
chr5 (2-150)||(30969120-30969264)
chr5 (32-195)||(26269074-26269233)
chr5 (29-139)||(8466988-8467094)
chr5 (2-80)||(6824343-6824420)
chr5 (1-88)||(21088620-21088707)
chr5 (91-150)||(14919335-14919394)
chr5 (1-195)||(23954553-23954730)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (1-150)||(22451193-22451338)
chr3 (1-195)||(33378546-33378736)
chr3 (8-195)||(43975653-43975836)
chr3 (1-150)||(52040728-52040873)
chr3 (8-195)||(4015691-4015874)
chr3 (1-150)||(11357187-11357332)
chr3 (1-195)||(26941021-26941211)
chr3 (1-195)||(40552020-40552210)
chr3 (1-195)||(21009562-21009753)
chr3 (8-150)||(22622524-22622662)
chr3 (1-195)||(3362480-3362670)
chr3 (8-190)||(42505841-42506019)
chr3 (1-150)||(46297568-46297713)
chr3 (1-150)||(53228958-53229103)
chr3 (2-150)||(14586486-14586629)
chr3 (2-150)||(33698379-33698523)
chr3 (1-198)||(39282877-39283070)
chr3 (2-150)||(44186323-44186467)
chr3 (9-172)||(40936206-40936365)
chr3 (10-150)||(7327288-7327424)
chr3 (2-150)||(29099572-29099716)
chr3 (2-150)||(44891723-44891867)
chr3 (10-190)||(47481756-47481933)
chr3 (6-150)||(27480164-27480308)
chr3 (8-195)||(37157940-37158123)
chr3 (2-123)||(32373696-32373813)
chr3 (10-150)||(1089928-1090063)
chr3 (8-195)||(24707879-24708059)
chr3 (8-195)||(37203300-37203483)
chr3 (2-150)||(2008158-2008309)
chr3 (1-195)||(48355166-48355356)
chr3 (10-190)||(54506041-54506218)
chr3 (8-150)||(50475043-50475188)
chr3 (2-150)||(29164035-29164172)
chr3 (8-149)||(36012371-36012508)
chr3 (1-180)||(22445841-22446016)
chr3 (1-150)||(4761454-4761599)
chr3 (2-195)||(21193833-21194022)
chr3 (2-142)||(25579965-25580101)
chr3 (8-130)||(34133167-34133285)
chr3 (1-111)||(54828546-54828652)
chr3 (1-125)||(46994492-46994612)
chr3 (1-125)||(51212602-51212722)
chr3 (8-150)||(3655005-3655146)
chr3 (261-329)||(13935977-13936045)
chr3 (10-82)||(43348491-43348563)
chr3 (2-88)||(45174732-45174818)
chr3 (90-190)||(20373029-20373129)
chr3 (1-189)||(11356925-11357101)
chr3 (24-88)||(11835497-11835561)
chr3 (1-150)||(24488768-24488913)
chr3 (10-130)||(38591932-38592048)
chr3 (10-88)||(53811598-53811676)
chr3 (1-60)||(20373136-20373195)
chr3 (2-66)||(11467050-11467114)
chr3 (110-172)||(35844577-35844639)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-150)||(41465735-41465880)
chr2 (1-195)||(43648024-43648214)
chr2 (8-150)||(5881770-5881908)
chr2 (8-195)||(2325157-2325340)
chr2 (2-150)||(33660201-33660345)
chr2 (1-195)||(35959130-35959316)
chr2 (8-150)||(18494105-18494243)
chr2 (1-195)||(4167156-4167346)
chr2 (9-195)||(41961082-41961264)
chr2 (2-150)||(7006762-7006906)
chr2 (1-189)||(11366165-11366350)
chr2 (8-150)||(26357818-26357956)
chr2 (1-150)||(33550807-33550956)
chr2 (1-150)||(19500739-19500884)
chr2 (1-190)||(3177173-3177358)
chr2 (2-150)||(33709056-33709200)
chr2 (1-150)||(44913898-44914046)
chr2 (10-150)||(4763874-4764010)
chr2 (2-130)||(13711694-13711818)
chr2 (3-130)||(27349792-27349915)
chr2 (1-150)||(39167193-39167338)
chr2 (38-195)||(19424421-19424574)
chr2 (2-150)||(31570558-31570702)
chr2 (2-150)||(43770672-43770816)
chr2 (1-150)||(19289147-19289292)
chr2 (2-106)||(19314079-19314182)
chr2 (3-172)||(37905946-37906112)
chr2 (2-124)||(4263926-4264044)
chr2 (8-150)||(31862093-31862231)
chr2 (1-150)||(29241969-29242107)
chr2 (3-72)||(45327956-45328025)
chr2 (2-123)||(4478600-4478717)
chr2 (2-106)||(44286184-44286284)
chr2 (9-150)||(41051124-41051260)
chr2 (90-150)||(33902333-33902393)
chr2 (48-150)||(41463414-41463512)
chr2 (109-195)||(45328028-45328113)
chr2 (2-72)||(36642223-36642293)
chr2 (52-125)||(18257387-18257456)
chr2 (2-41)||(41463779-41463818)
chr2 (100-145)||(17053960-17054005)
chr2 (100-145)||(17071601-17071646)
chr2 (8-61)||(17071646-17071699)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-195)||(33906445-33906633)
chr8 (1-195)||(1149399-1149589)
chr8 (8-195)||(16446642-16446825)
chr8 (8-195)||(35859174-35859357)
chr8 (1-195)||(43643362-43643552)
chr8 (2-150)||(34951869-34952013)
chr8 (2-150)||(38644212-38644356)
chr8 (3-150)||(27082650-27082793)
chr8 (1-195)||(4132453-4132643)
chr8 (1-150)||(7890769-7890914)
chr8 (1-150)||(12587815-12587960)
chr8 (1-150)||(16223096-16223241)
chr8 (2-150)||(466066-466210)
chr8 (1-195)||(8803583-8803774)
chr8 (16-150)||(24823206-24823336)
chr8 (8-195)||(34895202-34895385)
chr8 (1-194)||(1953756-1953945)
chr8 (2-150)||(11727258-11727402)
chr8 (10-190)||(18259321-18259497)
chr8 (8-150)||(5299758-5299896)
chr8 (1-150)||(23854243-23854388)
chr8 (1-195)||(37970286-37970476)
chr8 (1-125)||(1149757-1149877)
chr8 (8-150)||(35459523-35459661)
chr8 (1-147)||(40862652-40862795)
chr8 (1-195)||(1205160-1205350)
chr8 (10-195)||(30654350-30654531)
chr8 (2-150)||(39098931-39099075)
chr8 (2-150)||(44869731-44869875)
chr8 (1-139)||(12876343-12876477)
chr8 (8-150)||(31933698-31933836)
chr8 (28-195)||(33198062-33198225)
chr8 (1-139)||(36694789-36694923)
chr8 (1-144)||(6098331-6098475)
chr8 (1-150)||(10555017-10555161)
chr8 (8-130)||(9864388-9864506)
chr8 (62-197)||(41362716-41362847)
chr8 (2-82)||(13307857-13307936)
chr8 (1-88)||(34463707-34463791)
chr8 (90-150)||(43025992-43026052)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (2-150)||(12144-12287)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (8-195)||(8128-8311)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-150)||(408235-408380)
scaffold0002 (8-150)||(93907-94044)
scaffold0002 (1-150)||(368-507)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-148)||(44190-44333)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-148)||(154454-154597)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-195)||(145776-145967)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-84)||(267519-267602)
scaffold0008 (101-150)||(267606-267655)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (158-190)||(11378-11410)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32579680 - 32579870
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  32579680 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 32579775  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  32579776 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtagaaactcc 32579870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33816493 - 33816303
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  33816493 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 33816398  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  33816397 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcatcgtagaagctcc 33816303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28002963 - 28002788
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  28002963 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaattac----tattgatcatt 28002868  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  28002867 aatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 28002788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 50764955 - 50765099
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  50764955 caactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 50765050  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  50765051 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 50765099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35021012 - 35020863
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021012 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 35020913  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35020912 aatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 35020863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 37775893 - 37776091
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  37775893 caactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 37775988  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcctatcaa 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||        ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| || ||    
T  37775989 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccaataaa 37776088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30002617 - 30002473
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  30002617 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 30002522  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  30002521 atcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 30002473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 33341633 - 33341777
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  33341633 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 33341728  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  33341729 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 33341777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19440625 - 19440435
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  19440625 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 19440530  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  19440529 aatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 19440435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25184347 - 25184537
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  25184347 tcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 25184442  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  25184443 aatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctcc 25184537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19089423 - 19089240
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  19089423 tgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 19089328  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  19089327 aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 19089240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 39400243 - 39400430
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||||||    
T  39400243 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactat----tgatcatta 39400338  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaact 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39400339 atcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactggaccgtagaaact 39400430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3042853 - 3043043
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||     ||||||| |||    
T  3042853 tcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaatta----gtattgattatt 3042948  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  3042949 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctcc 3043043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 49376201 - 49376391
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  49376201 tcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagcattactaaatgaattac----tattgatcatt 49376296  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  49376297 aatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 49376391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 47253975 - 47254119
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  47253975 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 47254070  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  47254071 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 47254119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 55241081 - 55240937
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||    
T  55241081 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagataaattac----tattaatcatta 55240986  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  55240985 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 55240937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 7703744 - 7703928
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||||    
T  7703744 caactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tatttatcatta 7703839  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  7703840 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 7703928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1815535 - 1815680
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  1815535 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----aattgatcatt 1815630  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1815631 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 1815680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36493666 - 36493476
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  36493666 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagcattactcgatgaattac----tattgatcatt 36493571  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  36493570 aatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 36493476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 55477868 - 55477723
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||    
T  55477868 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcatt 55477773  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  55477772 aatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 55477723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34948071 - 34947927
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||| |||    
T  34948071 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaatac----tattgatcgtta 34947976  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  34947975 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 34947927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 32592319 - 32592507
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||||    |||||||| |||    
T  32592319 caactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattac----tattgatcgtta 32592414  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactc 194  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  32592415 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttatgactgcaccgtagaaactc 32592507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7152181 - 7152039
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  7152181 tcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattac----tattgatcatt 7152086  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaa 147  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7152085 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaa 7152039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34361469 - 34361278
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  34361469 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 34361374  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  34361373 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 34361278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37663711 - 37663528
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  37663711 tgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 37663616  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  37663615 aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaaagtcaatttcctgactgtaccgtagaagctcc 37663528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 6864269 - 6864459
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  6864269 tcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 6864364  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6864365 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctcc 6864459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17173524 - 17173714
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||| |||||     
T  17173524 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattac----tatttatcatg 17173619  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  17173620 aataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaaactcc 17173714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 26896330 - 26896507
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt-ctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||     
T  26896330 tttgcatgttaaaatt-tcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaacattactagatgaatatac----tattgatcattaatcagt 26896424  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26896425 aatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaa 26896507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025399
Alignment:
Q  29 aacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaa 35025420  T
Q  129 tcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  35025419 tcaaacattaa-atcaaaatta 35025399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29584168 - 29583987
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  29584168 tttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaa 29584073  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  29584072 tgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcc 29583987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32912557 - 32912374
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  32912557 tcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 32912462  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgta 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  32912461 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgta 32912374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17167947 - 17168137
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||| ||||||    
T  17167947 tcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattac----tatttatcatt 17168042  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||       ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||    
T  17168043 aattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagtttctttactgcaccgtagaaactcc 17168137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25701033 - 25700843
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    |||||||||||    
