View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8113_high_5 (Length: 345)

Name: NF8113_high_5
Description: NF8113
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8113_high_5
NF8113_high_5
[»] chr4 (155 HSPs)
chr4 (1-324)||(31959840-31960163)
chr4 (1-324)||(52569541-52569864)
chr4 (1-324)||(4440788-4441109)
chr4 (1-324)||(436162-436485)
chr4 (1-324)||(48174119-48174442)
chr4 (1-321)||(33227142-33227462)
chr4 (1-324)||(56375223-56375546)
chr4 (1-324)||(1777043-1777364)
chr4 (1-321)||(33190877-33191197)
chr4 (1-307)||(53707727-53708033)
chr4 (1-324)||(48622569-48622890)
chr4 (1-324)||(23906323-23906650)
chr4 (1-324)||(43433851-43434180)
chr4 (14-313)||(46582862-46583160)
chr4 (1-315)||(37797785-37798098)
chr4 (7-324)||(28236124-28236438)
chr4 (1-324)||(50286904-50287217)
chr4 (1-324)||(47265221-47265551)
chr4 (11-324)||(39100562-39100872)
chr4 (1-324)||(27450206-27450522)
chr4 (47-324)||(39708412-39708689)
chr4 (1-324)||(37773477-37773799)
chr4 (10-320)||(27983142-27983445)
chr4 (60-304)||(20192025-20192269)
chr4 (56-324)||(26037531-26037799)
chr4 (92-324)||(8286455-8286695)
chr4 (87-324)||(32479057-32479294)
chr4 (32-324)||(1793424-1793718)
chr4 (164-324)||(21236954-21237114)
chr4 (43-303)||(20591353-20591607)
chr4 (1-286)||(41009414-41009699)
chr4 (2-324)||(51421666-51421986)
chr4 (119-300)||(50679556-50679736)
chr4 (196-324)||(6957726-6957854)
chr4 (1-324)||(20601678-20601995)
chr4 (1-313)||(45204877-45205197)
chr4 (196-324)||(12494791-12494919)
chr4 (1-112)||(12494683-12494794)
chr4 (8-324)||(1211418-1211732)
chr4 (8-320)||(16002867-16003178)
chr4 (99-308)||(53518365-53518571)
chr4 (1-136)||(31458961-31459098)
chr4 (196-324)||(7947065-7947193)
chr4 (1-324)||(54470140-54470463)
chr4 (1-324)||(35690237-35690527)
chr4 (196-324)||(21528416-21528544)
chr4 (102-285)||(20821073-20821255)
chr4 (186-313)||(4548140-4548267)
chr4 (189-273)||(50862764-50862849)
chr4 (245-324)||(19969358-19969437)
chr4 (126-324)||(28351617-28351815)
chr4 (18-127)||(49987378-49987487)
chr4 (240-324)||(19154889-19154973)
chr4 (32-177)||(28497452-28497598)
chr4 (52-324)||(46372008-46372280)
chr4 (54-313)||(42639057-42639316)
chr4 (75-260)||(26356626-26356811)
chr4 (56-233)||(35555764-35555941)
chr4 (1-130)||(44047568-44047697)
chr4 (1-312)||(21106917-21107236)
chr4 (1-168)||(33709852-33710024)
chr4 (113-324)||(31961292-31961503)
chr4 (52-261)||(31897517-31897724)
chr4 (120-312)||(2589124-2589316)
chr4 (32-177)||(50662353-50662497)
chr4 (18-176)||(51252635-51252791)
chr4 (8-210)||(7092360-7092561)
chr4 (33-281)||(50680704-50680953)
chr4 (186-324)||(51811305-51811442)
chr4 (1-209)||(25257722-25257928)
chr4 (8-324)||(56225005-56225324)
chr4 (7-324)||(10208977-10209290)
chr4 (1-150)||(41192767-41192918)
chr4 (52-324)||(31339521-31339780)
chr4 (1-137)||(17900413-17900549)
chr4 (25-137)||(38570960-38571072)
chr4 (45-168)||(1427466-1427589)
chr4 (270-321)||(19061964-19062015)
chr4 (197-324)||(31043201-31043328)
chr4 (1-315)||(34233059-34233382)
chr4 (72-217)||(29398822-29398967)
chr4 (75-324)||(55579040-55579287)
chr4 (192-265)||(55809075-55809148)
chr4 (53-145)||(30621409-30621501)
chr4 (155-324)||(31459093-31459250)
chr4 (78-324)||(42285729-42285972)
chr4 (57-324)||(44360076-44360342)
chr4 (93-324)||(47372676-47372907)
chr4 (277-324)||(49939760-49939807)
chr4 (191-322)||(53540413-53540544)
chr4 (208-286)||(41009283-41009361)
chr4 (39-137)||(46715585-46715678)
chr4 (69-198)||(2588992-2589120)
chr4 (241-310)||(34208309-34208378)
chr4 (249-306)||(41729494-41729551)
chr4 (239-324)||(55007917-55008002)
chr4 (1-134)||(31403234-31403369)
chr4 (1-61)||(43070053-43070113)
chr4 (191-313)||(2557708-2557831)
chr4 (99-258)||(17666135-17666294)
chr4 (82-137)||(47611741-47611796)
chr4 (32-134)||(36557246-36557347)
chr4 (1-118)||(10775654-10775771)
chr4 (142-313)||(21945678-21945846)
chr4 (56-324)||(40018215-40018477)
chr4 (33-137)||(50471493-50471595)
chr4 (236-312)||(5306464-5306540)
chr4 (252-324)||(20105544-20105616)
chr4 (75-182)||(20131167-20131274)
chr4 (256-324)||(25427888-25427956)
chr4 (1-176)||(25755250-25755425)
chr4 (1-65)||(25967552-25967616)
chr4 (221-325)||(28550480-28550584)
chr4 (197-313)||(37488220-37488336)
chr4 (33-145)||(38903925-38904036)
chr4 (82-162)||(45185215-45185295)
chr4 (265-320)||(12443292-12443347)
chr4 (277-324)||(32633432-32633479)
chr4 (56-183)||(38266134-38266261)
chr4 (58-145)||(45175997-45176083)
chr4 (194-305)||(50287988-50288099)
chr4 (112-178)||(20605241-20605307)
chr4 (191-305)||(49987531-49987645)
chr4 (286-324)||(50238641-50238679)
chr4 (286-324)||(50238727-50238765)
chr4 (275-324)||(8284346-8284395)
chr4 (251-312)||(25575007-25575068)
chr4 (239-312)||(28486092-28486165)
chr4 (251-324)||(29209201-29209274)
chr4 (53-134)||(55768717-55768798)
chr4 (53-134)||(55832973-55833054)
chr4 (207-324)||(56439597-56439714)
chr4 (212-324)||(26024876-26024988)
chr4 (84-136)||(44860862-44860914)
chr4 (69-137)||(49738817-49738885)
chr4 (47-134)||(1380346-1380433)
chr4 (201-324)||(13296566-13296689)
chr4 (1-56)||(18966486-18966541)
chr4 (269-324)||(36255548-36255603)
chr4 (278-324)||(6958264-6958310)
chr4 (254-324)||(29398990-29399060)
chr4 (220-310)||(30621241-30621331)
chr4 (71-129)||(42293470-42293528)
chr4 (277-322)||(883388-883433)
chr4 (275-320)||(1965663-1965708)
chr4 (283-324)||(15661898-15661939)
chr4 (275-324)||(45209231-45209280)
chr4 (1-137)||(934649-934784)
chr4 (106-138)||(21214792-21214824)
chr4 (84-156)||(29182498-29182570)
chr4 (251-323)||(34379586-34379657)
chr4 (216-324)||(37042690-37042798)
chr4 (275-323)||(40932951-40932999)
chr4 (251-315)||(41192244-41192308)
chr4 (191-310)||(47147496-47147613)
[»] chr1 (159 HSPs)
chr1 (1-324)||(1210678-1211001)
chr1 (1-324)||(30202156-30202479)
chr1 (1-324)||(34792375-34792698)
chr1 (1-324)||(49347419-49347742)
chr1 (1-324)||(8671853-8672174)
chr1 (1-324)||(9592667-9592990)
chr1 (6-322)||(22090032-22090350)
chr1 (1-324)||(51440791-51441114)
chr1 (1-307)||(32230997-32231303)
chr1 (1-324)||(51601991-51602312)
chr1 (1-324)||(43240405-43240730)
chr1 (1-324)||(696202-696526)
chr1 (1-324)||(4001481-4001804)
chr1 (58-324)||(4029112-4029378)
chr1 (1-324)||(8391705-8392028)
chr1 (1-324)||(32082782-32083094)
chr1 (1-324)||(15085867-15086178)
chr1 (86-324)||(25979257-25979495)
chr1 (1-324)||(38807697-38808023)
chr1 (1-315)||(9509251-9509565)
chr1 (152-324)||(37311781-37311953)
chr1 (7-324)||(37462902-37463214)
chr1 (1-312)||(9599432-9599743)
chr1 (131-315)||(39318193-39318376)
chr1 (185-324)||(52921197-52921336)
chr1 (1-324)||(27847826-27848153)
chr1 (3-324)||(18469108-18469427)
chr1 (32-324)||(39140484-39140771)
chr1 (38-324)||(32404552-32404837)
chr1 (98-324)||(52561615-52561841)
chr1 (56-324)||(2544587-2544849)
chr1 (69-324)||(48431425-48431687)
chr1 (44-324)||(38868858-38869138)
chr1 (1-215)||(43423650-43423866)
chr1 (32-293)||(36623941-36624184)
chr1 (218-323)||(32079204-32079307)
chr1 (175-315)||(4415455-4415596)
chr1 (232-324)||(4707247-4707338)
chr1 (32-324)||(6025569-6025861)
chr1 (56-324)||(40416359-40416627)
chr1 (1-249)||(34827205-34827451)
chr1 (83-291)||(478695-478900)
chr1 (192-324)||(41560353-41560485)
chr1 (56-315)||(3818891-3819150)
chr1 (240-323)||(24020294-24020377)
chr1 (11-118)||(52561843-52561950)
chr1 (71-313)||(5338727-5338958)
chr1 (43-137)||(1661405-1661499)
chr1 (15-168)||(51812472-51812625)
chr1 (31-183)||(35828717-35828869)
chr1 (69-261)||(37263332-37263523)
chr1 (261-324)||(44751677-44751740)
chr1 (98-324)||(28528385-28528611)
chr1 (232-324)||(46423242-46423331)
chr1 (98-303)||(7762484-7762689)
chr1 (215-324)||(10200332-10200441)
chr1 (204-324)||(29128919-29129040)
chr1 (268-324)||(29577452-29577508)
chr1 (6-132)||(14226047-14226171)
chr1 (6-223)||(39894722-39894934)
chr1 (32-323)||(40419603-40419893)
chr1 (261-324)||(42337749-42337812)
chr1 (261-324)||(44941802-44941865)
chr1 (191-324)||(28511827-28511960)
chr1 (98-310)||(16272861-16273073)
chr1 (1-324)||(26016370-26016693)
chr1 (221-324)||(52532642-52532745)
chr1 (198-315)||(8676897-8677017)
chr1 (98-324)||(8796239-8796465)
chr1 (70-261)||(27637720-27637913)
chr1 (258-324)||(28090720-28090786)
chr1 (69-221)||(13827699-13827851)
chr1 (170-266)||(26299187-26299283)
chr1 (56-312)||(36339842-36340097)
chr1 (212-311)||(16142019-16142118)
chr1 (18-324)||(19908061-19908371)
chr1 (220-315)||(19936612-19936707)
chr1 (249-324)||(40568436-40568511)
chr1 (60-307)||(52832037-52832284)
chr1 (265-315)||(5113940-5113990)
chr1 (188-286)||(8628150-8628248)
chr1 (98-244)||(9002382-9002528)
chr1 (181-324)||(27520233-27520378)
chr1 (68-286)||(41611806-41612024)
chr1 (198-311)||(11941619-11941732)
chr1 (275-324)||(28533674-28533723)
chr1 (103-324)||(42501143-42501364)
chr1 (1-137)||(18793201-18793337)
chr1 (251-322)||(109021-109092)
chr1 (251-310)||(6084158-6084217)
chr1 (1-125)||(19936455-19936571)
chr1 (282-324)||(3777286-3777328)
chr1 (1-136)||(4379938-4380081)
chr1 (278-324)||(38877369-38877415)
chr1 (60-137)||(52073675-52073753)
chr1 (271-324)||(32112015-32112068)
chr1 (251-324)||(34444539-34444612)
chr1 (239-324)||(43375624-43375709)
chr1 (164-320)||(50806765-50806919)
chr1 (69-137)||(8343071-8343139)
chr1 (73-137)||(13827930-13827994)
chr1 (1-133)||(17815408-17815537)
chr1 (260-324)||(21769737-21769801)
chr1 (196-324)||(29807984-29808112)
chr1 (191-262)||(8342969-8343040)
chr1 (113-312)||(30834015-30834214)
chr1 (223-302)||(44905404-44905483)
chr1 (239-322)||(48865735-48865818)
chr1 (190-321)||(52878328-52878459)
chr1 (239-310)||(52900682-52900753)
chr1 (68-246)||(10272259-10272436)
chr1 (190-324)||(12930337-12930471)
chr1 (52-134)||(17275180-17275262)
chr1 (265-315)||(27072522-27072572)
chr1 (274-324)||(27704156-27704206)
chr1 (251-309)||(39776936-39776994)
chr1 (275-324)||(2429655-2429704)
chr1 (251-324)||(14557751-14557824)
chr1 (275-320)||(17269019-17269064)
chr1 (251-324)||(25715352-25715425)
chr1 (191-324)||(29577169-29577301)
chr1 (251-324)||(45510859-45510932)
chr1 (77-137)||(990672-990732)
chr1 (262-322)||(1290059-1290119)
chr1 (6-62)||(16142172-16142228)
chr1 (53-137)||(16943160-16943243)
chr1 (1-65)||(40920822-40920886)
chr1 (288-324)||(41165502-41165538)
chr1 (1-77)||(41611105-41611181)
chr1 (113-233)||(50771673-50771792)
chr1 (289-324)||(4318871-4318906)
chr1 (277-324)||(4590558-4590605)
chr1 (194-261)||(8203223-8203290)
chr1 (204-307)||(11331247-11331350)
chr1 (204-307)||(11489268-11489371)
chr1 (2-65)||(19908655-19908718)
chr1 (94-129)||(31274578-31274613)
chr1 (79-134)||(44905548-44905603)
chr1 (265-324)||(50257767-50257826)
chr1 (76-134)||(7921843-7921901)
chr1 (128-210)||(9602204-9602286)
chr1 (83-137)||(16822235-16822289)
chr1 (270-324)||(26113465-26113519)
chr1 (84-162)||(46388392-46388470)
chr1 (275-312)||(7083097-7083134)
chr1 (251-324)||(7133328-7133401)
chr1 (105-150)||(10569267-10569312)
chr1 (275-324)||(14225862-14225911)
chr1 (191-324)||(19908410-19908543)
chr1 (287-324)||(26299287-26299324)
chr1 (275-312)||(37294146-37294183)
chr1 (224-324)||(42539238-42539339)
chr1 (264-324)||(22175341-22175401)
chr1 (69-137)||(23791857-23791925)
chr1 (56-112)||(29578163-29578218)
chr1 (275-315)||(39123403-39123443)
chr1 (32-184)||(39422209-39422359)
chr1 (108-259)||(46226380-46226532)
chr1 (275-323)||(52073075-52073123)
[»] chr7 (152 HSPs)
chr7 (5-324)||(49029213-49029532)
chr7 (1-315)||(34869353-34869667)
chr7 (1-324)||(37617877-37618201)
chr7 (1-324)||(35906227-35906550)
chr7 (1-324)||(11593893-11594216)
chr7 (1-324)||(12841301-12841624)
chr7 (3-324)||(39906398-39906717)
chr7 (1-324)||(33349832-33350155)
chr7 (1-297)||(13859061-13859357)
chr7 (1-324)||(46355882-46356205)
chr7 (33-324)||(6374833-6375124)
chr7 (8-324)||(44855200-44855514)
chr7 (1-324)||(45836508-45836829)
chr7 (1-324)||(36651927-36652248)
chr7 (1-324)||(43281609-43281930)
chr7 (1-275)||(31005156-31005430)
chr7 (1-312)||(35559031-35559343)
chr7 (68-324)||(31682628-31682884)
chr7 (33-324)||(29650349-29650640)
chr7 (8-324)||(43491248-43491564)
chr7 (1-324)||(38606938-38607248)
chr7 (71-324)||(22349623-22349876)
chr7 (54-324)||(2885748-2886018)
chr7 (1-224)||(33072887-33073108)
chr7 (69-308)||(36869286-36869525)
chr7 (1-315)||(23404351-23404664)
chr7 (78-324)||(15682184-15682430)
chr7 (181-324)||(38900070-38900212)
chr7 (1-303)||(36136697-36136999)
chr7 (36-324)||(28627959-28628247)
chr7 (185-324)||(40979954-40980093)
chr7 (107-324)||(32631615-32631820)
chr7 (1-307)||(47848607-47848912)
chr7 (141-324)||(31681046-31681226)
chr7 (119-324)||(7273151-7273356)
chr7 (126-315)||(24598222-24598411)
chr7 (3-310)||(8492276-8492580)
chr7 (8-180)||(7272979-7273151)
chr7 (32-172)||(46014359-46014498)
chr7 (203-324)||(48919247-48919368)
chr7 (219-315)||(21078068-21078164)
chr7 (8-110)||(32630535-32630636)
chr7 (1-233)||(43282338-43282574)
chr7 (225-324)||(27648937-27649036)
chr7 (190-324)||(9210730-9210864)
chr7 (32-222)||(25579205-25579394)
chr7 (86-323)||(38135240-38135476)
chr7 (58-273)||(7189296-7189518)
chr7 (1-186)||(36514371-36514554)
chr7 (124-324)||(1011103-1011302)
chr7 (32-324)||(26741920-26742215)
chr7 (244-324)||(33073105-33073185)
chr7 (240-324)||(34035180-34035264)
chr7 (1-177)||(39811890-39812066)
chr7 (191-312)||(45601599-45601720)
chr7 (71-324)||(12966025-12966272)
chr7 (15-175)||(19262609-19262766)
chr7 (255-324)||(28208354-28208423)
chr7 (56-136)||(27021906-27021986)
chr7 (69-177)||(40169650-40169758)
chr7 (115-322)||(1569063-1569270)
chr7 (1-135)||(42187404-42187537)
chr7 (246-324)||(47852265-47852343)
chr7 (1-65)||(36869574-36869638)
chr7 (1-136)||(28020897-28021032)
chr7 (215-324)||(14057625-14057734)
chr7 (215-324)||(14367653-14367762)
chr7 (1-83)||(24598409-24598495)
chr7 (37-324)||(36101803-36102078)
chr7 (212-313)||(36239833-36239934)
chr7 (69-140)||(38920795-38920866)
chr7 (198-324)||(42187572-42187697)
chr7 (1-176)||(48736073-48736248)
chr7 (91-225)||(6420615-6420749)
chr7 (103-225)||(48202827-48202949)
chr7 (32-137)||(41948480-41948585)
chr7 (1-315)||(5335855-5336165)
chr7 (201-313)||(37976368-37976480)
chr7 (240-324)||(42969870-42969954)
chr7 (1-137)||(14593694-14593834)
chr7 (1-137)||(30200176-30200308)
chr7 (230-325)||(40415169-40415264)
chr7 (69-259)||(18605237-18605427)
chr7 (254-324)||(34926548-34926618)
chr7 (69-167)||(35713696-35713794)
chr7 (255-324)||(24177653-24177721)
chr7 (124-292)||(1531419-1531587)
chr7 (56-176)||(1740789-1740909)
chr7 (188-315)||(44951274-44951402)
chr7 (58-134)||(45558352-45558428)
chr7 (74-137)||(7220750-7220813)
chr7 (165-324)||(19119450-19119608)
chr7 (201-304)||(21517426-21517529)
chr7 (273-324)||(24777166-24777217)
chr7 (277-324)||(31869128-31869175)
chr7 (15-127)||(47796359-47796473)
chr7 (69-259)||(18637563-18637753)
chr7 (69-259)||(18650997-18651187)
chr7 (242-324)||(33103100-33103182)
chr7 (122-320)||(33139208-33139406)
chr7 (25-137)||(40830183-40830292)
chr7 (203-324)||(34745882-34746003)
chr7 (1-65)||(1523749-1523813)
chr7 (60-183)||(5418071-5418195)
chr7 (69-273)||(28562443-28562647)
chr7 (252-311)||(6807388-6807447)
chr7 (239-310)||(8519086-8519157)
chr7 (1-137)||(16013217-16013357)
chr7 (191-322)||(22174123-22174254)
chr7 (239-310)||(31859046-31859117)
chr7 (191-313)||(44401164-44401284)
chr7 (201-324)||(47796178-47796301)
chr7 (122-200)||(26925264-26925342)
chr7 (86-176)||(30144793-30144883)
chr7 (286-324)||(40630652-40630690)
chr7 (58-135)||(30632958-30633035)
chr7 (255-324)||(30814151-30814220)
chr7 (251-320)||(34341425-34341494)
chr7 (195-324)||(43281958-43282086)
chr7 (71-175)||(3457368-3457471)
chr7 (1-65)||(27021991-27022055)
chr7 (212-324)||(40149039-40149150)
chr7 (1-125)||(45841206-45841329)
chr7 (98-145)||(9797909-9797956)
chr7 (98-137)||(24549906-24549945)
chr7 (70-129)||(27893769-27893828)
chr7 (69-144)||(30914674-30914749)
chr7 (6-65)||(35713617-35713676)
chr7 (44-111)||(37439580-37439647)
chr7 (221-324)||(40391849-40391952)
chr7 (270-324)||(25891090-25891144)
chr7 (251-324)||(33732017-33732088)
chr7 (283-325)||(37595891-37595933)
chr7 (9-145)||(40139124-40139257)
chr7 (277-311)||(45558539-45558573)
chr7 (251-304)||(2882782-2882835)
chr7 (275-324)||(4604754-4604803)
chr7 (69-137)||(6429156-6429225)
chr7 (56-125)||(23720829-23720898)
chr7 (270-315)||(24376058-24376103)
chr7 (191-324)||(24549715-24549847)
chr7 (7-64)||(25731639-25731696)
chr7 (32-137)||(25826683-25826788)
chr7 (239-324)||(27893589-27893674)
chr7 (283-324)||(28708596-28708637)
chr7 (222-307)||(35922407-35922492)
chr7 (275-324)||(40138974-40139023)
chr7 (37-110)||(42177255-42177328)
chr7 (34-162)||(28858012-28858138)
chr7 (277-313)||(34029713-34029749)
chr7 (275-323)||(45054330-45054378)
chr7 (270-310)||(45903916-45903956)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (1-324)||(52138733-52139056)
chr3 (1-324)||(54278953-54279276)
chr3 (1-324)||(28245370-28245693)
chr3 (1-314)||(51447753-51448058)
chr3 (1-324)||(22006-22328)
chr3 (1-324)||(5168761-5169088)
chr3 (2-320)||(47233626-47233944)
chr3 (51-315)||(35033129-35033393)
chr3 (1-251)||(33272122-33272377)
chr3 (1-324)||(25191312-25191633)
chr3 (101-324)||(48508268-48508491)
chr3 (56-324)||(38850108-38850377)
chr3 (1-324)||(53519519-53519836)
chr3 (1-324)||(54128311-54128635)
chr3 (180-324)||(12096731-12096875)
chr3 (27-320)||(43694801-43695083)
chr3 (10-324)||(45289117-45289434)
chr3 (1-324)||(19676107-19676439)
chr3 (56-217)||(38060419-38060580)
chr3 (15-307)||(39600724-39601016)
chr3 (75-315)||(48953454-48953697)
chr3 (1-242)||(45728079-45728324)
chr3 (32-322)||(38430807-38431107)
chr3 (7-222)||(49503684-49503897)
chr3 (69-324)||(50960663-50960914)
chr3 (84-315)||(39235154-39235384)
chr3 (1-222)||(19736929-19737150)
chr3 (1-312)||(19757832-19758131)
chr3 (2-324)||(48734173-48734481)
chr3 (207-324)||(52156110-52156227)
chr3 (6-273)||(3186707-3186973)
chr3 (72-324)||(42510042-42510292)
chr3 (1-324)||(26490250-26490571)
chr3 (1-286)||(27917505-27917788)
chr3 (32-291)||(54425024-54425289)
chr3 (56-293)||(30294178-30294418)
chr3 (44-308)||(52678892-52679154)
chr3 (212-324)||(38060858-38060970)
chr3 (58-315)||(54365010-54365268)
chr3 (246-324)||(47555358-47555436)
chr3 (222-324)||(53262295-53262397)
chr3 (93-288)||(19162650-19162842)
chr3 (213-323)||(49042081-49042192)
chr3 (202-315)||(17022707-17022820)
chr3 (38-324)||(31454251-31454537)
chr3 (261-324)||(7895906-7895969)
chr3 (239-324)||(311335-311420)
chr3 (79-324)||(37351418-37351663)
chr3 (6-133)||(344928-345055)
chr3 (69-309)||(21200551-21200787)
chr3 (32-145)||(3987011-3987124)
chr3 (1-137)||(36820174-36820308)
chr3 (54-183)||(41842678-41842806)
chr3 (237-324)||(2133638-2133725)
chr3 (71-321)||(49841622-49841869)
chr3 (5-210)||(50249318-50249529)
chr3 (56-233)||(11581432-11581609)
chr3 (83-322)||(36303994-36304220)
chr3 (261-324)||(33271936-33271999)
chr3 (32-136)||(29600863-29600968)
chr3 (1-136)||(2340928-2341063)
chr3 (221-324)||(15296060-15296163)
chr3 (6-125)||(31337751-31337868)
chr3 (277-324)||(40273231-40273278)
chr3 (262-324)||(48532151-48532214)
chr3 (199-313)||(40116505-40116619)
chr3 (230-291)||(54422902-54422963)
chr3 (192-324)||(27893213-27893345)
chr3 (1-65)||(38850027-38850091)
chr3 (239-315)||(40116373-40116449)
chr3 (69-321)||(42026565-42026817)
chr3 (32-311)||(23534609-23534887)
chr3 (277-324)||(31566187-31566234)
chr3 (192-261)||(26990337-26990406)
chr3 (239-324)||(29601063-29601148)
chr3 (255-324)||(30797848-30797917)
chr3 (251-324)||(40991614-40991687)
chr3 (1-62)||(45236789-45236850)
chr3 (275-324)||(46148235-46148284)
chr3 (46-137)||(31453151-31453242)
chr3 (251-311)||(39208791-39208851)
chr3 (261-324)||(24541358-24541421)
chr3 (191-304)||(41482183-41482298)
chr3 (202-324)||(45486875-45487000)
chr3 (1-127)||(26388414-26388540)
chr3 (73-127)||(37534429-37534483)
chr3 (75-137)||(39535653-39535715)
chr3 (282-324)||(41529975-41530017)
chr3 (96-145)||(3870649-3870698)
chr3 (195-313)||(11284120-11284233)
chr3 (9-89)||(33307087-33307165)
chr3 (251-324)||(40106646-40106719)
chr3 (84-324)||(659541-659781)
chr3 (265-325)||(27796005-27796065)
chr3 (1-129)||(29817437-29817565)
chr3 (277-324)||(24778635-24778682)
chr3 (191-313)||(29475811-29475931)
chr3 (69-136)||(44134044-44134111)
chr3 (285-324)||(45834626-45834665)
chr3 (278-324)||(21862767-21862813)
chr3 (71-137)||(36868437-36868503)
chr3 (1-63)||(38054624-38054686)
chr3 (262-324)||(52927874-52927936)
chr3 (279-324)||(7278675-7278720)
chr3 (251-324)||(14415286-14415358)
chr3 (255-324)||(32170592-32170661)
chr3 (191-324)||(45493718-45493851)
chr3 (275-324)||(46367413-46367462)
chr3 (251-324)||(49503594-49503667)
chr3 (251-308)||(55244461-55244518)
chr3 (240-312)||(19737156-19737228)
chr3 (243-311)||(41842562-41842630)
chr3 (240-284)||(44571599-44571643)
chr3 (252-324)||(48712101-48712173)
[»] chr8 (124 HSPs)
chr8 (3-324)||(36565267-36565588)
chr8 (1-324)||(36545080-36545405)
chr8 (34-324)||(11523749-11524040)
chr8 (1-324)||(36394974-36395299)
chr8 (1-324)||(40813255-40813580)
chr8 (70-324)||(12491164-12491418)
chr8 (1-302)||(39946790-39947091)
chr8 (1-320)||(42854034-42854353)
chr8 (1-324)||(2796488-2796809)
chr8 (1-311)||(18125108-18125414)
chr8 (15-324)||(21121105-21121401)
chr8 (40-324)||(8932676-8932959)
chr8 (1-324)||(45419172-45419491)
chr8 (142-325)||(42469752-42469935)
chr8 (1-324)||(37077698-37078005)
chr8 (14-325)||(8879471-8879776)
chr8 (1-313)||(29520593-29520894)
chr8 (88-307)||(26904950-26905168)
chr8 (169-305)||(2027631-2027767)
chr8 (1-228)||(18751998-18752222)
chr8 (71-315)||(43904700-43904947)
chr8 (1-261)||(32043523-32043783)
chr8 (218-324)||(25473429-25473535)
chr8 (60-324)||(29700268-29700532)
chr8 (195-324)||(14742108-14742234)
chr8 (93-310)||(30559718-30559935)
chr8 (239-324)||(44529396-44529481)
chr8 (77-324)||(32930970-32931216)
chr8 (1-262)||(10079995-10080254)
chr8 (1-324)||(39953290-39953613)
chr8 (241-324)||(44047558-44047641)
chr8 (19-168)||(7046285-7046434)
chr8 (56-286)||(45512558-45512789)
chr8 (1-162)||(6510616-6510775)
chr8 (1-134)||(13171865-13171998)
chr8 (126-324)||(12025847-12026036)
chr8 (5-171)||(30748396-30748560)
chr8 (99-292)||(9904940-9905132)
chr8 (216-321)||(25300247-25300352)
chr8 (20-135)||(9695583-9695698)
chr8 (2-137)||(44681252-44681387)
chr8 (37-138)||(12796912-12797011)
chr8 (230-324)||(15215438-15215532)
chr8 (158-324)||(35362676-35362842)
chr8 (239-324)||(490506-490591)
chr8 (1-62)||(12492130-12492191)
chr8 (32-324)||(16917148-16917438)
chr8 (19-131)||(30113416-30113528)
chr8 (191-322)||(2216411-2216540)
chr8 (197-324)||(35914627-35914754)
chr8 (196-324)||(23492163-23492290)
chr8 (216-321)||(25288912-25289017)
chr8 (79-324)||(35643634-35643872)
chr8 (1-145)||(2518597-2518740)
chr8 (220-324)||(45041342-45041445)
chr8 (32-311)||(5908606-5908889)
chr8 (56-313)||(13589474-13589724)
chr8 (197-324)||(38391919-38392046)
chr8 (165-279)||(5266027-5266140)
chr8 (73-183)||(10824331-10824441)
chr8 (1-324)||(16351323-16351633)
chr8 (190-324)||(28169514-28169648)
chr8 (70-183)||(36143367-36143480)
chr8 (191-324)||(43733330-43733462)
chr8 (56-137)||(2776442-2776524)
chr8 (71-137)||(18474173-18474239)
chr8 (8-82)||(25288842-25288916)
chr8 (8-82)||(25300177-25300251)
chr8 (9-218)||(25985462-25985668)
chr8 (188-270)||(28269759-28269840)
chr8 (104-324)||(42584407-42584614)
chr8 (8-65)||(15215556-15215613)
chr8 (152-324)||(7531670-7531842)
chr8 (199-315)||(17491689-17491805)
chr8 (240-312)||(31715992-31716064)
chr8 (206-325)||(39967524-39967643)
chr8 (32-183)||(44373740-44373891)
chr8 (16-137)||(78988-79112)
chr8 (8-110)||(13986434-13986536)
chr8 (191-324)||(30812842-30812975)
chr8 (251-324)||(44699649-44699722)
chr8 (69-137)||(25985813-25985880)
chr8 (69-129)||(41444547-41444607)
chr8 (1-120)||(42493536-42493653)
chr8 (261-324)||(10668523-10668586)
chr8 (216-315)||(14459043-14459142)
chr8 (214-273)||(25439471-25439530)
chr8 (58-137)||(41971991-41972069)
chr8 (278-324)||(1928613-1928659)
chr8 (261-315)||(8255568-8255622)
chr8 (240-322)||(26363660-26363740)
chr8 (131-233)||(38178377-38178479)
chr8 (1-131)||(39051075-39051205)
chr8 (275-324)||(27556328-27556377)
chr8 (32-121)||(30456441-30456530)
chr8 (32-123)||(33666726-33666814)
chr8 (275-324)||(35646956-35647005)
chr8 (196-312)||(14903689-14903805)
chr8 (276-324)||(32276893-32276941)
chr8 (272-320)||(32569740-32569788)
chr8 (240-324)||(36069774-36069858)
chr8 (265-321)||(36143538-36143594)
chr8 (197-324)||(79156-79283)
chr8 (56-135)||(6483245-6483324)
chr8 (72-111)||(7103274-7103313)
chr8 (32-183)||(11733711-11733862)
chr8 (60-131)||(34196064-34196135)
chr8 (277-312)||(36042407-36042442)
chr8 (190-320)||(3801995-3802125)
chr8 (194-308)||(27037761-27037875)
chr8 (75-137)||(29645044-29645106)
chr8 (277-315)||(30456329-30456367)
chr8 (191-320)||(30783072-30783201)
chr8 (251-312)||(21425229-21425290)
chr8 (56-137)||(23023231-23023312)
chr8 (191-324)||(30198292-30198425)
chr8 (275-324)||(30689942-30689991)
chr8 (190-291)||(33827816-33827917)
chr8 (191-324)||(41444365-41444501)
chr8 (192-324)||(16994470-16994602)
chr8 (188-220)||(28255022-28255054)
chr8 (192-228)||(29709821-29709857)
chr8 (95-311)||(29735834-29736050)
chr8 (77-145)||(38689547-38689615)
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (1-324)||(4496315-4496640)
chr5 (1-324)||(24178443-24178766)
chr5 (5-324)||(12492410-12492732)
chr5 (1-324)||(1287605-1287938)
chr5 (1-324)||(28976885-28977206)
chr5 (1-324)||(2075499-2075823)
chr5 (33-324)||(38684932-38685223)
chr5 (1-324)||(1275198-1275520)
chr5 (1-323)||(10639230-10639557)
chr5 (1-324)||(3301777-3302100)
chr5 (1-324)||(16347406-16347727)
chr5 (71-324)||(20456776-20457029)
chr5 (16-324)||(14665658-14665968)
chr5 (1-313)||(34272955-34273258)
chr5 (126-324)||(2915522-2915719)
chr5 (1-324)||(26884715-26885038)
chr5 (157-324)||(13561412-13561579)
chr5 (199-324)||(29816513-29816638)
chr5 (32-303)||(14749271-14749542)
chr5 (164-324)||(14911268-14911428)
chr5 (100-324)||(38501444-38501668)
chr5 (212-315)||(16913918-16914021)
chr5 (15-261)||(31636009-31636253)
chr5 (25-310)||(36215457-36215730)
chr5 (6-312)||(6888931-6889237)
chr5 (1-312)||(27827-28126)
chr5 (56-312)||(79501-79757)
chr5 (248-324)||(30213755-30213831)
chr5 (1-318)||(32516491-32516805)
chr5 (1-286)||(17340500-17340786)
chr5 (60-261)||(2712936-2713137)
chr5 (32-324)||(7359287-7359577)
chr5 (1-131)||(15168723-15168855)
chr5 (32-324)||(6859345-6859637)
chr5 (241-324)||(5558314-5558397)
chr5 (56-324)||(14667751-14668027)
chr5 (79-324)||(30588460-30588703)
chr5 (239-323)||(418061-418145)
chr5 (75-315)||(1525651-1525891)
chr5 (53-233)||(15489609-15489789)
chr5 (46-162)||(43558015-43558133)
chr5 (218-288)||(2552932-2553002)
chr5 (23-228)||(42199243-42199446)
chr5 (17-145)||(418190-418318)
chr5 (10-261)||(10082834-10083079)
chr5 (1-219)||(21952284-21952508)
chr5 (221-313)||(28276391-28276483)
chr5 (69-137)||(33667217-33667285)
chr5 (71-183)||(43475243-43475355)
chr5 (191-324)||(9235172-9235302)
chr5 (69-233)||(28676596-28676760)
chr5 (229-324)||(39040917-39041012)
chr5 (230-324)||(2393039-2393133)
chr5 (95-208)||(15986879-15986992)
chr5 (69-137)||(18351120-18351189)
chr5 (1-128)||(11002645-11002770)
chr5 (197-324)||(11675658-11675786)
chr5 (265-324)||(7640533-7640592)
chr5 (105-262)||(9917538-9917695)
chr5 (170-284)||(15168873-15168987)
chr5 (98-291)||(23979976-23980167)
chr5 (79-322)||(29938126-29938364)
chr5 (95-221)||(36200769-36200894)
chr5 (211-320)||(2090556-2090665)
chr5 (192-324)||(15588416-15588546)
chr5 (251-324)||(32442151-32442224)
chr5 (105-209)||(11675547-11675651)
chr5 (193-313)||(29922409-29922529)
chr5 (204-304)||(42504293-42504393)
chr5 (1-324)||(7678413-7678733)
chr5 (88-183)||(21093772-21093867)
chr5 (33-136)||(31906626-31906729)
chr5 (124-263)||(33157918-33158057)
chr5 (126-309)||(43035039-43035222)
chr5 (1-111)||(219692-219802)
chr5 (1-75)||(20318920-20318989)
chr5 (279-324)||(408520-408565)
chr5 (191-320)||(12576890-12577019)
chr5 (259-324)||(18855798-18855863)
chr5 (1-62)||(28186956-28187017)
chr5 (59-324)||(38684471-38684736)
chr5 (1-65)||(5305549-5305613)
chr5 (190-286)||(14725640-14725736)
chr5 (72-136)||(37065533-37065597)
chr5 (277-324)||(3442897-3442944)
chr5 (265-320)||(9400708-9400763)
chr5 (236-323)||(20367061-20367148)
chr5 (32-87)||(42504446-42504501)
chr5 (262-324)||(38132531-38132592)
chr5 (278-324)||(42272687-42272733)
chr5 (191-324)||(6788190-6788323)
chr5 (69-246)||(38578625-38578802)
chr5 (117-221)||(27799892-27799996)
chr5 (288-324)||(39322105-39322141)
chr5 (60-137)||(41833795-41833874)
chr5 (272-324)||(42576214-42576266)
chr5 (277-324)||(28411885-28411932)
chr5 (253-324)||(43557859-43557930)
chr5 (278-324)||(2713146-2713192)
chr5 (58-156)||(4026529-4026627)
chr5 (206-324)||(5303582-5303703)
chr5 (282-324)||(27386554-27386596)
chr5 (4-90)||(34039973-34040059)
chr5 (251-317)||(41808105-41808171)
chr5 (190-315)||(25938091-25938216)
chr5 (79-136)||(27553842-27553899)
chr5 (69-126)||(38341641-38341698)
chr5 (269-310)||(39668904-39668945)
chr5 (275-324)||(41200372-41200421)
chr5 (23-63)||(2788583-2788623)
chr5 (251-315)||(18350937-18351001)
chr5 (275-315)||(28186817-28186857)
chr5 (252-324)||(38830504-38830575)
chr5 (276-324)||(41108755-41108803)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-324)||(28085309-28085632)
chr6 (1-324)||(32755852-32756177)
chr6 (1-324)||(30031189-30031512)
chr6 (1-324)||(35043467-35043790)
chr6 (1-324)||(5258174-5258499)
chr6 (5-324)||(608096-608417)
chr6 (1-324)||(20427663-20427985)
chr6 (8-324)||(9706716-9707026)
chr6 (1-310)||(5631751-5632064)
chr6 (40-324)||(12890556-12890831)
chr6 (14-315)||(21351872-21352171)
chr6 (1-312)||(9593748-9594061)
chr6 (1-222)||(10099987-10100206)
chr6 (1-307)||(14030739-14031034)
chr6 (70-307)||(33496963-33497198)
chr6 (79-324)||(30679417-30679652)
chr6 (191-325)||(34143790-34143924)
chr6 (191-325)||(34156406-34156540)
chr6 (117-245)||(7133795-7133923)
chr6 (117-245)||(7136718-7136846)
chr6 (6-325)||(28026855-28027169)
chr6 (140-311)||(5080912-5081083)
chr6 (1-315)||(6055806-6056119)
chr6 (236-324)||(31818999-31819087)
chr6 (74-303)||(2689646-2689868)
chr6 (238-324)||(34934856-34934942)
chr6 (190-324)||(5095956-5096090)
chr6 (231-324)||(3206485-3206578)
chr6 (1-101)||(5080788-5080888)
chr6 (76-315)||(24665818-24666058)
chr6 (3-137)||(33083993-33084127)
chr6 (69-324)||(31818533-31818787)
chr6 (1-206)||(26291711-26291917)
chr6 (191-324)||(34531-34664)
chr6 (1-156)||(9568593-9568750)
chr6 (219-324)||(10098922-10099025)
chr6 (2-324)||(10617260-10617574)
chr6 (44-162)||(2079317-2079434)
chr6 (71-131)||(8364575-8364635)
chr6 (58-323)||(7513416-7513683)
chr6 (191-324)||(8364679-8364812)
chr6 (1-228)||(25493972-25494199)
chr6 (272-315)||(1615258-1615301)
chr6 (277-324)||(30789100-30789147)
chr6 (230-324)||(5897619-5897713)
chr6 (11-108)||(5095816-5095913)
chr6 (1-66)||(33998288-33998353)
chr6 (60-124)||(21870299-21870363)
chr6 (8-84)||(2065018-2065098)
chr6 (44-131)||(6641628-6641715)
chr6 (265-311)||(1911577-1911623)
chr6 (1-78)||(33496117-33496194)
chr6 (211-311)||(1747984-1748084)
chr6 (253-313)||(9568884-9568944)
chr6 (265-324)||(413280-413339)
chr6 (33-136)||(12134115-12134218)
chr6 (1-145)||(7150526-7150667)
chr6 (230-324)||(7492551-7492645)
chr6 (277-315)||(10453272-10453310)
chr6 (239-309)||(14389202-14389272)
chr6 (278-320)||(21886314-21886356)
chr6 (115-324)||(579465-579674)
chr6 (158-219)||(3963889-3963950)
chr6 (275-324)||(7337221-7337270)
chr6 (251-324)||(12133928-12134001)
chr6 (283-324)||(32068635-32068676)
chr6 (275-324)||(32080676-32080725)
chr6 (205-261)||(38900-38956)
chr6 (76-136)||(43266-43326)
chr6 (77-221)||(9749353-9749497)
chr6 (279-315)||(12119678-12119714)
chr6 (275-315)||(32945455-32945495)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-324)||(31401-31724)
scaffold0018 (60-137)||(44081-44158)
[»] chr2 (110 HSPs)
chr2 (1-324)||(8180713-8181036)
chr2 (1-324)||(3866005-3866328)
chr2 (1-324)||(36183384-36183707)
chr2 (1-324)||(38452712-38453038)
chr2 (1-324)||(3243679-3244000)
chr2 (1-324)||(38429817-38430140)
chr2 (1-324)||(4807525-4807851)
chr2 (56-324)||(2610576-2610844)
chr2 (8-324)||(12734641-12734956)
chr2 (89-324)||(451674-451909)
chr2 (1-323)||(41197254-41197577)
chr2 (39-324)||(25834650-25834934)
chr2 (1-324)||(11992134-11992455)
chr2 (1-324)||(41763069-41763390)
chr2 (1-324)||(45367651-45367973)
chr2 (110-324)||(7326186-7326400)
chr2 (9-310)||(18424417-18424716)
chr2 (140-324)||(28508750-28508934)
chr2 (1-325)||(23997550-23997859)
chr2 (75-324)||(24583657-24583907)
chr2 (1-324)||(38434884-38435208)
chr2 (185-324)||(35643065-35643204)
chr2 (1-324)||(6237779-6238103)
chr2 (125-311)||(39029638-39029824)
chr2 (69-313)||(12141545-12141789)
chr2 (1-324)||(9556395-9556717)
chr2 (172-324)||(31959625-31959777)
chr2 (53-324)||(43751973-43752244)
chr2 (237-324)||(227358-227445)
chr2 (69-324)||(18958908-18959167)
chr2 (230-324)||(30306194-30306288)
chr2 (188-324)||(45543099-45543234)
chr2 (210-324)||(9996652-9996766)
chr2 (8-137)||(16097199-16097332)
chr2 (230-324)||(38328396-38328488)
chr2 (1-324)||(4598588-4598913)
chr2 (34-324)||(41545372-41545661)
chr2 (64-137)||(43238306-43238379)
chr2 (37-321)||(37481646-37481930)
chr2 (192-324)||(43573156-43573287)
chr2 (77-324)||(44437747-44437994)
chr2 (56-317)||(13149319-13149581)
chr2 (1-183)||(7825291-7825475)
chr2 (73-313)||(12882082-12882317)
chr2 (248-324)||(3635349-3635425)
chr2 (1-227)||(23714384-23714607)
chr2 (1-227)||(24102056-24102279)
chr2 (239-324)||(9496037-9496122)
chr2 (107-324)||(42543274-42543491)
chr2 (239-325)||(19336918-19337004)
chr2 (44-136)||(11412697-11412789)
chr2 (268-324)||(12474953-12475009)
chr2 (32-168)||(13240927-13241063)
chr2 (3-65)||(2610463-2610525)
chr2 (165-324)||(35755271-35755434)
chr2 (18-147)||(40759049-40759179)
chr2 (69-313)||(6218968-6219210)
chr2 (164-320)||(13443938-13444094)
chr2 (253-324)||(39709227-39709298)
chr2 (194-324)||(37470159-37470289)
chr2 (191-315)||(26670891-26671015)
chr2 (71-215)||(32443668-32443812)
chr2 (10-121)||(30743565-30743675)
chr2 (191-324)||(33504346-33504480)
chr2 (1-262)||(42092452-42092711)
chr2 (1-183)||(45077681-45077870)
chr2 (53-106)||(227307-227360)
chr2 (38-127)||(19024150-19024239)
chr2 (69-324)||(3481145-3481410)
chr2 (69-237)||(13592411-13592577)
chr2 (280-324)||(17670680-17670724)
chr2 (158-313)||(19235021-19235176)
chr2 (152-320)||(21834638-21834806)
chr2 (53-137)||(38860158-38860242)
chr2 (56-312)||(43832087-43832342)
chr2 (5-135)||(19337069-19337194)
chr2 (262-324)||(9531626-9531688)
chr2 (70-176)||(11017316-11017422)
chr2 (270-324)||(12520088-12520142)
chr2 (76-145)||(14197367-14197437)
chr2 (98-324)||(26784366-26784592)
chr2 (255-324)||(3720441-3720510)
chr2 (191-324)||(19855585-19855718)
chr2 (196-313)||(33287549-33287666)
chr2 (225-305)||(30743686-30743766)
chr2 (81-137)||(41858744-41858800)
chr2 (98-145)||(907710-907757)
chr2 (197-308)||(7431931-7432042)
chr2 (242-324)||(11412881-11412966)
chr2 (270-321)||(23915722-23915773)
chr2 (1-42)||(451930-451971)
chr2 (251-324)||(8197567-8197640)
chr2 (251-324)||(8202327-8202400)
chr2 (275-324)||(19224988-19225037)
chr2 (284-324)||(522445-522485)
chr2 (70-134)||(41330131-41330195)
chr2 (280-315)||(17626284-17626319)
chr2 (277-324)||(19334178-19334225)
chr2 (277-323)||(887092-887138)
chr2 (241-323)||(9394657-9394739)
chr2 (270-324)||(19863436-19863490)
chr2 (270-324)||(19867768-19867822)
chr2 (270-324)||(19872669-19872723)
chr2 (279-313)||(25384680-25384714)
chr2 (254-324)||(45077915-45077985)
chr2 (191-313)||(45436965-45437087)
chr2 (103-176)||(43260439-43260512)
chr2 (56-136)||(12905082-12905162)
chr2 (268-324)||(42549863-42549919)
chr2 (71-143)||(44411715-44411787)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (25-312)||(986-1271)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (8-324)||(82661-82974)
scaffold0024 (259-324)||(48142-48207)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-311)||(4320-4621)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-311)||(86648-86956)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (196-324)||(25558-25686)
scaffold0157 (1-112)||(25683-25794)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (110-324)||(11575-11787)
scaffold0113 (1-136)||(11810-11947)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (140-323)||(4708-4891)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (177-324)||(16687-16834)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (218-324)||(481-587)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (58-313)||(7431-7685)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (207-313)||(14722-14828)
scaffold0199 (83-136)||(14626-14678)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (260-324)||(28915-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (191-324)||(58252-58385)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (72-136)||(11802-11866)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (230-310)||(39481-39561)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (262-322)||(16464-16524)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (212-324)||(160350-160462)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 155)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31960163 - 31959840
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960163 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31960064  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960063 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31959964  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959963 gaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 31959864  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  31959863 gatccatgtagccgaccccactta 31959840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52569864 - 52569541
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569864 gttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52569765  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569764 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52569665  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569664 gaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 52569565  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  52569564 gatccatgtagccgaccccactta 52569541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 4440788 - 4441109
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440788 gttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagag--tgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaa 4440885  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440886 aataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 4440985  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440986 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 4441085  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4441086 gatccatgtagccgaccccactta 4441109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 436162 - 436485
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436162 gttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 436261  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436262 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 436361  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  436362 gaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcattt 436461  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  436462 gatccatgtagccgaccccactta 436485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48174442 - 48174119
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48174442 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaa 48174343  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174342 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 48174243  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48174242 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcattt 48174143  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  48174142 gatccatgtagcagaccccactta 48174119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 33227142 - 33227462
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227142 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 33227241  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33227242 aataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagat 33227341  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33227342 gaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 33227441  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccac 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33227442 gatccatgtagccgatcccac 33227462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 56375223 - 56375546
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56375223 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaa 56375322  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375323 aacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 56375422  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56375423 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 56375522  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  56375523 gatccatgtagccgacctcactta 56375546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1777364 - 1777043
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1777364 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 1777267  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777266 aataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 1777167  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1777166 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcattt 1777067  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1777066 gatccatgtagccgaccccactta 1777043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33191197 - 33190877
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33191197 gttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 33191098  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33191097 aatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagag 33190998  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33190997 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 33190898  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccac 321  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  33190897 gacccatgtagccgaccccac 33190877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 53707727 - 53708033
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707727 gttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 53707826  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53707827 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 53707926  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53707927 gaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 53708026  T
Q  301 gatccat 307  Q
    |||||||    
T  53708027 gatccat 53708033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48622890 - 48622569
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48622890 gttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaa 48622793  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622792 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 48622693  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622692 gaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 48622593  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  48622592 aatccatgtagccgaccccactta 48622569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23906650 - 23906323
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag------tgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 94  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||     
T  23906650 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttt 23906551  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23906550 gtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaag 23906453  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906452 gtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 23906353  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23906352 tcatttgatccatgtagctgaccccactta 23906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 43433851 - 43434180
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag------agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 94  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43433851 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 43433950  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43433951 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 43434050  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  43434051 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcg 43434150  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43434151 tcatttgatccatgtagtcgagcccactta 43434180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46583160 - 46582862
Alignment:
Q  14 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46583160 agtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 46583061  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagacta-gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 212  Q
    || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46583060 gggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatga 46582963  T
Q  213 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46582962 aaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagc 46582863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 37797785 - 37798098
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797785 gttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37797884  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  37797885 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagag 37797983  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  37797984 gaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcattt 37798083  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||||    
