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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF8084_low_10 (Length: 331)
Name: NF8084_low_10
Description: NF8084
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8084_low_10 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 3431851 - 3432155
Alignment:
| Q |
1 |
taattggttcgtaattcgcttcgctacttgatacgagctctagtacacaaccatcaaagtattaggtacgaaggagtacatatagtcgatacactatttt |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
3431851 |
taattggttcgtaattcgcttcgctacttgatacgagttctagtacacaaccctcaaagtattaggtacgaaggagtacatatagtcgatacactatttt |
3431950 |
T |
|
| Q |
101 |
aattcatggtatgatttaatatattcaacgctacatatatatgaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacacagatgaaataatcaa |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3431951 |
aattcatggtatgatttaatatattcaacgctacatat----gaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacacagatgaaataatcaa |
3432046 |
T |
|
| Q |
201 |
tataaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgggcaatataaatacatata |
300 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3432047 |
tataaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgagcaatataaatacatata |
3432146 |
T |
|
| Q |
301 |
ctttacctc |
309 |
Q |
| |
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||||||||| |
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| T |
3432147 |
ctttacctc |
3432155 |
T |
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Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11913643 - 11913357
Alignment:
| Q |
11 |
gtaattcgcttcgctacttgatacgagctctagtacacaaccatcaaagtatta---ggtacgaaggagtacat----atagtcgatacactattttaat |
103 |
Q |
| |
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||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |
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|
| T |
11913643 |
gtaattcgcttcgttccttgatacgagctctattacacaaccctcaaagtattattaggtatgaaggagtacatgcatatagtcgatgcactatttcaaa |
11913544 |
T |
|
| Q |
104 |
tcatggtatgatttaatatattcaacgctacatatatatgaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacacagatgaaataatcaatat |
203 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11913543 |
ttatggtatgatttaatatattaaacggcacct---tatgaatatgtttttaaattatacaaatgtaaagccatatttacac---tgaaataatcaatat |
11913450 |
T |
|
| Q |
204 |
aaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgggcaatataaataca |
296 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11913449 |
aaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacatatatatttactggtcaacacacgagcaatataaataca |
11913357 |
T |
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