T  25701033 tcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattac----tattgatcatt 25700938  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  |||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25700937 aatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaaactcc 25700843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 4598217 - 4598361
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    |||||||||    
T  4598217 caactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattactat----tgatcatta 4598312  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  4598313 atcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 4598361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 17272207 - 17272388
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||    
T  17272207 tttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcggtaa 17272302  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  17272303 tgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaataagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcc 17272388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 37287963 - 37288099
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    |||||| |||||    
T  37287963 caactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattac----tattgagcatta 37288058  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagat 142  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37288059 atcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagat 37288099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46888127 - 46887950
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  |    
T  46888127 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcacta 46888032  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  46888031 atcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccgtagaa 46887950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5047941 - 5047798
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||     ||||||||| |||    
T  5047941 aactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaatta----ttattgatcagtaa 5047846  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5047845 tcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaatta 5047798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 879525 - 879380
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  879525 tcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattat----tgatcatt 879430  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  879429 aataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 879380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4205218 - 4205408
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||| |||||     
T  4205218 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattac----tatttatcatg 4205313  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  4205314 aataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaagctcc 4205408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 23761306 - 23761450
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  23761306 caactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttattgatcatta 23761401  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  23761402 atcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 23761450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46884080 - 46883946
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||     
T  46884080 tgtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcattaatcagt 46883989  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  46883988 aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaatta 46883946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 27396857 - 27396993
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||  |     
T  27396857 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaat--gt 27396950  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  27396951 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 27396993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 50697475 - 50697621
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgca-tgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcat 99  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  50697475 tcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaattac----tattgatcat 50697570  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  50697571 taattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaatta 50697621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 9139465 - 9139606
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  9139465 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattac----tattgatcattaa 9139560  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||  ||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  9139561 tcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataatta 9139606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 38012088 - 38012169
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38012088 tcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Original strand, 38012581 - 38012641
Alignment:
Q  90 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012581 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 38012641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431934
Alignment:
Q  38 atagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatt 137  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattac----tattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacatt 23431921  T
Q  138 aagatcaaaatta 150  Q
    || || |||||||    
T  23431922 aaaattaaaatta 23431934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 42199972 - 42200106
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    || || |||||||||||     
T  42199972 tttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tactgttcattaatcagt 42200067  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaa 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  42200068 aatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatcaaa 42200106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4934179 - 4934044
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |           ||||||||  ||||| ||||||||||    | |||| ||||||    
T  4934179 tcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatt----tctattaatcatt 4934095  T
Q  101 aatcagcaatcaacaa-tttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4934094 aatcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaatta 4934044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 56050171 - 56050234
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacatt 71  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  56050171 tgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 35025573 - 35025530
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtac 44  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35025573 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48928249 - 48928059
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  48928249 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 48928154  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  48928153 aatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaaagtcaattttctaactgcaccgtagaagctcc 48928059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 35353317 - 35353507
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||    
T  35353317 tcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcac----tattgatcatt 35353412  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  35353413 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctcc 35353507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37703450 - 37703260
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  37703450 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 37703355  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  37703354 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttactgactgcaccatagaagctcc 37703260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46481079 - 46480906
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  46481079 aactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcattaa 46480984  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  46480983 tcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 46480906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41765030 - 41764840
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||     |||||||||||    
T  41765030 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggatgaatta----ttattgatcatt 41764935  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  41764934 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcccgactccaccgtagaaactcc 41764840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17842536 - 17842346
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  17842536 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattac----tattgatcatt 17842441  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  17842440 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctcc 17842346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 37110083 - 37110273
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  37110083 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 37110178  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       ||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  37110179 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaaatcaatttcttgactgcaccgtagaagctcc 37110273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27283953 - 27284148
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  27283953 tcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 27284048  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnnc-aaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcctat 198  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||       | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  27284049 aatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaatcttttcaaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcctat 27284148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9355778 - 9355633
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||||||    
T  9355778 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgc----tattgatcatt 9355683  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  9355682 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 9355633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32593158 - 32593014
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32593158 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattactatg----gatcatt 32593063  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32593062 aatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaatta 32593014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32821005 - 32820860
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||    
T  32821005 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcatt 32820910  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32820909 catcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 32820860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 30055743 - 30055926
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  30055743 tgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 30055838  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  30055839 aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 30055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 18797536 - 18797681
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  18797536 tcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 18797631  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18797632 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 18797681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 29173732 - 29173921
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  29173732 tcaactctgtttgcatgttaaaa-tgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatg 29173826  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  29173827 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcatcgtagaagctcc 29173921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 6546729 - 6546918
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  6546729 caactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 6546824  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  6546825 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 6546918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5657432 - 5657313
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  5657432 caactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 5657337  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    || || |||||| |||||||||||    
T  5657336 atgagtaatcaaaaatttaaaaat 5657313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26588029 - 26587899
Alignment:
Q  16 tgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaaca 115  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  26588029 tgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactat----tgatcattaatcagtaatcaaca 26587934  T
Q  116 atttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26587933 atttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 26587899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 24211950 - 24212136
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  24211950 tcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 24212045  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  24212046 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 24212136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 8861503 - 8861639
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||    
T  8861503 tttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatgcattactagatgaaatac----tattgatcattaatcagtaa 8861598  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  8861599 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaatta 8861639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15612710 - 15612566
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||||||||    
T  15612710 caactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttgttgatcatta 15612615  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  15612614 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 15612566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 23111401 - 23111586
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||    ||||||||||     
T  23111401 tcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattactagaagaattac----tattgatcata 23111496  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||        |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  23111497 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtagaa 23111586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25691495 - 25691351
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  25691495 caactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatta 25691400  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25691399 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 25691351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31579016 - 31578827
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  31579016 tcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 31578921  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactc 194  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  31578920 aatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaaactc 31578827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 12165953 - 12166072
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  12165953 caactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 12166048  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  12166049 atcagtaatcaacaatttaaaaat 12166072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12390591 - 12390411
Alignment:
Q  11 ttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaat 110  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| |||    
T  12390591 ttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattac----tatttatcattaatcagtaat 12390496  T
Q  111 caacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
      ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  12390495 tgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgacttcaccgtagaagctcc 12390411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10359166 - 10359021
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||    |||||||||||    
T  10359166 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactaaatgatttac----tattgatcatt 10359071  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  10359070 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaatta 10359021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44411492 - 44411347
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||| ||||    
T  44411492 tcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta----atattgaccatt 44411397  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  44411396 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataatta 44411347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 22687467 - 22687585
Alignment:
Q  28 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22687467 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattac----tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 22687562  T
Q  128 atcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||  |||||||||| |||||||    
T  22687563 atcatacattaagattaaaatta 22687585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 37704391 - 37704566