T  37798084 gatcaatgtagccga 37798098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 324
Target Start/End: Original strand, 28236124 - 28236438
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28236124 ttggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaatagg 28236221  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  28236222 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagac 28236320  T
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||| |    
T  28236321 ctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatcta 28236420  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28236421 tgtagccgaccccactta 28236438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 50286904 - 50287217
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    |||||||||||||||||||||||||    
T  50286904 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagtagaaaagttggtagaa 50286994  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50286995 aatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaa 50287094  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  50287095 gaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatgg-gccattt 50287193  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  50287194 gatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47265551 - 47265221
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  47265551 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaa 47265452  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 193  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    |||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  47265451 aataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaaga 47265352  T
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     
T  47265351 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagt 47265252  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  47265251 gtaatttgatccatgtagccgacctcactta 47265221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39100872 - 39100562
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39100872 atgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggctta 39100775  T
Q  111 gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 210  Q
    |||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39100774 gatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctag 39100676  T
Q  211 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  39100675 gaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgta 39100576  T
Q  311 gccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||    
T  39100575 gccgaccccactta 39100562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27450522 - 27450206
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450522 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 27450429  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27450428 aataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaag 27450329  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  27450328 gaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacactatggcgtcattt 27450230  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  27450229 gatccatgtagccgaccccactta 27450206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 47 - 324
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708689
Alignment:
Q  47 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatg 146  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  147 ctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 246  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  247 ggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccactta 39708689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37773799 - 37773477
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37773799 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaag-gggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaa 37773701  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  37773700 aataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagat 37773601  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||    
T  37773600 gaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactatgacataattt 37773501  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| || ||||||| ||| ||||    
T  37773500 gatctatatagccgaccccgctta 37773477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 320
Target Start/End: Original strand, 27983142 - 27983445
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  27983142 gatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtag-------gctt 27983234  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 209  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27983235 agatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacata 27983334  T
Q  210 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
     |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27983335 agaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 27983434  T
Q  310 agccgatccca 320  Q
    |||||||||||    
T  27983435 agccgatccca 27983445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 304
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192269
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 159  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  160 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  260 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgatc 20192269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26037799 - 26037531
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||| || ||||    
T  26037799 agagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaa 26037700  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26037699 gaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatga 26037600  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26037599 gttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccactta 26037531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286695
Alignment:
Q  92 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  192 ga--------ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 283  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  284 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccactta 8286695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 324
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479294
Alignment:
Q  87 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  187 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 32479294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 1793424 - 1793718
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1793424 gataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 1793523  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac--- 228  Q
    ||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||   | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||       
T  1793524 gaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccat 1793621  T
Q  229 -aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1793622 taattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactta 1793718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 21236954 - 21237114
Alignment:
Q  164 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236954 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 21237053  T
Q  264 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  21237054 caaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccactta 21237114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20591607 - 20591353
Alignment:
Q  43 gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagta 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20591607 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcata 20591508  T
Q  143 gatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 242  Q
    ||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  20591507 gatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatt 20591413  T
Q  243 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  20591412 tagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41009699 - 41009414
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt-aga 99  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41009699 gttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaa 41009600  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  41009599 aaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtaga 41009500  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  41009499 ggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51421986
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||  || || ||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaa 51421763  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  302 atccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcactta 51421986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  119 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 218  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  219 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957854
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccactta 6957854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20601995 - 20601678
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20601995 gttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagttggtagaa 20601896  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| || ||||||||||||     
T  20601895 aataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaa 20601796  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  20601795 gaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaattt 20601702  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||| | || ||||||||    
T  20601701 gattcatgtaactgaacccactta 20601678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45205197 - 45204877
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  45205197 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtaga 45205098  T
Q  100 aaataggctt--agatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||   ||||    ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||    
T  45205097 aaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaa 45204999  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  45204998 agaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta- 45204900  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  45204899 ggcgtaatttgatctatgtagcc 45204877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494919
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccactta 12494919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12494683 - 12494794
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494683 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12494782  T
Q  101 aataggcttaga 112  Q
    ||||||||||||    
T  12494783 aataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1211732 - 1211418
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag-- 105  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || | | ||||||||||||| | |||||||||| |||||       
T  1211732 tggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagag--tgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatat 1211635  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||    
T  1211634 gcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaaga 1211535  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt-catttgatc 304  Q
    | ||||| |||||| ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||| |||||  |||||||     
T  1211534 cataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgatt 1211438  T
Q  305 catgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1211437 catgtagccgaccccactta 1211418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Original strand, 16002867 - 16003178
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |    
T  16002867 tggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtc 16002966  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || ||||||  |||||||| |||    
T  16002967 ttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaatacc 16003065  T
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
        |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  16003066 gtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaatttaatccat 16003165  T
Q  308 gtagccgatccca 320  Q
     ||  ||||||||    
T  16003166 ataagcgatccca 16003178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518365
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  299 ttgatccatg 308  Q
    ||||||||||    
T  53518374 ttgatccatg 53518365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 31458961 - 31459098
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgg--gtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31458961 gttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtag 31459060  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459061 aaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947193
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccactta 7947193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 54470140 - 54470463
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  54470140 gttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaa 54470239  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||||||||   |||||| |||  ||||| | |     
T  54470240 actagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaattactagaggcaaaa 54470339  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| | ||||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||  || || ||| |||||||||    
T  54470340 gaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcattattgcgtcattt 54470439  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  54470440 gatccatgtagccaaccccactta 54470463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 35690237 - 35690527
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||            ||    
T  35690237 gttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtag------------aa 35690324  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                     |||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  35690325 aataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaag---------------------aagagtggattagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagag 35690403  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    ||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  35690404 gaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggcgtaattt 35690503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528544
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccactta 21528544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821073
Alignment:
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| || ||| ||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaaca-ttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaac 20821073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 313
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548267
Alignment:
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 285  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagcc 4548267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862849
Alignment:
Q  189 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga-gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 50862849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 324
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969437
Alignment:
Q  245 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 19969437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351815
Alignment:
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| | || |||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccactta 28351815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 49987378 - 49987487
Alignment:
Q  18 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  49987378 gtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtt 49987477  T
Q  118 tgggcatgta 127  Q
    ||| ||||||    
T  49987478 tggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154889
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccactta 19154889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 28497452 - 28497598
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28497452 gataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtaga 28497550  T
Q  130 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 177  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28497551 gagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 46372008 - 46372280
Alignment:
Q  52 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 151  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||     
T  46372008 cattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgta 46372107  T
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
     |||||||||  ||||| || |||| ||| ||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  46372108 ctaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 46372207  T
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  46372208 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccactta 46372280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42639316 - 42639057
Alignment:
Q  54 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 153  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  42639316 ttagagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggt 42639217  T
Q  154 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 253  Q
    |||  | ||  || | ||||||| ||||||| | |  ||||||||||||| | |||| ||||||   |||||||| ||||  || ||| ||| | | |||    
T  42639216 aaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatcactagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaat 42639117  T
Q  254 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||||||  |||| |||| | |||||||||| ||||||||| | | || |||||||||    
T  42639116 gagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatggcgtcgtgtaattcatgtagcc 42639057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 260  Q
    || ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555764
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagtta 35555842  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 233  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||   || |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  35555841 ggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatta 35555764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44047697 - 44047568
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44047697 gttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaa 44047598  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047597 tctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 21106917 - 21107236
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    ||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||    
T  21106917 gttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtagaaaggatagt 21107016  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa---gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa-atggaggagagtcaagttaaaag 192  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||  | |   |    
T  21107017 tgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtcagatcactgg 21107116  T
Q  193 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
    | | || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  21107117 atgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgatagaactttatgg 21107216  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    | |  ||||||| |||||||    
T  21107217 cttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 33709852 - 33710024
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||| |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33709852 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatgg 33709951  T
Q  96 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    | |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  33709952 tggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatca 33710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31961503 - 31961292
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||  ||||||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  31961503 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaa 31961404  T
Q  213 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31961403 aaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  313 cgatcccactta 324  Q
    ||| | ||||||    
T  31961303 cgacctcactta 31961292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897517
Alignment:
Q  52 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 151  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    || || ||||| ||| | ||||||| ||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  252 atgagttgga 261  Q
    ||||||||||    
T  31897526 atgagttgga 31897517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 2589124 - 2589316
Alignment:
Q  120 ggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| | ||||||| ||||  ||    
T  2589124 ggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcat 2589223  T
Q  220 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
     |||||||| || |  | |||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2589224 aagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagc 2589316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 50662353 - 50662497
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-tttgggcatgtagag 130  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50662353 gataggattggaaatgacagcattagagagag--tttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagag 50662450  T
Q  131 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 177  Q
    |||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  50662451 agaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaagga 50662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51252791 - 51252635
Alignment:
Q  18 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||     
T  51252791 gtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggta 51252694  T
Q  118 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  51252693 tgggcatgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7092561 - 7092360
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||  ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  7092561 tggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagtagaaaatatgatagaaaataggt 7092463  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    | ||||||| ||||||||||    
T  7092462 ttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcagaacataagaggtggaggaagacc 7092363  T
Q  208 tag 210  Q
    |||    
T  7092362 tag 7092360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 281
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680953
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 131  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa-caa 230  Q
    |||| || |||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  |     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 281  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811305
Alignment:
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 285  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccactta 51811305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25257928 - 25257722
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |   |||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  25257928 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaa 25257831  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
      ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||  ||| | |  |||||||| |    
T  25257830 gctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggaggggacacaaatcactagaggtaggg 25257731  T
Q  201 gaagaccta 209  Q
    |||||||||    
T  25257730 gaagaccta 25257722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 56225005 - 56225324
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |  || ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  56225005 tggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaag--ttgggataatacctatagtataaaagatggtagaaaata 56225102  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||     |||||| ||| ||| | |||||  |||| ||||||||||||| | | || | || ||||| |||    
T  56225103 ggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtctaatcaagaaagttagagaaag 56225202  T
Q  205 acctagga--aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    | |||  |  ||||||| || | ||| ||||  || | ||||||||| ||| | || ||||||||| |||| | | |||||||||||||  || ||||||    
T  56225203 atctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttga 56225302  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| | ||| ||||||||    
T  56225303 tccatgtggtcgaccccactta 56225324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 324
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209290
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 204  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  205 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 304  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  305 catgtagccgatcccactta 324  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  10209271 caagtagccgaccccactta 10209290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 41192767 - 41192918
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  41192767 gttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtgg 41192866  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 150  Q
    ||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41192867 aaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagattctgt 41192918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339780
Alignment:
Q  52 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 151  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| | ||| ||||||||| ||   |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    ||||       || ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgag----aatt-------atctagagatta 31339707  T
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccactta 31339780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 17900413 - 17900549
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17900413 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaa 17900512  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17900513 actagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38571072 - 38570960
Alignment:
Q  25 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38571072 tagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagtggaaactaggcttaggtggtttgggcat 38570973  T
Q  125 gtagagagaagac 137  Q
    ||||| |||||||    
T  38570972 gtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  45 atgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 144  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  145 tgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19062015 - 19061964
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19062015 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 19061964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043328
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |     
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcata 31043300  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| || ||| || ||||||||    
T  31043301 atttgatccttgcagctgaccccactta 31043328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34233382 - 34233059
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaa-gttggta 97  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||      
T  34233382 gttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtagaaaaagttggg- 34233284  T
Q  98 gaaaataggcttaga-------tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||||||        |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||  | |      
T  34233283 gaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatcgtcagatcact 34233184  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||| | |    
T  34233183 agaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgt 34233084  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  34233083 agcgtaatttgatccatgtagccga 34233059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Original strand, 29398822 - 29398967
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 171  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || || ||||| || |  ||    
T  29398822 tagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggat 29398921  T
Q  172 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 217  Q
     ||||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29398922 agaggatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaact 29398967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 324
Target Start/End: Original strand, 55579040 - 55579287
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 174  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    || ||| ||| ||| |||||||  ||   |||||    
T  55579040 cacctatagt-gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatgga 55579138  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 274  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| |||   || |||||| ||||  |||||||||||  |||   |||     
T  55579139 ggagagtcaaatcaaaagaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtt 55579238  T
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55579239 tatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccactta 55579287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621409
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 324
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459250
Alignment:
Q  155 agaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 254  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | ||||    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagacctagaaaaactattag-----------gaaag-atttagagattaatg 31459180  T
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  31459181 agttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285729
Alignment:
Q  78 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || |||||||  |||| | ||||||     
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatc-agtggaggg 42285874  T
Q  178 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 277  Q
    ||||||  | |  |||||| | || |||||||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |    
T  42285873 gagtcagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctat--aagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttttt 42285776  T
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  42285775 gatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccactta 42285729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 324
Target Start/End: Original strand, 44360076 - 44360342
Alignment:
Q  57 gagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 156  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||  || || | ||| |||||    
T  44360076 gagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaacta-gattaggttgtttgggcatgtagagagaagacatgtggacgatgtagtaag 44360174  T
Q  157 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 256  Q
     | | | ||||| ||||||| ||| ||| | |  || |   |  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |  |||||| | |||| |||||||    
T  44360175 gataatagatcatatggaggggaggcaaatcactagtgcctggagaagacttagaaaaactattagagaaactgtcaagaaggatcttgaggccaatgag 44360274  T
Q  257 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||   | |   ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44360275 ttggagaaagacacggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 44360342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 324
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372907
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 192  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||| | ||||||||| ||| | | |||||  |||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  193 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||  || |||  |||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgtagcccatcccactta 47372907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939760
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 49939760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540544
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||| | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccact 53540544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41009361 - 41009283
Alignment:
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||    
T  41009361 taggtaaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Original strand, 2588992 - 2589120
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| |||||    
T  2588992 gggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatca 2589090  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
     ||||||| |||| || |||  ||||||||    
T  2589091 gatggaggggagttaaattactagaggtag 2589120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208309
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgta 34208309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  249 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008002
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 55008002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31403369 - 31403234
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga----gtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    ||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31403369 gttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctatagtagaaaa-atggt 31403271  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31403270 ggaaactaggcttaggtgg-ttgggcatgtaaagagaa 31403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43070113 - 43070053
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 61  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43070113 gttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557708
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta- 289  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||     
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagcc 2557708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666135
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 258  Q
    | |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagtt 17666135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611796
Alignment:
Q  82 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 47611796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36557347 - 36557246
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557347 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagaga 36557249  T
Q  132 gaa 134  Q
    |||    
T  36557248 gaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10775771 - 10775654
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||| | ||  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10775771 gttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtagaaaagatggtagaa 10775672  T
Q  101 aataggcttagatggttt 118  Q
    | ||| | ||| ||||||    
T  10775671 actagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21945846 - 21945678
Alignment:
Q  142 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 241  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||    
T  21945846 agattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagat 21945747  T
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    || ||  | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||    
T  21945746 ttggaaattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagcc 21945678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40018477 - 40018215
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| || || | ||      
T  40018477 agagagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagacttgtatattctatagt-- 40018380  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
        ||| ||||| ||| |||  |||||| | |  ||||| | |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| |||||||    
T  40018379 ----agtagatcagatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaataaagacttagaaaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatga 40018284  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||    || || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40018283 gttggatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccactta 40018215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 50471493 - 50471595
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||   |  |||||||||  |||||||||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  50471493 ataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagag 50471590  T
Q  133 aagac 137  Q
    |||||    
T  50471591 aagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Original strand, 5306464 - 5306540
Alignment:
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5306464 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagc 5306540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20105616 - 20105544
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20105616 atgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcactta 20105544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  174 aggagagtc 182  Q
    |||||||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427888
Alignment:
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccactta 25427888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25755250 - 25755425
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtaga 99  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || |||| | |||||  |||||||||||||  ||||||||   ||| ||    
T  25755250 gttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaatagaaa-agagttggggtagcacctatcttagaaaagaaaggtgga 25755348  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25755349 aaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagg 25755425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 25967616 - 25967552
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25967616 gttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550480
Alignment:
Q  221 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  |||||   | |||||||| ||||||| || ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  321 cttat 325  Q
    |||||    
T  28550484 cttat 28550480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 313
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488336
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| |||| ||||  |||||||| || ||||||||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgta 37488319  T
Q  297 atttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||||||||||||||    
T  37488320 atttgatccatgtagcc 37488336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38904036 - 38903925
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||||||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38904036 ataggattaggaat-acaatattaccgagagactctgggtagcaccgatcatagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagag 38903938  T
Q  133 aagactagtagat 145  Q
    |||||| ||||||    
T  38903937 aagacttgtagat 38903925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45185295 - 45185215
Alignment:
Q  82 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 162  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  45185295 agtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagt 45185215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 320
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443347
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatccca 12443347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633432
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccactta 32633432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 183
Target Start/End: Original strand, 38266134 - 38266261
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  38266134 agagagagagttagggtagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataa 38266233  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  38266234 ggagagtagatcgtatggaggatagtca 38266261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Original strand, 45175997 - 45176083
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45175997 agagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287988
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || | ||||||| || |||||| |    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtc 50288000  T
Q  294 gtcatttgatcc 305  Q
    || |||| ||||    
T  50287999 gtaatttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 178
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605307
Alignment:
Q  112 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggaggag 20605307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987645
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| | ||||  |||||||| || |||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattat 49987630  T
Q  291 ggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||||| |||| ||||    
T  49987631 ggcgtaattttatcc 49987645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238641
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 50238641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238727
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 50238727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284395
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctactta 8284395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575068
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagc 25575068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 312
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486165
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209201
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccactta 29209201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 56439714 - 56439597
Alignment:
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  56439714 ctagaaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatcca 56439615  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  56439614 tatagccaaccccactta 56439597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024876
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  312 ccgatcccactta 324  Q
    |||| | ||||||    
T  26024888 ccgacctcactta 26024876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860914
Alignment:
Q  84 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaaga 44860914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 49738885 - 49738817
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||    
T  49738885 gggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagac 49738817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Original strand, 1380346 - 1380433
Alignment:
Q  47 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||| |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||  || |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1380346 gacaacattagagagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgatagaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaa 1380433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 324
Target Start/End: Original strand, 13296566 - 13296689
Alignment:
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||| ||  | ||||||||||| | ||||  |||||||| |  |||| ||| |||| ||||    
T  13296566 gaagacctaggaaagctattagagatactattagacaagatttggaaattaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaattt 13296665  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||| |||||| | ||||||    
T  13296666 gatgcatgcagccgacctcactta 13296689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 18966486 - 18966541
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta 56  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966486 gttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36255603 - 36255548
Alignment:
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36255603 ttggtgaatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccactta 36255548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6958310 - 6958264
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  6958310 gatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctactta 6958264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 324
Target Start/End: Original strand, 29398990 - 29399060
Alignment:
Q  254 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  29398990 gagttggaacgaaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccactta 29399060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30621331 - 30621241
Alignment:
Q  220 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| | |||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  30621331 tagagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42293528 - 42293470
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42293528 gtagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtaga 42293470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 883433 - 883388
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  883433 tgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccact 883388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1965708 - 1965663
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1965708 tatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatccca 1965663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661898
