View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8091_low_21 (Length: 413)

Name: NF8091_low_21
Description: NF8091
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8091_low_21
NF8091_low_21
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-398)||(2838031-2838429)
chr3 (4-398)||(2855241-2855636)
chr3 (1-398)||(2749304-2749702)
chr3 (8-399)||(2759530-2759922)
chr3 (1-398)||(2807576-2807974)
chr3 (8-397)||(2769385-2769775)
chr3 (8-399)||(2818873-2819265)
chr3 (1-398)||(5413195-5413593)
chr3 (1-397)||(2790629-2791026)
chr3 (1-398)||(2797670-2798068)
chr3 (22-221)||(3201274-3201473)
[»] scaffold0691 (1 HSPs)
scaffold0691 (1-399)||(5582-5981)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2838429 - 2838031
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838429 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 2838330  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2838329 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcc 2838230  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838229 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 2838130  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2838129 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaacgtgagtgaaaat 2838031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2855636 - 2855241
Alignment:
Q  4 aggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaata 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2855636 aggcaatacctgcaacataagaggtatttggtattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaata 2855537  T
Q  104 aaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2855536 aaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcctcc 2855437  T
Q  204 aaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2855436 aaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcta 2855337  T
Q  304 aaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2855336 aaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaacgtgagtgaaaat 2855241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 2749304 - 2749702
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  2749304 gtgaggcaatacctgcaacataagaggtatttgatattctttgatgacgtatggcaagaagattttgcggaccaggttcaatttgccatgccaaataaca 2749403  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749404 ataaaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 2749503  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2749504 tccaaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgtt 2749603  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2749604 caaaagtgcaggcagctacctctagcaattgtagctattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaat 2749702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 399
Target Start/End: Original strand, 2759530 - 2759922
Alignment:
Q  8 aatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaataaagg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2759530 aatacctagaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcctaataacaacaaagg 2759629  T
Q  108 tagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2759630 tagtaggatcataatcaccactagaattatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaac 2759729  T
Q  208 aaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgttcaaaaat 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  2759730 aaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagatatgatcttggagggcgttgtccaccggagcttgaggctgtggcaaaagaaattgtgcaaaagt 2759829  T
Q  308 gcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaatt 399  Q
     |||||| |||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2759830 tcaagcaactacctcttgcaattgtggccgttgctggtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaggtgagtcaaaatt 2759922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 2807576 - 2807974
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2807576 gtgaggcaatacctgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaggttgaatttgctatgcctaacaaca 2807675  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2807676 ataaaggtagtaggatcataatcacaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgac 2807775  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  2807776 tccaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagattcgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaatagatattgtt 2807875  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattgg-tgtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| || || |||||| |||| |||||| |||||    
T  2807876 cgaaaatgcaagcagctacctttggcaattgtagctattggcggtctactttcaacaaaatataaaacaataatggaatgggaaaaggtgagtcaaaat 2807974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 397
Target Start/End: Original strand, 2769385 - 2769775
Alignment:
Q  8 aatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaataaagg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  2769385 aatacctacaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaattttccatgccaaataacaataaacg 2769484  T
Q  108 tagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||||||||||| |||    
T  2769485 tagtaggatcataataaccacaagaatgatgcatgttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcttaacatgcaacttttgcctcctaac 2769584  T
Q  208 aaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgttcaaaaat 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||    
T  2769585 aaagcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgaacttgatgggcaatgtccaccagagcttcagtccatgtctaaagaaattgttcgaaaat 2769684  T
Q  308 gcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||| ||||    
T  2769685 gcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctattttcaacaaaatctaaaacaagaactgaatggcaaaaggtgagtcaaaa 2769775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 399