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  37704391 tcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattac----tattgatcatt 37704486  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||       ||||||||||||||| |||||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaatttcctgactg 37704566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Original strand, 7335034 - 7335192
Alignment:
Q  33 ataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcga 132  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  7335034 ataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----taatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaa 7335129  T
Q  133 acattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7335130 acattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 7335192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31520693 - 31520548
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  31520693 tcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgatgaattac----tattgatcatt 31520598  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  31520597 aatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataatta 31520548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 26980524 - 26980660
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     | ||||||||||||| | ||    
T  26980524 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaatta----ttgttgatcattaatcggtaa 26980619  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  26980620 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 26980660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11071415 - 11071557
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||| |||||||||| |   ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  11071415 tcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 11071507  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  11071508 aatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataatta 11071557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Original strand, 32432668 - 32432852
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||     |||| ||||| |||||      
T  32432668 tgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaatta----ttattaatcatgaatcaat 32432763  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcct 196  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32432764 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcct 32432852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34362123 - 34361996
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||     
T  34362123 tgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattac----ttttgatcattaatcagt 34362028  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 139  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34362027 cattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 34361996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4583128 - 4583318
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    |||| |||||     
T  4583128 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactggatgaattac----tattaatcatg 4583223  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  4583224 aatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctggctgcaccgtagaagctcc 4583318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 37347230 - 37347375
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  37347230 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactcgatgaattac----tattgatcatt 37347325  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37347326 aatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataatta 37347375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 33688213 - 33688127
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33688213 caactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctat 33688127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 10481814 - 10481989
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  10481814 tcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactat----tgatcgtt 10481909  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  10481910 aatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactg 10481989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 43925310 - 43925449
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||     
T  43925310 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----taatcatg 43925399  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  43925400 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 43925449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 44598876 - 44598955
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaa 81  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44598876 caactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaa 44598955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 21991846 - 21991981
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||     |||||||||||    ||||||||        
T  21991846 caactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca-----agatgaattac----tattgatc---- 21991932  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21991933 atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 21991981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15672714 - 15672536
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaata---gtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatc 97  Q
    |||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||    
T  15672714 tcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatc 15672619  T
Q  98 attaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  15672618 atgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 15672536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 43686249 - 43686330
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat 82  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43686249 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 38258873 - 38258978
Alignment:
Q  90 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  38258873 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcaccgtaga 38258972  T
Q  190 aactcc 195  Q
    | ||||    
T  38258973 agctcc 38258978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 48928516 - 48928469
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgt 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48928516 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 48928469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 38258754 - 38258816
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 63  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38258754 tcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 38053670 - 38053751
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat 82  Q
    |||||| | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  38053670 tcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  35 aaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||    |||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaata----atattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 14758262 - 14758452
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  14758262 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 14758357  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  14758358 aatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcgtgactgcaccgtagaagctcc 14758452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15168326 - 15168471
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  15168326 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattac----tattgatcatt 15168421  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15168422 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaatta 15168471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16415876 - 16416021
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  16415876 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattac----tattgatcatt 16415971  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16415972 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 16416021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 8222358 - 8222548
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||    
T  8222358 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-----tatattgatcatt 8222452  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  8222453 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtagaagctcc 8222548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28564729 - 28564562
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  28564729 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 28564634  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaattt 172  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       |||||||||||||||    
T  28564633 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 28564562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 2959978 - 2960163
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  2959978 tcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 2960073  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  2960074 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaa 2960163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11742305 - 11742169
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  11742305 tttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaa 11742210  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  11742209 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 11742169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15383163 - 15383354
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  15383163 tcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgattatt 15383258  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  15383259 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgaaccgtagaagctcc 15383354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30254653 - 30254844
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  30254653 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgattatt 30254748  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcct 196  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30254749 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactcct 30254844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27227431 - 27227286
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  27227431 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 27227336  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  27227335 aatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaatta 27227286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32267264 - 32267454
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||    
T  32267264 tcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgaacatt 32267359  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  32267360 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 32267454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 37451515 - 37451705
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  37451515 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 37451610  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       |||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||    
T  37451611 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttcactgcaccgtagaatctcc 37451705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47682440 - 47682250
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  47682440 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactaaatgaattac----tattgatcatt 47682345  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||       ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  47682344 aatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttactgactgcaccatagaagctcc 47682250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7079008 - 7078864
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  7079008 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatta 7078913  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  7078912 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 7078864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 46931639 - 46931830
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  46931639 tcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat--atat-tattgatcatt 46931735  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||    
T  46931736 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccttactgcaccgtagaagctcc 46931830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 22170948 - 22171086
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||     
T  22170948 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaacattattagataaattac----tattgatcattaattagt 22171043  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22171044 aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaatta 22171086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 25160862 - 25161008
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  25160862 tcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattac----tattgatcatt 25160957  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25160958 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaatta 25161008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34012321 - 34012138
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||     
T  34012321 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattac----tattgatcattaatcagt 34012226  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  34012225 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 34012138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 3535154 - 3535295
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  3535154 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 3535249  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaa 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  3535250 atcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaa 3535295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27267146 - 27267001
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  27267146 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgataatt 27267051  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27267050 aatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaatta 27267001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 51129089 - 51129214
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  51129089 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 51129184  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51129185 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 51129214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27563851 - 27563662
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  27563851 tcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatta----atattgatcatt 27563756  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27563755 aatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaaatcagtttcctgactgcaccatagaaactc 27563662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 47279420 - 47279564
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||    
T  47279420 caactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagatgaattac----tattgatcatta 47279515  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  47279516 attagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 47279564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 48353773 - 48353917
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  48353773 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaatta----ttattgatcatta 48353868  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  48353869 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 48353917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19899706 - 19899510
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |    
T  19899706 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcattaatcagta 19899611  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcctatcaaaataatc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||| || |||| ||||    
T  19899610 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttcctaactgcactgtagaagctcccataaaaaaaatc 19899511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 32216287 - 32216475
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||    
T  32216287 aactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactat----tgatcattaa 32216382  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  32216383 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctcc 32216475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40885043 - 40885178
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  40885043 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 40885138  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaag 140  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40885139 aattagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaag 40885178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 23999577 - 23999723
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  23999577 tcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 23999672  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  23999673 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 23999723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27532920 - 27532783
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  27532920 tgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 27532825  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  27532824 aatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 27532783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 4330511 - 4330656