Alignment:
Q  283 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 15661898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209231
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccactta 45209231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 934784 - 934649
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||| || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||  | |||||| ||||||||    
T  934784 gttgcgttggctgtgtggtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaagatggtagaa 934686  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | |   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  934685 actcatcttaggtggtttgggcaagtagagaggagac 934649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21214824 - 21214792
Alignment:
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagact 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21214824 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagact 21214792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 29182498 - 29182570
Alignment:
Q  84 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 156  Q
    |||||||| || || ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  29182498 tagaaaagatgctacaaactaagcttaggtggtttaggcatgtagagagaaaaccggtagattctgtggtaag 29182570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 34379586 - 34379657
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  34379586 aatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaacttgat-catgtagccgaccccactt 34379657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042690
Alignment:
Q  216 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  316 tcccactta 324  Q
     || |||||    
T  37042698 cccgactta 37042690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40932999 - 40932951
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  40932999 tatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccactt 40932951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Original strand, 41192244 - 41192308
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  41192244 aatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccga 41192308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Original strand, 47147496 - 47147613
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  | || || | |||||||||||| |||    
T  47147496 agaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattat 47147593  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  47147594 ggcattgtttgatccatgta 47147613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 159)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 1210678 - 1211001
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210678 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 1210777  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210778 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 1210877  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210878 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 1210977  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1210978 gatccatgtagccgaccccactta 1211001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30202479 - 30202156
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30202479 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaa 30202380  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30202379 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagag 30202280  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202279 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 30202180  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  30202179 gatccatgtagccgaccccactta 30202156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34792698 - 34792375
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792698 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 34792599  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792598 agtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 34792499  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34792498 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcattt 34792399  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  34792398 gatccatgtagccgaccccactta 34792375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49347742 - 49347419
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49347742 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaa 49347643  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347642 aataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 49347543  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347542 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 49347443  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  49347442 gatccatgtagccgaccccactta 49347419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 8671853 - 8672174
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671853 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8671950  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671951 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 8672050  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8672051 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 8672150  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||    
T  8672151 gatccatatagccaaccccactta 8672174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 9592667 - 9592990
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9592667 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaa 9592766  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592767 aataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 9592866  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9592867 gaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 9592966  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  9592967 gatccatgtagccgaccccactta 9592990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Original strand, 22090032 - 22090350
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090032 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 22090131  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22090132 aggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaa 22090231  T
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22090232 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgat 22090331  T
Q  304 ccatgtagccgatcccact 322  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  22090332 ccatgtagccgaccccact 22090350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51441114 - 51440791
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51441114 gttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaa 51441015  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51441014 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagag 51440915  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51440914 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcattt 51440815  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||    
T  51440814 gattcatgtaaccgaccccactta 51440791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32231303 - 32230997
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32231303 gttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaa 32231204  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32231203 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 32231104  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  32231103 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaattt 32231004  T
Q  301 gatccat 307  Q
    |||||||    
T  32231003 gatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 51601991 - 51602312
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51601991 gttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 51602088  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602089 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 51602188  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51602189 gaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcattt 51602288  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  51602289 gatccatgtagccaaccccactta 51602312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43240730 - 43240405
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  43240730 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatag 43240631  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43240630 aaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtag 43240531  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240530 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 43240431  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  43240430 ttgattcatgtagccgacctcactta 43240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 696202 - 696526
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696202 gttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 696301  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  696302 aataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 696401  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta-tggcgtcatt 299  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  696402 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatt 696501  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  696502 tgatcaatgtagccgaccccactta 696526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4001804 - 4001481
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4001804 gttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 4001705  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4001704 aataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 4001605  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||    
T  4001604 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcattt 4001505  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  4001504 gatccatgtagccaaccccactta 4001481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029378
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  158 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  258 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccactta 4029378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 8391705 - 8392028
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391705 gttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8391804  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |     
T  8391805 aataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatat 8391904  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||    
T  8391905 gaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcattt 8392004  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  8392005 gatccatgtagccaaccccactta 8392028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32083094 - 32082782
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083094 gttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 32082995  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32082994 aataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 32082895  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc-gtcatt 299  Q
    ||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  32082894 gaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatt 32082807  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  32082806 tgatccatgtagccgaccccactta 32082782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 15085867 - 15086178
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15085867 gttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 15085966  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15085967 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagag 15086066  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| ||            |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15086067 gaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcattt 15086154  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  15086155 gatccatgtagccaaccccactta 15086178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979257
Alignment:
Q  86 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 185  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 25979257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38808023 - 38807697
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38808023 gttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 38807925  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||| |    
T  38807924 agaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagct 38807825  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  38807824 aggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgta 38807725  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38807724 atttgttccatgtagccgaccccactta 38807697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 9509251 - 9509565
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9509251 gttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaa 9509350  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9509351 aataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagag 9509450  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||   |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||     
T  9509451 gaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattc 9509550  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||    
T  9509551 gatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311781
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 37311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37463214 - 37462902
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37463214 ttggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagag--agagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaatagg 37463117  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc-aagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||| ||||||||||   || |||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |   |||||||||||||||  |    
T  37463116 cttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggatta 37463020  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  37463019 cctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatcc 37462921  T
Q  306 atgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  37462920 atgtagccgaccccactta 37462902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9599743 - 9599432
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9599743 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaa 9599644  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||  | ||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  9599643 aataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagag 9599544  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| || |||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  9599543 gaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaattt 9599444  T
Q  301 gatccatgtagc 312  Q
    ||||||||||||    
T  9599443 gatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 131 - 315
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318376
Alignment:
Q  131 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 230  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga 39318376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 324
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921336
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 52921336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27848153 - 27847826
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27848153 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaa 27848055  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  27848054 aataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtagag 27847955  T
Q  201 gaagacc-taggaaaactattagagaaacaatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||| | | |||| ||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| |||| |||    
T  27847954 gaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgccgt 27847855  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27847854 aattttatccatgtagccgatctcactta 27847826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18469427 - 18469108
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  18469427 tgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagag--ttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaa 18469330  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    |||| |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||   | |||||||||||| ||    
T  18469329 taggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatga 18469230  T
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||||| || |||||     
T  18469229 agacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttgg 18469130  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | ||||||| ||| ||||||||    
T  18469129 ttcatgtagacgaccccactta 18469108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 39140484 - 39140771
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39140484 gataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagaga 39140583  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||||||   || ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||   |||  |||  |||  ||||||| ||    
T  39140584 gaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactat 39140678  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39140679 taggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccactta 39140771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32404837 - 32404552
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| || |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  32404837 attagaaacgacaacattcgagagtgagt-tgggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagac 32404739  T
Q  138 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaa 237  Q
      |||||| || | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32404738 ctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaa 32404639  T
Q  238 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||||||| | ||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32404638 agatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 32404552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561615
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| |||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  298 tttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccactta 52561615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544849
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| || | ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     | ||||| ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtcaa-acactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatga 2544780  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 2544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431425
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||| |||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatca 48431588  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgga 261  Q
     |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| |        |||||||||||    
T  48431587 gatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgga 48431488  T
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  48431487 tccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccactta 48431425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869138
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 143  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  144 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 243  Q
    || || | |  || ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  244 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || | | |||| |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccactta 38869138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 43423650 - 43423866
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggt--aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  43423650 gttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtgg 43423749  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||  | |||||    |||||| | |  ||||||||    
T  43423750 aaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactagaggtag 43423849  T
Q  199 aggaagacctaggaaaa 215  Q
    |||||||||||| ||||    
T  43423850 aggaagacctagaaaaa 43423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623941
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcatgtcgaga 36624086  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||||||| |||     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||            ||||||||| ||    
T  36624085 gaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagagaaactat 36624003  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc 36623941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079204
Alignment:
Q  218 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 317  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  318 ccactt 323  Q
    ||||||    
T  32079209 ccactt 32079204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415596
Alignment:
Q  175 ggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  274 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccga 4415596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707247
Alignment:
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccactta 4707247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 6025569 - 6025861
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  6025569 gataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaaacgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacaga 6025668  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||| ||   | ||| ||    |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |     
T  6025669 gaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactag 6025768  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6025769 taaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccactta 6025861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416627
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||||| ||| |||| |||||  | |  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||| || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||| ||||||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccactta 40416627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34827451 - 34827205
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||   ||||   |||||||  ||||||| | ||||| || |||| ||||||||    
T  34827451 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaaagatggtagaa 34827354  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||   |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||| || |  || ||    
T  34827353 aataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttagaaaaaataaag 34827254  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt 249  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34827253 gaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 291
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478900
Alignment:
Q  83 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 182  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  183 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 282  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatggt-tatgatag 478891  T
Q  283 aacactatg 291  Q
    || ||||||    
T  478892 aatactatg 478900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560485
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 41560485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3819150 - 3818891
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||    
T  3819150 agagagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaa 3819051  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
      ||||| ||||| |||||||  | ||||   |  ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | |||||    
T  3819050 agagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatga 3818951  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||  |||| |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  3818950 gttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccga 3818891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020294
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactt 24020294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  111 gatggttt 118  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338958
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||| | |||  | |  ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    | | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 5338958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Original strand, 1661405 - 1661499
Alignment:
Q  43 gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1661405 gaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812625
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||| ||| |||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatca 51812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828717
Alignment:
Q  31 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  131 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    |||||||   |||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtca 35828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263523
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||  ||||    
T  37263332 gggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatca 37263431  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
     ||||||| | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263432 gatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751740
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcactta 44751740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 324
Target Start/End: Original strand, 28528385 - 28528611
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |    ||| |||    
T  28528385 gaaactagacttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagta 28528484  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    | ||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  28528485 ggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcg 28528584  T
Q  298 tttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28528585 tttgattcatgtagccgaccccactta 28528611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423242
Alignment:
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 46423242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762484
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||  |||| ||| | ||| || |  | ||||||| ||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagata 7762590  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
     |    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  7762589 aaaagggacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaa 7762490  T
Q  298 tttgat 303  Q
    ||||||    
T  7762489 tttgat 7762484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200332
Alignment:
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  315 atcccactta 324  Q
    | | ||||||    
T  10200341 acctcactta 10200332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129040
Alignment:
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || || ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  304 -ccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccactta 29129040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577508
Alignment:
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 29577508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14226171 - 14226047
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||  |    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  14226171 gttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagag--ttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaaatag 14226074  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14226073 gcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894934
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
       ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || | ||   ||||||||   | |||||| ||||||||| |    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaaaa 39894916  T
Q  206 cctaggaaaactattaga 223  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39894917 cctagaaaaactattaga 39894934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 323
Target Start/End: Original strand, 40419603 - 40419893
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||| || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40419603 gatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagtagaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaga 40419702  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||||||  || |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||| |  | |  |||||||| || |||| ||| ||| ||||   |||||| ||    
T  40419703 gaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatggaggggagttagataactagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactat 40419802  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  40419803 tatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagatcactatggcgtcgttt-attcatgtagccgaccccactt 40419893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337812
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccactta 42337812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941802
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 44941802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511827
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || || || ||| | ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccactta 28511827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272861
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
     || | ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||  ||||| || | ||||||| | ||| || | |||| |||||||||||| |||| | |      
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaattattatgaaatatttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatat 16272874  T
Q  298 tttgatccatgta 310  Q
    |||||||||||||    
T  16272873 tttgatccatgta 16272861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 26016370 - 26016693
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26016370 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatgagaaaagatggtagaa 26016469  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |  || |||| | ||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||  | |  |||||||       
T  26016470 actagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcagatcactagaggtaaga 26016569  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | || ||||||| | ||||||| |||    
T  26016570 gtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaacattgtggcgtcgttt 26016669  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  26016670 gatacatgtagctgagcccactta 26016693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532642
Alignment:
Q  221 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  321 ctta 324  Q
    ||||    
T  52532645 ctta 52532642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676897
Alignment:
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg---tatgatagaacactatggcg 294  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | ||||||     
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggca 8676918  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccga 315  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8676917 taatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 324
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796465
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||  |||  |||||||| |||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  298 tttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccactta 8796465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637720
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc-- 167  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  168 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    | ||||||  ||| ||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttgga 27637720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090720
Alignment:
Q  258 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 28090720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827699
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatca 13827752  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 221  Q
     |||||  | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13827751 tatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299283
Alignment:
Q  170 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 266  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaa 26299283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36339842
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||  ||| ||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaa 36339998  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    |  | || ||||| |||||||| |   |  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  36339997 ggcgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatga 36339899  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||   |||  ||||  |||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  36339898 gttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagc 36339842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142019
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908061
Alignment:
Q  18 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  118 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa--- 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||   |||| |||||| | || ||  | |  | ||||||||| |||| ||| |||       
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  215 --actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
      ||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  313 cgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||||    
T  19908072 cgaccccactta 19908061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 315
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936707
Alignment:
Q  220 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccga 19936707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568436
Alignment:
Q  249 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccactta 40568436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 307
Target Start/End: Original strand, 52832037 - 52832284
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||   ||    
T  52832037 agagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagag 52832136  T
Q  160 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||| ||| | |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||    
T  52832137 agtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttg 52832236  T
Q  260 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     || ||||| | || |  ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  52832237 aatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccat 52832284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5113990
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 5113990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 286
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattta 244  Q
     || |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27520378 - 27520233
Alignment:
Q  181 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 278  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  27520378 tcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatg 27520279  T
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  27520278 atagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 286
Target Start/End: Original strand, 41611806 - 41612024
Alignment:
Q  68 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 167  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||| |||     
T  41611806 tgggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatt 41611905  T
Q  168 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
    |||| ||||   ||||    || ||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||    
T  41611906 aaatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaa 41612005  T
Q  268 tttggtgtatgatagaaca 286  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  41612006 tatggtttatcatagaaca 41612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941619
Alignment:
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  298 tttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtag 11941619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 28533674 - 28533723
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28533674 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 28533723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 324
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501364
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||  |||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    | |||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||  ||||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  42501343 tccatgtagccgaccctactta 42501364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18793337 - 18793201
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||  ||||||  ||||| |||||| ||  |||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  18793337 gttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaa 18793238  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  18793237 actagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 109092 - 109021
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||||||||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  109092 aatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcctgtcccact 109021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084217
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgta 6084217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936571
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19936455 gttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaaagatggtagaa 19936546  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  19936547 aataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777286
Alignment:
Q  282 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 3777286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 4379938 - 4380081
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--------gggtagcacctatagtagaaaagt 92  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||        |||||||| ||||||||||||||     
T  4379938 gttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactatagtagaaaaga 4380037  T
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380038 tggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877369
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccactta 38877369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32112068 - 32112015
Alignment:
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32112068 ggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccactta 32112015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444612
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactta 34444612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375624
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccactta 43375624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Original strand, 50806765 - 50806919
Alignment:
Q  164 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||  |||| | |||| |||||||     
T  50806765 gatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagattaatgcgttggata 50806862  T
Q  264 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||    
T  50806863 aaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgacccca 50806919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343071
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827930
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 17815408 - 17815537
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| || |||| | |||||| |||| |||    
T  17815408 gttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagaga-tgagg-taggacttataatggaaaagatggtggaa 17815504  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815505 actaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769737
Alignment:
Q  260 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 21769737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 29807984 - 29808112
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| || |  | || |||||| ||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  29807984 tagaagaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcga 29808083  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29808084 catttgattcatgtagccgattccactta 29808112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342969
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggat 8342969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30834015
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 212  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||| || |  |||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||||||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  213 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    || |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtagc 30834015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  223 agaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865735
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  48865818 gatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccact 48865735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878328
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  | | |||||||||||  ||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgatagaacttta 52878360  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    | | || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  52878359 tagtgtaatttgattcatgtaaccgataccac 52878328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900682
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 246
Target Start/End: Original strand, 10272259 - 10272436
Alignment:
Q  68 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||  || ||| | || | ||| ||||  ||||    
T  10272259 tgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgtggattc-gtaggaaggagaggagatc 10272357  T
Q  168 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 246  Q
    | ||||| | ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  10272358 agatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctaga 10272436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930337
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccactta 12930337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 17275180 - 17275262
Alignment:
Q  52 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | || |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275180 cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtggaaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072522
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 27072522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 324
Target Start/End: Original strand, 27704156 - 27704206
Alignment:
Q  274 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27704156 gtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgctta 27704206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2429704 - 2429655
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2429704 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccactta 2429655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 14557751 - 14557824
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| | |||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  14557751 aatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccactta 14557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17269019
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 17269019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715352
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | | |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcactta 25715352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577169
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattat 29577203  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  29577202 ggcataatttatttcatgtagccaaccccactta 29577169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510859
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 45510859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990672
Alignment:
Q  77 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||    
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagac 990672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290059
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccact 1290059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16142228 - 16142172
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 62  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16142228 gttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 137
Target Start/End: Original strand, 16943160 - 16943243
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943160 attagggagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40920886 - 40920822
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  40920886 gttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagagag 40920822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 324
