View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF8104_low_2 (Length: 523)
Name: NF8104_low_2
Description: NF8104
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8104_low_2 |
 | |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1028 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0582 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0807 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0631 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0224 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 484; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 29955226 - 29955725
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29955226 |
gagtaaatcgcccttacggcaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgattcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
29955325 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29955326 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
29955425 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
300 |
Q |
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|
|
| T |
29955426 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
29955525 |
T |
|
| Q |
301 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtat |
400 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29955526 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtat |
29955625 |
T |
|
| Q |
401 |
tcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctttgcactgaggtgaaatcagtagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
500 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29955626 |
tcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctttgcgctgaggtgaaatcaatagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
29955725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22625404 - 22625043
Alignment:
| Q |
4 |
taaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaagat |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22625404 |
taaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaattatcaccattttcacaacatcaactaagat |
22625305 |
T |
|
| Q |
104 |
attcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatg |
203 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22625304 |
atttaaactttctttcaaaatattcatcatattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatg |
22625205 |
T |
|
| Q |
204 |
agaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgtt |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22625204 |
agaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctatttcattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagtgctctacgtt |
22625105 |
T |
|
| Q |
304 |
caaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22625104 |
caaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
22625043 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12492166 - 12491803
Alignment:
| Q |
2 |
agtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaag |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12492166 |
agtaaatcgctattacaacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaag |
12492067 |
T |
|
| Q |
102 |
atattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaaga |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12492066 |
atattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaaacattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaaca |
12491967 |
T |
|
| Q |
202 |
tgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacg |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
12491966 |
tgagaccttttcatcaaacatgagatgcaataaaaattgtctaatccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataaggtctctgcg |
12491867 |
T |
|
| Q |
302 |
ttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
365 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12491866 |
ttctaattagcttatgagattataaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
12491803 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 480; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 19714162 - 19714661
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19714162 |
gagtaaatcgcccttacggcaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgattcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactga |
19714261 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19714262 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
19714361 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19714362 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
19714461 |
T |
|
| Q |
301 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtat |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19714462 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtat |
19714561 |
T |
|
| Q |
401 |
tcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctttgcactgaggtgaaatcagtagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
500 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19714562 |
tcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctttgcgctgaggtgaaatcaatagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
19714661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 500
Target Start/End: Original strand, 19709474 - 19709830
Alignment:
| Q |
144 |
gcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatct |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19709474 |
gcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataaagacatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatct |
19709573 |
T |
|
| Q |
244 |
attccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacgga |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19709574 |
attccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataaaagctctacgttaaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacgga |
19709673 |
T |
|
| Q |
344 |
ataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtattcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctt |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19709674 |
ataccgcccttacctttgagtgttcttccttccaaaaagctcctgctaagattgtattcgaatggaacgcacacgcaagtctttgaggtgattaagcctt |
19709773 |
T |
|
| Q |
444 |
tgcactgaggtgaaatcagtagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
500 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19709774 |
tgcgctgaggtgaaatcaatagttgctgctaatggctgggcgtggaagatatttagt |
19709830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 19704569 - 19704713
Alignment:
| Q |
2 |
agtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaag |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19704569 |
agtaaatcgcaattacaacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactgag |
19704668 |
T |
|
| Q |
102 |
atattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagca |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19704669 |
atattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagca |
19704713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 76163 - 76527
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76163 |
gagtaaatcgccctttcggcaacctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
76262 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
76263 |
aatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcatatcataatgccctgctatgccacaaaag |
76362 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
76363 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaaattatatattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttatttggataagggctctac |
76462 |
T |
|
| Q |
301 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
365 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
76463 |
gttcaagttatcttatgagattatgaatagataattgtacggaataccgcccttacctttaagtg |
76527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1028 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold1028
Description:
Target: scaffold1028; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 867