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  4330511 tcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattac----aattgatcatt 4330606  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4330607 aatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 4330656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21289830 - 21289975
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  21289830 tcaactctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattat----tgatcatt 21289925  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21289926 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 21289975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 1547528 - 1547646
Alignment:
Q  28 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1547528 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----cattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 1547623  T
Q  128 atcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  1547624 atcaaacattaagattaaaatta 1547646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 28769890 - 28770028
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| |      
T  28769890 tgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagatgaattac----tattgatcattaattaat 28769985  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  28769986 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 28770028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30326898 - 30326752
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  30326898 tcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatc 30326803  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  30326802 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaatta 30326752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 38823445 - 38823632
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  38823445 caactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 38823540  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaact 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||        |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  38823541 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaact 38823632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1359881 - 1359740
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||     |||||||    
T  1359881 tcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcattactggatgaattactatc----gatcatt 1359786  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaa 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1359785 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 1359740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9902993 - 9902815
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  9902993 tgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 9902898  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||       |||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  9902897 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaaattcttgactgcaccgtagaa 9902815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27763257 - 27763067
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||    ||||||||||    
T  27763257 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatac----tattgatcat 27763162  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactc 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27763161 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaatgtcaatttcctgactgtaccgtagaaactc 27763067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 15752261 - 15752404
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15752261 aactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattac----tattgatcattaa 15752356  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15752357 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaatta 15752404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 10922957 - 10923102
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||    || |||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  10922957 tcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcatt 10923052  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10923053 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 10923102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 3309384 - 3309520
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  3309384 caactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 3309479  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagat 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  3309480 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagat 3309520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 39393615 - 39393759
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  39393615 caactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatta 39393710  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||    
T  39393711 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaatta 39393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 238459 - 238316
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||     
T  238459 tcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcatg 238364  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaat 148  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  238363 aatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaat 238316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31621479 - 31621349
Alignment:
Q  17 gttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaa 116  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31621479 gttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattagtagatgaactac----tattgatcattaatcatcaatcaacaa 31621384  T
Q  117 ttt-aaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31621383 tttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaatta 31621349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 31962851 - 31962992
Alignment:
Q  6 tatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatca 105  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||    |||||||||||||||     
T  31962851 tatgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactac----tattgatcattaatcg 31962946  T
Q  106 gcaatcaacaa-tttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31962947 gtaatcaacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 31962992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33725546 - 33725414
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||                |||||||||||    
T  33725546 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaacattac----------------tattgatcatt 33725463  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatt-taaaaataaatcgaacattaagatcaaaat 148  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33725462 aatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaat 33725414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 42721269 - 42721411
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||    |||||||||||    
T  42721269 tcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaattac----tattgatcatt 42721361  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  42721362 aatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataatta 42721411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10181954 - 10181808
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcat 99  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    ||| |||    
T  10181954 tcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgaacat 10181859  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  10181858 taatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataatta 10181808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37618847 - 37618729
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     |||||| ||||    
T  37618847 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta----gtattgaccatt 37618752  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaa 123  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  37618751 aatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 41926387 - 41926531
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  41926387 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattac----tattgatcatt 41926481  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| |  ||||||  |||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  41926482 aattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataatta 41926531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 18422889 - 18422986
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||    
T  18422889 gtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagatgaattac----tattgatcattaatcaaca 18422984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Original strand, 38759764 - 38759846
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaatta 84  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38759764 caactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7234985 - 7234837
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  7234985 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 7234890  T
Q  101 aat---cagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7234889 aatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 7234837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 20768316 - 20768506
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  20768316 tcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 20768411  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  20768412 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 20768506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3879889 - 3879704
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  3879889 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatg 3879794  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3879793 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaa 3879704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6091132 - 6090987
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  6091132 tcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 6091037  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6091036 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 6090987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33892954 - 33892817
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||  |    
T  33892954 gtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattac----tattgatcattaatcaata 33892859  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  33892858 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaatta 33892817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 33619059 - 33619212
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaa-----aaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattga 95  Q
    |||||||||||||||||||||     | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||    
T  33619059 tcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattac----tattga 33619154  T
Q  96 tcatta---atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33619155 tcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaatta 33619212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4318771 - 4318627
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  4318771 caactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 4318676  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4318675 atcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatta 4318627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1946068 - 1946260
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||    ||||||||||    
T  1946068 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaagcattattagatgaatatac----tattgatcat 1946163  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatt-annnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1946164 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 1946260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 5627625 - 5627771
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    ||||||||||    
T  5627625 tcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaggtgaatatac----tattgatcat 5627720  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  5627721 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaatta 5627771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 29182407 - 29182540
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||       ||||||||||||| |||    
T  29182407 tttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattac-------tgatcattaatcaacaa 29182499  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||    
T  29182500 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaatta 29182540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21017062 - 21016923
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||     
T  21017062 tcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcatg 21016973  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||    
T  21016972 aatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaatta 21016923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054577
Alignment:
Q  28 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaata 126  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatac----tattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatg 7054601  T
Q  127 aatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  7054600 aatcaaacattaaaatcaaaatta 7054577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 30353307 - 30353253
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 56  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30353307 caactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaa 30353253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 6089138 - 6089275
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||     
T  6089138 caactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatatgaattac----tattgatcatt- 6089232  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
          |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  6089233 ------aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 6089275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 8513463 - 8513638
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||     
T  8513463 caactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt- 8513557  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtag 188  Q
          |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       ||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  8513558 ------aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtag 8513638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724064
Alignment:
Q  97 cattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 33724064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14409282 - 14409092
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  14409282 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattac----tattgatcatt 14409187  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  14409186 attcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 14409092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2888386 - 2888201
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  2888386 tcaaatatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 2888291  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2888290 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 2888201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 33908467 - 33908650
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    |||||||||||    
T  33908467 tcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat-aattac----tattgatcatt 33908561  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  33908562 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtaga 33908650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 25669810 - 25669955
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  25669810 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 25669905  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  25669906 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 25669955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35826427 - 35826282
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  35826427 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 35826332  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35826331 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 35826282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 42342955 - 42343100
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  42342955 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----cattgatcatt 42343050  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  42343051 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 42343100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22255416 - 22255606
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  22255416 tcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattac----tattgatcatt 22255511  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22255512 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcctgactgtaccgtagaagctcc 22255606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 24886321 - 24886466
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  24886321 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 24886416  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24886417 aatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 24886466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 22981029 - 22981172