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165538
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 41165538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 41611105 - 41611181
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcac 77  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  41611105 gttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771673
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  213 aaactattagagaaacaatta 233  Q
    ||||||| || ||||| ||||    
T  50771693 aaactataagcgaaactatta 50771673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318871
Alignment:
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 4318871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4590605 - 4590558
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4590605 tgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 4590558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203223
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttgga 8203223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331247
Alignment:
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  304 ccat 307  Q
    ||||    
T  11331250 ccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489268
Alignment:
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  304 ccat 307  Q
    ||||    
T  11489271 ccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19908718 - 19908655
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  19908718 ttgcgttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagag 19908655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  94 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 324
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257826
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactta 50257826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  76 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 9602204 - 9602286
Alignment:
Q  128 gagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  9602204 gagagaagactagtagattgtgtagtaagaagagaagatcagatagagggtagtcaaattgcaagaggcagaggaagacctag 9602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16822289 - 16822235
Alignment:
Q  83 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16822289 gtagacaagatggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26113519 - 26113465
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26113519 tggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcactta 26113465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388470
Alignment:
Q  84 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 162  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagt 46388470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Original strand, 7083097 - 7083134
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7083097 tatgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagc 7083134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7133401 - 7133328
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  7133401 aatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccactta 7133328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569267
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgt 10569267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225862
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccactta 14225862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908410
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttat 19908444  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||  ||||||||||||| | || ||||||||    
T  19908443 tgcgtagtttgatccatgtacctgaccccactta 19908410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 324
Target Start/End: Original strand, 26299287 - 26299324
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26299287 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 26299324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37294183 - 37294146
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37294183 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 37294146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42539339 - 42539238
Alignment:
Q  224 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca-ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42539339 gaaacaattaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccact 42539240  T
Q  323 ta 324  Q
    ||    
T  42539239 ta 42539238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175401
Alignment:
Q  264 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccactta 22175401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23791925 - 23791857
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23791925 gggtaggacccatggtagaaaagatggtagatactaaacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 23791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29578218 - 29578163
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  29578218 agagagagagt-tggctagcacctatagtagaaaaaatggtggaaaatgggcttaga 29578163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39123443 - 39123403
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  39123443 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 39123403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39422359 - 39422209
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||    
T  39422359 gatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaagatagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagaga 39422262  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 184  Q
    ||||||  ||||||  ||| || || ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  39422261 gaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaa 39422209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46226532 - 46226380
Alignment:
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca-agttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  46226532 ttaggtggtttggacttgtagagagaatacaaatagatgatgtggtatgaagagtagatcatatagagaggagtcagatcaaaaagaggtagaagaagac 46226433  T
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
     ||| ||||| || || ||||| ||||  ||  ||||| |||| |||||||||    
T  46226432 ttagaaaaaccataagtgaaactattatgaaatatttataggttaatgagttg 46226380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52073123 - 52073075
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  52073123 tatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccactt 52073075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 152)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 324
Target Start/End: Original strand, 49029213 - 49029532
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029213 cgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 49029312  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029313 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 49029412  T
Q  205 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029413 acctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 49029512  T
Q  305 catgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  49029513 catgtagccaaccccactta 49029532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 34869353 - 34869667
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869353 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 34869452  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34869453 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagag 34869552  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869553 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 34869652  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||    
T  34869653 gatccatgtagccga 34869667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 37617877 - 37618201
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37617877 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37617976  T
Q  101 aa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37617977 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 37618076  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37618077 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatt 37618176  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  37618177 tgatccatgtagccgaccccactta 37618201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35906550 - 35906227
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906550 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 35906451  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906450 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 35906351  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906350 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 35906251  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  35906250 gatccatgtagccgaccccactta 35906227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 11593893 - 11594216
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593893 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 11593992  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593993 aatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 11594092  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594093 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 11594192  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  11594193 gatccatgtagccgaccccactta 11594216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12841624 - 12841301
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841624 gttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12841525  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841524 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 12841425  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12841424 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcattt 12841325  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  12841324 gatccatgtagccgaccccactta 12841301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39906717 - 39906398
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906717 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 39906618  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39906617 taggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggag--gagtcaagttaaaagaggtagagga 39906520  T
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906519 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 39906420  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  39906419 tccatgtagccgaccccactta 39906398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33350155 - 33349832
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33350155 gttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaa 33350056  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350055 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 33349956  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  33349955 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcattt 33349856  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  33349855 gatccatgtagccgacctcactta 33349832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13859357 - 13859061
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13859357 gttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 13859258  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859257 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagag 13859158  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13859157 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46356205 - 46355882
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356205 gttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 46356106  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356105 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 46356006  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  46356005 gaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcattt 46355906  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  46355905 gatccatgtagccgaccccactta 46355882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375124
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  133 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 6375124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44855514 - 44855200
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855514 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 44855415  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44855414 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaagacc 44855315  T
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44855314 taggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtccat 44855217  T
Q  308 gtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  44855216 gtagccgaccccactta 44855200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45836829 - 45836508
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836829 gttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 45836730  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  | |||||||||    
T  45836729 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt--atgaggtagag 45836632  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45836631 ggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcattt 45836532  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  45836531 gatccatgtagccgaccccactta 45836508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 36651927 - 36652248
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  36651927 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaggg--taggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaa 36652024  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36652025 aataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagag 36652124  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36652125 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 36652224  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  36652225 gatccatgtagccgaccccactta 36652248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 43281609 - 43281930
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281609 gttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 43281706  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43281707 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 43281806  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43281807 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 43281906  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  43281907 gatccatgtagccgaccccactta 43281930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 31005156 - 31005430
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005156 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31005255  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005256 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31005355  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31005356 gaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt 31005430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35559343 - 35559031
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35559343 gttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtaga 35559244  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559243 aaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 35559144  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| || |||||    
T  35559143 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatt 35559044  T
Q  300 tgatccatgtagc 312  Q
    |||||||||||||    
T  35559043 tgatccatgtagc 35559031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682628
Alignment:
Q  68 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  168 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 31682628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650640
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  133 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 232  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 29650640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 43491248 - 43491564
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43491248 tggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggc 43491347  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43491348 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacc 43491447  T
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||  || |||| ||||||    
T  43491448 taggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccat 43491547  T
Q  308 gtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  43491548 gtagccgaccccactta 43491564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 38606938 - 38607248
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38606938 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaa 38607036  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  38607037 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagag 38607136  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  38607137 gaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgttt 38607224  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  38607225 gatccatgtagccgactccactta 38607248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 71 - 324
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349876
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccactta 22349876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885748
Alignment:
Q  54 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 153  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  154 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 253  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaat 2885819  T
Q  254 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2885818 gagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 2885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33072887 - 33073108
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072887 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 33072984  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33072985 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagag 33073084  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagag 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  33073085 gaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869286
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 36869286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 23404351 - 23404664
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23404351 gttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaa 23404450  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  23404451 aataggcttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaa 23404549  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  23404550 gaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatggtgtaattt 23404649  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
     |||| | |||||||    
T  23404650 tatccgtatagccga 23404664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 324
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682430
Alignment:
Q  78 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  178 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 277  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccactta 15682430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 324
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900212
Alignment:
Q  181 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  281 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccactta 38900212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36136697 - 36136999
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36136697 gttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 36136796  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  | | |||| ||||||    
T  36136797 aatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagag 36136896  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || ||||    
T  36136897 gaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaattt 36136996  T
Q  301 gat 303  Q
    |||    
T  36136997 gat 36136999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28628247 - 28627959
Alignment:
Q  36 ggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  28628247 ggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaa 28628148  T
Q  136 actagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 235  Q
    ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  28628147 acctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagg 28628048  T
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  28628047 aaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccactta 28627959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 185 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979954
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 40979954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 324
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631820
Alignment:
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    ||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32631715 ctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccactta 32631820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 47848607 - 47848912
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || | ||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  47848607 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaa 47848706  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| ||||    
T  47848707 aataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagag 47848806  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  | ||||    
T  47848807 gaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaattt 47848905  T
Q  301 gatccat 307  Q
    |||||||    
T  47848906 gatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681046
Alignment:
Q  141 tagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga 240  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 31681046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 324
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273356
Alignment:
Q  119 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 218  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| | ||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  219 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 318  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  319 cactta 324  Q
    ||||||    
T  7273351 cactta 7273356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598222
Alignment:
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga 24598222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492276
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||| | |||||  |||| |  |||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  303 tccatgta 310  Q
    || |||||    
T  8492283 tcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 7272979 - 7273151
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7272979 tggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 7273078  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 180  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7273079 ttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 172  Q
    ||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 324
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919368
Alignment:
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccactta 48919368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078164
Alignment:
Q  219 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccga 21078164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 32630535 - 32630636
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32630535 tggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 32630633  T
Q  108 tta 110  Q
    |||    
T  32630634 tta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 43282338 - 43282574
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt---agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 97  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  43282338 gttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtg 43282437  T
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag--g 195  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||||  |    
T  43282438 gaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcacaagaggtg 43282536  T
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43282537 tagaggatgacctagaaaaactataagagaaactatta 43282574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 324
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649036
Alignment:
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210730
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 9210730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25579394 - 25579205
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25579394 gataggattagaaatgaccacattagagagagtggg-gagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagaga 25579296  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 222  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | | ||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25579295 gaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcacaagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135240
Alignment:
Q  86 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 185  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||      
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 285  Q
    | |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccactt 38135240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189296
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat------gctgtg 151  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||      | |||     
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgta 7189419  T
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtc 250  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||     
T  7189418 gtatgaagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggtt 7189319  T
Q  251 aatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    || |||||| ||  |||||||||    
T  7189318 aaggagttgaatataaatttggt 7189296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36514554 - 36514371
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36514554 gttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 36514457  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 186  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  36514456 actagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaagt 36514371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011302
Alignment:
Q  124 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 223  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  224 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc-aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26742215 - 26741920
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  26742215 gataggattagaaatgataatatcagagagtgagagttgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagag 26742116  T
Q  131 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat--tagagaaac 228  Q
    | | |||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | |  ||||| |||||||||| ||| ||||||||   ||| ||||    
T  26742115 aaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac 26742016  T
Q  229 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  26742015 tattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccactta 26741920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073185
Alignment:
Q  244 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 33073185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035180
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 34035180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 39811890 - 39812066
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||  ||||  ||    
T  39811890 gttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaatggtgaaa 39811989  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 177  Q
    | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39811990 actcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 312
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601720
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagc 45601720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 324
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966272
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||| ||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    || ||   |||||| | |       ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||| |    
T  12966125 tgaagactagtcaaatca------ctagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||| | || |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccactta 12966272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19262766 - 19262609
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  19262766 gtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagag--ttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtg 19262669  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19262668 gtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208354
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 28208354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021906
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169758
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatca 40169749  T
Q  169 aatggagga 177  Q
    |||||||||    
T  40169750 aatggagga 40169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569270
Alignment:
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcg 1569262  T
Q  315 atcccact 322  Q
    | ||||||    
T  1569263 accccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 42187404 - 42187537
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  42187404 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaaagatggtggaa 42187502  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187503 aataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 324
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852343
Alignment:
Q  246 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 47852343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 36869638 - 36869574
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869638 gttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 28020897 - 28021032
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  28020897 gttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtagaaaagatggtggaa 28020996  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28020997 acttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057734
Alignment:
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  315 atcccactta 324  Q
    | ||||||||    
T  14057725 accccactta 14057734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367762
Alignment:
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  315 atcccactta 324  Q
    | ||||||||    
T  14367753 accccactta 14367762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24598495 - 24598409
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctatag 83  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24598495 gttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctatag 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36102078 - 36101803
Alignment:
Q  37 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||| ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36102078 gattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaaga 36101979  T
Q  137 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 236  Q
    |   |||||  |||   | | ||||| ||||| |||||| | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||             
T  36101978 cctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaattatta-tgaaa--------- 36101889  T
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
      |||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  36101888 --gatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccactta 36101803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239833
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 36239835  T
Q  312 cc 313  Q
    ||    
T  36239834 cc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920866
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgactag 38920866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 324
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187697
Alignment:
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact-atggcgtc 296  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||     
T  42187572 gaggaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaatt-ggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccgaccccactta 42187697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48736248 - 48736073
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  48736248 gttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaa 48736149  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    | ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  || |||  ||| || || ||||| |||||||||||||    
T  48736148 actagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg 48736073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420615
Alignment:
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202827
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  203 agacctaggaaaactattagaga 225  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagaga 48202827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 137
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948585
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  132 gaagac 137  Q
    ||||||    
T  41948580 gaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 5335855 - 5336165
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||   ||||| ||||| | ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  5335855 gttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagag--ttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaa 5335952  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| || || ||||| ||| | ||||||| ||||||| | |   ||||||| |    
T  5335953 actagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaatcactcgaggtaggg 5336052  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||| |||| | ||||||||  |||| || ||||  || ||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||| ||| ||||||||||| |||    
T  5336053 gaaaaccttgaaaaactat--gagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgattgaatactatggcgtcgttt 5336150  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
    ||| |||||||||||    
T  5336151 gattcatgtagccga 5336165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976480
Alignment:
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| | ||  || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  301 gatccatgtagcc 313  Q
    |||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagcc 37976480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969954
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccactta 42969954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 14593694 - 14593834
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg----ggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||   |  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    |||  ||||||||||||||||  ||||    
T  14593694 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagtagaaaaaatggt 14593793  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  14593794 agaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 14593834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30200308 - 30200176
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||    |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  30200308 gttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagagttag----ggtaacacctatagtagaaaagatggtggaa 30200213  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  30200212 actaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415264
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttat 40415264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605237
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18605328  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18605327 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18605237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926548
Alignment:
Q  254 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccactta 34926548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 167
Target Start/End: Original strand, 35713696 - 35713794
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 167  Q
    |||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  35713696 gggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177653
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccactta 24177653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531419
Alignment:
Q  124 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 223  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  224 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
     |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||| |||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacattatgg 1531419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 1740789 - 1740909
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | || |||  ||| ||||    
T  1740789 agagagagagtttgggtagcatctacagtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaa 1740888  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  1740889 ggagagtagatcagatggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 315
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951402
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccga 44951402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558428
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  74 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119450
Alignment:
Q  165 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 264  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagaccta-gaaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | |  |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 19119450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | ||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  301 gatc 304  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 324
Target Start/End: Original strand, 24777166 - 24777217
Alignment:
Q  273 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24777166 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctactta 24777217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869128
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 31869128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 112  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || ||  || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  113 tggtttgggcatgta 127  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637753
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18637662  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18637663 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18637753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651187
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18651096  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18651097 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103182
Alignment:
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| | ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 33103182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 320
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139406
Alignment:
Q  122 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 221  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| |||  | || |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  222 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || |  ||||| | || ||||||| | || ||||  || |||||||||||||| | |||||||    
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatccatgtaactgatccca 33139406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 40830183 - 40830292
Alignment:
Q  25 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  40830183 tagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagt---tgggtagcacctattgaagaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcat 40830279  T
Q  125 gtagagagaagac 137  Q
    | |||||||||||    
T  40830280 gaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 324
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746003
Alignment:
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||||   |||  |||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccactta 34746003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 1523749 - 1523813
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1523749 gttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagagag 1523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 158  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  159 gagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28562647 - 28562443
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||| || ||||| |||||   || |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | ||||  ||| ||||||||| | |||||    
T  28562647 gggtagcatctctagtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatca 28562548  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     || ||| | ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  28562547 gatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaat 28562448  T
Q  269 ttggt 273  Q
     ||||    
T  28562447 atggt 28562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Original strand, 6807388 - 6807447
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6807388 atgagttagatagaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtag 6807447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8519157 - 8519086
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  8519157 gatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgta 8519086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 16013217 - 16013357
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg----ggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||   |    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    |||  ||||||||||| ||||  ||||    
T  16013217 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagtacaaaaaatggt 16013316  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16013317 agaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 16013357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Original strand, 22174123 - 22174254
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| ||||| | ||||| || |||  |||| |||| | |||||||||| |||    
T  22174123 agaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattat 22174222  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22174223 ggcgttgtttgatccatgtagccgaccccact 22174254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || |||||  ||| |||| || | |||||||||||| |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47796301 - 47796178
Alignment:
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||  | ||| |||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  47796301 gaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaattt 47796202  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  47796201 gatccatgcagccgatcccgctta 47796178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  122 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 176
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144883
Alignment:
Q  86 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 324
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630690
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 40630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Original strand, 30632958 - 30633035
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632958 agagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814151
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 30814151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341425
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgacccca 34341425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282086
Alignment:
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||   | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| |||||||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcg 43282056  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  43282057 taatttgatctatctagccgacctcactta 43282086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 175
Target Start/End: Original strand, 3457368 - 3457471
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    ||||||| |||||||||||||   || |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  3457368 gtagcacttatagtagaaaagactgt-gaaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcaga 3457466  T
Q  171 tggag 175  Q
    |||||    
T  3457467 tggag 3457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27022055 - 27021991
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27022055 gttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagag 27021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149039
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || || || |||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  312 ccgatcccactta 324  Q
    ||||  |||||||    