Alignment:
| Q |
2 |
agtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaag |
101 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
1226 |
agtaaatcacccttacggcaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcacctttttcacaacatctattaag |
1127 |
T |
|
| Q |
102 |
atattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaaga |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1126 |
atatttaaactttctttcaaaatattcatcacattcatgaaagcattttctctaacgcacaagagagtcaaatcataatgtcatgctatgccacagaaga |
1027 |
T |
|
| Q |
202 |
tgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacg |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1026 |
tgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattgcattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctgtacg |
927 |
T |
|
| Q |
302 |
ttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
926 |
ttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
867 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1208695 - 1208361
Alignment:
| Q |
27 |
tgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaagatattcaaactttctttcaaaatat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1208695 |
tgacacaactacatgtcatgccatgcatgatgcaaactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaaaatattcaaactttctttcaaaatgt |
1208596 |
T |
|
| Q |
127 |
tcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaa |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1208595 |
tcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaa |
1208496 |
T |
|
| Q |
227 |
tgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatga |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1208495 |
tgcaataaaaattatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgtttaaattagcttatgagattatga |
1208396 |
T |
|
| Q |
327 |
atatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1208395 |
atatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
1208361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10051086 - 10050715
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10051086 |
gagtaaatcgcccttacggcaccctatgacacaattacatgtcatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
10050987 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10050986 |
gatattcaaactctctttcaaaatattcatcacatttatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataacgtcatgctatgccacaaaag |
10050887 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10050886 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaaattatatattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggttctac |
10050787 |
T |
|
| Q |
301 |
gttcaaattagc-------ttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtg |
365 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10050786 |
gttcagattaacttataagttataagattatgaatatataattatacagaataccgcccttacctttgagtg |
10050715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0582 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:
Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9520 - 9869
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9520 |
gagtaaatcgcccttacggcatcctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
9619 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9620 |
gatattcaaactttctttcaaaa---------cattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
9710 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9711 |
atgagaccctttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataaggactctac |
9810 |
T |
|
| Q |
301 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctt |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9811 |
gttcaaattagcttatgagattatgaatatataactgtacggaataccgcccttacctt |
9869 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9272811 - 9272474
Alignment:
| Q |
23 |
cctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaact-aagatattcaaactttctttcaa |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9272811 |
cctatgacacaactagatgcca-gccatggatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaacttaaaatattcaaactttctttcaa |
9272713 |
T |
|
| Q |
122 |
aatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaaca |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9272712 |
aatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgtcatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaaca |
9272613 |
T |
|
| Q |
222 |
tgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataaggg-ctctacgttcaaattagcttatgaga |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9272612 |
tgaaatgcaataaaatttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttataaggataagggtttctacgttcaagttaacttatgaga |
9272513 |
T |
|
| Q |
321 |
ttatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctt |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9272512 |
ttatgaatatctaattgtacggaataacgcccttacctt |
9272474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 65443 - 65246
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
65443 |
gagtaaatcgcccttacggcaccctatgacacaactacatgtcatgccatgcatgatgcgcactctttgaaatcatcaccattttcaaaacatcaactaa |
65344 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaa |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
65343 |
gatattcaaacttcctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgcaatgccacaaa |
65246 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 167 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 65246 - 65055
Alignment:
| Q |
167 |
agtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
65246 |
agtcaaatcataatgtcatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttgtctaatccattcttttatttatattc |
65147 |
T |
|
| Q |
267 |
aagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacct |
358 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
65146 |
aagtcttctcatcttattaggataaggtccctacgttcaaattagcttatgagattatggatatataattgtacagaataccgcccttacct |
65055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 20601138 - 20601472
Alignment:
| Q |
23 |
cctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaagatattcaaactttctttcaaa |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20601138 |
cctatgacacaactacatgtcatgacatgcatgatgcacactctttgaaatcataaccattttcacaacatcaactaaaatattcaaactttcttccaaa |
20601237 |
T |
|
| Q |
123 |
atattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacat |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601238 |
atattcatcacattcatcaaagcattttctttaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacat |
20601337 |
T |
|
| Q |
223 |
gaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagatt |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601338 |
gaaatgcaataaaa-atatagattacattcttttatttatattcaagttttctcctcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagatt |
20601436 |
T |
|
| Q |
323 |
atgaatatataattgtacggaataccgcccttacct |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20601437 |
atgaatatataattatacagaatactgcccttacct |
20601472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42833688 - 42833452
Alignment:
| Q |
132 |
acattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcata-----------atgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaac |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || | |
|
|
| T |
42833688 |
acattcatcaaagcattttctctaaagaacaagataatcaaa-cataattacaacgtcatgccatgctatgccaccaaagatgagacttttccaccacat |
42833590 |
T |
|
| Q |
221 |
atgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgaga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
42833589 |
atgaaatgcaataaaa-atatatatttcattcttttatttatattcaagttttctcctcttactatgataagggctctacgttcaacttaacttatgaga |
42833491 |
T |
|
| Q |
321 |
ttatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctt |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42833490 |
ttatgaatatataattgtacggaatatcgcccttacctt |