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  22981029 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagatgaatta----ttattgatcattaa 22981124  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22981125 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 22981172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 699384 - 699559
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  699384 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgattatt 699479  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  699480 aatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactg 699559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 5830126 - 5830272
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  5830126 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 5830221  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5830222 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaatta 5830272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35511416 - 35511233
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||     
T  35511416 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattac----tattgatcattaatcagt 35511321  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  35511320 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 35511233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22974023 - 22973878
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  22974023 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 22973928  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  22973927 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 22973878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31705553 - 31705363
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  31705553 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 31705458  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  31705457 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaatctcc 31705363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 7693456 - 7693600
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||    
T  7693456 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgttcatta 7693551  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  7693552 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 7693600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8741825 - 8741681
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||    ||||||||||||    
T  8741825 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaaatac----tattgatcatta 8741730  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8741729 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 8741681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38528165 - 38527988
Alignment:
Q  14 catgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaa 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||    
T  38528165 catgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaatcaa 38528070  T
Q  114 caatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  38528069 caatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 38527988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 35504606 - 35504743
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||     
T  35504606 tgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattac----tattgattattaatcagt 35504701  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatt 149  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35504702 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatt 35504743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 36866996 - 36867186
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||||     
T  36866996 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactggatgaattac----tattaatcatg 36867091  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  36867092 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctcc 36867186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 40133619 - 40133809
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    |||| |||||     
T  40133619 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattac----tattaatcatg 40133714  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  40133715 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctcc 40133809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 8437199 - 8437383
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  8437199 tcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 8437294  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  8437295 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcatcgtaga 8437383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 12910589 - 12910781
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||    
T  12910589 tcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgaacatt 12910684  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactccta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  12910685 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccta 12910781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15992479 - 15992336
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15992479 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaa 15992384  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15992383 tcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 15992336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 22019866 - 22020042
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  22019866 tttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaa 22019961  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22019962 tcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 22020042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31786587 - 31786396
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||    
T  31786587 tcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgttcatt 31786492  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcct 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| |||| || ||| ||||| |||||    
T  31786491 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccatagaatctcct 31786396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Original strand, 39573060 - 39573190
Alignment:
Q  16 tgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaaca 115  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39573060 tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaatcaaca 39573155  T
Q  116 atttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  39573156 atttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 39573190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17157972 - 17157782
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||    
T  17157972 tcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttattgatcatt 17157877  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||        |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  17157876 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgtaccgtagaagctcc 17157782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 27330547 - 27330728
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  27330547 tttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaa 27330642  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  27330643 tgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctcc 27330728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 32563375 - 32563519
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||     ||||||||||||    
T  32563375 caactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaatta----ttattgatcatta 32563470  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  32563471 atcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 32563519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27318428 - 27318239
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  27318428 tcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtaca--taagtttaagatgttgcaaacattactatatgaattac----tattgatcatt 27318335  T
Q  101 aatcagcaatcaacaa-tttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  27318334 aatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaaactcc 27318239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7208805 - 7208660
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||     |||||||||||    
T  7208805 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaatta----ttattgatcatt 7208710  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  7208709 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaatta 7208660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 9200459 - 9200649
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  9200459 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 9200554  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcct 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| || |||||||       ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||| |||||    
T  9200555 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctcct 9200649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 19120101 - 19120238
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||      
T  19120101 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtg 19120196  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  19120197 atcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 19120238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 25889604 - 25889749
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  25889604 tcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 25889699  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  25889700 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaatta 25889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36860658 - 36860843
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||| |||||     
T  36860658 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattac----tattaatcatg 36860753  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||        |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36860754 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 36860843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13956296 - 13956187
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  13956296 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 13956201  T
Q  108 aatcaacaatttaa 121  Q
    ||||||||||||||    
T  13956200 aatcaacaatttaa 13956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23116156 - 23115981
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||         |||||    ||||||||||||||     
T  23116156 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactg--------actat----tgatcattaatcagt 23116069  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  23116068 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcattttcctgacttcaccgtagaaactcc 23115981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28416465 - 28416292
Alignment:
Q  28 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  28416465 caacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactat----tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaaga 28416370  T
Q  128 atcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcctatcaaaata 205  Q
    ||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  28416369 atcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagcttcatgactgcaccgtagaagctcccttcaaaata 28416292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 35934131 - 35934275
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||     ||||||||||||    
T  35934131 caactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagttgaatta----ttattgatcatta 35934226  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||    
T  35934227 atcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaatta 35934275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25500853 - 25500722
Alignment:
Q  15 atgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaac 114  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    | ||||||||||||||| ||| |||    
T  25500853 atgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatac----tgttgatcattaatcagtaattaac 25500758  T
Q  115 aatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||| |||||||    
T  25500757 aatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaatta 25500722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 5837798 - 5837934
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||  ||    
T  5837798 tttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tgttgatcattaatcaataa 5837893  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||    
T  5837894 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaatta 5837934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43308591 - 43308456
Alignment:
Q  11 ttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaat 110  Q
    |||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||    
T  43308591 ttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagaaat 43308496  T
Q  111 caacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||  |||| || | ||| ||||||||||    
T  43308495 caacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaatta 43308456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Original strand, 43254156 - 43254279
Alignment:
Q  68 cattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtc 167  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  43254156 cattactagatgaattactat----tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtc 43254251  T
Q  168 aatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  43254252 aatttcctgactgcaccatagaagctcc 43254279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1429094 - 1428983
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  1429094 tttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaa 1428999  T
Q  110 ---tcaacaatttaaa 122  Q
       |||||||||||||    
T  1428998 tattcaacaatttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 15724723 - 15724856
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||    |||| |||||||    
T  15724723 caactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagcattactagatgaattac----tattaatcatta 15724818  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 139  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15724819 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 15724856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30969264 - 30969120
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||    |||| |||||||    
T  30969264 caactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatgagttac----tattaatcatta 30969169  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  30969168 atcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 30969120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269233
Alignment:
Q  32 gataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactac----tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaacca 26269169  T
Q  132 aacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | ||||||||| |||||||       || |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  26269170 atcattaagattaaaattaactttttcataaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaactcc 26269233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Original strand, 8466988 - 8467094
Alignment:
Q  29 aacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaa 128  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||    
T  8466988 aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaa 8467083  T
Q  129 tcgaacattaa 139  Q
    || ||||||||    
T  8467084 tcaaacattaa 8467094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6824420 - 6824343
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatga 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6824420 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatga 6824343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21088707 - 21088620
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |  ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21088707 tcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactat 21088620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14919394 - 14919335
Alignment:
Q  91 attgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14919394 attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 14919335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23954730 - 23954553
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||     ||||||||| |||||||||||||    ||||||||    
T  23954730 tcaactctgtttgcatgttaaaa-tgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactat----tgatcatt 23954641  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||       ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23954640 aatca-------acaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctcc 23954553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22451193 - 22451338
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||    
T  22451193 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttattgatcatt 22451288  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22451289 aatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaatta 22451338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33378736 - 33378546
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  33378736 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 33378641  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  33378640 aatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 33378546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43975836 - 43975653