T  40149051 ccgaatccactta 40149039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45841329 - 45841206
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||  ||| |||    
T  45841329 gttgtgttgaatgtgtggtaagcttagaagagatacggttagaaatgacaacattagatagagagt-tgagtaacacctataatagaaaagacggtggaa 45841231  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    | |||| |||| |||||||||||||    
T  45841230 actaggtttagttggtttgggcatg 45841206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24549945 - 24549906
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24549945 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 24549906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27893828 - 27893769
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893828 ggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30914749 - 30914674
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 144  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30914749 gggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 35713617 - 35713676
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  35713617 gttggatgtgtggtaaggttagatatgataggattagaaatgaaaatattagagagagag 35713676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 37439647 - 37439580
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  37439647 aatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaagatgatgtaaaataggcttag 37439580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40391952 - 40391849
Alignment:
Q  221 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||  | ||| ||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  40391952 agagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacccca 40391853  T
Q  321 ctta 324  Q
    ||||    
T  40391852 ctta 40391849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 25891090 - 25891144
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25891090 tggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 25891144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732088
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccactta 33732088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 325
Target Start/End: Original strand, 37595891 - 37595933
Alignment:
Q  283 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37595891 aacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgatcctacttat 37595933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40139257 - 40139124
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||  |||| |||| | ||||    
T  40139257 ggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagtc---gggtttcacctatagtagaaaatatggtggaaactgggct 40139161  T
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40139160 taggtgatctgggcatgtagggagaagatttgtagat 40139124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 311
Target Start/End: Original strand, 45558539 - 45558573
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45558539 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtag 45558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882782
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 304  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatc 2882782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604803
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccactta 4604803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6429225 - 6429156
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6429225 gggtagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagac 6429156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Original strand, 23720829 - 23720898
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23720829 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatg 23720898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24376103 - 24376058
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24376103 tggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 24376058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24549847 - 24549715
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||   |||    
T  24549847 agaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgatagaatcttat 24549748  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24549747 tgcgtcgttt-atccatgtagcagatcccactta 24549715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731639
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 64  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagaga 25731639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25826788 - 25826683
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||   ||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  25826788 gataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaaactcggcttgggtggtttgcgaatgtggaga 25826689  T
Q  132 gaagac 137  Q
    ||||||    
T  25826688 gaagac 25826683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27893674 - 27893589
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | |||||| |||| | |||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27893674 gatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctactta 27893589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 324
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708637
Alignment:
Q  283 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 28708637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922492
Alignment:
Q  222 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40139023 - 40138974
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40139023 tatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccactta 40138974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42177328 - 42177255
Alignment:
Q  37 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  42177328 gattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaactaggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 28858012 - 28858138
Alignment:
Q  34 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |    |||| ||||||||||||||||| |||    
T  28858012 taggattagaaatgacaacattagtgagaga-tg-gggtggcacctattgtagaaaacatggtagaaactcaagttaggtggtttgggcatgtagaaaga 28858109  T
Q  134 agactagtagatgctgtggtaagaagagt 162  Q
     |||  || ||| || | |||||||||||    
T  28858110 tgacctgtggattctatagtaagaagagt 28858138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029713
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 34029713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45054378 - 45054330
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45054378 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccactt 45054330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 310
Target Start/End: Original strand, 45903916 - 45903956
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45903916 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcaatgta 45903956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 52138733 - 52139056
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138733 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52138832  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138833 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52138932  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52138933 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttattt 52139032  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  52139033 gatccatgtagccgaccccactta 52139056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 54278953 - 54279276
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54278953 gttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 54279052  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54279053 aataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaa 54279152  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54279153 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 54279252  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  54279253 gatcaatgtagccgatcccactta 54279276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 28245370 - 28245693
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245370 gttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28245469  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28245470 aatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagat 28245569  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28245570 gaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcattt 28245669  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28245670 gatccatgtagccgatcccactta 28245693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51448058 - 51447753
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448058 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagta-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 51447960  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51447959 aataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga------- 51447867  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447866 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 51447767  T
Q  301 gatccatgtagccg 314  Q
    ||| ||||||||||    
T  51447766 gattcatgtagccg 51447753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 22006 - 22328
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 22105  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22106 a-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagag 22204  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22205 gaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 22304  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  22305 gatctatgtagccgaccccactta 22328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 5168761 - 5169088
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5168761 gttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggt 5168860  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5168861 agaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggt 5168960  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5168961 agaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtc 5169060  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5169061 atttgatccatgtagccgaccccactta 5169088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47233944 - 47233626
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233944 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 47233845  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |    
T  47233844 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaag 47233745  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47233744 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttg 47233645  T
Q  302 atccatgtagccgatccca 320  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  47233644 attcatgtagccgacccca 47233626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 315
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033393
Alignment:
Q  51 ccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  151 ggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc 250  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccga 35033393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33272377 - 33272122
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctata----gtagaaaagttg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    ||||||||||||    
T  33272377 gttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttg 33272278  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33272277 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 33272179  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272178 gtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 25191312 - 25191633
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25191312 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaa 25191409  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25191410 aatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagag 25191509  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25191510 gaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 25191609  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  25191610 gatccatgtagctgatcccactta 25191633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 324
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508491
Alignment:
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccactta 48508491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850377
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatg 254  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 38850377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 53519519 - 53519836
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata------gtagaaaagttg 94  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||    
T  53519519 gttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttg 53519618  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53519619 gtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagag 53519718  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    ||||||||||||||| ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||    
T  53519719 gtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacg 53519806  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53519807 tcatttgatccatgtagccgaccccactta 53519836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 54128311 - 54128635
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54128311 gttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 54128410  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||  |  ||||||||||||    
T  54128411 aataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagag 54128510  T
Q  201 gaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||    
T  54128511 gaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatt 54128610  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  54128611 tgatccatgtaggcgaccccactta 54128635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096731
Alignment:
Q  180 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  280 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 12096731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43695083 - 43694801
Alignment:
Q  27 gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43695083 gacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatg 43694990  T
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| | ||||||||| |||      ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43694989 tagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagg------aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagaga 43694896  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43694895 aaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgacccca 43694801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289117
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  306 atgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccactta 45289117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19676439 - 19676107
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag--------tgt--gggtagcacctatagtagaaaa 90  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19676439 gttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctatagtacaaaa 19676340  T
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    | || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||| || |||||||||||  | |||    
T  19676339 gatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtcagatcaaa 19676240  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  19676239 agaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatagagcattat 19676141  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19676140 ggcgtgatttgatccatgtagctgaccccactta 19676107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 38060419 - 38060580
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  38060419 agagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaa 38060518  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38060519 gaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600724
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 214  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccat 39600724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  174 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga--tttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
     | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 45728079 - 45728324
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt-agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45728079 gttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtaga 45728178  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaagaagag--tggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    || |||| | ||||||||| | ||||||||||| || ||   ||||||  || ||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45728179 aagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagat 45728278  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728279 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 322
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38431107
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  127 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 226  Q
    ||||||| |||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaa 38431006  T
Q  227 acaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca-----ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    || |||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  38431007 actattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgacccca 38431105  T
Q  321 ct 322  Q
    ||    
T  38431106 ct 38431107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503684
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  207 ctaggaaaactattag 222  Q
    ||||  ||||||||||    
T  49503697 ctag--aaactattag 49503684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960663
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||||||| |||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  50960718 atggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccactta 50960663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 315
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  84 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  184 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 283  Q
      | |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  284 acactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19736929 - 19737150
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19736929 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19737028  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||| |||| ||    
T  19737029 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggttga 19737127  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattag 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  19737128 ggaagacctagaaaaactattag 19737150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 19757832 - 19758131
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19757832 gttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19757931  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  | |||| |||||||    
T  19757932 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtaga 19758030  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||           ||||  |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||  | |||    
T  19758031 ggaagacctagaaaaactattag-----------gaaat-atttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatt 19758118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734173
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaa 48734384  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  48734283 aaggccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  302 atccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccactta 48734173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156110
Alignment:
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcca 52156128  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  52156127 tgtagccgaccccactta 52156110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186973
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||||| ||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaatag 3186806  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| | | ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| || |    
T  3186807 gc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaata 3186905  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3186906 cctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510042
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 171  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  172 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    |||||| |||||  | |  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 42510042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 26490250 - 26490571
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26490250 gttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 26490347  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||   | |||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| |||  ||| | |||| || |    
T  26490348 aataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtg 26490447  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |   |||||| | |||||||| ||||    
T  26490448 gaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaattt 26490547  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26490548 gatccatatagtcgatcccactta 26490571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27917505 - 27917788
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27917505 gttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagga 27917602  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| | |||  | | || |||||||     
T  27917603 aataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatcataataggtagac 27917702  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||   ||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  27917703 gaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggatctaaatatggtttacgatagaaca 27917788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54425024
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaag-------agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 224  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| ||       ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatg 54425024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294178
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagactagtagatgctgtgg 152  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||    |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  153 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 252  Q
    ||||||||||  || | ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  253 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    ||||||||||| || | || | ||||||| |||||||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatggc 30294178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52679154 - 52678892
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagt 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  52679154 aatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgt 52679055  T
Q  142 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 241  Q
    |||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || |||    
T  52679054 agatg--ttggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagat 52678959  T
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||| || | ||| |||| ||||||||||||    
T  52678958 ttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060970
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  312 ccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||    
T  38060958 ccgaccccactta 38060970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54365010
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||  |||||| || |  |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga 54365010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555358
Alignment:
Q  246 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccactta 47555358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262397
Alignment:
Q  222 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  322 tta 324  Q
    |||    
T  53262395 tta 53262397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162650
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 192  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  193 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 288  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatggt-aatgatagaacact 19162650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 323
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042192
Alignment:
Q  213 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt-atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  312 ccgatcccactt 323  Q
    |||| |||||||    
T  49042181 ccgaccccactt 49042192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022707
Alignment:
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  302 atccatgtagccga 315  Q
    || |||||||||||    
T  17022720 attcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454251
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgt-tggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  138 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa--gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 235  Q
      |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||   || | ||| |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||      
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||   | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31454339 taggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccactta 31454251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895906
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 7895906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311335
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccactta 311335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 324
Target Start/End: Original strand, 37351418 - 37351663
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  37351418 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaaggg 37351517  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 278  Q
    || ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| | |||||| ||||   | || |||| | ||    
T  37351518 aggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttg 37351617  T
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37351618 ttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 37351663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 345055 - 344928
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  345055 gttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaatag 344956  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||    
T  344955 gcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 21200551 - 21200787
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||| |||||    
T  21200551 gggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatca 21200648  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
     ||||||   |||||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  21200649 catggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaaa 21200747  T
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  21200748 tatg--gtattatagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 3987011 - 3987124
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3987011 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagaga 3987110  T
Q  132 gaagactagtagat 145  Q
    ||||||| ||||||    
T  3987111 gaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36820308 - 36820174
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||| |||| |||    
T  36820308 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagag--ttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaa 36820211  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  36820210 actaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41842806 - 41842678
Alignment:
Q  54 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 153  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  41842806 ttagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagt 41842708  T
Q  154 aagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41842707 aatgagagtagatcaaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133638
Alignment:
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccactta 2133638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 321
Target Start/End: Original strand, 49841622 - 49841869
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |   | || | ||||| |||||  |||| |    
T  49841622 gtagcacctatattagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac-attgacttctttagtaaggagagtaaatcaga 49841720  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    || |||  |||||| |||  |||||||||||||||||   |||||  || |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||| |||| |    
T  49841721 tgaagggtagtcaaattactagaggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatat 49841818  T
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  49841819 ggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 50249318 - 50249529
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaagattagacatgataggat---taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  50249318 cgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtagaaaagatggtggaaa 50249417  T
Q  102 ataggctta---gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
     ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||  | |  ||||||||    
T  50249418 ctagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtcatatcaccagaggtag 50249517  T
Q  199 aggaagacctag 210  Q
    ||||||||||||    
T  50249518 aggaagacctag 50249529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 233
Target Start/End: Original strand, 11581432 - 11581609
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||    
T  11581432 agagagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaa 11581531  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 233  Q
    |||||||  |||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11581532 gaagagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 322
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304220
Alignment:
Q  83 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 182  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| | ||||| || ||||  ||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactagg-ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  183 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 282  Q
    |  |||  ||||| ||  | |||||||| ||||||||||           |||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagacctagtaaaactatta-----------agaaag-atctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  283 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccact 36304220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271936
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccactta 33271936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 136
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  131 agaaga 136  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2341063 - 2340928
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||  ||||||||||  | ||||||||| |||| |||    
T  2341063 gttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaaagatggtggaa 2340964  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||   ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  2340963 aatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaaga 2340928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 324
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296163
Alignment:
Q  221 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  321 ctta 324  Q
    ||||    
T  15296160 ctta 15296163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31337868 - 31337751
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  31337868 gttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggttgaaactag 31337771  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||||  ||||||| |||||    
T  31337770 gcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40273278 - 40273231
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40273278 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 40273231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532214
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc-atgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccactta 48532214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116505
Alignment:
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaat 40116520  T
Q  299 ttgatccatgtagcc 313  Q
    | |||| | ||||||    
T  40116519 tcgatctacgtagcc 40116505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422902
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatg 54422902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893345
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||| |||||||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccactta 27893345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 38850027 - 38850091
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38850027 gttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116373
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccga 40116373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42026817 - 42026565
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||| |||||    
T  42026817 gggtagcactcacagtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatca 42026718  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     | |||||| | |||  |    ||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||  |  ||| ||| | | |||||||| |||  ||||    
T  42026717 gacggaggataatcacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaat 42026618  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  42026617 atggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccac 42026565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23534887 - 23534609
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||    
T  23534887 gataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaaagatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtaga 23534789  T
Q  130 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaca 229  Q
    ||  ||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  | |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||||     
T  23534788 ga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaact 23534691  T
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||| || || |||||| | |||||||||||    ||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23534690 attaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 23534609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31566234 - 31566187
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31566234 tgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 31566187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601148
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 29601148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797848
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccactta 30797848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991687
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 40991687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 45236789 - 45236850
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45236789 gttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148284
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 46148284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  46 tgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattaga-agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 311
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208851
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtag 39208851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541358
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccactta 24541358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41482298 - 41482183
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaagga-tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 288  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| ||| | ||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| |    
T  41482298 agaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacatt 41482199  T
Q  289 atggcgtcatttgatc 304  Q
    ||||||| ||||||||    
T  41482198 atggcgtaatttgatc 41482183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486875
Alignment:
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt---tggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | ||||| ||||| ||||||    |||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccactta 45486875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||   | | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39535715 - 39535653
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39535715 cacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 324
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530017
Alignment:
Q  282 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 41530017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870649
Alignment:
Q  96 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagat 3870649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284233
Alignment:
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||| ||     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  295 tcatttgatccatgtagcc 313  Q
    || ||||||||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagcc 11284233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 89  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacatt--agagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106646
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  || ||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccactta 40106646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 324
Target Start/End: Original strand, 659541 - 659781
Alignment:
Q  84 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    |||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||| || || | ||||   ||| |    
T  659541 tagaaaagatagtagaaacttagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtga 659640  T
Q  184 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 283  Q
    | | |  ||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| || |  | | ||||| || | ||||||||||||    || |  | |||||||||    
T  659641 aatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgataga 659740  T
Q  284 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  659741 acattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccactta 659781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27796065 - 27796005
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  27796065 aaatttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtacccaaccccacttat 27796005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 29817437 - 29817565
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||| ||||  || | | |||||||||  ||||||||||||||   |||| | ||| |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29817437 gttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagtagaaaagattgtagaa 29817536  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    | || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817537 agtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778635
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 24778635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475931
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||| |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||| |||||| |||| |||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagcc 29475931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44134111 - 44134044
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44134111 gggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834626
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccactta 45834626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21862813 - 21862767
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21862813 gatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 21862767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36868503 - 36868437
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  36868503 gtagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcatatataaagaagac 36868437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38054686 - 38054624
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38054686 gttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927874
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 52927874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 324
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278720
Alignment:
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 7278720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415286
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgat-catgtagccgaccccactta 14415286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170661
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccactta 32170661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45493851 - 45493718
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||| | ||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  45493851 agaggcagagggatacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 45493752  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  45493751 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccactta 45493718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46367462 - 46367413
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  46367462 tatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccactta 46367413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49503667 - 49503594
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  |||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  49503667 aatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctactta 49503594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 308
Target Start/End: Original strand, 55244461 - 55244518
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  55244461 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatg 55244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 19737156 - 19737228
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  19737156 atttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtagc 19737228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842562
Alignment:
Q  243 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||| |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 284
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 284  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712101
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccactta 48712101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 124)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36565588 - 36565267
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565588 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 36565489  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565488 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 36565389  T
Q  203 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36565388 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttga 36565289  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  36565288 tccatgtagccgaccccactta 36565267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 36545080 - 36545405
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36545080 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtag 36545179  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36545180 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtag 36545279  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36545280 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcat 36545379  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36545380 ttgatccatgtagccgaccccactta 36545405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523749
Alignment:
Q  34 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  133 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 232  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 11523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36395299 - 36394974
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36395299 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36395200  T
Q  101 aataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36395199 aataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtata 36395100  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca-t 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  36395099 ggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcatt 36395000  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36394999 ttgatccatgtagccgaccccactta 36394974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 40813255 - 40813580