Target Start/End: Original strand, 2818873 - 2819265
Alignment:
Q  8 aatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaataaagg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2818873 aatacctagaacataagaggtatttaatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccaggttgaatttgccatgcccaataacaacaaagg 2818972  T
Q  108 tagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2818973 tagtaggatcataatcaccacaagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactccaaac 2819072  T
Q  208 aaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgttcaaaaat 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||| | ||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2819073 aaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttaggtctgagcttggtggtcgttgtccaccggaacttgaggttgtggcaaaagaaattgttcaaaaat 2819172  T
Q  308 gcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaatt 399  Q
     ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2819173 tcaagcaattacctttggcaatcgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaaccatgatcgaatggcaaaaggtgagtcaaaatt 2819265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 5413195 - 5413593
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5413195 gtgaggcaatacctgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaacaagatttctctgaccaggttgaatttgcgatgcctaaaaaca 5413294  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  5413295 ataaaggtagtaggatcataatcaccactagaatgatgcaagttgcggattttttcaaaaaatcctttctagtatatgttcacaacctgcaacttttgcc 5413394  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  5413395 tccaaacaaagcatgggaactttactgcaagaaggtgtttggatttgaacttggtgggaattgtccatcggagcttcaggatgtatcgaaagaaattgtt 5413494  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  5413495 cgaaaatgcaagcagcttcctctagaaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaattattgaatggcaaaaggtgagtcaaaat 5413593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 2790629 - 2791026
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2790629 gtgaggcaatacctgaaacataaaaagtatttgatattcttcgatgatgtatggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccattccaaataaca 2790728  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2790729 ataaaggttgtaggatcataatcaccactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcttttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgac 2790828  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  2790829 accaaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgagcttggtgggcattgtccaccagagcttaagttcatgtcaaaagaaattgtt 2790928  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaa 397  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  2790929 cgaaaatgcaagcagctacccctggcaattgtagccgtcagtggtctactttcaacaaaagctaaaaccgtgactgaatggaaaatggtgagtcaaaa 2791026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 2797670 - 2798068
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2797670 gtgaggcaatacctgcaacataaaaagtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagacttttctgaccaggttgaatttgccatgcctaataaca 2797769  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    | ||||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2797770 acaaagcaaataggatcatcatcaccacgagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttcaagttcatgttcacaacttgcaacttttgac 2797869  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||| |||    
T  2797870 accaaacaaatcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgaggttggtgggcattgtccaccagagcttaactccatgtcaatagaaatagtt 2797969  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaat 398  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||  ||| ||||||| |||  |||||| |||||    
T  2797970 cgaaaatgcaagcagctacccctggcaattgtagccattggtggtctattttcgacaaaagctaaaactgtgactgaatggaaaatggtgagtcaaaat 2798068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 3201274 - 3201473
Alignment:
Q  22 aagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataacaataaaggtagtaggatcataa 121  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||  |||| |   || |||  | ||||| ||||| |||||      
T  3201274 aagaggtacttgcttttgtttgatgatgtttggaaagaaagtttttctgatgagattgaagatgccttaattagtaatgacaaaggaagtagaatcattg 3201373  T
Q  122 tcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaact 221  Q
    | || | ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3201374 tgaccagtagaatgatgcatgtagctgaatattttaagaaatcttttcttgttcatattcaccacctacaacctttgcctccaaacaaagcgtgggaact 3201473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0691 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0691
Description:

Target: scaffold0691; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5981 - 5582
Alignment:
Q  1 gtgaggcaatacctccaacataagaggtacttgatattctttgatgatgtttggcaagaagatttttccgaccagattgaatttgccatgcctaataaca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5981 gtgaggcaatacctgcaacataagaggtatttgatattctttgatgatgtatggcaagaagatttttctgaccaggttgaatttgccatgcctaataaca 5882  T
Q  101 ataaaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5881 ataaaggtagtaggattataatcaccacaagaatgatgcttgttgccgaatttttcaagaaatcctttatagttcatgttcacaaactgcaactcttgcc 5782  T
Q  201 tccaaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgtt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5781 tccaaacaaagtatgggaactcttctgcaaaaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccacttgagcttgaggctgtatcaaaagaaattgtt 5682  T
Q  301 caaaaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggt-gtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaagtgagtgaaaatt 399  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5681 aaaaaatgcaagcagctacctcttgcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatggttgaatggcaaaaggtgagtcaaaatt 5582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University