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  43975836 tgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaatta----atattgatcattaatcagc 43975741  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43975740 aatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccgtagaaactcc 43975653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 52040873 - 52040728
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||    
T  52040873 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatga----ttattgatcatt 52040778  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  52040777 aatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 52040728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 4015691 - 4015874
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  4015691 tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 4015786  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  4015787 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 4015874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11357332 - 11357187
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  11357332 tcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 11357237  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11357236 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 11357187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26941211 - 26941021
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  26941211 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 26941116  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26941115 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctcc 26941021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40552210 - 40552020
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  40552210 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgattatt 40552115  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  40552114 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccagactgcaccgtagaagctcc 40552020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21009753 - 21009562
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  21009753 tcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 21009658  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21009657 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactcc 21009562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22622662 - 22622524
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  22622662 tgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 22622567  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22622566 aatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 22622524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3362480 - 3362670
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  3362480 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattac----tattgatcatt 3362575  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  3362576 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcc 3362670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42506019 - 42505841
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  42506019 tgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 42505924  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42505923 aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaa 42505841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46297713 - 46297568
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  46297713 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 46297618  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46297617 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 46297568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 53229103 - 53228958
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||    
T  53229103 tcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatta----gtattgatcatt 53229008  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  53229007 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 53228958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14586629 - 14586486
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||     |||||||||    
T  14586629 caactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactac----tgatcatta 14586535  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14586534 atcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 14586486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 33698379 - 33698523
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  33698379 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaatta----atattgatcatta 33698474  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||    
T  33698475 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaatta 33698523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39282877 - 39283070
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||    
T  39282877 tcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcatt 39282972  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcctat 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  39282973 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcctat 39283070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44186467 - 44186323
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||    
T  44186467 caactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattac----tattgatcatta 44186372  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44186371 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 44186323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 40936206 - 40936365
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| | |    
T  40936206 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattac----tattgatcattaatcggta 40936301  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaattt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||       |||||||||||||||    
T  40936302 atcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 40936365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7327424 - 7327288
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||    
T  7327424 tttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcattaatcagtaa 7327329  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  7327328 tcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaatta 7327288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 29099572 - 29099716
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  29099572 caactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----cattgatcatta 29099667  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  29099668 atcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaatta 29099716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 44891723 - 44891867
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||    
T  44891723 caactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tgttgatcatta 44891818  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  44891819 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaatta 44891867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 47481756 - 47481933
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |    
T  47481756 tttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcattaatcagta 47481851  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  47481852 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgtaccgtagaa 47481933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27480308 - 27480164
Alignment:
Q  6 tatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg----caaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||     |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||    
T  27480308 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactat----tgattatta 27480213  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27480212 atcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatta 27480164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 37157940 - 37158123
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||     
T  37157940 tgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaagcattactagatgaattac----cattgatcattaatgagt 37158035  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  37158036 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 37158123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 32373696 - 32373813
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  32373696 caactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt----tctattgatcatta 32373791  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  32373792 atcagtaatcaacaatttaaaa 32373813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 1089928 - 1090063
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||    
T  1089928 tttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcattaatcaataa 1090022  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1090023 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 1090063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24708059 - 24707879
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    |||| ||||||||||||     
T  24708059 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagataaattac----tattaatcattaatcagt 24707964  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       ||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  24707963 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgactg---cgtagaaactcc 24707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 37203300 - 37203483
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||     
T  37203300 tgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactagatgaattac----cattgatcattaatgagt 37203395  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  37203396 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 37203483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 2008158 - 2008309
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat--at-attgatca 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||  || ||| ||||    
T  2008158 caactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatca 2008257  T
Q  99 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  2008258 gtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 2008309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 48355166 - 48355356
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  48355166 tcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattattat----tgatcatt 48355261  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||    
T  48355262 aatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctaactgcaccatagaagctcc 48355356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 54506041 - 54506218
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |    
T  54506041 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcattaatcagta 54506136  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  54506137 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaa 54506218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 50475043 - 50475188
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat--at-attgatcattaatc 104  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  50475043 tgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcattaatc 50475142  T
Q  105 agcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  50475143 agtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 50475188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 29164035 - 29164172
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||     
T  29164035 caactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaattac----tattgatcatt- 29164129  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29164130 ------aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 29164172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 36012371 - 36012508
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||     
T  36012371 tgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatgaattactat----tgatcattaatcagt 36012466  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  36012467 aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatt 36012508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22446016 - 22445841
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||    ||||||||    
T  22446016 tcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactat----tgatcatt 22445921  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactg 180  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||| |||||||    
T  22445920 aatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctgactg 22445841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4761599 - 4761454
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    |||| ||||||    
T  4761599 tcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacattaccagatgaattac----tattaatcatt 4761504  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  4761503 aatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 4761454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 21193833 - 21194022
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||    ||||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    |||| ||||    
T  21193833 caactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatgaattactat----tgattatta 21193928  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  21193929 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 21194022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 25579965 - 25580101
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  25579965 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 25580060  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagat 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  25580061 atccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagat 25580101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 34133167 - 34133285
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    || | ||||| |||| |     
T  34133167 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tagtaatcatgaatcggt 34133262  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  34133263 aatcaacaatttaaaaatgaatc 34133285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 54828652 - 54828546
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    |||||||||||    
T  54828652 tcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattac----tattgatcatt 54828557  T
Q  101 aatcagcaatc 111  Q
    |||||| ||||    
T  54828556 aatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 46994612 - 46994492
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  46994612 tcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 46994517  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  46994516 aatcagaaatcaacaatttaaaaat 46994492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 51212722 - 51212602
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  51212722 tcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 51212627  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  51212626 aattaaaaatcaacaatttaaaaat 51212602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3655146 - 3655005
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactag--atgaattactatatattgatcattaatca 105  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    ||||||| ||||||||    
T  3655146 tgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatatgaattac----tattgattattaatca 3655051  T
Q  106 gcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  3655050 gtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaatta 3655005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 13935977 - 13936045
Alignment:
Q  261 gaatttaccactttggaactaagtccagcgatcatagttttattgaaaaaacaattgtttaaatacaaa 329  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13935977 gaatttaccactatggaactaagcccagcgatcatggtttgattgaaaaaacaattgtttaaatacaaa 13936045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 43348491 - 43348563
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43348491 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 45174732 - 45174818
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45174732 caactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat 45174818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20373129 - 20373029
Alignment:
Q  90 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  20373129 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccataga 20373030  T
Q  190 a 190  Q
    |    
T  20373029 a 20373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11357101 - 11356925
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||        ||||||||    | ||||||    
T  11357101 tcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcatta--------attactat----tcatcatt 11357014  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  11357013 aattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttgtctgactgcaccgtaga 11356925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11835561 - 11835497
Alignment:
Q  24 atgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11835561 atgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactat 11835497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24488913 - 24488768
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    ||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||    |||| |||||     
T  24488913 tcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattac----tattaatcatg 24488818  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  24488817 aatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaatta 24488768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 38591932 - 38592048