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40813255 gttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 40813354  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40813355 aaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 40813454  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  40813455 aggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcat 40813554  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  40813555 ttgatccatgtagccaaccccactta 40813580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491164
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  170 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 12491164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 39946790 - 39947091
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39946790 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 39946889  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39946890 aataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagag 39946989  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39946990 gacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcattt 39947089  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  39947090 ga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42854353 - 42854034
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42854353 gttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaa 42854254  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42854253 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 42854154  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  42854153 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcattt 42854054  T
Q  301 gatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  42854053 gatccatgtagccgacccca 42854034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 2796488 - 2796809
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2796488 gttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtag 2796587  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2796588 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga---ct-gtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtag 2796683  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||    
T  2796684 aggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaat 2796783  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  2796784 ttgattcatgtagacgaccccactta 2796809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 18125108 - 18125414
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125108 gttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 18125205  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18125206 aataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagag 18125304  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| || ||||    
T  18125305 ggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-attt 18125403  T
Q  301 gatccatgtag 311  Q
    |||| ||||||    
T  18125404 gatcaatgtag 18125414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121401
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932959
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||       
T  8932676 taggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  140 gt-agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaag 238  Q
    || | ||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccactta 8932959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 45419172 - 45419491
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45419172 gttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga-attg-gggtagcacctatagtagaaaagatggtataa 45419269  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||    
T  45419270 aatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagag 45419367  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||    
T  45419368 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaattt 45419467  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  45419468 gatccatgtagccgaccccactta 45419491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469752
Alignment:
Q  142 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 241  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttat 42469752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 37077698 - 37078005
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||            ||||||||||||||    
T  37077698 gttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaaagttggtagaa 37077785  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||     
T  37077786 aatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaaaataggtagat 37077883  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||||  || ||| ||||    
T  37077884 gaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac--tgacgtaattt 37077981  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  37077982 gatccatgcagccgaccccactta 37078005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8879776 - 8879471
Alignment:
Q  14 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8879776 agtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat 8879677  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 213  Q
    | |||||| |||||||||||||||  |    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||  |||||| | |||| |||| ||||||    
T  8879676 gatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaa 8879581  T
Q  214 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||    
T  8879580 aactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagcc 8879483  T
Q  314 gatcccacttat 325  Q
    ||  ||||||||    
T  8879482 gactccacttat 8879471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 29520593 - 29520894
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa-agttggtaga 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |  |||| ||    
T  29520593 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaataaatggtgga 29520692  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  29520693 aa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtaga 29520781  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  29520782 ggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatt 29520880  T
Q  300 tgatccatgtagcc 313  Q
    ||||||||||||||    
T  29520881 tgatccatgtagcc 29520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccat 307  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027767
Alignment:
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc 2027767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18752222 - 18751998
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752222 gttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 18752125  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||| || || | ||||||||||||||||||  | ||| |  |||||||||||||||    
T  18752124 aata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagag 18752026  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaac 228  Q
    ||| |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18752025 gaatacctaaaaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag---gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 167  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  168 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 32043523 - 32043783
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32043523 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaa 32043622  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| | |  |||||||| |    
T  32043623 actagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggg 32043722  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||| || || |||||||||||||    
T  32043723 gaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttgga 32043783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473429
Alignment:
Q  218 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  318 ccactta 324  Q
    |||||||    
T  25473435 ccactta 25473429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 324
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700532
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  160 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  260 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || | |||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccactta 29700532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742108
Alignment:
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaat---atttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccactta 14742108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559935
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 192  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  193 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
    || |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||     
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  293 cgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgta 30559935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529481
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccactta 44529481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 324
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931216
Alignment:
Q  77 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 175  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatcta-tagattctgtagtaaggagactagatcagatggag 32931068  T
Q  176 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 275  Q
    || |||||  | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  32931069 gatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgt 32931167  T
Q  276 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32931168 atgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 32931216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10080254 - 10079995
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  10080254 gttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaagatggtggaa 10080156  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | |  ||||||||||    
T  10080155 actaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagag 10080057  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10080056 gaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat 10079995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39953613 - 39953290
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |   |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  39953613 gttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaa 39953514  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |||  |||| |||||| |||||||||||||  |||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| || |||  | |  |||||||| |    
T  39953513 actagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggg 39953414  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | |||| | ||||||||| ||  |||    
T  39953413 gtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgttt 39953314  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  39953313 gattcatgtagccgaccccactta 39953290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047558
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccactta 44047558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  19 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  119 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45512789 - 45512558
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| | || ||||    
T  45512789 agagagggagttggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaa 45512690  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||| | ||||  || |||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||    
T  45512689 gcagagtagattagatggcagatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatga 45512590  T
Q  256 gttggatcc-aaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45512589 gttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6510775 - 6510616
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6510775 gttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg--tagcacctataatagaaaagttggtagaa 6510678  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 162  Q
    || |   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  6510677 aacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagt 6510616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13171998 - 13171865
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13171998 gttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaagatggtggaa 13171899  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171898 aatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026036
Alignment:
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat---ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    |            ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Original strand, 30748396 - 30748560
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||   |    
T  30748396 cgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagag-ttgt-ggtcgcaccagtagtagaaaagatggtggaatcaa 30748493  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| | ||| ||||||||    
T  30748494 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904940
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | | |||||   | ||||||||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatgg 9904940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 321
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300352
Alignment:
Q  216 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  316 tcccac 321  Q
     |||||    
T  25300347 ccccac 25300352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  20 aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 119  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  120 ggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681252
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796912
Alignment:
Q  37 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaaga 12796914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215438
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccactta 15215438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362676
Alignment:
Q  158 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |    | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  258 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccactta 35362676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490591
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 490591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12492191 - 12492130
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12492191 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 16917148 - 16917438
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| || | |||  |||||| ||| | |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16917148 gataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagtagaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaaga 16917247  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    |||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| | |  | ||||||| |||||||||| ||| ||||  | ||||| ||    
T  16917248 gaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatcactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactat 16917346  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |   | ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| | || |  | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16917347 caaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaaca-tttgactgcttttgatccatgtagccgtccccactta 16917438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30113528 - 30113416
Alignment:
Q  19 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 118  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  30113528 taagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggttt 30113429  T
Q  119 gggcatgtagaga 131  Q
    |||||| ||||||    
T  30113428 gggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216540
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaatatgtt-tatgatagaacattat 2216508  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccact 2216540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914627
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccactta 35914627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492290
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | | ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccactta 23492290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 321
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289017
Alignment:
Q  216 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| || |||| ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  316 tcccac 321  Q
     |||||    
T  25289012 ccccac 25289017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643634
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa----atgga 174  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||          ||| ||||| ||| | ||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac---------atgtagtaaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 274  Q
    ||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||  || | |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35643681 tatgatagaacac--tgccatattttgatccatgtagcctaccccactta 35643634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2518740 - 2518597
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  2518740 gttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaagatggtggaa 2518642  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2518641 aataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041342
Alignment:
Q  220 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 319  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatcc-aatatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  320 actta 324  Q
    |||||    
T  45041346 actta 45041342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Original strand, 5908606 - 5908889
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg------tagaaaataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||      | |||| ||| ||||| ||||||||  ||     
T  5908606 gataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaaagatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg--ata 5908703  T
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| |||||  |||||||  ||||  | |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5908704 tagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagaga 5908803  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||| |||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||    
T  5908804 aactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaccttattgcgtaattggatccatgtag 5908889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 313
Target Start/End: Original strand, 13589474 - 13589724
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||     
T  13589474 agagagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtac 13589573  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    ||||||| ||| | |||||||| | |        |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||    
T  13589574 gaagagtagattatatggaggacaat-------gaagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatga 13589666  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||| ||| |||| || | |   |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  13589667 gttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagcc 13589724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||| || || | ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 279
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266140
Alignment:
Q  165 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 264  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  265 aaatttggtgtatga 279  Q
    |||||| || |||||    
T  5266126 aaatttagtttatga 5266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10824441 - 10824331
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 172  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||  ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10824441 agcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatg 10824342  T
Q  173 gaggagagtca 183  Q
    ||||| |||||    
T  10824341 gaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16351323 - 16351633
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||               
T  16351323 gttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaac---------- 16351412  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
      ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |   ||| |||      
T  16351413 --tagacttgggtggtttaggcatgtagagagaaaacttttggatcatgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcacttgagatagga 16351510  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| ||   | |  |||| | | ||||||||||||||| || |||    
T  16351511 gaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacactatggcatcgttt 16351609  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16351610 gattcatgtagacgaccccactta 16351633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169648
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| || |||| |||||| || || | ||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccactta 28169648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143480
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 169  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||| ||| | ||||| ||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  170 atggaggagagtca 183  Q
    |||||||| |||||    
T  36143467 atggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733462
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |  |||||||||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactat 43733428  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccactta 43733462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2776524 - 2776442
Alignment:
Q  56 agagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2776524 agagagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 25288842 - 25288916
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 82  Q
    ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25288842 tggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 25300177 - 25300251
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 82  Q
    ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25300177 tggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985668
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 208  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||  ||  ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  209 aggaaaacta 218  Q
    || |||||||    
T  25985659 agaaaaacta 25985668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269759
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584614
Alignment:
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||   ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||| |||||||| || ||||           ||| || |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactataag-gaaa-----------gatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  304 ccatgtagccgatcccactta 324  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  42584595 -cttgtagccgaccccactta 42584614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15215613 - 15215556
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15215613 tggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531670
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  | |  |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcactta 7531670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  || || || ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  299 ttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716064
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967524
Alignment:
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  | || | || |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  306 atgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttat 39967524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 44373740 - 44373891
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  44373740 gataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagt 44373839  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
     |||||   |||||  ||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44373840 aaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79112
Alignment:
Q  16 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata---ggcttaga 112  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 13986434 - 13986536
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  13986434 tggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagac 13986533  T
Q  108 tta 110  Q
    |||    
T  13986534 tta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812842
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 30812842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699722
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccactta 44699722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25985880 - 25985813
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25985880 gggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagac 25985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42493653 - 42493536
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| |||| |||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| | || |||    
T  42493653 gttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacattggagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaagattgtggaa 42493556  T
Q  101 aataggcttagatggtttgg 120  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  42493555 actaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10668586 - 10668523
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  10668586 atccatatttggtgtacgatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcactta 10668523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 315
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459142
Alignment:
Q  216 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 273
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  214 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41972069 - 41971991
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972069 agagagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928613
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 1928613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255568
Alignment:
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccga 8255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363740
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccact 26363740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178377
Alignment:
Q  131 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 230  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  231 tta 233  Q
    |||    
T  38178379 tta 38178377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39051075 - 39051205
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||  | |||||| ||| ||||    
T  39051075 gttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttgggataacacctatcattgaaaagatggcagaa 39051174  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    | | || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39051175 actcggtttaggtggtttgggtatgtagaga 39051205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556328
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 27556328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30456530 - 30456441
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 121  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  30456530 gatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttatgtggtttggg 30456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 123  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35647005 - 35646956
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35647005 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccactta 35646956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 312
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903805
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||    |||||||| || | ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  296 catttgatccatgtagc 312  Q
     ||||||||||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgtagc 14903805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 324
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276941
Alignment:
Q  276 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccactta 32276941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32569788 - 32569740
Alignment:
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  32569788 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgacccca 32569740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069858
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccactta 36069858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143594
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccac 36143594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 79156 - 79283
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||||||    
T  79156 agaggaaggcttagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatggcctgtgatagaacataatggcgtc 79255  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  79256 gtttgatccatgtacccgaccccactta 79283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 6483245 - 6483324
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6483245 agagagagagttggggtagctggtatagtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagggaag 6483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 111
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103313
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttag 7103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 11733711 - 11733862
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || || |||||||  ||||| || |||| |||| |||  |||  |||||||  | ||| ||||    
T  11733711 gataggattagaaatgacaacattagagaaagagttgggataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttgttgaga 11733810  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11733811 gaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtca 11733862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 312
Target Start/End: Original strand, 36042407 - 36042442
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36042407 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 36042442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 320
Target Start/End: Original strand, 3801995 - 3802125
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||| |  ||||| || ||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  3801995 aagatgtagaggaagacatacaaaaacaacaagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacacta 3802094  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||| || |||||||  |||||| ||| ||||    
T  3802095 tggagtaatttgattaatgtagtcgaaccca 3802125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Original strand, 27037761 - 27037875
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  27037761 ggtagagaaagacctagtaaaactatacgataaactattaggaaagatataaagattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaatattatggc 27037860  T
Q  294 gtcatttgatccatg 308  Q
    ||  |||||||||||    
T  27037861 gttttttgatccatg 27037875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645106
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagac 29645106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30456367 - 30456329
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30456367 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783072
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||| ||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacatta 30783103  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  30783102 tgaggtagtttgatccatgtagccgacccca 30783072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425290
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagc 21425290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 23023231 - 23023312
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  23023231 agagagagagttcgggtagcacttattgtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgattatgtagagagaagac 23023312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198292
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| | |||    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattat 30198326  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  30198325 ggtgtagtttgatctatgttgccgaccccactta 30198292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30689991
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 30689991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33827917 - 33827816
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  33827917 aagaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaata 33827818  T
Q  290 tg 291  Q
    ||    
T  33827817 tg 33827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444365
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctag--gaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 287  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||||||| ||||     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacat 41444402  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||   ||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41444401 tacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccactta 41444365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16994602 - 16994470
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||||||| | | ||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||    
T  16994602 gaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataatagaacgttatg 16994503  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
      ||  |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16994502 atgttgtttggtacatgtagccgaacccactta 16994470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28255054 - 28255022
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28255054 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatt 28255022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 29709821 - 29709857
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29709821 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 29709857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 311
Target Start/End: Original strand, 29735834 - 29736050
Alignment:
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||| | |||| | |||| | |||||| |||||| ||   |||||||| |  || ||||||||||||| || || ||||||||  | | |||||    
T  29735834 gtagaaaatatgtttaggtagtttcgacatgtacagagaataccgatagatgctataatacgaagagtggatcagatagacgagagtcagatcagaagag 29735933  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||| || | |||||||| || |||  | | ||  ||||| |||||||| || | |||||| ||||  |||| ||    
T  29735934 atagaggaagatctagaaaaactataagaaaagctattagaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaatatgatttatgattgaactttatgacg 29736033  T
Q  295 tcatttgatccatgtag 311  Q
    | ||||||| |||||||    
T  29736034 taatttgattcatgtag 29736050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 38689547 - 38689615
Alignment:
Q  77 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  38689547 cctattgtagaaaagatggtagaaactcagcttaggtggttttgacatctagagagaagacttgtagat 38689615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 4496315 - 4496640
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacat--gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4496315 gttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtag 4496414  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496415 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 4496514  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4496515 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcat 4496614  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4496615 ttgatccatgtagccgaccccactta 4496640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 24178443 - 24178766
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178443 gttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 24178542  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178543 aataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 24178642  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24178643 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcattt 24178742  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  24178743 gatctatgtagccgaccccactta 24178766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12492732 - 12492410
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta---tagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  12492732 cgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaa 12492633  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492632 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 12492533  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492532 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 12492433  T
Q  302 atccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  12492432 atgcatgtagccgaccccactta 12492410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1287938 - 1287605
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagcacctatagtagaaaa 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || ||||||||||||||||||||||    
T  1287938 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 1287839  T
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1287838 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 1287739  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1287738 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactat 1287639  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1287638 ggcgtcagttgatccatgtagccgaccccactta 1287605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28977206 - 28976885
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977206 gttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28977109  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977108 aataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 28977009  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977008 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 28976909  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28976908 gattcatgtagccgaccccactta 28976885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2075823 - 2075499
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  2075823 gttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagac 2075724  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075723 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 2075624  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2075623 gaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatt 2075524  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||    
T  2075523 tgattcatgtagccaaccccactta 2075499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685223
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  133 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 232  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 38685223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 1275198 - 1275520
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275198 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 1275296  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1275297 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagag 1275396  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  1275397 gaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcattt 1275496  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1275497 gatccatgtagccgaccccactta 1275520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 10639230 - 10639557
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag-------tagaaaagtt 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       ||||||||||    
T  10639230 gttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagtt 10639329  T
Q  94 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10639330 ggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag--tcaagttaaaaga 10639427  T
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639428 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 10639527  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10639528 gtcatttgatccatgtagccgaccccactt 10639557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 3301777 - 3302100
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3301777 gttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaa 3301876  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3301877 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 3301976  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3301977 gaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcattt 3302076  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  3302077 gatccatgtagccgaccccactta 3302100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16347727 - 16347406
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347727 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 16347628  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16347627 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 16347528  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16347527 gaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcattt 16347430  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  16347429 gatccatgtagccgaccctactta 16347406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 324
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457029
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  271 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 20457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 324
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665968
Alignment:
Q  16 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  112 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  312 ccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||    
T  14665956 ccgaccccactta 14665968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 34272955 - 34273258
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagcacctatagtagaaaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||||| |||||||    
T  34272955 gttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctataatagaaaa 34273049  T
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||              |||||||||||||||    
T  34273050 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagag--------------gagagtcaagttaaa 34273135  T
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273136 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34273235  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  34273236 gacgtcattcgatccatgtagcc 34273258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915522
Alignment:
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 2915522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26885038 - 26884715
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag-aaaagttggtaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26885038 gttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 26884939  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  26884938 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 26884839  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    ||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||    
T  26884838 ggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaat 26884741  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26884740 ttgatccatgtagccgaccccactta 26884715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561412
Alignment:
Q  157 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  257 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 13561412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 324
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816638
Alignment:
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccactta 29816638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 303
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 14911268 - 14911428
Alignment:
Q  164 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14911268 gatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatc 14911367  T
Q  264 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14911368 caaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 14911428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501444
Alignment:
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccactta 38501444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913918
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  312 ccga 315  Q
    ||||    
T  16913921 ccga 16913918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636009
Alignment:
Q  15 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||| || ||||||| | |  |||| ||| |||||| |||| |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 310
Target Start/End: Original strand, 36215457 - 36215730
Alignment:
Q  25 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||     
T  36215457 tagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcac 36215554  T
Q  125 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 224  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||  || | ||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||          ||||||||||| ||||    
T  36215555 gtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtag----------aggaaaactataagag 36215644  T
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||   |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  36215645 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 312