42833452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 359
Target Start/End: Original strand, 2269659 - 2269850
Alignment:
| Q |
178 |
aatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagtta-----tctattccattctttt-atttatattcaagtc |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| | || || || || |||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
2269659 |
aatgccatgctatcccacaaaagataatactattccaccacacatgaaatgcaataaaaattaatatatatatttcattttttttatctatattcaagtt |
2269758 |
T |
|
| Q |
272 |
ttctcatcttatta----ggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctt |
359 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| ||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2269759 |
tcctcctcttattaattaggaggagggttttacgttcaacttaccttatgagattatgaatatataattctacggaataccgcccttacctt |
2269850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Original strand, 11918092 - 11918187
Alignment:
| Q |
280 |
ttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttgagtgttcttccttc |
375 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
11918092 |
ttattaggaaaagagctctactaccaacttagcatatgagtttatgactacatgattgtacgaaataccacccttacctttgcgtgtttttccttc |
11918187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 42833856 - 42833824
Alignment:
| Q |
23 |
cctatgacacaactacatgccatgccatgcatg |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42833856 |
cctatgacacaactacatgccatgctatgcatg |
42833824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0807 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:
Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 361
Target Start/End: Original strand, 1 - 289
Alignment:
| Q |
73 |
tcatcaccattttcacaacatcaactaagatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaa |
172 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcatcaccgttttcacaacatcgattaagatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatgaaagcattttctctaacgcacaagagagtcaa |
100 |
T |
|
| Q |
173 |
atcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtct |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
atcataatgtcatgctatgccacagaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattgcattcttttatttatattcaagtct |
200 |
T |
|
| Q |
273 |
tctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201 |
tctcatcttattaggataagggctgtacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctttg |
289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 48 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15211085 - 15210834
Alignment:
| Q |
48 |
catgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaagatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15211085 |
catgcatgatgcacactctttgaaatcatccccattttcacaacatcaactaagatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcat |
15210986 |
T |
|
| Q |
148 |
tttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaacatgaaatgcaataaaagttatctattc |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
15210985 |
tttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgtcatgctatgccacaaaagatgagacctttttatcaaacatgaaatgcaataaaaattgtctattc |
15210886 |
T |
|
| Q |
248 |
cattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctcta |
299 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15210885 |
cattctcttatttatattcaagtcttctcatcctattatgataagggctcta |
15210834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0631 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0631
Description:
Target: scaffold0631; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4459
Alignment:
| Q |
1 |
gagtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4671 |
gagtaaatcgcccttacggcaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgatccacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaactaa |
4572 |
T |
|
| Q |
101 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4571 |
gatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaag |
4472 |
T |
|
| Q |
201 |
atgagaccttttc |
213 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |
|
|
| T |
4471 |
atgagatcttttc |
4459 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31094907 - 31094701
Alignment:
| Q |
2 |
agtaaatcgcccttacgacaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatg--atgcacactctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaacta |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31094907 |
agtaaatcgccctttcggcaccctatgacacaactacatgccatgccatgcatgttatgcattctctttgaaatcatcaccattttcacaacatcaacga |
31094808 |
T |
|
| Q |
100 |
agatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcataatgccatgctatgccacaaaa |
199 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31094807 |
aaatattcaaactttctttcaaaatattcatcacattcatcaaagcattttctctaaagaacaagataatcaaa-cataatgccatgctatgccaccaaa |
31094709 |
T |
|
| Q |
200 |
gatgagac |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
31094708 |
gatgagac |
31094701 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0224 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0224
Description:
Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20768 - 20532
Alignment:
| Q |
132 |
acattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaatcata-----------atgccatgctatgccacaaaagatgagaccttttcatcaaac |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || | |
|
|
| T |
20768 |
acattcatcaaagcattttctctaaagaacaagataatcaaa-cataattacaacgtcatgccatgctatgccaccaaagatgagacttttccaccacat |
20670 |
T |
|
| Q |
221 |
atgaaatgcaataaaagttatctattccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgaga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20669 |
atgaaatgcaataaaa-atatatatttcattcttttatttatattcaagttttctcctcttactatgataagggctctacgttcaacttaacttatgaga |
20571 |
T |
|
| Q |
321 |
ttatgaatatataattgtacggaataccgcccttacctt |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20570 |
ttatgaatatataattgtacggaatatcgcccttacctt |
20532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0224; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20936 - 20904
Alignment:
| Q |
23 |
cctatgacacaactacatgccatgccatgcatg |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20936 |
cctatgacacaactacatgccatgctatgcatg |
20904 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 359
Target Start/End: Original strand, 24499908 - 24500023
Alignment:
| Q |
244 |
attccattcttttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacgga |
343 |
Q |
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| T |
24499908 |
attccattcttttatttatattcaggttttctcatcttattaagataaaggctctacgttcaagttagcttatgaaattatgaatatataattgtacgga |
24500007 |
T |
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| Q |
344 |
ataccgcccttacctt |
359 |
Q |
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| T |
24500008 |
atatcgcccttacctt |
24500023 |
T |
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Original strand, 24499805 - 24499847
Alignment:
| Q |
132 |
acattcatcaaagcattttctctaaagcacaagagagtcaaat |
174 |
Q |
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| T |
24499805 |
acattcatcaaagcattttctctaaagaacaatagaatcaaat |
24499847 |
T |
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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Original strand, 31266475 - 31266580
Alignment:
| Q |
255 |
ttatttatattcaagtcttctcatcttattaggataagggctctacgttcaaattagcttatgagattatgaatatataattgtacggaataccgccctt |
354 |
Q |
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| T |
31266475 |
ttatttatattaaagttttctccttttattaagacaagaactctactaccaacttagcttatgattttatgaatacatgactgtacggaataccgttctt |
31266574 |
T |
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| Q |
355 |
accttt |
360 |
Q |
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|||||| |
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| T |
31266575 |
accttt |
31266580 |
T |
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