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||| ||||| || |  ||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  38591932 tttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattac----tattgatcattaatcagtaa 38592027  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  38592028 tcaacaatttaaaaatgaatc 38592048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53811676 - 53811598
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  53811676 tttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatgaattactat 53811598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20373195 - 20373136
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 60  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20373195 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatataagtccaagatg 20373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 11467050 - 11467114
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 66  Q
    ||||| |||||||||||| || ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11467050 caactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa 11467114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844639
Alignment:
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaattt 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||       |||||||||||||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattt 35844639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 41465735 - 41465880
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  41465735 tcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactatatgaattac----tattgatcatt 41465830  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41465831 aatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaatta 41465880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43648214 - 43648024
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  43648214 tcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattac----tattgatcatt 43648119  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  43648118 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 43648024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 5881770 - 5881908
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||     
T  5881770 tgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattattcagt 5881865  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5881866 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 5881908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2325340 - 2325157
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||     
T  2325340 tgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgattattaatcagt 2325245  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  2325244 aatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctcc 2325157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33660345 - 33660201
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  33660345 caactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 33660250  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  33660249 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 33660201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 35959130 - 35959316
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  35959130 tcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcatt 35959221  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       |||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||    
T  35959222 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttttgagtgcaccgtagaagctcc 35959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18494243 - 18494105
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |    |||||||||||||||||     
T  18494243 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattgc----tattgatcattaatcagt 18494148  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18494147 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 18494105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4167156 - 4167346
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    |||| |||||     
T  4167156 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattac----tattaatcatg 4167251  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  4167252 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctcc 4167346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 41961082 - 41961264
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  |    
T  41961082 gtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcaata 41961177  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  41961178 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 41961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7006906 - 7006762
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  7006906 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt----tctattgatcatta 7006811  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  7006810 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaatta 7006762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11366350 - 11366165
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||    
T  11366350 tcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac----tattgatcat 11366255  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtaga 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||       ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  11366254 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgactgcaccgtaga 11366165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 26357818 - 26357956
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  26357818 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 26357913  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26357914 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 26357956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33550956 - 33550807
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||  | |||    
T  33550956 tcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattgattatttatt 33550857  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33550856 aaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 33550807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19500884 - 19500739
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  19500884 tcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 19500789  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19500788 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 19500739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3177173 - 3177358
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    |||| |||||     
T  3177173 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagcattactagatgaattac----tatttatcatg 3177268  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||       ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3177269 aataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 3177358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33709200 - 33709056
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  33709200 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 33709105  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  33709104 atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 33709056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44913898 - 44914046
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactag---atgaattactatatattgatc 97  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||   |||||||||    |||| |||    
T  44913898 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagaaaatgaattac----tattaatc 44913993  T
Q  98 attaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44913994 atgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 44914046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 4763874 - 4764010
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  4763874 tttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagttgaattac----tattgatcattaatcagtaa 4763969  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  4763970 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 4764010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 13711694 - 13711818
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||    
T  13711694 caactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagatgaattac----tattgatcatta 13711789  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  13711790 atcagtaatcaacgatttaaaaatgaatc 13711818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27349915 - 27349792
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  27349915 aactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaa 27349820  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27349819 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 27349792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39167338 - 39167193
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||||||||  |||    ||     
T  39167338 tcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaattactattaatt----atg 39167243  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  39167242 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaatta 39167193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19424574 - 19424421
Alignment:
Q  38 atagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatt 137  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  19424574 atagtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcatt 19424479  T
Q  138 aagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  19424478 aagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctcc 19424421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31570702 - 31570558
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    ||||||||||||    
T  31570702 caactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaattac----tattgatcatta 31570607  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| |||| | |||||| || |||||||    
T  31570606 atcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaatta 31570558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43770816 - 43770672
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  43770816 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatt----tctattgatcatta 43770721  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  43770720 attagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 43770672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19289292 - 19289147
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||  | || |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  19289292 tcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactat----tgatcatt 19289197  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19289196 aatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaatta 19289147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Original strand, 19314079 - 19314182
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatg---taagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  19314079 caactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatca 19314174  T
Q  99 ttaatcag 106  Q
    ||||||||    
T  19314175 ttaatcag 19314182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 37905946 - 37906112
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    |||||||||||||    
T  37905946 aactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattac----tattgatcattaa 37906041  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaat-aaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaattt 172  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||       |||||||||||||||    
T  37906042 tcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaattt 37906112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4264044 - 4263926
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||     
T  4264044 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaagcattactagatgaaata----atattgatcattg 4263949  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaa 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4263948 atcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 31862093 - 31862231
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||  ||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||     
T  31862093 tgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattactat----tgatcattaatcagt 31862188  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31862189 aatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 31862231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29242107 - 29241969
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||    ||| ||||    
T  29242107 tcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagatga-------attactagatgaattactat----tgaacatt 29242019  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  29242018 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataatta 29241969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 45327956 - 45328025
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacatta 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45327956 aactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 4478600 - 4478717
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||    
T  4478600 caactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgc----tattgatcatta 4478695  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  4478696 atcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Original strand, 44286184 - 44286284
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||||||    
T  44286184 caactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattgttagatgaattac----tattgatcatta 44286279  T
Q  102 atcag 106  Q
    |||||    
T  44286280 atcag 44286284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41051260 - 41051124
Alignment:
Q  9 gtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagca 108  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||      ||||||||||||||||  |    
T  41051260 gtttgcatgttaaaa-tgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaatt----gttattgatcattaatcaata 41051166  T
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  41051165 atcaacaattcaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 41051124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Original strand, 33902333 - 33902393
Alignment:
Q  90 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33902333 tattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaatta 33902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463414
Alignment:
Q  48 taagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactat----tgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaa 41463417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328113
Alignment:
Q  109 atcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt-ctgactgcaccgtagaagctcc 45328113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 36642223 - 36642293
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacatta 72  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||    
T  36642223 caactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18257456 - 18257387
Alignment:
Q  52 tctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  18257456 tctaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaat 18257387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 41463818 - 41463779
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatag 41  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41463818 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053960
Alignment:
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17053960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17071699 - 17071646
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 61  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17071699 tgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 33906445 - 33906633
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  33906445 tcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 33906540  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||    
T  33906541 aatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcactgtagaagctcc 33906633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1149589 - 1149399
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  1149589 tcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 1149494  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1149493 aatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 1149399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16446825 - 16446642
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  16446825 tgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 16446730  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  16446729 aatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 16446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 35859174 - 35859357
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||     
T  35859174 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaatta----atattgatcattaatcagt 35859269  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35859270 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactcc 35859357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43643552 - 43643362
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  43643552 tcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 43643457  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  43643456 aatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctcc 43643362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34952013 - 34951869