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889237
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | |  || | |||||||| ||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  306 atgtagc 312  Q
    |||||||    
T  6889231 atgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 27827 - 28126
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  27827 gttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaaagatgatggaa 27925  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||| | ||||         || ||||||| ||||| |||   ||||||||  | ||||||||| |||    
T  27926 aataggcttaggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgtag---------tacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgag 28014  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||| | ||||    
T  28015 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataattt 28114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79757
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaa 79600  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||   | | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  79601 ggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatga 79700  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  79701 gctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagc 79757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213831
Alignment:
Q  248 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 30213831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 32516491 - 32516805
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||  |  | ||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  32516491 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaa 32516588  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||| |||| | |||  ||| |||||||||||    
T  32516589 aataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagag 32516688  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||| ||| ||||    
T  32516689 gaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaattt 32516787  T
Q  301 gatccatgtagccgatcc 318  Q
    |||| || || |||||||    
T  32516788 gatcgatataaccgatcc 32516805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17340786 - 17340500
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaaagttggtaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||| | ||||||||||  ||  ||||    
T  17340786 gttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattattaga 17340687  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  17340686 aaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaagggtaga 17340587  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
     |||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  17340586 tgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713137
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||   ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  160 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttg 2713135  T
Q  260 ga 261  Q
    ||    
T  2713136 ga 2713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7359577 - 7359287
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  7359577 gatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggttt-ggcatgtagaga 7359479  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aa 230  Q
    |||||   |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| |     
T  7359478 gaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactat 7359379  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||| |||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  7359378 ttagaaa-aatctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 7359287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15168723 - 15168855
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggta--agattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15168723 gttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtag 15168822  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168823 aaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859637
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagaga 6859444  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||  || |  || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6859445 gaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 6859544  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| || |||||| || | | | | ||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || || ||||||||    
T  6859545 taggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccactta 6859637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558397
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 5558397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14668027
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg--------catgtagagagaagactagtagatgc 147  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||||  ||| ||      
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacatta 14667850  T
Q  148 tgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagag 247  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |  | |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| | | ||  || ||| |||||    
T  14667851 tgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagag 14667950  T
Q  248 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14667951 attaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccactta 14668027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 324
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588703
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 178  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 278  Q
    ||||| || |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||   |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccactta 30588703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418061
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactt 418061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 315
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525891
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 174  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  || |||  || || ||||| ||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 274  Q
    |||||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | |  ||||     
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga 1525891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 152  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  153 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 233  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||  | | |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43558133 - 43558015
Alignment:
Q  46 tgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43558133 tgacaacattagagagagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtag 43558034  T
Q  144 atgctgtggtaagaagagt 162  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  43558033 atgctgcagtaagaagagt 43558015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 288
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  218 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 288  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 42199243 - 42199446
Alignment:
Q  23 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 122  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42199243 attagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggc 42199340  T
Q  123 atgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 222  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42199341 atgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattag 42199440  T
Q  223 agaaac 228  Q
    | ||||    
T  42199441 acaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418190
Alignment:
Q  17 ggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 114  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaatacttgtagat 418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10083079 - 10082834
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  10083079 gatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 10082980  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 209  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||      |||| ||||||| | |  |||| ||| | ||||||||    
T  10082979 aagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat------gaggggagtcaaatcaccagagatagggtaagaccta 10082886  T
Q  210 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    | |||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||| | |||||||||||    
T  10082885 gaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttgga 10082834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 21952284 - 21952508
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcac----ctatagtagaaaagttg 94  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||    |||||||||||||| ||    
T  21952284 gttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagtagaaaagatg 21952383  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    | ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || | ||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||| | |  ||||    
T  21952384 gcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaaatcactagag 21952483  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactat 219  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  21952484 gtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 313
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276483
Alignment:
Q  221 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagcc 28276483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475355
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  171 tggaggagagtca 183  Q
    ||||||| |||||    
T  43475343 tggaggatagtca 43475355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235302
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccga-cccactta 9235302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||  ||| ||||| | | |  || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 233  Q
     ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041012
Alignment:
Q  229 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 39041012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393133
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccactta 2393133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  195 gtagaggaagacct 208  Q
    ||| | ||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18351120
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagac 18351120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11002770 - 11002645
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  11002770 gttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttcgggtagcacctacagtagaaaacatggtagaa 11002673  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtag 128  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11002672 actagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675786
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccgaccccactta 11675786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640533
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccactta 7640533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917538
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  || |||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  205 acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggat 9917538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 284
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168987
Alignment:
Q  170 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  270 tggtgtatgatagaa 284  Q
    |||| ||||||||||    
T  15168973 tggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 291
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980167
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
     ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatg 23980167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 322
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938364
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 178  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||   ||| ||||     
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 278  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||| || | ||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg 29938321  T
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
     ||||||| | ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  29938322 -tagaacattttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccact 29938364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactatta 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090665
Alignment:
Q  211 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  311 gccgatccca 320  Q
     |||| ||||    
T  2090656 cccgacccca 2090665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588416
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctactta 15588416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442151
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccactta 32442151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675651
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  205 accta 209  Q
    |||||    
T  11675647 accta 11675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 313
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922529
Alignment:
Q  193 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 292  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  |||| || ||||||||| |||||    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagcc 29922529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504293
Alignment:
Q  204 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataaaaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T
Q  304 c 304  Q
    |    
T  42504293 c 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 7678413 - 7678733
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatagtagaaaagttg 94  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||||||||| | |    
T  7678413 gttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatagtagaaaaat-g 7678511  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    || ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||     |||||| |||||  | |  ||||    
T  7678512 gtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtcagatcactagag 7678604  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    | ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||| ||||      
T  7678605 gcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattatgag 7678702  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7678703 gtagtttgatccatgtagccgaccccactta 7678733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 31906626 - 31906729
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||| | |||||||| ||    
T  31906626 ataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcggaaatattcttagatagtttagacatgtagatag 31906725  T
Q  133 aaga 136  Q
    ||||    
T  31906726 aaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  124 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 223  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  224 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||| | || |||  ||||| || | |||||||||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035222
Alignment:
Q  126 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  226 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||  |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 219802 - 219692
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||    
T  219802 gttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgttgaaaaggtggtggaa 219703  T
Q  101 aataggcttag 111  Q
    | | |||||||    
T  219702 acttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 20318920 - 20318989
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20318920 gttgcgttggatgagtggtaagactgga-----taggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408520
Alignment:
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 408520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12577019 - 12576890
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| || |||    
T  12577019 agaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattat 12576920  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12576919 ggtgtcattttatacatgtagccgacccca 12576890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 324
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855863
Alignment:
Q  259 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccactta 18855863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28187017 - 28186956
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 62  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28187017 gttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 38684471 - 38684736
Alignment:
Q  59 gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 158  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||  || || | ||||| |    
T  38684471 gagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaagga 38684570  T
Q  159 gagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 258  Q
    ||||  || | ||||||| || || | | |  ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  || ||| ||||| | ||| ||||    
T  38684571 gagtatattagatggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagtt 38684670  T
Q  259 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||  |||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||    
T  38684671 ggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccactta 38684736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 5305549 - 5305613
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5305549 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725736
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 286  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaaca 14725736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442897
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 3442897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 320
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400763
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgacccca 9400763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 20367061 - 20367148
Alignment:
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20367061 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 42504501 - 42504446
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 87  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42504501 gatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Original strand, 38132531 - 38132592
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38132531 tccaaatgtggt-tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccactta 38132592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272733
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccactta 42272733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788323
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| || || || ||  | |||||||||||   |||| || | |||||||||||| |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccgacctcactta 6788323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578625
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatca 38578703  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 246  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  38578702 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctaga 38578625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 216  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  217 tatta 221  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322105
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccactta 39322105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 324
Target Start/End: Original strand, 42576214 - 42576266
Alignment:
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  42576214 gtgtatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgactta 42576266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411932
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccactta 28411932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43557930 - 43557859
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  43557930 tgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccactta 43557859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713192
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccactta 2713192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 156  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 324
Target Start/End: Original strand, 5303582 - 5303703
Alignment:
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt--ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga- 302  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| |  ||| |||||||||| | ||||||||  ||| |     
T  5303582 cctagaaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatatatggtatatgatagaatattatggcgttgttttaa 5303681  T
Q  303 tccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5303682 tccatgtagccgatcccactta 5303703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 324
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386596
Alignment:
Q  282 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27386596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 34039973 - 34040059
Alignment:
Q  4 gcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 90  Q
    ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||    
T  34039973 gcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagagaatgaatgtagcatgtatagtagaaaa 34040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808171
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 317  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatc 41808171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 315
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938216
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||||| || ||||| | || ||||| | |||||||    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactattagaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataacacta 25938190  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
     |  || ||||||| |||||||||||    
T  25938191 cgttgtaatttgattcatgtagccga 25938216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38341698 - 38341641
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38341698 gggtagcagctatagtagaaaagacagtggaaaataggcttaggtggtttgggtatgt 38341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 310
Target Start/End: Original strand, 39668904 - 39668945
Alignment:
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39668904 ttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgta 39668945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200372
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccactta 41200372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Original strand, 2788583 - 2788623
Alignment:
Q  23 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2788583 attagacatgatagaattaggaatgataacattagagagag 2788623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||||||||||||  |||| |||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28186857 - 28186817
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28186857 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccga 28186817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 38830504 - 38830575
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||    
T  38830504 atgagttggaccgaaatatgatgtatgatagaacattatagcgt-aattgatccatgtagctgaccccactta 38830575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41108803 - 41108755
Alignment:
Q  276 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  41108803 atgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 41108755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 28085309 - 28085632
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085309 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28085408  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28085409 aataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagag 28085508  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28085509 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcattt 28085608  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  28085609 gatccatgtagccgaccccactta 28085632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 32755852 - 32756177
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32755852 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 32755951  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755952 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 32756051  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756052 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 32756151  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32756152 ttgatccatgtagccgatcccactta 32756177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 30031189 - 30031512
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031189 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 30031288  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30031289 aataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 30031388  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30031389 ggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 30031488  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  30031489 gatccatgtagccgacctcactta 30031512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35043790 - 35043467
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  35043790 gttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaa 35043691  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||     
T  35043690 aataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagat 35043591  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35043590 gaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 35043491  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  35043490 gatcaatgtagctgatcccactta 35043467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5258499 - 5258174
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5258499 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 5258400  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5258399 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtag 5258300  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    || |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  5258299 agaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcat 5258200  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5258199 ttgatccacgtagccgaccccactta 5258174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 324
Target Start/End: Original strand, 608096 - 608417
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608096 cgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaata 608193  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  608194 ggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaag 608293  T
Q  205 acctag----gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||    
T  608294 acctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcattt 608393  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  608394 gatccatgtagccgaccctactta 608417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20427985 - 20427663
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20427985 gttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 20427886  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||    
T  20427885 aataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgag 20427786  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||||| |||||    
T  20427785 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacattt 20427687  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     ||| |||||||||| || |||||    
T  20427686 aatcaatgtagccgacccgactta 20427663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 9706716 - 9707026
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9706716 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggc 9706815  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||      ||||||||||||||   |||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||  |    
T  9706816 ttagatggtt------tgtagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggc 9706909  T
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    || | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9706910 taagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccat 9707009  T
Q  308 gtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  9707010 gtagccgaccccactta 9707026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 5631751 - 5632064
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5631751 gttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggt 5631850  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  5631851 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagac 5631950  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    | |||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  5631951 aaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtc 5632050  T
Q  297 atttgatccatgta 310  Q
    ||||||||||||||    
T  5632051 atttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890831
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |            
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca-------- 12890647  T
Q  140 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 239  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890648 -tagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 12890831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351872
Alignment:
Q  14 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagag--tggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || |||||  | || |||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  214 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9594061 - 9593748
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg------ggtagcacctatagtagaaaagttg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||  ||||||||||| ||    
T  9594061 gttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagtagaaaagatg 9593962  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||    
T  9593961 gtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaat--caagag 9593864  T
Q  195 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 294  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||  |    
T  9593863 gtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatg--g 9593766  T
Q  295 tcatttgatccatgtagc 312  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  9593765 taatttgatccatatagc 9593748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10100206 - 10099987
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10100206 gttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaa 10100109  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  10100108 aataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagag 10100009  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10100008 gaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 14030739 - 14031034
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030739 gttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 14030838  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||||||||    
T  14030839 taataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtaga 14030938  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||||           ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || | | |||||||| |||||  |||||||    
T  14030939 ggaagaccta-----------agaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcatt 14031026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 307
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     || | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 324
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679652
Alignment:
Q  79 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 278  Q
    |||||||||| ||||||||          |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggta----------taggaagactattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccactta 30679652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143790
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttat 34143790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156406
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttat 34156406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  217 tattagagaaacaattagaaaggatttag 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  217 tattagagaaacaattagaaaggatttag 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28027169 - 28026855
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28027169 gttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaatag 28027071  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28027070 gcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaaga 28026972  T
Q  206 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||||  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  |||| || ||||| |||||| |     
T  28026971 cctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aacattacggcgtaatttga-ca 28026875  T
Q  306 atgtagccgatcccacttat 325  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  28026874 atgtagccgaccccacttat 28026855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 311
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081083
Alignment:
Q  140 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6056119 - 6055806
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt-tggtaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||   |  |||     
T  6056119 gttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaaattatagg 6056022  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   || ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  6056021 aaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtaga 6055922  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | ||| |||    
T  6055921 ggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 6055822  T
Q  300 tgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||||||    
T  6055821 tgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819087
Alignment:
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 31819087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 303
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689868
Alignment:
Q  74 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 173  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  174 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 273  Q
    || ||||||| || |||||||||      |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||| | ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  274 gtatgatagaacactatggcgtcatttgat 303  Q
     ||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgat 2689868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934856
Alignment:
Q  238 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccactta 34934856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096090
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccactta 5096090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206485
Alignment:
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 3206485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 5080788 - 5080888
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5080788 gttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaa 5080887  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  5080888 a 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666058
Alignment:
Q  76 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 174  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 274  Q
    | | ||||   | |  ||||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 33083993 - 33084127
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  33083993 tgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaac 33084092  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33084093 tagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 324
Target Start/End: Original strand, 31818533 - 31818787
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||  || ||| |||  ||||| | ||| |||||    
T  31818533 gggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatca 31818631  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     |||||||  ||| |  | |  | ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || |    
T  31818632 tatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagt 31818731  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31818732 atggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 31818787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26291711 - 26291917
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtag-cacctatagtagaaaagttggta 97  Q
    |||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||  |||||| |||||||| |||||||  |||||    
T  26291711 gttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatagaaaatatggta 26291810  T
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||    | |||||| |||    
T  26291811 gaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgatcaaaagacgta 26291908  T
Q  198 gaggaagac 206  Q
    |||||||||    
T  26291909 gaggaagac 26291917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34531
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 34531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 9568593 - 9568750
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||| ||||||||||||| || | |    
T  9568593 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagatgatgg 9568692  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 156  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9568693 aaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagacatgtagattatgtggtaag 9568750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098922
Alignment:
Q  219 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 318  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  319 cactta 324  Q
    ||||||    
T  10098927 cactta 10098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10617574 - 10617260
Alignment:
Q  2 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||| |||||||     |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  10617574 ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgaca-----agagcgagagttggggtagcacttatagtagaaaagacg-tagaaa 10617481  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || | | |||   |||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |  ||||||||| |    
T  10617480 ctagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgtggtttctgcattaaggagagt--atcaaatggaggggagtcaaatcactagaggtagaag 10617383  T
Q  202 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 301  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||| ||||||  ||||    
T  10617382 aaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcgttgtttg 10617283  T
Q  302 atccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||  |||||||||  ||||||||    
T  10617282 atttatgtagccggccccactta 10617260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Original strand, 2079317 - 2079434
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 143  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  2079317 aatgacaatattagagagggagt-tgggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtag 2079415  T
Q  144 atgctgtggtaagaagagt 162  Q
    ||  ||| ||||| |||||    
T  2079416 attatgtagtaaggagagt 2079434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7513683 - 7513416
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaag 156  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||| || ||  || |||  ||| |||||    
T  7513683 agagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaaaaacccgtggattatgtagtaag 7513584  T
Q  157 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta-gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||| | |  ||||| | | ||||||||| |  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||    
T  7513583 aagagtcaatcagattgaggggagtcaaatcactagaggcagggggaagacctggataaactataagagaaacttttaggaaggatctagagatgaatga 7513484  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||    
T  7513483 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagctgatctcactt 7513416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364812
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||  | ||| |||||||   |||  |||| |||||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgctta 8364812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25494199 - 25493972
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| |||  || || ||    
T  25494199 gttgcgttggatgtgtggtgaatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaatatt-gtgga 25494101  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| |    
T  25494100 aaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatattacaagaggtaca 25494001  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaac 228  Q
     |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25494000 agaagacctagaagaactataagagaaac 25493972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1615301 - 1615258
Alignment:
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1615301 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 1615258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789100
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctactta 30789100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897713
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccactta 5897713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 33998353 - 33998288
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 66  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33998353 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2065098 - 2065018
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag----agagagagtgtgggtagcacctatagt 84  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2065098 tggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6641715 - 6641628
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  6641715 aatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Original strand, 1911577 - 1911623
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1911577 aaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 1911623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 33496117 - 33496194
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacc 78  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  33496117 gttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1748084 - 1747984
Alignment:
Q  211 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  1748084 gaaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgta 1747985  T
Q  311 g 311  Q
    |    
T  1747984 g 1747984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568944
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc 9568944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 324
Target Start/End: Original strand, 413280 - 413339
Alignment:
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  413280 aaatatggtatatgatagaagattatagtgtcatttgatcaatgtagccgatcccactta 413339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12134218 - 12134115
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| |||||||     
T  12134218 atagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaa 12134119  T
Q  133 aaga 136  Q
    ||||    
T  12134118 aaga 12134115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7150667 - 7150526
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||    |||||| | |||||  || ||||  |||| |||    
T  7150667 gttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt---tgggtaactcctatcataaaaaatatggtggaa 7150571  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    | | || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7150570 actcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagat 7150526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492645
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccactta 7492645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 315
Target Start/End: Original strand, 10453272 - 10453310
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10453272 tgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccga 10453310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14389272 - 14389202
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  14389272 gatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886356
Alignment:
Q  278 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgacccca 21886356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 324
Target Start/End: Original strand, 579465 - 579674
Alignment:
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| |||||||   |||    
T  579465 gtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaa 579564  T
Q  215 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | | ||| ||| ||| |||| |||| | |||  ||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  579565 actgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccg 579664  T
Q  315 atcccactta 324  Q
    ||||||||||    
T  579665 atcccactta 579674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 3963889 - 3963950
Alignment:
Q  158 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 219  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3963889 agagtggatcagaaggaggggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactat 3963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7337270 - 7337221
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7337270 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccactta 7337221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133928
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||| |||| || |  || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccactta 12133928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 324
Target Start/End: Original strand, 32068635 - 32068676
Alignment:
Q  283 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32068635 aacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccactta 32068676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 32080676 - 32080725
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32080676 tatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccactta 32080725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 38900 - 38956
Alignment:
Q  205 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  38900 acctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 38956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43326 - 43266
Alignment:
Q  76 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  43326 acctataatagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaaga 43266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9749497 - 9749353
Alignment:
Q  77 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||| | || |||| |||||| || ||||||||||||| |  ||||||  | | ||||||||||| |||||||  ||||    
T  9749497 cctatcgtagaaaagaaggtggaaacttggtttaggtggtttagggatgtagagagaagtcatgtagattttatagtaagaagagtagatcaaacagagg 9749398  T
Q  177 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 221  Q
      |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9749397 gtagtcaaatcattagaggcagaggaagatctagaaaaactatta 9749353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119678
Alignment:
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119714 atagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccga 12119678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 315
Target Start/End: Original strand, 32945455 - 32945495
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32945455 tatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 32945495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31724
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31500  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31501 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagag 31600  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  31601 gaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcattt 31700  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  31701 gatccatgtagccgaccccactta 31724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44081
Alignment:
Q  60 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 110)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 8180713 - 8181036
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180713 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8180812  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8180813 aataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagag 8180912  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8180913 gaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcattt 8181012  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  8181013 gatccatgtagccgaccccactta 8181036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 3866005 - 3866328
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3866005 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 3866104  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3866105 aataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagag 3866204  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3866205 gaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcattt 3866304  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  3866305 gatccatgtagccgaccccactta 3866328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 36183384 - 36183707
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36183384 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36183483  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36183484 aataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 36183583  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  36183584 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccattt 36183683  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  36183684 gatccatgtagccgaccccactta 36183707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38453038 - 38452712
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38453038 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggt 38452939  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38452938 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggt 38452840  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38452839 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtc 38452740  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38452739 attcgatccatgtagccgaccccactta 38452712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3244000 - 3243679
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  3244000 gttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaa 3243903  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3243902 aataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 3243803  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243802 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 3243703  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  3243702 gatccaggtagccgaccccactta 3243679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 38429817 - 38430140
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429817 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaa 38429916  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38429917 aataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagag 38430016  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38430017 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 38430116  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  38430117 gatccatgtagccgaccccactta 38430140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 4807525 - 4807851
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807525 gttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 4807624  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4807625 agaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggt 4807723  T
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4807724 agatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtc 4807823  T
Q  297 atttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4807824 atttgatccatgtagccgaccccactta 4807851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610844
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccactta 2610844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 12734641 - 12734956
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12734641 tggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggc 12734738  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagac 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  12734739 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagac 12734838  T
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12734839 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatcca 12734938  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  12734939 tgtagtcgaccccactta 12734956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 89 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451674
Alignment:
Q  89 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  189 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 288  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 451674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41197577 - 41197254
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41197577 gttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaa 41197478  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt-aaaagaggtaga 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41197477 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtaga 41197378  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    | |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  41197377 gaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatt 41197278  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  41197277 tgatccatgtagtcgaccccactt 41197254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834934
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  137 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 236  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 25834934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11992455 - 11992134
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992455 gttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 11992358  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  11992357 aataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaag 11992258  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||| |||||||| ||||    
T  11992257 gaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttattt 11992158  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  11992157 gatccatgtagctgaccccactta 11992134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41763390 - 41763069
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41763390 gttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtagaaaagttggtagaa 41763292  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41763291 aataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagag 41763192  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||   ||||||||||    
T  41763191 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcattt 41763093  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  41763092 gatccatgtagccgaccccactta 41763069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45367973 - 45367651
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367973 gttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 45367875  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45367874 aataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagag 45367775  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  45367774 gaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcattt 45367675  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  45367674 gatccatgtcgccgaccccactta 45367651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326186
Alignment:
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  210 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  310 agccgatcccactta 324  Q
    |||| | ||||||||    
T  7326200 agccaaccccactta 7326186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18424716 - 18424417
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424716 ggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg--tagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 18424619  T
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18424618 tagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacat 18424519  T
Q  209 aggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18424518 aggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatg 18424419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 324
Target Start/End: Original strand, 28508750 - 28508934
Alignment:
Q  140 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28508750 gtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagg 28508849  T
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28508850 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 28508934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23997550 - 23997859
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||| |||||||||    
T  23997550 gttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaaatttggtagaa 23997646  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23997647 aatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaa 23997746  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  23997747 gaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttattt 23997834  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||    
T  23997835 gattcatgtatccgaccccacttat 23997859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583657
Alignment:
Q  75 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  175 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt--gg 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  273 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | | |||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccactta 24583657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 38434884 - 38435208
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38434884 gttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaa 38434983  T
Q  101 aataggcttaga-tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    | ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||    
T  38434984 actagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcaga 38435083  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  38435084 ggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatt 38435183  T
Q  300 tgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38435184 tgatccatgtagccgatcccactta 38435208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 185 - 324
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643204
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccactta 35643204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6238103 - 6237779
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtag 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    ||||||||| |  |  || ||||||||||    
T  6238103 gttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgg-gagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataagttggtag 6238005  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  6238004 aaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaagaggtag 6237905  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
    || ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  6237904 agtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatgggatgat 6237805  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||    
T  6237804 ttgatctatatagtcgaccccactta 6237779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 311
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029824
Alignment:
Q  125 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 224  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 39029824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141789
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
     |||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagcc 12141789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9556717 - 9556395
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| | ||| |||    
T  9556717 gttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaa 9556619  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||  ||||| | ||    
T  9556618 aataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggcaaag 9556519  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || || || ||||    
T  9556518 gaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtgtaattt 9556419  T
Q  301 gatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||| |||||||||||  |||||||    
T  9556418 gatacatgtagccgactccactta 9556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959777
Alignment:
Q  172 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  272 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccactta 31959777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751973
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 152  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| |    
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtag 43752145  T
Q  153 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 252  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| | |||  | |   |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||    
T  43752144 tagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaa 43752045  T
Q  253 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  43752044 tgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcactta 43751973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227445
Alignment:
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 324
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959167
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtgg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||  | || |  ||| ||||| ||||| |    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  165 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 264  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| || || || || || ||| | |||||||||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  265 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccactta 18959167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306288
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 30306288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543099
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccactta 45543099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996652
Alignment:
Q  210 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  310 agccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||    
T  9996666 agccgaccccactta 9996652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16097332 - 16097199
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag----agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16097332 tggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaat 16097233  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16097232 aggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328396
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccactta 38328396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4598913 - 4598588
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||   ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4598913 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtag 4598814  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||| | |   ||| ||||||||| |||||| || |  ||||||||    
T  4598813 aaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtcaggtcactagaggtag 4598714  T
Q  199 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 298  Q
     || | |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  | |  | ||||||||||||||||||||||    
T  4598713 tggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgatagaacactatggcgtcat 4598614  T
Q  299 ttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  4598613 ttgattcatgtaaccgattccactta 4598588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 324
Target Start/End: Original strand, 41545372 - 41545661
Alignment:
Q  34 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt-agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||    
T  41545372 taggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaag 41545471  T
Q  133 aagact-agtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 231  Q
    ||| ||  |||||||  || ||   ||||||  |||| ||||||||  ||||||  |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| ||    
T  41545472 aagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaagccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccat 41545568  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    || ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||  || ||||||||| ||||||    
T  41545569 tataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcactta 41545661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  64 agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481646
Alignment:
Q  37 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  137 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 236  Q
    || ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccac 37481646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573156
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 43573156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437747
Alignment:
Q  77 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| ||  | ||| | |||||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  177 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 276  Q
     ||||||  | |  |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |||  |||| |     
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccactta 44437747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Original strand, 13149319 - 13149581
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |       
T  13149319 agagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctc 13149418  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt-agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 254  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||    
T  13149419 gaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 13149518  T
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 317  Q
    ||| | |||||||| | ||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  13149519 agtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatc 13149581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 7825291 - 7825475
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||  ||||      
T  7825291 gttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatagttgtaaatatggtga 7825390  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  7825391 aaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882082
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 169  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||   | |||   ||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca-gaggagacctgtagat--gtagatgctgtcgttcgaagagtagatcag 12882221  T
Q  170 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    |||||||||| || |  ||||||   | ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12882220 atggaggagattcta--taaaag---ttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaata 12882126  T
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  12882125 tggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcc 12882082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635349
Alignment:
Q  248 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 3635349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23714607 - 23714384
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  23714607 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaa 23714511  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | |  ||| |||||     
T  23714510 actagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcactagacgtagat 23714411  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaa 227  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23714410 gaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24102279 - 24102056
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  24102279 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaa 24102183  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | |  ||| |||||     
T  24102182 actagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcactagacgtagat 24102083  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaa 227  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24102082 gaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496122
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccactta 9496122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 324
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543491
Alignment:
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  307 tgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccactta 42543491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336918
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttat 325  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttat 19336918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412789
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataaga 11412789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474953
Alignment:
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 12474953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240927
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  132 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  13240963 gaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatca 13240927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Original strand, 2610463 - 2610525
Alignment:
Q  3 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 65  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610463 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755271
Alignment:
Q  165 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga----gttgg 260  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |    |||||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  261 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctactta 35755271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759179
Alignment:
Q  18 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 116  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  117 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 147  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagacttttagatgc 40759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219210
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatca 6219067  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    ||||||||| |||    | |   |||| |||| |||||||  | ||||||| | | |||| ||||| || ||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  6219068 aatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttag-aaactataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaat 6219165  T
Q  269 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
     |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  6219166 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcc 6219210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13444094 - 13443938
Alignment:
Q  164 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||  |||   ||||||  | |||||| |||  |    
T  13444094 gatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatgggcc 13443995  T
Q  264 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13443994 caaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgacccca 13443938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709227
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 39709227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470159
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 293  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||     
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccactta 37470159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671015
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | |||||||||| |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccga 26671015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 170  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  171 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 215  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Original strand, 30743565 - 30743675
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||  ||    
T  30743565 gatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtg-gggtagcacttatggtagaaaaattggtagaaattagaatt 30743663  T
Q  110 agatggtttggg 121  Q
    ||||||||||||    
T  30743664 agatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504480
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc-aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 289  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatccatctagccgaccccactta 33504480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 42092452 - 42092711
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||| |||||||   ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  42092452 gttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagag--ttggggtagcgcctatactagaaaagatggtagaa 42092549  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | || | |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  | ||  | ||    
T  42092550 actaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaattcactatagagacag 42092649  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    
T  42092650 gtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggat 42092711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 45077681 - 45077870
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||  | | ||||||    ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  45077681 gttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcatctatagtagaaaagatggt 45077780  T
Q  97 agaaaataggctt---agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 183  Q
     || | ||| |||   || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  45077781 ggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtca 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 324
Target Start/End: Original strand, 3481145 - 3481410
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  3481145 gggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatca 3481241  T
Q  169 aatggaggagagtca-------agttaaa-----agaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
     |||||||| |||||       ||| | |     ||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||  |    
T  3481242 gatggaggatagtcagatggacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaacaa 3481341  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3481342 gttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactta 3481410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13592577 - 13592411
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  | | ||||||||||| |||||    
T  13592577 gggtagcacctatagtataaatattg-tggaaaatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatca 13592480  T
Q  169 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaa 237  Q
    ||| ||||| |||||  ||  |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  13592479 aatagaggatagtcatatttcaagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaa 13592411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 324
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670724
Alignment:
Q  280 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 17670724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19235021
Alignment:
Q  158 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 256  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaag-atctagagattaatgat 19235078  T
Q  257 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||||  |||| |||| | |||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagcc 19235021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834806
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    |||||||||||  ||||||| || || || ||  ||| |||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  252 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 320  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 137
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860242
Alignment:
Q  53 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Original strand, 43832087 - 43832342
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 155  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  || |||  ||| || |    
T  43832087 agagagagagttggggtatcacctatagtaaaaaatatg-tggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagtta 43832185  T
Q  156 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    | ||||| ||||| ||||||   | |||| | |  ||| | |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||    
T  43832186 ggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagacgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 43832285  T
Q  256 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||    || || ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  43832286 gttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacggcatttgatccatgtagc 43832342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19337194 - 19337069
Alignment:
Q  5 cgttggatgagtggtaaga-ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 103  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19337194 cgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagtaaagatggtggaaaat 19337097  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    | |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337096 aagctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531626
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 9531626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 11017316 - 11017422
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| || ||||| || ||||||    
T  11017316 ggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaa 11017415  T
Q  170 atggagg 176  Q
    |||||||    
T  11017416 atggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12520142 - 12520088
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12520142 tggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 12520088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197367
Alignment:
Q  76 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26784592 - 26784366
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||   || |||  ||| ||||| || || ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| |    
T  26784592 gaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggca 26784493  T
Q  198 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 297  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| | |||  | |    
T  26784492 gagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaa 26784393  T
Q  298 tttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26784392 tttgatccatgtagccaatctcactta 26784366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720441
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 3720441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855718
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccactta 19855718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 313
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287666
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  296 catttgatccatgtagcc 313  Q
      |||||||| |||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagcc 33287666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 305
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743766
Alignment:
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||| | | |||||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatcc 30743766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 137
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  81 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907757
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431931
Alignment:
Q  197 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 296  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||| ||  |||| |||    
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  297 atttgatccatg 308  Q
    ||||||||||||    
T  7431942 atttgatccatg 7431931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Original strand, 11412881 - 11412966
Alignment:
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga---tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11412881 ttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcactta 11412966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23915773 - 23915722
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23915773 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccac 23915722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 451971 - 451930
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 42  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451971 gttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197567
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctactta 8197567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202327
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctactta 8202327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 19224988 - 19225037
Alignment:
Q  275 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19224988 tatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccactta 19225037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 324
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522485
Alignment:
Q  284 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacactta 522485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 315
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626319
Alignment:
Q  280 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccga 17626319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334178
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccactta 19334178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887092
Alignment:
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactt 887092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394657
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||| | |||| |||||||||||| | |||||||    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccactt 9394657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 19863436 - 19863490
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19863436 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccactta 19863490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 19867768 - 19867822
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19867768 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccactta 19867822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 19872669 - 19872723
Alignment:
Q  270 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19872669 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccactta 19872723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 313
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384714
Alignment:
Q  279 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagcc 25384714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 324
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45077985
Alignment:
Q  254 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccactta 45077985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Original strand, 45436965 - 45437087
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  || || ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||     
T  45436965 agaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattac 45437064  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    || || |||||||| ||||||||    
T  45437065 ggtgtaatttgatctatgtagcc 45437087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 12905082 - 12905162
Alignment:
Q  56 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||  |||| | |||||  |||||||||||||||    
T  12905082 agagagagagttggggtagcacctatagcagaaaagattgtagaagctagaattaggtagtttgaacatgtagagagaaga 12905162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42549919 - 42549863
Alignment:
Q  268 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  42549919 tttggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccactta 42549863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 44411715 - 44411787
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 143  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  44411715 gtagcacctatagtaggaaagatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagacttgtag 44411787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 986
Alignment:
Q  25 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  125 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 224  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  225 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 82661 - 82974
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  82661 tggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggc 82760  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  82761 ttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacc 82858  T
Q  208 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  82859 taggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccat 82957  T
Q  308 gtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  82958 gtagccgaccccactta 82974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48142
Alignment:
Q  259 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccactta 48142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4621 - 4320
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagtagaaaagttggtaga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  4621 gttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaa 4522  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  4521 aaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggta-- 4424  T
Q  200 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 299  Q
            ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  4423 --------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatt 4332  T
Q  300 tgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||    
T  4331 tgatccatgtag 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 86956 - 86648
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |   | |||||||||||||||||||    
T  86956 gttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaaagttggtagaa 86859  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  86858 aatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagat 86759  T
Q  201 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 300  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  86758 ggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaattt 86659  T
Q  301 gatccatgtag 311  Q
    |||||||||||    
T  86658 gatccatgtag 86648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25558
Alignment:
Q  196 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  296 catttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccactta 25558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25794 - 25683
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25794 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 25695  T
Q  101 aataggcttaga 112  Q
    ||||||||||||    
T  25694 aataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11575
Alignment:
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  210 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  310 agccgatcccactta 324  Q
    |||||| ||||||||    
T  11589 agccgaccccactta 11575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11947 - 11810
Alignment:
Q  1 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--gtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947 gttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 11848  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11847 aaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4891
Alignment:
Q  140 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 239  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 323  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactt 4891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16834
Alignment:
Q  177 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  277 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccactta 16834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Original strand, 481 - 587
Alignment:
Q  218 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  318 ccactta 324  Q
    |||||||    
T  581 ccactta 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7685
Alignment:
Q  58 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 157  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  158 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||| |||||| ||  |  ||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaaga-gtgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  258 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc 7685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 313
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14828
Alignment:
Q  207 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcca 14821  T
Q  307 tgtagcc 313  Q
    |||||||    
T  14822 tgtagcc 14828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 14626 - 14678
Alignment:
Q  83 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14626 gtagaaaagtaggtagaaaata-gcttagatggtcggggtatgtagagagaaga 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28915
Alignment:
Q  260 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 28915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58252
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 324  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaactta 58252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16464
Alignment:
Q  262 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 322  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccact 16464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160350
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||  | |||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  312 ccgatcccactta 324  Q
    || | ||||||||    
T  160362 ccaaccccactta 160350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University