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||    ||||||||||||    
T  34952013 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattac----tattgatcatta 34951918  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  34951917 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 34951869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 38644212 - 38644356
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  38644212 caactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 38644307  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38644308 atcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 38644356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27082793 - 27082650
Alignment:
Q  3 aactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    || | ||||||||    
T  27082793 aactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tacttatcattaa 27082698  T
Q  103 tcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27082697 tcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaatta 27082650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4132643 - 4132453
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  4132643 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 4132548  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||  | |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  4132547 aatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcaccatagaagctcc 4132453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7890914 - 7890769
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  7890914 tcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 7890819  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  7890818 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 7890769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12587815 - 12587960
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  12587815 tcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 12587910  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12587911 aatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 12587960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16223096 - 16223241
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  16223096 tcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 16223191  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  16223192 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 16223241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 466066 - 466210
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  466066 caactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 466161  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  466162 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 466210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8803774 - 8803583
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactatatattgatcat 99  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||    ||||||||||    
T  8803774 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatac----tattgatcat 8803679  T
Q  100 taatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8803678 taatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtaaaaactcc 8803583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24823336 - 24823206
Alignment:
Q  16 tgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaaca 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24823336 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgttcattaatcagtaatcaaca 24823241  T
Q  116 atttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24823240 atttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 24823206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 34895202 - 34895385
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||     
T  34895202 tgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattac----tattgatcattaatcagt 34895297  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  34895298 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaagctcc 34895385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1953945 - 1953756
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  1953945 tcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaagcattattagatgaattac----tattgatcatt 1953850  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactc 194  Q
    |||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1953849 aatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactc 1953756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 11727258 - 11727402
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  11727258 caactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 11727353  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  11727354 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaatta 11727402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 18259321 - 18259497
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||||| |||| || ||    
T  18259321 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatta----ttgttgatcagtaatgagtaa 18259416  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||       |||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  18259417 tcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcatgactgcaccatagaa 18259497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5299896 - 5299758
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||     
T  5299896 tgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattaatcattaatcagt 5299801  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  5299800 aatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaatta 5299758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23854388 - 23854243
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  23854388 tcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcatt 23854293  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23854292 aatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 23854243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37970476 - 37970286
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||    
T  37970476 tcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgt----tgatcatt 37970381  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  37970380 aatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcactttcctgactgcaccatagaagctcc 37970286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1149877 - 1149757
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  1149877 tcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 1149782  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaat 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1149781 aatcagtaatcaacaatttaaaaat 1149757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35459661 - 35459523
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||||| |||||||| || || || |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||     
T  35459661 tgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacattactagatgaattactat----tgatcattaatcaga 35459566  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35459565 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 35459523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 40862652 - 40862795
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||     
T  40862652 tcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat---ttg-tcata 40862747  T
Q  101 aatcagcaatcaacaattt-aaaaataaatcgaacattaagatcaaaa 147  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40862748 aatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaa 40862795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1205160 - 1205350
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||    
T  1205160 tcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattac----tattgatcatt 1205255  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||        |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  1205256 aatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactacaccgtagaagctcc 1205350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30654531 - 30654350
Alignment:
Q  10 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||| ||    
T  30654531 tttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaat--atat-tattgatcattaatcagtaa 30654435  T
Q  110 tcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    | |||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||       ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30654434 ttaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactcc 30654350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39099075 - 39098931
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  39099075 caactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 39098980  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    || |  |||||| |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||    
T  39098979 attaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaatta 39098931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 44869731 - 44869875
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  44869731 caactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 44869826  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  44869827 atcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 44869875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 12876343 - 12876477
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    |||| |||||     
T  12876343 tcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatgaattac----tatttatcatg 12876438  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 139  Q
    ||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  12876439 aataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaa 12876477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31933836 - 31933698
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||     
T  31933836 tgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaatta----ttattgatcattaatcagt 31933741  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31933740 aatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 31933698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 33198062 - 33198225
Alignment:
Q  28 caacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  33198062 caacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattac----tattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 33198157  T
Q  128 atcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    ||| | ||||||||| || ||||       |||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||    
T  33198158 atcaatcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtcaatttcatgattgcaccgtagaagctcc 33198225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36694923 - 36694789
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||| |||||     
T  36694923 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaagcatcactagatgaattac----tatttatcatg 36694828  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 139  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36694827 aataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaa 36694789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6098475 - 6098331
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaata-----gtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattga 95  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||     |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||    
T  6098475 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattga 6098380  T
Q  96 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatca 144  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6098379 tcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatca 6098331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10555161 - 10555017
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  10555161 tcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattac--actattgatcatt 10555064  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |   || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10555063 a---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 10555017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 9864388 - 9864506
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    || | ||||| |||| |     
T  9864388 tgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaataac----tagtaatcatgaatcggt 9864483  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatc 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  9864484 aatcaacaatttaaaaatgaatc 9864506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 197
Target Start/End: Original strand, 41362716 - 41362847
Alignment:
Q  62 tgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaa 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||       ||||    
T  41362716 tgcaaaaattactagatgaattactat----tgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaa 41362811  T
Q  162 aaagtcaatttactgactggaccgtagaaactccta 197  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  41362812 aaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccta 41362847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 13307857 - 13307936
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat 82  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13307857 caactctgtttgcatgttaaaa-tgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaagcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 34463707 - 34463791
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactat 88  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34463707 tcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtc---catgttgcaagcattactaaatgaattactat 34463791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Original strand, 43025992 - 43026052
Alignment:
Q  90 tattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  43025992 tattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaatta 43026052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 12144 - 12287
Alignment:
Q  2 caactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  12144 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatta 12239  T
Q  102 atcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12240 atcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaatta 12287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 8128 - 8311
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||     
T  8128 tgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagt 8223  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  8224 aatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 408380 - 408235
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  408380 tcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcatt 408285  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  408284 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaatta 408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 94044 - 93907
Alignment:
Q  8 tgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcagc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||      
T  94044 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgc----tattgatcattaatcact 93949  T
Q  108 aatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  93948 aatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatta 93907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 368 - 507
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||     
T  368 tcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----taatcatg 457  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  458 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 44190 - 44333
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||    |||||||||||    
T  44190 tcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattac----tattgatcatt 44285  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  44286 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaat 44333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 154597 - 154454
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||    |||||||||||    
T  154597 tcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattac----tattgatcatt 154502  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  154501 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaat 154454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 145967 - 145776
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   || | ||||||||||    
T  145967 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaata--taca-attgatcatt 145871  T
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattannnnnnncaaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaaactcc 195  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  145870 aatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 145776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 267519 - 267602
Alignment:
Q  1 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaatta 84  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  267519 tcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta 267602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 150
Target Start/End: Original strand, 267606 - 267655
Alignment:
Q  101 aatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatta 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  267606 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 267655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11410 - 11378
Alignment:
Q  158 caaaaaagtcaatttactgactggaccgtagaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11410 caaaaaagtcaatttactgactgcaccgtagaa 11378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University